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Reference ( gi|15293 ) : GAAATC-G-TT-CT--TG-AT-G--AAGTTT-G-T-GAG-GCTA------GCCCGCA-G--TC--AC-C--A-GTAGA-C-AG---AA-G-A--T-G-A--GC-A--A-CAT-GAT-CA--------CTT-CTG------CTTC-T-C-----TC-TGGAGGGAG-TCC--CCAA--T-G--ACTA-TC--A-C-----A-C-GC-T--G-CT-GC--TGGA--A---A-T------CTCA----C-CCAAC------CC--CAGT-GT-TGG-AGAAAA-C-C---T--GGG--GGA-AT--T-CG--A-TG-AGA-GGT---TT--GTGTCC-TCAG-CACCAG-A-CATAA-CT-CA-C-C-AG-CTGA----AA---TTGCAGTC-GAC-CACCCAGT-C-AA-G---T-AG-C-GAGACTT---TGAAAG-AGT
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gi|15304 : AAATC-G-TT-CT--TT-AT-A--AAGTTT-G-T-TAT-GCTT------GTTCGCA-G--CC--AA-C--A-ATTGT-T-GG---AA-G-A--T-T-G--GC-A--A-CAG-GAT-CA--------ATT-CTG------CTTC-T-T-----CC-TGGAGGGAA-CCG--CCAT--T-G--ACTA-GT--G-C-----A-C-AA-T--G-CT-AC--TGGA--G---A-T------CTCA----C-CCTAC------CT--TTAT-AT-TGG-AAGAAA-TAC---T--GTG--GAA-TT--T-CG--A-CA-AAA-GGA---TT--GGGTC
gi|15305 : AATTC-G-TT-CT--TG-AT-G--AC-TTT-G-T-CAG-GCTG--------TCACA----TC--AC-C--A-GTTGA-CGAGGGAAA-A-A--T-G-C--GC-AGAA-CATTGAT-CAGCATCCAGTTT-ATG------CTTG-T-CGTCAATC-CGGAGGGAGAGCCGGCC----T-GGAACTAGTA--A-C-----AAC-CT-T--GTCT-AC--TGGATGAC--A-T------CT-A----G-CCAAC------CT--CAGT-CT-TGGGAGAAAA-T-G---T--GAA--GAT-ATC-T-CG--A-CG-AGA-------TA--GGATCC-T-AA-CACCAG-AACATAG-CT-CA-C-CCAG-CTAA----AA-------------AA-CACCAAGT-C-AA-G---T-AG-
gi|15306 : AAATC-C-TT-CT--TGCAT-----AGTCT-G-T-TGA-ACTACATGTAACCTGCA-G--TC--TG-T--A-TTGGA-G-AG---A---------G-A--GC-A--G-CAC-AAC-CA--------ATT-C--------CTTT-C-C-----T--TAGAAGATA-TTG--CCAG--T-G--GCTA-TT--A-C-----A-C-CT-T--C-CT-GC--TGGA--tagcact
gi|15307 : AATCCG-TT-CT--TG-ATTG--AACTTT-G-T-AAG-GCTG------GTCCACA-GGTTC--ACTC--A-GTGGA-C-GG---AAAG-A--T-G-A--GC-A--A-CAT-GAT-TA--------CTT-ATG------CTTCTT-C-----TC-CGGAGGGAG-CCG--CCAG--T-G--ACT--TT--A-C-----A-C-GCTT--G-CT-AC--TGGA--G---ATT------CTCACGCCC-TCAAC------CT--CAGT-CT-TGA-AGAAAA-T-G---T--GGGATATA-AT--T-CG--A-CG-AGA-GGT---AT--GGATCC-TGAA-CATCAGAA-CATAAGCTCCA-G-C-AG-CTAA----AC---TTGCAGTC-G-C-CA-CCAAT-C-AA-AAGTT-AA-T-GAGACTC---CGAATG-AGTg
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gi|15311 : G-AT-G--AAGCTT-G-T-GAG-ACTG------GCCCGCA-G--TC--AC-C--A-GTGGA-T-GGG--AA-GCA--T-G-ATTAC-A--AACAT-TATTCA--------CTT-TTG------CTTC-T-------TC-TATGGGGAG-CCG--CCAG--T-G--ACTA-TTGTA-C-----A-CCGC-TAAG-CT-AC--TGGA--G---A-T------CTCA----T-CAAAC------CT--CAGT-CT-TGG-AGAAAA-T-C---T--GGG--GGACAT--T-CGA-A-TG-AG--GAT---TG--GT---C-TCAG-CACCAG-A-CA-AA-CT-CA-CAC-AG-CTGACTG-AA---TTGCTGTC-GGC-CACCT-GTACAAA-G---T-AG-T-GAGACTT---T-AAAG-
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gi|15314 : ttatgatgacaagGA-C--G---AA-G-A--T-G-A--GC-A--A-CAT-G-T-CA--------CTT-ATG------CTTC-T-C-----TC-CG-AGGGAG-CCG--CCG---T-G--ACTAGTT--AGC-----A---GC-T--G-CTTAC--TGGA--T---A-T------CTCA----C-CCAAC------CT--CAGT-CT-TAG-AGAAAA-T-G---T--GGA--TTA-AT--TTCG--A-CGGAGA-GGT---AT--GGATCC-TCAA-CACCAG-A-CAT-G-CT-CA-C-C--G-CTT------A---CTTCAGTC-GGC-CACGCAGT-C-AAGG---T-AG-CGGAGACTC---TGAAAG-AGT
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Reference ( family-720 ) : GAAATC-G-TT-CT--TG-AT-G--AAGTTT-G-T-GAG-GCTG------GCCCGCA-G--TC-AC-CA-GTGGA-CG-G----AA-G-A--T-G-A--GC-A--A-CAT-GAT-CA--------CTT-CTG------CTTC-T-C-----TC-TGGA-GGGAG--C-CG-CC--AGT-GACTA-TT--A-C-----A-C-GC-T--G-CT-AC--TGGA----GA----T------CTC-A----C-CCAAC------C-TCAGTC-TT-GGAGA-AAAC-C---T--GGGG-A--A-A-T--TCGAC-GA-GA-GGTT--T--GG-GTCC-TCAG-CACCAG-ACATAA-CT-CA-C-CAG-CTNA---A---C----TTGCAGTC-GGC-CACCCAGT-C-AA-G---TAG-T-GAG-A-CTC---TGAAAG-AGT
gi|15291 : GAAATC-G-TT-CT--TG-AT-T--AAGTTT-G-T-GAG-ACTG------GCCCGCA-G--TC-AG-CA-GGGGA-TG-G----AA-G-A--T-G-A--AC-A--A-CAT-GAT-CA--------CTT-CTG------CCTC-T-C-----CC-TGGA-GGGAG--C-CG-CC--TGT-GACTA-TT--A-A-----A-C-GC-T--G-CT-AC--TGGA----TA----T------CTC-A----C-CCAAC------C-TCGGTC-TT-GGAAA-TATC-C---T--AGAA-A--A-A-T--TTGAC-AA-GA-GGTT--T--GG-GTCC-TCAG-TACCAG-ACATAA-CT-CA-C-CAG-CTGA---A---C----TTCCAATC-GGC-CACCCAGG-C-AA-G---TGG-T-GAG-A-CTT---TGAGAG-AGT
