lowQualScore : 333333333333333333333333 11111 11111 333333333333 666666
lowQualScore : 0 1 1 55 3333 44 22 1 444 1 1 333 22 3 0 1 1 1 22 2 66 000000000000000000000000 3 00000 6 11111 44 222222222222 44 55555 999999 3 7777 3 3 44 3 5 5 5 5 5 5 666666 66 777 5
lowQualScore : . . . .. .... .. .. . ... . . ... .. . . . . . .. . .. ........................ . ..... . ..... .. ............ .. ..... ...... . .... . . .. . . . . . . . ...... .. ... .
lowQualScore : 6 8 8 99 7777 11 44 7 111 7 7 000 44 5 8 8 8 8 55 9 88 444444444444444444444444 1 88888 2 77777 66 333333333333 66 99999 666666 3 1111 3 3 66 3 0 0 0 0 0 0 666666 99 222 0
consensus : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CG---AAA--A-CGAGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AAT-CA-----AGATGATT--GTT-----------TTC--CTC---T-AT------TAA-GAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGT-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCG-CG-ATT--TCACC--CTTG-TAAACAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
Reference ( gi|110256 ) : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CG---AAA--A-CAAGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AAT-CA-----AGATGATT--GTA-----------TTC--CTC---T-AT------TAA-GAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGT-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCG-CG-ATTCATCACC--CTCG-TAAACAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110258 : ATTTAGACG-CCGA-GGAAGTTAT--TC----TG--C--AT-CAG--CC-A-AG---AAA--A-CAAGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----CAT-TA-----AGATTATT--GTT-----------TTC--CTC---T-AT------TAA-GAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGC-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCG-CG--TT--TCACC--CTTT-TAAATAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110261 : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CG---AAA--A-CAAGTA-CT-TTAT-TTTT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AAT-CA-----AG--------------------------------------------AA-GAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGC-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCG-CG--TT--TCACC--CTTG-TAAACAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110262 : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAT--CC-A-CG---AAA--A-CAAGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-AGATA------------------------CC-ACGGCTAAAAA----AAT-CA-----AGATGATT--GTT-----------TTC--CTC---T-AT------TAA-GAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-AACGT-C-A-CTC-TG-GCTATTCCG-AG--TT--TCACC--CTTG-TA---------------TTTGCCTCGTG
gi|110263 : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-G-CG---AAA--A-CAAATA-CT-TAAT-TTCT--ATT-T--TA------------------------AC-ACGGCTAAAA-----AAT-CA-----AGATGATT--GTT-----------TTC--CTC---T-AA------TAA-GAA----ACGAAAT-AGGT-CAAACCA--T-GA
gi|110265 : ATTTCGACG-CCGA-AGAGGTTAT--TC----TT--C--AA-CAG--CC-A-CG---AAA--AACAAGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------AC-ACGGCTAAAA-----AAN-NN-----NNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNTTC--CTC---TTGT------TAAAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GAC
gi|110266 : ATTTCGACG-CCGAAGGAGGTAATC-TC----TG--C--AA-CAA--C--A-CG---AAA--A-CAAGTAACT-TTAT-TTCT--ATTAC--TAT-----------------------CC-ACTGCTAAAACTCAGAACACATAAAAAGATGATTCGATT-----------TTC--CTTATAC-AT------TAA-CCA------GAAATTAGGTGCAAATCAGAC-GACGTAC-AAGTC-TGAGCTGTTCCG-CGTAT---TCACC--CTTGCTAAACAAACTTACGGAGTTTG
gi|110267 : ATTTCGACG-CCGA-G-AGGTATT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-AGCG---AAACGG-CAA-TA-CT-TTAT-T-CT--ATT-CC-TA------------------------CCCACG-CTAAAA-----AAT-CA-----AGATGA-T--GTT-----------TTC--CCC---T-AT------TAA-GAGACATACGAAAT-AGGT-CAAATCA--TAGAC
