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gi|102258 : AAAA--C---AA----A---A---AG-T--G-ATC-AGC-A--C----G---TT-T------TG----T-T-T---------------T--A-C--AA---G---AC---A-T-G-T----A--T-A--TA-G-AC-T--G-CGCT-T---G-C-CA-C-T-----T-GA----G-TGGT------T--C-A-A--T-AT-CCC-TCA-AG-G--C----AA-A--T---GC-TT-T---T-CT----T-T----C-AC-AT-TT-CT----T-A--A-GAG-T--GAAA----TAAAA--AA---AAAA
gi|102259 : AAAAT-C---AAC---ACCAA---AG-TA-G-ATC-AGC-A--C----G---TT-G------TT----G-T-T---------------TTGA-CG-AA---G---AC---A-TTG-TT---A--T-A--TA-G-AC-T--G--GCT-T---G-C-CA-C-T-----T-AA-TA-GGTG-T------T--C-A-A--TTAT-CCCCTCA-AG-G--TG---AA-A--T---GC-TT-T---T-CT----T-T----C-AC-AC-AT-CT----T-A--T-GAA-T--GAAA-----AAAA--AA---a
gi|102260 : AAAAT-A---ATC---A---A---AG-T--A-TTC-AGC-A--CC---G---TT-T------GT----T-T-T------------------A-CA-GA---A---AT---A-TTG-C----A--T-A--TA-G-AC-T--G-CGCT-TT--G-CACAAC-T-----T-GA-TA-G-TG-T------T--CAA-A--T-AT-CCCCTCA-A--G--C----AA-A--T---GC-TT-T---C-AT----T-T----C-AC-AC-AT-CT----T-A--T--AG-T--GAAAT---TAAAA--AA---CAAA
gi|102261 : AAAAT-C---AAC---A---A---AA-T--G-ATC-AGC-AG-C----G----T-T------TG----T-T-G---------------TT-A-CG-AA---G---AC-----TTG-TTG--AT-T-A--TA-G-AC-T--G-CG-T-T---G-C-CA-C-T-----T-GA-T--G-TG-T------T--C---A--T-AT-CCCCT-A-AG-GC-C----AA-AATT---GC-TT--------T----T-T----C-CC-AC-AC-TC----T-A--T-GAG-T--GAAA----TTAAA--AA---AAa
gi|102262 : AAAAT-C---AAA---C---A---AG-T--G-ATC-AGC-A--C----G----T-T------TT----T-G-T---------------TT-A-CGAAA---G---AC---A-TTG-T----A--T-A--TAGG-AC-T--G-CGCT-T---G-C-CA---T-----T-GA-TA-G-TG-T------T--C-C-A--T------------AA-T--C----AA-A--T---GC--T-T---T-CT----T-T----C-AC-ACAAT-CT----T-A--T-GAG-T--GAAA----TCAAT--AA---
gi|102263 : AAAAT-C---AAC---A---A---AG-T--G-ATCGAGC-A-------A---TT-T------TT----G-T-T---------------TG-A-CG--A---G---AC-----TTGTT----AATT-A--TA-G-AC-T--G-C-TT-G---G-C-CA-C-T-----T-GA-TA-G-TG-T------C--A-A-G--T-AT-CCCCTCA-AG-G--C-----C-A--T---GC-TT-TTTCT-CT----TGT----C-AC-AC--T-CT----T-A--T--AG-T--GAAA----TAAAA--AA---AAActagaaaa
gi|102264 : AAAAA-C---AA--------A---AG-T--G-AAC-AGC-GATC----G---TT-T------TT----CGT-T---------------TT-A-CG-AA---G---ACGTAA-TTT-C----A--T-A--TA-G-ACAT--GTCGCT-T---G-C-CA-C-T-----T-GACTA-G-TG-C------TTCC-A-AATT-ATGCTCCTCA-AA-G--TGCCAAA-A--G---GC-TT-T---T-TT----T-T----C-AC-AC-AT-CT----T-A--TGGAG-T--GAAA----AAAAA--CA---AAAAga
gi|102265 : AAAAC-CTCAAAC---A---A---AG-T--G-ATC-AGC-A--C----G---TT-T------TT----G-T-T---------------TT-A-CGAAA---G---AC---AGTTG-T----A----A--TA-G-AC-T----CGCG-T---GCC-CA-C-T-----T-GA-GA-G-TG--------T--C-A-A--T-AT-CCCCTCAGAG-GGAC----AA-A--CATGGA-TT-T---T-TC----T-T----C-AC-A--AT-CT----TAA--T-GA--T--G-AA----TAAAACCAA---AAa
gi|102266 : AAACT-C---AAC---A---A---AGTT--G-ATC-AGC-A--CGGG-G---TT-T------TC----T-G-T---------------------------------------TTG-T----AG-T-A--TA-G-AC-T--G-CGCT-T---T-T-CA-C-TGAAAAT-GA-TA-------------T--C-A-A--T-AT-CCCC-CA-AGTG--C----AA-A--T---GCTTT-T---T-TT----T-T----C-ATAAC-AT-CT----T-A--T-GAG-T--GAGA----TAAAA--AA---AAAAtaa
gi|102267 : AAAATAC---AACCCAA---AT--AG-T--T-ACC-AGTTA--A----G---TT-T------TT----TATAT---------------TT-A-CG-AA-------AC---A-TGT-T----G--T-A--TA-G-ACGT--G-TGCT-TTTAG-C-CA-CCT-----T-GA-TAAG-TG-T---------A-A-A--T-AT-CCCCTCA-AG----C----AA-A--T---GC-GT-G---T-TT-------------AC-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-T--GAGA----TAAAA--AA---
