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Reference ( family-629 )      :                                                                TTTCA-C---AG-T-GAGAA-A-A--T-AAC-AA-T-T-TCC--G-G--T--------CTA---CT-T--GCCGC-A-A-TA-TC-TA--T-CCGC-A-A-TA-C-TAA-TG-A-TNA--CC-TT-AA-T--T-TTAC-G-TT-A-T-AT---TT-AAT---AAA---TGT-----TC--ATG-GG---TT-T---T-----CT-T----A-TTTG--AA--T-A-T---CCCAA--A-A-T-AATTT-AATTTT-C---A-CT-----T--TAG-A-GG----A--TT-G--T--T--G-G-A-TC-CA-CC--T-ATCG-A-T-AC-ATAA
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Reference ( family-629 )      :                                                                TTTCA-C---AG-T-GAGAA-A-A--T-AAC-AA-T-T-TCC--G-G--T--------CTA---CT-T--GCCGC-A-A-TA-TC-TA--T-CCGC-A-A-TA-C-TAA-TG-A-TNA--CC-TT-AA-T--T-TTAC-G-TT-A-T-AT---TT-AAT---AAA---TGT-----TC--ATG-GG---TT-T---T-----CT-T----A-TTTG--AA--T-A-T---CCCAA--A-A-T-AATTT-AATTTT-C---A-CT-----T--TAG-A-GG----A--TT-G--T--T--G-G-A-TC-CA-CC--T-ATCG-A-T-AC-ATAA
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gi|83332                      :                                                                TTTCA-C---AG-T-GGGAA-A-A--T-AACTAA-T-T-TCC--G-G--T--------CTA---CT----GCCGC-AGA-TA-TC-CA--T-CCGC-ACA-TA-C-TAA--G-A-TTA--CC-TT-AA-T--T-T-AC-G-TT-AGT-AT---TT-AAT---AAA---TAT-----TCCCATG-GG---TT-T---T-----CT-T----A-TTTG--AA--T-A-T----CCAA--A-A---AATAT-AATTTT-TCTGA-CT-----TA-TAG-A-AG--------T-G--T--T--A-A-G-AC-CA-CC--T--TCG-A-T-TT-ATAA
gi|83333                      :                                                                TTTCA-CCCCAG-T-GAGAA-A-A--T-AAC-AA-TGT-TCC--G-G--TATC-----CTA---TT-T--GCCGCCA-A-TA-TC-TA--T-CCGC-A-A-TA-C-T-A-TG-A-TTA--CC-TTGAA-T--T-TTAC-G-TT-ATT-AT---TT-AATA--AAA---TG------TC--AGG-GG---TT-TCTGT-----CT-T----A-TTGC--AA--T-A-T---CCCAA--A-AGT-AATAT-AATTTT-C---A-CT-----TGATAG-A-G--------TT-G--T--TTAGCA-A-TCGCACCC--T-ATCG-A-T-a
gi|83334                      :                                                                TTTCA-C---AG-TTGAGAA-A-A--T-AAC-AA-C-T-TCCG-G-G--T--------CTA---CT-T--G-CG--A-A-TA-TCTTA--T-CCGC-A-A-TA-A-AAT-TT-A-TAA---C-TT-AA-T--TGTTAC-G-TT-A-TAAT---TT-AACGTAAAA---TGT-----T----TG-GG---TT-T---T-----C-------G-TTTG--AA--T-A-T---CCAAA--A-A-TGAATTT-AATTTT-C---A-CT-----T--TAA-G-AG----A--TTAG--T--T--G-GTA-TC-CA-CCCGT-ATCGAA-T-AC-AT
gi|83335                      :                                                                TTTCAAC---AG-T-GAGAA-AGA--T-ACA-AA-T-T-TCC--T-G--T--------CTA---CT-T--GCCGC-A-AATA-T--TA--TGCCG--A-A-TAAC-TAA-TG-A-TTA--CC-TTTGA-T--T-TTATTGCTT-A-T-AT---TTTAAT---AA----TGT-----TC--ATG-G----TT-A---T-----CT-T----A-TTTG--AA--TTA-T---CCCAA--A-A-T-AATAT--ATTTT-C---A-CTAAAAAA--TAT-A-GG----A--TT-G--T--TTAG-A-A-TC-CA-CC--TAATCG-A-T-TC-ATGA
