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3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|87297                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tatatcatttataaattttgtaataaaaaaatgctgtcaattcaatggtaataaatcccctaaaaaccatatgaatctctgaaataagctgaatgataagctaataaatgatgattttgaaaac-----T---A--G---TTT-CA-------A-AGG-G---T----GTG----------------T-A--TT-TA---T---A--G--A-GA--T---TT-T-T----G------C---A-AA----TATT--T--C-T--A-A----TTT-G-AAG-G--G--G-C-A--T----A--AC---TT--C-C--A--T--A---A-ACAA--T--TT---A-G-A-G---GA-T-A-A--A-T--A---------TTT--C---T-G-----CT--AA-T--A-----------------------TTG-T-A--C-AG----A-C-T------A--T--A---T-AAT---TGA---T-G--T-TTC---T--GAC-------T---G-T--A-T-A---CC-A-A-G--T-----TT-C---G--T-T----G------AA--T------TT-GA-AT-T--G-A--------T---A-G--T-T-C---A-A----------GA-----G-G-AGT---TT----G-C-G-AT-G-A-CAA-G-GA--TC-ATT
gi|87298                      :                         tatatcaattgtaaaatttgtaataaaaaaaaaatgctgtcaattcacatggtaagtaaatcccctaaaaaccatatgaaatctgtgaaataagctgaatgataagctaataaatgatggatttttgaaaacattgttTCATTTATA--AA--A-TTT-----T--G------T--T---A-ATAAAAAAA---T--TT-C-TGTTTTCA-GTTC-AGCCAT--T-GG-T-ATTAAA--T------CCCCT--T-AAAA---ACC-A---TA-G--------------AA--T-T-T-C-T-GA-----A------ATA--AGCTG--AA----A--TA----TA----TG-ATG-------------------------------------AT---TT---TT-G-A-AA--C-T---ATTGT-----T---A--G---TTT-CA-------A-AGG-GG-T-------------CA--T-T-G--TCA--TT-TA---T---G--A--G-GA--T---TT-T-T----G------C---A-AA----T--T--TTGT-T--A-A--G-TTT-G-AAG-G--G--G-C-A--TTA--A--A----TT--C-C--A--T--A---ACA--AT-T--T----A-G-A-G---G--T-T-A--A-T--A----------TT--CC--T-A-----CT--AA----A-----------------------TGG-C-A--C-A-----A-C--------A--C--A---G-AG----TGA---T-G--T-TCT---T--A-T-------T--------A-T-AG--CC-A-A-G--T-----T--T---T--T-CAGTTG------AA--G------TT-GG-------G-A--------T---A-G--T-T-T---C-A----------GA-----G-GAAG----TT----G-C-G-AT-G-A-CAG-G-GA--TC-ATT
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gi|87300                      :                                                                                                                                                                                                                                                                       tatatcatttataaaattttgtaataaaaaaaatttctgtcagttcagcatggtattaaatcccctaaaaaccatatgaatctctgaaataaactgaaatgataagctaatatatgatgattttttcaaagggtaatgtc-AT-AT-T---GACGT---TT-T-T----G-AA--T-----ATTGT-----T---A--G---TT--CA-------A-AGG--G-T-------------CA--A-GTG--TCA--TT-T----T---G--A--G-GA--T---TT-T-T----G------C---A-AA----T--T--TT-C-T--A-A--G-TTT-G-AAG-A--GA-G-C-A--T----A--ACT--TT--C-C--A--T--G---A-A--A--T--TTT--A-A-A-G---GA-T-C-A--A--------------TTT--CC--T-G-----CTT-AA-T--------------------------T-G-C-A--C-ATAGCAA-CAT------A-----A---T-A-----TGA---T-G--T-TCT---T--A-C-------T---G-T--A-T-A----C-A-A-GT-T-----T--C---A--T-T----G------AA--T------TT-GG-GT-T--G-GGT------T---A-G--T-T-TCACC-A----------GC-----G-G-AG----TT----G-C-G--T-G-A--AA-G-
gi|87301                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tattcattttataaaattttttgtaataaaaaaattttgtcaagttcagcatggtaatttaaatccctaaaaagcataagctgattagaaatgtaagctaata-A--TT-TAC--T---G--A--G-G---T---TT-T-T----G------C---A----------T--T--T-T--C-A--G-TT--G-AGG-G--G--G-G-A--T----A--ACA--TT--C-A--A--C--A---A-A--A--T--T----TTG-A-G---G--T-C-A--A---------------TT--TC--T-G-----CT--AT-C--A-------------------------G-C-A--C-A-----A-A-T------A--T--A---T-A-------------G--T-TCT---T--A-C-------T---G-T----T-A---C--A-A-G--T-----T--TCA-T--T-T----G------AA--T------T--GG-TT-G--G-A--------T---A-G--T-T-----C-A----------GA-----G---AG----TT----G-C-G-AT-G-A-CAA-GCA---TT-ATTa
gi|87305                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tattcatttaaaaattgtaataaaaaacgtctctgtcagttcagctggtataatccaaaatctatgaatttcgaaataagtgaaatgattaagcgtaatgatgatttttgaaattgttagttcaagggtcatgtc-TTC---AAG-G--G--G-C-A--T----A--ACT--TT--C-C-----T--A---A-A--AT-T--T----A-G-A-----GA-T---A--A-T--A---------TTT--TC--T-G-----CT--AA-T--A-----------------------T-G-C-A--C-A-----A---T------A--CA-A---T-A-----TGA---T-G--T-TCT---T----C-------T---G-TA-A-T-A---CCAA-A-G--T-----T--C---G--T-T----G------AA--T------TT-GG-TT-G--G-G--------T---A-G--T-T-T---C------------GA-----G-GTAGT---TT----G-C-G-AT-G-A-CAA-G-A---TTCATT
gi|87306                      :                                                  atatcatttataaaaaaaatttgaaataaaaaatttctgtcagtttgcatggtatgtaatccgcctaaaaaccatataaatttctgaaatactgaaaatgataaggtatcgttTCATTTATG--AG-GA-TTT-----T--G---------C---A-A-------A---T--TT-T-GT-----A-GTTG-A---AG--G-TG-C-AT--AA--A------TCC-A--T-AAAA---TTT-A---GAAGGA-T---C----AAAT--T-TTC-C-T-GC-T---A------ATA--TGCAC--AA-C-TA--CA----TA----TG-ATGT--TC--TTACT-------G--T-AT-AC-C---AA-GT---TTGC-GT-T-G-AA--T-TTGGTTAGG-----T---A--G---TTT-CA-------G-AGG-AG-TT----GTGA-TGACA--A-G-A--TCA--TT-TA---T---G--A--G-GA--T---TT-T----------------------------------C-T--A-A--G-TTT-G-AAG-G--G--A-C-A--T----A--AC---TT--C-T--G--T--A---A-A--A--T--TT---A-G-A-G---GA-T-C-A--A-A--A---------TTT--CC--T-G-----CT--AA-T--A-----------------------T-G-C-A--A-A-----A-C-T------A--C--A---T-A-----TGA---T-G--T-TC----T--A-A-------T---G-T--A-TGA---CT-A-A-G--T-----T--TCG-T--T-G----A------AA--T------TT-GG-TT-G--G-G--------T---A-G--T-T-T---C-A----------GA-----G-G-AG----TT----G-C-G-AT-G-A-CAA-G-C---TT-ATT
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gi|87309                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atatatctataaattttgtaataaaaaaaaaaattctgtcagttcagcatgttataatcccctaaaaaccatatgaatctttgaaataagctgaaatgataagctatatatgatgattttttaatattgttagtaaagggtagttc-A--TT-TAA--T---G--A--G-GA--TGTTTT-T-G----G------C---A-AA----T--T--TT-C-T--A-AT-G-TTT-GGAAG-G--G--G-C-A--T----A--A----TT--T-CCGA--T--A---G-A--A--T--TT---ATG-A-G---GA-TTC-A--A-ATGA---------TTT--AC--T-G-----CT--AA-TG-A-----------------------T-G-C-A--C-A-----A-C-T------A--C--A---T-T-----TGA---T-G--T-TCT---TA-A-C-------T---G-T--A-T-A---CC-A-A-G--T-----T--T---TG-T-T----G------AA--T------TT-GG-TT-G--A-G--------T---A-G--T-T-T---C-A----------GA-----
gi|87310                      : tatcatttataaaaacttttgtaataaaaagaaattctctcagtttcagcatggttatggtaatcccctaaaaaaaccatatgaaatctcttagatagctgaagatgataagctaatatatgattgattttttgaaatcttgttgttcaaaagggtcatgtcTCATTTATGTGAG-GA-TTTTCAACC--A------A--CCA-A-A-------A---T--TT-C-TA-----A-GTTT-G---AA--G-GG-C-ATT-AC--C------TTCCG--T-AAAG---ATTTA---GA-GGAAT---C----AATA--T-T-T-C-T-TG-CTTAA------ATA--TGCAC--AAAC-TAATCA----TA----TG-ATGT--TT--TT-TT-------A--CTGT-AA-CCA-AA-GT---CT-C-GT-T-GTAA--T-T-GGTTGGG-----T---A--G---TTTTCA-------G-AGG-AG-TT----GCGA-TGACA--A-G-AA-T-AATTTGTA---T---G--A--G--A--T---TT-T-C----A------C---A-AAAAT-T--T--T--C-T--A-A--G-TTT-G-AAATG--G--A-C-A--T----AT-AC---TT--G-C--G--T--A---A-A--G--T--TTT--A-G-A-G---GA-T-T-A--G-T--A---------TT---CC--T-G-----CT--AA-TTTA-----------------------T-G-C-A----A-----A-C-T------A--T--A---T-A-----TGA---T-G--TTCCT---T--A-A-------T---G----A-T-A---CT-A-AAG--T-----T--C---G--T-T----G------AA--T------TT-GG-TT-TTGG-G--------T---A-G--T-T-T---C-A----------GA-----G-G-AG----TT----G-CAG-AT-GAA-CAA-G-C---TT-ATT
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gi|87312                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atcaacttataaaattttgtaataaaaatt-G-G--TCA--TT-TA---T---G--AACG-AA--T---TT-T-T----G------C---A-GA----T--T--T--C-T--A-T--G-TTT-A-AAG-G--G--G-C-A--T----AACA----TT--C-C--A--T--A---A-A--AT-T--T----A-GAA-G---GA-T-C-A--A-T--A---------TTTC-CC--T-G-----CT--AA----A-----------------------T-G-aatcatt
