lowQualScore : 555555555555555555 1 222 1 222222 33 111 1 22222 11 1111 222 222 22222222222222
lowQualScore : 5 1 1 22 444444444444444444 1 22 7777 1 1 1 1 1 22 5555 3 1 3 1 666 3 1 1 22 1 22 1 1 3 6 666666 22 88 3 1 5555 1 4 22 55 1 1 1 333 444 555555 1 1 222 22 1 3 3 22 1 1 1 33 1 1 3 1 1 1 1 00 1 333 55 1 333 1 22 1 1 22 3 1 999 22 555 1 1 1 6 66 1 1 1 1 1 1 333 66 1 666 22 5 1 1 22 1 5555 5555 1 88888 44 22 1 1 33333333 1 55 1 22 1 1 3 1 3 33 1 3 0 22 3 44 1 00 1 666 1 888 1 66666 1 1 3333 22 333 3333 44 5 3 22 3 1 1 44 1 222 22 5555 22 1 777 5 66 666666 555 3 5555 1 3 3 333 22 3 44444 99999999999999 2
lowQualScore : . . . .. .................. . .. .... . . . . . .. .... . . . . ... . . . .. . .. . . . . ...... .. .. . . .... . . .. .. . . . ... ... ...... . . ... .. . . . .. . . . .. . . . . . . . .. . ... .. . ... . .. . . .. . . ... .. ... . . . . .. . . . . . . ... .. . ... .. . . . .. . .... .... . ..... .. .. . . ........ . .. . .. . . . . . .. . . . .. . .. . .. . ... . ... . ..... . . .... .. ... .... .. . . .. . . . .. . ... .. .... .. . ... . .. ...... ... . .... . . . ... .. . ..... .............. .
lowQualScore : 5 7 7 33 444444444444444444 7 33 6666 6 6 2 6 6 22 0000 2 6 2 6 888 2 6 6 22 6 22 6 6 2 4 222222 22 66 2 2 0000 6 8 22 33 6 6 5 333 222 222222 5 5 777 11 5 2 2 22 6 6 6 88 6 6 2 6 6 6 7 22 7 777 99 7 222 7 44 7 7 44 5 8 000 55 000 8 8 8 4 11 8 8 8 8 8 8 222 11 8 444 55 5 8 8 55 8 7777 7777 8 22222 33 55 8 6 88888888 7 11 7 44 7 7 5 7 5 44 7 5 2 44 5 11 7 11 7 999 7 333 7 55555 7 7 0000 44 555 7777 88 2 5 44 5 7 7 11 7 333 99 4444 44 7 888 2 44 777777 888 5 0000 7 5 5 000 44 5 33333 99999999999999 0
consensus : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--GAA-AT-A-A-ATCAT-----ATGG-G--T-A--T-T-T-A-T-A--A----G-G-T-G-TTT--A-GA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG--T-T-C----A-T-A--T-CT-T-ATA-T-A-G---GA---TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCT-A-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-AT-C-AA-AA-CC-TCAAT--TTA-TTTTC--AA--A-T--GA-A--AGAG-T-A--AT-AC-G-A-CT--GC---T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA--AAAGCA-A---TTTTT--C-G-A-C--A-AAT----GA----A-GA-N-A-A--TT--T-TCAGCCC--CG----GAG-AAN-T-A--A-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTACA-T--A-TAAT-GTAGCT-TA---T-GT---TA-GC-G---G-TA-TT-A-ATTG--ATA--A----A--A-G-TA--T-C-GG-T--TT-GGA---TAG-T----CA--GG-TTCA---T-A-ATG------TT--ACT-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TC-----AT-------C------CCCCCCC-CCCCCCCC
Reference ( gi|110312 ) : CCCCCGTTT-CATCTT-TTT--GAAGAT-A-A-TTCAT---TCATGG-G--T-A--T-T-T-A-T-A--A----G-G-T-G-TT---A-GA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG--T-T-C----A-T-A--T-TT-T-ATA-T-A-G---GA---T--AAA-GA-CAA---AGG--TCT-A-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-AT-C-AA-AA-CC-TCAAT-ATTA-TTTTG--AA--A-T--GA-A--AGAG-T-A--AT-AC-G-G-CT--GC---T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA--AAAGCA-A---TTTTT--C-G-A-C--A-AAT----GA----A-GA-A-A-A--TT--T-TCAGCCC--CG----GAG-AAC-T-A--A-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTACA-T--A-TAAC-GTAGCT-TA---T-GT---TA-GC-G---G-TA-TC-A-ATTG--AT---A----A--A-G-TA--T-C-GG-T--TT-GGA--TTAG-T----CA--GG-TTCA---T-A-GTG------TT--GCT-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TC-----AT-------C------CCCCCCC-CCCCCCCC
gi|110313 : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--GAA-AT-A-A-ATTAT-----ATTG-G--T-T--T-T-T-AAT-A--A----G-G-T-G-TTT--A-GA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AT------A--GTG--T-TTC----A-T-A--T-CT-T-ATA-T-T-G---GA---T--TAA-AA--AG---AGG--TCT-A-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-AT-C-AA-AA-CC-TCAAT--TCA-TTTTA--AA--A-T--GA-A--AGAG-T-ATAGT-AT-G-A-CT--GC---T-T-T-T-AA-GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA--AAAGCA-A---TTTTT--C-G-A-C--A-AAT----GA----A-GA-C-ACA--TT--T-TCAGCCC--CG----GTG-AAG-T-A--A-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-CTT--TTTACA-T--A-TAAT-GTAGCT-AA---T-GCTAGTA-GC-G---G-TA-TT-G-ATTG--ATA--A----A--A-G-TA--T-C-GG-T--TT-GGA---TAT-T----CA--GG-TTCA---T-A-ATG------TT--ACT-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TC--------------C------CCCCCTC-CCC
gi|110314 : CTCCTATTT-CATCTT-TTT--GAA-AT-A-A-ATCAT-----ATGG-G--T-A--T-T-TTA-T-A--G----G-G-T-G-TTT--A-GA-AT-TTTT----T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG--T-T-TT---A-T-A--T-CT-T-ATA-T-A-G---GA---TT-AAA-AA-CAA---ATG--TCT-A-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TATT-T-AT-C-AA-AA-CA-TCA-T--TCA-TTTTC--AA--A-T--GA-A--AGGG-T-A--AT-AT-G-A-CT--GC---T-T-T-TTA--GCAGTTTG-G-A-T-G-TT-TC---GA--AAATCA-A---TTTTT--C-G-A-C--A-AAT----GA----A-GA-C-GCA--TT--T-TCAGCCC--CG----GAG-AAG-T-A--A-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTACA-T--A-TAAT-ATAGCT-TA---T-GT---TA-GC-G---G-TA-TT-G-ATTG--AT---A----A--AGG-TA--T-C-GG-T--TT-GGA---TAG-T----CG--GG-TTCA---T-A-ATG------TT--AGT-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TT-----AT-------C------CCCCCAC-TCCC
gi|110315 : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--GAA-AT-A-A-ATCA-----AATGG-G--T-AC-T-T-T-A-T-A--A----G-G-G-G-AT---AAGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG--T-TTC----A-T-A--T-GT-T-ATA-T-A-G---GA---TT-AAA-GA-CAA---AGG--TAT-A-GAT-AA--TG-CA-TA-C--TTTT-T-AT-C-AA-A--CC-TCAAT--TTA-TTTTC--AA--A-T--AA-A--AGAG-T-A--AT-AC-G-A-CT--GC---T-T-T-TTA--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---AA--AAAACA-C---TTTTT--T-G-A-C--A-AAT----GA----A-GA-C-ACA--CT--T-TCAGCTC--CA----GAG-AAC-T-A--A-TT-AA-C-CGT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTACA-A--T-TGAT-GTAGCT-TT---T-GT---TG-GC-G---G-TA-TT-A-ATTG--ATA--A----A--A-G-TA--T-C-GG-TGGTT-GGA---TAGTT----CA--GG-TTCA---T-A-ATG------TT--GCT-ATTG-GC-CA-C-TT---T--A-TC-----ATAAA----C------CCCCCCC-CCCCC
gi|110316 : CCCTCATTT-CATCTT-T----GAA-AT-A-A-ATCAT-----ATGG-A--T-A--T-T-T-A-T-A--A----G-G-T-G-TT---A-GA-AT-TTGA--A-T--A-AA-TGG-CT-AG------A--GTG--T-T-C----A-T-A--T-CT-T--TA-T-A-G---GA---TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCT-A--AT-AA--TG-CA-TA-A--TTCA-T-TT-C-AATAA-CC-TCAAT--TTA-TTTTC--AA--A-----A-A--AGAG-T-A--ATTAC-G-A-CT--GC---T-T-T-TTA--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA--AATGCA-A---TTTTT--T-G-A-T--A-AAT----GA----A-GA-C-A-C--AT--T-TCAGCCA--TG----GAG-AAG-T-A--A-TT-GA-C-CAT-TGAATTTTCT-TTT-ATT--TTTACA-T--A-TAAT-ATAGCT-TA---T-GT---TA-GC-----G-TA-TT-A-ATTG--ATA--A----A--A-G-TA--T-C-GG-T--TT-GCA---TAT-T----CA--GG-TTCA---T-A-ATG------AT--ACT-A-TG-GA-CA-C--T---T--A-TC-----AT-------T------ACCCCCC-CCCCCCCC
gi|110317 : CCTCCATTTTCATCTT-TTTCTGAA-AT-A-AATTCAT-----ATGG-G--T-A--T-T-TTA-T-A--A----G-G-T-G-TT---A-GA-AT-TTGA--A-T--A-ATTAGG-CT-AG------A--GTG--T-TTC----A-T-A--TCTT-T-GTA-T-A-G---GAAT-T--AAA-GA-CAA---AGG--TCT-A--AT-AA--TG-CC-TA-A--TTTT-T-AT-C-AA-AA-CC-TCAAT--TTA-TTTTC--AA--A-A--TA-A--AGAG-T----AT-AC-G-A-CT--GCT--T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA--AAAGCA-A---TTTTT--CAG-A-C--A-AAT----GA----A-GG-G-ACA--TT--T-TCTGCCC--C-----GAG-AAC-T-A--A-TT-GA-C-CAT-TAAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTACA-T--A-TAAT-GTAGCT-TA---T-GT---TA-GC-A---G-TA-TT-A-ATTT--AA---A----A--A-G-TA--T-C-GG-T--TT-GGA---TAG-TCATGCA--GG-TTCA---T-A-AT-------TT--ACT-A-TG-GG-CA-C-TT---T--T-TC-----AT-------CATTAATCCCCTCT-CC
gi|110318 : CCCCCATTT-CAT--T-TTT--AAAAA--A-A-T-------------------A--T-T-T-A-T-A--A----G-G-T-G-TTT--A-AA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTA--T-TTC----A-T-A--T-CT-T-ATA-T-T-G---GA---TT-AAA-GA-CAA---GGG--TCT-A-GAT-AA--TG-CA-TA-C--TTTT-T-AT-A-AA-AA-CC-TTCAT-TTTT-TTTTTTCAA--A-T--GA-A--AGAG-T-A--AT-AC-G-A-CT--GC---T-T-T-TTA--GCAGTTTA-G-A-T-A-TT-TC---GA--AAAGCA-A---TTTTT--C-G-A-C--C-AAT----GA----A-GA-C-ACA--TT--T-TCAGCCC--CG----GAG-AGG-T-A--A-TT-CA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTACA-T--A-TAAT-CTAGCT-TA---T-GT---TA-GC-G---G-TA-TT-G-ATTG--AT---A----A--A-G-TA--T-C-GG-T--TT-GGA---TAG-TC---CA--GG-TTCA---T-A-ATG------TT--ATT-A-TG-GG-CA-CTTT---T--A-TT-----ATTAA----C------ACCCTCT-ACCCCCC
gi|110320 : CCCCCGTTT-CATCTT-TTT--GAA--T-A-A-ATAA------ATGG-G--T-A--T-T-TTA-T-A--A----GCG-T-G-TTT--A-GA-AT-TTAA--A-T--A-AA-AGG-CT-AGT-----A--GT---T-T-C----A-T-A--T-CT-T-A-A-T-A-G---GA---TTAAAA-GA-CAA---AGG--TCT-A-GAT-AA--TG-CA-TA-A--ATGT-T-AT-C-AA-AA-CC-TCAAT--TTA-TTTTG--AA--T-T--GA-A--AGAA-T-A--AT-AT-G-GACT--GC---T-T-T-TAA--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA--AAAGCA-A---TTTTT--T-G-A-C--A-AATTGAAGA----A-AA-A-A-A--TT--T-TCAGCCC--GG----GAG-AACTT-A--A-TT-GA-CACAT-TGAA-TTTCT-TTT-A-T--TTTACATT--A-TAAT-GTAGCT-AA---T-GTC--TA-GC-G---A-TA-TT-A-ATTG--ATTG-A----A--A-GTTA--TAA-GG-T--TT-GA----TAG-T----CA--GGTTTCA---T-A-AT-------TT--GCT-A--G-GG-CA-C-TTTTAT--A-TT-----AC-------T------CCCCCCC-CCCCC
gi|110319 : CCCCAATTT-CATGTT-TTT--GAA-AT-A-A-ATCAT-----ATAG-G--T-AC-T-T-T-A-T-A--A----G-G-T-G-TTT--A-GA-AT-TTGA--A----A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG--T-T-TTTCAA-TGA--T-GT-T-ATA-T-ATG---GA---T--AAA-GA-CAA---AGG--TCT-A-GAT-AA--TG-CA-TA-G--TTTT-T-AT-C-AA-AA-CC-TCAAT--TTA-TTTTC--AA--A-T--AA-AAGAGAG-T-A--AT-AC-G-A-CT--GC---TAT-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---TA--AAAGCG-A---TTCTT--C-G-A-C----AAT----GA----A-GACA-C-AT-TT--T-TCAGCCC--CA----GAT-AAC-T-A--A-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTCTT-TTT-AAT--TTTACAGT--A-TAAA-TTAGCT-TA---T-GT---AA-GC-A---G-TA-TT-A-A-TA--ATA--A----A--A-G-TA--T-C-GG-T--TT-GGA---TAT-T----CA--AG-TTC----------G------TT----T-A-TG-GG-CAGC-TT---T--A-TC-----ATATTACAAC------CCCCCCC-CCC
gi|110321 : CCCCCATTT-CA-CTT-TTT--AAA--T-A-A-T-CA------ATGG-G--T----T-T-T-A-T-A--A----A-A-TTG-TTT--A-GG-AT-TGGA--A-TTCA-AA-AGG-CT-TG------ACTGTA--T-T-C----A-T-A--T-CTCT-ATA-C-G-G---AA---TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCT-A-GAT-AA--TG-CA-TA----CTTT-T-AT-C-AA-AAACC-TCATC-TTTA-TTC-----A--A----GA-C--AGAG-T-C--AT-AC-G-A-CC--GC---T-T-T---A--TCAGTTTG---A-T-A-TT-TC---GA--AGAGCA-A---TTTT---C-G-A-C--A-AAT----AA----A-GA-C-ATA--GT--T-TCAG-CC--GG----GAG-AAC-T-A--C-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-T----TT--TTTACA-T--A-TAAT-GCAGCT-TA---T-G----TA-GC-A---G-TAGTT-G-ATTG--AT---A----A--A-ATTA--T-T-GG-T--TT-AGA--TGAG-T----CA---G-TTCA---TCA-ATG------TT--ACT-A-T--GG-CA-C-TT---T--A-TC-----ATTA-----C------ACCCCCC-CCCCCCCC
gi|110323 : CCCCC--TT-CATCTT-TTT--GAA-AT-AGA-ATCAT---T---GG-GAAT-A--T-TAT-A-T-A--A----G-G-T-G-TTT--A-GA-AT-T-GA--A-T--A-AG-A----T-AG------A--GTG--T-T------A-T-A--A-TC-T-ATA-C-T-A---GA---T--AAA-GA-CGA---AGG--T-T-A-GAT-TA--TGGCA-TA-----TGT-T-ATTC-GA-AA-CC-TCAAT--TTA-TTTTG--AA--A-T--GA-A--AT-G-T-A--AT-AC-GCA-TC--GC---T-T-T-A-A--G-AGTTTG-G-AGT-A-TT-TT---GA--A--GCA-A---TTTTT--C-G-A-C--A-AAT----GA----A-GACA-A-A--TT--T-TCAG-CC--CG----GAG--AC-T----A-TT--A-C-CAT-TGAT-TTCCT-TTT-ATT--TTTACA-T----T-AT-GTAGCT-TA---T-GT---TC-GC-G---A-TA-TT---ATTG---T---A----A--ACG-TA--T-C-GG----TT-GGA--ATAT-T----CG--GT-TTCA---T-A-ATG------TT--GCT-G--A-GG-CA-C-TT---T--A-TT------T-------A------CCCCCCC-CCCCCCC
