lowQualScore : 111 22222222222 1111111 222222222 2 111111 1
lowQualScore : 2 2 2 2 2 444 3 44444 77777777777 3 1 3 1 1 2 44 3333 5555 4444 1 77 44 666 555555 1 44 333 66666666 3333 22 333 1 3333 1 1 44 3 3333 1 555555 3 1 2222222 33 3 1 1 1 1 1 3333 44444 22 3 333 44 44 22 2 6666666 2 2 777 2 2 2 2 2 22 2 8 444444444 2 22 55 22 555 2 22 2 44 2 5 22 2 4 999999 0
lowQualScore : . . . . . ... . ..... ........... . . . . . . .. .... .... .... . .. .. ... ...... . .. ... ........ .... .. ... . .... . . .. . .... . ...... . . ....... .. . . . . . . .... ..... .. . ... .. .. .. . ....... . . ... . . . . . .. . . ......... . .. .. .. ... . .. . .. . . .. . . ...... .
lowQualScore : 1 1 1 1 1 555 8 88888 66666666666 6 8 6 8 8 1 33 9999 7777 0000 9 11 55 777 555555 7 11 000 33333333 7777 44 222 8 9999 8 8 33 6 9999 8 222222 6 8 8888888 66 4 9 9 8 8 8 9999 55555 55 8 333 55 55 88 0 8888888 1 0 555 0 1 1 1 1 99 1 6 999999999 1 99 00 88 555 0 88 0 88 0 8 99 1 7 333333 7
consensus : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--A--NT------TCGAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-TG----CC-TTG------C-TTTT-TC------A-TTCC-T-ATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---ACT--C--TTGT--T-AAAG-------G-AT-AT--TTTATTA-CA-AGG-TT-T-TT--G-GGAAAAAA----ATT-TAT-CATG--TG--TTCC--TTT---TTA-AACTTTTA--T-T--C-AA-TTTTTGG--T-TTGAATA-T---T--ATTTGTT-AACATA
Reference ( gi|101810 ) : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--A--TT------TCGAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-TG----CC-TTG------C-TTTT-TT------A-TTTC-T-ATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---ACT--C--TTGT--T-AAAG-------G-AT-AT--TTTATTA-CA-AGG-TT-T-TT--G-GGAAAAAA----ATT-TAT-CATG--TG--TTCC--TTT---TTA-AACTTTTA--T-T--C-AATTTTTTGG--T-TTGAATA-T---A--ATTTGTT-AACATA
gi|101811 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---ACT----------------------TCT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAGATAGATA----A--A-C-TA--G--A--TT------TCGAA-A--T---TCA--------T----TAT--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-TG----CC-TTG------C-TTTT-TT------A-TTCC-T-ATGCAT-T-C-AAG----AA-----GA--GT-A---ACT--C--TTGT--T-AAAG-------G-AT-AT--TTTATTA-CA-AGG-CT-T-TT--G-GAAAAAAA------T-TAT-CATG--CG--TCCC--TTT---TTA-AACTTTTA--T-T--C-AA-TTTTTGG--T-TTGAATA-T---T--ATTTGTT-AACATA
gi|101812 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----AC-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T-GC-A--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--A--AT------TCGAA----T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-TG----CC-T-G------C-TTTT-C-------A-TTCC---ATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---ACT--C--CT-T--T-AAAG-------G-AT-AT--TTTATTA-CACAGG-TTGTGTT--G-GGAAAAAA----ATT--AT-CATG--TG--TTCC--TTT---TTA-AACTTTTA--T-T--C-AATTTTTGGT--T-TTGAATA-T---ATTATTT-TT-AACATA
gi|101813 : TTAGCATA-TAAA-A-TAC-CAAA--CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--A--AT------TCGGA-AATT---TTA--------T----TAA--A-TGTGA---T-CAA----AGA-TG--T-TG----CC-TTG------CTTTTT-TT------A-TTCC-T-ATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---ACTC-C--CTGC--T-AAAG-------G-AT-A---TTTATTATCA-AGG-AT-T-TT--G-GGAAAAAA----A---TAT-CAT---TGGCTTCC--TTT---TT--AACTTTTA--T-T--C-AA-TTTTTGG--T-TTGAATA-T---T--TTTTGTT-
gi|101814 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAAACTCCTC-T-----GTTATTTTCAAA-ATGT-C-CAG-GTGA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--G--TT------TGGAA-A--C---TTA--------T----GAA--ATCCTGA---T-CAA----A-A-TG--T-TG----CC-TTG------C-TCTT-T-------A-GTCT-T-ATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---ACT--C--TTGT--G-AGAG-------G-AT-AT--TTTATAA-CA-AGG-TT-T-TTTGG-GGGAAAAA----A-T-TAT-CATG--TG--TTCT--TTT---TTT-TATTTTTA--T-T--A-AA-TTTTTGG--T-TTGAATA-T---T--ATTTGTT-AACATA
gi|101819 : TTAGTA-AATAAA-AATGC-CAAG--CCTC-T-----GT-----------TTGT-C-CAG-ATAAAT-GCCA--TAG----ATA----A--AAC-TA--AGAA--AT------TCGAA-A--T---TT---------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-TG----C--TTG------C-TTTT-GC------A-T--------ACAT-T-C-A-G----CA-----GG--GT-A---ACT--C--T-GT--T-AAAG-------G-AT-AT--TT-ATTA-CA-AGG-TT-T-TT--G-GGAAAAAA----ATG--AT-CATG--TG--TTCT--TTT---TTA-A-CTTTTA--T-T--C-AATTTTTGGG--T-TTGAATATT---A--CTTTGTT--ACATA
gi|101815 : TTAATA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----GT-----------GTGT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--A--AT------TCGAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-TG----CC-TTG------C-TTTT-TT------A-TTCC-T-ATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---ACT--C--CTGT--T-AAAG-------G-AT-AT--TTTATTA-
gi|101816 : TTAATA-A-TAAA-A-TCT-CAAACTCCTC-T-----ATTTATTTCCAAAATGT-C-CAG-ATGA-T-GCCA--TAG----ATATTTAA--A-C-TA--C--G--TT------TGGAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTCTGA---T-CAA----A-A-TG--T-TG----CC-TTG------C-GTTT-TA------A-ATCC-T-ATACAT-T-C-CAG----AT-----CG--GT-G---ACT--C--TTGT--T-AAAG-------G-AT-AT--TTTGTTA-CA-AGG-TT-T-TT--G-GAAAAAAA------T-TAT-CATG--TG--TTCC--TTT---TTA-AAAATGTA--T-T--C-AA-TTTTTGG--T-TTGAATG-A---C--ATTTGTT-AATATAaactttcattcaattttttggtttaaatatatttgttaccata
gi|101817 : TTAGTA-A-TATC-A--GC-CAA---CCT--T-----AT-----------ATGT-C--AG-ATAA-T-GC-A--TAG----ATA----AGAA-C-TA--G--A--AT------TCGAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T--AA----A-A-TGGTT-TG----CC-TTG------C-TTTT-TC------A--TTC-C-ATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---AATTCC--TCAT--T-AAAG-------G-AT-AT--TTTATTA-CA-AGGCTT-T-TT--G-G--AAAAA----ATT-CAT---TG--TG--TTCCCTTTT---TTA-AACTTTTA--T-TCCC-AATTTTTTGGTTT-TTGAATA-TTAAA--ATTTGTT-
gi|101818 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--A--TT------TCGAA-A--T---TTA--------T----TAG--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-TG----TC-TTG------T-TTTTATT------A-TTCC-T-ATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---ACT--C--T
gi|101820 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGCACAA---ACTCCT-----GT-----------AT-T-T-CA--ATAA-TTGCCA--T-------TA----A----C-TAC-G--A--TT------TTCAA-A--T---TTA--------A----TTG--ATTGTGA---T-CAA----A-A-T---T-TG----CC-TTG------C-TTTT-T-------A-TTCC-T-ATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---AC---C--TTGT--G-AAAG-------G-AC-A---TTTATTG-CA-A----T-T-TT--GAGGGAAAAA----A---TAT-CATG--TG--TTCC--TTTTGGTTA-AAC-TTTA--T-T--C-AA-TTTTTGG--T-TTGAATA-T---T--A-TTGTTAAACATA
