lowQualScore : 1111 2222 11111111111 11
lowQualScore : 2 1 1 3333 1 1 1 1 1 22 22 22 2 1 333 3 5 1 22 55 1 1 3 44 1 1 777 1 3 1 1 1 1 1 1 66 1 44 22 1 1 8888 2 44 99 5 1 1 555 888 1 0000 1 1 1 3 1 1 2 2 333 2 333 666666 4 77777 99 22 2 55 2 22 2 00000000000 2 00 2 22
lowQualScore : . . . .... . . . . . .. .. .. . . ... . . . .. .. . . . .. . . ... . . . . . . . . .. . .. .. . . .... . .. .. . . . ... ... . .... . . . . . . . . ... . ... ...... . ..... .. .. . .. . .. . ........... . .. . ..
lowQualScore : 0 9 9 9999 7 8 8 8 8 55 66 66 0 9 333 0 0 9 66 66 9 9 8 55 9 9 999 9 8 9 9 9 9 9 9 44 9 55 66 9 9 4444 2 55 99 5 9 9 222 111 9 9999 8 8 8 6 8 9 0 0 555 0 555 000000 4 77777 11 99 1 00 1 99 1 00000000000 1 11 1 99
consensus : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTTTAAATACT-T---AGATTG-TTCATT--TT-AG-G-GTA-T--GATA-A-AAGC---A-AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-TC-AG--TA-T--AATG--A-GTA-AA-T--TATGGTATTTTTATT--A-NGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AATA-T--C-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T--CC-T---AGAA-A--T-TGTCAA--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-TGAT-CC-TGCA--ATTTTTT
Reference ( gi|131755 ) : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTTTAAATACT-T---AAATTG-TTCATT--TT-AG-G-GTA-T--GATA-A-AAGC---A-AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-TC-AG--TA-T--AATG--A-GTA-AA-A--TATGGTATTTTTATT--A-TGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACGA--C-AATA-A--C-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T--CC-T---AGAA-A--T-TGTCAA--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-TGAT-CC-TGCA--ATTTTTT
gi|131757 : TTAAGG-TAGGTCC--T-AC----TCTTGGACT-TAC-T-TTG-T--GATTTC--TC--AAAAAAAT-GAGTTTAAATACT-T---AGATTG-TTCATT--TT-AG-G-GTA-T--GATA-A-A-GC---A-AAA-A-A-TTA-GGG-GCTTG-TC-AG--TA-T--AATG--A-GTA-AA-T--TATGGTATTTTTATT--A-AGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AATA-T--C-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T--CC-T---AGAA-A--T-TGTCAA--T--AT-TTTT--T-GT-T-TT--G-AGGT-----------A-TGAT-CC-AGCA--TTTTTTT
gi|131758 : TTAAGG-TAGGTCCC-T-ACCTACTCCTGAACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GATTTTAAATACT-T---AGATTG-TTCATT--TT-AG-G-GTA-T--GATA-A-AAGC---A-AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-TC-AG--TA-T--AATG--A-GT--AA-T--TATGGTACTTTTATT--A-AGTGTA-CCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AATA-T--C-AGAA--TCA-T-TG-A-AGAAAG-T--CC-T---AGAA-A--T-GTTTAA--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-CGATCCC-TGCA--ATTTTT
gi|131756 : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TCGAAAAAAATT-GAG-TTAAATACT-T---AGATTGTTTCATT--TT-AG-G-GTA-T--GATA-A-AAGC---A-AAACA-A-TTA-GGG-GGTTG-TC-AG--TA-T--AATG--A-GTA-AA-T--TATGGTG--TTTATT--A--GT---CCCCTA-TCTG-TCA---AACGA--C-AATA-GT-C-AGAAA-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T---C-T---AGAA-A--T-TGTC-A--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-TGAT-CC-TGCA--ATTTTTT
gi|131759 : TTAAGG-TAGGTCCC-TTAC----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTTT-AAT-CT-T----AGTTG-TTCATT--TT-AG-G-GTA-T--GATA-A-AAGC---A-AAA-A-A-TT--GGG-GCTTG-TC-AG--TA-TTAAATG--A-GTA-AA-T--TAT-GTATTTTTATT--A--GT-TACCCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AATA-T--C-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T---C-T---AGAA-A--T-TGTAAA--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------ATTGAT--C-TGCA--ATTTTTT
gi|131760 : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TC-TGGACTCTTC-T-T-G-T--GATT-C--TC--AAAAA--T-GAGTTTAAATACT-T---AGAT-G-TTCATT--TT-AG-G-GTA-T--GATA-A-A-GC---A-AAA-A-A-ATA-GGG-GGTTGGTC-AG--TAAT--AATG--AAGTA-AATA--TATGGTATTTTTATT--G-TGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AAGGG--C-AATA-T--C-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG--AG-T--CC-C---AGAA-A--T-TGTCAA--T--AA--TTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-TGAT-CC-TGCA--ATTTTTT
gi|131761 : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACC-TAT-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTTTAAATACT-TACGAGATTG-TTCATT--TG-AG-G-GTA-T--GATA-A-AAGC---C-AAA-A-A-TTA--GG-GGTTG-GC-AGTTTA-T--AATGAAA-GTA-AA-T--TATGGTATTTTTATT--A-CGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACAG--C-AATA-T--C-AGAAT-TCA-T-TGAA-AG-GAG-TCCCC-T---AGAA-A----TGTCCA--TA-AA-ATTT--T-G--T-TT--G-AGGA-----------A-TGAT-GC-TGCA--ATTTT
gi|131762 : TTAAGGGTAGGCC-----A-----TCC-GGACC-AAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTTTAAATACT-T---AGATTG-TTCATT--TG-AG-G-GTA-T--GATA-A-AAAC---A-AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-AC-AG--TA-T--AATG--A-GTA-AA-T--TATGGTATTTTTATT--A-TGTGTACCCCCA-TCAG-TCA---AACGG--C-AATA-T--C-AGAAC-TCA-T-TG-A-AG-GAG-T--CC-T---AGAG-T--A-TGTCCA--T--AA-ATTT--T-G--T-TT--G-ACGT-----------A-TGAC-GC-TGCA--ATTTTTT
gi|131763 : TTAAGG-TAGGTTCC-T-AC----TCCTGGAAC-TAC-C-T-G-T--GATT-C--TC--AAAAAATT-GAGTTTAAATATT-T---AGATTG-TTCATT--TG-AG-A-TTA-A--GATA-A-AAGC-----AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-TA-AG--TA-T--AATG--A-GTA-A-----------------ATT--A-TGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AAAA-T--C-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T--CC-T---AGAATA--T-T-TCCA--T--AA-ATTT--T-G--T-TT--A-TGGT-----------A-TGAT-GC-TGCA--ATTTTTT
gi|131764 : TTAAGG--AGGTC---T-AC------CTGGACT-TAC-T-T---T--GATCT---TC--AAAA-ATT-GAGTTTAAAT-CT-T---AGATT--TTCATTTCTT-AG-G-GTA-TA-GAT--A-AAGC---A-AAA-A-A-TTA-GGGTGGTTG-CC--G--TA----AATG--A-GTA-AATA--TATGGTATTTTTATT--A-AGTGTA-CCCCA-TCTG-T-----AACGG--C--ATA-T--C-AG-AT-TCA-TCTG-AGAG-AAA----CT-T---AGAA-A--T-TGTCAA--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AG------------------T-CCTTGCA--ATTTTTT