gi|83336                      :                                                                TTTTA-C---AG-T-GAGAA-ATA--A-AAA-AA-T-T-CTC--GCG--T--------TTA---TT-T--TGCGC-A---TA-TT-TA--T-CCGCTA-A-TA-GATTA-TG-A-TAA--CC-TT-AA-T--T-GTAC-G-TTGA-T-AT---TT-AAT---AAA---TGG-----TCG-ATGTGG---TT-T---TATTTATT-T----A-TTTG--AA--T-A-TATCTCCAA--ATA-T-AATTTTCATTTT-C---A-CT-----T--TAG-A-GG----AATTT-G--T--T--G-G---TC-CA-CCT-T-ATCG-A-T-AT-a
gi|83337                      :                                                                TCTTA-C---AGAT-GAGAACA-A--T-AAC-TA-T-TCTCC--G-G--T--------TTA---CT-TTAGCCGC-A-A-TA-TC-TC--T-ACGC-A-A-TA-CCTAA-TG-ACTAA--CC-TG-AA-T--T-TTCT-C-TT-A-T-AT---TT-ATA---AAA---TGT-----TC--ATG-GG---TT-T---T-----CT-T----A-TTTG--AAATT-A-T---CC--A--A-A-T-AA-TT-AATTAT-C---A-CT-----T--TAGCA-G--------TT-G--TAATA-G-A-A-TC-CA-CT--G-AGCG-AGT-AC-aa
gi|83338                      :                                                                TTTCA-C---AG-T-GAGAA-A-A--T-AAC-AA-C-T-TCC--G-G--T--------CTA---CT-T--GCCGC-A-A-TA-TC-AA--T-CCGC-A-A-TA-C-TAA-TG-A-TAA--CC-TT-AA-T--T-TTAC-G-TT-A-T-
gi|83339                      :                                                                TTTCA-----AG-T-GA-AA-A-A--T-AAC-AA-T-T-TCC--A-G--T--------TTAAGCCT-T--G-CG--A-A-TA-T--TA--T-CC-C-A-T-TG-C-TAA--G-A-AAAACCC-TT-A-----T-TTAA-G-TT-ACT-AT---TC---T---AAG---TGTTCTAATC--ATG-GA----T-T---T-----CT-T----A-TTTG--AA--T-A-T----CAAA--A-A-T-CATTT-ATTTCT-C---T-CT-----T--TAG-A--G----A--TT-G--TC-T--C-G-A-CT-CA-CC--T-ATTG-A-T-AC-ATAA
gi|83340                      :                                                                TTTCA-C---AG-T-GAGAA-A-A--T-AAC-AA-T-T-TCC--G-G--T--------CTA---CT-T--GCCGA-A-A-CA-TC-AA--T-CCGC-A-A-TA-C-TAA-TG-A-TTA--CC-TT-GA-T--a
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gi|83342                      :                                                                 TTCA-----AG-T-GGAAA-A-A--T-A-C-A----T-TCT--G-G--T--------TTA---CT-T--ACCGC-A-A-TA-T--TA--T-CCTC-A-AATA-C-TAA-TG-A--AA--CC-T--AA-T--T-TTACCG-TT-A-T-------T-AAT---AAA---TGT-----TC--ATA-GG---TT-T---C--------T----A-TTTG--AA--T-A-T---CCCAA--A-A-T-AATTT-TAATTT-C---ATCT-----T--TAG-A-GG----A--CT-G--T--T--G-G-A-TC-CA-CC--T-ATCG-A-TAAC-ATA
gi|83343                      :                                                                   CG-C---AG-C-GTGAA-G-A--T-AAC-AA------CT--G-GAAT---------TA---CT-T--GCCAC-A-C-TA-TT-TC--T-CCGC-G-A-CA-C-TAA-TG-A-CCA--CC-TT-CA-T--T-TTAT-G-AC-A-T-AT---
gi|83344                      :                                                                   CG-C---AG-C-GTGAA-G-A--T-AAC-AA------CT--G-GAAT---------TA---CT-T--GCCAC-A-C-TA-TT-TC--T-CCGC-G-A-CA-C-TAA-TG-A-CCA--CC-TT-CA-T--T-TTAT-G-AC-A-T-AT---
