lowQualScore : 22222222222222222222222222222222
lowQualScore : 2 1 222 44444 333 33 2 1 44444444 1 1 33 1 1 1 11 11 1 33333 77777777777777777777777777777777 2 1 33 1 1 3333 1
lowQualScore : . . ... ..... ... .. . . ........ . . .. . . . .. .. . ..... ................................ . . .. . . .... .
lowQualScore : 2 5 666 55555 555 88 5 2 55555555 2 2 00 2 2 2 77 77 2 11111 22222222222222222222222222222222 5 2 00 2 2 9999 3
consensus : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---TN-TA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT-C-----TC----------------A------TA-G-T--C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
Reference ( gi|116489 ) : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---TA-TA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT-C-----TC----------------A------TA-G-A--C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGGT
gi|116490 : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---TA-TA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT-C-----TC----------------A------TA-G-T--C-AA-TG--A-A-CTA----
gi|116495 : AAGCTC-TTGTTATTTCTTATTTTTTG----A---TA-TA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT-C-----TCA---------------A------TA-G-T--CAAA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGGT
gi|116491 : AAG-TC-TTGTT---TCTTTTTTTTTTTCATA---TA-TA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT-C-----TC----------------A------AA-G-T--C-AA-TG--A-A-ATA----AGAT-AAAAGAT
gi|116496 : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---TA-TA-T-TCTGTATAGC-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT-T-----TT-----------------------TA-A-AT-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAG
gi|116492 : AAG-TC-TTGTT---C--TATTTTTC-----ACTATA-TA-T-T--------C-TTAC--A-TA-G-AA--A--TCAAT-C-----TC----------------A------TA-G-T--C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
gi|116494 : AAG-TC-TTTTT---TCCTATTTTTC-----A---TT-TA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT-C-----TC-----------------------TA-G-GT-C-AA-AG--A-A-ATA----AGAA-AAAAGAT
gi|116493 : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---TA-TA-T-T--------C-A-GA--A-TA-G-AA--A--TCAAT-C-----TC----------------A------TA-G-T--G-AA-TG--A-ATATA----AGAA-AAGA
gi|116497 : AAG-TCATTGTT---TCTTATTTTTC-----A---TA-TA-T-T--------CTT-GCA-A-TA-G-AA--G--TCAAT-C-----T-----------------G------TA-G-T--C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-t
gi|116498 : AAG-TC-T-GTT---TCTTATTTTTC-----A---TA-TA-TAT--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A---CAGTAT-----TT----------------A------TT-GTG--C-AA-TG--AGA-ATA----AGAG-AAAA
gi|116499 : AAG-T--TTGTT---TTTTATTTTTC-----A---TA-TA-T-T--------C-T-GC--ATTA-GTAA--A--TCAAT-T-----TCTAGGGGGGGGGGGGGTA------TA-GTT--C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAA
gi|116500 : AAG-TC-TTGTT---TCTTA--TTTC-----A---TAGTACT-T--------C-A-GG--A-TA-A-A-------CAAT-C-----TC----------------A------TA-GTT--C-AA-TGCAA-A-AGA----AGAG-
gi|116501 : AG-TC-TTGTT---TTTTATTTTCC---------TA-TA-C-T--------C-------A-TG-G-AA--A--TCAAT-C-----TC----------------A------TA-G-GT-C-AACTG--A-A-ATA----AGAG-GAGAGGT
gi|116502 : AG-TC-TTGTT----CTTATTTTTC---------TA-CA-T-T--------C-A-GCTAA-TA-G-AACCA--T-AAT-C-----TT----------------A------TA-G-T--C-AA-TGA-A-A-ATA----TGAG-AAA
gi|116503 : G-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---TT-TA-G-T--------C-T-GC--A-TA-G-AT--A--TCAAT-C-----TC----------------A------TA-T-T--C-CA-TG--A-A-ATA----AGAC-AAAAGATgat
