lowQualScore                  :                                                                                                                              222222222             222                                                    11111111  1111111111111111111                                          333333333333333333333333333                                                       111                             222                2222           2222                                                                                                 22              222222                      22                         11111111           1               
lowQualScore                  :                                                                      1    22 44 1  22   1   3      3  666  1 22  3   1 1  1  888888888       333   555   1   88888888888 1  1  1 777  666 3  6666666  5 1 00000000  6666666666666666666 22  3     1  1 1  6666 1 22 44  3 5  444 333333333333333333333333333 3333 1  1   1 22  44   22    22  1  444444    3   1   888 1   444 1 1 1   333 1 1 4   222 88 1 44  1     1111  44444 0  9999   1 3     5 1   77  2  7 1   1      2  555 2 2   2  555   2 2    33  666 2 2  2  55  4 2     33 77    2   2     222222  33   2  2 2   2     99      99 2     33     2  33333333 2 33   2  3  4 2     2    
lowQualScore                  :                                                                      .    .. .. .  ..   .   .      .  ...  . ..  .   . .  .  .........       ...   ...   .   ........... .  .  . ...  ... .  .......  . . ........  ................... ..  .     .  . .  .... . .. ..  . .  ... ........................... .... .  .   . ..  ..   ..    ..  .  ......    .   .   ... .   ... . . .   ... . . .   ... .. . ..  .     ....  ..... .  ....   . .     . .   ..  .  . .   .      .  ... . .   .  ...   . .    ..  ... . .  .  ..  . .     .. ..    .   .     ......  ..   .  . .   .     ..      .. .     ..     .  ........ . ..   .  .  . .     .    
lowQualScore                  :                                                                      9    66 55 9  66   9   8      6  888  8 55  6   8 8  8  777777777       000   777   7   66666666666 8  8  9 111  000 8  4444444  5 8 77777777  9999999999999999999 55  6     7  7 7  7777 7 44 11  5 2  666 000000000000000000000000000 4444 5  5   5 11  22   11    00  5  333333    0   5   222 5   222 5 5 5   222 5 5 6   777 22 6 44  6     9999  33333 7  7777   8 6     5 8   55  0  6 9   9      1  888 1 1   1  333   4 4    22  555 4 4  4  66  7 2     11 22    2   2     111111  22   4  4 4   4     11      44 2     11     4  22222222 4 22   4  1  7 4     5    
consensus                     :                                                                  TATC-TTAT--C--T-TT--AAT-GCC-CGTAAT-TC---TT-C--AC-TGT-T-TT-CGT---C----CTTTTTC---TTTA-ATTT-CTT-----------G-TG-TT-G---TA---T-AC---C---AT-C-C----T---AC-C-----------------T--AA-CGTGA-AA-G-CG----C-G--T--GT-T-GC---T----------A-------T-T--G---A----T-CC-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GAT-A-A-CTC---G-T-T-CCG-T-T-T-T-CTAT--T--C-C--AC-ATTCGT---TA-----TATG--ACAAT-C-TTCAT-C-GTT--TG-TC-G-TAA-GATCGT-CG---T-T-TTC-TT--ACAA-G-TTCA--CA---A-C-CC-TT--AT-G-TTTTT--A-ATTGA-TGA-TAAGC-A---ACA--GAC-AA-C-AAG-CAAAA--TCAAAT-NT-ATTTG--AACAA-AC--------A-A--AAT-AAACT-C-CGAGA-TCTC
Reference ( gi|58883 )        :                                                                  TATC-TTAT--C--T-TT--AAT-GCC-TGTAAT-TC---TT-C--AC-TGT-T-TT-CG----C----TTTTTTC---TTTA-ATTT-CTT-----------G-TG-TT-G---TA---T-AC---C---AT-C-C----T---AC-C-----------------T--AA-CGTGA-AA-G-CG----C-G--T--GT-T-AC---T----------A-------T-T--G---A----T-CC-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GAT-C-A-CTC---G-T-T-CCG-T-T-T-T-CTA---T--C-C--AC-ATTCGT---TA-----TATG--A-AAT-C-TTCAT-C-GTT--TG-TC-G-TAA-GATCGT-CA---T-T-TTC-TT--ACAA-G-TTCA--CA---A-C-CC-TT--AT-G-TTTTT--ACATTGA-TGA-TAAGC-A---ACA--GAC-AA-C-AAG-CAAAA-CTCAAAT-AT-ATTTG--AACAA-AC--------A-A--AAT-AAGCT-C-CGAGA-TCTC
gi|58867                      :                                                                  TATC-TTAT--C--T-TT--AAT-GCC-TG-AAT-TC---T--C--AC-TGT-T-TT-CGT---C----TTTTTTC---TTT--ATTT-CTT-----------GCTG-TT-G---TA---T-AC---C---AT-C-C----T---AC-C-----------------T--AA-CGTGA-AA-G-CG----C-G--T--GT-T-AC---T----------A-------T-TG-G---A----T-CC-TCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GATAA-A-CTC---G-T-T-CCG-T-T-T-T-CTAT--T--C-C--AC-ATTCGT---AT-----TATG--ACAAT-C-TTCGT-C-GTT--TG-TC-GATAG-AATCGT-CA---T-T-TTC-TT--ACAA-G-TTCA--C----A-C-CC-TT--AT-G-TTTTT--AATTTGA-TGA-TAAGC-----ACA--GAT-AA-C-AAG-CAAAA--TCAAAT--T-ATTTG--AACAA-AC--------A-A--AAT-AAACT-C-CGAGA-TCTC
gi|58871                      :                                                               ttaTATC-TTAT--C--T-TT--AAT-GCC-TGTAAT-TCT--TT-C--AC-TG--T-TT-CGT---C----TTTTTTC---TTT--ATTT-CTT-----------G-TGTTT-G---TA---T-AC---C---AT-C-C----T---AC-CT----------------T--AA-CGTG---C-G-CG----C-G--T--GT-T-AC---T----------A-------T-TG-G---A----T-CC-GCCTA--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC--TT-GAT-A-A-CTC---G-T-T-CCG-T-T-T-T-CTAT--T--C-C--AC-ATTCG----TA-----TATG--ACAAT-C-TTCAT-C-GTT--TGTTC-G-TAA-GATCGT-CA---T-T-TTCTTT--ACAA-G-TTCA--CA---A-C-CC-TT--AT-G-TTTTT--A-ATTGA-TG---AATC-A-----A--GACAAA-C-AAG-CAAAA--TCAAATAAT-ATTTGACAACAA-A---------A-A--AAT-AAACT-C-AGAGA-TCTC
gi|58868                      :                                                               tttTATC-TTAA--C--T-TA--AAT-GCC-CGTAAT-TC---TT-C--AC-TGT-T-TC-CGT---C----CTTTTTC---TTTA--TTT-CTT-----------G-TG-TT-G---TA---T-AC---A---AT-C-C----TGT-AC-A-----------------T--GA-CGTGA-AA-G-CG----T-G--T--GT-A-GC---T----------T-------T-G--G---A----T-CC-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-AAT-G-A-CTC---G-T-T-CCG-T-T-T-T-CTAT--T--T-C--AC-ATTCG----TA-----AATG--ACAAT-C-TTCAT-C-GTT--TG-TC-G-TAA-GATCAT-CG---T-T-TTC-TT--CCAT-G-TTCA--CA---A-C-AC-TT--AT-G-TTTTT--A-ATTGA-TGA-TAAGC-----ACC--GAC-GA-C-AAG-CAAAA--TCAAAT-AT-ATTTG--AACTA-AC--------A-A--AAT-AAACTCC-CGAGA-TCTC
gi|58869                      :                                                               ttaTATC-TTAT--C--T-TT--AAT-GCC-CGTAAT-TC---TT-C---C-TGC-G-TT-CGTC--T----TTTTTTC---TTT--ATTT-CTT-----------G-TG-TT-G---TA---C-AA---T---AT-C-C----T---AC-A-----------------T--AA-CGTGA-AA-G-CG----C-G--TC-GT-T-AC---T----------A-------T-TG-G---A----T-CC-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GAT-A-A-TTC---G-T-C-TCG-T-T-T-T-CTA---TTCC-C--AC-AGTC-----TA-----TATG--ACAAT-CTTTCAT-C-GTT--TG-TC-G-TAA-GATCGT-CC---T-T-ATC-TT--ACAA-G--TCA--CA---A-C-CC-TT--AT-G---TTT--A-ATTGA-T-A-TAAGCAA---ACA--GAC-AA-C-AAG-CCAAA-ATAAAAT-AT-ATTTG--AACAA-AC--------A-A--AAT-AAACT-C-CGAGA-TCTC
gi|58873                      :                                                               ttaTATC-TTAT--C--T-TT--AAT-GCC-TGTAAT-TC---TT-C--AC-TGT-T-TT-CGT---C----TTTTTTC---TTTA-TTTT-CTT-----------G-TG-TTTG---TA---T-AC---C---AT-C-C----T---AC-C-----------------T--AA-CGTGA-AA-G-CG----C-G--T--GT-T-AC---T----------A-------T-T--GGA-A----T-CC-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GAT-A-A-CTC---G-T-T-CCG---T-T-T-CTAT--T--C-C--AC-ATTCG----TA-----TATG--ACAAT-C-TTCAT-C-G-T--TG--C-G-TAA-GATCAT-CAT--T-T-TTC-TG--ACAA-G-TTCA--CA---A-C-CCATT--AT-G-TTTTT--A-ATTGA-TGA-T-AGC-----ACA--GAC-AG-C-AAG-CAAAA---TAAAT-AC-AGTGG--AGC
gi|58885                      :                                                               ttaTATC-TTAT--C--T-TT--AAT-GCC-TGTAAT-TC---TT-C--AC-TG--T-TT-CG----T----CTTTTTC---TTT--ATTT-CTT-----------G-T--TT-G----A---T-AC---C---AT-C-C----T---ACGC-----------------T--AA-CGTGA-AA-G--G----C-G--T--GT-TCAC---T----------AG------T-G--G---A----T-CC-GCC-A--TT--TCT--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GAT-A-A-CTC---G-T-T-CCG-T-T-T-T-TTT---T--C-C--AC-ATTGGTA--TA-----TTTGACA-AGT-C-TTCAT-C-GTT--TG-TC-G-TAA-GATCGT-CA-----T-TTC-TT--ACAA-GTTTCA---A---A-C-CC-TTA-AT-G-TTTTT--A-ATTGA-TGA-TAAGC-----ACA--GAC-AACC-AAGCCAAAA-ATCAAA--AT-ATTT---AACAA-ACA-------A-A--AATAAAACT-C-CGAGA-TCTC