gi|131765 : TCAAGG-TAG-TCCC-T-AC----TC---GACC-TAC-T-T-G----GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTT-AAATACT-T---AGATGT-TTCATT--CG-AG-G-GT-------TATA-AAGC---A-AAT-A---TT----G-GGTT--TC-A---TA-T--AATG--A-GTA-AT-T--TATGGTATTCTTATT--A--GTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACG---C-AATATA--C-AAA---TCATT-TG-A-AG-AAG-T---C-T---A-AA-A--T-TGT-AA--T--AG--TTT--T-G--T-TT----AGGT-----------A-TTAT--C-TGCA--ATTTTT
gi|131766 : TTAAGG-TAGGTCCT-T-AC----TCCTGGACT-TAC-T-T-C-T--GA----------------------TTT-----CT-C---ATAT------ATT--TG-AG-G-ACA-T--GATA-A-TAGC---A-AAC-C-A-ATA-GGG---TTG-TC-AG--TA-T--AATG--A-GTA-AA-T--TATGGTATTTTTATT--A-CGTGTACCCCCA-TTTG-TCA---AACGG--C-AAAA-T--C-AGAATATCA-T-TG-A-AG-AA-----CC-T---AGAA-C--A-TGTAAA--TA-AA-ATTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-CCAT-GC-TGCA--ATATT
gi|131767 : TCAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACC-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-
gi|131768 : TTAAGA-TAGATCCC-T-AC----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATT
gi|131769 : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACT-T
gi|131770 : TAAGG-TAGGCC-----------TCC-GGAC---AA-C-T-G-T--GAATTC---C--AAAAAATT-GAGTTAAAATACT-T---AGA-TG-GTCATT--TG-A--G-GT--T--GAAA-ACAAG------AAA-A-A-TTC-CGG-GGTTG-AC--C--TA----AATG--A--TA-A------ATAGTA-TTTTATT--A-T-TGTA-CCCAA-TCAG-TAAAACAACGG--C-AATA-T--C-AGAAC-CCA-T-TG-A-AG-GAG-T---C-T---AGAG-T--A-TGCC-A--T--AA--ATT--T-G----TT--G-ACGT-------------CG----C-TGCA--ATTCTT
gi|131771 : AAGG-TAGGTCC--T-AT----CCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTT--CT--AAAAAATT-GAGTTTAAATACTGT---AGATTG-TTCATT--TT-AG-GTGTA-T--GATA-A-AAGCA--A-AAA-A-A-TTA-GGG-GG-TG-T--AG--TA-T--AATG--A-GT--AA-A--TTTGGTATTTTTATT--A-TGTGTA-ACCCA-TCTG-TCAG--AACAG--C-AATT-ATTC-AGAAT-TCA-TGTG-A-AG-AAG-T--CC-----ATAA-A--T-TGTC-A--T--AA-TTTT--TCG--TGTT--G-AAGG-----------A-GAGT-CC-TGTA--ATTTTTT
gi|131772 : AAGG-TAGATCCC-T-AC----TCCTGGACC-TAC-T-T-G-T--GATTTC--CT--AAAAAAT---------GATGTT-T---AAAT------ACT-------------------------AGC---A-AAA-A-C-TTA-GTG-GGTTG-TC-AT--TT-T--AATG--A-GTA-AA-G--TATGGTATTTTTATT--A-TGTGTA---CCA-TCTGTTTA---AACGG--C-AAT--T--C-AAATT-CCC-T-TG-A-AG-ACG-T--CC-T---AT-A-A--T-TGTAAA--T--
gi|131773 : AGC-TAGGTCCC-T--C----TCCTGGACC-TACAT-T-G-T--AATTTC--TC--AAAAT-TT-TAGTTTAAATACT-T---AGATTG-TTCATT--TTGAA-G-GTA-T--GATA-A-AAGC---A-AAACA-ATTTATGGG-GGTTG-TC-AGA-TA-T---ATG--A-GTATAA-ATTTATGGTA----CA-T--A-T-TGTA---CCA-------CA---AACGGACC-AATA-AT-C-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AA-----TC-T---ATAGTA--T-T-CCAA-----AA-ATTT--T-G--T-TT--G-A-AT-----------A-TGAT-GC-TGCA--ATTTTTTt
gi|131774 : AAG-TCGATCCC-T-CC----TCCC---CT-TCC-CCT-G-T--AAG--C--TC--AAAAAATT-TCCCTTAAATACG-G---AAATGG-TT---------AGTA-GTA-T----TT-A-AAGCTG-G-ATA-A-A-TCC-CTG-GGTTG-TCGAG--T--T--AATG--A-GTA-AA-T--TATGGTATTTTTATT--ATTGTGCAGCCCCA-TCT--TCA---AACAG--C-AATA-T--CAAGAAT-TCA-T-TG-A-AC-AAG-T--CC-T---AGAA-A--T-TGTGAAAGT--AT-TTTT--T-G--T-TT--GAAGGCATGAATTTTTGA-TGAT-CC-TGTT--ATTTTTT
gi|131775 : G-TAGGTCCCCT-A-----TCCTGAACT-TAC-T-T-G-TTTGATTTCCATC--AAAAAATTTGAGTTTAAATACT-T---AGAT-G-TTCATT--TT-AG-G-GTA-TTTGATA-A-AAGC---C-AAA-A-A-TTT-AGG-GGTTG-TC-AG--TA-TT-AATG--A-GTA-AA-T--TATGGTGTTTTTATTTAA-GGTGTACCCCCAATCTG-TCA---AACGG--C-AATA-T--C-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAGTT--CC-TTAGAGAA-AATT-TGTCAAATT--AATTTTT--T-G--T-TTTGA-AGGT-----------A-TGAT-CC-TGCA--ATTTTTT
gi|131776 : -T-AC----TCCTGGACC-TTT-T-C-G-T--GATTTC--TA--AAAAAAAA-GGTTTTAAATACT-T---CGATCG-TTCATT--TG-AG-G-GAA-T--GATA-A-ATGC---A-AAA-C-A-TTA-AGG-GATTG-TC-AG--TA-T--AATG--A-GTG-AA-T--TATGGTATTTTTATA--G-TGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AATA-T--C-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T--CC-T---AGAA-T--A-TGTCCA--T--AA-ATTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------T-TGAT-GG-TGCA--ATTT
gi|131777 : C----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAA
gi|131778 : ACT-TAC-T-T-GAT--GATTTC--TC--AAAAAATT-GGAGTTAAATACT-T---AGATTG-TTCATT--TT-AG-G-GTATT--GATA-A-AAGTAAAA-AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-TC-AGT-TA-T--AATG--A-GTA-AA-AT-TATGGTA-TTTTATTA-A-AGTGTACCCCCA-TCT--TCA---AACGG--CAAATA-T--C-AGTAT-TCA-T-TT-A-AG-AAG-T--CCTT---AGAA-A----TGTCAAT-T--AA-TTTTTCT-GTTT-TT--G-AGGT-----------A-CGAT--C-TGCA--ATTTTTT
gi|131779 : TCTAATTACT-C---GA-TAG-TTCGTT--TTGAG-G-GTATT--GCTG-A-AA-C---A-AAA-T-A-TTA-GTG-AGATG-CC-TG--TA-T--TATT--A-GTA-AA-T--CAGAGTATCTTTATG--A-AGTGTACCTCTA-TTTG-TCA---ATCAA--C-AGTA-T--C-AGAGT-CCA-C-TG-
gi|131780 : TTGAACACT-C---AAACNN-NNNNNN--NN-NN-N-NNN-N--NNNN-N-NNNC---ACAAA-ACA-TTA-GTG-GGTTG-TC-TG--TA-T--TATT--A-GTA-AA-T--CAGAGTATTTTTATG--A-AGTGTACCTCTA-TTTG-TCA---ATCAA--C-AGTA-T--C-AGAGT-CCA-C-TG-A-
gi|131781 : TA-T--C-AGAAT-TCA-C-TG-A-AG-AAA-T--CC-T---AGGA-A--TGTGTCCA--TAAAA-TTTT--T-G--T-TT--C-A-GT-----------A-TGAC-TG-TGCAACATTTTTT
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 3333 1 1 1 1 1 22 22 22 1 1 333 4 1 22 44 1 1 1 3 44 1 777 1 3 1 1 1 1 1 1 1 22 1 44 1 44 1 1 22 3 1 44 99 4 1 1 555 22 1 1 1 3 1 1 1 3 1 1 1 1 222 1 333 3 5555 3 77 66 88 22 2 44 2 22 2 99999999999 2 99 2 22
lowQualScore : . . . .... . . . . . .. .. .. . . ... . . .. .. . . . . .. . ... . . . . . . . . . .. . .. . .. . . .. . . .. .. . . . ... .. . . . . . . . . . . . . ... . ... . .... . .. .. .. .. . .. . .. . ........... . .. . ..
