lowQualScore : 111111 11 2222222 11 11 1111111111111 111111
lowQualScore : 5 2 33 444 2 77 333 1 1 7 1 2 33 777777 4 999 2 666 33 77777 33 2 2 2 2 33 3 7 2 9 2 5 2 2 88 3 44 3 33 0000000 44 22 5 555 66 8888888888888 3 44 55 333333 3 3
lowQualScore : . . .. ... . .. ... . . . . . .. ...... . ... . ... .. ..... .. . . . . .. . . . . . . . . .. . .. . .. ....... .. .. . ... .. ............. . .. .. ...... . .
lowQualScore : 5 9 77 111 4 55 333 8 8 3 9 1 11 777777 2 000 4 999 44 11111 99 9 9 9 9 99 7 3 9 0 9 7 9 9 77 3 66 8 99 8888888 22 77 7 666 55 3333333333333 3 66 00 000000 0 0
consensus : GTTCATTAGCCGT--TATTA---TGA-GAC-CA---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GTAA-----TAT-AG-G-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTG--AC-G-AAT-AC-GTTGGTGA--ACGATC-GCCA-TTTT-GGACTCGCT-TTGA-ACAAC-TCTTA-T--GTNGTCTGA-TGCAAT--C----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTA--CAA-GGGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--AACAGTGC--AAATGG-----CGACGAAGAGATA
Reference ( gi|100017 ) : GTTCGTTAGCCGT--TATTA---TGA-GAC-TA---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GTAT-----TAT-AG-A-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTG--AC-G-AAT-AC-GTTGGTGA--ATGCTC-GCGA-TTTT-GGACTCGCT-TTGA-ACAAT-TCTTA-T--GTAGTCTGA-AGCAAT--C----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTA--TAA-TGGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--AACAGTGC--AAATGA-----CAACAAAGAGATA
gi|100020 : GTTCATTAGCCGT--T-TTA---TGA-GAC--A---TAT-TGC-CT-CCTG-AAACCA-G--GTAT-----TAT-AG-A-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTG--AC-G-AAT-AC-GTTGATGA--ACGCTC-GTGA-TTTT-GCACTCGCT-TTGA-ACAAC-TCTCA-T--GAAGTCTGA-TGCAATCCC----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTA--CAAGTGGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGCA--AACAGTG---AAATGG-----CAAAGAAGAGATA
gi|100018 : GTTCTTTAGCCGT--TATTA---TGA-GAC-CA---TAT-TAC-CAGCCTGCAGAC-A-G--GTTA-----TAT-AG-G-TC-ATGT---GA--TGTT-----ACTGTG--AC-A-AAT-TC-GTTGGTGA--ACGATC-GCCA-TTTT-GGATTCGCT-TTGA-ACAAC-TCTTA-T--GCCGTCTGA-TGCAATCAC----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTA--CAA-GGGTAGA-------------TA-AACACGAAATTTGTA--AACAGTGC--AAATGG-----CGACGAAGAGATA
gi|100019 : GTTCATTTGCCGT--TATTA---TGA-GAC-CA---TATCTAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GTAA-----TAT-AG-G-TC-ACGT---CA--TCTT-----ACTGTG--AC-G-AAT-AT-GTTGGTGA--ACGATC-GCCA-TTTT-GGACTCGCT-TTGA-ACAAC-TCTTA-T--GTTGTCTGA-TGCAATCAC----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTA--CAA-GGGCAGA-------------TG-AACGCAAAGTTTCTA--AAAACTGT--AAATG
gi|100033 : GTTCGTCA-CAGTAAGATCA---CGT-GACCTA---TAT-TAC-CTGTCTC-AGGC-A-T--GTAA-----TAT-AG-g
gi|100021 : attgtgagaGTTCATTAGCCGT--TATTA---TGA-GAC-TA---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GTAA-----TACCAG-A-CCTACGCTCCGACTTCTCCACCAGCTGCG--A----AAT-AC-AT-GGTGA--ATGCTC-GCGA-TTTT-GGAC---CT-TTGA-ACAAC-TCTCA-T--GAAGTCTGA-TGCAAT--C----A--CACTGTTTGTAAAGAATG-TATTA--CAG--GGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--AACAGTGA--AAATGG-----CGAAGAAGAGATAacgttggtaaacgatcgtcattttggactcgctttgaacaactcttatgtcgtctgatgcgatcacactgtttgtaaagaatatattacaagggcagatgaacagaaagtttataaacagcgctaatggcgacgaagagat
gi|100022 : GTTCATT-GCCGT--TATTA---TGATGAC-CA---TAT-TAC-CTGCCT--AGAC-ATG--GTAT------AT-AG-G-CT-ACGT---GA--TCTA-----ACTGTG--AC-G-AAA-ACTGTTTTAAA--ACGATCCGCCA-TTTTTGGACTCGCT-TTGA-A-AATCTCTTA-T--GTAGTCTGA-A-CAAT--C----A--CACTGTTTGTAAAGAATG-TATTA--TAA-GGGCAGA-------------TGAAACACAAAG-TTGTA--AACAGTGC--AAATGG-----CGACAAAGAGA
gi|100023 : GTTCATTTGCC-T--TATT----TGA-GAC-CA---TAT-TAC-CTGATTG-AGAC-A-G--GTAA-----TAT-AG-AATC-ACGTT--GA--TCTT-----ACTGTG--AC-G-AAT-AC-GTTGGTGA--GCGAAC-GCGACTTTT-GGA-TCGCT-TTAA-AAAA--TCTTA-T--GTTGTCTGATTGC-AT--CCACAA--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATCACTTAA--GACAGA-------------TA-AACACAAAGTTTGTATTTACAGTACCAAAATAAGATAGCGACGAAGA-ATA