gi|101821 : TTAGTA-C-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-------AT-----------ATGT-C-CA--ATAA-T-GCCA--TAG----AGA----A--A-CATA--G--A--AT------TCCGA-A--T---TTA--------T----TAA--ATT-TGA---T-CTA----G-A-TG--T--G----C--TTG------T-TGTT-TC------AATTCC-T-ATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GTTA---ATC--C--TTGTAAT-AGAG-------G-ATTGT--TTTATTA-CA-AGG-TT-T-TT--G-GAGAACAAGC--ATA-TATGCATGGCTG--TTTC--CTT---TTA-AACTTTTA--T-T--C-AA-TTTTTGG--T-TAGAA
gi|101823 : TTAGTA-A-TAAATA-AGC-CA----CCTC-T-----ATT----------AGTT-C-CAG-ATAA---GCCAA-TAG----ATA----A----C-TACGG--A--AT------TCGAA-AC-T---TTA--------T----TAA---TTGTGA---G-CAA----A-A-TG--T--G----CC-TTG------C-TTGT-TC------A-TTTC-CGATACAT-T-C-A------AA-----AG--GT-A---ACT--C---TAT--T-AAAG-------G-AT-A---TTTAATA-CA-GGG-TT-T-TC--G-G--AAAAA----ATG-TG--CATG--TG--TTCC--TTT---TTAGAAATTTTA----T--C-AA-TTTTTGG----TTGAATA-T---atttttg
gi|101822 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGT-CAA---ACTCCT-----GTTATTTCCAAA-ATGT-C-CAG-ATTA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--G--TT------TGGAA-A--T---TCA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-TC----CC-TTG------CTTTTT-TT------A-TTAC-T-ATA-AT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---ACT--C--TTTT--T-Ata
gi|101824 : TTAGAA-A-TGAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----AT-----------ATGT-C-CAG-AT---T--TCA--TAA------A----A--A-C-TAAGG--A--TTAGGGAGTCGAA-A--TCTGCTA--------T----TAA--ATCGTGA---T-CAA----G-ATTG--TCTG----CA-TTG------C---TT-TC------A--TTC-C-ATACCA-T-C-AAG----AAGCTGGGG--GG-A---ACT--T--CCAT--T-AAAG-------G-AT-A----TTATTA-CA-AGT-CT-T-TC--G-GAAAAAAA----GTTATAT-CATG--TG---TCC--TTT---TAA-TACCTTTA--T-T--CGAATTTGTATA--C-TTG-ATA-T---T--ATTTGTTAAACAT
gi|101825 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T--CCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--A--AT------TCGAA-A--T---TTA--------TCCCCTAA--ATTGTGATGCT-CAA----A-A-TG--T-TGTGCACC-TTA------C-TATA-TTGAGTCAA-TGCCGT-TTACAT-T-CAAAG----AA-----GG--
gi|101826 : TAGTA---TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T------T-----------ATGT-C-CAG-ATA--T-GA-A--TGA----ATA----A--AAC-TA--GG-A--AT------TCGAA-A--T---TTA--------T----TTA--AATGTGA---TTCAATAGGA-C-TG--TCTG----CC-TTG------C-TTTT-TC------A-TGCC-T-ATACAT-TCC-AAG-----------GG--GT-A---ATC--CAATTG-----AAAG-------G-A--AT--TTTATTA-CA-AGG--T-T-TT--G-G----AAA----ATT---T-CATG--TG--------TTT---TTA-ACCTTTAA--T-T--C-AA-TTTTTGG--TATTGAATA-T---
gi|101827 : AGTA-A-CAAA-A-TGT-CAAACTCCTC-T-----TT-----------TTTTTC-CAA-A---------A--TGA----ATA----A--A-C-TA--G--G--TT------TGGAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGT------------------------TG----CC-TTG------C-TTTT-TC------A-TTCC-T-ATACAT-T-C-AAG----AA-----AG--GT-A---ACC--C--------------------------AT--TTTATTA-CA-AGG-TT-T-TT--G-AAAAAAAA----A---TAT-CGCG--TG--TT------------------------------------TTTGG--T-TGGAATA-T---T--ATTAGTT-AACATAta
gi|101828 : AGTA-A-TAAA-G-TTG-CAA---CCTC-T-----GT-----------ATGTTC-CAG-ATAA-T-GCCACATAG----ATA----A--A-C-TA--G--A--CA------TCGGA-A--A---TTA--------T----TAA--ATTG
gi|101829 : -A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-TTGTGTGT-----------ATGT-CTCACTATAA-C-TCTA--TAT----ATAT---A--C-C-TA--G--AATTC------TCGAAGA--T---GTA--------G----T-------GTG----T-AGA----G-A-TG--T-TG----TA-TCGGAAAACC-TTTG-AT------G-TTCC-T-GAACATGT-C-AGGTAGGAA-----GGTTGT-AGATACT--CC-TTGT--G-TGAGTATGTGTG-AT-AC--TTT-TTA-CA-AGG-GT-T-TT--T-ATAAAAAC----ATAATAT-CATG--TG--TTCA--TTT---TTA-AACCTTTA--T-TC-C-AA--TTTTGG--T-GTG
gi|101830 : ---CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAT-T-GCCA--TAG----ATA----ttgtattagtgtta
gi|101831 : TT-T-----GT-----------A-GT-C--AG-ATGA---G--A--TA------TA----A--G-C-TA--G--G--TT------T-GAG-A--T---TTT--------T----TAA---TTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-TG----CCGTTG------C-CTTT-T
gi|101832 : -C-CAGGATAA-T-GC-A--TAG----ATA----A--A-C-TA--A--A--AT------TCGAA-A--T---TTAATAAATTGT----TAATAATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T--G----CC-ATG------C-TTTT-TC------C-ATTC-C-ATACAT-T-C-AAG----AA-----AG--GT-A----CT--C--CTAT--T-AA-G-------G-AT-AT--TTTATTA-CA-AGT-TT-T-TT--G-G-AAAAAA----ATT-GAT-CATG--TG--TTCC--TTT---TTA-AACTTTTAATT-C--C-AA--TTTTGG--T-TTGAATA-T---T--ATTTGTTAAACATA
gi|101833 : CGAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TGT-T-TG----CC-TTG------A-TTTT-TT------C-ATTC-C-ATACAT-T-C-AAG----AG-----GC--GTAA---ACT--C--CTAT--T-AAAG-------GAAT-A---TTTATTA-CA-A-G-TT-T-TT--G-GAAAAAAA------T-TAT-CATG--TGT-TTCC--TTT---GTT-AACTTTTA--TCT--C-AA-TTGTTGG--T-TTGAATATT---A--CTTTGTT-
gi|101834 : GAA-G--A---TTA--------T----TAT--ATTCTTT---T-CTA----A-G-TG--T-TG----TC-TTG------C-TTTT-C-------A-GTCC-T-ATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---ACT--C--TTGT--TCAAAG-------A-GT-AC--TTTATTT-TC-AAG-TT-T-TT--G-GAAAAAAA----A---TAT---TA--TG--TTCC--TTT---TTA-AATTTTCA--T-T--C-AA-TTTTTGG--T-TTGAATA-T---T--ATTTGTTAAACAT
gi|101835 : T-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---ACT--C--TTGT--T-AAAG-------G-AT-ATATCTTATTA-CA-ATG-TT-T-TG--G-GGGAAAAA----AAA-TAT-CATG--TG--TTCC--TTT---TAA-AACTTTTA--T-T--C-AA-TTTTTGG--T-TTAAATA-T---T--ATTTGTT-AACATA
gi|101836 : -AT--TTTATTA-CA-AAG-TT-T-TT--G-GAAAATAATTACATG-TAT-CATG--TG--TTCC--TTT---TTA-AACTTTTA--T-T--T-A
gi|101815 : --TTTA--TTA-AACTTTCA--T-T--C-AATTTTTTGG--T-TTAAATA-T------ATTTGTT-ACCATA
Alignments
lowQualScore : 111 22222222222 222222222
lowQualScore : 2 2 2 2 2 333 3 44444 66666666666 3 1 3 1 1 44 3333 5555 22 3 1 66 44 1 555555 22 1 44 222 66666666 3333 22 333 1 3333 1 1 22 3 1 3333 1 666666 33333 333 1 33 1 1 66 1 1 1 3333 44444 22 1 333 1 44 44 22 1 6666666 2 1 22 1 2 2 2 2 22 2 5 111111111 2 22 22 2 22 1 333 1 1 1 22 1 4 2 2 2 44 555 22 333 4 9
lowQualScore : . . . . . ... . ..... ........... . . . . . .. .... .... .. . . .. .. . ...... .. . .. ... ........ .... .. ... . .... . . .. . . .... . ...... ..... ... . .. . . .. . . . .... ..... .. . ... . .. .. .. . ....... . . .. . . . . . .. . . ......... . .. .. . .. . ... . . . .. . . . . . .. ... .. ... . .
