lowQualScore                  :      22                      111111                 1111                                      11111111          8888888888                        11                555555             2222222                 2222222222222222222222                    11  2222                                                                              1111111111111111111                                                       222                                     111111111111                      33         
lowQualScore                  :      33 66     33  666    55 222222   4  666666 2   3333 2     333  2 6666  2  4   2 2 2      00000000 5555 2   7777777777   2    55    4   4   2 00  2 4 999  4    999999  22   2     1111111   555   77  22  0000000000000000000000 4   333       2 2  00  3333 22 2 4 2 2  8888888 11  2  4   99999  4 333 6  44   4     2 2 2 55  4 22  2  2222222222222222222 1    1  1 66666  1 1 1 3   5 1 2 88888888  2 2 2 2 44 111   44   22 22 4   4 4 2  2 4  2 2 2  333333333333   1    33 2  2     2 22   33    
lowQualScore                  :      .. ..     ..  ...    .. ......   .  ...... .   .... .     ...  . ....  .  .   . . .      ........ .... .   ..........   .    ..    .   .   . ..  . . ...  .    ......  ..   .     .......   ...   ..  ..  ...................... .   ...       . .  ..  .... .. . . . .  ....... ..  .  .   .....  . ... .  ..   .     . . . ..  . ..  .  ................... .    .  . .....  . . . .   . . . ........  . . . . .. ...   ..   .. .. .   . . .  . .  . . .  ............   .    .. .  .     . ..   ..    
lowQualScore                  :      33 11     11  111    00 111111   2  111111 1   2222 1     777  1 6666  1  2   1 1 1      00000000 0000 4   0000000000   4    66    7   7   4 33  4 7 777  7    555555  88   0     6666666   555   55  88  5555555555555555555555 0   555       1 1  00  2222 99 1 2 1 1  1111111 00  1  2   22222  2 777 3  88   0     0 0 0 55  0 88  0  7777777777777777777 9    9  9 77777  9 9 9 8   7 9 0 66666666  0 0 0 0 88 222   88   99 99 2   4 4 2  4 7  4 4 4  999999999999   8    22 4  4     7 33   77    
consensus                     : AAATA-AT-GTATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCA----T-ATACA---CG-C----AT-GC-GCT-C-A-CATTTT-------TC----C-ACAA----A----TAA-TAAT--CTCCCTTG-TAG-A--TT-T-T---GC-AGCA--TA--TA--CCT-ATGAT-C-----AAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA---GA--G-A-G-A-GA----T--ATATG-CA-CAT---A-CG-A---A-TA--TCA-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---G--C-ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---AT-A-A-T-G--A---TTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATC-TG-AAA--TATA
Reference ( gi|89247 )        : AAATAAAT-ATATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCA----T-ATACA---CA-C----AT-GC-GCT-C-A-CATTTT-------TC----C-ACAACTTTA----TAA-TAAT--CCCCCTTG-TAG-A--TT-T-T---GC-AGCAGCTA-CTA--CCT-ATGAT-C-----AAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA---GA--G-A-G-A-GA----T--ATATG-CA-CAT---A-CG-A---A-TA--TCA-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---G--C-ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---AT-A-A-T-G--A---TTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATC-T--AAA--TATA
gi|89246                      : AAATA--T-GTATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T--CA----T-ATA-A---CA-C----AT-GC-GCT-C-A-CATTTT-------TC----CCACAA---------TAA-TAAT--CCCC-TTG-TAG-A--TT-T-T---GC-AGCA-----TTA--CCT-ATGAT-C-----AAAA--TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AAAG-GA--G-A-G-A-GA----T--ATATG-CA-CAT---A-CG-A---A-TA--TCA-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---G--C-ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---AT-A-A-T-G--A---TTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T--A-C-A-AA----------GAAGTCCCAA--T-A--ATATC-TG-AAA--TATA
gi|89245                      : AAATA--T-GTATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCA----T-ATACG---CG-C----AT-GC-GCT-C-A-CATTTT-------TC----C-ACA-----A----TAA-TAAT--CTCCCTTG-TAG-AT-TT-T-T---GC-AGCA--TA--TA--CCTAAT--T-C-----CAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA---GA--GAA-G-A-G----------ATG-CA-CAT---A-CG-A---A-TA--TCA-TCCAA-T-C-A--GATT--TT-CA-----------GC---G--C-ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---AA-AGA-TAG--AT--TTT--GAC--A--T-CACTC-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCAAC--T-AC-ATATC-TG-AAA--TATA
gi|89248                      : AAATATTT-ATATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCAA---T-ATA-A---CG-C----AT-GCTGCT-C-A-CATTTT--------C----C-ACGA----A----TAA-TAAT--CTCCCTTG-TAG-A--TT-T-TTT-GC-AGCA--TA--TA--TCT-ATGAT-CC----AAA---TTT--CA--TT----------------------A-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA---GA--G-A-G-A-GA----T--ATGTA-C----T---A-C--A---A-TA--TCA-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---A--C-ACGT-GC-G-----AA-C-G-T-GTG-C-G-G----G---AT-A-A-T-G--GATTTTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATG-TG-AAA--TATA
gi|89249                      : AAATAG-T-GTATAT--GA---AA-T--T------GCA-CG------T-GCA----T-ATACA---CA-CC---AT-GC-GCT-C-A-CATTATA------TC----C-ACAA---------TAA-TAAT--CCCCCT-G-TAG-A--TT-T-T---GC-AGCA--TA--TA--CCT-ATGAT-C-----AAA---TTTT-CA--TT----------------------C-CAA---AAGCTT--A-TT--AAA--GA--G-A-GGA-GA----TT-ATATG-CA--AT---A-CG-A---A-TA--TCA-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---G--CAACGT-GC-G-----AG-C-G-TGGTACC-G-G----G---AT---A-T-G--A---TTT--GAC--A--T-CACGC-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGT-CCAA--T-AC-ATATC-TG-AAA--TATA
gi|89250                      : AAATA--T-GTATAT--GA---AAAT--T------GCAACG------T-GCA----T-ATACA---CG-C----AT-GC-GCT-CCA-CATTTT-------TA----C-ACAA---------TAA-TAAT--CCCCCTTG-TAG-A--TT-T-T---GCCAGCAA-TA--TA--CCT-ATGAT-C-----AAA---TTC--C---TT----------------------C-CAC---AAGCCCA-A-TT--AAA--GA--G-A-G-A-GA----T--ATATG-CAGCAT---AACG-A---A-TAA-TCA-TTCAAAT-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---G--C-ACGTGGC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----A------A-A-T-GA-A---TTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-CAA-AA----------G-AGT-CCAA--T-AC-ATATC-TG-AAA--TATA
gi|89252                      : AAATA--T-GTATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCA----T--TACA---CGGC----ATTGC-GCT-C-AACATTTT-------TC----C-ACAA---------TAA-TAAT--CTCC-TTG-TAG-A--TT-T-TT--GC-AGCA--TA--TA--CCT-ATGAT-CC----AAA---TTT---A--TT----------------------C-CAA---G---CTC-A-TTTAAA---GA--G-A-G-A-GA----T--AT-TG-CA-ATT---A-CG-A---A-TA--TCAATCCAA-T---A--GAGT--TT-CA-----------GC------C-ACGT-GC-GG----AG-C-G-T-G-G-C-G-G--------AT-A-A-T-G--A---TTT--TGC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-AGAA----------G-AGT-CCAA--T-AC-ATAAC-T--GAA--GATA
gi|89254                      : AAATATGT-TTAT-T--GA---AAAT--TAAAAATGCA-CG------T-GCACATAT-ATACA---CG-C----AT-GC-GCT-C-A-CATTTT--------C----C-ACA----------TAA-ACAT--CTCC-TTG-TAG-A--TT-TCT---GC-AGCA--TA--TA--CCT-AT-AT-CCAAAAAAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA----A--G-A-G---GA----G--AGATG--A-CAT---A-CG-A---AATA--TCA-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA--------------------------GC-G-----AG-C-G-T-GTGAC-G-G----G---AT-A-A-T-G--A----TT--GAC--A--T-CAC-CAA-AT-TAAA-C-A-AA------------AGTCCCAA--T-AC-ATATC-TGAAAA--TATAta
gi|89253                      : AAATATGT-TTAT-T--GA---AAAT--TAAAAATGCA-CG------T-GCACATAT-ATACA---CG-C----AT-GC-GCT-C-A-CATTTT--------C----C-ACA----------TAA-ACAT--CTCC-TTG-TAG-A--TT-TCT---GC-AGCA--TA--TA--CCT-AT-AT-CCAAAAAAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA----A--G-A-G---GA----G--AGATG--A-CAT---A-CG-A---AATA--TCA-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA--------------------------GC-G-----AG-C-G-T-GTGAC-G-G----G---AT-A-A-T-G--A----TT--GAC--A--T-CAC-CAA-AT-TAAA-C-A-AA------------AGTCCCAA--T-AC-ATATC-TGAAAA--TATA
gi|89258                      : AAATA--T-GTATAT--GACAGAAATCTT------GCA-CG------T-GCAC---T-ATACC---CA-CCGCAAT-GC-GCT-C-A-CATTTTGGGTTTTTC----C-ACGAAATCACGAATAA-TAAT--CTCC---G-TATTA--TT-T-T--------CAGCTA-TTATACCT-ATGAT-CC----AAA---TGT--CA--TTTTGTTTTGTGTTGTGGTGTTCTC-CAA---A-GCCTC-AATT--AAAGAGA--G-A-G-A-GG----T---TATG-TA-CATTTTA-CG-A---A-TA--TCA-TCCAA-T-C-A---A-T--TT-CAATGTGTTTGTTGC---G--C-ACGT-GCCG-----AG-CCG-TTGTG-C-G-GC---GTATAC-A-C-T-G--AGTTTTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATC-T--GAA--
