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Reference ( gi|101837 ) : CCCCCCCTTCT-AC--CCCCGT-----TCCG-TC-TGA-AA-CT-GA-ACGAC-G----TAA-CT----C----T----GT-AA-ATA--TCTC---C-G-AG---T-GT--T-A--GA-AA-AT--C--TGA-T-A-GACCAC----AT-T-A-C-G---AC--A-C-A-A-A-C-A--A-AAT-A-TCCG----TT--GTCA--C-G-T-A--T-T---A--T---T---CC---TT----TG--------ATTTAA---------T-GGAT--------TATC-AACT-GAT-C--A-ACTC-C-A------T-CA----TG--C-A-CGCACC
gi|101838 : CCCCCCTTTCT-AC--CCCCGT-----TCCG-TC-TGA-AA-CT-GA-ACGAC-G----TA--CT----C----T----GT-AA-ATC--TCTC---C-G-AG---T-GT--T-A--GA-AA-AT--C--CGA-T-A-GACCAC----AT-T-A-C-G---AC--A-C-A-A-A-C-A--A-A-T-A-TCCG----TT--GTCA--C-G-T-A--T-A---A--C---T---TC---CT----TG--------ATTTAA---------T-GGAT--------TATC-AACT-GAT-C--A-ACTC-C-A------T-CA----TG--C-A-CGCACC
gi|101839 : CCCCCCTTTCT-AC--CCCCGT-----TCCG-TC-TGA-AA-CT-GA--CGAC-G----TA--CT----C----T----GT-AA-ATC--TCTC---C-G-AG---T-GT--T-A--GA-AA-AT--C--CGA-T-A-GACCAC----AT-T-A-C-G---AC--A-C-A-A-A-C-A--A-AAT-A-TCCG----TT--GTCA--C-G-T-A--A-T---AACT---T---CC---TT----TG--------ATTTAA---------T--GAT--------TATC-AACT-GAT-C--A-ACTC-C-A------T-CA----TG--C-A-CGCACC
gi|101841 : CCCCTCCTTCT-AC--CCCCGT-----TCCG-TC-TTA-AA-CT-GA-ACGAC-G----TA--CT----C----T----GT-AA-ATA--TCTC---C-G-AG---T-GT--T-A--GA-AA-AT--C--CGA-T-A-GACCAC----AT-T-A-C-G---AC--A-C-C-A-A-G-A--A-AAA-A-TCCG----TT--GTCA--C-G-T-AT-T-T---T--T---T---CC---TT----TG--------ATTTAA---------T-GGAT--------TATC-AACT-GAT-C--A-ACTC-C-A------T-AA----T
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gi|101853 : CTCCCTCCC-CC--CCCCCC-----CCCA-TC-TGA-AG-CT-GA-ACGAC-G----TA--CT----C----T----GT-AA-AAC--TCTC---C-G-AG---T-GT--T-A--GA-AA-AT--C--CGA-T-A-GACCAC----AT-T-A-C-G---AC--A-C-A-A-A-C-A--A-AAT-A-TCCA----TT--G-CG--C-G-T-A--TAA---A--T---T---CC---TT----TG--------ATTTAA---------T-GGGT--------T----------AT-C--A-ACTC-C----------CA----TG--C-A-CACACCcctgcgacc
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gi|101858 : C--TCCCGT-----TCCG-TC-TGA-CA-CT-GA-ATGAC-G----TA--CT----C----T----GT-AA-ATA--TCTC---C-G-AG---T-GA--T-A--CA-AA-AT--C--CGA-T-A-CACCACGTAAAT-T-A-C-G---AA--A-C-A-A-G-C-A--A-AAT-A-TGCG----TT--GTCA--C-G-T-A--T-TT--A--C---T---CC---TT----TT--------ATTTAA---------T-GGAT--------TATG-AACT-TTT-C--A-ACTT-C-A------T-CA----TC--C-A-TGCAC
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Reference ( family-609 ) : CCCCCCCTTCT-AC--CCCCGT-----TCCG-TCC-GAA-A-CT-GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-A-C-AA-AA-T-A-TCCG----TTG--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------NATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTC-C-A--T-C---A----T--CC---A-CGCACC
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gi|101840 : CCACCCTTTCC-AT--CTCTGT-----TCTG-TCT-GAA-A-CT-GA-ACGAC-G-------A-CTC----T------GT-A-A---AT-T-TATC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-CA-AT--C--CTA-TA-TACCAC----ATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-A-C-AA-AA-T-A-TCAA----TTG--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTC-C-A--T-C---A----T--CC---A-TGCACC
gi|101841 : CCCCTCCTTCT-AC--CCCCGT-----TCCG-TCT-TAA-A-CT-GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-A-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--C-A-C-CA-A-G-AA-AA-A-A-TCCG----TTG--TCA--C-G-T-A-TT-----TTT-TCC-TTT-----------GATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTG--ATC-AACTC-C-A--T-A---A----T--
gi|101842 : CCCCCCCCTCC-AC--CCC-GT-----TCGG-TCT-GAA-A-CT-GA-ACGCC-G-----TTA-CTCGCGCT------GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---TTG-C-TGTA--GA-AA-AT--C--CGA-TAAGACCAC----ATT-A-CCG---A--A-ATC-AA-A-C-AA-AAAT-A-TCCG----TTGAGTCAAGC-G-T-A-TT-----TAC-TCT-TTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCCTAACTC-C-A--T-C---A----T--CC---A-TGCACC
gi|101843 : CCCCCCCTTCT-AT--TCCCG-------CCGGTCT-GAA-A-CT-GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-C-TCTA-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-A---C--CGA-TA-GACCA-----ATT-A-C-G---ACCA-A-CAAA-A-CAAA-AA-T-ACTCCGT---TTG--TCA--C-G-T-A-TT-----TA--TCC-CCT-----------GAATTAA---------TGGGA-T--------TATCAA--CTGGATCA-TACTC-C-A--T-C---A----TTGCT---A-CGCA
gi|101844 : CCCCCCTTTCT-AC--CTCCGT-----TCCG--CT-GAC-A-CT-GA-ACGAC-GACGTTT-A-CTC----T------AT-AGA---AT-C-TC-C-CA-AG---T-G-T-T--TTTGATCA-AT--C--GAA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--A---C-AA-A-C-AA-AA-T-A-TCCGG---TTG--TCA----A-T-A-TA------AA-TTC-TTT-----------GATTTAA---------T-GGA-T---------ATCAA--CTG--ATC-AACTC-C-A--T-C---A----T--GC---A-CGCAC
gi|101845 : CCCCCCTTTT-CCTACCTCGA-----TCCG-TCCTGAC-A-CTTGA-ACGAC-GAG---T-A-CTTCA--T------AT-A-A---AT-C-TCTC-CA-AG---T-T-T-T-----GA-CA-AT--C--CGA-TA--ACC-C----ATT-C-C-G---A--C-A-C-AA-AAC-AA-AA-TCA-TCCG----TTG--TCA--T-A---A-TA-----AAT-TCC-TTT-----------GATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTGA-TC---ACTC-CAA--T-C---A----T--GC---A-CGCACC
gi|101846 : CCCCCCCCTC--AC--CCC--------TCAA-TT--GAA-A-CTAGA-AAGGC-G-----TTA-CTC----------------A---TT-C-TCTC-TG-GA---TCG-T-T-----GA-AA-AT--C--TGA-TA-GACCAC----ATT-A-T-G---A--A-A-C-GA-A-C-AA-AA-T-A-TCTG----TTG--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TA-TTAA---------G-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTC-C-A--T-T---A----G--AC---ATTGCACC
gi|101847 : CCCCTCTTCTTAA--CCCCGT-----TCCG-TCT-GAA---CT-GA-ACGACTG-----C-AACTC----T------GT-A-A---ATACATCTC-CG-AG---T-G-TGT--A--GA-AA-AT--CACCGA-TA-GAC-AC----CTT-AAC-G---C--ACA-C-AA---C-AA-AA-T-A-TCCG----CTG--TCA--C-G-T-A-TT-----TAT-TCC---------------------------------GGA-TA-------TTTCAA--CTG--ATC-AACTC-A-A--T-C---A----T--GC---T-CGCACC
gi|101848 : CCCCCC------C--CCCCCT-----TCCG-TC---AA-A-CT-GATAC----------T-A-CT-----T------GT-A-A---ATTC-TCTC----AG---T-G-T-T--A--TA-GATAT--C--CGA--A-GAC-AC----ATT-A-C-G---A--A-A-A-AA-A-G-AA-AT-G-A-TTCG----T----TCA--C-G-T-A-TT-----TACATCC-TTT-----------T-TATAA---------T-GGA-TA-------TAT-AA--C-T--TCC-AA--C-C-A--T-C---A----T--CC---
gi|101849 : CCCCCCCCCC---C--CCCCGT-----TCTG-TCT-TGA-A-CT-GACATGAC-A-----T---TTC----T------GTTA-A---AT-C-TCCC-CC--GCCCT-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-CACCAC----A-T-A-C-A---A--ACA-C-AATA-C-AA-AT-C-C-TCCGT---TTG--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCTGTTT-----------TATATAtgcgacc