gi|58886                      :                                                                  TATC-TTAT--C--T-TTTAAAT-GCC-TATAAT-TC---TTTC--AC-TGT-TCTT-CGTCTTC----TTTCTTC---TTT---TCT-TTT-----------G-TG-TT-GAAGTG---T-AC---C---AT-C-C----T---AC-C-----------------T--AAACGTGA-AA-G-CGTGTGC-G--T--GTGT-AC---T----------A-------T-T--GGC-A----T-CC-GCC-A--TTGTTTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-G-T-A-A-CTC---G-T-T-CCG-T-T-TATGCTA---T--T-CCAAC-ATTCGT----A-----T-TG--ACAATTC-TTCAT-CTGTT--TG-TCTG-TAA-GATCGTTCA---T-C-TTC-TTTCACAA-G-TTCA--CA---AAC-CC-TT--AT-G-TTTTT--A-ATTGACTGACTAAGC-A---A-----GC-A--C-AAG-CAAA---TCAAAT-AT-ATTTG--AACAA-AC--------A-AGTAAT-AAACT-C-CGAGACTCTC
gi|58881                      :                                                                  TATC-TTAT--T--T------AT-GCC-TGTAAT-TC---TT-C--AC-TGT-T-TT------------TCTTTTT---TTTA----T-TTT-----------G-TG-TC-G---TA-----AC---C---ATAC-C----T---AC-C-----------------T--AA--GTGA-AA-G-CG----T--------T-T-AC---T--------------------T--G---G----T-C--GC--A--TT--TTC--TT-C--AC-TT------TCGC-TTT-GAT-A-A-CTC---G-T-T-CCG---T-T-T-CTAT--T--C-C--AC-ATTCG----TA-----TATG--ACAAT-C-TTCAT-C-G-T--TG-TC-G-TAA-GATCAT-CA-------TTC-TT--ACAA-G--TCA--CA---A---CC-TT--AT-G-TTTTT----ATTGA-TGA-TAA---A---GCA--G-C-AA-C-AAG-CAAA---TCAAAT-ATAATATG--AACAA-AC--------A-A--AAT-AA-CT-C-CGA
gi|58884                      :                                                                taTATC-TTAT--C--T-TT--AAT-GCC-TGTAAT-TC---TT-C--AC-TGT-T-TTTCGT---C----TTTTTTC---TTTA--TTT-CTT-----------G-TG-TG-G---TA---T-AC---C---AT-C-C----T---AC-C-----------------T--AA-CGTGA-AA-G-CG----C-G--T--GT-T-AC---T----------A-------T-TG-G---A----TCCC-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GAT-A-A-CTC---G-T-T-CCG-T-T-T-T-CTAT--T--C-C--AC-ATTCG----TA-----TATT-----AT-C-TT-AT-C-TTTAATG-CCTG-TAA-T-TCTT-CACTGT-T-TTC-
gi|58872                      :                                                                  TATC-TTAT--C--T-TT--AAT-GCC-TGTAAT-TC---TT-C--AC-TGT-T-TT-CGT---C----TTTTTTC---TTT--ATTT-CTTGTGTTGTCACAG-TG-TT-G---TA---T-AC---C---TT-C-C----T---AC-C-----------------T--AA-CGTGA-AA-G-CG----C-G--T--GT-T-AC---T----------A-------T-TG-G---A----T-CC-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GAT-A-A-CT----G-T-T-CCG-T-T-T-T-CTATATT--C-C--AC-ATTCGT---
gi|58882                      :                                                               ttaTATC-T-AT--C--T-TT--AATTGCCACG-ACT-TCC--TT-C--AC-TGC-T-TC-TG----CGGTCTTTTTTCCCTTCTG-ATTT-CTT-----------G-TG-TT-G---TA---T-AC---CT--AT-C-C----T---AC-C-----------------T--AA-CG-GA-------G----C-G--T--GT-T-GTGCAT----------A-------TGTAGG---A----T-CC-GCC-A--TT--TTCAATTTC--AC-TTGCTCAATCGT-TGT-GAT-A-A-CTCGTTG-T-T-CTG---T-T-T-CTA---TTCT-C--AC-ATTCGTCAATA-----TGTA--C-AAT-CTTTCATGC-GTT--GC-TC-G-TAAGGATCGT-TG---TGTATTC-TT--CCAA-G-TTCAATTA---A-CTCC-TT--ATCG-TTTCT--A-ACTGA-TGA-TA----A---ACA--GTC-AA-CAAAG-CAAAA--TCAAAC--T-ATTTG--AACAA-ACAATATTCAA-A--AAT-AAAGT-C-CGAGA-TCTCat
gi|58875                      :                                                                taTATC-T-AT--CATC-TT--AAT-GCC-TGTAATCTC---TC-A--ACATGT-T-TT-CG---------TCTTTTC---TTTA---TT-CTT-----------G-TG-TT-GC--TACGTT-AT---C---AT-C-TATATC---AC-C-----------------TTCAA-C-TGA-AA-GTCG----C-GCTT--GT-TTAC---T----------A-------A-T--GGA-A----T-C--GCC-AATTT--CTC--TTTT--AC-GT------TCGC-TTTTGAT-A-A-CTC---G-T-T-CCG-T-T-T-TTCTA---TTTC-C--A--ATGCGT----A-----T-TG--ACAGT-C-TTCATTC-GTT--TG-TC-G-TAA-GATCGT-CA---T-T-TTC-TT--ACAA-G-TTAA--CA---A-C-CC-CTTGAT-G-CTTTTTAATTTTGA-TG--TAAAC-ACGTACA--AAC-AA-T--GG-C-AAA-CTTAACC-TT-TTTGG--AACAATCC--------ATA--AAT-AA-CT-CTCGAGA-TC
gi|58876                      :                                                              ttagTATC-TTAT--C--T-TT--AAT-GCC-TGTAAT-TC---TT-C--AC-TGT-T-TT-TGT---C----CTTTTTC---TTT--ATTT-CTT-----------G-TG-TC-G---TA---T-AC---C---AT-C-C--------AC-C-----------------T--AA-CGTGA-AA-G-CG----C-A--T-------------------------------T-G--G---A----T-CC--CC-A--AT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GAT-A-A-CTC---G-T-TCCCA-TAT-T-T-CTG---T-------AC-AT---T---TA-----TAT
gi|58877                      :                                                               ttaTATT-TTAT--C--T-CA--AAT-GCC-CATAAT-TC---TT-T--AA-TGT-T-TT-CGA---C----TGTTTCC---TTT--ATTT-CTtttacaat
gi|58866                      :                                                               ttaTATC-TTAT--C--TATT--AAT-GCC-TGTAAT-TC---TT-C--AC-TGT-T-TT-CG----T----CTTTTTC---TTT--ATTT-CT--------------TG-TT-GA--CA---T--C---C---AT-T-T----T------------------------T-------TAG-AA-G-CG----TGG--T--G--T-AC---T------------------T-T--G---A----T-CC--CC-A--TT--TTC---TTC--AC-TT------TCGC-TTT-GAT-A-G-CT----G-TGT-TCG-T-T-T-T-CTA---T--C-C--A--AGTCG----TA-----TATT-----AT-C-TT-AT-C-TTTAATG-CCTG-TAA-T-TCTT-CA---C-T-GTT-TT--cattgctaatctgcattggatccaccattttctttcgctttgataactttttccgttttctattccacatttttgtatgaaaatcttcatcactgttttcttcccatgtacacaacgcttccactttttattgatgataagcactgacaacaagcaaaatctcgcatttatttgaaaagcaaaaactcccaagatc
gi|58887                      :                                                               ttaTATC-TTAT--CG-T-TT--AA--GCC-CGTA-T-CC---TT-CCCACCTGT-T-T--CG----T----CTTTTTA---TCTATATTT---------------G-TG-CT-G---TT---T-ATTTAC---AT-CAC----T---AC-T-----------------T--AAACGTGGGAA-G-CG----T-G--T--GT-TTGC---T----------A-------T-T--CT--A----T-CCCGCC-A--TT--TC----TTC--AC-TC------TTGC-TT--GAT-A-AACTC---G-T-T-CCA-T-TAT-T-CTA---T--T-C--AC-ATTCGT---TACTAGGTATG--ACAAT-C--TCAT-C-TTT--tc
gi|58893                      :                                                                  TATC-TTAT--C--T-TT--AAT-GCC-TGTAA
gi|58880                      : ctgccattttctttcactttcgcttttgataacttgttccgttttgctattccaacattcgtattTATCGTTATGTC--T-TT--AAT-GCCGTGTAAT-TC---TT-C--AC-TGTGT-TT-TGT---C----CTTTTTC---TTTG-ATTT-CTT-----------G-TG-T
gi|58879                      :                                                               ttaTATT-TCAT--C--T-TA--AAT-GTC-CATAAT-TC---TT-C--AA-TAT------------C----CCTTTTC---TTT--ATTT-CTT-----------G-TG-TA-A---TA---TAAA---T---AT-T-A----T---GC-C--------------------AA-T-----AA-G-CGTTC-C-T--T--ATCT-GCA--T----------G-------T-T-----------T-CC-ACC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT---T-T-G-CCCA--G-T-T---G-T-C-T-T-CTA---
gi|58870                      :                                                                 ttaTC-TTAT--C--T-TT--AAT-GTC-CATAAT-TC---TT-C--AA-TGT-T-TT-CGT---C----CCTTTTC---TTT--ATTT-CTT-----------G-TG-TT-G---TA---T-AC---A---AT-C-CTG--T---AC-A-----------------T--AA-CGTGA-AA-G-CG----C-G--T--GT-T-GC---TAATCTGC---A-------T-TG-G---A----T-CC-GCC-G--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GAT-A-A-CTT---G-T-T-CCG-T-T-T-T-CTAT--T--C-C--AC-ATTCG----TA-----TATG--ACAAT-T-TTCTT-C-GTT--TG-TC-A-TAA-GATCGT-CG---T-T-TTC-TT--CCAT-G-TTTA--CA---A-C-AC-TT--AT-GCTTTTT--AC--TGA-TGA-TAAGC-----ACA--GAC-GA-C-AAG-CAAAA--TCAAAT-CT-ATCTG--AACAA-AC--------A-A--AAT-AA-CT-C-CGAGA-TCTC
gi|58874                      :                                                                ttatTC-TTAT--C--T-T---AA---CC-CGTAAT-TCATCTT-C--AC-GTT-T-TT-CGTT--C----TTTTTTT---TTTA--TTT-CT------------G-T--TT-G---TA---T-AC---T---ATTC-C----T---AC-A-----------------T--AA-CGTGA-AA-G-CG----C-G--T--GT-T-GC---TC---------A-------G-T--GGGAA----T-CC-GCC-G--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT--AT-A-A-CTC---GTT-T-CCGTT-T-T-T-CTAT--T--C-C--AC-ATTCGTA--TA-----T-TG--ACAAT-C-TTCAT-C-GTT--TG-TC---TAA-GATCGT-CT---T-T-TTC------CAA-G-TTCA--CAC--A-C-CC-TG--AT-G-TTTTT--A-ACTGA-T-A-TAAGC-----ACAATGAC-AA-C-AA--CAAGA--TTAAAT-CT-A-TTG--AACAA-AC--------A-A--AAT-AATCA-C-CGAGA-
gi|58888                      :                                                                                         ttatattTATT-TC---TC-A--AC-TGT-T-TT-CG----T----CTTTTCG---TCTA-TCTTGCTT-----------G-TG-TT-G---TA---TCAC---TCCTATAC-C----T---AC-CCAGCCACATGCGCTTTGT--AA-CGTGA-AA-G-GG----C-G--TGGGT-T-GG---T----------A-------TATG-G---A----T-TC-A-C-A--TT--TTC--TTTC--ACGTT------TCGCTTTT-GAT---A-CTC---T-T-C-CTGCT-T-T-T-CTAT--T--C-C--ACGATTNNN---NN-----NNNN--N-NNN-N-NNNNN-N-NNN--NN-TC-G-AAA-AAT
gi|58878                      :                                                                                                 AATATC---TT-C--AA-TGT-T-TT-CGTC--C----CTTTTTC---ATTT-ATTT-CTT-----------G-TG-TT-G---TAAT-T-ACA--C---AT-C-C----TGTTAC-A-----------------T--AA-CGTGA-AAAG-CT----C-G--T--GT-T-GC---TTTAATCCTGCA-------T-T--G---GCAGTT-CC-GCC-A--TTGGTTC--TTTTCAAC-TT------TTGC-TTT-GAT-TAA-CTT---T-T-G-TCG-T-T-T-T-CTAT--T--C-C--AC-ATTTGT---