gi|100024 : GTTCATTTGCCGT--TATTA---TGA-TAC-TA---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GTAA-----TAT-AG-G-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTG--AC-G-AAT-AC-GATGGTGA--ACGATG-GCCA-TTTT-
gi|100025 : GTTCATTAACCCA--TATTA---TGA-TGC-CA---TAT-TAC-CTGCCTGGATAC-A-G--GTAA-----TAT-AT-G-TC-ATGT---GA--CCTT-----ACTGTG--AC-GGAAT-TC-GTTGGTGA--ACCATC-GCCA-TTTT-GGACTCGCT-TTGA-ATAGG-CCTT
gi|100026 : GTTCATTTATCGT--TAT-ACCTTGA-GAC-GAAATTAT-TACGCTGCCTG-AGAC---G--GTA-------AT-AG-AGGC-ACG----GA--TCTT-----ACTG-G--ACTG-CATCAC--TTGGTAACGACGC----CTA-TTTTGGGACTCACTCTTAA-ACAAC-CTTCA-T--GTGGTCTGA-TGCAAC--C----A--C--TGTCGGT-AAGAATGCTATT
gi|100028 : GTTCATTTGCCGT--TATTA---TGA-GAC-CA---TAT-TAC-CTGCCTG-AAAC-A-GTTGTATCAAAATAT-AATA-TC-ACGT---GA--
gi|100029 : GTTCATTATCCGC--TATTA---TGA-GAC-AA---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-
gi|100031 : GTTCATTAGCCGT--TATTA---TGA-GAC-CA---TAT-T-C-CTGCCTGCAGAC-
gi|100030 : GTTCATTAGCCGT--TATTA---TGA-GAC-CA---TAT-T-C-CTGCCTGCAGAC-
gi|100032 : GTTCATTAGCCGT--CATTA---TTA-GAC-CA---CAT-TAC-CTGCACG-AGA
gi|100033 : ATTG---TGA-GAC-TA---TAT-TAC-ATGCCTG-AGAC-A-G--GTAA-----TAT-AG-G-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTG--AC-G-AAC-AC-GTTGGTAA--ACGATC-GTCA-TTTT-GGACTCGCT-TTGA-ACAAC-TCTTA-T--GTCGTCTGA-TGCGATCAC----A--C--TGTTTGTAAAGAATA-TATTA--CAA-GGGCAGA-------------TG-AACAGAAAGTTTATA--AACAGCGC--TAATGG-----CGACGAAGAGAT
gi|100024 : ATCA---CGT-GACCTA---TAT-TAC-CTGTCTC-AGGC-A-G--GTAA-----TAT-AGTA-TC-A
gi|100019 : gttcatttgccgttattaC-TA---TAT-TAC-CTGTCTC-AGGC-A-G--GTActtactgtgacgaatacgatggtgaacgatggccatttt
gi|100023 : gttcatttgccgttattatgagaccatatcC-TA---TAT-TAC-CTGTCTC-AATC-A-G--GTAA-----TAT-GG-gtcacgtcatcttactgtgacgaatatgttggtgaacgatcgccattttggactcgctttgaacaactcttatgttgtctgatgcaatcacactgtttgtaaagaatgtattacaagggcagatgaacgcaaagtttctaaaaactgtaaatgg
gi|100034 : gttcatttgccttatttgagaA---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GTAT-----TATTAG-A-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTG--AC-G-AAT-AC-GTTGGTGA--ATGCTC-GCGA-TTTT-GGACTCGCT-TTGA-ACAAT-TCTTA-T--GTAGTCTGA-AGCAAT--C----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTA--TAA-TGGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--AACAGTGC--AAATGA-----CAACAAAGAGATAaatcacgttgatcttactgtgacgaatacgttggtgagcgaacgcgacttttggatcgctttaaaaaatcttatgttgtctgattgcatccacaactgtttgtaaagaatgtatcacttaagacagataaacacaaagtttgtatttacagtaccaaaataagatagcgacgaagaata
gi|100021 : ---TAT-TAC-CTGTCTC-AGGC-A-G--GTAA-----TAT-AG---TC-TCAT---AA--T
gi|100035 : gttcattagccgtt-TAC-C-GCCTG-ATAC-A-G--GTAG-----TAT-AG-A-T--ACG----GA--TCTT-----ACTGTGACAC-G-AAC-TC-TGTCGTAA--CCGATC-GC---CTTT--GACTCACT-TTGACACAAC-TCTTATT--GTGGT-TGA-TGCAAT--CA---A--C--TG-TCGT-AAGAATGTTATTccagacctacgctccgacttctccaccagctgcgaaatacatggtgaatgctcgcgattttggacctttgaacaactctcatgaagtctgatgcaatcacactgtttgtaaagaatgtattacagggcagatgaacacaaagtttgtaaacagtgaaaatggcgaagaagagata
gi|100036 : -----TAT-AG-A-TC-ATGT---GA--TCTT-----ACTGTG--AC-G-AAT-AT-GTTGGTGA--A
gi|100027 : AT-AG-G-TC-ATGT---GA--TCTT-----ATTGTG--AC-G-AAT-AA-GTTGGTGA--ACGATC-GCAA-TTTT-GGACTCGCT-TTGA-ACAAT-TCTc
gi|100037 : gttcatttgccgttatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaC-GCCA-TTTT-GGACTCGCT-TTGA-ACAAC-CCTTA-T--GTAGTCTGA-AGCAAT--CAA--A--C--TGTTAGTAAAGAATG-TATTA--TAG-TGGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--
gi|100038 : CTCGCT-TTGA-ACAAC-TCTTA-TCTGTCGTATGA-CGCAAT--C----AATC--TCTTTGTAAAGAATG-TGGTA--CAA-GGGCAAATTATCACAACAATTG-AACACAAAATGTGT---AACTGTGC--AAATGG-----CGACGAAGAGATA
gi|100039 : TCTGA-TGCAAT--C----A--CATTGTTTGAAAAGAATG-AATTA--CAA-GGGCATT-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--AACAGTGC--AATTTG-----CGACGAAGAAATA
gi|100040 : TG-TATTA--CAA-GGGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTCTA--AAAACTGC--AAATGG-----CGACGGAGAGATA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111 1111111 11 1111111111111 1111111