gi|101850 : CCCCCTCC-AC--CCCCGT-----TCCG-TGT-AAA-A-CT-GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------AT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-G--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-GGCCAC----ATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-A-C-AC-AA-T-A-TCCG----TTG--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TACTTAATGGATTTTTT-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTC-C-A--T-C---A----T--CC---A-TGCACC
gi|101851 : CCCCCTCC-AC--CCCCGT-----TCCG-TGA-TAA-A-C--GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------AT-A-A---AT-C-TCTC--G-AG---T-G-T-G--A--GA-AA-AT--C--CGACTA-GGCCAC----ATT-A-C-GG--A--A-A-C-AA-A-C-AC-AA-T-A-TCCG----TTG--TCA--C-GTT-A-TT-----TACTTCC-TTT-----------TACTTAA---------T-GGA-TTTTTTGGATATCAAACTTT--TCC-AACTC-CAA--T-C---A----T--CC---A-TGCACC
gi|101852 : CCCCCCCCCT--C--CTTCGT-----TCCG-TCT-GAA-A-CT-GA-ATGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-A-TCTC-CG-AG---T-G-A-T--A--CA-AA-AT--C--CGA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-A-C-AA-AA-T-A-TCTG-----------------------T-----TAC-TCC-TTT-----------TATTT------------------------------AA--CTT--TCC-AACTC-C-A--T-CCATG----T--AC---A-TGCACC
gi|101853 : CTCCCTCCC-CC--CCCCCC-----CCCA-TCT-GAA-G-CT-GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AA-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--C-A-C-AA-A-C-AA-AA-T-A-TCCA----TTG---CG--C-G-T-A-TA-----AAT-TCC-TTT-----------GATTTAA---------T-GGG-T--------TATCAA--C----TCC--------------C---A----T--GC---A-CACACC
gi|101854 : CC-AC--CCCCAT-----TC-G-TCC-GAA-A-CT-TA-ATGAC-------------------------------------C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--T--CGA-TA-GACCAC----A-T-A-TGG---A--A-A-C-AA-A-C-AA-AA-G-A-TACT----TTA--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-CCC-TTT------------ATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AAAGC-C-A--C-C---A----T--CC---A-TGCACCgaactccacatctagcatc
gi|101855 : T-AC--CCCTCT-----TCCG-TCC-GAA-A-CT-GA-ATGGC-G-----C-A-CAT----T------GT-A-A---AT-A-TCTC-CG-AT---T-G-T-T--A--GA-AA-TA--C--CGA-TA-TACCAC----ATT-A-A-G---A--A-A-C-AA-A-C-AA-AA-
gi|101856 : -AC--CCCCGTACCCTTTCA-TCC-GAA-A-CT-AA-ATGAC-G-----T-A-CTG----T------GT-A-A---AT-C-TTTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AC--C--AGA-TG-GACCAA----ATT-A-G-G------------AA-A-C-AA-AG-G-A-TCCG----TTA--TCA--C-G-T-G-TT-----TGC-CCT-TTTACTGGTACATGTATTTAA---------A-CGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTC-C-A--T-C---A----T--CC---A-TCCACC
gi|101857 : -AC--CCCCCT-----TCCG-TTC-GAA-A-CT-GA-ATGCC-G-----T-A-CTG----T------GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CG------------------------------------AA-A-C-AA-AA-T-A-TCAG----TTA--CCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-ATC-----------C--TTAA---------T-AGA-T--------TATCAA--TTT--TTC-AACTC-C-A--T-C---G----T--CC---A-TGC
gi|101858 : C--TCCCGT-----TCCG-TCT-GAC-A-CT-GA-ATGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-A-TCTC-CG-AG---T-G-A-T--A--CA-AA-AT--C--CGA-TA-CACCACGTAAATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-G-C-AA-AA-T-A-TGCG----TTG--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATGAA--CTT--TTC-AACTT-C-A--T-C---A----T--CC---A-TGCAC
gi|101859 : C--TCCCGT-----TCCG-TCT-GACCA-CT-GA-ATGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-A-TCTC-CG-AG---T-G-A-T--A--CA-AA-AT--C--CGA-TA-CACCACGTAAATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-G-C-AA-AA-T-A-TGCG----TTG--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCCTTTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATGAA--CTT--TTC-AACTT-C-A--T-C---A----T--CC---A-TGCAC
gi|101860 : C--CCCCCT-----TCCG-TC--GAA-A-CT-GA-ATGAC-------T-A-CTG----T------GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-A----T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-GAGCAC----ATT-AGC-G---A--A-A-C-AA-A-G-AATAA-G-A-TCCGT---TTG--TCA--CAG-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TA-TTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTC-CAA--TGT---A----T--CC---A-TGCAC
gi|101861 : C--CCCCCT-----TTCG-TTC-GAA-A-CT-GA-AGGAC-G-----T-A-CTG----TATGT--GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AC--C--
gi|101862 : --CCCCTT-----TCCG-TTC-GAA-ATCT-GA-A--AC-G-----T-A-ATC----TCAAAACGT-A-A---AT-A-TTTC-CGTAG---T-C-T-T--A---A-AA-AT--C--GAA-TA-GACC-C-----TT-A-T-G---A--A-A-CTAG-A-A-AA-AA-G-A-TCCG----T-G--TCA----G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TAAT-AA---------T-GGA-T--------TATAAA--CTT--TCC--ACT--C-A--T-C---A----C--CC---A-
gi|101863 : CCCAT-----TC-G-TCC-GAA-A-CT-TA-ATGAC-------------------------------------C-TCTC-CG-A----T-GTT-T--A--GA-AA-AT--T--CGA-TA-GACCAC----A-T-A-TGG---A--A-A-C-AA-A-C-AA-AA-G-A-TACT----TTA--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC--CC-TTT------------ATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AAAGC-C-A--C-C---A----T--CC---A-TGCACCt
gi|101864 : -A-TTC----T------GT-A-A---AT-C-TTTC-TG-GA---T-G-T-T--A--GA-AC-AC--C--CAA-T---ACTAG----A-G-A-G-G---G--A-A-A-AC-A-C-TA-AA-T-A----G----TTT--TCA--C-A-TCA-TT-----TAC--CC-ATT-----------GCTTTAG---------T-GGG----------TATCAA--ATT--TCC-AAATC-C-A--T-G---C----T--CCAAAA-TGCACC
gi|101865 : ----T------GT-A-ACATAT-C-TCTCACG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-ATCAC--CGA-TA-GAGCAC----ATTAA-C-G---A--A-A-C-AA-A-G-AA-AA-G-A-TTTGCAGATTG--TCA--C-G-T-A-TTACATATAC-TAG-TTT-----------AATTTAT---------TGGGA-T--------TATCA
gi|101866 : A-AT--C--CGA-TACGACCAG----AAT-T-C-GGAGA--A-A-C-AA-A-C-AATAA-T---CCCG-----TG--TCA--C-G-T-ACTT-----TAC-TCC-TTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATAAA--C-T--TCC-AACGT-C-AATT-C---A----T--CC---A-TGCACtttatca
gi|101867 : -AC--C--CGA-TA-GACCAT----ATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-A-G-CA-GA-G-A-TGCG----TCA--CTA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------T-TTTAA---------A-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTCTC-A--T-C---ACCATT--CC---A-TGCACC
gi|101868 : TC-A-C-A---A--C-A-C-AA-T-C-AACAA-T-A-TCCA----TTG--TCA--C-GTT-A-TT-----TAT-TCC--TT-----------GATTTAA---------T---ATT--------TATAAG--CTG--ATC-AACTC-C-A--T-C---A----T--
Alignments
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lowQualScore : .. .. ..... . .. . . . . . ..... . . .... ...... . . ... . . . . ... . . . .. .. . . .. .. . . .... . . . ... .. . . . . . . . ... . .... . .. .. . . . . ..... . . ............ ......... . . ........ .. .. . . . .. . ... .... .. ... ..