lowQualScore : 0 0 0 0 0 888 6 55555 44444444444 5 7 5 7 7 11 7777 4444 55 6 8 88 33 0 222222 33 7 00 999 00000000 5555 33 000 7 7777 7 7 44 5 7 7777 7 777777 55555 000 7 77 8 8 11 7 7 7 7777 33333 44 8 222 8 33 33 66 9 5555555 0 9 66 9 0 0 0 0 88 0 1 999999999 0 88 88 0 66 9 333 9 9 9 66 9 0 0 0 0 88 555 88 555 0 4
consensus : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--ANT------TC--GAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CC-TTG------C-T---TT---T-TC-A-TT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-CT--C--TTGT--T-AAAG-------GA-T-AT--TTTATTA-CA-AGG-TT-T-TT--G-GGAAAAAA----ATT-TAT-CATG--TG--TT-CC--TTT-T---TA-AACTTTT-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATT---A-TTTGTT-AACATA
Reference ( family-692 ) : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--ANT------TC--GAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CC-TTG------C-T---TT---T-TC-A-TT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-CT--C--TTGT--T-AAAG-------GA-T-AT--TTTATTA-CA-AGG-TT-T-TT--G-GGAAAAAA----ATT-TAT-CATG--TG--TT-CC--TTT-T---TA-AACTTTT-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATT---A-TTTGTT-AACATA
gi|101810 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--ATT------TC--GAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CC-TTG------C-T---TT---T-TT-A-TT-TC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-CT--C--TTGT--T-AAAG-------GA-T-AT--TTTATTA-CA-AGG-TT-T-TT--G-GGAAAAAA----ATT-TAT-CATG--TG--TT-CC--TTT-T---TA-AACTTTT-AT-T--C-AATT-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATA---A-TTTGTT-AACATA
gi|101811 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---ACT----------------------TCT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAGATAGATA----A--A-C-TA--G--ATT------TC--GAA-A--T---TCA--------T----TAT--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CC-TTG------C-T---TT---T-TT-A-TT-CC-TATGCAT-T-C-AAG----AA-----GA--GT-A---A-CT--C--TTGT--T-AAAG-------GA-T-AT--TTTATTA-CA-AGG-CT-T-TT--G-GAAAAAAA------T-TAT-CATG--CG--TC-CC--TTT-T---TA-AACTTTT-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATT---A-TTTGTT-AACATA
gi|101812 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----AC-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T-G-CA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--AAT------TC--G-A-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CC--TG------C-----TT---T-TC-A-TT-CC--ATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-CT--C--CT-T--T-AAAG-------GA-T-AT--TTTATTA-CACAGG-TTGTGTT--G-GGAAAAAA----A-T-TAT-CATG--TG--TT-CC--TTT-T---TA-AACTTTT-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-GT-T---TTGAATATATT---A-TTT-TT-AACATA
gi|101813 : TTAGCATA-TAAA-A-TAC-CAAA--CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--AAT------TC--GGA-AATT---TTA--------T----TAA--A-TGTGA---T-CAA----AGA-TG--T-T-G----CC-TTG------CTT---TT---T-TT-A-TT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-CTC-C--CTGC--T-AAAG-------GA-T-A---TTTATTATCA-AGG-AT-T-TT--G-GGAAAAAA----A---TAT-CAT---TGGCTT-CC--TTT-T---T--AACTTTT-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATT---T-TTTGTT-
gi|101814 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAAACTCCTC-T-----GTTATTTTCAAA-ATGT-C-CAG-GTGA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--GTT------TG--GAA-A--C---TTA--------T----GAA--ATCCTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CC-TTG------C-T---CT---T-T--A-GT-CT-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-CT--C--TTGT--G-AGAG-------GA-T-AT--TTTATAA-CA-AGG-TT-T-TTTGG-GGGAAAAA----A-T-TAT-CATG--TG--TT-CT--TTT-T---TT-TATTTTT-AT-T--A-AA-T-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATT---A-TTTGTT-AACATA
gi|101815 : TTAATA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----GT-----------GTGT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--AAT------TC--GAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CC-TTG------C-T---TT---T-TT-A-TT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-CT--C--CTGT--T-AAAG-------GA-T-AT--TTTATTA-
gi|101815 : --TTTAT---TA-AACTTTC-AT-T--C-AA-TTTTTT-G-G--T---TTAA--ATA-T---A-TTTGTT-ACCATAaactttcattcaattttttggtttaaatatatttgttaccata
gi|101816 : ttaataataaaatgccaacctctgtgtgtccagataatgccatagataaactagaattcgaaatttattaaattgtgatcaaaatgttgccttgcttttttattcctatacattcaagaagggtaactcctgttaaaggatatTTAATA-A-TAAA-A-TCT-CAAACTCCTC-T-----ATTTATTTCCAAAATGT-C-CAG-ATGA-T-GCCA--TAG----ATATTTAA--A-C-TA--C--GTT------TG--GAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTCTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CC-TTG------C-G---TT---T-TA-A-AT-CC-TATACAT-T-C-CAG----AT-----CG--GT-G---A-CT--C--TTGT--T-AAAG-------GA-T-AT--TTTGTTA-CA-AGG-TT-T-TT--G-GAAAAAAA------T-TAT-CATG--TG--TT-CC--TTT-T---TA-AAAATGT-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TTGA--ATGAC---A-TTTGTT-AATATA
gi|101817 : TTAGTA-A-TATC-A--GC-CAA---CCT--T-----AT-----------ATGT-C--AG-ATAA-T-GC-A--TAG----ATA----AGAA-C-TA--G--AAT------TC--GAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T--AA----A-A-TGGTT-T-G----CC-TTG------C-T---TT---T-TC-A-TT-CC--ATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-ATTCC--TCAT--T-AAAG-------GA-T-AT--TTTATTA-CA-AGGCTT-T-TT--G-G--AAAAA----ATT-CAT---TG--TG--TT-CCCTTTT-T---TA-AACTTTT-AT-TCCC-AATT-TTTT-G-GTTT---TTGA--ATATTAAAA-TTTGTT-
gi|101818 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--ATT------TC--GAA-A--T---TTA--------T----TAG--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----TC-TTG------T-T---TT---TATT-A-TT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-CT--C--T
gi|101819 : TTAGTA-AATAAA-AATGC-CAAG--CCTC-T-----GT-----------TTGT-C-CAG-ATAAAT-GCCA--TAG----ATA----A--AAC-TA--AGAAAT------TC--GAA-A--T---TT---------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----C--TTG------C-T---TT---T-GC-A-T--------ACAT-T-C-A-G----CA-----GG--GT-A---A-CT--C--T-GT--T-AAAG-------GA-T-AT--TT-ATTA-CA-AGG-TT-T-TT--G-GGAAAAAA----ATG--AT-CATG--TG--TT-CT--TTT-T---T--AACTTTT-AT-T--C-AA-T-TTTTGG-G--T---TTGA--ATATT---ACTTTGTT--ACATA
gi|101820 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGCACAA---ACTCCT-----GT-----------AT-T-T-CA--ATAA-TTGCCA--T-------TA----A----C-TAC-G--ATT------TT--CAA-A--T---TTA--------A----TTG--ATTGTGA---T-CAA----A-A-T---T-T-G----CC-TTG------C-T---TT---T-T--A-TT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-C---C--TTGT--G-AAAG-------GA-C-AT--TT-ATTG-CA-A----T-T-TT--GAGGGAAAAA----AT---AT-CATG--TG--TT-CC--TTT-TGGTTA-AACTTT--AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATT---A--TTGTTAAACATA
