lowQualScore : 111 22222222 111111111 1111111111 1111 111111111111 1111111111111
lowQualScore : 1 333 3 1 1 1 1 1 11111111 1 5555 000000000 3 1 1 1 4 444 3 5555555555 3 22 2222 1 4444 22 1 777 1 99999 33 1 1 55 3 33 3333 1 222 333333333333 55555555 1 1 222 1 1 555 2 2 55 5555 555555 33 22 2 33 2 88888 1 22 2 33 44 55555 33 8888888 33 33 2 555 1 1 1 0000000000000 6666666666 444 66666 3 1 33 444 1 22 333 1 1 11 11 1 44 11 11 2 1 1 44444 11 44 7777777777 1 2 555 33333 2 555 222 333 999999 66 44 1 1 99999999999 44 555 2 44 1 1 3 1
lowQualScore : . ... . . . . . . ........ . .... ......... . . . . . ... . .......... . .. .... . .... .. . ... . ..... .. . . .. . .. .... . ... ............ ........ . . ... . . ... . . .. .... ...... .. .. . .. . ..... . .. . .. .. ..... .. ....... .. .. . ... . . . ............. .......... ... ..... . . .. ... . .. ... . . .. .. . .. .. .. . . . ..... .. .. .......... . . ... ..... . ... ... ... ...... .. .. . . ........... .. ... . .. . . . .
lowQualScore : 9 444 8 8 7 7 7 7 44444444 7 2222 000000000 3 6 6 6 8 444 2 8888888888 2 22 2222 5 8888 11 5 333 5 44444 77 5 5 22 1 77 3333 5 777 777777777777 66666666 4 4 555 4 4 444 9 9 44 9999 555555 44 00 9 44 9 44444 4 00 9 44 88 55555 99 0000000 44 99 9 444 5 5 5 5555555555555 5555555555 111 33333 0 5 55 111 5 00 777 3 3 88 99 4 77 99 99 8 4 4 88888 99 77 4444444444 4 8 222 44444 5 222 444 888 111111 66 77 4 4 66666666666 88 444 9 11 5 5 0 5
consensus : ACG-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG-CA-CA--G-C--T----C-A---T------------C--------CC-C-T---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-AT--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T---A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GGC-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
Reference ( gi|83699 ) : ACG-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-A---T--AG-CA-CA--G-C--T----C-A---T------------C--------CC-C-T---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-AT--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T---A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GGC-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83702 : ACG-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-A---T--AG-CA-CA--G-C--T----C-A---T------------C--------CC-C-T---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-AT--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T---A-----TGG-C-GG--A---T-T--GAC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GGC-G-G-AC-----T--T--G----------A-------A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83703 : ACA-TGT---ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG-CA-CA--T-C--T----C-A---T------------C--------TC-C-T---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-AT--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T---A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGT---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GAC-G-G-ACT----T--T--T----------A-A-G---A-----ATTC---T---TC---T------A--TA--TT-C-A-----------T--G---AATT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83701 : ACG-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--T--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-AT--T--AG-CA-CA--G-C--T----C-A---T------------C--------CC-------T-AT-AT--TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-AA--TT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T---A-----T-G-C-GG--A-----T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GGC-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G----AAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83700 : ACG-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--T--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-AT--T--AG-CA-CA--G-C--T----C-A---T------------C--------CC-------T-AT-AT--TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-AA--TT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T---A-----T-G-C-GG--A-----T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GGC-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G----AAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83704 : ACG-TGTGT-TCC-T-G-TC-GTAG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG----A---G-CAA---T--AG-CA-CA--G-C--T----CAA---T------------C--------CC-C-T---T-AT-----TA-CC-C--T----G------C--G--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-AT--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CAGA-C------T------AA----------T---A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AAGG--A--AA-T--A--T--GGC-G-GCAC-----T--T--G----------A-A-GA--A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83705 : ACG-TGT-C-ACT-T-G-TC-G-AG-GTC--AT--C-C----G---------G-CC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA----------CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG-CA-GA--G-C--T----C-A---C------------C--------CC-C-T---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--T-AT--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T---A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AA----A--AA-T--A--T--GGC-G-G-AC-----T-------------------------------------T---GC---T------C--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83706 : ACG-TGA-A-ACC-T-G-TC-G-AG-GCT--AT--C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAAAA-A--C--AG-CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG-TA-CA--G-C--T----C-A---T------------C--------CC-T-T---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------T--A--A-A--TCAC-GA-----C-A--C-CT--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-T-C------T------AA----------T---A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AG-G--A--AA-T--A--T--GGC-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATGC---T---GC---T------A--TA--T
gi|83707 : ACG-TTTGT-ACC-T-G-TC-G-AG-C----A---C-C----G---------CCAC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--CC-A--CT-G--GTGTT---G-AA----GTG--A-A---G-C-C---A--AG-CA-CAT-G-C--T------A---T------------C--------CC-C-T---T-A--A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-AT--AT--ACG---A--CAAA------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-T------TG-----AA----------T---A-----TGG-CCGG--A---T-G--GCC---A-AA-G--A--A--T--A--T--GG--G-G-AC-----T--T--G----------A-AAG---A-----ATTCT--T---GC---T------A--TA--GT-T-A-----------T--G----AAT-CAT--GTT-C-A-GCTTT
gi|83708 : ACG-TGT---ACC-T-G-TC-G-AG-GTA--AT--C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---A-----------------------ATGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G------AG-CA-CA--G-T--T----C-A---T------------T--------CC-C-T---T-AT-A---TA-CC-CCTT----A------T--A--G-A--TCCT-GA-----TTA--C-AT--AT--A-----A--CAA-------T--A--TAA-T---ATC-CA-A-C------TA-----AA----------T---A-----TGGCC-GG--A---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--G-G-AT-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTCT--T---GCG--T------A--TAT-TT-T-A-----------T--GA--AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83709 : ACG-TGT-A-ACC-T-G-TC-G-AGTA----A---T-C----GC--------C-AC-A-G-G-TAA---A------------------------TGT----G-AA----GT---A-A---G-C-G---T--AG-CA-CA--G-CTTT----C-A---T------------C--------CC-C-T---T-AT-A---TA--C-C--T----G------C--A--G-A--TCCT-GG-----C-A--CAAT--AT--------A--CAA-------T--A--GAAGT---TTC-C--A-C------T------AA----------T---A-----TGG-C-GG------T-T--AGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GGC-G-G-AC-----T--T--G----------A-ATG---A-----ATTC---T---GC---T------AG-TA--TT-T-AT----------T--G---AAAT-CAT--G-T-CGA-GCTTTAA
gi|83710 : ACG-TGT-C-ACT-TTG-TC-G-AG-GTC--AT--C-C----G---------G-CC-A-G---TAA---AT-CAGAA----------CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-A---T--AG-CA-CA--G-C--T----C-A---C------------C--------CC-C-T---TAAT-A---TA--C-C--T----G------C--A--A-A--T-CT-GA-----C-A--A-AT--AT--A-----A--C---------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA--------------A-----TGG-C--G--A---T-T--GGC---A-------A--AA-TA-A--T--GGC-G-G-AC-----T-------------------------------------T---GC---T------C--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTAAA
gi|83711 : ACGATGT-A-ACC-T-G-TC-G-AG-A----A---TTC----A---------A-AC-A-GAG-TAA---A-----------------------ATGT----G-AA----GAG--A-A---G-C-G---TTTAG-CATCA--G-CC-T----C-A---T------------C--------CC-C-T---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------CC-A--G-A--TCCT-GA-----A-A--C-AT--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAAAT---ATC-CA-A-C------T------AA----------T---A-----GGC-C-GG--AA--T-T--GGC---A-AA-G--A--AA----A--T--GGCCGCG-AC-----T--T--G----------A-A-GG--A-----ATTC---T---GC---TT-----A--TAATTT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83712 : ACG-TGT---ACC-T-G-TC-G-AG-GTA--A---T-C----AA--------C-AC-A-G-G-TAA---AT------------------------GT----G-AA----GAG--A-----G-C-G---TT-AG-CA-CAA-G-C--T----C-A---T------------C--------CC-C-T---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--G-A--TCCT-GAC----C-A--C-AT--AT--A-----A--CAA-------T--AACGAA-----ATC-CA-A-T--------------A----------T---A-----TGG-C-GA--A-----T--GGC-----AA-G--A--A-----A--T--GGC-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC-------GC---T------A--TAT-TT-T-AT----------T--G---AAAT-C
