lowQualScore : 111111
lowQualScore : 000 1 99 1 1 000 00 0 1 0 00 0 77 11 0 0 777777 222 000 0 11 1111 00 00 0 0 000 0 000 0 0 0 0 0 0
lowQualScore : ... . .. . . ... .. . . . .. . .. .. . . ...... ... ... . .. .... .. .. . . ... . ... . . . . . .
lowQualScore : 999 1 00 1 0 999 77 5 0 4 66 4 00 00 4 4 777777 444 777 4 00 3333 66 66 4 4 777 4 777 4 4 4 4 4 4
consensus : TGACTA---T-TGN-C-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--AA--GAC--A---CGG-CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
Reference ( gi|24237 ) : TGACTA---T-TGA-C-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAG-CAA--G-ATA-G--TG--GAC--A---CAG-CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24236 : TGGCTA---T-TGC-CCT-A---AA--A-T-TC-T--TGT-TAA-CAA--G-ATA-G--AA--GAC--A---CAG-CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAGT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24230 : TGACTA---T-TGC-C-A-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-A--AA--GAA--A---CAA-CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAG---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24239 : TGACTA---C-TGA-C-T-A---AA--A-T-TT-T--CAT-GAA-CAA--A-ATA-G--AA--GAC--A---CAG-CAT--TC----AT--CTGAG-AAA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GGGA
gi|24243 : TGATTA---T-TGT-C-T-A---AA--A-G-TC-T--TGT-GAA-TAG--G-ATA-G--AA--GAC--A---TAA-CAT--TC----AT--C--AG-AGC-ATC---AT-CAG---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24245 : TGACCA---T-TG--C-T-A---AG--A-A-TC-C--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--AT--GAC--A---CAG-CAT--TC----AT--T--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACTAAT-G-TTGCCC-ATA-GAGA
gi|24235 : TGACT------TGC-C-G-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--AA--GAC--A---CGG-CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTATCC-ATG-GAGA
gi|24241 : TGCCTA---T-TGC-C-A-A---AA--A-T-CT-C--TGT-GAC-CAA--G-ATA-G--AA--GAC--A---CAG-TAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCTC-ATG-GAGA
gi|24252 : TGAGTA---C-TGC-C-T-A---AA--A-A-TC-A--CGT-GAA-CAA--G-GTA-G--AA--GAC--A---CAG-CAT--CC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCTC-ATG-GAGA
gi|24231 : TGACTA---T-TGC-C-G-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-TA---G-ATA-G--AA--GAA--A---CAG-CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACCAAT-G-TT-CCC-ATG-GAGA
gi|24250 : TGAGTA---C-TGC-C-TTA---AA--A-A-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-GTA-G--AA--GAC--A---CAA-CAT--CC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGGCC-ATG-GAGA
gi|24238 : TGATAA---T-TGC-C-T-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-TAA--G-ATA-G--AG--GAC--A---TAG-TAT--AT----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-AC-AAT-G-TTGCGC-ATG-GAGA
gi|24277 : TGAATA---C-TGT-C-T-A---AA--A-A-TC-A--TGT-GAA-CAA--G-GTA-G--AA--GAC--A---CAT-CAT--CC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCA-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24273 : TGAGTA---C-TGC-C-T-A---AA--A-A-TC-A--CGT-GAA-CAA--G-TT--G--AA--GAC--A---CAG-CAT--CC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24275 : TAACTA---T-TGC-C-T-T---AA--A-T--C-T--TGT-GAA-CAA--G-ACA-G--AA--GAC--A---CAG-TAT--TC----AT--C--AA-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-CTCC-ATAAAT-G-TTG-CC-ATG-GAGA
gi|24232 : TGACTAGTAT-TGC-C-G-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-TAA--G-A---G--TGAAGAA--A---CAG-CAT--TC----AT--C--AT-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACCAAT-G-TTCCCC-ATG-GAGA
gi|24289 : TGACTG---T--GA-CCT-A---AA--A-C-CC-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--AA--GAC--A---CAT-CAT--TC----AT--T--AG-AGA-ATC---AT-AAA---ACC-TTCC-A-AAAT-G-CTGTCC-ATG-GGGA
gi|24233 : TGACTA---T-TGC-C-G-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-CGA--G--TA----TGAAGAC------CAG-CATA-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TT-C-ACATAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24267 : TGACTA---T-TG--C-T-A---AA--A-A-TC-T--TGT-GAA-CAT--G-ATA-G--AA--GCA--A---TGG-CAT--TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AC-TAA---ACC-TTCC-ATAAAT-G-TTACCT-ATG-GAGA
gi|24294 : TGACT----T-TGGTC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-AAA-CTT--G-ATG-G--AA--GAT--A---TAG-CGA--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCTC-ATG-GA
gi|24292 : TGACTA---A-TGC-C-T-A---AA--A-A-TC-T--TGT-GAA-AAA--G-ATA-G--AA--AAC--A---TAG-AAT--TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-A-TAGCCCTTTG-GAGA
gi|24300 : TAACTA---T-TAC-C-C-C---AA--A-A-CC-T--TGT-GAA-CAC--G-ATA-G--GA--GTC--G---CAG-CAT--TC----AT--C--CC-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAACT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24299 : TAACTA---T-TAC-C-C-C---AA--A-A-CC-T--TGT-GAA-CAC--G-ATA-G--GA--GTC--G---CAG-CAT--TC----AT--C--CC-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAACT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24271 : TGAGTA---C-TGC-C-A-A---AA--A-A-TC-A--TGT-GAA-CAA--G-GTA-G------AAG--A---CAG-CAT--CC----AT--C--AG-AGG-GTC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTCCCC-ATG-GAGA
gi|24256 : TGACTA---T-TGC-C-A-A---AA--A-A-TC-C--TTT-GAAACAA--G-ATA-G--AA--GA---A---CAA-CAT--TC----AT--C--AG-AGATATCTGAAT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-G
gi|24281 : TGACTA---T-TGC-C-T-A---AA--AAT-TC-T--TGT-GA--CAC--G-ATA-G--AA--GCA--A---TGG-TAT--TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AC-TAA---ACC-TTCC-ATAAAT-G-TTACCT-ATG-GAGA
gi|24287 : TGACTA---T-TG--C-T-A---AA--A-A-TC-T--TGT-GAA-CAC--G-ATA-G--AA--GCA--A---TGG-CAT--TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AC-TAA---ACC-TTCC-ATAAAT---TTACCT-ATG-GAGA
gi|24258 : TGACTA---T-TG--C-C-A---AA--A-A-CC-C--TGT-GA--CAA--G-ATAAG--AA--GAT--A---CAG-CAT--TCG---AT--T--AG-AGA-ATC---CT-TAA---ACT-TTCCCACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAAA
gi|24282 : TGA-TA---T-TG--C-T-A---AA--A-A-TC-T--TGT-GAA-CAC--G-ATA-G--AA--GCA--A---TGG-TAT--TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AC-TAA---ACC-TTCC-ATAAAT-G-TTACCT-ATG-GAGA
gi|24302 : TGTCTA---T-TG--C-T-A---AA--A-A-TC-T--TGT-GAA-CAC--G-ATA-G--AA--GCA--A---TGG-CAT--TT----AT--C--AG-AGA--TC---AT-TAA---ACC-TTCC-ATGAAT-G-TTACCT-ATG-GAGA
gi|24257 : TGACTA---T-TGG-C-C-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-CAA--C-AGA-T--CG--GAA--G---AAT-CATCATC----AT--T--AG-AGA-ATC---CT-CAA---ATC-TTCC-ACAAATCG-TTGCCC-ATG-
gi|24255 : TGACTA---A-TGC-C-G-A---AA--A-A--C-T--TGT-GAA-TAA--G-TCA-G--AA--AAA--A---CAG-CAT--TT----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-C-A---ACC-TCCC-ACCAAT-G-TTCCCC-ATG-GAGA
gi|24279 : TGATTA---T-TGT-T-G-A---AA--A-T-AC-T--TGT-GAA-TAA--G-GTA-G--AA--GAA--A---CGG-CAT--TT----AT--C--AG-AAA-ATA---AC-CAA---ACC-TTCC-GCCAAT-G-TTCCTC-ATG-GA
gi|24297 : TGACTA---T-TGC-C-G-A---AATAA-T-CC-T--TGT-GAA-CAA--T-AGA-A---A--GAA--A---TA--CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAAAAGACC--ACC-ACCAAT-G-TT-CCC-ATG-GA
gi|24380 : GACTA---C-TGA-C-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--TG--GAC--A---CAG-CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---CT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24381 : GACTA---C-TGA-C-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--TG--GAC--A---CAG-CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AA-TAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24386 : GACTA---T-TGA-C-T-A---AA--A-T-TC-T--TGC-GAG-CAA--G-ATA-G--AG--GAC--T---CAG-CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CCA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24382 : GAATA---C-TGA-C-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-CAA-CAA--G-ATA-G--TG--GAT--A---CAG-CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24379 : GACTA---T-TGA-C-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--GTATA-G--TG--GAA--A---CAG-CA---TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24383 : GACTG---T-TGA-C-T-G---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAATAG-ACA-C--TG--GAC--A---CAG-TAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAG
gi|24378 : GACTA---T-TGA-C-T-A---AA--A-T-AC-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--TG--GACC-A---CAG-CAT--TC----AC--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G--TGCCC-AGG-GAGA
gi|24387 : GACTA---T-TGA-C-T-A---AA--A-T-TC-T--TGC-GAG-CAA--G-ATA-G--AG--GAC--T---CAG-CAT--TC----AA--C--AG-AGA-ATA---AT-CCA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24402 : GACTA---T-TGA-C-T-A---AA--G-T-TC-T--TGT-GA--CAA--G-ATA-G--AG--GAC--T---CAG-CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAC---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCT-ATG-GAGA
gi|24384 : GAATA---C-TGA-C-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-CAA-CAA--G-ATA-G--TG--GAT--A---CAG-CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACCAAT-G-TTCCCC-ATG-GAGA
gi|24391 : GACTA---T-TGA-C-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--A-ATG-G--AG--GGC--T---CAG-TAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24392 : GACTA---T-TGA-C-T-G---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--A-ATG-G--AG--GGC--T---CAG-TAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ATAAAT-G-TTGCTC-ATG-GAGA