lowQualScore : 9 8 8 7777 7 7 7 7 7 44 55 55 9 8 222 4 8 55 99 8 8 8 6 33 8 555 8 6 8 8 8 8 8 8 8 55 8 33 8 33 8 8 55 6 7 33 44 8 8 8 000 55 8 7 7 5 7 7 7 5 7 8 9 9 999 9 333 8 1111 7 11 44 22 88 0 88 0 88 0 55555555555 0 00 0 88
consensus : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTTTAAATACT-TA---GATTG-TTCATT--TT-AG-G-GT-A-T--GATAA-AAGC---A-AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-TC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--T-TATGGTATTTTTATT--A-NGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AA-T-A-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T--CC-T---AGAA-A--T-TGTCAA--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-TGAT-CC-TGCA--ATTTTTT
Reference ( family-673 ) : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTTTAAATACT-TA---GATTG-TTCATT--TT-AG-G-GT-A-T--GATAA-AAGC---A-AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-TC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--T-TATGGTATTTTTATT--A-NGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AA-T-A-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T--CC-T---AGAA-A--T-TGTCAA--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-TGAT-CC-TGCA--ATTTTTT
gi|131755 : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTTTAAATACT-TA---AATTG-TTCATT--TT-AG-G-GT-A-T--GATAA-AAGC---A-AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-TC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--A-TATGGTATTTTTATT--A-TGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACGA--C-AA-T-A-AC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T--CC-T---AGAA-A--T-TGTCAA--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-TGAT-CC-TGCA--ATTTTTT
gi|131756 : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TCGAAAAAAATT-GAG-TTAAATACT-TA---GATTGTTTCATT--TT-AG-G-GT-A-T--GATAA-AAGC---A-AAACA-A-TTA-GGG-GGTTG-TC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--T-TATGGTG--TTTATT--A--GT---CCCCTA-TCTG-TCA---AACGA--C-AA-T-AGTC-AGAAA-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T---C-T---AGAA-A--T-TGTC-A--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-TGAT-CC-TGCA--ATTTTTT
gi|131757 : TTAAGG-TAGGTCC--T-AC----TCTTGGACT-TAC-T-TTG-T--GATTTC--TC--AAAAAAAT-GAGTTTAAATACT-TA---GATTG-TTCATT--TT-AG-G-GT-A-T--GATAA-A-GC---A-AAA-A-A-TTA-GGG-GCTTG-TC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--T-TATGGTATTTTTATT--A-AGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AA-T-A-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T--CC-T---AGAA-A--T-TGTCAA--T--AT-TTTT--T-GT-T-TT--G-AGGT-----------A-TGAT-CC-AGCA--TTTTTTT
gi|131758 : TTAAGG-TAGGTCCC-T-ACCTACTCCTGAACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GATTTTAAATACT-TA---GATTG-TTCATT--TT-AG-G-GT-A-T--GATAA-AAGC---A-AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-TC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT---AA--T-TATGGTACTTTTATT--A-AGTGTA-CCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AA-T-A-TC-AGAA--TCA-T-TG-A-AGAAAG-T--CC-T---AGAA-A--T-GTTTAA--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-CGATCCC-TGCA--ATTTTT
gi|131759 : TTAAGG-TAGGTCCC-TTAC----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTTTAA-T-CT-TA---G-TTG-TTCATT--TT-AG-G-GT-A-T--GATAA-AAGC---A-AAA-A-A-TT--GGG-GCTTG-TC-AG-T--A-TTAA-ATGA--GT-A-AA--T-TATG-TATTTTTATT--A--GT-TACCCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AA-T-A-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T---C-T---AGAA-A--T-TGTAAA--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------ATTGAT--C-TGCA--ATTTTTT
gi|131760 : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TC-TGGACTCTTC-T-T-G-T--GATT-C--TC--AAAAA--T-GAGTTTAAATACT-TA---GAT-G-TTCATT--TT-AG-G-GT-A-T--GATAA-A-GC---A-AAA-A-A-ATA-GGG-GGTTGGTC-AG-T--AAT--A-ATGAA-GT-A-AA--TATATGGTATTTTTATT--G-TGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AAGGG--C-AA-T-A-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG--AG-T--CC-C---AGAA-A--T-TGTCAA--T--AA--TTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-TGAT-CC-TGCA--ATTTTTT
gi|131761 : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACC-TAT-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTTTAAATACT-TACGAGATTG-TTCATT--TG-AG-G-GT-A-T--GATAA-AAGC---C-AAA-A-A-TTA-GGG-G-TTG-GC-AG-TTTA-T--A-ATGAAAGT-A-AA--T-TATGGTATTTTTATT--A-CGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACAG--C-AA-T-A-TC-AGAAT-TCA-T-TGAA-AG-GAG-TCCCC-T---AGAA-A----TGTCCA--TA-AA-ATTT--T-G--T-TT--G-AGGA-----------A-TGAT-GC-TGCA--ATTTT
gi|131762 : TTAAGGGTAGGCC-----A-----TCC-GGACC-AAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTTTAAATACT-TA---GATTG-TTCATT--TG-AG-G-GT-A-T--GATAA-AAAC---A-AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-AC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--T-TATGGTATTTTTATT--A-TGTGTACCCCCA-TCAG-TCA---AACGG--C-AA-T-A-TC-AGAAC-TCA-T-TG-A-AG-GAG-T--CC-T---AGAG-T--A-TGTCCA--T--AA-ATTT--T-G--T-TT--G-ACGT-----------A-TGAC-GC-TGCA--ATTTTTT
gi|131763 : TTAAGG-TAGGTTCC-T-AC----TCCTGGAAC-TAC-C-T-G-T--GATT-C--TC--AAAAAATT-GAGTTTAAATATT-TA---GATTG-TTCATT--TG-AG-A-TT-A-A--GATAA-AAGC-----AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-TA-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--T-TAT-----------------GTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AA-A-A-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T--CC-T---AGAATA--T-T-TCCA--T--AA-ATTT--T-G--T-TT--A-TGGT-----------A-TGAT-GC-TGCA--ATTTTTT
