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Reference ( gi|99896 ) : ATTT-TAAA-TT-CTTAAAAA--CGGGTA-T-TT-AGAACTGG-AGGCCAA-TGTT-AAC--T-TT----ATA--A-TACAA--A---TTA---ACG-ACTCA-------ATG--C---------T-CAT--GGACC-T----G-C--G-TAG-CT--CAGT-TGGTAA-CG---C-T-C--GGGACCGCC----AA-CCGCG-ACGTC-G-TGA---GTTCG-AC--TCCCC-GC-G-TCGGCG-TTG-ACACA-AATTTT-C--TTT-CT-T-CACA-TA-TT-TCGG---CA--AT--A-GTG--C--TAT-AGT--A------CTATTT-C-G--GCA-TAG-TGC-ACGGTC---G--C-TACA-T--A--T--A-TT-CA---TAG--A-----A-C---ACTA-T-GCG-A--AA-ATG----GT--GCA-ATA-G-TG--A--T-------TA---T-AT---A-GGGAGAAGC-T-AACA-GG-AAGC--ATAATAAT
gi|99897 : ATTT-TAAA-TT-CTTAAAAA--CGGGTA-T-TT-AGAACTGG-AGGCCAA-TGTT-AAC--T-TT----ATA--A-TAAAA--A---TTA---ACG-ACTCA-------TTT--C---------T-CAT--GAGCC-T----G-C--G-TAG-CT--CAGT-CGGTAA-CG---C-T-C--CGGACCGCC----AA-CCGCG-ACGCC-A-AGA---GTTCG-AC--TCCCC-GC-G-TCGGCG-TTG-ACACA-AATTTT-A--TTT-CT-T-C-CT-TG-TT-TAGG---C---AT--A-GTG--C--TAT-GGT--A------CTATTT-C-G--GCA-TAG-TGC-ACGGTC---G--C-AGCA-T--A--A--A-AT-CA---TAG--A-----A-C---ACTG-T-GCG-A--AA-ATG----GT--GGA-ATA-G-TG--A--T-------TA---C-AT---A-GGGAGAAGC-T-AACA-GG-AAGCA-ATAATAAT
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gi|99898 : ATTT-TAAA-TT-CTTAAAAA--CGGGTA-T-TT-AGAACTGG-AGGCCAA-TGTT-AAC--T-TT----ATA--A-TAAAA--A---TTA---ACG-ACTCA-------TTT--C---------T-CAT--GAGCC-T----G-C--G-TAG-CT--CAGT---GTAA--G---C-T-C--CGGACCGCC----AA-CCGCG-ACGCC-A-AGA---GTTCG-AC--TCCCC-GC-G-TCGGCG-TTG-ACACA-AATTTT-A--TTT-CT-T-CCCT-TG-TT-TAGG---C---AT--A-GTG--C--TAT-GGT--A------CTATTT-C----GCA-TAG-TGC-ACGGTC---G--C-AGCA-T--A--A--A-AT-CA---TAG--A-----A-C---ACTG-T-GCG-A--AA-ATG----GT--GGA-ATA-G-TG--A--T-------TA---C-AT---A-GGGAGAAGC-T-AACA-GG-AAGC--ATAATAAT
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Reference ( family-653 ) : ATTT-TAAA-TT-CTTAAAAA--CGGGTA-T-TT-AGAACTGG-AGGCCAA-TGTTAAC--T-TT----ATA--A-TAAAA--A---TTA---ACG-ACTCA-------ATG--C---------T-CGT--GGGCC-T----G-C--G-TAG-CT--CAGTC-GGTAA-CG---CTCC--GGACCGCC----AA-CCGCG-ACGTC-G-TGA---GTTCG-AC--TCCCC-GC-G-TCGGCG-T-TA-ACAC-A-AATTTT-A-TTTCT-T-CACG-TA-TT-TCGG---CA--AT--A-GTGC--TATAGT--A------CTATTT-C-G--GCA-TAG-TGC-ACGGTC---G--C-TACA----TAAA-T---T-CA---TAG--AA-C---ACTA-T-GCG-A--AA-ATGG----TGG--AA------TA-G-TG--A--T-------TA---T-A-T---A-GGGA---GAA--GC-T-A-AC----A-GG-AAGC--ATAA-TAAT