gi|15292 : GAAATC-G-TT-CT--TG-AT-T--AAGTTT-G-T-GAG-ACTG------GCCCGCA-G--TC-AG-CA-G-GGA-TG-G----AA-G-A--T-G-A--ACAA--A-CAT-GAT-CA--------CTT-CTG------CCTC-T-C-----CC-TGGA-GGGAG--C-CG-CC--TGT-GACTA-TT--A-A-----A-C-GC-T--G-CT-AC--TGGA----TA----T------CTC-A----C-CCAAC------C-TCGGTC-TT-GGAAA-TATC-C---T--AGAA-A--A-A-T--TTGAC-AA-GA-GGTT--T--GG-GTCC-TCAG-TACCAG-ACATAA-CT-CA-C-CAG-CTGA---A---C----TTCCAATC-GGC-CACCCAGG-C-AA-G---TGG-T-GAG-A-CTT---TGAGAG-AGT
gi|15293 : GAAATC-G-TT-CT--TG-AT-G--AAGTTT-G-T-GAG-GCTA------GCCCGCA-G--TC-AC-CA-GTAGA-CA-G----AA-G-A--T-G-A--GC-A--A-CAT-GAT-CA--------CTT-CTG------CTTC-T-C-----TC-TGGA-GGGAG--T-CC-CC--AAT-GACTA-TC--A-C-----A-C-GC-T--G-CT-GC--TGGA----AA----T------CTC-A----C-CCAAC------C-CCAGTG-TT-GGAGA-AAAC-C---T--GGGG-G--A-A-T--TCGAT-GA-GA-GGTT--T--GT-GTCC-TCAG-CACCAG-ACATAA-CT-CA-C-CAG-CTGA---A---A----TTGCAGTC-GAC-CACCCAGT-C-AA-G---TAG-C-GAG-A-CTT---TGAAAG-AGT
gi|15294 : GAAATC-G-TT-CT--TG-AT-G--AAGTGT-G-T-AAG-ACTG------GTCCTCA-G--TC-AC-CA-GTGGA-CG-G----AA-G-A--T-G-A--GC-A--A-CAT-GAT-CA--------CTT-CTG------CTTT-T-C-----TC-TAGA-GGGAG--C-CA-CC--GGT-GACTA-TT--A-C-----A-C-GC-T--G-CT-AC--TGGA----GA----T------CTC-A----C-TCAAC------C-TCAGTC-TT-GGAGA-AAAC-G---T--GGAA-A--A-T-T--TTGAC-AA-GA-GGAA--T--GG-GTCC-TTAG-CACCAG-ACATAA-CT-CA-C-CAG-CTTA---A---C----TTGCAGTA-GAC-CACCCAGT-C-AA-G---TAG-T-GAG-A-CTC---TGAAA
gi|15295 : GAAGTC-G-CT-CT--TG-AT-G--AAGTTT-G-T-GAG-GCTG------GTCCACA-G--TC-AC-CA-GTGGA-TG-G----AA-G-A--T-G-A--GC-A--A-CAT-GAT-CA--------CTT-TTG------CTTC-T-C-----TC-TGGA-GGGAG--C-CA-CC--AGT-GATTA-TT--A-C-----A-C-GC-T--G-CC-AC--TGGA----TA----T------CTC-A----T-CCAAC------C-CCAGTC-TT-GGAAA-AAAC-G---T--GGGA-A--A-A-T--TCGAC-GA-GA-GGTA--T--GG-ATCC-TCAG-CACTAG-ACATAG-CT-CA-C-CA--------------------GCAGTC-GGC-CACCCAGT-C-AA-G---TAG-T-GAG-A-CTC---TGAAAG-AGT
gi|15296 : GAAGTT-G-TT-CT--TG-AT-G--AAGTTT-G-T-AAG-GCAG------GTCCGCA-G--TC-AA-AA-GTGGA-CG-G----AA-G-A--T-G-A--AC-A--A-AAT-GAT-CA--------CCT-CTG------CTTC-T-C-----TC-TGGA-GGGAG--C-CG-AC--AGT-GACTA-TT--A-C-----A-C-GC-T--G-CT-AC--TGGA----GA----T------CTC-A----C-CCAATCTCGAGC-TCAGTT-TT-GGAGA-AAGC-C---T--TGGG-A--A-A-T--TCTAC-AA-GA-GGTT--T--GG-GTCC-TCAG-CATCAG-ACAT-A-CT-CA-C-CAG-CTGA---A---C----TTGCTGTC-GGT-CATCCAGT-C-AA-G---TAG-T-GAT-T-ATT---TGACAG-AGT
gi|15297 : GAAATC-G-TT-CT--TG-AT-T--AACTTT-G-C-GAG-GCTG------GTCCACA-G--TC-AC-CA-GTGGA-CG-G----AA-G-A--T-G-A--GC-A--A-CAT-GAT-CA--------CTT-ATA------CTTC-T-C-----TC-CGAA-GGGAG--A--------AGT-GACTA-TT--A-T-----G-C-GC-T--G-CT-AC--TGGA----GA----T------CTC-A----C-CCAAC------C-TC-----TT-GGAGA-AAAC-G---T--GGGA-T--A-A-T--TCGAC-GA-GA-GGTA--T--GG-GTCC-TCAA-CACCAG-ACATAC-CT-CA-C-CAG-CTTA---A---C----TTGCAGTC-GGC-CACCCAGT-C-AA-G---TA----GAG-A-CTC---TGAGAG-AGT
gi|15298 : GAAATC-G-TT-CA--TT-AT-G--AAGTTT-G-T-GAA-GCTG------GCTTGCA-G--TC-AA-AG-GTGGA-CG-G----AA-G-A--T-A-A--AC-A--A-CAT-GAT-CA--------CTT-CTG------CTTC-T-C-----TC-TGGA-GGGGA--C-CG-CC--AGT-GATTA-TT--A-C-----A-C-GC-T--G-CT-TC--TGGATAATTA----T------CTC-A----C-CCAAC------C-TCAGTC-TT-GGAGA-AATC-C---T---TGG-A--A-A-T--TC-------TA-GGTT--T--GG-GTCC-TCAG-CACCAG-CCATAA-CT-CA-C-CAG-CTGA---A---T----TTCCCGTC-GG--CACCCAGT-C-AA-G---TAA-T-GAG-G-CTT---TGAAAG-AGT
gi|15299 : GGAATA-G-TT-CT--TG-AT-G--AAGTTTTG-TTGAG-GCTG------GCTTG-A-G--TC-A---A-A-GGG-CG-G----AA-G-A--TTG-A-----A--A-CAT-GAT-TA--------CTTTCTG------CTTC-TGC-----TC-TG-A-GGGAG--C-AG-CC--AGT-GATTA-TT--A-ATTTAAA-C-GC-T--G-CT-TCCTTGGAT---AA----T------TCT-A----T-CCA-C------C-TCAGTC-TT-GGAGATAATC-C---T--GGGG-A--A-A-T--TC-AC-AA-GA-GGTT--T--GG-GTCC-TCAG-CACCAG-ACAC-A-CT-CA-T-CAG-TTGA---AAATC----TTCCAGTT-GGCAGACCCA-T-C-AA-G---TAGTT-GTG-G-CTTTTATGAAAGTAGT
gi|15300 : GAAATC-G-TT-TT--TG--T-G--AA-TTT-G-T-GAG-GCTG------GCC-ACA-G--TC-AC-CA-GTGGA-CG-G----AA-G-A--T-G-A--GC-A--A-CAT-G-T-CA--------CTT-CTG------C-TC-T-C-----TC------GGGA--------CC--GGT-G--TA-TT----C-----A-C-GC-T--G-TT-AC--TGGA----TA----T------CTC-A----A-CCAA-------C-TCAGTC-TT-GGAGA-GAAC-G---T--GGGA-A--A-A-A--TCGAC-GA-GA---TT--TAAGG-GTCC-TCAG--ACCA----------T-CA-A-C---TTCA---A---C----TT-CAGTC--GC-CACCCTG--C-AA-G---TAG-T-GAG-A-CTC---T