gi|58889                      :                                                                                                   ttatgaaatcttaatcgtataaatccc----C----TTTTTTC---TTTA--TTT-CTT-----------A-TG-TT-G---TA---T-AC---T---AC-C-C--------AC-CA----------------T--AA-CATGA-AA-G-CG----C-G--T--GT-T-GC---T----------A-------T-T--GG--A----T-CC-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GAT-A-A-CTC---G-T-T-CCA-T-T-T-T-CTA---TT-C-C--AC-ATTCG----TA-----TATG--ACAAT-C-TTCAT-C-GTT--TG-TC-G-TAA-GTTCGA-CG---T-T-TTC-TT--CCAA-G-TTCA--CA---A-C-CC-TT--AT-G-TTTTT--A-ACTGA-TGA-TAAGC-----ACA--GAC-AA-C-AAG-CGAAA--TCAAAT-CT-ATTTG--AACAA-AC--------A-A--ATT-AATCT-C-CGAGA-a
gi|58890                      :                                                                                                                                                                                                gt---AT-C-C----TGT-AC-A-----------------T--AA-CGTGT-AA-G-CG----T-G--C--GT-T-GC---T----------AATCTGCAT-T--GG--A----T-CC-ACC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GAT-A-A-CTC---G-T-T-CCG-T-T-T-T-CTAT--T--C-T--AC-ATTCG----TA-----TATG--ACAAT-C-TTCGT-C-GTT--TG-TC-A-CAA-GATCGT-CA---T-T-TTC-TT--CCAT-G-TTTA--CA---A-A-AC-TT--ATCC-TTTTT--AC--TGA-TGA-TAAGC-A---
gi|58891                      :                                                                                                                                                                                                                   tatttttagtgtctacaatatacgtaaaGTGA-AA-G-CG----C-G--T--GT-T-AC--------------A-------T-T--GG--A----T-CC-GCC-A--TT--T-C--TTTC--AC-TT-------CGC-TTT-GAT-A-A-TTC---G-T-T-CCG---T-T-T-CTAT--T--C-C--AC-ATTCG----TA-----TATG--ACAAT-C-TTCATAC-G-T--TG-TC-G-TAA-GATCGT-CA---T-T-TTC-TT--ACAA-G-TTCA--CA---A-C-CC-TT--AT-G--TTTT--A-ATTGA-TGA-TAAGC-----ACA--GAC-AA-C-AAG-CACAA-ATAAAAT-AT-ATTTG--AACAA-ACA-------A-A--AAT-AAACT-C-CGAGA-TCTCctga
gi|58892                      :                                                                                                                                                                                                                                                                              ---T----------A-------T-T--G---G----A-TC-ACC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GAT-A-A-C
gi|58877                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                  ----------A-------T-T--GG--A----T-CC-ACC-A--TT--TTC--TTT---------------CGC-TTT-GAT-A-A-CTT---T-T-T-CCG-T-T-T-T-CTAT--T--C-C--AC-ATTT-T---TG-----TATGA-A-AAT-C-TTCAT-C-ACT----------------------G---T-T-TTC-TT--CCCATG-TACA--CA---A-C-GC-TT--CC-A-CTTTT---TATTGA-TGA-TAAGC-----ACT--GAC-AA-C-AAG-CAAAATCTCGCAT-TT-ATTTG--AA-AA-GC--------A-A------AAACTCC-CAAGA-TC
gi|58893                      :                                                                                                                                                                                                                                         ttatattttatctcaaatgcccataattctttaatgttttcgactgtttcctttatttctcattgctaatctgc-CT-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGCTTTT-GAT-A-A-CTT---G-T-T-CCG-T-T-T-TGCTA---T--T-CCAAC-ATTCG----TA-----TTT------AT-C-TT-AT-C-TTTAATG-CCTG-TAA-
gi|58894                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --AC-TT------TTGC-TTT-AAT-A-A-CTC---A-------G-T-T-T-G--TA---T--TAC--AC-ATTCG----TA-----CATGA-A-AAT-C-TTCCT-C-ATT--
gi|58895                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 C-G-TAA-GATCGT-TG---T-T-TTC-TT--CCAA-G-TTCA--CATTAA-C-CC-TT--AT-G-TTTTT--A-ACTGA-TGA-TAAGC-A----CA--GAC-AA-C-AAG-CAAAA--TCAAAT-CT-ATTTG--AACAA-AC--------A-A--AAT-AAACT-C-CGAGA-TCTC
gi|58896                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -TTGTT--AC--TGA-TGA-TAAGC-A----CA--GAC-AA-C-AAA-CAAAA--TTAAAT-TT-ATGTG--AA-AG-AT--------A-A--GAT-AAACC-C-CAAGA-TCT
gi|58897                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ccatgttggcgtagctcT-ATTTG--AACAA-AC--------A-A--AAT-AAACT-C-CGAGA-TCTC

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                   22       11111111111                                  1111111    11111111111111111                                           333333333333333333333333333                                                                                                         111                                                                                                                                   22222                                                     11111111                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                   1 22  1 22 1 1 3333   1   3      3  666  1 22  3  1 1 1    222  55    1  444  1 11   1   00000000000 1  3   444  555 3 1 6666666  5 1 0000000  1 55555555555555555 22  3    1 1   1  6666  22 33  3 4 22 444 222222222222222222222222222 3333 1  1   1 22  44   22    22  1  444444    2   1  1 1  1   1  1 555   3 1 1 1 4 22  1  1 1 1 1 1     888 66666  1  1    1 1 1  1  1 3 1   77  2  7 1    2     2 66666 2 2   2  444   2 2    33  666 2 2  2  55  2 2      2 55    2   2     11111   33   2  2   2 2 33 2   55      55 2     22     2  22222222 2 33   2     4 2     2    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                   . ..  . .. . . ....   .   .      .  ...  . ..  .  . . .    ...  ..    .  ...  . ..   .   ........... .  .   ...  ... . . .......  . . .......  . ................. ..  .    . .   .  ....  .. ..  . . .. ... ........................... .... .  .   . ..  ..   ..    ..  .  ......    .   .  . .  .   .  . ...   . . . . . ..  .  . . . . .     ... .....  .  .    . . .  .  . . .   ..  .  . .    .     . ..... . .   .  ...   . .    ..  ... . .  .  ..  . .      . ..    .   .     .....   ..   .  .   . . .. .   ..      .. .     ..     .  ........ . ..   .     . .     .    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                   7 44  7 44 7 7 8888   7   5      3  222  7 33  3  7 7 7    999  99    7  666  7 33   7   22222222222 7  3   888  444 5 7 1111111  0 7 0000000  7 00000000000000000 33  3    6 6   6  2222  22 88  2 8 22 222 444444444444444444444444444 3333 5  5   5 00  11   00    00  4  111111    9   4  4 4  4   5  5 666   0 5 5 5 4 00  5  5 5 5 5 5     444 11111  7  7    7 7 8  8  8 6 8   55  0  6 9    1     1 88888 1 1   1  777   2 2    11  111 2 2  2  33  2 2      1 00    1   1     33333   11   2  2   2 2 11 2   33      44 1     99     2  55555555 2 11   2     4 2     4    
consensus                     :                                                                                                                                                               TATC-T--TA-T--C-T-T-T--AAT-GCC-CGTAAT-TC---TT-C--AC-TG-T-T-TTCG---TCC-TTTT-TC---TT-TAATTT-CTT-----------G-TG-TTG---TA---T-A-C---C---AT-C-C----T--AC-C-----------------T--AA-CGTG-A-AAG-CG----CG--T--GT-T-G--C---T----------A-------T-T--GG--A----T-CC-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AA-CTC-GT-T---CCG-T-T-T-T-C--TA-TT-C-C-A-C-ATTCGT-TA-----TA-TG-ACAA-T-C-TT-CA-T-C-GTT--TG-TC-G-TAAG-ATCGT-C---G-T-T-TTC-TT--ACAA-G-TTCA--CA---A-C-CC-TT--AT-G-TTTTTA-A--TTGA-TGA-TAAGC-A---ACA--GAC-AA-CAA-G-C--A-AAA--TCAAAT-NT-ATTTG--AACAA-AC--------A-A--AAT-AAACT-C-CGAGA-TCTC
Reference ( family-606 )      :                                                                                                                                                               TATC-T--TA-T--C-T-T-T--AAT-GCC-CGTAAT-TC---TT-C--AC-TG-T-T-TTCG---TCC-TTTT-TC---TT-TAATTT-CTT-----------G-TG-TTG---TA---T-A-C---C---AT-C-C----T--AC-C-----------------T--AA-CGTG-A-AAG-CG----CG--T--GT-T-G--C---T----------A-------T-T--G---A----T-CC-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AA-CTC-GT-T---CCG-T-T-T-T-C--TA-TT-C-C-A-C-ATTCGT-TA-----TA-TG-ACAA-T-C-TT-CA-T-C-GTT--TG-TC-G-TAAG-ATCGT-C---G-T-T-TTC-TT--ACAA-G-TTCA--CA---A-C-CC-TT--AT-G-TTTTTA-A--TTGA-TGA-TAAGC-A---ACA--GAC-AA-CAA-G-C--A-AAA--TCAAAT-NT-ATTTG--AACAA-AC--------A-A--AAT-AAACT-C-CGAGA-TCTC