gi|99896 : ATTT-TAAA-TT-CTTAAAAA--CGGGTA-T-TT-AGAACTGG-AGGCCAA-TGTTAAC--T-TT----ATA--A-TACAA--A---TTA---ACG-ACTCA-------ATG--C---------T-CAT--GGACC-T----G-C--G-TAG-CT--CAGTT-GGTAA-CG---CTCG--GGACCGCC----AA-CCGCG-ACGTC-G-TGA---GTTCG-AC--TCCCC-GC-G-TCGGCG-T-TG-ACAC-A-AATTTT-C-TTTCT-T-CACA-TA-TT-TCGG---CA--AT--A-GTGC--TATAGT--A------CTATTT-C-G--GCA-TAG-TGC-ACGGTC---G--C-TACA----TATA-T---T-CA---TAG--AA-C---ACTA-T-GCG-A--AA-ATGG----TGC--AA------TA-G-TG--A--T-------TA---T-A-T---A-GGGA---GAA--GC-T-A-AC----A-GG-AAGC--ATAA-TAAT
gi|99897 : ATTT-TAAA-TT-CTTAAAAA--CGGGTA-T-TT-AGAACTGG-AGGCCAA-TGTTAAC--T-TT----ATA--A-TAAAA--A---TTA---ACG-ACTCA-------TTT--C---------T-CAT--GAGCC-T----G-C--G-TAG-CT--CAGTC-GGTAA-CG---CTCC--GGACCGCC----AA-CCGCG-ACGCC-A-AGA---GTTCG-AC--TCCCC-GC-G-TCGGCG-T-TG-ACAC-A-AATTTT-A-TTTCT-T-C-CT-TG-TT-TAGG---C---AT--A-GTGC--TATGGT--A------CTATTT-C-G--GCA-TAG-TGC-ACGGTC---G--C-AGCA----TAAA-A---T-CA---TAG--AA-C---ACTG-T-GCG-A--AA-ATGG----TGG--AA------TA-G-TG--A--T-------TA---C-A-T---A-GGGA---GAA--GC-T-A-AC----A-GG-AAGCA-ATAA-TAAT
gi|99898 : ATTT-TAAA-TT-CTTAAAAA--CGGGTA-T-TT-AGAACTGG-AGGCCAA-TGTTAAC--T-TT----ATA--A-TAAAA--A---TTA---ACG-ACTCA-------TTT--C---------T-CAT--GAGCC-T----G-C--G-TAG-CT--CAGT---GTAA--G---CTCC--GGACCGCC----AA-CCGCG-ACGCC-A-AGA---GTTCG-AC--TCCCC-GC-G-TCGGCG-T-TG-ACAC-A-AATTTT-A-TTTCT-T-CCCT-TG-TT-TAGG---C---AT--A-GTGC--TATGGT--A------CTATTT-C----GCA-TAG-TGC-ACGGTC---G--C-AGCA----TAAA-A---T-CA---TAG--AA-C---ACTG-T-GCG-A--AA-ATGG----TGG--AA------TA-G-TG--A--T-------TA---C-A-T---A-GGGA---GAA--GC-T-A-AC----A-GG-AAGC--ATAA-TAAT
gi|99899 : ATTT-CGAT-TT-CTTAAAAA--CGGGTA-T-TT-AGAACTTG-AGGCCAA-TGTTAAC--G-TT----ATA--A-TAAAA--A---TTA---ATG-ACTCA-------ATG--C---------T-CAT--GGGCC-T----G-C--A-TAG-CT--CAGTC-GGTAA-CG---CTCC--GGGCCGCC----AA-CAGCG-ACGTC-G-TGA---GTTCG-AC--TCCCT-GC-G-TCGGTG-T-TA-ACAC-A-AATTTT-A-TCTCT-T-CACG-TA-TA-TCGG---C---AT--A-GTGCTATATAGT--A------CTATTT-C-G--GCA-TAG-TGC-ACGGTG---G--C-TAAA----TAAA-T---T-CA---TAG--AA-C---ACTA-T-GCG-A--AA-ATTG----TGG--AA------TA-G-TA--A--T-------TA---T-A-T---A-GGGA---GGA--GC-T-A-AC----A-GG-AAGC--ATAA-TAAT
gi|99900 : ATTT-TAAA-TT-CTTAAAAA--CGGGTA-A-TT-AGAATTGG-AGGCTAA-TGTTAAC--T-TT----ATA--A-TAAAA--A---TTA---ACG-ACTCG-------ATG--C---------T-CAA--GGGCC-T----G-C--A-TAG-CT--CAGTC--GTAA-CG---CTCC--GGACCGCC----AT-CTGCA-ACGTC-G-TGA---GTTCG-AC--TCCCC-GC-A-TCGGTG-G-TA-ACACAA-AATTTTAA-TTTCT-T-CACG-TA-TT-TCGG---C---AT--A-GTGC--TATAGT--A------CTATTT-T-G--GCA-TAG-TGC-ACGGTC---G--C-T--A----TAAA-T---T-CA---TAA--AA-C---ATTA-T-GCG-A--AA-ATGG----TGG--AA------TA-G-TG--AT-T-------TA---T-A-T---A-GGGA---GTA--GC-A-A-AC----A-GG-AAGC--ATAA-TAAT