gi|102268 : AAAAT-C---AAC---A---A---AA-T--T-ATC-AAC-A--C----G---TT-TGGTTTTTT----T-T-TGGGGGGGGGGGGGGGTT-A-TG-AA---G---AA---A-TTG-TT---G--T-G--TA-G-AC-T--G-CG-------------------------A-TA-G-TG-T------T--C-A-A--T-A----------------------A-A--T---GC-TT-T---T-TT----T-T----C-AC-AC-AT-CTCATCC-A--T-GAG-T--GGGA----TAAAA--AA---AAA
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gi|102272 : AAAT-C---AAC---A---A---AG-C--T-ACT-AGC-A--C----G---TT-T------TG----T-T-T---------------TA-A-CG-AA---G---AC---A-TTG-T----A--T-AATTA---AC-A--G-CGCT-----G-C-CA-C-T-----T--A-TA-G-TG-T------T--C-A----T-AT-CCC-TCA-AG-G--C----AA-A--T---GC-TT-T---T-CT----T-T----C-ACAAC-AT--T----T-A--T-GAG-T--GAAA-----AAAA--AA---AAA
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gi|102274 : AAAT-C---A-C---A---A---AG-T--G-ATC-AGC---------G---TT-T------TT----TGT-T---------------TT-A-CG-AA---G---AC---A-TTG-T----A--T-A--TA-G-AC-TGCG-CGCT-T---G-C-CA-C-T-----TAGA-TA-G-TG-T------T--C-A-A--T-A-----ATCA------------AA-A--T---GC-TT-T---TCCT----T-T----CAAC-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-T--GAAT----CAAA
gi|102275 : AAA--C---AAA---A---A---GG-T--G-A---ATC-A--CAGGGG---TT-T------TTG---T-T-T---------------TT-AACG-AA---A---CCC--A-TTG-TT---G--T-A--TA-G-AC-T--G----------G--------------T-GA-TA-A-TG-T------T--C-A-A--T--C-CCCCTCA-AT-G--C----AA-A--T---GC-TT-T---T-TT----T-TTCCCC-AT-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-C--GGAGAATTTAAAA--AA---
gi|102276 : AC---A---ATTTAA-T--G-ATC-AAC-A--C----G---TT-T------TT----G-T-T---------------TT-A-TG-AA---G---CC---A-TTG-T----T--G-AG-TA-G-AC-T--G-CGCT-----A-C-CA-T-T-----C-GA-TA-G-TG-T------T--C-A-A--T-AT-CCCCTCA-AG-G--C----AA-A--T---GC-CT-T------T----T-T----C-AC-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-T--GGGA----TAAAA--CA---AAAA
gi|102277 : G-C--G-ACC-AGC-A--C----G---TT-T------CC----G-T-T---------------TA-A-CG-AA---GCCGAT---A-TTG-T----G--T-A--CA----C-T--G-CGCT-T---A-C-CA-T-T-----T-GA-TA-T-TG-T------TG-C-ACA--C-AC-CCACTAT-AG-G--T----TA-A--T---GC-TT-T---T-ATAAGAT-T----T--------T-TT----T-T--T-AAG-C--GAGA----GAAAA--AA---ATAAa
gi|102278 : -T--G-ATC-AAC-A--C----G---TT-T------TG----T-T-T---------------TT-A-TG-AA---G---CC---A-TTG-TTGA-A--T-------G-AC-T--G-CGCT-A---G-C-CA-C-T-----C-GA-TA-G-TG-T------T--C-A-A--T-AT-CCCCTCA-AG-G--C----AA-A--T---GC-TT-T------T----T-T----C-AC-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-TG-GGAA----TAAAA--AA---AA
gi|102279 : -ATC-AAC-A--A----G---TT-T------TT----G-T-T---------------TT-A-TG-AA---A---AC---A-TTG-TT---G--T-G--TA-G-AC-T--G-CGCT-A---G-C-CA-C-T-----C-GA-TA-G-TG-T------T--C-A-A--T-TT-CCCCTCA-AG-G--C----AA-A--T---GC-CT-T---T-TT----T-C----C-AC-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-T--GGGA----TAGAA--AACCCAAAA
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gi|102281 : -T--G-CGCT-T---G-C-CA-C-T-----T-GA-TG-G-TG-T------T--C-A-A--T-AT-CCTCTCA-AG-G--C----AA-A--TGA-GG-TT-T---T-TT----T-T----C-AC-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-T--GAGA----TAAAA--AA---AA
Alignments
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lowQualScore : . ... ... ... ... . .. . . . .. .... ... . ...... ...... . ............... .. . . ... ... ... . . ....... . .. . . . .. . ..... . . . . ..... . . . . . ...... .. . . .. . . . . .. .... . .. ... . . ... . .... . .... . . . . .... . .. . . .. .... .. ...