gi|89262                      :  AATAA-T-ATATTC--GA---AAATC-T------GCA-TGCACCGTT-GCA----T-ATACA---CA-C----AT-GC-GCT-C-A-C-TTTT-------TC----C-ACA--TTTA----TAA-TAATAATCCCCT-G-TAG-A--TT-T-T----T-GGCA--TA-TTA--CCT-ATGTC-C-----AAA---TT---CA--TT----------------------C-AAA---AAGCC-C-A-TT--AA----A--G-A-G-A-GAGCATT--ATATG-CAACAT---A-CGGA---A-TA--TCA-TCCAA-T-C-A--GA-T--TTTCA-----------GC---GGCC-ACG--GC-G-----AG-C-GGT-GTG-C-G-G----G---AT-A-T-T-G--AA--TTT--GAC--ACAT-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-TCAATATC-TG-AAA--TATat
gi|89256                      :     AAAT-ATGTAT--AT---GAAT--T------GCAACG------T-GCA----T-ATACA---CA-C----AT-GC-GCT-C-A-CAATTT-------TC----C-ACA-----A----TAA-TAATC-CCCCCTTGTTAG-ATTTT-T-T---GC-AGCA--TA--TA--CCT-AATATCC-----AAA---TGT--CA--TT----------------------CGCAA---AAGCCTC---TTAAAA---GA--G-A-G-A-GA----T--ATATG-CA-CA----A-CGAA---A-TA--TC--TCC-A-T-CAA--GA-T--TT-CA-----------GC----------------------AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---AT-A-A-T----A---TTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAATTT-AC-ATATC-TGAAAA--TATA
gi|89257                      :     AAAT-A-ATGTTAGA---AAAT--T------GC--C-------T-GCA------ATA-A---CA-C----AT-GCTGCT-C-A-CATTTT-------TC----C-ACAA---------TAACTGAT--TCCCCTTG-TA--A--TT-T-T---GC-AGCA--TA--TA--CCT-ATGAT-CCC---AAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCTGC-A-TTA-AA---AA--G-A-G-ATGA----T--ATATG-CA--ATG--A-CG-A---A-TA--TCA-TCC-A-T-C-A---A-T--TT-CA-----------GC---A--A-ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----GA--AT-A-ACT-GAAA---TTT--GAC--A--T-CA--C-A-ATCT-AAGC-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATCTT--GAA--TATA
gi|89255                      :     AGAT-GTATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCA----T-ATACG---CG-C----AT-CC-GCT-C-A-CATTTT-------CC----C---------A----TAA-TAAT--CTCCCTTGTTAA-T--TT-T-T---GC-AGCA-CTA--TA--CCT-ATGAT-C-----CAA---ATT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA----A--G-A-G-A-GA-------AT----CA-CAT-----CG-A---A-TAGTTCATTCCAA-T-C-ACTGA-T--TT-CA-----------GC---G--C-ACGT-GC-G-----AGCC-G-T-GTG-CTG-GAGTAG---AT-A-A-T--------TTT--GACTGA--T-CAT-C-A-AT-T-AA-C-A-AA------------AGTCCAAG--T-AC-A
gi|89260                      :   aaAAATTGTATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GC-------ATACA---CG-C----AT-GC-GCT-C-A-
gi|89251                      :       AT-GTATAT--GG---AAAT--T------GCA-CG------T-GTA----T-ATACA---CG-C----AT-GT--CTGT-G-CATTTT-------TC----C-ACA-----A----TAA-TAAT---CTCCTTG-TAG-A--TTGT-T---GC-AGCA--TA--TA--CTT-ATGATCC-----AAA---TTT--CA---T----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TTA-AA---GA--G-ATG-A-GA----T--A---G-C--C-------TG-A---ATTA--TCA-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CAAG---------GC---G----ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---AT-A-A-T-G--AT--TTT--GAC--A--T--AC-C-ATAT-T-AA-C-A-AA----------A-AGTCCCAA--T-AC-A
gi|89261                      :   aattAT-GTATAT--GA---AA-T--T------GCA-CG------T--CA----T-ATACG---CG-C----AT-GC-GCT-C-A--ATTTT-------TC----C-ACAA---------TAA-TAAT--CTTCCTTG-TAG-A--TT-T-TTATGC-AGCA--TA--TA--CCT-ATGAC-C-----AAA---TTTTTCA--TT----------------------C--AA---AAGC-TC-A-TT--AAA--GA--G-A-G-A-GA----T--G---G-CA-CAA---A-CG-A-----TA--TCA-TCCAA-TTC-A--GA-T--TT-CA-----------GTTT-G--C-ACG--GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A--A-A-T-G--A---TTTTGGAC--A--TTCAC---A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGT-CCAA--TAAC-ATATC-T--GAAATTATA
gi|89259                      :    aatAT-GTATAG--GGT--AAAT--T------GCA-CG------TTGCA----TTATACAATTCA-C----A--GC-GCT-C-T-CACTTT-------TCTTTCC-ACAA---------TAA-TAAT--CTCCCTTG-TAG-AT-TT-T-T---GCTAG--ACTA--TA--CCT-ATGATCC-----AAATACTTT--CAGTTT----------------------CTCAA---AAGTCTCTA-TT--AAAC-GATGG-A-A-A-GA----T---TATGTCA-CAT---A-CC-A---A-TA--TCA-TCACA-T-C-AATGA-T--TT-CA-----------GTCGAG--C-GCGT-G---------G-C-A-T-G-G-C-C-G----G---AT-A-A-G-G--ATT-TTT--GAC--A--TCCAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AACCATCCTCATT-AGTCCCCA----AC-ATATC-TG-AAA--TATA
gi|89263                      :        aaattTAT--AA---AAAT--T------GCA-TG------T-GCA----A-ATACA---CG-C----AT-GC-GCT-C-A-CATTTT-------TC----C-ACA-----A----TAA-TAAT--CTCCCTCG-TAG-AT-TT-T-T---GT-AGCATATACCTA--TAT-ATGATCC-----AAA---TTT--TA--TT----------------------C-CAA---AAGCTT
gi|89265                      :                          T--T------GCA-CG------T-GCA----T-----G---CA-C----GT-GT-GCT-T-A--ATTTT-------
gi|89264                      :                                    atgcacacgcatgtgcgttgacatttttgactacatcattctatgggcaaacatattatctacctgtgtggtaaatattaattcattctctttattcattagaaagttacagacgttttagcattatccaatc-CTA--CCT-ATGCTGT-----AAA---TAT--CA--TT----------------------T-CAT---TATCTTA-A-TT--TA---TA--A-ACA-A-GT----T--ACGGG-CG-AAT---T-TG-------TA--TTA-TCCAA-T-C-A--AA-A--TG-CA-----------GC---A--C-ACGT-GC-A-----CG-C-A-T-GTG-C-aattgaaattttgacttc
gi|89267                      :                                                                                                          tgcacgtgcatgcgcatgcgtgtttgcaatttttattacatcagtgtgtagaactttatctttgtTA--CCT-ATGATCC-----AAA---TAT--CA--TT----------------------C-CAT---AAACCTC-A-TA--AAT--GA--G-A-G-A-G--------ATATG-TA-CAT---T-CA-A---A-TA--TCA-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---C--C-ACGT-GC-A-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---AT-A-A-G-G--AT--TTT--GAC--A--T-CAA-C-A-A
gi|89266                      :                                                                                                                                                                           tg--CCT-ATGAT-C-----CCA---TTTTTCA--TTTC--------------------C-CAACAGAAGCCTT-C-TT--AA---------A-G-A-GA----TCGATATG-CA-CATGA-G-CG-AATTA-TA--TCA-T-CAA-T-C-A--GA-TTGTT-CA-----------CC---G--C-ACCT--C-GTCAGTAG-C-G-T-GTG-C-ACG----GTT-AT-A-A-T-G--C---TTT--
gi|89265                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atatA--TTA-TCCAA-T-C-A--AA-A--TT-AA-----------GC---A--C-ACGT-GC-A-----TG-C-A-C-GTG-C-A-A----A---AT-----T-G--AAATTTT--GAC--T--T-Cctttgaca
gi|89268                      :                                                                                                                                                                                                                      atgcacacgcatgtgcgttgacatttttgactacatcattctatgggcaaacatattatctacctgtgtggtaaatattaattcattctctttattcattagaaagttacagacgttttagc-----------GC---T--C-ATGT-GC-G-----AG-C-A-T-GTG-C-G-G----G---ATTA-A-T-G--A---TTTT-GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATC-TG-AAA--TATA

lowQualScore                  :          22                     111111                 1111                                                            33333333333333333333                        1111111                                                    1111111                 1111111111111111111111                        22222                                                                            11111111111  111111                                                       222                                     111111111111                                
lowQualScore                  :          11 2      4  555    44 111111   4  555555 2   1111 1     333  3 4444  1  3  22 1 1 1    2  8888888888 4444 2  33333333333333333333   2    2    5 2  4   2 5555555  2 4 888  4  2 1 66 1 1 66666   3333    66666666 1 9999999   666   55  22  8888888888888888888888 3   333       1 1  99  00000 44 1 5  1 555555 0   1  3   88888  3 333 5  44  1 1     1 1 1 55  3 22  1  11111111111  000000 1    1  3 44444  1 1 1 3   5 1 1 6666 666 1 1 1 1 1 1 222   44   22 22 4   4 4 2  2 4  2 2 2  222222222222   1    33 2  2       7  2 2    
lowQualScore                  :          .. .      .  ...    .. ......   .  ...... .   .... .     ...  . ....  .  .  .. . . .    .  .......... .... .  ....................   .    .    . .  .   . .......  . . ...  .  . . .. . . .....   ....    ........ . .......   ...   ..  ..  ...................... .   ...       . .  ..  ..... .. . .  . ...... .   .  .   .....  . ... .  ..  . .     . . . ..  . ..  .  ...........  ...... .    .  . .....  . . . .   . . . .... ... . . . . . . ...   ..   .. .. .   . . .  . .  . . .  ............   .    .. .  .       .  . .    
