lowQualScore : 1 3 3 55555 33 1 1 33 3 22 1 222 1 1 1 3 222 3 1 1 1 44444 222 1 1 222 1 1
lowQualScore : . . . ..... .. . . .. . .. . ... . . . . ... . . . . ..... ... . . ... . .
lowQualScore : 7 3 3 88888 88 6 5 77 1 11 5 777 5 5 5 1 777 1 5 5 6 00000 888 6 6 999 7 7
consensus : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
Reference ( gi|81126 ) : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81124 : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81129 : TATTA-GTTA-C-ACA-----TTCAGTTC--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81127 : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--AG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-G-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81130 : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AT-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GG-A-----A---TG-G-AAG---T-CCGT-ATTCGG
gi|81131 : TATTA-GTTA-CCACAC----GTCAGTTT--CG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-ACGG---GT-G-T-GA-A-----A---TT-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81132 : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-ATTAAC-G---G-AG-CATC-C-A-TG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AGAAGTT-CCGT-ATTGGG
gi|81133 : TATTA-GTTAAC-ACA-----GTCAGTTT--GG-GA--G--TA-AT--AC-A---A-AGTCATC-C-AAGG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T--CGT-ATTGG
gi|81134 : TATTG-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG------------------------G-A-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81125 : TATTA-GTCA-C-ACA-----GTCAGCTT--AG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTTATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----AGCTTG----AG---T-CCCA-ATTGGG
gi|81128 : TATTAAGTTA-T-ACATTAAAGTCAGTTTTTAG-GACAG--TA-AT--A--G---G-AGTCATGAC-A-GG---GA-G-T-GGGA-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATGGG
gi|81135 : ATTC-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-A--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-TG---GT-A-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81138 : ATTT-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AT--------GTAATC-C-A--G---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81137 : ATTC-GTT--C-ACA-----GTCAGTTT--GG-ACC-A--TA-AT--AC-G---G-AGTCAT--C-A-GG---GT-GAT-GA-A-----A---TG-G--AA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81136 : ATTC-GTTA-C-ACA------TCAGTTT--GG-GAC-A--TA-AT--AC-------AGTCATC-C-A-GGGCTGT-G-T-GA-GTATATA---TG-G-AAA---T-CCAT-ATTGGG
gi|81139 : ATTC-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-A--TA-TT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-
gi|81140 : ATTT-GTTA-C-TTA-----GTCAGCTT--CG-AAC-A--TC-AT--GCTGATCG-AGTCGTC-C-A-AG---GT-T-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CTGT-CTTGGG
gi|81141 : TTC-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTTT-GGTGAC-AA-TA-AT--AC-G---GGAGTCATC-CCA-GG---GT-G-TTGA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81142 : TA-GTTAAC-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-C-AG---GTGG-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81143 : TA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---AG-G-
gi|81144 : TA-ATTG-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--GA-AT--AC-------AGTCA------------AT-G------A-----A---TG-GAAAA---T-AC-T-ATTGGG
gi|81145 : A-ATTA-CCACA-----GTCAGTTT---G-GAC-A--TATAT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---AT-G-T-G--G-----A---TGTG-AAA---T-CCCCAATTGGG
gi|81147 : -GTTA-C-ACC-----GTTAGCTT--GG-GAC-A--CA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-T-T-GC-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81146 : -GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-ATTTA-AT--AC-G---G-GATCAT--C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---T--G-AAA---T-CCGT-ATTGG
gi|81148 : TA-C-ACA-----GTCATTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GA---GTGG-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---A-GCGT-ATTGGG
gi|81149 : TT--GG-GAC-G--TATAT--AC-----G-AATCATC-C-A-GG---G--G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---TCCCGT-ATTGGG
gi|81150 : C-A--TA-AT--AC-G---G-AGTCGTC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-A-AAA---T-CTGT-ATTGGG
Alignments
lowQualScore : 1 3 3 55555 33 1 1 33 3 22 1 222 1 1 1 3 222 3 1 1 1 33333 222 1 1 222 1 1
lowQualScore : . . . ..... .. . . .. . .. . ... . . . . ... . . . . ..... ... . . ... . .