gi|87312                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atcatttataacatttgtacataaaaaaaaaaattctgtcagcagcatggtatttaaatccgcctaaaaacccattgaatctttgaaataagctgagatgataacttaatatatgatgatttttttgaaatttggttagtcaaagggttaat---T--T-T----G------AA--T------T------T-T--G-T--------T---ACG--TGT-T---C-A----------GA-----G-G-AG----TT----G-C-G-ATGG-A-CAACG-A---TC-ATTatgtttgaattttgttacgtgttcagaggagttgcgatggacaacgatcatt
gi|87313                      :                                                                                                                                                                                                                                                                         atcatttataacatttgtacataaaaaaaaaaattctgtcagcagcatggtatttaaatccgcctaaaaacccattgaatctttgaaataagctgagatgataacttaatatatgatgatttttttgaaatttggttagtcaaagggttaatggtcatttatgaacgaatttttgcagatttctatgtttaaaggggcataacattccataaaatttagaaggatcaatatttccctgctaaatgatg-A--TT-TA---T---G--AACG-AA--T---TT-T-T----G------C---A-A-----T--T--G--C-T--A-A--G-TTT-A-AAG-G--G--G-C-A--T----A--AACACTT--C-C--A--T--A---A-A--AT-T--T----A-G-A-G---GA-T-C-A--T-A--T---------TTC--CC--T-G-----CT--AA----A-----------------------T-A-C-----------------------------------------TGA---T-G--T---------------------------------------------------------------T-T----G------AA--T------TT-TG-TTAC--G-A--------T---A-G--T-T-T---C-A----------GA-----G-G-AG----TT----GAC-G-AT-G-A-CAACG-A---TC-ATT
gi|87314                      :                                                  atcatttataacttttgtacataaaaaaaaaaatctgtcagcagcatggtattaaatcctaaaaacccatagaatctttgaaataagctgagatgataactataatatatgatgatttttttgaaatttggttgttcaagggtttgatattc---A-A-------A---T--TT-C-TGTC---A-GTTC-ATG-AT--G-GT-A-ATCAAA--T------CCCCT--CTAAAA---ATC-A---TA-TAA-T--------------T-T-C-C-T-G------A------AGA--TACACTGAA-T-GA--AC----TA----AG--------C--TAGCT-------AA-T-AT-AT-G---AT-GA---TT---TT-G-A-AA--T-----ATTGT-----T---A--G---TT--CA-------A-AGG--G-TC-----CG--TGTC----------C-A--TT-TA---T---G--A--G-GA--T---TT-T-T----GT-----C---A-AA----T--T--T--TAT--A-AA-G-TTA-G-A-G-G--G--G-C-A--T----A--AC---TT--C-C--ATTC--A---A-C--T--T--T----A-G-A-G---AA-T-C-A--A-T--A---------TTC--CT--T-G-----CT--AA-T--------------------------T-G-C-A--C-A-----C-C-T------A--C--A---T-A-----TGA---T-G--T-TC----T--A-C-------T---A-T--A-TAA---CC-A-A-GT-T-----T--C---G--T-T----G------AAATT------TT-GG-
gi|87314                      :                                                                                                                                         atcatttttaaaattttttaataaaaaCATTTATG--AG-GA-TTT-----T--T------GT-C---A-A-------A---T--TT-TATA-----AAGTTA-G---AG--G-GG-C-AT--AA--C------TTCCATTC-AACT----TT-A---GA-GAA-T---C----AATA--T-T-C-C-T-TGCT---A------AT---TGCAC--AC-C-TA--CA----TA----TG-ATGT--TC---TACT-------A--T-ATAAC-C---AA-GT---TT-C-GT-T-G-AAATT-TTGGtt
gi|87317                      :   atcatttttaaaattttttaataaaaaaaatttctgtcagttcatgatggtaatcaaatcccctctaaaaatcatataatttcctgaagatacactgaatgaactaagctagctaatatatgatgattttgaaatattgttagttcaaagggtccgtgtcTTATTTATA--AG-GA-TTT-----AA-G------G--C---A-A-------A---T--TT-C-TA-----A-ATTC-A---AA--TTGG-C-AT--AA--T------TCCTT--A-AAAA---ATT-A---GG-GGA-TA--C----GAAT--T-T-C-C-T-GG-T---A------ATA--TGCAC--AA-CATA--CA----TA----TG-ATGT--CC--TTACT-------A--C-AT-GT-C---AA-GT---TT---TG-C-A-A-----TCGGATCAG-----T---ATAG---TTT-CA-------G-AGG-AG-TT----GCG-CTGACA--A-G-G--TTA--TT-TA---T---G--A--G-GA--T---TT-A-A----GG-----C---A-AA----T--T--T--C-T--A-A--G-TTT-G-AAG-A--T--G-C-A--TTTATA--A----CT--C-CC-A--C--A---A-A--AA-C--T----A-G-G-G---GA-T-C-A--A-A--A---------TTT--CC--T-G-----GT--AT-T--A-----------------------T-G-C-A--C-A-----A-C-T------A--C--A---T-A-----TGA---T-G--T-CCT---T--G-C-------T---A-C--A-T-A---CC-A-A-G--T-----T--T---TG-T-A----A------AA--A------TC-GG-AT-C--A-G--------T---A-G--T-T-T---C-A----------GA-----G-G-Att
gi|87318                      :                                                                                                                                                                   TTATTTATG--AA-GA-TTT-----CA-G------G--C---A-A-------A---T--TT-C-TA-----A-GTTC-A---AC--G-AC-C-AT--AA---------TCCCA--C-AAAA---ATT-A---GA-GGA-T---C----AAAA--T-T-C-C-T-GG-T---A------ATA--TGCAC--AA-C-TA--CA----TA----TG-ATGT--CC--TTGCT-------A--C-AT-AT-G---AA-GT---TT-C-TT-C-A-AA--T-TCGGATCAG-----TATAA--G---TTT-CA-------G-AGG-AG-TT----GCGGCTGACA--A-G-G--T-A--TT-CA---T---G--A--G-GA--T---TT-A-A----G------C---A-AA----T--T--T--C-T--A-A--G-TTC-A-AAC-T--A--C-C-C--T----A--A----TT--C-C--A--C--A---A-A--A--T--T----A-G-A-G---GA-T-A-A--A-A--A---------TTT--CC--T-G-----GT--AA-T--A-----------------------TAG-C-A--C-A-----A-C-T------A--C--A---T-A-----TGA---T-G--T-CCT---T--G-C-------T---A-C--A-T-A---TG-A-A-G--T-----T--C---T--T-C----A------AA--T------TC-GG-AT-C--A-G--------T---A-G--T-T-T---C-A----------GA-----G-G-AG----TT----G-C-G-CT-G-A-CAA-G-G---TT-ATT
gi|87320                      :                                                                                                                                                                                                          ---A-A-------A---A--TT-C-TGTC---A-GTTC-A---GC--ATGG-T-ATT-AA--A------TCCCC--T-AAAA---ACC-A---TA-TGA-------------A--T-T-T-C-T-GA-----A------ATA---------AG-C-TG--AA-----A----TG-ATAA--------GCT-------AA-T-AT-AT-G---AT-GA---TT-T-TT-G-A-AA--T-----ATTGT-----T---A--G---TT--CA-------A-AGG--G-T-------------CA--T-G-T--C-A--TT-TA---T---G--A--G-GA--T---TT-T-T----G------CAAAA-AA----T--T--T----T--A-A--G-TTT-G---G-G--G--A-C-A--T----A--AAC--TT--C-C--A--T--A---A-C--AT-T--T----A-G-A-G---GA-T-C-A--
gi|87320                      :                                                                                                                                            tctacagtattttgaaataaaaaTCATTTATG--AG-GA-TTT-----T--T------G--CAAAA-A-------A---T--TT---TA-----A-GTTT-----GG--G-GA-C-ATA-AA--C------TTCCA--T-AACA---TTT-A---GA-GGA-T---C----A
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gi|87325                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttgtaataaaaaaaattctgtcagttcagccccatggtattaaaatcccctagtaaaaaccatatgaattctgaaataagctgaaatgataagctaatatatgttgattttttgaaattattgttagttcaaagggtcatgc-----T---A--G---TTT-CA-------A-AGG--G-T-------------CA--T-G-T--C-A--TT-TA---T---G--A--G-GA--T---TT-T-T----G------C---A-AA----T--T--TT-C-A--A-A--G-TTT-G-ATG-G--A--G-C-A--T----A--AC---TT--C-C--A--T--A---A-C--A--T--T----G-G-A-G---GA-T-G-A--A-T--A---------TTT--CC--T-G-----CT--AA-T--A-----------------------T-G-C-A--C-A-----A-C-T------A--C--A---T-A-----TTA---T-G--T-TAA---T--A-C-------T---G-T--A-T-A---CC-A-A-GT-T-----T--C---G--T-T----G------AA--T------TT-GG--T-T--T-G--------T---A-G--T-T-T---C-A----------GA-----G-G-AG----TC----G-C-G-AT-G-A-AAA-G-T---TT-ATTggaagg