lowQualScore                  :          33 2      2  888    88 555555   0  888888 0   9999 9     333  8 0000  9  8  66 9 9 9    0  4444444444 2222 0  77777777777777777777   0    0    0 0  0   0 2222222  0 0 222  0  0 9 11 8 8 44444   9999    66666666 8 4444444   888   00  55  6666666666666666666666 6   222       9 9  00  88888 55 9 7  9 111111 5   9  8   77777  8 333 7  55  9 9     9 9 9 22  8 66  9  11111111111  222222 8    8  6 55555  8 8 8 6   5 8 9 0000 000 9 9 9 9 9 9 999   55   88 88 0   2 2 1  2 4  2 2 2  666666666666   1    11 2  2       5  5 5    
consensus                     :     AAATA--T-GTATAT-GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCA----T-ATACA---CG-C----AT-GC-GC--T-C-A-CATT-TT-------T--C----C-ACA-----A----A--------TAA-TAAT-CTCCCT-TG-TAG-A-------TT-T-T---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TATG--------A-T-C-----AAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA---G-A--G-A-GA-G-A-T--ATATG-CA-CAT---A-CG-A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---G--C-ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-T-A-A-T-G-A---TTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATCTG-AA-A-TATA
Reference ( family-743 )      :     AAATAA-T-GTATAT-GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCA----T-ATACA---CG-C----AT-GC-GC--T-C-A-CATT-TT-------T--C----C-ACA-----A----A--------TAA-TAAT-CTCCCT-TG-TAG-A-------TT-T-T---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TATG--------A-T-C-----AAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA---G-A--G-A-GA-G-A-T--ATATG-CA-CAT---A-CG-A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---G--C-ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-T-A-A-T-G-A---TTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATCTG-AA-A-TATA
gi|89245                      :     AAATA--T-GTATAT-GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCA----T-ATACG---CG-C----AT-GC-GC--T-C-A-CATT-TT-------T--C----C-AC------A----A--------TAA-TAAT-CTCCCT-TG-TAG-AT------TT-T-T---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TA----------ATT-C-----CAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA---G-A--GAA-GA-G--------ATG-CA-CAT---A-CG-A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GATT--TT-CA-----------GC---G--C-ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-A-AGA-TAG-AT--TTT--GAC--A--T-CACTC-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCAAC--T-AC-ATATCTG-AA-A-TATA
gi|89246                      :     AAATA--T-GTATAT-GA---AAAT--T------GCA-CG------T--CA----T-ATA-A---CA-C----AT-GC-GC--T-C-A-CATT-TT-------T--C----CCACA-----A-------------TAA-TAAT-C-CCCT-TG-TAG-A-------TT-T-T---GC-AG-C-A--T---T-----ACC----TATG--------A-T-C-----AAAA--TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AAAG-G-A--G-A-GA-G-A-T--ATATG-CA-CAT---A-CG-A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---G--C-ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-T-A-A-T-G-A---TTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T--A-C-A-AA----------GAAGTCCCAA--T-A--ATATCTG-AA-A-TATA
gi|89247                      :     AAATAAAT-ATATAT-GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCA----T-ATACA---CA-C----AT-GC-GC--T-C-A-CATT-TT-------T--C----C-ACA-----ACTTTA--------TAA-TAAT-CCCCCT-TG-TAG-A-------TT-T-T---GC-AG-C-AGCT-ACT-----ACC----TATG--------A-T-C-----AAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA---G-A--G-A-GA-G-A-T--ATATG-CA-CAT---A-CG-A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---G--C-ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-T-A-A-T-G-A---TTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATCT--AA-A-TATA
gi|89248                      :     AAATAT-TTATATAT-GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCAA---T-ATA-A---CG-C----AT-GCTGC--T-C-A-CATT-TT----------C----C-ACG-----A----A--------TAA-TAAT-CTCCCT-TG-TAG-A-------TT-T-TTT-GC-AG-C-A--T-A-T-----ATC----TATG--------A-T-CC----AAA---TTT--CA--TT----------------------A-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA---G-A--G-A-GA-G-A-T--ATGTA-C----T---A-C--A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---A--C-ACGT-GC-G-----AA-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-T-A-A-T-G-GATTTTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATGTG-AA-A-TATA
gi|89249                      :     AAATAG-T-GTATAT-GA---AA-T--T------GCA-CG------T-GCA----T-ATACA---CACC----AT-GC-GC--T-C-A-CATTATA-------T--C----C-AC------A----A--------TAA-TAAT-C-CCCC-TG-TAG-A-------TT-T-T---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TATG--------A-T-C-----AAAT--TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAG-CTT-A-TTA-AA---G-A--G-AGGA-G-ATT--ATATG-CA--AT---A-CG-A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---G--CAACGT-GC-G-----AG-C-G-TGGTACC-G-G----G---A-T---A-T-G-A---TTT--GAC--A--T-CACGC-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGT-CCAA--T-AC-ATATCTG-AA-A-TATA
gi|89250                      :     AAATA--T-GTATAT-GA---AAAT--T------GCAACG------T-GCA----T-ATACA---CG-C----AT-GC-GC--T-CCA-CATT-TT-------T--A----C-ACA-----A-------------TAA-TAAT-CCCCCT-TG-TAG-A-------TT-T-T---GCCAG-C-AA-T-A-T-----ACC----TATG--------A-T-C-----AAA---TTC--C---TT----------------------C-CAC---AAGCCCA-A-TT--AAA--G-A--G-A-GA-G-A-T--ATATG-CAGCAT---AACG-A---A-TAA-TC-A-TTCAAAT-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---G--C-ACGTGGC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----A-------A-A-T-GAA---TTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-CAA-AA----------G-AGT-CCAA--T-AC-ATATCTG-AA-A-TATA
gi|89251                      :      AATTA-T-GTATAT-GG---AAAT--T------GCA-CG------T-GTA----T-ATACA---CG-C----AT-GT--C--TGT-G-CATT-TT-------T--C----C-AC------A----A--------TAA-TAAT-CT-CCT-TG-TAG-A-------TTGT-T---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACT----TATG--------A-TCC-----AAA---TTT--CA---T----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TTA-AA---G-A--G-ATGA-G-A-T--A---G-C--C-------TG-A---ATTA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CAAG---------GC---G----ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-T-A-A-T-G-AT--TTT--GAC--A--T--AC-C-ATAT-T-AA-C-A-AA----------A-AGTCCCAA--T-AC-A
gi|89252                      :     AAATA--T-GTATAT-GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCA----T--TACA---CGGC----ATTGC-GC--T-C-AACATT-TT-------T--C----C-ACA-----A-------------TAA-TAAT-CTCC-T-TG-TAG-A-------TT-T-TT--GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TATG--------A-TCC-----AAA---TTT---A--TT----------------------C-CAA---G---CTC-A-TTTAAA---G-A--G-A-GA-G-A-T--AT-TG-CA-ATT---A-CG-A---A-TA--TCAA-TCCAA-T---A--GAGT--TT-CA-----------GC------C-ACGT-GCGG-----AG-C-G-T-G-G-C---G----G---A-T-A-A-T-G-A---TTT--TGC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-AGAA----------G-AGT-CCAA--T-AC-ATAACTG-AAGA-TATA
gi|89253                      :     AAATA--T-GTTTATTGA---AAAT--TAAAAATGCA-CG------T-GCACATAT-ATACA---CG-C----AT-GC-GC--T-C-A-CATT-TT----------C----C-ACA-------------------TAA-ACAT-CTCC-T-TG-TAG-A-------TT-TCT---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TAT---------A-T-CCAAAAAAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA-----A--G-A-G--G-A-G--AGATG--A-CAT---A-CG-A---AATA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA--------------------------GC-G-----AG-C-G-T-GTGAC-G-G----G---A-T-A-A-T-G-A----TT--GAC--A--T-CAC-CAA-AT-TAAA-C-A-AA------------AGTCCCAA--T-AC-ATATCTGAAA-A-TATA
gi|89254                      :     AAATA--T-GTTTATTGA---AAAT--TAAAAATGCA-CG------T-GCACATAT-ATACA---CG-C----AT-GC-GC--T-C-A-CATT-TT----------C----C-ACA-------------------TAA-ACAT-CTCC-T-TG-TAG-A-------TT-TCT---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TAT---------A-T-CCAAAAAAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA-----A--G-A-G--G-A-G--AGATG--A-CAT---A-CG-A---AATA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA--------------------------GC-G-----AG-C-G-T-GTGAC-G-G----G---A-T-A-A-T-G-A----TT--GAC--A--T-CAC-CAA-AT-TAAA-C-A-AA------------AGTCCCAA--T-AC-ATATCTGAAA-A-TATA
gi|89255                      :          A-T-GTATAT-GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCA----T-ATACG---CG-C----AT-CC-GC--T-C-A-CATT-TT-------C--C----C--------------A--------TAA-TAAT-CTCCCT-TGTTAA-T-------TT-T-T---GC-AG-C-AC-T-A-T-----ACC----TATG--------A-T-C-----CAA---ATT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA-----A--G-A-GA-G-A----AT----CA-CAT-----CG-A---A-TAGTTC-ATTCCAA-T-C-ACTGA-T--TT-CA-----------GC---G--C-ACGT-GC-G-----AGCC-G-T-GTG-CTG-GAGTAG---A-T-A-A-T-------TTT--GACTGA--T-CAT-C-A-AT-T-AA-C-A-AA------------AGTCCAAG--T-AC-A
gi|89256                      : aaagAAATA--T-GTATAT-GA---A--T--T------GCAACG------T-GCA----T-ATACA---CA-C----AT-GC-GC--T-C-A-CAAT-TT-------T--C----C-AC------A----A--------TAA-TAATCCCCCCT-TGTTAG-ATT-----TT-T-T---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TAAT--------A-TCC-----AAA---TGT--CA--TT----------------------CGCAA---AAGCCTC---TTAAAA---G-A--G-A-GA-G-A-T--ATATG-CA-CA----A-CGAA---A-TA--TC---TCC-A-T-CAA--GA-T--TT-CA-----------GC----------------------AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-T-A-A-T---A---TTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAATTT-AC-ATATCTGAAA-A-TATA
gi|89257                      :     AAATAA-T-GT-TA--GA---AAAT--T------GC--C-------T-GCA------ATA-A---CA-C----AT-GCTGC--T-C-A-CATT-TT-------T--C----C-ACA-----A-------------TAACTGAT-TCCCCT-TG-TA--A-------TT-T-T---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TATG--------A-T-CCC---AAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCTGC-A-TT--AA---A-AA-G-A-GATG-A-T--ATATG-CA--ATG--A-CG-A---A-TA--TC-A-TCCA--T-C-A---A-T--TT-CA-----------GC---A--A-ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---AAT-A-ACT-G-AAA-TTT--GAC--A--T-CAC---A-ATCT-AAGC-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATCTT-GA-A-TATA
gi|89258                      :     AAATA--T-GTATAT-GACAGAAATCTT------GCA-CG------T-GCAC---T-ATACC---CA-CCGCAAT-GC-GC--T-C-A-CATT-TTGGGTTTTT--C----C-ACG-----A----AATCACGAATAA-TAAT-CTCC----G-TATTA-------TT-T-T----C-AG-CTA--TTA-T-----ACC----TATG--------A-T-CC----AAA---TGT--CA--TTTTGTTTTGTGTTGTGGTGTTCTC-CAA---A-GCCTC-AATT--AAAGAG-A--G-A-GA-G-G-T---TATG-TA-CATTTTA-CG-A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A---A-T--TT-CAATGTGTTTGTTGC---G--C-ACGT-GCCG-----AG-CCG-TTGTG-C-G-GC---GTATA-C-A-C-T-G-AGTTTTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATCTG-AA-A-
gi|89259                      :     AAATTA-T-GTATAG-GGT--AAAT--T------GCA-CG------TTGCA----TTATACAATTCA-C----A--GC-GC--T-C-T-CACT-TT-------T--CTTTCC-ACA-----A-------------TAA-TAAT-CTCCCT-TG-TAG-AT------TT-T-T---GCTAG-A-C--T-A-T-----ACC----TATG--------A-TCC-----AAATACTTT--CAGTTT----------------------CTCAA---AAGTCTCTA-TT--AAAC-G-ATGG-A-AA-G-A-T---TATGTCA-CAT---A-CC-A---A-TA--TC-A-TCACA-T-C-AATGA-T--TT-CA-----------GTCGAG--C-GCGT-G---------G-C-A-T-G-G-C-C-G----G---A-T-A-A-G-G-ATT-TTT--GAC--A--TCCAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AACCATCCTCATT-AGTCCCCA----AC-ATATCTG-AA-A-TATA