gi|15301 : GATATC-G-TTTCT--TG-AT-G--AAGTTT-G-T-GAG-GCTG------GTC---A-G--TC--C-CA-GTGAA-CG-G----AA-G-A--T-G-A--GA-A--A-CAT-GAT-CA--------CTT-ATG------CTTC-T-------TC--AGA-GGGAG--C-CG-CC--GGT-GACAT-TT--A-C-----A-T-GC-T--G----AC--TG------GA----T------TTC-A----C-CAAGT------A-T--GTC--T-GGAG----AC-CCGTC--GGGA-A--A-A-G--TCGACTGA-GACTGTA--T--GG-GTCC-TCAGACAACAG--CATAG-CT-CA---CAG-CTTAT--A---C----TTGATGT--GAC-CACCCAGT-C-AA-----T-G-T-CAGCA-CTC---TGAAAG-AGT
gi|15302 : GAAAAC-G-TT-CT--TG-AT-GGAAAGTTTTG-T-GAG-GCTC------GTCCGCATG--TCCAC-CG-GTGGA-CG-G----AA-G-A--T-G-A--GC-A----CAT-GAA-CA--------CT--CTG------CTTC-T-C-----TC-TGGA-GGGAG--C-CG-CC--AGTGGACT
gi|15303 : GAAAAC-C-TT-CT--TG-GT-G--GAGTTT-G-T-GAG-GCTA------GCTCGCA-G--TC-AA-AC-GAGGA-CG-G----AA-G-A--T-G-A--AC-A--A-CAT-GAT-AA--------CTT-CTG------CTTC-T-C-----TC-TGGA-GGG
gi|15304 : AAATC-G-TT-CT--TT-AT-A--AAGTTT-G-T-TAT-GCTT------GTTCGCA-G--CC-AA-CA-ATTGT-TG-G----AA-G-A--T-T-G--GC-A--A-CAG-GAT-CA--------ATT-CTG------CTTC-T-T-----CC-TGGA-GGGAA--C-CG-CC--ATT-GACTA-GT--G-C-----A-C-AA-T--G-CT-AC--TGGA----GA----T------CTC-A----C-CCTAC------C-TTTATA-TT-GGAAG-AAATAC---T--GTGG-A--A-T-T--TCGAC-AA-AA-GGAT--T--GG-GTC
gi|15305 : AATTC-G-TT-CT--TG-AT-G--AC-TTT-G-T-CAG-GCTG--------TCACA----TC-AC-CA-GTTGA-CG-AGGGAAA-A-A--T-G-C--GC-AGAA-CATTGAT-CAGCATCCAGTTT-ATG------CTTG-T-CGTCAATC-CGGA-GGGAGAGC-CGGCC--TGG-AACTA-GT--AAC-----AAC-CT-T--GTCT-AC--TGGAT---GA----C------ATCTA----G-CCAAC------C-TCAGTC-TTGGGAGA-AAAT-G---T--GAAG-A--T-A-TC-TCGAC-GA-GA----T--A--GG-ATCC-T-AA-CACCAGAACATAG-CT-CACC-CAG-CTAA---A-----------------AAA-CACCAAGT-C-AA-G---TAG-T-AGC-A-CT
gi|15306 : AAATC-C-TT-CT--TGCAT-----AGTCT-G-T-TGA-ACTACATGTAACCTGCA-G--TC-TG-TA-TTGGA---------GA-G-A----G-A--GC-A--G-CAC-AAC-CA--------ATT-C--------CTTT-C-C-----T--TAGA-AGATA--T-TG-CC--AGT-GGCTA-TT--A-C-----A-C-CT-T--C-CT-GC--TGGA----G
gi|15307 : AATCCG-TT-CT--TG-ATTG--AACTTT-G-T-AAG-GCTG------GTCCACA-GGTTC-ACTCA-GTGGA-CG-G----AAAG-A--T-G-A--GC-A--A-CAT-GAT-TA--------CTT-ATG------CTTCTT-C-----TC-CGGA-GGGAG--C-CG-CC--AGT-GACT--TT--A-C-----A-C-GCTT--G-CT-AC--TGGA----GAT---T------CTC-ACGCCC-TCAAC------C-TCAGTC-TT-GAAGA-AAAT-G---T--GGGATAT-A-A-T--TCGAC-GA-GA-GGTA--T--GG-ATCC-TGAA-CATCAGAACATAAGCTCCA-G-CAG-CTAA---A---C----TTGCAGTC--GC-CA-CCAAT-C-AA-AAGTTAA-T-GAG-A-CTC---CGAATG-AGT
gi|15308 : AATC-GATT-CAGATG-AT-G--AAGTTA-G-T-GTGTGCTG------GTTCACA-G--AC-AC-CACGTGGAACGAG----AA-A-AATT-GTA--GC-ATAA-CAT-AGT-AA--------TTT-CTAGCTATACTTC-TTC-----TCGCAGA-GGGAG--CGCG-CCGAAGT-GAATA-TT--A-C-----A-C-GC-T--G-CT-A---TGAA----GA----TAATATCCTC-A----CACCAACA-----CGTCAGTCATT-GGAAA-AAAC-G---T--GCGG-A--A-A-GCGTCGAC-GA-GA-TGTAAAT--GGCGTCCATCAGGCAACAG-AC-TAA-CT-CAGC-CAGACTTA---A---C----TTGCAGTCAGGC-CACCCAGT-C-AA-G---TAG-T-GAG-ACCTCCA-TGAAAG-
gi|15309 : T--TG-AT-G--AACTTT-G-T-GAT-GCTG------GTCCACA-G--TC-AA-CA-TTG-----------------------------A--A-CAT-GAT-CA--------GTT-ATG------CTTC-T-C-----TC-CGGA-GGGAT--C-TG-CC--AGT-GACTA-TT--A-C-----A-C-GC-T--G-CT-AC--TGGA----GA----T------CTC-A----C-CCAAC------C-TCAGTA-TT-GAAGA-AAAT-G---C--GAGA-T--A-A-T--TCGAC-GA-AA-GGTA--T--GG-ACCC-TGAA-CACCAG-ACATAG-CT-CA-C-CAG-CTTA---A---C----TTGCAGTC-GGA-CACACAGT-C-AA-G---TAG-T-GAG-A-CTC---TGAAAG-AGT
gi|15310 : G-AT-G--AAGCTT-G-T-GAG-ACTG------GCCCGCA-G--TC-AC-CA-GTGGA-TG-G----AA-G-A--T-G-A--AC-A--A-CAT-TAT-CA--------CTT-TTG------CTTT-T-C-----TA-TGGA-GGGAG--C-CG-CC--AGT-GACTA-TT--A-C-----A-C-GC-T--G-CT-AC--TGGA----GA----T------CTC-A----T-CCAAC------C-TCAGTC-TT-GGAGA-AATC-C---T--GGGG-G--A-A-T--TCAAC-AT-GA-GGAT--T--TG-GTCC-TCAG-CACCAG-ACATAA-CT-CA-C-CAG-CTGA---A---CTGAATTGCTGTC-GGC-CACCCTGT-C-AA-G---TAG-T-GAG-A-CTT---TTAAAG-AGT
gi|15311 : G-AT-G--AAGCTT-G-T-GAG-ACTG------GCCCGCA-G--TC-AC-CA-GTGGA-TG-GG---AA-GCA--T-G-ATTAC-A--AACAT-TATTCA--------CTT-TTG------CTTC-T-------TC-TATG-GGGAG--C-CG-CC--AGT-GACTA-TTGTA-C-----A-CCGC-TAAG-CT-AC--TGGA----GA----T------CTC-A----T-CAAAC------C-TCAGTC-TT-GGAGA-AAAT-C---T--GGGG-G--ACA-T--TCGA---ATGA-GGAT--T--GG---TC-TCAG-CACCAG-ACA-AA-CT-CA-CACAG-CTGACTGA---A----TTGCTGTC-GGC-CACCT-GTACAAA-G---TAG-T-GAG-A-CTT---T-AAAG-