gi|101821 : TTAGTA-C-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-------AT-----------ATGT-C-CA--ATAA-T-GCCA--TAG----AGA----A--A-CATA--G--AAT------TC--CGA-A--T---TTA--------T----TAA--ATT-TGA---T-CTA----G-A-TG--T---G----C--TTG------T-T---GT---T-TC-AATT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GTTA---A-TC--C--TTGTAAT-AGAG-------GA-TTGT--TTTATTA-CA-AGG-TT-T-TT--G-GAGAACAAGC--ATA-TATGCATGGCTG--TT-TC--CTT-T---TA-AACTTTT-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TAGA--A-ATT-----TTTG
gi|101822 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGT-CAA---ACTCCT-----GTTATTTCCAAA-ATGT-C-CAG-ATTA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--GTT------TG--GAA-A--T---TCA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-C----CC-TTG------CTT---TT---T-TT-A-TT-AC-TATA-AT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-CT--C--TTTT--T-A
gi|101823 : TTAGTA-A-TAAATA-AGC-CA----CCTC-T-----ATT----------AGTT-C-CAG-ATAA---GCCAA-TAG----ATA----A----C-TACGG--AAT------TC--GAA-AC-T---TTA--------T----TAA---TTGTGA---G-CAA----A-A-TG--T---G----CC-TTG------C-T---TG---T-TC-A-TTTCC-GATACAT-T-C-AAA----A-------G--GT-A---A-CT--C--T-AT--T-AAAG-------GA-T-AT--TTAAT-A-CA-GGG-TT-T-TC--G-G--AAAAA----ATG-TG--CATG--TG--TT-CC--TTT-T---TAGAAATTTT-A--T--C-AA-T-TTTT-G-G------TTGA--ATATT---A-
gi|101824 : TTAGAA-A-TGAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----AT-----------ATGT-C-CAG-AT---T--TCA--TAA------A----A--A-C-TAAGG--ATTAGGGAGTC--GAA-A--TCTGCTA--------T----TAA--ATCGTGA---T-CAA----G-ATTG--TCT-G----CA-TTG------C------T---T-TC-A-TT-CC--ATACCA-T-C-AAG----AAGCTGGGG--GG-A---A-CT--T--CCAT--T-AAAG-------GA-T-A----TTATTA-CA-AGT-CT-T-TC--G-GAAAAAAA----GTTATAT-CATG--TG---T-CC--TTT-T---AA-TACCTTT-AT-T--CGAA-T-TTGT-ATA--C---TTG---ATATT---A-TTTGTTAAACAT
gi|101825 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T--CCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--AAT------TC--GAA-A--T---TTA--------TCCCCTAA--ATTGTGATGCT-CAA----A-A-TG--T-T-GTGCACC-TTA------C-TATATTGAGT-CA-A-TG-CCGTTTACAT-T-CAAAG----AA-----GG--
gi|101826 : TAGTA---TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T------T-----------ATGT-C-CAG-ATA--T-GA-A--TGA----ATA----A--AAC-TA--GG-AAT------TC--GAA-A--T---TTA--------T----TTA--AATGTGA---TTCAATAGGA-C-TG--TCT-G----CC-TTG------C-T---TT---T-TC-A-TG-CC-TATACAT-TCC-AAG-----------GG--GT-A---A-TC--CAATTG-----AAAG-------GA---AT--TTTATTA-CA-AGG--T-T-TT--G-G----AAA----ATT---T-CATG--TG---------TTT-T---TA-ACCTTTA-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--TA--TTGA--ATATT---A-
gi|101827 : AGTA-A-CAAA-A-TGT-CAAACTCCTC-T-----TT-----------TTTTTC-CAA-A---------A--TGA----ATA----A--A-C-TA--G--GTT------TG--GAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGT------------------------T-G----CC-TTG------C-T---TT---T-TC-A-TT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----AG--GT-A---A-CC--C--------------------------AT--TTTATTA-CA-AGG-TT-T-TT--G-AAAAAAAA----A---TAT-CGCG--TG---------------------------------------T-TTTT-G-G--T---TGGA--ATATT---A-TTAGTT-AACATA
gi|101828 : AGTA-A-TAAA-G-TTG-CAA---CCTC-T-----GT-----------ATGTTC-CAG-ATAA-T-GCCACATAG----ATA----A--A-C-TA--G--ACA------TC--GGA-A--A---TTA--------T----TAA--ATTG
gi|101829 : -A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-TTGTGTGT-----------ATGT-CTCACTATAA-C-TCTA--TAT----ATAT---A--C-C-TA--G--AAT------TCTCGAAGA--T---GTA--------G----T-------GTG----T-AGA----G-A-TG--T-T-G----TA-TCGGAAAACC-T---TT---G-AT-G-TT-CC-TGAACATGT-C-AGGTAGGAA-----GGTTGT-AGATA-CT--CC-TTGT--G-TGAGTATGTGTGA-T-AC--TTT-TTA-CA-AGG-GT-T-TT--T-ATAAAAAC----ATAATAT-CATG--TG--TT-CA--TTT-T---TA-AACCTTT-AT-T--C-CA-A-TTTT-G-G--TGTGTTG----TATT---A--GTGTT-
gi|101830 : ---CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAT-T-GCCA--TAG----ATA----
gi|101831 : TT-T-----GT-----------A-GT-C--AG-ATGA---G--A--TA------TA----A--G-C-TA--G--GTT------T---GAG-A--T---TTT--------T----TAA---TTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CCGTTG------C-C---TT---T-T
gi|101832 : -C-CAGGATAA-T-GC-A--TAG----ATA----A--A-C-TA--A--AAT------TC--GAA-A--T---TTAATAAATTGT----TAATAATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T---G----CC-ATG------C-T---TT---T-TCCA-TT-CC--ATACAT-T-C-AAG----AA-----AG--GT-A-----CT--C--CTAT--T-AA-G-------GA-T-AT--TTTATTA-CA-A-G-TT-T-TT--T-GGAAAAAA----ATT-GAT-CATG--TG--TT-CC--TTT-T---TA-AACTTTTAAT-T--C-CA-A-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATT---A-TTTGTTAAACATA
gi|101833 : C--GAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-TTG----CC-TTGA-----T-T---TT---T-TC-A-TT-CC--ATACAT-T-C-AAG----AG-----GC--GT-A---AACT--C--CTAT--T-AAAG-------GAAT-AT--TT-ATTA-CA-AG--TT-T-TT--G-GAAAAAAA------T-TAT-CATG--TG--TTTCC--TTT-G---TT-AACTTTT-ATCT--C-AA-T-TGTT-G-G--T---TTGA--ATATT---ACTTTGTT-
gi|101834 : --GAA-G--A---TTA--------T----TAT--ATTCTTT---T-CTA----A-G-TG--T-T-G----TC-TTG------C-T---TT---T--C-A-GT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-CT--C--TTGT--TCAAAG-------AG-T-AC--TTTATTT-TC-AAG-TT-T-TT--G-GAAAAAAA----AT---AT-TATG--T----T-CC--TTT-T---TA-AATTTTC-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATT---A-TTTGTTAAACAT
gi|101835 : T-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-CT--C--TTGT--T-AAAG-------GA-T-ATATCTTATTA-CA-ATG-TT-T-TG--G-GGGAAAAA----AAA-TAT-CATG--TG--TT-CC--TTT-T---AA-AACTTTT-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TTAA--ATATT---A-TTTGTT-AACATA
gi|101836 : -AT--TTTATTA-CA-AAG-TT-T-TT--G-GAAAATAATTACATG-TAT-CATG--TG--TT-CC--TTT-T---TA-AACTTTT-AT-T--T-A
Alignments
lowQualScore : 111 22222222222 222222222
lowQualScore : 2 2 2 2 2 333 3 44444 66666666666 3 1 3 1 1 44 3333 5555 22 3 1 66 44 1 555555 22 1 44 222 66666666 3333 22 333 1 3333 1 1 22 3 1 3333 1 666666 33333 333 1 33 1 1 66 1 1 1 3333 44444 22 1 333 1 44 44 22 1 6666666 2 1 22 1 2 2 2 2 22 2 5 111111111 2 22 22 2 22 1 333 1 1 1 22 1 4 2 2 2 44 555 22 333 4 9
lowQualScore : . . . . . ... . ..... ........... . . . . . .. .... .... .. . . .. .. . ...... .. . .. ... ........ .... .. ... . .... . . .. . . .... . ...... ..... ... . .. . . .. . . . .... ..... .. . ... . .. .. .. . ....... . . .. . . . . . .. . . ......... . .. .. . .. . ... . . . .. . . . . . .. ... .. ... . .
