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gi|5357 : CCCCTC-A----A-CA--AT--CAA--T---------AG-A-T-GT-G-A-C--G-GC-CCCA-AG-T----GG------CGAA-------------TT--G---AAG-CA--CTG-G-T-AA---A-C-G-C-AA---G---T-GC---A---C-A-A--CG-TC-AC-----C-AAT-A-C-A-AAT--T-C-A-A-T--CA-ATGAGTG---C-AATC--AA----T-A--A--AA-T--C----AATCAAt
gi|5358 : CCCCTC-A----A-CATAAT--CAA--T-CA-AAT-CAA-A-T-AG-A-A-G--A-GC-CCCA-AGGT----GG--G---CGAA-------------TT--G---ATG-CA--CT--GGT-AA---AGC-G-CAA----G---T-GC---A---C---AA-CG-TC-A------C-AAT-TCC-A-AAT--T-C---A-T--CA-AT--------C-AGTC--------T-CA-A--AA-T--C----AATt
gi|5359 : CCCCTC-A----A-CA--ATTTCAA--TTCA-A-T-CAATA-TTGT-G-A-C--G-GC-CCCA-AG-T----GG--C---GGAA-------------TT--G---A-G-CA--CTG-GGT-AA---A-C-G-G-AA---G---T-GC---A---C-A-GA-CG-TC-AC-----C-AAT-T-C-A-AAT--T-C-A-T-C--TA-AT--------C-AGTC--AA----T-C--A--A
gi|5360 : CCCCTC-A----AACA--AT--CAA--T-CA-A-T-AAA-A---GC---A-C--G-GC-CCCA-AG-T----GG------C-AA-------------TT--G---A-G-CA--CTG-GGT-AA---A-C-G-C-AA---G---T-GC---A---CCA-AA-CG-TC-AC-----C-AAT-T-CAA-AAT--T-C-A-ATT--CA-AT--------C-ATTC--AA----C-------AA-T--C----AAtaagtacatcaat
gi|5361 : CCCCTC-ATAAAA-CAC-AT--CAA--T-CA-A-T-AAA-A-T-GT-G-A-C--GTGC-CCCA-GG------GG--G---CTAAAAAT---------TT--GA--A-A-CA--CTATGAT-AA---A-C-G-CAA----G---T-GCT--ATTCT-A-AA-CG-TC-AC-----C-AAT-T-C----AT--TAC-A-A-T--CA-AT--------C-ACTC--AACTTCT-C--AAGAG-T--C----AATAAA
gi|5362 : CCCCTCTA----A-CA--AT--CAAG-T-GA-A-A-CAA-A-T-GT-G-A-C--G-GC-CCCA-AC-TCGCCGC--G---CGAA-------------TT--GA--A-G-CACCCTG-GGT-AA---A-CGG-C-A----G---T-GC---A---C-A-AA-CGTTC-AC-----C-AAT-T-T-A-AAT--T-C-ACA-T--CA-AT--------C-AGTC--AA----TCC--A--CATT--C----AATTAA
gi|5363 : CCTCTC-A----A-CA--AT--CAA--G-CA-A-TACAA-ACT-AT-G-A-C--G-AC-CCCA--G-T----GG--G---CGAA-------------TT--G---T-G-CG--CTG-GGT-AA---A-C-C-CAA----G---C-AC---A---C-C-AC-CG-TT-AA-----C-AGT-A-C-A-AA-------A-G-T--CA-AT--------
gi|5364 : CCTCTC-A----A-CA--ATT-CAA--G-CA-A-T-AAC-A-C-TT-G-A-C--G-AC-CCCA--G-T----GG------CGAA-------------TT--G---T-G-CG--CTG-GGTAAA---A-C-C-C-A----A---CAGC---A---C-A-AACCG-TTAACA----C-AGT-A-C-A-AA-------A-G-T--CA-AT--------aaacaat