gi|89260                      :     AAAT---T-GTATAT-GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GC-------ATACA---CG-C----AT-GC-GC--T-C-A-
gi|89261                      :      AATA--T-GTATAT-GA---AA-T--T------GCA-CG------T--CA----T-ATACG---CG-C----AT-GC-GC--T-C-A--ATT-TT-------T--C----C-ACA-----A-------------TAA-TAAT-CTTCCT-TG-TAG-A-------TT-T-TTATGC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TATG--------A-C-C-----AAA---TTTTTCA--TT----------------------C--AA---AAGC-TC-A-TT--AAA--G-A--G-A-GA-G-A-T--G---G-CA-CAA---A-CG-A-----TA--TC-A-TCCAA-TTC-A--GA-T--TT-CA-----------GTTT-G--C-ACG--GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A---A-A-T-G-A---TTTTGGAC--A--TTCAC---A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGT-CCAA--TAAC-ATATCTG-AA-ATTATA
gi|89262                      :      AATAA-T-ATATTC-GA---AAATC-T------GCA-TGCACCGTT-GCA----T-ATACA---CA-C----AT-GC-GC--T-C-A-C-TT-TT-------T--C----C-ACATTTATA----A--------TAA-TAAT-CCCC---TG-TAG-A-------TT-T-T----T-GG-C-A--T-A-TT----ACC----TATG--------T-C-C-----AAA---TT---CA--TT----------------------C-AAA---AAGCC-C-A-TT--AAA--G-A--G-A-GA-GCA-TT-ATATG-CAACAT---A-CGGA---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TTTCA-----------GC---GGCC-ACG--GC-G-----AG-C-GGT-GTG-C-G-G----G---A-T-A-T-T-G-AA--TTT--GAC--ACAT-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-TCAATATCTG-AA-A-TAT
gi|89263                      :                 TAT-AA---AAAT--T------GCA-TG------T-GCA----A-ATACA---CG-C----AT-GC-GC--T-C-A-CATT-TT-------T--C----C-AC------A----A--------TAA-TAAT-CTCCCT-CG-TAG-AT------TT-T-T---GT-AG-C-A--T-A-T-----ACCTATATATG--------A-TCC-----AAA---TTT--TA--TT----------------------C-CAA---AAGCTT
gi|89264                      :                              --T------GCA-CG------T-GCA----T-GCGCA---TG-C----GT-GT-TT--G-C-A--ATT-TT-------T----------------------A--------TTA-CA----TCAGTGTG-TAG-AACTTTATCT-T-T---G----------T-C-T-----ACC----TATG--------C-TGT-----AAA---TAT--CA--TT----------------------T-CAT---TATCTTA-A-TT--TA---T-A--A-ACAA-G-T-T--ACGGG-CG-AAT---T-TG-------TA--TT-A-TCCAA-T-C-A--AA-A--TG-CA-----------GC---A--C-ACGT-GC-A-----CG-C-A-T-GTG-C-
gi|89265                      :                                                       A----T-GCACA---CG-C----AT-GT-GCGTT-G-A-CATT-TT-------TGAC----T-ACA-----------------------TCAT--TC----TA-TGG------------------GC-AAAC-A--T-A-TTATCTACC----TGTGTGGTAAATA-T-T-----AA-----TT--CA--TT----------------------C-T--------CTTT-A-TT--CA---TTA--G-A-AA-G-T-T--ACA-G--A-CGT---T-TT-A---G-CA--TT-A-TCCAA-T-C-A--AA-A--TT-AA-----------GC---A--C-ACGT-GC-A-----TG-C-A-C-GTG-C-A-A----A---A-T-----T-G-AAATTTT--GAC--T--T-C
gi|89266                      :                                                                                                                                                                                           -A--T-A-T------CC----TATG--------A-T-C-----CCA---TTTTTCA--TTTC--------------------C-CAACAGAAGCCTT-C-TT--AA----------A-GA-G-A-TCGATATG-CA-CATGA-G-CG-AATTA-TA--TC-A-T-CAA-T-C-A--GA-TTGTT-CA-----------CC---G--C-ACCT--C-GTCAGTAG-C-G-T-GTG-C-ACG----GTT-A-T-A-A-T-G-C---TTT--
gi|89267                      :                                                                                                                                                                                             --T-G-T-----ACC----TATG--------A-TCC-----AAA---TAT--CA--TT----------------------C-CAT---AAACCTC-A-TA--AAT--G-A--G-A-GA-G------ATATG-TA-CAT---T-CA-A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---C--C-ACGT-GC-A-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-T-A-A-G-G-AT--TTT--GAC--A--T-CAA-C-A-Actttgaca
gi|89268                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -----------GC---T--C-ATGT-GC-G-----AG-C-A-T-GTG-C-G-G----G---A-TTA-A-T-G-A---TTTT-GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATCTG-AA-A-TATA

lowQualScore                  :                                111111                 1111                                                            33333333333333333333                        1111111                                                    1111111                 1111111111111111111111                        22222                                                                            11111111111  111111                                                       222                                     111111111111                                
lowQualScore                  :     2 77 33      77  555    44 111111   4  555555 2   1111 1     333  3 4444  1  3  22 1 1 1    2  8888888888 4444 2  33333333333333333333   2    2    5 2  4   2 5555555  2 4 888  4  2 1 66 1 1 66666   3333    66666666 1 9999999   666   55  22  8888888888888888888888 3   333       1 1  99  00000 44 1 5  1 555555 0   1  3   88888  3 333 5  44  1 1     1 1 1 55  3 22  1  11111111111  000000 1    1  3 44444  1 1 1 3   5 1 1 6666 666 1 1 1 1 1 1 222   44   22 22 4   4 4 2  2 4  2 2 2  222222222222   1    33 2  2       7  2 2    
lowQualScore                  :     . .. ..      ..  ...    .. ......   .  ...... .   .... .     ...  . ....  .  .  .. . . .    .  .......... .... .  ....................   .    .    . .  .   . .......  . . ...  .  . . .. . . .....   ....    ........ . .......   ...   ..  ..  ...................... .   ...       . .  ..  ..... .. . .  . ...... .   .  .   .....  . ... .  ..  . .     . . . ..  . ..  .  ...........  ...... .    .  . .....  . . . .   . . . .... ... . . . . . . ...   ..   .. .. .   . . .  . .  . . .  ............   .    .. .  .       .  . .    
lowQualScore                  :     2 55 11      11  888    88 555555   0  888888 0   9999 9     333  8 0000  9  8  66 9 9 9    0  4444444444 2222 0  77777777777777777777   0    0    0 0  0   0 2222222  0 0 222  0  0 9 11 8 8 44444   9999    66666666 8 4444444   888   00  55  6666666666666666666666 6   222       9 9  00  88888 55 9 7  9 111111 5   9  8   77777  8 333 7  55  9 9     9 9 9 22  8 66  9  11111111111  222222 8    8  6 55555  8 8 8 6   5 8 9 0000 000 9 9 9 9 9 9 999   55   88 88 0   2 2 1  2 4  2 2 2  666666666666   1    11 2  2       5  5 5    
consensus                     : AAAT-A--T--GTATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCA----T-ATACA---CG-C----AT-GC-GC--T-C-A-CATT-TT-------T--C----C-ACA-----A----A--------TAA-TAAT-CTCCCT-TG-TAG-A-------TT-T-T---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TATG--------A-T-C-----AAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA---G-A--G-A-GA-G-A-T--ATATG-CA-CAT---A-CG-A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---G--C-ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-T-A-A-T-G-A---TTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATCTG-AA-A-TATA
Reference ( family-743 )      : AAAT-A--T--GTATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCA----T-ATACA---CG-C----AT-GC-GC--T-C-A-CATT-TT-------T--C----C-ACA-----A----A--------TAA-TAAT-CTCCCT-TG-TAG-A-------TT-T-T---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TATG--------A-T-C-----AAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA---G-A--G-A-GA-G-A-T--ATATG-CA-CAT---A-CG-A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---G--C-ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-T-A-A-T-G-A---TTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATCTG-AA-A-TATA
gi|89245                      : AAAT-A--T--GTATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCA----T-ATACG---CG-C----AT-GC-GC--T-C-A-CATT-TT-------T--C----C-AC------A----A--------TAA-TAAT-CTCCCT-TG-TAG-AT------TT-T-T---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TA----------ATT-C-----CAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA---G-A--GAA-GA-G--------ATG-CA-CAT---A-CG-A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GATT--TT-CA-----------GC---G--C-ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-A-AGA-TAG-AT--TTT--GAC--A--T-CACTC-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCAAC--T-AC-ATATCTG-AA-A-TATA
gi|89246                      : AAAT-A--T--GTATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T--CA----T-ATA-A---CA-C----AT-GC-GC--T-C-A-CATT-TT-------T--C----CCACA-----A-------------TAA-TAAT-C-CCCT-TG-TAG-A-------TT-T-T---GC-AG-C-A--T---T-----ACC----TATG--------A-T-C-----AAAA--TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AAAG-G-A--G-A-GA-G-A-T--ATATG-CA-CAT---A-CG-A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---G--C-ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-T-A-A-T-G-A---TTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T--A-C-A-AA----------GAAGTCCCAA--T-A--ATATCTG-AA-A-TATA
gi|89247                      : AAAT-AAAT--ATATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCA----T-ATACA---CA-C----AT-GC-GC--T-C-A-CATT-TT-------T--C----C-ACA-----ACTTTA--------TAA-TAAT-CCCCCT-TG-TAG-A-------TT-T-T---GC-AG-C-AGCT-ACT-----ACC----TATG--------A-T-C-----AAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA---G-A--G-A-GA-G-A-T--ATATG-CA-CAT---A-CG-A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---G--C-ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-T-A-A-T-G-A---TTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATCT--AA-A-TATA
gi|89248                      : AAAT-A--TTTATATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCAA---T-ATA-A---CG-C----AT-GCTGC--T-C-A-CATT-TT----------C----C-ACG-----A----A--------TAA-TAAT-CTCCCT-TG-TAG-A-------TT-T-TTT-GC-AG-C-A--T-A-T-----ATC----TATG--------A-T-CC----AAA---TTT--CA--TT----------------------A-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA---G-A--G-A-GA-G-A-T--ATGTA-C----T---A-C--A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---A--C-ACGT-GC-G-----AA-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-T-A-A-T-G-GATTTTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATGTG-AA-A-TATA
gi|89249                      : AAAT-AG-T--GTATAT--GA---AA-T--T------GCA-CG------T-GCA----T-ATACA---CACC----AT-GC-GC--T-C-A-CATTATA-------T--C----C-AC------A----A--------TAA-TAAT-C-CCCC-TG-TAG-A-------TT-T-T---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TATG--------A-T-C-----AAAT--TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAG-CTT-A-TTA-AA---G-A--G-AGGA-G-ATT--ATATG-CA--AT---A-CG-A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---G--CAACGT-GC-G-----AG-C-G-TGGTACC-G-G----G---A-T---A-T-G-A---TTT--GAC--A--T-CACGC-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGT-CCAA--T-AC-ATATCTG-AA-A-TATA
gi|89250                      : AAAT-A--T--GTATAT--GA---AAAT--T------GCAACG------T-GCA----T-ATACA---CG-C----AT-GC-GC--T-CCA-CATT-TT-------T--A----C-ACA-----A-------------TAA-TAAT-CCCCCT-TG-TAG-A-------TT-T-T---GCCAG-C-AA-T-A-T-----ACC----TATG--------A-T-C-----AAA---TTC--C---TT----------------------C-CAC---AAGCCCA-A-TT--AAA--G-A--G-A-GA-G-A-T--ATATG-CAGCAT---AACG-A---A-TAA-TC-A-TTCAAAT-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---G--C-ACGTGGC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----A-------A-A-T-GAA---TTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-CAA-AA----------G-AGT-CCAA--T-AC-ATATCTG-AA-A-TATA
