lowQualScore                  :           11                                                               11111111   55555555                                                                                                    111111  2222222222222222222222222         2                                                                                                                                333333                                                                          444444444444444444444444444444444   111                           1111111111                               111111                                         3                                  
lowQualScore                  :      66   55  2 2      2     55 0   33 2    666       777 33   4  2 5555 2 00000000   33333333     4   2       4      2   22 666666 222 2 22    2 2 22 2  2 6 2 1 55  666666   22   55     333    000000  1111111111111111111111111      22 2 66666 1  1      3  333 1   1 44  1 777  22   5555555 1  1      666    1   333   1  22  1        9  22 3     333  1 1   1 1 1 1 444444   1      1   1   1   1   1 1   3333  1      2 2 22  999  0   2 2  22 22  333333333333333333333333333333333   222     22  3    2 4444  8888 8888888888 4444  77777       55  2 55  2 222222     2  33  9999999                      5       2        3   3   1         
lowQualScore                  :      ..   ..  . .      .     .. .   .. .    ...       ... ..   .  . .... . ........   ........     .   .       .      .   .. ...... ... . ..    . . .. .  . . . . ..  ......   ..   ..     ...    ......  .........................      .. . ..... .  .      .  ... .   . ..  . ...  ..   ....... .  .      ...    .   ...   .  ..  .        .  .. .     ...  . .   . . . . ......   .      .   .   .   .   . .   ....  .      . . ..  ...  .   . .  .. ..  .................................   ...     ..  .    . ....  .... .......... ....  .....       ..  . ..  . ......     .  ..  .......                      .       .        .   .   .         
lowQualScore                  :      77   44  5 5      5     99 2   44 5    555       444 22   7  4 0000 7 99999999   11111111     4   2       4      2   99 111111 777 1 99    1 1 99 1  1 3 1 3 88  111111   99   00     333    777777  0000000000000000000000000      66 9 77777 9  8      6  000 7   8 33  8 111  55   9999999 8  8      888    8   333   3  66  9        0  55 6     222  8 8   8 3 8 8 888888   7      7   7   8   8   8 8   9999  8      0 0 88  000  1   2 2  99 99  111111111111111111111111111111111   555     88  3    1 5555  7777 9999999999 7777  88888       33  2 33  2 888888     4  22  5555555                      4       5        9   1   4         
consensus                     : ATCAAC-ACAA-TA-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT--C-ATAA---TCTGTTT---A--TTT-AT-C----ACA--------TATT-------ACGTT-AAC-AAATCAA-TATTTA-GTG--T------T-A-C-T--TTCA-T-C--A-AT-T-A-ACT--CA------CAA--AGG--TGAAA---ATTG------GT-------------------------GGTGAA--AGT-----G-TA-CAAAAT-GA---A-AAA-T--TC-G--CAA--TTA-------T-TA-CAAAAT---TACA-TAT---TTTTGG--GC-ATATTTTCGTA--A-TTTCA---TG-T-TTA-ACC-A-C---CC-TTT-TTTCTT-CTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-T--TG---CATTTG-A-AA--A--GT----------A-T------AA--A-AAT----ATAGC--ACTTT--ACTGGCT-T----TT----T-T---T----T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--TA--C----CCCCTTATCGGTCAATTACTAT-AAACTTC-ACTGAAAANTTA-AGGAAATATGTTT
Reference ( gi|81344 )        : ATCAAT-ACAT-TA-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT--C-ATAA---TCTGTTT---A--TTT-AT-C----ATA--------TAT--------ACGTT-AAC-AAATCAA-TATTTA-GTG--T------T-A-C-T--TTCA-T-C--A-AT-T-A-ATT--CA------CAA--AGG--TGAAA---ATTG------GT-------------------------GGTGAA--A-T-----G-TA-CAAAAT-GA---A-AAA-T--TC-G--TAA--TTA-------T-TA-CAAAAT---TACA-TAT---TTTTGG--GC-ATATTTTCTTA--A-TTTCA---TG-T-TTA-ACC-A-C--ATT-TTT-TTTCTT-CTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-T--TG---CATTTG-A-AA--A--GT----------A-T------AA--A-AAT----TTAGG--ACTTT--ACTGGCT-T----TT----T-T---T----T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--TA--C----CCCCTTATCGGTCAATTACTATAAAACTTC-ACTGAAAATTTA-AGGAAATATGTTT
gi|81345                      : ATCAAC-ACAA-TA-G-GAA-GC-AAAATG-AATTT--C-ATAA---TCTGTTT---A--TTT-AT-C----GCA--------TATT-------ACGTT-GAT-AAATCAA-TATTTA-GTG--T------T-T-C-T--TTCA-T-C--A-AT-T-A-ACT--CA--------A--AGA--TGAAA---ATCG------GT-------------------------GGTGAA--AGT-----G-TA-CAAAAT-GC---T-AAA-T--TC-G--CAA--TGA-------T-TA-CAAAAT---AACA-CAT---TTTTTA--GC-ATATTTTCGTA--A-TTTCA---TG-T-TTC-ACC-A-C---CC-TTT-TTTCTT-CTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-T--TG---CATTTG-A-AA--A--GT----------A-TG-----AA--A-AAT----ATAGC--ACTTT--ACTGGCT-T----TT----T-TC--T----T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-AAGATGTACATG-TA--TA-------CCCCTTATCGGTCAATTATCAT-AAACTTC-ACTGAAAAGTTA-AGGAAATAT
gi|81347                      : ATCAAC-ACAC-TA-A-GTAAGC-AAAAT--AATTT--C-ATAA---TCTGTTT---A--TTT-AT-C----ACA--------TATT-------ACGAT-AAC-AAAGCAA-TATCTA-GTG--T------C-A-T-T--TTCA-T-T--A-AT-T-A-ACT--CA------CAA--AGG--TGAAA---ATTG------AT-------------------------TGTGAA--A-GA----G-TA-CAAAAT-GA---A-AAA-T--TC-T--CAA--TTA-------A-TA-CAAAAT---TACA-TAT---TTT-GG--GC-ATATTTTCATA--A-TTTT----TA-T-TTA-ACC-A-C----T-TTT-TTTCTT-CTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-GTT--TG---CA-TTG-A-AA--A--GT----------A-T------AA--A-AAT----ATAGC--CCTTC--ATTGACT-T----TTTTTCT-T---T----T----TGT----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--T---C----CCCCTTATCGGTCAATTACTAT-AAACTTC-AATGAAAGGTTA-AGGAAATATGTT
gi|81346                      : ATCAAC-ACAA-TA-G-GAAAGT-GAA-T--AATTT--C-ATAA---TCTGTTT---A--TTT-AT-C----GCA--------TATT-------ACGTT-AAT-AAATCAA-TATTTA-GTG--T------T-T-C-T--TTCA-T-C--A-AT-T-A-ACT--CA--------A--AGA--TGAAA---ATTG------GT-------------------------GATAAA--AGT-----G-TA-CAAAAT-GA---T-AAA-T--TC-G--CAA--TTA-------T-TA-CAAAAT---TACA-CAT---TTTTGG--GC-ATATTTTCGTA--A-TTTCA---TG-T-TTA-ACC-A-C----C-TTT-TTTCTT-TTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-T--TG---CATTTG-A-AA--A--GT----------A-TG-----AA--A-AAT----ATAAC--ACTTT--ACAGGCT-TTTTGTT----T-C---T----T----TG-----TAC--CTG-TC-T--GT-AAGATGTACATG-TA--AA--C----CCCCTTATCGGTCAATTATTAT-AAACTTC-ACTTAAAAGGTA-TGGAAATATGTTT
gi|81349                      : ATCAAC-ACAA-TA-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT--T-ATAA---TATGTTT---A--TTT-AT-C----ACA--------TATTACATTGTACGTT-AAC-AAATCAG-TATTTA-GTG--T------T-A-C----TTCA-T-C--A-AA-T-A-ACT--CA------CAA--AGA--TGAAA---AGTG------GT-------------------------GGTGAA--AGT-----G-TA-CAAAAC-GA---A-AAA-T--TC-G--CAA--TTA-------T-TA-CAAAAT---AACA-TAT---TTTGGG--GC-ATATTTTCGTA--A-TTTCA---TG-T-TTA-GAC-A-C---CC-TTT-TTTCTT-CTT-TAG-AA------A-AAT----AT-A-----------------------A-AA--A--AT----------A----------------------TAGC--ACTTT--ACTGGCT-T----TT----T-G---TAC--T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--TA--C----CCCCATATCGGTCAATTACTAT-AAACTTC-ACTGAAAATTTA-A
gi|81351                      : ATCAAC-ACAA-TA-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT--T-ATAA---TATGTTT---A--TTT-AT-C----ACA--------TATTACATTGTACGTT-AAC-AAATCAG-TATTTA-GTG--T------T-A-C-T--T-CA-T-C--A-AA-T-A-ACT--CA------CAA--AGA--TGAAA---AGTG------GT-------------------------GGTGAA--AGT-----G-TA-CAAAAC-GA---A-AAAAT--TC-G--CAA--TTA-------T-TA-CAAAAT---AACA-TAT---TTTGGG--GC-ATATTTTCGTA--A-TTTCA---TG-T-TTA-GAC-A-C---CC-TTT-TTTCTT-CTT-TAG-AA------A-AAT----AT-A-----------------------A-AA--A--AT----------A----------------------TAGC--ACTTT--ACTGGCT-T----TT----T-G---TAC--T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--TA--C----CCCCATATCGGTCAATTACTAT-AAACTTC-ACTGAAAATTTA-A
gi|81350                      : ATCAAC-ACAA-TA-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT----ATAA---TATGTTT---A--TTT-AT-C----ACA--------TATTACATTGTACGTT-AAC-AAATCAG-TATTTA-GTG--T------T-A-C-T--TTCA-T-C--A-AA-T-A-ACT--CA------CAA--AGA--TGAAA---AGTG------GT-------------------------GGTGAA--AGT-----G-TA-CAAAAC-G----A-AAA-T--TC-G--CAA--TTA-------T-TA-CAAAAT---AACA-TAT---TTTGGG--GC-ATATTTTCGTA--A-TTTCA---TG-T-TTA-GAC-A-C---CC-TTT-TTTCTT-CTT-TAG-AA------A-AAT----AT-A-----------------------A-AA--A--AT----------A----------------------TAGC--ACTTT--ACTGGCT-T----TT----T-G---TAC--T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--TA--C----CCCA-TATCGGTCAATTACTAT-AAACTTC-ACTGAAAATTTA-AAATAATA
gi|81352                      : ATCAAC-ACAA-TA-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT--TTATAA---TATGTTT---A--TTT-AT-C----ACA--------TATTACATTGTACGTT-AAC-AAATCAG-TATTTA-GT----------T-A-C-T--TTCA-T-C--A-AA-T-A--CT--CA------CAA--AGA--TGAAA---AGTG------GT-------------------------GGTGAA--AGT-----G-TA-AAAAAC-GA---A-AAA-T--TC-G--CAA--TTA-------T-TA-CAAAAT----AAA-TAT---TTTGGG--GC-ATATTTTCGTA--A-TTTCA---TG-T-TTA-GAC-A-C---CC-TTT-TTTCTT-CTT-TA
