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lowQualScore                  :          11111111  6   66   3 3       6666666666666666666666666666666666  555555   2  33     88   2       6666  4  7777 2      5     3333  1   77  4444 1   1    3 222      22     2222222    22  33 22   1 22 2 33  2 555 2  2 2    3     3   88  6    44   3 00  3     44  3   999999  44  1 2222 3  11111111   55 3     222 3   55      3 3 666   99999       66   0000000  44 3 3 3  1111   6     3     3      9999 3 2222222      3       44      
lowQualScore                  :          ........  .   ..   . .       ..................................  ......   .  ..     ..   .       ....  .  .... .      .     ....  .   ..  .... .   .    . ...      ..     .......    ..  .. ..   . .. . ..  . ... .  . .    .     .   ..  .    ..   . ..  .     ..  .   ......  ..  . .... .  ........   .. .     ... .   ..      . . ...   .....       ..   .......  .. . . .  ....   .     .     .      .... . .......      .       ..      
lowQualScore                  :          22222222  2   55   1 1       4444444444444444444444444444444444  444444   9  99     44   4       9999  4  7777 2      2     7777  7   55  6666 6   6    2 888      33     2222222    44  22 44   7 33 2 77  9 000 9  9 9    1     1   33  2    22   3 00  3     66  3   666666  66  9 7777 6  11111111   00 6     444 6   00      6 6 444   11111       77   8888888  66 3 3 3  7777   7     3     3      7777 3 6666666      3       66      
consensus                     : AACAAACAA--------AA-TAAA-CTC-C-GAGATCT------------C---------C-----------GA------GAG-TG--TAACTC-GAA-TTTTCTC----CG-TCG-C-G-AGGTTAATGGAG----TG-ATC-GGA-GT-G-AGC-GGAA-T---ATAACG--ACTGGATT-AA-TTAT--TC-GG--GTT-A--C-A--CT-G---A-GT-G-TAAT-GCCGG-CCC-GTA-CACT--TGT-G-TAT-GATCC--TG-AAA------AA--TTCG----T-AC----T---TAC--C-GGCCC--NT-ATA--GATATC-G-A---TCT-----TTCCGGT-AAGG-------AA--A-T-C-AT----ACC-AAAAG-TTTTC-AAATTC--T-A-A-T-T---TTTCGA-CACTTTT--GCAAAA
Reference ( gi|7452 )         : AACAAACAA--------AA-TAAA-CTC-C-GAGATCT------------C---------T-----------GA------GAG-TG--TAACTT-GAA-TTTTCTC----CG-TCG-T-G-AGGTTAATGGAG----TG-ATC-AGA-AT-G-AGC-GGAA-T---ATAACG--ACTGGATT-AA-TTAT--TC-GG--GTT-A--C-A--CT-G---A-GT-G-TAAT-GCCGG-CCC-ATA-CACT--TGT-G-CAT-GATCC--TG-AAA------AA--TTTG----T-AC----T---TAC--C-GGCCC--AT-ATACTAATATC-G-A---TCT-----TTCCGGT-GAGG-------AA--A-T-C-AT----ACC-AAAAG-TTTTC-AAATTC--T-A-A-T-T---TTTCGA-CACTTTT--GCAAAA
gi|7448                       : AACAAACAA--------AA-TAAG-CTC-C-GAGATCT------------C---------CAGAAGATCTCCGA------GAG-TG--TAACTG-GAAATTTTCTC----CG-TCG-C-G-AG-TTA-TGGAG----TG-ATC-GGA-AT-G-AGC-GGAA-T---ATAACG--ACTGGATT-AA-TTAT--TC-GG--GTT-A--C-A--CT-G---A-GT-G-T-AT-ACCGG-CCC-GTA-CACT--TGT-G-TATGGATCC--TG-AAA------AA--TTCG----T-AC----TC--TAC--T-GGCCC--TT-ATA--GATATC-G-A---TCT-----TTCCGGT-AAGG-------AA--A-T-C-AT----ACC-AAAAG-TTT---AAATT---T-A-A-T-T---TTTCGA-CACTTTT--GCAAAA