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gi|87327                      :                                                                                                                                                                                                                                                                        ttcagcagggtattaaatcccctgaaaaccatatgaatttctgaaataagctgaaatgataagctaatatatgactatttttgaaaaaaaatgtcagttc----TA----TT-GTGT--CCCATAGCT-------AACC-AT-AT-TGGAAA-GT---TT-CCTT-CAG-AA--A-TTGGAGCAGATTATT---A--G---TT--CATGTCTATGCAGG-AG-TTATTGGCCGCTGACA--A-G-G--TTA--TT-CA---CTC-G--A--G-GA--T---TT-T-AAG--G------C---A-AA----T--T--T--C-T--A-A--G-TTC-A-AAC-G--G--T-C-A--T----A--A----CT--C-CT-A--C--A---A-A--AA-T--T----A-G-A-AT--GA-T-C-A--A-A--A---------TTT--CC--T-G-----GT--AA-T--A-----------------------T-G-C-A--C-A-----A-C-T------A--C--A---T-A-----TGAT--T-G--T-CCT---T--G-C-------T---A-C--A-T-A---TC-A-A-GT-T-----T--C---T--T-C----A------AA--CA-----TC-GG-AT-C--A-GT-------T---A-G--T-T-T---C-A----------GA-----G-GCAG----TT----G-C-A-AT-A-A-C
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gi|87339                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GCT-------A--G-TT-AT-C---AA-GT---TT-C-T--A-A-AA--T-TTGGAT-AG-----T---A--G---TT--CG-------G-AGG-AG-TT----GC-GCTGACA--A-G-GT-T-A--TT-TA---T---G--A--A-GA--T---TT-CAG----G------C---A-AA----T--T--T--C-T--A-A--G-TTC---AAC-G--A--C-C-A--T----A--A----TC--C-C--A--CA-A---A-A--A--T--T----A-G-A-G---GA-T-C-A--A-A--A----------TT--CC--T-G-----GT--AA-T--A-----------------------T-G-C-A--C-A-----A-C-T------A--C--A---T-A-----TGA---T-G--T-CCT---T--G-C-------T---A-C--A-T-A---TG-A-A-GT-T-----T--C---T--T-C----A------AA--T------TC-GG-AT-C--A-G--------TATAA-G--T-T-T---C-A----------GA-----G-G-AG----TT----G-CGG-CT-G-A-CAA-G-G----T-ATT
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|87307                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atg--ATT--TA---T---G--A--G-AA--T---TT----------G------C---A-AA---T--T--T----C-T--A-A--GTTT-A-AAG-GG--G-C-A--T----A---A-C-TT-CC-A-T-A---A-A-AT--T-T----A-G-A-G---G-A-T-C-A---A-T--ATTT-------CC--T-G----C-T--AA--T-A-T-G-C-A--C-A-----A-C-C------A--T------A---TTGAGTT--TGA-T-A--TT-G--T--------T-A--------C------G-T--AG-T-T-TC----AGAGGA-T--T--T----T-----C-T--A-----AG--T-TT-GAAG-GG-G--GA------T---A-AACTT-TTG-T-A-AAATTGTA-G-AG----TT----G-C-GA-T-G-A-C--A-A-G---CTT-ATT
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gi|87333                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aatgaaagctaatatattcatgaggtttgaaatatttGCT-------A--C-ATAT-C---AA-AT---TT-C-TAA---AAA--T-----------CGGATCGG--------T---A--G---TT--CA----------G-AGG-AGTT-G-----C-A-TGATA--A-G-G--T--ATT--TA---T---G--A--C-GAG-T---TT-T-----G--G------C---A-AC---T--T--T------T--A-A--GTT--G-AAG-GG----C-A--T----A---A-C-TC-AC-A-C-A---A-A-A---A-T----A-A-A-G---GGA-T-T-A---A-A--ATTC-------CC--T-G----G-T--AA--T-A-T-G-C-A--C-A-----A-C-T------A--C------A---T--------TGA-T-G--TC-C--T--------T-G--------C--T---A-C--A--T-G-TG----A-AG---T--T--T----TG----T-C--A-----AA--A-TC-G--G-AT-C--AG------T---A-G--TT-T---C-A-GA-----G-G-AG----TT----G-C-GC-T-G-A-C--A-A-
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-64 )       :                                                                                                                                                                   TTATTTAT--G--AG-GA--TTT-----C--G-----G--C--A-AA---T--T-T-CTA-----AGTTC-A---A-A--G-GG-C-A-T--AA--C------TCCCAC-AAAA---ATT-A---GA-G-GA-T---C----AAAA--T-T--C-C---T-GGT---A------ATA-----------------------TGCAC--AA-C-TA--CA----T-A----TG-A-TGT--CC--TTGCT-------A--C-A-TAT-C---AA-GT---TT-C--TT--N---AAAT------T----CGGATCGG--------T---A--G---TTT-CA----------G-AGG-AG----TT-G-----C-GCTGACA--A-G-G--T--A--TT-TA---T---G--A--G-GA-T---TT-T-----C--G------C---A-AA---T--T--T----C-T--A-A--GTTT-G-AAG-GG--G-C-A--T----A---A-C-TT-CC-G-T-A---A-A--A---T-T----A-G-A-G---G-A-T-C--A---AT-ATTT-------CCT-G----C-T--AA-T--A-T-G-C-A--C-A-----A-C-T------A--C------A---T--A-----TGA-T-G-TT-C--T--------T--A--------C--T---G-T--A--T-A-CC-A-A-G---TT-T-C---G----T-T--G-AA--T-TT-G--G-T-T--G-G-G----T---A-G--TT-T---C-A-GA-----G-G-AG---TT----G-C-GA-T-G-A-CA-A-G-A-TCATT
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gi|87294                      :                                                                                                                                    tatatcatttataaaaaacagtttgaataaaTCATTTAT--A--AA--A--TTT-----T--GTATAAA--A--A-AA---T--T-T-CTGTC---AGTTC-A---GCA--T-GG-T-A-TTTAA--A------TCCCCT-AAAA---ACC-A---TA-T-GA-------------A--T-T--T-C---T-GAA---A------ATAGC---------------------TGAAA--GA-T-TA---A----G-G----TA-A-TAT--A----TG--------------A-TAT--------AT---TT-T--TG--A---AAAT------T----TG--T-----------T---A--G---TT--CA----------A-AGG--G----T---------------CA--T-G-T--C--A--TT-TA---T---G--A--G-GA-T---TT-T--------G------C---A-AA---T--T--T----T-G--T-A--GTT--G-AAG-GT--G-C-A--T----A---A-A-T--CC-A-T-A---A-A--A---T-TT---A-G-AAG---G-A-T-C--A---AA-TTTT-------CCT-G----C-T--AA-T--A-T-G-C-A--C-A-----A-C-T------A--C------A---T--A-----TGA-T-G-TT-C--T--------T--A--------C--T---G-T--A--T-A-CC-A-A-G---TT-TGC---G----T-T--G-AA--T-TT-G--G-T-T--A-G-G----T---A-G--TT-T---C-A-GA-----G-G-AG---TT----G-T-GA-T-G-A-CA-A-G-A-TCATT
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gi|87296                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tatatatttattaaaatttgtaataaaaATTGT--------T---A--G---TTT-CA----------A-AGG--G----TC-G-----T-G---------------T--A--TT-TA---T------A--G-AA-T---TT-T--------G------C---A-AA---T--T--TT---C-T--A-A--GTTT-G-AA--GG--G-C-A--T----A---A-C-TT-CC-A-T-A---A-A--T---T-T----A-G-A-G---G-A-T----A---AT-ATTT-------CCT-G----C-T--AA-T--ATT-G-T-A--C-A-----A-C-T------A--T------A---TA-A-----TGA-T-G-TT-C--T--------G--A--------C--T---G-T--A--T-A-CC-A-A-G---TT-T-C---G----T-T--GAAA--T-TT-G--G-T-T----G-T----T---A-G--TT-T---C-A-GA-----G-G-AG---TT----G-C-GA-T-G-A-CA-A-G-A-TCATT
gi|87297                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tatatcatttataaattttgtaataaaaaaatgctgtcaattcaatggtaataaatcccctaaaaaccatatgaatctctgaaataagctgaatgataagctaataaatgatgattttgaaaac--------T---A--G---TTT-CA----------A-AGG----------G-----T-GT-----------G--T--A--TT-TA---T---A--G--A-GA-T---TT-T-----T--G------C---A-AA---TATT--T----C-T--A-A---TTT-G-AAG-GG--G-C-A--T----A---A-C-TT-CC-A-T-A---A-ACAA---T-TT---A-G-A-G---G-A-T-A--A---AT-ATTT-------C-T-G----C-T--AA-T--A-TTG-T-A--C-AG----A-C-T------A--T------A---T--AAT---TGA-T-G-TTTC--T--------G--A--------C--T---G-T--A--T-A-CC-A-A-G---TT-T-C---G----T-T--G-AA--T-TT-G--A-A-T--T-G-A----T---A-G--TT-C---A-A-GA-----G-G-AGT--TT----G-C-GA-T-G-A-CA-AGG-A-TCATT
gi|87298                      :                                                                  tatatcaattgtaaaatttgtaataaaaaaaaaatgctgtcaattcacatggtaagtaaatcccctaaaaaccatatgaaatctgtgaaataagctgaatgataagctaataaatgatggatttttgaaaacattgtt--A-AA---T--T-T-CTGTTTTCAGTTC-AGCCA-T--T-GG-T-A-TTAAA--T------CCCCTT-AAAA---ACC-A---TA-G---------------AA--T-T--T-C---T-GA----A------ATA-----------------------AGCTG--AA----A--TA----T-A----TG-A-TG-------------------------------------AT---TT----TT--G---AAAC------T-------ATTGT--------T---A--G---TTT-CA----------A-AGG-GG----T--------C-ATTGTCA---------------TT-TA---T---G--A--G-GA-T---TT-T-----T--G------C---A-AA---T--T--TTG--T-T--A-A--GTTT-G-AAG-GG--G-C-AT-T----A---A-A-TT-CC-A-T-A---ACA--AT--T-T----A-G-A-G---G---T-T--A---AT-A-TT-------CCT-A----C-T--AA----A-TGG-C-A--C-A-----A-C--------A--C------A---G--AG----TGA-T-G-TT-C--T--------T--A--------T--T---A-T--A----G-CC-A-A-G---TT-T-TTCAG----T-T--G-AA----------G-T-T--G-G-GA---T---A-G--TT-T---C-A-GA-----G-GAAG---TT----G-C-GA-T-G-A-CAGG-G-A-TCATT