gi|83713 : ACG-TGTAT-CTC-T-G-TCAG-AG-G----C---C-C----GTAATCCACTC-AC-A-G-GGTAAC--ATACAGAA-A--CTCA--CT-G--GTGT----GTGACCCCGTG--A-GAGTG-C-GG--T--AG-CA-CA--G-C--TTCATC-A---T------------C--------CCTC-T---T-AT-A----A-CCGC--T----C------C--A--A-A--TCTG-AA-----C-A--C-ATT-AT--A-----AACCAA-------TT-A--GAA-T---ATC-CA-AAC------T------AA----------T---A-----TGG-C-GG--A---T-CTAGGC---A-AA-G--ATTAA-T--A-----GGC-T-G-AC-----T--TTGG----------A-A-C---A-----A-TC---T---GC---T------A--TA--TT-TAA-----------T--G---AAATCCAT--G-TCC-A-GCTTTA
gi|83714 : ACG-TGT-C-ACT-T-G-TC-G-AG-G----ATATC-G----G---------C--C-A-G-T-AAA---AT-CAGCA-A--C------TAG--GTGT----G-AA----GTG--A-AA--G-C-A---T--AGGCA-CA--T-C-------C-A---C------------C--------CC-C-T-----A--A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--A-ATTAAT--A-----A--C-A-------T--A--GAA-----ACC-AG-A-C------T------AA----------T---A-----TGG-C-GGATA---T-T--GGG---A-A-----A--AA-T--A--T---GC-T-G-AC-----T--T--G---------------------------C---T----C---T------A-------T-T-A-----------T--GAAAAAAT-CAT--G-T-CGA-GCTTTAA
gi|83715 : ACG-TGT-A-GCC-T-G-TC-G-AG-GTTATG---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-GAGGTGT----G-AAA---GTG--A-AA--G-C-G---T--AG-CA-CA--G-C-------C-A---TTT----------C--------CC-C-T---T-AT-A---TA-CC-TCAT----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-AT--AC--A-----A--CAAAAAGATAC--A--AAA-TC--ATC-AA-A-C------T------GAGTACCCGGGGT---A-----TGG-T-----A---T-T--GGC---A-AA-G--
gi|83716 : G-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG------A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGTACGTG-AA----GTG--A-A---G-C-A---T--AG-CA-CA--G-C--T----C-A---T---------------------CC-C-T---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--CAAT--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T---A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GGC-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--GA--AAAT-CAT--G-T-C-A-ACTTTAA
gi|83717 : G-TGT-TTACCGT-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--AAACT-G--GTGTACGTG-AA----GTG--AGA---G-C-A---T--AG-CA-CA--G-C--T----C-----T------------C--------CC-C-T---T-AT-A---TA-CC-C--T----GC-----C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-AT--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------TTA----AA----------T---A------GG-C-GG--A---T-G--GGCA--A-AA-G--A--AA-T--AGCT--GGC-G-G-AC-----T--T--GAAAAAAGGAAA-A-A---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------TC-G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTT
gi|83718 : G-TGT-T-ACC-T-GGTC-G--G-A----A---C-C----G---------C-AC-A-G-GGTAA---TTTCAGAT-A--C--A--CT-G--GTCG----G-AA----GTG--A-AA--G-C-G---T--AG-CA-CA--GGC--T----C-AAATC------------C--------CC-C-T---T-AT-A---TA-CC-A--T----G------CCAA--A-A--TCCT-GATA---C-A--C-AT--ATG-A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------TT--A-----TGG-C-G---A---T-T--GGC---CTAA-G--A--AA-TTGA--T--GGC-G-G-AC-----T--T--AT---------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83719 : -TGT-T-ACC---G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-GGTAA---AT-CAGGA-AACC--A--CTTG--GTGTT---G-AA----GTG--A-A---G-C-A---T--AG-CA-C---G-C--T----C-A---T------------C--------CC-CTT---T-AT-----TA-CC-CT-T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-AT--ATA-A-----A--CAA-------T--A--GAA-CTTAATC-CA-A-C-------------AA----------T---A-----TGGCC-GG--A---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--TGCGGC-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----A-TC---T---GC---TA-----A--TA--TT-T-A-----------T--T---GAAT-CAT--T-C-C-A-GCTTTAA
gi|83720 : -TGT-C-ACTGT-G-TC-G-AG-GTC--A---T-CCCTGG---------CCACTG-G-G-TAA---AT-CAGAA----------CT-G--GTGT----G-AA----GTGCAA-A---G-C-GAATT--AG-CA-CA--G-C--T----C-A---AA-----------C--------CC-C-TCTTT-AT-AGTTTA-CC-C--TT---G------C--A--A-AAATACC-AAAGACCC-A--C-AT--ATTAA-----G--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-CA-----T------AA----------T---A-----TGG-C-GGC-ACATT-T--GGCCCAG-AA-A--A--AA-TA-A--T--GGCGG-G-AC-----T--T--G-------------------------CCC---T----C---T------A--T---CT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-AGGCTT
gi|83721 : -G-TC-A-AA-T----G---C-C----G---------C-AC-AAG-G-TAA---AT------------------------GT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG--A-CA--G-C--T----C-A---T------------C--------CC-C-T---T-AT-A---TAACC-C--T----G------C--A--G-A--TCCTCGA-----C-A--C-AT--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---GT--CA-A-C------T------AA----------T---A-----TGG-C-GG------T-T--AGC-----AA-G--A--AA-T--A--T---GC-G-G-AC-----T--TG-G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TT--TTCT-A-----------TC-G---AAAT-CAT----T-C-A-GCTTTAA
gi|83722 : -TC-G-AG-T----A---C-CT---G---------T-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAACA--C--A--CT-G--GTGTTA--G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG-CA-CA--G-C--T----C-T---TTC----------C--------CC-T-T---T-AT-A---TA-CCTC--TG---G------C--A--ATA--TCCT-GA-------A--C-AC--AT--ACTCACA--CAA-------TCCA--GAA-TA--ATC-CC-A-CGCCACTT------AA----------T---ACGG--TGG-C-GT--T---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--G-G-AC-----TTAT--G----------A-A-GTGCA-----A-TC---TATGGC---TATA---A--TA--TT-T-AGATAATTTACGT--G---AAAT-CATTGG-T-C-A-GCCTT
gi|83723 : -C----A---------C-AC-A-G-A-TAA---AT-CATAA-A--T--A--CC-A--ATGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-A---T--AG-CA-AA--A-C--T----A-A---TGTCCTGAATTGCC--------TC-C-T---A-AT-A---TG-CC-A--T----GAAAAAAC--A--ATA--TGCA-AA-----A-A--C-AT--AT--A-----ATTTAA-------T--GATGGA-T---GCT-CA-A-C------TGGACTGAA----------TATAA-----TAG-T-GG--A---T----------A-TA-G--A--A-------------C-A-G-GC-----A--T--C----------A-A-G---A-----ATTC---T---TG---T------A--AA--TT-T-A-----------T--G---AAGT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83724 : -A-G-G-TAATTTCT-CAGAA-AACC--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTT--A-A---GTC-G---T--AG-CA-CATTGTC--T----T-T---T------------CTATTGTCTCC-C-T---T-ATTA---TATCC-C--TTTGGG------C--A--A-AA-TCCTTGAT----C-ATGC-AT--AT--A-----A--CAAAT-----T--A--GA--T---ATCATA-A-C------T------AA----------T---ACCACCTGG-G-GA--A---TAT--GGC---A-AA-GGAA--AA-T--A--T--GGC-G-G-AC--------T--G----------A-A-G---A-----A-TC---T---GC---C------AT-TA--TT-T-A-----------TTGA---AAATGCATTGG-T-C-A-GCTTTAA
gi|83725 : -AA----GTG--T-A-----C-G---T--AG-CA-CA--G-C--T----C-A---T------------T--------CC-C-T---T-AT-A---TA-CC----T----G------C--AGTA-T--TCCT-GA-----C-A--C-AT--AT--A-----A--CAA-------T--A---AA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T---A-----T---------------T--GGC---A-AA-G--A--AAAT--A--T--GGC-G-G-AC-----T--TT-G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-TAT--G-T-T-C-GCTTTAA
gi|83726 : -C-T---T-AA-T---TA-CC-T--T----G------T--A--G-A--TCCT-GA-----T-A--G-AT--AT--A-----A--CAA-------T-----GA-----------------------------AA----------T---A-----TGG-C-GA--A---T-A--AGC---A-GA-G--A--CA-T--A--T--GGC-G-G-AC-----A--T--G----------A-A-T---A-----ATTCTAAT---ACATGT------A--TA--TT-T-A-----------A--G---AATT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83727 : -C-T---T-AT-A---TA-CG-C--T----G------A--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-AT--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---
gi|83730 : ---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GGC-G-G-A---------T--A----------AGA-G---A-----AATG---T----C---T------AGGTA--TT-T-A-----------A--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTA
gi|83729 : ---A-AA-A--A--AA-T--A--T--GGC-G-G-ATCAAGAT--T--G----------A-A-A---A--------C---T---GT---TTAGGTGG--TA--TT-T-A-----------A--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83728 : ---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GGC-G-G-A---------T--A----------A-A-G---ATGAAAATGT---T--------T------AGGTA--TT-T-A-----------A--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
Alignments
lowQualScore : 111 22222222 1111111111 1111 111111111111
lowQualScore : 1 222 3 1 1 1 1 1 00000000 1 5555 888888888 4 1 1 1 4 444 3 3333333333 1 22 1111 1 4444 22 1 777 1 1 777 33 1 1 55 3 1 5555 1 222 333333333333 55555555 1 222 1 1 666 2 2 55 5555 555555 33 11 2 33 2 88888 1 11 1 1 33 44 55555 33 7777777 33 33 2 555 1 1 1 9999999999999 6666666666 1 66666 2 1 555555 1 22 333 1 1 11 11 1 44 11 11 11 2 1 1 44444 11 44 7777777777 1 2 555 33333 2 555 222 333 888888 66 44 1 1 99999999999 44 555 2 33 1 1 2 1
lowQualScore : . ... . . . . . . ........ . .... ......... . . . . . ... . .......... . .. .... . .... .. . ... . . ... .. . . .. . . .... . ... ............ ........ . ... . . ... . . .. .... ...... .. .. . .. . ..... . .. . . .. .. ..... .. ....... .. .. . ... . . . ............. .......... . ..... . . ...... . .. ... . . .. .. . .. .. .. .. . . . ..... .. .. .......... . . ... ..... . ... ... ... ...... .. .. . . ........... .. ... . .. . . . .