gi|58866                      :                                                                                                                                                               TATC-T--TA-T--C-TAT-T--AAT-GCC-TGTAAT-TC---TT-C--AC-TG-T-T-TTCG---T-C-TTTT-TC---TT-T-ATTT-CT--------------TG-TTG----A---C-ATC---C---AT-T-T----T-----T-----------------T--A-----G-A-A----G----CG--T--GG-T-GTAC---T------------------T-T--G---A----T-CC--CC-A--TT--TTC---TTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AG-CT--GTGT---TCG-T-T-T-T-C--TA--T-C-C-A---AGTCG--TA-----TA-TT----A-T-C-TT--A-T-C-TTTAATG-CCTG-TAA
gi|58866                      :                                                                                                                                                            ttaTATC-T--TA-T--C-T-T-T--AAT-GCC-TGTAAT-TC---TT-C--AC-TG-T-T-TTttcttcactgtttttc
gi|58867                      : ttatatcttatctattaatgcctgtaattcttcactgttttcgtctttttctttatttcttgttgacatccattttttagaagcgtggtgtactttgatccccattttcttcactttcgctttgatagctgtgttcgttttctatccaagtcgtatatTATC-T--TA-T--C-T-T-T--AAT-GCC-TG-AAT-TC---T--C--AC-TG-T-T-TTCG---TCT-TTTT-TC---TT-T-ATTT-CTT-----------GCTG-TTG---TA---T-A-C---C---AT-C-C----T--AC-C-----------------T--AA-CGTG-A-AAG-CG----CG--T--GT-T-A--C---T----------A-------T-TG-G---A----T-CC-TCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-TAAA-CTC-GT-T---CCG-T-T-T-T-C--TA-TT-C-C-A-C-ATTCGT-AT-----TA-TG-ACAA-T-C-TT-CG-T-C-GTT--TG-TC-GATAGA-ATCGT-C---A-T-T-TTC-TT--ACAA-G-TTCA--C----A-C-CC-TT--AT-G-TTTTTA-AT-TTGA-TGA-TAAGC-----ACA--GAT-AA-CAA-G-C--A-AAA--TCAAAT--T-ATTTG--AACAA-AC--------A-A--AAT-AAACT-C-CGAGA-TCTCtc
gi|58868                      :                                                                                                                                                            ttaTATC-T--TA-A--C-T-T-A--AAT-GCC-CGTAAT-TC---TT-C--AC-TG-T-T-TCCG---TCC-TTTT-TC---TT-TA-TTT-CTT-----------G-TG-TTG---TA---T-A-C---A---AT-C-C----TGTAC-A-----------------T--GA-CGTG-A-AAG-CG----TG--T--GT-A-G--C---T----------T-------T-G--G---A----T-CC-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-AA-T-GA-CTC-GT-T---CCG-T-T-T-T-C--TA-TT-T-C-A-C-ATTCG--TA-----AA-TG-ACAA-T-C-TT-CA-T-C-GTT--TG-TC-G-TAAG-ATCAT-C---G-T-T-TTC-TT--CCAT-G-TTCA--CA---A-C-AC-TT--AT-G-TTTTTA-A--TTGA-TGA-TAAGC-----ACC--GAC-GA-CAA-G-C--A-AAA--TCAAAT-AT-ATTTG--AACTA-AC--------A-A--AAT-AAACTCC-CGAGA-TCTC
gi|58869                      :                                                                                                                                                            ttaTATC-T--TA-T--C-T-T-T--AAT-GCC-CGTAAT-TC---TT-C---C-TG-C-G-TTCG---TCT-TTTT-TT---CT-TTATTT-CTT-----------G-TG-TTG---TA---C-A-A---T---AT-C-C----T--AC-A-----------------T--AA-CGTG-A-AAG-CG----CG--TC-GT-T-A--C---T----------A-------T-T--GG--A----T-CC-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AA-TTC-GT-C---TCG-T-T-T-T-C--TA-TTCC-C-A-C-AGTC---TA-----TA-TG-ACAA-T-CTTT-CA-T-C-GTT--TG-TC-G-TAAG-ATCGT-C---C-T-T-ATC-TT--ACAA-G--TCA--CA---A-C-CC-TT--AT-G---TTTA-A--TTGA-T-A-TAAGCAA---ACA--GAC-AA-CAA-GCC--A-AAA--TAAAAT-AT-ATTTG--AACAA-AC--------A-A--AAT-AAACT-C-CGAGA-TCTC
gi|58870                      :                                                                                                                                                              ttaTC-T--TA-T--C-T-T-T--AAT-GTC-CATAAT-TC---TT-C--AA-TG-T-T-TTCG---TCC-CTTT-TC---TT-TA-TTT-CTT-----------G-TG-TTG---TA---T-A-C---A---AT-C-C----TGTAC-A-----------------T--AA-CGTG-A-AAG-CG----CG--T--GT-T-G--C---T----------AATCTGCAT-T--GG--A----T-CC-GCC-G--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AA-CTT-GT-T---CCG-T-T-T-T-C--TA-TT-C-C-A-C-ATTCGT--A-----TA-TG-ACAA-T-T-TT-CT-T-C-GTT--TG-TC-A-TAAG-ATCGT-C---G-T-T-TTC-TT--CCAT-G-TTTA--CA---A-C-AC-TT--AT-G-CTTTTT-A--CTGA-TGA-TAAGC-----ACA--GAC-GA-CAA-G-C--A-AAA--TCAAAT-CT-ATCTG--AACAA-AC--------A-A--AAT--AACT-C-CGAGA-TCTC
gi|58871                      :                                                                                                                                                           ttatTATC-T--TA-T--C-T-T-T--AAT-GCC-TGTAAT-TCT--TT-C--AC-TG---T-TTCG---TCT-TTTT-TC---TT-T-ATTT-CTT-----------G-TGTTTG---TA---T-A-C---C---AT-C-C----T--AC-CT----------------T--AA-CGTG----CG-CG----CG--T--GT-T-A--C---T----------A-------T-TG-G---A----T-CC-GCCTA--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC--TT-GA-T-AA-CTC-GT-T---CCG-T-T-T-T-C--TA-TT-C-C-A-C-ATTCG--TA-----TA-TG-ACAA-T-C-TT-CA-T-C-GTT--TGTTC-G-TAAG-ATCGT-C---A-T-T-TTCTTT--ACAA-G-TTCA--CA---A-C-CC-TT--AT-G-TTTTTA-A--TTGA-TG---AATC-A-----A--GACAAA-CAA-G-C--A-AAA--TCAAATAAT-ATTTGACAACAA-A---------A-A--AAT-AAACT-C-AGAGA-TCTC
gi|58872                      :                                                                                                                                                            tttTATC-T--TA-T--C-T-T-T--AAT-GCC-TGTAAT-TC---TT-C--AC-TG-T-T-TTCG---TCT-TTTT-TC---TT-T-ATTT-CTTGTGTTGTCACAG-TG-TTG---TA---T-A-C---C---TT-C-C----T--AC-C-----------------T--AA-CGTG-A-AAG-CG----CG--T--GT-T-A--C---T----------A-------T-TG-G---A----T-CC-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AA-CT--GT-T---CCG-T-T-T-T-CTATA-TT-C-C-A-C-ATTCGT-
gi|58873                      :                                                                                                                                                            ttaTATC-T--TA-T--C-T-T-T--AAT-GCC-TGTAAT-TC---TT-C--AC-TG-T-T-TTCG---TCT-TTTT-TC---TT-TATTTT-CTT-----------G-TGTTTG---TA---T-A-C---C---AT-C-C----T--AC-C-----------------T--AA-CGTG-A-AAG-CG----CG--T--GT-T-A--C---T----------A-------T-T--GGA-A----T-CC-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AA-CTC-GT-T---CCG---T-T-T-C--TA-TT-C-C-A-C-ATTCG--TA-----TA-TG-ACAA-T-C-TT-CA-T-C-G-T--TG--C-G-TAAG-ATCAT-C---ATT-T-TTC-TG--ACAA-G-TTCA--CA---A-C-CCATT--AT-G-TTTTTA-A--TTGA-TGA-T-AGC-----ACA--GAC-AG-CAA-G-C--A-AAA--T-AAAT-AC-AGTGG--AGCat
gi|58874                      :                                                                                                                                                              ttaTC-T--TA-T--C-T-T----AA---CC-CGTAAT-TCATCTT-C--AC-GT-T-T-TTCG---TTC-TTTT-TT---TT-TTATTT-CT------------G-T--TTG---TA---T-A-C---T---ATTC-C----T--AC-A-----------------T--AA-CGTG-A-AAG-CG----CG--T--GT-T-G--C---TC---------A-------G-T--GGGAA----T-CC-GCC-G--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT--A-T-AA-CTC-GT-TT--CCG-T-T-T-TTC--TA-TT-C-C-A-C-ATTCG--TA-----TATTG-ACAA-T-C-TT-CA-T-C-GTT--TG-TC---TAAG-ATCGT-C---T-T-T-TTC------CAA-G-TTCA--CAC--A-C-CC-TG--AT-G-TTTTTA-A--CTGA-T-A-TAAGC-----ACAATGAC-AA-CAA---C--A-AGA--TTAAAT-CT-A-TTG--AACAA-AC--------A-A--AAT-AATCA-C-CGAGA-
gi|58875                      :                                                                                                                                                        ttatattTATC-TATCA-T--C-T-T----AAT-GCC-TGTAATCTC---TC-A--ACATG-T-T-TTCG---TC---TTT-TC---TT-TA--TT-CTT-----------G-TG-TTGC--TACGTT-A-T---C---AT-C-TATATC--AC-C-----------------TTCAA-C-TG-A-AAGTCG----CGCTT--GT-TTA--C---T----------A-------A-T--GGA-A----T-C--GCC-AATTT--CTC--TTTT--AC-GT------TCGC-TTTTGA-T-AA-CTC-GT-T---CCGTT-T-T-T-C--TATTT-C-C-A---ATGCG--TA-----T--TG-ACAG-T-C-TT-CATT-C-GTT--TG-TC-G-TAAG-ATCGT-C---A-T-T-TTC-TT--ACAA-G-TTAA--CA---A-C-CC-CTTGAT-GCTTTTTA-ATTTTGA-TG--TAAAC-ACGTACA--AAC-AA-T-G-G-C--A-AAC--TTAACC-TT-TTTGG--AACAATCC--------ATA--AAT--AACT-CTCGAGA-TC
gi|58876                      :                                                                                                                                                           ttagTATC-T--TA-T--C-T-T-T--AAT-GCC-TGTAAT-TC---TT-C--AC-TG-T-T-TTTG---TCC-TTTT-TC---TT-T-ATTT-CTT-----------G-TG-TCG---TA---T-A-C---C---AT-C-C-------AC-C-----------------T--AA-CGTG-A-AAG-CG----C------AT-T-G------------------------------G---A----T-CC--CC-A--AT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AA-CTC-GT-TC--CCA-TAT-T-T-C--TG-T------A-C-ATTTA--TA-----TT-TT-ACAA-T-
gi|58877                      :                                                                                                                                                            ttaTATT-T--TA-T--C-T-C-A--AAT-GCC-CATAAT-TC---TT-T--AA-TG-T-T-TTCG---ACT-GTTT-CC---TT-T-ATTT-CT--------------CA-TTG------------------------------------C-----------------T--AA-TCTG-C-A-----------------T-T-G------------------------------G---A----T-CC-ACC-A--TT--TT----------C-TT------TCGC-TTT-GA-T-AA-CTT-TT-T---CCG-T-T-T-T-C--TA-TT-C-C-A-C-ATTT-T-TG-----TA-TG-AAAA-T-C-TT-CA-T-C-ACT-------------------------G-T-T-TTC-TT--CCCATG-TACA--CA---A-C-GC-TT--CC-A-CTTTTT-A--TTGA-TGA-TAAGC-----ACT--GAC-AA-CAA-G-C--A-AAATCTCGCAT-TT-ATTTG--AA-AA-GC--------A-A------AAACTCC-CAAGA-TC