gi|116504 : -TT-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---TT-TA-T-T--------C-T-GC--A-TACG-AT--A--TCAAT-C-----TC----------------A------TA-T-T--C-CA-TG--A-A-ATA----AGAACAAAAG
gi|116505 : -TT-TTGTT---TTTTTTTTTTT-----AA--TG-TT-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAAT-C-----TT----------------A------AA-A-T--C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
gi|116506 : -TC-TTTTT---TTTAAATTTTC-----A---TT-TA-T-T--------C-T-GC--A-AG-G-AA--A--TCAAT-C-----TC----------------A------AA-G-A--C-AA-TG--A-A-ATA----AGAA-
gi|116507 : -TT-TTGGT---TTTT-TTCTTC-----A---TG-TA-T-T--------C---GC--A-TG-G-AA--A--TCTAT-C-----T------------------------TA-A-AT-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAAG
gi|116508 : C-TTGTT---TCTTGTTTTTC-----A---TT-TA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT-C-----TT----------------A------GA-G-T--A-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAat
gi|116509 : C-TTGTT---TCTTACTTTTC-----A---TT-TA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAAT-C-----TT----------------A------AA-G-T--C-AA-TT--A-A-ATA----AGAG-GAAAGATtgat
gi|116510 : C-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---TT-TAAT-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TAAAT-T-----TT----------------A------AAAG-T--T-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGGT
gi|116512 : C-TTGTT---T-TTATTTTTC-----A---TT-TA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AG--A--TAAAT-T-----TT----------------A------AA-A-G--CTAA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGGT
gi|116511 : C-TTGTT---TCTTATTGTTC-----C---TT-TA-T-T--------C-T-AC--T-CA-G-AA--A--TCAAC-C-----TT----------------A------AA-G-T--C-AA-TG--A-A-ATATTATAGAG-AAAAGGT
gi|116513 : C-TTGTT---T---AATTTGT-----A---TA-TA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCTAT-C-----TT----------------A------AA-A-T--C-AA-TG--A-A-GTA----AGA
gi|116514 : -TTTTT---TTTTAATTTTC-----A---TG-TA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAAT-C-----TT----------------A------AA-A-T--C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
gi|116515 : -TCGTT---TTTTATTTA-C-----A---TT-CA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAAT-C-----TT----------------A------AA-A-T--C-AA-TG--A-A-ATAG---AGAG-AAAA
gi|116516 : TGTT---TCTTGATTTTT-----A---TT-TA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAAT-C-----TT----------------ACTTACTTA-A-AGTC-AA-TG--A-A-ATG----AGAG-AAAA
gi|116517 : CTTGTTTTTT-----A---TT-CA-T-T--------C-T-GC--A-TA-T-AA--ACATCAAT-C-----T-----------------A------TAAG-T--C-TA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAA
gi|116518 : ATGTTTC-----A---TA-TA-T-T--------C-T-G---A-TA-A-AA--A--TCAAT-CATAAATT----------------A------AA-G-T--C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGATaat
gi|116519 : TTTC-----A---TA-AA------------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT-C-----TTCA--------------A------TA-G-A--C-AA-GA--A-A-ATA----AGAG-AAAGG
gi|116520 : TC-----A---TA-TA-T-T--------C-A-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT-C-----TC----------------A------TA-A-T--C-AA-TG--A-A-ATA----TGAG-AAAAGAT
gi|116521 : -TA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAAT-C-----TT----------------A------AA-A-T--C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AATAGAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111
lowQualScore : 2 1 222 44444 333 22 2 1 44444444 1 1 22 1 1 1 11 11 1 33333 555555555555555555555555555 4 2 1 1 1 22 1 1 3333 2
lowQualScore : . . ... ..... ... .. . . ........ . . .. . . . .. .. . ..... ........................... . . . . . .. . . .... .
