lowQualScore                  :                                     111111                                                       11111                                                                                                                                                                                                                                                                             2222222  111                                                                                                                                          222222222                          2222222                                     
lowQualScore                  :        2  2   4 2  999 2   2    22  000000 2  2 2  1    1    1 4444  3 1  888  555555 222  1     00000  1 1 1       22  2 444 1  1 3    1  1    1 1 3333    1   1   1 55   3 1 333 1 1 3  66 1 22   1 1 1    1   22 1  0    22 1   55   22 1 666 22 88 1 22   44444 1    44   888    1 1 22  1  7    33 777777 5555555    1  22  2  4444    2   2      2   2 333   2 2      2   2  2222222  000    22  66 1   1 1 66 22     1  1 3 1   1 22 3 555 1 9999 22 3  1 3  1 7777777  1   1 3333 22  1   3333  7777 1  333  1 3 1  3   3 333    333333333 3 1  1   4  22     3 66  4444444 22  3333 1   3     1   44444        
lowQualScore                  :        .  .   . .  ... .   .    ..  ...... .  . .  .    .    . ....  . .  ...  ...... ...  .     .....  . . .       ..  . ... .  . .    .  .    . . ....    .   .   . ..   . . ... . . .  .. . ..   . . .    .   .. .  .    .. .   ..   .. . ... .. .. . ..   ..... .    ..   ...    . . ..  .  .    .. ...... .......    .  ..  .  ....    .   .      .   . ...   . .      .   .  .......  ...    ..  .. .   . . .. ..     .  . . .   . .. . ... . .... .. .  . .  . .......  .   . .... ..  .   ....  .... .  ...  . . .  .   . ...    ......... . .  .   .  ..     . ..  ....... ..  .... .   .     .   .....        
lowQualScore                  :        1  1   2 0  555 0   0    88  111111 0  0 0  8    5    5 8888  1 5  222  333333 777  5     66666  5 5 5       00  9 555 5  5 8    9  9    8 8 9999    8   9   9 22   6 9 333 9 9 8  22 9 66   9 9 9    9   66 9  6    66 9   22   66 9 000 66 33 9 66   33333 9    55   666    9 9 66  9  1    99 000000 9999999    9  88  0  2222    0   0      0   0 555   0 0      0   0  6666666  888    66  44 9   9 9 88 55     8  8 6 8   8 55 6 000 8 8888 55 6  8 6  8 7777777  8   7 7777 44  7   7777  4444 7  000  7 5 7  5   5 000    333333333 5 7  7   6  33     3 22  2222222 33  5555 7   3     8   55555        
consensus                     : CAGGGTT-CG-ACA-C-TC---G-TCA-GAAT--TT---T--G-AC-T-CG-CCAT-TCGG-G----CA-A-CC-G-AA--A---T---AC-TGATC-----TT-A-G-GTTGCCC--GA-A---C-GG-A-TTTC-AG-GTTG-C-C----CAAA-CAA-AAA-T--ATG-A-A---A-C-A-AAN-A-G--AAC-T-T-CAAA-TGT--A-TTATTTC--T-AAA--TCT--A-T---T--G--C-A--CTT--C--T-TTTT--CAG---TTTC-A-A--AT-AGGAAAT-GT------A-------TTTT-AA--TT-CT----TTTC-ACA-TTATTT-CCA-T---TTG-T-ATTCTT-ATT-TC-----A-AA-T-AAAT--AG--A-AAT-T-A--T--TCTGA-CA-A-T-CCA-A--A-C---T-C--G-T--C-AC-C-AG-G-------TC-GTC-A----T--TT-GGG----CG----A-GC---TG-T-G-TT-AAC-A---AACA--G------G-T-CG-TCAAAA--TTCAC-A--TC----A--G--GG----T-GGA-AATGG-CGA-----GGTGACGA
Reference ( gi|66136 )        : CAGGGTT-CG-ACA-C-TC---G-TCA-GAAT--TT---T--G-AC-T-CG-CCAT-TCGG-G----CA-A-CC-G-AA--A---T---AC-TGATC-----TT-A-G-GTTGCCC--GA-A---C-GG-A-TTTC-AG-GTTG-C-C----CAAA-CAA-AAA-T--ATG-A-A---A-C-A-AAC-A-G--AAC-T-T-CAAA-TGT--A-TTATTTC--T-AAA--TCT--A-T---T--G--C-A--CTT--C--T-TTTT--CAG---TTTC-A-A--AT-AGAAAAT-GT------A-------TTTT-AA--TT-CT----TTTC-ACA-TTATTT-CCA-T---TTG-T-ATTCTT-ATT-TC-----T-AA-C-AAAT--AG--A-AAT-T-A--T--TCTGA-CA-A-T-CCA-A--A-C---T-C--A-T--C-AC-C-AG-G-------TC-GTC-A----T--TT-GGG----CG----A-GC---TG-T-G-TT-AAC-A---AACA--C------G-T-CG-TCAGAA--TTCAC-A--TC----T--G--GG----T-GGA-AATGG-CGA-----GGTGACGA
gi|66137                      : CAGGGTT-CG-ACC-C-TC---G-TCA-GAAT--TT---T--G-AC-T-CG-CTAT-TTGG-G----CA-A-CC-G-AA--A---T---AC-TGATC-----TT-A-G-GTTGACC--GA-A---C-GG-A-TTTC-AG-GTTG-C-C----CAAA-CAA-AAA-T--ATG-A-A---A-C-A-AAC-A-G--AAC-T-T-CAAA-TGT--A-TTATTTC--T-AAA--TCT--A-T---T--G--C-A--CTT--C--T-TTTT--CAG---TTTC-A-A--AT-AG-AAGT-GTTATTTAA-------TTTT-AA--TT-CT----TTTC-ACA-TTATTT-CCA-T---TTG-T-ATTCTT-ATT-TC-----A-AA-T-AAAT--AG--A-AAT-T-A--T--TCTGA-CA-A-T-CCA-A--A-C---T-G--G-T--C-AC-C-AG-G-------TC-GTC-A----T--CT-GGG----CG----A-GC---TG-T---TT-AAC-A---AACA--G------G-T-CA-TCAAAA--TTCAC-A--TC----A--G--GG----TGGGA-AATGG-CGAAGAGCGGTGACGA
gi|66138                      : CAGGGTT-CG-AC--C-TC---G-TCA-GAAT--TC---T--G-AC-T-CG-CTAT-TCGG-G----CA-A-CC-G-AA--A---T---AC-TGATC-----TT-A-G-GTTG-CC--GA-A---C-GG-A-TTTT-AG-GTTGCC-C----CAAA-CCA-AAA-T--ATG-A-A---A-C-A-AAC-A-G--AAC-T-T-CAAA-TG---A-TTATTTC--T-AAA--TCT--A-T---T--G--C-A--CTT--C--T-TTTT--CAG---TTTCAA-A--AT-AGGAAAT-GT------A-------TTTT-AA--TT-CT----TTTC-ACA-GTATTT-CCA-----TTG-T-ATTCTT-ATT-TC-----A-AA-T-AAAT--AG--A-AAT-T-A--T--TCTGA-CA-A-T-CCA-A--A-C---T-C--GTT--C-AC-C-A--G-------TC-GTC-A----T--TT-GGG----CG----A-GC---TG-T-G-TT--AC-A---AACA--G------G-T-CG-TCAAAA--TTCAC-A--TC----A--G--GG----T-GGA-AATGG-CGA-----GGTGACGA