gi|7449                       : AACAAACAA--------AA-TAAA-CTC-C-GAGATCT------------C---------CAGAGATCTCC-GA------GAG-TG--TAACTC-GAA-TTTTCTC----CG-TCA-C-G-AGGTTA-TGGAG----TG-ATC-GGA-AT-G-AGC-GAAA-T---ATAGTG--ACTGGATT-A--TTAT--TC-GG--GTT-A----A--CTTG---A-GT-G-TAAT-ACCGG-CC--GTA-CACT--TGT-G-TAT-GATCC--TG-AAA------AA--TCT-----T-AC----T---TAC--C-GGCCC--CTTATA--GATATC-G-A---TCT-----TTCCGGT-AAGG-------AA--A-T-C-AT----ACC-AAAAG-TTTTC-AAATTC--A-A-A-T-T---TTTCGA-CACTTTG--CCAAAA
gi|7450                       : AACAAACAA--------AAATAAA-CTC-C-GAGATCT------------C---------CAGAGATTCTCCGA------GAG-TG--TAACTTAGAA-TTTTCTC----TG-TCG-C-G-AGGTT-ATGTAG----TG-ATC-GGA-AT-G-AGC-GAAA-T---ATAGCG--ACTGGATT-AA-TTAT--TC--G--GTT-A--C-A--CT-G---A-GT-GTTAAT-ACCGGCCCC-GTA-CACT--TGTGG-TAT-GATCC--TG-AAA------AATGTTCG----T-AC----T---TAC--T-GGCCC--TT-ATA--GATATC-GAA---TCT-----TTCC-GT-AAGG-------AA--A-T-C-AT----ACCAAAAAG-TTTTC-AAATTC--A-A-A-T-T---TTTCGA-CACTTTT--GCAAA
gi|7456                       : AACAAACAA--------AA-TAA--CTC-C-GAGATCT------------C---------C-----------GA------GAG-TG--TAGTGC-GAA-TTTTCTC----CA-TCG-C-G-AG-TAAATGG-G----TG-ATC-GGA-GT-G-AGC-GGAA-T---ATAAAG--ACTGGATT-A-----T--TC-GG--GTT-A--C-A---T-A---A-GT-G-TAAT-GCCGG-CCC-ATA--ACT--TGT-G-TAT-GATCC--TG-GAA------AA--TTCG----T-ACAAGTT---TAC--C-GGCCC--TT-ATA--AATATT-G-A---TCT-----TTCCAGT-AAGG-------AA--A-T-C-AT----ACC-AAAAG-TTTTC-AAATTC--A-A-A-T-T---TTTCAA-CACTTTA--GCAAAA
gi|7457                       : AACTAACAA--------AA-TAAA-CTC-CCGAGATCT------------C---------TAGAGCTTAGA-GATCTCC-GAG-TG--TTACTC-GAA-TTTTTTC----CA-CCA-C-G-AGGTAAATGGAG----TG-ATC-GGA-GT-G-AGC-AGAA-T---ATAATG--ATTGGATT-A-----T--TC---------A--C-A--AT-G---A-GT-G-TAAT-GCCGG-CCC-GTA-CACT--TGT-G-TAT-AATCC--TG-GAA------AA--TTCG----T-AC----T---TACCGC-GGCCC--TT-ATA--AATATC-G-A---TCT-----TTCTGGT-AAGG-------AA--A-T-C-TT----ACC-AAAAG-TTTTC-AAGTTC--T-A-A-T-T---TTTCGA-CACTTTT--GCAAAA
gi|7454                       : AACAAACAA--------AA-TAAA-CTC-C-GAGATCT------------CAGAGATCTCC-----------GA------GAG-TG--TAACTC-GA---TTTCTC----CGGTCG-C-G-AGGTTA-TGGAG----TG--TC-GGA-AT-G-AGC-GGAA-T---ATAACG--ACTGGATT-AA-TTAT--TC--G--GTT-A--C-A--CT-G---A-GT-G--AAT-ACCGG-CCT-CGA-CACT--TGT-G-TAT-GATCCTTTG-AAA------AT--TTCG----T-AT----T---TA---C-GGCCC--TT-ATAGAGATATC-G-A---TCT-----TTCCGGTAAAGG-------AA--ATT-C-AA----GCC-AAAAG-TTTTC-AAATTC--A-A-ATT-T---TTTCGACCCCTTTT--GCCAAA
gi|7453                       : AACAAACAATATTCAAAAA-TAAA-GTC-C-GAGATCT------------C---------T-----------GA------GAGATGACTAACTT-GAA-TTTTCTCG---CG-TCG-T-G-AGGTAATTGGAG----TGCATC-AGA-ATGG-AGCGGGAA-T---ATAACGCAACTGGATT-AATTTAT--TC-AGGTGTT-A--C-A--CT-G---A-GT-G-TAATCGCCGG-CCCGATATCACTTGTGT-G-CAT--ATCC--TGAAAA------AA--TTTG----T-AC----A---TAC--C-GGCCC--AT--CACTAATATC-G-ACCCTCTTCTTCTTCCGGT-GAGG-------AA--A-TGC-AT----TCC-AAAAG-TTTTCAAAATTC--T-ATACT-T---TTTCGA-TCCTTTTTGGCAAA
gi|7455                       : AACAAACAA--------AAATAAAACTC-C-GAGATCT------------CCAGAGACTCT-----------GA------GAG-TG--TAACTG-GAA-TTTTCTC----CG-TCGCC-G-AGGT--ATGGAG----TG-ATC--GA-AT---AGC-GGAAGTTTAATAACG--AC-GGATT-AA-TTAT--TC-GG--TTT-A--C-A--CT-G---AGGT-G-GAAT-ACC-G-CCC-GTA--ACT--TGT-G-TAT-GAT-C--TG-AAA------A----TTGCCCAT-AC----T---TAC--T-GGCCC--TT-ATA--GATATC-G-A---TCT-----TTCCGGT-AAGG-------AA--A-T-C-AT----ACCAAAAAG---TTC-AAATTT--T-A-A-T-T---TTTCAC-CACTTTT--GCAAA