gi|110322 : CCCCCATTT-AATCTT-TTT--GAA-AT-A-A-TT-AT---T-ATTG-G--T-A--TGT-T-A-T-A--A----G-G-G-G-TTT--A-GC-AT-TTTA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG--T-TTC----A-T-A--C-TT-T-ATA-T-A-G---GA---TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCT-A-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-AT-C-AA-AA-CC-TCAAT--TTA-TTTT---CA--A-T---A-A--AGAT-T-A--AT--C-G-A-CT---CTTAT-T-C-T-A---CA-TTT--G-A-T-A--T-TC---AAC-AAATCA-A---TTTTT--C-G-ACC--A-AAT----TA----A-AA-C-T-A--TT--T-TC-GCCC--TG------A-AAC-T-A--A--T-AA-C-CAT-TGA---TTC--TTT-ATT--TTTACA-------AAA-GTAGC--TA---T--T---TA-GC-A---T-TA-TT-G-ATTG--ATA--A----A--A-G-TA--C----G-T--TT-GGA--T--A-T----CA--GG-TCCAAC-T-A-ATGTCTACATT--ACT-A-C--GG-CT-C-TT---T--A-TC-----ATTA-----C------ACCCCCC-CCACCCC
gi|110324 : CCCCAATTT-CATCTT-TTT--GAA-AT-A-A-ATCAT-----ATAG-G--C-A--T-T---A-T-T--A----G-A-T-T-TT---A-GA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CTTAG------A--GTGC-T-T-C----A-T-A--T-CT-T-ATA-T-T-GTTGGA---TT-AAA-GA-CAA----GG--TCT-A-GGT-AA--TA-CA-TA-A--TTTT-T-ATTC-AA-AA-CC-TCAAT--TTA-TTTC---AA--A-T--TA-A--AGAG-TTA--AT-A--G-A-CT--GC---T-TCT-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TCAAAAA--AAAGCC-ATTGTTTTT--T-G---C--A-AAT----AA----A-GACA-C-A--TTTGT-TCAGCCCCACG----GAA-AAG-T-A--A-TT-GA-C-CAT-TGA---TTTT-TTT-ATT--TTTACA-T--A-AAAT-G-AGCT-TA---T-GT---TA-GC-A---G-TA-T
gi|110325 : CCCTCATGT-TATCTT-TTT--GAAAA----A-TCTAT----AATGG-A--TTAGTT-T-T-A-T-A---------G-T-G-TTT--A-GA-AT-TTGA--A-T--T-AA-AGG--T-AG------A--GTGT-T-T-C----A-T-A--T-CT-T-ATA-T-G-A---GAT--T--AAACGA-CAA---AGGTTTCT-AGGATAAA--TG-CACTA-A--TTTT-T-AT-C-CA-AA-CCGTCAAT--TTA-TTTTC--AAC-A-T--GC-A--AGAGTT-A--AT-AC-G-A-CT--GC---T-T-TGT-A--GCCATTTGAG-A-T-A-TT-TC---AAC-AAAGCA-A---TTTTT--T-G------A-AATC---GA----A-GACACA-A--TT--TCTCA-CAC--TG----CAGAAAG-T-A--A--T-GA-C-CATATGA---TTCT-TTTAACT--TTTACA-TG-A-TGA--ATA-CTATA---T-GT---TACGC-G---T-TT-T----ATTG--ATA--A----A--A-G-TA--T-C----T--TT-GGA---TAT-T----CA--GG-TTTA---TCA-ATG------AT--ACT-A-T--GA-CA-C-TT---T--A--C-----AT-------T------ACCCCCC-CCCTCCCC
gi|110326 : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--GAAAATAA-A-TTTAT---T-ATGG-G--T-G--T-T-T-G-T-A--A----G-G-T-GTTT---A-TA-ATCTTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AA------T--GTGT-T-T-C----A-TCA--T-CT-TAATA-T-A-G---AAT--T--AAA-GA-CAA---AGG--TCT-A-GAT-AA--TG-CA-TATA--TTTT-T-AT-C-AA-A---C-TCAA--ATT------------------------AGAG-T-A--AT-AC-G-A-CT--GC---T-T-T-T-A--GCAGTTTG-GAA-T-A-TT-TC---T---AAAGCG-A---TTTTT--C-G-A-T--A-AAT----GA----A-GA-C-A-GCCTT--T-TCAGC
gi|110327 : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--TAA-AT-A-A-ATCATAATTTATGG-G--T-A--T-T-TTA-T-A--A----G-G-T-G-TTT--A-GA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AGCTATAGA--GTG--T-TTC----A-T-A--C-CT-T-ATA-T-A-G---GA---TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCT-A-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-AT-C-TA-AA-CC-TCAAT--TTA-TTTTC--AA--A-T--GA-A--AGAG-T-A--AT-
gi|110328 : CCCCCATTT-CATCTG-TTT--GAA-AT-A-A-ATCAT-----ATGGTA--T-A--T-T-T-A---A--ACCCCGTA-T-T-TT---A-GA-AT-TTGA--A-T--A-GA-GGGAGT-AG------A--GCT--T-T-C----A-T-A--T-CT-T-ATATT-A-G---GAT--T--AAA-GA-CTA---AGT--TC----AAT-AA--TG-CA--A-A--AATT-T-AT-CTAA-AA-TC-------ATTA-TTTTC--AA--A-C-------------C-G--AT--------CT--G----T-T-T-T-A--TCAG--TG-G-G-T-A--T-TC---GA--A---CA-A---TTTTT--CGG-A-C--A-AAT----------------------TT---------------------A-AAC-A-A--A-TT-GA----A--------TTCT-TTT-A-T--TTTACA-T--A-TAAT--TAGCT-T----T-GTG--TA-CC-A---G--A-TT-A-ATTG--ATAAAA----A--A-G-TA--T-C--G-T--TT---A--ATAG-T----CT--AG-TTCAATTT-ACGTA------TT------------G-CA-C-TT---T--ATTC-----ATTTA----C------CCCTCCC-CCCCCC
gi|110329 : CCCCCATTT-CATCTT--------AAAT-T-A-T--AT---T----G-G--T-A--T-T-TTA-T-A--A----G-G-T-G-TTT--A-GA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--ATG--TGT-C----A-T-A--C-CT-T-ATA-T-A-G---GA---TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCT-A-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-AT-C-AA-AA-
gi|110330 : CTCCCATTT-GATCTT-TTT--GAA-AT-A-A-ATCAT---ATATGC-A--T-A--T-T-TTA-T-A--A----G-G-T-G-TT---AAGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-----------------T-T-C----A-T-A--C-CT-T-ATA-T-T-G---GAT--T--AAA-GA-CAA---AGG--TCT-
gi|110331 : CCCCGTTT-CATCTT-TTT--AAA--T-A-A-ATC-----TAATGG-G--T-A--T-T-T-A-T-A--A----A-G-T-G-TTT--A-GA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTGT-T-T-C----A-T-T--T-CT-T-ATA-T-A-G---GA---T--AAA-GA-CAA---A-G--TCT-A-GTT-AA--TG-CA-TA-AT-TTTT-T-AT-C--A-AA-CC-TCAAT--TCATTTTTG--AA--A-T--GA-A--TTAG-T-A--AT-AC-G-A-CT--GC---T-T-T-TAA--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA--CAAGCA-A---TTTTT--C-G-A-C--G-AAT----GA----A-GACA-A-A--TT--A-TCAG--C--CG----GAG-AAG-T-A--A-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCTCTTT-A-T--TTTACA-T--A-TAA--GTAGCT-TA---T-GT---C--GC-----G-TA-T--A-ATTG--ATA--A----A--A-G-TA--T-C--G-T--TT-GGA---TAG-T----CA--GG-TTTA---T-A-ATGT-----TT--GCT-A-TGAGG-CA-C-TT---T----TC-----AC-------C------CCCCCAC-CCCCCCCC
gi|110332 : CCCCGTTT-CATCTT-TTT--AAA--T-A-A-ATCAT-----ATGG-T--T-T--T-A-T-A-T-A--AC---A-G-T-G-TTT--A-GA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AAG-CT-AG------A--GTG--T-TTC----A-TCA--T-CT-T-GTA-TTA-G---GA---T--TAA--A-CAA---AG---TCT-A-GAT-TA--TG-CA-TA-AATTTTT-T-AT-C-AA-AA-CC--CAAT--TCA-TTT-G--AAC-A-T--GA-T---TAG-T-A--AT-CA-G-A-CT--GC---T-T-T-T-AA-GCAGTT-G-G-A-T-A-TTAGC---GA--AA-GCA-A---TTTTT--C-G-A-C--G-AAT----GA----AAGA-A-A-A--TT--T-TCACCAC--CG----GAG-AAG-T-A--A-TT-GAAC-CAA-TGAA-CTTTT-CTT-ATTATTTTACA-T--CCTAAT-GTAGCT--A---TAGT---TC-GC-G---G-TA-TT-A-ATTG--AT---A----ACAA-G-TA--T-C-GG-TA-TT-GGA--TTAG-T----C----G-TTTA---T-A-ATG------TTTTGCTTACTG-GG-CA-C-TT---T--AATC-----AC-------A------CACCCCCACCCCCCCCccccc
gi|110334 : CCCCGTTT-GATCTT-TTT--GAA--T-A-A-ATCAT----CATGG-G--T-T--A-T-T-A-T-ACTA----G-G-T-G-TTT--A-GA-AT-TTGA--ACT--A-AA-AGG-CTCAA------A--GTG--T-T-T----A-T-A--A-TC-T-TTA-T-A-GC--GAAT-T--AAA-GA-CAA---AC---TCT-ACGATTAA--TG-CA-TA-A--CTTTCT-AT-C-AA-A--CC-TCATTTATTT-TTTTG--AA--C-T--GA-A---GAG-T-A--ATTACCG-G-ATTAGC---T-T-T-T-AAAGCAGTTTG-G---T-A-TT-TC---GA--AAAGCACA---TTTTTTTC-ACA-C--ACGAT----GAG---A-CA-A-A-A--TC--T-GCAAGCC--CGTAAGGAG-AAC-TGA--A-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT--TT--TTTACA-CTAA-TAACTGTTG---TA---T-GTA--TA-GCAG---G-TG-AT-A-ATAG--AT---AACCGA--A-G-TA--T-C-GG-T--TTGGGA--ATAG-T----CATTGG-TTCACT-T-A-CTG------TT--GCTAA-TT-GG-C--C-TT---TACA-TC-----AT-------A------CCCCCCC-CCCCCCC
gi|110333 : CCCCTTTT-CATCTT-TTT--GGAAAT-A-A-ATCAT-----ATGG-A--T-AT-T-T-T-A-T-A--A----G-G-TGG-TT---A-TA-AT-TTGA--A-T--CTAA-ATG-CT-AG------A--GTGTTT-T-C----A-T-A--T-CT-T-ATG-T-T-G---GAATTT--AAA-GA-CAA---AGG--TCTAA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--ATTT-T-TT-C--A-AA-CC-TCAAT--TTA-TGTTC--AA--ACT--GA-A--AGAG-T-A--AT-A------CT--TT---T-T-T-T-A--GCAGTATA-G-A-T-ATTT-TT---GA--AAAGCA-GGGTTTTTT--CAA-A-CCAA-AAT----GAATACA-GG-A-A-A--TT--T-CT------------------AT-T-ATTA-TT--A-C-AATATAAA--------TT-AGT--TT------------AC-GTA---------T-GT---TA-GC-A---T-TA-TT-G-ATTGATAT---A----A--A-G-TATTT-C-GG-T--TT-GGA---TAT-T----CA--GG-TT-A---T-A-ATG------TT--A-T-A-TG-GG-CC-CTTT---T--A-TT-----ATTAAA---C------CCCCCCC-CCCC
gi|110335 : CCCCTTTA-CAT-TT-TTT--GAA-AT-A-A-G--AT---CTATAG-G--T----T-T-T-A-G-A--A----G-G-T-G-TT---A-GA-AT-TTG---A-T--A-AA-AAGCCT-AT------A--GTG--TAT-C----A-T-A--A-TC-T-ATA-T-A-G---GAAT-T--AAA-GA-CAATCCTGT--TCT-----T-AACTTC-TA-TA-A--TTTT-A-GC-C-AA-AA-
gi|110336 : TT-CATCTTGTTT--GACAAA-A-A-ATCAT---G-ATGG-A--T-A--T-T-TTA-T-C--A----G-G-T-G-TTTCTA-GATAT-TTGA--A-T--A-AA-GGC-CTCAG------A--GTT--T-T-C----AGT-T--T-CT-T-ACA-TGA-G---GA---TT-AAA-AC-CAA---AGA--TC--A-GAT-AA--TG-CA-TA-A--CTTT-T-AT-C-AA-AA-CC-TCAAT-TTTA-TCTTC--AATCA-T--GAGA--AGAG-T-A--AT-AC-G-A-CT--GC---T-T-T-TCA--GCAATTTT-G-G-TCA-TT-TC---GAAGAAAGCA-A---TTATC--T-G-A-T--A-AAT----GA----A-GACA-C-A--TT--T-TCAGCCC--TG----GAG-ATA-T-A--A-TTAGAGC-CA--TGAA-TTCTT-TCT-ATT--TTAACA-T--A-TAAT-ATAGCT-TAT--T-TT---TA-GC-A---G-TA-TCAA-ATTG--AT---A----AACA-G-TA--T-C-GGAT--TT-GG----TAT-T----CA--GG-TT-A---TGA-G---------T--ACT-A-TG-AATCACC-TT---T--A-TC-----AT-------T------ACCCCTC-CCCtaacttcgcttgattgcctaaaa
gi|110337 : --T-T-T-A-TTA--A----G-GAT-G-TTT--A-GA-AT-TTGATAA-T--T-AA-AGG-CTTAG------A--GTG--T-T-C----A-T-AACC-CT-T-AT--T-A-G---GA---TT-AAA-GAGCAA---AAG--TCT-A-GAT-A---TG-CA-TA-A--TTTT-TTAT-C-AA-A--CC-TCAAT--TTA-ATTTC--AA--A-TTGAA-A--AGAG-T-A--AT-GC-G-A-CT--GC---T-T-T-TTA--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC----A--AGAGCA-A---TTTTT--C-G-A-C--A-AAG----AA----A-GA-C-ATA--TT--T-TCAGCCT--GG----TAG-AAC-T-A--ATTT-AA-C-CAT-TGAA-TTTC--TTT-ATT--TTTACA-T--A-TAAT-GTAGCT-TAAT-C-GT---TA-GC-A---GTTA-TT-A-GTTG--ATA--A----A--A-G-TT--T-C-GG-T--TT-GGA---TAG-T----CA--GG-TTCA---T-A-ATG------TT--ACT-A-C--GG-CC-C-TT---T--A-TC-----AT-------T------ACTCCCC-CCCCGCCC
gi|110338 : tTA-T-G-G---AT---T--AAA-GA-CAA---GGG--TTT-A-GAT-AA--TG-TA-TA-A--ATTT-T-AT-C-AA-AA-TC-TCA---ATTA-TTTTC--AA--A-T--GA-A--AGAG-T-A--AT-AC-A-A-CT--GC---T-T-T-TGA--ACA--CTG-G-A-T-A-TT-TC---GA--AAAACA-A---TTTTT--C-G-A-C--A-AAT----GA----A-GACA-C-A--TT---------------------G-AAG-C-A--A-TT-GA-T-CAT-CGAA-TTTTT-TTT-ATT--TTTACA-T--A-TGAT-GTAGCT-TA---T-G
gi|110339 : GTCT--TG----AAA-AAT-T-A--A-TG-GC-C-CAT-TGAA-TTTTT-TTTAATT--TTTACA-T--A-TTTT-GTTGTT-GAAAGT-GT-------C-T---G-TA-AC-ATATT---ATG--A----A--A-G-TA--TGA-GG-T--GT-GGT--TT---T----CA--AG-GTCA---T-T-GTG------AC--GCT-A-TG---------TT---T--G-CC-----ATAGCAA--C------CCCCC
gi|110340 : ----GAC-AAA-T-A--A-TG-GC-C-CAT-TGA--TTTTT-TTT-ATT--TTTACA-T--A-T-TT-GTAGTT-TA---A-GT---AA-GT-GTCTG-TA-AC-GTATT---ATGG-A----A--A-T-TA--T-CAGG-T--AT-GGT--TT---T----CG--G---TCA---T-T-ATG------AC--GCT-A-CG-GT-TA-C-CA---T--A-GC-----AA-------C------CCCC
gi|110341 : A---T-TT---TA-AT-G---G-TA-TT-ACATTG---T---A----T--A-G-CA--T-C-AG-T--TT-GGAAATTAG-T----TA--GG-TTCA---T-A-ATG------TT--ACT-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TCGATTAAC-------C------CCCTCCA-CCCCCCCC
gi|110342 : -ATTG--AT---A----A--AAG-TA--T-C-GG-T--GT-GGA--T-AA-T----CA--GG-TTCA---T-A-ATG------TT--ACT-A-TG-GG-CA-C-TA---T--T-TC-----AT-------
Alignments
lowQualScore : 11 1 1 22222222222222
lowQualScore : 1 1 2222 1 1 1 1 1 1 3 88 55555 1 22 7777 444 1 9 1 1 22 444 1 1 1 1 222 1 1 22 1 22 1 1 3 6 666666 22 4 3 44 4444 1 4 33 1 1 1 3 333 444 1 33 1 1 1 222 22 4 3 22 1 1 1 33 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 5555555 44 1 222 1 22 3 22 1 1 44 1 1 1 444 1 1 1 5 55 1 1 1 1 1 1 333 55 1 666 22 3 1 1 22 1 5555 1 1 22 66 9 44 22 1 33333333 1 22 1 3 3 1 1 22 1 3 22 1 3 44 1 1 6666 666 4 1 222 8888888888 1 1 333 1 1 22 1 444 1 1 22 3 1 1 44 22 444 3 33 5555 22 1 44 3 666666 22 1 3 4444 1 3 3 222 22 3 44444 88888888888888 1
lowQualScore : . . .... . . . . . . . .. ..... . .. .... ... . . . . .. ... . . . . ... . . .. . .. . . . . ...... .. . . .. .... . . .. . . . . ... ... . .. . . . ... .. . . .. . . . .. . . . . . . . . . . . ....... .. . ... . .. . .. . . .. . . . ... . . . . .. . . . . . . ... .. . ... .. . . . .. . .... . . .. .. . .. .. . ........ . .. . . . . . .. . . .. . . .. . . .... ... . . ... .......... . . ... . . .. . ... . . .. . . . .. .. ... . .. .... .. . .. . ...... .. . . .... . . . ... .. . ..... .............. .