gi|81353                      : ATCAGC-ACAA-TA-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT--C-ATAAGATTCTCTTT---A--TTT-TTAC----ATA--------T-T--------ACGTTTAAA-AAGTCAA-TATTTA-GTG--T------T-A-C-T--TTCA-T-C--A-AT-C-A-ACT--CA------CAA--AGA--TTAAA---ATTG------CT-------------------------GTTGAA--AGT-----G-TA-CAAAAT-AA---G-AA
gi|81354                      : ATCAAC-ACAT----A-GAAA-C-AAAAT--G------T-A-AA---TATGTTT---A--TTTTAT-C----A-A--------TATTG------ACGAT-A-C-AAAGCAA-TATTAATGTGAGT------T-G-T-T--TTCA-G----A-AT-TGA-ACT--CA------CAA--AGG--TGAAA---ATTGA-----GT-------------------------GGTGAA--G-T-----G-TA--AA----GA---A-AAA-T--TC-G--CAA--TTA-------T-TT-CTAAA----TA-A-TAT---TTTGGG--GCAATATGTT-GTA-----TTCA---CG-T-TTA-ATC-A-A--CTG-TTTATTGCTT-CTT-TAGTAATAATTGA-GAT----TT-ACATC
gi|81355                      : ATCAAT-ACAAATATG-GAAAGCCAAAATGGATTTT--C-ACAA---TCTGTGT---A--TTT--T-A----ACA--------T-T--------GCG-----C-AAAT-----AGTT---TG--TCCGGCCT-A---T--TACA-T-C--ATAT-T-ACATT--TAACAAATCAATAAGGAATTAAACCTATTGTCGTATGT-------------------------CGTAAC--G-T-----G-TATCAAAAT-GATTGA-AAA-T--TC-GCATAA--TTAACATTATT-TA-CTATATA--TATA-CATCCGTTTTGGAGGC-ATATTTTCGTA--AATTTCAGTGTG-T-TTA-ACT-AGC--CTTATTG-TTTCTTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-GATTTTATT-GTATCT-G-TTCTGTGCCATTTG-A-AAGGA--GT----------A-TAAGA--AA--A-AACCCTATTAAGCAACTTT--ACGGGC
gi|81348                      : ATCAAC-ACAA-TA-G-GAAAGT-AAAAT--ACTTT--C-ATAA---TCTGTTT---ATTTTT-AT-C----ATA--------
gi|81356                      :  TCAAC-ACAA-TA-G-GAAAGC-AAAAT--TATTT--C-ACAA---TCTGTTT---A--TTT-AT-C----ACA--------TATT-------ACGTT-AAC-AAATCAG-CATTTA-GTG--T------T-A-C-T--TTCA-T-C--A-AT-T-A-ACT--CA------CAA--AGA--TGAAA---ATTG------GT-------------------------GGTGAA--AGT-----G-TA-CAAAAT-GA---A-AAA-T--TT-A--CAA--TTA-------T-TA-CAAAAT---TACA-TGT---TTTGGG--GC-ATATTTTCGTA--A-TTTCA---TG-T-TTA-ACC-A-C----C-TTT-TTTCTT-CTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-G--TG---CATTTG-A-AA--A--GT----------A-TATAAAAAA--A-AAT----ATAGC--AATTT--TCAAGCT-T----TT----T-T---TTTCAT----TG-----TAAAGCT--TT-T--GT-A------ACGTG-TA--TA--C----CCCTTTTTCGGTCAATTGCTAACTAACTTC-ACTGA
gi|81357                      :  TCAATCACAG-TA-G----AG---AAAT--A-TTT--C-ATAA---TCTGTTCTC-A--TTT-TC-C----TTA--------TTTT-------ACGTT-A-C-AAGC--A-TATTTA-GTG--T------T---C-T--CTC----------T-T-A-ATT--CA------CAA----G--TGAAA---AT-G------GTA------------------------GGTGAG--A-T-----GCTG-AAAAATTGA---A-A---T--TC-G--CAAGATTA-------T-TG-CAA------TACA-T-T---TTTTTG--GC-AT-TGTTTTTATTA-TTT-A---TG-T-TTAGACC-A-C---CT-TTT-TTTCTT-CTT-TAG---T-A-T-A-GAT----TT-AC--TT-G-T--TG---C-TTTGAA-AA--A--GT----------A-T------AC--A-AAT----ATA-G--AC-TT--ACTGCCT-T----TTC---T-T---T----T----TGTTTGTTACAG-T--TC-T--GT--------ACATGCTA--TA--C----CCC--TATCGGTCAATT-CT-TAAAA-TTC-A-TGAAA--TTA-GG---ATGTGCTT
gi|81358                      :    AAC-GCAA-TA-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT--C-ATAA---TCTGTTT---A--TTT-AT-C----ATA--------TATT-------ATGTTTAAC-AAAGCAA-TATTTA-GTG--T------T-A-C-T--TTCA-T-C--A-AT-T-A-ATT--CA------CAA--AGG--TGAAA---ATTG------GT-------------------------GGTGAA--A-T-----G-TA-CAAAAT-GA---A-AAA-T--TC-G--CAA--TTA-------T-TA-CAAAAT---TACA-TAT---TTTTGG--GC-ATATGTTCTTA--A-TTTCA---TG-T-TTA-A-C-A-C--CTT-TTT-TTTCTT-CTT-TAG-AAT-ATT-A-G-T----TT--CATCT-G-T--TG---AATTTG-A-AA--A--GT----------A-TA-----AA--A-AAT----ATAGC--ACTTT--ACTGGCT-T----TT----TAC---T----T----TG-----TACAGCTTCTC-T--GT-A------ACATG-TA--TA-------CCCCTTATCGGTCAATTACAAT-AAACTTCTCCTGAAAATTTA-AGG-AATGTGTTT
gi|81359                      :     AC-ACAA-TA-GAGAAAGC-AAAAT--AATTT--C-ATAAA--TCTGTTTTATA--TAT-AT-C----ATAA-------TATT-------ACGTT-AAC-AAAGCAA-TATTTA-GTG--T------T-A-CAT--TTCAAT-C--A-AT-TTA-ATTTTCA------CAA--AGG--TGAAA---TTTGCTG---GT-------------------------GGTGAACAG-T-----C-TA-CAAAAT-GA---A-AA--T--TC-G--CAA--TTA-------TATAATGAGAT---TACAATAT---TTTTGG--GC-ATATTGTCTTA--A-TTTCA---TG-T-TTT-AAC-A-C--CTT-TTT-TTTCTT-CTTATAG-AAT-ATT-A-GAT----T---CATCTGG-T--TAGCTCATTTT-A-AA--AACGT----------ATT------AA--A-AAT----ATAGC--AC-TT--ACTGCTT-T----TT----T-T---C----T----TT-----TACAGCT--TCTT--GTAA------ACATG-TA--TATCC----CTCCTTATCGGTCAATTACTAT--AACTTC-ACTGAAAATTTATAGGGAACATGT
gi|81360                      :          AT-TA----AAAAC-AAAAT--AATTTAAC-ATA----TCTGTTT---A--TTTTAT-CGACAATACATGTATTTAT--------TCGTT-AACCGAATCAAATATT---GTG--T------T-T-G-T--TTCA-T-CTTA-ATAT-A-ACT--CA------CAA--AGAA-TGAAA---ATTG------GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGATGAA--AGT-----G-TA-CAAAAT-GA---A-AAA-T--CC-G--CAA--TTA-------T-TA-CAAAAT---TACA-TAT---TTTTGG--GC-ATAATTTCGTA--A-ATTTT---TG-T-TTA-ACC-A-C---CT-ATT-TTTCTT-CTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATAT-G-T--TG---CATTTG-A-AA--A--GT----------A-T------AAT-A-AGT----ATAGC--GCTTT--ACTGGCT-T----GT----T-
gi|81361                      :                                      acacaAA---TCTGTTT---A--TTT-AT-C----ACA--------TATT-------ACGTT-AAT-TAATCAA-TATTTT-GTG--T------T-A-C-T--TTCA-T-C--A-AT-G-A-ACT--CA------CAA--AGA--TGGAA---ATTG------GT-------------------------GGTGAA--AGT-----A-TA-CAAAATAAA---A-AAA-T--TC-G--CAA--TTA-------T-TA-CAAAAT---TACA-TA
gi|81363                      :                                                                                      T--------ACGTT-AAC-AAAGCAAATATTTA-GTG--T------TTA-C-TACTTCA-TTC--A-AT-TTA-ATTTTCA------CAA---GG--TGAAA---ATTG------GT-------------------------GGTGAA--AGT-----G-TA-CAAAAT-GA---A-AAA-T--TG-C--CAG--TTA-------T-TA-CAAAAT---TACA-TAT---TTTTGG--TA-ATAGTTTCGTA--A-TTTCA---TG-T-TTA-ACT-A-C---CC-TTT-TTTCTT-CTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-T--TG---CAATTG-A-AA--A--GT----------A-TA-----AA--A-AAT----ATAGC--ACTTT--ACTGGCT-T----TT----T-TC--T----T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--TA--C----CCCCTTATCGGTCAATTACTAT--AACTTC-ACTGAAAAGTTA-AGGAAATATGTTT
gi|81364                      :                                                                                    ttT--------ACGTT-AAC-ACAGCAA-TATTTA-GTG--T------T-AAT-T--TTCA-T-C--C-AT-T-A-ACT--CA------CAA--AGG--TGAAA---ATTG------AT-------------------------GGTGAA--G-T-----G-TA-CAAAAT-GA---ATAAA-TTGTCGG--CAA--TTA---------TA-TGAAATG--TACA-TA----TTTTGG--GC-ATACTTTCGTA--ATTTTCA---TG-T-TTA-ACC-A-CCAATT-TTT-CTT-TT-C-----G-AAT-ATT-A-AAT----TTAACATCT---T--TG---C-TTTG-A-AA--A--GT----------A-TTAAAA-AA--A-AAT----ATA-G--CCCTT--A--GGCT-T----TT----T-TC--T----T----TG-----TCCAGCT--TA-TC-GT--------ACATG-TA--TA-------CCCCTTATCGGTCAATTACTAT-AATCTTC-ACTGAAA
gi|81365                      :                                                                                                                       tcTG--T------T-A-C-T--TTCA-G-C--A-AT-T-A-ATT--CA------CAA--AGG--TGAAA---ATTG------GT-------------------------GGTGAA--A-T-----G-TA-CAAAAT-GA---A-AAA-T--TG-G--CAA--TTA-------T-TA-CAAAAT---TACA-TAT---TTTTGG--GC-ATATTTTCTTA--A-TTTCA---TG-T-TTA-ACC-A-C---CT-TTT-TTTCTT-CTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-T--TG---
gi|81367                      :                                                                                                                                                                                            ---ATTG------GT-------------------------GATGAA--AGT-----G-TA-CAAAAT-GA---A-AAA-T--TC-A--TAA--TTA-------T-TA-CAAAGT---TACA-TAT---TTTTGG--GC-ATATTTTCGTA--A-TTTCT---TG-T-TGA-ACC-A-C--CTA-TTT-T---TT-CTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACAT
gi|81366                      :                                                                                                                                                                                            ---ATTG------GT-------------------------GG-GAA--A-TATATAG-TA-CCAAAT--A---A-AAA-TG-TC-G--CAA--TTA-------T-TA-TAAAAGCCATGCA-TAT---GA--GG--AC-ATAATGTCCTG--A-TTTTA---TG-G-TTT-ACC-A-C--ATA-CTT-TT-CTA-GTT-CAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-T--TG---CATTT
gi|81368                      :                                                                                                                                                                                                                                         aacttgtaaagattA-CAAAAG-AG---A-AAG-T--TC-G--CAA--T-A-------T-TA-CAAAG-------A-CAG---TCTTGG--AT-ATAGTGTAGTG--A-TTTCA---A-----TA-ATT-A-C--TCT-GAT-TTTCTT-CTT-TAG-AAT-ATT-ACGA-----TT-ACATCT-G-A--TG---CATTTG-A-AA--A--GTTAAAAAAAAAA-A------AA--A-AA-------AGC--ACGCC--AC-AACA-A----TT----T-C---T----T----T------TACGACT--TC-T--GT-A------ATATG-CA--TA--