gi|66139                      : CAGGGTT-CG-ACA-C-TCC--G-TCA-GA-T--TT---T--C-GC-T-CG-CT-T-TCGG-G----CA---CC-A-AA--A---T---AC-TGATC-----TT-A-G-GTTGCCC--GA-A---C-GG-A-TTTC-AG-GTTG-C-C----CAAA-CAA-AAAAT--GTG-A-A---A-C-A-AAC-AAG--AAC-T-T-CAAA-TGTGTA-TTATTTC--T-AAAAATCT--AAT---T--GT-C-A--CTT--C--T-TTTT--CAG---TTTC-A-A--AT-AGGAAAC-GT------A-------TTTT-AA--TT-CT----TTTC-ACA-TTATTT-CCA-T---TTG-T-ATTCTT-ATT-TC-----CAAA-T-AAAT--AG--A-AAT-T-A--T--TCTGA-CA-A-T-CCA-A--A-C---T-C--G-TCAC-AC-C-AG-T-------TC-GTCAA----T--TT-GGG----CG----A-GC---TG-TGG-TTAAAC-A---AACA--C------G-T-CG-TCAAAA--TTCAC-A--TC----A--G--GG----T-GAAGAATGG-CGA-----GGTGACGA
gi|66140                      : CAGGGTT-CG-ACA-C-TC---G-TCA-GAAT--TT---T--G-AC-T-CG-CCAT-TCGG-G----CA-A-CC-G-AA--A---T---AC-TGATC-----TT-A-G-GTTGCCC--GA-A---C-GG-A-TTTC-AG-GT-------------A-GAA-AAA-T--ATG-A-A---A-C-A-ACC-A-G--ATC-T-T-CAAA-TGT--A-TTTTTTT--T-AAA--TCT--A-T---T--G--C-T--CTT--C--T-TTTT--CAG---TTTC-A-A--AT-AGGAAAT-CT------A-------TTT--------------------ACA-TTATTT-CCA-T---TTG-T-ATTCTT-ATT-TC-----A-AA-T-AAAT--AG--A-AAT-T-A--T--TCTGA-CA-A-T-CCT-A--A-C---T-C--G-T--C-AC-C-AG-G-------TC-ATC-A----T--TT-GGG----CG----A-GC---TG-T-G-TT-AAC-A---AACA--G------G-T-CG-TCAAAA--TTTCG-A--TC----A--G--GG----T-GGA-AATGG-CGA-----GGTGACGA
gi|66141                      : CAGGGTT-CG-ACA-C-TT---G-TCA-GAAT--TT---G--G-AC-T-CG-CCAT-TCGG-G----CA-A-CC-T-AA--G---T---AC-TGATC-----TC-A-G-GTTGCCC--GA-A---C-GA-A-TTTC-AG-GTTG-C-T----CAAACCAA-AAA-T--ATG-C-A---A-C-G-AAA-A-G--AAC-T-T-CAAA-CAT--A-TTATTTC--T-AAA--TCT--A-A---T--G--C-A--TTT--A--T-TTTT--CAG---TTTC-A-A--AT-AGGAAAT-GT------A-------TCTT-AA--TT-CT----TTTC-ACG-TTTATT-C---T---TTGAT-ATTCTT-ATT-TC-----A-AA-T-TAAT--AG--A-AAA-T-A--T--TTTGA-CA-A-T-CCA-A--A-C---T-C--G-T--C-AT-CAAG-G-------TT-GTC-A----T--TT-GGG----CG----A-GC---TA-T-G-TT-AAC-A---AACA--G------G-T-CG-TCAGAA--ATCAC-A--TC----A--G--GG----T-GGA-AATGG--GA-----GGTGACGA
gi|66142                      : CAGGGTT-CG-ACA-C-TC---G-TCA-GAAT--TT---G--G-AC-T-CG-CCAT-TCGG-G----CA-A-CC-T-AA--G---T---AC-TGA-------------------------------------TTTC-AG-GTTG-C-C----CAAA-CAA-AAA-T--ATG-A-A---A-T-G-AAA-A-G--CAC-T-T-CAAA-TAT--A-TTATTTT--T-AAA--TCT--A-TAG-T--G--C-A--TTT--A--T-TTTT--CAG---TTTC-A-A--AT-AAGAAAT-GT------A-------TTTT-AA--TT-CT----TTTC-ACA-TTATTT-TCA-T---TTG-T-ATTCTT-ATT-TC-----A-AA-T-AGAT--AA--A-AAT-T-A--T--TCCGA-CA-A-C-CCA-A--A-C---T-C--G-T--C-AC-CTGG-G-------TT-GTC-A----T--TT-GGG----TG----A-GC---TA-T-G-TT-AAC-AGCTAATA--G------G-T-CA-TCAAAA--TTCAC-A--TC----A--G--GG----T-GAA-AATGG-CGA-----GGTGACGA
gi|66143                      : CAGGGTTTCG-ACA-C-TC---G-TCA-GACA--TT---T--G-AC-T-CGGCCAT-TTTG-G----CA-A-CC-G-AA--A---T---AC-TGATC-----TT-A-G-GTT-CCC--AA-A---C-A--A-TTTC-AG-GTTG-C-C----CAAA-CAA-AAA-T--ATG-A-A---A-A-A-AAA-A-G--AAC-T-T-CAAA-TGT--A-TTTTCTC--T-AAA--TCT--A-----T--G--CGA--TTT--C--T-TTTT--CAGT--TTTC-A-A--ATCACGAAAT-GT------A-------TTTT-AA--TT-CT----TTTC-A-A-TTATTT-CAA-TTGATTG-A-TTTCTT-ATT-TC-----A-AATT-AAAT--AG--A-CATAT-ATTT--TTTGA-CAGA-TCCCA-A--A-C---T-C--G-T--CAAC-C-TG-G-------TT-GTA-A----T--TT-GGG----CG----A-GC---TA-T-T-TTGAGC-A---AACA--G------G-T-CGTTCAAAA--TTCAC-A--TC----A--G--GG----T-GGG-AATGG-CGA-----GGTGACGA
gi|66144                      : CAGGGTT-CG-ACA-C-TCT--G-TCA-GAAT--TT---T--G--C-T-TG-CCAT-TCGG-G----CA-A-CC-ATAA--A---T---AC-TGATC-----TT-A-G-GTTGCCC--GA-A---C-GG-A-TTTC-AG-GTTG-CGC----CAAA-CAA-AAT-T--GTGAA-A---A-C-A-AAC-A-GATAAC-T-T-CAAA-TGT--A-TTTTTTC--T--AA--TCT--A-----T--G--C-A--CTT--C--T-TTTT--CAG---TTTC-A-A--AT-AGGAAA-------------------TCT-AA------------TTT-ACA-TTTATT-CCA-----TTG-T-ATTCTT-ATT-TC-------AA-T-GAAT--AG--A-AAT-T-A-----TCT-A-CA-A-T-CCT-A--A-CT--T-C--G-T--C-AC-C-AG-G-------TC-ATC-A----T--TT--GG----CG----A-TC---TG---G-GT-AAC-A---AACA--G------G-T-CG-TCAAAA--TTTCC-A--TCA---A--G--GG----T-GGATCATGG-CGA------CTGACGA
gi|66146                      : CAGGGTT-CG-A-A-C-TCCCCG-TC--GAAT--TT---TTGG-ACGT-CG-CCAT-TCAG-G----CA-A-CC-A-AA--A---T---A--TGATC-----TT-A-ATGTTGCCC--GAGA---C-GG-AATTTC-AGAGTTG-C-C----CAAA-CAA-AAA-T--GTG-A-A---A-C-A-----------------------TGT--AATTATT-C--T-AA---TCT--A-T---T--GG-C-AAACTT--C--T-TTTTT-CAG---TTTC-ATA--AT-AGGAT-T-GT------A-------TTTT-AA--TT-CT----TTTC-ACA-TTATTTTCCA-T---TTG-T-ATTCTT-ATT-TC-----A-AA-A-TAAT--AG--A-AAT-T-A--TAATCTGA-C----T-CCA-A--A-C---T-C--G-T--CAAC-C-AG-G-------TC-GTC-A----TTCTT-GG------G----A-GC---TG-T-GTTT-AACAA---AACA---------G-T-CG-TCAAAA--TTCACAA--TC----------AA----T-CGA-AATG