gi|110257 : ATTTCTCCA-CCTC-GGAAGTTAT--TC----TG--C--AA-CAA--AC-A-CG---AAA--A-CGCGTG-CT-TTAT-TTCTTAATT-C--TA------------------------C
gi|110268 : ATTTCTCCA-CCTC-GGAGGTTGT--TC----TG--C--AA-CAA--CC-A-CG---AAA--G-CACGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110269 : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--AC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CGATTAAA--A-C
gi|110270 : ATTTCTCCA-CCTC-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-AAA--CC-A-TG---AAA--A-CGCGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110259 : ATTTCTCCA-CCTC-AGAGGTTTT--TC----TG--C--AA-CAA--CC-A-CG---AAA--A-CGCGTG-CT-TCAT-TTCT--
gi|110271 : ATTTTGAGGACCAA-GGAGGTTGT--AC----TG--CTCAT-CAT--TC-A-C----AAA--A-CAAA-A-CC-TT----TCT--ATT-G--TA------------------------CT-ATGACTCAAA-----AATGTAC----AGCTGATT--GT------------TTC--TT
gi|110264 : ATTTCTCCA-CCTC-GGAGGATAT--TCCGGCTG--C--AG-CAA--CC-A-CG---AAA--A-CGCGTG-CT-TTAT-TTCT--ta
gi|110260 : ATTTCTCCA-CCTC-AGAGGTTTT--TC----TG--C--CA-CAA--CC-A-CG---AAA--A-TGCGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110272 : TTTCTCCA-CCTC-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAA--CC-G-CA---AAA--A-CGCGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110273 : TTTGACG-CCGA-GAGGTTTCT--TC----TG--C--A--C-G--CC-A-CG---AAA--AACAAGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AAT-C
gi|110274 : TTGACG-CCGA-GGAAGTGAT--TC----TG--C--AT-CAC--CC-A-AG---AAA--A-CAAGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-T--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----CAT-TA-----AGATTATT--GTT-----------TTC--CTC---T-AT------TAA-GAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGC-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCG-CG--TT--TCACC--CTTT-TAAATAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110275 : TCGGCG-TCTA-A-ATGTTAT--TC----TG--C--AA-CAT--TC-T-CG---AAA--A-CGCGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110276 : G-CCGA-GGAGGGTATC-TC----TGG-C--AAACAG--CCCA-CG---AAA--A-CAAGTA-CTGTTATATTCT--ATT-C--TAGCTTCTTCTCTTTCCTTCCCTTACCC-ATAGCTAAAA-----AAT-CA-----AGATAATT--GTG-----------TTCAGCTC---C-AT------TAA-GAA----ACGAAAT-AGG--CAAATCA--T-GACAT-CCA-GTCCTG-GCTGTTCCGTCA-ATT--TCACCGCCTTG-TAAACAACCTTTT-GAGTTTGCCTCG
gi|110277 : G-CCGA-GGCTTTTATATTC----CAAAC--AA-CATTTCG-A-CG---AAA--A-CAAGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AAT-CA-----ATATGATT--ATT-----------TTA--CTC---T-ATTACATGTAA-GAA----GCGAAAT-AGGC-CAAATCA--T-GAC
gi|110278 : -CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CG---AAA--A-CAAGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ATAGCTAAAA-----AAT-CA-----AGATAATT--GTT-----------TTC--CTC---C-AT------TAA-GAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACAT-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCG-C--ATT--TCACC--CTTG-TAAACAACCTTTT-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110279 : AGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAA--CC-A-CG---AAA--A-CGCTTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110280 : ---T-AT------TAA-GAA----TTGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGT-C-A-GTC-TG-GCTGTTCTG-CG--TT--TCACC--CTTG-TAAACAACCTTTC-GAGTTTG
Alignments
lowQualScore : 222222222222222222222222 11111 11111111111 11111 2
lowQualScore : 0 1 1 55 3333 44 22 1 333 1 1 444 1 222 1 1 1 22 2 66 888888888888888888888888 2 00000 33333333333 5 00000 44 44 777 888888 3 6666 3 3 44 3 4 4 4 4 4 4 1 66 66 4 4
lowQualScore : . . . .. .... .. .. . ... . . ... . ... . . . .. . .. ........................ . ..... ........... . ..... .. .. ... ...... . .... . . .. . . . . . . . . .. .. . .