gi|81362                      :                                                                                                                                                                                                                                                                  ---A-AAG-T--TC-G--CAA--TTA-------T-TA-AAAAGT---TA-A---------TTAG-----ATA-GCTCTGT--A-TTTCA---TG-A-TTT-ATC-A-C--A-T-GAT-TTTCTT-CTG-TAG-AAT-ATT-A-CAA----TT-ACATCT-G-T--TG---CATCT--A-AA--A--TT----------T-T------AA--ACAAA----ATAGC--ACTTC--AC-AACA-A----TT----T-C---T----T----T------TACGACT--TC-T--GT-A------ATAT
gi|81369                      :                                                                                                                                                                                                                                                                              catttttcatttatattaattaacacatacatgtaacatattttcattaatcaactaataaagaagTA--G-TTTCA---TGATGTTA-AGCGA-C---CT-GTT-TTTCTT-CTT-TAA-GAT-ATT-A-GTT----TC-ATCTCT-G-T--TGC--CAATTG-ACAA--A--GT----------A-CTGAA--AA--A-AGT----ATAGC--ACTTTAAACTGGCT-A----TT----T-T---T----TCTTGTG-----TACAGCC--TC-TAGGT-A------A-ATG-TAAGTA--CTGCGCTCCTTATCGGTCAATTACTAT-AAACTTC-ACTGAAAAGTTT-AGGAAATATATTtgatcaaaccttcaatttgaaaaaaaaaattatcaaaatatgttt
gi|81370                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gT-TTTCTT-CTT-TAG-AAT-ATT-A-AAT----TT-ACATCT-A-T--TG---CATTTG-A-AA--A--GT----------A-TTAAAAAAA--A-AAT----ATAGC--CCTTT--ACTGGCT-T----TT----T-TC--T----T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--TA--C----CCCCTTATCGGTCAATTACTAT-AATCTTC-ACTGAAA
gi|81371                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A--A--GT----------A-T------AAGCA-CAC----TT--G--ATTTT--GC-GGCTAT----TT----T-TCCCT----T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--TA--A----CCCTTTATAGGTCAATTACTAT-AAACTTC-ACTGAAAAGTTA-AGGAAATATGTTT
gi|81372                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttgaaacgtaaaaaaagcg--ACTTT--ACTGGCT-T----TTT---T-T---T----T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--TA--C----CCCCTTATCGGTCAATTACTAT-AAACTTC-ACTGAAAATTTA-AGGAAATATGTTT

lowQualScore                  :                                                                                             2222222                                                                                                    1111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                         3333333333333333       1111111                                              11111111                               111111                                                                                 
lowQualScore                  :      2     2 2 2 2      2     55     33 2    666       666 22   4   666666  22 2   333 2 22 6666666   4   2       4 22     2 22  22  1 1 1 22    1 6666 22   1 5   333 55        44     333    999999  9999999999999999999999999      1 333  1 1  1      3 1 222 1    44  1   66666666 22    1 1 1      666    1   333      22  1  1          3     333  1 1   1 0 1  1 44 1 5555 1         1   1   1   1 1   3333  1      1 1 22  666 2     2 2  55555  1111111111111111  2 2  2222222   22 2  1  6666666    22 2    2 4444  8888 2 77777777 4444  77777       55  2 55  2 222222     2  22 333 7777777                      2 33      2        1   2             
lowQualScore                  :      .     . . . .      .     ..     .. .    ...       ... ..   .   ......  .. .   ... . .. .......   .   .       . ..     . ..  ..  . . . ..    . .... ..   . .   ... ..        ..     ...    ......  .........................      . ...  . .  .      . . ... .    ..  .   ........ ..    . . .      ...    .   ...      ..  .  .          .     ...  . .   . . .  . .. . .... .         .   .   .   . .   ....  .      . . ..  ... .     . .  .....  ................  . .  .......   .. .  .  .......    .. .    . ....  .... . ........ ....  .....       ..  . ..  . ......     .  .. ... .......                      . ..      .        .   .             
lowQualScore                  :      4     4 4 4 4      4     66     22 4    111       666 99   2   111111  99 1   555 0 88 0000000   0   0       0 88     0 66  66  9 9 9 66    9 0000 66   9 5   222 00        33     000    888888  1111111111111111111111111      7 000  7 7  7      3 7 999 7    11  7   33333333 44    7 7 7      555    7   222      55  8  8          5     000  7 7   7 8 7  7 11 7 2222 7         7   7   7   7 7   7777  7      9 9 66  777 0     0 0  00000  1111111111111111  0 0  2222222   88 0  9  2222222    66 8    0 2222  2222 0 11111111 5555  44444       00  1 00  1 111111     1  99 777 3333333                      2 11      2        9   7             
consensus                     : ATCAA-CACAA-T-A-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT--C-ATAA---TCTGTTT---A--TTT-ATC------AC--A-TAT---T-A--C-------GTT-AAC-AAATCAA-T--ATTTA-G--TG--TT-A-C-T--TTCA-T----C--AAT-T-AAC---T--CACAAAGG--TGAAA---ATTG------GT-------------------------GGTGAA-A---GT-G-TA-CAAAAT-G-A---A-AAAT--TC-GCA--------A--TTAT-T-A-CAAAAT---TACA-TAT---TTTTGG--GC-AT-ATTTTCGTAA-TTTCA---TG-T-TTA-ACC-AC-C-CT-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-T--TG---C-ATTTG-A-AA--A--GT-------A-T------AA-A-AA-------TAT--A-GC-AC-------TTTA--CTGGCT-T----TT----T-T---T----T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--T---A--C----CCCCTTATCGGTCAATTACTAT-A--AACTTC-ACTGAAAANTTA-AGGAAATATGTTT
Reference ( family-650 )      : ATCAA-CACAA-T-A-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT--C-ATAA---TCTGTTT---A--TTT-ATC------AC--A-TAT---T-A--C-------GTT-AAC-AAATCAA-T--ATTTA-G--TG--TT-A-C-T--TTCA-T----C--AAT-T-AAC---T--CACAAAGG--TGAAA---ATTG------GT-------------------------GGTGAA-A---GT-G-TA-CAAAAT-G-A---A-AAAT--TC-GCA--------A--TTAT-T-A-CAAAAT---TACA-TAT---TTTTGG--GC-AT-ATTTTCGTAA-TTTCA---TG-T-TTA-ACC-AC-C-CT-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-T--TG---C-ATTTG-A-AA--A--GT-------A-T------AA-A-AA-------TAT--A-GC-AC-------TTTA--CTGGCT-T----TT----T-T---T----T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--T---A--C----CCCCTTATCGGTCAATTACTAT-A--AACTTC-ACTGAAAANTTA-AGGAAATATGTTT
gi|81344                      : ATCAA-TACAT-T-A-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT--C-ATAA---TCTGTTT---A--TTT-ATC------AT--A-TAT-----A--C-------GTT-AAC-AAATCAA-T--ATTTA-G--TG--TT-A-C-T--TTCA-T----C--AAT-T-AAT---T--CACAAAGG--TGAAA---ATTG------GT-------------------------GGTGAA-A----T-G-TA-CAAAAT-G-A---A-AAAT--TC-GTA--------A--TTAT-T-A-CAAAAT---TACA-TAT---TTTTGG--GC-AT-ATTTTCTTAA-TTTCA---TG-T-TTA-ACC-ACAT-TT-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-T--TG---C-ATTTG-A-AA--A--GT-------A-T------AA-A-AA-------TTT--A-GG-AC-------TTTA--CTGGCT-T----TT----T-T---T----T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--T---A--C----CCCCTTATCGGTCAATTACTATAA--AACTTC-ACTGAAAATTTA-AGGAAATATGTTT
gi|81345                      : ATCAA-CACAA-T-A-G-GAA-GC-AAAATG-AATTT--C-ATAA---TCTGTTT---A--TTT-ATC------GC--A-TAT---T-A--C-------GTT-GAT-AAATCAA-T--ATTTA-G--TG--TT-T-C-T--TTCA-T----C--AAT-T-AAC---T--CA--AAGA--TGAAA---ATCG------GT-------------------------GGTGAA-A---GT-G-TA-CAAAAT-G-C---T-AAAT--TC-GCA--------A--TGAT-T-A-CAAAAT---AACA-CAT---TTTTTA--GC-AT-ATTTTCGTAA-TTTCA---TG-T-TTC-ACC-AC-C-CT-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-T--TG---C-ATTTG-A-AA--A--GT-------A-TG-----AA-A-AA-------TAT--A-GC-AC-------TTTA--CTGGCT-T----TT----T-TC--T----T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-AAGATGTACATG-TA--T---A-------CCCCTTATCGGTCAATTATCAT-A--AACTTC-ACTGAAAAGTTA-AGGAAATAT
gi|81346                      : ATCAA-CACAA-T-A-G-GAAAGT-GAA-T--AATTT--C-ATAA---TCTGTTT---A--TTT-ATC------GC--A-TAT---T-A--C-------GTT-AAT-AAATCAA-T--ATTTA-G--TG--TT-T-C-T--TTCA-T----C--AAT-T-AAC---T--CA--AAGA--TGAAA---ATTG------GT-------------------------GATAAA-A---GT-G-TA-CAAAAT-G-A---T-AAAT--TC-GCA--------A--TTAT-T-A-CAAAAT---TACA-CAT---TTTTGG--GC-AT-ATTTTCGTAA-TTTCA---TG-T-TTA-ACC-A--C-CT-T----T-TTTCTTTTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-T--TG---C-ATTTG-A-AA--A--GT-------A-TG-----AA-A-AA-------TAT--A-AC-AC-------TTTA--CAGGCT-TTTTGTT----T-C---T----T----TG-----TAC--CTG-TC-T--GT-AAGATGTACATG-TA--A---A--C----CCCCTTATCGGTCAATTATTAT-A--AACTTC-ACTTAAAAGGTA-TGGAAATATGTTT
gi|81347                      : ATCAA-CACAC-T-A-A-GTAAGC-AAAAT--AATTT--C-ATAA---TCTGTTT---A--TTT-ATC------AC--A-TAT---T-A--C-------GAT-AAC-AAAGCAA-T--ATCTA-G--TG--TC-A-T-T--TTCA-T----T--AAT-T-AAC---T--CACAAAGG--TGAAA---ATTG------AT-------------------------TGTGAA-A---GA-G-TA-CAAAAT-G-A---A-AAAT--TC-TCA--------A--TTAA-T-A-CAAAAT---TACA-TA----TTTTGG--GC-AT-ATTTTCATAA-TTTT----TA-T-TTA-ACC-A--C-TT-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-GTT--TG---C-A-TTG-A-AA--A--GT-------A-T------AA-A-AA-------TAT--A-GC-CC-------TTCA--TTGACT-T----TTTTTCT-T---T----T----TGT----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--T------C----CCCCTTATCGGTCAATTACTAT-A--AACTTC-AATGAAAGGTTA-AGGAAATATGTT
gi|81348                      : ATCAA-CACAA-T-A-G-GAAAGT-AAAAT--ACTTT--C-ATAA---TCTGTTT---ATTTTT-ATC------AT--A-
