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Reference ( gi|76289 )        : CCGGGT-ATACCC-GG-----GGT--ACT-T-CTTACAAT-C--AA-GTGACCCGGTG--------G-ATA-------TAGTAATAA-AAATGTTGAA-TTTCTACCGT--A-------T-AT-AAC---A-TT-TT-TTGGCACA-GAAAA---G-G--CTAACA--TT-GTT--AC-AAA---TT-A-----TGT-TTATT-TC--A-TTA-GAGTATCTG-AATTA--------TATAC-ATTCTGTCTCAGA--A-T-A-AGCCACTA-TCGCTAC
gi|76290                      : CTGGGT-ATACCC-GG-----GCT--ACT-T-CTTACAAT-C--AA-GTGACCCGGCG--------C-ATA-------TAGTATTGA-AAATGTTGAA-TTTCTACCGT--A-------T-AT-AAC---A-AT-TT-TTGGCACA-GAAAA---G-G--CTAACA--GT-TTT--GC-AAA---TT-A-----TGT-TTATT-TC--A-TTA-GAGTATCTG-AATTA--------AATAC-ATTCTGTCCCAAA--A-T-A-AACCACTA-TCGCTAC
gi|76291                      : CCGAAT-ATACCC-GG-----GCT--ATT-T-CTTAGAAT-C--AA-GTGACCCGGCG--------C-ATA-------TAGTAATGA-AAATGTTGAA-TTTCTACCGT--A-------T-AT-AAC---A-TT-TT-TTGGCACA-GAAAA---G-G--CCAACA--TT-TTT--AC-AAA---TT-A-----TGT-TTATT-TC--A-TTA-GAGTACCTGTCATTATTTTATTTTATAC-ATTCTGTCTCAGA--A-T-A-AGCCACTA-TCGCTAC
gi|76293                      : CCAAAT-GTACCC-GG-----GGT--ACT-T-CTTAGAAT-C--AA-GTGACCCGGTG--------T-ATACAATGTGTAGAAATGA-AAATGTTGAA-TTTCTACCGT--A-------T-AG-AAC---A-TT-TT-T-GGCACA-GAAA----G-G--CTACCA--TT-TTT--AT-AAA---TC-A-----TGA-TTATT-TC--A-TTA-GAGTACCTG-AATTA--------AATAC-ATTCTGTCTCGAA--A-T-A-AGCCACTC-TCGCTA
gi|76292                      : CCGGGT-ATACCA-GG-----GCT--ACT-T-CTTAGAAT-C--AA-GTGACCCGGCC--------GCATA-------TAGTAATGA-AAATGTTGAA-TCTCTACCGT--A-------T-AT-TAT---A-AT-TC-TTGGCACA-GAAAA---G-G--CAAACA--CT-TTT--AC-AAA---T--------TGT-TTATT-TC--A-TTA-G-----CTG-AATTA--------AATAC-AT--TGTCTCAGA--A-T-A-AGCCACTA-TCGCTAC
gi|76294                      : CCGGAT-ATACCC-GG-----GAT--ACT-T-CTTAGAAT-C--AA-GTGACCCGGTG--------C-ATA-------TAGTAATGA-AAATGTTGAA-TTTCTACCGT--A-------T-AT-AACTTTT-TT-TT-TTGGCACA-GAAAA---G-G--CTAACA--TT-TTT--AC-AAA---TT-A-----TGT-TTATT-TC--A-TTA-GAGTACCTA-AATTA--------
gi|76295                      : CCGGAT-ATACCCCGG-----GGT--AGT-T-CTTAAAAT-C--AA-GTGACCTGGTG--------C-AAA-------TAGTAATGA-AAATGTTGAA-TTTCTTCCAT--G-------T-AT-AAC---ATTT-TT-TTGGCATT-GAAAA---G-G--CTCATA--TT-TTT--AC-AAA---TT-A-----TGA-TTATT-TC--A-ATACGAGAATCTG-AA-TA---------ATAC--TTCTGTCTCGGA--A-T-A-AGCCACTC-TCGCTACa
gi|76296                      : CCGGGT-ATACCC-GG-----AGT--ACTGT-CTTAGAAT-CCCAG-CTGACCCGGCG--------C-ATA-------T-GTACTAC-AAATGTTGAAATTTCTACCGT--A-------T-ATAAAC---A--T-TT-TTGGCACA-GAAAA---G-GCCCTAG-A--TT-GTT--AC-AAAAATTC-A-----TGT-TTATT-TC--A-GTA-GAGTATGTG-AA-TA--------AATAC-ATTCTGTCTCAGA--A-T-ATAGCCACTA-TCGCTAC
gi|76297                      : CCGGGT-ATACCC-GG-----GAT--ACT-T-CTTAGAAT-C--AA-GTGACCCGGCG--------C-ATA-------TTGTAATAA-AAATATTGAA-TTTCTACCAT--A-------T-AT-AAC---A-TT-TT-TTGGCACA-GAAAA---G-G--CTAACA--TT-GTT--AT-AAA---TC-AAAATTTGT----TT-TT--A-TTA-AA