lowQualScore : 3 444 2 0 333 2 2 8 2 2 33 66666 1 3333333333333 5 333 2 666 33 66666 66 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 44 1 44 8888888 33 11 5 44 3 6666666666666 3 44 0000000
lowQualScore : . ... . . ... . . . . . .. ..... . ............. . ... . ... .. ..... .. . . . . . . . . . . . .. . .. ....... .. .. . .. . ............. . .. .......
lowQualScore : 8 111 4 3 999 1 1 4 2 5 77 77777 1 8888888888888 0 000 5 999 44 77777 33 7 7 7 7 7 7 7 9 7 7 1 22 0 00 6666666 99 88 3 22 1 9999999999999 1 22 8888888
consensus : GTTCATTAGCCGTTAT---TATGA-GACCA---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GT-----AAT-------------AT-AG-G-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AC-GTTGGTGAACGATC-GCC-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ACAACTCTTA-T--GTNGTCTGA-TGCAAT--C----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTAC--AAG-GGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--AACAGTGC-------AAATGGCGACGAAGAGATA
Reference ( family-750 ) : GTTCATTAGCCGTTAT---TATGA-GACCA---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GT-----AAT-------------AT-AG-G-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AC-GTTGGTGAACGATC-GCC-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ACAACTCTTA-T--GTNGTCTGA-TGCAAT--C----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTAC--AAG-GGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--AACAGTGC-------AAATGGCGACGAAGAGATA
gi|100017 : GTTCGTTAGCCGTTAT---TATGA-GACTA---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GT-----ATT-------------AT-AG-A-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AC-GTTGGTGAATGCTC-GCG-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ACAATTCTTA-T--GTAGTCTGA-AGCAAT--C----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTAT--AAT-GGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--AACAGTGC-------AAATGACAACAAAGAGATA
gi|100018 : GTTCTTTAGCCGTTAT---TATGA-GACCA---TAT-TAC-CAGCCTGCAGAC-A-G--GT-----TAT-------------AT-AG-G-TC-ATGT---GA--TGTT-----ACTGTGAC--A-AAT-TC-GTTGGTGAACGATC-GCC-A-TTTT-GG-ATTCGCT-TTGA-ACAACTCTTA-T--GCCGTCTGA-TGCAATCAC----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTAC--AAG-GGTAGA-------------TA-AACACGAAATTTGTA--AACAGTGC-------AAATGGCGACGAAGAGATA
gi|100019 : GTTCATTTGCCGTTAT---TATGA-GACCA---TATCTAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GT-----AAT-------------AT-AG-G-TC-ACGT---CA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AT-GTTGGTGAACGATC-GCC-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ACAACTCTTA-T--GTTGTCTGA-TGCAATCAC----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTAC--AAG-GGCAGA-------------TG-AACGCAAAGTTTCTA--AAAACTGT-------AAATGG
gi|100020 : GTTCATTAGCCGTT-T---TATGA-GAC-A---TAT-TGC-CT-CCTG-AAACCA-G--GT-----ATT-------------AT-AG-A-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AC-GTTGATGAACGCTC-GTG-A-TTTT-GC-ACTCGCT-TTGA-ACAACTCTCA-T--GAAGTCTGA-TGCAATCCC----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTAC--AAGTGGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGCA--AACAGTG--------AAATGGCAAAGAAGAGATA
gi|100021 : GTTCATTAGCCGTTAT---TATGA-GACTA---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GT-----AAT-------------ACCAG-A-CCTACGCTCCGACTTCTCCACCAGCTGCGA-----AAT-AC-AT-GGTGAATGCTC-GCG-A-TTTT-GG-AC---CT-TTGA-ACAACTCTCA-T--GAAGTCTGA-TGCAAT--C----A--CACTGTTTGTAAAGAATG-TATTAC--A-G-GGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--AACAGTGA-------AAATGGCGAAGAAGAGATA
gi|100022 : GTTCATT-GCCGTTAT---TATGATGACCA---TAT-TAC-CTGCCT--AGAC-ATG--GT-----A-T-------------AT-AG-G-CT-ACGT---GA--TCTA-----ACTGTGAC--G-AAA-ACTGTTTTAAAACGATCCGCC-A-TTTTTGG-ACTCGCT-TTGA-AAATCTCTTA-T--GTAGTCTGA--ACAAT--C----A--CACTGTTTGTAAAGAATG-TATTAT--AAG-GGCAGA-------------TGAAACACAAAG-TTGTA--AACAGTGC-------AAATGGCGACAAAGAGA