gi|131764 : TTAAGG--AGGTC---T-AC------CTGGACT-TAC-T-T---T--GATCT---TC--AAAA-ATT-GAGTTTAAAT-CT-TA---GATT--TTCATTTCTT-AG-G-GT-A-TA-GAT-A-AAGC---A-AAA-A-A-TTA-GGGTGGTTG-CC--G-T--A----A-ATGA--GT-A-AA--TATATGGTATTTTTATT--A-AGTGTA-CCCCA-TCTG-T-----AACGG--C--A-T-A-TC-AG-AT-TCA-TCTG-AGAG-AAA----CT-T---AGAA-A--T-TGTCAA--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AG------------------T-CCTTGCA--ATTTTTT
gi|131765 : TCAAGG-TAG-TCCC-T-AC----TC---GACC-TAC-T-T-G----GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTT-AAATACT-TA---GATGT-TTCATT--CG-AG-G-GTTA-T------A-AAGC---A-AAT-A---TT----G-GGTT--TC-A--T--A-T--A-ATGA--GT-A-AT--T-TATGGTATTCTTATT--A--GTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AAC-G--C-AA-T-A-T--ACAAA-TCATT-TG-A-AG-AAG-T---C-T---A-AA-A--T-TGT-AA--T--AG--TTT--T-G--T-TT----AGGT-----------A-TTAT--C-TGCA--ATTTTT
gi|131766 : TTAAGG-TAGGTCCT-T-AC----TCCTGGACT-TAC-T-T-C-T--GATTT---------------------------CT-CA---TAT------ATT--TG-AG-G-AC-A-T--GATAA-TAGC---A-AAC-C-A-ATA-GGG---TTG-TC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--T-TATGGTATTTTTATT--A-CGTGTACCCCCA-TTTG-TCA---AACGG--C-AA-A-A-TC-AGAATATCA-T-TG-A-AG-AA-----CC-T---AGAA-C--A-TGTAAA--TA-AA-ATTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-CCAT-GC-TGCA--ATATT
gi|131767 : TCAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACC-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-
gi|131768 : TTAAGA-TAGATCCC-T-AC----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATT
gi|131769 : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACT-T
gi|131770 : TAAGG-TAGGCC-----------TCC-GGAC---AA-C-T-G-T--GAATTC---C--AAAAAATT-GAGTTAAAATACT-TA---GA-TG-GTCATT--TG-A--G-GT---T--GAAAACAAG------AAA-A-A-TTC-CGG-GGTTG-AC--C-T--A----A-ATGA---T-A-A------ATAGTA-TTTTATT--A-T-TGTA-CCCAA-TCAG-TAAAACAACGG--C-AA-T-A-TC-AGAAC-CCA-T-TG-A-AG-GAG-T---C-T---AGAG-T--A-TGCC-A--T--AA--ATT--T-G----TT--G-ACGT-------------CG----C-TGCA--ATTCTT
gi|131771 : AAGG-TAGGTCC--T-AT----CCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTT--CT--AAAAAATT-GAGTTTAAATACTGTA---GATTG-TTCATT--TT-AG-GTGT-A-T--GATAA-AAGCA--A-AAA-A-A-TTA-GGG-GG-TG-T--AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--T-T-TGGTATTTTTATT--A-TGTGTA-ACCCA-TCTG-TCAG--AACAG--C-AATT-ATTC-AGAAT-TCA-TGTG-A-AG-AAG-T--CC-----ATAA-A--T-TGTC-A--T--AA-TTTT--TCG--TGTT--G-AAGG-----------A-GAGT-CC-TGTA--ATTTTTT
gi|131772 : AAGG-TAGATCCC-T-AC----TCCTGGACC-TAC-T-T-G-T--GATTTC--CT--AAAAAAT---------GATGTT-TA---AAT------ACT-------------------------AGC---A-AAA-A-C-TTA-GTG-GGTTG-TC-AT-T--T-T--A-ATGA--GT-A-AA--G-TATGGTATTTTTATT--A-TGTGTA---CCA-TCTGTTTA---AACGG--C-AA-T---TC-AAATT-CCC-T-TG-A-AG-ACG-T--CC-T---AT-A-A--T-TGTAAA--T--
gi|131773 : AGC-TAGGTCCC-T--C----TCCTGGACC-TACAT-T-G-T--AATTTC--TC--AAAAT-TT-TAGTTTAAATACT-TA---GATTG-TTCATT--TTGAA-G-GT-A-T--GATAA-AAGC---A-AAACA-ATTTATGGG-GGTTG-TC-AG----A-T--ATATGA--GT-ATAAATT-TATGGTA--CATAT-------TGTA---CCA-------CA---AACGGACC-AA-TAA-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AA-----TC-T---ATAGTA--T-T-CCAA-----AA-ATTT--T-G--T-TT--G-A-AT-----------A-TGAT-GC-TGCA--ATTTTTTt
gi|131774 : AAG-TCGATCCC-T-CC----TCCC---CT-TCC-CCT-G-T--AAG--C--TC--AAAAAATT-TCCCTTAAATACG-GA---AATGG-TT---------AGTA-GT-A-T----TTA-AAGCTG-G-ATA-A-A-TCC-CTG-GGTTG-TCGAG-T----T--A-ATGA--GT-A-AA--T-TATGGTATTTTTATT--ATTGTGCAGCCCCA-TCT--TCA---AACAG--C-AA-T-A-TCAAGAAT-TCA-T-TG-A-AC-AAG-T--CC-T---AGAA-A--T-TGTGAAAGT--AT-TTTT--T-G--T-TT--GAAGGCATGAATTTTTGA-TGAT-CC-TGTT--ATTTTTT
gi|131775 : G-TAGGTCCCCT-A-----TCCTGAACT-TAC-T-T-G-TTTGATTTCCATC--AAAAAATTTGAGTTTAAATACT-TA---GAT-G-TTCATT--TT-AG-G-GT-A-TTTGATAA-AAGC---C-AAA-A-A-TTT-AGG-GGTTG-TC-AG-T--A-TT-A-ATGA--GT-A-AA--T-TATGGTGTTTTTATTTAA-GGTGTACCCCCAATCTG-TCA---AACGG--C-AA-T-A-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAGTT--CC-TTAGAGAA-AATT-TGTCAAATT--AATTTTT--T-G--T-TTTGA-AGGT-----------A-TGAT-CC-TGCA--ATTTTTT
gi|131776 : -T-AC----TCCTGGACC-TTT-T-C-G-T--GATTTC--TA--AAAAAAAA-GGTTTTAAATACT-TC---GATCG-TTCATT--TG-AG-G-GA-A-T--GATAA-ATGC---A-AAA-C-A-TTA-AGG-GATTG-TC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-G-AA--T-TATGGTATTTTTATA--G-TGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AA-T-A-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T--CC-T---AGAA-T--A-TGTCCA--T--AA-ATTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------T-TGAT-GG-TGCA--ATTT
gi|131777 : C----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAA
gi|131778 : ACT-TAC-T-T-GAT--GATTTC--TC--AAAAAATT-GGAGTTAAATACT-TA---GATTG-TTCATT--TT-AG-G-GT-ATT--GATAA-AAGTAAAA-AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-TC-AGTT--A-T--A-ATGA--GTAA-AA--T-TATGGTA-TTTTATTA-A-AGTGTACCCCCA-TCT--TCA---AACGG--CAAA-T-A-TC-AGTAT-TCA-T-TT-A-AG-AAG-T--CCTT---AGAA-A----TGTCAAT-T--AA-TTTTTCT-GTTT-TT--G-AGGT-----------A-CGAT--C-TGCA--ATTTTTT
gi|131779 : TCTAATTACT-C----GATAG-TTCGTT--TTGAG-G-GT-ATT--GCTGA-AA-C---A-AAA-T-A-TTA-GTG-AGATG-CC-TG-T--A-T--T-ATTA--GT-A-AA--T-CAGAGTATCTTTATG--A-AGTGTACCTCTA-TTTG-TCA---ATCAA--C-AG-T-A-TC-AGAGT-CCA-C-TG-
gi|131780 : TTGAACACT-CA---AACNN-NNNNNN--NN-NN-N-NN-N-N--NNNNN-NNNC---ACAAA-ACA-TTA-GTG-GGTTG-TC-TG-T--A-T--T-ATTA--GT-A-AA--T-CAGAGTATTTTTATG--A-AGTGTACCTCTA-TTTG-TCA---ATCAA--C-AG-T-A-TC-AGAGT-CCA-C-TG-A-
gi|131781 : -T-A-TC-AGAAT-TCA-C-TG-A-AG-AAA-T--CC-T---AGGA-A--TGTGTCCA--TAAAA-TTTT--T-G--T-TT--C-A-GT-----------A-TGAC-TG-TGCAACATTTTTT
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 3333 1 1 1 1 1 22 22 22 1 1 333 4 1 22 44 1 1 1 3 44 1 777 1 3 1 1 1 1 1 1 1 22 1 44 1 44 1 1 22 3 1 44 99 4 1 1 555 22 1 1 1 3 1 1 1 3 1 1 1 1 222 1 333 3 5555 3 77 66 88 22 2 44 2 22 2 99999999999 2 99 2 22
lowQualScore : . . . .... . . . . . .. .. .. . . ... . . .. .. . . . . .. . ... . . . . . . . . . .. . .. . .. . . .. . . .. .. . . . ... .. . . . . . . . . . . . . ... . ... . .... . .. .. .. .. . .. . .. . ........... . .. . ..