gi|24390 : GACTA---T-TGT-C-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CA-------------G--GAC--T---CAG-CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24398 : GACTA---C-TGA-C-T-A---AA--A-T-TC-T--TTT-GAA-CAA--G-ATA-A--AG--GAT--G---CGA-CAT--TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-CAA---ACT-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24393 : GACTA---T-TGT-C-T-A---AA--A-A-TT-T--TGT-GAG-CAA--G-ACA-G------GAC--T---CGG-CAC--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCTC-ATG-GAGA
gi|24407 : GAGTA---A-TGA-C-T-A---AA--A-T-TC-T--TTT-GAA-CAA--G-ATA-T--AA--GAT--T---CAG-CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGTCC-ATG-GAGA
gi|24405 : GACTA---T-TGA-C-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-----------------------G-TAT--TG----AT--T--AG-AGA-AGC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24385 : GACTA---T-TG--C-C-A---AA--A-T-TCCT--TGT-GAA-TAA--G-ACA-G--AA--GAC--A---CAG-CAT--TT----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TACC-ATCAAT-G-TTCCCC-TTA-GAGA
gi|24412 : GAGTA---C-TGC-C-T-A---AA--A-CATC-A--TGT-GAA-CAA--G-GTA-G--AA--GAT--A---CAA-CAT--CC----TT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-AAG-GAGA
gi|24408 : GACTG---TGTGT-C-C-A---GA--A-C-T--T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--AA--GCA--A---GGG-CAT--CC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTAC-ACAAAT-G-TTGTCC-ATG-GAG
gi|24437 : ACTA---T-TGA-C-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--TG--GAC--A---CAG-CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GA
gi|24433 : ACTA---T-TGC-C-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAT-CAA--G-ATA-A--AA--AAC--A---CAG-CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-AAGA
gi|24451 : ATTA---T-TGA-T-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-ATG-G--AG--GAC--T---TAT-CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24445 : ACTA---T-TGA-C-T-GTCTCA--A-TATC-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--AG--GAC--A---CAG-CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24438 : ACTA---T-TAA-C-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--A-ATA-G--AG--GAC--T---CAG-CAT--TC----TT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAGAT-G-TTGTCC-ATG-GAGA
gi|24441 : ACTA---T-TGA-C-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-TAA-TAA--G-ATA-G--AA--GAC--A---CAG-CAT--TC----AT--C--AG-AAA-AAT---GT-TAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24455 : ACTA---T-CGA-C-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GCA-CAA--G-ATA-G--AG--GAC--A---TAA-CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ATAAAT-G-TTGCAC-ATG-GA
gi|24439 : ACTA---T-TGA-C-T-A---GA--A-T-TC-T--TTT-GAA-CAA--G-ATA-G--AA--GAT--G---CAG-CAT--TC----GT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTGG-ACAAAT-G-TTGCCC-ATA-GAGA
gi|24452 : ACTT---T-TGC-T-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-AAA-CAA--G-ATA-G--AA--GAC--A---CAG-CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAG---AAC-TTCC-ACAGAT-G-TTGCCC-ATG-AAAA
gi|24456 : ATTA---T-TGT-C-T-A-----------TC-T--TGT-GAT-CAA--A-ATA-G--AA--GAC--A---CAG-CAT--TC----CT--C--AG-AGA-ACC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGTCC-ATG-GAGA
gi|24446 : ACTA---T-TGC-C-GGA---AA--A-T-CC-T--TGTTGAA-TCA--G-ATA-GAATG--AA---A---CAG-CAT--TT----CTTTC--AG-AGA-ATC---ATTCAG---ACC-TATC-ACAAAT-GGTTGCCC-ATG-GAGA
gi|24482 : CTA---T-TGA-C-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--AG--GAC--T---CAG-CAT--TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-GAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24481 : CTA---T-TGA-C-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--AG--GAC--T---CAG-CAT--TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-GAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24480 : CTA---T-TGA-C-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--AG--GAC--T---CAG-CAT--TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-GAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24479 : CTA---T-TGA-C-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--AG--GAC--T---CAG-CAT--TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-GAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24483 : CTA---T-TGC-C-T-T---AA--A-A-TC-T--TGT-AAA-CAA--G-ATA-G--AA--GCA--A---CAA-CAT--TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---CCT-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAAA
gi|24493 : TA---TGTGT-C-T-A---AA--A-T-G--T--TAT-GAA-CAA--G-ATA-G--AA--GGG--A---GGG-CAT--TT----AT--C--AG-AGT-ATC---AT-CAA---ACC-TTCT-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24504 : A---T-TGC-C-T-A---AA--A-A-TC-T--TGT-TAA-CAA--G-ATA-G--GA--GAC--AGATCAG-CAT--TC----AT--T--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-A-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24507 : A---C-TGC-C-T-A---AA--A-T--C-A--CGT-AAA-CAA--G-GTA-G--AA--GAC--A---CAG-CAT--CC----AT--C--AG-AGT-ATC---AT-CAA---ACC-CTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24502 : A---T-TGC-T-T-A---AA--A-T-CC-T--TTT-GAT-TAA--A-ATA-G--AA--ACC--C---CAA-CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-A-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24515 : ---T-TGA-C-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--AG--GAC--A---CAG-CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-GTGCCC-ATG-GAGA
gi|24517 : ---T-TG--C-T-T---AA--A-T-T--T--TGT-GAA-CAA--G-AAA-G--AA--AAC--A---TAG-CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACT-TTCC-ACAAAT-G-TTGTCT-TTG-GAGA
gi|24526 : -TGT-C-T-G---AA--A-T--C-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--AA--GCA--A---GGG-CAT--TT----AT--C--GG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTCCCC-ATG-GAGA
gi|24563 : -A---AA--A-T--A-T--TGT-GAA-CAA--G-GTA-G--AA--GAA--A---CAG-CAT--TC----AT--T--AG-AGG-ATC---AT-CAA---GCC-TCCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24577 : ---AA--A-T-TC-T--TGT-AAA-CAA--A-AGA-G--TG--GAC--A---CAA-CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAGT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24588 : A--A-T-TC-C--TGT-GAG-CAAA-G-ATA-G--AA--GAC--A---AAG-CAT--TC----AT--C--AT-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATA-GA
gi|24583 : A--A-C-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-A--AG--CA---A---GGG-TAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24584 : A--A-C-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--AA--G-C--A---AAGGTAT--TC----AT--A--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACT-TTCC-ACAAAT-G-TTCCCC-ATG-GAGA
gi|24586 : A--A-T-TC-TCATAT-TAA-TAA--G-GGA-G--AA--GAC--A---CAG-CAT--CC----AT--C--AG-AGG-ACC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24613 : C-T--TGT-GAG-CAA--G-ATA-G--AA--GAC--A---CAG-CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ATAAAT-G-TTGCAC-ATG-GAGA
gi|24536 : C-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--AA--GCA--A---GGG-TAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24535 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--AA--GCA--A---GGG-CAT--TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAG
gi|24538 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--AA--GCA--A---GGG-CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-G
gi|24542 : ccggaaaC-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--AA--GCA--A---GGG-CAT--TC----AT--C--AG-AAG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCT-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24543 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--AA--GCA--A---GGG-CAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTACTC-ATA-GAGA
gi|24546 : ccggaacC-T--TGT-AAA-CAA--G-ATA-G--AA--GCT--A---GGA-CAT--TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCT-ATG-GAGA
gi|24545 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--AA--AGC--A---AGG-CAT--TA----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACCTTTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-AAG
gi|24537 : ccgagacC-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--AA--GCA--A---GGG-TAT--TT----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-GAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24544 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--AA--GCA--A---GGG-AAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAG---ACC-TTCC-AAAAAT-G-TTGCCT-ATG-GAGA
gi|24556 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G------AATTAA---GAG-CTT--TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-CAA---AAC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAG
gi|24599 : cggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-A--AA--GCA--A---GGG-CAT--TC----AT--C--AGGAGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-AAAA
gi|24527 : cC-T--TGT-GTA-CAA--G-ATA-G--AA--GCA--A---GGG-TAT--TCTGACAT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GA
gi|24534 : tgtccagaacC-C--TGT-TAA-TAA--A-ATA-G--AA--GCA--A---GGG-CAT--TC----AT--C--AG-AGA--TC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATGAGAGA
gi|24582 : ccggaac-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--AA--GTA--A---GGG-CAT--TC----AT--T--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24618 : aacct-T--TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--AA--GCA--A---GGG-TAT--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-A-TTGCTC-ATG-GAGA
gi|24630 : --TGT-GAA-CAA--G-ATA-G--AA--GCA--A---GGG-TAT--TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
Alignments
lowQualScore : 000 1 3 0 1 000 00 0 1 0 00 0 0 11 0 0 0 0000 0 11 000 1 0 1111 00 00 0 0 000 0 000 0 0 0 0 0 0
lowQualScore : ... . . . . ... .. . . . .. . . .. . . . .... . .. ... . . .... .. .. . . ... . ... . . . . . .