gi|89251                      : AATT-A--T--GTATAT--GG---AAAT--T------GCA-CG------T-GTA----T-ATACA---CG-C----AT-GT--C--TGT-G-CATT-TT-------T--C----C-AC------A----A--------TAA-TAAT-CT-CCT-TG-TAG-A-------TTGT-T---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACT----TATG--------A-TCC-----AAA---TTT--CA---T----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TTA-AA---G-A--G-ATGA-G-A-T--A---G-C--C-------TG-A---ATTA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CAAG---------GC---G----ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-T-A-A-T-G-AT--TTT--GAC--A--T--AC-C-ATAT-T-AA-C-A-AA----------A-AGTCCCAA--T-AC-A
gi|89252                      : AAAT-A--T--GTATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCA----T--TACA---CGGC----ATTGC-GC--T-C-AACATT-TT-------T--C----C-ACA-----A-------------TAA-TAAT-CTCC-T-TG-TAG-A-------TT-T-TT--GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TATG--------A-TCC-----AAA---TTT---A--TT----------------------C-CAA---G---CTC-A-TTTAAA---G-A--G-A-GA-G-A-T--AT-TG-CA-ATT---A-CG-A---A-TA--TCAA-TCCAA-T---A--GAGT--TT-CA-----------GC------C-ACGT-GCGG-----AG-C-G-T-G-G-C---G----G---A-T-A-A-T-G-A---TTT--TGC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-AGAA----------G-AGT-CCAA--T-AC-ATAACTG-AAGA-TATA
gi|89253                      : AAAT-A--T--GTTTATT-GA---AAAT--TAAAAATGCA-CG------T-GCACATAT-ATACA---CG-C----AT-GC-GC--T-C-A-CATT-TT----------C----C-ACA-------------------TAA-ACAT-CTCC-T-TG-TAG-A-------TT-TCT---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TAT---------A-T-CCAAAAAAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA-----A--G-A-G--G-A-G--AGATG--A-CAT---A-CG-A---AATA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA--------------------------GC-G-----AG-C-G-T-GTGAC-G-G----G---A-T-A-A-T-G-A----TT--GAC--A--T-CAC-CAA-AT-TAAA-C-A-AA------------AGTCCCAA--T-AC-ATATCTGAAA-A-TATA
gi|89254                      : AAAT-A--T--GTTTATT-GA---AAAT--TAAAAATGCA-CG------T-GCACATAT-ATACA---CG-C----AT-GC-GC--T-C-A-CATT-TT----------C----C-ACA-------------------TAA-ACAT-CTCC-T-TG-TAG-A-------TT-TCT---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TAT---------A-T-CCAAAAAAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA-----A--G-A-G--G-A-G--AGATG--A-CAT---A-CG-A---AATA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA--------------------------GC-G-----AG-C-G-T-GTGAC-G-G----G---A-T-A-A-T-G-A----TT--GAC--A--T-CAC-CAA-AT-TAAA-C-A-AA------------AGTCCCAA--T-AC-ATATCTGAAA-A-TATA
gi|89255                      : AAAG-A--T--GTATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCA----T-ATACG---CG-C----AT-CC-GC--T-C-A-CATT-TT-------C--C----C--------------A--------TAA-TAAT-CTCCCT-TGTTAA-T-------TT-T-T---GC-AG-C-AC-T-A-T-----ACC----TATG--------A-T-C-----CAA---ATT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA-----A--G-A-GA-G-A----AT----CA-CAT-----CG-A---A-TAGTTC-ATTCCAA-T-C-ACTGA-T--TT-CA-----------GC---G--C-ACGT-GC-G-----AGCC-G-T-GTG-CTG-GAGTAG---A-T-A-A-T-------TTT--GACTGA--T-CAT-C-A-AT-T-AA-C-A-AA------------AGTCCAAG--T-AC-A
gi|89256                      : AAAT-A--T--GTATAT--GA---A--T--T------GCAACG------T-GCA----T-ATACA---CA-C----AT-GC-GC--T-C-A-CAAT-TT-------T--C----C-AC------A----A--------TAA-TAATCCCCCCT-TGTTAG-ATT-----TT-T-T---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TAAT--------A-TCC-----AAA---TGT--CA--TT----------------------CGCAA---AAGCCTC---TTAAAA---G-A--G-A-GA-G-A-T--ATATG-CA-CA----A-CGAA---A-TA--TC---TCC-A-T-CAA--GA-T--TT-CA-----------GC----------------------AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-T-A-A-T---A---TTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAATTT-AC-ATATCTGAAA-A-TATA
gi|89257                      : AAAT-AA-T--GT-TA---GA---AAAT--T------GC--C-------T-GCA------ATA-A---CA-C----AT-GCTGC--T-C-A-CATT-TT-------T--C----C-ACA-----A-------------TAACTGAT-TCCCCT-TG-TA--A-------TT-T-T---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TATG--------A-T-CCC---AAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCTGC-A-TT--AA---A-AA-G-A-GATG-A-T--ATATG-CA--ATG--A-CG-A---A-TA--TC-A-TCCA--T-C-A---A-T--TT-CA-----------GC---A--A-ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---AAT-A-ACT-G-AAA-TTT--GAC--A--T-CAC---A-ATCT-AAGC-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATCTT-GA-A-TATA
gi|89258                      : AAAT-A--T--GTATAT--GACAGAAATCTT------GCA-CG------T-GCAC---T-ATACC---CA-CCGCAAT-GC-GC--T-C-A-CATT-TTGGGTTTTT--C----C-ACG-----A----AATCACGAATAA-TAAT-CTCC----G-TATTA-------TT-T-T----C-AG-CTA--TTA-T-----ACC----TATG--------A-T-CC----AAA---TGT--CA--TTTTGTTTTGTGTTGTGGTGTTCTC-CAA---A-GCCTC-AATT--AAAGAG-A--G-A-GA-G-G-T---TATG-TA-CATTTTA-CG-A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A---A-T--TT-CAATGTGTTTGTTGC---G--C-ACGT-GCCG-----AG-CCG-TTGTG-C-G-GC---GTATA-C-A-C-T-G-AGTTTTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATCTG-AA-A-
gi|89259                      : AAATTA--T--GTATAG--GGT--AAAT--T------GCA-CG------TTGCA----TTATACAATTCA-C----A--GC-GC--T-C-T-CACT-TT-------T--CTTTCC-ACA-----A-------------TAA-TAAT-CTCCCT-TG-TAG-AT------TT-T-T---GCTAG-A-C--T-A-T-----ACC----TATG--------A-TCC-----AAATACTTT--CAGTTT----------------------CTCAA---AAGTCTCTA-TT--AAAC-G-ATGG-A-AA-G-A-T---TATGTCA-CAT---A-CC-A---A-TA--TC-A-TCACA-T-C-AATGA-T--TT-CA-----------GTCGAG--C-GCGT-G---------G-C-A-T-G-G-C-C-G----G---A-T-A-A-G-G-ATT-TTT--GAC--A--TCCAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AACCATCCTCATT-AGTCCCCA----AC-ATATCTG-AA-A-TATA
gi|89260                      : AAAT----T--GTATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GC-------ATACA---CG-C----AT-GC-GC--T-C-A-
gi|89261                      :  AAT-A--T--GTATAT--GA---AA-T--T------GCA-CG------T--CA----T-ATACG---CG-C----AT-GC-GC--T-C-A--ATT-TT-------T--C----C-ACA-----A-------------TAA-TAAT-CTTCCT-TG-TAG-A-------TT-T-TTATGC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TATG--------A-C-C-----AAA---TTTTTCA--TT----------------------C--AA---AAGC-TC-A-TT--AAA--G-A--G-A-GA-G-A-T--G---G-CA-CAA---A-CG-A-----TA--TC-A-TCCAA-TTC-A--GA-T--TT-CA-----------GTTT-G--C-ACG--GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A---A-A-T-G-A---TTTTGGAC--A--TTCAC---A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGT-CCAA--TAAC-ATATCTG-AA-ATTATA
gi|89262                      :  AAT-A-----ATATATTCGA---AAATC-T------GCA-TGCACCGTT-GCA----T-ATACA---CA-C----AT-GC-GC--T-C-A-C-TT-TT-------T--C----C-ACATTTATA----A--------TAA-TAAT-CCCC---TG-TAG-A-------TT-T-T----T-GG-C-A--T-A-TT----ACC----TATG--------T-C-C-----AAA---TT---CA--TT----------------------C-AAA---AAGCC-C-A-TT--AAA--G-A--G-A-GA-GCA-TT-ATATG-CAACAT---A-CGGA---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TTTCA-----------GC---GGCC-ACG--GC-G-----AG-C-GGT-GTG-C-G-G----G---A-T-A-T-T-G-AA--TTT--GAC--ACAT-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-TCAATATCTG-AA-A-TAT
gi|89263                      :               TAT--AA---AAAT--T------GCA-TG------T-GCA----A-ATACA---CG-C----AT-GC-GC--T-C-A-CATT-TT-------T--C----C-AC------A----A--------TAA-TAAT-CTCCCT-CG-TAG-AT------TT-T-T---GT-AG-C-A--T-A-T-----ACCTATATATG--------A-TCC-----AAA---TTT--TA--TT----------------------C-CAA---AAGCTT
gi|89264                      :                             --T------GCA-CG------T-GCA----T-GCGCA---TG-C----GT-GT-TT--G-C-A--ATT-TT-------T----------------------A--------TTA-CA----TCAGTGTG-TAG-AACTTTATCT-T-T---G----------T-C-T-----ACC----TATG--------C-TGT-----AAA---TAT--CA--TT----------------------T-CAT---TATCTTA-A-TT--TA---T-A--A-ACAA-G-T-T--ACGGG-CG-AAT---T-TG-------TA--TT-A-TCCAA-T-C-A--AA-A--TG-CA-----------GC---A--C-ACGT-GC-A-----CG-C-A-T-GTG-C-
gi|89265                      :                                                      A----T-GCACA---CG-C----AT-GT-GCGTT-G-A-CATT-TT-------TGAC----T-ACA-----------------------TCAT--TC----TA-TGG------------------GC-AAAC-A--T-A-TTATCTACC----TGTGTGGTAAATA-T-T-----AA-----TT--CA--TT----------------------C-T--------CTTT-A-TT--CA---TTA--G-A-AA-G-T-T--ACA-G--A-CGT---T-TT-A---G-CA--TT-A-TCCAA-T-C-A--AA-A--TT-AA-----------GC---A--C-ACGT-GC-A-----TG-C-A-C-GTG-C-A-A----A---A-T-----T-G-AAATTTT--GAC--T--T-C
gi|89266                      :                                                                                                                                                                                          -A--T-A-T------CC----TATG--------A-T-C-----CCA---TTTTTCA--TTTC--------------------C-CAACAGAAGCCTT-C-TT--AA----------A-GA-G-A-TCGATATG-CA-CATGA-G-CG-AATTA-TA--TC-A-T-CAA-T-C-A--GA-TTGTT-CA-----------CC---G--C-ACCT--C-GTCAGTAG-C-G-T-GTG-C-ACG----GTT-A-T-A-A-T-G-C---TTT--
gi|89267                      :                                                                                                                                                                                            --T-G-T-----ACC----TATG--------A-TCC-----AAA---TAT--CA--TT----------------------C-CAT---AAACCTC-A-TA--AAT--G-A--G-A-GA-G------ATATG-TA-CAT---T-CA-A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---C--C-ACGT-GC-A-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-T-A-A-G-G-AT--TTT--GAC--A--T-CAA-C-A-Actttgaca
gi|89268                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -----------GC---T--C-ATGT-GC-G-----AG-C-A-T-GTG-C-G-G----G---A-TTA-A-T-G-A---TTTT-GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATCTG-AA-A-TATA

lowQualScore                  :                                111111                 1111                                                            33333333333333333333                        1111111                                                    1111111                 1111111111111111111111                        22222                                                                            11111111111  111111                                                       222                                     111111111111                                
lowQualScore                  :     2 77 33      77  555    44 111111   4  555555 2   1111 1     333  3 4444  1  3  22 1 1 1    2  8888888888 4444 2  33333333333333333333   2    2    5 2  4   2 5555555  2 4 888  4  2 1 66 1 1 66666   3333    66666666 1 9999999   666   55  22  8888888888888888888888 3   333       1 1  99  00000 44 1 5  1 555555 0   1  3   88888  3 333 5  44  1 1     1 1 1 55  3 22  1  11111111111  000000 1    1  3 44444  1 1 1 3   5 1 1 6666 666 1 1 1 1 1 1 222   44   22 22 4   4 4 2  2 4  2 2 2  222222222222   1    33 2  2       7  2 2    
lowQualScore                  :     . .. ..      ..  ...    .. ......   .  ...... .   .... .     ...  . ....  .  .  .. . . .    .  .......... .... .  ....................   .    .    . .  .   . .......  . . ...  .  . . .. . . .....   ....    ........ . .......   ...   ..  ..  ...................... .   ...       . .  ..  ..... .. . .  . ...... .   .  .   .....  . ... .  ..  . .     . . . ..  . ..  .  ...........  ...... .    .  . .....  . . . .   . . . .... ... . . . . . . ...   ..   .. .. .   . . .  . .  . . .  ............   .    .. .  .       .  . .    