lowQualScore : 11 11 77777 5 99 5 5 0 0 5 77777 9 9 8888 999999 4 4 444 8 4 4 4 444 8 4 4 99 99 4 3 88 88 3 7 7777 3 6 9 555 88 6 3 6 3 3 3 9 444 3 8888 3 88 88 3 7 3 3 33333 0 7 666666666666 555555555 8 4 88888888 00 44 4 4 3 00 4 555 0000 00 777 33
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Reference ( family-609 ) : CCCCCCCTTCT-AC--CCCCGT-----TCCG-TCC-GAA-A-CT-GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-A-C-AA-AA-T-A-TCCG----TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTC-C-A--T-C---A----T--CC---A-CGCACC
gi|101837 : CCCCCCCTTCT-AC--CCCCGT-----TCCG-TCT-GAA-A-CT-GA-ACGAC-G-----T-AACTC----T------GT-A-A---AT-A-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--TGA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--C-A-C-AA-A-C-AA-AA-T-A-TCCG----TT-G--TCA--C-G-T-A--T-----TAT-TCC-TTT-----------GATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTG--ATC-AACTC-C-A--T-C---A----T--GC---A-CGCACC
gi|101838 : CCCCCCTTTCT-AC--CCCCGT-----TCCG-TCT-GAA-A-CT-GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--C-A-C-AA-A-C--A-AA-T-A-TCCG----TT-G--TCA--C-G-T-A--T-----AAC-TTC-CTT-----------GATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTG--ATC-AACTC-C-A--T-C---A----T--GC---A-CGCACC
gi|101839 : CCCCCCTTTCT-AC--CCCCGT-----TCCG-TCT-GAA-A-CT-G--ACGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--C-A-C-AA-A-C-AA-AA-T-A-TCCG----TT-G--TCA--C-G-T-A-AT-----AACTTCC-TTT-----------GATTTAA---------T--GA-T--------TATCAA--CTG--ATC-AACTC-C-A--T-C---A----T--GC---A-CGCACC
gi|101840 : CCACCCTTTCC-AT--CTCTGT-----TCTG-TCT-GAA-A-CT-GA-ACGAC-G-------A-CTC----T------GT-A-A---AT-T-TATC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-CA-AT--C--CTA-TA-TACCAC----ATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-A-C-AA-AA-T-A-TCAA----TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTC-C-A--T-C---A----T--CC---A-TGCACC
gi|101841 : CCCCTCCTTCT-AC--CCCCGT-----TCCG-TCT-TAA-A-CT-GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-A-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--C-A-C-CA-A-G-AA-AA-A-A-TCCG----TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TTT-TCC-TTT-----------GATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTG--ATC-AACTC-C-A--T-A---A----T--
gi|101842 : CCCCCCCCTCC-AC--CCC-GT-----TCGG-TCT-GAA-A-CT-GA-ACGCC-G-----TTA-CTCGCGCT------GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---TTG-C-TGTA--GA-AA-AT--C--CGA-TAAGACCAC----ATT-A-CCG---A--A-ATC-AA-A-C-AA-AAAT-A-TCCG----TT-GAGTCAAGC-G-T-A-TT-----TAC-TCT-TTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCCTAACTC-C-A--T-C---A----T--CC---A-TGCACC
gi|101843 : CCCCCCCTTCT-AT--TCCCG-------CCGGTCT-GAA-A-CT-GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-C-TCTA-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-A---C--CGA-TA-GACCA-----ATT-A-C-G---ACCA-A-CAAA-A-CAAA-AA-T-ACTCCGT---TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TA--TCC-CCT-----------GAATTAA---------TGGGA-T--------TATCAA--CTGGATCA-TACTC-C-A--T-C---A----TTGCT---A-CGCA
gi|101844 : CCCCCCTTTCT-AC--CTCCGT-----TCCG--CT-GAC-A-CT-GA-ACGAC-GACGTTT-A-CTC----T------AT-AGA---AT-C-TC-C-CA-AG---T-G-T-T--TTTGATCA-AT--C--GAA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--A---C-AA-A-C-AA-AA-T-A-TCCGG---TT-G--TCA----A-T-A-TA------AA-TTC-TTT-----------GATTTAA---------T-GGA-T---------ATCAA--CTG--ATC-AACTC-C-A--T-C---A----T--GC---A-CGCAC
gi|101845 : CCCCCCTTTT-CCTACCTCGA-----TCCG-TCCTGAC-A-CTTGA-ACGAC-GAG---T-A-CTTCA--T------AT-A-A---AT-C-TCTC-CA-AG---T-T-T-T-----GA-CA-AT--C--CGA-TA--ACC-C----ATT-C-C-G---A--C-A-C-AA-AAC-AA-AA-TCA-TCCG----TT-G--TCA--T-A---A-TA-----AAT-TCC-TTT-----------GATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTGA-TC---ACTC-CAA--T-C---A----T--GC---A-CGCACC
gi|101846 : CCCCCCCCTC--AC--CCC--------TCAA-TT--GAA-A-CTAGA-AAGGC-G-----TTA-CTC----------------A---TT-C-TCTC-TG-GA---TCG-T-T-----GA-AA-AT--C--TGA-TA-GACCAC----ATT-A-T-G---A--A-A-C-GA-A-C-AA-AA-T-A-TCTG----TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TA-TTAA---------G-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTC-C-A--T-T---A----G--AC---ATTGCACC
gi|101847 : CCCCTCTTCTTAA--CCCCGT-----TCCG-TCT-GAA---CT-GA-ACGACTG-----C-AACTC----T------GT-A-A---ATACATCTC-CG-AG---T-G-TGT--A--GA-AA-AT--CACCGA-TA-GAC-AC----CTT-AAC-G---C--ACA-C-AA---C-AA-AA-T-A-TCCG----CT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TAT-TCC---------------------------------GGA-TA-------TTTCAA--CTG--ATC-AACTC-A-A--T-C---A----T--GC---T-CGCACC
gi|101848 : CCCCCC------C--CCCCCT-----TCCG-TC---AA-A-CT-GATAC----------T-A-CT-----T------GT-A-A---ATTC-TCTC----AG---T-G-T-T--A--TA-GATAT--C--CGA--A-GAC-AC----ATT-A-C-G---A--A-A-A-AA-A-G-AA-AT-G-A-TTCG----TT-----CA--C-G-T-A-TT-----TACATCC-TTT-----------T-TATAA---------T-GGA-TA-------TAT-AA--C-T--TCC-AA--C-C-A--T-C---A----T--CC---
gi|101849 : CCCCCCCCCC---C--CCCCGT-----TCTG-TCT-TGA-A-CT-GACATGAC-A-----T---TTC----T------GTTA-A---AT-C-TCCC-CC--GCCCT-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-CACCAC----A-T-A-C-A---A--ACA-C-AATA-C-AA-AT-C-C-TCCGT---TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCTGTTT-----------TATATAtgcgacc
gi|101850 : CCCCCTCC-AC--CCCCGT-----TCCG-TGT-AAA-A-CT-GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------AT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-G--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-GGCCAC----ATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-A-C-AC-AA-T-A-TCCG----TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TACTTAATGGATTTTTT-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTC-C-A--T-C---A----T--CC---A-TGCACC