lowQualScore : 8 444 6 7 7 7 7 7 11111111 6 0000 000000000 8 5 5 5 6 222 1 8888888888 5 11 7777 5 6666 00 5 000 5 5 000 55 5 5 00 0 5 2222 5 666 111111111111 44444444 4 444 4 4 666 8 8 22 7777 333333 33 99 8 33 8 11111 4 99 4 4 33 77 33333 88 8888888 33 88 8 222 4 4 4 8888888888888 3333333333 4 11111 9 4 444444 4 00 555 3 3 88 88 3 55 88 88 88 7 3 3 77777 88 55 2222222222 3 7 000 33333 1 000 333 777 888888 33 55 4 4 33333333333 77 222 8 99 4 4 9 4
consensus : ACG-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
Reference ( family-608 ) : ACG-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83699 : ACG-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-A---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83700 : ACG-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--T--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-AT--T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---T------------C--------CC------T-AT-AT--TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-A--TT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----T-G-C-GG--A-----T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G----AAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83701 : ACG-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--T--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-AT--T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---T------------C--------CC------T-AT-AT--TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-A--TT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----T-G-C-GG--A-----T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G----AAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83702 : ACG-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-A---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GAC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-------A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83703 : ACA-TGT---ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG-CA-CA--T-C-T----C-A---T------------C--------TC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGT---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GA--C-G-G-ACT----T--T--T----------A-A-G---A-----ATTC---T---TC---T------A--TA--TT-C-A-----------T--G---AATT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83704 : ACG-TGTGT-TCC-T-G-TC-GTAG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG----A---G-CAA---T--AG-CA-CA--G-C-T----CAA---T------------C--------CC-CT---T-AT-----TA-CC-C--T----G------C--G--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CAGA-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AAGG--A--AA-T--A--T--GG--C-G-GCAC-----T--T--G----------A-A-GA--A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83705 : ACG-TGT-C-ACT-T-G-TC-G-AG-GTC--AT--C-C----G---------G-CC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA----------CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG-CA-GA--G-C-T----C-A---C------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--T-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AA----A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T-------------------------------------T---GC---T------C--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83706 : ACG-TGA-A-ACC-T-G-TC-G-AG-GCT--AT--C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAAAA-A--C--AG-CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG-TA-CA--G-C-T----C-A---T------------C--------CC-TT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------T--A--A-A--TCAC-GA-----C-A--C-C-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-T-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AG-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATGC---T---GC---T------A--TA--T
gi|83707 : ACG-TTTGT-ACC-T-G-TC-G-AG-C----A---C-C----G---------CCAC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--CC-A--CT-G--GTGTT---G-AA----GTG--A-A---G-C-C---A--AG-CA-CAT-G-C-T------A---T------------C--------CC-CT---T-A--A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--ACG---A--CAAA------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-T------TG-----AA----------T-A-----TGG-CCGG--A---T-G--GCC---A-AA-G--A--A--T--A--T--GG----G-G-AC-----T--T--G----------A-AAG---A-----ATTCT--T---GC---T------A--TA--GT-T-A-----------T--G----AAT-CAT--GTT-C-A-GCTTT
gi|83708 : ACG-TGT---ACC-T-G-TC-G-AG-GTA--AT--C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---A-----------------------ATGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G------AG-CA-CA--G-T-T----C-A---T------------T--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-CCTT----A------T--A--G-A--TCCT-GA-----TTA--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--TAA-T---ATC-CA-A-C------TA-----AA----------T-A-----TGGCC-GG--A---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG----G-G-AT-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTCT--T---GCG--T------A--TAT-TT-T-A-----------T--GA--AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83709 : ACG-TGT-A-ACC-T-G-TC-G-AGTA----A---T-C----G---------CCAC-A-G-G-TAA---AT------------------------GT----G-AA----GT---A-A---G-C-G---T--AG-CA-CA--G-C-TTT--C-A---T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC----T----G------C--A--G-A--TCCT-GG-----C-A--C-AAT--AT--A--------CAA-------T--A--GAAGT---TTC-CA---C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG------T-T--AGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-ATG---A-----ATTC---T---GC---T------AG-TA--TT-T-AT----------T--G---AAAT-CAT--G-T-CGA-GCTTTAA
gi|83710 : ACG-TGT-C-ACT-TTG-TC-G-AG-GTC--AT--C-C----G---------G-CC-A-G---TAA---AT-CAGAA----------CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-A---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---C------------C--------CC-CT---TAAT-A---TA--C-C--T----G------C--A--A-A--T-CT-GA-----C-A--A-A-T--AT--A-----A--C---------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA------------A-----TGG-C--G--A---T-T--GGC---A-------A--AA-TA-A--T--GG--C-G-G-AC-----T-------------------------------------T---GC---T------C--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTAAA
gi|83711 : ACGATGT-A-ACC-T-G-TC-G-AG-A----A---TTC----A---------A-AC-A-GAG-TAA---A-----------------------ATGT----G-AA----GAG--A-A---G-C-G---TTTAG-CATCA--G-CCT----C-A---T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------CC-A--G-A--TCCT-GA-----A-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAAAT---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----GGC-C-GG--AA--T-T--GGC---A-AA-G--A--AA----A--T--GG--CCGCG-AC-----T--T--G----------A-A-GG--A-----ATTC---T---GC---TT-----A--TAATTT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83712 : ACG-TGT---ACC-T-G-TC-G-AG-GTA--A---T-C----AA--------C-AC-A-G-G-TAA---AT------------------------GT----G-AA----GAG--A-----G-C-G---TT-AG-CA-CAA-G-C-T----C-A---T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--G-A--TCCT-GAC----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--AACGAA-----ATC-CA-A-T--------------A----------T-A-----TGG-C-GA--A-----T--GGC-----AA-G--A--A-----A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC-------GC---T------A--TAT-TT-T-AT----------T--G---AAAT-C
gi|83713 : ACG-TGTAT-CTC-T-G-TCAG-AG-G----C---C-C----GTAATCCACTC-AC-A-G-GGTAAC--ATACAGAA-A--CTCA--CT-G--GTGT----GTGACCCCGTG--A-GAGTG-C-GG--T--AG-CA-CA--G-C-TTCATC-A---T------------C--------CCTCT---T-AT-A----A-CCGC--T----C------C--A--A-A--TCTG-AA-----C-A--C-A-TT-AT--A-----AACCAA-------TT-A--GAA-T---ATC-CA-AAC------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-CTAGGC---A-AA-G--ATTAA-T--A-----GG--C-T-G-AC-----T--TTGG----------A-A-C---A-----A-TC---T---GC---T------A--TA--TT-TAA-----------T--G---AAATCCAT--G-TCC-A-GCTTTA
gi|83714 : ACG-TGT-C-ACT-T-G-TC-G-AG-G----ATATC-G----G---------C--C-A-G-T-AAA---AT-CAGCA-A--CT-A-----G--GTGT----G-AA----GTG--A-AA--G-C-A---T--AGGCA-CA--T-C------C-A---C------------C--------CC-CT-----A--A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--A-A-TTAAT--A-----A--C-A-------T--A--GAA-----ACC-AG-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GGATA---T-T--GGG---A-A-----A--AA-T--A--T---G--C-T-G-AC-----T--T--G---------------------------C---T----C---T------A-------T-T-A-----------T--GAAAAAAT-CAT--G-T-CGA-GCTTTAA