lowQualScore : 7 2 2 66666 77 5 5 55 0 00 5 666 5 5 5 0 666 0 5 5 5 88888 777 5 5 888 6 6
consensus : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
Reference ( family-694 ) : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81124 : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81125 : TATTA-GTCA-C-ACA-----GTCAGCTT--AG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTTATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----AGCTTG----AG---T-CCCA-ATTGGG
gi|81126 : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81127 : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--AG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-G-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81128 : TATTAAGTTA-T-ACATTAAAGTCAGTTTTTAG-GACAG--TA-AT--A--G---G-AGTCATGAC-A-GG---GA-G-T-GGGA-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATGGG
gi|81129 : TATTA-GTTA-C-ACA-----TTCAGTTC--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81130 : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AT-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GG-A-----A---TG-G-AAG---T-CCGT-ATTCGG
gi|81131 : TATTA-GTTA-CCACAC----GTCAGTTT--CG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-ACGG---GT-G-T-GA-A-----A---TT-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81132 : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-ATTAAC-G---G-AG-CATC-C-A-TG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AGAAGTT-CCGT-ATTGGG
gi|81133 : TATTA-GTTAAC-ACA-----GTCAGTTT--GG-GA--G--TA-AT--AC-A---A-AGTCATC-C-AAGG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T--CGT-ATTGG
gi|81134 : TATTG-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG------------------------G-A-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81135 : ATTC-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-A--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-TG---GT-A-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81136 : ATTC-GTTA-C-ACA------TCAGTTT--GG-GAC-A--TA-AT--AC-------AGTCATC-C-A-GGGCTGT-G-T-GA-GTATATA---TG-G-AAA---T-CCAT-ATTGGG
gi|81137 : ATTC-GTT--C-ACA-----GTCAGTTT--GG-ACC-A--TA-AT--AC-G---G-AGTCAT--C-A-GG---GT-GAT-GA-A-----A---TG-G--AA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81138 : ATTT-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AT--------GTAATC-C-A--G---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81139 : ATTC-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-A--TA-TT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-
gi|81140 : ATTT-GTTA-C-TTA-----GTCAGCTT--CG-AAC-A--TC-AT--GCTGATCG-AGTCGTC-C-A-AG---GT-T-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CTGT-CTTGGG
gi|81141 : TTC-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTTT-GGTGAC-AA-TA-AT--AC-G---GGAGTCATC-CCA-GG---GT-G-TTGA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81142 : TA-GTTAAC-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-C-AG---GTGG-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81143 : TA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---AG-G-
gi|81144 : TA-ATTG-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--GA-AT--AC-------AGTCA------------AT-G------A-----A---TG-GAAAA---T-AC-T-ATTGGG
gi|81145 : A-ATTA-CCACA-----GTCAGTTT---G-GAC-A--TATAT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---AT-G-T-G--G-----A---TGTG-AAA---T-CCCCAATTGGG
gi|81146 : -GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-ATTTA-AT--AC-G---G-GATCAT--C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---T--G-AAA---T-CCGT-ATTGG
gi|81147 : -GTTA-C-ACC-----GTTAGCTT--GG-GAC-A--CA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-T-T-GC-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81148 : TA-C-ACA-----GTCATTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GA---GTGG-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---A-GCGT-ATTGGG
gi|81149 : TT--GG-GAC-G--TATAT--AC-----G-AATCATC-C-A-GG---G--G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---TCCCGT-ATTGGG
gi|81150 : C-A--TA-AT--AC-G---G-AGTCGTC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-A-AAA---T-CTGT-ATTGGG
Alignments
lowQualScore : 1 3 3 55555 33 1 1 33 3 22 1 222 1 1 1 3 222 3 1 1 1 33333 222 1 1 222 1 1
lowQualScore : . . . ..... .. . . .. . .. . ... . . . . ... . . . . ..... ... . . ... . .