gi|58878                      :                                                                                                                                                             ttaATC-T--TAAT--C-G-TAT--AAA-TCC-C--AATATC---TT-C--AA-TG-T-T-TTCG---TCCCTTTT-TC---AT-TTATTT-CTT-----------G-TG-TTG---TAAT-T-A-CA--C---AT-C-CTGT-T--AC-A-----------------T--AA-CGTGAA-AAG-CT----CG--T--GT-T-G--C---TTTAATCCTGCA-------T-T--G---GCAGTT-CC-GCC-A--TTGGTTC--TTTTCAAC-TT------TTGC-TTT-GATT-AA-CTT-TT-G---TCG-T-T-T-T-C--TA-TT-C-C-A-C-ATTTGT-
gi|58879                      :                                                                                                                                                        ttatgaaTATT-T--CA-T--C-T-T-A--AAT-GTC-CATAAT-TC---TT-C--AA-T---------A---TCC-CTTT-TC---TT-T-ATTT-CTT-----------G-TG-TAA---TA---TAA-A---T---AT-T-A----T--GC-C--------------------AA-T------AAG-CGTTC-CT--T--ATCT-G--CA--T----------G-------T-T-----------T-CC-ACC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT----T-TG-CCCAGT-T-----G-T-C-T-T-C--TA-a
gi|58880                      :                                                                                                                                                            ttaTATCGT--TA-TGTC-T-T-T--AAT-GCCGTGTAAT-TC---TT-C--AC-TG-TGT-TTTG---TCC-TTTT-TC---TT-TGATTT-CTT-----------G-TG-T
gi|58881                      :                                                                                                                                                            ttaTATC-T--TA-T--T-T-------AT-GCC-TGTAAT-TC---TT-C--AC-TG-T-T-TTT------C-TTTT-TT---TT---ATTT---T-----------G-TG-TCG---TA-----A-C---C---ATAC-C----T--AC-C-----------------T--AA--GTG-A-AAG-CG----T-------T-T-A--C---T--------------------T--G---G----T-C--GC--A--TT--TTC--TT-C--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AA-CTC-GT-T---CCG---T-T-T-C--TA-TT-C-C-A-C-ATTCG--TA-----TA-TG-ACAA-T-C-TT-CA-T-C-G-T--TG-TC-G-TAAG-ATCAT-C---A-----TTC-TT--ACAA-G--TCA--CA---A---CC-TT--AT-G-TTTTT--A--TTGA-TGA-TAA---A---GCA--G-C-AA-CAA-G-C----AAA--TCAAAT-ATAATATG--AACAA-AC--------A-A--AAT--AACT-C-CGA
gi|58882                      :                                                                                                                                                             taTATC-T---A-T--C-T-T-T--AATTGCCACG-ACT-TCC--TT-C--AC-TG-C-T-TCTGCGGTCT-TTTT-TCCCTTC-TGATTT-CTT-----------G-TG-TTG---TA---T-A-C---CT--AT-C-C----T--AC-C-----------------T--AA-CG-G-A------G----CG--T--GT-T-G--TGCAT----------A-------TGTAGG---A----T-CC-GCC-A--TT--TTCAATTTC--AC-TTGCTCAATCGT-TGT-GA-T-AA-CTC-GT-TGTTCTG-T-T-T---C--TA-TT-CTC-A-C-ATTCGT-CAA----TA-TGTACAA-T-C-TTTCA-TGC-GTT--GC-TC-G-TAAGGATCGT-T---G-TGTATTC-TT--CCAA-G-TTCAATTA---A-CTCC-TT--ATCG-TTTCTA-A--CTGA-TGA-TAA-------ACA--GTC-AA-CAAAG-C--A-AAA--TCAAA--CT-ATTTG--AACAA-ACAATATTCAA-A--AAT-AAAGT-C-CGAGA-TCTC
gi|58883                      :                                                                                                                                                             taTATC-T--TA-T--C-T-T-T--AAT-GCC-TGTAAT-TC---TT-C--AC-TG-T-T-TTCG----CT-TTTT-TC---TT-TAATTT-CTT-----------G-TG-TTG---TA---T-A-C---C---AT-C-C----T--AC-C-----------------T--AA-CGTG-A-AAG-CG----CG--T--GT-T-A--C---T----------A-------T-T--G---A----T-CC-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-CA-CTC-GT-T---CCG-T-T-T-T-C--TA--T-C-C-A-C-ATTCGT-TA-----TA-TG-A-AA-T-C-TT-CA-T-C-GTT--TG-TC-G-TAAG-ATCGT-C---A-T-T-TTC-TT--ACAA-G-TTCA--CA---A-C-CC-TT--AT-G-TTTTTACA--TTGA-TGA-TAAGC-A---ACA--GAC-AA-CAA-G-C--A-AAAC-TCAAAT-AT-ATTTG--AACAA-AC--------A-A--AAT-AAGCT-C-CGAGA-TCTC
gi|58884                      :                                                                                                                                                               TATC-T--TA-T--C-T-T-T--AAT-GCC-TGTAAT-TC---TT-C--AC-TGTT-T-TTCG---TCT-TTTT-TC---TT-T-ATTT-CTT-----------G-TG-TGG---TA---T-A-C---C---AT-C-C----T--AC-C-----------------T--AA-CGTG-A-AAG-CG----CG--T--GT-T-A--C---T----------A-------T-TG-G---A----TCCC-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AA-CTC-GT-T---CCG-T-T-T-T-C--TA-TT-C-C-A-C-ATTCG--TA-----TA-TT----A-T-C-TT--A-T-C-TTTAATG-CCTG-TAAT--TCTT-CACTG-T-T-TTC-
gi|58885                      :                                                                                                                                                               TATC-T--TA-T--C-T-T-T--AAT-GCC-TGTAAT-TC---TT-C--AC-TG-T-T-T-CG---TC--TTTT-TC---TT-TA-TTT-CTT-----------G-T--TTG----A---T-A-C---C---AT-C-C----T--ACGC-----------------T--AA-CGTG-A-AAG--G----CG--T--GT-TCA--C---T----------A-------G-T--GG--A----T-CC-GCC-A--TT--TCT--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AA-CTC-GT-T---CCG-T-T-T-T-T--T--TT-C-C-A-C-ATTGGTATA-----TT-TG-ACAAGT-C-TT-CA-T-C-GTT--TG-TC-G-TAAG-ATCGT-C---A---T-TTC-TT--ACAA-GTTTCA---A---A-C-CC-TTA-AT-G-TTTTTA-A--TTGA-TGA-TAAGC-----ACA--GAC-AACCAA-G-CCAA-AAA--TCAAA--AT-ATTT---AACAA-ACA-------A-A--AATAAAACT-C-CGAGA-TCTC
gi|58886                      :                                                                                                                                                               TATC-T--TA-T--C-T-T-TTAAAT-GCC-TATAAT-TC---TTTC--AC-TG-T-TCTTCG---TCT-TCTT-TC---TTCT--TTT-CTTTT---------G-TG-TTGAAGTG---T-A-C---C---AT-C-C----T--AC-C-----------------T--AAACGTG-A-AAG-CGTGTGCG--T--GTGT-A--C---T----------A-------T-T--GGC-A----T-CC-GCC-A--TTGTTTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-G--T-AA-CTC-GT-T---CCG-T-T-TATGC--TA-TT-C-C-AAC-ATTCGT--A-----T--TG-ACAA-TTC-TT-CA-T-CTGTT--TG-TCTG-TAAG-ATCGTTC---A-T-C-TTC-TTTCACAA-G-TTCA--CA---AAC-CC-TT--AT-G-TTTTTA-A--TTGACTGACTAAGC-A---A-----GC-A--CAA-G-C--A-AA---TCAAAT-AT-ATTTG--AACAA-AC--------A-AGTAAT-AAACT-C-CGAGACTCTC
gi|58887                      :                                                                                                                                                               TATC-T--TA-T--CGT-T-T--AA--GCC-CGTA-T-CC---TT-CCCACCTG-T-T-T-CG---TCT-TTTTATC---TA-TA-----TTT-----------G-TG-CTG---TT---T-A-TTTAC---AT-CAC----T--AC-T-----------------T--AAACGTG-GGAAG-CG----TG--T--GT-TTG--C---T----------A-------T-T--CT--A----T-CCCGCC-A--TT--TC----TTC--AC-TC------TTGC-TT--GA-T-AAACTC-GT-T---CCA-T-TAT-T-C--TA-TT-C---A-C-ATTCGT-TACTAGGTA-TG-ACAA-T-C--T-CA-T-C-TTT--
gi|58888                      :                                                                                                                                                                                                TATT-TC---TC-A--AC-TG-T-T-TTCG---TC---TTT-TCG--TC-TATCTTGCTT-----------G-TG-TTG---TA---TCA-C---TCCTATAC-C----T--AC-CCAGCCACATGCGCTTTGT--AA-CGTG-A-AAG-GG----CG--TGGGT-T-G--G---T----------A-------TATG-G---A----T-TC-A-C-A--TT--TTC--TTTC--ACGTT------TCGCTTTT-GA-T--A-CTC-TT-C---CTGCT-T-T-T-C--TA-TT-C-C-A-CGATT
gi|58889                      :                                                                                                                                                                                                                             G---TCT-TTTT-TC---TT-TA-TTT-CTT-----------A-TG-TTG---TA---T-A-C---T---AC-C-C-------AC-CA----------------T--AA-CATG-A-AAG-CG----CG--T--GT-T-G--C---T----------A-------T-T--GG--A----T-CC-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AA-CTC-GT-T---CCA-T-T-T-T-C--TA-TT-C-C-A-C-ATTCGT--A-----TA-TG-ACAA-T-C-TT-CA-T-C-GTT--TG-TC-G-TAAG-TTCGA-C---G-T-T-TTC-TT--CCAA-G-TTCA--CA---A-C-CC-TT--AT-G-TTTTTA-A--CTGA-TGA-TAAGC-----ACA--GAC-AA-CAA-G-C--G-AAA--TCAAAT-CT-ATTTG--AACAA-AC--------A-A--ATT-AATCT-C-CGAGA-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcgaaaaat
gi|58890                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                ---AT-C-C----TGTAC-A-----------------T--AA-CGTG-T-AAG-CG----TG--C--GT-T-G--C---T----------AATCTGCAT-T--GG--A----T-CC-ACC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AA-CTC-GT-T---CCG-T-T-T-T-C--TA-TT-C-T-A-C-ATTCG--TA-----TA-TG-ACAA-T-C-TT-CG-T-C-GTT--TG-TC-A-CAAG-ATCGT-C---A-T-T-TTC-TT--CCAT-G-TTTA--CA---A-A-AC-TT--AT-C-CTTTTT-A--CTGA-TGA-TAAGC-A---
gi|58891                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tatttttagtgtctacaatatacgtaaaGTG-A-AAG-CG----CG--T--GT-T-A--C--------------A-------T-T--GG--A----T-CC-GCC-A--TT--T-C--TTTC--AC-TT-------CGC-TTT-GA-T-AA-TTC-GT-T---CCG-T-T-T---C--TA-TT-C-C-A-C-ATTCGT--A-----TA-TG-ACAA-T-C-TT-CA-TAC-G-T--TG-TC-G-TAAG-ATCGT-C---A-T-T-TTC-TT--ACAA-G-TTCA--CA---A-C-CC-TT--AT-G--TTTTA-A--TTGA-TGA-TAAGC-----ACA--GAC-AA-CAA-G-C--ACAAA--TAAAAT-AT-ATTTG--AACAA-ACA-------A-A--AAT-AAACT-C-CGAGA-TCTCctga
gi|58892                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ---T----------A-------T-T--G---G----A-TC-ACC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AA-C
gi|58893                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -CT-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGCTTTT-GA-T-AA-CTT-GT-T---CCG-T-T-T-TGC--TA-TT-C-CAA-C-ATTCG--TA-----TT-T-----A-T-C-TT--A-T-C-TTTAATG-CCTG-TAA
gi|58894                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         --AC-TT------TTGC-TTT-AA-T-AA-CTC-A--------G---T-T-T-G--TA-TT-A-C-A-C-ATTCG--TA-----CA-TG-AAAA-T-C-TT-CC-T-C-ATT--
gi|58895                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               C-G-TAAG-ATCGT-T---G-T-T-TTC-TT--CCAA-G-TTCA--CATTAA-C-CC-TT--AT-G-TTTTTA-A--CTGA-TGA-TAAGC-A----CA--GAC-AA-CAA-G-C--A-AAA--TCAAAT-CT-ATTTG--AACAA-AC--------A-A--AAT-AAACT-C-CGAGA-TCTC
gi|58896                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -A--CTGA-TGA-TAAGC-A----CA--GAC-AA-CAA-A-C--A-AAA--TTAAAT-TT-ATGTG--AA-AG-AT--------A-A--GAT-AAACC-C-CAAGA-TCT
gi|58897                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ccatgttggcgtagctcttgttT-ATTTG--AACAA-AC--------A-A--AAT-AAACT-C-CGAGA-TCTC

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                   22                                                                  11111111111111111                                         111111111111111111                                                                                                               111                                                                                                                                   22222                                                     11111111                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                   1 22  1 22 1 1 3333   1   3      3  444  3 22  3  1 1 1    222  55    1  444  1 11   1   22 1  1 88888888888 1 555  555 3 1 5555555  5 1 9999999  1 33333333333333333 44  3    1 1   1  6666  22 44  3 4  444 555555555555555555 3 1  66 22 1  1   1 22  44   22    22  1  444444    2   1  1 1  1   1  1 555   3 1 1 1 4 22  1  1 1 1 1 1     777 66666  1  1    1 1 1  1  1 3 1   77   1 7 1    2     2 66666 2 2   2  444   2 2    33  666 2 2  2  55  2 2      2 55    2   2     11111   33   2  2   2 2 33 2   55      55 2     22     2  22222222 2 33   2     4 2     2    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                   . ..  . .. . . ....   .   .      .  ...  . ..  .  . . .    ...  ..    .  ...  . ..   .   .. .  . ........... . ...  ... . . .......  . . .......  . ................. ..  .    . .   .  ....  .. ..  . .  ... .................. . .  .. .. .  .   . ..  ..   ..    ..  .  ......    .   .  . .  .   .  . ...   . . . . . ..  .  . . . . .     ... .....  .  .    . . .  .  . . .   ..   . . .    .     . ..... . .   .  ...   . .    ..  ... . .  .  ..  . .      . ..    .   .     .....   ..   .  .   . . .. .   ..      .. .     ..     .  ........ . ..   .     . .     .    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                   7 44  7 44 7 7 8888   7   5      3  666  3 33  3  7 7 7    999  99    7  666  7 33   7   44 7  7 33333333333 8 000  777 6 8 7777777  2 7 8888888  7 99999999999999999 11  5    7 7   7  5555  33 00  2 8  222 222222222222222222 1 5  77 11 5  5   5 00  11   00    00  4  111111    9   4  4 4  4   5  5 666   0 5 5 5 4 00  5  5 5 5 5 5     444 11111  7  7    7 7 8  8  8 6 8   55   9 6 9    1     1 88888 1 1   1  777   2 2    11  111 2 2  2  33  2 2      1 00    1   1     33333   11   2  2   2 2 11 2   33      44 1     99     2  55555555 2 11   2     4 2     4    
consensus                     :                                                                                                                                                               TATC-T--TA-T--C-T-T-T--AAT-GCC-CGTAAT-TC---TT-C--AC-TG-T-T-TTCG---TCC-TTTT-TC---TT-TAATTT-CTT--G-TG-T-----------T-G---TA---T-A-C---C---AT-C-C----T--AC-C-----------------T--AA-CGTG-A-AAG-CG----CG--T--GT-T-GC---T----------A-------T-T-GG--A--T-CC-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AA-CTC-GT-T---CCG-T-T-T-T-C--TA-TT-C-C-A-C-ATTCGT-TA-----TA-TG-ACAA-T-C-TT-CA-T-C-GTT--TGT-C-G-TAAG-ATCGT-C---G-T-T-TTC-TT--ACAA-G-TTCA--CA---A-C-CC-TT--AT-G-TTTTTA-A--TTGA-TGA-TAAGC-A---ACA--GAC-AA-CAA-G-C--A-AAA--TCAAAT-NT-ATTTG--AACAA-AC--------A-A--AAT-AAACT-C-CGAGA-TCTC
Reference ( family-606 )      :                                                                                                                                                               TATC-T--TA-T--C-T-T-T--AAT-GCC-CGTAAT-TC---TT-C--AC-TG-T-T-TTCG---TCC-TTTT-TC---TT-TAATTT-CTT--G-TG-T-----------T-G---TA---T-A-C---C---AT-C-C----T--AC-C-----------------T--AA-CGTG-A-AAG-CG----CG--T--GT-T-GC---T----------A-------T-T-GG--A--T-CC-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AA-CTC-GT-T---CCG-T-T-T-T-C--TA-TT-C-C-A-C-ATTCGT-TA-----TA-TG-ACAA-T-C-TT-CA-T-C-GTT--TGT-C-G-TAAG-ATCGT-C---G-T-T-TTC-TT--ACAA-G-TTCA--CA---A-C-CC-TT--AT-G-TTTTTA-A--TTGA-TGA-TAAGC-A---ACA--GAC-AA-CAA-G-C--A-AAA--TCAAAT-NT-ATTTG--AACAA-AC--------A-A--AAT-AAACT-C-CGAGA-TCTC
gi|58866                      :                                                                                                                                                               TATC-T--TA-T--C-TAT-T--AAT-GCC-TGTAAT-TC---TT-C--AC-TG-T-T-TTCG---T-C-TTTT-TC---TT-T-ATTT-CT-----TG-T-----------T-G----A---C-ATC---C---AT-T-T----T-----T-----------------T--A-----G-A-A----G----CG--T--GG-T-G----T----------AC------T-T-TG--A--T-CC--CC-A--TT--TTC---TTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AG-CT--GTGT---TCG-T-T-T-T-C--TA--T-C-C-A---AGTCG--TA-----TA-TT----A-T-C-TT--A-T-C-TTTAATGC-CTG-TAA
gi|58866                      :                                                                                                                                                            ttaTATC-T--TA-T--C-T-T-T--AAT-GCC-TGTAAT-TC---TT-C--AC-TG-T-T-TTttcttcactgtttttc
gi|58867                      : ttatatcttatctattaatgcctgtaattcttcactgttttcgtctttttctttatttcttgttgacatccattttttagaagcgtggtgtactttgatccccattttcttcactttcgctttgatagctgtgttcgttttctatccaagtcgtatatTATC-T--TA-T--C-T-T-T--AAT-GCC-TG-AAT-TC---T--C--AC-TG-T-T-TTCG---TCT-TTTT-TC---TT-T-ATTT-CTT--GCTG-T-----------T-G---TA---T-A-C---C---AT-C-C----T--AC-C-----------------T--AA-CGTG-A-AAG-CG----CG--T--GT-T-AC---T----------A-------T-T-GG--A--T-CC-TCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-TAAA-CTC-GT-T---CCG-T-T-T-T-C--TA-TT-C-C-A-C-ATTCGT-AT-----TA-TG-ACAA-T-C-TT-CG-T-C-GTT--TGT-C-GATAGA-ATCGT-C---A-T-T-TTC-TT--ACAA-G-TTCA--C----A-C-CC-TT--AT-G-TTTTTA-AT-TTGA-TGA-TAAGC-----ACA--GAT-AA-CAA-G-C--A-AAA--TCAAAT--T-ATTTG--AACAA-AC--------A-A--AAT-AAACT-C-CGAGA-TCTCtc
gi|58868                      :                                                                                                                                                            ttaTATC-T--TA-A--C-T-T-A--AAT-GCC-CGTAAT-TC---TT-C--AC-TG-T-T-TCCG---TCC-TTTT-TC---TT-TA-TTT-CTT--G-TG-T-----------T-G---TA---T-A-C---A---AT-C-C----TGTAC-A-----------------T--GA-CGTG-A-AAG-CG----TG--T--GT-A-GC---T------------------T-T-GG--A--T-CC-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-AA-T-GA-CTC-GT-T---CCG-T-T-T-T-C--TA-TT-T-C-A-C-ATTCGT-AA------A-TG-ACAA-T-C-TT-CA-T-C-GTT--TGT-C-G-TAAG-ATCAT-C---G-T-T-TTC-TT--CCAT-G-TTCA--CA---A-C-AC-TT--AT-G-TTTTTA-A--TTGA-TGA-TAAGC-----ACC--GAC-GA-CAA-G-C--A-AAA--TCAAAT-AT-ATTTG--AACTA-AC--------A-A--AAT-AAACTCC-CGAGA-TCTC