lowQualScore : 999 0 5 5 0 999 77 5 0 4 66 4 4 00 8 4 4 9999 8 33 777 5 4 2222 55 55 4 4 777 4 777 4 4 4 4 4 4
consensus : TGACTA---T-TGNC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CGGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
Reference ( family-67 ) : TGACTA---T-TGNC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CGGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24230 : TGACTA---T-TGCC-A-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-AA----A-GAA-A---CAACAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAG---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24231 : TGACTA---T-TGCC-G-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-TA---G-AT-A-GA----A-GAA-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACCAAT-G-TT-CCC-ATG-GAGA
gi|24232 : TGACTAGTAT-TGCC-G-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-TAA--G-AG-T-GA----A-GAA-A---CAGCAT-TC----AT--C--AT-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACCAAT-G-TTCCCC-ATG-GAGA
gi|24233 : TGACTA---T-TGCC-G-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-CGA--GTAT---GA----A-GAC-----CAGCATATC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TT-C-ACATAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24235 : TGACT------TGCC-G-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CGGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTATCC-ATG-GAGA
gi|24236 : TGGCTA---T-TGCCCT-A---AA--A-T-TC-T--TGT-TAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAGT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24237 : TGACTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAG-CAA--G-AT-A-GT----G-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24238 : TGATAA---T-TGCC-T-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-TAA--G-AT-A-GA----G-GAC-A---TAGTAT-AT----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-AC-AAT-G-TTGCGC-ATG-GAGA
gi|24239 : TGACTA---C-TGAC-T-A---AA--A-T-TT-T--CAT-GAA-CAA--A-AT-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--CTGAG-AAA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GGGA
gi|24241 : TGCCTA---T-TGCC-A-A---AA--A-T-CT-C--TGT-GAC-CAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CAGTAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCTC-ATG-GAGA
gi|24243 : TGATTA---T-TGTC-T-A---AA--A-G-TC-T--TGT-GAA-TAG--G-AT-A-GA----A-GAC-A---TAACAT-TC----AT--C--AG-AGC-ATC---AT-CAG---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24245 : TGACCA---T-TG-C-T-A---AG--A-A-TC-C--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----T-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--T--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACTAAT-G-TTGCCC-ATA-GAGA
gi|24250 : TGAGTA---C-TGCC-TTA---AA--A-A-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-GT-A-GA----A-GAC-A---CAACAT-CC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGGCC-ATG-GAGA
gi|24252 : TGAGTA---C-TGCC-T-A---AA--A-A-TC-A--CGT-GAA-CAA--G-GT-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-CC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCTC-ATG-GAGA
gi|24255 : TGACTA---A-TGCC-G-A---AA--A-A--C-T--TGT-GAA-TAA--G-TC-A-GA----A-AAA-A---CAGCAT-TT----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-C-A---ACC-TCCC-ACCAAT-G-TTCCCC-ATG-GAGA
gi|24256 : TGACTA---T-TGCC-A-A---AA--A-A-TC-C--TTT-GAAACAA--G-AT-A-GA----A-GA--A---CAACAT-TC----AT--C--AG-AGATATCTGAAT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-G
gi|24257 : TGACTA---T-TGGC-C-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-CAACAG-ATCG-GA----A-GAA-T---CATCAT--C----AT--T--AG-AGA-ATC---CT-CAA---ATC-TTCC-ACAAATCG-TTGCCC-ATG-
gi|24258 : TGACTA---T-TGCC-A-A---AA--A-C-CC-T---GT-GA--CAA--G-AT-AAGA----A-GAT-A---CAGCAT-TCG---AT--T--AG-AGA-ATC---CT-TAA---ACT-TTCCCACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAAA
gi|24267 : TGACTA---T-TG-C-T-A---AA--A-A-TC-T--TGT-GAA-CAT--G-AT-A-GA----A-GCA-A---TGGCAT-TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AC-TAA---ACC-TTCC-ATAAAT-G-TTACCT-ATG-GAGA
gi|24271 : TGAGTA---C-TGCC-A-A---AA--A-A-TC-A--TGT-GAA-CAA--G-GT-A-GA----A-GAC-A-----GCAT-CC----AT--C--AG-AGG-GTC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTCCCC-ATG-GAGA
gi|24273 : TGAGTA---C-TGCC-T-A---AA--A-A-TC-A--CGT-GAA-CAA--G-TT---GA----A-GAC-A---CAGCAT-CC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24275 : TAACTA---T-TGCC-T-T---AA--A-T--C-T--TGT-GAA-CAA--G-AC-A-GA----A-GAC-A---CAGTAT-TC----AT--C--AA-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-CTCC-ATAAAT-G-TTG-CC-ATG-GAGA
gi|24277 : TGAATA---C-TGTC-T-A---AA--A-A-TC-A--TGT-GAA-CAA--G-GT-A-GA----A-GAC-A---CATCAT-CC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCA-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24279 : TGATTA---T-TGTT-G-A---AA--A-T-AC-T--TGT-GAA-TAA--G-GT-A-GA----A-GAA-A---CGGCAT-TT----AT--C--AG-AAA-ATA---AC-CAA---ACC-TTCC-GCCAAT-G-TTCCTC-ATG-GA
gi|24281 : TGACTA---T-TGCC-T-A---AA--AAT-TC-T--TGT-GA--CAC--G-AT-A-GA----A-GCA-A---TGGTAT-TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AC-TAA---ACC-TTCC-ATAAAT-G-TTACCT-ATG-GAGA
gi|24282 : TGA-TA---T-TG-C-T-A---AA--A-A-TC-T--TGT-GAA-CAC--G-AT-A-GA----A-GCA-A---TGGTAT-TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AC-TAA---ACC-TTCC-ATAAAT-G-TTACCT-ATG-GAGA
gi|24287 : TGACTA---T-TG-C-T-A---AA--A-A-TC-T--TGT-GAA-CAC--G-AT-A-GA----A-GCA-A---TGGCAT-TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AC-TAA---ACC-TTCC-ATAAAT---TTACCT-ATG-GAGA
gi|24289 : TGACTG---T-GACC-T-A---AA--A-C-CC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CATCAT-TC----AT--T--AG-AGA-ATC---AT-AAA---ACC-TTCC-A-AAAT-G-CTGTCC-ATG-GGGA
gi|24292 : TGACTA---A-TGCC-T-A---AA--A-A-TC-T--TGT-GAA-AAA--G-AT-A-GA----A-AAC-A---TAGAAT-TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-A-TAGCCCTTTG-GAGA
gi|24294 : TGACTT---T-GGTC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-AAA-CTT--G-AT-G-GA----A-GAT-A---TAGCGA-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCTC-ATG-GA
gi|24297 : TGACTA---T-TGCC-G-A---AATAA-T-CC-T--TGT-GAA-CAA-----T-A-GA----AAGAA-A---TA-CAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAAAAGACC--ACC-ACCAAT-G-TT-CCC-ATG-GA
gi|24299 : TAACTA---T-TACC-C-C---AA--A-A-CC-T--TGT-GAA-CAC--G-AT-A-GG----A-GTC-G---CAGCAT-TC----AT--C--CC-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAACT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24300 : TAACTA---T-TACC-C-C---AA--A-A-CC-T--TGT-GAA-CAC--G-AT-A-GG----A-GTC-G---CAGCAT-TC----AT--C--CC-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAACT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24302 : TGTCTA---T-TG-C-T-A---AA--A-A-TC-T--TGT-GAA-CAC--G-AT-A-GA----A-GCA-A---TGGCAT-TT----AT--C--AG-AG--ATC---AT-TAA---ACC-TTCC-ATGAAT-G-TTACCT-ATG-GAGA
gi|24378 : GACTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-AC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GT----G-GACCA---CAGCAT-TC----AC--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G--TGCCC-AGG-GAGA
gi|24379 : GACTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--GTAT-A-GT----G-GAA-A---CAGCA--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24380 : GACTA---C-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GT----G-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---CT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24381 : GACTA---C-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GT----G-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AA-TAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24382 : GAATA---C-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-CAA-CAA--G-AT-A-GT----G-GAT-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24383 : GACTG---T-TGAC-T-G---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA-----T-A-GACACTG-GAC-A---CAGTAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAG
gi|24384 : GAATA---C-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-CAA-CAA--G-AT-A-GT----G-GAT-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACCAAT-G-TTCCCC-ATG-GAGA
gi|24385 : GACTA---T-TGCC---A---AA--A-T-TCCT--TGT-GAA-TAA--G-AC-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-TT----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TACC-ATCAAT-G-TTCCCC-TTA-GAGA
gi|24386 : GACTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGC-GAG-CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-T---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CCA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24387 : GACTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGC-GAG-CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-T---CAGCAT-TC----AA--C--AG-AGA-ATA---AT-CCA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24390 : GACTA---T-TGTC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAG--G-A--------------C-T---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24391 : GACTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--A-AT-G-GA----G-GGC-T---CAGTAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24392 : GACTA---T-TGAC-T-G---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--A-AT-G-GA----G-GGC-T---CAGTAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ATAAAT-G-TTGCTC-ATG-GAGA