gi|15312 : -AT-C--AATTTT-GAT-GAG-ACTG------GCTCGCA-T--TT-AA-TA-GTAGA-CA-G----CA-A-A--T-A-A--GC-A--A-CAT-GAT-CA--------CAT-CTG------CTTG-T-C-----T--TGGATGGGAT--C-CA-CC--AGT-TATTA-TT--A-C-----G-C-TC-T--G-CT-AC--AGGA----GA----T------ATC-A----C-CCAAC------C-TTAGTT-TT-GGAGA-AATC-C---C--AGGG-A--A-G-T--TCGAC-AA-GA-GGTT--C--CG-GTCG-TCAA-CATCAG-ACATAA-CT-CA-C-CAG-TTGA---A---A----TTG
gi|15313 : G------GCCCGCA-G--TC-AA-CT-GAGTA-CG-G----AA-G-A--T-G-A--AT-A--G-AAT-GAT-AA--------TCT-CTG------CATC-T-C-----TC-TGGA-AGGAG--C-CA-CC--AAT-AACTA-TA--A-C-----A-C-AC-T--G-AT-AC--TGAA----GA----T------CTC-A----A-CCAAC------C-GCAGTC-TT-GGAGA-A----C---TCAGGGG-A--A-A-T--TTTAC-AA-GG-GGTT--T--TA-GTCC-TCAG-CACTCG-ACATAA-AT-CA-C-CAA-CTTA---A---C----TTGTAGTC-aataga
gi|15314 : ttatgatgacaaGGA-CG------AA-G-A--T-G-A--GC-A--A-CAT-G-T-CA--------CTT-ATG------CTTC-T-C-----TC-CG-A-GGGAG--C-CG-CC---GT-GACTAGTT--AGC-----A---GC-T--G-CTTAC--TGGA----TA----T------CTC-A----C-CCAAC------C-TCAGTC-TT-AGAGA-AAA------T--GTGG-ATTA-ATT--TCGACGGA-GA-GGTA--T--GG-ATCC-TCAA-CACCAG-ACAT-G-CT-CA-C-C-G-CTT----A---C----TT-CAGTC-GGC-CACGCAGT-C-AAGG---TAG-CGGAG-A-CTC---TGAAAG-AGTaac
gi|15315 : --C-CG-CC--AGT-GATTA-TA--T-C-----A-C-GA-T--G-CC-AC--TGGA----TAATTAT------CTC-A----C-CCAAC------C-TCAGTC-TT-GGAGA-AATC-C---A--GGGG-A--A-A-T--TCGAC-GA-GA-GTTT--T--GG-GTCC-TCGG-CACCAG-AAATAA-CT-CA-C-CAG-TTGG---A---C----TTTCAGTC-GG--CACCCAGT-C-AA-G---AAG-T-GAG-G-CTA---TGAAAG-AGT
Alignments
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lowQualScore : . . . .. . . .. . . . . ...... . .. . .. . . . .... . . .. . . .. . .. . . . ........ . ...... . . ..... . . .. . . .. . . .. . ..... . . . .. . . .. .... .... ...... . .... . ...... . . . . . ..... .. . .. . . .. . . . ... .. . . . . . . . . . . ... ........ . . . . . . ... . . . . ... .
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Reference ( family-720 ) : GAAATC-G-TT-CT--TG-AT-G--AAGTTT-G-T-GAG-GCTG------GCCCGCA-G--TC-AC-CA-GTGGA-CG-G----AA-G-A--T-G-A--GC-A--A-CAT-GAT-CA--------CTT-CTG------CTTC-T-C-----TC-TGGA-GGGAG--C-CG-CC--AGT-GACTA-TT--A-C-----A-C-GC-T--G-CT-AC--TGGA----GA----T------CTC-A----C-CCAAC------C-TCAGTC-TT-GGAGA-AAAC-C---T--GGGG-A--A-A-T--TCGAC-GA-GA-GGTT--T--GG-GTCC-TCAG-CACCAG-ACATAA-CT-CA-C-CAG-CTGA---A---C----TTGCAGTC-GGC-CACCCAGT-C-AA-G---TAG-T-GAG-A-CTC---TGAAAG-AGT
gi|15291 : GAAATC-G-TT-CT--TG-AT-T--AAGTTT-G-T-GAG-ACTG------GCCCGCA-G--TC-AG-CA-GGGGA-TG-G----AA-G-A--T-G-A--AC-A--A-CAT-GAT-CA--------CTT-CTG------CCTC-T-C-----CC-TGGA-GGGAG--C-CG-CC--TGT-GACTA-TT--A-A-----A-C-GC-T--G-CT-AC--TGGA----TA----T------CTC-A----C-CCAAC------C-TCGGTC-TT-GGAAA-TATC-C---T--AGAA-A--A-A-T--TTGAC-AA-GA-GGTT--T--GG-GTCC-TCAG-TACCAG-ACATAA-CT-CA-C-CAG-CTGA---A---C----TTCCAATC-GGC-CACCCAGG-C-AA-G---TGG-T-GAG-A-CTT---TGAGAG-AGT
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gi|15294 : GAAATC-G-TT-CT--TG-AT-G--AAGTGT-G-T-AAG-ACTG------GTCCTCA-G--TC-AC-CA-GTGGA-CG-G----AA-G-A--T-G-A--GC-A--A-CAT-GAT-CA--------CTT-CTG------CTTT-T-C-----TC-TAGA-GGGAG--C-CA-CC--GGT-GACTA-TT--A-C-----A-C-GC-T--G-CT-AC--TGGA----GA----T------CTC-A----C-TCAAC------C-TCAGTC-TT-GGAGA-AAAC-G---T--GGAA-A--A-T-T--TTGAC-AA-GA-GGAA--T--GG-GTCC-TTAG-CACCAG-ACATAA-CT-CA-C-CAG-CTTA---A---C----TTGCAGTA-GAC-CACCCAGT-C-AA-G---TAG-T-GAG-A-CTC---TGAAA
gi|15295 : GAAGTC-G-CT-CT--TG-AT-G--AAGTTT-G-T-GAG-GCTG------GTCCACA-G--TC-AC-CA-GTGGA-TG-G----AA-G-A--T-G-A--GC-A--A-CAT-GAT-CA--------CTT-TTG------CTTC-T-C-----TC-TGGA-GGGAG--C-CA-CC--AGT-GATTA-TT--A-C-----A-C-GC-T--G-CC-AC--TGGA----TA----T------CTC-A----T-CCAAC------C-CCAGTC-TT-GGAAA-AAAC-G---T--GGGA-A--A-A-T--TCGAC-GA-GA-GGTA--T--GG-ATCC-TCAG-CACTAG-ACATAG-CT-CA-C-CA--------------------GCAGTC-GGC-CACCCAGT-C-AA-G---TAG-T-GAG-A-CTC---TGAAAG-AGT
gi|15296 : GAAGTT-G-TT-CT--TG-AT-G--AAGTTT-G-T-AAG-GCAG------GTCCGCA-G--TC-AA-AA-GTGGA-CG-G----AA-G-A--T-G-A--AC-A--A-AAT-GAT-CA--------CCT-CTG------CTTC-T-C-----TC-TGGA-GGGAG--C-CG-AC--AGT-GACTA-TT--A-C-----A-C-GC-T--G-CT-AC--TGGA----GA----T------CTC-A----C-CCAATCTCGAGC-TCAGTT-TT-GGAGA-AAGC-C---T--TGGG-A--A-A-T--TCTAC-AA-GA-GGTT--T--GG-GTCC-TCAG-CATCAG-ACAT-A-CT-CA-C-CAG-CTGA---A---C----TTGCTGTC-GGT-CATCCAGT-C-AA-G---TAG-T-GAT-T-ATT---TGACAG-AGT