gi|101851 : CCCCCTCC-AC--CCCCGT-----TCCG-TGA-TAA-A-C--GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------AT-A-A---AT-C-TCTC--G-AG---T-G-T-G--A--GA-AA-AT--C--CGACTA-GGCCAC----ATT-A-C-GG--A--A-A-C-AA-A-C-AC-AA-T-A-TCCG----TT-G--TCA--C-GTT-A-TT-----TACTTCC-TTT-----------TACTTAA---------T-GGA-TTTTTTGGATATCAAACTTT--TCC-AACTC-CAA--T-C---A----T--CC---A-TGCACC
gi|101852 : CCCCCCCCCT--C--CTTCGT-----TCCG-TCT-GAA-A-CT-GA-ATGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-A-TCTC-CG-AG---T-G-A-T--A--CA-AA-AT--C--CGA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-A-C-AA-AA-T-A-TCTG------------------------T-----TAC-TCC-TTT-----------TATTT------------------------------AA--CTT--TCC-AACTC-C-A--T-CCATG----T--AC---A-TGCACC
gi|101853 : CTCCCTCCC-CC--CCCCCC-----CCCA-TCT-GAA-G-CT-GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AA-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--C-A-C-AA-A-C-AA-AA-T-A-TCCA----TT-G---CG--C-G-T-A-TA-----AAT-TCC-TTT-----------GATTTAA---------T-GGG-T--------TATCAA--C----TCC--------------C---A----T--GC---A-CACACC
gi|101854 : CC-AC--CCCCAT-----TC-G-TCC-GAA-A-CT-TA-ATGAC-------------------------------------C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--T--CGA-TA-GACCAC----A-T-A-TGG---A--A-A-C-AA-A-C-AA-AA-G-A-TACT----TT-A--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC--CC-CTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AAAGC-C-A--C-C---A----T--CC---A-TGCACCgaactccacatctagcatc
gi|101855 : T-AC--CCCTCT-----TCCG-TCC-GAA-A-CT-GA-ATGGC-G-----C-A-CAT----T------GT-A-A---AT-A-TCTC-CG-AT---T-G-T-T--A--GA-AA-TA--C--CGA-TA-TACCAC----ATT-A-A-G---A--A-A-C-AA-A-C-AA-AA-
gi|101856 : -AC--CCCCGTACCCTTTCA-TCC-GAA-A-CT-AA-ATGAC-G-----T-A-CTG----T------GT-A-A---AT-C-TTTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AC--C--AGA-TG-GACCAA----ATT-A-G-G------------AA-A-C-AA-AG-G-A-TCCG----TT-A--TCA--C-G-T-G-TT-----TGC-CCT-TTTACTGGTACATGTATTTAA---------A-CGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTC-C-A--T-C---A----T--CC---A-TCCACC
gi|101857 : -AC--CCCCCT-----TCCG-TTC-GAA-A-CT-GA-ATGCC-G-----T-A-CTG----T------GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CG------------------------------------AA-A-C-AA-AA-T-A-TCAG----TT-A--CCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-ATC-------------CTTAA---------T-AGA-T--------TATCAA--TTT--TTC-AACTC-C-A--T-C---G----T--CC---A-TGC
gi|101858 : C--TCCCGT-----TCCG-TCT-GAC-A-CT-GA-ATGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-A-TCTC-CG-AG---T-G-A-T--A--CA-AA-AT--C--CGA-TA-CACCACGTAAATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-G-C-AA-AA-T-A-TGCG----TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATGAA--CTT--TTC-AACTT-C-A--T-C---A----T--CC---A-TGCAC
gi|101859 : C--TCCCGT-----TCCG-TCT-GACCA-CT-GA-ATGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-A-TCTC-CG-AG---T-G-A-T--A--CA-AA-AT--C--CGA-TA-CACCACGTAAATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-G-C-AA-AA-T-A-TGCG----TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCCTTTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATGAA--CTT--TTC-AACTT-C-A--T-C---A----T--CC---A-TGCAC
gi|101860 : C--CCCCCT-----TCCG-TC--GAA-A-CT-GA-ATGAC-------T-A-CTG----T------GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-A----T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-GAGCAC----ATT-AGC-G---A--A-A-C-AA-A-G-AATAA-G-A-TCCG----TTTG--TCA--CAG-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TATT-AA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTC-CAA--TGT---A----T--CC---A-TGCAC
gi|101861 : C--CCCCCT-----TTCG-TTC-GAA-A-CT-GA-AGGAC-G-----T-A-CTG----TATGT--GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AC--C--
gi|101862 : --CCCCTT-----TCCG-TTC-GAA-ATCT-GA-A--AC-G-----T-A-ATC----TCAAAACGT-A-A---AT-A-TTTC-CGTAG---T-C-T-T--A---A-AA-AT--C--GAA-TA-GACC-C-----TT-A-T-G---A--A-A-CTAG-A-A-AA-AA-G-A-TCCG----T--G--TCA----G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TAAT-AA---------T-GGA-T--------TATAAA--CTT--TCC--ACT--C-A--T-C---A----C--CC---A-
gi|101863 : CCCAT-----TC-G-TCC-GAA-A-CT-TA-ATGAC-------------------------------------C-TCTC-CG-A----T-GTT-T--A--GA-AA-AT--T--CGA-TA-GACCAC----A-T-A-TGG---A--A-A-C-AA-A-C-AA-AA-G-A-TACT----TT-A--TCA--C-G-T-A-TT-----TA---CC-CTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AAAGC-C-A--C-C---A----T--CC---A-TGCACCt
gi|101864 : -A-TTC----T------GT-A-A---AT-C-TTTC-TG-GA---T-G-T-T--A--GA-AC-AC--C--CAA-T---ACTAG----A-G-A-G-G---G--A-A-A-AC-A-C-TA-AA-T-A----G----TT-T--TCA--C-A-TCA-TT-----TAC--CC-ATT-----------GCTTTAG---------T-GGG----------TATCAA--ATT--TCC-AAATC-C-A--T-G---C----T--CCAAAA-TGCACC
gi|101865 : ----T------GT-A-ACATAT-C-TCTCACG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-ATCAC--CGA-TA-GAGCAC----ATTAA-C-G---A--A-A-C-AA-A-G-AA-AA-G-A-TTTGCAGATT-G--TCA--C-G-T-A-TTACATATAC-TAG-TTT-----------AATTTAT---------TGGGA-T--------TATCA
gi|101866 : A-AT--C--CGA-TACGACCAG----AAT-T-C-GGAGA--A-A-C-AA-A-C-AATAA-T---CCCG-----T-G--TCA--C-G-T-ACTT-----TAC-TCC-TTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATAAA--C-T--TCC-AACGT-C-AATT-C---A----T--CC---A-TGCACtttatca
gi|101867 : -AC--C--CGA-TA-GACCAT----ATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-A-G-CA-GA-G-A-TGCG----TC-A--CTA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------T-TTTAA---------A-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTCTC-A--T-C---ACCATT--CC---A-TGCACC
gi|101868 : TC-A-C-A---A--C-A-C-AA-T-C-AACAA-T-A-TCCA----TT-G--TCA--C-GTT-A-TT-----TAT-TCC--TT-----------GATTTAA---------T---ATT--------TATAAG--CTG--ATC-AACTC-C-A--T-C---A----T--
Alignments
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lowQualScore : .. .. ..... . .. . . . . . ..... . . .... ...... . . ... . . . . ... . . . .. .. . . .. .. . . .... . . . ... .. . . . . . . . ... . .... . .. .. . . . . ..... . . ............ ......... . . ........ .. .. . . . .. . ... .... .. ... ..