lowQualScore : 1 7 7 66 5555 00 33 7 555 7 7 666 7 888 7 7 7 44 7 33 333333333333333333333333 9 00000 66666666666 7 88888 22 22 999 888888 1 5555 1 1 22 1 4 4 4 4 4 4 1 11 11 4 4
consensus : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CG---AAAA-CG--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATGATT--GTTTTC--CTC---TAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGT-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCG-CG-TT--TCACC--CTTG-TAAACAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
Reference ( family-728 ) : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CG---AAAA-CG--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATGATT--GTTTTC--CTC---TAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGT-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCG-CGATT--TCACC--CTTG-TAAACAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110256 : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATGATT--GTATTC--CTC---TAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGT-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCG-CGATTCATCACC--CTCG-TAAACAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110257 : ATTTCTCCA-CCTC-GGAAGTTAT--TC----TG--C--AA-CAA--AC-A-CG---AAAA-CG--CGTG-CT-TTAT-TTCTTAATT-C--TA------------------------C
gi|110258 : ATTTAGACG-CCGA-GGAAGTTAT--TC----TG--C--AT-CAG--CC-A-AG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----CA-----------T-TA-----AGATTATT--GTTTTC--CTC---TAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGC-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCG-CG-TT--TCACC--CTTT-TAAATAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110259 : ATTTCTCCA-CCTC-AGAGGTTTT--TC----TG--C--AA-CAA--CC-A-CG---AAAA-CG--CGTG-CT-TCAT-TTCT--
gi|110260 : ATTTCTCCA-CCTC-AGAGGTTTT--TC----TG--C--CA-CAA--CC-A-CG---AAAA-TG--CGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110261 : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTTT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGA---------------------------------AGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGC-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCG-CG-TT--TCACC--CTTG-TAAACAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110262 : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAT--CC-A-CG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-AGATA------------------------CC-ACGGCTAAAAA----AA-----------T-CA-----AGATGATT--GTTTTC--CTC---TAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-AACGT-C-A-CTC-TG-GCTATTCCG-AG-TT--TCACC--CTTG-TA---------------TTTGCCTCGTG
gi|110263 : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-G-CG---AAAA-CA--AATA-CT-TAAT-TTCT--ATT-T--TA------------------------AC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATGATT--GTTTTC--CTC---TAA------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAACCA--T-GA
gi|110264 : ATTTCTCCA-CCTC-GGAGGATAT--TCCGGCTG--C--AG-CAA--CC-A-CG---AAAA-CG--CGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110265 : ATTTCGACG-CCGA-AGAGGTTAT--TC----TT--C--AA-CAG--CC-A-CGA--AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------AC-ACGGCTAAAA-----AANNNNNNNNNNNN-NN-----NNNNNNNN--NNNTTC--CTCT--TGT------TAAAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GAC
gi|110266 : ATTTCGACG-CCGAAGGAGGTAATC-TC----TG--C--AA-CAA--C--A-CG---AAAA-CA--AGTAACT-TTAT-TTCT--ATTAC--TAT-----------------------CC-ACTGCTAAAACTCAGAA-----------CACATAAAAAGATGATTCGATTTTC--CTTATACAT------T-AACCA------GAAATTAGGTGCAAATCAGAC-GACGTAC-AAGTC-TGAGCTGTTCCG-CGTAT--TCACC--CTTGCTAAACAAACTTACGGAGTTTG
gi|110267 : ATTTCGACG-CCGA-G-AGGTATT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-AGCG---AAA--CGGCAATA-CT-TTAT-T-CT--ATT-CC-TA------------------------CCCACG-CTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATGA-T--GTTTTC--CCC---TAT------T-AAGAGACATACGAAAT-AGGT-CAAATCA--TAGAC
gi|110268 : ATTTCTCCA-CCTC-GGAGGTTGT--TC----TG--C--AA-CAA--CC-A-CG---AAAG-CA--CGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110269 : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--AC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CGATTAAAA-C
gi|110270 : ATTTCTCCA-CCTC-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-AAA--CC-A-TG---AAAA-CG--CGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110271 : ATTTTGAGGACCAA-GGAGGTTGT--AC----TG--CTCAT-CAT--TC-A-C----AAAA-CA--AA-A-CC-TT----TCT--ATT-G--TA------------------------CT-ATGACTCAAA-----AA-----------TGTAC----AGCTGATT--GTTT----CTT---TA
gi|110272 : TTTCTCCA-CCTC-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAA--CC-G-CA---AAAA-CG--CGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110273 : TTTGACG-CCGA-GAGGTTTCT--TC----TG--C--A--C-G--CC-A-CG---AAAAACA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-C
gi|110274 : TTGACG-CCGA-GGAAGTGAT--TC----TG--C--AT-CAC--CC-A-AG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-T--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----CA-----------T-TA-----AGATTATT--GTTTTC--CTC---TAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGC-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCG-CG-TT--TCACC--CTTT-TAAATAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110275 : TCGGCG-TCTA-A-ATGTTAT--TC----TG--C--AA-CAT--TC-T-CG---AAAA-CG--CGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110276 : G-CCGA-GGAGGGTATC-TC----TGG-C--AAACAG--CCCA-CG---AAAA-CA--AGTA-CTGTTATATTCT--ATT-C--TAGCTTCTTCTCTTTCCTTCCCTTACCC-ATAGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATAATT--GTGTTCAGCTC---CAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGG--CAAATCA--T-GACAT-CCA-GTCCTG-GCTGTTCCGTCAATT--TCACCGCCTTG-TAAACAACCTTTT-GAGTTTGCCTCG
gi|110277 : G-CCGA-GGCTTTTATATTC----CAAAC--AA-CATTTCG-A-CG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----ATATGATT--ATTTTA--CTC---TATTACATGT-AAGAA----GCGAAAT-AGGC-CAAATCA--T-GAC
gi|110278 : -CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ATAGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATAATT--GTTTTC--CTC---CAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACAT-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCG-C-ATT--TCACC--CTTG-TAAACAACCTTTT-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110279 : AGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAA--CC-A-CG---AAAA-CG--CTTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110280 : ---TAT------T-AAGAA----TTGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGT-C-A-GTC-TG-GCTGTTCTG-CG-TT--TCACC--CTTG-TAAACAACCTTTC-GAGTTTG
Alignments
lowQualScore : 222222222222222222222222 11111 11111111111 11111
lowQualScore : 0 1 1 55 3333 44 22 1 333 1 1 444 1 222 1 1 1 22 2 66 888888888888888888888888 2 00000 33333333333 5 00000 44 44 777 888888 3 6666 3 3 44 3 4 4 4 4 4 66 4 4 66 66 4 4
lowQualScore : . . . .. .... .. .. . ... . . ... . ... . . . .. . .. ........................ . ..... ........... . ..... .. .. ... ...... . .... . . .. . . . . . . .. . . .. .. . .