gi|5365 : CCCCTC-A----A-CA--ATT-CAAACT-CA-A-T-CAA-A-T-GT-G-C-C--G----CCCA-AT-T----GG------CGAA-------------TT--GG--A-G-CA--CTG-G-T-AA---T-C-G-C-A----AGCCT-GC---A---C-AGAA-CG-TC-AC-----C-AAT-T------AT----C-A-A-T--CA-GTTGTATTTTC-AATC--AA----T-A--A--AA-T--C----AATCaaacaat
gi|5366 : CCCTC-A------CA--AT--CAA--T-CA-A-T-CAA-A-T-GT-G-A----G-GC-CCCA-AG-T----GG--G---CGAA-------------TT--G-----G-CA--CTG-GGT-AA---A-C-G-CAA----G---T-GC---A---C-A-AA-CG-TC-AC-----C-AAT-T-C-A-AAT--T-C-A-A-T--CA-AT--------C-AGTC--AA----T-C-----AA-T--CATAAAATCAAcaataattaagaaatcaatcaat
gi|5367 : CCCAC-A----A-CA--AT--CAA--T-CA-A---CAA-A-T-GT-G-A-C--G-GT-CCC--AG-T----GGGCG---CGAA-------------TT--G---A-G-CA--CTG-GGT-AA---A-C-GAA-A----G---T--C---A---C-A-AA-CG-TC-A------C-AAT-T-C---AAT--T-C-A-A-T--CA-AT--------C-AATC--AA----T----A--AA-T--T----AATCAAt
gi|5368 : CCCTC-A----A-CA---T----A--C-TA-A-T-CAA-A-T-GT-G-A-C--G-GC-C--A-AG-T----GG--G---GAAA-------------TT--G---A-GGCA--CTG-GGT-AA---A-C-G-C-A--------T-GC---A--------A-CG-TC-AC-----C-A-T-T-C-A-A-T--T-C-A-A-T--CA-AT--------C-AGTC--AA----T-C--A--TA-T--CAT--AATCAAt
gi|5369 : CCCTC-A------CA--AT--CAA--T-CA---T-CAA---T-GTTG-A-T--G-GC-CC---AG-T----GG--GG--CGAT-------------TG--G---A-G-CG----G-GGT-AA---A-C-G---A----G---T-GC---AT--C-A-AA-CG-TC-ACAATATC-AAT-T-C-A-TAC--G-C-A-G-T--CA-AT--------C-AATCATAA----T-C------A-T--C----AATt
gi|5370 : CCCTC-A----A-CAC-AT--CAA--T-CA-A-T-CAA-A-T-GC-T-A-CTCG-CC-CTCA-AG-T----GG------CGAACTTAAGGATCAATTT--G---A-G-CA--CTG-GGA-AT---A-C---C-A----G---T-GC---A---C---AA-C--TC-AC-----C-AATCT-C-A-AAT--T-C-A-A-T--AAGAT--------C-AGTC--AA----T-------AA-T--C----AATAAA
gi|5371 : TC-A----A-CA--AAA-CAA----CA-A-TTCAA-A-T-GT-GGA-C--G-GG-CCCC-AG-T----GG--TAATTGAAAT-----------TT--G---A-G--A--CTG-AGT-AATTTA-C-A---A----G---T-GCCCAA---T-A-AC-CG-TC-ACG----C-AAT-----A-AAT--TTC-A-A-T--C--AT--------C-AATT--AA----T-C--A--AT-A--C----AATCAaatatcaatcaataaatcaatcaat
gi|5372 : C-A----A-CA--AT--CA---T-TA-A-T-CA------GT-G-A-C--G-GCACCTA-AG-T----GG--G-----AA-------------TG--G---A-G-CA---TG-GGT-A------C-G-C-AA---G---T-GC---AT--C-A-GA-CG-T--AC-----C-AAT-T-T-C-AAT--T-A-A-A-T--CA-GT--------CAAGTC--AA----T-CATA--AA-T--C----CATgggcatttcaatcaatcaatc