gi|100023 : GTTCATTTGCC-TTAT---T-TGA-GACCA---TAT-TAC-CTGATTG-AGAC-A-G--GT-----AAT-------------AT-AG-AATC-ACGTT--GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AC-GTTGGTGAGCGAAC-GCG-ACTTTT-GG-A-TCGCT-TTAA-A-AAATCTTA-T--GTTGTCTGATTGC-AT--CCACAA--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATCACTTAA--GACAGA-------------TA-AACACAAAGTTTGTATTTACAGTACCAAAATAAGATAGCGACGAAGA-ATA
gi|100024 : GTTCATTTGCCGTTAT---TATGA-TACTA---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GT-----AAT-------------AT-AG-G-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AC-GATGGTGAACGATG-GCC-A-TTTT-
gi|100025 : GTTCATTAACCCATAT---TATGA-TGCCA---TAT-TAC-CTGCCTGGATAC-A-G--GT-----AAT-------------AT-AT-G-TC-ATGT---GA--CCTT-----ACTGTGAC--GGAAT-TC-GTTGGTGAACCATC-GCC-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ATAGGCCTT
gi|100026 : GTTCATTTATCGTTATACCT-TGA-GACGAAATTAT-TACGCTGCCTG-AGAC---G--GT-----AAT-------------AG-AG-G--C-ACG----GA--TCTT-----ACTG-GACT-G-CATCAC--TTGGT-AACGA-C-GCCTA-TTTT-GGGACTCACTCTTAA-ACAACCTTCA-T--GTGGTCTGA-TGCAAC--C----A--C--TGTCGGT-AAGAATGCTATT
gi|100027 : GTTCATTTGCCGTTAT---NNNNN-NNNNN---NNN-NNN-NNNNNNN-NNNN-N-N--NN-----NNNNNNNNNNNNNNNAAT-AG-G-TC-ATGT---GA--TCTT-----ATTGTGAC--G-AAT-AA-GTTGGTGAACGATC-GCA-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ACAATTCT
gi|100028 : GTTCATTTGCCGTTAT---TATGA-GACCA---TAT-TAC-CTGCCTG-AAAC-A-GTTGTATCAAAAT-------------AT-AATA-TC-ACGT---GA--
gi|100029 : GTTCATTATCCGCTAT---TATGA-GACAA---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-
gi|100030 : GTTCATTAGCCGTTAT---TATGA-GACCA---TAT-T-C-CTGCCTGCAGAC-
gi|100031 : GTTCATTAGCCGTTAT---TATGA-GACCA---TAT-T-C-CTGCCTGCAGAC-
gi|100032 : GTTCATTAGCCGTCAT---TATTA-GACCA---CAT-TAC-CTGCACG-AGA
gi|100033 : AT---TGTGA-GACTA---TAT-TAC-ATGCCTG-AGAC-A-G--GT-----AAT-------------AT-AG-G-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAC-AC-GTTGGTAAACGATC-GTC-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ACAACTCTTA-T--GTCGTCTGA-TGCGATCAC----A--C--TGTTTGTAAAGAATA-TATTAC--AAG-GGCAGA-------------TG-AACAGAAAGTTTATA--AACAGCGC-------TAATGGCGACGAAGAGAT
gi|100034 : A---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GT-----ATT-------------ATTAG-A-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AC-GTTGGTGAATGCTC-GCG-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ACAATTCTTA-T--GTAGTCTGA-AGCAAT--C----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTAT--AAT-GGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--AACAGTGC-------AAATGACAACAAAGAGATA
gi|100035 : -TAC-C-GCCTG-ATAC-A-G--GT-----AGT-------------AT-AG-A-T--ACG----GA--TCTT-----ACTGTGACACG-AAC-TC-TGTCGTAACCGATC-GCC----TTT-G--ACTCACT-TTGACACAACTCTTATT--GTGGT-TGA-TGCAAT--CA---A--C--TG-TCGT-AAGAATGTTATT
gi|100036 : T-------------AT-AG-A-TC-ATGT---GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AT-GTTGGTGAAC
gi|100037 : C-GCC-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ACAACCCTTA-T--GTAGTCTGA-AGCAAT--CAA--A--C--TGTTAGTAAAGAATG-TATTAT--AGT-GGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--
gi|100038 : CTCGCT-TTGA-ACAACTCTTA-TCTGTCGTATGA-CGCAAT--C----AATC--TCTTTGTAAAGAATG-TGGTAC--AAG-GGCAAATTATCACAACAATTG-AACACAAAATGTGT---AACTGTGC-------AAATGGCGACGAAGAGATA
gi|100039 : TCTGA-TGCAAT--C----A--CATTGTTTGAAAAGAATG-AATTAC--AAG-GGCATT-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--AACAGTGC-------AATTTGCGACGAAGAAATA
gi|100040 : TG-TATTAC--AAG-GGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTCTA--AAAACTGC-------AAATGGCGACGGAGAGATA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111 1111111 11 1111111111111 1111111
lowQualScore : 3 444 2 0 333 2 2 8 2 2 33 66666 1 3333333333333 5 333 2 666 33 66666 66 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 44 1 44 8888888 33 11 5 44 3 6666666666666 3 44 0000000
lowQualScore : . ... . . ... . . . . . .. ..... . ............. . ... . ... .. ..... .. . . . . . . . . . . . .. . .. ....... .. .. . .. . ............. . .. .......