gi|87299                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tatatcatttataaaattttgttaataaaa--A--TT-TA---T---G--A--G-GA-T---TT-T-----T--G------C---A-AT---T--T--T----C-T--A-A--GTTT-G-AAG-GG--G-C-A--T----A---A---TT-CC-A-T-A---A-A--AT--T-T----A-G-A-G---G-A-T-C--A---AT-ATTT-------CCT-T----C-T--AA-T--
gi|87300                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                          tatatcatttataaaattttgtaataaaaaaaatttctgtcagttcagcatggtattaaatcccctaaaaaccatatgaatctctgaaataaactgaaatgataagctaatatatgatgattttttcaaagggtaatgtc-A-TAT-T---GACGT---TT-----T--T---GAAT--------------ATTGT--------T---A--G---TT--CA----------A-AGG--G----T---------------CA--A-GTG--TC-A--TT-T----T---G--A--G-GA-T---TT-T-----T--G------C---A-AA---T--T--TT---C-T--A-A--GTTT-G-AAG-AGA-G-C-A--T----A---A-C-TTTCC-A-T-G---A-A--A---T-TTT--A-A-A-G---G-A-T-C--A---AT---TT-------CCT-G----C-TT-AA-T----T-G-C-A--C-ATAGCAA-CAT------A---------A---T--A-----TGA-T-G-TT-C--T--------T--A--------C--T---G-T--A--T-A--C-A-A-G---TT-T-C---A----T-T--G-AA--T-TTGG--G-T-T--G-G-GT---T---A-G--TT-TCACC-A-GC-----G-G-AG---TT----G-C-G--T-G-A--A-A-G-A-
gi|87301                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tattcattttataaaattttttgtaataaaaaaattttgtcaagttcagcatggtaatttaaatccctaaaaagcataagctgattagaaatgtaagctaata--A--TT-TAC--T---G--A--G-G--T---TT-T-----T--G------C---A---------T--T----T-T--C-A--GTT--G-AGG-GG--G-G-A--T----A---A-CATT-CA-A-C-A---A-A--A---T-T----TTG-A-G---G---T-C--A---AT----T-------TCT-G----C-T--AT-C--A---G-C-A--C-A-----A-A-T------A--T------A---T--A-----------G-TT-C--T--------T--A--------C--T---G-T-----T-A-C--A-A-G---TT-T-C---AT---T-T--G-AA----TT-G--G-T-T--G-G-A----T---A-G---T-T---C-A-GA-------G-AG---TT----G-C-GA-T-G-A-CA-A-GCA-TTATT
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gi|87307                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atg--A--TT-TA---T---G--A--G-AA-T---TT----------G------C---A-AA---T--T--T----C-T--A-A--GTTT-A-AAG-GG--G-C-A--T----A---A-C-TT-CC-A-T-A---A-A--AT--T-T----A-G-A-G---G-A-T-C--A---AT-ATTT-------CCT-G----C-T--AA-T--A-T-G-C-A--C-A-----A-C-C------A--T------A---TTGAGTT--TGA-T-A-TT-G--T--------T--A--------C------G-T--AG-T-T-TC-AGA-GGATTT-T-C----------T--A-AG--T-TT-GAAG-G-G--G-G-A----T---A-AACTT-TTG-T-A-AAATTGTA-G-AG---TT----G-C-GA-T-G-A-CA-A-G-C-TTATT
gi|87309                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atatatctataaattttgtaataaaaaaaaaaattctgtcagttcagcatgttataatcccctaaaaaccatatgaatctttgaaataagctgaaatgataagctatatatgatgattttttaatattgttagtaaagggtagttc--A--TT-TAA--T---G--A--G-GA-TGTTTT-T-----G--G------C---A-AA---T--T--TT---C-T--A-AT-GTTT-GGAAG-GG--G-C-A--T----A---A-T-TT-CC-GAT-A---G-A--A---T-TT---ATG-A-G---G-A-T-TCAA---ATGATTT-------ACT-G----C-T--AA-TG-A-T-G-C-A--C-A-----A-C-T------A--C------A---T--T-----TGA-T-G-TT-C--T--------T--AA-------C--T---G-T--A--T-A-CC-A-A-G---TT-T-T---G----T-T--G-AA--T-TT-G--G-T-T--G-A-G----T---A-G--TT-T---C-A-GA-----
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gi|87320                      :                                                                                                                                                                                                            --A-AA---A--T-T-CTGTC---AGTTC-A---GCA--T-GG-T-A-TT-AA--A------TCCCCT-AAAA---ACC-A---TA-T-GA-------------A--T-T--T-C---T-GA----A------ATA------------------------------AG-C-TG--AA------A----TG-A-TAA--------GCT-------AA-T-A-TAT-G---AT-GA---TT-T--TT--G---AAAT--------------ATTGT--------T---A--G---TT--CA----------A-AGG--G----T---------------CA--T-G-T--C--A--TT-TA---T---G--A--G-GA-T---TT-T-----T--G------CAAAA-AA---T--T--T------T--A-A--GTTT-G---G-GG--A-C-A--TA---A---A-C-TT-CC-A-T-A---A-C--AT--T-T----A-G-A-G---G-A-T-C--A---
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gi|87356                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GG--------T---A--G---TTT-CA----------G-AGG-AG----TT-T-----C-GATGACG--A-G-A--TC-A--TT-TA---T---G--A--G-GA-T---TT-------C--G------C---------------------T-T--A-A--GTTT-G-AAG-GG--A-C-A--T----A---A-C-TT-CT-GAT-A---A-A--A---T-TT---A-G-A-G---G-A-T-C--A---AT-ATTT-------CCT-G----C-T--AA-T--A-T-G-C-A--A-A-----A-A-T------A--C------A---T--A-----TGA-T-G-TT-C-----------T--A--------A--T---G-T--A--T-A-CT-A-A-G---TT-TCC---G----T-T--G-AA--T-TT-G--G-T-T----G-G----T---A-G--TT-T---C-A-GA-----G-G-AG---TT----G-C-GA-T-G-A-CA-A-G-tatgaggatttcgcttaagtttgaagggacataacttctgataaaatttagaggatcaatatttcctgctaatatgcaaaaatacatatgatgttctaatgtatactaagtttccgttgaatttggttggtagtttcagaggagttgcgatgacaagcttgatt
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gi|87359                      :                                                                                                                                                                  aTTATTTAT--G--AC-GAGTTTT-----T--G-----G--C--A-AA---A--T-T-CTA-----AGTTT-A---G-A--G-GGGC-AAT--AA--C------TCACAT-AAAA---ATA-A---GG-G-GAGT---C----AAAA--T-T--C-CCCTT-GGT---A------ATT-----------------------AGCAC--AA-C-TA--CA----TTA----TG-A-TGT--CC--TTGCT-------A--C-ACTGT-TG--AA-GT---TT-TGGTC--A---AAAT------T----TGGATCAG--------T---A--G---TTT-CA----------G-AGG-AGTTTTTT-G-----C-GCTGACA--A-G-GT-T--A--TT-tatgacgagtttttggcaaaattctaagtttagaggggcaataactcacataaaaataaggggagtcaaaattccccttggtaattagcacaactacattatgatgtccttgctacactgttgaagttttggtcaaaatttggatcagtagtttcagaggagttttttgcgctgacaaggttatt
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Reference ( family-64 )       :                                                                                                                                                                   TTATTTAT--G--AG-GA--TTT-----C--G-----G--C--A-AA---T--T-T-CTA-----AGTTC-A---A-A--G-GG-C-A-T--AA--C------TCCCAC-AAAA---ATT-A---GA-G-GA-T---C----AAAA--T-T--C-C---T-GGT---A------ATA-----------------------TGCAC--AA-C-TA--CA----T-A----TG-A-TGT--CC--TTGCT-------A--C-A-TAT-C---AA-GT---TT-C--TT--N---AAAT------T----CGGATCGG--------T---A--G---TTT-CA----------G-AGG-AG----TT-G-----C-GCTGACA--A-G-G--T--A--TT-TA---T---G--A--G-GA-T---TT-T-----C--G------C---A-AA---T--T--T----C-T--A-A--GTTT-G-AAG-GG--G-C-A--T----A---A-C-TT-CC-G-T-A---A-A--A---T-T----A-G-A-G---G-A-T-C--A---AT-ATTT-------CCT-G----C-T--AA-T--A-T-G-C-A--C-A-----A-C-T------A--C------A---T--A-----TGA-T-G-TT-C--T--------T--A--------C--T---G-T--A--T-A-CC-A-A-G---TT-T-C---G----T-T--G-AA--T-TT-G--G-T-T--G-G-G----T---A-G--TT-T---C-A-GA-----G-G-AG---TT----G-C-GA-T-G-A-CA-A-G-A-TCATT
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gi|87300                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                          tatatcatttataaaattttgtaataaaaaaaatttctgtcagttcagcatggtattaaatcccctaaaaaccatatgaatctctgaaataaactgaaatgataagctaatatatgatgattttttcaaagggtaatgtc-A-TAT-T---GACGT---TT-----T--T---GAAT--------------ATTGT--------T---A--G---TT--CA----------A-AGG--G----T---------------CA--A-GTG--TC-A--TT-T----T---G--A--G-GA-T---TT-T-----T--G------C---A-AA---T--T--TT---C-T--A-A--GTTT-G-AAG-AGA-G-C-A--T----A---A-C-TTTCC-A-T-G---A-A--A---T-TTT--A-A-A-G---G-A-T-C--A---AT---TT-------CCT-G----C-TT-AA-T----T-G-C-A--C-ATAGCAA-CAT------A---------A---T--A-----TGA-T-G-TT-C--T--------T--A--------C--T---G-T--A--T-A--C-A-A-G---TT-T-C---A----T-T--G-AA--T-TTGG--G-T-T--G-G-GT---T---A-G--TT-TCACC-A-GC-----G-G-AG---TT----G-C-G--T-G-A--A-A-G-A-