lowQualScore : 1 5 555 44444 444 77 4 2 44444444 2 2 99 2 2 2 77 77 2 00000 444444444444444444444444444 8 4 2 2 2 99 2 2 8888 6
consensus : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-NTA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT-C-----TC----------------AN--------A-G-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
Reference ( family-594 ) : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-NTA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT-C-----TC----------------AT--------A-G-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
gi|116489 : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-ATA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT-C-----TC----------------AT--------A-G-A-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGGT
gi|116490 : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-ATA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT-C-----TC----------------AT--------A-G-T-C-AA-TG--A-A-CTA----
gi|116491 : AAG-TC-TTGTT---TCTTTTTTTTTTTCATA---T-ATA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT-C-----TC----------------AA--------A-G-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAT-AAAAGAT
gi|116492 : AAG-TC-TTGTT---C--TATTTTTC-----ACTAT-ATA-T-T--------C-TTAC--A-TA-G-AA--A--TCAAT-C-----TC----------------AT--------A-G-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
gi|116493 : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-ATA-T-T--------C-A-GA--A-TA-G-AA--A--TCAAT-C-----TC----------------AT--------A-G-T-G-AA-TG--A-ATATA------AG-AAAAGAT
gi|116494 : AAG-TC-TTTTT---TCCTATTTTTC-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT-C-----TC-----------------T--------AGG-T-C-AA-AG--A-A-ATA----AGAA-AAAAGAT
gi|116495 : AAGCTC-TTGTTATTTCTTATTTTTTG----A---T-ATA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT-C-----TCA---------------AT--------A-G-T-CAAA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGGT
gi|116496 : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-ATA-T-TCTGTATAGC-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT-T-----TT----------------TA--------A-A-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAG
gi|116497 : AAG-TCATTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-ATA-T-T--------CTT-GCA-A-TA-G-AA--G--TCAAT-C-----T-----------------GT--------A-G-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-
gi|116498 : AAG-TC-T-GTT---TCTTATTTTTC-----A---T-ATA-TAT--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A---CAGTAT-----TT----------------AT--------T-G-TGC-AA-TG--AGA-ATA----AGAG-AAAA
gi|116499 : AAG-T--TTGTT---TTTTATTTTTC-----A---T-ATA-T-T--------C-T-GC--ATTA-GTAA--A--TCAAT-T-----TCTAGGGGGGGGGGGGGTAT--------A-GTT-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAA
gi|116500 : AAG-TC-TTGTT---TCTTA--TTTC-----A---TAGTACT-T--------C-A-GG--A-TA-A-A-------CAAT-C-----TC----------------AT--------A-GTT-C-AA-TGCAA-A-AGA----AGAG-
gi|116501 : AG-TC-TTGTT---TTTTATTTTCC------------TA-T-A--------C-T--C--A-TG-G-AA--A--TCAAT-C-----TC----------------AT--------AGG-T-C-AACTG--A-A-ATA----AGAG-GAGAGGT
gi|116502 : AG-TC-TTGTT----CTTATTTTTC---------T-ACA-T-T--------C-A-GCTAA-TA-G-AACCA--T-AAT-C-----TT----------------AT--------A-G-T-C-AA-TGA-A-A-ATA----TGAG--AAAGAT
gi|116503 : G-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-TTA-G-T--------C-T-GC--A-TA-G-AT--A--TCAAT-C-----TC----------------AT--------A-T-T-C-CA-TG--A-A-ATA----AGAC-AAAAGAT
gi|116504 : -TT-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-TACG-AT--A--TCAAT-C-----TC----------------AT--------A-T-T-C-CA-TG--A-A-ATA----AGAACAAAAG
gi|116505 : -TT-TTGTT---TTTTTTTTTTT-----AA--T-GTT-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAAT-C-----TT----------------AA--------A-A-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
gi|116506 : -TC-TTTTT---TTTAAATTTTC-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-AG-G-AA--A--TCAAT-C-----TC----------------AA--------A-G-A-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAA-
gi|116507 : -TT-TTGGT---TTTT-TTCTTC-----A---T-GTA-T-T--------C---GC--A-TG-G-AA--A--TCTAT-C-----TT----------------A---------A-A-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAGAAAAAGAT
gi|116508 : C-TTGTT---TCTTGTTTTTC-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT-C-----TT----------------AG--------A-G-T-A-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAATGAT
gi|116509 : C-TTGTT---TCTTACTTTTC-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAAT-C-----TT----------------AA--------A-G-T-C-AA-TT--A-A-ATA----AGAG-GAAAGAT