gi|83345                      :                                                                   CG-C---AG-C-GTGAA-G-A--T-AAC-AA------CT--G-GAAT---------TA---CT-T--GCCAC-A-C-TA-TT-TC--T-CCGC-G-A-CA-C-TAATTG-A-CCA--CC-TT-CATT--T-TTAT-G-AC-A-T-AT---
gi|83346                      :                                                                                  AA-A-A--TTAAT-AAAT-T-TTC--A-C--T--------TGN---TT-T--GCCGC-A-A-TA-T---A--T-CTGC-T-A-TG-CATAG--G-A-TCG--CC-TT---------TCAC-G-TT-A-C-GT---T--------AAC---T------------TG-GGGTTTT-T---T-----TT-T----A-TTCT--AA--T-A-C---CCCAA--A-A-TTAAT---AATTTTTC---A-CT-----T--T-G-A-GGT---T--TT-G--C--T--T-G-A-TC-CG-TC--T-ATCA-A-A-TC-ATAA
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gi|83348                      : aaataacaattttcggtcccctcaccgcaatatctattcgcaatactaatgtgaccttaattttacgtatatttataaacttaattt--T-AAC-AA-T-T-TCC--G-G--T--------TTA---TT-T--GCCCC-T-A-TA-TA-TA--T-CCGC-A-A-TA-C-AAA-TG-A-TAA--CC-TT-AA-T--T-TTAC-G-TT-G-T-GC---TT-GAT---ATA---TGT-----TC--ATG-GG---TT-T---T-----CT-T----A-TTTG--AA--T-A-T---CCGAA--A-A-T-AATCT-AATTTT-C---G-CT-----T--TAG-A-GG----A--TT-G--C--T--G-G-A-TT-CA-CC--T-ATCG-A-T-AC-ATAAa
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gi|83350                      :                                                                                                                                                                                                                                          T-----TC--GTG-GG---TT-T---T-----CT-T----A-TTTG--AA--T-A-T---CCCAA--A-C-T-AAATT-AATTTT-C---A-GC-----T--TAG-AGGG----A--TT-G--T--C--G-G-A-TC-CA-CC--T-ATCG-A-T-AC-ATAAa


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blockSeqs                     :                                                                     . .    . .     . . .  .   .  T   .   .  . .  .          .    . .      . . .  . C   .  .    . . .  . .   .  . . A .   .  .  . .  .    . .  . . A  .    A   .     .     .      .    .  .    . .   .      . .    .    .   .  . . .       .  . . .     .      . .   .  .     .    . .  .    .   . .  .  .  . . .  .  .  .  .    . . .  .
blockSeqs                     :                                                                     . .    . .     . . .  .   .  C   .   .  . .  .          .    . .      . . .  . C   .  .    . . .  . .   .  . . A .   .  .  . .  .    . .  . . A  .    A   .     .     .      .    .  .    . .   .      . .    .    .   .  . . .       .  . . .     .      . .   .  .     .    . .  .    .   . .  .  .  . . .  .  .  .  .    . . .  .