lowQualScore                  :     2 55 11      11  888    88 555555   0  888888 0   9999 9     333  8 0000  9  8  66 9 9 9    0  4444444444 2222 0  77777777777777777777   0    0    0 0  0   0 2222222  0 0 222  0  0 9 11 8 8 44444   9999    66666666 8 4444444   888   00  55  6666666666666666666666 6   222       9 9  00  88888 55 9 7  9 111111 5   9  8   77777  8 333 7  55  9 9     9 9 9 22  8 66  9  11111111111  222222 8    8  6 55555  8 8 8 6   5 8 9 0000 000 9 9 9 9 9 9 999   55   88 88 0   2 2 1  2 4  2 2 2  666666666666   1    11 2  2       5  5 5    
consensus                     : AAAT-A--T--GTATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCA----T-ATACA---CG-C----AT-GC-GC--T-C-A-CATT-TT-------T--C----C-ACA-----A----A--------TAA-TAAT-CTCCCT-TG-TAG-A-------TT-T-T---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TATG--------A-T-C-----AAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA---G-A--G-A-GA-G-A-T--ATATG-CA-CAT---A-CG-A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---G--C-ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-T-A-A-T-G-A---TTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATCTG-AA-A-TATA
Reference ( family-743 )      : AAAT-A--T--GTATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCA----T-ATACA---CG-C----AT-GC-GC--T-C-A-CATT-TT-------T--C----C-ACA-----A----A--------TAA-TAAT-CTCCCT-TG-TAG-A-------TT-T-T---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TATG--------A-T-C-----AAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA---G-A--G-A-GA-G-A-T--ATATG-CA-CAT---A-CG-A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---G--C-ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-T-A-A-T-G-A---TTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATCTG-AA-A-TATA
gi|89245                      : AAAT-A--T--GTATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCA----T-ATACG---CG-C----AT-GC-GC--T-C-A-CATT-TT-------T--C----C-AC------A----A--------TAA-TAAT-CTCCCT-TG-TAG-AT------TT-T-T---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TA----------ATT-C-----CAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA---G-A--GAA-GA-G--------ATG-CA-CAT---A-CG-A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GATT--TT-CA-----------GC---G--C-ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-A-AGA-TAG-AT--TTT--GAC--A--T-CACTC-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCAAC--T-AC-ATATCTG-AA-A-TATA
gi|89246                      : AAAT-A--T--GTATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T--CA----T-ATA-A---CA-C----AT-GC-GC--T-C-A-CATT-TT-------T--C----CCACA-----A-------------TAA-TAAT-C-CCCT-TG-TAG-A-------TT-T-T---GC-AG-C-A--T---T-----ACC----TATG--------A-T-C-----AAAA--TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AAAG-G-A--G-A-GA-G-A-T--ATATG-CA-CAT---A-CG-A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---G--C-ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-T-A-A-T-G-A---TTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T--A-C-A-AA----------GAAGTCCCAA--T-A--ATATCTG-AA-A-TATA
gi|89247                      : AAAT-AAAT--ATATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCA----T-ATACA---CA-C----AT-GC-GC--T-C-A-CATT-TT-------T--C----C-ACA-----ACTTTA--------TAA-TAAT-CCCCCT-TG-TAG-A-------TT-T-T---GC-AG-C-AGCT-ACT-----ACC----TATG--------A-T-C-----AAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA---G-A--G-A-GA-G-A-T--ATATG-CA-CAT---A-CG-A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---G--C-ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-T-A-A-T-G-A---TTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATCT--AA-A-TATA
gi|89248                      : AAAT-A--TTTATATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCAA---T-ATA-A---CG-C----AT-GCTGC--T-C-A-CATT-TT----------C----C-ACG-----A----A--------TAA-TAAT-CTCCCT-TG-TAG-A-------TT-T-TTT-GC-AG-C-A--T-A-T-----ATC----TATG--------A-T-CC----AAA---TTT--CA--TT----------------------A-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA---G-A--G-A-GA-G-A-T--ATGTA-C----T---A-C--A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---A--C-ACGT-GC-G-----AA-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-T-A-A-T-G-GATTTTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATGTG-AA-A-TATA
gi|89249                      : AAAT-AG-T--GTATAT--GA---AA-T--T------GCA-CG------T-GCA----T-ATACA---CACC----AT-GC-GC--T-C-A-CATTATA-------T--C----C-AC------A----A--------TAA-TAAT-C-CCCC-TG-TAG-A-------TT-T-T---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TATG--------A-T-C-----AAAT--TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAG-CTT-A-TTA-AA---G-A--G-AGGA-G-ATT--ATATG-CA--AT---A-CG-A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---G--CAACGT-GC-G-----AG-C-G-TGGTACC-G-G----G---A-T---A-T-G-A---TTT--GAC--A--T-CACGC-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGT-CCAA--T-AC-ATATCTG-AA-A-TATA
gi|89250                      : AAAT-A--T--GTATAT--GA---AAAT--T------GCAACG------T-GCA----T-ATACA---CG-C----AT-GC-GC--T-CCA-CATT-TT-------T--A----C-ACA-----A-------------TAA-TAAT-CCCCCT-TG-TAG-A-------TT-T-T---GCCAG-C-AA-T-A-T-----ACC----TATG--------A-T-C-----AAA---TTC--C---TT----------------------C-CAC---AAGCCCA-A-TT--AAA--G-A--G-A-GA-G-A-T--ATATG-CAGCAT---AACG-A---A-TAA-TC-A-TTCAAAT-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---G--C-ACGTGGC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----A-------A-A-T-GAA---TTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-CAA-AA----------G-AGT-CCAA--T-AC-ATATCTG-AA-A-TATA
gi|89251                      : AATT-A--T--GTATAT--GG---AAAT--T------GCA-CG------T-GTA----T-ATACA---CG-C----AT-GT--C--TGT-G-CATT-TT-------T--C----C-AC------A----A--------TAA-TAAT-CT-CCT-TG-TAG-A-------TTGT-T---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACT----TATG--------A-TCC-----AAA---TTT--CA---T----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TTA-AA---G-A--G-ATGA-G-A-T--A---G-C--C-------TG-A---ATTA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CAAG---------GC---G----ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-T-A-A-T-G-AT--TTT--GAC--A--T--AC-C-ATAT-T-AA-C-A-AA----------A-AGTCCCAA--T-AC-A
gi|89252                      : AAAT-A--T--GTATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCA----T--TACA---CGGC----ATTGC-GC--T-C-AACATT-TT-------T--C----C-ACA-----A-------------TAA-TAAT-CTCC-T-TG-TAG-A-------TT-T-TT--GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TATG--------A-TCC-----AAA---TTT---A--TT----------------------C-CAA---G---CTC-A-TTTAAA---G-A--G-A-GA-G-A-T--AT-TG-CA-ATT---A-CG-A---A-TA--TCAA-TCCAA-T---A--GAGT--TT-CA-----------GC------C-ACGT-GCGG-----AG-C-G-T-G-G-C---G----G---A-T-A-A-T-G-A---TTT--TGC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-AGAA----------G-AGT-CCAA--T-AC-ATAACTG-AAGA-TATA
gi|89253                      : AAAT-A--T--GTTTATT-GA---AAAT--TAAAAATGCA-CG------T-GCACATAT-ATACA---CG-C----AT-GC-GC--T-C-A-CATT-TT----------C----C-ACA-------------------TAA-ACAT-CTCC-T-TG-TAG-A-------TT-TCT---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TAT---------A-T-CCAAAAAAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA-----A--G-A-G--G-A-G--AGATG--A-CAT---A-CG-A---AATA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA--------------------------GC-G-----AG-C-G-T-GTGAC-G-G----G---A-T-A-A-T-G-A----TT--GAC--A--T-CAC-CAA-AT-TAAA-C-A-AA------------AGTCCCAA--T-AC-ATATCTGAAA-A-TATA
gi|89254                      : AAAT-A--T--GTTTATT-GA---AAAT--TAAAAATGCA-CG------T-GCACATAT-ATACA---CG-C----AT-GC-GC--T-C-A-CATT-TT----------C----C-ACA-------------------TAA-ACAT-CTCC-T-TG-TAG-A-------TT-TCT---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TAT---------A-T-CCAAAAAAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA-----A--G-A-G--G-A-G--AGATG--A-CAT---A-CG-A---AATA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA--------------------------GC-G-----AG-C-G-T-GTGAC-G-G----G---A-T-A-A-T-G-A----TT--GAC--A--T-CAC-CAA-AT-TAAA-C-A-AA------------AGTCCCAA--T-AC-ATATCTGAAA-A-TATA