gi|66147                      : CAGGGTT-CGCAAA-C-TC---GGTCA-GAAT--TG------G-AC-TTCG-CCAT-TCGG-G----CCCA-CC-G-AA--G---T---A-----------------G-GTTGCCC--GA-A---C-GG-A-TTTC-AG-GT-G-C-C-----AAA-CAA-AAA------------------------A-G--AAC-T-T-CAAA-TGT--A-TTATTTC--T-AAA--TCT--A-T---T-----C-A--TTG--C--A-TT------G----TTC-A-A--AT-AG--GAT--T------A-------TTTT-AA--TT-CT----TTTC-AAA-TTATTT-TTA-T---TTG-T-A-TCTT-ATTCTT-----C-AA-T-AATT--AGA-A-AAT-T-AT-T--TCGGA-CA-AGT-CGA-AGGA-CTAGT-C--A----C-AC-C-AGCGT------TT-GTC------T--TT-GGG----CG----ATTC---TA-T-G-TT-AAC-A---TACA--G------G-T-CG-TCAAAA--TTCAG-A--TC----A--G--TG----T-GGA-AATGG-CGA-----GGTGACGA
gi|66148                      : CAGGGTT-CC-ACA-C-TC---A-TCA-GAAT--TC---G--G-AC-T-CA-CCAT-TCGG-G----CG-A-CC-A-AA--G---T---AC-TGATC-----TC-A-G-GTTTCCC--GA-A---C-AG-A-TTTC-AG-GTTA-C-C----CAAA-CAA-AAA-T--ATG-A-A---A-C-A-AAA-A-G--AAC-T-T-CAAA-TGT--A-TTATTTC--T-AAA--TCT--A-TAAAT--G--C-A--TTT--C--T-TTTT--CAG---TTTC-A-A--AT-AGGAAAT-GT------A-------TTTT-
gi|66149                      : CAGGGTT-CG-ACA-C-TT---G-TCA-GAAT--TC---G--G-AC-T-CG-CCAT-TCGG-G----CA-A-CC-G-AA--G---T---AC-TGATC-----CC-A-G-G-TGCCC--AA-A---C-
gi|66150                      : CAGGGTT-CG-ACA-C-TT---G-TCA-GAAT--TC---G--G-AC-T-CG-CCAT-TCGG-G----CA-A-CC-G-AA--G---T---AC-TGATC------C-A-G---TGCCC--AA-A---
gi|66145                      : CAGG--T-CG-ACA-C-TC---G-TCA-GAA---TT---T--G-AC-T-CG-CCATATCGG-G----CA-A-CC-A-AA--A---T---
gi|66151                      :  AGGGTT-CG-ACATC-TC---G--CA-GAATAATT---G--G-AC-T-CG-CCAT-TCGT-G----CA-ATCC-T-AA--G---T---AC--GATC-----T--A-G-GT-GCC---AA-A---C-GG-A-TTTCGAG-GTT--T-C----CAAA-CAACAAA-T--ATG-A-A---AAC-A-AACGA-G--AACAT-G-CAAAATGT--A-TTATT-CAGT-AAAGTTCTTAA-T---TTTG--C-A--CTTTCC--TATTTT--CAG---TTTC-A-A--AA-GGAAAGT-GTG-----A-------TT---GA--TT-CT----TTTCGAC--TTATTT-CCA-T---TTG-T-ATTTCT-ATT-TC-----A-AA-CTAAAT--AGA-A-AAG-T-A--T--ATCAA-CA-A-T-CCA-A--A-C---A-C----T--C-AC-T-CG-G-------TC-GTC-AACCCA--TT-GGG----CG----A-GC---GG-T-G-CT----------ATA--C------G-T-CA--AAAAA--TTCAC-T--TC----A--G--GG----T-GGA-AATGA-CGA-----GGTGACGA
gi|66152                      :   GGGTT-CG-ACA-C-TC---G-TCA-GAAT--TT---TT-G-AC-T-CG-CCAT-TCGG-G----CA-A-CC-C-AA--AAATT---ACTTGAAC-----TT-A-G-GTTGCCC--GA-AAC-C-GG-A-TTTC-AG-GTTG-C-CATTTCGAA-TCA-AAA-C--GTG-
gi|66154                      :    GGTT-GA-ACA-TGTC---G-ATACGAAT--TT---G--G-AC-T-CG-CCAT-TGGG-GG---CA-A-CC-T-AA--G---T---TC-TGATC-----TC-A-G-AGTGCCC--TA-A---CCAG-A-ATTC--G-GTTG-C-C----TCAA-CAA-AA--T--ATGTA-A---A-C-G-AAA-A-G--GAA-T-T-CAAA-T-T--A-TTATTTC------A--TGA--A-T---T--G--C-T--ATT--T--T-TTTT--CAG---TT-C-A-AGAAT-AAGAAAT-GT------A-------TTTT-AAGATT-CT----TT-C-ACG-TTGTTT-CAT-T---TTG-T-ATTTTA-ATT-TC-------AA-T-AAAT--AGTAA-AAG-T-ACGT--ACTGA-AA-A-T-CCA-A--A-G---T-C--G-T--C-ACGC-GG-G-------TT-GT--A----T--AT-GG-----CG------GC---TAAT-G-TT-AAC-A---AACA--G------G-TTCG-CCAAAA--T-CACGA--TC----A--G--TG------GGG-AATGG-CGA-----GGTGACGA
gi|66153                      :    GGTT-CG-ACA-C-TC---G-TCA-GA-T--TT---T--G-AC-T-CG-CCAT-TCGGCG----C--A-CC-A-CA--A---A---AC-TGATC-----TT-A-G-GTTGCCTCGGA-A---C-GG-A-TTT--AG-GTTG-C-T----C----CAC-AAA-T--ATG-A-AAAGA-CAA-AAC-A-G--AAC-TAT-C-AA-TGT--A-TT-TTTC--T-AAT--CCT--A-T---T--G--C-A--CTT--A--T-TTTTTCCAT---TTTC-A-A--AT-AGGAAAT--T------A-------TCT
gi|66155                      :     GTT-CG-ACATC-TCC--G-TCA-GAAA--AC---T--G-AC-T-CG-CCAT-TCGG-G----CACA-CC-A-GATGA---T---A--TGATCAATC-TT---G-GTTGCC---GA-A---C-AG-AATTTC-AG-GTTG-C-C------AA-CAA-AAA-T--ATG-AGA---A-C-A-AAA-A-G--AAC-T-T-CAA--TGT--A-TTAAT-C--T-AAA--TCT--A-T---T--GGGC-A--ATT--CATT-TTTT--CAG---TTTC-A-A--AT-AGAAA-T-GT------A-------TTTTTAA--TC-TTACAGTTTC-AC--TTATTT-C-A-T---TTG-TCATTCTT-ATT-TCAAAGAT-AA---AAAT--AG--ATAAT-TTA--T--TCTGAGCA-AAT-CGA-T--A-C---TACGAA-T--C-AT-C-AG-G-------CCTGTG-A----T--TTTGGG----CG----A-GC---TA-G-G-TT-AAC-A---AACA--G------G-T-CG-TCAAAAATTTCAC-A--TC----A--G--GG----T-GGA-AATGG-CGA-----AGTGACGA
gi|66156                      :                 -TT---G-TCA-GAAT--TTGCAT--GGAC-T-TG-CCAT-TCGG-GAAACCA-A-TC-G-AA--G---T---AC-T----------T-A-C-AT-----------------G-A-TCTC-AG-GTTG-C-C----CAAA-TGA-AAA-T--ATG-A-A---A-C-A-AAA-A-G--AAC-T-T-CAAA-TGT--A-CTATTTC--T-AAA--TCT--A-T---T--G--C-A--TTT--C----TTTT--CAG---TTTC-A-A--AT-AGGAAAT-GT------A-------TTTT-AA--TT-C-----TTTC-AAG-TTACTT-TCA-T---TTG-T-ATTCTT-ATT-TC-----A-AA-T-AAAT--AG--A-AAT-T-A--T--TCTGA-CA-A-A-CCA-A--A-C---T-C--G-T--C-AC-C-AG-GAGTTAAATT-GTT-A----C--TT-TGGCGCTCG----A-GCTTATG-CAG-TT-AAC-A---AACAGGCCG----G-T-CG-TCAAAA--ATCAC-A--TC----A--G--GGTGCAT-GGA-AATGA-CGA-----GGTGACGA
gi|66140                      :                                                    -CCGT-TCGG-G----CA-A-CC-T-AA--------------GATCAGTATTT-C-G-GTTGCCC--GA-A---T-GG-
gi|66144                      :                    cagggttcgacactcgtcagaattttgactcg-CCGT-TCGG-G----CA-A-CC-T-AA--------------GATCAGTATTT-ATG-GTTGCCC--GA-A---T-GG-atttcaggtagaaaaatatgaaacaaccagatcttcaaatgtattttttttaaatctattgctcttctttttcagtttcaaataggaaatctatttacattatttccatttgtattcttatttcaaataaatagaaattattctgacaatcctaactcgtcaccaggtcatcatttgggcgagctgtgttaacaaacaggtcgtcaaaatttcgatcagggtggaaatggcgaggtgacga