lowQualScore : 6 6 4444 6 6 6 6 6 6 2 66 66666 6 22 0000 222 5 2 5 5 11 222 5 5 5 5 777 5 5 11 5 11 5 5 1 2 000000 11 6 1 44 8888 5 6 77 5 5 5 0 222 666 5 55 5 5 5 666 00 6 1 11 5 5 5 77 5 5 5 5 5 5 5 7 7 7 7 1111111 00 7 666 7 33 3 33 7 7 11 7 7 7 888 7 7 7 7 99 7 7 7 7 7 7 000 99 7 111 44 5 7 7 44 7 4444 7 7 44 22 1 11 44 7 88888888 7 77 7 3 3 7 7 99 7 3 33 7 3 00 7 7 9999 666 8 6 888 4444444444 6 6 888 7 7 33 7 666 7 7 33 3 7 7 00 33 666 3 88 2222 33 7 66 3 555555 33 7 3 1111 7 3 3 999 33 3 22222 22222222222222 9
consensus : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGG-G--T-A--T---T-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG-T-T--C----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-A-T-TTATTTT---C---AA--A-T--GA-A--AGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA--AAAGCA-A---TTTTT--C-G-A-C--A-AAT----GA-A-G--A-CACA--TT--T-TCAGCCC--CG----GAG-AA-NT-AATT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TGTAGCT----TA---TGT-TA-G---C-G--------GT-A-TT-A-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AG-T----CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AC-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TC-----AT-------C------CCCCCCC-CCCCCCCC
Reference ( family-626 ) : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGG-G--T-A--T---T-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG-T-T--C----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-A-T-TTATTTT---C---AA--A-T--GA-A--AGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA--AAAGCA-A---TTTTT--C-G-A-C--A-AAT----GA-A-G--A-NA-A--TT--T-TCAGCCC--CG----GAG-AA-NT-AATT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TGTAGCT----TA---TGT-TA-G---C-G--------GT-A-TT-A-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AG-T----CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AC-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TC-----AT-------C------CCCCCCC-CCCCCCCC
gi|110312 : CCCCCGTTT-CATCTT-TTT--G-A-AGA-TA-A-TT-C-ATTCA-----TGG-G--T-A--T---T-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TT---AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG-T-T--C----A-T-A--TTT-T-A-TA-T-A-G---G-A---T-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-A-TATTATTTT---G---AA--A-T--GA-A--AGAG-TA--A-T-AC--G-G-CT-GC---T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA--AAAGCA-A---TTTTT--C-G-A-C--A-AAT----GA-A-G--A-AA-A--TT--T-TCAGCCC--CG----GAG-AA-CT-AATT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-CGTAGCT----TA---TGT-TA-G---C-G--------GT-A-TC-A-ATTG-A-T----A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--AT--T-AG-T----CA--GG-TTCA--T-AGTG------TT--GC-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TC-----AT-------C------CCCCCCC-CCCCCCCC
gi|110313 : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-T-AT--A-----TTG-G--T-T--T---T-T-AAT-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AT------A--GTG-T-TT-C----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-T-G---G-A--TT-AAA-AA---G---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-A-T-TCATTTT---A---AA--A-T--GA-A--AGAG-TATAG-T-AT--G-A-CT-GC---T-T-T-T-AA-GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA--AAAGCA-A---TTTTT--C-G-A-C--A-AAT----GA-A-G--A-CACA--TT--T-TCAGCCC--CG----GTG-AA-GT-AATT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-CTT--TTTAC-A-T--A-TAA-TGTAGCT----AA---TGC-TA-GTAGC-G--------GT-A-TT-G-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AT-T----CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AC-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TC--------------C------CCCCCTC-CCC
gi|110314 : CTCCTATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGG-G--T-A--T---T-TTA-T-A--G---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTTT----T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG-T-T--TT---A-T-A--TCT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-AA-CAA---ATG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TATT-T-A-T-C-AA-AA-CA-TCA---T-TCATTTT---C---AA--A-T--GA-A--AGGG-TA--A-T-AT--G-A-CT-GC---T-T-T-TTA--GCAGTTTG-G-A-T-G-TT-TC---GA--AAATCA-A---TTTTT--C-G-A-C--A-AAT----GA-A-G--A-CGCA--TT--T-TCAGCCC--CG----GAG-AA-GT-AATT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TATAGCT----TA---TGT-TA-G---C-G--------GT-A-TT-G-ATTG-A-T--A-A---A-GG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AG-T----CG--GG-TTCA--T-AATG------TT--AG-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TT-----AT-------C------CCCCCAC-TCCC
gi|110315 : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AA--A-----TGG-G--T-AC-T---T-T-A-T-A--A---G-G-G-G-ATA--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG-T-TT-C----A-T-A--TGT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TATA-GAT-AA--TG-CA-TA-C--TTTT-T-A-T-C-AA-A--CC-TCA-A-T-TTATTTT---C---AA--A-T--AA-A--AGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-TTA--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---AA--AAAACA-C---TTTTT--T-G-A-C--A-AAT----GA-A-G--A-CACA--CT--T-TCAGCTC--CA----GAG-AA-CT-AATT-AA-C-CGT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-A--T-TGA-TGTAGCT----TT---TGT-TG-G---C-G--------GT-A-TT-A-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-TGGTTGG--A---T-AGTT----CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--GC-T-ATTG-GC-CA-C-TT---T--A-TC-----ATAAA----C------CCCCCCC-CCCCC
gi|110316 : CCCTCATTT-CATCTT-T----G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGG-A--T-A--T---T-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TT---AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-TGG-CT-AG------A--GTG-T-T--C----A-T-A--TCT-T---TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA--AT-AA--TG-CA-TA-A--TTCA-T-T-T-C-AATAA-CC-TCA-A-T-TTATTTT---C---AA--A-----A-A--AGAG-TA--ATT-AC--G-A-CT-GCT--T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA--AATGCA-A---TTTTT--T-G-A-T--A-AAT----GA-A-G--A-CA-C--AT--T-TCAGCCA--TG----GAG-AA-GT-AATT-GA-C-CAT-TGAATTTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TATAGCT----TA---TGT-TA-G---C----------GT-A-TT-A-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGC--A---T-AT-T----CA--GG-TTCA--T-AATG------AT--AC-T-A-TG-GA-CA-C--T---T--A-TC-----AT-------T------ACCCCCC-CCCCCCCC
gi|110317 : CCTCCATTTTCATCTT-TTTCTG-A-A-A-TA-A-ATTC-AT--A-----TGG-G--T-A--T---T-TTA-T-A--A---G-G-T-G-TT---AGA-AT-TTGA--A-T--A-ATTAGG-CT-AG------A--GTG-T-TT-C----A-T-A--TCT-TTG-TA-T-A-G---G-AA-TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA--AT-AA--TG-CC-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-A-T-TTATTTT---C---AA--A-A--TA-A--AGAG-TA----T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-TTA--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA--AAAGCA-A---TTTTT--CAG-A-C--A-AAT----GA-A-G--G-GACA--TT--T-TCTGCCC--C-----GAG-AA-CT-AATT-GA-C-CAT-TAAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TGTAGCT----TA---TGT-TA-G---C-A--------GT-A-TT-A-ATTT-A----A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AG-TCATGCA--GG-TTCA--T-AAT-------TT--AC-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--T-TC-----AT-------CATTAATCCCCTCT-CC
gi|110318 : CCCCCATTT-CAT--T-TTT--A-A-A-A--A-A-AT----------------------A--T---T-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AAA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTA-T-TT-C----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-T-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---GGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-C--TTTT-T-A-T-A-AA-AA-CC-TTC-A-T-TTTTTTTTTTC---AA--A-T--GA-A--AGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-TTA--GCAGTTTA-G-A-T-A-TT-TC---GA--AAAGCA-A---TTTTT--C-G-A-C--C-AAT----GA-A-G--A-CACA--TT--T-TCAGCCC--CG----GAG-AG-GT-AATT-CA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TCTAGCT----TA---TGT-TA-G---C-G--------GT-A-TT-G-ATTG-A-T----A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AG-TC---CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AT-T-A-TG-GG-CA-CTTT---T--A-TT-----ATTAA----C------ACCCTCT-ACCCCCC
gi|110319 : CCCCAATTT-CATGTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TAG-G--T-AC-T---T-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A----A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG-T-T--TTTCAA-TGA--TGT-T-A-TA-T-ATG---G-A--T--AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-G--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-A-T-TTATTTT---C---AA--A-T--AA-AAGAGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---TAT-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---TA--AAAGCG-A---TTCTT--C-G-A-C----AAT----GA-A-G--A-CACAT-TT--T-TCAGCCC--CA----GAT-AA-CT-AATT-GA-C-CAT-TGAA-TTCTT-TTT-AAT--TTTAC-AGT--A-TAA-ATTAGCT----TA---TGT-AA-G---C-A--------GT-A-TT-A-A-TA-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AT-T----CA--AG-TTC--------G------TT-----T-A-TG-GG-CAGC-TT---T--A-TC-----ATATTACAAC------CCCCCCC-CCC
gi|110320 : CCCCCGTTT-CATCTT-TTT--G---A-A-TA-A-AT-A-A---A-----TGG-G--T-AT-T---T-T-A-T-A--A---GCG-T-G-TTT--AGA-AT-TTAA--A-T--A-AA-AGG-CT-AGT-----A--GT--T-T--C----A-T-A--TCT-T-A--A-T-A-G---G-A--TTAAAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--ATGT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-A-T-TTATTTT---G---AA--T-T--GA-A--AGAA-TA--A-T-ATG-G-A-CT-GC---T-T-T-TAA--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA--AAAGCA-A---TTTTT--T-G-A-C--A-AATTGAAGA-A-A--A-AA-A--TT--T-TCAGCCC--GG----GAG-AACTT-AATT-GA-CACAT-TGAA-TTTCT-TTT-A-T--TTTAC-ATT--A-TAA-TGTAGCT----AA---TGTCTA-G---C-G--------AT-A-TT-A-ATTG-ATT--G-A---A-AGTTA--TAA-GG-T--TT-G--A---T-AG-T----CA--GGTTTCA--T-AAT-------TT--GC-T-A--G-GG-CA-C-TTTTAT--A-TT-----AC-------T------CCCCCCC-CCCCC
gi|110321 : CCCCCATTT-CA-CTT-TTT----A-A-A-TA-A--T-C-A---A-----TGG-G--T----T---T-T-A-T-A--A---A-A-TTG-TTT--AGG-AT-TGGA--A-TTCA-AA-AGG-CT-TG------ACTGTA-T-T--C----A-T-A--TCTCT-A-TA-C-G-G---A-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA----CTTT-T-A-T-C-AA-AAACC-TCATC-T-TTATT-----C---AA-------GA-C--AGAG-TC--A-T-AC--G-A-CC-GC---T-T-T---A--TCAGTTTG---A-T-A-TT-TC---GA--AGAGCA-A---TTTT---C-G-A-C--A-AAT----AA-A-G--A-CATA--GT--T-TCAGCCG---G----GAG-AA-CT-ACTT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT------TTTAC-A-T--A-TAA-TGCAGCT----TA---TG--TA-G---C-A--------GT-AGTT-G-ATTG-A-T--A-A---A-AT-TA--T-T-GG-T--TTAG--A---TGAG-T----CA---G-TTCA--TCAATG------TT--AC-T-A-T--GG-CA-C-TT---T--A-TC-----ATTA-----C------ACCCCCC-CCCCCCCC
gi|110322 : CCCCCATTT-AATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A--T-T-ATT-A-----TTG-G--T-A--TG--T-T-A-T-A--A---G-G-G-G-TTT--AGC-AT-TTTA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG-T-TT-C----A-T-A--CTT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-A-T-TTATTTT---C----A--A-T---A-A--AGAT-TA--A-T--C--G-A-CT--CTTAT-T-C-T-A---CA-TTT--G-A-T-A--T-TC---AAC-AAATCA-A---TTTTT--C-G-ACC--A-AAT----TA-A-A--A-CT-A--TT--T-TC-GCCC--TG------A-AA-CT-AA-T-AA-C-CAT-TGA---TTC--TTT-ATT--TTTAC-A-------AA-AGTAGC-----TA---T-T-TA-G---C-A--------TT-A-TT-G-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--C----G-T--TTGG--A---T-A--T----CA--GG-TCCAACT-AATGTCTACATT--AC-T-A-C--GG-CT-C-TT---T--A-TC-----ATTA-----C------ACCCCCC-CCACCCC
gi|110323 : CCCCC--TT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TAGA-AT-C-AT--------TGG-GAAT-A--T---TAT-A-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-T-GA--A-T--A-AG-A----T-AG------A--GTG-T-T-------A-T-A--ATC-T-A-TACT-A-G---A-----T-AAA-GA-CGA---AGG--T-TA-GAT-TA--TGGCA-TA-----TGT-T-A-TTC-GA-AA-CC-TCA-A-T-TTATTTT---G---AA--A-T--GA-A--AT-G-TA--A-T-AC--GCA-TC-GC---T-T-T-A-A--G-AGTTTG-G-AGT-A-TT-TT---GA--A--GCA-A---TTTTT--C-G-A-C--A-AAT----GA-A-G--ACAA-A--TT--T-TCAG-CC--CG----GAG--A-CT--ATT--A-C-CAT-TGAT-TTCCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T----T-A-TGTAGCT----TA---TGT-TC-G---C-G--------AT-A-TT---ATTG---T--A-A---A-CG-TA--T-C-GG-T--TGGA--A---T-AT-T----CG--GT-TTCA--T-AATG------TT--GC-T-G--A-GG-CA-C-TT---T--A-TT------T-------A------CCCCCCC-CCCCCCC
gi|110324 : CCCCAATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TAG-G--C-A--T---T---A-T-T--A---G-A-T---TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CTTAG------A--GTGCT-T--C----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-T-GTTGG-A--TT-AAA-GA-CAA----GG--TCTA-GGT-AA--TA-CA-TA-A--TTTT-T-ATT-C-AA-AA-CC-TCA-A-T-TTA-TTT---C---AA--A-T--TA-A--AGAGTTA--A-T-A---G-A-CT-GC---T-TCT-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TCAAAAA--AAAGCC-ATTGTTTTT--T-G---C--A-AAT----AA-A-G--A-CACA--TTTGT-TCAGCCCCACG----GAA-AA-GT-AATT-GA-C-CAT-TGA---TTTT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-AAA-TG-AGCT----TA---TGT-TA-G---C-A--------GT-A-T
gi|110325 : CCCTCATGT-TATCTT-TTT--G-A-A-A----A-AT-CTAT--AA----TGG-A--TTAGTT---T-T-A-T-A--------G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--T-AA-AGG--T-AG------A--GTGTT-T--C----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-G-A---G-A--TT-AAACGA-CAA---AGGTTTCTAGGATAAA--TG-CACTA-A--TTTT-T-A-T-C-CA-AA-CCGTCA-A-T-TTATTTT---C---AAC-A-T--GC-A--AGAGTTA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-TGT-A--GCCATTTGAG-A-T-A-TT-TC---AAC-AAAGCA-A---TTTTT--T-G------A-AATC---GA-A-GACA-CA-A--TT--TCTCA-CAC--TG----CAGAAA-GT-AA-T-GA-C-CATATGA---TTCT-TTTAACT--TTTAC-A-TG-A-TGA--ATA-CTA---TA---TGT-TACG---C-G--------TT---TT---ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C----T--TTGG--A---T-AT-T----CA--GG-TTTA--TCAATG------AT--AC-T-A-T--GA-CA-C-TT---T--A--C-----AT-------T------ACCCCCC-CCCTCCCC
gi|110326 : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-AATA-A-AT-TTATT-A-----TGG-G--T-G--T---T-T-G-T-A--A---G-G-T-G-TTT--ATA-ATCTTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AA------T--GTG-T-TT-C----A-TCA--TCT-T-AATA-T-A-G---A-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TATA--TTTT-T-A-T-C-AA-A---C-TCA-A-----ATT------------------------AGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-T-A--GCAGTTTG-GAA-T-A-TT-TC---T---AAAGCG-A---TTTTT--C-G-A-T--A-AAT----GA-A-G--A-CA-GCCTT--T-TCAGC
gi|110327 : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--T-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--AATTTATGG-G--T-A--T---T-TTA-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AGCTATAGA--GTG-T-TT-C----A-T-A--CCT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-TA-AA-CC-TCA-A-T-TTATTTT---C---AA--A-T--GA-A--AGAG-TA--A-T-
gi|110328 : CCCCCATTT-CATCTG-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGGTA--T-A--T---T-T-A---A--ACCCC-G-T-ATTTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-GA-GGGAGT-AG------A--GCT-T-T--C----A-T-A--TCT-T-A-TATT-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CTA---AGT--TC---AAT-AA--TG-CA--A-A--AATT-T-A-T-CTAA-AA----TCA-----TTATTTT---C---AA--A-C----------------------C--G-ATCT-G----T-T-T-T-A--TCAG--TG-G-G-T-A--T-TC---GA--A---CA-A---TTTTT--C-G--------------------G--A-CA-A--AT--T-T------------------AA-AC-AA---------AT-TGAA--TTCT-TTT-A-T--TTTAC-A-T--A-TAA-T-TAGCT----T----TGTGTA-C---C-A--------G--A-TT-A-ATTG-A-TAAA-A---A-AG-TA--T-C--G-T--TT-A--A---T-AG-T----CT--AG-TTC-----AAT-------TT--ACGT-A-T--TG-CA-C-TT---T--ATTC-----ATTTA----C------CCCTCCC-CCCCCC
gi|110329 : CCCCCATTT-CATCTT---------------A-A-AT-T-AT--A-----TTG-G--T-A--T---T-TTA-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--ATG-TGT--C----A-T-A--CCT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-