gi|7459                       : AACAAACAA--------AA-TAA------------TCA------------C---------C-----------GA------GAG-T---TAACTC-GAA-TTTTCTC----CG-TCG-CAG-AAGTTAATGGA-----TG-ATC-GGA-AT-G-AGC-G-AA-T---ATAATG--AC-GGATT-AA-T-AT--TC-G----TT-A--CCA--CT-G---A-GT-G-TAAT-GCTG--CCC-GTA-CACT--TGT-G-TAT-ATTCC--TG-AAA------AA--TTCG----T-AC----TAAATAC--CTGGCCT--AT-G----AATATCCG-A---TCT-----TTC-GGT-AAGT-------AA--A-T-C-AG----ACC-AAAAG-TTTTC-AAA-TC--A-A-A--------TTCGA-CACTTTT--GCAAAA
gi|7458                       : AACAAA-AA--------AA-TAAA-CTC-A-GAGATCT------------C---------CAGA--------GATCTCCGGAG-TG--TAACTG-GAA-TTTTCTC----CG-TCG-C-C-GGGTTA-TGGAG----TG-ATC-GGA-AT-G-AGC-CGAA-T---ATAACG--ACTGGATT-AC-TTAT--TCGGG--GTT-AATC-A--CT-G---A-GT-G-TAAT-ACCGG-CCC-GTA-CACT--TGT-GTCAT-GATCC--TC-GAATTTGATAA--TTCGCT--T-AC----T---TGA--C-TGCCCTTAT-ATACGACT-TC--------CT-----TCCCGGT-AAGG-------TACGA-T-CTATTC--AGT-AAATG-GTTTC-AAATTT--TCA-A-T-TTC-TTTCTT-AACTTTT--GCAAAA
gi|7460                       : AACAAACAA--------AA-TAAA-CTC-C-GAGA-CT------------C---------C-----------GA------GAG-TG--TAACTC-GAA-ATTTCTC----CG-TCG-C-G-GGGTTA-TGGAA----TG-ATC-GGA-AA-G-AGC-GGAA-T---ATAACG--ACTGGA
gi|7451                       : AACAAACAA--------AA-TAAA-CTC-C-GAGATCT------------C---------C-----------GA------GAG-TG--TAACTA-GAA-TTTTCTC----TG-TCG-C-G-AGGTT-ATGGAT----TG-ATC-GGA-AT-G-AGC-GAAA-T---ATAGC
gi|7461                       :         A--------AA-TAA--CTCTC-GAGATCCAGATCGATCCTAC---------T-----------GA------GAG-TG--TAACTT-CGA-TTTTCTCTTCTCGATCG-C-G-A-GTTATTGGAG----TG-ATC-GGAGAT-GTAGC-GAAA-T---ATGTCG--AC-GGA-T-AA-TTAT--TC-AG--GTTCA--C-A--CT-GATTA-GTCG-TAAT-AC--G-CCG-TTACCACT--TGT-GTTAT-GATCC--TA-AAA-----------TCG----TGAC----T---GAC--C-GG-CC--AC-TTACAGATATC-G-A---TAC-----TTGTTGT-GAGGAAGGGATAA--A-T-C-ATCAAGACC-AAGAGTTTTTC-AAA-TCAAT-A-A-TATTTATTTCGA--ACTTTT--
gi|7463                       :                                   ATCT------------C---------C-----------GA------GAG-TG--TAACTC-AGA-TTTTCTC----CG-TCG-C-A-AGGTTAATGGAG----TG-GTC-AAA-AT-G-AGC-GGGA-T---ATAAAG--ACTGGATCAAA-TTAT--TC-GG--GTT-A--C-A--C
gi|7464                       :                                                                                                   -TTTTCTC----CG-AC--T-G-TAGTTAATGTAG----TG-ATC-GGA-GA-G-AGC-GGAA-T---ATAACG--ACTGG-----A-TTAT--TC-GG--GTT-A--
gi|7465                       :                                                           gagattgtaactcgaataattcaagccctcccgtctccgg-TTCTCTC----CG-AC--T-GTAGGTTAATGTAGCACTTG-ATC-GGA-GA-G-AGC-GGAA-T---ATAACG--ACTGG-----A-TTAT--TC-GG--GTT-A--
gi|7466                       :                                                                                             ctccgg-TTCTCTC----CG-ACT-T-T--GGTTAATGTAG----CG-ATCGATA-GG-G-AGC-GGAA-T---ATAACG--ACTGG-----A-TTAT--TC-GG--GTT-A--
gi|7462                       :                                                                                                ctccggTTCTC----CG-T------------AGTGGA--------ATC-GGA-GC-A-CGC-GGAAAT---ATAACG--ATTGGAT-----TTAT--AT-AG--GTT-A--C-