lowQualScore : 0 0 0 0 0 888 6 55555 44444444444 5 7 5 7 7 11 7777 4444 55 6 8 88 33 0 222222 33 7 00 999 00000000 5555 33 000 7 7777 7 7 44 5 7 7777 7 777777 55555 000 7 77 8 8 11 7 7 7 7777 33333 44 8 222 8 33 33 66 9 5555555 0 9 66 9 0 0 0 0 88 0 1 999999999 0 88 88 0 66 9 333 9 9 9 66 9 0 0 0 0 88 555 88 555 0 4
consensus : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--ANT------TC--GAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CC-TTG------C-T---TT---T-TC-A-TT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-CT--C--TTGT--T-AAAG-------GA-T-AT--TTTATTA-CA-AGG-TT-T-TT--G-GGAAAAAA----ATT-TAT-CATG--TG--TT-CC--TTT-T---TA-AACTTTT-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATT---A-TTTGTT-AACATA
Reference ( family-692 ) : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--ANT------TC--GAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CC-TTG------C-T---TT---T-TC-A-TT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-CT--C--TTGT--T-AAAG-------GA-T-AT--TTTATTA-CA-AGG-TT-T-TT--G-GGAAAAAA----ATT-TAT-CATG--TG--TT-CC--TTT-T---TA-AACTTTT-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATT---A-TTTGTT-AACATA
gi|101810 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--ATT------TC--GAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CC-TTG------C-T---TT---T-TT-A-TT-TC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-CT--C--TTGT--T-AAAG-------GA-T-AT--TTTATTA-CA-AGG-TT-T-TT--G-GGAAAAAA----ATT-TAT-CATG--TG--TT-CC--TTT-T---TA-AACTTTT-AT-T--C-AATT-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATA---A-TTTGTT-AACATA
gi|101811 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---ACT----------------------TCT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAGATAGATA----A--A-C-TA--G--ATT------TC--GAA-A--T---TCA--------T----TAT--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CC-TTG------C-T---TT---T-TT-A-TT-CC-TATGCAT-T-C-AAG----AA-----GA--GT-A---A-CT--C--TTGT--T-AAAG-------GA-T-AT--TTTATTA-CA-AGG-CT-T-TT--G-GAAAAAAA------T-TAT-CATG--CG--TC-CC--TTT-T---TA-AACTTTT-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATT---A-TTTGTT-AACATA
gi|101812 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----AC-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T-G-CA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--AAT------TC--G-A-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CC--TG------C-----TT---T-TC-A-TT-CC--ATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-CT--C--CT-T--T-AAAG-------GA-T-AT--TTTATTA-CACAGG-TTGTGTT--G-GGAAAAAA----A-T-TAT-CATG--TG--TT-CC--TTT-T---TA-AACTTTT-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-GT-T---TTGAATATATT---A-TTT-TT-AACATA
gi|101813 : TTAGCATA-TAAA-A-TAC-CAAA--CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--AAT------TC--GGA-AATT---TTA--------T----TAA--A-TGTGA---T-CAA----AGA-TG--T-T-G----CC-TTG------CTT---TT---T-TT-A-TT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-CTC-C--CTGC--T-AAAG-------GA-T-A---TTTATTATCA-AGG-AT-T-TT--G-GGAAAAAA----A---TAT-CAT---TGGCTT-CC--TTT-T---T--AACTTTT-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATT---T-TTTGTT-
gi|101814 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAAACTCCTC-T-----GTTATTTTCAAA-ATGT-C-CAG-GTGA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--GTT------TG--GAA-A--C---TTA--------T----GAA--ATCCTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CC-TTG------C-T---CT---T-T--A-GT-CT-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-CT--C--TTGT--G-AGAG-------GA-T-AT--TTTATAA-CA-AGG-TT-T-TTTGG-GGGAAAAA----A-T-TAT-CATG--TG--TT-CT--TTT-T---TT-TATTTTT-AT-T--A-AA-T-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATT---A-TTTGTT-AACATA
gi|101815 : TTAATA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----GT-----------GTGT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--AAT------TC--GAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CC-TTG------C-T---TT---T-TT-A-TT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-CT--C--CTGT--T-AAAG-------GA-T-AT--TTTATTA-
gi|101815 : --TTTAT---TA-AACTTTC-AT-T--C-AA-TTTTTT-G-G--T---TTAA--ATA-T---A-TTTGTT-ACCATAaactttcattcaattttttggtttaaatatatttgttaccata
gi|101816 : ttaataataaaatgccaacctctgtgtgtccagataatgccatagataaactagaattcgaaatttattaaattgtgatcaaaatgttgccttgcttttttattcctatacattcaagaagggtaactcctgttaaaggatatTTAATA-A-TAAA-A-TCT-CAAACTCCTC-T-----ATTTATTTCCAAAATGT-C-CAG-ATGA-T-GCCA--TAG----ATATTTAA--A-C-TA--C--GTT------TG--GAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTCTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CC-TTG------C-G---TT---T-TA-A-AT-CC-TATACAT-T-C-CAG----AT-----CG--GT-G---A-CT--C--TTGT--T-AAAG-------GA-T-AT--TTTGTTA-CA-AGG-TT-T-TT--G-GAAAAAAA------T-TAT-CATG--TG--TT-CC--TTT-T---TA-AAAATGT-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TTGA--ATGAC---A-TTTGTT-AATATA
gi|101817 : TTAGTA-A-TATC-A--GC-CAA---CCT--T-----AT-----------ATGT-C--AG-ATAA-T-GC-A--TAG----ATA----AGAA-C-TA--G--AAT------TC--GAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T--AA----A-A-TGGTT-T-G----CC-TTG------C-T---TT---T-TC-A-TT-CC--ATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-ATTCC--TCAT--T-AAAG-------GA-T-AT--TTTATTA-CA-AGGCTT-T-TT--G-G--AAAAA----ATT-CAT---TG--TG--TT-CCCTTTT-T---TA-AACTTTT-AT-TCCC-AATT-TTTT-G-GTTT---TTGA--ATATTAAAA-TTTGTT-
gi|101818 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--ATT------TC--GAA-A--T---TTA--------T----TAG--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----TC-TTG------T-T---TT---TATT-A-TT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-CT--C--T
gi|101819 : TTAGTA-AATAAA-AATGC-CAAG--CCTC-T-----GT-----------TTGT-C-CAG-ATAAAT-GCCA--TAG----ATA----A--AAC-TA--AGAAAT------TC--GAA-A--T---TT---------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----C--TTG------C-T---TT---T-GC-A-T--------ACAT-T-C-A-G----CA-----GG--GT-A---A-CT--C--T-GT--T-AAAG-------GA-T-AT--TT-ATTA-CA-AGG-TT-T-TT--G-GGAAAAAA----ATG--AT-CATG--TG--TT-CT--TTT-T---T--AACTTTT-AT-T--C-AA-T-TTTTGG-G--T---TTGA--ATATT---ACTTTGTT--ACATA
gi|101820 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGCACAA---ACTCCT-----GT-----------AT-T-T-CA--ATAA-TTGCCA--T-------TA----A----C-TAC-G--ATT------TT--CAA-A--T---TTA--------A----TTG--ATTGTGA---T-CAA----A-A-T---T-T-G----CC-TTG------C-T---TT---T-T--A-TT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-C---C--TTGT--G-AAAG-------GA-C-AT--TT-ATTG-CA-A----T-T-TT--GAGGGAAAAA----AT---AT-CATG--TG--TT-CC--TTT-TGGTTA-AACTTT--AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATT---A--TTGTTAAACATA
gi|101821 : TTAGTA-C-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-------AT-----------ATGT-C-CA--ATAA-T-GCCA--TAG----AGA----A--A-CATA--G--AAT------TC--CGA-A--T---TTA--------T----TAA--ATT-TGA---T-CTA----G-A-TG--T---G----C--TTG------T-T---GT---T-TC-AATT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GTTA---A-TC--C--TTGTAAT-AGAG-------GA-TTGT--TTTATTA-CA-AGG-TT-T-TT--G-GAGAACAAGC--ATA-TATGCATGGCTG--TT-TC--CTT-T---TA-AACTTTT-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TAGA--A-ATT-----TTTG
gi|101822 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGT-CAA---ACTCCT-----GTTATTTCCAAA-ATGT-C-CAG-ATTA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--GTT------TG--GAA-A--T---TCA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-C----CC-TTG------CTT---TT---T-TT-A-TT-AC-TATA-AT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-CT--C--TTTT--T-A
gi|101823 : TTAGTA-A-TAAATA-AGC-CA----CCTC-T-----ATT----------AGTT-C-CAG-ATAA---GCCAA-TAG----ATA----A----C-TACGG--AAT------TC--GAA-AC-T---TTA--------T----TAA---TTGTGA---G-CAA----A-A-TG--T---G----CC-TTG------C-T---TG---T-TC-A-TTTCC-GATACAT-T-C-AAA----A-------G--GT-A---A-CT--C--T-AT--T-AAAG-------GA-T-AT--TTAAT-A-CA-GGG-TT-T-TC--G-G--AAAAA----ATG-TG--CATG--TG--TT-CC--TTT-T---TAGAAATTTT-A--T--C-AA-T-TTTT-G-G------TTGA--ATATT---A-