lowQualScore : 7 2 2 66666 77 5 5 55 0 00 5 666 5 5 5 0 666 0 5 5 5 88888 777 5 5 888 6 6
consensus : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
Reference ( family-694 ) : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81124 : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81125 : TATTA-GTCA-C-ACA-----GTCAGCTT--AG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTTATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----AGCTTG----AG---T-CCCA-ATTGGG
gi|81126 : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81127 : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--AG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-G-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81128 : TATTAAGTTA-T-ACATTAAAGTCAGTTTTTAG-GACAG--TA-AT--A--G---G-AGTCATGAC-A-GG---GA-G-T-GGGA-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATGGG
gi|81129 : TATTA-GTTA-C-ACA-----TTCAGTTC--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81130 : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AT-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GG-A-----A---TG-G-AAG---T-CCGT-ATTCGG
gi|81131 : TATTA-GTTA-CCACAC----GTCAGTTT--CG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-ACGG---GT-G-T-GA-A-----A---TT-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81132 : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-ATTAAC-G---G-AG-CATC-C-A-TG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AGAAGTT-CCGT-ATTGGG
gi|81133 : TATTA-GTTAAC-ACA-----GTCAGTTT--GG-GA--G--TA-AT--AC-A---A-AGTCATC-C-AAGG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T--CGT-ATTGG
gi|81134 : TATTG-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG------------------------G-A-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81135 : ATTC-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-A--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-TG---GT-A-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81136 : ATTC-GTTA-C-ACA------TCAGTTT--GG-GAC-A--TA-AT--AC-------AGTCATC-C-A-GGGCTGT-G-T-GA-GTATATA---TG-G-AAA---T-CCAT-ATTGGG
gi|81137 : ATTC-GTT--C-ACA-----GTCAGTTT--GG-ACC-A--TA-AT--AC-G---G-AGTCAT--C-A-GG---GT-GAT-GA-A-----A---TG-G--AA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81138 : ATTT-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AT--------GTAATC-C-A--G---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81139 : ATTC-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-A--TA-TT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-
gi|81140 : ATTT-GTTA-C-TTA-----GTCAGCTT--CG-AAC-A--TC-AT--GCTGATCG-AGTCGTC-C-A-AG---GT-T-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CTGT-CTTGGG
gi|81141 : TTC-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTTT-GGTGAC-AA-TA-AT--AC-G---GGAGTCATC-CCA-GG---GT-G-TTGA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81142 : TA-GTTAAC-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-C-AG---GTGG-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81143 : TA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---AG-G-
gi|81144 : TA-ATTG-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--GA-AT--AC-------AGTCA------------AT-G------A-----A---TG-GAAAA---T-AC-T-ATTGGG
gi|81145 : A-ATTA-CCACA-----GTCAGTTT---G-GAC-A--TATAT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---AT-G-T-G--G-----A---TGTG-AAA---T-CCCCAATTGGG
gi|81146 : -GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-ATTTA-AT--AC-G---G-GATCAT--C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---T--G-AAA---T-CCGT-ATTGG
gi|81147 : -GTTA-C-ACC-----GTTAGCTT--GG-GAC-A--CA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-T-T-GC-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81148 : TA-C-ACA-----GTCATTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GA---GTGG-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---A-GCGT-ATTGGG
gi|81149 : TT--GG-GAC-G--TATAT--AC-----G-AATCATC-C-A-GG---G--G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---TCCCGT-ATTGGG
gi|81150 : C-A--TA-AT--AC-G---G-AGTCGTC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-A-AAA---T-CTGT-ATTGGG
blockSeqs : A A C TTAAA TT T A TT T TA T ATC G A C C GCT G A T G TATAT GCT T A AGT C A
blockSeqs : . A C C T . . A T . . . . . . A . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
finalCons : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
Alignments
lowQualScore : 1 3 3 55555 33 1 1 33 3 22 1 222 1 1 1 3 222 3 1 1 1 33333 222 1 1 222 1 1
lowQualScore : . . . ..... .. . . .. . .. . ... . . . . ... . . . . ..... ... . . ... . .