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Reference ( family-639 ) : AAAAT-C---AAC---A---A---AG-T--G-ATC-AGC-A--C----G---TT-T------TT----T-T-T---------------TT-A-CG-AA---G---AC---A-TTG-T----A--T-A--TA-G-AC-T--G-CGCT-T---G-C-CA-C-T-----T-GA-TA-G-TG-T------T--C-A-A--T-AT-CCCCTCA-AG-G--C----AA-A--T---GC-TT-T---T-CT----T-T----C-AC-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-T--GAAA----TAAAA--AA---AAAA
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gi|102262 : AAAAT-C---AAA---C---A---AG-T--G-ATC-AGC-A--C----G----T-T------TT----T-G-T---------------TT-A-CGAAA---G---AC---A-TTG-T----A--T-A--TAGG-AC-T--G-CGCT-T---G-C-CA---T-----T-GA-TA-G-TG-T------T--C-C-A--T------------AA-T--C----AA-A--T---GC--T-T---T-CT----T-T----C-AC-ACAAT-CT----T-A--T-GAG-T--GAAA----TCAAT--AA---
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gi|102267 : AAAATAC---AACCCAA---AT--AG-T--T-ACC-AGTTA--A----G---TT-T------TT----TATAT---------------TT-A-CG-AA-------AC---A-TGT-T----G--T-A--TA-G-ACGT--G-TGCT-TTTAG-C-CA-CCT-----T-GA-TAAG-TG-T---------A-A-A--T-AT-CCCCTCA-AG----C----AA-A--T---GC-GT-G---T-TT-------------AC-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-T--GAGA----TAAAA--AA---
gi|102268 : AAAAT-C---AAC---A---A---AA-T--T-ATC-AAC-A--C----G---TT-TGGTTTTTT----T-T-TGGGGGGGGGGGGGGGTT-A-TG-AA---G---AA---A-TTG-TT---G--T-G--TA-G-AC-T--G-CG-------------------------A-TA-G-TG-T------T--C-A-A--T-A----------------------A-A--T---GC-TT-T---T-TT----T-T----C-AC-AC-AT-CTCATCC-A--T-GAG-T--GGGA----TAAAA--AA---AAA
gi|102269 : AAAAT-----AAC---C---ATT-AG-T--G-ATC-AGC-A--C----G---TT-T------TTGCTGT-T-T---------------TT-A-CG-AA-------AC---A-CTG-TTTTAA--T----TA-G-AC-T--G-CGAC-T---A-T-CA-C-T-----T-GATTA-G-TG-T-------------A--T-------TTCA-----------------------------------------------C-AC--C-AT-CT----T-A--T-GAGTT--GAGA----TAAAA--AA---AAAA
gi|102270 : AAACT-C---AAC---A---A---AG-T--GCATC-AGC-A--C----GGCATTGC------TT----T-T-G---------------TT-A-C-------G---AC-----TTG-C----G--T-A--TACG-AC--------CT-T---G----A-----------GA-TA-A-TG-TTAATCGT--T-A-A--T-ATGCCCCTCA-A--G--C----AACA--T---GC-TTCT---T-TT----T-T----C-CCTAC-AT-CT----T-GACT-GAG-CTAGAAT----TAAAA--GG---AAAAa
gi|102271 : AAAT-C---AAC---A---A---AGCT--G-ATT-AGC-A--C----G---TT-T------TG----T-T-T---------------TA-A-CG-AA---G---AC---A-TTG-T----A--TAA--TA---AC-A--G-CGC--T---G-C-CA-C-T-----T--A-TA-G-TG-T------T--CAA-A--T-AT-CACCTCA-AG-G--C----AA-A--T---GCTTT-T---T-CT----T-T----C-ACAAC-AT--T----T-A--T-GAG-T--GAAA-----AAAA--AA---AAa
gi|102272 : AAAT-C---AAC---A---A---AG-C--T-ACT-AGC-A--C----G---TT-T------TG----T-T-T---------------TA-A-CG-AA---G---AC---A-TTG-T----A--T-AATTA---AC-A--G-CGCT-----G-C-CA-C-T-----T--A-TA-G-TG-T------T--C-A----T-AT-CCC-TCA-AG-G--C----AA-A--T---GC-TT-T---T-CT----T-T----C-ACAAC-AT--T----T-A--T-GAG-T--GAAA-----AAAA--AA---AAA