blockSeqs                     :                                                                     . .    . .     . . .  .   .  C   .   .  . .  .          .    . .      . . .  . C   .  .    . . .  . .   .  . . T .   .  .  . .  .    . .  . . A  .    A   .     .     .      .    .  .    . .   .      . .    .    .   .  . . .       .  . . .     .      . .   .  .     .    . .  .    .   . .  .  .  . . .  .  .  .  .    . . .  .
blockSeqs                     :                                                                     . .    . .     . . .  .   .  T   .   .  . .  .          .    . .      . . .  . C   .  .    . . .  . .   .  . . T .   .  .  . .  .    . .  . . A  .    A   .     .     .      .    .  .    . .   .      . .    .    .   .  . . .       .  . . .     .      . .   .  .     .    . .  .    .   . .  .  .  . . .  .  .  .  .    . . .  .
blockSeqs                     :                                                                     . .    . .     . . .  .   .  C   .   .  . .  .          .    . .      . . .  . C   .  .    . . .  . .   .  . . T .   .  .  . .  .    . .  . . A  .    A   .     .     .      .    .  .    . .   .      . .    .    .   .  . . .       .  . . .     .      . .   .  .     .    . .  .    .   . .  .  .  . . .  .  .  .  .    . . .  .
blockSeqs                     :                                                                     . .    . .     . . .  .   .  C   .   .  . .  .          .    . .      . . .  . C   .  .    . . .  . .   .  . . A .   .  .  . .  .    . .  . . A  .    A   .     .     .      .    .  .    . .   .      . .    .    .   .  . . .       .  . . .     .      . .   .  .     .    . .  .    .   . .  .  .  . . .  .  .  .  .    . . .  .
blockSeqs                     :                                                                     . .    . .     . . .  .   .  T   .   .  . .  .          .    . .      . . .  . C   .  .    . . .  . .   .  . . T .   .  .  . .  .    . .  . . A  .    A   .     .     .      .    .  .    . .   .      . .    .    .   .  . . .       .  . . .     .      . .   .  .     .    . .  .    .   . .  .  .  . . .  .  .  .  .    . . .  .
blockSeqs                     :                                                                     . .    . .     . . .  .   .  T   .   .  . .  .          .    . .      . . .  . C   .  .    . . .  . .   .  . . A .   .  .  . .  .    . .  . . A  .    A   .     .     .      .    .  .    . .   .      . .    .    .   .  . . .       .  . . .     .      . .   .  .     .    . .  .    .   . .  .  .  . . .  .  .  .  .    . . .  .
blockSeqs                     :                                                                     . .    . .     . . .  .   .  C   .   .  . .  .          .    . .      . . .  . T   .  .    . . .  . .   .  . . A .   .  .  . .  .    . .  . . A  .    A   .     .     .      .    .  .    . .   .      . .    .    .   .  . . .       .  . . .     .      . .   .  .     .    . .  .    .   . .  .  .  . . .  .  .  .  .    . . .  .
blockSeqs                     :                                                                     . .    . .     . . .  .   .  T   .   .  . .  .          .    . .      . . .  . C   .  .    . . .  . .   .  . . A .   .  .  . .  .    . .  . . A  .    A   .     .     .      .    .  .    . .   .      . .    .    .   .  . . .       .  . . .     .      . .   .  .     .    . .  .    .   . .  .  .  . . .  .  .  .  .    . . .  .
blockSeqs                     :                                                                     . .    . .     . . .  .   .  T   .   .  . .  .          .    . .      . . .  . C   .  .    . . .  . .   .  . . A .   .  .  . .  .    . .  . . A  .    A   .     .     .      .    .  .    . .   .      . .    .    .   .  . . .       .  . . .     .      . .   .  .     .    . .  .    .   . .  .  .  . . .  .  .  .  .    . . .  .