gi|7469                       :                                                                        cggagatctcagattgggtaactccgaataattccaagccccccaccatctcggTAATGTAG----TG-ATC-AGA-GA-G-AGC-GGAA-T---ATAACG--ACTGG-----A-TTAT--TC-GG--GTT-A--C-
gi|7470                       :                                                                                                                               gATGTAG----TG-ATCGATA-GG-G-AGC-GGAA-T---ATAACG--ACTG-----AA-TTAT--TC-GG--GTT-A--cgatggtccggctcgt
gi|7471                       :                                                                                                                                ATGTAG----TG-ATCGATA-GG-G-AGC-GGAA-T---ATAACG--ACTG-----AA-TTAT--TC--G--GTT-A--
gi|7468                       :                                                                                                                                ACGAAG----CG-ATC-AAA-A-----GC-GGAA-T---ATAACG--GCTGG-----A-GTAT--TC-GG--GTT-A--
gi|7467                       :                                                                                                                         tcaccgacttGAG----CG-AT--AGG----G-AGC-GGAA-T---ATAACG--ACTGGATT--A-TTGTCATT-GG--GTC-A--A-ATGCT-G---T-GT-G-
gi|7472                       :                                                                                                                             tctccggttctctccgacttgtA-GT-G-AGC-GGAA-T---ATAACA--ACTGG-----A-TTAT--TC-GG--GTT-A--C-
gi|7473                       :                                                                                                                                     agtgagcggaaattaacaat-AGC-GGAA-T---ATAACG--ACTGGATT-AA-TTAC--TC-AA--TTT-A--C-A--CT-G---A-GT-G-TAAT-GCCGG-CCC-GTA-CATT--
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Reference ( family-670 )      : AACAAACAA--------AA-TAAA-CTC-C------------------GAGATC--------TC-----------C---------GA------GAG-TG--TAACTC-GAA-T--TTTC---TC----CG-TCGC-GA----GGTT------AATGGAG----TG-ATCGG-AG-T-G-AGC-GGAA---TA-TAACG--ACTGGATT-AA-TTAT--TC-GG--GTT-A--C-A--CT-G---A-GT-G-TAAT-GCCGG-CC-CG-TA-CACTTGT-G-T--AT-GATCC--TG-AAA------AA--TT---CG--T-AC----T---TACC-G--G-CC-CNT-AT--A--GATAT-CG-A---T-CT-----TTCCG---GT-AAGG---AA--A-T-C-AT----ACC-AAAAG-TTTTC-AAATTC--T-A-A-T-T---TTTCGA-CACTTTT--GCAAAA
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Reference ( family-670 )      : AACAAACAA--------AA-TAAA-CTC-C------------------GAGATC--------TC-----------C-----------GA------GAG-TG--TAACTC-GAA-T--TTTC---TC----CG-TCGC-GA----GGTT------AATGGAG----TG-ATCGG-AG-T-G-AGC-GGAA---TA-TAACG--ACTGGATT-AA-TTAT--TC-GG--GTT-A--C-A--CT-G---A-GT-GT-AAT-GCCGGCC-C-G-TA-CACTTGTG-T--AT-GATCC--TG-AAA------AAT--T---CG--T-AC----T---TACC-G--G-CC-C-TTAT--A--GATAT-CG-A---T-CT-----TTCCG---GT-AAGG---AA--A-T-C-AT----ACC-AAAAG-TTTTC-AAATTC--T-A-A-T-T---TTTCGA-CACTTTT--GCAAAA