gi|102273 : AAAT-C---A-C---A---A----G-T--G-ATC-AGC-A--G----A---TT-T------TT----G-T-T---------------TT-A-CG-AA---G---AC---A-TTG-T----A--T-A--TA-G-AC-T--G-CGCT-T---G-C-CA-C-T-----TAGA-TA-G-TG-T------T--C-A-A--T-A-----ATCA------------AA-A--T---GC--T-T---T-CT----T-TCA--C-AC-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-T--GAAT----CAAAcaa
gi|102274 : AAAT-C---A-C---A---A---AG-T--G-ATC-AGC---------G---TT-T------TT----TGT-T---------------TT-A-CG-AA---G---AC---A-TTG-T----A--T-A--TA-G-AC-TGCG-CGCT-T---G-C-CA-C-T-----TAGA-TA-G-TG-T------T--C-A-A--T-A-----ATCA------------AA-A--T---GC-TT-T---TCCT----T-T----CAAC-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-T--GAAT----CAAA
gi|102275 : AAA--C---AAA---A---A---GG-T--G-A---ATC-A--CAGGGG---TT-T------TTG---T-T-T---------------TT-AACG-AA---A---CCC--A-TTG-TT---G--T-A--TA-G-AC-T--G----------G--------------T-GA-TA-A-TG-T------T--C-A-A--T--C-CCCCTCA-AT-G--C----AA-A--T---GC-TT-T---T-TT----T-TTCCCC-AT-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-C--GGAGAATTTAAAA--AA---
gi|102276 : AC---A---ATTTAA-T--G-ATC-AAC-A--C----G---TT-T------TT----G-T-T---------------TT-A-TG-AA---G---CC---A-TTG-T----T--G-AG-TA-G-AC-T--G-CGCT-----A-C-CA-T-T-----C-GA-TA-G-TG-T------T--C-A-A--T-AT-CCCCTCA-AG-G--C----AA-A--T---GC-CT-T------T----T-T----C-AC-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-T--GGGA----TAAAA--CA---AAAA
gi|102277 : G-C--G-ACC-AGC-A--C----G---TT-T------CC----G-T-T---------------TA-A-CG-AA---GCCGAT---A-TTG-T----G--T-A--CA----C-T--G-CGCT-T---A-C-CA-T-T-----T-GA-TA-T-TG-T------TG-C-ACA--C-AC-CCACTAT-AG-G--T----TA-A--T---GC-TT-T---T-ATAAGAT-T----T--------T-TT----T-T--T-AAG-C--GAGA----GAAAA--AA---ATAAa
gi|102278 : -T--G-ATC-AAC-A--C----G---TT-T------TG----T-T-T---------------TT-A-TG-AA---G---CC---A-TTG-TTGA-A--T-------G-AC-T--G-CGCT-A---G-C-CA-C-T-----C-GA-TA-G-TG-T------T--C-A-A--T-AT-CCCCTCA-AG-G--C----AA-A--T---GC-TT-T------T----T-T----C-AC-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-TG-GGAA----TAAAA--AA---AA
gi|102279 : -ATC-AAC-A--A----G---TT-T------TT----G-T-T---------------TT-A-TG-AA---A---AC---A-TTG-TT---G--T-G--TA-G-AC-T--G-CGCT-A---G-C-CA-C-T-----C-GA-TA-G-TG-T------T--C-A-A--T-TT-CCCCTCA-AG-G--C----AA-A--T---GC-CT-T---T-TT----T-C----C-AC-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-T--GGGA----TAGAA--AACCCAAAA
gi|102280 : C-A--C----G---TC-T------TG----T-G-T---------------TT-A-TG-AA---G---CC---A-TTG-T----T--G-AG-TA-GCAC-T--G-CGCTAT---G-C-CA-T-T-----C-GA-TA-G-TG-T------TTTC-A-A--T-AT-CCC-TCA-AG-G--------A-A--T---GC-TT-T---T-CT----T-C----C--C-ACAAT-CT----T-A--T-GAG-T--G-GA----TAGGA--AA---AAAa