gi|66141                      :                      cagggttcgacactctgtcagaattttgcttgCGT-TCGG-G----CA-A-CCTG-AG--A---T----C-AGTAC-----TT-A-G-GTTGCCC--GA-A---T-GG-atttcaggttgcgccaaacaaaattgtgaaaacaaacagataacttcaaatgtattttttctaatctatgcacttctttttcagtttcaaataggaaatctaatttacatttattccattgtattcttatttcaatgaatagaaattatctacaatcctaacttcgtcaccaggtcatcatttggcgatctgggtaacaaacaggtcgtcaaaatttccatcaagggtggatcatggcgactgacga
gi|66137                      :                        cagggttcgacacttgtcagaatttggactcgT-TTGG-G----CA-A-CCTG-AA--A---T----C-CG--------TT-C-G-GTCAACC--TA-AGATC-AGTA-TTTC--G-GTTG-C-C----CAAA-TAaatttcaggttgctcaaaccaaaaatatgcaacgaaaagaacttcaaacatattatttctaaatctaatgcatttatttttcagtttcaaataggaaatgtatcttaattcttttcacgtttattctttgatattcttatttcaaattaatagaaaatattttgacaatccaaactcgtcatcaaggttgtcatttgggcgagctatgttaacaaacaggtcgtcagaaatcacatcagggtggaaatgggaggtgacga
gi|66142                      :                       cagggttcgaccctcgtcagaattttgactcgcT-TTGG-G----CA-A-CCTG-AA--A---T----C-AGTAC-----TT-A-G-GTTGCCC--GA-A---T-GG-caaaaatatgaaacaaacagaacttcaaatgtattatttctaaatctattgcacttctttttcagtttcaaatagaagtgttatttaattttaattcttttcacattatttccatttgtattcttatttcaaataaatagaaattattctgacaatccaaactggtcaccaggtcgtcatctgggcgagctgtttaacaaacaggtcatcaaaattcacatcagggtgggaaatggcgaagagcggtgacga
gi|66152                      :                        cagggttcgacactcgtcagaatttggactcgT-TCGG-G----CA-A-CC-T-AA--G---TTCAAG-TAATT-----TTTG-G-GTTGCCC--GA-A---T-GG-caaaaatatgaaatgaaaagcacttcaaatatattatttttaaatctatagtgcatttatttttcagtttcaaataagaaatgtattttaattcttttcacattattttcatttgtattcttatttcaaatagataaaaattattccgacaacccaaactcgtcacctgggttgtcatttgggtgagctatgttaacagctaataggtcatcaaaattcacatcagggtgaaaatggcgaggtgacga
gi|66157                      :                                                            gggttcgacactcgtcagaatttttgactcgC-TGATC-----TT-A-G-GTTGCCC--GA-A---T-GT-A-TTTC-AG-GTTG-C-C----CAAA-CAA-AAA-T--ATG-A-A---A-C-A-AAC-A-G--AAC-T-T-CAAA-TGT--A-TT-TTTC--TAAAA--TCT--A-T---T--GC-C-A--CTT--C--T-TTTT--CAG---TTTC-A-A--AT-AGAAA---------------------TT-A----T-CT----ATT--ACA-TTA-TT-CCA-T---TTG-T-ATTCTT-ATT-TC-----A-AA-T-AAAT--AG--A-AAT-T-A--T--TCTGA-CA-A-T-CCCTA--A-C---T-C--G-T--C-AC-C-AG-G-------TC-ATC-A----T--TT-GGG----CG----A-GC---TC-T-G-TT-AAC-A---AACA---------G-T-CA-TCAAAA--TTC-C-A--TC-------A--GG----T-GGA-AATGGTTGA-----GGTGACGAaccggatttcaggttgccatttcgaatcaaaacgtg
gi|66158                      :                                                                                            -TGTTC-----TC-A-G-G--GTTC--GACA---C-GA-A-TTTC-AG-GTTG-C-C----CAAA-CAA-AAA-TTTATG-A-A---A-A-AGAAA-A-C--AAC-T-T-CAAA-TAT--A-TTATTTC--T-AAA--TCT--A-T---T--G--C-A--TTT-------TTTT--CAGGTTTTTC-A-A--AT-AGGAAATTGT------A-------TTTT-AA--TT-CT----TTTC-ACG-T-ATTT-TCA-T---TTG-T-TTCCTT-ATT-TT-----C-AA-T-TAAT--AG--A-AAT-T-A--T--TCTGA-CA-A-T-CCA-A--AGC---T-C--G-T--C-AC-C-AG-G-------CT-GTC-A----T--TT-GGC----CAAAGTA-GC---TA-T-T-GT-AAC-A---AACA--G------GTT-CG-T-AAAA--GTCAC-AATTC----A--G--GG----T-GG--TATGG-CGA-----GGTGACAA
gi|66159                      :                                                                                                                    C--AA-A---C-GA-A-TT-C-AG-GT-G-C-C----CAAA-CAA-AAA-TTTATG-A-A---A-A-AGAAA-A-C--AAC-T-T-CAAA-TAT--A-TTATTTC--T-AAA--TCT--A-T---T--G--C-A--TTT-------TTTT--CAGGTTTTTC-A-A--AT-AGGAAATTGT------A-------TTTT-AA--TT-CT----TTTC-ACG-T-ATTT-TCA-T---TTG-T-TTCCTT-ATT-TT-----C-AA-T-TAAT--AG--A-AAT-T-A--T--TCTGA-CA-A-T-CCA-A--AGC---T-C--G-T--C-AC-C-AG-G-------CT-GTC-A----T--TT-GGC----CAAAGTA-GC---TA-T-T-GT-AAC-A---AACA--G------GTT-CG-T-AAAA--GTCAC-AATTC----A--G--GG----T-GG--TATGG-CGA-----GGTGACAA
gi|66160                      :                                                                                                                                               TG-C-C----CAA--CAA-AAA-T--ATG-A-A---A-C-A-AAC-A-G--AAC-T-T-CAAA-TGT--A-TTTTTTC--T-AAA--TCT--A-T---T--G--C-A--CTT--C--T-TTTT--CAG---TTTC-A-A--AT-AGGAAAT--T------A-----------------T-CT----ATTT-ACA-TTATTT-CCATT---TTG-T-ATTCTTAATT-TC-----A-AA-T-AAAT--AG--A-AAT-T-A--T--TCTGA-CA-A-T-CCT-A--A-C---T-C--G-T--C-AC-C-AG-G-------TC-ATC-A----T--TT-GGG----CG----A-GC---TG-T-G-TT-AACAA---AACA--G------G-T-CG-TCAAAA--TTTCC-AT-TC----A--G--GG----T-GGA-A
gi|66161                      :                                                                                                                                                                            -A-A---A-C-A-AAA-T-G--AAC-T-TTCAAA-TGT--A-TTATTTC--T-AAA--TCA--T-T---T--G--C-A--TTT--C--T-TTTT--CAG---TTTG-A-A--AT-AGGAAAT-GT------ACATTGTATTTT-AA--TT-CT----TTTC-GCAATTATTT-TTA-T---ATG-T-ATTCTT-ATT-TT-----T-AA-A-AAAAGAAG--A-AAT-T-A--T--TCTGA-CA-A-T-CGA-T--A-C---T-C--G-T--C-AC-C-AG-G-------TC-GTC-A----T--TT-GGA----CG----A-TC---TA-T-G-TT-AAC-A---TACA--TGTACAGG-T-TG-TCAAA----TCAG-A--TC----A--G--GG----T-GGA-AATGG-CGA-----GGTGACGA