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Reference ( family-670 )      : AACAAACAA--------AA-TAAA-CTC-C------------------GAGATC--------TC-----------C-----------GA------GAG-TG--TAACTC-GAA-T--TTTC---TC----CG-TCGC-GA----GGTT------AATGGAG----TG-ATCGG-AG-T-G-AGC-GGAA---TA-TAACG--ACTGGATT-AA-TTAT--TC-GG--GTT-A--C-A--CT-G---A-GT-GT-AAT-GCCGGCC-C-G-TA-CACTTGTG-T--AT-GATCC--TG-AAA------AAT--T---CG--T-AC----T---TACC-G--G-CC-C-TTAT--A--GATAT-CG-A---T-CT-----TTCCG---GT-AAGG---AA--A-T-C-AT----ACC-AAAAG-TTTTC-AAATTC--T-A-A-T-T---TTTCGA-CACTTTT--GCAAAA
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gi|7458                       : AACAAA-AA--------AA-TAAA-CTC-A------------------GAGATC--------TC-----------CAGA--------GATCTCCGGAG-TG--TAACTG-GAA-T--TTTC---TC----CG-TCGC-CG----GGTT------A-TGGAG----TG-ATCGG-AA-T-G-AGC-CGAA---TA-TAACG--ACTGGATT-AC-TTAT--TCGGG--GTT-AATC-A--CT-G---A-GT-GT-AAT-ACCGGCC-C-G-TA-CACTTGTG-TC-AT-GATCC--TC-GAATTTGATAAT--T---CGCTT-AC----T---TGAC-T--G-CC-C-TTAT------ATA--CG-ACTTC-CT-----TCCCG---GT-AAGG---TACGA-T-CTATTC--AGT-AAATG-GTTTC-AAATTT--TCA-A-T-TTC-TTTCTT-AACTTTT--GCAAAA
gi|7459                       : AACAAACAA--------AA-TAA-----------------------------TC--------AC-----------C-----------GA------GAG-T---TAACTC-GAA-T--TTTC---TC----CG-TCGCAGA----AGTT------AATGGA-----TG-ATCGG-AA-T-G-AGC-G-AA---TA-TAATG--AC-GGATT-AA-T-AT--TC-G----TT-A--CCA--CT-G---A-GT-GT-AAT-GCTG-CC-C-G-TA-CACTTGTG-T--AT-ATTCC--TG-AAA------AAT--T---CG--T-AC----TAAATACCTG--G-CC----TAT--G--AATATCCG-A---T-CT-----TT-CG---GT-AAGT---AA--A-T-C-AG----ACC-AAAAG-TTTTC-AAA-TC--A-A-A--------TTCGA-CACTTTT--GCAAAA
gi|7460                       : AACAAACAA--------AA-TAAA-CTC-C------------------GAGA-C--------TC-----------C-----------GA------GAG-TG--TAACTC-GAA-A--TTTC---TC----CG-TCGC-GG----GGTT-------ATGGAA----TG-ATCGG-AA-A-G-AGC-GGAA---TA-TAACG--ACTGGA
gi|7461                       :         A--------AA-TAA--CTCTC------------------GAGATCCAGATCGATC-----------CTACT-------GA------GAG-TG--TAACTT-CGA-T--TTTC---TCTTCTCGATCGC-GA-----GTT------ATTGGAG----TG-ATCGG-AGAT-GTAGC-GAAA---TA-TGTCG--AC-GGA-T-AA-TTAT--TC-AG--GTTCA--C-A--CT-GATTA-GTCGT-AAT-AC--GCC-G-T-TACCACTTGTGTT--AT-GATCC--TA-AAA-----------T---CG--TGAC----T---GACC-G--G-CCAC-TTAC--A--GATAT-CG-A---TACT-----TGTTGTGAGG-AAGGGATAA--A-T-C-ATCAAGACC-AAGAGTTTTTC-AAA-TCAAT-A-A-TATTTATTTCGA--ACTTTT--
gi|7462                       :                               ------------------GAGATC--------TC-----------A-----------GA------TTG-GG--TAACTCCGAA-TAATTCCAAGCC----CC-CCAC-CATCTCGGTTCTCCGTAGTGGA--------ATCGG-AG-C-A-CGC-GGAAA--TA-TAACG--ATTGGAT-----TTAT--AT-AG--GTT-A--C-
gi|7463                       :                                                  cgATC--------TC-----------C-----------GA------GAG-TG--TAACTC-AGA-T--TTTC---TC----CG-TCGC-AA----GGTT------AATGGAG----TG-GTCAA-AA-T-G-AGC-GGGA---TA-TAAAG--ACTGGATCAAA-TTAT--TC-GG--GTT-A--C-A--C
gi|7464                       :                                                                                                           CTC-CGG-T--TTTC---TC----CG-AC-T-GT----AGTT------AATGTAG----TG-ATCGG-AG-A-G-AGC-GGAA---TA-TAACG--ACTGG-----A-TTAT--TC-GG--GTT-A--