lowQualScore : 11 11 77777 5 99 5 5 0 0 5 77777 9 9 8888 999999 4 4 444 8 4 4 4 444 8 4 4 99 99 4 3 88 88 3 7 7777 3 6 9 555 88 6 3 6 3 3 3 9 444 3 8888 3 88 88 3 7 3 3 33333 0 7 666666666666 555555555 8 4 88888888 00 44 4 4 3 00 4 555 0000 00 777 33
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Reference ( family-609 ) : CCCCCCCTTCT-AC--CCCCGT-----TCCG-TCC-GAA-A-CT-GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-A-C-AA-AA-T-A-TCCG----TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTC-C-A--T-C---A----T--CC---A-CGCACC
gi|101837 : CCCCCCCTTCT-AC--CCCCGT-----TCCG-TCT-GAA-A-CT-GA-ACGAC-G-----T-AACTC----T------GT-A-A---AT-A-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--TGA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--C-A-C-AA-A-C-AA-AA-T-A-TCCG----TT-G--TCA--C-G-T-A--T-----TAT-TCC-TTT-----------GATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTG--ATC-AACTC-C-A--T-C---A----T--GC---A-CGCACC
gi|101838 : CCCCCCTTTCT-AC--CCCCGT-----TCCG-TCT-GAA-A-CT-GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--C-A-C-AA-A-C--A-AA-T-A-TCCG----TT-G--TCA--C-G-T-A--T-----AAC-TTC-CTT-----------GATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTG--ATC-AACTC-C-A--T-C---A----T--GC---A-CGCACC
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gi|101842 : CCCCCCCCTCC-AC--CCC-GT-----TCGG-TCT-GAA-A-CT-GA-ACGCC-G-----TTA-CTCGCGCT------GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---TTG-C-TGTA--GA-AA-AT--C--CGA-TAAGACCAC----ATT-A-CCG---A--A-ATC-AA-A-C-AA-AAAT-A-TCCG----TT-GAGTCAAGC-G-T-A-TT-----TAC-TCT-TTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCCTAACTC-C-A--T-C---A----T--CC---A-TGCACC
gi|101843 : CCCCCCCTTCT-AT--TCCCG-------CCGGTCT-GAA-A-CT-GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-C-TCTA-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-A---C--CGA-TA-GACCA-----ATT-A-C-G---ACCA-A-CAAA-A-CAAA-AA-T-ACTCCGT---TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TA--TCC-CCT-----------GAATTAA---------TGGGA-T--------TATCAA--CTGGATCA-TACTC-C-A--T-C---A----TTGCT---A-CGCA
gi|101844 : CCCCCCTTTCT-AC--CTCCGT-----TCCG--CT-GAC-A-CT-GA-ACGAC-GACGTTT-A-CTC----T------AT-AGA---AT-C-TC-C-CA-AG---T-G-T-T--TTTGATCA-AT--C--GAA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--A---C-AA-A-C-AA-AA-T-A-TCCGG---TT-G--TCA----A-T-A-TA------AA-TTC-TTT-----------GATTTAA---------T-GGA-T---------ATCAA--CTG--ATC-AACTC-C-A--T-C---A----T--GC---A-CGCAC
gi|101845 : CCCCCCTTTT-CCTACCTCGA-----TCCG-TCCTGAC-A-CTTGA-ACGAC-GAG---T-A-CTTCA--T------AT-A-A---AT-C-TCTC-CA-AG---T-T-T-T-----GA-CA-AT--C--CGA-TA--ACC-C----ATT-C-C-G---A--C-A-C-AA-AAC-AA-AA-TCA-TCCG----TT-G--TCA--T-A---A-TA-----AAT-TCC-TTT-----------GATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTGA-TC---ACTC-CAA--T-C---A----T--GC---A-CGCACC
gi|101846 : CCCCCCCCTC--AC--CCC--------TCAA-TT--GAA-A-CTAGA-AAGGC-G-----TTA-CTC----------------A---TT-C-TCTC-TG-GA---TCG-T-T-----GA-AA-AT--C--TGA-TA-GACCAC----ATT-A-T-G---A--A-A-C-GA-A-C-AA-AA-T-A-TCTG----TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TA-TTAA---------G-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTC-C-A--T-T---A----G--AC---ATTGCACC
gi|101847 : CCCCTCTTCTTAA--CCCCGT-----TCCG-TCT-GAA---CT-GA-ACGACTG-----C-AACTC----T------GT-A-A---ATACATCTC-CG-AG---T-G-TGT--A--GA-AA-AT--CACCGA-TA-GAC-AC----CTT-AAC-G---C--ACA-C-AA---C-AA-AA-T-A-TCCG----CT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TAT-TCC---------------------------------GGA-TA-------TTTCAA--CTG--ATC-AACTC-A-A--T-C---A----T--GC---T-CGCACC
gi|101848 : CCCCCC------C--CCCCCT-----TCCG-TC---AA-A-CT-GATAC----------T-A-CT-----T------GT-A-A---ATTC-TCTC----AG---T-G-T-T--A--TA-GATAT--C--CGA--A-GAC-AC----ATT-A-C-G---A--A-A-A-AA-A-G-AA-AT-G-A-TTCG----TT-----CA--C-G-T-A-TT-----TACATCC-TTT-----------T-TATAA---------T-GGA-TA-------TAT-AA--C-T--TCC-AA--C-C-A--T-C---A----T--CC---
gi|101849 : CCCCCCCCCC---C--CCCCGT-----TCTG-TCT-TGA-A-CT-GACATGAC-A-----T---TTC----T------GTTA-A---AT-C-TCCC-CC--GCCCT-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-CACCAC----A-T-A-C-A---A--ACA-C-AATA-C-AA-AT-C-C-TCCGT---TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCTGTTT-----------TATATAtgcgacc
gi|101850 : CCCCCTCC-AC--CCCCGT-----TCCG-TGT-AAA-A-CT-GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------AT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-G--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-GGCCAC----ATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-A-C-AC-AA-T-A-TCCG----TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TACTTAATGGATTTTTT-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTC-C-A--T-C---A----T--CC---A-TGCACC
gi|101851 : CCCCCTCC-AC--CCCCGT-----TCCG-TGA-TAA-A-C--GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------AT-A-A---AT-C-TCTC--G-AG---T-G-T-G--A--GA-AA-AT--C--CGACTA-GGCCAC----ATT-A-C-GG--A--A-A-C-AA-A-C-AC-AA-T-A-TCCG----TT-G--TCA--C-GTT-A-TT-----TACTTCC-TTT-----------TACTTAA---------T-GGA-TTTTTTGGATATCAAACTTT--TCC-AACTC-CAA--T-C---A----T--CC---A-TGCACC
gi|101852 : CCCCCCCCCT--C--CTTCGT-----TCCG-TCT-GAA-A-CT-GA-ATGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-A-TCTC-CG-AG---T-G-A-T--A--CA-AA-AT--C--CGA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-A-C-AA-AA-T-A-TCTG------------------------T-----TAC-TCC-TTT-----------TATTT------------------------------AA--CTT--TCC-AACTC-C-A--T-CCATG----T--AC---A-TGCACC
gi|101853 : CTCCCTCCC-CC--CCCCCC-----CCCA-TCT-GAA-G-CT-GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AA-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--C-A-C-AA-A-C-AA-AA-T-A-TCCA----TT-G---CG--C-G-T-A-TA-----AAT-TCC-TTT-----------GATTTAA---------T-GGG-T--------TATCAA--C----TCC--------------C---A----T--GC---A-CACACC
gi|101854 : CC-AC--CCCCAT-----TC-G-TCC-GAA-A-CT-TA-ATGAC-------------------------------------C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--T--CGA-TA-GACCAC----A-T-A-TGG---A--A-A-C-AA-A-C-AA-AA-G-A-TACT----TT-A--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC--CC-CTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AAAGC-C-A--C-C---A----T--CC---A-TGCACCgaactccacatctagcatc