gi|110330 : CTCCCATTT-GATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TAT-G--C-A--TATTT-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TTA--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT----------------T-T--C----A-T-A--CCT-T-A-TA-T-T-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCT
gi|110331 : CCCCGTTT-CATCTT-TTT----A-A-A-TA-A-AT-C-TA--A-----TGG-G--T-A--T---T-T-A-T-A--A---A-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTGTT-T--C----A-T-T--TCT-T-A-TA-T-A-G---G-A---T-AAA-GA-CAA---A-G--TCTA-GTT-AA--TG-CA-TA-AT-TTTT-T-A-T-C--A-AA-CC-TCA-A-T-TCATTTT---TG--AA--A-T--GA-A--TTAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-TAA--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA--CAAGCA-A---TTTTT--C-G-A-C--G-AAT----GA-A-G--ACAA-A--TT--A-TCAG--C--CG----GAG-AA-GT-AATT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCTCTTT-A-T--TTTAC-A-T--A-TAA--GTAGCT----TA---TGT-C--G---C----------GT-A--T-A-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C--G-T--TTGG--A---T-AG-T----CA--GG-TTTA--T-AATGT-----TT--GC-T-A-TGAGG-CA-C-TT---T----TC-----AC-------C------CCCCCAC-CCCCCCCC
gi|110332 : CCCCGTTT-CATCTT-TTT----A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGG-T--T-T--T---A-T-A-T-A--AC--A-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AAG-CT-AG------A--GTG-T-TT-C----A-TCA--TCT-T-G-TA-TTA-G---G-A--TT-AAA----CAA---AG---TCTA-GAT-TA--TG-CA-TA-AATTTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC--CA-A-T-TCATTTG---A---AC--A-T--GA-T---TAG-TA--A-T-CA--G-A-CT-GC---T-T-T-T-AA-GCAGTT-G-G-A-T-A-TTAGC---GA--AA-GCA-A---TTTTT--C-G-A-C--G-AAT----GA-AAG--A-AA-A--TT--T-TCACCAC--CG----GAG-AA-GT-AATT-GAAC-CAA-TGAA-CTTTT-CTT-ATTATTTTAC-A-T--CCTAA-TGTAGCTA---TA----GT-TC-G---C-G--------GT-A-TT-A-ATTG-A-T--A-AC--A-AG-TA--T-C-GG-TA-TTGG--A---TTAG-T----C----G-TTTA--T-AATG------TTTTGC-TTACTG-GG-CA-C-TT---T--AATC-----AC-------A------CACCCCCACCCCCCCCccccc
gi|110333 : CCCCTTTT-CATCTT-TTT--GGA-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGG-A--T-A--T---T-TTA-T-A--A---G-G-T-G-GTT--ATA-AT-TTGA--A-T--CTAA-ATG-CT-AG------A--GTG-T-TTTC----A-T-A--TCT-T-A-TG-T-T-G---G-AATTT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTAAGAT-AA--TG-CA-TA-A--ATTT-T-T-T-C--A-AA-CC-TCA-A-T-TTATGTT---C---AA--ACT--GA-A--AGAG-TA--A-T-------A-CT-TT---T-T-T-T-A--GCAGTATA-G-A-T-ATTT-TT---GA--AAAGCA-GGGTTTTTT--CAA-A-CCAA-AAT----GA-A-T--A--------------CAG-------------G-AA-AT---------------------TTCT-ATT-ATT--ATTACAA-T--A-TAA-ATTAGTTTACGTA---TGT-TA-G---C-A--------TT-A-TT-G-ATTG-A-T--ATA---A-AG-TATTT-C-GG-T--TTGG--A---T-AT-T----CA--GG-TT-A--T-AATG------TT--A--T-A-TG-GG-CC-CTTT---T--A-TT-----ATTAAA---C------CCCCCCC-CCCC
gi|110334 : CCCCGTTT-GATCTT-TTT--G-A-A---TA-A-AT-C-ATC-A-----TGG-G--T-T--A---T-T-A-T-ACTA---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--ACT--A-AA-AGG-CTCAA------A--GTG-T-T--T----A-T-AA-TCT-T---TA-T-A-GCG-A-A--TT-AAA-GA-CAA---AC---TCTACGATTAA--TG-CA-TA-A--CTTTCT-A-T-C-AA-A--CC-TCA---T-TTATTTT---TTTGAA--C-T--GA-A---GAG-TA--A-TTACCGG-A-TTAGC---T-T-T-T-AAAGCAGTTTG-G---T-A-TT-TC---GA--AAAGCACA---TTTTTTTC-ACA-C--ACGAT----GAGA-C--A-AA-A--TC--T-GCAAGCC--CGTAAGGAG-AA-CTGAATT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT--TT--TTTAC-A-CTAA-TAACTGTTG------TA---TGTATA-G---CAG--------GT-G-AT-A-ATAG-A-T--A-ACCGA-AG-TA--T-C-GG-T--TTGGGAA---T-AG-T----CATTGG-TTCACTT-ACTG------TT--GC-TAA-TT-GG-C--C-TT---TACA-TC-----AT-------A------CCCCCCC-CCCCCCC
gi|110335 : CCCCTTTA-CAT-TT-TTT--G-A-A-A-TA-AGAT-C--T--A-----TAG-G--T----T---T-T-A-G-A--A---G-G-T-G-TT---AGA-AT-TTG---A-T--A-AA-AAGCCT-AT------A--GTG-TAT--C----A-T-A--ATC-T-A-TA-T-A-G---GAA--TT-AAA-GA-CAATCCTGT--TCT----T-AACTTC-TA-TA-A--TTTT-A-G-C-C-AA-AA-
gi|110336 : TT-CATCTTGTTT--G-ACA-A-AA-A-AT-C-ATG-A-----TGG-A--T-A--T---T-TTA-T-C--A---G-G-T-G-TTTCTAGATAT-TTGA--A-T--A-AA-GGC-CTCAG------A--GTT-T-T--C----AGT-T--TCT-T-A-CA-TGA-G---G-A--TT-AAA-AC-CAA---AGA--TC-A-GAT-AA--TG-CA-TA-A--CTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-ATT-TTATCTT---C---AATCA-T--GAGA--AGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-TCA--GCAATTTT-G-G-TCA-TT-TC---GAAGAAAGCA-A---TTATC--T-G-A-T--A-AAT----GA-A-G--A-CACA--TT--T-TCAGCCC--TG----GAG-AT-AT-AATTAGAGC-CA--TGAA-TTCTT-TCT-ATT--TTAAC-A-T--A-TAA-TATAGCT----TAT--TTT-TA-G---C-A--------GT-A-TCAA-ATTG-A-T--A-A---ACAG-TA--T-C-GGAT--TTGG------T-AT-T----CA--GG-TT-A--T-GA-G-------T--AC-T-A-TG-AATCACC-TT---T--A-TC-----AT-------T------ACCCCTC-CCCtaacttcgcttgattgcctaaaa
gi|110337 : --T---T-T-A-TTA--A---G-GAT-G-TTT--AGA-AT-TTGATAA-T--T-AA-AGG-CTTAG------A--GTG-T-T--C----A-T-AACCCT-T-A-T--T-A-G---G-A--TT-AAA-GAGCAA---AAG--TCTA-GAT-A---TG-CA-TA-A--TTTT-TTA-T-C-AA-A--CC-TCA-A-T-TTAATTT---C---AA--A-TTGAA-A--AGAG-TA--A-T-GC--G-A-CT-GC---T-T-T-TTA--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC----A--AGAGCA-A---TTTTT--C-G-A-C--A-AAG----AA-A-G--A-CATA--TT--T-TCAGCCT--GG----TAG-AA-CT-AATTTAA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TT--ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TGTAGCT----TAAT-CGT-TA-G---C-A--------GTTA-TT-A-GTTG-A-T--A-A---A-AG-TT--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AG-T----CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AC-T-A-C--GG-CC-C-TT---T--A-TC-----AT-------T------ACTCCCC-CCCCGCCC
gi|110338 : t-TA-T---G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---GGG--TTTA-GAT-AA--TG-TA-TA-A--ATTT-T-A-T-C-AA-AA-TC-TCA-A---TTATTTT---C---AA--A-T--GA-A--AGAG-TA--A-T-AC--A-A-CT-GC---T-T-T-TGA--ACA--CTG-G-A-T-A-TT-TC---GA--AAAACA-A---TTTTT--C-G-A-C--A-AAT----GA-A-G--A-CACA--TT---------------------G-AA-GC-AATT-GA-T-CAT-CGAA-TTTTT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TGA-TGTAGCT----TA---TG
gi|110339 : GTCT--TG----AAA-AA-TT-AATG-GC-C-CAT-TGAA-TTTTT-TTTAATT--TTTAC-A-T--A-TTT-TGTTGTT----GAAAGTGT-CT-G---T-A--------AC-A-T----ATT--A-T--G-A---A-AG-TA--TGA-GG-T--GTGG------T-TT-T----CA--AG-GTCA--T-TGTG------AC--GC-T-A-TG---------TT---T--G-CC-----ATAGCAA--C------CCCCC
gi|110340 : ----GAC-AA-AT-AATG-GC-C-CAT-TGA--TTTTT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-T-T-TGTAGTT----TA---AGT-AA-G---T-GTCTGTAACGT-A-TT-A---TG------G-A---A-AT-TA--T-CAGG-T--ATGG------T-TT-T----CG--G---TCA--T-TATG------AC--GC-T-A-CG-GT-TA-C-CA---T--A-GC-----AA-------C------CCCC
gi|110341 : A---TTT-TA-A---T-G--------GT-A-TT-ACATTGTA-T--A--------G-CA--T-C-AG-T--TTGG--AAATT-AG-T----TA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AC-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TCGATTAAC-------C------CCCTCCA-CCCCCCCC
gi|110342 : -TA-A---C-A--------AT-A-AT-G-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--GTGG--A---T-AA-T----CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AC-T-A-TG-GG-CA-C-TA---T--T-TC-----AT-------
Alignments
lowQualScore : 11 111 1 22222222222222
lowQualScore : 1 1 2222 1 1 1 1 1 1 3 88 55555 1 22 7777 444 1 9 1 1 22 444 1 1 1 1 222 1 1 22 1 22 1 1 3 6 666666 22 6 3 44 3333 1 4 33 1 1 1 3 333 444 1 33 1 1 1 222 22 4 3 22 1 1 1 33 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 5555555 44 1 222 1 22 3 22 1 1 44 1 1 1 000 1 1 1 0 55 1 1 1 1 1 1 333 3 22 1 666 22 3 1 22 1 1 22 22 44 55 22 333 3333 1 33 1 1 1 3 1 1 22 1 3 22 1 3 44 1 1 6666 666 777 1 8888888888 1 1 333 1 1 22 1 444 1 1 22 3 1 1 44 22 444 3 33 5555 22 1 44 3 666666 22 1 3 4444 1 3 3 222 22 3 44444 88888888888888 1
lowQualScore : . . .... . . . . . . . .. ..... . .. .... ... . . . . .. ... . . . . ... . . .. . .. . . . . ...... .. . . .. .... . . .. . . . . ... ... . .. . . . ... .. . . .. . . . .. . . . . . . . . . . . ....... .. . ... . .. . .. . . .. . . . ... . . . . .. . . . . . . ... . .. . ... .. . . .. . . .. .. .. .. .. ... .... . .. . . . . . . .. . . .. . . .. . . .... ... ... . .......... . . ... . . .. . ... . . .. . . . .. .. ... . .. .... .. . .. . ...... .. . . .... . . . ... .. . ..... .............. .
lowQualScore : 6 6 4444 6 6 6 6 6 6 2 66 66666 6 22 0000 222 5 2 5 5 11 222 5 5 5 5 777 5 5 11 5 11 5 5 1 2 000000 11 2 1 44 3333 5 6 77 5 5 5 0 222 666 5 55 5 5 5 666 00 6 1 11 5 5 5 77 5 5 5 5 5 5 5 7 7 7 7 1111111 00 7 666 7 33 3 33 7 7 11 7 7 7 000 7 7 7 4 99 7 7 7 7 7 7 000 5 44 7 111 44 5 7 44 7 7 44 44 77 99 44 555 5555 7 22 7 7 7 3 7 7 99 7 3 33 7 3 00 7 7 9999 666 666 6 4444444444 6 6 888 7 7 33 7 666 7 7 33 3 7 7 00 33 666 3 88 2222 33 7 66 3 555555 33 7 3 1111 7 3 3 999 33 3 22222 22222222222222 9
consensus : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGG-G--T-A--T---T-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG-T-T--C----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---C---AA--A-T--GA-A--AGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--AAGCA-A---TTTTT--C-GA-C--AAA-T-GA--AG--ACA-CA--TT--TTCAGCCC--CG----GAG-AA-NT-AA-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TGTAGCT----TA---TGT---TA-GC-G--------G-TA-TT-A-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AG-T----CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AC-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TC-----AT-------C------CCCCCCC-CCCCCCCC
Reference ( family-626 ) : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGG-G--T-A--T---T-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG-T-T--C----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---C---AA--A-T--GA-A--AGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--AAGCA-A---TTTTT--C-GA-C--AAA-T-GA--AG--ACA-CA--TT--TTCAGCCC--CG----GAG-AA-NT-AA-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TGTAGCT----TA---TGT---TA-GC-G--------G-TA-TT-A-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AG-T----CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AC-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TC-----AT-------C------CCCCCCC-CCCCCCCC
gi|110312 : CCCCCGTTT-CATCTT-TTT--G-A-AGA-TA-A-TT-C-ATTCA-----TGG-G--T-A--T---T-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TT---AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG-T-T--C----A-T-A--TTT-T-A-TA-T-A-G---G-A--T--AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-ATATT-ATTTT---G---AA--A-T--GA-A--AGAG-TA--A-T-AC--G-G-CT-GC---T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--AAGCA-A---TTTTT--C-GA-C--AAA-T-GA--AG--AAA--A--TT--TTCAGCCC--CG----GAG-AA-CT-AA-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-CGTAGCT----TA---TGT---TA-GC-G--------G-TA-TC-A-ATTG-A-T----A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--AT--T-AG-T----CA--GG-TTCA--T-AGTG------TT--GC-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TC-----AT-------C------CCCCCCC-CCCCCCCC
gi|110313 : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-T-AT--A-----TTG-G--T-T--T---T-T-AAT-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AT------A--GTG-T-TT-C----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-T-G---G-A--TT-AAA-AA---G---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TC-ATTTT---A---AA--A-T--GA-A--AGAG-TATAG-T-AT--G-A-CT-GC---T-T-T-T-AA-GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--AAGCA-A---TTTTT--C-GA-C--AAA-T-GA--AG--ACA-CA--TT--TTCAGCCC--CG----GTG-AA-GT-AA-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-CTT--TTTAC-A-T--A-TAA-TGTAGCT----AA---TGCTAGTA-GC-G--------G-TA-TT-G-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AT-T----CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AC-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TC--------------C------CCCCCTC-CCC
gi|110314 : CTCCTATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGG-G--T-A--T---T-TTA-T-A--G---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTT---T-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTGTT-T--T----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-AA-CAA---ATG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TATT-T-A-T-C-AA-AA-CA-TC--AT-TC-ATTTT---C---AA--A-T--GA-A--AGGG-TA--A-T-AT--G-A-CT-GCT--T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-G-TT-TC---GA-A--AATCA-A---TTTTT--C-GA-C--AAA-T-GA--AG--ACG-CA--TT--TTCAGCCC--CG----GAG-AA-GT-AA-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TATAGCT----TA---TGT---TA-GC-G--------G-TA-TT-G-ATTG-A-T--A-A---A-GG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AG-T----CG--GG-TTCA--T-AATG------TT--AG-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TT-----AT-------C------CCCCCAC-TCCC
gi|110315 : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AA--A-----TGG-G--T-AC-T---T-T-A-T-A--A---G-G-G-G-ATA--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG-T-TT-C----A-T-A--TGT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TATA-GAT-AA--TG-CA-TA-C--TTTT-T-A-T-C--A-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---C---AA--A-T--AA-A--AGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GCT--T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---AA-A--AAACA-C---TTTTT--T-GA-C--AAA-T-GA--AG--ACA-CA--CT--TTCAGCTC--CA----GAG-AA-CT-AA-TT-AA-C-CGT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-A--T-TGA-TGTAGCT----TT---TGT---TG-GC-G--------G-TA-TT-A-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-TGGTTGG--A---T-AGTT----CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--GC-T-ATTG-GC-CA-C-TT---T--A-TC-----ATAAA----C------CCCCCCC-CCCCC
gi|110316 : CCCTCATTT-CATCTT-T----G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGG-A--T-A--T---T-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TT---AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-TGG-CT-AG------A--GTG-T-T--C----A-T-A--TCT-T---TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA--AT-AA--TG-CA-TA-A--TTCA-T-T-T-C-AATAA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---C---AA--A-----A-A--AGAG-TA--ATT-AC--G-A-CT-GCT--T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--ATGCA-A---TTTTT--T-GA-T--AAA-T-GA--AG--ACA-CA---T--TTCAGCCA--TG----GAG-AA-GT-AA-TT-GA-C-CAT-TGAATTTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TATAGCT----TA---TGT---TA-GC----------G-TA-TT-A-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGC--A---T-AT-T----CA--GG-TTCA--T-AATG------AT--AC-T-A-TG-GA-CA-C--T---T--A-TC-----AT-------T------ACCCCCC-CCCCCCCC
gi|110317 : CCTCCATTTTCATCTT-TTTCTG-A-A-A-TA-A-ATTC-AT--A-----TGG-G--T-A--T---T-TTA-T-A--A---G-G-T-G-TT---AGA-AT-TTGA--A-T--A-ATTAGG-CT-AG------A--GTG-T-TT-C----A-T-A--TCT-TTG-TA-T-A-G---G-AA-TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA--AT-AA--TG-CC-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---C---AA--A-A--TA-A--AGAG-T---A-T-AC--G-A-CT-GCT--T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--AAGCA-A---TTTTT--CAGA-C--AAA-T-GA--AG--GGA-CA--TT--TTCTGCCC--C-----GAG-AA-CT-AA-TT-GA-C-CAT-TAAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TGTAGCT----TA---TGT---TA-GC-A--------G-TA-TT-A-ATTT-A----A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AG-TCATGCA--GG-TTCA--T-AAT-------TT--AC-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--T-TC-----AT-------CATTAATCCCCTCT-CC
gi|110318 : CCCCCATTT-CAT--T-TTT--A-A-A-A--A-A-AT----------------------A--T---T-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AAA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTA-T-TT-C----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-T-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---GGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-C--TTTT-T-A-T-A-AA-AA-CC-TTC-AT-TT-TTTTTTTTC---AA--A-T--GA-A--AGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-TTA--GCAGTTTA-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--AAGCA-A---TTTTT--C-GA-C--CAA-T-GA--AG--ACA-CA--TT--TTCAGCCC--CG----GAG-AG-GT-AA-TT-CA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TCTAGCT----TA---TGT---TA-GC-G--------G-TA-TT-G-ATTG-A-T----A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AG-TC---CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AT-T-A-TG-GG-CA-CTTT---T--A-TT-----ATTAA----C------ACCCTCT-ACCCCCC