lowQualScore : 8 111 4 3 999 1 1 4 2 5 77 77777 1 8888888888888 0 000 5 999 44 77777 33 7 7 7 7 7 7 7 9 7 7 1 22 0 00 6666666 99 88 3 22 1 9999999999999 1 22 8888888
consensus : GTTCATTAGCCGTTAT---TATGA-GACCA---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GT-----AAT-------------AT-AG-G-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AC-GTTGGTGAACGATC-GCC-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ACAACTCTTA-T--GTNGTCTGA-TGCAAT--C----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTAC--AAG-GGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--AACAGTGC-------AAATGGCGACGAAGAGATA
Reference ( family-750 ) : GTTCATTAGCCGTTAT---TATGA-GACCA---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GT-----AAT-------------AT-AG-G-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AC-GTTGGTGAACGATC-GCC-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ACAACTCTTA-T--GTNGTCTGA-TGCAAT--C----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTAC--AAG-GGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--AACAGTGC-------AAATGGCGACGAAGAGATA
gi|100017 : GTTCGTTAGCCGTTAT---TATGA-GACTA---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GT-----ATT-------------AT-AG-A-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AC-GTTGGTGAATGCTC-GCG-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ACAATTCTTA-T--GTAGTCTGA-AGCAAT--C----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTAT--AAT-GGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--AACAGTGC-------AAATGACAACAAAGAGATA
gi|100018 : GTTCTTTAGCCGTTAT---TATGA-GACCA---TAT-TAC-CAGCCTGCAGAC-A-G--GT-----TAT-------------AT-AG-G-TC-ATGT---GA--TGTT-----ACTGTGAC--A-AAT-TC-GTTGGTGAACGATC-GCC-A-TTTT-GG-ATTCGCT-TTGA-ACAACTCTTA-T--GCCGTCTGA-TGCAATCAC----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTAC--AAG-GGTAGA-------------TA-AACACGAAATTTGTA--AACAGTGC-------AAATGGCGACGAAGAGATA
gi|100019 : GTTCATTTGCCGTTAT---TATGA-GACCA---TATCTAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GT-----AAT-------------AT-AG-G-TC-ACGT---CA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AT-GTTGGTGAACGATC-GCC-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ACAACTCTTA-T--GTTGTCTGA-TGCAATCAC----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTAC--AAG-GGCAGA-------------TG-AACGCAAAGTTTCTA--AAAACTGT-------AAATGG
gi|100020 : GTTCATTAGCCGTT-T---TATGA-GAC-A---TAT-TGC-CT-CCTG-AAACCA-G--GT-----ATT-------------AT-AG-A-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AC-GTTGATGAACGCTC-GTG-A-TTTT-GC-ACTCGCT-TTGA-ACAACTCTCA-T--GAAGTCTGA-TGCAATCCC----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTAC--AAGTGGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGCA--AACAGTG--------AAATGGCAAAGAAGAGATA
gi|100021 : GTTCATTAGCCGTTAT---TATGA-GACTA---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GT-----AAT-------------ACCAG-A-CCTACGCTCCGACTTCTCCACCAGCTGCGA-----AAT-AC-AT-GGTGAATGCTC-GCG-A-TTTT-GG-AC---CT-TTGA-ACAACTCTCA-T--GAAGTCTGA-TGCAAT--C----A--CACTGTTTGTAAAGAATG-TATTAC--A-G-GGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--AACAGTGA-------AAATGGCGAAGAAGAGATA
gi|100022 : GTTCATT-GCCGTTAT---TATGATGACCA---TAT-TAC-CTGCCT--AGAC-ATG--GT-----A-T-------------AT-AG-G-CT-ACGT---GA--TCTA-----ACTGTGAC--G-AAA-ACTGTTTTAAAACGATCCGCC-A-TTTTTGG-ACTCGCT-TTGA-AAATCTCTTA-T--GTAGTCTGA--ACAAT--C----A--CACTGTTTGTAAAGAATG-TATTAT--AAG-GGCAGA-------------TGAAACACAAAG-TTGTA--AACAGTGC-------AAATGGCGACAAAGAGA
gi|100023 : GTTCATTTGCC-TTAT---T-TGA-GACCA---TAT-TAC-CTGATTG-AGAC-A-G--GT-----AAT-------------AT-AG-AATC-ACGTT--GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AC-GTTGGTGAGCGAAC-GCG-ACTTTT-GG-A-TCGCT-TTAA-A-AAATCTTA-T--GTTGTCTGATTGC-AT--CCACAA--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATCACTTAA--GACAGA-------------TA-AACACAAAGTTTGTATTTACAGTACCAAAATAAGATAGCGACGAAGA-ATA
gi|100024 : GTTCATTTGCCGTTAT---TATGA-TACTA---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GT-----AAT-------------AT-AG-G-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AC-GATGGTGAACGATG-GCC-A-TTTT-
gi|100025 : GTTCATTAACCCATAT---TATGA-TGCCA---TAT-TAC-CTGCCTGGATAC-A-G--GT-----AAT-------------AT-AT-G-TC-ATGT---GA--CCTT-----ACTGTGAC--GGAAT-TC-GTTGGTGAACCATC-GCC-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ATAGGCCTT
gi|100026 : GTTCATTTATCGTTATACCT-TGA-GACGAAATTAT-TACGCTGCCTG-AGAC---G--GT-----AAT-------------AG-AG-G--C-ACG----GA--TCTT-----ACTG-GACT-G-CATCAC--TTGGT-AACGA-C-GCCTA-TTTT-GGGACTCACTCTTAA-ACAACCTTCA-T--GTGGTCTGA-TGCAAC--C----A--C--TGTCGGT-AAGAATGCTATT
gi|100027 : GTTCATTTGCCGTTAT---NNNNN-NNNNN---NNN-NNN-NNNNNNN-NNNN-N-N--NN-----NNNNNNNNNNNNNNNAAT-AG-G-TC-ATGT---GA--TCTT-----ATTGTGAC--G-AAT-AA-GTTGGTGAACGATC-GCA-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ACAATTCT
gi|100028 : GTTCATTTGCCGTTAT---TATGA-GACCA---TAT-TAC-CTGCCTG-AAAC-A-GTTGTATCAAAAT-------------AT-AATA-TC-ACGT---GA--
