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blockSeqs                     :       A    TATACT  ATATAAC C     GAAGGA A . TGGA  A T    CAA     TT  CAA AA  T GC C CATCCT  C  AG          CTG  CATCG A C A  AA A CGG G   G   T  A
blockSeqs                     :       .    .       .       .     .      . . A     . A    T       TT  .   .   T G  C .       .  A           .    .     G C .  .  . .   .   .   T  .
blockSeqs                     :       .    .       .       .     .      . . T     . .    .       TT  .   .   T .  C .       .  .           .    .     . . .  .  . .   .   .   T  .
blockSeqs                     :       .    .       .       .     .      . . G     . .    .       T   .   .   . .  C .       .  .           .    .     . . .  .  . .   .   .   T  .
blockSeqs                     :       .    .       .       .     .      . . T     . .    .       .   .   .   . .  C .       .  .           .    .     . . .  .  . .   .   .   A  .
blockSeqs                     :       .    .       .       .     .      . . T     . .    .       .   .   .   . .  C .       .  .           .    .     . . .  .  . .   .   .   A  .
blockSeqs                     :       .    .       .       .     .      . . A     . .    .       .   .   .   . .  C .       .  .           .    .     . . .  .  . .   .   .   T  .
blockSeqs                     :       .    .       .       .     .      . . T     . .    .       .   .   .   . .  C .       .  .           .    .     . . .  .  . .   .   .   T  .
blockSeqs                     :       .    .       .       .     .      . . T     . .    .       .   .   .   . .  C .       .  .           .    .     . . .  .  . .   .   .   T  .
blockSeqs                     :       .    .       .       .     .      . . T     . .    .       .   .   .   . .  C .       .  .           .    .     . . .  .  . .   .   .   T  .
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blockSeqs                     :       .    .       .       .     .      . . T     . .    .       .   .   .   . .  C .       .  .           .    .     . . .  .  . .   .   .   A  .
blockSeqs                     :       .    .       .       .     .      . . T     . .    .       .   .   .   . .  T .       .  .           .    .     . . .  .  . .   .   .   A  .
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blockSeqs                     :       .    .       .       .     .      . . C     . .    .       .   .   .   . .  A .       .  .           .    .     . . .  .  . .   .   .   T  .
blockSeqs                     :       .    .       .       .     .      . . T     . .    .       .   .   .   . .  C .       .  .           .    .     . . .  .  . .   .   .   A  .
blockSeqs                     :            .       .       .     .      . . .     . .    .       .   .   .   . .  . .       .  .           .    .     . . .  .  . .   .   .   A  .
blockSeqs                     :                    .       .     .      . . .     . .    .       .   .   .   . .  . .       .  .           .    .     . . .  .  . .   .   .       
blockSeqs                     :                                  .      . . .     . .    .       .   .   .   . .  . .       .  .           .    .     . . .  .  .                 
blockSeqs                     :                                                   . .    .       .   .   .   . .  . .       .  .           .    .     . . .  .  .                 
blockSeqs                     :                                                                                             .  .                                                  


blockSeqCons                  :                                             T***
originalCons                  : TTATCA-TATA------CT-------T-GGTAG------T-G-AT---TA-T-GCAG---AATCT--GC---A--TG-G--CCT------GA-TA--TGGATGACGT---CA-----C-A-A-TC--A-C---C-CAT-ATCNGC-ACGCCGTGCAA
finalCons                     : TTATCA-TATA------CT-------T-GGTAG------T-G-AT---TA-T-GCAG---AATCT--GC---A--TG-G--CCT------GA-TA--TGGATGACGT---CA-----C-A-A-TC--A-C---C-CAT-ATCNGC-ACGCCGTGCAA





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lowQualScore                  :       .    ......  ....... .     ...... . . ....  . .    ...     ..  ... ..  . .. . ......  .  ..          ...  ..... . . .  .. . ... .   .   .  .           
lowQualScore                  :       7    888888  2222222 6     444444 5 5 2222  5 0    111     66  666 00  4 55 2 333333  4  44          666  77777 0 0 5  00 5 888 6   6   0  7           
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Reference ( family-658 )      : TTATCA-TATA------CT-------T-GGTAG------T-G-AT---TA-T-GCAG---AATCT--GC---A--TG-G--CCT------GA-TA--TGGATGACGT---CA-----C-A-A-TC--A-C---C-CAT-ATCNGC-ACGCCGTGCAA
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gi|132909                     :                              GTAG------T-G-AT---TG-T-GCAA---AATCT--GC---A--TG-A--CAT------GA-TA--TGGATCACGT---CA-----C-A-A-TC--A-C---C-CAT-ATCTGC-ACGCCGTGCAA
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gi|132911                     :                                                                                           aA-TA--TGGATGACGT---CA-----C-A-T-TC--A-C---CGAAT-ATTAGC-AC-CTGTGCAAaaaa