gi|101824 : TTAGAA-A-TGAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----AT-----------ATGT-C-CAG-AT---T--TCA--TAA------A----A--A-C-TAAGG--ATTAGGGAGTC--GAA-A--TCTGCTA--------T----TAA--ATCGTGA---T-CAA----G-ATTG--TCT-G----CA-TTG------C------T---T-TC-A-TT-CC--ATACCA-T-C-AAG----AAGCTGGGG--GG-A---A-CT--T--CCAT--T-AAAG-------GA-T-A----TTATTA-CA-AGT-CT-T-TC--G-GAAAAAAA----GTTATAT-CATG--TG---T-CC--TTT-T---AA-TACCTTT-AT-T--CGAA-T-TTGT-ATA--C---TTG---ATATT---A-TTTGTTAAACAT
gi|101825 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T--CCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--AAT------TC--GAA-A--T---TTA--------TCCCCTAA--ATTGTGATGCT-CAA----A-A-TG--T-T-GTGCACC-TTA------C-TATATTGAGT-CA-A-TG-CCGTTTACAT-T-CAAAG----AA-----GG--
gi|101826 : TAGTA---TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T------T-----------ATGT-C-CAG-ATA--T-GA-A--TGA----ATA----A--AAC-TA--GG-AAT------TC--GAA-A--T---TTA--------T----TTA--AATGTGA---TTCAATAGGA-C-TG--TCT-G----CC-TTG------C-T---TT---T-TC-A-TG-CC-TATACAT-TCC-AAG-----------GG--GT-A---A-TC--CAATTG-----AAAG-------GA---AT--TTTATTA-CA-AGG--T-T-TT--G-G----AAA----ATT---T-CATG--TG---------TTT-T---TA-ACCTTTA-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--TA--TTGA--ATATT---A-
gi|101827 : AGTA-A-CAAA-A-TGT-CAAACTCCTC-T-----TT-----------TTTTTC-CAA-A---------A--TGA----ATA----A--A-C-TA--G--GTT------TG--GAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGT------------------------T-G----CC-TTG------C-T---TT---T-TC-A-TT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----AG--GT-A---A-CC--C--------------------------AT--TTTATTA-CA-AGG-TT-T-TT--G-AAAAAAAA----A---TAT-CGCG--TG---------------------------------------T-TTTT-G-G--T---TGGA--ATATT---A-TTAGTT-AACATA
gi|101828 : AGTA-A-TAAA-G-TTG-CAA---CCTC-T-----GT-----------ATGTTC-CAG-ATAA-T-GCCACATAG----ATA----A--A-C-TA--G--ACA------TC--GGA-A--A---TTA--------T----TAA--ATTG
gi|101829 : -A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-TTGTGTGT-----------ATGT-CTCACTATAA-C-TCTA--TAT----ATAT---A--C-C-TA--G--AAT------TCTCGAAGA--T---GTA--------G----T-------GTG----T-AGA----G-A-TG--T-T-G----TA-TCGGAAAACC-T---TT---G-AT-G-TT-CC-TGAACATGT-C-AGGTAGGAA-----GGTTGT-AGATA-CT--CC-TTGT--G-TGAGTATGTGTGA-T-AC--TTT-TTA-CA-AGG-GT-T-TT--T-ATAAAAAC----ATAATAT-CATG--TG--TT-CA--TTT-T---TA-AACCTTT-AT-T--C-CA-A-TTTT-G-G--TGTGTTG----TATT---A--GTGTT-
gi|101830 : ---CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAT-T-GCCA--TAG----ATA----
gi|101831 : TT-T-----GT-----------A-GT-C--AG-ATGA---G--A--TA------TA----A--G-C-TA--G--GTT------T---GAG-A--T---TTT--------T----TAA---TTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CCGTTG------C-C---TT---T-T
gi|101832 : -C-CAGGATAA-T-GC-A--TAG----ATA----A--A-C-TA--A--AAT------TC--GAA-A--T---TTAATAAATTGT----TAATAATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T---G----CC-ATG------C-T---TT---T-TCCA-TT-CC--ATACAT-T-C-AAG----AA-----AG--GT-A-----CT--C--CTAT--T-AA-G-------GA-T-AT--TTTATTA-CA-A-G-TT-T-TT--T-GGAAAAAA----ATT-GAT-CATG--TG--TT-CC--TTT-T---TA-AACTTTTAAT-T--C-CA-A-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATT---A-TTTGTTAAACATA
gi|101833 : C--GAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-TTG----CC-TTGA-----T-T---TT---T-TC-A-TT-CC--ATACAT-T-C-AAG----AG-----GC--GT-A---AACT--C--CTAT--T-AAAG-------GAAT-AT--TT-ATTA-CA-AG--TT-T-TT--G-GAAAAAAA------T-TAT-CATG--TG--TTTCC--TTT-G---TT-AACTTTT-ATCT--C-AA-T-TGTT-G-G--T---TTGA--ATATT---ACTTTGTT-
gi|101834 : --GAA-G--A---TTA--------T----TAT--ATTCTTT---T-CTA----A-G-TG--T-T-G----TC-TTG------C-T---TT---T--C-A-GT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-CT--C--TTGT--TCAAAG-------AG-T-AC--TTTATTT-TC-AAG-TT-T-TT--G-GAAAAAAA----AT---AT-TATG--T----T-CC--TTT-T---TA-AATTTTC-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATT---A-TTTGTTAAACAT
gi|101835 : T-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-CT--C--TTGT--T-AAAG-------GA-T-ATATCTTATTA-CA-ATG-TT-T-TG--G-GGGAAAAA----AAA-TAT-CATG--TG--TT-CC--TTT-T---AA-AACTTTT-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TTAA--ATATT---A-TTTGTT-AACATA
gi|101836 : -AT--TTTATTA-CA-AAG-TT-T-TT--G-GAAAATAATTACATG-TAT-CATG--TG--TT-CC--TTT-T---TA-AACTTTT-AT-T--T-A
blockSeqs : T A T A A ACT C TGTGT TTATTTCCAAA T T T A T CA ATAG TTTA GA A A CG GA T AGGGAG TC G AT CTG ATAAATTG CCCC TA TGC T TAGG G T GT C T TGCA G GAAAAC TATA GAG A CC A T GT G C A TAGG GCTGG TT T GAT A TC AA AA C TATGTGT A T AT T C C G G TG A A TTACATGT G GC GC T CT A GGT G A C CC G T T G T TT GTG AT AAA C A
blockSeqs : . . . . . ACT C . TATTTTCAAA T . G . . A . T . A . AG G A . . . C . . . . . . . . . . C . . . A TT . . T . . T . . . . . . . . . C C . . . . . . . . . . . . . G GCATAT . . . . . . . . . . . . . . . . T A . . C A
blockSeqs : . . . . . ACT . . TATTTCCAAA . . . . . . . . . . . C . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . C . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G GTTAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . A . . T . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G ATAAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A ATTC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . A . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G ATGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . C . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G ATTG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A AAAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . C . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A ATT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . C . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A ATT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T ATG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . C . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G ATT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . C . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . A . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . C . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons : ATT******
originalCons : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--ANT------TC--GAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CC-TTG------C-T---TT---T-TC-A-TT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-CT--C--TTGT--T-AAAG-------GA-T-AT--TTTATTA-CA-AGG-TT-T-TT--G-GGAAAAAA----ATT-TAT-CATG--TG--TT-CC--TTT-T---TA-AACTTTT-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATT---A-TTTGTT-AACATA
finalCons : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--ANT------TC--GAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CC-TTG------C-T---TT---T-TC-A-TT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---A-CT--C--TTGT--T-AAAG-------GA-T-AT--TTTATTA-CA-AGG-TT-T-TT--G-GGAAAAAAATT------AT-CATG--TG--TT-CC--TTT-T---TA-AACTTTT-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATT---A-TTTGTT-AACATA
Alignments
lowQualScore : 111 22222222222 111111111
lowQualScore : 2 2 2 2 2 333 3 44444 66666666666 3 1 3 1 1 1 44 3333 5555 22 3 1 66 44 1 555555 22 1 44 222 66666666 3333 22 333 1 3333 1 1 22 3 1 3333 1 666666 1 333 333 1 55 1 1 66 1 1 1 3333 44444 22 3 333 44 44 22 1 6666666 1 44 1 2 0 2 2 444 2 222222222 2 4 22 44 22 555 1 1 1 22 1 4 2 2 2 44 555 22 333 4 9
lowQualScore : . . . . . ... . ..... ........... . . . . . . .. .... .... .. . . .. .. . ...... .. . .. ... ........ .... .. ... . .... . . .. . . .... . ...... . ... ... . .. . . .. . . . .... ..... .. . ... .. .. .. . ....... . .. . . . . . ... . ......... . . .. .. .. ... . . . .. . . . . . .. ... .. ... . .