gi|83715 : ACG-TGT-A-GCC-T-G-TC-G-AG-GTTATG---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-GAGGTGT----G-AAA---GTG--A-AA--G-C-G---T--AG-CA-CA--G-C------C-A---TTT----------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-TCAT----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AC--A-----A--CAAAAAGATAC--A--AAA-TC--ATC-AA-A-C------T------GAGTACCCGGGGT-A-----TGG-T-----A---T-T--GGC---A-AA-G--
gi|83716 : G-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG------A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGTACGTG-AA----GTG--A-A---G-C-A---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---T---------------------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--CAA-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--GA--AAAT-CAT--G-T-C-A-ACTTTAA
gi|83717 : G-TGT-TTACCGT-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--AAACT-G--GTGTACGTG-AA----GTG--AGA---G-C-A---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-----T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----GC-----C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------TTA----AA----------T-A------GG-C-GG--A---T-G--GGCA--A-AA-G--A--AA-T--AGCT--GG--C-G-G-AC-----T--T--GAAAAAAGGAAA-A-A---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------TC-G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTT
gi|83718 : G-TGT-T-ACC-T-GGTC-G--G-A----A---C-C----G---------C-AC-A-G-GGTAA---TTTCAGAT-A--C--A--CT-G--GTCG----G-AA----GTG--A-AA--G-C-G---T--AG-CA-CA--GGC-T----C-AAATC------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-A--T----G------CCAA--A-A--TCCT-GATA---C-A--C-A-T--ATG-A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------TTA-----TGG-C-G---A---T-T--GGC---CTAA-G--A--AA-TTGA--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--AT---------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83719 : -TGT-T-ACC---G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-GGTAA---AT-CAGGA-AACC--A--CTTG--GTGTT---G-AA----GTG--A-A---G-C-A---T--AG-CA-C---G-C-T----C-A---T------------C--------CC-CT---T--T-AT--TA-CC-CT-T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--ATA-A-----A--CAA-------T--A--GAA-CTTAATC-CA-A-C-------------AA----------T-A-----TGGCC-GG--A---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--TGCGG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----A-TC---T---GC---TA-----A--TA--TT-T-A-----------T--T---GAAT-CAT--T-C-C-A-GCTTTAA
gi|83720 : -TGT-C-ACTGT-G-TC-G-AG-GTC--A---T-CCCTGG---------CCACTG-G-G-TAA---AT-CAGAA----------CT-G--GTGT----G-AA----GTGCAA-A---G-C-GAATT--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---AA-----------C--------CC-CTCTTT-AT-AGTTTA-CC-C--TT---G------C--A--A-AAATACC-AAAGACCC-A--C-A-T--ATTAA-----G--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-CA-----T------AA----------T-A-----TGG-C-GGC-ACATT-T--GGCCCAG-AA-A--A--AA-TA-A--T--GG--CGG-G-AC-----T--T--G-------------------------CCC---T----C---T------A--T---CT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-AGGCTT
gi|83721 : -G-TC-A-AA-T----G---C-C----G---------C-AC-AAG-G-TAA---AT------------------------GT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG--A-CA--G-C-T----C-A---T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TAACC-C--T----G------C--A--G-A--TCCTCGA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---GT--CA-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG------T-T--AGC-----AA-G--A--AA-T--A--T---G--C-G-G-AC-----T--TG-G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TT--TTCT-A-----------TC-G---AAAT-CAT----T-C-A-GCTTTAA
gi|83722 : -TC-G-AG-T----A---C-CT---G---------T-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAACA--C--A--CT-G--GTGTTA--G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-T---TTC----------C--------CC-TT---T-AT-A---TA-CCTC--TG---G------C--A--ATA--TCCT-GA-------A--C-A-C--AT--ACTCACA--CAA-------TCCA--GAA-TA--ATC-CC-A-CGCCACTT------AA----------T-ACGG--TGG-C-GT--T---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG----G-G-AC-----TTAT--G----------A-A-GTGCA-----A-TC---TATGGC---TATA---A--TA--TT-T-AGATAATTTACGT--G---AAAT-CATTGG-T-C-A-GCCTT
gi|83723 : -C----A---------C-AC-A-G-A-TAA---AT-CATAA-A--T--A--CC-A--ATGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-A---T--AG-CA-AA--A-C-T----A-A---TGTCCTGAATTGCC--------TC-CT---A-AT-A---TG-CC-A--T----GAAAAAAC--A--ATA--TGCA-AA-----A-A--C-A-T--AT--A-----ATTTAA-------T--GATGGA-T---GCT-CA-A-C------TGGACTGAA----------T-A-----TAA-T-AG--------T--GG----------------A-T--A--T--AGAAC-A-G-GC-----A--T--C----------A-A-G---A-----ATTC---T---TG---T------A--AA--TT-T-A-----------T--G---AAGT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83724 : -A-G-G-TAATTTCT-CAGAA-AACC--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTT--A-A---GTC-G---T--AG-CA-CATTGTC-T----T-T---T------------CTATTGTCTCC-CT---T-ATTA---TATCC-C--TTTGGG------C--A--A-AA-TCCTTGAT----C-ATGC-A-T--AT--A-----A--CAAAT-----T--A--GA--T---ATCATA-A-C------T------AA----------T-ACCACCTGG-G-GA--A---TAT--GGC---A-AA-GGAA--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC--------T--G----------A-A-G---A-----A-TC---T---GC---C------AT-TA--TT-T-A-----------TTGA---AAATGCATTGG-T-C-A-GCTTTAA
gi|83725 : -AA----GTG--T-A-----C-G---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---T------------T--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC----T----G------C--AGTA-T--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A---AA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----T---------------T--GGC---A-AA-G--A--AAAT--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--TT-G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-TAT--G-T-T-C-GCTTTAA
gi|83726 : -CT---T-AA-T---TA-CC-T--T----G------T--A--G-A--TCCT-GA-----T-A--G-A-T--AT--A-----A--CAA-------T-----GA-----------------------------AA----------T-A-----TGG-C-GA--A---T-A--AGC---A-GA-G--A--CA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----A--T--G----------A-A-T---A-----ATTCTAAT---ACATGT------A--TA--TT-T-A-----------A--G---AATT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83727 : -CT---T-AT-A---TA-CG-C--T----G------A--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---
gi|83728 : ---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-A---------T--A----------A-A-G---ATGAAAATGT---T--------T------AGGTA--TT-T-A-----------A--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83729 : ---A-AA-A--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-ATCAAGAT--T--G----------A-A-A---A--------C---T---GT---TTAGGTGG--TA--TT-T-A-----------A--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83730 : ---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-A---------T--A----------AGA-G---A-----AATG---T----C---T------AGGTA--TT-T-A-----------A--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTA
Alignments
lowQualScore : 111 22222222 1111111111 1111 111111111111
lowQualScore : 1 222 3 1 1 1 1 1 00000000 1 5555 888888888 4 1 1 1 4 444 3 3333333333 1 22 1111 1 4444 22 1 777 1 1 777 33 1 1 55 3 1 5555 1 222 333333333333 55555555 1 222 1 1 666 2 2 55 5555 555555 33 11 2 33 2 88888 1 11 1 1 33 44 55555 33 7777777 33 33 2 555 1 1 1 9999999999999 6666666666 1 66666 2 1 555555 1 22 333 1 1 11 11 1 44 11 11 11 2 1 1 44444 11 44 7777777777 1 2 555 33333 2 555 222 333 888888 66 44 1 1 99999999999 44 555 2 33 1 1 2 1
lowQualScore : . ... . . . . . . ........ . .... ......... . . . . . ... . .......... . .. .... . .... .. . ... . . ... .. . . .. . . .... . ... ............ ........ . ... . . ... . . .. .... ...... .. .. . .. . ..... . .. . . .. .. ..... .. ....... .. .. . ... . . . ............. .......... . ..... . . ...... . .. ... . . .. .. . .. .. .. .. . . . ..... .. .. .......... . . ... ..... . ... ... ... ...... .. .. . . ........... .. ... . .. . . . .