gi|100029 : GTTCATTATCCGCTAT---TATGA-GACAA---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-
gi|100030 : GTTCATTAGCCGTTAT---TATGA-GACCA---TAT-T-C-CTGCCTGCAGAC-
gi|100031 : GTTCATTAGCCGTTAT---TATGA-GACCA---TAT-T-C-CTGCCTGCAGAC-
gi|100032 : GTTCATTAGCCGTCAT---TATTA-GACCA---CAT-TAC-CTGCACG-AGA
gi|100033 : AT---TGTGA-GACTA---TAT-TAC-ATGCCTG-AGAC-A-G--GT-----AAT-------------AT-AG-G-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAC-AC-GTTGGTAAACGATC-GTC-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ACAACTCTTA-T--GTCGTCTGA-TGCGATCAC----A--C--TGTTTGTAAAGAATA-TATTAC--AAG-GGCAGA-------------TG-AACAGAAAGTTTATA--AACAGCGC-------TAATGGCGACGAAGAGAT
gi|100034 : A---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GT-----ATT-------------ATTAG-A-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AC-GTTGGTGAATGCTC-GCG-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ACAATTCTTA-T--GTAGTCTGA-AGCAAT--C----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTAT--AAT-GGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--AACAGTGC-------AAATGACAACAAAGAGATA
gi|100035 : -TAC-C-GCCTG-ATAC-A-G--GT-----AGT-------------AT-AG-A-T--ACG----GA--TCTT-----ACTGTGACACG-AAC-TC-TGTCGTAACCGATC-GCC----TTT-G--ACTCACT-TTGACACAACTCTTATT--GTGGT-TGA-TGCAAT--CA---A--C--TG-TCGT-AAGAATGTTATT
gi|100036 : T-------------AT-AG-A-TC-ATGT---GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AT-GTTGGTGAAC
gi|100037 : C-GCC-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ACAACCCTTA-T--GTAGTCTGA-AGCAAT--CAA--A--C--TGTTAGTAAAGAATG-TATTAT--AGT-GGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--
gi|100038 : CTCGCT-TTGA-ACAACTCTTA-TCTGTCGTATGA-CGCAAT--C----AATC--TCTTTGTAAAGAATG-TGGTAC--AAG-GGCAAATTATCACAACAATTG-AACACAAAATGTGT---AACTGTGC-------AAATGGCGACGAAGAGATA
gi|100039 : TCTGA-TGCAAT--C----A--CATTGTTTGAAAAGAATG-AATTAC--AAG-GGCATT-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--AACAGTGC-------AATTTGCGACGAAGAAATA
gi|100040 : TG-TATTAC--AAG-GGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTCTA--AAAACTGC-------AAATGGCGACGGAGAGATA
blockSeqs : A ACC T AAT C G C C T TT ATCAA A NNNNNNNNNNNNA C AA T TCC CT CACCA AC G C T C T C T G C C T CT C TT CCACA AT AC C TT T TTATCACAACAAT A TT CAAAATA
blockSeqs : T . . . . . G . . . . A . T TA . T . . T . . . . . . . . . . . . T T CAC . AC T . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . C . . . . T . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . A T CAC . AT . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . C . . . . A . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . A T CCC . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A T CAC . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T T CAA . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . A . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . G T CA . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . A . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . C A C . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . N . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . A T C . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . A . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . G A C . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . A . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . A C C . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . T . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . C T C . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons :
originalCons : GTTCATTAGCCGTTAT---TATGA-GACCA---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GT-----AAT-------------AT-AG-G-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AC-GTTGGTGAACGATC-GCC-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ACAACTCTTA-T--GTNGTCTGA-TGCAAT--C----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTAC--AAG-GGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--AACAGTGC-------AAATGGCGACGAAGAGATA
finalCons : GTTCATTAGCCGTTAT---TATGA-GACCA---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GT-----AAT-------------AT-AG-G-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AC-GTTGGTGAACGATC-GCC-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ACAACTCTTA-T--GTNGTCTGA-TGCAAT--C----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTAC--AAG-GGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--AACAGTGC-------AAATGGCGACGAAGAGATA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111 1111111 11 1111111111111 1111111
lowQualScore : 3 444 2 0 333 2 2 8 2 2 33 66666 1 3333333333333 5 333 2 666 33 66666 66 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 44 1 44 8888888 33 11 5 44 3 6666666666666 3 44 0000000
lowQualScore : . ... . . ... . . . . . .. ..... . ............. . ... . ... .. ..... .. . . . . . . . . . . . .. . .. ....... .. .. . .. . ............. . .. .......