lowQualScore : 9 8 8 7777 7 7 7 7 7 44 55 55 9 8 222 4 8 55 99 8 8 8 6 33 8 555 8 6 8 8 8 8 8 8 8 55 8 33 8 33 8 8 55 6 7 33 44 8 8 8 000 55 8 7 7 5 7 7 7 5 7 8 9 9 999 9 333 8 1111 7 11 44 22 88 0 88 0 88 0 55555555555 0 00 0 88
consensus : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTTTAAATACT-TA---GATTG-TTCATT--TT-AG-G-GT-A-T--GATAA-AAGC---A-AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-TC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--T-TATGGTATTTTTATT--A-NGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AA-T-A-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T--CC-T---AGAA-A--T-TGTCAA--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-TGAT-CC-TGCA--ATTTTTT
Reference ( family-673 ) : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTTTAAATACT-TA---GATTG-TTCATT--TT-AG-G-GT-A-T--GATAA-AAGC---A-AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-TC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--T-TATGGTATTTTTATT--A-NGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AA-T-A-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T--CC-T---AGAA-A--T-TGTCAA--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-TGAT-CC-TGCA--ATTTTTT
gi|131755 : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTTTAAATACT-TA---AATTG-TTCATT--TT-AG-G-GT-A-T--GATAA-AAGC---A-AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-TC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--A-TATGGTATTTTTATT--A-TGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACGA--C-AA-T-A-AC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T--CC-T---AGAA-A--T-TGTCAA--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-TGAT-CC-TGCA--ATTTTTT
gi|131756 : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TCGAAAAAAATT-GAG-TTAAATACT-TA---GATTGTTTCATT--TT-AG-G-GT-A-T--GATAA-AAGC---A-AAACA-A-TTA-GGG-GGTTG-TC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--T-TATGGTG--TTTATT--A--GT---CCCCTA-TCTG-TCA---AACGA--C-AA-T-AGTC-AGAAA-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T---C-T---AGAA-A--T-TGTC-A--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-TGAT-CC-TGCA--ATTTTTT
gi|131757 : TTAAGG-TAGGTCC--T-AC----TCTTGGACT-TAC-T-TTG-T--GATTTC--TC--AAAAAAAT-GAGTTTAAATACT-TA---GATTG-TTCATT--TT-AG-G-GT-A-T--GATAA-A-GC---A-AAA-A-A-TTA-GGG-GCTTG-TC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--T-TATGGTATTTTTATT--A-AGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AA-T-A-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T--CC-T---AGAA-A--T-TGTCAA--T--AT-TTTT--T-GT-T-TT--G-AGGT-----------A-TGAT-CC-AGCA--TTTTTTT
gi|131758 : TTAAGG-TAGGTCCC-T-ACCTACTCCTGAACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GATTTTAAATACT-TA---GATTG-TTCATT--TT-AG-G-GT-A-T--GATAA-AAGC---A-AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-TC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT---AA--T-TATGGTACTTTTATT--A-AGTGTA-CCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AA-T-A-TC-AGAA--TCA-T-TG-A-AGAAAG-T--CC-T---AGAA-A--T-GTTTAA--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-CGATCCC-TGCA--ATTTTT
gi|131759 : TTAAGG-TAGGTCCC-TTAC----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTTTAA-T-CT-TA---G-TTG-TTCATT--TT-AG-G-GT-A-T--GATAA-AAGC---A-AAA-A-A-TT--GGG-GCTTG-TC-AG-T--A-TTAA-ATGA--GT-A-AA--T-TATG-TATTTTTATT--A--GT-TACCCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AA-T-A-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T---C-T---AGAA-A--T-TGTAAA--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------ATTGAT--C-TGCA--ATTTTTT
gi|131760 : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TC-TGGACTCTTC-T-T-G-T--GATT-C--TC--AAAAA--T-GAGTTTAAATACT-TA---GAT-G-TTCATT--TT-AG-G-GT-A-T--GATAA-A-GC---A-AAA-A-A-ATA-GGG-GGTTGGTC-AG-T--AAT--A-ATGAA-GT-A-AA--TATATGGTATTTTTATT--G-TGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AAGGG--C-AA-T-A-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG--AG-T--CC-C---AGAA-A--T-TGTCAA--T--AA--TTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-TGAT-CC-TGCA--ATTTTTT
gi|131761 : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACC-TAT-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTTTAAATACT-TACGAGATTG-TTCATT--TG-AG-G-GT-A-T--GATAA-AAGC---C-AAA-A-A-TTA-GGG-G-TTG-GC-AG-TTTA-T--A-ATGAAAGT-A-AA--T-TATGGTATTTTTATT--A-CGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACAG--C-AA-T-A-TC-AGAAT-TCA-T-TGAA-AG-GAG-TCCCC-T---AGAA-A----TGTCCA--TA-AA-ATTT--T-G--T-TT--G-AGGA-----------A-TGAT-GC-TGCA--ATTTT
gi|131762 : TTAAGGGTAGGCC-----A-----TCC-GGACC-AAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTTTAAATACT-TA---GATTG-TTCATT--TG-AG-G-GT-A-T--GATAA-AAAC---A-AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-AC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--T-TATGGTATTTTTATT--A-TGTGTACCCCCA-TCAG-TCA---AACGG--C-AA-T-A-TC-AGAAC-TCA-T-TG-A-AG-GAG-T--CC-T---AGAG-T--A-TGTCCA--T--AA-ATTT--T-G--T-TT--G-ACGT-----------A-TGAC-GC-TGCA--ATTTTTT
gi|131763 : TTAAGG-TAGGTTCC-T-AC----TCCTGGAAC-TAC-C-T-G-T--GATT-C--TC--AAAAAATT-GAGTTTAAATATT-TA---GATTG-TTCATT--TG-AG-A-TT-A-A--GATAA-AAGC-----AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-TA-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--T-TAT-----------------GTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AA-A-A-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T--CC-T---AGAATA--T-T-TCCA--T--AA-ATTT--T-G--T-TT--A-TGGT-----------A-TGAT-GC-TGCA--ATTTTTT
gi|131764 : TTAAGG--AGGTC---T-AC------CTGGACT-TAC-T-T---T--GATCT---TC--AAAA-ATT-GAGTTTAAAT-CT-TA---GATT--TTCATTTCTT-AG-G-GT-A-TA-GAT-A-AAGC---A-AAA-A-A-TTA-GGGTGGTTG-CC--G-T--A----A-ATGA--GT-A-AA--TATATGGTATTTTTATT--A-AGTGTA-CCCCA-TCTG-T-----AACGG--C--A-T-A-TC-AG-AT-TCA-TCTG-AGAG-AAA----CT-T---AGAA-A--T-TGTCAA--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AG------------------T-CCTTGCA--ATTTTTT
gi|131765 : TCAAGG-TAG-TCCC-T-AC----TC---GACC-TAC-T-T-G----GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTT-AAATACT-TA---GATGT-TTCATT--CG-AG-G-GTTA-T------A-AAGC---A-AAT-A---TT----G-GGTT--TC-A--T--A-T--A-ATGA--GT-A-AT--T-TATGGTATTCTTATT--A--GTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AAC-G--C-AA-T-A-T--ACAAA-TCATT-TG-A-AG-AAG-T---C-T---A-AA-A--T-TGT-AA--T--AG--TTT--T-G--T-TT----AGGT-----------A-TTAT--C-TGCA--ATTTTT
gi|131766 : TTAAGG-TAGGTCCT-T-AC----TCCTGGACT-TAC-T-T-C-T--GATTT---------------------------CT-CA---TAT------ATT--TG-AG-G-AC-A-T--GATAA-TAGC---A-AAC-C-A-ATA-GGG---TTG-TC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--T-TATGGTATTTTTATT--A-CGTGTACCCCCA-TTTG-TCA---AACGG--C-AA-A-A-TC-AGAATATCA-T-TG-A-AG-AA-----CC-T---AGAA-C--A-TGTAAA--TA-AA-ATTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-CCAT-GC-TGCA--ATATT
gi|131767 : TCAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACC-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-
gi|131768 : TTAAGA-TAGATCCC-T-AC----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATT
gi|131769 : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACT-T
gi|131770 : TAAGG-TAGGCC-----------TCC-GGAC---AA-C-T-G-T--GAATTC---C--AAAAAATT-GAGTTAAAATACT-TA---GA-TG-GTCATT--TG-A--G-GT---T--GAAAACAAG------AAA-A-A-TTC-CGG-GGTTG-AC--C-T--A----A-ATGA---T-A-A------ATAGTA-TTTTATT--A-T-TGTA-CCCAA-TCAG-TAAAACAACGG--C-AA-T-A-TC-AGAAC-CCA-T-TG-A-AG-GAG-T---C-T---AGAG-T--A-TGCC-A--T--AA--ATT--T-G----TT--G-ACGT-------------CG----C-TGCA--ATTCTT