gi|110319 : CCCCAATTT-CATGTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TAG-G--T-AC-T---T-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A----A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG-T-T--TTTCAA-TGA--TGT-T-A-TA-T-ATG---G-A--T--AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-G--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---C---AA--A-T--AA-AAGAGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---TAT-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---TA-A--AAGCG-A---TTCTT--C-GA-C---AA-T-GA--AG--ACA-CAT-TT--TTCAGCCC--CA----GAT-AA-CT-AA-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTCTT-TTT-AAT--TTTAC-AGT--A-TAA-ATTAGCT----TA---TGT---AA-GC-A--------G-TA-TT-A-A-TA-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AT-T----CA--AG-TTC--------G------TT-----T-A-TG-GG-CAGC-TT---T--A-TC-----ATATTACAAC------CCCCCCC-CCC
gi|110320 : CCCCCGTTT-CATCTT-TTT--G---A-A-TA-A-AT-A-A---A-----TGG-G--T-AT-T---T-T-A-T-A--A---GCG-T-G-TTT--AGA-AT-TTAA--A-T--A-AA-AGG-CT-AGT-----A--GT--T-T--C----A-T-A--TCT-T-A--A-T-A-G---G-A--TTAAAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--ATGT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---G---AA--T-T--GA-A--AGAA-TA--A-T-ATG-G-A-CT-GC---T-T-T-TAA--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--AAGCA-A---TTTTT--T-GA-C--AAATT-GA--AGAAAAA-AA--TT--TTCAGCCC--GG----GAG-AACTT-AA-TT-GA-CACAT-TGAA-TTTCT-TTT-A-T--TTTAC-ATT--A-TAA-TGTAGCT----AA---TGTC--TA-GC-G--------A-TA-TT-A-ATTG-ATT--G-A---A-AGTTA--TAA-GG-T--TT-G--A---T-AG-T----CA--GGTTTCA--T-AAT-------TT--GC-T-A--G-GG-CA-C-TTTTAT--A-TT-----AC-------T------CCCCCCC-CCCCC
gi|110321 : CCCCCATTT-CA-CTT-TTT----A-A-A-TA-A--T-C-A---A-----TGG-G--T----T---T-T-A-T-A--A---A-A-TTG-TTT--AGG-AT-TGGA--A-TTCA-AA-AGG-CT-TG------ACTGTA-T-T--C----A-T-A--TCTCT-A-TA-C-G-G---A-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA----CTTT-T-A-T-C-AA-AAACC-TCATCT-TT-ATT-----C---AA-------GA-C--AGAG-TC--A-T-AC--G-A-CC-GC---T-T-T---A--TCAGTTTG---A-T-A-TT-TC---GA-A--GAGCA-A---TTTT---C-GA-C--AAA-T-AA--AG--ACA-TA--GT--TTCAGCCG---G----GAG-AA-CT-AC-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT------TTTAC-A-T--A-TAA-TGCAGCT----TA---TG----TA-GC-A--------G-TAGTT-G-ATTG-A-T--A-A---A-AT-TA--T-T-GG-T--TTAG--A---TGAG-T----CA---G-TTCA--TCAATG------TT--AC-T-A-T--GG-CA-C-TT---T--A-TC-----ATTA-----C------ACCCCCC-CCCCCCCC
gi|110322 : CCCCCATTT-AATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A--T-T-ATT-A-----TTG-G--T-A--TG--T-T-A-T-A--A---G-G-G-G-TTT--AGC-AT-TTTA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG-T-TT-C----A-T-A--CTT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---C----A--A-T---A-A--AGAT-TA--A-T--C--G-A-CT--CTTAT-T-C-T-A---CA-TTT--G-A-T-A--T-TC---AACA--AATCA-A---TTTTT--C-GACC--AAA-T-TA--AA--AC--TA--TT--TTC-GCCC--TG------A-AA-CT-AA--T-AA-C-CAT-TGA---TTC--TTT-ATT--TTTAC-A-------AA-AGTAGC-----TA---T-T---TA-GC-A--------T-TA-TT-G-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--C----G-T--TTGG--A---T-A--T----CA--GG-TCCAACT-AATGTCTACATT--AC-T-A-C--GG-CT-C-TT---T--A-TC-----ATTA-----C------ACCCCCC-CCACCCC
gi|110323 : CCCCC--TT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TAGA-AT-C-AT--------TGG-GAAT-A--T---TAT-A-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-T-GA--A-T--A-AG-A----T-AG------A--GTG-T-T-------A-T-A--ATC-T-A-TACT-A-G---A-----T-AAA-GA-CGA---AGG--T-TA-GAT-TA--TGGCA-TA-----TGT-T-A-TTC-GA-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---G---AA--A-T--GA-A--AT-G-TA--A-T-AC--GCA-TC-GC---T-T-T-A-A--G-AGTTTG-G-AGT-A-TT-TT---GA-A----GCA-A---TTTTT--C-GA-C--AAA-T-GA--AG--ACA-AA--TT--TTCAG-CC--CG----GAG--A-CT--A-TT--A-C-CAT-TGAT-TTCCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T----T-A-TGTAGCT----TA---TGT---TC-GC-G--------A-TA-TT---ATTG---T--A-A---A-CG-TA--T-C-GG-T--TGGA--A---T-AT-T----CG--GT-TTCA--T-AATG------TT--GC-T-G--A-GG-CA-C-TT---T--A-TT------T-------A------CCCCCCC-CCCCCCC
gi|110324 : CCCCAATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TAG-G--C-A--T---T---A-T-T--A---G-A-T---TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CTTAG------A--GTGCT-T--C----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-T-GTTGG-A--TT-AAA-GA-CAA----GG--TCTA-GGT-AA--TA-CA-TA-A--TTTT-T-ATT-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TT-A-TTT---C---AA--A-T--TA-A--AGAGTTA--A-T-A---G-A-CT-GC---T-TCT-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TCAAAAA-A--AAGCC-ATTGTTTTT--T-G--C--AAA-T-AA--AG--ACA-CA--TTTGTTCAGCCCCACG----GAA-AA-GT-AA-TT-GA-C-CAT-TGA---TTTT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-AAA-TG-AGCT----TA---TGT---TA-GC-A--------G-TA-T
gi|110325 : CCCTCATGT-TATCTT-TTT--G-A-A-A----A-AT-CTAT--AA----TGG-A--TTAGTT---T-T-A-T-A--------G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--T-AA-AGG--T-AG------A--GTGTT-T--C----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-G-A---G-A--TT-AAACGA-CAA---AGGTTTCTAGGATAAA--TG-CACTA-A--TTTT-T-A-T-C-CA-AA-CCGTCA-AT-TT-ATTTT---C---AAC-A-T--GC-A--AGAGTTA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-TGT-A--GCCATTTGAG-A-T-A-TT-TC---AACA--AAGCA-A---TTTTT--T-G-----AAA-TCGA--AG--ACA-CAATTT--CTCA-CAC--TG----CAGAAA-GT-AA--T-GA-C-CATATGA---TTCT-TTTAACT--TTTAC-A-TG-A-TGA--ATA-CTA---TA---TGT---TACGC-G--------T-T--TT---ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C----T--TTGG--A---T-AT-T----CA--GG-TTTA--TCAATG------AT--AC-T-A-T--GA-CA-C-TT---T--A--C-----AT-------T------ACCCCCC-CCCTCCCC
gi|110326 : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-AATA-A-AT-TTATT-A-----TGG-G--T-G--T---T-T-G-T-A--A---G-G-T-G-TTT--ATA-ATCTTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AA------T--GTG-T-TT-C----A-TCA--TCT-T-AATA-T-A-G---A-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TATA--TTTT-T-A-T-C-AA-A---C-TCA-A-----ATT------------------------AGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-T-A--GCAGTTTG-GAA-T-A-TT-TC---T--A--AAGCG-A---TTTTT--C-GA-T--AAA-T-GA--AG--ACAGCC--TT--TTCAGC
gi|110327 : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--T-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--AATTTATGG-G--T-A--T---T-TTA-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AGCTATAGA--GTG-T-TT-C----A-T-A--CCT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-TA-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---C---AA--A-T--GA-A--AGAG-TA--A-T-
gi|110328 : CCCCCATTT-CATCTG-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGGTA--T-A--T---T-T-A---A--ACCCC-G-T-ATTTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-GA-GGGAGT-AG------A--GCT-T-T--C----A-T-A--TCT-T-A-TATT-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CTA---AGT--TC---AAT-AA--TG-CA--A-A--AATT-T-A-T-CTAA-AA----TCA----TT-ATTTT---C---AA--A-C----------------------C--G-ATCT-G----T-T-T-T-A--TCAG--TG-G-G-T-A--T-TC---GA-A-----CA-A---TTTTT--C-G----------------G--ACA-AA--TT--T-------------------AA-AC-AA----------AT-TGAA--TTCT-TTT-A-T--TTTAC-A-T--A-TAA-T-TAGCT----T----TGTG--TA-CC-A--------G--A-TT-A-ATTG-A-TAAA-A---A-AG-TA--T-C--G-T--TT-A--A---T-AG-T----CT--AG-TTC-----AAT-------TT--ACGT-A-T--TG-CA-C-TT---T--ATTC-----ATTTA----C------CCCTCCC-CCCCCC
gi|110329 : CCCCCATTT-CATCTT---------------A-A-AT-T-AT--A-----TTG-G--T-A--T---T-TTA-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--ATG-TGT--C----A-T-A--CCT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-
gi|110330 : CTCCCATTT-GATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TAT-G--C-A--TATTT-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TTA--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT----------------T-T--C----A-T-A--CCT-T-A-TA-T-T-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCT
gi|110331 : CCCCGTTT-CATCTT-TTT----A-A-A-TA-A-AT-C-TA--A-----TGG-G--T-A--T---T-T-A-T-A--A---A-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTGTT-T--C----A-T-T--TCT-T-A-TA-T-A-G---G-A---T-AAA-GA-CAA---A-G--TCTA-GTT-AA--TG-CA-TA-AT-TTTT-T-A-T-C--A-AA-CC-TCA-AT-TC-ATTTT---TG--AA--A-T--GA-A--TTAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-TAA--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-C--AAGCA-A---TTTTT--C-GA-C--GAA-T-GA--AG--ACA-AA--TT--ATCAG--C--CG----GAG-AA-GT-AA-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCTCTTT-A-T--TTTAC-A-T--A-TAA--GTAGCT----TA---TGT---C--GC----------G-TA--T-A-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C--G-T--TTGG--A---T-AG-T----CA--GG-TTTA--T-AATGT-----TT--GC-T-A-TGAGG-CA-C-TT---T----TC-----AC-------C------CCCCCAC-CCCCCCCC
gi|110332 : CCCCGTTT-CATCTT-TTT----A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGG-T--T-T--T---A-T-A-T-A--AC--A-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AAG-CT-AG------A--GTG-T-TT-C----A-TCA--TCT-T-G-TA-TTA-G---G-A--TT-AAA----CAA---AG---TCTA-GAT-TA--TG-CA-TA-AATTTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC--CA-AT-TC-ATTTG---A---AC--A-T--GA-T---TAG-TA--A-T-CA--G-A-CT-GC---T-T-T-T-AA-GCAGTT-G-G-A-T-A-TTAGC---GA-A--A-GCA-A---TTTTT--C-GA-C--GAA-T-GA--AA--GAA-AA--TT--TTCACCAC--CG----GAG-AA-GT-AA-TT-GAAC-CAA-TGAA-CTTTT-CTT-ATTATTTTAC-A-T--CCTAA-TGTAGCTA---TA----GT---TC-GC-G--------G-TA-TT-A-ATTG-A-T--A-AC--A-AG-TA--T-C-GG-TA-TTGG--A---TTAG-T----C----G-TTTA--T-AATG------TTTTGC-TTACTG-GG-CA-C-TT---T--AATC-----AC-------A------CACCCCCACCCCCCCCccccc
gi|110333 : CCCCTTTT-CATCTT-TTT--GGA-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGG-A--T-A--T---T-TTA-T-A--A---G-G-T-G-GTT--ATA-AT-TTGA--A-T--CTAA-ATG-CT-AG------A--GTG-T-TTTC----A-T-A--TCT-T-A-TG-T-T-G---G-AATTT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTAAGAT-AA--TG-CA-TA-A--ATTT-T-T-T-C--A-AA-CC-TCA-AT-TT-ATGTT---C---AA--ACT--GA-A--AGAG-TA--A-T-------A-CT-TT---T-T-T-T-A--GCAGTATA-G-A-T-ATTT-TT---GA-A--AAGCA-GGGTTTTTT--CAAA-CCAAAA-T-GA--AT--ACA--------------------G----GA--------AA-TT-----------------TCT-ATT-ATT--ATTACAA-T--A-TAA-ATTAGTTTACGTA---TGT---TA-GC-A--------T-TA-TT-G-ATTG-A-T--ATA---A-AG-TATTT-C-GG-T--TTGG--A---T-AT-T----CA--GG-TT-A--T-AATG------TT--A--T-A-TG-GG-CC-CTTT---T--A-TT-----ATTAAA---C------CCCCCCC-CCCC
gi|110334 : CCCCGTTT-GATCTT-TTT--G-A-A---TA-A-AT-C-ATC-A-----TGG-G--T-T--A---T-T-A-T-ACTA---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--ACT--A-AA-AGG-CTCAA------A--GTG-T-T--T----A-T-AA-TCT-T---TA-T-A-GCG-A-A--TT-AAA-GA-CAA---AC---TCTACGATTAA--TG-CA-TA-A--CTTTCT-A-T-C-AA-A--CC-TCA--T-TT-ATTTT---TTTGAA--C-T--GA-A---GAG-TA--A-TTACCGG-A-TTAGC---T-T-T-T-AAAGCAGTTTG-G---T-A-TT-TC---GA-A--AAGCACA---TTTTTTTC--A-C--ACA-C-GATGAG--ACA-AAA-TC--TGCAAGCC--CGTAAGGAG-AA-CTGAA-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT--TT--TTTAC-A-CTAA-TAACTGTTG------TA---TGTA--TA-GCAG--------G-TG-AT-A-ATAG-A-T--A-ACCGA-AG-TA--T-C-GG-T--TTGGGAA---T-AG-T----CATTGG-TTCACTT-ACTG------TT--GC-TAA-TT-GG-C--C-TT---TACA-TC-----AT-------A------CCCCCCC-CCCCCCC
gi|110335 : CCCCTTTA-CAT-TT-TTT--G-A-A-A-TA-AGAT-C--T--A-----TAG-G--T----T---T-T-A-G-A--A---G-G-T-G-TT---AGA-AT-TTG---A-T--A-AA-AAGCCT-AT------A--GTG-TAT--C----A-T-A--ATC-T-A-TA-T-A-G---GAA--TT-AAA-GA-CAATCCTGT--TCT----T-AACTTC-TA-TA-A--TTTT-A-G-C-C-AA-AA-
gi|110336 : TT-CATCTTGTTT--G-ACA-A-AA-A-AT-C-ATG-A-----TGG-A--T-A--T---T-TTA-T-C--A---G-G-T-G-TTTCTAGATAT-TTGA--A-T--A-AA-GGC-CTCAG------A--GTT-T-T--C----AGT-T--TCT-T-A-CA-TGA-G---G-A--TT-AAA-AC-CAA---AGA--TC-A-GAT-AA--TG-CA-TA-A--CTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TTTATCTT---C---AATCA-T--GAGA--AGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-TCA--GCAATTTT-G-G-TCA-TT-TC---GA-AGAAAGCA-A---TTATC--T-GA-T--AAA-T-GA--AG--ACA-CA--TT--TTCAGCCC--TG----GAG-AT-AT-AA-TTAGAGC-CA--TGAA-TTCTT-TCT-ATT--TTAAC-A-T--A-TAA-TATAGCT----TAT--TTT---TA-GC-A--------G-TA-TCAA-ATTG-A-T--A-A---ACAG-TA--T-C-GGAT--TTGG------T-AT-T----CA--GG-TT-A--T-GA-G-------T--AC-T-A-TG-AATCACC-TT---T--A-TC-----AT-------T------ACCCCTC-CCCtaacttcgcttgattgcctaaaa
gi|110337 : --T---T-T-A-TTA--A---G-GAT-G-TTT--AGA-AT-TTGATAA-T--T-AA-AGG-CTTAG------A--GTG-T-T--C----A-T-AACCCT-T-A-T--T-A-G---G-A--TT-AAA-GAGCAA---AAG--TCTA-GAT-A---TG-CA-TA-A--TTTT-TTA-T-C-AA-A--CC-TCA-AT-TT-AATTT---C---AA--A-TTGAA-A--AGAG-TA--A-T-GC--G-A-CT-GC---T-T-T-TTA--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC----A-A--GAGCA-A---TTTTT--C-GA-C--AAA-G-AA--AG--ACA-TA--TT--TTCAGCCT--GG----TAG-AA-CT-AATTT-AA-C-CAT-TGAA-TTTC--TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TGTAGCT----TAAT-CGT---TA-GC-A--------GTTA-TT-A-GTTG-A-T--A-A---A-AG-TT--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AG-T----CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AC-T-A-C--GG-CC-C-TT---T--A-TC-----AT-------T------ACTCCCC-CCCCGCCC
gi|110338 : t-TA-T---G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---GGG--TTTA-GAT-AA--TG-TA-TA-A--ATTT-T-A-T-C-AA-AA-TC-TCA-A--TT-ATTTT---C---AA--A-T--GA-A--AGAG-TA--A-T-AC--A-A-CT-GC---T-T-T-TGA--ACA--CTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--AAACA-A---TTTTT--C-GA-C--AAA-T-GA--AG--ACA-CA--TT--------------------G-AA-GC-AA-TT-GA-T-CAT-CGAA-TTTTT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TGA-TGTAGCT----TA---TG
gi|110339 : GTCT--TG----AAA-AA-TT-AA-TG-GC-C-CAT-TGAA-TTTTT-TTTAATT--TTTAC-A-T--A-TTT-TGTTGTT----GAAAGTGT---CT-GT-A--------A-CA-T----ATT--A-T--G-A---A-AG-TA--TGA-GG-T--GTGG------T-TT-T----CA--AG-GTCA--T-TGTG------AC--GC-T-A-TG---------TT---T--G-CC-----ATAGCAA--C------CCCCC
gi|110340 : ----GAC-AA-AT-AA-TG-GC-C-CAT-TGA--TTTTT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-T-T-TGTAGTT----TA---AGT---AA-GT-GTCTGTAACG-TA-TT-A---TG------G-A---A-AT-TA--T-CAGG-T--ATGG------T-TT-T----CG--G---TCA--T-TATG------AC--GC-T-A-CG-GT-TA-C-CA---T--A-GC-----AA-------C------CCCC
gi|110341 : A---TTT---TA-AT-G--------G-TA-TT-ACATTGTA-T--A--------G-CA--T-C-AG-T--TTGG--AAATT-AG-T----TA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AC-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TCGATTAAC-------C------CCCTCCA-CCCCCCCC
gi|110342 : ---TA-AC-A--------A-TA-AT-G-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--GTGG--A---T-AA-T----CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AC-T-A-TG-GG-CA-C-TA---T--T-TC-----AT-------
Alignments
lowQualScore : 11 111 1 22222222222222
lowQualScore : 1 1 2222 1 1 1 1 1 1 3 88 55555 1 22 7777 444 1 9 1 1 22 444 1 1 1 1 222 1 1 22 1 22 1 1 3 6 666666 22 6 3 44 3333 1 4 33 1 1 1 3 333 444 1 33 1 1 1 222 22 4 3 22 1 1 1 33 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 5555555 44 1 222 1 22 3 22 1 1 44 1 1 1 000 1 1 1 0 55 1 1 1 1 1 1 333 3 22 1 666 22 3 1 22 1 1 22 22 44 55 22 333 3333 1 33 1 1 1 3 1 1 22 1 3 22 1 3 44 1 1 6666 666 777 1 8888888888 1 1 333 1 1 22 1 444 1 1 22 3 1 1 44 22 444 3 33 5555 22 1 44 3 666666 22 1 3 4444 1 3 3 222 22 3 44444 88888888888888 1
lowQualScore : . . .... . . . . . . . .. ..... . .. .... ... . . . . .. ... . . . . ... . . .. . .. . . . . ...... .. . . .. .... . . .. . . . . ... ... . .. . . . ... .. . . .. . . . .. . . . . . . . . . . . ....... .. . ... . .. . .. . . .. . . . ... . . . . .. . . . . . . ... . .. . ... .. . . .. . . .. .. .. .. .. ... .... . .. . . . . . . .. . . .. . . .. . . .... ... ... . .......... . . ... . . .. . ... . . .. . . . .. .. ... . .. .... .. . .. . ...... .. . . .... . . . ... .. . ..... .............. .