lowQualScore : 8 111 4 3 999 1 1 4 2 5 77 77777 1 8888888888888 0 000 5 999 44 77777 33 7 7 7 7 7 7 7 9 7 7 1 22 0 00 6666666 99 88 3 22 1 9999999999999 1 22 8888888
consensus : GTTCATTAGCCGTTAT---TATGA-GACCA---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GT-----AAT-------------AT-AG-G-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AC-GTTGGTGAACGATC-GCC-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ACAACTCTTA-T--GTNGTCTGA-TGCAAT--C----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTAC--AAG-GGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--AACAGTGC-------AAATGGCGACGAAGAGATA
Reference ( family-750 ) : GTTCATTAGCCGTTAT---TATGA-GACCA---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GT-----AAT-------------AT-AG-G-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AC-GTTGGTGAACGATC-GCC-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ACAACTCTTA-T--GTNGTCTGA-TGCAAT--C----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTAC--AAG-GGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--AACAGTGC-------AAATGGCGACGAAGAGATA
gi|100017 : GTTCGTTAGCCGTTAT---TATGA-GACTA---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GT-----ATT-------------AT-AG-A-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AC-GTTGGTGAATGCTC-GCG-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ACAATTCTTA-T--GTAGTCTGA-AGCAAT--C----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTAT--AAT-GGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--AACAGTGC-------AAATGACAACAAAGAGATA
gi|100018 : GTTCTTTAGCCGTTAT---TATGA-GACCA---TAT-TAC-CAGCCTGCAGAC-A-G--GT-----TAT-------------AT-AG-G-TC-ATGT---GA--TGTT-----ACTGTGAC--A-AAT-TC-GTTGGTGAACGATC-GCC-A-TTTT-GG-ATTCGCT-TTGA-ACAACTCTTA-T--GCCGTCTGA-TGCAATCAC----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTAC--AAG-GGTAGA-------------TA-AACACGAAATTTGTA--AACAGTGC-------AAATGGCGACGAAGAGATA
gi|100019 : GTTCATTTGCCGTTAT---TATGA-GACCA---TATCTAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GT-----AAT-------------AT-AG-G-TC-ACGT---CA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AT-GTTGGTGAACGATC-GCC-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ACAACTCTTA-T--GTTGTCTGA-TGCAATCAC----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTAC--AAG-GGCAGA-------------TG-AACGCAAAGTTTCTA--AAAACTGT-------AAATGG
gi|100020 : GTTCATTAGCCGTT-T---TATGA-GAC-A---TAT-TGC-CT-CCTG-AAACCA-G--GT-----ATT-------------AT-AG-A-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AC-GTTGATGAACGCTC-GTG-A-TTTT-GC-ACTCGCT-TTGA-ACAACTCTCA-T--GAAGTCTGA-TGCAATCCC----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTAC--AAGTGGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGCA--AACAGTG--------AAATGGCAAAGAAGAGATA
gi|100021 : GTTCATTAGCCGTTAT---TATGA-GACTA---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GT-----AAT-------------ACCAG-A-CCTACGCTCCGACTTCTCCACCAGCTGCGA-----AAT-AC-AT-GGTGAATGCTC-GCG-A-TTTT-GG-AC---CT-TTGA-ACAACTCTCA-T--GAAGTCTGA-TGCAAT--C----A--CACTGTTTGTAAAGAATG-TATTAC--A-G-GGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--AACAGTGA-------AAATGGCGAAGAAGAGATA
gi|100022 : GTTCATT-GCCGTTAT---TATGATGACCA---TAT-TAC-CTGCCT--AGAC-ATG--GT-----A-T-------------AT-AG-G-CT-ACGT---GA--TCTA-----ACTGTGAC--G-AAA-ACTGTTTTAAAACGATCCGCC-A-TTTTTGG-ACTCGCT-TTGA-AAATCTCTTA-T--GTAGTCTGA--ACAAT--C----A--CACTGTTTGTAAAGAATG-TATTAT--AAG-GGCAGA-------------TGAAACACAAAG-TTGTA--AACAGTGC-------AAATGGCGACAAAGAGA