gi|131771 : AAGG-TAGGTCC--T-AT----CCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTT--CT--AAAAAATT-GAGTTTAAATACTGTA---GATTG-TTCATT--TT-AG-GTGT-A-T--GATAA-AAGCA--A-AAA-A-A-TTA-GGG-GG-TG-T--AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--T-T-TGGTATTTTTATT--A-TGTGTA-ACCCA-TCTG-TCAG--AACAG--C-AATT-ATTC-AGAAT-TCA-TGTG-A-AG-AAG-T--CC-----ATAA-A--T-TGTC-A--T--AA-TTTT--TCG--TGTT--G-AAGG-----------A-GAGT-CC-TGTA--ATTTTTT
gi|131772 : AAGG-TAGATCCC-T-AC----TCCTGGACC-TAC-T-T-G-T--GATTTC--CT--AAAAAAT---------GATGTT-TA---AAT------ACT-------------------------AGC---A-AAA-A-C-TTA-GTG-GGTTG-TC-AT-T--T-T--A-ATGA--GT-A-AA--G-TATGGTATTTTTATT--A-TGTGTA---CCA-TCTGTTTA---AACGG--C-AA-T---TC-AAATT-CCC-T-TG-A-AG-ACG-T--CC-T---AT-A-A--T-TGTAAA--T--
gi|131773 : AGC-TAGGTCCC-T--C----TCCTGGACC-TACAT-T-G-T--AATTTC--TC--AAAAT-TT-TAGTTTAAATACT-TA---GATTG-TTCATT--TTGAA-G-GT-A-T--GATAA-AAGC---A-AAACA-ATTTATGGG-GGTTG-TC-AG----A-T--ATATGA--GT-ATAAATT-TATGGTA--CATAT-------TGTA---CCA-------CA---AACGGACC-AA-TAA-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AA-----TC-T---ATAGTA--T-T-CCAA-----AA-ATTT--T-G--T-TT--G-A-AT-----------A-TGAT-GC-TGCA--ATTTTTTt
gi|131774 : AAG-TCGATCCC-T-CC----TCCC---CT-TCC-CCT-G-T--AAG--C--TC--AAAAAATT-TCCCTTAAATACG-GA---AATGG-TT---------AGTA-GT-A-T----TTA-AAGCTG-G-ATA-A-A-TCC-CTG-GGTTG-TCGAG-T----T--A-ATGA--GT-A-AA--T-TATGGTATTTTTATT--ATTGTGCAGCCCCA-TCT--TCA---AACAG--C-AA-T-A-TCAAGAAT-TCA-T-TG-A-AC-AAG-T--CC-T---AGAA-A--T-TGTGAAAGT--AT-TTTT--T-G--T-TT--GAAGGCATGAATTTTTGA-TGAT-CC-TGTT--ATTTTTT
gi|131775 : G-TAGGTCCCCT-A-----TCCTGAACT-TAC-T-T-G-TTTGATTTCCATC--AAAAAATTTGAGTTTAAATACT-TA---GAT-G-TTCATT--TT-AG-G-GT-A-TTTGATAA-AAGC---C-AAA-A-A-TTT-AGG-GGTTG-TC-AG-T--A-TT-A-ATGA--GT-A-AA--T-TATGGTGTTTTTATTTAA-GGTGTACCCCCAATCTG-TCA---AACGG--C-AA-T-A-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAGTT--CC-TTAGAGAA-AATT-TGTCAAATT--AATTTTT--T-G--T-TTTGA-AGGT-----------A-TGAT-CC-TGCA--ATTTTTT
gi|131776 : -T-AC----TCCTGGACC-TTT-T-C-G-T--GATTTC--TA--AAAAAAAA-GGTTTTAAATACT-TC---GATCG-TTCATT--TG-AG-G-GA-A-T--GATAA-ATGC---A-AAA-C-A-TTA-AGG-GATTG-TC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-G-AA--T-TATGGTATTTTTATA--G-TGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AA-T-A-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T--CC-T---AGAA-T--A-TGTCCA--T--AA-ATTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------T-TGAT-GG-TGCA--ATTT
gi|131777 : C----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAA
gi|131778 : ACT-TAC-T-T-GAT--GATTTC--TC--AAAAAATT-GGAGTTAAATACT-TA---GATTG-TTCATT--TT-AG-G-GT-ATT--GATAA-AAGTAAAA-AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-TC-AGTT--A-T--A-ATGA--GTAA-AA--T-TATGGTA-TTTTATTA-A-AGTGTACCCCCA-TCT--TCA---AACGG--CAAA-T-A-TC-AGTAT-TCA-T-TT-A-AG-AAG-T--CCTT---AGAA-A----TGTCAAT-T--AA-TTTTTCT-GTTT-TT--G-AGGT-----------A-CGAT--C-TGCA--ATTTTTT
gi|131779 : TCTAATTACT-C----GATAG-TTCGTT--TTGAG-G-GT-ATT--GCTGA-AA-C---A-AAA-T-A-TTA-GTG-AGATG-CC-TG-T--A-T--T-ATTA--GT-A-AA--T-CAGAGTATCTTTATG--A-AGTGTACCTCTA-TTTG-TCA---ATCAA--C-AG-T-A-TC-AGAGT-CCA-C-TG-
gi|131780 : TTGAACACT-CA---AACNN-NNNNNN--NN-NN-N-NN-N-N--NNNNN-NNNC---ACAAA-ACA-TTA-GTG-GGTTG-TC-TG-T--A-T--T-ATTA--GT-A-AA--T-CAGAGTATTTTTATG--A-AGTGTACCTCTA-TTTG-TCA---ATCAA--C-AG-T-A-TC-AGAGT-CCA-C-TG-A-
gi|131781 : -T-A-TC-AGAAT-TCA-C-TG-A-AG-AAA-T--CC-T---AGGA-A--TGTGTCCA--TAAAA-TTTT--T-G--T-TT--C-A-GT-----------A-TGAC-TG-TGCAACATTTTTT
blockSeqs : G C T CTAC C A C T A TT CA GA T G CGA T T TC TG T T T T TT C AAA C C C T T T G G T TT A TA T AA A T AT A T TA TT C A T AAC AC A T A G A A T C A G A T CCC T TAG T ATT A AG AA TT TC C TT G TG A ATGAATTTTTG T CC T AC
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . TG . . . T A . TG . C . . . . . . . . . T . A . . . A C A A C . . G . . . . T . . . G . . . . C . . T TG A AT A T . . T . . . . . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . A C . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . T A T A T . . . . . . . . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T C . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . T A . . T . . . . . . . . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . C C . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . T C . . T . . . . . . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T C . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . T C . . A . . . . . . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . A C . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . T C . . A . . . . . . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . C C . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A A . . A . . . . . . . . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T C . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . T A . . T . . . . . . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T G . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . T A . . A . . . . . . . . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T C . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . T A . . T . . . . . . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . G C . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A A . . A . . . . . . . . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T C . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . A A . . T . . . . . . . . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . A C . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . T A . . A . . . . . . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . A C . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . T C . . T . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . A . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . T A . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . N . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T C . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTTTAAATACT-TA---GATTG-TTCATT--TT-AG-G-GT-A-T--GATAA-AAGC---A-AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-TC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--T-TATGGTATTTTTATT--A-NGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AA-T-A-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T--CC-T---AGAA-A--T-TGTCAA--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-TGAT-CC-TGCA--ATTTTTT
finalCons : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTTTAAATACT-TA---GATTG-TTCATT--TT-AG-G-GT-A-T--GATAA-AAGC---A-AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-TC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--T-TATGGTATTTTTATT--A-NGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AA-T-A-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T--CC-T---AGAA-A--T-TGTCAA--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-TGAT-CC-TGCA--ATTTTTT
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 3333 1 1 1 1 1 22 22 22 1 1 333 4 1 22 44 1 1 1 3 44 1 777 1 3 1 1 1 1 1 1 1 22 1 44 1 44 1 1 22 3 1 44 99 4 1 1 555 22 1 1 1 3 1 1 1 3 1 1 1 1 222 1 333 3 5555 3 77 66 88 22 2 44 2 22 2 99999999999 2 99 2 22
lowQualScore : . . . .... . . . . . .. .. .. . . ... . . .. .. . . . . .. . ... . . . . . . . . . .. . .. . .. . . .. . . .. .. . . . ... .. . . . . . . . . . . . . ... . ... . .... . .. .. .. .. . .. . .. . ........... . .. . ..