gi|102281 : -T--G-CGCT-T---G-C-CA-C-T-----T-GA-TG-G-TG-T------T--C-A-A--T-AT-CCTCTCA-AG-G--C----AA-A--TGA-GG-TT-T---T-TT----T-T----C-AC-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-T--GAGA----TAAAA--AA---AA
blockSeqs : A TCA CCA CCA TTT T TG C G T AT AGGG GCA G GGTTTT GCTGT A GGGGGGGGGGGGGGG TG A A AAA CCG GTA G T TTTAA A AT G G A GC G TTTA C A A C GAAAA A G A G T TAATCG TC A C AT T G G T GA GCCA C AT ATG T C TTC C AAGA G TCCC A A A G CATC A AC G T TA AATT CC CCC
blockSeqs : . . . . TT C A . . . G GGG . . . GT . . T . A . . C . . TGAT . G C C G . T TT . . . . . A C . . G . TT A . T . G . . C A . . GA T . . . . . CA . T A C . . . . T G T . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . C . . . CG . . T . . . . . . . TGAA . G . . . . . AT . . . . . . T . . . . G . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TA . . T . . . . . . . AAT . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TG . . T . . . . . . . TA . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . GT . . T . . . . . . . AG . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . TG . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . . . . . TG . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . . . . . TG . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . A . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . A . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . A . . . . . . . G . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . G . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : AAAAT-C---AAC---A---A---AG-T--G-ATC-AGC-A--C----G---TT-T------TT----T-T-T---------------TT-A-CG-AA---G---AC---A-TTG-T----A--T-A--TA-G-AC-T--G-CGCT-T---G-C-CA-C-T-----T-GA-TA-G-TG-T------T--C-A-A--T-AT-CCCCTCA-AG-G--C----AA-A--T---GC-TT-T---T-CT----T-T----C-AC-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-T--GAAA----TAAAA--AA---AAAA
finalCons : AAAAT-C---AAC---A---A---AG-T--G-ATC-AGC-A--C----G---TT-T------TT----T-T-T---------------TT-A-CG-AA---G---AC---A-TTG-T----A--T-A--TA-G-AC-T--G-CGCT-T---G-C-CA-C-T-----T-GA-TA-G-TG-T------T--C-A-A--T-AT-CCCCTCA-AG-G--C----AA-A--T---GC-TT-T---T-CT----T-T----C-AC-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-T--GAAA----TAAAA--AA---AAAA
Alignments
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lowQualScore : 1 222 222 222 666 3 33 1 1 1 33 6666 222 1 444444 999999 1 888888888888888 11 1 2 222 222 333 1 1 3333333 1 44 2 2 2 11 2 44444 1 1 1 1 33333 2 4 1 1 2 333333 55 2 1 33 1 2 1 1 33 5555 1 11 444 2 1 222 1 2222 1 4444 1 5 2 2 2222 1 11 1 2 33 5555 22 222
lowQualScore : . ... ... ... ... . .. . . . .. .... ... . ...... ...... . ............... .. . . ... ... ... . . ....... . .. . . . .. . ..... . . . . ..... . . . . . ...... .. . . .. . . . . .. .... . .. ... . . ... . .... . .... . . . . .... . .. . . .. .... .. ...