gi|81349                      : ATCAA-CACAA-T-A-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT--T-ATAA---TATGTTT---A--TTT-ATC------AC--A-TAT---T-A--CATTGTACGTT-AAC-AAATCAG-T--ATTTA-G--TG--TT-A-C-T--T-CA-T----C--AAA-T-AAC---T--CACAAAGA--TGAAA---AGTG------GT-------------------------GGTGAA-A---GT-G-TA-CAAAAC-G-A---A-AAAT--TC-GCA--------A--TTAT-T-A-CAAAAT---AACA-TAT---TTTGGG--GC-AT-ATTTTCGTAA-TTTCA---TG-T-TTA-GAC-AC-C-CT-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AA------A-AAT---------AT---------------------A-AA--------------------------A-AA-------TAT--A-GC-AC-------TTTA--CTGGCT-T----TT----T-G---TAC--T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--T---A--C----CCCCATATCGGTCAATTACTAT-A--AACTTC-ACTGAAAATTTA-
gi|81350                      : ATCAA-CACAA-T-A-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT----ATAA---TATGTTT---A--TTT-ATC------AC--A-TAT---T-A--CATTGTACGTT-AAC-AAATCAG-T--ATTTA-G--TG--TT-A-C-T--TTCA-T----C--AAA-T-AAC---T--CACAAAGA--TGAAA---AGTG------GT-------------------------GGTGAA-A---GT-G-TA-CAAAAC-G-----A-AAAT--TC-GCA--------A--TTAT-T-A-CAAAAT---AACA-TAT---TTTGGG--GC-AT-ATTTTCGTAA-TTTCA---TG-T-TTA-GAC-AC-C-CT-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AA------A-AAT---------AT---------------------A-AA--------------------------A-AA-------TAT--A-GC-AC-------TTTA--CTGGCT-T----TT----T-G---TAC--T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--T---A--C----CCCA-TATCGGTCAATTACTAT-A--AACTTC-ACTGAAAATTTA-AAATAATA
gi|81351                      : ATCAA-CACAA-T-A-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT--T-ATAA---TATGTTT---A--TTT-ATC------AC--A-TAT---T-A--CATTGTACGTT-AAC-AAATCAG-T--ATTTA-G--TG--TT-A-C----TTCA-T----C--AAA-T-AAC---T--CACAAAGA--TGAAA---AGTG------GT-------------------------GGTGAA-A---GT-G-TA-CAAAAC-GAA---A-AAAT--TC-GCA--------A--TTAT-T-A-CAAAAT---AACA-TAT---TTTGGG--GC-AT-ATTTTCGTAA-TTTCA---TG-T-TTA-GAC-AC-C-CT-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AA------A-AAT---------AT---------------------A-AA--------------------------A-AA-------TAT--A-GC-AC-------TTTA--CTGGCT-T----TT----T-G---TAC--T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--T---A--C----CCCCATATCGGTCAATTACTAT-A--AACTTC-ACTGAAAATTTA-
gi|81352                      : ATCAA-CACAA-T-A-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT--TTATAA---TATGTTT---A--TTT-ATC------AC--A-TAT---T-A--CATTGTACGTT-AAC-AAATCAG-T--ATTTA-G--T----T-A-C-T--TTCA-T----C--AAA-T-A-C---T--CACAAAGA--TGAAA---AGTG------GT-------------------------GGTGAA-A---GT-G-TA-AAAAAC-G-A---A-AAAT--TC-GCA--------A--TTAT-T-A-CAAAA----TAAA-TAT---TTTGGG--GC-AT-ATTTTCGTAA-TTTCA---TG-T-TTA-GAC-AC-C-CT-T----T-TTTCTTCTT-TA
gi|81353                      : ATCAG-CACAA-T-A-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT--C-ATAAGATTCTCTTT---A--TTT--TT------AC--A-TAT---T-A--C-------GTTTAAA-AAGTCAA-T--ATTTA-G--TG--TT-A-C-T--TTCA-T----C--AAT-C-AAC---T--CACAAAGA--TTAAA---ATTG------CT-------------------------GTTGAA-A---GT-G-TA-CAAAAT-A-A---G-AA
gi|81354                      : ATCAA-CACA--T-A-G-AAA--C-AAAAT--G------T-A-AA---TATGTTT---A--TTTTATC------A---A-TAT---TGA--C-------GAT-A-C-AAAGCAA-T--ATTAATG--TGAGTT-G-T-T--TTCA-G-------AAT-TGAAC---T--CACAAAGG--TGAAA---ATTGA-----GT-------------------------GGTG-A-A---GT-G-TA--AA----G-A---A-AAAT--TC-GCA--------A--TTAT-T-T-CTAAA----TA-A-TAT---TTTGGG--GCAAT-ATGTT-GTA---TTCA---CG-T-TTA-ATCAAC-T-GT-T----TATTGCTTCTT-TAGTAATAATTGA-GAT----TT-ACATC
gi|81355                      : ATCAA-TACAAAT-ATG-GAAAGCCAAAATGGATTTT--C-ACAA---TCTGTGT---A--TTT--TA------AC--A-T-----T-G--C-------G-----C-AAAT-AG-TTTGTCCG-GCCTA--TT-A-C-A--T-CA-TATTAC--ATT-T-AACAAAT--CAATAAGGAATTAAACCTATTGTCGTATGT-------------------------CGT-AA-C---GT-G-TATCAAAAT-G-ATTGA-AAAT--TC-GCATAATTAACA--TTAT-TTA-CTATATA--TATA-CATCCGTTTTGGAGGC-AT-ATTTTCGTAAATTTCAGTGTG-T-TTA-ACT-AG-C-CT-TATTGT-TTCTTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-GATTTTATT-GTATCT-G-TTCTGTGCC-ATTTG-A-AAGGA--GT-------A-T------AA-G-AAAAAACCCTATTAA-GCAAC-------TTTA--CGGGC
gi|81356                      :  TCAA-CACAA-T-A-G-GAAAGC-AAAAT--TATTT--C-ACAA---TCTGTTT---A--TTT-ATC------AC--A-TAT---T-A--C-------GTT-AAC-AAATCAG-C--ATTTA-G--TG--TT-A-C-T--TTCA-T----C--AAT-T-AAC---T--CACAAAGA--TGAAA---ATTG------GT-------------------------GGTGAA-A---GT-G-TA-CAAAAT-G-A---A-AAAT--TT-ACA--------A--TTAT-T-A-CAAAAT---TACA-TGT---TTTGGG--GC-AT-ATTTTCGTAA-TTTCA---TG-T-TTA-ACC-A--C-CT-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-G--TG---C-ATTTG-A-AA--A--GT-------A-TATAAAAAA-A-AA-------TAT--A-GC-AA-------TTTT--CAAGCT-T----TT----T-T---TTTCAT----TG-----TAAAGCT--TT-T--GT-A------ACGTG-TA--T---A--C----CCCTTTTTCGGTCAATTGCTA--ACTAACTTC-ACTGA
gi|81357                      :  TCAATCACAG-T-A-G----AG---AAAT--A-TTT--C-ATAA---TCTGTTCTC-A--TTT-TCC------TT--A-TTT---T-A--C-------GTT-A-C-AAGC--A-T--ATTTA-G--TG--TT---C-T--CTC------------T-T-AAT---T--CACAA--G--TGAAA---AT-G------GTA------------------------GGTGAG-A----T-GCTG-AAAAATTG-A---A-A--T--TC-GCA--------AGATTAT-T-G-CAA------TACA-T-T---TTTTTG--GC-ATTGTTTTTATTA-TTT-A---TG-T-TTAGACC-AC-C-TT-T----T-TTTCTTCTT-TAG---T-A-T-A-GAT----TT-AC--TT-G-T--TG---C--TTTGAA-AA--A--GT-------A-T------AC-A-AA-------TAT--A-G--AC--------TTA--CTGCCT-T----TTC---T-T---T----T----TGTTTGTTACAG-T--TC-T--GT--------ACATGCTA--T---A--C----CCC--TATCGGTCAATT-CT-T-A--AAATTC-A-TGAAA--TTA-GG---ATGTGCTT
gi|81358                      :    AA-CGCAA-T-A-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT--C-ATAA---TCTGTTT---A--TTT-ATC------AT--A-TAT---T-A--T-------GTTTAAC-AAAGCAA-T--ATTTA-G--TG--TT-A-C-T--TTCA-T----C--AAT-T-AAT---T--CACAAAGG--TGAAA---ATTG------GT-------------------------GGTGAA-A----T-G-TA-CAAAAT-G-A---A-AAAT--TC-GCA--------A--TTAT-T-A-CAAAAT---TACA-TAT---TTTTGG--GC-AT-ATGTTCTTAA-TTTCA---TG-T-TTA-A-C-AC-CTTT-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-G-T----TT--CATCT-G-T--TG---A-ATTTG-A-AA--A--GT-------A-TA-----AA-A-AA-------TAT--A-GC-AC-------TTTA--CTGGCT-T----TT----TAC---T----T----TG-----TACAGCTTCTC-T--GT-A------ACATG-TA--T---A-------CCCCTTATCGGTCAATTACAAT-A--AACTTCTCCTGAAAATTTA-AGG-AATGTGTTT
gi|81359                      :     A-CACAA-T-A-GAGAAAGC-AAAAT--AATTT--C-ATAAA--TCTGTTTTATA--TAT-ATC------AT--AATAT---T-A--C-------GTT-AAC-AAAGCAA-T--ATTTA-G--TG--TT-A-CAT--TTCAAT----C--AAT-TTAAT---TTTCACAAAGG--TGAAA---TTTGCTG---GT-------------------------GGTGAACA---GT-C-TA-CAAAAT-G-A---A-AA-T--TC-GCA--------A--TTATAT-AATGAGAT---TACAATAT---TTTTGG--GC-AT-ATTGTCTTAA-TTTCA---TG-T-TTT-AAC-AC-CTTT-T----T-TTTCTTCTTATAG-AAT-ATT-A-GAT----T---CATCTGG-T--TAGCTC-ATTTT-A-AA--AACGT-------ATT------AA-A-AA-------TAT--A-GC-AC--------TTA--CTGCTT-T----TT----T-T---C----T----TT-----TACAGCT--TCTT--GTAA------ACATG-TA--T---ATCC----CTCCTTATCGGTCAATTACTAT----AACTTC-ACTGAAAATTTATAGGGAACATGT
gi|81360                      :     A-CACAA-TTA----AAAAC-AAAAT--AATTTAAC-ATA----TCTGTTT---A--TTTTATCGACAATAC--A-TGTATTT-ATTC-------GTT-AACCGAATCAAAT--ATT---G--TG--TT-T-G-T--TTCA-T----CTTAATAT-AAC---T--CACAAAGAA-TGAAA---ATTG------GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGATGAA-A---GT-G-TA-CAAAAT-G-A---A-AAAT--CC-GCA--------A--TTAT-T-A-CAAAAT---TACA-TAT---TTTTGG--GC-AT-AATTTCGTAA-ATTTT---TG-T-TTA-ACC-AC-C-TA-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATAT-G-T--TG---C-ATTTG-A-AA--A--GT-------A-T------AATA-AG-------TAT--A-GC-GC-------TTTA--CTGGCT-T----GT----T-
gi|81361                      :                                            AA---TCTGTTT---A--TTT-ATC------AC--A-TAT---T-A--C-------GTT-AAT-TAATCAA-T--ATTTT-G--TG--TT-A-C-T--TTCA-T----C--AAT-G-AAC---T--CACAAAGA--TGGAA---ATTG------GT-------------------------GGTGAA-A---GT-A-TA-CAAAATAA-A---A-AAAT--TC-GCA--------A--TTAT-T-A-CAAAAT---TACA-TA
gi|81362                      :                                                        ---A--TTT-TTC------ATTTA-TAT---T-A----------ATT-AAC-ACAT--A-C--ATGTA-A--CA--T--A-T-T--TTCA-T----T--AAT-C-AAC---T----------------A---AT---------------------------------------AA-A---G----------AA----G---A-AAGT--TC-GCA--------A--TTAT-T-A-AAAAGT---TA----AT---T----A--G--AT-AGCTCTGTA--TTTCA---TG-A-TTT-ATC-AC-A-TG-A----T-TTTCTTCTG-TAG-AAT-ATT-A-CAA----TT-ACATCT-G-T--TG---C-ATCT--A-AA--A--TT-------T-T------AA-ACAA-------AAT--A-GC-AC-------TTCA--C-AACA-A----TT----T-C---T----T----T------TACGACT--TC-T--GT-A------ATATT-GA--TCAAA--C----CT---------TCAATT--TGA-A--AA--------AAAAAATTA-TCAAAATATGTTT
gi|81363                      :                                                                                  cT---T-A--C-------GTT-AAC-AAAGCAAAT--ATTTA-G--TG--TTTA-C-TACTTCA-TT---C--AAT-TTAAT---TTTCACAA-GG--TGAAA---ATTG------GT-------------------------GGTGAA-A---GT-G-TA-CAAAAT-G-A---A-AAAT--TG-CCA--------G--TTAT-T-A-CAAAAT---TACA-TAT---TTTTGG--TA-AT-AGTTTCGTAA-TTTCA---TG-T-TTA-ACT-AC-C-CT-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-T--TG---C-AATTG-A-AA--A--GT-------A-TA-----AA-A-AA-------TAT--A-GC-AC-------TTTA--CTGGCT-T----TT----T-TC--T----T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--T---A--C----CCCCTTATCGGTCAATTACTAT----AACTTC-ACTGAAAAGTTA-AGGAAATATGTTT