blockSeqs : T TAAA A TA TT AC T C A A T C T T G A TC T A T G CGCC TAAT CTTAAGGATCAAT TG CGA A G CC C A TTT A G A ACAAT GCC A CCA TTC C G C T A AATAT C TC A T CA A G C T TA G TGTATTTT A AT CTTC CAAG T GA ATAA
blockSeqs : . . . C T G . C . T . . . . . . . . . . . . GCG AAAT . A T . A T . TT A . . AA . . CT A . . A . . A A CT . . . T . . . . . GAGTG . . C CATA . C AT
blockSeqs : . . . C T . . . . . . . . . . . . . . . . . GG AT . A . . . . . . G . . AA . . T T . . C . . G . T . . . . . . . . . . . . . CAA . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . AA . . . T . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . CCA . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . CA . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . CA . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . CA . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . CA . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . AA . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . CA . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . AA . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . CA . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . CA . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : CA*****
originalCons : CCCCTC-A----A-CA--AT--CAA--T-CA-A-T-CAA-A-T-GT-G-A-C--G-GC-CCCA-AG-T----GG--G---CGAA-------------TT--G---A-G-CA--CTG-GGT-AA---A-C-G-C-A----G---T-GC---A---C-A-AA-CG-TC-AC-----C-AAT-T-C-A-AAT--T-C-A-A-T--CA-AT--------C-AGTC--AA----T-C--A--AA-T--C----AATCAA
finalCons : CCCCTC-A----A-CA--AT--CAA--T-CA-A-T-CAA-A-T-GT-G-A-C--G-GC-CCCA-AG-T----GG--G---CGAA-------------TT--G---A-G-CA--CTG-GGT-AA---A-C-G-C-A----G---T-GC---A---C-A-AA-CG-TC-AC-----C-AAT-T-C-A-AAT--T-C-A-A-T--CA-AT--------C-AGTC--AA----TCA-----AA-T--C----AATCAA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111 111111 1111111
lowQualScore : 1 3333 1 55 66 33 1 3 1 3 1 1 1 1 1 1 22 1 1 0 1 1 3333 777777 3333333333333 22 777 3 1 33 3 1 444 4 1 1 777777 222 1 666 777 1 1 4 1 1 66666 3 555 1 1 22 3 1 1 1 22 1 99999999 1 0 22 5555 5555555 1 44 6666
lowQualScore : . .... . .. .. .. . . . . . . . . . . .. . . . . . .... ...... ............. .. ... . . .. . . ... . . . ...... ... . ... ... . . . . . ..... . ... . . .. . . . . .. . ........ . . .. .... ....... . .. ....