lowQualScore : 1 7 7 66 5555 00 33 7 555 7 7 666 7 888 7 7 7 44 7 33 333333333333333333333333 9 00000 66666666666 7 88888 22 22 999 888888 1 5555 1 1 22 1 4 4 4 4 4 11 4 4 11 11 4 4
consensus : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CG---AAAA-CG--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATGATT--GTTTTC--CTC---TAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGT-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCGC--G-T-T--TCACC--CTTG-TAAACAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
Reference ( family-728 ) : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CG---AAAA-CG--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATGATT--GTTTTC--CTC---TAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGT-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCGC--G-T-T--TCACC--CTTG-TAAACAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110256 : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATGATT--GTATTC--CTC---TAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGT-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCGC--GAT-TCATCACC--CTCG-TAAACAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110257 : ATTTCTCCA-CCTC-GGAAGTTAT--TC----TG--C--AA-CAA--AC-A-CG---AAAA-CG--CGTG-CT-TTAT-TTCTTAATT-C--TA------------------------C
gi|110258 : ATTTAGACG-CCGA-GGAAGTTAT--TC----TG--C--AT-CAG--CC-A-AG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----CA-----------T-TA-----AGATTATT--GTTTTC--CTC---TAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGC-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCGC--G-T-T--TCACC--CTTT-TAAATAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110259 : ATTTCTCCA-CCTC-AGAGGTTTT--TC----TG--C--AA-CAA--CC-A-CG---AAAA-CG--CGTG-CT-TCAT-TTCT--
gi|110260 : ATTTCTCCA-CCTC-AGAGGTTTT--TC----TG--C--CA-CAA--CC-A-CG---AAAA-TG--CGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110261 : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTTT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGA---------------------------------AGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGC-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCGC--G-T-T--TCACC--CTTG-TAAACAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110262 : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAT--CC-A-CG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-AGATA------------------------CC-ACGGCTAAAAA----AA-----------T-CA-----AGATGATT--GTTTTC--CTC---TAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-AACGT-C-A-CTC-TG-GCTATTCCGA--G-T-T--TCACC--CTTG-TA---------------TTTGCCTCGTG
gi|110263 : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-G-CG---AAAA-CA--AATA-CT-TAAT-TTCT--ATT-T--TA------------------------AC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATGATT--GTTTTC--CTC---TAA------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAACCA--T-GA
gi|110264 : ATTTCTCCA-CCTC-GGAGGATAT--TCCGGCTG--C--AG-CAA--CC-A-CG---AAAA-CG--CGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110265 : ATTTCGACG-CCGA-AGAGGTTAT--TC----TT--C--AA-CAG--CC-A-CGA--AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------AC-ACGGCTAAAA-----AANNNNNNNNNNNN-NN-----NNNNNNNN--NNNTTC--CTCT--TGT------TAAAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GAC
gi|110266 : ATTTCGACG-CCGAAGGAGGTAATC-TC----TG--C--AA-CAA--C--A-CG---AAAA-CA--AGTAACT-TTAT-TTCT--ATTAC--TAT-----------------------CC-ACTGCTAAAACTCAGAA-----------CACATAAAAAGATGATTCGATTTTC--CTTATACAT------T-AACCA------GAAATTAGGTGCAAATCAGAC-GACGTAC-AAGTC-TGAGCTGTTCCGC--G-TAT--TCACC--CTTGCTAAACAAACTTACGGAGTTTG