lowQualScore : 9 8 8 7777 7 7 7 7 7 44 55 55 9 8 222 4 8 55 99 8 8 8 6 33 8 555 8 6 8 8 8 8 8 8 8 55 8 33 8 33 8 8 55 6 7 33 44 8 8 8 000 55 8 7 7 5 7 7 7 5 7 8 9 9 999 9 333 8 1111 7 11 44 22 88 0 88 0 88 0 55555555555 0 00 0 88
consensus : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTTTAAATACT-TA---GATTG-TTCATT--TT-AG-G-GT-A-T--GATAA-AAGC---A-AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-TC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--T-TATGGTATTTTTATT--A-NGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AA-T-A-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T--CC-T---AGAA-A--T-TGTCAA--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-TGAT-CC-TGCA--ATTTTTT
Reference ( family-673 ) : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTTTAAATACT-TA---GATTG-TTCATT--TT-AG-G-GT-A-T--GATAA-AAGC---A-AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-TC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--T-TATGGTATTTTTATT--A-NGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AA-T-A-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T--CC-T---AGAA-A--T-TGTCAA--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-TGAT-CC-TGCA--ATTTTTT
gi|131755 : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTTTAAATACT-TA---AATTG-TTCATT--TT-AG-G-GT-A-T--GATAA-AAGC---A-AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-TC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--A-TATGGTATTTTTATT--A-TGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACGA--C-AA-T-A-AC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T--CC-T---AGAA-A--T-TGTCAA--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-TGAT-CC-TGCA--ATTTTTT
gi|131756 : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TCGAAAAAAATT-GAG-TTAAATACT-TA---GATTGTTTCATT--TT-AG-G-GT-A-T--GATAA-AAGC---A-AAACA-A-TTA-GGG-GGTTG-TC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--T-TATGGTG--TTTATT--A--GT---CCCCTA-TCTG-TCA---AACGA--C-AA-T-AGTC-AGAAA-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T---C-T---AGAA-A--T-TGTC-A--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-TGAT-CC-TGCA--ATTTTTT
gi|131757 : TTAAGG-TAGGTCC--T-AC----TCTTGGACT-TAC-T-TTG-T--GATTTC--TC--AAAAAAAT-GAGTTTAAATACT-TA---GATTG-TTCATT--TT-AG-G-GT-A-T--GATAA-A-GC---A-AAA-A-A-TTA-GGG-GCTTG-TC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--T-TATGGTATTTTTATT--A-AGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AA-T-A-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T--CC-T---AGAA-A--T-TGTCAA--T--AT-TTTT--T-GT-T-TT--G-AGGT-----------A-TGAT-CC-AGCA--TTTTTTT
gi|131758 : TTAAGG-TAGGTCCC-T-ACCTACTCCTGAACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GATTTTAAATACT-TA---GATTG-TTCATT--TT-AG-G-GT-A-T--GATAA-AAGC---A-AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-TC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT---AA--T-TATGGTACTTTTATT--A-AGTGTA-CCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AA-T-A-TC-AGAA--TCA-T-TG-A-AGAAAG-T--CC-T---AGAA-A--T-GTTTAA--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-CGATCCC-TGCA--ATTTTT
gi|131759 : TTAAGG-TAGGTCCC-TTAC----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTTTAA-T-CT-TA---G-TTG-TTCATT--TT-AG-G-GT-A-T--GATAA-AAGC---A-AAA-A-A-TT--GGG-GCTTG-TC-AG-T--A-TTAA-ATGA--GT-A-AA--T-TATG-TATTTTTATT--A--GT-TACCCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AA-T-A-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T---C-T---AGAA-A--T-TGTAAA--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------ATTGAT--C-TGCA--ATTTTTT
gi|131760 : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TC-TGGACTCTTC-T-T-G-T--GATT-C--TC--AAAAA--T-GAGTTTAAATACT-TA---GAT-G-TTCATT--TT-AG-G-GT-A-T--GATAA-A-GC---A-AAA-A-A-ATA-GGG-GGTTGGTC-AG-T--AAT--A-ATGAA-GT-A-AA--TATATGGTATTTTTATT--G-TGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AAGGG--C-AA-T-A-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG--AG-T--CC-C---AGAA-A--T-TGTCAA--T--AA--TTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-TGAT-CC-TGCA--ATTTTTT
gi|131761 : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACC-TAT-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTTTAAATACT-TACGAGATTG-TTCATT--TG-AG-G-GT-A-T--GATAA-AAGC---C-AAA-A-A-TTA-GGG-G-TTG-GC-AG-TTTA-T--A-ATGAAAGT-A-AA--T-TATGGTATTTTTATT--A-CGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACAG--C-AA-T-A-TC-AGAAT-TCA-T-TGAA-AG-GAG-TCCCC-T---AGAA-A----TGTCCA--TA-AA-ATTT--T-G--T-TT--G-AGGA-----------A-TGAT-GC-TGCA--ATTTT
gi|131762 : TTAAGGGTAGGCC-----A-----TCC-GGACC-AAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTTTAAATACT-TA---GATTG-TTCATT--TG-AG-G-GT-A-T--GATAA-AAAC---A-AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-AC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--T-TATGGTATTTTTATT--A-TGTGTACCCCCA-TCAG-TCA---AACGG--C-AA-T-A-TC-AGAAC-TCA-T-TG-A-AG-GAG-T--CC-T---AGAG-T--A-TGTCCA--T--AA-ATTT--T-G--T-TT--G-ACGT-----------A-TGAC-GC-TGCA--ATTTTTT
gi|131763 : TTAAGG-TAGGTTCC-T-AC----TCCTGGAAC-TAC-C-T-G-T--GATT-C--TC--AAAAAATT-GAGTTTAAATATT-TA---GATTG-TTCATT--TG-AG-A-TT-A-A--GATAA-AAGC-----AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-TA-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--T-TAT-----------------GTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AA-A-A-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T--CC-T---AGAATA--T-T-TCCA--T--AA-ATTT--T-G--T-TT--A-TGGT-----------A-TGAT-GC-TGCA--ATTTTTT