lowQualScore : 6 6 4444 6 6 6 6 6 6 2 66 66666 6 22 0000 222 5 2 5 5 11 222 5 5 5 5 777 5 5 11 5 11 5 5 1 2 000000 11 2 1 44 3333 5 6 77 5 5 5 0 222 666 5 55 5 5 5 666 00 6 1 11 5 5 5 77 5 5 5 5 5 5 5 7 7 7 7 1111111 00 7 666 7 33 3 33 7 7 11 7 7 7 000 7 7 7 4 99 7 7 7 7 7 7 000 5 44 7 111 44 5 7 44 7 7 44 44 77 99 44 555 5555 7 22 7 7 7 3 7 7 99 7 3 33 7 3 00 7 7 9999 666 666 6 4444444444 6 6 888 7 7 33 7 666 7 7 33 3 7 7 00 33 666 3 88 2222 33 7 66 3 555555 33 7 3 1111 7 3 3 999 33 3 22222 22222222222222 9
consensus : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGG-G--T-A--T---T-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG-T-T--C----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---C---AA--A-T--GA-A--AGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--AAGCA-A---TTTTT--C-GA-C--AAA-T-GA--AG--ACA-CA--TT--TTCAGCCC--CG----GAG-AA-NT-AA-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TGTAGCT----TA---TGT---TA-GC-G--------G-TA-TT-A-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AG-T----CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AC-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TC-----AT-------C------CCCCCCC-CCCCCCCC
Reference ( family-626 ) : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGG-G--T-A--T---T-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG-T-T--C----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---C---AA--A-T--GA-A--AGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--AAGCA-A---TTTTT--C-GA-C--AAA-T-GA--AG--ACA-CA--TT--TTCAGCCC--CG----GAG-AA-NT-AA-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TGTAGCT----TA---TGT---TA-GC-G--------G-TA-TT-A-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AG-T----CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AC-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TC-----AT-------C------CCCCCCC-CCCCCCCC
gi|110312 : CCCCCGTTT-CATCTT-TTT--G-A-AGA-TA-A-TT-C-ATTCA-----TGG-G--T-A--T---T-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TT---AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG-T-T--C----A-T-A--TTT-T-A-TA-T-A-G---G-A--T--AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-ATATT-ATTTT---G---AA--A-T--GA-A--AGAG-TA--A-T-AC--G-G-CT-GC---T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--AAGCA-A---TTTTT--C-GA-C--AAA-T-GA--AG--AAA--A--TT--TTCAGCCC--CG----GAG-AA-CT-AA-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-CGTAGCT----TA---TGT---TA-GC-G--------G-TA-TC-A-ATTG-A-T----A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--AT--T-AG-T----CA--GG-TTCA--T-AGTG------TT--GC-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TC-----AT-------C------CCCCCCC-CCCCCCCC
gi|110313 : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-T-AT--A-----TTG-G--T-T--T---T-T-AAT-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AT------A--GTG-T-TT-C----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-T-G---G-A--TT-AAA-AA---G---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TC-ATTTT---A---AA--A-T--GA-A--AGAG-TATAG-T-AT--G-A-CT-GC---T-T-T-T-AA-GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--AAGCA-A---TTTTT--C-GA-C--AAA-T-GA--AG--ACA-CA--TT--TTCAGCCC--CG----GTG-AA-GT-AA-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-CTT--TTTAC-A-T--A-TAA-TGTAGCT----AA---TGCTAGTA-GC-G--------G-TA-TT-G-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AT-T----CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AC-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TC--------------C------CCCCCTC-CCC
gi|110314 : CTCCTATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGG-G--T-A--T---T-TTA-T-A--G---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTT---T-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTGTT-T--T----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-AA-CAA---ATG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TATT-T-A-T-C-AA-AA-CA-TC--AT-TC-ATTTT---C---AA--A-T--GA-A--AGGG-TA--A-T-AT--G-A-CT-GCT--T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-G-TT-TC---GA-A--AATCA-A---TTTTT--C-GA-C--AAA-T-GA--AG--ACG-CA--TT--TTCAGCCC--CG----GAG-AA-GT-AA-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TATAGCT----TA---TGT---TA-GC-G--------G-TA-TT-G-ATTG-A-T--A-A---A-GG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AG-T----CG--GG-TTCA--T-AATG------TT--AG-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TT-----AT-------C------CCCCCAC-TCCC
gi|110315 : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AA--A-----TGG-G--T-AC-T---T-T-A-T-A--A---G-G-G-G-ATA--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG-T-TT-C----A-T-A--TGT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TATA-GAT-AA--TG-CA-TA-C--TTTT-T-A-T-C--A-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---C---AA--A-T--AA-A--AGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GCT--T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---AA-A--AAACA-C---TTTTT--T-GA-C--AAA-T-GA--AG--ACA-CA--CT--TTCAGCTC--CA----GAG-AA-CT-AA-TT-AA-C-CGT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-A--T-TGA-TGTAGCT----TT---TGT---TG-GC-G--------G-TA-TT-A-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-TGGTTGG--A---T-AGTT----CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--GC-T-ATTG-GC-CA-C-TT---T--A-TC-----ATAAA----C------CCCCCCC-CCCCC
gi|110316 : CCCTCATTT-CATCTT-T----G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGG-A--T-A--T---T-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TT---AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-TGG-CT-AG------A--GTG-T-T--C----A-T-A--TCT-T---TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA--AT-AA--TG-CA-TA-A--TTCA-T-T-T-C-AATAA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---C---AA--A-----A-A--AGAG-TA--ATT-AC--G-A-CT-GCT--T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--ATGCA-A---TTTTT--T-GA-T--AAA-T-GA--AG--ACA-CA---T--TTCAGCCA--TG----GAG-AA-GT-AA-TT-GA-C-CAT-TGAATTTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TATAGCT----TA---TGT---TA-GC----------G-TA-TT-A-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGC--A---T-AT-T----CA--GG-TTCA--T-AATG------AT--AC-T-A-TG-GA-CA-C--T---T--A-TC-----AT-------T------ACCCCCC-CCCCCCCC
gi|110317 : CCTCCATTTTCATCTT-TTTCTG-A-A-A-TA-A-ATTC-AT--A-----TGG-G--T-A--T---T-TTA-T-A--A---G-G-T-G-TT---AGA-AT-TTGA--A-T--A-ATTAGG-CT-AG------A--GTG-T-TT-C----A-T-A--TCT-TTG-TA-T-A-G---G-AA-TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA--AT-AA--TG-CC-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---C---AA--A-A--TA-A--AGAG-T---A-T-AC--G-A-CT-GCT--T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--AAGCA-A---TTTTT--CAGA-C--AAA-T-GA--AG--GGA-CA--TT--TTCTGCCC--C-----GAG-AA-CT-AA-TT-GA-C-CAT-TAAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TGTAGCT----TA---TGT---TA-GC-A--------G-TA-TT-A-ATTT-A----A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AG-TCATGCA--GG-TTCA--T-AAT-------TT--AC-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--T-TC-----AT-------CATTAATCCCCTCT-CC
gi|110318 : CCCCCATTT-CAT--T-TTT--A-A-A-A--A-A-AT----------------------A--T---T-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AAA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTA-T-TT-C----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-T-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---GGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-C--TTTT-T-A-T-A-AA-AA-CC-TTC-AT-TT-TTTTTTTTC---AA--A-T--GA-A--AGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-TTA--GCAGTTTA-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--AAGCA-A---TTTTT--C-GA-C--CAA-T-GA--AG--ACA-CA--TT--TTCAGCCC--CG----GAG-AG-GT-AA-TT-CA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TCTAGCT----TA---TGT---TA-GC-G--------G-TA-TT-G-ATTG-A-T----A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AG-TC---CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AT-T-A-TG-GG-CA-CTTT---T--A-TT-----ATTAA----C------ACCCTCT-ACCCCCC
gi|110319 : CCCCAATTT-CATGTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TAG-G--T-AC-T---T-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A----A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG-T-T--TTTCAA-TGA--TGT-T-A-TA-T-ATG---G-A--T--AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-G--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---C---AA--A-T--AA-AAGAGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---TAT-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---TA-A--AAGCG-A---TTCTT--C-GA-C---AA-T-GA--AG--ACA-CAT-TT--TTCAGCCC--CA----GAT-AA-CT-AA-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTCTT-TTT-AAT--TTTAC-AGT--A-TAA-ATTAGCT----TA---TGT---AA-GC-A--------G-TA-TT-A-A-TA-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AT-T----CA--AG-TTC--------G------TT-----T-A-TG-GG-CAGC-TT---T--A-TC-----ATATTACAAC------CCCCCCC-CCC
gi|110320 : CCCCCGTTT-CATCTT-TTT--G---A-A-TA-A-AT-A-A---A-----TGG-G--T-AT-T---T-T-A-T-A--A---GCG-T-G-TTT--AGA-AT-TTAA--A-T--A-AA-AGG-CT-AGT-----A--GT--T-T--C----A-T-A--TCT-T-A--A-T-A-G---G-A--TTAAAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--ATGT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---G---AA--T-T--GA-A--AGAA-TA--A-T-ATG-G-A-CT-GC---T-T-T-TAA--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--AAGCA-A---TTTTT--T-GA-C--AAATT-GA--AGAAAAA-AA--TT--TTCAGCCC--GG----GAG-AACTT-AA-TT-GA-CACAT-TGAA-TTTCT-TTT-A-T--TTTAC-ATT--A-TAA-TGTAGCT----AA---TGTC--TA-GC-G--------A-TA-TT-A-ATTG-ATT--G-A---A-AGTTA--TAA-GG-T--TT-G--A---T-AG-T----CA--GGTTTCA--T-AAT-------TT--GC-T-A--G-GG-CA-C-TTTTAT--A-TT-----AC-------T------CCCCCCC-CCCCC
gi|110321 : CCCCCATTT-CA-CTT-TTT----A-A-A-TA-A--T-C-A---A-----TGG-G--T----T---T-T-A-T-A--A---A-A-TTG-TTT--AGG-AT-TGGA--A-TTCA-AA-AGG-CT-TG------ACTGTA-T-T--C----A-T-A--TCTCT-A-TA-C-G-G---A-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA----CTTT-T-A-T-C-AA-AAACC-TCATCT-TT-ATT-----C---AA-------GA-C--AGAG-TC--A-T-AC--G-A-CC-GC---T-T-T---A--TCAGTTTG---A-T-A-TT-TC---GA-A--GAGCA-A---TTTT---C-GA-C--AAA-T-AA--AG--ACA-TA--GT--TTCAGCCG---G----GAG-AA-CT-AC-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT------TTTAC-A-T--A-TAA-TGCAGCT----TA---TG----TA-GC-A--------G-TAGTT-G-ATTG-A-T--A-A---A-AT-TA--T-T-GG-T--TTAG--A---TGAG-T----CA---G-TTCA--TCAATG------TT--AC-T-A-T--GG-CA-C-TT---T--A-TC-----ATTA-----C------ACCCCCC-CCCCCCCC
gi|110322 : CCCCCATTT-AATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A--T-T-ATT-A-----TTG-G--T-A--TG--T-T-A-T-A--A---G-G-G-G-TTT--AGC-AT-TTTA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG-T-TT-C----A-T-A--CTT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---C----A--A-T---A-A--AGAT-TA--A-T--C--G-A-CT--CTTAT-T-C-T-A---CA-TTT--G-A-T-A--T-TC---AACA--AATCA-A---TTTTT--C-GACC--AAA-T-TA--AA--AC--TA--TT--TTC-GCCC--TG------A-AA-CT-AA--T-AA-C-CAT-TGA---TTC--TTT-ATT--TTTAC-A-------AA-AGTAGC-----TA---T-T---TA-GC-A--------T-TA-TT-G-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--C----G-T--TTGG--A---T-A--T----CA--GG-TCCAACT-AATGTCTACATT--AC-T-A-C--GG-CT-C-TT---T--A-TC-----ATTA-----C------ACCCCCC-CCACCCC
gi|110323 : CCCCC--TT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TAGA-AT-C-AT--------TGG-GAAT-A--T---TAT-A-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-T-GA--A-T--A-AG-A----T-AG------A--GTG-T-T-------A-T-A--ATC-T-A-TACT-A-G---A-----T-AAA-GA-CGA---AGG--T-TA-GAT-TA--TGGCA-TA-----TGT-T-A-TTC-GA-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---G---AA--A-T--GA-A--AT-G-TA--A-T-AC--GCA-TC-GC---T-T-T-A-A--G-AGTTTG-G-AGT-A-TT-TT---GA-A----GCA-A---TTTTT--C-GA-C--AAA-T-GA--AG--ACA-AA--TT--TTCAG-CC--CG----GAG--A-CT--A-TT--A-C-CAT-TGAT-TTCCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T----T-A-TGTAGCT----TA---TGT---TC-GC-G--------A-TA-TT---ATTG---T--A-A---A-CG-TA--T-C-GG-T--TGGA--A---T-AT-T----CG--GT-TTCA--T-AATG------TT--GC-T-G--A-GG-CA-C-TT---T--A-TT------T-------A------CCCCCCC-CCCCCCC
gi|110324 : CCCCAATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TAG-G--C-A--T---T---A-T-T--A---G-A-T---TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CTTAG------A--GTGCT-T--C----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-T-GTTGG-A--TT-AAA-GA-CAA----GG--TCTA-GGT-AA--TA-CA-TA-A--TTTT-T-ATT-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TT-A-TTT---C---AA--A-T--TA-A--AGAGTTA--A-T-A---G-A-CT-GC---T-TCT-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TCAAAAA-A--AAGCC-ATTGTTTTT--T-G--C--AAA-T-AA--AG--ACA-CA--TTTGTTCAGCCCCACG----GAA-AA-GT-AA-TT-GA-C-CAT-TGA---TTTT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-AAA-TG-AGCT----TA---TGT---TA-GC-A--------G-TA-T
gi|110325 : CCCTCATGT-TATCTT-TTT--G-A-A-A----A-AT-CTAT--AA----TGG-A--TTAGTT---T-T-A-T-A--------G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--T-AA-AGG--T-AG------A--GTGTT-T--C----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-G-A---G-A--TT-AAACGA-CAA---AGGTTTCTAGGATAAA--TG-CACTA-A--TTTT-T-A-T-C-CA-AA-CCGTCA-AT-TT-ATTTT---C---AAC-A-T--GC-A--AGAGTTA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-TGT-A--GCCATTTGAG-A-T-A-TT-TC---AACA--AAGCA-A---TTTTT--T-G-----AAA-TCGA--AG--ACA-CAATTT--CTCA-CAC--TG----CAGAAA-GT-AA--T-GA-C-CATATGA---TTCT-TTTAACT--TTTAC-A-TG-A-TGA--ATA-CTA---TA---TGT---TACGC-G--------T-T--TT---ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C----T--TTGG--A---T-AT-T----CA--GG-TTTA--TCAATG------AT--AC-T-A-T--GA-CA-C-TT---T--A--C-----AT-------T------ACCCCCC-CCCTCCCC
gi|110326 : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-AATA-A-AT-TTATT-A-----TGG-G--T-G--T---T-T-G-T-A--A---G-G-T-G-TTT--ATA-ATCTTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AA------T--GTG-T-TT-C----A-TCA--TCT-T-AATA-T-A-G---A-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TATA--TTTT-T-A-T-C-AA-A---C-TCA-A-----ATT------------------------AGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-T-A--GCAGTTTG-GAA-T-A-TT-TC---T--A--AAGCG-A---TTTTT--C-GA-T--AAA-T-GA--AG--ACAGCC--TT--TTCAGC
gi|110327 : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--T-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--AATTTATGG-G--T-A--T---T-TTA-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AGCTATAGA--GTG-T-TT-C----A-T-A--CCT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-TA-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---C---AA--A-T--GA-A--AGAG-TA--A-T-
gi|110328 : CCCCCATTT-CATCTG-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGGTA--T-A--T---T-T-A---A--ACCCC-G-T-ATTTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-GA-GGGAGT-AG------A--GCT-T-T--C----A-T-A--TCT-T-A-TATT-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CTA---AGT--TC---AAT-AA--TG-CA--A-A--AATT-T-A-T-CTAA-AA----TCA----TT-ATTTT---C---AA--A-C----------------------C--G-ATCT-G----T-T-T-T-A--TCAG--TG-G-G-T-A--T-TC---GA-A-----CA-A---TTTTT--C-G----------------G--ACA-AA--TT--T-------------------AA-AC-AA----------AT-TGAA--TTCT-TTT-A-T--TTTAC-A-T--A-TAA-T-TAGCT----T----TGTG--TA-CC-A--------G--A-TT-A-ATTG-A-TAAA-A---A-AG-TA--T-C--G-T--TT-A--A---T-AG-T----CT--AG-TTC-----AAT-------TT--ACGT-A-T--TG-CA-C-TT---T--ATTC-----ATTTA----C------CCCTCCC-CCCCCC
gi|110329 : CCCCCATTT-CATCTT---------------A-A-AT-T-AT--A-----TTG-G--T-A--T---T-TTA-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--ATG-TGT--C----A-T-A--CCT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-
gi|110330 : CTCCCATTT-GATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TAT-G--C-A--TATTT-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TTA--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT----------------T-T--C----A-T-A--CCT-T-A-TA-T-T-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCT
gi|110331 : CCCCGTTT-CATCTT-TTT----A-A-A-TA-A-AT-C-TA--A-----TGG-G--T-A--T---T-T-A-T-A--A---A-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTGTT-T--C----A-T-T--TCT-T-A-TA-T-A-G---G-A---T-AAA-GA-CAA---A-G--TCTA-GTT-AA--TG-CA-TA-AT-TTTT-T-A-T-C--A-AA-CC-TCA-AT-TC-ATTTT---TG--AA--A-T--GA-A--TTAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-TAA--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-C--AAGCA-A---TTTTT--C-GA-C--GAA-T-GA--AG--ACA-AA--TT--ATCAG--C--CG----GAG-AA-GT-AA-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCTCTTT-A-T--TTTAC-A-T--A-TAA--GTAGCT----TA---TGT---C--GC----------G-TA--T-A-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C--G-T--TTGG--A---T-AG-T----CA--GG-TTTA--T-AATGT-----TT--GC-T-A-TGAGG-CA-C-TT---T----TC-----AC-------C------CCCCCAC-CCCCCCCC