gi|76298                      : CCGGGTTATACCC-GGTGTGCGGT--ACTGT-CTTAGAAT-C--AA-GTGACCCGATG--------C-A--------------------AATGTTG------CTACCGT--A-------T-AT-AAC---A------------------AAA---G-G--CTAACA--TT-TTG--AC-AAA---TC-A-----TGT-TTCTT-TC--A-TTA-GAGTACCTG-AATTA--------AATAC-ATTCTGTCTTAGAATA-T-A-AGTCTTTA-TCACTAC
gi|76299                      : CCAGGT-ATACCC-GATCCGAGGT--ACT-T----GGAATGC--AAAGTGACCTAGTG--------C-ATA-------AAG-AATAA-AATTGTTGAA-TTTCTACCGT--AA------T-AT-AAC---A-TT-TG-TTTGCACA-GAAAA---G-G--CTAACA--AT-TTT--A---AA---TT-A-----TGT-TTATT-TC--A-TTA-GAGTACCTG-AATTA--------
gi|76300                      : CCAGGT-ATACCC-GG-----GGT--ACT-T-CTTAGAAT-C--AA-GTGACCCGGCG--------C-ATA-------TAGTGATAA-AAATGTTAAA-TTTCTAC-------------------AC---A-TT-GT-T----ACA----------------------------------AA---TT-A-----TGT-TTATT--------------CATCTG--ATTA--------AATACAATTCTGTCTCAGA--A-T-A-AGCCACTA--CGCTa
gi|76301                      : CCGGGT-ATACCC-GG-----AGT--AGT-T-CTAAGAAT-C--AA-GTGACCCAGCG--------C-ATA-------TA
gi|76302                      :      T-ATACCC-GC-----GGTTAACT-C-TTTAGAAT-C--AA-ATGACCCAGTG--------C-ATA-------TAGTAATGACACATGTTTAA-TATCaaattaggctactttacgaatttatgtttattctcaattaagagttctaattaaataactttgtctcagaataagtcactatcctac
gi|76303                      :  cggac-ATACCT-GT-----GGT--ACT-T-CTTAGAAT-C--AA-GTGATACGGTGCATTTATAG-ATA--------AGTAACGA-AAATGTTGAA-TTTCTACCGT--A-------T-TT-AA------TTATT-TTAGCACA-GAAAA---G-G--CTAACA--TC-TTT--GC-AAA---TT-A-----TGT-TTATT-TC--A-TTA-GAGAACCTG-AATTG--------AATAC-ATTCTGTCTCAGA--A-T-A-AGCCACTA-TCGCTAC
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Reference ( family-741 )      :                                      CCGGGT-ATACCC-GG-----GGT--ACT-T-CTTAGAAT-C--AA-GTGACCCGGC-GCAT------A-------TA-GTAATGA-AAATGTTG-AATTTCTACCGTA-------TA-T-A-AC---A-TT-TT-TTGGCACA-GAAAA---G-G--CTAAC-ATT---T--TTAC-AAA---TT---------ATGT-TTA-TT-TC--ATT-A-GAGTACCTG-AATTA----A----ATAC-ATTCTGTCTCAGA--A-T-A-AGCCACTA-TCGCTAC
gi|76289                      :                                      CCGGGT-ATACCC-GG-----GGT--ACT-T-CTTACAAT-C--AA-GTGACCCGGT-GGAT------A-------TA-GTAATAA-AAATGTTG-AATTTCTACCGTA-------TA-T-A-AC---A-TT-TT-TTGGCACA-GAAAA---G-G--CTAAC-ATT---G--TTAC-AAA---TT---------ATGT-TTA-TT-TC--ATT-A-GAGTATCTG-AATTA----T----ATAC-ATTCTGTCTCAGA--A-T-A-AGCCACTA-TCGCTAC
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Reference ( family-741 )      :                                      CCGGGT-ATACCC-GG-----GGT--ACT-T-CTTAGAAT-C--AA-GTGACCCGGC-GCAT------A-------TA-GTAATGA-AAATGTTG-AATTTCTACCGTA-------TA-T-A-AC---A-TT-TT-TTGGCACA-GAAAA---G-G--CTAAC-ATT---T--TTAC-AAA---TT---------ATGT-TTA-TT-TC--ATT-A-GAGTACCTG-AATTA----A----ATAC-ATTCTGTCTCAGA--A-T-A-AGCCACTA-TCGCTAC
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gi|76294                      :                                      CCGGAT-ATACCC-GG-----GAT--ACT-T-CTTAGAAT-C--AA-GTGACCCGGT-GCAT------A-------TA-GTAATGA-AAATGTTG-AATTTCTACCGTA-------TA-T-A-ACTTTT-TT-TT-TTGGCACA-GAAAA---G-G--CTAAC-ATT---T--TTAC-AAA---TT---------ATGT-TTA-TT-TC--ATT-A-GAGTACCTA-AATTA----A----