gi|131764 : TTAAGG--AGGTC---T-AC------CTGGACT-TAC-T-T---T--GATCT---TC--AAAA-ATT-GAGTTTAAAT-CT-TA---GATT--TTCATTTCTT-AG-G-GT-A-TA-GAT-A-AAGC---A-AAA-A-A-TTA-GGGTGGTTG-CC--G-T--A----A-ATGA--GT-A-AA--TATATGGTATTTTTATT--A-AGTGTA-CCCCA-TCTG-T-----AACGG--C--A-T-A-TC-AG-AT-TCA-TCTG-AGAG-AAA----CT-T---AGAA-A--T-TGTCAA--T--AA-TTTT--T-G--T-TT--G-AG------------------T-CCTTGCA--ATTTTTT
gi|131765 : TCAAGG-TAG-TCCC-T-AC----TC---GACC-TAC-T-T-G----GATTTC--TC--AAAAAATT-GAGTT-AAATACT-TA---GATGT-TTCATT--CG-AG-G-GTTA-T------A-AAGC---A-AAT-A---TT----G-GGTT--TC-A--T--A-T--A-ATGA--GT-A-AT--T-TATGGTATTCTTATT--A--GTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AAC-G--C-AA-T-A-T--ACAAA-TCATT-TG-A-AG-AAG-T---C-T---A-AA-A--T-TGT-AA--T--AG--TTT--T-G--T-TT----AGGT-----------A-TTAT--C-TGCA--ATTTTT
gi|131766 : TTAAGG-TAGGTCCT-T-AC----TCCTGGACT-TAC-T-T-C-T--GATTT---------------------------CT-CA---TAT------ATT--TG-AG-G-AC-A-T--GATAA-TAGC---A-AAC-C-A-ATA-GGG---TTG-TC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--T-TATGGTATTTTTATT--A-CGTGTACCCCCA-TTTG-TCA---AACGG--C-AA-A-A-TC-AGAATATCA-T-TG-A-AG-AA-----CC-T---AGAA-C--A-TGTAAA--TA-AA-ATTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------A-CCAT-GC-TGCA--ATATT
gi|131767 : TCAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACC-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAAATT-
gi|131768 : TTAAGA-TAGATCCC-T-AC----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATT
gi|131769 : TTAAGG-TAGGTCCC-T-AC----TCCTGGACT-T
gi|131770 : TAAGG-TAGGCC-----------TCC-GGAC---AA-C-T-G-T--GAATTC---C--AAAAAATT-GAGTTAAAATACT-TA---GA-TG-GTCATT--TG-A--G-GT---T--GAAAACAAG------AAA-A-A-TTC-CGG-GGTTG-AC--C-T--A----A-ATGA---T-A-A------ATAGTA-TTTTATT--A-T-TGTA-CCCAA-TCAG-TAAAACAACGG--C-AA-T-A-TC-AGAAC-CCA-T-TG-A-AG-GAG-T---C-T---AGAG-T--A-TGCC-A--T--AA--ATT--T-G----TT--G-ACGT-------------CG----C-TGCA--ATTCTT
gi|131771 : AAGG-TAGGTCC--T-AT----CCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTT--CT--AAAAAATT-GAGTTTAAATACTGTA---GATTG-TTCATT--TT-AG-GTGT-A-T--GATAA-AAGCA--A-AAA-A-A-TTA-GGG-GG-TG-T--AG-T--A-T--A-ATGA--GT-A-AA--T-T-TGGTATTTTTATT--A-TGTGTA-ACCCA-TCTG-TCAG--AACAG--C-AATT-ATTC-AGAAT-TCA-TGTG-A-AG-AAG-T--CC-----ATAA-A--T-TGTC-A--T--AA-TTTT--TCG--TGTT--G-AAGG-----------A-GAGT-CC-TGTA--ATTTTTT
gi|131772 : AAGG-TAGATCCC-T-AC----TCCTGGACC-TAC-T-T-G-T--GATTTC--CT--AAAAAAT---------GATGTT-TA---AAT------ACT-------------------------AGC---A-AAA-A-C-TTA-GTG-GGTTG-TC-AT-T--T-T--A-ATGA--GT-A-AA--G-TATGGTATTTTTATT--A-TGTGTA---CCA-TCTGTTTA---AACGG--C-AA-T---TC-AAATT-CCC-T-TG-A-AG-ACG-T--CC-T---AT-A-A--T-TGTAAA--T--
gi|131773 : AGC-TAGGTCCC-T--C----TCCTGGACC-TACAT-T-G-T--AATTTC--TC--AAAAT-TT-TAGTTTAAATACT-TA---GATTG-TTCATT--TTGAA-G-GT-A-T--GATAA-AAGC---A-AAACA-ATTTATGGG-GGTTG-TC-AG----A-T--ATATGA--GT-ATAAATT-TATGGTA--CATAT-------TGTA---CCA-------CA---AACGGACC-AA-TAA-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AA-----TC-T---ATAGTA--T-T-CCAA-----AA-ATTT--T-G--T-TT--G-A-AT-----------A-TGAT-GC-TGCA--ATTTTTTt
gi|131774 : AAG-TCGATCCC-T-CC----TCCC---CT-TCC-CCT-G-T--AAG--C--TC--AAAAAATT-TCCCTTAAATACG-GA---AATGG-TT---------AGTA-GT-A-T----TTA-AAGCTG-G-ATA-A-A-TCC-CTG-GGTTG-TCGAG-T----T--A-ATGA--GT-A-AA--T-TATGGTATTTTTATT--ATTGTGCAGCCCCA-TCT--TCA---AACAG--C-AA-T-A-TCAAGAAT-TCA-T-TG-A-AC-AAG-T--CC-T---AGAA-A--T-TGTGAAAGT--AT-TTTT--T-G--T-TT--GAAGGCATGAATTTTTGA-TGAT-CC-TGTT--ATTTTTT
gi|131775 : G-TAGGTCCCCT-A-----TCCTGAACT-TAC-T-T-G-TTTGATTTCCATC--AAAAAATTTGAGTTTAAATACT-TA---GAT-G-TTCATT--TT-AG-G-GT-A-TTTGATAA-AAGC---C-AAA-A-A-TTT-AGG-GGTTG-TC-AG-T--A-TT-A-ATGA--GT-A-AA--T-TATGGTGTTTTTATTTAA-GGTGTACCCCCAATCTG-TCA---AACGG--C-AA-T-A-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAGTT--CC-TTAGAGAA-AATT-TGTCAAATT--AATTTTT--T-G--T-TTTGA-AGGT-----------A-TGAT-CC-TGCA--ATTTTTT
gi|131776 : -T-AC----TCCTGGACC-TTT-T-C-G-T--GATTTC--TA--AAAAAAAA-GGTTTTAAATACT-TC---GATCG-TTCATT--TG-AG-G-GA-A-T--GATAA-ATGC---A-AAA-C-A-TTA-AGG-GATTG-TC-AG-T--A-T--A-ATGA--GT-G-AA--T-TATGGTATTTTTATA--G-TGTGTACCCCCA-TCTG-TCA---AACGG--C-AA-T-A-TC-AGAAT-TCA-T-TG-A-AG-AAG-T--CC-T---AGAA-T--A-TGTCCA--T--AA-ATTT--T-G--T-TT--G-AGGT-----------T-TGAT-GG-TGCA--ATTT
gi|131777 : C----TCCTGGACT-TAC-T-T-G-T--GATTTC--TC--AAAAA
gi|131778 : ACT-TAC-T-T-GAT--GATTTC--TC--AAAAAATT-GGAGTTAAATACT-TA---GATTG-TTCATT--TT-AG-G-GT-ATT--GATAA-AAGTAAAA-AAA-A-A-TTA-GGG-GGTTG-TC-AGTT--A-T--A-ATGA--GTAA-AA--T-TATGGTA-TTTTATTA-A-AGTGTACCCCCA-TCT--TCA---AACGG--CAAA-T-A-TC-AGTAT-TCA-T-TT-A-AG-AAG-T--CCTT---AGAA-A----TGTCAAT-T--AA-TTTTTCT-GTTT-TT--G-AGGT-----------A-CGAT--C-TGCA--ATTTTTT
gi|131779 : TCTAATTACT-C----GATAG-TTCGTT--TTGAG-G-GT-ATT--GCTGA-AA-C---A-AAA-T-A-TTA-GTG-AGATG-CC-TG-T--A-T--T-ATTA--GT-A-AA--T-CAGAGTATCTTTATG--A-AGTGTACCTCTA-TTTG-TCA---ATCAA--C-AG-T-A-TC-AGAGT-CCA-C-TG-
gi|131780 : TTGAACACT-CA---AACNN-NNNNNN--NN-NN-N-NN-N-N--NNNNN-NNNC---ACAAA-ACA-TTA-GTG-GGTTG-TC-TG-T--A-T--T-ATTA--GT-A-AA--T-CAGAGTATTTTTATG--A-AGTGTACCTCTA-TTTG-TCA---ATCAA--C-AG-T-A-TC-AGAGT-CCA-C-TG-A-
gi|131781 : -T-A-TC-AGAAT-TCA-C-TG-A-AG-AAA-T--CC-T---AGGA-A--TGTGTCCA--TAAAA-TTTT--T-G--T-TT--C-A-GT-----------A-TGAC-TG-TGCAACATTTTTT