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Reference ( family-653 ) : ATTT-TAAA-TT-CTTAAAAA--CGGGTA-T-TT-AGAACTGG-AGGCCAA-TGTTAAC--T-TT----ATA--A-TAAAA--A---TTA---ACG-ACTCA-------ATG--C---------T-CGT--GGGCC-T----G-C--G-TAG-CT--CAGTC-GGTAA-CG---CTCC--GGACCGCC----AA-CCGCG-ACGTC-G-TGA---GTTCG-AC--TCCCC-GC-G-TCGGCG-T-TA-ACAC-A-AATTTT-A-TTTCT-T-CACG-TA-TT-TCGG---CA--AT--A-GTGC--TATAGT--A------CTATTT-C-G--GCA-TAG-TGC-ACGGTC---G--C-TACA----TAAA-T---T-CA---TAG--AA-C---ACTA-T-GCG-A--AA-ATGG----TGG--AA------TA-G-TG--A--T-------TA---T-A-T---A-GGGA---GAA--GC-T-A-AC----A-GG-AAGC--ATAA-TAAT
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . . . . . . . . . . . . CG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . AT . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . AC . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . G . . . . . . . . . . . . CG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . AT . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . . . . . G . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . A . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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originalCons : ATTT-TAAA-TT-CTTAAAAA--CGGGTA-T-TT-AGAACTGG-AGGCCAA-TGTTAAC--T-TT----ATA--A-TAAAA--A---TTA---ACG-ACTCA-------ATG--C---------T-CGT--GGGCC-T----G-C--G-TAG-CT--CAGTC-GGTAA-CG---CTCC--GGACCGCC----AA-CCGCG-ACGTC-G-TGA---GTTCG-AC--TCCCC-GC-G-TCGGCG-T-TA-ACAC-A-AATTTT-A-TTTCT-T-CACG-TA-TT-TCGG---CA--AT--A-GTGC--TATAGT--A------CTATTT-C-G--GCA-TAG-TGC-ACGGTC---G--C-TACA----TAAA-T---T-CA---TAG--AA-C---ACTA-T-GCG-A--AA-ATGG----TGG--AA------TA-G-TG--A--T-------TA---T-A-T---A-GGGA---GAA--GC-T-A-AC----A-GG-AAGC--ATAA-TAAT
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Reference ( family-653 ) : ATTT-TAAA-TT-CTTAAAAA--CGGGTA-T-TT-AGAACTGG-AGGCCAA-TGTTAAC--T-TT----ATA--A-TAAAA--A---TTA---ACG-ACTCA-------ATG--C---------T-CGT--GGGCC-T----G-C--G-TAG-CT--CAGTC-GGTAA-CG---CTCC--GGACCGCC----AA-CCGCG-ACGTC-G-TGA---GTTCG-AC--TCCCC-GC-G-TCGGCG-T-TA-ACAC-A-AATTTT-ATTTCT-T-CACG-TA------TT-TCGGC-AT----A-GTGC--TATAGT--A------CTATTT-C-G--GCA-TAG-TGC-ACGGTC---G--C-TACA----TAAA-T---TCA---TAG--AA-C---ACTA-T-GCG-A--AA-ATGG----TGG--AA------TA-G-TG--A--T-------TA---T-A-T---A-GGGA---GAA--GC-T-A-AC----A-GG-AAGC--ATAA-TAAT