gi|76295                      :                                      CCGGAT-ATACCCCGG-----GGT--AGT-T-CTTAAAAT-C--AA-GTGACCTGGT-GCAA------A-------TA-GTAATGA-AAATGTTG-AATTTCTTCCATG-------TA-T-A-AC---ATTT-TT-TTGGCATT-GAAAA---G-G--CTCAT-ATT---T--TTAC-AAA---TT---------ATGA-TTA-TT-TC--AAT-ACGAGAATCTG-AAT------A----ATAC--TTCTGTCTCGGA--A-T-A-AGCCACTC-TCGCTAC
gi|76296                      :                                      CCGGGT-ATACCC-GG-----AGT--ACTGT-CTTAGAAT-CCCAG-CTGACCCGGC-GCAT------A-------T--GTACTAC-AAATGTTGAAATTTCTACCGTA-------TA-TAA-AC---A--T-TT-TTGGCACA-GAAAA---G-GCCCTAG--ATT---G--TTAC-AAAAATTC---------ATGT-TTA-TT-TC--AGT-A-GAGTATGTG-AA-TA----A----ATAC-ATTCTGTCTCAGA--A-T-ATAGCCACTA-TCGCTAC
gi|76297                      :                                      CCGGGT-ATACCC-GG-----GAT--ACT-T-CTTAGAAT-C--AA-GTGACCCGGC-GCAT------A-------TT-GTAATAA-AAATATTG-AATTTCTACCATA-------TA-T-A-AC---A-TT-TT-TTGGCACA-GAAAA---G-G--CTAAC-ATT---G--TTAT-AAA---TCA--------AAAT-TTGTTT-TT--ATT-A-AA
gi|76298                      :                                      CCGGGTTATACCC-GGTGTGCGGT--ACTGT-CTTAGAAT-C--AA-GTGACCCG---------------------------ATGC-AAATGTTG------CTACCGTA-------TA-T-A-AC---A------------------AAA---G-G--CTAAC-ATT---T--TGAC-AAA---TC---------ATGT-TTC-TT-TC--ATT-A-GAGTACCTG-AATTA----A----ATAC-ATTCTGTCTTAGAATA-T-A-AGTCTTTA-TCACTAC
gi|76299                      :                                      CCAGGT-ATACCC-GATCCGAGGT--ACT-T----GGAATGC--AAAGTGACCTAGT-GCAT------A-------AA-G-AATAA-AATTGTTG-AATTTCTACCGTAA------TA-T-A-AC---A-TT-TG-TTTGCACA-GAAAA---G-G--CTAAC-AAT---T--TTA---AA---TT---------ATGT-TTA-TT-TC--ATT-A-GAGTACCTG-AATTA----A----
gi|76300                      :                                      CCAGGT-ATACCC-GG-----GGT--ACT-T-CTTAGAAT-C--AA-GTGACCCGGC-GCAT------A-------TA-GTGATAA-AAATGTTA-AATTTCTAC------------------AC---A-TT-GT-T----ACA-----------------------------------AA---TT---------ATGT-TTA--T-TC--AT----------CTG--ATTA----A----ATACAATTCTGTCTCAGA--A-T-A-AGCCACTA--CGCT
gi|76301                      :                                      CCGGGT-ATACCC-GG-----AGT--AGT-T-CTAAGAAT-C--AA-GTGACCCAGC-GCAT------A-------TA-
gi|76301                      :                                                                                                                                                                                 GCATA-TAAAATTAG-G--CTA-----C---T--TTAC-GAA---TTT--------ATGT-TTA-TTCTCA-ATTAA-GAGT-TCT--AATTA----A----ATA--ACTTTGTCTCAGA--A-T-A-AGTCACTA-TC-CTACaaattaggctactttacgaatttatgtttattctcaattaagagttctaattaaataactttgtctcagaataagtcactatcctac
gi|76302                      : ccgggtatacccggagtagttctaagaatcaagtgacccagcT-ATACCC-GC-----GGTTAACT-C-TTTAGAAT-C--AA-ATGACCCAGT-GCAT------A-------TA-GTAATGACACATGTTT-AATATC