gi|110267 : ATTTCGACG-CCGA-G-AGGTATT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-AGCG---AAA--CGGCAATA-CT-TTAT-T-CT--ATT-CC-TA------------------------CCCACG-CTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATGA-T--GTTTTC--CCC---TAT------T-AAGAGACATACGAAAT-AGGT-CAAATCA--TAGAC
gi|110268 : ATTTCTCCA-CCTC-GGAGGTTGT--TC----TG--C--AA-CAA--CC-A-CG---AAAG-CA--CGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110269 : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--AC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CGATTAAAA-C
gi|110270 : ATTTCTCCA-CCTC-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-AAA--CC-A-TG---AAAA-CG--CGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110271 : ATTTTGAGGACCAA-GGAGGTTGT--AC----TG--CTCAT-CAT--TC-A-C----AAAA-CA--AA-A-CC-TT----TCT--ATT-G--TA------------------------CT-ATGACTCAAA-----AA-----------TGTAC----AGCTGATT--GTTT----CTT---TA
gi|110272 : TTTCTCCA-CCTC-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAA--CC-G-CA---AAAA-CG--CGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110273 : TTTGACG-CCGA-GAGGTTTCT--TC----TG--C--A--C-G--CC-A-CG---AAAAACA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-C
gi|110274 : TTGACG-CCGA-GGAAGTGAT--TC----TG--C--AT-CAC--CC-A-AG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-T--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----CA-----------T-TA-----AGATTATT--GTTTTC--CTC---TAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGC-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCGC--G-T-T--TCACC--CTTT-TAAATAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110275 : TCGGCG-TCTA-A-ATGTTAT--TC----TG--C--AA-CAT--TC-T-CG---AAAA-CG--CGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110276 : G-CCGA-GGAGGGTATC-TC----TGG-C--AAACAG--CCCA-CG---AAAA-CA--AGTA-CTGTTATATTCT--ATT-C--TAGCTTCTTCTCTTTCCTTCCCTTACCC-ATAGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATAATT--GTGTTCAGCTC---CAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGG--CAAATCA--T-GACAT-CCA-GTCCTG-GCTGTTCCGTCAA-T-T--TCACCGCCTTG-TAAACAACCTTTT-GAGTTTGCCTCG
gi|110277 : G-CCGA-GGCTTTTATATTC----CAAAC--AA-CATTTCG-A-CG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----ATATGATT--ATTTTA--CTC---TATTACATGT-AAGAA----GCGAAAT-AGGC-CAAATCA--T-GAC
gi|110278 : -CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ATAGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATAATT--GTTTTC--CTC---CAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACAT-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCGC--A-T-T--TCACC--CTTG-TAAACAACCTTTT-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110279 : AGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAA--CC-A-CG---AAAA-CG--CTTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110280 : ---TAT------T-AAGAA----TTGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGT-C-A-GTC-TG-GCTGTTCTGC--G-T-T--TCACC--CTTG-TAAACAACCTTTC-GAGTTTG
Alignments
lowQualScore : 222222222222222222222222 11111 11111111111 11111
lowQualScore : 0 1 1 55 3333 44 22 1 333 1 1 444 1 222 1 1 1 22 2 66 888888888888888888888888 2 00000 33333333333 5 00000 44 44 777 888888 3 6666 3 3 44 3 4 4 4 4 4 66 4 4 66 66 4 4
lowQualScore : . . . .. .... .. .. . ... . . ... . ... . . . .. . .. ........................ . ..... ........... . ..... .. .. ... ...... . .... . . .. . . . . . . .. . . .. .. . .