lowQualScore : 0 0 0 0 0 888 6 55555 44444444444 5 7 5 7 7 6 11 7777 4444 55 6 8 88 33 0 222222 33 7 00 999 00000000 5555 33 000 7 7777 7 7 44 5 7 7777 7 777777 7 000 000 7 55 8 8 11 7 7 7 7777 33333 44 6 222 33 33 66 9 5555555 9 55 9 0 4 0 0 000 0 555555555 0 0 88 88 66 222 9 9 9 66 9 0 0 0 0 88 555 88 555 0 4
consensus : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--ANT------TC--GAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CC-TTG------C-T---TT---T-TC-A-TT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---ACT--C--TTGT--T-AAAG-------GAT-AT--TTTATTA-CA-AGGTT-T-TT--GGG-AAAAAA----A-T--T-AT-CATG--TG--TTCC--TTT---TTA-AACTTTT-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATT---A-TTTGTT-AACATA
Reference ( family-692 ) : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--ANT------TC--GAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CC-TTG------C-T---TT---T-TC-A-TT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---ACT--C--TTGT--T-AAAG-------GAT-AT--TTTATTA-CA-AGGTT-T-TT--GGG-AAAAAA----A-T--T-AT-CATG--TG--TTCC--TTT---TTA-AACTTTT-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATT---A-TTTGTT-AACATA
gi|101810 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--ATT------TC--GAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CC-TTG------C-T---TT---T-TT-A-TT-TC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---ACT--C--TTGT--T-AAAG-------GAT-AT--TTTATTA-CA-AGGTT-T-TT--GGG-AAAAAA----ATT--T-AT-CATG--TG--TTCC--TTT---TTA-AACTTTT-AT-T--C-AATT-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATA---A-TTTGTT-AACATA
gi|101811 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---ACT----------------------TCT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAGATAGATA----A--A-C-TA--G--ATT------TC--GAA-A--T---TCA--------T----TAT--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CC-TTG------C-T---TT---T-TT-A-TT-CC-TATGCAT-T-C-AAG----AA-----GA--GT-A---ACT--C--TTGT--T-AAAG-------GAT-AT--TTTATTA-CA-AGGCT-T-TT---GG-AAAAAA----A-T--T-AT-CATG--CG--TCCC--TTT---TTA-AACTTTT-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATT---A-TTTGTT-AACATA
gi|101812 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----AC-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T-GC-A--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--AAT------TC--GAA----T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CC-T-G------C-T---TT---T--C-A-TT-CC--ATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---ACT--C--CT-T--T-AAAG-------GAT-AT--TTTATTA-CACAGGTTGTGTT--GGG-AAAAAA----A-T--T-AT-CATG--TG--TTCC--TTT---TTA-AACTTTT-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-GT-T---TTGAATATATT---A-TTT-TT-AACATA
gi|101813 : TTAGCATA-TAAA-A-TAC-CAAA--CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--AAT------TC--GGA-AATT---TTA--------T----TAA--AT-GTGA---T-CAA----AGA-TG--T-T-G----CC-TTG------C-T---TT---T-TTTA-TT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---ACTC-C--CTGC--T-AAAG-------GAT-A---TTTATTATCA-AGGAT-T-TT--GGG-AAAAAA----A----T-AT-CAT---TGGCTTCC--TTT---TT--AACTTTT-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATT---T-TTTGTT-
gi|101814 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAAACTCCTC-T-----GTTATTTTCAAA-ATGT-C-CAG-GTGA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--GTT------TG--GAA-A--C---TTA--------T----GAA--ATCCTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CC-TTG------C-T---CT---T-T--A-GT-CT-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---ACT--C--TTGT--G-AGAG-------GAT-AT--TTTATAA-CA-AGGTT-T-TTTGGGG-GAAAAA----A-T--T-AT-CATG--TG--TTCT--TTT---TTT-TATTTTT-AT-T--A-AA-T-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATT---A-TTTGTT-AACATA
gi|101815 : TTAATA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----GT-----------GTGT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--AAT------TC--GAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CC-TTG------C-T---TT---T-TT-A-TT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---ACT--C--CTGT--T-AAAG-------GAT-AT--TTTATTA-
gi|101815 : --TTTA--TTA-AACTTTC-AT-T--C-AA-TTTTTT-G-G--T---TTAA--ATA-T---A-TTTGTT-ACCATAaactttcattcaattttttggtttaaatatatttgttaccata
gi|101816 : ttaataataaaatgccaacctctgtgtgtccagataatgccatagataaactagaattcgaaatttattaaattgtgatcaaaatgttgccttgcttttttattcctatacattcaagaagggtaactcctgttaaaggatatTTAATA-A-TAAA-A-TCT-CAAACTCCTC-T-----ATTTATTTCCAAAATGT-C-CAG-ATGA-T-GCCA--TAG----ATATTTAA--A-C-TA--C--GTT------TG--GAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTCTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CC-TTG------C-G---TT---T-TA-A-AT-CC-TATACAT-T-C-CAG----AT-----CG--GT-G---ACT--C--TTGT--T-AAAG-------GAT-AT--TTTGTTA-CA-AGGTT-T-TT---GG-AAAAAA----A-T--T-AT-CATG--TG--TTCC--TTT---TTA-AAAATGT-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TTGA--ATGAC---A-TTTGTT-AATATA
gi|101817 : TTAGTA-A-TATC-A--GC-CAA---CCT--T-----AT-----------ATGT-C--AG-ATAA-T-GC-A--TAG----ATA----AGAA-C-TA--G--AAT------TC--GAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T--AA----A-A-TGGTT-T-G----CC-TTG------C-T---TT---T-TC-A-TT-CC--ATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---AATTCC--TCAT--T-AAAG-------GAT-AT--TTTATTA-CA-AGGCT-T-TT--TGG-AAAAAA----T-T--C-AT---TG--TG--TTCCCTTTT---TTA-AACTTTT-AT-TCCC-AATT-TTTT-G-GTTT---TTGA--ATATTAAAA-TTTGTT-
gi|101818 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--ATT------TC--GAA-A--T---TTA--------T----TAG--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----TC-TTG------T-T---TT---TATT-A-TT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---ACT--C--T
gi|101819 : TTAGTA-AATAAA-AATGC-CAAG--CCTC-T-----GT-----------TTGT-C-CAG-ATAAAT-GCCA--TAG----ATA----A--AAC-TA--AGAAAT------TC--GAA-A--T---TT---------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----C--TTG------C-T---TT---T-GC-A-T--------ACAT-T-C-A-G----CA-----GG--GT-A---ACT--C--T-GT--T-AAAG-------GAT-AT--TT-ATTA-CA-AGGTT-T-TT--GGG-AAAAAA----A-T--G-AT-CATG--TG--TTCT--TTT---TT--AACTTTT-AT-T--C-AA-T-TTTTGG-G--T---TTGA--ATATT---ACTTTGTT--ACATA