gi|101855 : T-AC--CCCTCT-----TCCG-TCC-GAA-A-CT-GA-ATGGC-G-----C-A-CAT----T------GT-A-A---AT-A-TCTC-CG-AT---T-G-T-T--A--GA-AA-TA--C--CGA-TA-TACCAC----ATT-A-A-G---A--A-A-C-AA-A-C-AA-AA-
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gi|101857 : -AC--CCCCCT-----TCCG-TTC-GAA-A-CT-GA-ATGCC-G-----T-A-CTG----T------GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CG------------------------------------AA-A-C-AA-AA-T-A-TCAG----TT-A--CCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-ATC-------------CTTAA---------T-AGA-T--------TATCAA--TTT--TTC-AACTC-C-A--T-C---G----T--CC---A-TGC
gi|101858 : C--TCCCGT-----TCCG-TCT-GAC-A-CT-GA-ATGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-A-TCTC-CG-AG---T-G-A-T--A--CA-AA-AT--C--CGA-TA-CACCACGTAAATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-G-C-AA-AA-T-A-TGCG----TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATGAA--CTT--TTC-AACTT-C-A--T-C---A----T--CC---A-TGCAC
gi|101859 : C--TCCCGT-----TCCG-TCT-GACCA-CT-GA-ATGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-A-TCTC-CG-AG---T-G-A-T--A--CA-AA-AT--C--CGA-TA-CACCACGTAAATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-G-C-AA-AA-T-A-TGCG----TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCCTTTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATGAA--CTT--TTC-AACTT-C-A--T-C---A----T--CC---A-TGCAC
gi|101860 : C--CCCCCT-----TCCG-TC--GAA-A-CT-GA-ATGAC-------T-A-CTG----T------GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-A----T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-GAGCAC----ATT-AGC-G---A--A-A-C-AA-A-G-AATAA-G-A-TCCG----TTTG--TCA--CAG-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TATT-AA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTC-CAA--TGT---A----T--CC---A-TGCAC
gi|101861 : C--CCCCCT-----TTCG-TTC-GAA-A-CT-GA-AGGAC-G-----T-A-CTG----TATGT--GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AC--C--
gi|101862 : --CCCCTT-----TCCG-TTC-GAA-ATCT-GA-A--AC-G-----T-A-ATC----TCAAAACGT-A-A---AT-A-TTTC-CGTAG---T-C-T-T--A---A-AA-AT--C--GAA-TA-GACC-C-----TT-A-T-G---A--A-A-CTAG-A-A-AA-AA-G-A-TCCG----T--G--TCA----G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TAAT-AA---------T-GGA-T--------TATAAA--CTT--TCC--ACT--C-A--T-C---A----C--CC---A-
gi|101863 : CCCAT-----TC-G-TCC-GAA-A-CT-TA-ATGAC-------------------------------------C-TCTC-CG-A----T-GTT-T--A--GA-AA-AT--T--CGA-TA-GACCAC----A-T-A-TGG---A--A-A-C-AA-A-C-AA-AA-G-A-TACT----TT-A--TCA--C-G-T-A-TT-----TA---CC-CTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AAAGC-C-A--C-C---A----T--CC---A-TGCACCt
gi|101864 : -A-TTC----T------GT-A-A---AT-C-TTTC-TG-GA---T-G-T-T--A--GA-AC-AC--C--CAA-T---ACTAG----A-G-A-G-G---G--A-A-A-AC-A-C-TA-AA-T-A----G----TT-T--TCA--C-A-TCA-TT-----TAC--CC-ATT-----------GCTTTAG---------T-GGG----------TATCAA--ATT--TCC-AAATC-C-A--T-G---C----T--CCAAAA-TGCACC
gi|101865 : ----T------GT-A-ACATAT-C-TCTCACG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-ATCAC--CGA-TA-GAGCAC----ATTAA-C-G---A--A-A-C-AA-A-G-AA-AA-G-A-TTTGCAGATT-G--TCA--C-G-T-A-TTACATATAC-TAG-TTT-----------AATTTAT---------TGGGA-T--------TATCA
gi|101866 : A-AT--C--CGA-TACGACCAG----AAT-T-C-GGAGA--A-A-C-AA-A-C-AATAA-T---CCCG-----T-G--TCA--C-G-T-ACTT-----TAC-TCC-TTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATAAA--C-T--TCC-AACGT-C-AATT-C---A----T--CC---A-TGCACtttatca
gi|101867 : -AC--C--CGA-TA-GACCAT----ATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-A-G-CA-GA-G-A-TGCG----TC-A--CTA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------T-TTTAA---------A-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTCTC-A--T-C---ACCATT--CC---A-TGCACC
gi|101868 : TC-A-C-A---A--C-A-C-AA-T-C-AACAA-T-A-TCCA----TT-G--TCA--C-GTT-A-TT-----TAT-TCC--TT-----------GATTTAA---------T---ATT--------TATAAG--CTG--ATC-AACTC-C-A--T-C---A----T--
blockSeqs : TT TA ACCCT G CT C T T T T ACGTT T A GCGC CAAAAC T G CAT A A A T CCC T T G GT TT T T CA AC C A GTAA A A C GAG CC C T A T A A T AT C CAGA T AG AG A T C C ACATA T G ACTGGTACATGT TGGATTTTT G T TTTTTGGA AC GA T T A AT G CAT CCAT TG AAA TT
blockSeqs : T . . . T . . A C . AG T . CA ATGT . . . T . . . . C . . . . . . . . . C GTAA . G G G . C . T . . . T TC . T . . . . T . . . A T G . G . A . A . . A . . . . . . C
blockSeqs : T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . C T . G . . . . . . . . T . G . . . A . . . . A . . . . . . C
blockSeqs : C . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : C . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . C
blockSeqs : T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . C
blockSeqs : T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . C
blockSeqs : T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . C
blockSeqs : C . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : C . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : T . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : C . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . C
blockSeqs : C . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : T . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : CCCCCCCTTCT-AC--CCCCGT-----TCCG-TCC-GAA-A-CT-GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-A-C-AA-AA-T-A-TCCG----TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTC-C-A--T-C---A----T--CC---A-CGCACC
finalCons : CCCCCCCTTCT-AC--CCCCGT-----TCCG-TCC-GAA-A-CT-GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-A-C-AA-AA-T-A-TCCG----TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTC-C-A--T-C---A----T--CC---A-CGCACC
Alignments
lowQualScore : 44 22 33333 1 66 1 1 3 3 1 55555 2 2 4444 666666 1 1 222 2 1 1 1 222 2 1 1 11 11 1 1 11 11 1 2 5555 1 2 3 333 11 2 1 2 1 1 1 3 111 1 6666 1 11 11 1 2 1 1 33333 4 2 888888888888 555555555 2 1 77777777 22 33 1 1 4 22 1 222 3333 22 222 22
lowQualScore : .. .. ..... . .. . . . . . ..... . . .... ...... . . ... . . . . ... . . . .. .. . . .. .. . . .... . . . ... .. . . . . . . . ... . .... . .. .. . . . . ..... . . ............ ......... . . ........ .. .. . . . .. . ... .... .. ... ..