lowQualScore : 8 444 6 7 7 7 7 7 11111111 6 0000 000000000 8 5 5 5 6 222 1 8888888888 5 11 7777 5 6666 00 5 000 5 5 000 55 5 5 00 0 5 2222 5 666 111111111111 44444444 4 444 4 4 666 8 8 22 7777 333333 33 99 8 33 8 11111 4 99 4 4 33 77 33333 88 8888888 33 88 8 222 4 4 4 8888888888888 3333333333 4 11111 9 4 444444 4 00 555 3 3 88 88 3 55 88 88 88 7 3 3 77777 88 55 2222222222 3 7 000 33333 1 000 333 777 888888 33 55 4 4 33333333333 77 222 8 99 4 4 9 4
consensus : ACG-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
Reference ( family-608 ) : ACG-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83699 : ACG-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-A---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83700 : ACG-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--T--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-AT--T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---T------------C--------CC------T-AT-AT--TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-A--TT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----T-G-C-GG--A-----T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G----AAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83701 : ACG-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--T--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-AT--T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---T------------C--------CC------T-AT-AT--TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-A--TT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----T-G-C-GG--A-----T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G----AAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83702 : ACG-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-A---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GAC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-------A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83703 : ACA-TGT---ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG-CA-CA--T-C-T----C-A---T------------C--------TC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGT---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GA--C-G-G-ACT----T--T--T----------A-A-G---A-----ATTC---T---TC---T------A--TA--TT-C-A-----------T--G---AATT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83704 : ACG-TGTGT-TCC-T-G-TC-GTAG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG----A---G-CAA---T--AG-CA-CA--G-C-T----CAA---T------------C--------CC-CT---T-AT-----TA-CC-C--T----G------C--G--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CAGA-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AAGG--A--AA-T--A--T--GG--C-G-GCAC-----T--T--G----------A-A-GA--A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83705 : ACG-TGT-C-ACT-T-G-TC-G-AG-GTC--AT--C-C----G---------G-CC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA----------CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG-CA-GA--G-C-T----C-A---C------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--T-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AA----A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T-------------------------------------T---GC---T------C--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83706 : ACG-TGA-A-ACC-T-G-TC-G-AG-GCT--AT--C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAAAA-A--C--AG-CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG-TA-CA--G-C-T----C-A---T------------C--------CC-TT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------T--A--A-A--TCAC-GA-----C-A--C-C-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-T-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AG-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATGC---T---GC---T------A--TA--T
gi|83707 : ACG-TTTGT-ACC-T-G-TC-G-AG-C----A---C-C----G---------CCAC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--CC-A--CT-G--GTGTT---G-AA----GTG--A-A---G-C-C---A--AG-CA-CAT-G-C-T------A---T------------C--------CC-CT---T-A--A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--ACG---A--CAAA------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-T------TG-----AA----------T-A-----TGG-CCGG--A---T-G--GCC---A-AA-G--A--A--T--A--T--GG----G-G-AC-----T--T--G----------A-AAG---A-----ATTCT--T---GC---T------A--TA--GT-T-A-----------T--G----AAT-CAT--GTT-C-A-GCTTT
gi|83708 : ACG-TGT---ACC-T-G-TC-G-AG-GTA--AT--C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---A-----------------------ATGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G------AG-CA-CA--G-T-T----C-A---T------------T--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-CCTT----A------T--A--G-A--TCCT-GA-----TTA--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--TAA-T---ATC-CA-A-C------TA-----AA----------T-A-----TGGCC-GG--A---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG----G-G-AT-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTCT--T---GCG--T------A--TAT-TT-T-A-----------T--GA--AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83709 : ACG-TGT-A-ACC-T-G-TC-G-AGTA----A---T-C----G---------CCAC-A-G-G-TAA---AT------------------------GT----G-AA----GT---A-A---G-C-G---T--AG-CA-CA--G-C-TTT--C-A---T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC----T----G------C--A--G-A--TCCT-GG-----C-A--C-AAT--AT--A--------CAA-------T--A--GAAGT---TTC-CA---C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG------T-T--AGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-ATG---A-----ATTC---T---GC---T------AG-TA--TT-T-AT----------T--G---AAAT-CAT--G-T-CGA-GCTTTAA
gi|83710 : ACG-TGT-C-ACT-TTG-TC-G-AG-GTC--AT--C-C----G---------G-CC-A-G---TAA---AT-CAGAA----------CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-A---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---C------------C--------CC-CT---TAAT-A---TA--C-C--T----G------C--A--A-A--T-CT-GA-----C-A--A-A-T--AT--A-----A--C---------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA------------A-----TGG-C--G--A---T-T--GGC---A-------A--AA-TA-A--T--GG--C-G-G-AC-----T-------------------------------------T---GC---T------C--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTAAA
gi|83711 : ACGATGT-A-ACC-T-G-TC-G-AG-A----A---TTC----A---------A-AC-A-GAG-TAA---A-----------------------ATGT----G-AA----GAG--A-A---G-C-G---TTTAG-CATCA--G-CCT----C-A---T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------CC-A--G-A--TCCT-GA-----A-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAAAT---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----GGC-C-GG--AA--T-T--GGC---A-AA-G--A--AA----A--T--GG--CCGCG-AC-----T--T--G----------A-A-GG--A-----ATTC---T---GC---TT-----A--TAATTT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83712 : ACG-TGT---ACC-T-G-TC-G-AG-GTA--A---T-C----AA--------C-AC-A-G-G-TAA---AT------------------------GT----G-AA----GAG--A-----G-C-G---TT-AG-CA-CAA-G-C-T----C-A---T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--G-A--TCCT-GAC----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--AACGAA-----ATC-CA-A-T--------------A----------T-A-----TGG-C-GA--A-----T--GGC-----AA-G--A--A-----A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC-------GC---T------A--TAT-TT-T-AT----------T--G---AAAT-C
gi|83713 : ACG-TGTAT-CTC-T-G-TCAG-AG-G----C---C-C----GTAATCCACTC-AC-A-G-GGTAAC--ATACAGAA-A--CTCA--CT-G--GTGT----GTGACCCCGTG--A-GAGTG-C-GG--T--AG-CA-CA--G-C-TTCATC-A---T------------C--------CCTCT---T-AT-A----A-CCGC--T----C------C--A--A-A--TCTG-AA-----C-A--C-A-TT-AT--A-----AACCAA-------TT-A--GAA-T---ATC-CA-AAC------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-CTAGGC---A-AA-G--ATTAA-T--A-----GG--C-T-G-AC-----T--TTGG----------A-A-C---A-----A-TC---T---GC---T------A--TA--TT-TAA-----------T--G---AAATCCAT--G-TCC-A-GCTTTA
gi|83714 : ACG-TGT-C-ACT-T-G-TC-G-AG-G----ATATC-G----G---------C--C-A-G-T-AAA---AT-CAGCA-A--CT-A-----G--GTGT----G-AA----GTG--A-AA--G-C-A---T--AGGCA-CA--T-C------C-A---C------------C--------CC-CT-----A--A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--A-A-TTAAT--A-----A--C-A-------T--A--GAA-----ACC-AG-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GGATA---T-T--GGG---A-A-----A--AA-T--A--T---G--C-T-G-AC-----T--T--G---------------------------C---T----C---T------A-------T-T-A-----------T--GAAAAAAT-CAT--G-T-CGA-GCTTTAA