gi|24393 : GACTA---T-TGTC-T-A---AA--A-A-TT-T--TGT-GAG-CAA--G-AC-A-G-------GAC-T---CGGCAC-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCTC-ATG-GAGA
gi|24398 : GACTA---C-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TTT-GAA-CAA--G-AT-A-AA----G-GAT-G---CGACAT-TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-CAA---ACT-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24402 : GACTA---T-TGAC-T-A---AA--G-T-TC-T--TGT-GA--CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-T---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAC---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCT-ATG-GAGA
gi|24405 : GACTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G------------------------GTAT-TG----AT--T--AG-AGA-AGC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24407 : GAGTA---A-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TTT-GAA-CAA--G-AT-A-TA----A-GAT-T---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGTCC-ATG-GAGA
gi|24408 : GACTG---TGTGTC-C-A---GA--A-C-T--T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGCAT-CC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTAC-ACAAAT-G-TTGTCC-ATG-GAG
gi|24412 : GAGTA---C-TGCC-T-A---AA--A-CATC-A--TGT-GAA-CAA--G-GT-A-GA----A-GAT-A---CAACAT-CC----TT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-AAG-GAGA
gi|24433 : ACTA---T-TGCC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAT-CAA--G-AT-A-AA----A-AAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-AAGA
gi|24437 : ACTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GT----G-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GA
gi|24438 : ACTA---T-TAAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--A-AT-A-GA----G-GAC-T---CAGCAT-TC----TT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAGAT-G-TTGTCC-ATG-GAGA
gi|24439 : ACTA---T-TGAC-T-A---GA--A-T-TC-T--TTT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GAT-G---CAGCAT-TC----GT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTGG-ACAAAT-G-TTGCCC-ATA-GAGA
gi|24441 : ACTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-TAA-TAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AAA-AAT---GT-TAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24445 : ACTA---T-TGAC-T-GTCTCA--A-TATC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24446 : ACTA---T-TGCC-GGA---AA--A-T-CC-T--TGTTGAA-TCA--G-AT-A-GA----ATGAA-A---CAGCAT-TT----CTTTC--AG-AGA-ATC---ATTCAG---ACC-TATC-ACAAAT-GGTTGCCC-ATG-GAGA
gi|24451 : ATTA---T-TGAT-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-G-GA----G-GAC-T---TATCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24452 : ACTT---T-TGCT-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-AAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAG---AAC-TTCC-ACAGAT-G-TTGCCC-ATG-AAAA
gi|24455 : ACTA---T-CGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GCA-CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-A---TAACAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ATAAAT-G-TTGCAC-ATG-GA
gi|24456 : ATTA---T-TGTC-T-A-----------TC-T--TGT-GAT-CAA--A-AT-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-TC----CT--C--AG-AGA-ACC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGTCC-ATG-GAGA
gi|24479 : CTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-T---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-GAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24480 : CTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-T---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-GAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24481 : CTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-T---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-GAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24482 : CTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-T---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-GAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24483 : CTA---T-TGCC-T-T---AA--A-A-TC-T--TGT-AAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---CAACAT-TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---CCT-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAAA
gi|24493 : TA---TGTGTC-T-A---AA--A-T-G--T--TAT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GGG-A---GGGCAT-TT----AT--C--AG-AGT-ATC---AT-CAA---ACC-TTCT-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24502 : A---T-TGCT-T-A---AA--A-T-CC-T--TTT-GAT-TAA--A-AT-A-GA----A-ACC-C---CAACAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-A-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24504 : A---T-TGCC-T-A---AA--A-A-TC-T--TGT-TAA-CAA--G-AT-A-GG----A-GAC-AGATCAGCAT-TC----AT--T--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-A-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24507 : A---C-TGCC-T-A---AA--A-T--C-A--CGT-AAA-CAA--G-GT-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-CC----AT--C--AG-AGT-ATC---AT-CAA---ACC-CTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24515 : ---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-GTGCCC-ATG-GAGA
gi|24517 : ---T-TGCT-T-A---AA------TT-T--TGT-GAA-CAA--G-AA-A-GA----A-AAC-A---TAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACT-TTCC-ACAAAT-G-TTGTCT-TTG-GAGA
gi|24526 : -TGTC-T-G---AA--A-T--C-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGCAT-TT----AT--C--GG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTCCCC-ATG-GAGA
gi|24527 : -TGTC-C-A---GA--A-C--C-T--TGT-GTA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGTAT-TCTGACAT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GA
gi|24534 : C-C--TGT-TAA-TAA--A-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGCAT-TC----AT--C--AG-AGA--TC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATGAGAGA
gi|24535 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGCAT-TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAG
gi|24536 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGTAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24537 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGTAT-TT----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-GAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24538 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-G
gi|24542 : ccggaaaC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGCAT-TC----AT--C--AG-AAG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCT-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24543 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTACTC-ATA-GAGA
gi|24544 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGAAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAG---ACC-TTCC-AAAAAT-G-TTGCCT-ATG-GAGA
gi|24545 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-AGC-A---AGGCAT-TA----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACCTTTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-AAG
gi|24546 : ccgagacC-T--TGT-AAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCT-A---GGACAT-TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCT-ATG-GAGA
gi|24556 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-TTA-A---GAGCTT-TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-CAA---AAC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAG
gi|24563 : cggaac-A---AA--A-T--A-T--TGT-GAA-CAA--G-GT-A-GA----A-GAA-A---CAGCAT-TC----AT--T--AG-AGG-ATC---AT-CAA---GCC-TCCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24577 : ---AA--A-T-TC-T--TGT-AAA-CAA--A-AG-A-GT----G-GAC-A---CAACAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAGT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24582 : -T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GTA-A---GGGCAT-TC----AT--T--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24583 : aacctA--A-C-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A--A----A-GCA-A---GGGTAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24584 : A--A-C-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---AGGTAT-TC----AT--A--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACT-TTCC-ACAAAT-G-TTCCCC-ATG-GAGA
gi|24586 : A--A-T-TC-TCATAT-TAA-TAA--G-GG-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-CC----AT--C--AG-AGG-ACC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24588 : A--A-T-TC-C--TGT-GAG-CAAA-G-AT-A-GA----A-GAC-A---AAGCAT-TC----AT--C--AT-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATA-GA
gi|24599 : C-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-AA----A-GCA-A---GGGCAT-TC----AT--C--AGGAGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-AAAA
gi|24613 : cC-T--TGT-GAG-CAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ATAAAT-G-TTGCAC-ATG-GAGA
gi|24618 : -T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGTAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-A-TTGCTC-ATG-GAGA
gi|24630 : --TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGTAT-TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
Alignments
lowQualScore : 000 1 3 0 1 000 00 0 1 0 00 0 0 11 0 0 0 0000 0 11 000 1 0 1111 00 00 0 0 000 0 000 0 0 0 0 0 0
lowQualScore : ... . . . . ... .. . . . .. . . .. . . . .... . .. ... . . .... .. .. . . ... . ... . . . . . .