gi|81364                      :                                                                                   t---T-A--C-------GTT-AAC-ACAGCAA-T--ATTTA-G--TG--TT-AAT-T--TTCA-T----C--CAT-T-AAC---T--CACAAAGG--TGAAA---ATTG------AT-------------------------GGTG-A-A---GT-G-TA-CAAAAT-G-A---ATAAATTGTCGGCA--------A--TTA--T-A-TGAAATG--TACA-TA----TTTTGG--GC-AT-ACTTTCGTAATTTTCA---TG-T-TTA-ACC-AC-C-AA-T----T-TTTCT--TT-TCG-AAT-ATT-A-AAT----TTAACATCT---T--TG---C--TTTG-A-AA--A--GT-------A-TTAAAA-AA-A-AA-------TAT--A-GC--C-------CTTA----GGCT-T----TT----T-TC--T----T----TG-----TCCAGCT--TA-TC-GT--------ACATG-TA--T---A-------CCCCTTATCGGTCAATTACTAT-A--ATCTTC-ACTGAAA
gi|81365                      :                                                                                                                            tc--TG--TT-A-C-T--TTCA-G----C--AAT-T-AAT---T--CACAAAGG--TGAAA---ATTG------GT-------------------------GGTGAA-A----T-G-TA-CAAAAT-G-A---A-AAAT--TG-GCA--------A--TTAT-T-A-CAAAAT---TACA-TAT---TTTTGG--GC-AT-ATTTTCTTAA-TTTCA---TG-T-TTA-ACC-AC-C-TT-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-T--TG---
gi|81366                      :                                                                                                                                                                -AAC---T--TGTAAAGA--TTA------TTG------GT-------------------------GG-GAA-ATATATAG-TA-CCAAAT---A---A-AAATG-TC-GCA--------A--TTAT-T-A-TAAAAGCCATGCA-TAT---GA--GG--AC-AT-AATGTCCTGA-TTTTA---TG-G-TTT-ACC-AC-A-TA-C----T-TTTCTAGTT-CAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-T--TG---C-ATTT
gi|81367                      :                                                                                                                                                                                         ---ATTG------GT-------------------------GATGAA-A---GT-G-TA-CAAAAT-G-A---A-AAAT--TC-ATA--------A--TTAT-T-A-CAAAGT---TACA-TAT---TTTTGG--GC-AT-ATTTTCGTAA-TTTCT---TG-T-TGA-ACC-AC-C----T----A-TTTTTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACAT
gi|81368                      :                                                                                                                                                                                                                                                  A-CAAAAG-A-G---A-AAGT--TC-GCA--------A--T-AT-T-A-CAAAG-------A-CAG---TCTTGG--AT-AT-AGTGTAGTGA-TTTCA---A-----TA-ATT-AC-T-CT-GA---T-TTTCTTCTT-TAG-AAT-ATT-ACGAT----T--ACATCT-G-A--TG---C-ATTTG-A-AA--A--GTTAAAAAAA-A------AA-A-AA-------AAA--A-GC-AC-------GCCA--C-AACA-A----TT----T-C---T----T----T------TACGACT--TC-T--GT-A------ATATG-CA--T---A--
gi|81369                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GTAG-TTTCA---TGATGTTA-AGC-GA-C-CTGT----T-TTTCTTCTT-TAA-GAT-ATT-A-GTT----TC-ATCTCT-G-T--TG---CCAATTG-ACAA--A--GT-------A-CTGAA--AA-A-AG-------TAT--A-GC-AC-------TTTAAACTGGCT-A----TT----T-T---T----TCTTGTG-----TACAGCC--TC-TAGGT-A------A-ATG-TAAGT---A--CTGCGCTCCTTATCGGTCAATTACTAT-A--AACTTC-ACTGAAAAGTTT-AGGAAATATATT
gi|81370                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ----T-TTTCTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-AAT----TT-ACATCT-A-T--TG---C-ATTTG-A-AA--A--GT-------A-TTAAAAAAA-A-AA-------TAT--A-GC-CC-------TTTA--CTGGCT-T----TT----T-TC--T----T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--T---A--C----CCCCTTATCGGTCAATTACTAT-A--ATCTTC-ACTGAAA
gi|81371                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTG-A-AA--C--GT-------A-A------AA-A-AAGCGAAG-TAT--AAGC-ACACTTGATTTTG--C-GGCTAT----TT----T-TCCCT----T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--T---A--A----CCCTTTATAGGTCAATTACTAT-A--AACTTC-ACTGAAAAGTTA-AGGAAATATGTTT
gi|81372                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -AC-------TTTA--CTGGCT-T----TTT---T-T---T----T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--T---A--C----CCCCTTATCGGTCAATTACTAT-A--AACTTC-ACTGAAAATTTA-AGGAAATATGTTT

lowQualScore                  :                                                                                             2222222                                                                                                    1111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                         3333333333333333       1111111                                              11111111                               111111                                                                                 
lowQualScore                  :      2     2 2 2 2      2     55     33 2    666       666 22   4   666666  22 2   333 2 22 6666666   4   2       4 22     2 22  22  1 1 1 22    1 6666 22   1 5   333 55        44     333    999999  9999999999999999999999999      1 333  1 1  1      3 1 222 1    44  1   66666666 22    1 1 1      666    1   333      22  1  1          3     333  1 1   1 0 1  1 44 1 5555 1         1   1   1   1 1   3333  1      1 1 22  666 2     2 2  55555  1111111111111111  2 2  2222222   22 2  1  6666666    22 2    2 4444  8888 2 77777777 4444  77777       55  2 55  2 222222     2  22 333 7777777                      2 33      2        1   2             
lowQualScore                  :      .     . . . .      .     ..     .. .    ...       ... ..   .   ......  .. .   ... . .. .......   .   .       . ..     . ..  ..  . . . ..    . .... ..   . .   ... ..        ..     ...    ......  .........................      . ...  . .  .      . . ... .    ..  .   ........ ..    . . .      ...    .   ...      ..  .  .          .     ...  . .   . . .  . .. . .... .         .   .   .   . .   ....  .      . . ..  ... .     . .  .....  ................  . .  .......   .. .  .  .......    .. .    . ....  .... . ........ ....  .....       ..  . ..  . ......     .  .. ... .......                      . ..      .        .   .             
lowQualScore                  :      4     4 4 4 4      4     66     22 4    111       666 99   2   111111  99 1   555 0 88 0000000   0   0       0 88     0 66  66  9 9 9 66    9 0000 66   9 5   222 00        33     000    888888  1111111111111111111111111      7 000  7 7  7      3 7 999 7    11  7   33333333 44    7 7 7      555    7   222      55  8  8          5     000  7 7   7 8 7  7 11 7 2222 7         7   7   7   7 7   7777  7      9 9 66  777 0     0 0  00000  1111111111111111  0 0  2222222   88 0  9  2222222    66 8    0 2222  2222 0 11111111 5555  44444       00  1 00  1 111111     1  99 777 3333333                      2 11      2        9   7             
consensus                     : ATCAA-CACAA-T-A-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT--C-ATAA---TCTGTTT---A--TTT-ATC------AC--A-TAT---T-A--C-------GTT-AAC-AAATCAA-T--ATTTA-G--TG--TT-A-C-T--TTCA-T----C--AAT-T-AAC---T--CACAAAGG--TGAAA---ATTG------GT-------------------------GGTGAA-A---GT-G-TA-CAAAAT-G-A---A-AAAT--TC-GCA--------A--TTAT-T-A-CAAAAT---TACA-TAT---TTTTGG--GC-AT-ATTTTCGTAA-TTTCA---TG-T-TTA-ACC-AC-C-CT-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-T--TG---C-ATTTG-A-AA--A--GT-------A-T------AA-A-AA-------TAT--A-GC-AC-------TTTA--CTGGCT-T----TT----T-T---T----T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--T---A--C----CCCCTTATCGGTCAATTACTAT-A--AACTTC-ACTGAAAANTTA-AGGAAATATGTTT
Reference ( family-650 )      : ATCAA-CACAA-T-A-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT--C-ATAA---TCTGTTT---A--TTT-ATC------AC--A-TAT---T-A--C-------GTT-AAC-AAATCAA-T--ATTTA-G--TG--TT-A-C-T--TTCA-T----C--AAT-T-AAC---T--CACAAAGG--TGAAA---ATTG------GT-------------------------GGTGAA-A---GT-G-TA-CAAAAT-G-A---A-AAAT--TC-GCA--------A--TTAT-T-A-CAAAAT---TACA-TAT---TTTTGG--GC-AT-ATTTTCGTAA-TTTCA---TG-T-TTA-ACC-AC-C-CT-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-T--TG---C-ATTTG-A-AA--A--GT-------A-T------AA-A-AA-------TAT--A-GC-AC-------TTTA--CTGGCT-T----TT----T-T---T----T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--T---A--C----CCCCTTATCGGTCAATTACTAT-A--AACTTC-ACTGAAAANTTA-AGGAAATATGTTT
gi|81344                      : ATCAA-TACAT-T-A-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT--C-ATAA---TCTGTTT---A--TTT-ATC------AT--A-TAT-----A--C-------GTT-AAC-AAATCAA-T--ATTTA-G--TG--TT-A-C-T--TTCA-T----C--AAT-T-AAT---T--CACAAAGG--TGAAA---ATTG------GT-------------------------GGTGAA-A----T-G-TA-CAAAAT-G-A---A-AAAT--TC-GTA--------A--TTAT-T-A-CAAAAT---TACA-TAT---TTTTGG--GC-AT-ATTTTCTTAA-TTTCA---TG-T-TTA-ACC-ACAT-TT-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-T--TG---C-ATTTG-A-AA--A--GT-------A-T------AA-A-AA-------TTT--A-GG-AC-------TTTA--CTGGCT-T----TT----T-T---T----T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--T---A--C----CCCCTTATCGGTCAATTACTATAA--AACTTC-ACTGAAAATTTA-AGGAAATATGTTT