gi|101820 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGCACAA---ACTCCT-----GT-----------AT-T-T-CA--ATAA-TTGCCA--T-------TA----A----C-TAC-G--ATT------TT--CAA-A--T---TTA--------A----TTG--ATTGTGA---T-CAA----A-A-T---T-T-G----CC-TTG------C-T---TT---T-T--A-TT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---AC---C--TTGT--G-AAAG-------GAC-A---TTTATTG-CA-A---T-T-TT--GAG-GGAAAA----A-A--T-AT-CATG--TG--TTCC--TTTTGGTTA-AAC-TTT-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATT---A--TTGTTAAACATA
gi|101821 : TTAGTA-C-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-------AT-----------ATGT-C-CA--ATAA-T-GCCA--TAG----AGA----A--A-CATA--G--AAT------TC--CGA-A--T---TTA--------T----TAA--ATT-TGA---T-CTA----G-A-TG--T---G----C--TTG------T-T---GT---T-TC-AATT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GTTA---ATC--C--TTGTAAT-AGAG-------GATTGT--TTTATTA-CA-AGGTT-T-TT--GGA-GAACAAGC--A-TA-T-ATGCATGGCTG--TTTC--CTT---TTA-AACTTTT-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TAGA--A-ATT-----TTTG
gi|101822 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGT-CAA---ACTCCT-----GTTATTTCCAAA-ATGT-C-CAG-ATTA-T-GCCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--GTT------TG--GAA-A--T---TCA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-C----CC-TTG------CTT---TT---T-TT-A-TT-AC-TATA-AT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---ACT--C--TTTT--T-A
gi|101823 : TTAGTA-A-TAAATA-AGC-CA----CCTC-T-----ATT----------AGTT-C-CAG-ATAA---GCCAA-TAG----ATA----A----C-TACGG--AAT------TC--GAA-AC-T---TTA--------T----TAA---TTGTGA---G-CAA----A-A-TG--T---G----CC-TTG------C-T---TG---T-TC-A-TTTCC-GATACAT-T-C-AAA----A-------G--GT-A---ACT--C--T-AT--T-AAAG-------GAT-AT--TTAAT-A-CA-GGGTT-T-TC--GGA-AAAAA----------T-GTGCATG--TG--TTCC--TTT---TTAGAAATTTT-A--T--C-AA-T-TTTT-G-G------TTGA--ATATT---A-
gi|101824 : TTAGAA-A-TGAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----AT-----------ATGT-C-CAG-AT---T--TCA--TAA------A----A--A-C-TAAGG--ATTAGGGAGTC--GAA-A--TCTGCTA--------T----TAA--ATCGTGA---T-CAA----G-ATTG--TCT-G----CA-TTG------C------T---T-TC-A-TT-CC--ATACCA-T-C-AAG----AAGCTGGGG--GG-A---ACT--T--CCAT--T-AAAG-------GAT-A----TTATTA-CA-AGTCT-T-TC--GGA-AAAAAA----G-TTAT-AT-CATG--TG---TCC--TTT---TAA-TACCTTT-AT-T--CGAA-T-TTGT-ATA--C---TTG---ATATT---A-TTTGTTAAACAT
gi|101825 : TTAGTA-A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAA-T--CCA--TAG----ATA----A--A-C-TA--G--AAT------TC--GAA-A--T---TTA--------TCCCCTAA--ATTGTGATGCT-CAA----A-A-TG--T-T-GTGCACC-TTA------C-TATATTGAGT-CA-A-TG-CCGTTTACAT-T-CAAAG----AA-----GG--
gi|101826 : TAGTA---TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-T------T-----------ATGT-C-CAG-ATA--T-GA-A--TGA----ATA----A--AAC-TA--GG-AAT------TC--GAA-A--T---TTA--------T----TTA--AATGTGA---TTCAATAGGA-C-TG--TCT-G----CC-TTG------C-T---TT---T-TC-A-TG-CC-TATACAT-TCC-AAG-----------GG--GT-A---ATC--CAATTG-----AAAG-------GA--AT--TTTATTA-CA-AGG-T-T-TT--GG-----AAA----A-T--T--T-CATG--TG--------TTT---TTA-ACCTTTA-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--TA--TTGA--ATATT---A-
gi|101827 : AGTA-A-CAAA-A-TGT-CAAACTCCTC-T-----TT-----------TTTTTC-CAA-A---------A--TGA----ATA----A--A-C-TA--G--GTT------TG--GAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGT------------------------T-G----CC-TTG------C-T---TT---T-TC-A-TT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----AG--GT-A---ACC--C-------------------------AT--TTTATTA-CA-AGGTT-T-TT--GAA-AAAAAA----A----T-AT-CGCG--TG-------------------------------------T-TTTT-G-G--T---TGGA--ATATT---A-TTAGTT-AACATA
gi|101828 : AGTA-A-TAAA-G-TTG-CAA---CCTC-T-----GT-----------ATGTTC-CAG-ATAA-T-GCCACATAG----ATA----A--A-C-TA--G--ACA------TC--GGA-A--A---TTA--------T----TAA--ATTG
gi|101829 : -A-TAAA-A-TGC-CAA---CCTC-TTGTGTGT-----------ATGT-CTCACTATAA-C-TCTA--TAT----ATAT---A--C-C-TA--G--AAT------TCTCGAAGA--T---GTA--------G----T-------GTG----T-AGA----G-A-TG--T-T-G----TA-TCGGAAAACC-T---TT---G-AT-G-TT-CC-TGAACATGT-C-AGGTAGGAA-----GGTTGT-AGATACT--CC-TTGT--G-TGAGTATGTGTGAT-AC--TTT-TTA-CA-AGGGT-T-TT--TAT-AAAAAC----A-TAAT-AT-CATG--TG--TTCA--TTT---TTA-AACCTTT-AT-T--C-CA-A-TTTT-G-G--TGTGTTG----TATT---A--GTGTT-
gi|101830 : ---CCTC-T-----GT-----------ATGT-C-CAG-ATAT-T-GCCA--TAG----ATA----
gi|101831 : TT-T-----GT-----------A-GT-C--AG-ATGA---G--A--TA------TA----A--G-C-TA--G--GTT------T---GAG-A--T---TTT--------T----TAA---TTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-T-G----CCGTTG------C-C---TT---T-T
gi|101832 : -C-CAGGATAA-T-GC-A--TAG----ATA----A--A-C-TA--A--AAT------TC--GAA-A--T---TTAATAAATTGT----TAATAATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T---G----CC-ATG------C-T---TT---T-TCCA-TT-CC--ATACAT-T-C-AAG----AA-----AG--GT-A----CT--C--CTAT--T-AA-G-------GAT-AT--TTTATTA-CA-A-GTT-T-TT--TGG-AAAAAA----A-T--TGAT-CATG--TG--TTCC--TTT---TTA-AACTTTTAAT-T--C-CA-A-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATT---A-TTTGTTAAACATA
gi|101833 : C--GAA-A--T---TTA--------T----TAA--ATTGTGA---T-CAA----A-A-TG--T-TTG----CC-TTGA-----T-T---TT---T-TC-A-TT-CC--ATACAT-T-C-AAG----AG-----GC--GTAA---ACT--C--CTAT--T-AAAG-------GA--ATA-TTTATTA-CA-A-GTT-T-TT---GG-AAAAAA----A-T--T-AT-CATG--TGT-TTCC--TTT---GTT-AACTTTT-ATCT--C-AA-T-TGTT-G-G--T---TTGA--ATATT---ACTTTGTT-
gi|101834 : --GAA-G--A---TTA--------T----TAT--ATTCTTT---T-CTA----A-G-TG--T-T-G----TC-TTG------C-T---TT---T--C-A-GT-CC-TATACAT-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---ACT--C--TTGT--TCAAAG-------AGT-AC--TTTATTT-TC-AAGTT-T-TT--GGA-AAAAAA----A-T----AT-TATG--T----TCC--TTT---TTA-AATTTTC-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TTGA--ATATT---A-TTTGTTAAACAT
gi|101835 : T-T-C-AAG----AA-----GG--GT-A---ACT--C--TTGT--T-AAAG-------GAT-ATATCTTATTA-CA-ATGTT-T-TG--GGGGAAAAAA----A-A--T-AT-CATG--TG--TTCC--TTT---TAA-AACTTTT-AT-T--C-AA-T-TTTT-G-G--T---TTAA--ATATT---A-TTTGTT-AACATA
gi|101836 : -AT--TTTATTA-CA-AAGTT-T-TT--GGA-AAATAATTACA-TG-T-AT-CATG--TG--TTCC--TTT---TTA-AACTTTT-AT-T--T-A