gi|76303                      :                                       cggac-ATACCT-GT-----GGT--ACT-T-CTTAGAAT-C--AA-GTGATACGGT-GCATTTATAGA-------TAAGTAACGA-AAATGTTG-AATTTCTACCGTA-------TT-T-A-A------TTATT-TTAGCACA-GAAAA---G-G--CTAAC-ATC---T--TTGC-AAA---TT---------ATGT-TTA-TT-TC--ATT-A-GAGAACCTG-AATTG----A----ATAC-ATTCTGTCTCAGA--A-T-A-AGCCACTA-TCGCTAC
gi|76304                      :                                                     G-----GGT--ACT-TTCTTAGAAT-C--AA-GTGACA-GGT-GCAT------A-------TA----------------------TCTACCGTACAACGTGTA-T-A-AC---A-TT---------------AAA---G-G--CTAAC-A-A---T--TTACAAAA---TT---------GTGT-TTA-TT-TC--ATT-A-GAGTACCTG-AGTTA----A----ATAC-ATTCTGTCTCAGA--A-TAA-AGCCCCTC-TCTCTAC
gi|76305                      :                                                                         ccAAT-C--AC-GTGACCCGAC----T-----------------------A-AAATATTG-TCTTTCTATCATA-------TA---A-AC---A-TT-AC-CTGGCATA-GAAAA---A-G--TTAAC-GCTAGCT--TGAC-AAA------------------------------ATT-A-ATGCACCAG-GATTA-----------GC-ATTATGTCTTAGA--A-T-A-AGTTACTC-TC
gi|76306                      :                                                                                                           -------TA-GTCATGG-AAATGTTG-AATTTCTACCGTG-------GA-T-ATAC-----TT-TT-TTGGCACACGAAAA---G-G--CTAAT-ATT---TTATCAA-AAA---TT---------ATGT-TTA-TT-TTCAAAT-A-GAGGATCTG-AATTT----A----ATAA-ATTC-GTCTCAAA--ATT-A-AGCCACTA-TCGCT
gi|76307                      :                                                                                               cagtatatacgg-------TA-GTCATGA-AAATGTTG-AATT-CTACCGTG-------TAAT-A-A----A-TT-TT-A-GGCA-A-GAAAA---GCG--CTAAT-AAT---T--TTAC-AAA---CT---------ATATGTTA-TT-TC--ATA-G-AAGTATCTA-ATTTA----T----ATA--ACTCTGCC---AA--A-T-A-AG-CACTAGTCGCTAC
gi|76308                      :                                                                                                                                                 TA-------TA-T-A-AC---A-TT-TTTTTGGCACA-GAAAA---A-G--CTAAT-ATT---T--TTAC-AAA---TT---------ATAT-TTA-TT-TC--A-T-A-GAGTACCTG-AATTA----A----ATAC-ATTTTGTCTCAGA--A-T-A-AGCCACTA-CCGCTAC
gi|76309                      :                                                                                                                                                                         T-TT-TGGGCACA-GAAAA---G-G--CTAAC-ACT---T----AC-AAAA--TC---------ATGT-TTA-TT-TC--ATT-A-GAGCACCTG-CATTA----A----GTAC-ATCCTGTCTCGGA--A-T-A-AGTTACTC-TCGCTAC
gi|76310                      :                                                                                                                                                                          -TT-TTGGCACA-GAAAA---G-G--CTAAC-ATT---A--TTAC-AAA---TT---------ATGT-TTA-TG-TC--ATT-A-GAGTATCTG-AATGA----A----ATGC-ATTCTGTATCAGA--A-T-A-AGCCACTA-TCGCTA
gi|76311                      :                                                                                                                                                                                                     TAACCATT---T--TAAC-AAA---TCGTGTTTATCATGT-TTA-TT-TT--ATT---GAGTACCTT-A-TTA----A----A-AC-ATTCTG-CACAGA--A-T-G-AGCCACTC-TCGCTAC