gi|110332 : CCCCGTTT-CATCTT-TTT----A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGG-T--T-T--T---A-T-A-T-A--AC--A-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AAG-CT-AG------A--GTG-T-TT-C----A-TCA--TCT-T-G-TA-TTA-G---G-A--TT-AAA----CAA---AG---TCTA-GAT-TA--TG-CA-TA-AATTTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC--CA-AT-TC-ATTTG---A---AC--A-T--GA-T---TAG-TA--A-T-CA--G-A-CT-GC---T-T-T-T-AA-GCAGTT-G-G-A-T-A-TTAGC---GA-A--A-GCA-A---TTTTT--C-GA-C--GAA-T-GA--AA--GAA-AA--TT--TTCACCAC--CG----GAG-AA-GT-AA-TT-GAAC-CAA-TGAA-CTTTT-CTT-ATTATTTTAC-A-T--CCTAA-TGTAGCTA---TA----GT---TC-GC-G--------G-TA-TT-A-ATTG-A-T--A-AC--A-AG-TA--T-C-GG-TA-TTGG--A---TTAG-T----C----G-TTTA--T-AATG------TTTTGC-TTACTG-GG-CA-C-TT---T--AATC-----AC-------A------CACCCCCACCCCCCCCccccc
gi|110333 : CCCCTTTT-CATCTT-TTT--GGA-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGG-A--T-A--T---T-TTA-T-A--A---G-G-T-G-GTT--ATA-AT-TTGA--A-T--CTAA-ATG-CT-AG------A--GTG-T-TTTC----A-T-A--TCT-T-A-TG-T-T-G---G-AATTT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTAAGAT-AA--TG-CA-TA-A--ATTT-T-T-T-C--A-AA-CC-TCA-AT-TT-ATGTT---C---AA--ACT--GA-A--AGAG-TA--A-T-------A-CT-TT---T-T-T-T-A--GCAGTATA-G-A-T-ATTT-TT---GA-A--AAGCA-GGGTTTTTT--CAAA-CCAAAA-T-GA--AT--ACA--------------------G----GA--------AA-TT-----------------TCT-ATT-ATT--ATTACAA-T--A-TAA-ATTAGTTTACGTA---TGT---TA-GC-A--------T-TA-TT-G-ATTG-A-T--ATA---A-AG-TATTT-C-GG-T--TTGG--A---T-AT-T----CA--GG-TT-A--T-AATG------TT--A--T-A-TG-GG-CC-CTTT---T--A-TT-----ATTAAA---C------CCCCCCC-CCCC
gi|110334 : CCCCGTTT-GATCTT-TTT--G-A-A---TA-A-AT-C-ATC-A-----TGG-G--T-T--A---T-T-A-T-ACTA---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--ACT--A-AA-AGG-CTCAA------A--GTG-T-T--T----A-T-AA-TCT-T---TA-T-A-GCG-A-A--TT-AAA-GA-CAA---AC---TCTACGATTAA--TG-CA-TA-A--CTTTCT-A-T-C-AA-A--CC-TCA--T-TT-ATTTT---TTTGAA--C-T--GA-A---GAG-TA--A-TTACCGG-A-TTAGC---T-T-T-T-AAAGCAGTTTG-G---T-A-TT-TC---GA-A--AAGCACA---TTTTTTTC--A-C--ACA-C-GATGAG--ACA-AAA-TC--TGCAAGCC--CGTAAGGAG-AA-CTGAA-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT--TT--TTTAC-A-CTAA-TAACTGTTG------TA---TGTA--TA-GCAG--------G-TG-AT-A-ATAG-A-T--A-ACCGA-AG-TA--T-C-GG-T--TTGGGAA---T-AG-T----CATTGG-TTCACTT-ACTG------TT--GC-TAA-TT-GG-C--C-TT---TACA-TC-----AT-------A------CCCCCCC-CCCCCCC
gi|110335 : CCCCTTTA-CAT-TT-TTT--G-A-A-A-TA-AGAT-C--T--A-----TAG-G--T----T---T-T-A-G-A--A---G-G-T-G-TT---AGA-AT-TTG---A-T--A-AA-AAGCCT-AT------A--GTG-TAT--C----A-T-A--ATC-T-A-TA-T-A-G---GAA--TT-AAA-GA-CAATCCTGT--TCT----T-AACTTC-TA-TA-A--TTTT-A-G-C-C-AA-AA-
gi|110336 : TT-CATCTTGTTT--G-ACA-A-AA-A-AT-C-ATG-A-----TGG-A--T-A--T---T-TTA-T-C--A---G-G-T-G-TTTCTAGATAT-TTGA--A-T--A-AA-GGC-CTCAG------A--GTT-T-T--C----AGT-T--TCT-T-A-CA-TGA-G---G-A--TT-AAA-AC-CAA---AGA--TC-A-GAT-AA--TG-CA-TA-A--CTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TTTATCTT---C---AATCA-T--GAGA--AGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-TCA--GCAATTTT-G-G-TCA-TT-TC---GA-AGAAAGCA-A---TTATC--T-GA-T--AAA-T-GA--AG--ACA-CA--TT--TTCAGCCC--TG----GAG-AT-AT-AA-TTAGAGC-CA--TGAA-TTCTT-TCT-ATT--TTAAC-A-T--A-TAA-TATAGCT----TAT--TTT---TA-GC-A--------G-TA-TCAA-ATTG-A-T--A-A---ACAG-TA--T-C-GGAT--TTGG------T-AT-T----CA--GG-TT-A--T-GA-G-------T--AC-T-A-TG-AATCACC-TT---T--A-TC-----AT-------T------ACCCCTC-CCCtaacttcgcttgattgcctaaaa
gi|110337 : --T---T-T-A-TTA--A---G-GAT-G-TTT--AGA-AT-TTGATAA-T--T-AA-AGG-CTTAG------A--GTG-T-T--C----A-T-AACCCT-T-A-T--T-A-G---G-A--TT-AAA-GAGCAA---AAG--TCTA-GAT-A---TG-CA-TA-A--TTTT-TTA-T-C-AA-A--CC-TCA-AT-TT-AATTT---C---AA--A-TTGAA-A--AGAG-TA--A-T-GC--G-A-CT-GC---T-T-T-TTA--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC----A-A--GAGCA-A---TTTTT--C-GA-C--AAA-G-AA--AG--ACA-TA--TT--TTCAGCCT--GG----TAG-AA-CT-AATTT-AA-C-CAT-TGAA-TTTC--TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TGTAGCT----TAAT-CGT---TA-GC-A--------GTTA-TT-A-GTTG-A-T--A-A---A-AG-TT--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AG-T----CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AC-T-A-C--GG-CC-C-TT---T--A-TC-----AT-------T------ACTCCCC-CCCCGCCC
gi|110338 : t-TA-T---G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---GGG--TTTA-GAT-AA--TG-TA-TA-A--ATTT-T-A-T-C-AA-AA-TC-TCA-A--TT-ATTTT---C---AA--A-T--GA-A--AGAG-TA--A-T-AC--A-A-CT-GC---T-T-T-TGA--ACA--CTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--AAACA-A---TTTTT--C-GA-C--AAA-T-GA--AG--ACA-CA--TT--------------------G-AA-GC-AA-TT-GA-T-CAT-CGAA-TTTTT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TGA-TGTAGCT----TA---TG
gi|110339 : GTCT--TG----AAA-AA-TT-AA-TG-GC-C-CAT-TGAA-TTTTT-TTTAATT--TTTAC-A-T--A-TTT-TGTTGTT----GAAAGTGT---CT-GT-A--------A-CA-T----ATT--A-T--G-A---A-AG-TA--TGA-GG-T--GTGG------T-TT-T----CA--AG-GTCA--T-TGTG------AC--GC-T-A-TG---------TT---T--G-CC-----ATAGCAA--C------CCCCC
gi|110340 : ----GAC-AA-AT-AA-TG-GC-C-CAT-TGA--TTTTT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-T-T-TGTAGTT----TA---AGT---AA-GT-GTCTGTAACG-TA-TT-A---TG------G-A---A-AT-TA--T-CAGG-T--ATGG------T-TT-T----CG--G---TCA--T-TATG------AC--GC-T-A-CG-GT-TA-C-CA---T--A-GC-----AA-------C------CCCC
gi|110341 : A---TTT---TA-AT-G--------G-TA-TT-ACATTGTA-T--A--------G-CA--T-C-AG-T--TTGG--AAATT-AG-T----TA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AC-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TCGATTAAC-------C------CCCTCCA-CCCCCCCC
gi|110342 : ---TA-AC-A--------A-TA-AT-G-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--GTGG--A---T-AA-T----CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AC-T-A-TG-GG-CA-C-TA---T--T-TC-----AT-------
blockSeqs : T G CTG C . A G G T T T ATTTA T AA TAGT ATT A T A T CT CCC C A T T TCT T C TA C TC T T A T CTATAG CT T G TT TTCA G G AC C T A C AT TTG A AT A C G TCC TT G A CT G C T AT C T T T T T A G T . T TTTC TC C TGA G AG T TA T T CG C T A TTA A C G T AA A A G C T A AAA C GA C TTG TT A C CA T C TG AA GC AT TG CAC TAAG A CT G T A A A A AT C A AT A G TA C C TACG AAG TAG C GTCTGTAAC T G AA T T AA T CCG C T TT A A A GG GA AAT G GT CATG TT T AC C TCTACA TT G T TTG T G T TTA AC T GATTA ATTACAAC A
blockSeqs : . . GG . . . . . . T T A . . AC G . T . . . C . . . . T . . . . . . . C C T . C A T . . C A . . . T TA CG . A . . . . . A T . . . . T . . . . . . . . . . . TTTG C . G . . T . . . G . . . T . . . A A . . . . . . . C . . GGT . A . . . . . . C T . C . . G . . . G . . A . A . . T G . . A AT C . AG . . AC . . . . C . . . G . . A . . T T C . . CT C T . . A TGA . C T . . A . CATTAAT .
blockSeqs : . . G . . . . . . . C . . . AC . . T . . . . . . . . T . . . . . . . . C . . T . T . . C . . . . . GA . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . G . . . . . . . . . . T . . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C A . C . . G . . . . . . A . . . . . . . . A T G . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . CTG . . . . . . . AGCAAC .
blockSeqs : . . G . . . . . . . G . . . AT . . T . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . T . T . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . . . T . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . C . . C . . . . . . A . . . . . . . . . . A . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . TG . . . . . . . TAAAC .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . T . . . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . T . . G . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . TG . . . . . . . AAAC .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . C . . C . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . TG . . . . . . . TAAC .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . C . . G . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . TG . . . . . . . TTAC .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . C . . C . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . G . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . TG . . . . . . . TAC .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . G . . C . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . TG . . . . . . . TAC .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . TG . . . . . . . C .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . C . . C . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . G . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . TT . . . . . . . C .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . G . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . TG . . . . . . . T .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . C . . G . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . TG . . . . . . . T .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . C . . A . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . CG . . . . . . . A .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . G . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . TG . . . . . . . T .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . G . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . TG . . . . . . . C .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . G . . C . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . G . . . . . . . A .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . A . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . T . . . . . . . A .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . C . . . . . . . T .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . G . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . T . . . . . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . T . . . . . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : ** T** C* ***
originalCons : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGG-G--T-A--T---T-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG-T-T--C----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---C---AA--A-T--GA-A--AGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--AAGCA-A---TTTTT--C-GA-C--AAA-T-GA--AG--ACA-CA--TT--TTCAGCCC--CG----GAG-AA-NT-AA-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TGTAGCT----TA---TGT---TA-GC-G--------G-TA-TT-A-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AG-T----CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AC-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TC-----AT-------C------CCCCCCC-CCCCCCCC
finalCons : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGG-G--T-A--T---T-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG-T-T--C----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---C---AA--A-T--GA-A--AGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--AAGCA-A---TTTTT--C-GA-C--AAA-T-GA--AG--ACAC-A--TT--TTCAGCCC--CG----GAG-AA-NT-AA-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TGTAGCT----TA---TGT---TA-GC-G--------G-TA-TT-A-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AG-T----CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AC-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TC-----AT-------C------CCCCCCC-CCCCCCCC
Alignments
lowQualScore : 11 111 1 22222222222222
lowQualScore : 1 1 2222 1 1 1 1 1 1 3 88 55555 1 22 7777 444 1 9 1 1 22 444 1 1 1 1 222 1 1 22 1 22 1 1 3 6 666666 22 6 3 44 3333 1 4 33 1 1 1 3 333 444 1 33 1 1 1 222 22 4 3 22 1 1 1 33 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 5555555 44 1 222 1 22 3 22 1 1 44 1 1 1 000 1 1 1 0 55 1 1 1 1 1 1 333 3 22 1 666 22 3 1 22 1 1 22 22 44 55 22 333 3333 1 33 1 1 1 3 1 1 22 1 3 22 1 3 44 1 1 6666 666 777 1 8888888888 1 1 333 1 1 22 1 444 1 1 22 3 1 1 44 22 444 3 33 5555 22 1 44 3 666666 22 1 3 4444 1 3 3 222 22 3 44444 88888888888888 1
lowQualScore : . . .... . . . . . . . .. ..... . .. .... ... . . . . .. ... . . . . ... . . .. . .. . . . . ...... .. . . .. .... . . .. . . . . ... ... . .. . . . ... .. . . .. . . . .. . . . . . . . . . . . ....... .. . ... . .. . .. . . .. . . . ... . . . . .. . . . . . . ... . .. . ... .. . . .. . . .. .. .. .. .. ... .... . .. . . . . . . .. . . .. . . .. . . .... ... ... . .......... . . ... . . .. . ... . . .. . . . .. .. ... . .. .... .. . .. . ...... .. . . .... . . . ... .. . ..... .............. .
lowQualScore : 6 6 4444 6 6 6 6 6 6 2 66 66666 6 22 0000 222 5 2 5 5 11 222 5 5 5 5 777 5 5 11 5 11 5 5 1 2 000000 11 2 1 44 3333 5 6 77 5 5 5 0 222 666 5 55 5 5 5 666 00 6 1 11 5 5 5 77 5 5 5 5 5 5 5 7 7 7 7 1111111 00 7 666 7 33 3 33 7 7 11 7 7 7 000 7 7 7 4 99 7 7 7 7 7 7 000 5 44 7 111 44 5 7 44 7 7 44 44 77 99 44 555 5555 7 22 7 7 7 3 7 7 99 7 3 33 7 3 00 7 7 9999 666 666 6 4444444444 6 6 888 7 7 33 7 666 7 7 33 3 7 7 00 33 666 3 88 2222 33 7 66 3 555555 33 7 3 1111 7 3 3 999 33 3 22222 22222222222222 9
consensus : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGG-G--T-A--T---T-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG-T-T--C----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---C---AA--A-T--GA-A--AGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--AAGCA-A---TTTTT--C-GA-C--AAA-T-GA--AG--ACA-CA--TT--TTCAGCCC--CG----GAG-AA-NT-AA-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TGTAGCT----TA---TGT---TA-GC-G--------G-TA-TT-A-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AG-T----CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AC-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TC-----AT-------C------CCCCCCC-CCCCCCCC
Reference ( family-626 ) : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGG-G--T-A--T---T-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG-T-T--C----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---C---AA--A-T--GA-A--AGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--AAGCA-A---TTTTT--C-GA-C--AAA-T-GA--AG--ACA-CA--TT--TTCAGCCC--CG----GAG-AA-NT-AA-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TGTAGCT----TA---TGT---TA-GC-G--------G-TA-TT-A-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AG-T----CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AC-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TC-----AT-------C------CCCCCCC-CCCCCCCC
gi|110312 : CCCCCGTTT-CATCTT-TTT--G-A-AGA-TA-A-TT-C-ATTCA-----TGG-G--T-A--T---T-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TT---AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG-T-T--C----A-T-A--TTT-T-A-TA-T-A-G---G-A--T--AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-ATATT-ATTTT---G---AA--A-T--GA-A--AGAG-TA--A-T-AC--G-G-CT-GC---T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--AAGCA-A---TTTTT--C-GA-C--AAA-T-GA--AG--AAA--A--TT--TTCAGCCC--CG----GAG-AA-CT-AA-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-CGTAGCT----TA---TGT---TA-GC-G--------G-TA-TC-A-ATTG-A-T----A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--AT--T-AG-T----CA--GG-TTCA--T-AGTG------TT--GC-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TC-----AT-------C------CCCCCCC-CCCCCCCC
gi|110313 : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-T-AT--A-----TTG-G--T-T--T---T-T-AAT-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AT------A--GTG-T-TT-C----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-T-G---G-A--TT-AAA-AA---G---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TC-ATTTT---A---AA--A-T--GA-A--AGAG-TATAG-T-AT--G-A-CT-GC---T-T-T-T-AA-GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--AAGCA-A---TTTTT--C-GA-C--AAA-T-GA--AG--ACA-CA--TT--TTCAGCCC--CG----GTG-AA-GT-AA-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-CTT--TTTAC-A-T--A-TAA-TGTAGCT----AA---TGCTAGTA-GC-G--------G-TA-TT-G-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AT-T----CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AC-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TC--------------C------CCCCCTC-CCC
gi|110314 : CTCCTATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGG-G--T-A--T---T-TTA-T-A--G---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTT---T-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTGTT-T--T----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-AA-CAA---ATG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TATT-T-A-T-C-AA-AA-CA-TC--AT-TC-ATTTT---C---AA--A-T--GA-A--AGGG-TA--A-T-AT--G-A-CT-GCT--T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-G-TT-TC---GA-A--AATCA-A---TTTTT--C-GA-C--AAA-T-GA--AG--ACG-CA--TT--TTCAGCCC--CG----GAG-AA-GT-AA-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TATAGCT----TA---TGT---TA-GC-G--------G-TA-TT-G-ATTG-A-T--A-A---A-GG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AG-T----CG--GG-TTCA--T-AATG------TT--AG-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TT-----AT-------C------CCCCCAC-TCCC
gi|110315 : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AA--A-----TGG-G--T-AC-T---T-T-A-T-A--A---G-G-G-G-ATA--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG-T-TT-C----A-T-A--TGT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TATA-GAT-AA--TG-CA-TA-C--TTTT-T-A-T-C--A-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---C---AA--A-T--AA-A--AGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GCT--T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---AA-A--AAACA-C---TTTTT--T-GA-C--AAA-T-GA--AG--ACA-CA--CT--TTCAGCTC--CA----GAG-AA-CT-AA-TT-AA-C-CGT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-A--T-TGA-TGTAGCT----TT---TGT---TG-GC-G--------G-TA-TT-A-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-TGGTTGG--A---T-AGTT----CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--GC-T-ATTG-GC-CA-C-TT---T--A-TC-----ATAAA----C------CCCCCCC-CCCCC