gi|89255                      : AAAG-A--T--GTATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCA----T-ATACG---CG-C----AT-CC-GC--T-C-A-CATT-TT-------C--C----C--------------A--------TAA-TAAT-CTCCCT-TGTTAA-T-------TT-T-T---GC-AG-C-AC-T-A-T-----ACC----TATG--------A-T-C-----CAA---ATT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA-----A--G-A-GA-G-A----AT----CA-CAT-----CG-A---A-TAGTTC-ATTCCAA-T-C-ACTGA-T--TT-CA-----------GC---G--C-ACGT-GC-G-----AGCC-G-T-GTG-CTG-GAGTAG---A-T-A-A-T-------TTT--GACTGA--T-CAT-C-A-AT-T-AA-C-A-AA------------AGTCCAAG--T-AC-A
gi|89256                      : AAAT-A--T--GTATAT--GA---A--T--T------GCAACG------T-GCA----T-ATACA---CA-C----AT-GC-GC--T-C-A-CAAT-TT-------T--C----C-AC------A----A--------TAA-TAATCCCCCCT-TGTTAG-ATT-----TT-T-T---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TAAT--------A-TCC-----AAA---TGT--CA--TT----------------------CGCAA---AAGCCTC---TTAAAA---G-A--G-A-GA-G-A-T--ATATG-CA-CA----A-CGAA---A-TA--TC---TCC-A-T-CAA--GA-T--TT-CA-----------GC----------------------AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-T-A-A-T---A---TTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAATTT-AC-ATATCTGAAA-A-TATA
gi|89257                      : AAAT-AA-T--GT-TA---GA---AAAT--T------GC--C-------T-GCA------ATA-A---CA-C----AT-GCTGC--T-C-A-CATT-TT-------T--C----C-ACA-----A-------------TAACTGAT-TCCCCT-TG-TA--A-------TT-T-T---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TATG--------A-T-CCC---AAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCTGC-A-TT--AA---A-AA-G-A-GATG-A-T--ATATG-CA--ATG--A-CG-A---A-TA--TC-A-TCCA--T-C-A---A-T--TT-CA-----------GC---A--A-ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---AAT-A-ACT-G-AAA-TTT--GAC--A--T-CAC---A-ATCT-AAGC-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATCTT-GA-A-TATA
gi|89258                      : AAAT-A--T--GTATAT--GACAGAAATCTT------GCA-CG------T-GCAC---T-ATACC---CA-CCGCAAT-GC-GC--T-C-A-CATT-TTGGGTTTTT--C----C-ACG-----A----AATCACGAATAA-TAAT-CTCC----G-TATTA-------TT-T-T----C-AG-CTA--TTA-T-----ACC----TATG--------A-T-CC----AAA---TGT--CA--TTTTGTTTTGTGTTGTGGTGTTCTC-CAA---A-GCCTC-AATT--AAAGAG-A--G-A-GA-G-G-T---TATG-TA-CATTTTA-CG-A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A---A-T--TT-CAATGTGTTTGTTGC---G--C-ACGT-GCCG-----AG-CCG-TTGTG-C-G-GC---GTATA-C-A-C-T-G-AGTTTTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATCTG-AA-A-
gi|89259                      : AAATTA--T--GTATAG--GGT--AAAT--T------GCA-CG------TTGCA----TTATACAATTCA-C----A--GC-GC--T-C-T-CACT-TT-------T--CTTTCC-ACA-----A-------------TAA-TAAT-CTCCCT-TG-TAG-AT------TT-T-T---GCTAG-A-C--T-A-T-----ACC----TATG--------A-TCC-----AAATACTTT--CAGTTT----------------------CTCAA---AAGTCTCTA-TT--AAAC-G-ATGG-A-AA-G-A-T---TATGTCA-CAT---A-CC-A---A-TA--TC-A-TCACA-T-C-AATGA-T--TT-CA-----------GTCGAG--C-GCGT-G---------G-C-A-T-G-G-C-C-G----G---A-T-A-A-G-G-ATT-TTT--GAC--A--TCCAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AACCATCCTCATT-AGTCCCCA----AC-ATATCTG-AA-A-TATA
gi|89260                      : AAAT----T--GTATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GC-------ATACA---CG-C----AT-GC-GC--T-C-A-
gi|89261                      :  AAT-A--T--GTATAT--GA---AA-T--T------GCA-CG------T--CA----T-ATACG---CG-C----AT-GC-GC--T-C-A--ATT-TT-------T--C----C-ACA-----A-------------TAA-TAAT-CTTCCT-TG-TAG-A-------TT-T-TTATGC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TATG--------A-C-C-----AAA---TTTTTCA--TT----------------------C--AA---AAGC-TC-A-TT--AAA--G-A--G-A-GA-G-A-T--G---G-CA-CAA---A-CG-A-----TA--TC-A-TCCAA-TTC-A--GA-T--TT-CA-----------GTTT-G--C-ACG--GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A---A-A-T-G-A---TTTTGGAC--A--TTCAC---A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGT-CCAA--TAAC-ATATCTG-AA-ATTATA
gi|89262                      :  AAT-A-----ATATATTCGA---AAATC-T------GCA-TGCACCGTT-GCA----T-ATACA---CA-C----AT-GC-GC--T-C-A-C-TT-TT-------T--C----C-ACATTTATA----A--------TAA-TAAT-CCCC---TG-TAG-A-------TT-T-T----T-GG-C-A--T-A-TT----ACC----TATG--------T-C-C-----AAA---TT---CA--TT----------------------C-AAA---AAGCC-C-A-TT--AAA--G-A--G-A-GA-GCA-TT-ATATG-CAACAT---A-CGGA---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TTTCA-----------GC---GGCC-ACG--GC-G-----AG-C-GGT-GTG-C-G-G----G---A-T-A-T-T-G-AA--TTT--GAC--ACAT-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-TCAATATCTG-AA-A-TAT
gi|89263                      :               TAT--AA---AAAT--T------GCA-TG------T-GCA----A-ATACA---CG-C----AT-GC-GC--T-C-A-CATT-TT-------T--C----C-AC------A----A--------TAA-TAAT-CTCCCT-CG-TAG-AT------TT-T-T---GT-AG-C-A--T-A-T-----ACCTATATATG--------A-TCC-----AAA---TTT--TA--TT----------------------C-CAA---AAGCTT
gi|89264                      :                             --T------GCA-CG------T-GCA----T-GCGCA---TG-C----GT-GT-TT--G-C-A--ATT-TT-------T----------------------A--------TTA-CA----TCAGTGTG-TAG-AACTTTATCT-T-T---G----------T-C-T-----ACC----TATG--------C-TGT-----AAA---TAT--CA--TT----------------------T-CAT---TATCTTA-A-TT--TA---T-A--A-ACAA-G-T-T--ACGGG-CG-AAT---T-TG-------TA--TT-A-TCCAA-T-C-A--AA-A--TG-CA-----------GC---A--C-ACGT-GC-A-----CG-C-A-T-GTG-C-
gi|89265                      :                                                      A----T-GCACA---CG-C----AT-GT-GCGTT-G-A-CATT-TT-------TGAC----T-ACA-----------------------TCAT--TC----TA-TGG------------------GC-AAAC-A--T-A-TTATCTACC----TGTGTGGTAAATA-T-T-----AA-----TT--CA--TT----------------------C-T--------CTTT-A-TT--CA---TTA--G-A-AA-G-T-T--ACA-G--A-CGT---T-TT-A---G-CA--TT-A-TCCAA-T-C-A--AA-A--TT-AA-----------GC---A--C-ACGT-GC-A-----TG-C-A-C-GTG-C-A-A----A---A-T-----T-G-AAATTTT--GAC--T--T-C
gi|89266                      :                                                                                                                                                                                          -A--T-A-T------CC----TATG--------A-T-C-----CCA---TTTTTCA--TTTC--------------------C-CAACAGAAGCCTT-C-TT--AA----------A-GA-G-A-TCGATATG-CA-CATGA-G-CG-AATTA-TA--TC-A-T-CAA-T-C-A--GA-TTGTT-CA-----------CC---G--C-ACCT--C-GTCAGTAG-C-G-T-GTG-C-ACG----GTT-A-T-A-A-T-G-C---TTT--
gi|89267                      :                                                                                                                                                                                            --T-G-T-----ACC----TATG--------A-TCC-----AAA---TAT--CA--TT----------------------C-CAT---AAACCTC-A-TA--AAT--G-A--G-A-GA-G------ATATG-TA-CAT---T-CA-A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---C--C-ACGT-GC-A-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-T-A-A-G-G-AT--TTT--GAC--A--T-CAA-C-A-Actttgaca
gi|89268                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -----------GC---T--C-ATGT-GC-G-----AG-C-A-T-GTG-C-G-G----G---A-TTA-A-T-G-A---TTTT-GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATCTG-AA-A-TATA


blockSeqs                     :     T AA TT      TC  CAG    CT AAAAAT   A  CACCGT T   CATA T     ATT  C CGCA  T  T  GT G C A    A  GGGTTTTT   TTTC C  GAAATCACGAA            C    C    C G  T   T ACTTTAT  G C TAT  C  A T GC T C TATCT   TATA    TGGTAAAT . CCAAAA    TAC   TT  GT  TTGTTTTGTGTTGTGGTGTTCT G   CAG       T A  TA  AGAG  TG . G  T CATT       T  G   TTTA   A ATT T  GT  A T     A T A CT  G TG  T  ATGTGTTTGTT  CGAG   A    G  G TCAGT  C C G G   C T C AGTA TAT A T . C . A ATT   TG   TG CA C   G A T  C A  G A G  CCATCCTCATT    C    TT A  A       A  G T
blockSeqs                     :     . G  .       T   T      C  AAAAAT   A  .      .   CATA .     .    G .     .  T  .  . . .    .  TGA        .    .  ATTTATAA               .    .    C .  T   . TT       . C TT   T  . . A  . . T       .       .        . CCAAAA    A     TT  .   TC                     T   .         . .  AA  AGG   A  . T  . ATCG       .  A   GAG    G .   A  A   . .     . . . AT  . .   .  AG           TTG    .    .  C .      . . . T   A . . C    TT  . . . . . . GTT   T    .  .  T   . A .  . A  . . .  GA             C    .  .  .       A  . .
