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gi|127702                     :                                  AT-GT-ACCT---T-CG--TA--CAT--TTCC--C-ACTT-TT-TGA-CGTCACAAT--GAAAAAGT-G-CGTCAC
gi|127703                     :                                  AT-GT-ACCT---T-CG--TA--CAT--TTCC----ACTT-TT-TGA-CGTCACAAT--GAAAAAGT-G-CGTCAC
gi|127704                     :                                  AT-GT-ACCT---C-TG--TG--CAC--TTCG--C-ACCA-TA-TGA-CGTTACAAT--TGAAAAGT-A-CGTTA
gi|127705                     :                                  AT-GT-ACCT---C-TG--TG--CAC--TTCG--C-ACCA-TA-TGA-CGT-ACAAT--TGAAAAGT-A-CGTCA
gi|127706                     :                                  AT-GT-ACCT---C-TG--TG--CAC--TGCG--C-ACCA-TA-TGA-CGCCACAAT--TGAAAAGT-A-CGTCA
gi|127707                     :                                  AT-GT-ACCC---C-AG--TG--CAC--TTCG--C-AGTG-TG-TGA-CGCCACAAT--ACAAAAGT-A-CGTCAC
gi|127708                     :                                  AT-GT-AC-T---C-TG--TG--CAC--TTCC--A-CCCA-TA-TGA-CGTCACAATTGGAAAAAGT-A-CGTC
gi|127709                     :                                  AT-GT-ATCT---C-AG--TG--CAC--TTCA--T-ACTT-CA-TTA-CGTAACAAT--GAAAATGT-A-CGTAAC
gi|127710                     :                                  AT-GT-GCCT---C-TG--TA--CAC--TTCCAGC-AGTA-CG-TGA-CGTCATAAT--ACAAAAGT-A-TGTCAC


blockSeqs                     :       T AGCA   T AAA TA      CG    A  T    AGC G  CA  TA   CT    AG C   TC  T   G         TG        G C
blockSeqs                     :       . .      T A   T       .     .  .    AG  .  .   .    .     .  .   T   .   .         .         . .
blockSeqs                     :       . .      . .   .       .     .  .    G   .  .   .    .     .  .   T   .   .         .         . .
blockSeqs                     :       . .      . .   .       .     .  .    .   .  .   .    .     .  .   T   .   .         .         . .
blockSeqs                     :       . .      . .   .       .     .  .    .   .  .   .    .     .  .   T   .   .         .         . .
blockSeqs                     :       . .      . .   .       .     .  .    .   .  .   .    .     .  .   T   .   .         .         . .
blockSeqs                     :       . .      . .   .       .     .  .    .   .  .   .    .     .  .   T   .   .         .         . .
blockSeqs                     :       . .      . .   .       .     .  .    .   .  .   .    .     .  .   T   .   .         .         . .
blockSeqs                     :       . .      . .   .       .     .  .    .   .  .   .    .     .  .   T   .   .         .         . .
blockSeqs                     :       . .      . .   .       .     .  .    .   .  .   .    .     .  .   T   .   .         .         . .
blockSeqs                     :       . .      . .   .       .     .  .    .   .  .   .    .     .  .   A   .   .         .         . .
blockSeqs                     :       . .      . .   .       .     .  .    .   .  .   .    .     .  .   T   .   .         .         . .
blockSeqs                     :       . .      . .   .       .     .  .    .   .  .   .    .     .  .   C   .   .         .         . .
blockSeqs                     :                  .   .       .     .  .    .   .  .   .    .     .  .   A   .   .         .         . .
blockSeqs                     :                              .     .  .    .   .  .   .    .     .  .   A   .   .         .         . .
blockSeqs                     :                                    .  .    .   .  .   .    .     .  .   T   .   .         .         . .
blockSeqs                     :                                    .  .    .   .  .   .    .     .  .   T   .   .         .         . .
blockSeqs                     :                                    .  .    .   .  .   .    .     .  .   T   .   .         .         . .
blockSeqs                     :                                    .  .    .   .  .   .    .     .  .   A   .   .         .         . .
blockSeqs                     :                                    .  .    .   .  .   .    .     .  .   A   .   .         .         . .
blockSeqs                     :                                    .  .    .   .  .   .    .     .  .   A   .   .         .         . .
blockSeqs                     :                                    .  .    .   .  .   .    .     .  .   G   .   .         .         . .
blockSeqs                     :                                    .  .    .   .  .   .    .     .  .   A   .   .         .         . .
blockSeqs                     :                                    .  .    .   .  .   .    .     .  .   T   .   .         .         . .
blockSeqs                     :                                    .  .    .   .  .   .    .     .  .   A                              


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : CAACAG-G----GAG-A---T--AACTCT--GGAT-GT-ACCT---C-CG--TA--CAT--TTCC--C-ACTT-TA-TGA-CGTCACAAT--GAAAAAGT-G-CGTCAC
finalCons                     : CAACAG-G----GAG-A---T--AACTCT--GGAT-GT-ACCT---C-CG--TA--CAT--TTCC--C-ACTT-TA-TGA-CGTCACAAT--GAAAAAGT-G-CGTCAC