lowQualScore : 5 3333 5 22 77 77 5 1 5 1 5 5 5 5 5 5 11 5 5 2 5 5 3333 999999 8888888888888 11 333 1 5 77 1 5 888 6 5 5 777777 777 5 333 333 5 5 6 5 5 99999 1 888 5 5 11 1 5 5 5 11 5 44444444 7 2 44 4444 0000000 9 55 7777
consensus : CCCCTC-A----A-CA--AT--CAA--T-CA-A-T-CAA-A-T-GT-G-A-C--G-GC-CCCA-AG-T----GG--G---CGAA-------------TT--G---A-G-CA--CTG-GGT-AA---A-C-G-C-A----G---T-GC---A---C-A-AA-CG-TC-AC-----C-AAT-T-C-A-AAT--T-C-A-A-T--CA-AT--------C-AGTC--AA----T-C--A--AA-T--C----AATCAA
Reference ( family-696 ) : CCCCTC-A----A-CA--AT--CAA--T-CA-A-T-CAA-A-T-GT-G-A-C--G-GC-CCCA-AG-T----GG--G---CGAA-------------TT--G---A-G-CA--CTG-GGT-AA---A-C-G-C-A----G---T-GC---A---C-A-AA-CG-TC-AC-----C-AAT-T-C-A-AAT--T-C-A-A-T--CA-AT--------C-AGTC--AA----T-C--A--AA-T--C----AATCAA
gi|5347 : CCCCTT-A----A-CA--AT--CAA--T-CA-A-T-CAA-A-T-GG-G-A-C--G-GC-CCCA-AG-T----GG--G---CGAA-------------TT--G---A-G-CA--TTG-GGT-AA---A-C-G-CAA----G---T-GC---A---T-A-AA-CG-TC-AC-----C-AAT-A-C-A-AAT--T-C-A-A-T--CA-AT--------C-AGTC--AA----T-C-----AA-T--C----AATCAA
gi|5348 : CCCCTC-A----A-CA--AT--CAA--T-CA-A-T-CAA-A-T-GT-G-A-C--G-GC-C--A-AG-T----GG--G---CGAA-------------TT--G---A-G-CA--CTG-GGT-AA---A-C-G-C-A----G---T-GC---A---C-A-AA-CG-TC-AC-----C-AAT-T-C-A-AAT--T-C-A-A-T--CA-AT--------C-AGTC--AA----T-C--A--AA-T--C----AATAAAt
gi|5349 : CCCCTC-A----A-CA--AT--CAA-------A-T-CAA-T-T-GT-G-A-C--G-GC-CCCATAG-------G--G---CGAA-------------TT--G---A-G-CA---TG-GGT-AA---A-C-G-A-A----G---T-GC---A---C-A-A--CG-TC-AC-----C-AA----C-A-AATCAT-C-A-A-T--CA-GT--------C-AATC--AT----T-C--A--AT-T--C----AATCAA
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gi|5352 : CCCCTC-A----A-CA--AT--CAA--T-CCCA-T-CAA-A-T-GT-G-AAC--G-GC-C--A-AG-T----GG--G---CGAA-------------TT--G---A-G-CAA-CTG-GGT-AATT-A---G-C-AA---G---T-GC---AA--C-A-AA-CG--C-AC-----CCAAT-A-C-A-AAT--T-C-A-G-T--CA-AT--------C-AATC--AG----T-C-----AG-T--C----AATCAAt
gi|5353 : CCACTC-A----A-CA--AG--TAA--T-CA-G-T-TAA-A-T-G--G-A-C--G-GC-CC-A-AG-T----GG--G---CGAA-------------TT--GCGAA-G-CA--CTGCGGT-AA---A-T-G-C-ACAATG---T-TCCT-A---C-A-AACCG-TC-AC-----CAAAT-A-C-ATGAT--T-C-G-A-CTACA-A---------C-ATCC--AAC---T-C--A--GC-TC-C----AATCGAt
gi|5354 : CCCCTC-A----A-CA--AT--CAA--T-CA-A-T-CAA-A-T-GT-G-A-C----------A-AG-T----GG--G---CGAA-------------TTTGG---A-G-CA--CTG-GGT-AA---AAC-G-C-AA---G---T-GC---A---C-A-AA-CG-TC-AC-----C-AAT-T-C-A-AAT--T-CGA-A-T--C--AT--------C-AATC--AA----T-C-----AA-T--C----AATTAAt