gi|116510 : C-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-TTAAT-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TAAAT-T-----TT----------------AA--------AAG-T-T-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGGT
gi|116511 : C-TTGTT---TCTTATTGTTC-----C---T-TTA-T-T--------C-T-AC--T-CA-G-AA--A--TCAAC-C-----TT----------------AA--------A-G-T-C-AA-TG--A-A-ATATTATAGAG-AAAAGGT
gi|116512 : C-TTGTT---T-TTATTTTTC-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AG--A--TAAAT-T-----TTA---------------AA--------A-G-C-T-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGGT
gi|116513 : C-TTGTT---T---AATTTGT-----A---T-ATA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCTAT-C-----TT----------------AA--------A-A-T-C-AA-TG--A-A-GTA----AGA
gi|116514 : -TTTTT---TTTTAATTTTC-----A---T-GTA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAAT-C-----TT----------------AA--------A-A-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
gi|116515 : -TCGTT---TTTTATTTA-C-----A---T-TCA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAAT-C-----TT----------------AA--------A-A-T-C-AA-TG--A-A-ATAG---AGAG-AAAA
gi|116516 : TGTT---TCTTGATTTTT-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAAT-C-----TT----------------ACTTACTTAAA-G-T-C-AA-TG--A-A-ATG----AGAG-AAAA
gi|116517 : CTTGTTTTTT-----A---T-TCA-T-T--------C-T-GC--A-TA-T-AA--ACATCAAT-C-----T-----------------AT--------AAG-T-C-TA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAAAT
gi|116518 : ATGTTTC-----A---T-ATA-T-T--------C-T-G---A-TA-A-AA--A--TCAAT-CATAAATT----------------AA--------A-G-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
gi|116519 : TTTC-----A---T-AAA------------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT-C-----TTCA--------------AT--------A-G-A-C-AA-GA--A-A-ATA----AGAG-AAAGG
gi|116520 : TC-----A---T-ATA-T-T--------C-A-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT-C-----TC----------------AT--------A-A-T-C-AA-TG--A-A-ATA----TGAG-AAAAGAT
gi|116521 : TA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAAT-C-----TT----------------AA--------A-A-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AATAGAT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111
lowQualScore : 2 1 222 44444 333 22 2 1 44444444 1 1 22 1 1 1 11 11 55555555 33333 22222222222222222 1 2 2 1 1 1 22 1 1 3333 2
lowQualScore : . . ... ..... ... .. . . ........ . . .. . . . .. .. ........ ..... ................. . . . . . . .. . . .... .
lowQualScore : 1 5 555 44444 444 77 4 2 44444444 2 2 99 2 2 2 77 77 66666666 00000 66666666666666666 0 4 4 2 2 2 99 2 2 8888 6
consensus : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-NTA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------ANA-G-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
Reference ( family-594 ) : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-NTA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------ANA-G-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
gi|116489 : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-ATA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------ATA-G-A-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGGT
gi|116490 : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-ATA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------ATA-G-T-C-AA-TG--A-A-CTA----
gi|116491 : AAG-TC-TTGTT---TCTTTTTTTTTTTCATA---T-ATA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------AAA-G-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAT-AAAAGAT
gi|116492 : AAG-TC-TTGTT---C--TATTTTTC-----ACTAT-ATA-T-T--------C-TTAC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------ATA-G-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
gi|116493 : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-ATA-T-T--------C-A-GA--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------ATA-G-T-G-AA-TG--A-ATATA------AG-AAAAGAT
gi|116494 : AAG-TC-TTTTT---TCCTATTTTTC-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------TAG-G-T-C-AA-AG--A-A-ATA----AGAA-AAAAGAT
gi|116495 : AAGCTC-TTGTTATTTCTTATTTTTTG----A---T-ATA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TCA---------------ATA-G-T-CAAA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGGT
gi|116496 : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-ATA-T-TCTGTATAGC-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------T-----TT----------------TAA-A-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAG
gi|116497 : AAG-TCATTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-ATA-T-T--------CTT-GCA-A-TA-G-AA--G--TCAAT--------C-----T-----------------GTA-G-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-