gi|66162                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     T-GG------A-------TTTT-GA--TTTCT----TTTC-ACA-TTATTT-TCA-T---TT------TCAA-ATT-TT--------A-T-ATAT--GG--A-TTT-T-A------CTGA-TA-A-T-TCA-A--A-C---T-C--A-------C-T-GG-G-------TT-GCC-A----T--TT-A-------------------CG-T---TT-AAC-G---AACA--G------G-T-CG-TCAAAA--ATCA-----TT----T--GAAGG----T-GGA-AATGA-CGA-----
gi|66163                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -AA-C-AAAT--AG--A-AAT-T-A--T--TCTGA-CA-A-A-TCA-A--A-C---T-C--G-T--C-AC-C-AG-G-------TC-ATT-A----T--TT-GGG----TG----A-TC---TA-G-G-TT-AAC-A---AACA--G------G-T-CA-TCAAAA--TTCAC-A--TCAGGATCAG--GG----T-GGA-AATGA-TGA-----GGTGACAA
gi|66164                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   --T--TCTTA-CA-A-T-CCA-A--A-C---T-T--G-T--C-AC-C-AG-G-------TC-----A----T--TT-GAG----CA----A-GC---TA-T-G-TT-AAC-A---AACA--G------G-T-CG-TCAAAT--TTCAC-A--TC----A--G--GG----T-GGA-AATGG-CGA-----
gi|66165                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TT-A----T--TT-GGG----TG----A-AC---TA-G-G-TT-TAC-A---AACA--A------G-T-CA-TCAGAA--ATCAT-T--TC----G--G--GA----T-GGA-AAAGA-CGA-----AGTG
gi|66166                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AA--TTCAC-A--TC----A--G--GG----T-GGA-AATGG-CGA-----GGTGA

lowQualScore                  :        2  2   4 1  999 1   1    22  999999 1  1 1  1    1    1 6666  3 1  33  333333   1     3333    1       22  3 22 1   3    1  1    1 1 3333     1  1   1 55   3 1 333 1 1 3  44 1 22   1 1 1    1   22 1  0    22 1   55   22 1 555 22 88 1 22   33333 1   1 22   888    1 1 22  1      5 0 666666 5555555    1  22  1  4444    1   1   1      1 333   1 1      1  22  1 22   66    22   44 1  1 1 1 66 22     1  1 3 1   1 22 3 1 1  44 44 3  1 3  1 7777777  1   1  5555  1   3333  7777 1  222  1 3 1  3   3 444 44444   3333  3 1  1      44     777777777  1    3333 1   3     1   44444        
lowQualScore                  :        .  .   . .  ... .   .    ..  ...... .  . .  .    .    . ....  . .  ..  ......   .     ....    .       ..  . .. .   .    .  .    . . ....     .  .   . ..   . . ... . . .  .. . ..   . . .    .   .. .  .    .. .   ..   .. . ... .. .. . ..   ..... .   . ..   ...    . . ..  .      . . ...... .......    .  ..  .  ....    .   .   .      . ...   . .      .  ..  . ..   ..    ..   .. .  . . . .. ..     .  . . .   . .. . . .  .. .. .  . .  . .......  .   .  ....  .   ....  .... .  ...  . . .  .   . ... .....   ....  . .  .      ..     .........  .    .... .   .     .   .....        
lowQualScore                  :        0  0   0 9  000 9   9    66  222222 9  9 9  9    9    9 0000  8 9  22  444444   8     9999    8       44  5 44 8   8    9  9    8 8 9999     8  8   8 00   5 8 222 8 8 6  11 8 55   8 8 8    8   55 8  2    55 8   00   55 8 777 55 00 8 55   77777 8   8 55   222    8 8 55  8      2 9 777777 7777777    8  66  9  0000    9   9   9      9 333   9 9      9  66  9 66   11    55   33 8  8 8 8 55 44     7  7 5 7   7 44 5 7 7  11 88 5  7 5  7 4444444  7   7  8888  7   5555  1111 7  999  7 3 7  3   3 666 22222   5555  3 7  7      44     999999999  6    4444 6   2     7   33333        
consensus                     : CAGGGTT-CG-ACA-C-TC---G-TCA-GAAT--TT---T--G-AC-T-CG-CCAT-TCGG-G----CA-A-CCG-AA--G---TAC-TGATC----TTAG-GTTGCCC--GA-A--C-GGA-TTTC-AG-GTTG-C-C----CAAAC-AA-AAA-T--ATG-A-A---A-C-A-AAN-A-G--AAC-T-T-CAAA-TGT--A-TTATTTC--T-AAA--TCT--A-T---T--G--C-A--CTT--C--T-TTT-T--CAG---TTTC-A-A--AT-AGGAAA-TGT------A-------TTTT-AA--TT-CT----TTTC-ACA-TTA-TTTCCA-T---TTG-T-ATTCTT-AT--TT-C--AAA--TAAA--TAG--A-AA-T-T-A--T--TCTGA-CA-A-T-CCA-A--A-C-T-CG--T--C-AC-C-AG-G-------TC-GTC-AT----TT-GGG----CG----A-GC---TG-T-G-TT-AAC-A---A-----ACA----GG-T-CG-TCAAAA--TTCAC------A--TC-AGGG----T-GGA-AATGG-CGA-----GGTGACGA
Reference ( family-627 )      : CAGGGTT-CG-ACA-C-TC---G-TCA-GAAT--TT---T--G-AC-T-CG-CCAT-TCGG-G----CA-A-CCG-AA--A---TAC-TGATC----TTAG-GTTGCCC--GA-A--C-GGA-TTTC-AG-GTTG-C-C----CAAAC-AA-AAA-T--ATG-A-A---A-C-A-AAN-A-G--AAC-T-T-CAAA-TGT--A-TTATTTC--T-AAA--TCT--A-T---T--G--C-A--CTT--C--T-TTT-T--CAG---TTTC-A-A--AT-AGGAAA-TGT------A-------TTTT-AA--TT-CT----TTTC-ACA-TTA-TTTCCA-T---TTG-T-ATTCTT-AT--TT-C--AAA--TAAA--TAG--A-AA-T-T-A--T--TCTGA-CA-A-T-CCA-A--A-C-T-CG--T--C-AC-C-AG-G-------TC-GTC-AT----TT-GGG----CG----A-GC---TG-T-G-TT-AAC-A---A-----ACA----GG-T-CG-TCAAAA--TTCAC------A--TC-AGGG----T-GGA-AATGG-CGA-----GGTGACGA
gi|66136                      : CAGGGTT-CG-ACA-C-TC---G-TCA-GAAT--TT---T--G-AC-T-CG-CCAT-TCGG-G----CA-A-CCG-AA--A---TAC-TGATC----TTAG-GTTGCCC--GA-A--C-GGA-TTTC-AG-GTTG-C-C----CAAAC-AA-AAA-T--ATG-A-A---A-C-A-AAC-A-G--AAC-T-T-CAAA-TGT--A-TTATTTC--T-AAA--TCT--A-T---T--G--C-A--CTT--C--T-TTT-T--CAG---TTTC-A-A--AT-AGAAAA-TGT------A-------TTTT-AA--TT-CT----TTTC-ACA-TTA-TTTCCA-T---TTG-T-ATTCTT-AT--TT-C--TAA--CAAA--TAG--A-AA-T-T-A--T--TCTGA-CA-A-T-CCA-A--A-C-T-CA--T--C-AC-C-AG-G-------TC-GTC-AT----TT-GGG----CG----A-GC---TG-T-G-TT-AAC-A---A-----ACA----CG-T-CG-TCAGAA--TTCAC------A--TC-TGGG----T-GGA-AATGG-CGA-----GGTGACGA