lowQualScore : 1 7 7 66 5555 00 33 7 555 7 7 666 7 888 7 7 7 44 7 33 333333333333333333333333 9 00000 66666666666 7 88888 22 22 999 888888 1 5555 1 1 22 1 4 4 4 4 4 11 4 4 11 11 4 4
consensus : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CG---AAAA-CG--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATGATT--GTTTTC--CTC---TAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGT-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCGC--G-T-T--TCACC--CTTG-TAAACAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
Reference ( family-728 ) : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CG---AAAA-CG--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATGATT--GTTTTC--CTC---TAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGT-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCGC--G-T-T--TCACC--CTTG-TAAACAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110256 : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATGATT--GTATTC--CTC---TAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGT-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCGC--GAT-TCATCACC--CTCG-TAAACAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110257 : ATTTCTCCA-CCTC-GGAAGTTAT--TC----TG--C--AA-CAA--AC-A-CG---AAAA-CG--CGTG-CT-TTAT-TTCTTAATT-C--TA------------------------C
gi|110258 : ATTTAGACG-CCGA-GGAAGTTAT--TC----TG--C--AT-CAG--CC-A-AG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----CA-----------T-TA-----AGATTATT--GTTTTC--CTC---TAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGC-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCGC--G-T-T--TCACC--CTTT-TAAATAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110259 : ATTTCTCCA-CCTC-AGAGGTTTT--TC----TG--C--AA-CAA--CC-A-CG---AAAA-CG--CGTG-CT-TCAT-TTCT--
gi|110260 : ATTTCTCCA-CCTC-AGAGGTTTT--TC----TG--C--CA-CAA--CC-A-CG---AAAA-TG--CGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110261 : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTTT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGA---------------------------------AGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGC-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCGC--G-T-T--TCACC--CTTG-TAAACAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110262 : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAT--CC-A-CG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-AGATA------------------------CC-ACGGCTAAAAA----AA-----------T-CA-----AGATGATT--GTTTTC--CTC---TAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-AACGT-C-A-CTC-TG-GCTATTCCGA--G-T-T--TCACC--CTTG-TA---------------TTTGCCTCGTG
gi|110263 : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-G-CG---AAAA-CA--AATA-CT-TAAT-TTCT--ATT-T--TA------------------------AC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATGATT--GTTTTC--CTC---TAA------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAACCA--T-GA
gi|110264 : ATTTCTCCA-CCTC-GGAGGATAT--TCCGGCTG--C--AG-CAA--CC-A-CG---AAAA-CG--CGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110265 : ATTTCGACG-CCGA-AGAGGTTAT--TC----TT--C--AA-CAG--CC-A-CGA--AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------AC-ACGGCTAAAA-----AANNNNNNNNNNNN-NN-----NNNNNNNN--NNNTTC--CTCT--TGT------TAAAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GAC
gi|110266 : ATTTCGACG-CCGAAGGAGGTAATC-TC----TG--C--AA-CAA--C--A-CG---AAAA-CA--AGTAACT-TTAT-TTCT--ATTAC--TAT-----------------------CC-ACTGCTAAAACTCAGAA-----------CACATAAAAAGATGATTCGATTTTC--CTTATACAT------T-AACCA------GAAATTAGGTGCAAATCAGAC-GACGTAC-AAGTC-TGAGCTGTTCCGC--G-TAT--TCACC--CTTGCTAAACAAACTTACGGAGTTTG
gi|110267 : ATTTCGACG-CCGA-G-AGGTATT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-AGCG---AAA--CGGCAATA-CT-TTAT-T-CT--ATT-CC-TA------------------------CCCACG-CTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATGA-T--GTTTTC--CCC---TAT------T-AAGAGACATACGAAAT-AGGT-CAAATCA--TAGAC
gi|110268 : ATTTCTCCA-CCTC-GGAGGTTGT--TC----TG--C--AA-CAA--CC-A-CG---AAAG-CA--CGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110269 : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--AC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CGATTAAAA-C
gi|110270 : ATTTCTCCA-CCTC-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-AAA--CC-A-TG---AAAA-CG--CGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110271 : ATTTTGAGGACCAA-GGAGGTTGT--AC----TG--CTCAT-CAT--TC-A-C----AAAA-CA--AA-A-CC-TT----TCT--ATT-G--TA------------------------CT-ATGACTCAAA-----AA-----------TGTAC----AGCTGATT--GTTT----CTT---TA
gi|110272 : TTTCTCCA-CCTC-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAA--CC-G-CA---AAAA-CG--CGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110273 : TTTGACG-CCGA-GAGGTTTCT--TC----TG--C--A--C-G--CC-A-CG---AAAAACA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-C
gi|110274 : TTGACG-CCGA-GGAAGTGAT--TC----TG--C--AT-CAC--CC-A-AG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-T--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----CA-----------T-TA-----AGATTATT--GTTTTC--CTC---TAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGC-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCGC--G-T-T--TCACC--CTTT-TAAATAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110275 : TCGGCG-TCTA-A-ATGTTAT--TC----TG--C--AA-CAT--TC-T-CG---AAAA-CG--CGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110276 : G-CCGA-GGAGGGTATC-TC----TGG-C--AAACAG--CCCA-CG---AAAA-CA--AGTA-CTGTTATATTCT--ATT-C--TAGCTTCTTCTCTTTCCTTCCCTTACCC-ATAGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATAATT--GTGTTCAGCTC---CAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGG--CAAATCA--T-GACAT-CCA-GTCCTG-GCTGTTCCGTCAA-T-T--TCACCGCCTTG-TAAACAACCTTTT-GAGTTTGCCTCG
gi|110277 : G-CCGA-GGCTTTTATATTC----CAAAC--AA-CATTTCG-A-CG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----ATATGATT--ATTTTA--CTC---TATTACATGT-AAGAA----GCGAAAT-AGGC-CAAATCA--T-GAC
gi|110278 : -CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ATAGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATAATT--GTTTTC--CTC---CAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACAT-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCGC--A-T-T--TCACC--CTTG-TAAACAACCTTTT-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110279 : AGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAA--CC-A-CG---AAAA-CG--CTTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110280 : ---TAT------T-AAGAA----TTGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGT-C-A-GTC-TG-GCTGTTCTGC--G-T-T--TCACC--CTTG-TAAACAACCTTTC-GAGTTTG
blockSeqs : A A AT CGGC AA TC A TTT C G ATT A GCA A G A TA A GA GCTTCTTCTCTTTCCTTCCCTTAC C CTCAG NNNNNNNNNNN A TAAAA CG AG ATA TACATG A ACAT T G GA A A C A C A CA . A . GC C G
blockSeqs : . . C . G . . A . . A . C . . . . . C T . A . G C . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . G . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . .
blockSeqCons : **
originalCons : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CG---AAAA-CG--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATGATT--GTTTTC--CTC---TAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGT-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCGC--G-T-T--TCACC--CTTG-TAAACAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
finalCons : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CG---AAAA-CG--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATGATT--GTTTTC--CTC---TAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGT-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCGC--G-T-T--TCACC--CTTG-TAAACAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
Alignments
lowQualScore : 222222222222222222222222 11111 11111111111 11111
lowQualScore : 0 1 1 55 3333 44 22 1 333 1 1 444 1 222 1 1 1 22 2 66 888888888888888888888888 2 00000 33333333333 5 00000 44 44 777 888888 3 6666 3 3 44 3 4 4 4 4 4 66 4 4 66 66 4 4
lowQualScore : . . . .. .... .. .. . ... . . ... . ... . . . .. . .. ........................ . ..... ........... . ..... .. .. ... ...... . .... . . .. . . . . . . .. . . .. .. . .
lowQualScore : 1 7 7 66 5555 00 33 7 555 7 7 666 7 888 7 7 7 44 7 33 333333333333333333333333 9 00000 66666666666 7 88888 22 22 999 888888 1 5555 1 1 22 1 4 4 4 4 4 11 4 4 11 11 4 4
consensus : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CG---AAAA-CG--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATGATT--GTTTTC--CTC---TAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGT-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCGC--G-T-T--TCACC--CTTG-TAAACAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
Reference ( family-728 ) : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CG---AAAA-CG--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATGATT--GTTTTC--CTC---TAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGT-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCGC--G-T-T--TCACC--CTTG-TAAACAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110256 : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATGATT--GTATTC--CTC---TAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGT-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCGC--GAT-TCATCACC--CTCG-TAAACAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110257 : ATTTCTCCA-CCTC-GGAAGTTAT--TC----TG--C--AA-CAA--AC-A-CG---AAAA-CG--CGTG-CT-TTAT-TTCTTAATT-C--TA------------------------C
gi|110258 : ATTTAGACG-CCGA-GGAAGTTAT--TC----TG--C--AT-CAG--CC-A-AG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----CA-----------T-TA-----AGATTATT--GTTTTC--CTC---TAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGC-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCGC--G-T-T--TCACC--CTTT-TAAATAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110259 : ATTTCTCCA-CCTC-AGAGGTTTT--TC----TG--C--AA-CAA--CC-A-CG---AAAA-CG--CGTG-CT-TCAT-TTCT--
gi|110260 : ATTTCTCCA-CCTC-AGAGGTTTT--TC----TG--C--CA-CAA--CC-A-CG---AAAA-TG--CGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110261 : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTTT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGA---------------------------------AGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGC-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCGC--G-T-T--TCACC--CTTG-TAAACAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110262 : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAT--CC-A-CG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-AGATA------------------------CC-ACGGCTAAAAA----AA-----------T-CA-----AGATGATT--GTTTTC--CTC---TAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-AACGT-C-A-CTC-TG-GCTATTCCGA--G-T-T--TCACC--CTTG-TA---------------TTTGCCTCGTG