gi|110316 : CCCTCATTT-CATCTT-T----G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGG-A--T-A--T---T-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TT---AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-TGG-CT-AG------A--GTG-T-T--C----A-T-A--TCT-T---TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA--AT-AA--TG-CA-TA-A--TTCA-T-T-T-C-AATAA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---C---AA--A-----A-A--AGAG-TA--ATT-AC--G-A-CT-GCT--T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--ATGCA-A---TTTTT--T-GA-T--AAA-T-GA--AG--ACA-CA---T--TTCAGCCA--TG----GAG-AA-GT-AA-TT-GA-C-CAT-TGAATTTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TATAGCT----TA---TGT---TA-GC----------G-TA-TT-A-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGC--A---T-AT-T----CA--GG-TTCA--T-AATG------AT--AC-T-A-TG-GA-CA-C--T---T--A-TC-----AT-------T------ACCCCCC-CCCCCCCC
gi|110317 : CCTCCATTTTCATCTT-TTTCTG-A-A-A-TA-A-ATTC-AT--A-----TGG-G--T-A--T---T-TTA-T-A--A---G-G-T-G-TT---AGA-AT-TTGA--A-T--A-ATTAGG-CT-AG------A--GTG-T-TT-C----A-T-A--TCT-TTG-TA-T-A-G---G-AA-TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA--AT-AA--TG-CC-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---C---AA--A-A--TA-A--AGAG-T---A-T-AC--G-A-CT-GCT--T-T-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--AAGCA-A---TTTTT--CAGA-C--AAA-T-GA--AG--GGA-CA--TT--TTCTGCCC--C-----GAG-AA-CT-AA-TT-GA-C-CAT-TAAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TGTAGCT----TA---TGT---TA-GC-A--------G-TA-TT-A-ATTT-A----A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AG-TCATGCA--GG-TTCA--T-AAT-------TT--AC-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--T-TC-----AT-------CATTAATCCCCTCT-CC
gi|110318 : CCCCCATTT-CAT--T-TTT--A-A-A-A--A-A-AT----------------------A--T---T-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AAA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTA-T-TT-C----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-T-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---GGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-C--TTTT-T-A-T-A-AA-AA-CC-TTC-AT-TT-TTTTTTTTC---AA--A-T--GA-A--AGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-TTA--GCAGTTTA-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--AAGCA-A---TTTTT--C-GA-C--CAA-T-GA--AG--ACA-CA--TT--TTCAGCCC--CG----GAG-AG-GT-AA-TT-CA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TCTAGCT----TA---TGT---TA-GC-G--------G-TA-TT-G-ATTG-A-T----A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AG-TC---CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AT-T-A-TG-GG-CA-CTTT---T--A-TT-----ATTAA----C------ACCCTCT-ACCCCCC
gi|110319 : CCCCAATTT-CATGTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TAG-G--T-AC-T---T-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A----A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG-T-T--TTTCAA-TGA--TGT-T-A-TA-T-ATG---G-A--T--AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-G--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---C---AA--A-T--AA-AAGAGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---TAT-T-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---TA-A--AAGCG-A---TTCTT--C-GA-C---AA-T-GA--AG--ACA-CAT-TT--TTCAGCCC--CA----GAT-AA-CT-AA-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTCTT-TTT-AAT--TTTAC-AGT--A-TAA-ATTAGCT----TA---TGT---AA-GC-A--------G-TA-TT-A-A-TA-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AT-T----CA--AG-TTC--------G------TT-----T-A-TG-GG-CAGC-TT---T--A-TC-----ATATTACAAC------CCCCCCC-CCC
gi|110320 : CCCCCGTTT-CATCTT-TTT--G---A-A-TA-A-AT-A-A---A-----TGG-G--T-AT-T---T-T-A-T-A--A---GCG-T-G-TTT--AGA-AT-TTAA--A-T--A-AA-AGG-CT-AGT-----A--GT--T-T--C----A-T-A--TCT-T-A--A-T-A-G---G-A--TTAAAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--ATGT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---G---AA--T-T--GA-A--AGAA-TA--A-T-ATG-G-A-CT-GC---T-T-T-TAA--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--AAGCA-A---TTTTT--T-GA-C--AAATT-GA--AGAAAAA-AA--TT--TTCAGCCC--GG----GAG-AACTT-AA-TT-GA-CACAT-TGAA-TTTCT-TTT-A-T--TTTAC-ATT--A-TAA-TGTAGCT----AA---TGTC--TA-GC-G--------A-TA-TT-A-ATTG-ATT--G-A---A-AGTTA--TAA-GG-T--TT-G--A---T-AG-T----CA--GGTTTCA--T-AAT-------TT--GC-T-A--G-GG-CA-C-TTTTAT--A-TT-----AC-------T------CCCCCCC-CCCCC
gi|110321 : CCCCCATTT-CA-CTT-TTT----A-A-A-TA-A--T-C-A---A-----TGG-G--T----T---T-T-A-T-A--A---A-A-TTG-TTT--AGG-AT-TGGA--A-TTCA-AA-AGG-CT-TG------ACTGTA-T-T--C----A-T-A--TCTCT-A-TA-C-G-G---A-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA----CTTT-T-A-T-C-AA-AAACC-TCATCT-TT-ATT-----C---AA-------GA-C--AGAG-TC--A-T-AC--G-A-CC-GC---T-T-T---A--TCAGTTTG---A-T-A-TT-TC---GA-A--GAGCA-A---TTTT---C-GA-C--AAA-T-AA--AG--ACA-TA--GT--TTCAGCCG---G----GAG-AA-CT-AC-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT------TTTAC-A-T--A-TAA-TGCAGCT----TA---TG----TA-GC-A--------G-TAGTT-G-ATTG-A-T--A-A---A-AT-TA--T-T-GG-T--TTAG--A---TGAG-T----CA---G-TTCA--TCAATG------TT--AC-T-A-T--GG-CA-C-TT---T--A-TC-----ATTA-----C------ACCCCCC-CCCCCCCC
gi|110322 : CCCCCATTT-AATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A--T-T-ATT-A-----TTG-G--T-A--TG--T-T-A-T-A--A---G-G-G-G-TTT--AGC-AT-TTTA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTG-T-TT-C----A-T-A--CTT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---C----A--A-T---A-A--AGAT-TA--A-T--C--G-A-CT--CTTAT-T-C-T-A---CA-TTT--G-A-T-A--T-TC---AACA--AATCA-A---TTTTT--C-GACC--AAA-T-TA--AA--AC--TA--TT--TTC-GCCC--TG------A-AA-CT-AA--T-AA-C-CAT-TGA---TTC--TTT-ATT--TTTAC-A-------AA-AGTAGC-----TA---T-T---TA-GC-A--------T-TA-TT-G-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--C----G-T--TTGG--A---T-A--T----CA--GG-TCCAACT-AATGTCTACATT--AC-T-A-C--GG-CT-C-TT---T--A-TC-----ATTA-----C------ACCCCCC-CCACCCC
gi|110323 : CCCCC--TT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TAGA-AT-C-AT--------TGG-GAAT-A--T---TAT-A-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-T-GA--A-T--A-AG-A----T-AG------A--GTG-T-T-------A-T-A--ATC-T-A-TACT-A-G---A-----T-AAA-GA-CGA---AGG--T-TA-GAT-TA--TGGCA-TA-----TGT-T-A-TTC-GA-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---G---AA--A-T--GA-A--AT-G-TA--A-T-AC--GCA-TC-GC---T-T-T-A-A--G-AGTTTG-G-AGT-A-TT-TT---GA-A----GCA-A---TTTTT--C-GA-C--AAA-T-GA--AG--ACA-AA--TT--TTCAG-CC--CG----GAG--A-CT--A-TT--A-C-CAT-TGAT-TTCCT-TTT-ATT--TTTAC-A-T----T-A-TGTAGCT----TA---TGT---TC-GC-G--------A-TA-TT---ATTG---T--A-A---A-CG-TA--T-C-GG-T--TGGA--A---T-AT-T----CG--GT-TTCA--T-AATG------TT--GC-T-G--A-GG-CA-C-TT---T--A-TT------T-------A------CCCCCCC-CCCCCCC
gi|110324 : CCCCAATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TAG-G--C-A--T---T---A-T-T--A---G-A-T---TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CTTAG------A--GTGCT-T--C----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-T-GTTGG-A--TT-AAA-GA-CAA----GG--TCTA-GGT-AA--TA-CA-TA-A--TTTT-T-ATT-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TT-A-TTT---C---AA--A-T--TA-A--AGAGTTA--A-T-A---G-A-CT-GC---T-TCT-T-A--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TCAAAAA-A--AAGCC-ATTGTTTTT--T-G--C--AAA-T-AA--AG--ACA-CA--TTTGTTCAGCCCCACG----GAA-AA-GT-AA-TT-GA-C-CAT-TGA---TTTT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-AAA-TG-AGCT----TA---TGT---TA-GC-A--------G-TA-T
gi|110325 : CCCTCATGT-TATCTT-TTT--G-A-A-A----A-AT-CTAT--AA----TGG-A--TTAGTT---T-T-A-T-A--------G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--T-AA-AGG--T-AG------A--GTGTT-T--C----A-T-A--TCT-T-A-TA-T-G-A---G-A--TT-AAACGA-CAA---AGGTTTCTAGGATAAA--TG-CACTA-A--TTTT-T-A-T-C-CA-AA-CCGTCA-AT-TT-ATTTT---C---AAC-A-T--GC-A--AGAGTTA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-TGT-A--GCCATTTGAG-A-T-A-TT-TC---AACA--AAGCA-A---TTTTT--T-G-----AAA-TCGA--AG--ACA-CAATTT--CTCA-CAC--TG----CAGAAA-GT-AA--T-GA-C-CATATGA---TTCT-TTTAACT--TTTAC-A-TG-A-TGA--ATA-CTA---TA---TGT---TACGC-G--------T-T--TT---ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C----T--TTGG--A---T-AT-T----CA--GG-TTTA--TCAATG------AT--AC-T-A-T--GA-CA-C-TT---T--A--C-----AT-------T------ACCCCCC-CCCTCCCC
gi|110326 : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-AATA-A-AT-TTATT-A-----TGG-G--T-G--T---T-T-G-T-A--A---G-G-T-G-TTT--ATA-ATCTTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AA------T--GTG-T-TT-C----A-TCA--TCT-T-AATA-T-A-G---A-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TATA--TTTT-T-A-T-C-AA-A---C-TCA-A-----ATT------------------------AGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-T-A--GCAGTTTG-GAA-T-A-TT-TC---T--A--AAGCG-A---TTTTT--C-GA-T--AAA-T-GA--AG--ACAGCC--TT--TTCAGC
gi|110327 : CCCCCATTT-CATCTT-TTT--T-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--AATTTATGG-G--T-A--T---T-TTA-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AGCTATAGA--GTG-T-TT-C----A-T-A--CCT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-TA-AA-CC-TCA-AT-TT-ATTTT---C---AA--A-T--GA-A--AGAG-TA--A-T-
gi|110328 : CCCCCATTT-CATCTG-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGGTA--T-A--T---T-T-A---A--ACCCC-G-T-ATTTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-GA-GGGAGT-AG------A--GCT-T-T--C----A-T-A--TCT-T-A-TATT-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CTA---AGT--TC---AAT-AA--TG-CA--A-A--AATT-T-A-T-CTAA-AA----TCA----TT-ATTTT---C---AA--A-C----------------------C--G-ATCT-G----T-T-T-T-A--TCAG--TG-G-G-T-A--T-TC---GA-A-----CA-A---TTTTT--C-G----------------G--ACA-AA--TT--T-------------------AA-AC-AA----------AT-TGAA--TTCT-TTT-A-T--TTTAC-A-T--A-TAA-T-TAGCT----T----TGTG--TA-CC-A--------G--A-TT-A-ATTG-A-TAAA-A---A-AG-TA--T-C--G-T--TT-A--A---T-AG-T----CT--AG-TTC-----AAT-------TT--ACGT-A-T--TG-CA-C-TT---T--ATTC-----ATTTA----C------CCCTCCC-CCCCCC
gi|110329 : CCCCCATTT-CATCTT---------------A-A-AT-T-AT--A-----TTG-G--T-A--T---T-TTA-T-A--A---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--ATG-TGT--C----A-T-A--CCT-T-A-TA-T-A-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTA-GAT-AA--TG-CA-TA-A--TTTT-T-A-T-C-AA-AA-
gi|110330 : CTCCCATTT-GATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TAT-G--C-A--TATTT-T-A-T-A--A---G-G-T-G-TTA--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT----------------T-T--C----A-T-A--CCT-T-A-TA-T-T-G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---AGG--TCT
gi|110331 : CCCCGTTT-CATCTT-TTT----A-A-A-TA-A-AT-C-TA--A-----TGG-G--T-A--T---T-T-A-T-A--A---A-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CT-AG------A--GTGTT-T--C----A-T-T--TCT-T-A-TA-T-A-G---G-A---T-AAA-GA-CAA---A-G--TCTA-GTT-AA--TG-CA-TA-AT-TTTT-T-A-T-C--A-AA-CC-TCA-AT-TC-ATTTT---TG--AA--A-T--GA-A--TTAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-TAA--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-C--AAGCA-A---TTTTT--C-GA-C--GAA-T-GA--AG--ACA-AA--TT--ATCAG--C--CG----GAG-AA-GT-AA-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCTCTTT-A-T--TTTAC-A-T--A-TAA--GTAGCT----TA---TGT---C--GC----------G-TA--T-A-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C--G-T--TTGG--A---T-AG-T----CA--GG-TTTA--T-AATGT-----TT--GC-T-A-TGAGG-CA-C-TT---T----TC-----AC-------C------CCCCCAC-CCCCCCCC
gi|110332 : CCCCGTTT-CATCTT-TTT----A-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGG-T--T-T--T---A-T-A-T-A--AC--A-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AAG-CT-AG------A--GTG-T-TT-C----A-TCA--TCT-T-G-TA-TTA-G---G-A--TT-AAA----CAA---AG---TCTA-GAT-TA--TG-CA-TA-AATTTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC--CA-AT-TC-ATTTG---A---AC--A-T--GA-T---TAG-TA--A-T-CA--G-A-CT-GC---T-T-T-T-AA-GCAGTT-G-G-A-T-A-TTAGC---GA-A--A-GCA-A---TTTTT--C-GA-C--GAA-T-GA--AA--GAA-AA--TT--TTCACCAC--CG----GAG-AA-GT-AA-TT-GAAC-CAA-TGAA-CTTTT-CTT-ATTATTTTAC-A-T--CCTAA-TGTAGCTA---TA----GT---TC-GC-G--------G-TA-TT-A-ATTG-A-T--A-AC--A-AG-TA--T-C-GG-TA-TTGG--A---TTAG-T----C----G-TTTA--T-AATG------TTTTGC-TTACTG-GG-CA-C-TT---T--AATC-----AC-------A------CACCCCCACCCCCCCCccccc
gi|110333 : CCCCTTTT-CATCTT-TTT--GGA-A-A-TA-A-AT-C-AT--A-----TGG-A--T-A--T---T-TTA-T-A--A---G-G-T-G-GTT--ATA-AT-TTGA--A-T--CTAA-ATG-CT-AG------A--GTG-T-TTTC----A-T-A--TCT-T-A-TG-T-T-G---G-AATTT-AAA-GA-CAA---AGG--TCTAAGAT-AA--TG-CA-TA-A--ATTT-T-T-T-C--A-AA-CC-TCA-AT-TT-ATGTT---C---AA--ACT--GA-A--AGAG-TA--A-T-------A-CT-TT---T-T-T-T-A--GCAGTATA-G-A-T-ATTT-TT---GA-A--AAGCA-GGGTTTTTT--CAAA-CCAAAA-T-GA--AT--ACA--------------------G----GA--------AA-TT-----------------TCT-ATT-ATT--ATTACAA-T--A-TAA-ATTAGTTTACGTA---TGT---TA-GC-A--------T-TA-TT-G-ATTG-A-T--ATA---A-AG-TATTT-C-GG-T--TTGG--A---T-AT-T----CA--GG-TT-A--T-AATG------TT--A--T-A-TG-GG-CC-CTTT---T--A-TT-----ATTAAA---C------CCCCCCC-CCCC
gi|110334 : CCCCGTTT-GATCTT-TTT--G-A-A---TA-A-AT-C-ATC-A-----TGG-G--T-T--A---T-T-A-T-ACTA---G-G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--ACT--A-AA-AGG-CTCAA------A--GTG-T-T--T----A-T-AA-TCT-T---TA-T-A-GCG-A-A--TT-AAA-GA-CAA---AC---TCTACGATTAA--TG-CA-TA-A--CTTTCT-A-T-C-AA-A--CC-TCA--T-TT-ATTTT---TTTGAA--C-T--GA-A---GAG-TA--A-TTACCGG-A-TTAGC---T-T-T-T-AAAGCAGTTTG-G---T-A-TT-TC---GA-A--AAGCACA---TTTTTTTC--A-C--ACA-C-GATGAG--ACA-AAA-TC--TGCAAGCC--CGTAAGGAG-AA-CTGAA-TT-GA-C-CAT-TGAA-TTTCT-TTT--TT--TTTAC-A-CTAA-TAACTGTTG------TA---TGTA--TA-GCAG--------G-TG-AT-A-ATAG-A-T--A-ACCGA-AG-TA--T-C-GG-T--TTGGGAA---T-AG-T----CATTGG-TTCACTT-ACTG------TT--GC-TAA-TT-GG-C--C-TT---TACA-TC-----AT-------A------CCCCCCC-CCCCCCC
gi|110335 : CCCCTTTA-CAT-TT-TTT--G-A-A-A-TA-AGAT-C--T--A-----TAG-G--T----T---T-T-A-G-A--A---G-G-T-G-TT---AGA-AT-TTG---A-T--A-AA-AAGCCT-AT------A--GTG-TAT--C----A-T-A--ATC-T-A-TA-T-A-G---GAA--TT-AAA-GA-CAATCCTGT--TCT----T-AACTTC-TA-TA-A--TTTT-A-G-C-C-AA-AA-
gi|110336 : TT-CATCTTGTTT--G-ACA-A-AA-A-AT-C-ATG-A-----TGG-A--T-A--T---T-TTA-T-C--A---G-G-T-G-TTTCTAGATAT-TTGA--A-T--A-AA-GGC-CTCAG------A--GTT-T-T--C----AGT-T--TCT-T-A-CA-TGA-G---G-A--TT-AAA-AC-CAA---AGA--TC-A-GAT-AA--TG-CA-TA-A--CTTT-T-A-T-C-AA-AA-CC-TCA-AT-TTTATCTT---C---AATCA-T--GAGA--AGAG-TA--A-T-AC--G-A-CT-GC---T-T-T-TCA--GCAATTTT-G-G-TCA-TT-TC---GA-AGAAAGCA-A---TTATC--T-GA-T--AAA-T-GA--AG--ACA-CA--TT--TTCAGCCC--TG----GAG-AT-AT-AA-TTAGAGC-CA--TGAA-TTCTT-TCT-ATT--TTAAC-A-T--A-TAA-TATAGCT----TAT--TTT---TA-GC-A--------G-TA-TCAA-ATTG-A-T--A-A---ACAG-TA--T-C-GGAT--TTGG------T-AT-T----CA--GG-TT-A--T-GA-G-------T--AC-T-A-TG-AATCACC-TT---T--A-TC-----AT-------T------ACCCCTC-CCCtaacttcgcttgattgcctaaaa
gi|110337 : --T---T-T-A-TTA--A---G-GAT-G-TTT--AGA-AT-TTGATAA-T--T-AA-AGG-CTTAG------A--GTG-T-T--C----A-T-AACCCT-T-A-T--T-A-G---G-A--TT-AAA-GAGCAA---AAG--TCTA-GAT-A---TG-CA-TA-A--TTTT-TTA-T-C-AA-A--CC-TCA-AT-TT-AATTT---C---AA--A-TTGAA-A--AGAG-TA--A-T-GC--G-A-CT-GC---T-T-T-TTA--GCAGTTTG-G-A-T-A-TT-TC----A-A--GAGCA-A---TTTTT--C-GA-C--AAA-G-AA--AG--ACA-TA--TT--TTCAGCCT--GG----TAG-AA-CT-AATTT-AA-C-CAT-TGAA-TTTC--TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TAA-TGTAGCT----TAAT-CGT---TA-GC-A--------GTTA-TT-A-GTTG-A-T--A-A---A-AG-TT--T-C-GG-T--TTGG--A---T-AG-T----CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AC-T-A-C--GG-CC-C-TT---T--A-TC-----AT-------T------ACTCCCC-CCCCGCCC
gi|110338 : t-TA-T---G---G-A--TT-AAA-GA-CAA---GGG--TTTA-GAT-AA--TG-TA-TA-A--ATTT-T-A-T-C-AA-AA-TC-TCA-A--TT-ATTTT---C---AA--A-T--GA-A--AGAG-TA--A-T-AC--A-A-CT-GC---T-T-T-TGA--ACA--CTG-G-A-T-A-TT-TC---GA-A--AAACA-A---TTTTT--C-GA-C--AAA-T-GA--AG--ACA-CA--TT--------------------G-AA-GC-AA-TT-GA-T-CAT-CGAA-TTTTT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-TGA-TGTAGCT----TA---TG
gi|110339 : GTCT--TG----AAA-AA-TT-AA-TG-GC-C-CAT-TGAA-TTTTT-TTTAATT--TTTAC-A-T--A-TTT-TGTTGTT----GAAAGTGT---CT-GT-A--------A-CA-T----ATT--A-T--G-A---A-AG-TA--TGA-GG-T--GTGG------T-TT-T----CA--AG-GTCA--T-TGTG------AC--GC-T-A-TG---------TT---T--G-CC-----ATAGCAA--C------CCCCC
gi|110340 : ----GAC-AA-AT-AA-TG-GC-C-CAT-TGA--TTTTT-TTT-ATT--TTTAC-A-T--A-T-T-TGTAGTT----TA---AGT---AA-GT-GTCTGTAACG-TA-TT-A---TG------G-A---A-AT-TA--T-CAGG-T--ATGG------T-TT-T----CG--G---TCA--T-TATG------AC--GC-T-A-CG-GT-TA-C-CA---T--A-GC-----AA-------C------CCCC
gi|110341 : A---TTT---TA-AT-G--------G-TA-TT-ACATTGTA-T--A--------G-CA--T-C-AG-T--TTGG--AAATT-AG-T----TA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AC-T-A-TG-GG-CA-C-TT---T--A-TCGATTAAC-------C------CCCTCCA-CCCCCCCC
gi|110342 : ---TA-AC-A--------A-TA-AT-G-ATTG-A-T--A-A---A-AG-TA--T-C-GG-T--GTGG--A---T-AA-T----CA--GG-TTCA--T-AATG------TT--AC-T-A-TG-GG-CA-C-TA---T--T-TC-----AT-------