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gi|87305                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tattcatttaaaaattgtaataaaaaacgtctctgtcagttcagctggtataatccaaaatctatgaatttcgaaataagtgaaatgattaagcgtaatgatgatttttgaaattgttagttcaagggtcatgtcTTT-C-AAG-GG--G-C-A--T----A---A-C-TT-TC-C-T-A---A-A--A---T-TT---A-G-A-G-----A-T----A---AT-ATTT-------TCT-G----C-T--AA-T--A-T-G-C-A--C-A-----A---T------A--CA-----A---T--A-----TGA-T-G-TT-C--T--------T-----------C--T---G-TA-A--T-A-CC-A-A-A---GT-T-C---G----T-T--G-AA--T-TT-G--G-T-T--G-G-G----T---A-G--TT-T---C---GA-----G-GTAGT--TT----G-C-GA-T-G-A-CA-A-G-ATTCATT
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gi|87307                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atg--A--TT-TA---T---G--A--G-AA-T---TT----------G------C---A-AA---T--T--T----C-T--A-A--GTTT-A-AAG-GG--G-C-A--T----A---A-C-TT-CC-A-T-A---A-A--AT--T-T----A-G-A-G---G-A-T-C--A---AT-ATTT-------CCT-G----C-T--AA-T--A-T-G-C-A--C-A-----A-C-C------A--T------A---TTGAGTT--TGA-T-A-TT-G--T--------T--A--------C------G-T--AG-T-T-TC-AGA-GGATTT-T-C----------T--A-AG--T-TT-GAAG-G-G--G-G-A----T---A-AACTT-TTG-T-A-AAATTGTA-G-AG---TT----G-C-GA-T-G-A-CA-A-G-C-TTATT
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gi|87314                      :                                                                                        atcatttataacttttgtacataaaaaaaaaaatctgtcagcagcatggtattaaatcctaaaaacccatagaatctttgaaataagctgagatgataactataatatatgatgat--A-AA---T--T-T-CTGTC---AGTTC-ATG-A-T--G-GT-A-A-TCAAA--T------CCCCTCTAAAA---ATC-A---TA-T-AA-T--------------T-T--C-C---T-G-----A------AGA-----------------------TACACTGAA-T-GA--AC----T-A----AG---------C--TAGCT-------AA-T-A-TAT-G---AT-GA---TT----TT--G---AAAT--------------ATTGT--------T---A--G---TT--CA----------A-AGG--G----TC-------C-G-TGTC----------C--A--TT-TA---T---G--A--G-GA-T---TT-T-----T--GT-----C---A-AA---T--T--T----TAT--A-A--AGTT-A-GAG-GG--G-C-A--T----A---A-C-TT-CC-A-T-T---C-A--ACT-T-T----A-G-A-G---A-A-T-C--A---AT-ATTC-------CTT-G----C-T--AA-T----T-G-C-A--C-A-----C-C-T------A--C------A---T--A-----TGA-T-G-TT-C-----------T--A--------C--T---A-T--A--TAA-CC-A-A-G---TT-T-C---G----T-T--G-AAATT-TT-G--G-T-T--
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gi|87320                      :                                                                                                                                                                                                            --A-AA---A--T-T-CTGTC---AGTTC-A---GCA--T-GG-T-A-TT-AA--A------TCCCCT-AAAA---ACC-A---TA-T-GA-------------A--T-T--T-C---T-GA----A------ATA------------------------------AG-C-TG--AA------A----TG-A-TAA--------GCT-------AA-T-A-TAT-G---AT-GA---TT-T--TT--G---AAAT--------------ATTGT--------T---A--G---TT--CA----------A-AGG--G----T---------------CA--T-G-T--C--A--TT-TA---T---G--A--G-GA-T---TT-T-----T--G------CAAAA-AA---T--T--T------T--A-A--GTTT-G---G-GG--A-C-A--TA---A---A-C-TT-CC-A-T-A---A-C--AT--T-T----A-G-A-G---G-A-T-C--A---
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gi|87325                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttgtaataaaaaaaattctgtcagttcagccccatggtattaaaatcccctagtaaaaaccatatgaattctgaaataagctgaaatgataagctaa--------T---A--G---TTT-CA----------A-AGG--G----T---------------CA--T-G-T--C--A--TT-TA---T---G--A--G-GA-T---TT-T-----T--G------C---A-AA---T--T--TT---C-A--A-A--GTTT-G-ATG-GA--G-C-A--T----A---A-C-TT-CC-A-T-A---A-C--A---T-T----G-G-A-G---G-A-T-G--A---AT-ATTT-------CCT-G----C-T--AA-T--A-T-G-C-A--C-A-----A-C-T------A--C------A---T--A-----TTA-T-G-TT-A--A--------T--A--------C--T---G-T--A--T-A-CC-A-A-G---TT-T-C---G----T-T--G-AA--T-TT-G--G-T-T----T-G----T---A-G--TT-T---C-A-GA-----G-G-AG---TC----G-C-GA-T-G-A-AA-A-G-T-TTATT
gi|87326                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgtcagttcagcatggtattaaatccgctaaatctgaaataagctgaaatgataagctaatatatgaataattttggaaatattat--A--TT-TA---T---G--C--G-GA-T---TT-T-----T--G------T---A-AA---T--T--TT---C-T--A-A--GTTT-G-AAG-GG--A-C-A--T----A---A-C-TT-C
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gi|87336                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aGCT-------AA-C-A-TAT-C---AA-GT---TT-T--CT--T---AAAA------T----CGGATTGG--------T---A--G---TTT-CA----------G-AGG--G----TT-G-----C-AATGATA--A-G-GT-T--A--TT-TA---T---G--A--C-GAGT---TT-T-----G--G------CA--A-AA---A--T--T----C-T--A-A--GGTT-A-GAG-GG--G-CAA--T----A---A-C-TC-AC-A-TAA---A-A--A---T-A----A-G-G-G---G-A-T-C--A---AA-AATTCC-----CCT-G----G-T--AA-T----T-G-C-A--C-A-----A-C-T------A--CAT----A---T--A-----TGA-T-G-TC-C--T--------T--G--------C--T---A-C--A--T-G-TG-A-AGG---TT-T-T---G----G-TCAA-AA--T-TT-G--G-A-T--C-A-G----T---A-G--TT-T---C-A-GA-----G-G-AGTTTTT----G-C-GC-T-G-A-CA-A-G-G-TTATTct
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gi|87339                      :                                                                                                                                                                   TTATTTAT--G--AA-GA--TTT-----CA-G-----G--C--A-AA---T--T-T-CTA-----AGTTC-A---A-C--G-AC-C-A-T--AA---------TCCCAC-AAAA---ATT-A---GA-G-GA-T---C----AAAA--T-T--C-C---T-GGT---A------ATA-----------------------TGCAC--AA-C-TA--CA----T-A----TG-A-TGT--CC--TTGCT-------A--C-A-TAT-G---AA-GT---TT-C--TT--C---AAAT------T----CGGATCAG--------TATAA--G---TTT-CA----------G-AGG-AG----TT-G-----CGGCTGACA--A-G-G--T--A--TT-
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                           .  .      .    TT       .     .  .     .   .        .           .   . TT    . .   .   A              .    .       .    .    . .   .       .  . T  . .   .   .   .        .                           .   . .  .   .      .       .   .   .      .       .  .     G         .      .   G        TTC                 .        .   .       T   .              A  .       .     . A        . GTT            .   .      .     . .      TG              .      .      .  T      .    .     .        G      .  .    .     .  .  A   . .   .    T   . T    .     .     .      .    .    .           .    . .     .  . . .      . .     . . .         .      .   .  .       .        .  .        .  .        .  .   . .  .  . .      . .    . . .   .    .    .  T       .  . . G      .    .     .     .     .  .       .  .    .         .          . A  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                           .  .      .    AT       .     .  .     .   .        .           .   . AA    . .   .   C              .    .       .    .    . .   .       .  . T  . .   .   .   .        .                           .   . .  .   .      .       .   .   .      .       .  .     C         .      .   T        ATC                 .        .   .       T   .              A  .       .     . A        . ATC            .   .      .     . .      TG              .      .      .  T      .    .     .        G      .  .    .     .  .  A   . .   .    A   . T    .     .     .      .    .    .           .    . .     .  . . .      . .     . . .         .      .   .  .       .        .  .        .  .        .  .   . .  .  . .      . .    . . .   .    .    .  T       .  . . G      .    .     .     .     .  .       .  .    .         .          . A  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                           .  .      .    AA       .     .  .     .   .        .           .   . CG    . .   .   C              .    .       .    .    . .   .       .  . T  . .   .   .   .        .                           .   . .  .   .      .       .   .   .      .       .  .     G         .      .   G        TTT                 .        .   .       T   .              A  .       .     . C        . ATC            .   .      .     . .      TG              .      .      .  T      .    .     .        G      .  .    .     .  .  A   . .   .    A   . T    .     .     .      .    .    .           .    . .     .  . . .      . .     . . .         .      .   .  .       .        .  .        .  .        .  .   . .  .  . .      . .    . . .   .    .    .  T       .  . . G      .    .     .     .     .  .       .  .    .         .          . A  