gi|83715 : ACG-TGT-A-GCC-T-G-TC-G-AG-GTTATG---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-GAGGTGT----G-AAA---GTG--A-AA--G-C-G---T--AG-CA-CA--G-C------C-A---TTT----------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-TCAT----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AC--A-----A--CAAAAAGATAC--A--AAA-TC--ATC-AA-A-C------T------GAGTACCCGGGGT-A-----TGG-T-----A---T-T--GGC---A-AA-G--
gi|83716 : G-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG------A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGTACGTG-AA----GTG--A-A---G-C-A---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---T---------------------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--CAA-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--GA--AAAT-CAT--G-T-C-A-ACTTTAA
gi|83717 : G-TGT-TTACCGT-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--AAACT-G--GTGTACGTG-AA----GTG--AGA---G-C-A---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-----T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----GC-----C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------TTA----AA----------T-A------GG-C-GG--A---T-G--GGCA--A-AA-G--A--AA-T--AGCT--GG--C-G-G-AC-----T--T--GAAAAAAGGAAA-A-A---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------TC-G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTT
gi|83718 : G-TGT-T-ACC-T-GGTC-G--G-A----A---C-C----G---------C-AC-A-G-GGTAA---TTTCAGAT-A--C--A--CT-G--GTCG----G-AA----GTG--A-AA--G-C-G---T--AG-CA-CA--GGC-T----C-AAATC------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-A--T----G------CCAA--A-A--TCCT-GATA---C-A--C-A-T--ATG-A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------TTA-----TGG-C-G---A---T-T--GGC---CTAA-G--A--AA-TTGA--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--AT---------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83719 : -TGT-T-ACC---G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-GGTAA---AT-CAGGA-AACC--A--CTTG--GTGTT---G-AA----GTG--A-A---G-C-A---T--AG-CA-C---G-C-T----C-A---T------------C--------CC-CT---T--T-AT--TA-CC-CT-T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--ATA-A-----A--CAA-------T--A--GAA-CTTAATC-CA-A-C-------------AA----------T-A-----TGGCC-GG--A---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--TGCGG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----A-TC---T---GC---TA-----A--TA--TT-T-A-----------T--T---GAAT-CAT--T-C-C-A-GCTTTAA
gi|83720 : -TGT-C-ACTGT-G-TC-G-AG-GTC--A---T-CCCTGG---------CCACTG-G-G-TAA---AT-CAGAA----------CT-G--GTGT----G-AA----GTGCAA-A---G-C-GAATT--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---AA-----------C--------CC-CTCTTT-AT-AGTTTA-CC-C--TT---G------C--A--A-AAATACC-AAAGACCC-A--C-A-T--ATTAA-----G--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-CA-----T------AA----------T-A-----TGG-C-GGC-ACATT-T--GGCCCAG-AA-A--A--AA-TA-A--T--GG--CGG-G-AC-----T--T--G-------------------------CCC---T----C---T------A--T---CT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-AGGCTT
gi|83721 : -G-TC-A-AA-T----G---C-C----G---------C-AC-AAG-G-TAA---AT------------------------GT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG--A-CA--G-C-T----C-A---T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TAACC-C--T----G------C--A--G-A--TCCTCGA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---GT--CA-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG------T-T--AGC-----AA-G--A--AA-T--A--T---G--C-G-G-AC-----T--TG-G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TT--TTCT-A-----------TC-G---AAAT-CAT----T-C-A-GCTTTAA
gi|83722 : -TC-G-AG-T----A---C-CT---G---------T-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAACA--C--A--CT-G--GTGTTA--G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-T---TTC----------C--------CC-TT---T-AT-A---TA-CCTC--TG---G------C--A--ATA--TCCT-GA-------A--C-A-C--AT--ACTCACA--CAA-------TCCA--GAA-TA--ATC-CC-A-CGCCACTT------AA----------T-ACGG--TGG-C-GT--T---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG----G-G-AC-----TTAT--G----------A-A-GTGCA-----A-TC---TATGGC---TATA---A--TA--TT-T-AGATAATTTACGT--G---AAAT-CATTGG-T-C-A-GCCTT
gi|83723 : -C----A---------C-AC-A-G-A-TAA---AT-CATAA-A--T--A--CC-A--ATGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-A---T--AG-CA-AA--A-C-T----A-A---TGTCCTGAATTGCC--------TC-CT---A-AT-A---TG-CC-A--T----GAAAAAAC--A--ATA--TGCA-AA-----A-A--C-A-T--AT--A-----ATTTAA-------T--GATGGA-T---GCT-CA-A-C------TGGACTGAA----------T-A-----TAA-T-AG--------T--GG----------------A-T--A--T--AGAAC-A-G-GC-----A--T--C----------A-A-G---A-----ATTC---T---TG---T------A--AA--TT-T-A-----------T--G---AAGT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83724 : -A-G-G-TAATTTCT-CAGAA-AACC--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTT--A-A---GTC-G---T--AG-CA-CATTGTC-T----T-T---T------------CTATTGTCTCC-CT---T-ATTA---TATCC-C--TTTGGG------C--A--A-AA-TCCTTGAT----C-ATGC-A-T--AT--A-----A--CAAAT-----T--A--GA--T---ATCATA-A-C------T------AA----------T-ACCACCTGG-G-GA--A---TAT--GGC---A-AA-GGAA--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC--------T--G----------A-A-G---A-----A-TC---T---GC---C------AT-TA--TT-T-A-----------TTGA---AAATGCATTGG-T-C-A-GCTTTAA
gi|83725 : -AA----GTG--T-A-----C-G---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---T------------T--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC----T----G------C--AGTA-T--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A---AA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----T---------------T--GGC---A-AA-G--A--AAAT--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--TT-G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-TAT--G-T-T-C-GCTTTAA
gi|83726 : -CT---T-AA-T---TA-CC-T--T----G------T--A--G-A--TCCT-GA-----T-A--G-A-T--AT--A-----A--CAA-------T-----GA-----------------------------AA----------T-A-----TGG-C-GA--A---T-A--AGC---A-GA-G--A--CA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----A--T--G----------A-A-T---A-----ATTCTAAT---ACATGT------A--TA--TT-T-A-----------A--G---AATT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83727 : -CT---T-AT-A---TA-CG-C--T----G------A--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---
gi|83728 : ---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-A---------T--A----------A-A-G---ATGAAAATGT---T--------T------AGGTA--TT-T-A-----------A--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83729 : ---A-AA-A--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-ATCAAGAT--T--G----------A-A-A---A--------C---T---GT---TTAGGTGG--TA--TT-T-A-----------A--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83730 : ---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-A---------T--A----------AGA-G---A-----AATG---T----C---T------AGGTA--TT-T-A-----------A--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTA
blockSeqs : A GT G T G A T T TTATG T CCTG TAATCCACT C T A A G TTT A ACTCA T AG ACGT T CCCC CA G AGT T A AAT TT G T TT G C TCAT A AAT GTCCTGAATTGC TATTGTCT T CTT A T GTT A G CT TTGG AAAAAA CA GT T AA C AGACC T TG A A TA TA CTCAC AC AAAGATA CC AC G TTA A G A GCCACTT GTACCCGGGG T CCACC C C CACAT A TA CCA T G GA TT A TG GC GC AA C C C CAAGA TA TG AAAAAAGGAA G A TGC TGAAA T TAA ATG ATG TAGGTG GG AT C A GATAATTTACG TG AAA C TG T C G G
blockSeqs : . GT G . . . . . TCAT . T A C . . . G C T ACAAA . . ACGT . A . . A . . T T . . T T . TT . . TT . . . . . T T T CA T C C . T A T TA . . . . T G CG TT AT T AT A C . . . TGGACTG . . CGG C . ATA . . A . . . . . A . . . G . . T . G T . T A . T T . G ATA GG T . . T C A G TG . . G .
blockSeqs : . AT . . . . . . CTAT . . . C . . . G . . AACCA . . TA . . . . A . . T . . . A . . . . . TC . . . . . T . . T G . . . . . . C . . . . . A . . A . . . A . . . TTA . . . . . AA . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . . G . T T . . T G T . . T C A . . . . . .