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gi|99909 : atttaattcttaaaaacaggtatttaaaaaatggagatcaatgtaactgttgttgataaaaaaagtattgtcgactcaatgctctgggccttgcgtagtcgtggtaacgctcccgacgggtaacatatggtTTT-TACA-TT-CTTAAAAAAACGGGTA-T-TT-AGAACTGG-GAGGCAA-TGTTAA---T-TT----ATA--A-TAAAA--A---TTA---ACG-ACT---------ATG--C---------T-TGT--GGGCC-T----G-C--G-TAG-CT--CAGTC-GGTAA--G---CTCC--CGAC-GCC----A--CCGCG-ACGTC-G-TGA---GTTCG-AC--TCCCC-GC-G-TCGGCGGT-TC-ACAC-ATAATTTTTATTTCT-TTCACA-TA------TT-TCGGC--T----A-GTGC--TATAGT--A-------TATTT-C-G--GCAATAG-TGC-ACGGTC---G----TACA----TAA--T---TCA---TAG--AA-----ACTA-T-GCG-A--AA-CTGG----TGG--AA------TA-G-TG--A--T-------TA---T-A-T---A-GGGA---GAA--GC-T-A-AC----A--G-AAGCATATAA-TAAT
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gi|99916 : AC--T-TT----ATA--A-TAAAG--A---TTA---ACG-ACTCA-------ATG--C---------T-TGT--GGGCC-T----G-C--T-TAG-CT--CAGTC-GGT--------------------------AA-CCGCA-ACGTC-GTTGA---GTTCG-AC--TCCAC-GC-A-TCGCCG-T-TA-ACAC-A-AATTTT-ATTTCT-T-CACG-AA------TT-TCGGC-AT----A-GTGC--TGTAGC--A------CTATTT-C-G--GCA-TAG-TGC-ACGGTC---G--C-TACA----TAAA-T---T-A---TAG--AA-A---AC---T-GCGAA--AA-ATGA----TGGGAAA------TA-T-AG--A----------TA---T-A-T---A-GGGA---GAA--GCTT-C-AC----A-GGAAAGC--ATAA-TAAT
gi|99917 : GCC-C----G-C--G-TAG-CT--CAGTC-GGTAG-AG---CATC--AGACTTTT----AATCTGAG-G-GTC-T-TGG---GTTCG-AG--TCCCA-AC-G-TGGGCG--------AC-T-TGTTTT-ACTTCT-
gi|99918 : CC-T----G-C--G-TAG-CT--CAATC-GGTAA-CG---CTCC--GGACTTCT----AA-TCGCG-ACGTC-G-TGA---GTTGG-AC--TTGGC-GA-A-ACGGTG-A-AA-ATAC-A-AATTTTAATTTCT-T-CATG-TA------T--------AC----C-GTGC----------A------CTATTT-C-G--GCA-TAG-TAC-ACAGCC---G--C-TATA----TAAA-T---TCA---AAG--AA-C---AATT-T-CCA-AATAA-ATGG----TGG--AG------TA-G-TG--A--T-------TA---T-G-T---A-GTGG---AAA--TC-T-A-AC----A-GG-AAGC--TTAA-TA
gi|99919 : A-CCGCG-ACGTC-G-TGA---GTTCA-AC--TCCCC-GC-G-TTGCCG-
gi|99920 : TTTCT-T-CACT-TAA-----TT-TCAGC-AT----AAGTGC--CATAGTCAA------CTATTTAC-G--GCA-TAG-TGC-AC--TC---GATT-TGCAGTATTAAT-T---TCA---TAACAAA-C---A-TA-TTGCA-A--AT-ATGG----TGG--AA------TACG-TG--AAGC-------TA---T-A-TTTTA-GGAA----AC--GC-T-A-AC----A-GG-AAGT--AT
gi|99921 : -TA------TT-TCGGC-AT----A-GTGC--TACAGT--A------CTATTT-T-G--GCA-TGT-TGC-ACGGTC---G--T-TACA----TAAA-T---TCA---AAG--AG-C---ACTA-G-GCA-A--AA-ATGG----TGG--GA------TT-G-TG--A--T-------T
gi|99922 : GC--TGTGCT--A------CTGCTT-C-A--ACA-TAG-TGCCATTGTCTACG--C-TATG----TGAA-TCATTCA---TG------T---ACTA-T-GCC-A--AA-ATAG----TGG--AG------TA-GCTG--A--TGTATAAATA---T-A-G---A-AGGA---GA
gi|99923 : ATTT-C-G--GCA-TAG-TGC-ACGGTC---G--C-TATA----TAAA-A---TCA---TAA--AA-C---ACTA-T-GCG-A--AA-ATGG----TGC--AG------TA-G-TG--A--T-------TA---T-A-T---A-GGGA---GAA--GC-T-A-AC----A-GG-AAGC--ATAA-TAAT
gi|99924 : A----TAAA-T---TAA---GAA--AA-C---ACTAAT-GCG-AGAAA-ATGG----TGG--AA------TA-G-TG--A--T-------TAATCT-A-T---A-G