gi|81345                      : ATCAA-CACAA-T-A-G-GAA-GC-AAAATG-AATTT--C-ATAA---TCTGTTT---A--TTT-ATC------GC--A-TAT---T-A--C-------GTT-GAT-AAATCAA-T--ATTTA-G--TG--TT-T-C-T--TTCA-T----C--AAT-T-AAC---T--CA--AAGA--TGAAA---ATCG------GT-------------------------GGTGAA-A---GT-G-TA-CAAAAT-G-C---T-AAAT--TC-GCA--------A--TGAT-T-A-CAAAAT---AACA-CAT---TTTTTA--GC-AT-ATTTTCGTAA-TTTCA---TG-T-TTC-ACC-AC-C-CT-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-T--TG---C-ATTTG-A-AA--A--GT-------A-TG-----AA-A-AA-------TAT--A-GC-AC-------TTTA--CTGGCT-T----TT----T-TC--T----T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-AAGATGTACATG-TA--T---A-------CCCCTTATCGGTCAATTATCAT-A--AACTTC-ACTGAAAAGTTA-AGGAAATAT
gi|81346                      : ATCAA-CACAA-T-A-G-GAAAGT-GAA-T--AATTT--C-ATAA---TCTGTTT---A--TTT-ATC------GC--A-TAT---T-A--C-------GTT-AAT-AAATCAA-T--ATTTA-G--TG--TT-T-C-T--TTCA-T----C--AAT-T-AAC---T--CA--AAGA--TGAAA---ATTG------GT-------------------------GATAAA-A---GT-G-TA-CAAAAT-G-A---T-AAAT--TC-GCA--------A--TTAT-T-A-CAAAAT---TACA-CAT---TTTTGG--GC-AT-ATTTTCGTAA-TTTCA---TG-T-TTA-ACC-A--C-CT-T----T-TTTCTTTTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-T--TG---C-ATTTG-A-AA--A--GT-------A-TG-----AA-A-AA-------TAT--A-AC-AC-------TTTA--CAGGCT-TTTTGTT----T-C---T----T----TG-----TAC--CTG-TC-T--GT-AAGATGTACATG-TA--A---A--C----CCCCTTATCGGTCAATTATTAT-A--AACTTC-ACTTAAAAGGTA-TGGAAATATGTTT
gi|81347                      : ATCAA-CACAC-T-A-A-GTAAGC-AAAAT--AATTT--C-ATAA---TCTGTTT---A--TTT-ATC------AC--A-TAT---T-A--C-------GAT-AAC-AAAGCAA-T--ATCTA-G--TG--TC-A-T-T--TTCA-T----T--AAT-T-AAC---T--CACAAAGG--TGAAA---ATTG------AT-------------------------TGTGAA-A---GA-G-TA-CAAAAT-G-A---A-AAAT--TC-TCA--------A--TTAA-T-A-CAAAAT---TACA-TA----TTTTGG--GC-AT-ATTTTCATAA-TTTT----TA-T-TTA-ACC-A--C-TT-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-GTT--TG---C-A-TTG-A-AA--A--GT-------A-T------AA-A-AA-------TAT--A-GC-CC-------TTCA--TTGACT-T----TTTTTCT-T---T----T----TGT----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--T------C----CCCCTTATCGGTCAATTACTAT-A--AACTTC-AATGAAAGGTTA-AGGAAATATGTT
gi|81348                      : ATCAA-CACAA-T-A-G-GAAAGT-AAAAT--ACTTT--C-ATAA---TCTGTTT---ATTTTT-ATC------AT--A-
gi|81349                      : ATCAA-CACAA-T-A-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT--T-ATAA---TATGTTT---A--TTT-ATC------AC--A-TAT---T-A--CATTGTACGTT-AAC-AAATCAG-T--ATTTA-G--TG--TT-A-C-T--T-CA-T----C--AAA-T-AAC---T--CACAAAGA--TGAAA---AGTG------GT-------------------------GGTGAA-A---GT-G-TA-CAAAAC-G-A---A-AAAT--TC-GCA--------A--TTAT-T-A-CAAAAT---AACA-TAT---TTTGGG--GC-AT-ATTTTCGTAA-TTTCA---TG-T-TTA-GAC-AC-C-CT-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AA------A-AAT---------AT---------------------A-AA--------------------------A-AA-------TAT--A-GC-AC-------TTTA--CTGGCT-T----TT----T-G---TAC--T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--T---A--C----CCCCATATCGGTCAATTACTAT-A--AACTTC-ACTGAAAATTTA-
gi|81350                      : ATCAA-CACAA-T-A-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT----ATAA---TATGTTT---A--TTT-ATC------AC--A-TAT---T-A--CATTGTACGTT-AAC-AAATCAG-T--ATTTA-G--TG--TT-A-C-T--TTCA-T----C--AAA-T-AAC---T--CACAAAGA--TGAAA---AGTG------GT-------------------------GGTGAA-A---GT-G-TA-CAAAAC-G-----A-AAAT--TC-GCA--------A--TTAT-T-A-CAAAAT---AACA-TAT---TTTGGG--GC-AT-ATTTTCGTAA-TTTCA---TG-T-TTA-GAC-AC-C-CT-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AA------A-AAT---------AT---------------------A-AA--------------------------A-AA-------TAT--A-GC-AC-------TTTA--CTGGCT-T----TT----T-G---TAC--T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--T---A--C----CCCA-TATCGGTCAATTACTAT-A--AACTTC-ACTGAAAATTTA-AAATAATA
gi|81351                      : ATCAA-CACAA-T-A-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT--T-ATAA---TATGTTT---A--TTT-ATC------AC--A-TAT---T-A--CATTGTACGTT-AAC-AAATCAG-T--ATTTA-G--TG--TT-A-C----TTCA-T----C--AAA-T-AAC---T--CACAAAGA--TGAAA---AGTG------GT-------------------------GGTGAA-A---GT-G-TA-CAAAAC-GAA---A-AAAT--TC-GCA--------A--TTAT-T-A-CAAAAT---AACA-TAT---TTTGGG--GC-AT-ATTTTCGTAA-TTTCA---TG-T-TTA-GAC-AC-C-CT-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AA------A-AAT---------AT---------------------A-AA--------------------------A-AA-------TAT--A-GC-AC-------TTTA--CTGGCT-T----TT----T-G---TAC--T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--T---A--C----CCCCATATCGGTCAATTACTAT-A--AACTTC-ACTGAAAATTTA-
gi|81352                      : ATCAA-CACAA-T-A-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT--TTATAA---TATGTTT---A--TTT-ATC------AC--A-TAT---T-A--CATTGTACGTT-AAC-AAATCAG-T--ATTTA-G--T----T-A-C-T--TTCA-T----C--AAA-T-A-C---T--CACAAAGA--TGAAA---AGTG------GT-------------------------GGTGAA-A---GT-G-TA-AAAAAC-G-A---A-AAAT--TC-GCA--------A--TTAT-T-A-CAAAA----TAAA-TAT---TTTGGG--GC-AT-ATTTTCGTAA-TTTCA---TG-T-TTA-GAC-AC-C-CT-T----T-TTTCTTCTT-TA
gi|81353                      : ATCAG-CACAA-T-A-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT--C-ATAAGATTCTCTTT---A--TTT--TT------AC--A-TAT---T-A--C-------GTTTAAA-AAGTCAA-T--ATTTA-G--TG--TT-A-C-T--TTCA-T----C--AAT-C-AAC---T--CACAAAGA--TTAAA---ATTG------CT-------------------------GTTGAA-A---GT-G-TA-CAAAAT-A-A---G-AA
gi|81354                      : ATCAA-CACA--T-A-G-AAA--C-AAAAT--G------T-A-AA---TATGTTT---A--TTTTATC------A---A-TAT---TGA--C-------GAT-A-C-AAAGCAA-T--ATTAATG--TGAGTT-G-T-T--TTCA-G-------AAT-TGAAC---T--CACAAAGG--TGAAA---ATTGA-----GT-------------------------GGTG-A-A---GT-G-TA--AA----G-A---A-AAAT--TC-GCA--------A--TTAT-T-T-CTAAA----TA-A-TAT---TTTGGG--GCAAT-ATGTT-GTA---TTCA---CG-T-TTA-ATCAAC-T-GT-T----TATTGCTTCTT-TAGTAATAATTGA-GAT----TT-ACATC
gi|81355                      : ATCAA-TACAAAT-ATG-GAAAGCCAAAATGGATTTT--C-ACAA---TCTGTGT---A--TTT--TA------AC--A-T-----T-G--C-------G-----C-AAAT-AG-TTTGTCCG-GCCTA--TT-A-C-A--T-CA-TATTAC--ATT-T-AACAAAT--CAATAAGGAATTAAACCTATTGTCGTATGT-------------------------CGT-AA-C---GT-G-TATCAAAAT-G-ATTGA-AAAT--TC-GCATAATTAACA--TTAT-TTA-CTATATA--TATA-CATCCGTTTTGGAGGC-AT-ATTTTCGTAAATTTCAGTGTG-T-TTA-ACT-AG-C-CT-TATTGT-TTCTTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-GATTTTATT-GTATCT-G-TTCTGTGCC-ATTTG-A-AAGGA--GT-------A-T------AA-G-AAAAAACCCTATTAA-GCAAC-------TTTA--CGGGC
gi|81356                      :  TCAA-CACAA-T-A-G-GAAAGC-AAAAT--TATTT--C-ACAA---TCTGTTT---A--TTT-ATC------AC--A-TAT---T-A--C-------GTT-AAC-AAATCAG-C--ATTTA-G--TG--TT-A-C-T--TTCA-T----C--AAT-T-AAC---T--CACAAAGA--TGAAA---ATTG------GT-------------------------GGTGAA-A---GT-G-TA-CAAAAT-G-A---A-AAAT--TT-ACA--------A--TTAT-T-A-CAAAAT---TACA-TGT---TTTGGG--GC-AT-ATTTTCGTAA-TTTCA---TG-T-TTA-ACC-A--C-CT-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-G--TG---C-ATTTG-A-AA--A--GT-------A-TATAAAAAA-A-AA-------TAT--A-GC-AA-------TTTT--CAAGCT-T----TT----T-T---TTTCAT----TG-----TAAAGCT--TT-T--GT-A------ACGTG-TA--T---A--C----CCCTTTTTCGGTCAATTGCTA--ACTAACTTC-ACTGA
gi|81357                      :  TCAATCACAG-T-A-G----AG---AAAT--A-TTT--C-ATAA---TCTGTTCTC-A--TTT-TCC------TT--A-TTT---T-A--C-------GTT-A-C-AAGC--A-T--ATTTA-G--TG--TT---C-T--CTC------------T-T-AAT---T--CACAA--G--TGAAA---AT-G------GTA------------------------GGTGAG-A----T-GCTG-AAAAATTG-A---A-A--T--TC-GCA--------AGATTAT-T-G-CAA------TACA-T-T---TTTTTG--GC-ATTGTTTTTATTA-TTT-A---TG-T-TTAGACC-AC-C-TT-T----T-TTTCTTCTT-TAG---T-A-T-A-GAT----TT-AC--TT-G-T--TG---C--TTTGAA-AA--A--GT-------A-T------AC-A-AA-------TAT--A-G--AC--------TTA--CTGCCT-T----TTC---T-T---T----T----TGTTTGTTACAG-T--TC-T--GT--------ACATGCTA--T---A--C----CCC--TATCGGTCAATT-CT-T-A--AAATTC-A-TGAAA--TTA-GG---ATGTGCTT
gi|81358                      :    AA-CGCAA-T-A-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT--C-ATAA---TCTGTTT---A--TTT-ATC------AT--A-TAT---T-A--T-------GTTTAAC-AAAGCAA-T--ATTTA-G--TG--TT-A-C-T--TTCA-T----C--AAT-T-AAT---T--CACAAAGG--TGAAA---ATTG------GT-------------------------GGTGAA-A----T-G-TA-CAAAAT-G-A---A-AAAT--TC-GCA--------A--TTAT-T-A-CAAAAT---TACA-TAT---TTTTGG--GC-AT-ATGTTCTTAA-TTTCA---TG-T-TTA-A-C-AC-CTTT-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-G-T----TT--CATCT-G-T--TG---A-ATTTG-A-AA--A--GT-------A-TA-----AA-A-AA-------TAT--A-GC-AC-------TTTA--CTGGCT-T----TT----TAC---T----T----TG-----TACAGCTTCTC-T--GT-A------ACATG-TA--T---A-------CCCCTTATCGGTCAATTACAAT-A--AACTTCTCCTGAAAATTTA-AGG-AATGTGTTT