lowQualScore : 7 2 2 66666 77 5 5 55 0 00 5 666 5 5 5 0 666 0 5 5 5 88888 777 5 5 888 6 6
consensus : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
Reference ( family-694 ) : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81124 : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81125 : TATTA-GTCA-C-ACA-----GTCAGCTT--AG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTTATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----AGCTTG----AG---T-CCCA-ATTGGG
gi|81126 : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81127 : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--AG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-G-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81128 : TATTAAGTTA-T-ACATTAAAGTCAGTTTTTAG-GACAG--TA-AT--A--G---G-AGTCATGAC-A-GG---GA-G-T-GGGA-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATGGG
gi|81129 : TATTA-GTTA-C-ACA-----TTCAGTTC--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81130 : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AT-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GG-A-----A---TG-G-AAG---T-CCGT-ATTCGG
gi|81131 : TATTA-GTTA-CCACAC----GTCAGTTT--CG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-ACGG---GT-G-T-GA-A-----A---TT-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81132 : TATTA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-ATTAAC-G---G-AG-CATC-C-A-TG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AGAAGTT-CCGT-ATTGGG
gi|81133 : TATTA-GTTAAC-ACA-----GTCAGTTT--GG-GA--G--TA-AT--AC-A---A-AGTCATC-C-AAGG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T--CGT-ATTGG
gi|81134 : TATTG-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG------------------------G-A-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81135 : ATTC-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-A--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-TG---GT-A-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81136 : ATTC-GTTA-C-ACA------TCAGTTT--GG-GAC-A--TA-AT--AC-------AGTCATC-C-A-GGGCTGT-G-T-GA-GTATATA---TG-G-AAA---T-CCAT-ATTGGG
gi|81137 : ATTC-GTT--C-ACA-----GTCAGTTT--GG-ACC-A--TA-AT--AC-G---G-AGTCAT--C-A-GG---GT-GAT-GA-A-----A---TG-G--AA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81138 : ATTT-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AT--------GTAATC-C-A--G---GT-G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81139 : ATTC-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-A--TA-TT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-
gi|81140 : ATTT-GTTA-C-TTA-----GTCAGCTT--CG-AAC-A--TC-AT--GCTGATCG-AGTCGTC-C-A-AG---GT-T-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CTGT-CTTGGG
gi|81141 : TTC-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTTT-GGTGAC-AA-TA-AT--AC-G---GGAGTCATC-CCA-GG---GT-G-TTGA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81142 : TA-GTTAAC-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-C-AG---GTGG-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81143 : TA-GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---AG-G-
gi|81144 : TA-ATTG-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-G--GA-AT--AC-------AGTCA------------AT-G------A-----A---TG-GAAAA---T-AC-T-ATTGGG
gi|81145 : A-ATTA-CCACA-----GTCAGTTT---G-GAC-A--TATAT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---AT-G-T-G--G-----A---TGTG-AAA---T-CCCCAATTGGG
gi|81146 : -GTTA-C-ACA-----GTCAGTTT--GG-GAC-ATTTA-AT--AC-G---G-GATCAT--C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---T--G-AAA---T-CCGT-ATTGG
gi|81147 : -GTTA-C-ACC-----GTTAGCTT--GG-GAC-A--CA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GG---GT-T-T-GC-A-----A---TG-G-AAA---T-CCGT-ATTGGG
gi|81148 : TA-C-ACA-----GTCATTTT--GG-GAC-G--TA-AT--AC-G---G-AGTCATC-C-A-GA---GTGG-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---A-GCGT-ATTGGG
gi|81149 : TT--GG-GAC-G--TATAT--AC-----G-AATCATC-C-A-GG---G--G-T-GA-A-----A---TG-G-AAA---TCCCGT-ATTGGG
gi|81150 : C-A--TA-AT--AC-G---G-AGTCGTC-C-A-GG---GT-G-T-GA-A-----A---TG-A-AAA---T-CTGT-ATTGGG