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                           .  .      .    AC       .     .  .     .   .        .           .   . T     . .   .   C              .    .       .    .    . .   .       .  . .  . .   .   .   .        .                           .   . .  .   .      .       .   .   .      .       .  .     C         .      .   G        TTT                 .        .   .       T   .              A  .       .     . A        . GTC            .   .      .     . .      TG              .      .      .  .      .    .     .        G      .  .    .     .  .  G   . .   .    .   . T    .     .     .      .    .    .           .    . .     .  . . .      . .     . . .         .      .   .  .       .        .  .        .  .        .  .   . .  .  . .      . .    . . .   .    .    .  T       .  . . G      .    .     .     .     .  .       .  .    .         .          . A  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                           .  .      .    AA       .     .  .     .   .        .           .   . T     . .   .   T              .    .       .    .    . .   .       .  . .  . .   .   .   .        .                           .   . .  .   .      .       .   .   .      .       .  .     C         .      .   G        TTC                 .        .   .       T   .              A  .       .     . A        . GTT            .   .      .     . .      TG              .      .      .  .      .    .     .        G      .  .    .     .  .  A   . .   .    .   . T    .     .     .      .    .    .           .    . .     .  . . .      . .     . . .         .      .   .  .       .        .  .        .  .        .  .   . .  .  . .      . .    . . .   .    .    .  T       .  . . C      .    .     .     .     .  .       .  .    .         .          . G  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                           .  .      .    AA       .     .  .     .   .        .           .   . T     . .   .   T              .    .       .    .    . .   .       .  . .  . .   .   .   .        .                           .   . .  .   .      .       .   .   .      .       .  .     G         .      .   C        TTC                 .        .   .       T   .              A  .       .     . A        . GCT            .   .      .     . .      AG              .      .      .  .      .    .     .        A      .  .    .     .  .  G   . .   .    .   . .    .     .     .      .    .    .           .    . .     .  . . .      . .     . . .         .      .   .  .       .        .  .        .  .        .  .   . .  .  . .      . .    . . .   .    .    .  T       .  . . C      .    .     .     .     .  .       .  .    .         .          . T  
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                           .  .      .    TT       .     .  .     .   .        .           .   . G     . .   .   C              .    .       .    .    . .   .       .  . .  . .   .   .   .        .                           .   . .  .   .      .       .   .   .      .       .  .     C         .      .   C        ATC                 .        .   .       T   .              T  .       .     . T        . GTT            .   .      .     . .      TG              .      .      .  .      .    .     .        C      .  .    .     .  .  A   . .   .    .   . .    .     .     .      .    .    .           .    . .     .  . . .      . .     . . .         .      .   .  .       .        .  .        .  .        .  .   . .  .  . .      . .    . . .   .    .    .  T       .  . . C      .    .     .     .     .  .       .  .    .         .          . G  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                           .  .      .    T        .     .  .     .   .        .           .   . G     . .   .   C              .    .       .    .    . .   .       .  . .  . .   .   .   .        .                           .   . .  .   .      .       .   .   .      .       .  .     C         .      .   A        CTC                 .        .   .       T   .              A  .       .     . C        . GTT            .   .      .     . .      GG              .      .      .  .      .    .     .        A      .  .    .     .  .  A   . .   .    .   . .    .     .     .      .    .    .           .    . .     .  . . .      . .     . . .         .      .   .  .       .        .  .        .  .        .  .   . .  .  . .      . .    . . .   .    .    .  T       .  . . C      .    .     .     .     .  .       .  .    .         .          . A  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                           .  .      .    T        .     .  .     .   .        .           .   . T     . .   .   C              .    .       .    .    . .   .       .  . .  . .   .   .   .        .                           .   . .  .   .      .       .   .   .      .       .  .     A         .      .   T        ATC                 .        .   .       T   .              A  .       .     . C        . GTT            .   .      .     . .      GG              .      .      .  .      .    .     .        G      .  .    .     .  .  A   . .   .    .   . .    .     .     .      .    .    .           .    . .     .  . . .      . .     . . .         .      .   .  .       .        .  .        .  .        .  .   . .  .  . .      . .    . . .   .    .    .  T       .  . . C      .    .     .     .     .  .       .  .    .         .          . A  
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                           .  .      .    T        .     .  .     .   .        .           .   . C     . .   .   C              .    .       .    .    . .   .       .  . .  . .   .   .   .        .                           .   . .  .   .      .       .   .   .      .       .  .     T         .      .   A        ATC                 .        .   .       T   .              A  .       .     . C        . GTT            .   .      .     . .      CA              .      .      .  .      .    .     .        C      .  .    .     .  .  A   . .   .    .   . .    .     .     .      .    .    .           .    . .     .  . . .      . .     . . .         .      .   .  .       .        .  .        .  .        .  .   . .  .  . .      . .    . . .   .    .    .  T       .  . . A      .    .     .     .     .  .       .  .    .         .          . A  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                           .  .      .    C        .     .  .     .   .        .           .   . T     . .   .   C              .    .       .    .    . .   .       .  . .  . .   .   .   .        .                           .   . .  .   .      .       .   .   .      .       .  .     C         .      .   A        ATC                 .        .   .       T   .              A  .       .     . C        . GTT            .   .      .     . .      CG              .      .      .  .      .    .     .        C      .  .    .     .  .  A   . .   .    .   . .    .     .     .      .    .    .           .    . .     .  . . .      . .     . . .         .      .   .  .       .        .  .        .  .        .  .   . .  .  . .      . .    . . .   .    .    .  T       .  . . A      .    .     .     .     .  .       .  .    .         .          . G  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                           .  .      .    T        .     .  .     .   .        .           .   . G     . .   .   C              .    .       .    .    . .   .       .  . .  . .   .   .   .        .                           .   . .  .   .      .       .   .   .      .       .  .     C         .      .   A        ATC                 .        .   .       T   .              A  .       .     . C        . TC             .   .      .     . .      GG              .      .      .  .      .    .     .        G      .  .    .     .  .  A   . .   .    .   . .    .     .     .      .    .    .           .    . .     .  . . .      . .     . . .         .      .   .  .       .        .  .        .  .        .  .   . .  .  . .      . .    . . .   .    .    .  A       .  . . C      .    .     .     .     .  .       .  .    .         .          . G  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                           .  .      .    A        .     .  .     .   .        .           .   . T     . .   .   C              .    .       .    .    . .   .       .  . .  . .   .   .   .        .                           .   . .  .   .      .       .   .   .      .       .  .     C         .      .   C        ATC                 .        .   .       T   .              A  .       .     . T        . TC             .   .      .     . .      TG              .      .      .  .      .    .     .        G      .  .    .     .  .  G   . .   .    .   . .    .     .     .      .    .    .           .    . .     .  . . .      . .     . . .         .      .   .  .       .        .  .        .  .        .  .   . .  .  . .      . .    . . .   .    .    .  T       .  . . G      .    .     .     .     .  .       .  .    .         .          . A  
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                           .  .      .    .        .     .  .     .   .        .           .   . G     . .   .   C              .    .       .    .    . .   .       .  . .  . .   .   .   .        .                           .   . .  .   .      .       .   .   .      .       .  .     A         .      .   A        ATC                 .        .   .       T   .              A  .       .     . C        . GT             .   .      .     . .      CG              .      .      .  .      .    .     .        G      .  .    .     .  .  A   . .   .    .   . .    .     .     .      .    .    .           .    . .     .  . . .      . .     . . .         .      .   .  .       .        .  .        .  .        .  .   . .  .  . .      . .    . . .   .    .    .  A       .  . . G      .    .     .     .     .  .       .  .    .         .          . A  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                   .     .  .     .   .        .           .   . C     . .   .   C              .    .       .    .    . .   .       .  . .  . .   .   .   .        .                           .   . .  .   .      .       .   .   .      .       .  .     C         .      .   A        ATC                 .        .   .       T   .              A  .       .     . C        . TC             .   .      .     . .      CA              .      .      .  .      .    .     .        G      .  .    .     .  .  G   . .   .    .   . .    .     .     .      .    .    .           .    . .     .  . . .      . .     . . .         .      .   .  .       .        .  .        .  .        .  .   . .  .  . .      . .    . . .   .    .    .  T       .  . . A      .    .     .     .     .  .       .  .    .         .          . T  
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                            .     .   .        .           .   . C     . .   .   C              .    .       .    .    . .   .       .  . .  . .   .   .   .        .                           .   . .  .   .      .       .   .   .      .       .  .     A         .      .   T        TTC                 .        .   .       T   .              A  .       .     . C        . TC             .   .      .     . .      CG              .      .      .  .      .    .     .        G      .  .    .     .  .  A   . .   .    .   . .    .     .     .      .    .    .           .    . .     .  . . .      . .     . . .         .      .   .  .       .        .  .        .  .        .  .   . .  .  . .      . .    . . .   .    .    .  T       .  . . G      .    .     .     .     .  .       .  .    .         .          . C  
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      .     .         .      .   A        TC                  .        .   .       .   .              .  .       .     . .        .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-64 )       :                                                                                                                                                                TTATTTAT--G--AG-GATTT-AN--GGC------A-AA----T-T-TCTA-----AGTTC-A---A-A--G-GG-C-AT--AA--C------TCCCAC-AAAA---ATT-A---GA-G-GA-T---C----AAAA--T-T--C-C-T-GGT---A------ATA-----------------------TGCAC--AA-C-TA--CA----TA----TG-A-TGT--CC--TTGCT-------A--C-ATAT-C---AAGT---TT-C-TT--------NA-AA-NTCGGATCGG--------T---A--G---TTT-CA----------G-AGG-AGTT-G-----C-GCTGACA--A-G-G---TT-A--TT-T-A---T--G--A--G-GA--T---TT-T-----C--G------C---A-AA---T--T--T----C-T--A-A--GTTT-G-AAG-GG--G-C-A--T----A---A-C-TT-CC-G-T-A---A-A--A---T-T----A-G-A-G---G-A-T-C--A---AT-ATTT-------CC--T-G----C-T--AA-T--A-T-G-C-A--C-A-----A-C-T------A--C------A---T--A-----TGA-T-G-TT-C--T--------T--A--------C--T---G-T--A--T-A-CC----A-A-G---TT-T-C---G----T-T--G-AA--T-TT-G--G-T-T--G-G-G----T---A-G--TT-T---C-A-GA-----G-G-AG----TT----G-C-GA-T-G-A-CA-A-G-A-TCATT
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gi|87294                      :                                                                                                                                                              tatatcatttataaaaaacagtttgaataaa------A-AA----T-T-TCTGTC---AGTTC-A---GCA--T-GG-T-ATTTAA--A------TCCCCT-AAAA---ACC-A---TA-T-GA-------------A--T-T--T-C-T-GAA---A------ATAGC---------------------TGAAA--GA-T-TA---A----GG----TA-A-TAT--A----TG---------A--T-ATAT-------------T-T-TT--------GA-AA-AT----TTGT--------T---A--G---TT--CA----------A-AGG--GTC------------------A-T-G---TC-A--TT-T-A---T--G--A--G-GA--T---TT-T--------G------C---A-AA---T--T--T----T-G--T-A--GTT--G-AAG-GT--G-C-A--T----A---A-A-T--CC-A-T-A---A-A--A---T-TT---A-G-AAG---G-A-T-C--A---AA-TTTT-------CC--T-G----C-T--AA-T--A-T-G-C-A--C-A-----A-C-T------A--C------A---T--A-----TGA-T-G-TT-C--T--------T--A--------C--T---G-T--A--T-A-CC----A-A-G---TT-TGC---G----T-T--G-AA--T-TT-G--G-T-T--A-G-G----T---A-G--TT-T---C-A-GA-----G-G-AG----TT----G-T-GA-T-G-A-CA-A-G-A-TCATT