gi|5355 : CCCCTC-A----A-CA--AT--CAA--T-CA-A-T-CAC-A-A-GT-G-A-C--G-GC-CCCA-AG-T----GG--G---CGAA-------------GT--G---A-G-TA--CTG-AGT-AA---A-C-G-C------G---T-GC---A---C-A-AA-CG-TC-AC-----C-GAT-A-C-A-AAT--T-C-A-A-T--CA-AT--------C-ATTC--AA----T-C--A--At
gi|5356 : CCCCTC-A----A-CA--AT--CAA--T-CA-A-T-CAA---T-GT---A-C--G-GC-CC-A-AG-T----GG--G---CGA--------------TT--G---A-G-CA--CTG-GGT-AA---AAC-G-C-AA---G---T-GC---A---C-A-AAACG-TC-AC-----C-AAT-T-C-A-AAT--T-C-A-A-T--CA-AT--------C-AGTC--AA----T-C-----AA-TGAC----AATCAAtaaataaa
gi|5357 : CCCCTC-A----A-CA--AT--CAA--T---------AG-A-T-GT-G-A-C--G-GC-CCCA-AG-T----GG------CGAA-------------TT--G---AAG-CA--CTG-G-T-AA---A-C-G-C-AA---G---T-GC---A---C-A-A--CG-TC-AC-----C-AAT-A-C-A-AAT--T-C-A-A-T--CA-ATGAGTG---C-AATC--AA----T-A--A--AA-T--C----AATCAAt
gi|5358 : CCCCTC-A----A-CATAAT--CAA--T-CA-AAT-CAA-A-T-AG-A-A-G--A-GC-CCCA-AGGT----GG--G---CGAA-------------TT--G---ATG-CA--CT--GGT-AA---AGC-G-CAA----G---T-GC---A---C---AA-CG-TC-A------C-AAT-TCC-A-AAT--T-C---A-T--CA-AT--------C-AGTC--------T-CA-A--AA-T--C----AATt
gi|5359 : CCCCTC-A----A-CA--ATTTCAA--TTCA-A-T-CAATA-TTGT-G-A-C--G-GC-CCCA-AG-T----GG--C---GGAA-------------TT--G---A-G-CA--CTG-GGT-AA---A-C-G-G-AA---G---T-GC---A---C-A-GA-CG-TC-AC-----C-AAT-T-C-A-AAT--T-C-A-T-C--TA-AT--------C-AGTC--AA----T-C--A--A
gi|5360 : CCCCTC-A----AACA--AT--CAA--T-CA-A-T-AAA-A---GC---A-C--G-GC-CCCA-AG-T----GG------C-AA-------------TT--G---A-G-CA--CTG-GGT-AA---A-C-G-C-AA---G---T-GC---A---CCA-AA-CG-TC-AC-----C-AAT-T-CAA-AAT--T-C-A-ATT--CA-AT--------C-ATTC--AA----C-------AA-T--C----AAtaagtacatcaat
gi|5361 : CCCCTC-ATAAAA-CAC-AT--CAA--T-CA-A-T-AAA-A-T-GT-G-A-C--GTGC-CCCA-GG------GG--G---CTAAAAAT---------TT--GA--A-A-CA--CTATGAT-AA---A-C-G-CAA----G---T-GCT--ATTCT-A-AA-CG-TC-AC-----C-AAT-T-C----AT--TAC-A-A-T--CA-AT--------C-ACTC--AACTTCT-C--AAGAG-T--C----AATAAA
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gi|5363 : CCTCTC-A----A-CA--AT--CAA--G-CA-A-TACAA-ACT-AT-G-A-C--G-AC-CCCA--G-T----GG--G---CGAA-------------TT--G---T-G-CG--CTG-GGT-AA---A-C-C-CAA----G---C-AC---A---C-C-AC-CG-TT-AA-----C-AGT-A-C-A-AA-------A-G-T--CA-AT--------