lowQualScore : 11 11 77777 5 99 5 5 0 0 5 77777 9 9 8888 999999 4 4 444 8 4 4 4 444 8 4 4 99 99 4 3 88 88 3 7 7777 3 6 9 555 88 6 3 6 3 3 3 9 444 3 8888 3 88 88 3 7 3 3 33333 0 7 666666666666 555555555 8 4 88888888 00 44 4 4 3 00 4 555 0000 00 777 33
consensus : CCCCCCCTTCT-AC--CCCCGT-----TCCG-TCC-GAA-A-CT-GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-A-C-AA-AA-T-A-TCCG----TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTC-C-A--T-C---A----T--CC---A-CGCACC
Reference ( family-609 ) : CCCCCCCTTCT-AC--CCCCGT-----TCCG-TCC-GAA-A-CT-GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-A-C-AA-AA-T-A-TCCG----TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTC-C-A--T-C---A----T--CC---A-CGCACC
gi|101837 : CCCCCCCTTCT-AC--CCCCGT-----TCCG-TCT-GAA-A-CT-GA-ACGAC-G-----T-AACTC----T------GT-A-A---AT-A-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--TGA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--C-A-C-AA-A-C-AA-AA-T-A-TCCG----TT-G--TCA--C-G-T-A--T-----TAT-TCC-TTT-----------GATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTG--ATC-AACTC-C-A--T-C---A----T--GC---A-CGCACC
gi|101838 : CCCCCCTTTCT-AC--CCCCGT-----TCCG-TCT-GAA-A-CT-GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--C-A-C-AA-A-C--A-AA-T-A-TCCG----TT-G--TCA--C-G-T-A--T-----AAC-TTC-CTT-----------GATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTG--ATC-AACTC-C-A--T-C---A----T--GC---A-CGCACC
gi|101839 : CCCCCCTTTCT-AC--CCCCGT-----TCCG-TCT-GAA-A-CT-G--ACGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--C-A-C-AA-A-C-AA-AA-T-A-TCCG----TT-G--TCA--C-G-T-A-AT-----AACTTCC-TTT-----------GATTTAA---------T--GA-T--------TATCAA--CTG--ATC-AACTC-C-A--T-C---A----T--GC---A-CGCACC
gi|101840 : CCACCCTTTCC-AT--CTCTGT-----TCTG-TCT-GAA-A-CT-GA-ACGAC-G-------A-CTC----T------GT-A-A---AT-T-TATC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-CA-AT--C--CTA-TA-TACCAC----ATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-A-C-AA-AA-T-A-TCAA----TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTC-C-A--T-C---A----T--CC---A-TGCACC
gi|101841 : CCCCTCCTTCT-AC--CCCCGT-----TCCG-TCT-TAA-A-CT-GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-A-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--C-A-C-CA-A-G-AA-AA-A-A-TCCG----TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TTT-TCC-TTT-----------GATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTG--ATC-AACTC-C-A--T-A---A----T--
gi|101842 : CCCCCCCCTCC-AC--CCC-GT-----TCGG-TCT-GAA-A-CT-GA-ACGCC-G-----TTA-CTCGCGCT------GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---TTG-C-TGTA--GA-AA-AT--C--CGA-TAAGACCAC----ATT-A-CCG---A--A-ATC-AA-A-C-AA-AAAT-A-TCCG----TT-GAGTCAAGC-G-T-A-TT-----TAC-TCT-TTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCCTAACTC-C-A--T-C---A----T--CC---A-TGCACC
gi|101843 : CCCCCCCTTCT-AT--TCCCG-------CCGGTCT-GAA-A-CT-GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-C-TCTA-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-A---C--CGA-TA-GACCA-----ATT-A-C-G---ACCA-A-CAAA-A-CAAA-AA-T-ACTCCGT---TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TA--TCC-CCT-----------GAATTAA---------TGGGA-T--------TATCAA--CTGGATCA-TACTC-C-A--T-C---A----TTGCT---A-CGCA
gi|101844 : CCCCCCTTTCT-AC--CTCCGT-----TCCG--CT-GAC-A-CT-GA-ACGAC-GACGTTT-A-CTC----T------AT-AGA---AT-C-TC-C-CA-AG---T-G-T-T--TTTGATCA-AT--C--GAA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--A---C-AA-A-C-AA-AA-T-A-TCCGG---TT-G--TCA----A-T-A-TA------AA-TTC-TTT-----------GATTTAA---------T-GGA-T---------ATCAA--CTG--ATC-AACTC-C-A--T-C---A----T--GC---A-CGCAC
gi|101845 : CCCCCCTTTT-CCTACCTCGA-----TCCG-TCCTGAC-A-CTTGA-ACGAC-GAG---T-A-CTTCA--T------AT-A-A---AT-C-TCTC-CA-AG---T-T-T-T-----GA-CA-AT--C--CGA-TA--ACC-C----ATT-C-C-G---A--C-A-C-AA-AAC-AA-AA-TCA-TCCG----TT-G--TCA--T-A---A-TA-----AAT-TCC-TTT-----------GATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTGA-TC---ACTC-CAA--T-C---A----T--GC---A-CGCACC
gi|101846 : CCCCCCCCTC--AC--CCC--------TCAA-TT--GAA-A-CTAGA-AAGGC-G-----TTA-CTC----------------A---TT-C-TCTC-TG-GA---TCG-T-T-----GA-AA-AT--C--TGA-TA-GACCAC----ATT-A-T-G---A--A-A-C-GA-A-C-AA-AA-T-A-TCTG----TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TA-TTAA---------G-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTC-C-A--T-T---A----G--AC---ATTGCACC
gi|101847 : CCCCTCTTCTTAA--CCCCGT-----TCCG-TCT-GAA---CT-GA-ACGACTG-----C-AACTC----T------GT-A-A---ATACATCTC-CG-AG---T-G-TGT--A--GA-AA-AT--CACCGA-TA-GAC-AC----CTT-AAC-G---C--ACA-C-AA---C-AA-AA-T-A-TCCG----CT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TAT-TCC---------------------------------GGA-TA-------TTTCAA--CTG--ATC-AACTC-A-A--T-C---A----T--GC---T-CGCACC
gi|101848 : CCCCCC------C--CCCCCT-----TCCG-TC---AA-A-CT-GATAC----------T-A-CT-----T------GT-A-A---ATTC-TCTC----AG---T-G-T-T--A--TA-GATAT--C--CGA--A-GAC-AC----ATT-A-C-G---A--A-A-A-AA-A-G-AA-AT-G-A-TTCG----TT-----CA--C-G-T-A-TT-----TACATCC-TTT-----------T-TATAA---------T-GGA-TA-------TAT-AA--C-T--TCC-AA--C-C-A--T-C---A----T--CC---
gi|101849 : CCCCCCCCCC---C--CCCCGT-----TCTG-TCT-TGA-A-CT-GACATGAC-A-----T---TTC----T------GTTA-A---AT-C-TCCC-CC--GCCCT-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-CACCAC----A-T-A-C-A---A--ACA-C-AATA-C-AA-AT-C-C-TCCGT---TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCTGTTT-----------TATATAtgcgacc
gi|101850 : CCCCCTCC-AC--CCCCGT-----TCCG-TGT-AAA-A-CT-GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------AT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-G--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-GGCCAC----ATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-A-C-AC-AA-T-A-TCCG----TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TACTTAATGGATTTTTT-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTC-C-A--T-C---A----T--CC---A-TGCACC