lowQualScore : 999 0 5 5 0 999 77 5 0 4 66 4 4 00 8 4 4 9999 8 33 777 5 4 2222 55 55 4 4 777 4 777 4 4 4 4 4 4
consensus : TGACTA---T-TGNC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CGGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
Reference ( family-67 ) : TGACTA---T-TGNC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CGGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24230 : TGACTA---T-TGCC-A-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-AA----A-GAA-A---CAACAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAG---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24231 : TGACTA---T-TGCC-G-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-TA---G-AT-A-GA----A-GAA-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACCAAT-G-TT-CCC-ATG-GAGA
gi|24232 : TGACTAGTAT-TGCC-G-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-TAA--G-AG-T-GA----A-GAA-A---CAGCAT-TC----AT--C--AT-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACCAAT-G-TTCCCC-ATG-GAGA
gi|24233 : TGACTA---T-TGCC-G-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-CGA--GTAT---GA----A-GAC-----CAGCATATC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TT-C-ACATAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24235 : TGACT------TGCC-G-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CGGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTATCC-ATG-GAGA
gi|24236 : TGGCTA---T-TGCCCT-A---AA--A-T-TC-T--TGT-TAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAGT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24237 : TGACTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAG-CAA--G-AT-A-GT----G-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24238 : TGATAA---T-TGCC-T-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-TAA--G-AT-A-GA----G-GAC-A---TAGTAT-AT----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-AC-AAT-G-TTGCGC-ATG-GAGA
gi|24239 : TGACTA---C-TGAC-T-A---AA--A-T-TT-T--CAT-GAA-CAA--A-AT-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--CTGAG-AAA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GGGA
gi|24241 : TGCCTA---T-TGCC-A-A---AA--A-T-CT-C--TGT-GAC-CAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CAGTAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCTC-ATG-GAGA
gi|24243 : TGATTA---T-TGTC-T-A---AA--A-G-TC-T--TGT-GAA-TAG--G-AT-A-GA----A-GAC-A---TAACAT-TC----AT--C--AG-AGC-ATC---AT-CAG---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24245 : TGACCA---T-TG-C-T-A---AG--A-A-TC-C--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----T-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--T--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACTAAT-G-TTGCCC-ATA-GAGA
gi|24250 : TGAGTA---C-TGCC-TTA---AA--A-A-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-GT-A-GA----A-GAC-A---CAACAT-CC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGGCC-ATG-GAGA
gi|24252 : TGAGTA---C-TGCC-T-A---AA--A-A-TC-A--CGT-GAA-CAA--G-GT-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-CC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCTC-ATG-GAGA
gi|24255 : TGACTA---A-TGCC-G-A---AA--A-A--C-T--TGT-GAA-TAA--G-TC-A-GA----A-AAA-A---CAGCAT-TT----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-C-A---ACC-TCCC-ACCAAT-G-TTCCCC-ATG-GAGA
gi|24256 : TGACTA---T-TGCC-A-A---AA--A-A-TC-C--TTT-GAAACAA--G-AT-A-GA----A-GA--A---CAACAT-TC----AT--C--AG-AGATATCTGAAT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-G
gi|24257 : TGACTA---T-TGGC-C-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-CAACAG-ATCG-GA----A-GAA-T---CATCAT--C----AT--T--AG-AGA-ATC---CT-CAA---ATC-TTCC-ACAAATCG-TTGCCC-ATG-
gi|24258 : TGACTA---T-TGCC-A-A---AA--A-C-CC-T---GT-GA--CAA--G-AT-AAGA----A-GAT-A---CAGCAT-TCG---AT--T--AG-AGA-ATC---CT-TAA---ACT-TTCCCACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAAA
gi|24267 : TGACTA---T-TG-C-T-A---AA--A-A-TC-T--TGT-GAA-CAT--G-AT-A-GA----A-GCA-A---TGGCAT-TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AC-TAA---ACC-TTCC-ATAAAT-G-TTACCT-ATG-GAGA
gi|24271 : TGAGTA---C-TGCC-A-A---AA--A-A-TC-A--TGT-GAA-CAA--G-GT-A-GA----A-GAC-A-----GCAT-CC----AT--C--AG-AGG-GTC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTCCCC-ATG-GAGA
gi|24273 : TGAGTA---C-TGCC-T-A---AA--A-A-TC-A--CGT-GAA-CAA--G-TT---GA----A-GAC-A---CAGCAT-CC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24275 : TAACTA---T-TGCC-T-T---AA--A-T--C-T--TGT-GAA-CAA--G-AC-A-GA----A-GAC-A---CAGTAT-TC----AT--C--AA-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-CTCC-ATAAAT-G-TTG-CC-ATG-GAGA
gi|24277 : TGAATA---C-TGTC-T-A---AA--A-A-TC-A--TGT-GAA-CAA--G-GT-A-GA----A-GAC-A---CATCAT-CC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCA-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24279 : TGATTA---T-TGTT-G-A---AA--A-T-AC-T--TGT-GAA-TAA--G-GT-A-GA----A-GAA-A---CGGCAT-TT----AT--C--AG-AAA-ATA---AC-CAA---ACC-TTCC-GCCAAT-G-TTCCTC-ATG-GA
gi|24281 : TGACTA---T-TGCC-T-A---AA--AAT-TC-T--TGT-GA--CAC--G-AT-A-GA----A-GCA-A---TGGTAT-TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AC-TAA---ACC-TTCC-ATAAAT-G-TTACCT-ATG-GAGA
gi|24282 : TGA-TA---T-TG-C-T-A---AA--A-A-TC-T--TGT-GAA-CAC--G-AT-A-GA----A-GCA-A---TGGTAT-TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AC-TAA---ACC-TTCC-ATAAAT-G-TTACCT-ATG-GAGA
gi|24287 : TGACTA---T-TG-C-T-A---AA--A-A-TC-T--TGT-GAA-CAC--G-AT-A-GA----A-GCA-A---TGGCAT-TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AC-TAA---ACC-TTCC-ATAAAT---TTACCT-ATG-GAGA
gi|24289 : TGACTG---T-GACC-T-A---AA--A-C-CC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CATCAT-TC----AT--T--AG-AGA-ATC---AT-AAA---ACC-TTCC-A-AAAT-G-CTGTCC-ATG-GGGA
gi|24292 : TGACTA---A-TGCC-T-A---AA--A-A-TC-T--TGT-GAA-AAA--G-AT-A-GA----A-AAC-A---TAGAAT-TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-A-TAGCCCTTTG-GAGA
gi|24294 : TGACTT---T-GGTC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-AAA-CTT--G-AT-G-GA----A-GAT-A---TAGCGA-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCTC-ATG-GA
gi|24297 : TGACTA---T-TGCC-G-A---AATAA-T-CC-T--TGT-GAA-CAA-----T-A-GA----AAGAA-A---TA-CAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAAAAGACC--ACC-ACCAAT-G-TT-CCC-ATG-GA
gi|24299 : TAACTA---T-TACC-C-C---AA--A-A-CC-T--TGT-GAA-CAC--G-AT-A-GG----A-GTC-G---CAGCAT-TC----AT--C--CC-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAACT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24300 : TAACTA---T-TACC-C-C---AA--A-A-CC-T--TGT-GAA-CAC--G-AT-A-GG----A-GTC-G---CAGCAT-TC----AT--C--CC-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAACT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24302 : TGTCTA---T-TG-C-T-A---AA--A-A-TC-T--TGT-GAA-CAC--G-AT-A-GA----A-GCA-A---TGGCAT-TT----AT--C--AG-AG--ATC---AT-TAA---ACC-TTCC-ATGAAT-G-TTACCT-ATG-GAGA
gi|24378 : GACTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-AC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GT----G-GACCA---CAGCAT-TC----AC--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G--TGCCC-AGG-GAGA
gi|24379 : GACTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--GTAT-A-GT----G-GAA-A---CAGCA--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24380 : GACTA---C-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GT----G-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---CT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24381 : GACTA---C-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GT----G-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AA-TAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24382 : GAATA---C-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-CAA-CAA--G-AT-A-GT----G-GAT-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24383 : GACTG---T-TGAC-T-G---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA-----T-A-GACACTG-GAC-A---CAGTAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAG
gi|24384 : GAATA---C-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-CAA-CAA--G-AT-A-GT----G-GAT-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACCAAT-G-TTCCCC-ATG-GAGA
gi|24385 : GACTA---T-TGCC---A---AA--A-T-TCCT--TGT-GAA-TAA--G-AC-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-TT----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TACC-ATCAAT-G-TTCCCC-TTA-GAGA
gi|24386 : GACTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGC-GAG-CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-T---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CCA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24387 : GACTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGC-GAG-CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-T---CAGCAT-TC----AA--C--AG-AGA-ATA---AT-CCA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24390 : GACTA---T-TGTC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAG--G-A--------------C-T---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24391 : GACTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--A-AT-G-GA----G-GGC-T---CAGTAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24392 : GACTA---T-TGAC-T-G---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--A-AT-G-GA----G-GGC-T---CAGTAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ATAAAT-G-TTGCTC-ATG-GAGA
gi|24393 : GACTA---T-TGTC-T-A---AA--A-A-TT-T--TGT-GAG-CAA--G-AC-A-G-------GAC-T---CGGCAC-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCTC-ATG-GAGA
gi|24398 : GACTA---C-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TTT-GAA-CAA--G-AT-A-AA----G-GAT-G---CGACAT-TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-CAA---ACT-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24402 : GACTA---T-TGAC-T-A---AA--G-T-TC-T--TGT-GA--CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-T---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAC---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCT-ATG-GAGA