gi|116498 : AAG-TC-T-GTT---TCTTATTTTTC-----A---T-ATA-TAT--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A---CAGTA-------T-----TT----------------ATT-G-TGC-AA-TG--AGA-ATA----AGAG-AAAA
gi|116499 : AAG-T--TTGTT---TTTTATTTTTC-----A---T-ATA-T-T--------C-T-GC--ATTA-GTAA--A--TCAAT--------T-----TCTAGGGGGGGGGGGGGTATA-GTT-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAA
gi|116500 : AAG-TC-TTGTT---TCTTA--TTTC-----A---TAGTACT-T--------C-A-GG--A-TA-A-A-------CAAT--------C-----TC----------------ATA-GTT-C-AA-TGCAA-A-AGA----AGAG-
gi|116501 : AG-TC-TTGTT---TTTTATTTTCC------------TA-T-A--------C-T--C--A-TG-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------ATAGG-T-C-AACTG--A-A-ATA----AGAG-GAGAGGT
gi|116502 : AG-TC-TTGTT----CTTATTTTTC---------T-ACA-T-T--------C-A-GCTAA-TA-G-AACCA--T-AAT--------C-----TT----------------ATA-G-T-C-AA-TGA-A-A-ATA----TGAG--AAAGAT
gi|116503 : G-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-TTA-G-T--------C-T-GC--A-TA-G-AT--A--TCAAT--------C-----TC----------------ATA-T-T-C-CA-TG--A-A-ATA----AGAC-AAAAGAT
gi|116504 : -TT-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-TACG-AT--A--TCAAT--------C-----TC----------------ATA-T-T-C-CA-TG--A-A-ATA----AGAACAAAAG
gi|116505 : -TT-TTGTT---TTTTTTTTTTT-----AA--T-GTT-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAAT--------C-----TT----------------AAA-A-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
gi|116506 : -TC-TTTTT---TTTAAATTTTC-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-AG-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------AAA-G-A-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAA-
gi|116507 : -TT-TTGGT---TTTT-TTCTTC-----A---T-GTA-T-T--------C---GC--A-TG-G-AA--A--TCTAT--------C-----TT----------------AAA---T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAGAAAAAGAT
gi|116508 : C-TTGTT---TCTTGTTTTTC-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TT----------------AGA-G-T-A-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAATGAT
gi|116509 : C-TTGTT---TCTTACTTTTC-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAAT--------C-----TT----------------AAA-G-T-C-AA-TT--A-A-ATA----AGAG-GAAAGAT
gi|116510 : C-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-TTAAT-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TAAAT--------T-----TT----------------AAAAG-T-T-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGGT
gi|116511 : C-TTGTT---TCTTATTGTTC-----C---T-TTA-T-T--------C-T-AC--T-CA-G-AA--A--TCAAC--------C-----TT----------------AAA-G-T-C-AA-TG--A-A-ATATTATAGAG-AAAAGGT
gi|116512 : C-TTGTT---T-TTATTTTTC-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AG--A--TAAAT--------T-----TTA---------------AAA-G-C-T-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGGT
gi|116513 : C-TTGTT---T---AATTTGT-----A---T-ATA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCTAT--------C-----TT----------------AAA-A-T-C-AA-TG--A-A-GTA----AGA
gi|116514 : -TTTTT---TTTTAATTTTC-----A---T-GTA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAAT--------C-----TT----------------AAA-A-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
gi|116515 : -TCGTT---TTTTATTTA-C-----A---T-TCA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAAT--------C-----TT----------------AAA-A-T-C-AA-TG--A-A-ATAG---AGAG-AAAA
gi|116516 : TGTT---TCTTGATTTTT-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAATCTTACTTAC-----TT----------------AAA-G-T-C-AA-TG--A-A-ATG----AGAG-AAAA
gi|116517 : CTTGTTTTTT-----A---T-TCA-T-T--------C-T-GC--A-TA-T-AA--ACATCAAT--------C-----TA----------------TAA-G-T-C-TA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAAAT
gi|116518 : ATGTTTC-----A---T-ATA-T-T--------C-T-G---A-TA-A-AA--A--TCAAT--------CATAAATT----------------AAA-G-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
gi|116519 : TTTC-----A---T-AAA------------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TTCA--------------ATA-G-A-C-AA-GA--A-A-ATA----AGAG-AAAGG
gi|116520 : TC-----A---T-ATA-T-T--------C-A-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------ATA-A-T-C-AA-TG--A-A-ATA----TGAG-AAAAGAT
gi|116521 : TA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAAT--------C-----TT----------------AAA-A-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AATAGAT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111
lowQualScore : 2 1 222 44444 333 22 2 1 44444444 1 1 22 1 1 1 11 11 55555555 33333 22222222222222222 1 2 2 1 1 1 22 1 1 3333 2
lowQualScore : . . ... ..... ... .. . . ........ . . .. . . . .. .. ........ ..... ................. . . . . . . .. . . .... .