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gi|87296                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tataT-T-TT--------GA-AA-AC---ATTGT--------T---A--G---TTT-CA----------A-AGG--GTC-G-----T-G-----------------T-A--TT-T-A---T-----A--G-AA--T---TT-T--------G------C---A-AA---T--T--TT---C-T--A-A--GTTT-G-AA--GG--G-C-A--T----A---A-C-TT-CC-A-T-A---A-A--T---T-T----A-G-A-G---G-A-T----A---AT-ATTT-------CC--T-G----C-T--AA-T--ATT-G-T-A--C-A-----A-C-T------A--T------A---TA-A-----TGA-T-G-TT-C--T--------G--A--------C--T---G-T--A--T-A-CC----A-A-G---TT-T-C---G----T-T--GAAA--T-TT-G--G-T-T----G-T----T---A-G--TT-T---C-A-GA-----G-G-AG----TT----G-C-GA-T-G-A-CA-A-G-A-TCATT
gi|87297                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tatatcatttataaattttgtaataaaaaaatgctgtcaattcaatggtaataaatcccctaaaaaccatatgaatctctgaaataagctgaatgataagctaataaatgatga--------T---A--G---TTT-CA----------A-AGG-G--T-G-----T-G-----------------T-A--TT-T-A---T--A--G--A-GA--T---TT-T-----T--G------C---A-AA---TATT--T----C-T--A-A---TTT-G-AAG-GG--G-C-A--T----A---A-C-TT-CC-A-T-A---A-ACAA---T-TT---A-G-A-G---G-A-T-A--A---AT-ATTT-------C---T-G----C-T--AA-T--A-TTG-T-A--C-AG----A-C-T------A--T------A---T--AAT---TGA-T-G-TTTC--T--------G--A--------C--T---G-T--A--T-A-CC----A-A-G---TT-T-C---G----T-T--G-AA--T-TT-G--A-A-T--T-G-A----T---A-G--TT-C---A-A-GA-----G-G-AGT---TT----G-C-GA-T-G-A-CA-AGG-A-TCATT
gi|87298                      :                                                   tatatcaattgtaaaatttgtaataaaaaaaaaatgctgtcaattcacatggtaagtaaatcccctaaaaaccatatgaaatctgtgaaataagctgaatgataagctaataaatgatggatttttgaaaacattgtt------A-AA----T-T-TCTGTTTTCAGTTC-AGCCA-T--T-GG-T-ATTAAA--T------CCCCTT-AAAA---ACC-A---TA-G---------------AA--T-T--T-C-T-GA----A------ATA-----------------------AGCTG--AA----A--TA----TA----TG-A-TG-----------------------------------AT---TT---TT--------GA-AA-CT---ATTGT--------T---A--G---TTT-CA----------A-AGG-GGT---------------CA--T-T-G---TC-A--TT-T-A---T--G--A--G-GA--T---TT-T-----T--G------C---A-AA---T--T--TTG--T-T--A-A--GTTT-G-AAG-GG--G-C-AT-T----A---A-A-TT-CC-A-T-A---ACA--AT--T-T----A-G-A-G---G---T-T--A---AT-A-TT-------CC--T-A----C-T--AA----A-TGG-C-A--C-A-----A-C--------A--C------A---G--AG----TGA-T-G-TT-C--T--------T--A--------T--T---A-T--A----G-CC----A-A-G---TT-T-TTCAG----T-T--G-AA----------G-T-T--G-G-GA---T---A-G--TT-T---C-A-GA-----G-GAAG----TT----G-C-GA-T-G-A-CAGG-G-A-TCATT
gi|87299                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tatatcatttataaaattttgttaataaaaA--A-T-G---TC-A--TT-T-A---T--G--A--G-GA--T---TT-T-----T--G------C---A-AT---T--T--T----C-T--A-A--GTTT-G-AAG-GG--G-C-A--T----A---A---TT-CC-A-T-A---A-A--AT--T-T----A-G-A-G---G-A-T-C--A---AT-ATTT-------CC--T-T----C-T--AA-T--
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gi|87301                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tattcattttataaaattttttgtaataaaaaaattttgtcaagttcagcatggtaatttaaatccctaaaaagcataagctgattagaaatgtaagctaataatattgacgtttttgaat-G---TC-A--TT-T-AC--T--G--A--G-G---T---TT-T-----T--G------C---A---------T--T----T-T--C-A--GTT--G-AGG-GG--G-G-A--T----A---A-CATT-CA-A-C-A---A-A--A---T-T----TTG-A-G---G---T-C--A---AT----T-------TC--T-G----C-T--AT-C--A---G-C-A--C-A-----A-A-T------A--T------A---T--A-----------G-TT-C--T--------T--A--------C--T---G-T-----T-A-C-----A-A-G---TT-T-C---AT---T-T--G-AA----TT-G--G-T-T--G-G-A----T---A-G---T-T---C-A-GA-------G-AG----TT----G-C-GA-T-G-A-CA-A-GCA-TTATT
gi|87305                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tattcatttaaaaattgtaataaaaaacgtctctgtcagttcagctggtataatccaaaatctatgaatttcgaaataagtgaaatgattaagcgtaatgatgatttttgaaattgttagttcaagggtcatTTT-C-AAG-GG--G-C-A--T----A---A-C-TT-TC-C-T-A---A-A--A---T-TT---A-G-A-G-----A-T----A---AT-ATTT-------TC--T-G----C-T--AA-T--A-T-G-C-A--C-A-----A---T------A--CA-----A---T--A-----TGA-T-G-TT-C--T--------T-----------C--T---G-TA-A--T-A-CC----A-A-A---GT-T-C---G----T-T--G-AA--T-TT-G--G-T-T--G-G-G----T---A-G--TT-T---C---GA-----G-GTAGT---TT----G-C-GA-T-G-A-CA-A-G-ATTCATT
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gi|87326                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgtcagttcagcatggtattaaatccgctaaatctgaaataagctgaaatgataagctaatatatgaataattttggaaatattat--A-G-T---TC-A--TT-T-A---T--G--C--G-GA--T---TT-T-----T--G------T---A-AA---T--T--TT---C-T--A-A--GTTT-G-AAG-GG--A-C-A--T----A---A-C-TT-C
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gi|87333                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aatgaaagctaatatattcatgaggtttgaaatattttagttcagagggtcatGCT-------A--C-ATAT-C---AAAT---TT-C-T---------AA-AA-ATCGGATCGG--------T---A--G---TT--CA----------G-AGG-AGTT-G-----C-A-TGATA--A-G-G---T--A--TT-T-A---T--G--A--C-GAG-T---TT-T-----G--G------C---A-AC---T--T--T------T--A-A--GTT--G-AAG-GG----C-A--T----A---A-C-TC-AC-A-C-A---A-A--A---A-T----A-A-A-G---GGA-T-T--A---AA-ATTC-------CC--T-G----G-T--AA-T--A-T-G-C-A--C-A-----A-C-T------A--C------A---T--------TGA-T-G-TC-C--T--------T--G--------C--T---A-C--A--T-G-TG----A-A-G---TT-T-T---G----T-C--A-AA--A-TC-G--G-A-T--C-A-G----T---A-G--TT-T---C-A-GA-----G-G-AG----TT----G-C-GC-T-G-A-CA-A-A-A-att
gi|87336                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aGCT-------AA-C-ATAT-C---AAGT---TT-T-CT--------TA-AA-ATCGGATTGG--------T---A--G---TTT-CA----------G-AGG--GTT-G-----C-AATGATA--A-G-G---TT-A--TT-T-A---T--G--A--C-GAG-T---TT-T-----G--G------CA--A-AA---A--T--T----C-T--A-A--GGTT-A-GAG-GG--G-CAA--T----A---A-C-TC-AC-A-TAA---A-A--A---T-A----A-G-G-G---G-A-T-C--A---AA-AATTCC-----CC--T-G----G-T--AA-T----T-G-C-A--C-A-----A-C-T------A--CAT----A---T--A-----TGA-T-G-TC-C--T--------T--G--------C--T---A-C--A--T-G-TG----A-AGG---TT-T-T---G----G-TCAA-AA--T-TT-G--G-A-T--C-A-G----T---A-G--TT-T---C-A-GA-----G-G-AGTTT-TT----G-C-GC-T-G-A-CA-A-G-G-TTATTct
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gi|87357                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GA--------T---A--G---TTT--A----------G-AGGGAGTT-G-----C-A-TGACA--A-G-ACCTTT-A--TT---G---T--A--A--G-GA--T---TT-T-------------------A-AA---T--TGGT----C-T--A-A--GTTT-T-GAA-GG--G-C-A--T----T---A-C-TTTCC-G-C-ATT-A-A--A---T-TTAT-A-A-G-G---G-A-T-C--A---AT-ATT--------CC--T-G----C----AA-T--A-T-G-C-A--C-A-------C-T------A--C------A---T--A-----TGA-TTG-TT-C--T--------T--A--------C--T---G-T--A--T-A-CC----A-A-G---CT-T-T---C----T-T--G-AA--T-TT-G--G---T--A-G-G----T---A-G--TT-T---C-A-GAC----G-G-AG----TT------C-GA-T-G-A--A-A-G-A-attgtaaggattttaaattggtctaagttttgaagggcattactttccgcattaaatttataagggatcaatattcctgcaatatgcacactacatatgattgttcttactgtataccaagctttcttgaatttggtaggtagtttcagacggagttcgatgaaagatt
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gi|87359                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -AA-ATCGGATTGG--------T---A--G---TTT-CA----------G-AGG--GTT-G-----C-AATGATA--A-G-G---TT-A--TT-T-A---T--G--A--C-GAGTT---TT-T-----G--G------C---A-AA---A--T--T----C-T--A-A--GTTT-A-GAG-GG--G-CAA--T----A---A-C-TC-AC-A-TAA---A-A--A---T-A----A-G-G-G---G-AGT-C--A---AA-ATTC-------CCCTT-G----G-T--AA-T--T-A-G-C-A--C-A-----A-C-T------A--C------AT--T--A-----TGA-T-G-TC-C--T--------T--G--------C--------T--A--C-A-CTGTTGA-A-G---TT-T-T---G----G-TCAA-AA--T-TT-G--G-A-T--C-A-G----T---A-G--TT-T---C-A-GA-----G-G-AGTTTTTT----G-C-GC-T-G-A-CA-A-G-G-TTATT
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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