lowQualScore : 7 999 888 888 666 0 55 4 4 4 33 7777 444 4 000000 666666 4 666666666666666 88 4 8 444 444 888 4 4 3333333 4 77 8 8 7 88 7 22222 3 3 3 3 33333 7 0 3 3 7 888888 00 7 3 22 3 7 3 3 22 5555 3 88 222 7 3 333 3 8888 3 7777 3 3 7 7 8888 3 88 3 7 22 5555 00 555
consensus : AAAAT-C---AAC---A---A---AG-T--G-ATC-AGC-A--C----G---TT-T------TT----T-T-T---------------TT-A-CG-AA---G---AC---A-TTG-T----A--T-A--TA-G-AC-T--G-CGCT-T---G-C-CA-C-T-----T-GA-TA-G-TG-T------T--C-A-A--T-AT-CCCCTCA-AG-G--C----AA-A--T---GC-TT-T---T-CT----T-T----C-AC-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-T--GAAA----TAAAA--AA---AAAA
Reference ( family-639 ) : AAAAT-C---AAC---A---A---AG-T--G-ATC-AGC-A--C----G---TT-T------TT----T-T-T---------------TT-A-CG-AA---G---AC---A-TTG-T----A--T-A--TA-G-AC-T--G-CGCT-T---G-C-CA-C-T-----T-GA-TA-G-TG-T------T--C-A-A--T-AT-CCCCTCA-AG-G--C----AA-A--T---GC-TT-T---T-CT----T-T----C-AC-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-T--GAAA----TAAAA--AA---AAAA
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gi|102256 : AAAAT-C---AAC---A---A---AG-TTGA-ATC-AGC-A--C----G---TT-T------TT----G-T-T---------------TT-A-CG-AAAAAG---AC---G-TTG-T----A--T-A--TA-G-AC-T--GGCGCT-T---G-T-CA-C-T-----T-GAGTA-G-TG-T------T--C-A-A--T-AT-CCCC-CT-AG-G--C----AA-A--T---GC-TT-T---T-CT----T-T----C-AC-AC-AT-CT----T-A--T--AG-T--GAAAT---TAAAA--AA---AAAAcaa
gi|102257 : AAAAT-C---AAC---A---A---AG-T--G-ATC-AGC-A--C----A---AT-T------GT----T-T-T------------------A-CG-AA---G---AC---A-ATG-T----A--T-A--TA-G-AC-T--G-CG-T-T---G-C-CA-C-T-----T-GA-TA---TGTT------T--C-A-A--T-AT-CCTCTCA-AG-G--C----AA-A--T---GA--T-T---T-CT----T-T----C-AC-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-T--G-AA----TAAAA--AA---AAAa
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gi|102259 : AAAAT-C---AAC---ACCAA---AG-TA-G-ATC-AGC-A--C----G---TT-G------TT----G-T-T---------------TTGA-CG-AA---G---AC---A-TTG-TT---A--T-A--TA-G-AC-T--G--GCT-T---G-C-CA-C-T-----T-AA-TA-GGTG-T------T--C-A-A--TTAT-CCCCTCA-AG-G--TG---AA-A--T---GC-TT-T---T-CT----T-T----C-AC-AC-AT-CT----T-A--T-GAA-T--GAAA-----AAAA--AA---a
gi|102260 : AAAAT-A---ATC---A---A---AG-T--A-TTC-AGC-A--CC---G---TT-T------GT----T-T-T------------------A-CA-GA---A---AT---A-TTG-C----A--T-A--TA-G-AC-T--G-CGCT-TT--G-CACAAC-T-----T-GA-TA-G-TG-T------T--CAA-A--T-AT-CCCCTCA-A--G--C----AA-A--T---GC-TT-T---C-AT----T-T----C-AC-AC-AT-CT----T-A--T--AG-T--GAAAT---TAAAA--AA---CAAA
gi|102261 : AAAAT-C---AAC---A---A---AA-T--G-ATC-AGC-AG-C----G----T-T------TG----T-T-G---------------TT-A-CG-AA---G---AC-----TTG-TTG--AT-T-A--TA-G-AC-T--G-CG-T-T---G-C-CA-C-T-----T-GA-T--G-TG-T------T--C---A--T-AT-CCCCT-A-AG-GC-C----AA-AATT---GC-TT--------T----T-T----C-CC-AC-AC-TC----T-A--T-GAG-T--GAAA----TTAAA--AA---AAa
gi|102262 : AAAAT-C---AAA---C---A---AG-T--G-ATC-AGC-A--C----G----T-T------TT----T-G-T---------------TT-A-CGAAA---G---AC---A-TTG-T----A--T-A--TAGG-AC-T--G-CGCT-T---G-C-CA---T-----T-GA-TA-G-TG-T------T--C-C-A--T------------AA-T--C----AA-A--T---GC--T-T---T-CT----T-T----C-AC-ACAAT-CT----T-A--T-GAG-T--GAAA----TCAAT--AA---