gi|66137                      : CAGGGTT-CG-ACC-C-TC---G-TCA-GAAT--TT---T--G-AC-T-CG-CTAT-TTGG-G----CA-A-CCG-AA--A---TAC-TGATC----TTAG-GTTGACC--GA-A--C-GGA-TTTC-AG-GTTG-C-C----CAAAC-AA-AAA-T--ATG-A-A---A-C-A-AAC-A-G--AAC-T-T-CAAA-TGT--A-TTATTTC--T-AAA--TCT--A-T---T--G--C-A--CTT--C--T-TTT-T--CAG---TTTC-A-A--AT-A-GAAG-TGTTATTTAA-------TTTT-AA--TT-CT----TTTC-ACA-TTA-TTTCCA-T---TTG-T-ATTCTT-AT--TT-C--AAA--TAAA--TAG--A-AA-T-T-A--T--TCTGA-CA-A-T-CCA-A--A-C-T-GG--T--C-AC-C-AG-G-------TC-GTC-AT----CT-GGG----CG----A-GC---TG-T---TT-AAC-A---A-----ACA----GG-T-CA-TCAAAA--TTCAC------A--TC-AGGG----TGGGA-AATGG-CGAAGAGCGGTGACGA
gi|66138                      : CAGGGTT-CG-AC--C-TC---G-TCA-GAAT--TC---T--G-AC-T-CG-CTAT-TCGG-G----CA-A-CCG-AA--A---TAC-TGATC----TTAG-GTTG-CC--GA-A--C-GGA-TTTT-AG-GTTGCC-C----CAAAC-CA-AAA-T--ATG-A-A---A-C-A-AAC-A-G--AAC-T-T-CAAA-TG---A-TTATTTC--T-AAA--TCT--A-T---T--G--C-A--CTT--C--T-TTT-T--CAG---TTTCAA-A--AT-AGGAAA-TGT------A-------TTTT-AA--TT-CT----TTTC-ACA-GTA-TTTCCA-----TTG-T-ATTCTT-AT--TT-C--AAA--TAAA--TAG--A-AA-T-T-A--T--TCTGA-CA-A-T-CCA-A--A-C-T-CGT-T--C-AC-C-A--G-------TC-GTC-AT----TT-GGG----CG----A-GC---TG-T-G-TT--AC-A---A-----ACA----GG-T-CG-TCAAAA--TTCAC------A--TC-AGGG----T-GGA-AATGG-CGA-----GGTGACGA
gi|66139                      : CAGGGTT-CG-ACA-C-TCC--G-TCA-GA-T--TT---T--C-GC-T-CG-CT-T-TCGG-G----CA---CCA-AA--A---TAC-TGATC----TTAG-GTTGCCC--GA-A--C-GGA-TTTC-AG-GTTG-C-C----CAAAC-AA-AAAAT--GTG-A-A---A-C-A-AAC-AAG--AAC-T-T-CAAA-TGTGTA-TTATTTC--T-AAAAATCT--AAT---T--GT-C-A--CTT--C--T-TTT-T--CAG---TTTC-A-A--AT-AGGAAA-CGT------A-------TTTT-AA--TT-CT----TTTC-ACA-TTA-TTTCCA-T---TTG-T-ATTCTT-AT--TTCC--AAA--TAAA--TAG--A-AA-T-T-A--T--TCTGA-CA-A-T-CCA-A--A-C-T-CG--TCAC-AC-C-AG-T-------TC-GTCAAT----TT-GGG----CG----A-GC---TG-TGG-TTAAAC-A---A-----ACA----CG-T-CG-TCAAAA--TTCAC------A--TC-AGGG----T-GAAGAATGG-CGA-----GGTGACGA
gi|66140                      : CAGGGTT-CG-ACA-C-TC---G-TCA-GAAT--TT---T--G-AC-T-CG-CCAT-TCGG-G----CA-A-CCG-AA--A---TAC-TGATC----TTAG-GTTGCCC--GA-A--C-GGA-TTTC-AG-GT-------------AG-AA-AAA-T--ATG-A-A---A-C-A-ACC-A-G--ATC-T-T-CAAA-TGT--A-TTTTTTT--T-AAA--TCT--A-T---T--G--C-T--CTT--C--T-TTT-T--CAG---TTTC-A-A--AT-AGGAAA-TCT------A-------TTT--------------------ACA-TTA-TTTCCA-T---TTG-T-ATTCTT-AT--TT-C--AAA--TAAA--TAG--A-AA-T-T-A--T--TCTGA-CA-A-T-CCT-A--A-C-T-CG--T--C-AC-C-AG-G-------TC-ATC-AT----TT-GGG----CG----A-GC---TG-T-G-TT-AAC-A---A-----ACA----GG-T-CG-TCAAAA--TTTCG------A--TC-AGGG----T-GGA-AATGG-CGA-----GGTGACGA
gi|66141                      : CAGGGTT-CG-ACA-C-TT---G-TCA-GAAT--TT---G--G-AC-T-CG-CCAT-TCGG-G----CA-A-CCT-AA--G---TAC-TGATC----TCAG-GTTGCCC--GA-A--C-GAA-TTTC-AG-GTTG-C-T----CAAACCAA-AAA-T--ATG-C-A---A-C-G-AAA-A-G--AAC-T-T-CAAA-CAT--A-TTATTTC--T-AAA--TCT--A-A---T--G--C-A--TTT--A--T-TTT-T--CAG---TTTC-A-A--AT-AGGAAA-TGT------A-------TCTT-AA--TT-CT----TTTC-ACG-TTT-ATTC---T---TTGAT-ATTCTT-AT--TT-C--AAA--TTAA--TAG--A-AA-A-T-A--T--TTTGA-CA-A-T-CCA-A--A-C-T-CG--T--C-AT-CAAG-G-------TT-GTC-AT----TT-GGG----CG----A-GC---TA-T-G-TT-AAC-A---A-----ACA----GG-T-CG-TCAGAA--ATCAC------A--TC-AGGG----T-GGA-AATGG--GA-----GGTGACGA
gi|66142                      : CAGGGTT-CG-ACA-C-TC---G-TCA-GAAT--TT---G--G-AC-T-CG-CCAT-TCGG-G----CA-A-CCT-AA--G---TAC-TGAT--------------------------------TTC-AG-GTTG-C-C----CAAAC-AA-AAA-T--ATG-A-A---A-T-G-AAA-A-G--CAC-T-T-CAAA-TAT--A-TTATTTT--T-AAA--TCT--A-TAG-T--G--C-A--TTT--A--T-TTT-T--CAG---TTTC-A-A--AT-AAGAAA-TGT------A-------TTTT-AA--TT-CT----TTTC-ACA-TTA-TTTTCA-T---TTG-T-ATTCTT-AT--TT-C--AAA--TAGA--TAA--A-AA-T-T-A--T--TCCGA-CA-A-C-CCA-A--A-C-T-CG--T--C-AC-CTGG-G-------TT-GTC-AT----TT-GGG----TG----A-GC---TA-T-G-TT-AAC-AGCTA-----ATA----GG-T-CA-TCAAAA--TTCAC------A--TC-AGGG----T-GAA-AATGG-CGA-----GGTGACGA
gi|66143                      : CAGGGTTTCG-ACA-C-TC---G-TCA-GACA--TT---T--G-AC-T-CGGCCAT-TTTG-G----CA-A-CCG-AA--A---TAC-TGATC----TTAG-GTT-CCC--AA-A--C-A-A-TTTC-AG-GTTG-C-C----CAAAC-AA-AAA-T--ATG-A-A---A-A-A-AAA-A-G--AAC-T-T-CAAA-TGT--A-TTTTCTC--T-AAA--TCT--A-----T--G--CGA--TTT--C--T-TTT-T--CAGT--TTTC-A-A--ATCACGAAA-TGT------A-------TTTT-AA--TT-CT----TTTC-A-A-TTA-TTTCAA-TTGATTG-A-TTTCTT-AT--TT-C--AAAT-TAAA--TAG--A-CA-TAT-ATTT--TTTGA-CAGA-TCCCA-A--A-C-T-CG--T--CAAC-C-TG-G-------TT-GTA-AT----TT-GGG----CG----A-GC---TA-T-T-TTGAGC-A---A-----ACA----GG-T-CGTTCAAAA--TTCAC------A--TC-AGGG----T-GGG-AATGG-CGA-----GGTGACGA