gi|15297 : GAAATC-G-TT-CT--TG-AT-T--AACTTT-G-C-GAG-GCTG------GTCCACA-G--TC-AC-CA-GTGGA-CG-G----AA-G-A--T-G-A--GC-A--A-CAT-GAT-CA--------CTT-ATA------CTTC-T-C-----TC-CGAA-GGGAG--A--------AGT-GACTA-TT--A-T-----G-C-GC-T--G-CT-AC--TGGA----GA----T------CTC-A----C-CCAAC------C-TC-----TT-GGAGA-AAAC-G---T--GGGA-T--A-A-T--TCGAC-GA-GA-GGTA--T--GG-GTCC-TCAA-CACCAG-ACATAC-CT-CA-C-CAG-CTTA---A---C----TTGCAGTC-GGC-CACCCAGT-C-AA-G---TA----GAG-A-CTC---TGAGAG-AGT
gi|15298 : GAAATC-G-TT-CA--TT-AT-G--AAGTTT-G-T-GAA-GCTG------GCTTGCA-G--TC-AA-AG-GTGGA-CG-G----AA-G-A--T-A-A--AC-A--A-CAT-GAT-CA--------CTT-CTG------CTTC-T-C-----TC-TGGA-GGGGA--C-CG-CC--AGT-GATTA-TT--A-C-----A-C-GC-T--G-CT-TC--TGGATAATTA----T------CTC-A----C-CCAAC------C-TCAGTC-TT-GGAGA-AATC-C---T---TGG-A--A-A-T--TC-------TA-GGTT--T--GG-GTCC-TCAG-CACCAG-CCATAA-CT-CA-C-CAG-CTGA---A---T----TTCCCGTC-GG--CACCCAGT-C-AA-G---TAA-T-GAG-G-CTT---TGAAAG-AGT
gi|15299 : GGAATA-G-TT-CT--TG-AT-G--AAGTTTTG-TTGAG-GCTG------GCTTG-A-G--TC-A---A-A-GGG-CG-G----AA-G-A--TTG-A-----A--A-CAT-GAT-TA--------CTTTCTG------CTTC-TGC-----TC-TG-A-GGGAG--C-AG-CC--AGT-GATTA-TT--A-ATTTAAA-C-GC-T--G-CT-TCCTTGGAT---AA----T------TCT-A----T-CCA-C------C-TCAGTC-TT-GGAGATAATC-C---T--GGGG-A--A-A-T--TC-AC-AA-GA-GGTT--T--GG-GTCC-TCAG-CACCAG-ACAC-A-CT-CA-T-CAG-TTGA---AAATC----TTCCAGTT-GGCAGACCCA-T-C-AA-G---TAGTT-GTG-G-CTTTTATGAAAGTAGT
gi|15300 : GAAATC-G-TT-TT--TG--T-G--AA-TTT-G-T-GAG-GCTG------GCC-ACA-G--TC-AC-CA-GTGGA-CG-G----AA-G-A--T-G-A--GC-A--A-CAT-G-T-CA--------CTT-CTG------CT-C-T-C-----TC------GGGA--------CC--GGT-G--TA-TT----C-----A-C-GC-T--G-TT-AC--TGGA----TA----T------CTC-A----A-CCAAC--------TCAGTC-TT-GGAGA-GAAC-G---T--GGGA-A--A-A-A--TCGAC-GA-GA---TT--TAAGG-GTCC-TCAG--ACCA----------T-CA-A-C---TTCA---A---C----TT-CAGTC-G-C-CACCCTG--C-AA-G---TAG-T-GAG-A-CTC---T
gi|15301 : GATATC-G-TTTCT--TG-AT-G--AAGTTT-G-T-GAG-GCTG------GTC---A-G--TC--C-CA-GTGAA-CG-G----AA-G-A--T-G-A--GA-A--A-CAT-GAT-CA--------CTT-ATG------CTTC-T-------TC--AGA-GGGAG--C-CG-CC--GGT-GACAT-TT--A-C-----A-T-GC-T--G----AC--TG------GA----T------TTC-A----C-CAAGT------A-T--GTC--T-GGAG----AC-CCGTC--GGGA-A--A-A-G--TCGACTGA-GACTGTA--T--GG-GTCC-TCAGACAACAG--CATAG-CT-CA---CAG-CTTAT--A---C----TTGATGT--GAC-CACCCAGT-C-AA-----T-G-T-CAGCA-CTC---TGAAAG-AGT
gi|15302 : GAAAAC-G-TT-CT--TG-AT-GGAAAGTTTTG-T-GAG-GCTC------GTCCGCATG--TCCAC-CG-GTGGA-CG-G----AA-G-A--T-G-A--GC-A----CAT-GAA-CA--------CT--CTG------CTTC-T-C-----TC-TGGA-GGGAG--C-CG-CC--AGTGGACT
gi|15303 : GAAAAC-C-TT-CT--TG-GT-G--GAGTTT-G-T-GAG-GCTA------GCTCGCA-G--TC-AA-AC-GAGGA-CG-G----AA-G-A--T-G-A--AC-A--A-CAT-GAT-AA--------CTT-CTG------CTTC-T-C-----TC-TGGA-GGG
gi|15304 : AAATC-G-TT-CT--TT-AT-A--AAGTTT-G-T-TAT-GCTT------GTTCGCA-G--CC-AA-CA-ATTGT-TG-G----AA-G-A--T-T-G--GC-A--A-CAG-GAT-CA--------ATT-CTG------CTTC-T-T-----CC-TGGA-GGGAA--C-CG-CC--ATT-GACTA-GT--G-C-----A-C-AA-T--G-CT-AC--TGGA----GA----T------CTC-A----C-CCTAC------C-TTTATA-TT-GGAAG-AAATAC---T--GTGG-A--A-T-T--TCGAC-AA-AA-GGAT--T--GG-GTC
gi|15305 : AATTC-G-TT-CT--TG-AT-G--AC-TTT-G-T-CAG-GCTG--------TCACA----TC-AC-CA-GTTGA-CG-AGGGAAA-A-A--T-G-C--GC-AGAA-CATTGAT-CAGCATCCAGTTT-ATG------CTTG-T-CGTCAATC-CGGA-GGGAGAGC-CGGCC--TGG-AACTA-GT--AAC-----AAC-CT-T--GTCT-AC--TGGAT---GA----C------ATCTA----G-CCAAC------C-TCAGTC-TTGGGAGA-AAAT-G---T--GAAG-A--T-A-TC-TCGAC-GA-GA----T--A--GG-ATCC-T-AA-CACCAGAACATAG-CT-CACC-CAG-CTAA---A-----------------AAA-CACCAAGT-C-AA-G---TAG-T-AGC-A-CT
gi|15306 : AAATC-C-TT-CT--TGCAT-----AGTCT-G-T-TGA-ACTACATGTAACCTGCA-G--TC-TG-TA-TTGGA---------GA-G-A----G-A--GC-A--G-CAC-AAC-CA--------ATT-C--------CTTT-C-C-----T--TAGA-AGATA--T-TG-CC--AGT-GGCTA-TT--A-C-----A-C-CT-T--C-CT-GC--TGGA----G
gi|15307 : AATCCG-TT-CT--TG-ATTG--AACTTT-G-T-AAG-GCTG------GTCCACA-GGTTC-ACTCA-GTGGA-CG-G----AAAG-A--T-G-A--GC-A--A-CAT-GAT-TA--------CTT-ATG------CTTCTT-C-----TC-CGGA-GGGAG--C-CG-CC--AGT-GACT--TT--A-C-----A-C-GCTT--G-CT-AC--TGGA----GAT---T------CTC-ACGCCC-TCAAC------C-TCAGTC-TT-GAAGA-AAAT-G---T--GGGATAT-A-A-T--TCGAC-GA-GA-GGTA--T--GG-ATCC-TGAA-CATCAGAACATAAGCTCCA-G-CAG-CTAA---A---C----TTGCAGTC--GC-CA-CCAAT-C-AA-AAGTTAA-T-GAG-A-CTC---CGAATG-AGT