blockSeqs                     :                                                                     . .    . .     . . .  .   .  T   .   .  . .  .          .    . .      . . .  . C   .  .    . . .  . .   .  . . T .   .  .  . .  .    . .  . . G  .    A   .     .     .      .    .  .    . .   .      . .    .    .   .  . . .       .  . . .     .      . .   .  .     .    . .  .    .   . .  .  .  . . .  .  .  .  .    . . .  .
blockSeqs                     :                                                                     . .    . .     . . .  .   .  C   .   .  . .  .          .    . .      . . .  . T   .  .    . . .  . .   .  . . A .   .  .  . .  .    . .  . . A  .    G   .     .     .      .    .  .    . .   .      . .    .    .   .  . . .       .  . . .     .      . .   .  .     .    . .  .    .   . .  .  .  . . .  .  .  .  .    . . .  .
blockSeqs                     :                                                                     . .    . .     . . .  .   .  T   .   .  . .  .          .    . .      . . .  . T   .  .    . . .  . .   .  . . A .   .  .  . .  .    . .  . . A  .    A   .     .     .      .    .  .    . .   .      . .    .    .   .  . . .       .  . . .     .      . .   .  .     .    . .  .    .   . .  .  .  . . .  .  .  .  .    . . .  .
blockSeqs                     :                                                                     . .    . .     . . .  .   .  T   .   .  . .  .          .    . .      . . .  . T   .  .    . . .  . .   .  . . C .   .  .  . .  .    . .  . . G  .    .   .     .     .      .    .  .    . .   .      . .    .    .   .  . . .       .  . . .     .      . .   .  .     .    . .  .    .   . .  .  .  . . .  .  .  .  .    . . .  .
blockSeqs                     :                                                                     . .    . .     . . .  .   .  T   .   .  . .  .          .    . .      . . .  . C   .  .    . . .  . .   .  . . C .   .  .  . .  .    . .  . . .  .    .   .     .     .      .    .  .    . .   .      . .    .    .   .  . . .       .  . . .     .      . .   .  .     .    . .  .    .   . .  .  .  . . .  .  .  .  .    . . .  .
blockSeqs                     :                                                                     . .    . .     . . .  .   .  T   .   .  . .  .          .    . .      . . .  . A   .  .    . . .  . .   .  . . C .   .  .  . .  .    . .  . . .  .    .   .     .     .      .    .  .    . .   .      . .    .    .   .  . . .       .  . . .     .      . .   .  .     .    . .  .    .   . .  .  .  . . .  .  .  .  .    . . .   
blockSeqs                     :                                                                     . .    . .     . . .  .   .  .   .   .  . .  .          .    . .      . . .  . .   .  .    . . .  . .   .  . . C .   .  .  . .  .    . .  . . .  .    .   .     .     .      .    .  .    . .   .      . .    .    .   .  . . .       .  . . .     .      . .   .  .     .                                                          
blockSeqs                     :                                                                     . .    . .     . . .  .   .  .   .   .  . .  .          .    . .      . . .  . .   .  .    . . .  . .   .  . . G .   .  .  . .  .    . .  . . .  .    .   .     .     .      .    .  .    . .   .      . .    .    .   .  . . .       .  . . .     .                                                                                
blockSeqs                     :                                                                                    . . .  .   .  .   .   .  . .  .          .    . .      . . .  . .   .  .    . . .  . .   .  . . T .   .  .  . .  .    . .  . . .  .                    .      .    .  .    . .   .      . .    .    .   .  . . .       .  . . .                                                                                      
blockSeqs                     :                                                                                    . . .  .   .  .   .   .  . .  .          .    . .      . . .  . .   .  .    . . .  . .   .  . . A .   .  .  . .  .    . .  . . .  .                                                                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                                                                        .  .   .  .   .   .  . .  .          .    . .      . . .  . .   .  .    . . .  . .   .  . . . .   .  .  . .  .    . .  . .    .                                                                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                  . .  . .   .  . . . .   .  .  . .                                                                                                                                                                                                      


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