gi|76312                      :                                                                                                                                                                                                                                                                           TTA----A----ATAC-ATTCTGTCTTAGA--A-T-A-AGCCACT


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blockSeqs                     :                                            .      .  TCCGA   .    G .        . .   .          .    TTATAGA         .       .        .             A        . . .  .   .  .  . T      .     .   . .      .   .   .     .   A    A            .   .  .  A    . .         .     .    .       .             .  . . .        .
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lowQualScore                  :                                            7      7  55555   44   0 5        4 22  4          4    99999999999999  1       2        2             4444444  2 2 2  999 2  0  0 9      9     333 9 66     8 9 222 55    8   000  999999999    8   8  8  33   8 8         9     9999 9999    0             88 0 0 0        1       
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Reference ( family-741 )      :                                      CCGGGT-ATACCC-GG-----GGT--ACT-T-CTTAGAAT-C--AA-GTGACCCGGC-GCAT------A-------TA-GTAATGA-AAATGTTG-AATTTCTACCGTA-------TA-T-A-AC---A-TT-TT-TTGGCACA-GAAAA---G-G--CTAAC-ATT---T--TTAC-AAA---TT---------ATGT-TTA-TT-TC--ATT-A-GAGTACCTG-AATTA----A----ATAC-ATTCTGTCTCAGA--A-T-A-AGCCACTA-TCGCTAC
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gi|76301                      :                                                                                                                                                                                 GCATA-TAAAATTAG-G--CTA-----C---T--TTAC-GAA---TTT--------ATGT-TTA-TTCTCA-ATTAA-GAGT-TCT--AATTA----A----ATA--ACTTTGTCTCAGA--A-T-A-AGTCACTA-TC-CTACaaattaggctactttacgaatttatgtttattctcaattaagagttctaattaaataactttgtctcagaataagtcactatcctac
gi|76302                      : ccgggtatacccggagtagttctaagaatcaagtgacccagcT-ATACCC-GC-----GGTTAACT-C-TTTAGAAT-C--AA-ATGACCCAGT-GCAT------A-------TA-GTAATGACACATGTTT-AATATC
gi|76303                      :                                       cggac-ATACCT-GT-----GGT--ACT-T-CTTAGAAT-C--AA-GTGATACGGT-GCATTTATAGA-------TAAGTAACGA-AAATGTTG-AATTTCTACCGTA-------TT-T-A-A------TTATT-TTAGCACA-GAAAA---G-G--CTAAC-ATC---T--TTGC-AAA---TT---------ATGT-TTA-TT-TC--ATT-A-GAGAACCTG-AATTG----A----ATAC-ATTCTGTCTCAGA--A-T-A-AGCCACTA-TCGCTAC
gi|76304                      :                                                     G-----GGT--ACT-TTCTTAGAAT-C--AA-GTGACA-GGT-GCAT------A-------TA----------------------TCTACCGTACAACGTGTA-T-A-AC---A-TT---------------AAA---G-G--CTAAC-A-A---T--TTACAAAA---TT---------GTGT-TTA-TT-TC--ATT-A-GAGTACCTG-AGTTA----A----ATAC-ATTCTGTCTCAGA--A-TAA-AGCCCCTC-TCTCTAC