blockSeqs                     :     . A  .       T   .      .  .        .  .      .   A    .     .    . .     .  .  .  . . .    .  T          .    .  AACTTTA                .    .    C .  .   . T        . . T    .  . . C  . . .       .       .        . CCC       T     .   .   .                      .   .         . .  A   ACG   .  . C  . ATT        .  .   AA     . .   A  .   . .     . . . .   . .   .  .            GGC    .    .  . .      . . . .   A . . .    .   . . . . . . AAT   .    .  .  .   . . .  . .  . . .  G              C    .  .  .       A  . .
blockSeqs                     :     . .  .       .   .      .  .        .  .      .   C    .     .    . .     .  .  .  . . .    .  T          .    .  GAA                    .    .    C .  .   . T        . . .    .  . . .  . . .       .       .        . CC        .     .   .   .                      .   .         . .  A   AG    .  . .  . AT         .  .   GA     . .   .  .   . .     . . . .   . .   .  .            G      .    .  . .      . . . .   . . . .    .   . . . . . . AA    .    .  .  .   . . .  . .  . . .  G              C    .  .  .       .  . .
blockSeqs                     :     . .  .       .   .      .  .        .  .      .   .    .     .    . .     .  .  .  . . .    .  T          .    .  AA                     .    .    C .  .   . .        . . .    .  . . .  . . .       .       .        . CC        .     .   .   .                      .   .         . .  .   AG    .  . .  . AT         .  .   A      . .   .  .   . .     . . . .   . .   .  .            G      .    .  . .      . . . .   . . . .    .   . . . . . . TT    .    .  .  .   . . .  . .  . . .  G              C    .  .  .       .  . .
blockSeqs                     :     . .  .       .   .      .  .        .  .      .   .    .     .    . .     .  .  .  . . .    .  T          .    .  AA                     .    .    C .  .   . .        . . .    .  . . .  . . .       .       .        . CC        .     .   .   .                      .   .         . .  .   AG    .  . .  . AT         .  .   A      . .   .  .   . .     . . . .   . .   .  .            A      .    .  . .      . . . .   . . . .    .   . . . . . . T     .    .  .  .   . . .  . .  . . .  G              C    .  .  .       .  . .
blockSeqs                     :     . .  .       .   .      .  .        .  .      .   .    .     .    . .     .  .  .  . . .    .  T          .    .  AA                     .    .    C .  .   . .        . . .    .  . . .  . . .       .       .        . CC        .     .   .   .                      .   .         . .  .   TT    .  . .  . AT         .  .   A      . .   .  .   . .     . . . .   . .   .  .            G      .    .  . .      . . . .   . . . .    .   . . . . . . A     .    .  .  .   . . .  . .  . . .  A              C    .  .  .       .  . .
blockSeqs                     :     . .  .       .   .      .  .        .  .      .   .    .     .    . .     .  .  .  . . .    .  T          .    .  AA                     .    .    C .  .   . .        . . .    .  . . .  . . .       .       .        . CC        .     .   .   .                      .   .         . .  .   TG    .  . .  . AT         .  .   A      . .   .  .   . .     . . . .   . .   .  .            G      .    .  . .      . . . .   . . . .    .   . . . . . . T     .    .  .  .   . . .  . .  . . .  G              C    .  .  .       .  . .
blockSeqs                     :     . .  .       .   .      .  .        .  .      .   .    .     .    . .     .  .  .  . . .    .  C          .    .  AA                     .    .    C .  .   . .        . . .    .  . . .  . . .       .       .        . CC        .     .   .   .                      .   .         . .  .   G     .  . .  . AT         .  .   A      . .   .  .   . .     . . . .   . .   .  .            G      .    .  . .      . . . .   . . . .    .   . . . . . . .     .    .  .  .   . . .  . .  . . .  G              C    .  .  .       .  . .
blockSeqs                     :     . .  .       .   .      .  .        .  .      .   .    .     .    . .     .  .  .  . . .    .  T          .    .  AA                     .    .    C .  .   . .        . . .    .  . . .  . . .       .       .        . CC        .     .   .   .                      .   .         . .  .   G     .  . .  . AG         .  .   A      . .   .  .   . .     . . . .   . .   .  .            G      .    .  . .      . . . .   . . . .    .   . . . . . . .     .    .  .  .   . . .  . .  . . .  G              C    .  .  .       .  . .
blockSeqs                     :     . .  .       .   .      .  .        .  .      .   .    .     .    . .     .  .  .  . . .    .  T          .    .  AA                     .    .    C .  .   . .        . . .    .  . . .  . . .       .       .        . GT        .     .   .   .                      .   .         . .  .   G     .  . .  . AG         .  .   A      . .   .  .   . .     . . . .   . .   .  .            A      .    .  . .      . . . .   . . . .    .   . . . . . . .     .    .  .  .   . . .  . .  . . .  G              C    .  .  .       .  . .
blockSeqs                     :     . .  .       .   .      .  .        .  .      .   .    .     .    . .     .  .  .  . . .    .  T          .    .  AA                     .    .    C .  .   . .        . . .    .  . . .  . . .       .       .        . CC        .     .   .   .                      .   .         . .  .   G     .  . .  . AT         .  .   A      . .   .  .   . .     . . . .   . .   .  .            G      .    .  . .      . . . .   . . . .    .   . . . . . . .     .    .  .  .   . . .  . .  . . .  G              C    .  .  .       .  . .
blockSeqs                     :     . .  .       .   .      .  .        .  .      .   .    .     .    . .     .  .  .  . . .    .  T          .    .  AA                     .    .    G .  .   . .        . . .    .  . . .  . . .       .       .        . C         .     .   .   .                      .   .         . .  .   G     .  . .  . AT         .  .   A      . .   .  .   . .     . . . .   . .   .  .            A      .    .  . .      . . . .   . . . .    .   . . . . . . .     .    .  .  .   . . .  . .  . . .  G              C    .  .  .       .  . .
blockSeqs                     :     . .  .       .   .      .  .        .  .      .   .    .     .    . .     .  .  .  . . .    .  T          .    .  AA                     .    .    . .  .   . .        . . .    .  . . .  . . .       .       .        . C         .     .   .   .                      .   .         . .  .   G     .  . .  . GT         .  .   A      . .   .  .   . .     . . . .   . .   .  .            A      .    .  . .      . . . .   . . . .    .   . . . . . . .     .    .  .  .   . . .  . .  . . .  G              .    .  .  .       .  . .
blockSeqs                     :     . .  .       .   .      .  .        .  .      .   .    .     .    . .     .  .  .  . . .    .  T          .    .  A                      .    .    . .  .   . .        . . .    .  . . .  . . .       .       .        . C         .     .   .   .                      .   .         . .  .   A     .  . .  . AT         .  .   A      . .   .  .   . .     . . . .   . .   .  .            G      .    .  . .      . . . .   . . . .    .   . . . . . . .     .    .  .  .   . . .  . .  . . .  .              .    .  .  .       .  . .
blockSeqs                     :     . .  .       .   .      .  .        .  .      .   .    .     .    . .     .  .  .  . . .    .  T          .    .  A                      .    .    . .  .   . .        . . .    .  . . .  . . .       .       .        . C         .     .   .   .                      .   .         . .  .   T     .  . .  . AT         .  .   T      . .   .  .   . .     . . . .   . .   .  .            C      .    .  . .      . . . .   . . . .    .   . . . . . . .     .    .  .  .   . . .  . .  . . .  .              .    .  .  .             
blockSeqs                     :     . .  .       .   .      .  .        .  .      .   .    .     .    . .     .  .  .  . . .    .  .          .    .  A                      .    .    . .  .   . .        . . .    .  . . .  . . .       .       .        . C         .     .   .   .                      .   .         . .  .   .     .  . .  . TT         .  .   T      . .   .  .   . .     . . . .   . .   .  .            T      .    .  . .      . . . .   . . . .    .   . . . . . . .     .    .  .  .   . . .  . .  . . .  .              .    .  .  .             
blockSeqs                     :                  .   .      .  .        .  .      .   .    .     .    . .     .  .  .  . . .    .  .          .    .  A                      .    .    . .  .   . .        . . .    .  . . .  . . .       .       .        . C         .     .   .   .                      .   .         . .  .   .     .  . .  . TT         .  .   T      . .   .  .   . .     . . . .   . .   .  .            .      .    .  . .      . . . .   . . . .    .   . . . . . . .     .    .  .  .   . . .                                                      
blockSeqs                     :                             .  .        .  .      .   .    .     .    . .     .  .  .  . . .    .  .          .    .  A                      .    .    . .  .   . .        . . .    .  . . .  . . .       .       .        . C         .     .   .   .                      .   .         . .  .   .     .  . .  . A          .  .   .      . .   .  .   . .     . . . .   . .   .  .            .      .    .  . .      . . . .   . . . .    .   . . . . . . .     .    .  .  .                                                              
blockSeqs                     :                                                       .    .     .    . .     .  .  .  . . .                                                                                             . .  . . .       .       .        . T         .     .   .   .                      .   .         . .  .   .     .  . .  . .          .  .   .      . .   .  .   . .     . . . .   . .   .  .            .      .    .  . .      . . . .   . . . .    .   . . . . . . .     .                                                                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                            .  . . .       .       .        . C         .     .   .   .                      .   .                                                                                                   .            .      .    .  . .      . . . .   . .                                                                                                        


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                   *******                                                                                                                                          AT****                                                                                                                                     ***
originalCons                  : AAAT-A--T--GTATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCA----T-ATACA---CG-C----AT-GC-GC--T-C-A-CATT-TT-------T--C----C-ACA-----A----A--------TAA-TAAT-CTCCCT-TG-TAG-A-------TT-T-T---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TATG--------A-T-C-----AAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA---G-A--G-A-GA-G-A-T--ATATG-CA-CAT---A-CG-A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---G--C-ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-T-A-A-T-G-A---TTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATCTG-AA-A-TATA
finalCons                     : AAAT-A--T--GTATAT--GA---AAAT--T------GCA-CG------T-GCA----T-ATACA---CG-C----AT-GC-GC--T-C-A-CATT-TT-------T--C----C-ACA-----A----A--------TAA-TAAT-CTCCCT-TG-TAG-A-------TT-T-T---GC-AG-C-A--T-A-T-----ACC----TATG--------A-T-C-----AAA---TTT--CA--TT----------------------C-CAA---AAGCCTC-A-TT--AA---G-A--G-A-GA-GAT----ATATG-CA-CAT---A-CG-A---A-TA--TC-A-TCCAA-T-C-A--GA-T--TT-CA-----------GC---G--C-ACGT-GC-G-----AG-C-G-T-GTG-C-G-G----G---A-T-A-A-T-G-A---TTT--GAC--A--T-CAC-C-A-AT-T-AA-C-A-AA----------G-AGTCCCAA--T-AC-ATATCTG-AA-A-TATA