gi|58869                      :                                                                                                                                                            ttaTATC-T--TA-T--C-T-T-T--AAT-GCC-CGTAAT-TC---TT-C---C-TG-C-G-TTCG---TCT-TTTT-TT---CT-TTATTT-CTT--G-TG-T-----------T-G---TA---C-A-A---T---AT-C-C----T--AC-A-----------------T--AA-CGTG-A-AAG-CG----CG--TC-GT-T-AC---T----------A-------T-T-GG--A--T-CC-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AA-TTC-GT-C---TCG-T-T-T-T-C--TA-TTCC-C-A-C-AGTC---TA-----TA-TG-ACAA-T-CTTT-CA-T-C-GTT--TGT-C-G-TAAG-ATCGT-C---C-T-T-ATC-TT--ACAA-G--TCA--CA---A-C-CC-TT--AT-G---TTTA-A--TTGA-T-A-TAAGCAA---ACA--GAC-AA-CAA-GCC--A-AAA--TAAAAT-AT-ATTTG--AACAA-AC--------A-A--AAT-AAACT-C-CGAGA-TCTC
gi|58870                      :                                                                                                                                                              ttaTC-T--TA-T--C-T-T-T--AAT-GTC-CATAAT-TC---TT-C--AA-TG-T-T-TTCG---TCC-CTTT-TC---TT-TA-TTT-CTT--G-TG-T-----------T-G---TA---T-A-C---A---AT-C-C----TGTAC-A-----------------T--AA-CGTG-A-AAG-CG----CG--T--GT-T-GC---T----------AATCTGCAT-T-GG--A--T-CC-GCC-G--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AA-CTT-GT-T---CCG-T-T-T-T-C--TA-TT-C-C-A-C-ATTCG--TA-----TA-TG-ACAA-T-T-TT-CT-T-C-GTT--TGT-C-A-TAAG-ATCGT-C---G-T-T-TTC-TT--CCAT-G-TTTA--CA---A-C-AC-TT--AT-G-CTTTTT-A--CTGA-TGA-TAAGC-----ACA--GAC-GA-CAA-G-C--A-AAA--TCAAAT-CT-ATCTG--AACAA-AC--------A-A--AAT--AACT-C-CGAGA-TCTC
gi|58871                      :                                                                                                                                                           ttatTATC-T--TA-T--C-T-T-T--AAT-GCC-TGTAAT-TC---TTTC--AC-TG-T-T-T-CG---TCT-TTTT-TC---TT-TA-TTT-CTT--G-TG-T-----------TTG---TA---T-A-C---C---AT-C-C----T--AC-C-----------------TT-AA-CGTG-C---G-CG----CG--T--GT-T-AC---T----------A-------T-T-GG--A--T-CC-GCCTA--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TT--GA-T-AA-CTC-GT-T---CCG-T-T-T-T-C--TA-TT-C-C-A-C-ATTCGT--A-----TA-TG-ACAA-T-C-TT-CA-T-C-GTT--TGTTC-G-TAAG-ATCGT-C---A-T-T-TTCTTT--ACAA-G-TTCA--CA---A-C-CC-TT--AT-G-TTTTTA-A--TTGA-TG---AATC-A-----A--GACAAA-CAA-G-C--A-AAA--TCAAATAAT-ATTTGACAACAA-A---------A-A--AAT-AAACT-C-AGAGA-TCTC
gi|58872                      :                                                                                                                                                            tttTATC-T--TA-T--C-T-T-T--AAT-GCC-TGTAAT-TC---TT-C--AC-TG-T-T-TTCG---TCT-TTTT-TC---TT-TA-TTT-CTT--G-TG-TTGTCACAGTGTT-G---TA---T-A-C---C---TT-C-C----T--AC-C-----------------T--AA-CGTG-A-AAG-CG----CG--T--GT-T-AC---T----------A-------T-T-GG--A--T-CC-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AA-CT--GT-T---CCG-T-T-T-T-CTATA-TT-C-C-A-C-ATTCGT-
gi|58873                      :                                                                                                                                                            ttaTATC-T--TA-T--C-T-T-T--AAT-GCC-TGTAAT-TC---TT-C--AC-TG-T-T-TTCG---TCT-TTTT-TC---TT-TATTTT-CTT--G-TGTT-----------T-G---TA---T-A-C---C---AT-C-C----T--AC-C-----------------T--AA-CGTG-A-AAG-CG----CG--T--GT-T-AC---T----------A-------T-T-GGA-A--T-CC-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AA-CTC-GT-T---CCG---T-T-T-C--TA-TT-C-C-A-C-ATTCG--TA-----TA-TG-ACAA-T-C-TT-CA-T-C-G-T--TG--C-G-TAAG-ATCAT-C---ATT-T-TTC-TG--ACAA-G-TTCA--CA---A-C-CCATT--AT-G-TTTTTA-A--TTGA-TGA-T-AGC-----ACA--GAC-AG-CAA-G-C--A-AAA--T-AAAT-AC-AGTGG--AGCat
gi|58874                      :                                                                                                                                                              ttaTC-T--TA-T--C-T-T----AA---CC-CGTAAT-TCATCTT-C--AC-GT-T-T-TTCG---TTC-TTTT-TT---TT-TTATTT-CT---G-T--T-----------T-G---TA---T-A-C---T---ATTC-C----T--AC-A-----------------T--AA-CGTG-A-AAG-CG----CG--T--GT-T-GC---TC---------A-------G-T-GGGAA--T-CC-GCC-G--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT--A-T-AA-CTC-GT-TT--CCG-T-T-T-TTC--TA-TT-C-C-A-C-ATTCG--TA-----TATTG-ACAA-T-C-TT-CA-T-C-GTT--TGT-C---TAAG-ATCGT-C---T-T-T-TTC------CAA-G-TTCA--CAC--A-C-CC-TG--AT-G-TTTTTA-A--CTGA-T-A-TAAGC-----ACAATGAC-AA-CAA---C--A-AGA--TTAAAT-CT-A-TTG--AACAA-AC--------A-A--AAT-AATCA-C-CGAGA-
gi|58875                      :                                                                                                                                                        ttatattTATC-TATCA-T--C-T-T----AAT-GCC-TGTAATCTC---TC-A--ACATG-T-T-TTCG---TC---TTT-TC---TT-TA--TT-CTT--G-TG-T-----------T-GC--TACGTT-A-T---C---AT-C-TATATC--AC-C-----------------TTCAA-C-TG-A-AAGTCG----CGCTT--GT-TTAC---T----------A-------A-T-GG--A--A-TC-GCC-AATTT--CTC--TTTT--AC-GT------TCGC-TTTTGA-T-AA-CTC-GT-T---CCGTT-T-T-T-C--TATTT-C-C-A---ATGCG--TA-----T--TG-ACAG-T-C-TT-CATT-C-GTT--TGT-C-G-TAAG-ATCGT-C---A-T-T-TTC-TT--ACAA-G-TTAA--CA---A-C-CC-CTTGAT-GCTTTTTA-ATTTTGA-TG--TAAAC-ACGTACA--AAC-AA-T-G-G-C--A-AAC--TTAACC-TT-TTTGG--AACAATCC--------ATA--AAT--AACT-CTCGAGA-TC
gi|58876                      :                                                                                                                                                           ttagTATC-T--TA-T--C-T-T-T--AAT-GCC-TGTAAT-TC---TT-C--AC-TG-T-T-TTTG---TCC-TTTT-TC---TT-T-ATTT-CTT--G-TG-T-----------C-G---TA---T-A-C---C---AT-C-C-------AC-C-----------------T--AA-CGTG-A-AAG-CG----C---------------------------A-------T-T-GG--A--T-CC--CC-A--AT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AA-CTC-GT-TC--CCA-TAT-T-T-C--TG-T------A-C-ATTTA--TA-----TT-TT-ACAA-T-
gi|58877                      :                                                                                                                                                            ttaTATT-T--TA-T--C-T-C-A--AAT-GCC-CATAAT-TC---TT-T--AA-TG-T-T-TTCG---ACT-GTTT-CC---TT-T-ATTT-CT
gi|58877                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tta-T-GC--------------A-------T-T-GG--A--T-CC-ACC-A--TT--TTC--TTT---------------CGC-TTT-GA-T-AA-CTT-TT-T---CCG-T-T-T-T-C--TA-TT-C-C-A-C-ATTT-T-TG-----TA-TG-AAAA-T-C-TT-CA-T-C-ACT-------------------------G-T-T-TTC-TT--CCCATG-TACA--CA---A-C-GC-TT--CC-A-CTTTTT-A--TTGA-TGA-TAAGC-----ACT--GAC-AA-CAA-G-C--A-AAATCTCGCAT-TT-ATTTG--AA-AA-GC--------A-A------AAACTCC-CAAGA-TCcattgctaatctgcattggatccaccattttctttcgctttgataactttttccgttttctattccacatttttgtatgaaaatcttcatcactgttttcttcccatgtacacaacgcttccactttttattgatgataagcactgacaacaagcaaaatctcgcatttatttgaaaagcaaaaactcccaagatc
gi|58878                      :                                                                                         ttatattttatctcaaatgcccataattctttaatgttttcgactgtttcctttatttctcattgctaatcATC-T--TAAT--C-G-TAT--AAA-TCC-C--AATATC---TT-C--AA-TG-T-T-TTCG---TCCCTTTT-TC---AT-TTATTT-CTT--G-TG-T-----------T-G---TAAT-T-A-CA--C---AT-C-CTGT-T--AC-A-----------------T--AA-CGTGAA-AAG-CT----CG--T--GT-T-GC---TTTAATCCTGCA-------T-T-GGC-AGTT-CC-GCC-A--TTGGTTC--TTTTCAAC-TT------TTGC-TTT-GATT-AA-CTT-TT-G---TCG-T-T-T-T-C--TA-TT-C-C-A-C-ATTTGT-
gi|58879                      :                                                                                                                                                        ttatgaaTATT-T--CA-T--C-T-T-A--AAT-GTC-CATAAT-TC---TT-C--AA-T---------A---TCC-CTTT-TC---TT-T-ATTT-CTT--G-TG-T-----------A-A---TA---TAA-A---T---AT-T-A----T--GC-C--------------------AA-T------AAG-CGTTC-CT--T--ATCT-GCA--T----------G-------T-T--------T-CC-ACC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT----T-TG-CCCAGT-T-----G-T-C-T-T-C--TA-a
gi|58880                      :                                                                                                                                                            ttaTATCGT--TA-TGTC-T-T-T--AAT-GCCGTGTAAT-TC---TT-C--AC-TG-TGT-TTTG---TCC-TTTT-TC---TT-TGATTT-CTT--G-TG-T-----------