gi|76305                      :                                                                         ccAAT-C--AC-GTGACCCGAC----T-----------------------A-AAATATTG-TCTTTCTATCATA-------TA---A-AC---A-TT-AC-CTGGCATA-GAAAA---A-G--TTAAC-GCTAGCT--TGAC-AAA------------------------------ATT-A-ATGCACCAG-GATTA-----------GC-ATTATGTCTTAGA--A-T-A-AGTTACTC-TC
gi|76306                      :                                                                                                           -------TA-GTCATGG-AAATGTTG-AATTTCTACCGTG-------GA-T-ATAC-----TT-TT-TTGGCACACGAAAA---G-G--CTAAT-ATT---TTATCAA-AAA---TT---------ATGT-TTA-TT-TTCAAAT-A-GAGGATCTG-AATTT----A----ATAA-ATTC-GTCTCAAA--ATT-A-AGCCACTA-TCGCT
gi|76307                      :                                                                                               cagtatatacgg-------TA-GTCATGA-AAATGTTG-AATT-CTACCGTG-------TAAT-A-A----A-TT-TT-A-GGCA-A-GAAAA---GCG--CTAAT-AAT---T--TTAC-AAA---CT---------ATATGTTA-TT-TC--ATA-G-AAGTATCTA-ATTTA----T----ATA--ACTCTGCC---AA--A-T-A-AG-CACTAGTCGCTAC
gi|76308                      :                                                                                                                                                 TA-------TA-T-A-AC---A-TT-TTTTTGGCACA-GAAAA---A-G--CTAAT-ATT---T--TTAC-AAA---TT---------ATAT-TTA-TT-TC--A-T-A-GAGTACCTG-AATTA----A----ATAC-ATTTTGTCTCAGA--A-T-A-AGCCACTA-CCGCTAC
gi|76309                      :                                                                                                                                                                         T-TT-TGGGCACA-GAAAA---G-G--CTAAC-ACT---T----AC-AAAA--TC---------ATGT-TTA-TT-TC--ATT-A-GAGCACCTG-CATTA----A----GTAC-ATCCTGTCTCGGA--A-T-A-AGTTACTC-TCGCTAC
gi|76310                      :                                                                                                                                                                          -TT-TTGGCACA-GAAAA---G-G--CTAAC-ATT---A--TTAC-AAA---TT---------ATGT-TTA-TG-TC--ATT-A-GAGTATCTG-AATGA----A----ATGC-ATTCTGTATCAGA--A-T-A-AGCCACTA-TCGCTA
gi|76311                      :                                                                                                                                                                                                     TAACCATT---T--TAAC-AAA---TCGTGTTTATCATGT-TTA-TT-TT--ATT---GAGTACCTT-A-TTA----A----A-AC-ATTCTG-CACAGA--A-T-G-AGCCACTC-TCGCTAC
gi|76312                      :                                                                                                                                                                                                                                                                           TTA----A----ATAC-ATTCTGTCTTAGA--A-T-A-AGCCACT