gi|24405 : GACTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G------------------------GTAT-TG----AT--T--AG-AGA-AGC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24407 : GAGTA---A-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TTT-GAA-CAA--G-AT-A-TA----A-GAT-T---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGTCC-ATG-GAGA
gi|24408 : GACTG---TGTGTC-C-A---GA--A-C-T--T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGCAT-CC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTAC-ACAAAT-G-TTGTCC-ATG-GAG
gi|24412 : GAGTA---C-TGCC-T-A---AA--A-CATC-A--TGT-GAA-CAA--G-GT-A-GA----A-GAT-A---CAACAT-CC----TT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-AAG-GAGA
gi|24433 : ACTA---T-TGCC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAT-CAA--G-AT-A-AA----A-AAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-AAGA
gi|24437 : ACTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GT----G-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GA
gi|24438 : ACTA---T-TAAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--A-AT-A-GA----G-GAC-T---CAGCAT-TC----TT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAGAT-G-TTGTCC-ATG-GAGA
gi|24439 : ACTA---T-TGAC-T-A---GA--A-T-TC-T--TTT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GAT-G---CAGCAT-TC----GT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTGG-ACAAAT-G-TTGCCC-ATA-GAGA
gi|24441 : ACTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-TAA-TAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AAA-AAT---GT-TAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24445 : ACTA---T-TGAC-T-GTCTCA--A-TATC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24446 : ACTA---T-TGCC-GGA---AA--A-T-CC-T--TGTTGAA-TCA--G-AT-A-GA----ATGAA-A---CAGCAT-TT----CTTTC--AG-AGA-ATC---ATTCAG---ACC-TATC-ACAAAT-GGTTGCCC-ATG-GAGA
gi|24451 : ATTA---T-TGAT-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-G-GA----G-GAC-T---TATCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24452 : ACTT---T-TGCT-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-AAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAG---AAC-TTCC-ACAGAT-G-TTGCCC-ATG-AAAA
gi|24455 : ACTA---T-CGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GCA-CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-A---TAACAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ATAAAT-G-TTGCAC-ATG-GA
gi|24456 : ATTA---T-TGTC-T-A-----------TC-T--TGT-GAT-CAA--A-AT-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-TC----CT--C--AG-AGA-ACC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGTCC-ATG-GAGA
gi|24479 : CTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-T---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-GAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24480 : CTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-T---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-GAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24481 : CTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-T---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-GAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24482 : CTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-T---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-GAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24483 : CTA---T-TGCC-T-T---AA--A-A-TC-T--TGT-AAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---CAACAT-TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---CCT-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAAA
gi|24493 : TA---TGTGTC-T-A---AA--A-T-G--T--TAT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GGG-A---GGGCAT-TT----AT--C--AG-AGT-ATC---AT-CAA---ACC-TTCT-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24502 : A---T-TGCT-T-A---AA--A-T-CC-T--TTT-GAT-TAA--A-AT-A-GA----A-ACC-C---CAACAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-A-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24504 : A---T-TGCC-T-A---AA--A-A-TC-T--TGT-TAA-CAA--G-AT-A-GG----A-GAC-AGATCAGCAT-TC----AT--T--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-A-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24507 : A---C-TGCC-T-A---AA--A-T--C-A--CGT-AAA-CAA--G-GT-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-CC----AT--C--AG-AGT-ATC---AT-CAA---ACC-CTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24515 : ---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-GTGCCC-ATG-GAGA
gi|24517 : ---T-TGCT-T-A---AA------TT-T--TGT-GAA-CAA--G-AA-A-GA----A-AAC-A---TAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACT-TTCC-ACAAAT-G-TTGTCT-TTG-GAGA
gi|24526 : -TGTC-T-G---AA--A-T--C-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGCAT-TT----AT--C--GG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTCCCC-ATG-GAGA
gi|24527 : -TGTC-C-A---GA--A-C--C-T--TGT-GTA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGTAT-TCTGACAT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GA
gi|24534 : C-C--TGT-TAA-TAA--A-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGCAT-TC----AT--C--AG-AGA--TC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATGAGAGA
gi|24535 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGCAT-TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAG
gi|24536 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGTAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24537 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGTAT-TT----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-GAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24538 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-G
gi|24542 : ccggaaaC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGCAT-TC----AT--C--AG-AAG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCT-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24543 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTACTC-ATA-GAGA
gi|24544 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGAAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAG---ACC-TTCC-AAAAAT-G-TTGCCT-ATG-GAGA
gi|24545 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-AGC-A---AGGCAT-TA----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACCTTTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-AAG
gi|24546 : ccgagacC-T--TGT-AAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCT-A---GGACAT-TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCT-ATG-GAGA
gi|24556 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-TTA-A---GAGCTT-TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-CAA---AAC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAG
gi|24563 : cggaac-A---AA--A-T--A-T--TGT-GAA-CAA--G-GT-A-GA----A-GAA-A---CAGCAT-TC----AT--T--AG-AGG-ATC---AT-CAA---GCC-TCCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24577 : ---AA--A-T-TC-T--TGT-AAA-CAA--A-AG-A-GT----G-GAC-A---CAACAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAGT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24582 : -T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GTA-A---GGGCAT-TC----AT--T--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24583 : aacctA--A-C-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A--A----A-GCA-A---GGGTAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24584 : A--A-C-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---AGGTAT-TC----AT--A--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACT-TTCC-ACAAAT-G-TTCCCC-ATG-GAGA
gi|24586 : A--A-T-TC-TCATAT-TAA-TAA--G-GG-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-CC----AT--C--AG-AGG-ACC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24588 : A--A-T-TC-C--TGT-GAG-CAAA-G-AT-A-GA----A-GAC-A---AAGCAT-TC----AT--C--AT-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATA-GA
gi|24599 : C-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-AA----A-GCA-A---GGGCAT-TC----AT--C--AGGAGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-AAAA
gi|24613 : cC-T--TGT-GAG-CAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ATAAAT-G-TTGCAC-ATG-GAGA
gi|24618 : -T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGTAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-A-TTGCTC-ATG-GAGA
gi|24630 : --TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGTAT-TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
blockSeqs : G C T CC A TGAC
blockSeqs : G C G A A G
blockSeqs : . C . A A .
blockSeqs : . C . C G .
blockSeqs : . C . C A .
blockSeqs : . A . C A .
blockSeqs : . C . C A .
blockSeqs : . A . C A .
blockSeqs : . C . C A .
blockSeqs : . T . C A .
blockSeqs : . C . C A .
blockSeqs : . C . C A .
blockSeqs : . C . C A .
blockSeqs : . C . C A .
blockSeqs : . G . A A .
blockSeqs : . C . A A .
blockSeqs : . C . T A .
blockSeqs : . C . A G .
blockSeqs : . C . C A .
blockSeqs : . T . C A .
blockSeqs : . T . C A .
blockSeqs : . C . C G .
blockSeqs : . C . A G .
blockSeqs : . C . A G .
blockSeqs : . T . A G .
blockSeqs : . C . A A .
blockSeqs : . C . C A .
blockSeqs : . C . C A .
blockSeqs : . A . T A .
blockSeqs : . A . A A .
blockSeqs : . A . C A .
blockSeqs : . A . C G .
blockSeqs : . A . A A .
blockSeqs : . A . A A .
blockSeqs : . A . C A .
blockSeqs : . C . C A .
blockSeqs : . A . T A .
blockSeqs : . A . C A .
blockSeqs : . T . T A .
blockSeqs : . A . C A .
blockSeqs : . A . C A .
blockSeqs : . T . C A .
blockSeqs : . A . C A .
blockSeqs : . A . C A .
blockSeqs : . A . C A .
blockSeqs : . A . C G .
blockSeqs : . T . T G .
blockSeqs : . C . C A .
blockSeqs : . C . T A .
blockSeqs : . A . A G .
blockSeqs : . A . T A .
blockSeqs : . A . C A .
blockSeqs : . A . C A .
blockSeqs : . A . C A .
blockSeqs : . C . T A .
blockSeqs : . A . C A .
blockSeqs : . C . C A .
blockSeqs : . A . A A .
blockSeqs : . T . C A .
blockSeqs : . A . C A .
blockSeqs : . A . C A .
blockSeqs : . A . C A .
blockSeqs : . A . C A .