Alignments
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lowQualScore                  :       . ....   . ... ..      ..    .  .    ... .  ..  ..   ..    .. .   ..  .   .         ..        . .      
lowQualScore                  :       9 1111   7 333 33      44    5  5    333 5  11  11   11    11 5   00  6   6         22        6 6      
consensus                     : CAACAG-G----GAG-A---T--AACTCT--GGAT-GT-ACCT---C-CG--TA--CAT--TTCC--C-ACTT-TA-TGA-CGTCACAAT--GAAAAAGT-G-CGTCAC
Reference ( family-704 )      : CAACAG-G----GAG-A---T--AACTCT--GGAT-GT-ACCT---C-CG--TA--CAT--TTCC--C-ACTT-TA-TGA-CGTCACAAT--GAAAAAGT-G-CGTCAC
gi|127685                     : CAACAG-G----GAG-A---T--AACTCT--GGAT-GT-ACCT---C-CG--TA--CAT--TTCC--C-ACTT-TA-TGA-CGTCACAAT--GAAAAAGT-G-CGTCAC
gi|127686                     : CAACAG-G----GAG-A---T--AACTCT--GGAT-GT-ACCT---C-CG--TA--CAT--TTCC--C-ACTT-TA-TGA-CGTCACAAT--GAAAAAGT-G-CGTCAC
gi|127687                     : CAACGG-G----GAG-A---T--AACTCT--GGAT-GT-ACCT---C-CG--TA--CAT--TTCC--C-ACTT-TA-TGA-CGTCACAAT--GAAAAAGT-G-CGTCAC
gi|127688                     : CAACAG-G----GAG-A---T--AACTCT--GGAT-GT-ACCT---C-CG--CA--CAT--TT-C--C-ACTT-TA-TGA-CGTCACAAT--GAAAAAGT-G-CGTCAC
gi|127689                     : CAACAG-G----GAG-A---T--AACTCT--GGAT-GT-ACCT---C-CG--TA--CAT--TTCC--C-ACTT-TA-AAA-CGTCACAAT--GAAAAAGT-G-TGTCAC
gi|127690                     : CAACAG-G----GAG-AAAAT--AACTCT--GGAT-GT-ACCT---T-CG--TA--CAT--TTCC--C-ACTT-TA-TGA-CGTCACAAT--GAAAACAC-G-TGTCAC
gi|127691                     : CAACAG-G----GATTA---T--AACTCT--GGAT-GT-ACCT---C--G--TA--CATCTTTCC--C-ACTT-TA-TGA-CGTCACAAT--GAAAGAGT-G-CGTCAC
gi|127692                     : CAACAG-G----GAGTA---T--AACTCT--GGAT-GT-ACCT---C-CG--TATACAT--TTCC--CCACTT-TA--GA-CGTCACAAT--GAAAAAGT-G-CGT
gi|127693                     : CAACAG-GAGCAGGA-A---TTAAACTCT--GGAT-GT-ACCT---C-CG--TA--CAT--TTCC--C-ACTT-TA-TGAGGGGTACAAT--GAAAAAGT-G--GTCAC
gi|127694                     : CAACAGTG----GAG-A---TT-AACTCTCGGGAT-GT-ATCC---T-CG--TA--CAT--TTCC----ACGT-GA-TGA-CGTCACAAT--GAAAAAGT-T-CGTCAC
gi|127695                     : CAA-AG-G----GAG-A---T--AAC-CT--GGAT-GTTACCTAGCCGCG--TA--CAT--TTCC--C-ATTA-TA-TGA-CGTCACAAT--GAAAAGGTGG-CGTTAC
gi|127696                     : CAACAG-G----GAG-A---T--AACTCT--TGAT-GT-ACCT---C-TA--CG--CAC--TTCA--C-ACTT-
gi|127697                     :  AACAG-G----GAG-AA--T--AACTGT--GGAT-GT--CCTG--T-CG--TA--TAT--TTCC--C-ACTTCTA-TCA-CGTCACAAT--G-AAAACT-G-CGTCAC
gi|127698                     :     AA-G----GAG-A---T--AACTCT--GGATAGT-ACCTAG-C-CGCATA--CAT--TTCC--C-ACTC-TATTGA-CTCCACAAT--GAAAAGGT-GCCGTTAC
gi|127699                     :                  ---T--GACTAT--GAAT-GT-ACCT---C-TG--TG--CAC--TTCG--C-TCCA-TA-TGA-CGTCACAAT--TGAAAATT-A-CGTCA
gi|127700                     :                            CT--AAAT-GT-ACCC---C-AG--TG--CAC--TTCA--C-AGCA-TC-TGA-AGTCACGAT--GAAAAAAT-G-CGTCA
gi|127701                     :                                  AT-GT-ACCT---T-CG--TA--CAT--TTCC--C-ACTT-TT-TGA-CGTCACAAT--GAAAAAGT-G-CGTCAC
gi|127702                     :                                  AT-GT-ACCT---T-CG--TA--CAT--TTCC--C-ACTT-TT-TGA-CGTCACAAT--GAAAAAGT-G-CGTCAC
gi|127703                     :                                  AT-GT-ACCT---T-CG--TA--CAT--TTCC----ACTT-TT-TGA-CGTCACAAT--GAAAAAGT-G-CGTCAC
gi|127704                     :                                  AT-GT-ACCT---C-TG--TG--CAC--TTCG--C-ACCA-TA-TGA-CGTTACAAT--TGAAAAGT-A-CGTTA
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gi|127707                     :                                  AT-GT-ACCC---C-AG--TG--CAC--TTCG--C-AGTG-TG-TGA-CGCCACAAT--ACAAAAGT-A-CGTCAC
gi|127708                     :                                  AT-GT-AC-T---C-TG--TG--CAC--TTCC--A-CCCA-TA-TGA-CGTCACAATTGGAAAAAGT-A-CGTC
gi|127709                     :                                  AT-GT-ATCT---C-AG--TG--CAC--TTCA--T-ACTT-CA-TTA-CGTAACAAT--GAAAATGT-A-CGTAAC
gi|127710                     :                                  AT-GT-GCCT---C-TG--TA--CAC--TTCCAGC-AGTA-CG-TGA-CGTCATAAT--ACAAAAGT-A-TGTCAC