lowQualScore : 1 5 555 44444 444 77 4 2 44444444 2 2 99 2 2 2 77 77 66666666 00000 66666666666666666 0 4 4 2 2 2 99 2 2 8888 6
consensus : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-NTA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------ANA-G-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
Reference ( family-594 ) : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-NTA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------ANA-G-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
gi|116489 : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-ATA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------ATA-G-A-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGGT
gi|116490 : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-ATA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------ATA-G-T-C-AA-TG--A-A-CTA----
gi|116491 : AAG-TC-TTGTT---TCTTTTTTTTTTTCATA---T-ATA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------AAA-G-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAT-AAAAGAT
gi|116492 : AAG-TC-TTGTT---C--TATTTTTC-----ACTAT-ATA-T-T--------C-TTAC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------ATA-G-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
gi|116493 : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-ATA-T-T--------C-A-GA--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------ATA-G-T-G-AA-TG--A-ATATA------AG-AAAAGAT
gi|116494 : AAG-TC-TTTTT---TCCTATTTTTC-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------TAG-G-T-C-AA-AG--A-A-ATA----AGAA-AAAAGAT
gi|116495 : AAGCTC-TTGTTATTTCTTATTTTTTG----A---T-ATA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TCA---------------ATA-G-T-CAAA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGGT
gi|116496 : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-ATA-T-TCTGTATAGC-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------T-----TT----------------TAA-A-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAG
gi|116497 : AAG-TCATTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-ATA-T-T--------CTT-GCA-A-TA-G-AA--G--TCAAT--------C-----T-----------------GTA-G-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-
gi|116498 : AAG-TC-T-GTT---TCTTATTTTTC-----A---T-ATA-TAT--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A---CAGTA-------T-----TT----------------ATT-G-TGC-AA-TG--AGA-ATA----AGAG-AAAA
gi|116499 : AAG-T--TTGTT---TTTTATTTTTC-----A---T-ATA-T-T--------C-T-GC--ATTA-GTAA--A--TCAAT--------T-----TCTAGGGGGGGGGGGGGTATA-GTT-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAA
gi|116500 : AAG-TC-TTGTT---TCTTA--TTTC-----A---TAGTACT-T--------C-A-GG--A-TA-A-A-------CAAT--------C-----TC----------------ATA-GTT-C-AA-TGCAA-A-AGA----AGAG-
gi|116501 : AG-TC-TTGTT---TTTTATTTTCC------------TA-T-A--------C-T--C--A-TG-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------ATAGG-T-C-AACTG--A-A-ATA----AGAG-GAGAGGT
gi|116502 : AG-TC-TTGTT----CTTATTTTTC---------T-ACA-T-T--------C-A-GCTAA-TA-G-AACCA--T-AAT--------C-----TT----------------ATA-G-T-C-AA-TGA-A-A-ATA----TGAG--AAAGAT
gi|116503 : G-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-TTA-G-T--------C-T-GC--A-TA-G-AT--A--TCAAT--------C-----TC----------------ATA-T-T-C-CA-TG--A-A-ATA----AGAC-AAAAGAT
gi|116504 : -TT-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-TACG-AT--A--TCAAT--------C-----TC----------------ATA-T-T-C-CA-TG--A-A-ATA----AGAACAAAAG
gi|116505 : -TT-TTGTT---TTTTTTTTTTT-----AA--T-GTT-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAAT--------C-----TT----------------AAA-A-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
gi|116506 : -TC-TTTTT---TTTAAATTTTC-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-AG-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------AAA-G-A-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAA-
gi|116507 : -TT-TTGGT---TTTT-TTCTTC-----A---T-GTA-T-T--------C---GC--A-TG-G-AA--A--TCTAT--------C-----TT----------------AAA---T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAGAAAAAGAT
gi|116508 : C-TTGTT---TCTTGTTTTTC-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TT----------------AGA-G-T-A-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAATGAT
gi|116509 : C-TTGTT---TCTTACTTTTC-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAAT--------C-----TT----------------AAA-G-T-C-AA-TT--A-A-ATA----AGAG-GAAAGAT
gi|116510 : C-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-TTAAT-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TAAAT--------T-----TT----------------AAAAG-T-T-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGGT
gi|116511 : C-TTGTT---TCTTATTGTTC-----C---T-TTA-T-T--------C-T-AC--T-CA-G-AA--A--TCAAC--------C-----TT----------------AAA-G-T-C-AA-TG--A-A-ATATTATAGAG-AAAAGGT
gi|116512 : C-TTGTT---T-TTATTTTTC-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AG--A--TAAAT--------T-----TTA---------------AAA-G-C-T-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGGT
gi|116513 : C-TTGTT---T---AATTTGT-----A---T-ATA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCTAT--------C-----TT----------------AAA-A-T-C-AA-TG--A-A-GTA----AGA
gi|116514 : -TTTTT---TTTTAATTTTC-----A---T-GTA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAAT--------C-----TT----------------AAA-A-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
gi|116515 : -TCGTT---TTTTATTTA-C-----A---T-TCA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAAT--------C-----TT----------------AAA-A-T-C-AA-TG--A-A-ATAG---AGAG-AAAA
gi|116516 : TGTT---TCTTGATTTTT-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAATCTTACTTAC-----TT----------------AAA-G-T-C-AA-TG--A-A-ATG----AGAG-AAAA
gi|116517 : CTTGTTTTTT-----A---T-TCA-T-T--------C-T-GC--A-TA-T-AA--ACATCAAT--------C-----TA----------------TAA-G-T-C-TA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAAAT
gi|116518 : ATGTTTC-----A---T-ATA-T-T--------C-T-G---A-TA-A-AA--A--TCAAT--------CATAAATT----------------AAA-G-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
gi|116519 : TTTC-----A---T-AAA------------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TTCA--------------ATA-G-A-C-AA-GA--A-A-ATA----AGAG-AAAGG
gi|116520 : TC-----A---T-ATA-T-T--------C-A-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------ATA-A-T-C-AA-TG--A-A-ATA----TGAG-AAAAGAT
gi|116521 : TA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAAT--------C-----TT----------------AAA-A-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AATAGAT
blockSeqs : C A ATT TTCAT CTA AG C A CTGTATAG T T TA T C T CC CA CTTACTTA ATAAA CTAGGGGGGGGGGGGGT T G T G A C CA G T TTAT C
blockSeqs : . . . G A A A . . . . A . . . . . A . TCA A A T . . . A . . G A
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . CA T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . TA T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . C A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . . . C T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . C A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . C T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . C T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . C T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . . . C T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . . . . . . C T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . . . C A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . . . C A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . . . . . T G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . C T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-NTA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------ANA-G-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
finalCons : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-NTA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------ANA-G-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111
lowQualScore : 2 1 222 44444 333 22 2 1 44444444 1 1 22 1 1 1 11 11 55555555 33333 22222222222222222 1 2 2 1 1 1 22 1 1 3333 2
lowQualScore : . . ... ..... ... .. . . ........ . . .. . . . .. .. ........ ..... ................. . . . . . . .. . . .... .