blockSeqs : . TT . . . . . . TAAT . . . . . . . . . . AACCA . . T . . . . A . . G . . . . . . . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . A T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . TCAT . . . . . . . . . . ACAG . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . ATAT . . . . . . . . . . ACCA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . TAA . . . . . . . . . . ACTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . . . . TCA . . . . . . . . . . CACA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . A . . . . . . . . . . ATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . A . . . . . . . . . . ATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . . . . A . . . . . . . . . . ACA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . A . . . . . . . . . . ACA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . . . . A . . . . . . . . . . ACA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . A . . . . . . . . . . ACA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . A . . . . . . . . . . ACA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . A . . . . . . . . . . ACA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . C . . . . . . . . . . ATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons :
originalCons : ACG-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
finalCons : ACG-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
Alignments
lowQualScore : 111 22222222 1111111111 1111 111111111111
lowQualScore : 1 222 3 1 1 1 1 1 00000000 1 5555 888888888 4 1 1 1 4 444 3 3333333333 1 22 1111 1 4444 22 1 777 1 1 777 33 1 1 55 3 1 5555 1 222 333333333333 55555555 1 222 1 1 666 2 2 55 5555 555555 33 11 2 33 2 88888 1 11 1 1 33 44 55555 33 7777777 33 33 2 555 1 1 1 9999999999999 6666666666 1 66666 2 1 555555 1 22 333 1 1 11 11 1 44 11 11 11 2 1 1 44444 11 44 7777777777 1 2 555 33333 2 555 222 333 888888 66 44 1 1 99999999999 44 555 2 33 1 1 2 1
lowQualScore : . ... . . . . . . ........ . .... ......... . . . . . ... . .......... . .. .... . .... .. . ... . . ... .. . . .. . . .... . ... ............ ........ . ... . . ... . . .. .... ...... .. .. . .. . ..... . .. . . .. .. ..... .. ....... .. .. . ... . . . ............. .......... . ..... . . ...... . .. ... . . .. .. . .. .. .. .. . . . ..... .. .. .......... . . ... ..... . ... ... ... ...... .. .. . . ........... .. ... . .. . . . .
lowQualScore : 8 444 6 7 7 7 7 7 11111111 6 0000 000000000 8 5 5 5 6 222 1 8888888888 5 11 7777 5 6666 00 5 000 5 5 000 55 5 5 00 0 5 2222 5 666 111111111111 44444444 4 444 4 4 666 8 8 22 7777 333333 33 99 8 33 8 11111 4 99 4 4 33 77 33333 88 8888888 33 88 8 222 4 4 4 8888888888888 3333333333 4 11111 9 4 444444 4 00 555 3 3 88 88 3 55 88 88 88 7 3 3 77777 88 55 2222222222 3 7 000 33333 1 000 333 777 888888 33 55 4 4 33333333333 77 222 8 99 4 4 9 4
consensus : ACG-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
Reference ( family-608 ) : ACG-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83699 : ACG-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-A---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83700 : ACG-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--T--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-AT--T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---T------------C--------CC------T-AT-AT--TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-A--TT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----T-G-C-GG--A-----T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G----AAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83701 : ACG-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--T--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-AT--T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---T------------C--------CC------T-AT-AT--TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-A--TT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----T-G-C-GG--A-----T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G----AAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83702 : ACG-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-A---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GAC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-------A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83703 : ACA-TGT---ACC-T-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG-CA-CA--T-C-T----C-A---T------------C--------TC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGT---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GA--C-G-G-ACT----T--T--T----------A-A-G---A-----ATTC---T---TC---T------A--TA--TT-C-A-----------T--G---AATT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83704 : ACG-TGTGT-TCC-T-G-TC-GTAG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTG----A---G-CAA---T--AG-CA-CA--G-C-T----CAA---T------------C--------CC-CT---T-AT-----TA-CC-C--T----G------C--G--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CAGA-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AAGG--A--AA-T--A--T--GG--C-G-GCAC-----T--T--G----------A-A-GA--A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83705 : ACG-TGT-C-ACT-T-G-TC-G-AG-GTC--AT--C-C----G---------G-CC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA----------CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG-CA-GA--G-C-T----C-A---C------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--T-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AA----A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T-------------------------------------T---GC---T------C--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83706 : ACG-TGA-A-ACC-T-G-TC-G-AG-GCT--AT--C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAAAA-A--C--AG-CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG-TA-CA--G-C-T----C-A---T------------C--------CC-TT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------T--A--A-A--TCAC-GA-----C-A--C-C-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-T-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AG-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATGC---T---GC---T------A--TA--T
gi|83707 : ACG-TTTGT-ACC-T-G-TC-G-AG-C----A---C-C----G---------CCAC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--CC-A--CT-G--GTGTT---G-AA----GTG--A-A---G-C-C---A--AG-CA-CAT-G-C-T------A---T------------C--------CC-CT---T-A--A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--ACG---A--CAAA------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-T------TG-----AA----------T-A-----TGG-CCGG--A---T-G--GCC---A-AA-G--A--A--T--A--T--GG----G-G-AC-----T--T--G----------A-AAG---A-----ATTCT--T---GC---T------A--TA--GT-T-A-----------T--G----AAT-CAT--GTT-C-A-GCTTT
gi|83708 : ACG-TGT---ACC-T-G-TC-G-AG-GTA--AT--C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---A-----------------------ATGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G------AG-CA-CA--G-T-T----C-A---T------------T--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-CCTT----A------T--A--G-A--TCCT-GA-----TTA--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--TAA-T---ATC-CA-A-C------TA-----AA----------T-A-----TGGCC-GG--A---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG----G-G-AT-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTCT--T---GCG--T------A--TAT-TT-T-A-----------T--GA--AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83709 : ACG-TGT-A-ACC-T-G-TC-G-AGTA----A---T-C----G---------CCAC-A-G-G-TAA---AT------------------------GT----G-AA----GT---A-A---G-C-G---T--AG-CA-CA--G-C-TTT--C-A---T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC----T----G------C--A--G-A--TCCT-GG-----C-A--C-AAT--AT--A--------CAA-------T--A--GAAGT---TTC-CA---C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG------T-T--AGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-ATG---A-----ATTC---T---GC---T------AG-TA--TT-T-AT----------T--G---AAAT-CAT--G-T-CGA-GCTTTAA
gi|83710 : ACG-TGT-C-ACT-TTG-TC-G-AG-GTC--AT--C-C----G---------G-CC-A-G---TAA---AT-CAGAA----------CT-G--GTGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-A---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---C------------C--------CC-CT---TAAT-A---TA--C-C--T----G------C--A--A-A--T-CT-GA-----C-A--A-A-T--AT--A-----A--C---------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA------------A-----TGG-C--G--A---T-T--GGC---A-------A--AA-TA-A--T--GG--C-G-G-AC-----T-------------------------------------T---GC---T------C--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTAAA
gi|83711 : ACGATGT-A-ACC-T-G-TC-G-AG-A----A---TTC----A---------A-AC-A-GAG-TAA---A-----------------------ATGT----G-AA----GAG--A-A---G-C-G---TTTAG-CATCA--G-CCT----C-A---T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------CC-A--G-A--TCCT-GA-----A-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAAAT---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----GGC-C-GG--AA--T-T--GGC---A-AA-G--A--AA----A--T--GG--CCGCG-AC-----T--T--G----------A-A-GG--A-----ATTC---T---GC---TT-----A--TAATTT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83712 : ACG-TGT---ACC-T-G-TC-G-AG-GTA--A---T-C----AA--------C-AC-A-G-G-TAA---AT------------------------GT----G-AA----GAG--A-----G-C-G---TT-AG-CA-CAA-G-C-T----C-A---T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--G-A--TCCT-GAC----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--AACGAA-----ATC-CA-A-T--------------A----------T-A-----TGG-C-GA--A-----T--GGC-----AA-G--A--A-----A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC-------GC---T------A--TAT-TT-T-AT----------T--G---AAAT-C
gi|83713 : ACG-TGTAT-CTC-T-G-TCAG-AG-G----C---C-C----GTAATCCACTC-AC-A-G-GGTAAC--ATACAGAA-A--CTCA--CT-G--GTGT----GTGACCCCGTG--A-GAGTG-C-GG--T--AG-CA-CA--G-C-TTCATC-A---T------------C--------CCTCT---T-AT-A----A-CCGC--T----C------C--A--A-A--TCTG-AA-----C-A--C-A-TT-AT--A-----AACCAA-------TT-A--GAA-T---ATC-CA-AAC------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-CTAGGC---A-AA-G--ATTAA-T--A-----GG--C-T-G-AC-----T--TTGG----------A-A-C---A-----A-TC---T---GC---T------A--TA--TT-TAA-----------T--G---AAATCCAT--G-TCC-A-GCTTTA
gi|83714 : ACG-TGT-C-ACT-T-G-TC-G-AG-G----ATATC-G----G---------C--C-A-G-T-AAA---AT-CAGCA-A--CT-A-----G--GTGT----G-AA----GTG--A-AA--G-C-A---T--AGGCA-CA--T-C------C-A---C------------C--------CC-CT-----A--A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--A-A-TTAAT--A-----A--C-A-------T--A--GAA-----ACC-AG-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GGATA---T-T--GGG---A-A-----A--AA-T--A--T---G--C-T-G-AC-----T--T--G---------------------------C---T----C---T------A-------T-T-A-----------T--GAAAAAAT-CAT--G-T-CGA-GCTTTAA
gi|83715 : ACG-TGT-A-GCC-T-G-TC-G-AG-GTTATG---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-GAGGTGT----G-AAA---GTG--A-AA--G-C-G---T--AG-CA-CA--G-C------C-A---TTT----------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-TCAT----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AC--A-----A--CAAAAAGATAC--A--AAA-TC--ATC-AA-A-C------T------GAGTACCCGGGGT-A-----TGG-T-----A---T-T--GGC---A-AA-G--
gi|83716 : G-TGT-T-ACC-T-G-TC-G-AG------A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--A--CT-G--GTGTACGTG-AA----GTG--A-A---G-C-A---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---T---------------------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--CAA-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG--A---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--GA--AAAT-CAT--G-T-C-A-ACTTTAA
gi|83717 : G-TGT-TTACCGT-G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAA-A--C--AAACT-G--GTGTACGTG-AA----GTG--AGA---G-C-A---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-----T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-C--T----GC-----C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------TTA----AA----------T-A------GG-C-GG--A---T-G--GGCA--A-AA-G--A--AA-T--AGCT--GG--C-G-G-AC-----T--T--GAAAAAAGGAAA-A-A---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------TC-G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTT
gi|83718 : G-TGT-T-ACC-T-GGTC-G--G-A----A---C-C----G---------C-AC-A-G-GGTAA---TTTCAGAT-A--C--A--CT-G--GTCG----G-AA----GTG--A-AA--G-C-G---T--AG-CA-CA--GGC-T----C-AAATC------------C--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC-A--T----G------CCAA--A-A--TCCT-GATA---C-A--C-A-T--ATG-A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------TTA-----TGG-C-G---A---T-T--GGC---CTAA-G--A--AA-TTGA--T--GG--C-G-G-AC-----T--T--AT---------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83719 : -TGT-T-ACC---G-TC-G-AG-G----A---C-C----G---------C-AC-A-G-GGTAA---AT-CAGGA-AACC--A--CTTG--GTGTT---G-AA----GTG--A-A---G-C-A---T--AG-CA-C---G-C-T----C-A---T------------C--------CC-CT---T--T-AT--TA-CC-CT-T----G------C--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--ATA-A-----A--CAA-------T--A--GAA-CTTAATC-CA-A-C-------------AA----------T-A-----TGGCC-GG--A---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--TGCGG--C-G-G-AC-----T--T--G----------A-A-G---A-----A-TC---T---GC---TA-----A--TA--TT-T-A-----------T--T---GAAT-CAT--T-C-C-A-GCTTTAA
gi|83720 : -TGT-C-ACTGT-G-TC-G-AG-GTC--A---T-CCCTGG---------CCACTG-G-G-TAA---AT-CAGAA----------CT-G--GTGT----G-AA----GTGCAA-A---G-C-GAATT--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---AA-----------C--------CC-CTCTTT-AT-AGTTTA-CC-C--TT---G------C--A--A-AAATACC-AAAGACCC-A--C-A-T--ATTAA-----G--CAA-------T--A--GAA-T---ATC-CA-A-CA-----T------AA----------T-A-----TGG-C-GGC-ACATT-T--GGCCCAG-AA-A--A--AA-TA-A--T--GG--CGG-G-AC-----T--T--G-------------------------CCC---T----C---T------A--T---CT-T-A-----------T--G---AAAT-CAT--G-T-C-AGGCTT
gi|83721 : -G-TC-A-AA-T----G---C-C----G---------C-AC-AAG-G-TAA---AT------------------------GT----G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG--A-CA--G-C-T----C-A---T------------C--------CC-CT---T-AT-A---TAACC-C--T----G------C--A--G-A--TCCTCGA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---GT--CA-A-C------T------AA----------T-A-----TGG-C-GG------T-T--AGC-----AA-G--A--AA-T--A--T---G--C-G-G-AC-----T--TG-G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TT--TTCT-A-----------TC-G---AAAT-CAT----T-C-A-GCTTTAA
gi|83722 : -TC-G-AG-T----A---C-CT---G---------T-AC-A-G-G-TAA---AT-CAGAACA--C--A--CT-G--GTGTTA--G-AA----GTG--A-A---G-C-G---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-T---TTC----------C--------CC-TT---T-AT-A---TA-CCTC--TG---G------C--A--ATA--TCCT-GA-------A--C-A-C--AT--ACTCACA--CAA-------TCCA--GAA-TA--ATC-CC-A-CGCCACTT------AA----------T-ACGG--TGG-C-GT--T---T-T--GGC---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG----G-G-AC-----TTAT--G----------A-A-GTGCA-----A-TC---TATGGC---TATA---A--TA--TT-T-AGATAATTTACGT--G---AAAT-CATTGG-T-C-A-GCCTT
gi|83723 : -C----A---------C-AC-A-G-A-TAA---AT-CATAA-A--T--A--CC-A--ATGT----G-AA----GTG--A-A---G-C-A---T--AG-CA-AA--A-C-T----A-A---TGTCCTGAATTGCC--------TC-CT---A-AT-A---TG-CC-A--T----GAAAAAAC--A--ATA--TGCA-AA-----A-A--C-A-T--AT--A-----ATTTAA-------T--GATGGA-T---GCT-CA-A-C------TGGACTGAA----------T-A-----TAA-T-AG--------T--GG----------------A-T--A--T--AGAAC-A-G-GC-----A--T--C----------A-A-G---A-----ATTC---T---TG---T------A--AA--TT-T-A-----------T--G---AAGT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83724 : -A-G-G-TAATTTCT-CAGAA-AACC--A--CT-G--GTGT----G-AA----GTT--A-A---GTC-G---T--AG-CA-CATTGTC-T----T-T---T------------CTATTGTCTCC-CT---T-ATTA---TATCC-C--TTTGGG------C--A--A-AA-TCCTTGAT----C-ATGC-A-T--AT--A-----A--CAAAT-----T--A--GA--T---ATCATA-A-C------T------AA----------T-ACCACCTGG-G-GA--A---TAT--GGC---A-AA-GGAA--AA-T--A--T--GG--C-G-G-AC--------T--G----------A-A-G---A-----A-TC---T---GC---C------AT-TA--TT-T-A-----------TTGA---AAATGCATTGG-T-C-A-GCTTTAA
gi|83725 : -AA----GTG--T-A-----C-G---T--AG-CA-CA--G-C-T----C-A---T------------T--------CC-CT---T-AT-A---TA-CC----T----G------C--AGTA-T--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A---AA-T---ATC-CA-A-C------T------AA----------T-A-----T---------------T--GGC---A-AA-G--A--AAAT--A--T--GG--C-G-G-AC-----T--TT-G----------A-A-G---A-----ATTC---T---GC---T------A--TA--TT-T-A-----------T--G---AAAT-TAT--G-T-T-C-GCTTTAA
gi|83726 : -CT---T-AA-T---TA-CC-T--T----G------T--A--G-A--TCCT-GA-----T-A--G-A-T--AT--A-----A--CAA-------T-----GA-----------------------------AA----------T-A-----TGG-C-GA--A---T-A--AGC---A-GA-G--A--CA-T--A--T--GG--C-G-G-AC-----A--T--G----------A-A-T---A-----ATTCTAAT---ACATGT------A--TA--TT-T-A-----------A--G---AATT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83727 : -CT---T-AT-A---TA-CG-C--T----G------A--A--A-A--TCCT-GA-----C-A--C-A-T--AT--A-----A--CAA-------T--A--GAA-T---
gi|83728 : ---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-A---------T--A----------A-A-G---ATGAAAATGT---T--------T------AGGTA--TT-T-A-----------A--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83729 : ---A-AA-A--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-ATCAAGAT--T--G----------A-A-A---A--------C---T---GT---TTAGGTGG--TA--TT-T-A-----------A--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTAA
gi|83730 : ---A-AA-G--A--AA-T--A--T--GG--C-G-G-A---------T--A----------AGA-G---A-----AATG---T----C---T------AGGTA--TT-T-A-----------A--G---AAAT-CAT--G-T-C-A-GCTTTA