gi|15308 : AATC-GATT-CAGATG-AT-G--AAGTTA-G-T-GTGTGCTG------GTTCACA-G--AC-AC-CACGTGGAACGAG----AA-A-AATT-GTA--GC-ATAA-CAT-AGT-AA--------TTT-CTAGCTATACTTC-TTC-----TCGCAGA-GGGAG--CGCG-CCGAAGT-GAATA-TT--A-C-----A-C-GC-T--G-CT-A---TGAA----GA----TAATATCCTC-A----CACCAACA-----CGTCAGTCATT-GGAAA-AAAC-G---T--GCGG-A--A-A-GCGTCGAC-GA-GA-TGTAAAT--GGCGTCCATCAGGCAACAG-AC-TAA-CT-CAGC-CAGACTTA---A---C----TTGCAGTCAGGC-CACCCAGT-C-AA-G---TAG-T-GAG-ACCTCCA-TGAAAG-
gi|15309 : T--TG-AT-G--AACTTT-G-T-GAT-GCTG------GTCCACA-G--TC-AA-CA-TTG-----------------------------A--A-CAT-GAT-CA--------GTT-ATG------CTTC-T-C-----TC-CGGA-GGGAT--C-TG-CC--AGT-GACTA-TT--A-C-----A-C-GC-T--G-CT-AC--TGGA----GA----T------CTC-A----C-CCAAC------C-TCAGTA-TT-GAAGA-AAAT-G---C--GAGA-T--A-A-T--TCGAC-GA-AA-GGTA--T--GG-ACCC-TGAA-CACCAG-ACATAG-CT-CA-C-CAG-CTTA---A---C----TTGCAGTC-GGA-CACACAGT-C-AA-G---TAG-T-GAG-A-CTC---TGAAAG-AGT
gi|15310 : G-AT-G--AAGCTT-G-T-GAG-ACTG------GCCCGCA-G--TC-AC-CA-GTGGA-TG-G----AA-G-A--T-G-A--AC-A--A-CAT-TAT-CA--------CTT-TTG------CTTT-T-C-----TA-TGGA-GGGAG--C-CG-CC--AGT-GACTA-TT--A-C-----A-C-GC-T--G-CT-AC--TGGA----GA----T------CTC-A----T-CCAAC------C-TCAGTC-TT-GGAGA-AATC-C---T--GGGG-G--A-A-T--TCAAC-AT-GA-GGAT--T--TG-GTCC-TCAG-CACCAG-ACATAA-CT-CA-C-CAG-CTGA---A---CTGAATTGCTGTC-GGC-CACCCTGT-C-AA-G---TAG-T-GAG-A-CTT---TTAAAG-AGT
gi|15311 : G-AT-G--AAGCTT-G-T-GAG-ACTG------GCCCGCA-G--TC-AC-CA-GTGGA-TG-GG---AA-GCA--T-G-ATTAC-A--AACAT-TATTCA--------CTT-TTG------CTTC-T-------TC-TATG-GGGAG--C-CG-CC--AGT-GACTA-TTGTA-C-----A-CCGC-TAAG-CT-AC--TGGA----GA----T------CTC-A----T-CAAAC------C-TCAGTC-TT-GGAGA-AAAT-C---T--GGGG-G--ACA-T--TCGA---ATGA-GGAT--T--GG---TC-TCAG-CACCAG-ACA-AA-CT-CA-CACAG-CTGACTGA---A----TTGCTGTC-GGC-CACCT-GTACAAA-G---TAG-T-GAG-A-CTT---T-AAAG-
gi|15312 : -AT-C--AATTTT-GAT-GAG-ACTG------GCTCGCA-T--TT-AA-TA-GTAGA-CA-G----CA-A-A--T-A-A--GC-A--A-CAT-GAT-CA--------CAT-CTG------CTTG-T-C-----T--TGGATGGGAT--C-CA-CC--AGT-TATTA-TT--A-C-----G-C-TC-T--G-CT-AC--AGGA----GA----T------ATC-A----C-CCAAC------C-TTAGTT-TT-GGAGA-AATC-C---C--AGGG-A--A-G-T--TCGAC-AA-GA-GGTT--C--CG-GTCG-TCAA-CATCAG-ACATAA-CT-CA-C-CAG-TTGA---A---A----TTG
gi|15313 : G------GCCCGCA-G--TC-AA-CT-GAGTA-CG-G----AA-G-A--T-G-A--AT-A--G-AAT-GAT-AA--------TCT-CTG------CATC-T-C-----TC-TGGA-AGGAG--C-CA-CC--AAT-AACTA-TA--A-C-----A-C-AC-T--G-AT-AC--TGAA----GA----T------CTC-A----A-CCAAC------C-GCAGTC-TT-GGAGA-A----C---TCAGGGG-A--A-A-T--TTTAC-AA-GG-GGTT--T--TA-GTCC-TCAG-CACTCG-ACATAA-AT-CA-C-CAA-CTTA---A---C----TTGTAGTC-aataga
gi|15314 : ttatgatgacaaGGA-CG------AA-G-A--T-G-A--GC-A--A-CAT-G-T-CA--------CTT-ATG------CTTC-T-C-----TC-CG-A-GGGAG--C-CG-CC---GT-GACTAGTT--AGC-----A---GC-T--G-CTTAC--TGGA----TA----T------CTC-A----C-CCAAC------C-TCAGTC-TT-AGAGA-AAA------T--GTGG-ATTA-ATT--TCGACGGA-GA-GGTA--T--GG-ATCC-TCAA-CACCAG-ACAT-G-CT-CA-C-C-G-CTT----A---C----TT-CAGTC-GGC-CACGCAGT-C-AAGG---TAG-CGGAG-A-CTC---TGAAAG-AGTaac
gi|15315 : --C-CG-CC--AGT-GATTA-TA--T-C-----A-C-GA-T--G-CC-AC--TGGA----TAATTAT------CTC-A----C-CCAAC------C-TCAGTC-TT-GGAGA-AATC-C---A--GGGG-A--A-A-T--TCGAC-GA-GA-GTTT--T--GG-GTCC-TCGG-CACCAG-AAATAA-CT-CA-C-CAG-TTGG---A---C----TTTCAGTC-GG--CACCCAGT-C-AA-G---AAG-T-GAG-G-CTA---TGAAAG-AGT
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blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . G . . . G . . . . . . . TA . . . . . . . T . . . . . . . . . . G . . . . . . . . T T . . . . A . . . . A AC . . T . . C G . . T . . . G A . . G . . G T AATC G . . . . . . . . . . CA .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . A C . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . C G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A C . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . G . A G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . T . C G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . G . C G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T C . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . G . C C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T G . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . C . T C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A C . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . C G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A C . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . A . C G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . A . C G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . C G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . C G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . G . A G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . G . A G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T C . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . G . C G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A C . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . C T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T C . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A C . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T C . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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lowQualScore : 2 2 2 99 8 8 55 6 8 8 8 000000 7 44 7 88 7 7 7 2222 7 7 33 7 7 33 7 66 7 7 7 00000000 7 888888 7 3 22222 7 7 33 7 7 33 7 7 44 5 33333 7 7 7 44 7 7 44 2222 7777 222222 8 9999 8 000000 8 8 8 8 0 22222 55 8 33 8 8 33 6 8 8 000 55 8 9 8 8 9 9 8 9 9 2 222 33333333 9 0 1 1 1 1 777 1 1 1 1 999 5
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Reference ( family-720 ) : GAAATC-G-TT-CT--TG-AT-G--AAGTTT-G-T-GAG-GCTG------GCCCGCA-G--TC-AC-CA-GTGGA-CG-G----AA-G-A--T-G-A--GC-A--A-CAT-GAT-CA--------CTT-CTG------CTTC-T-C-----TC-TGGA-GGGAG--C-CG-CC--AGT-GACTA-TT--A-C-----A-C-GC-T--G-CT-AC--TGGA----GA----T------CTC-A----C-CCAAC------C-TCAGTC-TT-GGAGA-AAAC-C---T--GGGG-A--A-A-T--TCGAC-GA-GA-GGTT--T--GG-GTCC-TCAG-CACCAG-ACATAA-CT-CA-C-CAG-CTGA---A---C----TTGCAGTC-GGC-CACCCAGT-C-AA-G---TAG-T-GAG-A-CTC---TGAAAG-AGT
gi|15291 : GAAATC-G-TT-CT--TG-AT-T--AAGTTT-G-T-GAG-ACTG------GCCCGCA-G--TC-AG-CA-GGGGA-TG-G----AA-G-A--T-G-A--AC-A--A-CAT-GAT-CA--------CTT-CTG------CCTC-T-C-----CC-TGGA-GGGAG--C-CG-CC--TGT-GACTA-TT--A-A-----A-C-GC-T--G-CT-AC--TGGA----TA----T------CTC-A----C-CCAAC------C-TCGGTC-TT-GGAAA-TATC-C---T--AGAA-A--A-A-T--TTGAC-AA-GA-GGTT--T--GG-GTCC-TCAG-TACCAG-ACATAA-CT-CA-C-CAG-CTGA---A---C----TTCCAATC-GGC-CACCCAGG-C-AA-G---TGG-T-GAG-A-CTT---TGAGAG-AGT
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gi|15295 : GAAGTC-G-CT-CT--TG-AT-G--AAGTTT-G-T-GAG-GCTG------GTCCACA-G--TC-AC-CA-GTGGA-TG-G----AA-G-A--T-G-A--GC-A--A-CAT-GAT-CA--------CTT-TTG------CTTC-T-C-----TC-TGGA-GGGAG--C-CA-CC--AGT-GATTA-TT--A-C-----A-C-GC-T--G-CC-AC--TGGA----TA----T------CTC-A----T-CCAAC------C-CCAGTC-TT-GGAAA-AAAC-G---T--GGGA-A--A-A-T--TCGAC-GA-GA-GGTA--T--GG-ATCC-TCAG-CACTAG-ACATAG-CT-CA-C-CA--------------------GCAGTC-GGC-CACCCAGT-C-AA-G---TAG-T-GAG-A-CTC---TGAAAG-AGT
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gi|15302 : GAAAAC-G-TT-CT--TG-AT-GGAAAGTTTTG-T-GAG-GCTC------GTCCGCATG--TCCAC-CG-GTGGA-CG-G----AA-G-A--T-G-A--GC-A----CAT-GAA-CA--------CT--CTG------CTTC-T-C-----TC-TGGA-GGGAG--C-CG-CC--AGTGGACT
gi|15303 : GAAAAC-C-TT-CT--TG-GT-G--GAGTTT-G-T-GAG-GCTA------GCTCGCA-G--TC-AA-AC-GAGGA-CG-G----AA-G-A--T-G-A--AC-A--A-CAT-GAT-AA--------CTT-CTG------CTTC-T-C-----TC-TGGA-GGG
gi|15304 : AAATC-G-TT-CT--TT-AT-A--AAGTTT-G-T-TAT-GCTT------GTTCGCA-G--CC-AA-CA-ATTGT-TG-G----AA-G-A--T-T-G--GC-A--A-CAG-GAT-CA--------ATT-CTG------CTTC-T-T-----CC-TGGA-GGGAA--C-CG-CC--ATT-GACTA-GT--G-C-----A-C-AA-T--G-CT-AC--TGGA----GA----T------CTC-A----C-CCTAC------C-TTTATA-TT-GGAAG-AAATAC---T--GTGG-A--A-T-T--TCGAC-AA-AA-GGAT--T--GG-GTC
gi|15305 : AATTC-G-TT-CT--TG-AT-G--AC-TTT-G-T-CAG-GCTG--------TCACA----TC-AC-CA-GTTGA-CG-AGGGAAA-A-A--T-G-C--GC-AGAA-CATTGAT-CAGCATCCAGTTT-ATG------CTTG-T-CGTCAATC-CGGA-GGGAGAGC-CGGCC--TGG-AACTA-GT--AAC-----AAC-CT-T--GTCT-AC--TGGAT---GA----C------ATCTA----G-CCAAC------C-TCAGTC-TTGGGAGA-AAAT-G---T--GAAG-A--T-A-TC-TCGAC-GA-GA----T--A--GG-ATCC-T-AA-CACCAGAACATAG-CT-CACC-CAG-CTAA---A-----------------AAA-CACCAAGT-C-AA-G---TAG-T-AGC-A-CT