blockSeqs : . C . C A .
blockSeqs : . T . C A .
blockSeqs : . C . C A .
blockSeqs : . C . A A .
blockSeqs : . C . G G .
blockSeqs : . A . C A .
blockSeqs : . C . C A .
blockSeqs : . T . C A .
blockSeqs : . T . C A .
blockSeqs : . . . C A .
blockSeqs : . . . A G .
blockSeqs : . . . A G .
blockSeqs : . . . A G .
blockSeqs : . . . A G .
blockSeqs : . A G .
blockSeqs : A G .
blockSeqs : A G .
blockSeqs : A G .
blockSeqs : A G .
blockSeqs : A G .
blockSeqs : C G .
blockSeqs : T G .
blockSeqs : A A .
blockSeqs : A A .
blockSeqs : C A .
blockSeqs : A G .
blockSeqs : A G .
blockSeqs : A G .
blockSeqs : C A .
blockSeqs : C A .
blockSeqs : A G .
blockSeqs : C A .
blockSeqs : A G .
blockSeqs : A G .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons :
originalCons : TGACTA---T-TGNC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CGGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
finalCons : TGACTA---T-TGNC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CGGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
Alignments
lowQualScore : 000 1 3 0 1 000 00 0 1 0 00 0 0 11 0 0 0 0000 0 11 000 1 0 1111 00 00 0 0 000 0 000 0 0 0 0 0 0
lowQualScore : ... . . . . ... .. . . . .. . . .. . . . .... . .. ... . . .... .. .. . . ... . ... . . . . . .
lowQualScore : 999 0 5 5 0 999 77 5 0 4 66 4 4 00 8 4 4 9999 8 33 777 5 4 2222 55 55 4 4 777 4 777 4 4 4 4 4 4
consensus : TGACTA---T-TGNC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CGGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
Reference ( family-67 ) : TGACTA---T-TGNC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CGGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24230 : TGACTA---T-TGCC-A-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-AA----A-GAA-A---CAACAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAG---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24231 : TGACTA---T-TGCC-G-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-TA---G-AT-A-GA----A-GAA-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACCAAT-G-TT-CCC-ATG-GAGA
gi|24232 : TGACTAGTAT-TGCC-G-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-TAA--G-AG-T-GA----A-GAA-A---CAGCAT-TC----AT--C--AT-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACCAAT-G-TTCCCC-ATG-GAGA
gi|24233 : TGACTA---T-TGCC-G-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-CGA--GTAT---GA----A-GAC-----CAGCATATC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TT-C-ACATAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24235 : TGACT------TGCC-G-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CGGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTATCC-ATG-GAGA
gi|24236 : TGGCTA---T-TGCCCT-A---AA--A-T-TC-T--TGT-TAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAGT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24237 : TGACTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAG-CAA--G-AT-A-GT----G-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24238 : TGATAA---T-TGCC-T-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-TAA--G-AT-A-GA----G-GAC-A---TAGTAT-AT----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-AC-AAT-G-TTGCGC-ATG-GAGA
gi|24239 : TGACTA---C-TGAC-T-A---AA--A-T-TT-T--CAT-GAA-CAA--A-AT-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--CTGAG-AAA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GGGA
gi|24241 : TGCCTA---T-TGCC-A-A---AA--A-T-CT-C--TGT-GAC-CAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CAGTAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCTC-ATG-GAGA
gi|24243 : TGATTA---T-TGTC-T-A---AA--A-G-TC-T--TGT-GAA-TAG--G-AT-A-GA----A-GAC-A---TAACAT-TC----AT--C--AG-AGC-ATC---AT-CAG---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24245 : TGACCA---T-TG-C-T-A---AG--A-A-TC-C--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----T-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--T--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACTAAT-G-TTGCCC-ATA-GAGA
gi|24250 : TGAGTA---C-TGCC-TTA---AA--A-A-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-GT-A-GA----A-GAC-A---CAACAT-CC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGGCC-ATG-GAGA
gi|24252 : TGAGTA---C-TGCC-T-A---AA--A-A-TC-A--CGT-GAA-CAA--G-GT-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-CC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCTC-ATG-GAGA
gi|24255 : TGACTA---A-TGCC-G-A---AA--A-A--C-T--TGT-GAA-TAA--G-TC-A-GA----A-AAA-A---CAGCAT-TT----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-C-A---ACC-TCCC-ACCAAT-G-TTCCCC-ATG-GAGA
gi|24256 : TGACTA---T-TGCC-A-A---AA--A-A-TC-C--TTT-GAAACAA--G-AT-A-GA----A-GA--A---CAACAT-TC----AT--C--AG-AGATATCTGAAT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-G
gi|24257 : TGACTA---T-TGGC-C-A---AA--A-T-CC-T--TGT-GAA-CAACAG-ATCG-GA----A-GAA-T---CATCAT--C----AT--T--AG-AGA-ATC---CT-CAA---ATC-TTCC-ACAAATCG-TTGCCC-ATG-
gi|24258 : TGACTA---T-TGCC-A-A---AA--A-C-CC-T---GT-GA--CAA--G-AT-AAGA----A-GAT-A---CAGCAT-TCG---AT--T--AG-AGA-ATC---CT-TAA---ACT-TTCCCACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAAA
gi|24267 : TGACTA---T-TG-C-T-A---AA--A-A-TC-T--TGT-GAA-CAT--G-AT-A-GA----A-GCA-A---TGGCAT-TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AC-TAA---ACC-TTCC-ATAAAT-G-TTACCT-ATG-GAGA
gi|24271 : TGAGTA---C-TGCC-A-A---AA--A-A-TC-A--TGT-GAA-CAA--G-GT-A-GA----A-GAC-A-----GCAT-CC----AT--C--AG-AGG-GTC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTCCCC-ATG-GAGA
gi|24273 : TGAGTA---C-TGCC-T-A---AA--A-A-TC-A--CGT-GAA-CAA--G-TT---GA----A-GAC-A---CAGCAT-CC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24275 : TAACTA---T-TGCC-T-T---AA--A-T--C-T--TGT-GAA-CAA--G-AC-A-GA----A-GAC-A---CAGTAT-TC----AT--C--AA-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-CTCC-ATAAAT-G-TTG-CC-ATG-GAGA
gi|24277 : TGAATA---C-TGTC-T-A---AA--A-A-TC-A--TGT-GAA-CAA--G-GT-A-GA----A-GAC-A---CATCAT-CC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCA-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24279 : TGATTA---T-TGTT-G-A---AA--A-T-AC-T--TGT-GAA-TAA--G-GT-A-GA----A-GAA-A---CGGCAT-TT----AT--C--AG-AAA-ATA---AC-CAA---ACC-TTCC-GCCAAT-G-TTCCTC-ATG-GA
gi|24281 : TGACTA---T-TGCC-T-A---AA--AAT-TC-T--TGT-GA--CAC--G-AT-A-GA----A-GCA-A---TGGTAT-TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AC-TAA---ACC-TTCC-ATAAAT-G-TTACCT-ATG-GAGA
gi|24282 : TGA-TA---T-TG-C-T-A---AA--A-A-TC-T--TGT-GAA-CAC--G-AT-A-GA----A-GCA-A---TGGTAT-TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AC-TAA---ACC-TTCC-ATAAAT-G-TTACCT-ATG-GAGA
gi|24287 : TGACTA---T-TG-C-T-A---AA--A-A-TC-T--TGT-GAA-CAC--G-AT-A-GA----A-GCA-A---TGGCAT-TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AC-TAA---ACC-TTCC-ATAAAT---TTACCT-ATG-GAGA
gi|24289 : TGACTG---T-GACC-T-A---AA--A-C-CC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CATCAT-TC----AT--T--AG-AGA-ATC---AT-AAA---ACC-TTCC-A-AAAT-G-CTGTCC-ATG-GGGA
gi|24292 : TGACTA---A-TGCC-T-A---AA--A-A-TC-T--TGT-GAA-AAA--G-AT-A-GA----A-AAC-A---TAGAAT-TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-A-TAGCCCTTTG-GAGA
gi|24294 : TGACTT---T-GGTC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-AAA-CTT--G-AT-G-GA----A-GAT-A---TAGCGA-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCTC-ATG-GA
gi|24297 : TGACTA---T-TGCC-G-A---AATAA-T-CC-T--TGT-GAA-CAA-----T-A-GA----AAGAA-A---TA-CAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAAAAGACC--ACC-ACCAAT-G-TT-CCC-ATG-GA
gi|24299 : TAACTA---T-TACC-C-C---AA--A-A-CC-T--TGT-GAA-CAC--G-AT-A-GG----A-GTC-G---CAGCAT-TC----AT--C--CC-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAACT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24300 : TAACTA---T-TACC-C-C---AA--A-A-CC-T--TGT-GAA-CAC--G-AT-A-GG----A-GTC-G---CAGCAT-TC----AT--C--CC-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAACT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24302 : TGTCTA---T-TG-C-T-A---AA--A-A-TC-T--TGT-GAA-CAC--G-AT-A-GA----A-GCA-A---TGGCAT-TT----AT--C--AG-AG--ATC---AT-TAA---ACC-TTCC-ATGAAT-G-TTACCT-ATG-GAGA
gi|24378 : GACTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-AC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GT----G-GACCA---CAGCAT-TC----AC--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G--TGCCC-AGG-GAGA
gi|24379 : GACTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--GTAT-A-GT----G-GAA-A---CAGCA--TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24380 : GACTA---C-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GT----G-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---CT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24381 : GACTA---C-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GT----G-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AA-TAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24382 : GAATA---C-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-CAA-CAA--G-AT-A-GT----G-GAT-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24383 : GACTG---T-TGAC-T-G---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA-----T-A-GACACTG-GAC-A---CAGTAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAG
gi|24384 : GAATA---C-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-CAA-CAA--G-AT-A-GT----G-GAT-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACCAAT-G-TTCCCC-ATG-GAGA
gi|24385 : GACTA---T-TGCC---A---AA--A-T-TCCT--TGT-GAA-TAA--G-AC-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-TT----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TACC-ATCAAT-G-TTCCCC-TTA-GAGA