gi|102263 : AAAAT-C---AAC---A---A---AG-T--G-ATCGAGC-A-------A---TT-T------TT----G-T-T---------------TG-A-CG--A---G---AC-----TTGTT----AATT-A--TA-G-AC-T--G-C-TT-G---G-C-CA-C-T-----T-GA-TA-G-TG-T------C--A-A-G--T-AT-CCCCTCA-AG-G--C-----C-A--T---GC-TT-TTTCT-CT----TGT----C-AC-AC--T-CT----T-A--T--AG-T--GAAA----TAAAA--AA---AAActagaaaa
gi|102264 : AAAAA-C---AA--------A---AG-T--G-AAC-AGC-GATC----G---TT-T------TT----CGT-T---------------TT-A-CG-AA---G---ACGTAA-TTT-C----A--T-A--TA-G-ACAT--GTCGCT-T---G-C-CA-C-T-----T-GACTA-G-TG-C------TTCC-A-AATT-ATGCTCCTCA-AA-G--TGCCAAA-A--G---GC-TT-T---T-TT----T-T----C-AC-AC-AT-CT----T-A--TGGAG-T--GAAA----AAAAA--CA---AAAAga
gi|102265 : AAAAC-CTCAAAC---A---A---AG-T--G-ATC-AGC-A--C----G---TT-T------TT----G-T-T---------------TT-A-CGAAA---G---AC---AGTTG-T----A----A--TA-G-AC-T----CGCG-T---GCC-CA-C-T-----T-GA-GA-G-TG--------T--C-A-A--T-AT-CCCCTCAGAG-GGAC----AA-A--CATGGA-TT-T---T-TC----T-T----C-AC-A--AT-CT----TAA--T-GA--T--G-AA----TAAAACCAA---AAa
gi|102266 : AAACT-C---AAC---A---A---AGTT--G-ATC-AGC-A--CGGG-G---TT-T------TC----T-G-T---------------------------------------TTG-T----AG-T-A--TA-G-AC-T--G-CGCT-T---T-T-CA-C-TGAAAAT-GA-TA-------------T--C-A-A--T-AT-CCCC-CA-AGTG--C----AA-A--T---GCTTT-T---T-TT----T-T----C-ATAAC-AT-CT----T-A--T-GAG-T--GAGA----TAAAA--AA---AAAAtaa
gi|102267 : AAAATAC---AACCCAA---AT--AG-T--T-ACC-AGTTA--A----G---TT-T------TT----TATAT---------------TT-A-CG-AA-------AC---A-TGT-T----G--T-A--TA-G-ACGT--G-TGCT-TTTAG-C-CA-CCT-----T-GA-TAAG-TG-T---------A-A-A--T-AT-CCCCTCA-AG----C----AA-A--T---GC-GT-G---T-TT-------------AC-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-T--GAGA----TAAAA--AA---
gi|102268 : AAAAT-C---AAC---A---A---AA-T--T-ATC-AAC-A--C----G---TT-TGGTTTTTT----T-T-TGGGGGGGGGGGGGGGTT-A-TG-AA---G---AA---A-TTG-TT---G--T-G--TA-G-AC-T--G-CG-------------------------A-TA-G-TG-T------T--C-A-A--T-A----------------------A-A--T---GC-TT-T---T-TT----T-T----C-AC-AC-AT-CTCATCC-A--T-GAG-T--GGGA----TAAAA--AA---AAA
gi|102269 : AAAAT-----AAC---C---ATT-AG-T--G-ATC-AGC-A--C----G---TT-T------TTGCTGT-T-T---------------TT-A-CG-AA-------AC---A-CTG-TTTTAA--T----TA-G-AC-T--G-CGAC-T---A-T-CA-C-T-----T-GATTA-G-TG-T-------------A--T-------TTCA-----------------------------------------------C-AC--C-AT-CT----T-A--T-GAGTT--GAGA----TAAAA--AA---AAAA
gi|102270 : AAACT-C---AAC---A---A---AG-T--GCATC-AGC-A--C----GGCATTGC------TT----T-T-G---------------TT-A-C-------G---AC-----TTG-C----G--T-A--TACG-AC--------CT-T---G----A-----------GA-TA-A-TG-TTAATCGT--T-A-A--T-ATGCCCCTCA-A--G--C----AACA--T---GC-TTCT---T-TT----T-T----C-CCTAC-AT-CT----T-GACT-GAG-CTAGAAT----TAAAA--GG---AAAAa
gi|102271 : AAAT-C---AAC---A---A---AGCT--G-ATT-AGC-A--C----G---TT-T------TG----T-T-T---------------TA-A-CG-AA---G---AC---A-TTG-T----A--TAA--TA---AC-A--G-CGC--T---G-C-CA-C-T-----T--A-TA-G-TG-T------T--CAA-A--T-AT-CACCTCA-AG-G--C----AA-A--T---GCTTT-T---T-CT----T-T----C-ACAAC-AT--T----T-A--T-GAG-T--GAAA-----AAAA--AA---AAa