gi|15306 : AAATC-C-TT-CT--TGCAT-----AGTCT-G-T-TGA-ACTACATGTAACCTGCA-G--TC-TG-TA-TTGGA---------GA-G-A----G-A--GC-A--G-CAC-AAC-CA--------ATT-C--------CTTT-C-C-----T--TAGA-AGATA--T-TG-CC--AGT-GGCTA-TT--A-C-----A-C-CT-T--C-CT-GC--TGGA----G
gi|15307 : AATCCG-TT-CT--TG-ATTG--AACTTT-G-T-AAG-GCTG------GTCCACA-GGTTC-ACTCA-GTGGA-CG-G----AAAG-A--T-G-A--GC-A--A-CAT-GAT-TA--------CTT-ATG------CTTCTT-C-----TC-CGGA-GGGAG--C-CG-CC--AGT-GACT--TT--A-C-----A-C-GCTT--G-CT-AC--TGGA----GAT---T------CTC-ACGCCC-TCAAC------C-TCAGTC-TT-GAAGA-AAAT-G---T--GGGATAT-A-A-T--TCGAC-GA-GA-GGTA--T--GG-ATCC-TGAA-CATCAGAACATAAGCTCCA-G-CAG-CTAA---A---C----TTGCAGTC--GC-CA-CCAAT-C-AA-AAGTTAA-T-GAG-A-CTC---CGAATG-AGT
gi|15308 : AATC-GATT-CAGATG-AT-G--AAGTTA-G-T-GTGTGCTG------GTTCACA-G--AC-AC-CACGTGGAACGAG----AA-A-AATT-GTA--GC-ATAA-CAT-AGT-AA--------TTT-CTAGCTATACTTC-TTC-----TCGCAGA-GGGAG--CGCG-CCGAAGT-GAATA-TT--A-C-----A-C-GC-T--G-CT-A---TGAA----GA----TAATATCCTC-A----CACCAACA-----CGTCAGTCATT-GGAAA-AAAC-G---T--GCGG-A--A-A-GCGTCGAC-GA-GA-TGTAAAT--GGCGTCCATCAGGCAACAG-AC-TAA-CT-CAGC-CAGACTTA---A---C----TTGCAGTCAGGC-CACCCAGT-C-AA-G---TAG-T-GAG-ACCTCCA-TGAAAG-
gi|15309 : T--TG-AT-G--AACTTT-G-T-GAT-GCTG------GTCCACA-G--TC-AA-CA-TTG-----------------------------A--A-CAT-GAT-CA--------GTT-ATG------CTTC-T-C-----TC-CGGA-GGGAT--C-TG-CC--AGT-GACTA-TT--A-C-----A-C-GC-T--G-CT-AC--TGGA----GA----T------CTC-A----C-CCAAC------C-TCAGTA-TT-GAAGA-AAAT-G---C--GAGA-T--A-A-T--TCGAC-GA-AA-GGTA--T--GG-ACCC-TGAA-CACCAG-ACATAG-CT-CA-C-CAG-CTTA---A---C----TTGCAGTC-GGA-CACACAGT-C-AA-G---TAG-T-GAG-A-CTC---TGAAAG-AGT
gi|15310 : G-AT-G--AAGCTT-G-T-GAG-ACTG------GCCCGCA-G--TC-AC-CA-GTGGA-TG-G----AA-G-A--T-G-A--AC-A--A-CAT-TAT-CA--------CTT-TTG------CTTT-T-C-----TA-TGGA-GGGAG--C-CG-CC--AGT-GACTA-TT--A-C-----A-C-GC-T--G-CT-AC--TGGA----GA----T------CTC-A----T-CCAAC------C-TCAGTC-TT-GGAGA-AATC-C---T--GGGG-G--A-A-T--TCAAC-AT-GA-GGAT--T--TG-GTCC-TCAG-CACCAG-ACATAA-CT-CA-C-CAG-CTGA---A---CTGAATTGCTGTC-GGC-CACCCTGT-C-AA-G---TAG-T-GAG-A-CTT---TTAAAG-AGT
gi|15311 : G-AT-G--AAGCTT-G-T-GAG-ACTG------GCCCGCA-G--TC-AC-CA-GTGGA-TG-GG---AA-GCA--T-G-ATTAC-A--AACAT-TATTCA--------CTT-TTG------CTTC-T-------TC-TATG-GGGAG--C-CG-CC--AGT-GACTA-TTGTA-C-----A-CCGC-TAAG-CT-AC--TGGA----GA----T------CTC-A----T-CAAAC------C-TCAGTC-TT-GGAGA-AAAT-C---T--GGGG-G--ACA-T--TCGA---ATGA-GGAT--T--GG---TC-TCAG-CACCAG-ACA-AA-CT-CA-CACAG-CTGACTGA---A----TTGCTGTC-GGC-CACCT-GTACAAA-G---TAG-T-GAG-A-CTT---T-AAAG-
gi|15312 : -AT-C--AATTTT-GAT-GAG-ACTG------GCTCGCA-T--TT-AA-TA-GTAGA-CA-G----CA-A-A--T-A-A--GC-A--A-CAT-GAT-CA--------CAT-CTG------CTTG-T-C-----T--TGGATGGGAT--C-CA-CC--AGT-TATTA-TT--A-C-----G-C-TC-T--G-CT-AC--AGGA----GA----T------ATC-A----C-CCAAC------C-TTAGTT-TT-GGAGA-AATC-C---C--AGGG-A--A-G-T--TCGAC-AA-GA-GGTT--C--CG-GTCG-TCAA-CATCAG-ACATAA-CT-CA-C-CAG-TTGA---A---A----TTG
gi|15313 : G------GCCCGCA-G--TC-AA-CT-GAGTA-CG-G----AA-G-A--T-G-A--AT-A--G-AAT-GAT-AA--------TCT-CTG------CATC-T-C-----TC-TGGA-AGGAG--C-CA-CC--AAT-AACTA-TA--A-C-----A-C-AC-T--G-AT-AC--TGAA----GA----T------CTC-A----A-CCAAC------C-GCAGTC-TT-GGAGA-A----C---TCAGGGG-A--A-A-T--TTTAC-AA-GG-GGTT--T--TA-GTCC-TCAG-CACTCG-ACATAA-AT-CA-C-CAA-CTTA---A---C----TTGTAGTC-aataga
gi|15314 : ttatgatgacaaGGA-CG------AA-G-A--T-G-A--GC-A--A-CAT-G-T-CA--------CTT-ATG------CTTC-T-C-----TC-CG-A-GGGAG--C-CG-CC---GT-GACTAGTT--AGC-----A---GC-T--G-CTTAC--TGGA----TA----T------CTC-A----C-CCAAC------C-TCAGTC-TT-AGAGA-AAA------T--GTGG-ATTA-ATT--TCGACGGA-GA-GGTA--T--GG-ATCC-TCAA-CACCAG-ACAT-G-CT-CA-C-C-G-CTT----A---C----TT-CAGTC-GGC-CACGCAGT-C-AAGG---TAG-CGGAG-A-CTC---TGAAAG-AGTaac
gi|15315 : --C-CG-CC--AGT-GATTA-TA--T-C-----A-C-GA-T--G-CC-AC--TGGA----TAATTAT------CTC-A----C-CCAAC------C-TCAGTC-TT-GGAGA-AATC-C---A--GGGG-A--A-A-T--TCGAC-GA-GA-GTTT--T--GG-GTCC-TCGG-CACCAG-AAATAA-CT-CA-C-CAG-TTGG---A---C----TTTCAGTC-GG--CACCCAGT-C-AA-G---AAG-T-GAG-G-CTA---TGAAAG-AGT