gi|7465                       :                                                                         gagattgtaactcgaataattcaagccctcccgtCTC-CGG-T--TCTC---TC----CG-ACTG-TA----GGTT------AATGTAGCACTTG-ATCGG-AG-A-G-AGC-GGAA---TA-TAACG--ACTGG-----A-TTAT--TC-GG--GTT-A--
gi|7466                       :                                                                                                           CTC-CGG-T--TCTC---TC----CG-ACTT-T-----GGTT------AATGTAG----CG-ATCGATAG-G-G-AGC-GGAA---TA-TAACG--ACTGG-----A-TTAT--TC-GG--GTT-A--
gi|7467                       :                                                                                                                                                               GAG----CG-ATAGG------G-AGC-GGAA---TA-TAACG--ACTGGATT--A-TTGTCATT-GG--GTC-A--A-ATGCT-G---T-GT-G
gi|7468                       :                                                                                                                                      tctccggttctctccgacttgtACGAAG----CG-ATCAA-A------AGC-GGAA---TA-TAACG--GCTGG-----A-GTAT--TC-GG--GTT-A--
gi|7469                       :                                                                                                                                          tcaccgacttT------AATGTAG----TG-ATCAG-AG-A-G-AGC-GGAA---TA-TAACG--ACTGG-----A-TTAT--TC-GG--GTT------A--CC-G---A-TG-GT------CCGGCT-C-G-T
gi|7470                       :                                                                                                                                                           gATGTAG----TG-ATCGATAG-G-G-AGC-GGAA---TA-TAACG--ACTG-----AA-TTAT--TC-GG--GTT-A--
gi|7471                       :                                                                                                                                                            ATGTAG----TG-ATCGATAG-G-G-AGC-GGAA---TA-TAACG--ACTG-----AA-TTAT--TC--G--GTT-A--
gi|7472                       :                                                                                                                                                                              -AG-T-G-AGC-GGAA---TA-TAACA--ACTGG-----A-TTAT--TC-GG--GTT-A--C-
gi|7473                       :                                                                                                                                                                 agtgagcggaaattaacaat-AGC-GGAA---TA-TAACG--ACTGGATT-AA-TTAC--TC-AA--TTT-A--C-A--CT-G---A-GT-GT-AAT-GCCGGCC-C-G-TA-CATT
gi|7474                       :                                                                                                                                                                                                                                      T-A--C-A--CT-G---A-GT-GT-AAT-GCCGTCC-C-G-TA-CACTTGTG-T--AT-GATCC--TG-AGA------AA
gi|7475                       :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    T-AAGG---AA--A-T-C-AT----ATC-AAAAG-TTTTC-AAATTC--T-A-A---T---TTTCGA-CACTTTT--GCAAA