gi|24386 : GACTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGC-GAG-CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-T---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CCA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24387 : GACTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGC-GAG-CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-T---CAGCAT-TC----AA--C--AG-AGA-ATA---AT-CCA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24390 : GACTA---T-TGTC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAG--G-A--------------C-T---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24391 : GACTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--A-AT-G-GA----G-GGC-T---CAGTAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24392 : GACTA---T-TGAC-T-G---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--A-AT-G-GA----G-GGC-T---CAGTAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ATAAAT-G-TTGCTC-ATG-GAGA
gi|24393 : GACTA---T-TGTC-T-A---AA--A-A-TT-T--TGT-GAG-CAA--G-AC-A-G-------GAC-T---CGGCAC-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCTC-ATG-GAGA
gi|24398 : GACTA---C-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TTT-GAA-CAA--G-AT-A-AA----G-GAT-G---CGACAT-TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-CAA---ACT-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24402 : GACTA---T-TGAC-T-A---AA--G-T-TC-T--TGT-GA--CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-T---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAC---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCT-ATG-GAGA
gi|24405 : GACTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G------------------------GTAT-TG----AT--T--AG-AGA-AGC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24407 : GAGTA---A-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TTT-GAA-CAA--G-AT-A-TA----A-GAT-T---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGTCC-ATG-GAGA
gi|24408 : GACTG---TGTGTC-C-A---GA--A-C-T--T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGCAT-CC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTAC-ACAAAT-G-TTGTCC-ATG-GAG
gi|24412 : GAGTA---C-TGCC-T-A---AA--A-CATC-A--TGT-GAA-CAA--G-GT-A-GA----A-GAT-A---CAACAT-CC----TT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-AAG-GAGA
gi|24433 : ACTA---T-TGCC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAT-CAA--G-AT-A-AA----A-AAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-AAGA
gi|24437 : ACTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GT----G-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GA
gi|24438 : ACTA---T-TAAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--A-AT-A-GA----G-GAC-T---CAGCAT-TC----TT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAGAT-G-TTGTCC-ATG-GAGA
gi|24439 : ACTA---T-TGAC-T-A---GA--A-T-TC-T--TTT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GAT-G---CAGCAT-TC----GT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTGG-ACAAAT-G-TTGCCC-ATA-GAGA
gi|24441 : ACTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-TAA-TAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AAA-AAT---GT-TAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24445 : ACTA---T-TGAC-T-GTCTCA--A-TATC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24446 : ACTA---T-TGCC-GGA---AA--A-T-CC-T--TGTTGAA-TCA--G-AT-A-GA----ATGAA-A---CAGCAT-TT----CTTTC--AG-AGA-ATC---ATTCAG---ACC-TATC-ACAAAT-GGTTGCCC-ATG-GAGA
gi|24451 : ATTA---T-TGAT-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-G-GA----G-GAC-T---TATCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24452 : ACTT---T-TGCT-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-AAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAG---AAC-TTCC-ACAGAT-G-TTGCCC-ATG-AAAA
gi|24455 : ACTA---T-CGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GCA-CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-A---TAACAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ATAAAT-G-TTGCAC-ATG-GA
gi|24456 : ATTA---T-TGTC-T-A-----------TC-T--TGT-GAT-CAA--A-AT-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-TC----CT--C--AG-AGA-ACC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGTCC-ATG-GAGA
gi|24479 : CTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-T---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-GAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24480 : CTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-T---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-GAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24481 : CTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-T---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-GAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24482 : CTA---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-T---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-GAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24483 : CTA---T-TGCC-T-T---AA--A-A-TC-T--TGT-AAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---CAACAT-TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---CCT-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAAA
gi|24493 : TA---TGTGTC-T-A---AA--A-T-G--T--TAT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GGG-A---GGGCAT-TT----AT--C--AG-AGT-ATC---AT-CAA---ACC-TTCT-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24502 : A---T-TGCT-T-A---AA--A-T-CC-T--TTT-GAT-TAA--A-AT-A-GA----A-ACC-C---CAACAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-A-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24504 : A---T-TGCC-T-A---AA--A-A-TC-T--TGT-TAA-CAA--G-AT-A-GG----A-GAC-AGATCAGCAT-TC----AT--T--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-A-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24507 : A---C-TGCC-T-A---AA--A-T--C-A--CGT-AAA-CAA--G-GT-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-CC----AT--C--AG-AGT-ATC---AT-CAA---ACC-CTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24515 : ---T-TGAC-T-A---AA--A-T-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----G-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-GTGCCC-ATG-GAGA
gi|24517 : ---T-TGCT-T-A---AA------TT-T--TGT-GAA-CAA--G-AA-A-GA----A-AAC-A---TAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACT-TTCC-ACAAAT-G-TTGTCT-TTG-GAGA
gi|24526 : -TGTC-T-G---AA--A-T--C-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGCAT-TT----AT--C--GG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTCCCC-ATG-GAGA
gi|24527 : -TGTC-C-A---GA--A-C--C-T--TGT-GTA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGTAT-TCTGACAT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GA
gi|24534 : C-C--TGT-TAA-TAA--A-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGCAT-TC----AT--C--AG-AGA--TC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATGAGAGA
gi|24535 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGCAT-TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAG
gi|24536 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGTAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24537 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGTAT-TT----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-GAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24538 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-G
gi|24542 : ccggaaaC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGCAT-TC----AT--C--AG-AAG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCT-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24543 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTACTC-ATA-GAGA
gi|24544 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGAAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAG---ACC-TTCC-AAAAAT-G-TTGCCT-ATG-GAGA
gi|24545 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-AGC-A---AGGCAT-TA----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACCTTTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-AAG
gi|24546 : ccgagacC-T--TGT-AAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCT-A---GGACAT-TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCT-ATG-GAGA
gi|24556 : ccggaacC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-TTA-A---GAGCTT-TC----AT--C--AG-AAA-ATC---AT-CAA---AAC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAG
gi|24563 : cggaac-A---AA--A-T--A-T--TGT-GAA-CAA--G-GT-A-GA----A-GAA-A---CAGCAT-TC----AT--T--AG-AGG-ATC---AT-CAA---GCC-TCCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24577 : ---AA--A-T-TC-T--TGT-AAA-CAA--A-AG-A-GT----G-GAC-A---CAACAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAGT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24582 : -T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GTA-A---GGGCAT-TC----AT--T--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24583 : aacctA--A-C-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A--A----A-GCA-A---GGGTAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24584 : A--A-C-TC-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---AGGTAT-TC----AT--A--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACT-TTCC-ACAAAT-G-TTCCCC-ATG-GAGA
gi|24586 : A--A-T-TC-TCATAT-TAA-TAA--G-GG-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-CC----AT--C--AG-AGG-ACC---AT-CAA---ACC-TTTC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA
gi|24588 : A--A-T-TC-C--TGT-GAG-CAAA-G-AT-A-GA----A-GAC-A---AAGCAT-TC----AT--C--AT-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATA-GA
gi|24599 : C-T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-AA----A-GCA-A---GGGCAT-TC----AT--C--AGGAGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-AAAA
gi|24613 : cC-T--TGT-GAG-CAA--G-AT-A-GA----A-GAC-A---CAGCAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTTC-ATAAAT-G-TTGCAC-ATG-GAGA
gi|24618 : -T--TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGTAT-TC----AT--C--AG-AGA-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-A-TTGCTC-ATG-GAGA
gi|24630 : --TGT-GAA-CAA--G-AT-A-GA----A-GCA-A---GGGTAT-TC----AT--C--AG-AGG-ATC---AT-CAA---ACC-TTCC-ACAAAT-G-TTGCCC-ATG-GAGA