gi|101851 : CCCCCTCC-AC--CCCCGT-----TCCG-TGA-TAA-A-C--GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------AT-A-A---AT-C-TCTC--G-AG---T-G-T-G--A--GA-AA-AT--C--CGACTA-GGCCAC----ATT-A-C-GG--A--A-A-C-AA-A-C-AC-AA-T-A-TCCG----TT-G--TCA--C-GTT-A-TT-----TACTTCC-TTT-----------TACTTAA---------T-GGA-TTTTTTGGATATCAAACTTT--TCC-AACTC-CAA--T-C---A----T--CC---A-TGCACC
gi|101852 : CCCCCCCCCT--C--CTTCGT-----TCCG-TCT-GAA-A-CT-GA-ATGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-A-TCTC-CG-AG---T-G-A-T--A--CA-AA-AT--C--CGA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-A-C-AA-AA-T-A-TCTG------------------------T-----TAC-TCC-TTT-----------TATTT------------------------------AA--CTT--TCC-AACTC-C-A--T-CCATG----T--AC---A-TGCACC
gi|101853 : CTCCCTCCC-CC--CCCCCC-----CCCA-TCT-GAA-G-CT-GA-ACGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AA-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-GACCAC----ATT-A-C-G---A--C-A-C-AA-A-C-AA-AA-T-A-TCCA----TT-G---CG--C-G-T-A-TA-----AAT-TCC-TTT-----------GATTTAA---------T-GGG-T--------TATCAA--C----TCC--------------C---A----T--GC---A-CACACC
gi|101854 : CC-AC--CCCCAT-----TC-G-TCC-GAA-A-CT-TA-ATGAC-------------------------------------C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--T--CGA-TA-GACCAC----A-T-A-TGG---A--A-A-C-AA-A-C-AA-AA-G-A-TACT----TT-A--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC--CC-CTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AAAGC-C-A--C-C---A----T--CC---A-TGCACCgaactccacatctagcatc
gi|101855 : T-AC--CCCTCT-----TCCG-TCC-GAA-A-CT-GA-ATGGC-G-----C-A-CAT----T------GT-A-A---AT-A-TCTC-CG-AT---T-G-T-T--A--GA-AA-TA--C--CGA-TA-TACCAC----ATT-A-A-G---A--A-A-C-AA-A-C-AA-AA-
gi|101856 : -AC--CCCCGTACCCTTTCA-TCC-GAA-A-CT-AA-ATGAC-G-----T-A-CTG----T------GT-A-A---AT-C-TTTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AC--C--AGA-TG-GACCAA----ATT-A-G-G------------AA-A-C-AA-AG-G-A-TCCG----TT-A--TCA--C-G-T-G-TT-----TGC-CCT-TTTACTGGTACATGTATTTAA---------A-CGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTC-C-A--T-C---A----T--CC---A-TCCACC
gi|101857 : -AC--CCCCCT-----TCCG-TTC-GAA-A-CT-GA-ATGCC-G-----T-A-CTG----T------GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CG------------------------------------AA-A-C-AA-AA-T-A-TCAG----TT-A--CCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-ATC-------------CTTAA---------T-AGA-T--------TATCAA--TTT--TTC-AACTC-C-A--T-C---G----T--CC---A-TGC
gi|101858 : C--TCCCGT-----TCCG-TCT-GAC-A-CT-GA-ATGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-A-TCTC-CG-AG---T-G-A-T--A--CA-AA-AT--C--CGA-TA-CACCACGTAAATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-G-C-AA-AA-T-A-TGCG----TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATGAA--CTT--TTC-AACTT-C-A--T-C---A----T--CC---A-TGCAC
gi|101859 : C--TCCCGT-----TCCG-TCT-GACCA-CT-GA-ATGAC-G-----T-A-CTC----T------GT-A-A---AT-A-TCTC-CG-AG---T-G-A-T--A--CA-AA-AT--C--CGA-TA-CACCACGTAAATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-G-C-AA-AA-T-A-TGCG----TT-G--TCA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCCTTTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATGAA--CTT--TTC-AACTT-C-A--T-C---A----T--CC---A-TGCAC
gi|101860 : C--CCCCCT-----TCCG-TC--GAA-A-CT-GA-ATGAC-------T-A-CTG----T------GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-A----T-G-T-T--A--GA-AA-AT--C--CGA-TA-GAGCAC----ATT-AGC-G---A--A-A-C-AA-A-G-AATAA-G-A-TCCG----TTTG--TCA--CAG-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TATT-AA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTC-CAA--TGT---A----T--CC---A-TGCAC
gi|101861 : C--CCCCCT-----TTCG-TTC-GAA-A-CT-GA-AGGAC-G-----T-A-CTG----TATGT--GT-A-A---AT-C-TCTC-CG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-AC--C--
gi|101862 : --CCCCTT-----TCCG-TTC-GAA-ATCT-GA-A--AC-G-----T-A-ATC----TCAAAACGT-A-A---AT-A-TTTC-CGTAG---T-C-T-T--A---A-AA-AT--C--GAA-TA-GACC-C-----TT-A-T-G---A--A-A-CTAG-A-A-AA-AA-G-A-TCCG----T--G--TCA----G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------TAAT-AA---------T-GGA-T--------TATAAA--CTT--TCC--ACT--C-A--T-C---A----C--CC---A-
gi|101863 : CCCAT-----TC-G-TCC-GAA-A-CT-TA-ATGAC-------------------------------------C-TCTC-CG-A----T-GTT-T--A--GA-AA-AT--T--CGA-TA-GACCAC----A-T-A-TGG---A--A-A-C-AA-A-C-AA-AA-G-A-TACT----TT-A--TCA--C-G-T-A-TT-----TA---CC-CTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AAAGC-C-A--C-C---A----T--CC---A-TGCACCt
gi|101864 : -A-TTC----T------GT-A-A---AT-C-TTTC-TG-GA---T-G-T-T--A--GA-AC-AC--C--CAA-T---ACTAG----A-G-A-G-G---G--A-A-A-AC-A-C-TA-AA-T-A----G----TT-T--TCA--C-A-TCA-TT-----TAC--CC-ATT-----------GCTTTAG---------T-GGG----------TATCAA--ATT--TCC-AAATC-C-A--T-G---C----T--CCAAAA-TGCACC
gi|101865 : ----T------GT-A-ACATAT-C-TCTCACG-AG---T-G-T-T--A--GA-AA-ATCAC--CGA-TA-GAGCAC----ATTAA-C-G---A--A-A-C-AA-A-G-AA-AA-G-A-TTTGCAGATT-G--TCA--C-G-T-A-TTACATATAC-TAG-TTT-----------AATTTAT---------TGGGA-T--------TATCA
gi|101866 : A-AT--C--CGA-TACGACCAG----AAT-T-C-GGAGA--A-A-C-AA-A-C-AATAA-T---CCCG-----T-G--TCA--C-G-T-ACTT-----TAC-TCC-TTT-----------TATTTAA---------T-GGA-T--------TATAAA--C-T--TCC-AACGT-C-AATT-C---A----T--CC---A-TGCACtttatca
gi|101867 : -AC--C--CGA-TA-GACCAT----ATT-A-C-G---A--A-A-C-AA-A-G-CA-GA-G-A-TGCG----TC-A--CTA--C-G-T-A-TT-----TAC-TCC-TTT-----------T-TTTAA---------A-GGA-T--------TATCAA--CTT--TCC-AACTCTC-A--T-C---ACCATT--CC---A-TGCACC
gi|101868 : TC-A-C-A---A--C-A-C-AA-T-C-AACAA-T-A-TCCA----TT-G--TCA--C-GTT-A-TT-----TAT-TCC--TT-----------GATTTAA---------T---ATT--------TATAAG--CTG--ATC-AACTC-C-A--T-C---A----T--