blockSeqs                     :          TATTCAAA  A   AA   T CGAGATCTCTAGAGCTTA      CAGATCGA  CAGAGATTCTCC             TCTCCG   A  AC      A   . AA    AAG  TTCT  G    C  TCTC    CTCCGTAG     CACT  C     T ATG  T   G    GTT  A     CA     ATTAAT     CA  G  GT   C AT C TG  T ATT G  C  T   C       T C A  T        G GC  .     TT  A   TTTGAT   GT GCC  CT G  AAGTT       T CG C  A A    ACT       C  A CCC A  TCTTC     TGA  A    GAT  CG T G T  CAAG   A     T     A      AAT  T TATTTA       C       TG
blockSeqs                     :          .         A   A    . .                       .         CAGAGATCTCC              .        .  .       C   . .     .    G     A    A  .       AA           .     .     T GAT  .   .    A    .     .      ATCAAA     .   .  .    . .  . .   . .   .  .  .   .       . . .  C        T C   .     .   .   .        .  .    .  .  TAAA        . .  .  . .    AGA       .  . CTT .  .         .    .    .    .  . . .  TC     A     .     .      TC   . TTTC         .       . 
blockSeqs                     :          .         .   A    . .                       .         AGAGATCTCC               .        .  .       .   . .     .    .     .    .  .       AT           .     .     T AT   .   .    .    .     .      ATTAA      .   .  .    . .  . .   . .   .  .  .   .       . . .  .        . .   .     .   .   .        .  .    .  .  T           . .  .  . .    A         .  . .   .  .         .    .    .    .  . . .  .      .     .     .      A    . CTT          .       . 
blockSeqs                     :          .         .   A    . .                       .         CAGAGACTCT               .        .  .       .   . .     .    .     .    .  .       AA           .     .     . AT   .   .    .    .     .      ATTAA      .   .  .    . .  . .   . .   .  .  .   .       . . .  .        . .   .     .   .   .        .  .    .  .  T           . .  .  . .    A         .  . .   .  .         .    .    .    .  . . .  .      .     .     .      A    . TTT          .       . 
blockSeqs                     :          .         .   A    . .                       .         CTACT                    .        .  .       .   . .     .    .     .    .  .       AA           .     .     . AT   .   .    .    .     .      ATTAA      .   .  .    . .  . .   . .   .  .  .   .       . . .  .        . .   .     .   .   .        .  .    .  .  T           . .  .  . .    T         .  . .   .  .         .    .    .    .  . . .  .      .     .     .      T    . TT           .       . 
blockSeqs                     :          .         .   A    . .                       .         CAGA                     .        .  .       .   . .     .    .     .    .  .       AA           .     .     . AT   .   .    .    .     .      ATTAA      .   .  .    . .  . .   . .   .  .  .   .       . . .  .        . .   .     .   .   .        .  .    .  .  A           . .  .  . .    A         .  . .   .  .         .    .    .    .  . . .  .      .     .     .      T    . TT           .       . 