gi|58881                      :                                                                                                                                                            ttaTATC-T--TA-T--T-T-------AT-GCC-TGTAAT-TC---TT-C--AC-TG-T-T-TTT------C-TTTT-TT---TT---ATTT---T--G-TG-T-----------C-G---TA-----A-C---C---ATAC-C----T--AC-C-----------------T--AA--GTG-A-AAG-CG----T-------T-T-AC---T--------------------T-GG-------TC-GC--A--TT--TTC--TT-C--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AA-CTC-GT-T---CCG---T-T-T-C--TA-TT-C-C-A-C-ATTCG--TA-----TA-TG-ACAA-T-C-TT-CA-T-C-G-T--TGT-C-G-TAAG-ATCAT-C---A-----TTC-TT--ACAA-G--TCA--CA---A---CC-TT--AT-G-TTTTT--A--TTGA-TGA-TAA---A---GCA--G-C-AA-CAA-G-C----AAA--TCAAAT-ATAATATG--AACAA-AC--------A-A--AAT--AACT-C-CGA
gi|58882                      :                                                                                                                                                             taTATC-T---A-T--C-T-T-T--AATTGCCACG-ACT-TCC--TT-C--AC-TG-C-T-TCTGCGGTCT-TTTT-TCCCTTC-TGATTT-CTT--G-TG-T-----------T-G---TA---T-A-C---CT--AT-C-C----T--AC-C-----------------T--AA-CG-G-A------G----CG--T--GT-T-GTGCAT----------A-------TGTAGG--A--T-CC-GCC-A--TT--TTCAATTTC--AC-TTGCTCAATCGT-TGT-GA-T-AA-CTC-GT-TGTTCTG-T-T-T---C--TA-TT-CTC-A-C-ATTCGT-CAA----TA-TGTACAA-T-C-TTTCA-TGC-GTT--GCT-C-G-TAAGGATCGT-T---G-TGTATTC-TT--CCAA-G-TTCAATTA---A-CTCC-TT--ATCG-TTTCTA-A--CTGA-TGA-TAA-------ACA--GTC-AA-CAAAG-C--A-AAA--TCAAA--CT-ATTTG--AACAA-ACAATATTCAA-A--AAT-AAAGT-C-CGAGA-TCTC
gi|58883                      :                                                                                                                                                             taTATC-T--TA-T--C-T-T-T--AAT-GCC-TGTAAT-TC---TT-C--AC-TG-T-T-TTCG----CT-TTTT-TC---TT-TAATTT-CTT--G-TG-T-----------T-G---TA---T-A-C---C---AT-C-C----T--AC-C-----------------T--AA-CGTG-A-AAG-CG----CG--T--GT-T-AC---T----------A-------T-T--G--A--T-CC-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-CA-CTC-GT-T---CCG-T-T-T-T-C--TA--T-C-C-A-C-ATTCGT-TA-----TA-TG-A-AA-T-C-TT-CA-T-C-GTT--TGT-C-G-TAAG-ATCGT-C---A-T-T-TTC-TT--ACAA-G-TTCA--CA---A-C-CC-TT--AT-G-TTTTTACA--TTGA-TGA-TAAGC-A---ACA--GAC-AA-CAA-G-C--A-AAAC-TCAAAT-AT-ATTTG--AACAA-AC--------A-A--AAT-AAGCT-C-CGAGA-TCTC
gi|58884                      :                                                                                                                                                               TATC-T--TA-T--C-T-T-T--AAT-GCC-TGTAAT-TC---TT-C--AC-TGTT-T-TTCG---TCT-TTTT-TC---TT-T-ATTT-CTT--G-TG-T-----------G-G---TA---T-A-C---C---AT-C-C----T--AC-C-----------------T--AA-CGTG-A-AAG-CG----CG--T--GT-T-AC---T----------A-------T-T-GG--A--TCCC-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AA-CTC-GT-T---CCG-T-T-T-T-C--TA-TT-C-C-A-C-ATTCG--TA-----TA-TT----A-T-C-TT--A-T-C-TTTAATGC-CTG-TAAT--TCTT-CACTG-T-T-TTC-
gi|58885                      :                                                                                                                                                               TATC-T--TA-T--C-T-T-T--AAT-GCC-TGTAAT-TC---TT-C--AC-TG-T-T-T-CG---TC--TTTT-TC---TT-TA-TTT-CTT--G-T--T-----------T-G----A---T-A-C---C---AT-C-C----T--ACGC-----------------T--AA-CGTG-A-AAG--G----CG--T--GT-TCAC---T----------A-------G-T-GG--A--T-CC-GCC-A--TT--TCT--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AA-CTC-GT-T---CCG-T-T-T-T-T--T--TT-C-C-A-C-ATTGGTATA-----TT-TG-ACAAGT-C-TT-CA-T-C-GTT--TGT-C-G-TAAG-ATCGT-C---A---T-TTC-TT--ACAA-GTTTCA---A---A-C-CC-TTA-AT-G-TTTTTA-A--TTGA-TGA-TAAGC-----ACA--GAC-AACCAA-G-CCAA-AAA--TCAAA--AT-ATTT---AACAA-ACA-------A-A--AATAAAACT-C-CGAGA-TCTC
gi|58886                      :                                                                                                                                                               TATC-T--TA-T--C-T-T-TTAAAT-GCC-TATAAT-TC---TTTC--AC-TG-T-TCTTCG---TCT-TCTT-TC---TTCT--TTT-CTTTTG-TG-T-----------T-GAAGTG---T-A-C---C---AT-C-C----T--AC-C-----------------T--AAACGTG-A-AAG-CGTGTGCG--T--GTGT-AC---T----------A-------T-T-GGC-A--T-CC-GCC-A--TTGTTTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-G--T-AA-CTC-GT-T---CCG-T-T-TATGC--TA-TT-C-C-AAC-ATTCGT--A-----T--TG-ACAA-TTC-TT-CA-T-CTGTT--TGT-CTG-TAAG-ATCGTTC---A-T-C-TTC-TTTCACAA-G-TTCA--CA---AAC-CC-TT--AT-G-TTTTTA-A--TTGACTGACTAAGC-A---A-----GC-A--CAA-G-C--A-AA---TCAAAT-AT-ATTTG--AACAA-AC--------A-AGTAAT-AAACT-C-CGAGACTCTC
gi|58887                      :                                                                                                                                                               TATC-T--TA-T--CGT-T-T--AA--GCC-CGTA-T-CC---TT-CCCACCTG-T-T-T-CG---TCT-TTTTATC---TA-TA-----TTT--G-TG-C-----------T-G---TT---T-A-TTTAC---AT-CAC----T--AC-T-----------------T--AAACGTG-GGAAG-CG----TG--T--GT-TTGC---T----------A-------T-T-CT--A--T-CCCGCC-A--TT--TC----TTC--AC-TC------TTGC-TT--GA-T-AAACTC-GT-T---CCA-T-TAT-T-C--TA-TT-C---A-C-ATTCGT-TACTAGGTA-TG-ACAA-T-C--T-CA-T-C-TTT--
gi|58888                      :                                                                                                                                                                                                TATT-TC---TC-A--AC-TG-T-T-TTCG---TC---TTT-TCG--TC-TATCTTGCTT--G-TG-T-----------T-G---TA---TCA-C---TCCTATAC-C----T--AC-CCAGCCACATGCGCTTTGT--AA-CGTG-A-AAG-GG----CG--TGGGT-T-GG---T----------A-------TAT-GG--A--T-TC-A-C-A--TT--TTC--TTTC--ACGTT------TCGCTTTT-GA-T--A-CTC-TT-C---CTGCT-T-T-T-C--TA-TT-C-C-A-CGATT
gi|58889                      :                                                                                                                                                                                                                             G---TCT-TTTT-TC---TT-TA-TTT-CTT--A-TG-T-----------T-G---TA---T-A-C---T---AC-C-C-------AC-CA----------------T--AA-CATG-A-AAG-CG----CG--T--GT-T-GC---T----------A-------T-T-GG--A--T-CC-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AA-CTC-GT-T---CCA-T-T-T-T-C--TA-TT-C-C-A-C-ATTCG--TA-----TA-TG-ACAA-T-C-TT-CA-T-C-GTT--TGT-C-G-TAAG-TTCGA-C---G-T-T-TTC-TT--CCAA-G-TTCA--CA---A-C-CC-TT--AT-G-TTTTTA-A--CTGA-TGA-TAAGC-----ACA--GAC-AA-CAA-G-C--G-AAA--TCAAAT-CT-ATTTG--AACAA-AC--------A-A--ATT-AATCT-C-CGAGA-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcgaaaaat
gi|58890                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ---AT-C-C----TGTAC-A-----------------T--AA-CGTG-T-AAG-CG----TG--C--GT-T-GC---T----------AATCTGCAT-T-GG--A--T-CC-ACC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AA-CTC-GT-T---CCG-T-T-T-T-C--TA-TT-C-T-A-C-ATTCG--TA-----TA-TG-ACAA-T-C-TT-CG-T-C-GTT--TGT-C-A-CAAG-ATCGT-C---A-T-T-TTC-TT--CCAT-G-TTTA--CA---A-A-AC-TT--AT-C-CTTTTT-A--CTGA-TGA-TAAGC-A---
gi|58891                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tatttttagtgtctacaatatacgtaaaGTG-A-AAG-CG----CG--T--GT-T-AC--------------A-------T-T-GG--A--T-CC-GCC-A--TT--T-C--TTTC--AC-TT-------CGC-TTT-GA-T-AA-TTC-GT-T---CCG-T-T-T---C--TA-TT-C-C-A-C-ATTCGT--A-----TA-TG-ACAA-T-C-TT-CA-TAC-G-T--TGT-C-G-TAAG-ATCGT-C---A-T-T-TTC-TT--ACAA-G-TTCA--CA---A-C-CC-TT--AT-G--TTTTA-A--TTGA-TGA-TAAGC-----ACA--GAC-AA-CAA-G-C--ACAAA--TAAAAT-AT-ATTTG--AACAA-ACA-------A-A--AAT-AAACT-C-CGAGA-TCTCctga
gi|58892                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ---T----------A-------T-T-GG--A--T-C--ACC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGC-TTT-GA-T-AA-C
gi|58893                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -CT-GCC-A--TT--TTC--TTTC--AC-TT------TCGCTTTT-GA-T-AA-CTT-GT-T---CCG-T-T-T-TGC--TA-TT-C-CAA-C-ATTCG--TA-----TT-T-----A-T-C-TT--A-T-C-TTTAATGC-CTG-TAA
gi|58894                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       --AC-TT------TTGC-TTT-AA-T-AA-CTC-A--------G---T-T-T-G--TA-TT-A-C-A-C-ATTCG--TA-----CA-TG-AAAA-T-C-TT-CC-T-C-ATT--
gi|58895                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -C-G-TAAG-ATCGT-T---G-T-T-TTC-TT--CCAA-G-TTCA--CATTAA-C-CC-TT--AT-G-TTTTTA-A--CTGA-TGA-TAAGC-A----CA--GAC-AA-CAA-G-C--A-AAA--TCAAAT-CT-ATTTG--AACAA-AC--------A-A--AAT-AAACT-C-CGAGA-TCTC
gi|58896                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -A--CTGA-TGA-TAAGC-A----CA--GAC-AA-CAA-A-C--A-AAA--TTAAAT-TT-ATGTG--AA-AG-AT--------A-A--GAT-AAACC-C-CAAGA-TCT
gi|58897                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ccatgttggcgtagctcttgttT-ATTTG--AACAA-AC--------A-A--AAT-AAACT-C-CGAGA-TCTC