gi|102272 : AAAT-C---AAC---A---A---AG-C--T-ACT-AGC-A--C----G---TT-T------TG----T-T-T---------------TA-A-CG-AA---G---AC---A-TTG-T----A--T-AATTA---AC-A--G-CGCT-----G-C-CA-C-T-----T--A-TA-G-TG-T------T--C-A----T-AT-CCC-TCA-AG-G--C----AA-A--T---GC-TT-T---T-CT----T-T----C-ACAAC-AT--T----T-A--T-GAG-T--GAAA-----AAAA--AA---AAA
gi|102273 : AAAT-C---A-C---A---A----G-T--G-ATC-AGC-A--G----A---TT-T------TT----G-T-T---------------TT-A-CG-AA---G---AC---A-TTG-T----A--T-A--TA-G-AC-T--G-CGCT-T---G-C-CA-C-T-----TAGA-TA-G-TG-T------T--C-A-A--T-A-----ATCA------------AA-A--T---GC--T-T---T-CT----T-TCA--C-AC-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-T--GAAT----CAAAcaa
gi|102274 : AAAT-C---A-C---A---A---AG-T--G-ATC-AGC---------G---TT-T------TT----TGT-T---------------TT-A-CG-AA---G---AC---A-TTG-T----A--T-A--TA-G-AC-TGCG-CGCT-T---G-C-CA-C-T-----TAGA-TA-G-TG-T------T--C-A-A--T-A-----ATCA------------AA-A--T---GC-TT-T---TCCT----T-T----CAAC-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-T--GAAT----CAAA
gi|102275 : AAA--C---AAA---A---A---GG-T--G-A---ATC-A--CAGGGG---TT-T------TTG---T-T-T---------------TT-AACG-AA---A---CCC--A-TTG-TT---G--T-A--TA-G-AC-T--G----------G--------------T-GA-TA-A-TG-T------T--C-A-A--T--C-CCCCTCA-AT-G--C----AA-A--T---GC-TT-T---T-TT----T-TTCCCC-AT-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-C--GGAGAATTTAAAA--AA---
gi|102276 : AC---A---ATTTAA-T--G-ATC-AAC-A--C----G---TT-T------TT----G-T-T---------------TT-A-TG-AA---G---CC---A-TTG-T----T--G-AG-TA-G-AC-T--G-CGCT-----A-C-CA-T-T-----C-GA-TA-G-TG-T------T--C-A-A--T-AT-CCCCTCA-AG-G--C----AA-A--T---GC-CT-T------T----T-T----C-AC-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-T--GGGA----TAAAA--CA---AAAA
gi|102277 : G-C--G-ACC-AGC-A--C----G---TT-T------CC----G-T-T---------------TA-A-CG-AA---GCCGAT---A-TTG-T----G--T-A--CA----C-T--G-CGCT-T---A-C-CA-T-T-----T-GA-TA-T-TG-T------TG-C-ACA--C-AC-CCACTAT-AG-G--T----TA-A--T---GC-TT-T---T-ATAAGAT-T----T--------T-TT----T-T--T-AAG-C--GAGA----GAAAA--AA---ATAAa
gi|102278 : -T--G-ATC-AAC-A--C----G---TT-T------TG----T-T-T---------------TT-A-TG-AA---G---CC---A-TTG-TTGA-A--T-------G-AC-T--G-CGCT-A---G-C-CA-C-T-----C-GA-TA-G-TG-T------T--C-A-A--T-AT-CCCCTCA-AG-G--C----AA-A--T---GC-TT-T------T----T-T----C-AC-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-TG-GGAA----TAAAA--AA---AA
gi|102279 : -ATC-AAC-A--A----G---TT-T------TT----G-T-T---------------TT-A-TG-AA---A---AC---A-TTG-TT---G--T-G--TA-G-AC-T--G-CGCT-A---G-C-CA-C-T-----C-GA-TA-G-TG-T------T--C-A-A--T-TT-CCCCTCA-AG-G--C----AA-A--T---GC-CT-T---T-TT----T-C----C-AC-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-T--GGGA----TAGAA--AACCCAAAA
gi|102280 : C-A--C----G---TC-T------TG----T-G-T---------------TT-A-TG-AA---G---CC---A-TTG-T----T--G-AG-TA-GCAC-T--G-CGCTAT---G-C-CA-T-T-----C-GA-TA-G-TG-T------TTTC-A-A--T-AT-CCC-TCA-AG-G--------A-A--T---GC-TT-T---T-CT----T-C----C--C-ACAAT-CT----T-A--T-GAG-T--G-GA----TAGGA--AA---AAAa
gi|102281 : -T--G-CGCT-T---G-C-CA-C-T-----T-GA-TG-G-TG-T------T--C-A-A--T-AT-CCTCTCA-AG-G--C----AA-A--TGA-GG-TT-T---T-TT----T-T----C-AC-AC-AT-CT----T-A--T-GAG-T--GAGA----TAAAA--AA---AA