gi|110263 : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-G-CG---AAAA-CA--AATA-CT-TAAT-TTCT--ATT-T--TA------------------------AC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATGATT--GTTTTC--CTC---TAA------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAACCA--T-GA
gi|110264 : ATTTCTCCA-CCTC-GGAGGATAT--TCCGGCTG--C--AG-CAA--CC-A-CG---AAAA-CG--CGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110265 : ATTTCGACG-CCGA-AGAGGTTAT--TC----TT--C--AA-CAG--CC-A-CGA--AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------AC-ACGGCTAAAA-----AANNNNNNNNNNNN-NN-----NNNNNNNN--NNNTTC--CTCT--TGT------TAAAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GAC
gi|110266 : ATTTCGACG-CCGAAGGAGGTAATC-TC----TG--C--AA-CAA--C--A-CG---AAAA-CA--AGTAACT-TTAT-TTCT--ATTAC--TAT-----------------------CC-ACTGCTAAAACTCAGAA-----------CACATAAAAAGATGATTCGATTTTC--CTTATACAT------T-AACCA------GAAATTAGGTGCAAATCAGAC-GACGTAC-AAGTC-TGAGCTGTTCCGC--G-TAT--TCACC--CTTGCTAAACAAACTTACGGAGTTTG
gi|110267 : ATTTCGACG-CCGA-G-AGGTATT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-AGCG---AAA--CGGCAATA-CT-TTAT-T-CT--ATT-CC-TA------------------------CCCACG-CTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATGA-T--GTTTTC--CCC---TAT------T-AAGAGACATACGAAAT-AGGT-CAAATCA--TAGAC
gi|110268 : ATTTCTCCA-CCTC-GGAGGTTGT--TC----TG--C--AA-CAA--CC-A-CG---AAAG-CA--CGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110269 : ATTTCGACG-CCGA-GGAGGTTAT--AC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CGATTAAAA-C
gi|110270 : ATTTCTCCA-CCTC-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-AAA--CC-A-TG---AAAA-CG--CGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110271 : ATTTTGAGGACCAA-GGAGGTTGT--AC----TG--CTCAT-CAT--TC-A-C----AAAA-CA--AA-A-CC-TT----TCT--ATT-G--TA------------------------CT-ATGACTCAAA-----AA-----------TGTAC----AGCTGATT--GTTT----CTT---TA
gi|110272 : TTTCTCCA-CCTC-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAA--CC-G-CA---AAAA-CG--CGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110273 : TTTGACG-CCGA-GAGGTTTCT--TC----TG--C--A--C-G--CC-A-CG---AAAAACA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-C
gi|110274 : TTGACG-CCGA-GGAAGTGAT--TC----TG--C--AT-CAC--CC-A-AG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-T--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----CA-----------T-TA-----AGATTATT--GTTTTC--CTC---TAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGC-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCGC--G-T-T--TCACC--CTTT-TAAATAACCTTTC-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110275 : TCGGCG-TCTA-A-ATGTTAT--TC----TG--C--AA-CAT--TC-T-CG---AAAA-CG--CGTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110276 : G-CCGA-GGAGGGTATC-TC----TGG-C--AAACAG--CCCA-CG---AAAA-CA--AGTA-CTGTTATATTCT--ATT-C--TAGCTTCTTCTCTTTCCTTCCCTTACCC-ATAGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATAATT--GTGTTCAGCTC---CAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGG--CAAATCA--T-GACAT-CCA-GTCCTG-GCTGTTCCGTCAA-T-T--TCACCGCCTTG-TAAACAACCTTTT-GAGTTTGCCTCG
gi|110277 : G-CCGA-GGCTTTTATATTC----CAAAC--AA-CATTTCG-A-CG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ACGGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----ATATGATT--ATTTTA--CTC---TATTACATGT-AAGAA----GCGAAAT-AGGC-CAAATCA--T-GAC
gi|110278 : -CCGA-GGAGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAG--CC-A-CG---AAAA-CA--AGTA-CT-TTAT-TTCT--ATT-C--TA------------------------CC-ATAGCTAAAA-----AA-----------T-CA-----AGATAATT--GTTTTC--CTC---CAT------T-AAGAA----ACGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACAT-C-A-GTC-TG-GCTGTTCCGC--A-T-T--TCACC--CTTG-TAAACAACCTTTT-GAGTTTGCCTCGTG
gi|110279 : AGGTTAT--TC----TG--C--AA-CAA--CC-A-CG---AAAA-CG--CTTG-CT-TTAT-TTCT--
gi|110280 : ---TAT------T-AAGAA----TTGAAAT-AGGT-CAAATCA--T-GACGT-C-A-GTC-TG-GCTGTTCTGC--G-T-T--TCACC--CTTG-TAAACAACCTTTC-GAGTTTG