blockSeqs                     :          .         .   A    . .                       .         C                        .        .  .       .   . .     .    .     .    .  .       AT           .     .     . AT   .   .    .    .     .      ATTAC      .   .  .    . .  . .   . .   .  .  .   .       . . .  .        . .   .     .   .   .        .  .    .  .  T           . .  .  . .    A         .  . .   .  .         .    .    .    .  . . .  .      .     .     .      A    . TT           .       . 
blockSeqs                     :          .         .   A    . .                       .         T                        .        .  .       .   . .     .    .     .    .  .       AA           .     .     . GT   .   .    .    .     .      ATTAA      .   .  .    . .  . .   . .   .  .  .   .       . . .  .        . .   .     .   .   .        .  .    .  .  T           . .  .  . .    A         .  . .   .  .         .    .    .    .  . . .  .      .     .     .      T    . TT           .       . 
blockSeqs                     :          .         .   A    . .                       .         T                        .        .  .       .   . .     .    .     .    .  .       AA           .     .     . GT   .   .    .    .     .      ATTAA      .   .  .    . .  . .   . .   .  .  .   .       . . .  .        . .   .     .   .   .        .  .    .  .  T           . .  .  . .    G         .  . .   .  .         .    .    .    .  . . .  .      .     .     .      A    . TT           .       . 
blockSeqs                     :          .         .   A    . .                       .         C                        .        .  .       .   . .     .    .     .    .  .       AA           .     .     . AT   .   .    .    .     .      ATTA       .   .  .    . .  . .   . .   .  .  .   .       . . .  .        . .   .     .   .   .        .  .    .  .  T           . .  .  . .    A         .  . .   .  .         .    .    .    .  . . .  .      .     .     .      T    . TT           .       . 
blockSeqs                     :          .         .   .    . .                       .         C                        .        .  .       .   . .     .    .     .    .  .       AA           .     .     . AT   .   .    .    .     .      ATTA       .   .  .    . .  . .   . .   .  .  .   .       . . .  .        . .   .     .   .   .        .  .    .  .  T           . .  .  . .    .         .  . .   .  .         .    .    .    .  . . .  .      .     .     .      A    . T            .       . 
blockSeqs                     :          .         .   .    . .                       .         C                        .        .  .       .   . .     .    .     .    .  .       AA           .     .     . AA   .   .    .    .     .      ATTA       .   .  .    . .  . .   . .   .  .  .   .       . . .  .        . .   .     .   .   .                                                                                      .    .    .  . . .  .      .     .     .      T    . .            .       . 
blockSeqs                     :          .         .   .    . .                       .         C                        .        .  .       .   . .     .    .     .    .  .       A            .     .     . GC   .   .    .    .     .      ATAA       .   .  .    . .  . .   . .   .  .  .   .       . . .  .                                                                                                                                                                                               
blockSeqs                     :                               .                       .         A                        .        .  .       .   . .     .    .     .    .  .       A            .     .     . AT   .   .    .    .     .      ATTA       .   .  .    . .  . .   . .   .  .  .   .       . . .                                                                                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                                       .         C                        .        .  .       .   . .     .    .     .    .  .       A            .     .     . GA   .   .    .    .     .      AT         .   .  .    . .  . .   . .   .  .                                                                                                                                                                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                              .   . .     .    .     .    .  .       A            .     .     . GA   .   .    .    .     .      AA         .   .  .    . .  . .                                                                                                                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                              .   . .     .    .     .    .  .       A            .     .     . GG   .   .    .    .     .      AA         .   .  .    . .  .                                                                                                                                                                                                                                    
blockSeqs                     :                                                                                                              .   . .     .    .     .    .  .       A            .     .     . GA   .   .    .    .     .      A          .   .  .    . .  .                                                                                                                                                                                                                                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                     A            .     .     . GG   .   .    .    .     .      A          .   .  .    . .                                                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                  .     .     . GG   .   .    .    .     .      A          .   .  .    . .                                                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                  .     .     . GT   .   .    .    .     .      A          .   .  .    . .                                                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                  .     .     . T    .   .    .    .     .      A          .   .  .    . .                                                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                  .     .     . .    .   .    .    .     .      A          .   .  .    . .                                                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                              . .    .   .    .    .     .                             . .                                                                                                                                                                                                                                       
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blockSeqCons                  :                                                                 C**********************                                                             AA******                                                                                                                                                                        T*******
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