gi|81359                      :     A-CACAA-T-A-GAGAAAGC-AAAAT--AATTT--C-ATAAA--TCTGTTTTATA--TAT-ATC------AT--AATAT---T-A--C-------GTT-AAC-AAAGCAA-T--ATTTA-G--TG--TT-A-CAT--TTCAAT----C--AAT-TTAAT---TTTCACAAAGG--TGAAA---TTTGCTG---GT-------------------------GGTGAACA---GT-C-TA-CAAAAT-G-A---A-AA-T--TC-GCA--------A--TTATAT-AATGAGAT---TACAATAT---TTTTGG--GC-AT-ATTGTCTTAA-TTTCA---TG-T-TTT-AAC-AC-CTTT-T----T-TTTCTTCTTATAG-AAT-ATT-A-GAT----T---CATCTGG-T--TAGCTC-ATTTT-A-AA--AACGT-------ATT------AA-A-AA-------TAT--A-GC-AC--------TTA--CTGCTT-T----TT----T-T---C----T----TT-----TACAGCT--TCTT--GTAA------ACATG-TA--T---ATCC----CTCCTTATCGGTCAATTACTAT----AACTTC-ACTGAAAATTTATAGGGAACATGT
gi|81360                      :     A-CACAA-TTA----AAAAC-AAAAT--AATTTAAC-ATA----TCTGTTT---A--TTTTATCGACAATAC--A-TGTATTT-ATTC-------GTT-AACCGAATCAAAT--ATT---G--TG--TT-T-G-T--TTCA-T----CTTAATAT-AAC---T--CACAAAGAA-TGAAA---ATTG------GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGATGAA-A---GT-G-TA-CAAAAT-G-A---A-AAAT--CC-GCA--------A--TTAT-T-A-CAAAAT---TACA-TAT---TTTTGG--GC-AT-AATTTCGTAA-ATTTT---TG-T-TTA-ACC-AC-C-TA-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATAT-G-T--TG---C-ATTTG-A-AA--A--GT-------A-T------AATA-AG-------TAT--A-GC-GC-------TTTA--CTGGCT-T----GT----T-
gi|81361                      :                                            AA---TCTGTTT---A--TTT-ATC------AC--A-TAT---T-A--C-------GTT-AAT-TAATCAA-T--ATTTT-G--TG--TT-A-C-T--TTCA-T----C--AAT-G-AAC---T--CACAAAGA--TGGAA---ATTG------GT-------------------------GGTGAA-A---GT-A-TA-CAAAATAA-A---A-AAAT--TC-GCA--------A--TTAT-T-A-CAAAAT---TACA-TA
gi|81362                      :                                                        ---A--TTT-TTC------ATTTA-TAT---T-A----------ATT-AAC-ACAT--A-C--ATGTA-A--CA--T--A-T-T--TTCA-T----T--AAT-C-AAC---T----------------A---AT---------------------------------------AA-A---G----------AA----G---A-AAGT--TC-GCA--------A--TTAT-T-A-AAAAGT---TA----AT---T----A--G--AT-AGCTCTGTA--TTTCA---TG-A-TTT-ATC-AC-A-TG-A----T-TTTCTTCTG-TAG-AAT-ATT-A-CAA----TT-ACATCT-G-T--TG---C-ATCT--A-AA--A--TT-------T-T------AA-ACAA-------AAT--A-GC-AC-------TTCA--C-AACA-A----TT----T-C---T----T----T------TACGACT--TC-T--GT-A------ATATT-GA--TCAAA--C----CT---------TCAATT--TGA-A--AA--------AAAAAATTA-TCAAAATATGTTT
gi|81363                      :                                                                                  cT---T-A--C-------GTT-AAC-AAAGCAAAT--ATTTA-G--TG--TTTA-C-TACTTCA-TT---C--AAT-TTAAT---TTTCACAA-GG--TGAAA---ATTG------GT-------------------------GGTGAA-A---GT-G-TA-CAAAAT-G-A---A-AAAT--TG-CCA--------G--TTAT-T-A-CAAAAT---TACA-TAT---TTTTGG--TA-AT-AGTTTCGTAA-TTTCA---TG-T-TTA-ACT-AC-C-CT-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-T--TG---C-AATTG-A-AA--A--GT-------A-TA-----AA-A-AA-------TAT--A-GC-AC-------TTTA--CTGGCT-T----TT----T-TC--T----T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--T---A--C----CCCCTTATCGGTCAATTACTAT----AACTTC-ACTGAAAAGTTA-AGGAAATATGTTT
gi|81364                      :                                                                                   t---T-A--C-------GTT-AAC-ACAGCAA-T--ATTTA-G--TG--TT-AAT-T--TTCA-T----C--CAT-T-AAC---T--CACAAAGG--TGAAA---ATTG------AT-------------------------GGTG-A-A---GT-G-TA-CAAAAT-G-A---ATAAATTGTCGGCA--------A--TTA--T-A-TGAAATG--TACA-TA----TTTTGG--GC-AT-ACTTTCGTAATTTTCA---TG-T-TTA-ACC-AC-C-AA-T----T-TTTCT--TT-TCG-AAT-ATT-A-AAT----TTAACATCT---T--TG---C--TTTG-A-AA--A--GT-------A-TTAAAA-AA-A-AA-------TAT--A-GC--C-------CTTA----GGCT-T----TT----T-TC--T----T----TG-----TCCAGCT--TA-TC-GT--------ACATG-TA--T---A-------CCCCTTATCGGTCAATTACTAT-A--ATCTTC-ACTGAAA
gi|81365                      :                                                                                                                            tc--TG--TT-A-C-T--TTCA-G----C--AAT-T-AAT---T--CACAAAGG--TGAAA---ATTG------GT-------------------------GGTGAA-A----T-G-TA-CAAAAT-G-A---A-AAAT--TG-GCA--------A--TTAT-T-A-CAAAAT---TACA-TAT---TTTTGG--GC-AT-ATTTTCTTAA-TTTCA---TG-T-TTA-ACC-AC-C-TT-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-T--TG---
gi|81366                      :                                                                                                                                                                -AAC---T--TGTAAAGA--TTA------TTG------GT-------------------------GG-GAA-ATATATAG-TA-CCAAAT---A---A-AAATG-TC-GCA--------A--TTAT-T-A-TAAAAGCCATGCA-TAT---GA--GG--AC-AT-AATGTCCTGA-TTTTA---TG-G-TTT-ACC-AC-A-TA-C----T-TTTCTAGTT-CAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-T--TG---C-ATTT
gi|81367                      :                                                                                                                                                                                         ---ATTG------GT-------------------------GATGAA-A---GT-G-TA-CAAAAT-G-A---A-AAAT--TC-ATA--------A--TTAT-T-A-CAAAGT---TACA-TAT---TTTTGG--GC-AT-ATTTTCGTAA-TTTCT---TG-T-TGA-ACC-AC-C----T----A-TTTTTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACAT
gi|81368                      :                                                                                                                                                                                                                                                  A-CAAAAG-A-G---A-AAGT--TC-GCA--------A--T-AT-T-A-CAAAG-------A-CAG---TCTTGG--AT-AT-AGTGTAGTGA-TTTCA---A-----TA-ATT-AC-T-CT-GA---T-TTTCTTCTT-TAG-AAT-ATT-ACGAT----T--ACATCT-G-A--TG---C-ATTTG-A-AA--A--GTTAAAAAAA-A------AA-A-AA-------AAA--A-GC-AC-------GCCA--C-AACA-A----TT----T-C---T----T----T------TACGACT--TC-T--GT-A------ATATG-CA--T---A--
gi|81369                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GTAG-TTTCA---TGATGTTA-AGC-GA-C-CTGT----T-TTTCTTCTT-TAA-GAT-ATT-A-GTT----TC-ATCTCT-G-T--TG---CCAATTG-ACAA--A--GT-------A-CTGAA--AA-A-AG-------TAT--A-GC-AC-------TTTAAACTGGCT-A----TT----T-T---T----TCTTGTG-----TACAGCC--TC-TAGGT-A------A-ATG-TAAGT---A--CTGCGCTCCTTATCGGTCAATTACTAT-A--AACTTC-ACTGAAAAGTTT-AGGAAATATATT
gi|81370                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ----T-TTTCTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-AAT----TT-ACATCT-A-T--TG---C-ATTTG-A-AA--A--GT-------A-TTAAAAAAA-A-AA-------TAT--A-GC-CC-------TTTA--CTGGCT-T----TT----T-TC--T----T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--T---A--C----CCCCTTATCGGTCAATTACTAT-A--ATCTTC-ACTGAAA
gi|81371                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTG-A-AA--C--GT-------A-A------AA-A-AAGCGAAG-TAT--AAGC-ACACTTGATTTTG--C-GGCTAT----TT----T-TCCCT----T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--T---A--A----CCCTTTATAGGTCAATTACTAT-A--AACTTC-ACTGAAAAGTTA-AGGAAATATGTTT
gi|81372                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -AC-------TTTA--CTGGCT-T----TTT---T-T---T----T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--T---A--C----CCCCTTATCGGTCAATTACTAT-A--AACTTC-ACTGAAAATTTA-AGGAAATATGTTT


blockSeqs                     :      T     A T T A      C     GG     AA T    GAT       TAT TT   T   GACAAT  TT A   ATT G TT ATTGTAC   T   C       A TT     T CC  AG  T A A AC    A ATTA TT   A G   AAA TT        AA     CCT    TCGTAT  NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG      C TAT  A C  T      T A TTG T    TG  G   TAATTAAC GA    A T A      CCA    A   CCG      AG  A  T          A     GTG  A G   G   A  . TT G ATTG A         A   T   A   G C   TTTA  A      G T TC  TGC C     A C  GGA    TAAAAAAAA         T C  AAAACCC   TA A  A  ACTTGAT    AA T    A TTTG  TTTC A TTTCA    CTTG  TTTGT       TC  T AG  A AGATGT     C  AG CAA CTGCG                        . CT      T        G   T
blockSeqs                     :      .     . . . .      .     G      .  .    A         TC  .    T   .       .  .   .   . .  ATTGTAC   T   .       A .      . .   .   . . . .     . T    .    . T   .   TT        A      .      CTG     A                              . .    . .  .      A . .   .    G   .   .        .     . . .      A      .   .        .   .  .          T     .    . .   .   .  . TT . A    .         .   .   .   . .   .     .      . . .   GCT .     . .  AAC    ATATAAAA          . .  GCGAAG    .  .  .  .          .  A    . .     C    . CCCT     .     T           G   . C   . AGATGT     .  .  .   TCC                          . .       .        G   .
blockSeqs                     :      .     . . . .      .     .      .  .    .         .   .    .   .       .  .   .   . .  ATTGTAC   .   .       . .      . .   .   . . . .     . .    .    . T   .   .         .      .      A       .                              . .    . .  .      . . .   .    .   .   .        .     . . .      G      .   .        .   .  .          .     .    . .   .   .  . C  . .    .         .   .   .   . .   .     .      . . .   .   .     . .  A      ATTAAAAA          . .  .         .  .  .  .          .  T    . .     T    . TAC      .     .           .   . .   . .          .  .  .   C                            . .       .        G   .