gi|66144                      : CAGGGTT-CG-ACA-C-TCT--G-TCA-GAAT--TT---T--G--C-T-TG-CCAT-TCGG-G----CA-A-CCATAA--A---TAC-TGATC----TTAG-GTTGCCC--GA-A--C-GGA-TTTC-AG-GTTG-CGC----CAAAC-AA-AAT-T--GTGAA-A---A-C-A-AAC-A-GATAAC-T-T-CAAA-TGT--A-TTTTTTC--T--AA--TCT--A-----T--G--C-A--CTT--C--T-TTT-T--CAG---TTTC-A-A--AT-AGGAAA-------------------TCT-AA------------TTT-ACA-TTT-ATTCCA-----TTG-T-ATTCTT-AT--TT-C---AA--TGAA--TAG--A-AA-T-T-A-----TCT-A-CA-A-T-CCT-A--A-CTT-CG--T--C-AC-C-AG-G-------TC-ATC-AT----TT--GG----CG----A-TC---TG---G-GT-AAC-A---A-----ACA----GG-T-CG-TCAAAA--TTTCC------A--TCAAGGG----T-GGATCATGG-CGA------CTGACGA
gi|66145                      : CAGG--T-CG-ACA-C-TC---G-TCA-GAA---TT---T--G-AC-T-CG-CCATATCGG-G----CA-A-CCA-AA--A---T
gi|66146                      : CAGGGTT-CG-A-A-C-TCCCCG-TC--GAAT--TT---TTGG-ACGT-CG-CCAT-TCAG-G----CA-A-CCA-AA--A---TA--TGATC----TTAATGTTGCCC--GAGA--C-GGAATTTC-AGAGTTG-C-C----CAAAC-AA-AAA-T--GTG-A-A---A-C-A-----------------------TGT--AATTATT-C--T-AA---TCT--A-T---T--GG-C-AAACTT--C--T-TTTTT--CAG---TTTC-ATA--AT-AGG-AT-TGT------A-------TTTT-AA--TT-CT----TTTC-ACA-TTATTTTCCA-T---TTG-T-ATTCTT-AT--TT-C--AAA--ATAA--TAG--A-AA-T-T-A--TAATCTGA-C----T-CCA-A--A-C-T-CG--T--CAAC-C-AG-G-------TC-GTC-ATTC--TT-GG------G----A-GC---TG-T-GTTT-AACAA---A-----ACA-----G-T-CG-TCAAAA--TTCACA-----A--TC-A--A----T-CGA-AATG
gi|66147                      : CAGGGTT-CGCAAA-C-TC---GGTCA-GAAT--TG------G-AC-TTCG-CCAT-TCGG-G----CCCA-CCG-AA--G---TA--------------G-GTTGCCC--GA-A--C-GGA-TTTC-AG-GT-G-C-C-----AAAC-AA-AAA------------------------A-G--AAC-T-T-CAAA-TGT--A-TTATTTC--T-AAA--TCT--A-T---T-----C-A--TTG--C--A-TT-------G----TTC-A-A--AT-AGG--A-T-T------A-------TTTT-AA--TT-CT----TTTC-AAA-TTA-TTTTTA-T---TTG-T-A-TCTT-ATTCTT-C---AA--TAAT--TAGA-A-AA-T-T-AT-T--TCGGA-CA-AGT-CGA-AGGA-C-T-AG--TCAC-AC-C-AGCGT------TT-GTC--T----TT-GGG----CG----ATTC---TA-T-G-TT-AAC-A---T-----ACA----GG-T-CG-TCAAAA--TTCAG------A--TC-AGTG----T-GGA-AATGG-CGA-----GGTGACGA
gi|66148                      : CAGGGTT-CC-ACA-C-TC---A-TCA-GAAT--TC---G--G-AC-T-CA-CCAT-TCGG-G----CG-A-CCA-AA--G---TAC-TGATC----TCAG-GTTTCCC--GA-A--C-AGA-TTTC-AG-GTTA-C-C----CAAAC-AA-AAA-T--ATG-A-A---A-C-A-AAA-A-G--AAC-T-T-CAAA-TGT--A-TTATTTC--T-AAA--TCT--A-TAAAT--G--C-A--TTT--C--T-TTT-T--CAG---TTTC-A-A--AT-AGGAAA-TGT------A-------TTTT-
gi|66149                      : CAGGGTT-CG-ACA-C-TT---G-TCA-GAAT--TC---G--G-AC-T-CG-CCAT-TCGG-G----CA-A-CCG-AA--G---TAC-TGATC----CCAG-G-TGCCC--AA-A--C-
gi|66150                      : CAGGGTT-CG-ACA-C-TT---G-TCA-GAAT--TC---G--G-AC-T-CG-CCAT-TCGG-G----CA-A-CCG-AA--G---TAC-TGATC-----CAG---TGCCC--AA-A--
gi|66151                      :  AGGGTT-CG-ACATC-TC---G--CA-GAATAATT---G--G-AC-T-CG-CCAT-TCGT-G----CA-ATCCT-AA--G---TAC--GATC----T-AG-GT-GCC---AA-A--C-GGA-TTTCGAG-GTT--T-C----CAAAC-AACAAA-T--ATG-A-A---AAC-A-AACGA-G--AACAT-G-CAAAATGT--A-TTATT-CAGT-AAAGTTCTTAA-T---TTTG--C-A--CTTTCC--TATTT-T--CAG---TTTC-A-A--A--AGGAAAGTGTG-----A-------TT---GA--TT-CT----TTTCGAC--TTA-TTTCCA-T---TTG-T-ATTTCT-AT--TT-C--AAAC-TAAA--TAG--A-AAAG-T-A--T--ATCAA-CA-A-T-CCA-A--A-C-A-C---T--C-AC-T-CG-G-------TC-GTC-AACCCATT-GGG----CG----A-GC---GG-T-G-CT-A--------------TA---------CG-TCAAAAAATTCAC------T--TC-AGGG----T-GGA-AATGA-CGA-----GGTGACGA
gi|66152                      :   GGGTT-CG-ACA-C-TC---G-TCA-GAAT--TT---TT-G-AC-T-CG-CCAT-TCGG-G----CA-A-CCC-AA--AAATTACTTGAAC----TTAG-GTTGCCC--GA-AACC-GGA-TTTC-AG-GTTG-C-CATTTCGAAT-CA-AAA-C--GTG-
gi|66153                      :    GGTT-CG-ACA-C-TC---G-TCA-GA-T--TT---T--G-AC-T-CG-CCAT-TCGGCG----C--A-CCA-CA--A---AAC-TGATC----TTAG-GTTGCCTCGGA-A--C-GGA-TTT--AG-GTTG-C-T----C---C-AC-AAA-T--ATG-A-AAAGA-CAA-AAC-A-G--AAC-TAT-C-AA-TGT--A-TT-TTTC--T-AAT--CCT--A-T---T--G--C-A--CTT--A--T-TTT-TTCCAT---TTTC-A-A--AT-AGGAAA-T-T------A-------TCT
gi|66154                      :    GGTT-GA-ACA-TGTC---G-ATACGAAT--TT---G--G-AC-T-CG-CCAT-TGGG-GG---CA-A-CCT-AA--G---TTC-TGATC----TCAG-AGTGCCC--TA-A--CCAGA-ATTC--G-GTTG-C-C----TCAAC-AA-AA--T--ATGTA-A---A-C-G-AAA-A-G--GAA-T-T-CAAA-T-T--A-TTATTTC------A--TGA--A-T---T--G--C-T--ATT--T--T-TTT-T--CAG---TT-C-A-AGAAT-AAGAAA-TGT------A-------TTTT-AAGATT-CT----TT-C-ACG-TTG-TTTCAT-T---TTG-T-ATTTTA-AT--TT-C--AA---TAAA--TAGTAA-AA-G-T-ACGT--ACTGA-AA-A-T-CCA-A--A-G-T-CG--T--C-ACGC-GG-G-------TT-GT--AT----AT-GG-----CG------GC---TAAT-G-TT-AAC-A---A-----ACA----GG-TTCG-CCAAAA--T-CACG-----A--TC-AGTG------GGG-AATGG-CGA-----GGTGACGA
gi|66155                      :     GTT-CG-ACATC-TCC--G-TCA-GAAA--AC---T--G-AC-T-CG-CCAT-TCGG-G----CACA-CCA-GATGA---TA--TGATCAATCTT-G-GTTGCC---GA-A--C-AGAATTTC-AG-GTTG-C-C------AAC-AA-AAA-T--ATG-AGA---A-C-A-AAA-A-G--AAC-T-T-CAA--TGT--A-TTAAT-C--T-AAA--TCT--A-T---T--GGGC-A--ATT--CATT-TTT-T--CAG---TTTC-A-A--AT-AG-AAA-TGT------A-------TTTTTAA--TC-TTACAGTTTC-AC--TTA-TTTC-A-T---TTG-TCATTCTT-AT--TT-C--AAAGATAAAAATAG--ATAA-T-TTA--T--TCTGAGCA-AAT-CGA-T--A-C-TACGAAT--C-AT-C-AG-G-------CCTGTG-AT----TTTGGG----CG----A-GC---TA-G-G-TT-AAC-A---A-----ACA----GG-T-CG-TCAAAAATTTCAC------A--TC-AGGG----T-GGA-AATGG-CGA-----AGTGACGA