gi|100023 : GTTCATTTGCC-TTAT---T-TGA-GACCA---TAT-TAC-CTGATTG-AGAC-A-G--GT-----AAT-------------AT-AG-AATC-ACGTT--GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AC-GTTGGTGAGCGAAC-GCG-ACTTTT-GG-A-TCGCT-TTAA-A-AAATCTTA-T--GTTGTCTGATTGC-AT--CCACAA--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATCACTTAA--GACAGA-------------TA-AACACAAAGTTTGTATTTACAGTACCAAAATAAGATAGCGACGAAGA-ATA
gi|100024 : GTTCATTTGCCGTTAT---TATGA-TACTA---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GT-----AAT-------------AT-AG-G-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AC-GATGGTGAACGATG-GCC-A-TTTT-
gi|100025 : GTTCATTAACCCATAT---TATGA-TGCCA---TAT-TAC-CTGCCTGGATAC-A-G--GT-----AAT-------------AT-AT-G-TC-ATGT---GA--CCTT-----ACTGTGAC--GGAAT-TC-GTTGGTGAACCATC-GCC-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ATAGGCCTT
gi|100026 : GTTCATTTATCGTTATACCT-TGA-GACGAAATTAT-TACGCTGCCTG-AGAC---G--GT-----AAT-------------AG-AG-G--C-ACG----GA--TCTT-----ACTG-GACT-G-CATCAC--TTGGT-AACGA-C-GCCTA-TTTT-GGGACTCACTCTTAA-ACAACCTTCA-T--GTGGTCTGA-TGCAAC--C----A--C--TGTCGGT-AAGAATGCTATT
gi|100027 : GTTCATTTGCCGTTAT---NNNNN-NNNNN---NNN-NNN-NNNNNNN-NNNN-N-N--NN-----NNNNNNNNNNNNNNNAAT-AG-G-TC-ATGT---GA--TCTT-----ATTGTGAC--G-AAT-AA-GTTGGTGAACGATC-GCA-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ACAATTCT
gi|100028 : GTTCATTTGCCGTTAT---TATGA-GACCA---TAT-TAC-CTGCCTG-AAAC-A-GTTGTATCAAAAT-------------AT-AATA-TC-ACGT---GA--
gi|100029 : GTTCATTATCCGCTAT---TATGA-GACAA---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-
gi|100030 : GTTCATTAGCCGTTAT---TATGA-GACCA---TAT-T-C-CTGCCTGCAGAC-
gi|100031 : GTTCATTAGCCGTTAT---TATGA-GACCA---TAT-T-C-CTGCCTGCAGAC-
gi|100032 : GTTCATTAGCCGTCAT---TATTA-GACCA---CAT-TAC-CTGCACG-AGA
gi|100033 : AT---TGTGA-GACTA---TAT-TAC-ATGCCTG-AGAC-A-G--GT-----AAT-------------AT-AG-G-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAC-AC-GTTGGTAAACGATC-GTC-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ACAACTCTTA-T--GTCGTCTGA-TGCGATCAC----A--C--TGTTTGTAAAGAATA-TATTAC--AAG-GGCAGA-------------TG-AACAGAAAGTTTATA--AACAGCGC-------TAATGGCGACGAAGAGAT
gi|100034 : A---TAT-TAC-CTGCCTG-AGAC-A-G--GT-----ATT-------------ATTAG-A-TC-ACGT---GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AC-GTTGGTGAATGCTC-GCG-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ACAATTCTTA-T--GTAGTCTGA-AGCAAT--C----A--C--TGTTTGTAAAGAATG-TATTAT--AAT-GGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--AACAGTGC-------AAATGACAACAAAGAGATA
gi|100035 : -TAC-C-GCCTG-ATAC-A-G--GT-----AGT-------------AT-AG-A-T--ACG----GA--TCTT-----ACTGTGACACG-AAC-TC-TGTCGTAACCGATC-GCC----TTT-G--ACTCACT-TTGACACAACTCTTATT--GTGGT-TGA-TGCAAT--CA---A--C--TG-TCGT-AAGAATGTTATT
gi|100036 : T-------------AT-AG-A-TC-ATGT---GA--TCTT-----ACTGTGAC--G-AAT-AT-GTTGGTGAAC
gi|100037 : C-GCC-A-TTTT-GG-ACTCGCT-TTGA-ACAACCCTTA-T--GTAGTCTGA-AGCAAT--CAA--A--C--TGTTAGTAAAGAATG-TATTAT--AGT-GGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--
gi|100038 : CTCGCT-TTGA-ACAACTCTTA-TCTGTCGTATGA-CGCAAT--C----AATC--TCTTTGTAAAGAATG-TGGTAC--AAG-GGCAAATTATCACAACAATTG-AACACAAAATGTGT---AACTGTGC-------AAATGGCGACGAAGAGATA
gi|100039 : TCTGA-TGCAAT--C----A--CATTGTTTGAAAAGAATG-AATTAC--AAG-GGCATT-------------TG-AACACAAAGTTTGTA--AACAGTGC-------AATTTGCGACGAAGAAATA
gi|100040 : TG-TATTAC--AAG-GGCAGA-------------TG-AACACAAAGTTTCTA--AAAACTGC-------AAATGGCGACGGAGAGATA