gi|5364 : CCTCTC-A----A-CA--ATT-CAA--G-CA-A-T-AAC-A-C-TT-G-A-C--G-AC-CCCA--G-T----GG------CGAA-------------TT--G---T-G-CG--CTG-GGTAAA---A-C-C-C-A----A---CAGC---A---C-A-AACCG-TTAACA----C-AGT-A-C-A-AA-------A-G-T--CA-AT--------aaacaat
gi|5365 : CCCCTC-A----A-CA--ATT-CAAACT-CA-A-T-CAA-A-T-GT-G-C-C--G----CCCA-AT-T----GG------CGAA-------------TT--GG--A-G-CA--CTG-G-T-AA---T-C-G-C-A----AGCCT-GC---A---C-AGAA-CG-TC-AC-----C-AAT-T------AT----C-A-A-T--CA-GTTGTATTTTC-AATC--AA----T-A--A--AA-T--C----AATCaaacaat
gi|5366 : CCCTC-A------CA--AT--CAA--T-CA-A-T-CAA-A-T-GT-G-A----G-GC-CCCA-AG-T----GG--G---CGAA-------------TT--G-----G-CA--CTG-GGT-AA---A-C-G-CAA----G---T-GC---A---C-A-AA-CG-TC-AC-----C-AAT-T-C-A-AAT--T-C-A-A-T--CA-AT--------C-AGTC--AA----T-C-----AA-T--CATAAAATCAAcaataattaagaaatcaatcaat
gi|5367 : CCCAC-A----A-CA--AT--CAA--T-CA-A---CAA-A-T-GT-G-A-C--G-GT-CCC--AG-T----GGGCG---CGAA-------------TT--G---A-G-CA--CTG-GGT-AA---A-C-GAA-A----G---T--C---A---C-A-AA-CG-TC-A------C-AAT-T-C---AAT--T-C-A-A-T--CA-AT--------C-AATC--AA----T----A--AA-T--T----AATCAAt
gi|5368 : CCCTC-A----A-CA---T----A--C-TA-A-T-CAA-A-T-GT-G-A-C--G-GC-C--A-AG-T----GG--G---GAAA-------------TT--G---A-GGCA--CTG-GGT-AA---A-C-G-C-A--------T-GC---A--------A-CG-TC-AC-----C-A-T-T-C-A-A-T--T-C-A-A-T--CA-AT--------C-AGTC--AA----T-C--A--TA-T--CAT--AATCAAt
gi|5369 : CCCTC-A------CA--AT--CAA--T-CA---T-CAA---T-GTTG-A-T--G-GC-CC---AG-T----GG--GG--CGAT-------------TG--G---A-G-CG----G-GGT-AA---A-C-G---A----G---T-GC---AT--C-A-AA-CG-TC-ACAATATC-AAT-T-C-A-TAC--G-C-A-G-T--CA-AT--------C-AATCATAA----T-C------A-T--C----AATt
gi|5370 : CCCTC-A----A-CAC-AT--CAA--T-CA-A-T-CAA-A-T-GC-T-A-CTCG-CC-CTCA-AG-T----GG------CGAACTTAAGGATCAATTT--G---A-G-CA--CTG-GGA-AT---A-C---C-A----G---T-GC---A---C---AA-C--TC-AC-----C-AATCT-C-A-AAT--T-C-A-A-T--AAGAT--------C-AGTC--AA----T-------AA-T--C----AATAAA
gi|5371 : TC-A----A-CA--AAA-CAA----CA-A-TTCAA-A-T-GT-GGA-C--G-GG-CCCC-AG-T----GG--TAATTGAAAT-----------TT--G---A-G--A--CTG-AGT-AATTTA-C-A---A----G---T-GCCCAA---T-A-AC-CG-TC-ACG----C-AAT-----A-AAT--TTC-A-A-T--C--AT--------C-AATT--AA----T-C--A--AT-A--C----AATCAaatatcaatcaataaatcaatcaat
gi|5372 : C-A----A-CA--AT--CA---T-TA-A-T-CA------GT-G-A-C--G-GCACCTA-AG-T----GG--G-----AA-------------TG--G---A-G-CA---TG-GGT-A------C-G-C-AA---G---T-GC---AT--C-A-GA-CG-T--AC-----C-AAT-T-T-C-AAT--T-A-A-A-T--CA-GT--------CAAGTC--AA----T-CATA--AA-T--C----CATgggcatttcaatcaatcaatc