blockSeqs                     :      .     . . . .      .     .      .  .    .         .   .    .   .       .  .   .   . .  ATTGTAC   .   .       . .      . .   .   . . . .     . .    .    . .   .   .         .      .      .       .                              . .    . .  .      . . .   .    .   .   .        .     . . .      .      .   .        .   .  .          .     .    . .   .   .  . C  . .    .         .   .   .   . .   .     .      . . .   .   .     . .  A      ATTAAAA           . .  .         .  .  .  .          .  T    . .     .    . TAC      .     .           .   . .   . .          .  .  .   C                            . .       .        T   .
blockSeqs                     :      .     . . . .      .     .      .  .    .         .   .    .   .       .  .   .   . .  .         .   .       . .      . .   .   . . . .     . .    .    . .   .   .         .      .      .       .                              . .    . .  .      . . .   .    .   .   .        .     . . .      .      .   .        .   .  .          .     .    . .   .   .  . T  . .    .         .   .   .   . .   .     .      . . .   .   .     . .  A      ACTGAA            . .  .         .  .  .  .          .  T    . .     .    . TAC      .     .           .   . .   . .          .  .  .   C                            . .       .        T   .
blockSeqs                     :      .     . . . .      .     .      .  .    .         .   .    .   .       .  .   .   . .  .         .   .       . .      . .   .   . . . .     . .    .    . .   .   .         .      .      .       .                              . .    . .  .      . . .   .    .   .   .        .     . . .      .      .   .        .   .  .          .     .    . .   .   .  . C  . .    .         .   .   .   . .   .     .      . . .   .   .     . .  A      ATG               . .  .         .  .  .  .          .  T    . .     .    . CT       .     .           .   . .   . .          .  .  .   C                            . .       .        T   .
blockSeqs                     :      .     . . . .      .     .      .  .    .         .   .    .   .       .  .   .   . .  .         .   .       . .      . .   .   . . . .     . .    .    . .   .   .         .      .      .       .                              . .    . .  .      . . .   .    .   .   .        .     . . .      .      .   .        .   .  .          .     .    . .   .   .  . C  . .    .         .   .   .   . .   .     .      . . .   .   .     . .  A      ATG               . .  .         .  .  .  .          .  G    . .     .    . CT       .     .           .   . .   . .          .  .  .   C                            . .       .        T   .
blockSeqs                     :      .     . . . .      .     .      .  .    .         .   .    .   .       .  .   .   . .  .         .   .       . .      . .   .   . . . .     . .    .    . .   .   .         .      .      .       .                              . .    . .  .      . . .   .    .   .   .        .     . . .      .      .   .        .   .  .          .     .    . .   .   .  . C  . .    .         .   .   .   . .   .     .      . . .   .   .     . .  A      ATA               . .  .         .  .  .  .          .  A    . .     .    . CT       .     .           .   . .   . .          .  .  .   C                            . .       .        T   .
blockSeqs                     :      .     . . . .      .     .      .  .    .         .   .    .   .       .  .   .   . .  .         .   .       . .      . .   .   . . . .     . .    .    . .   .   .         .      .      .       .                              . .    . .  .      . . .   .    .   .   .        .     . . .      .      .   .        .   .  .          .     .    . .   .   .  . C  . .    .         .   .   .   . .   .     .      . . .   .   .     . .  A      ATT               . .  .         .  .  .  .          .  T    . .     .    . CT       .     .           .   . .   . .          .  .  .   C                            . .       .        A   .
blockSeqs                     :      .     . . . .      .     .      .  .    .         .   .    .   .       .  .   .   . .  .         .   .       . .      . .   .   . . . .     . .    .    . .   .   .         .      .      .       .                              . .    . .  .      . . .   .    .   .   .        .     . . .      .      .   .        .   .  .          .     .    . .   .   .  . G  . .    .         .   .   .   . .   .     .      . . .   .   .     . .  A      ATA               . .  .         .  .  .  .          .  T    . .     .    . T        .     .           .   . .   . .          .  .  .   C                            . .       .        G   .
blockSeqs                     :      .     . . . .      .     .      .  .    .         .   .    .   .       .  .   .   . .  .         .   .       . .      . .   .   . . . .     . .    .    . .   .   .         .      .      .       .                              . .    . .  .      . . .   .    .   .   .        .     . . .      .      .   .        .   .  .          .     .    . .   .   .  . C  . .    .         .   .   .   . .   .     .      . . .   .   .     . .  A      AT                . .  .         .  .  .  .          .  T    . .     .    . T        .     .           .   . .   . .          .  .  .   C                            . .       .        G   .
blockSeqs                     :      .     . . . .      .     .      .  .    .         .   .    .   .       .  .   .   . .  .         .   .       . .      . .   .   . . . .     . .    .    . .   .   .         .      .      .       .                              . .    . .  .      . . .   .    .   .   .        .     . . .      .      .   .        .   .  .          .     .    . .   .   .  . C  . .    .         .   .   .   . .   .     .      . . .   .   .     . .  A      AT                . .  .         .  .  .  .          .  T    . .     .    . T        .     .           .   . .   . .          .  .  .   C                            . .       .        G   .
blockSeqs                     :      .     . . . .      .     .      .  .    .         .   .    .   .       .  .   .   . .  .         .   .       . .      . .   .   . . . .     . .    .    . .   .   .         .      .      .       .                              . .    . .  .      . . .   .    .   .   .        .     . . .      .      .   .        .   .  .          .     .    . .   .   .  . T  . .    .         .   .   .   . .   .     .      . . .   .   .     . .  A      AT                . .  .         .  .  .  .          .  T    . .     .    . T        .     .           .   . .   . .          .  .  .   A                            . .       .        T   .
blockSeqs                     :      .     . . . .      .     .      .  .    .         .   .    .   .       .  .   .   . .  .         .   .       . .      . .   .   . . . .     . .    .    . .   .   .         .      .      .       .                              . .    . .  .      . . .   .    .   .   .        .     . . .      .      .   .        .   .  .          .     .    . .   .   .  . T  . .    .         .   .   .   . .   .     .      . . .   .   .     . .  A      AT                . .  .         .  .  .  .          .  T    . .     .    . C        .     .           .   . .   . .          .  .  .   C                            . .       .        .   .
blockSeqs                     :      .     . . . .      .     .      .  .    .         .   .    .   .       .  .   .   . .  .         .   .       . .      . .   .   . . . .     . .    .    . .   .   .         .      .      .       .                              . .    . .  .      . . .   .    .   .   .        .     . . .      .      .   .        .   .  .          .     .    . .   .   .  . T  . .    .         .   .   .   . .   .     .      . . .   .   .     . .  A      TT                . .  .         .  .  .  .          .  T    . .     .    . T        .     .           .   . .   . .          .  .  .   .                            . .       .             
blockSeqs                     :      .     . . . .      .     .      .  .    .         .   .    .   .       .  .   .   . .  .         .   .       . .      . .   .   . . . .     . .    .    . .   .   .         .      .      .       .                              . .    . .  .      . . .   .    .   .   .        .     . . .      .      .   .        .   .  .          .     .    . .   .   .  . C  . .    .         .   .   .   . .   .     .      . . .   .   .     . .  C      AA                . .  .         .  .  .  .          .  T    . .     .    . T        .     .           .   . .   . .          .  .  .   .                            . .       .             
blockSeqs                     :                                              .         .   .    .   .       .  .   .   . .  .         .   .       . .      . .   .   . . . .     . .    .    . .   .   .         .      .      .       .                              . .    . .  .      . . .   .    .   .   .        .     . . .      .      .   .        .   .  .          .     .    . .   .   .  . A  . .    .         .   .   .   . .   .     .      . . .   .   .     . .  .      .                 . .  .         .  .  .  .          .  .    . .     .    . T        .     .           .   . .   . .          .  .  .   .                            . .       .             
blockSeqs                     :                                                        .   .    .   .       .  .   .   . .  .         .   .       . .      . .   .   . . . .     . .    .    . .   .   .         .      .      .       .                              . .    . .  .      . . .   .    .   .   .        .     . . .      .      .   .        .   .  .          .     .    . .   .   .  . T  . .    .         .   .   .   . .   .     .      . . .   .   .     . .  .      .                 . .  .         .  .  .  .          .  .    . .     .    . T        .     .           .   . .   . .          .  .  .                                                        
blockSeqs                     :                                                                                    .   . .  .         .   .       . .      . .   .   . . . .     . .    .    . .   .   .         .      .      .       .                              . .    . .  .      . . .   .    .   .   .        .     . . .      .      .   .        .   .  .          .     .    . .   .   .  . T  . .    .         .   .   .   . .   .     .      . . .   .   .     . .  .      .                 . .  .         .  .  .  .          .  .    . .     .    .                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                              .   .   . . . .     . .    .    . .   .   .         .      .      .       .                              . .    . .  .      . . .   .    .   .   .        .     . . .      .      .   .        .   .  .          .     .    . .   .   .  . C  . .    .         .   .   .   . .   .     .      . . .   .                                                            .  .          .  .                                                                                                                                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                .   .   .         .      .      .       .                              . .    . .  .      . . .   .    .   .   .        .     . . .      .      .   .        .   .  .          .     .    . .   .   .  . C  . .    .         .   .   .   . .   .     .                                                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                         .      .       .                              . .    . .  .      . . .   .    .   .   .        .     . . .      .      .                              .     .    . .   .   .  . .  . .    .         .   .   .   . .   .     .                                                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                   .      . . .   .                                                                                                           .    .         .                                                                                                                                                                                                                                                         


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : ATCAA-CACAA-T-A-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT--C-ATAA---TCTGTTT---A--TTT-ATC------AC--A-TAT---T-A--C-------GTT-AAC-AAATCAA-T--ATTTA-G--TG--TT-A-C-T--TTCA-T----C--AAT-T-AAC---T--CACAAAGG--TGAAA---ATTG------GT-------------------------GGTGAA-A---GT-G-TA-CAAAAT-G-A---A-AAAT--TC-GCA--------A--TTAT-T-A-CAAAAT---TACA-TAT---TTTTGG--GC-AT-ATTTTCGTAA-TTTCA---TG-T-TTA-ACC-AC-C-CT-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-T--TG---C-ATTTG-A-AA--A--GT-------A-T------AA-A-AA-------TAT--A-GC-AC-------TTTA--CTGGCT-T----TT----T-T---T----T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--T---A--C----CCCCTTATCGGTCAATTACTAT-A--AACTTC-ACTGAAAANTTA-AGGAAATATGTTT
finalCons                     : ATCAA-CACAA-T-A-G-GAAAGC-AAAAT--AATTT--C-ATAA---TCTGTTT---A--TTT-ATC------AC--A-TAT---T-A--C-------GTT-AAC-AAATCAA-T--ATTTA-G--TG--TT-A-C-T--TTCA-T----C--AAT-T-AAC---T--CACAAAGG--TGAAA---ATTG------GT-------------------------GGTGAA-A---GT-G-TA-CAAAAT-G-A---A-AAAT--TC-GCA--------A--TTAT-T-A-CAAAAT---TACA-TAT---TTTTGG--GC-AT-ATTTTCGTAA-TTTCA---TG-T-TTA-ACC-AC-C-CT-T----T-TTTCTTCTT-TAG-AAT-ATT-A-GAT----TT-ACATCT-G-T--TG---C-ATTTG-A-AA--A--GT-------A-T------AA-A-AA-------TAT--A-GC-AC-------TTTA--CTGGCT-T----TT----T-T---T----T----TG-----TACAGCT--TC-T--GT-A------ACATG-TA--T---A--C----CCCCTTATCGGTCAATTACTAT-A--AACTTC-ACTGAAAANTTA-AGGAAATATGTTT