gi|66156                      :                 -TT---G-TCA-GAAT--TTGCAT--GGAC-T-TG-CCAT-TCGG-GAAACCA-A-TCG-AA--G---TAC-T---------TAC-AT----------------GA-TCTC-AG-GTTG-C-C----CAAAT-GA-AAA-T--ATG-A-A---A-C-A-AAA-A-G--AAC-T-T-CAAA-TGT--A-CTATTTC--T-AAA--TCT--A-T---T--G--C-A--TTT--C----TTT-T--CAG---TTTC-A-A--AT-AGGAAA-TGT------A-------TTTT-AA--TT-C-----TTTC-AAG-TTA-CTTTCA-T---TTG-T-ATTCTT-AT--TT-C--AAA--TAAA--TAG--A-AA-T-T-A--T--TCTGA-CA-A-A-CCA-A--A-C-T-CG--T--C-AC-C-AG-GAGTTAAATT-GTT-AC----TT-TGGCGCTCG----A-GCTTATG-CAG-TT-AAC-A---A-----ACAGGCCGG-T-CG-TCAAAA--ATCAC------A--TC-AGGGTGCAT-GGA-AATGA-CGA-----GGTGACGA
gi|66157                      :                                                                                       C-TGATC----TTAG-GTTGCCC--GA-A--T-GTA-TTTC-AG-GTTG-C-C----CAAAC-AA-AAA-T--ATG-A-A---A-C-A-AAC-A-G--AAC-T-T-CAAA-TGT--A-TT-TTTC--TAAAA--TCT--A-T---T--GC-C-A--CTT--C--T-TTT-T--CAG---TTTC-A-A--AT-A-GAAA-T-T------A-------TCT---A--TT------------ACA-TTA--TTCCA-T---TTG-T-ATTCTT-AT--TT-C--AAA--TAAA--TAG--A-AA-T-T-A--T--TCTGA-CA-A-T-CCCTA--A-C-T-CG--T--C-AC-C-AG-G-------TC-ATC-AT----TT-GGG----CG----A-GC---TC-T-G-TT-AAC-A---A-----ACA-----G-T-CA-TCAAAA--TTC-C------A--TC-A-GG----T-GGA-AATGGTTGA-----GGTGACGA
gi|66158                      :                                                                                        -TGTTC----TCAG-G--GTTC--GACA--C-GAA-TTTC-AG-GTTG-C-C----CAAAC-AA-AAA-TTTATG-A-A---A-A-AGAAA-A-C--AAC-T-T-CAAA-TAT--A-TTATTTC--T-AAA--TCT--A-T---T--G--C-A--TTT-------TTT-T--CAGGTTTTTC-A-A--AT-AGGAAATTGT------A-------TTTT-AA--TT-CT----TTTC-ACG--TA-TTTTCA-T---TTG-T-TTCCTT-AT--TT-T--CAA--TTAA--TAG--A-AA-T-T-A--T--TCTGA-CA-A-T-CCA-A--AGC-T-CG--T--C-AC-C-AG-G-------CT-GTC-AT----TT-GGC----CAAAGTA-GC---TA-T-T-GT-AAC-A---A-----ACA----GGTT-CG-T-AAAA--GTCAC------AATTC-AGGG----T-GG--TATGG-CGA-----GGTGACAA
gi|66159                      :                                                                                                             C--AA-A--C-GAA-TT-C-AG-GT-G-C-C----CAAAC-AA-AAA-TTTATG-A-A---A-A-AGAAA-A-C--AAC-T-T-CAAA-TAT--A-TTATTTC--T-AAA--TCT--A-T---T--G--C-A--TTT-------TTT-T--CAGGTTTTTC-A-A--AT-AGGAAATTGT------A-------TTTT-AA--TT-CT----TTTC-ACG--TA-TTTTCA-T---TTG-T-TTCCTT-AT--TT-T--CAA--TTAA--TAG--A-AA-T-T-A--T--TCTGA-CA-A-T-CCA-A--AGC-T-CG--T--C-AC-C-AG-G-------CT-GTC-AT----TT-GGC----CAAAGTA-GC---TA-T-T-GT-AAC-A---A-----ACA----GGTT-CG-T-AAAA--GTCAC------AATTC-AGGG----T-GG--TATGG-CGA-----GGTGACAA
gi|66160                      :                                                                                                                                      TG-C-C----CAA-C-AA-AAA-T--ATG-A-A---A-C-A-AAC-A-G--AAC-T-T-CAAA-TGT--A-TTTTTTC--T-AAA--TCT--A-T---T--G--C-A--CTT--C--T-TTT-T--CAG---TTTC-A-A--AT-AGGAAA-T-T------A-----------------T-CT----ATTT-ACA-TTA-TTTCCATT---TTG-T-ATTCTTAAT--TT-C--AAA--TAAA--TAG--A-AA-T-T-A--T--TCTGA-CA-A-T-CCT-A--A-C-T-CG--T--C-AC-C-AG-G-------TC-ATC-AT----TT-GGG----CG----A-GC---TG-T-G-TT-AACAA---A-----ACA----GG-T-CG-TCAAAA--TTTCC------AT-TC-AGGG----T-GGA-A
gi|66161                      :                                                                                                                                                                   -A-A---A-C-A-AAA-T-G--AAC-T-TTCAAA-TGT--A-TTATTTC--T-AAA--TCA--T-T---T--G--C-A--TTT--C--T-TTT-T--CAG---TTTG-A-A--AT-AGGAAA-TGT------ACATTGTATTTT-AA--TT-CT----TTTC-GCAATTA-TTTTTA-T---ATG-T-ATTCTT-AT--TT-TTAAAA--AAAG--AAG--A-AA-T-T-A--T--TCTGA-CA-A-T-CGA-T--A-C-T-CG--T--C-AC-C-AG-G-------TC-GTC-AT----TT-GGA----CG----A-TC---TA-T-G-TT-AAC-AT--ACATGTACA----GG-T-TG-TCAAA----TCAG------A--TC-AGGG----T-GGA-AATGG-CGA-----GGTGACGA
gi|66162                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -TGG------A-------TTTT-GA--TTTCT----TTTC-ACA-TTA-TTTTCA-T---TT------TCAA-AT--TT-T--ATA--TA----TGG--A-TT-T-T-A------CTGA-TA-A-T-TCA-A--A-C-T-C--------AC-T-GG-G-------TT-GCC-AT----TT-A-------------------CG-T---TT-AAC-G---A-----ACA----GG-T-CG-TCAAAA--ATCAT------T--TG-AAGG----T-GGA-AATGA-CGA-----
gi|66163                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AA--CAAA--TAG--A-AA-T-T-A--T--TCTGA-CA-A-A-TCA-A--A-C-T-CG--T--C-AC-C-AG-G-------TC-ATT-AT----TT-GGG----TG----A-TC---TA-G-G-TT-AAC-A---A-----ACA----GG-T-CA-TCAAAA--TTCACATCAGGA--TC-AGGG----T-GGA-AATGA-TGA-----GGTGACAA
gi|66164                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --T--TCTTA-CA-A-T-CCA-A--A-C-T-TG--T--C-AC-C-AG-G-------TC-----AT----TT-GAG----CA----A-GC---TA-T-G-TT-AAC-A---A-----ACA----GG-T-CG-TCAAAT--TTCAC------A--TC-AGGG----T-GGA-AATGG-CGA-----
gi|66165                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TT-AT----TT-GGG----TG----A-AC---TA-G-G-TT-TAC-A---A-----ACA----AG-T-CA-TCAGAA--ATCAT------T--TC-GGGA----T-GGA-AAAGA-CGA-----AGTG
gi|66166                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AA--TTCAC------A--TC-AGGG----T-GGA-AATGG-CGA-----GGTGA