lowQualScore : 1 5 555 44444 444 77 4 2 44444444 2 2 99 2 2 2 77 77 66666666 00000 66666666666666666 0 4 4 2 2 2 99 2 2 8888 6
consensus : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-NTA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------ANA-G-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
Reference ( family-594 ) : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-NTA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------ANA-G-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
gi|116489 : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-ATA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------ATA-G-A-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGGT
gi|116490 : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-ATA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------ATA-G-T-C-AA-TG--A-A-CTA----
gi|116491 : AAG-TC-TTGTT---TCTTTTTTTTTTTCATA---T-ATA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------AAA-G-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAT-AAAAGAT
gi|116492 : AAG-TC-TTGTT---C--TATTTTTC-----ACTAT-ATA-T-T--------C-TTAC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------ATA-G-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
gi|116493 : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-ATA-T-T--------C-A-GA--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------ATA-G-T-G-AA-TG--A-ATATA------AG-AAAAGAT
gi|116494 : AAG-TC-TTTTT---TCCTATTTTTC-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------TAG-G-T-C-AA-AG--A-A-ATA----AGAA-AAAAGAT
gi|116495 : AAGCTC-TTGTTATTTCTTATTTTTTG----A---T-ATA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TCA---------------ATA-G-T-CAAA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGGT
gi|116496 : AAG-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-ATA-T-TCTGTATAGC-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------T-----TT----------------TAA-A-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAG
gi|116497 : AAG-TCATTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-ATA-T-T--------CTT-GCA-A-TA-G-AA--G--TCAAT--------C-----T-----------------GTA-G-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-
gi|116498 : AAG-TC-T-GTT---TCTTATTTTTC-----A---T-ATA-TAT--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A---CAGTA-------T-----TT----------------ATT-G-TGC-AA-TG--AGA-ATA----AGAG-AAAA
gi|116499 : AAG-T--TTGTT---TTTTATTTTTC-----A---T-ATA-T-T--------C-T-GC--ATTA-GTAA--A--TCAAT--------T-----TCTAGGGGGGGGGGGGGTATA-GTT-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAA
gi|116500 : AAG-TC-TTGTT---TCTTA--TTTC-----A---TAGTACT-T--------C-A-GG--A-TA-A-A-------CAAT--------C-----TC----------------ATA-GTT-C-AA-TGCAA-A-AGA----AGAG-
gi|116501 : AG-TC-TTGTT---TTTTATTTTCC------------TA-T-A--------C-T--C--A-TG-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------ATAGG-T-C-AACTG--A-A-ATA----AGAG-GAGAGGT
gi|116502 : AG-TC-TTGTT----CTTATTTTTC---------T-ACA-T-T--------C-A-GCTAA-TA-G-AACCA--T-AAT--------C-----TT----------------ATA-G-T-C-AA-TGA-A-A-ATA----TGAG--AAAGAT
gi|116503 : G-TC-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-TTA-G-T--------C-T-GC--A-TA-G-AT--A--TCAAT--------C-----TC----------------ATA-T-T-C-CA-TG--A-A-ATA----AGAC-AAAAGAT
gi|116504 : -TT-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-TACG-AT--A--TCAAT--------C-----TC----------------ATA-T-T-C-CA-TG--A-A-ATA----AGAACAAAAG
gi|116505 : -TT-TTGTT---TTTTTTTTTTT-----AA--T-GTT-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAAT--------C-----TT----------------AAA-A-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
gi|116506 : -TC-TTTTT---TTTAAATTTTC-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-AG-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------AAA-G-A-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAA-
gi|116507 : -TT-TTGGT---TTTT-TTCTTC-----A---T-GTA-T-T--------C---GC--A-TG-G-AA--A--TCTAT--------C-----TT----------------AAA---T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAGAAAAAGAT
gi|116508 : C-TTGTT---TCTTGTTTTTC-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TT----------------AGA-G-T-A-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAATGAT
gi|116509 : C-TTGTT---TCTTACTTTTC-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAAT--------C-----TT----------------AAA-G-T-C-AA-TT--A-A-ATA----AGAG-GAAAGAT
gi|116510 : C-TTGTT---TCTTATTTTTC-----A---T-TTAAT-T--------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TAAAT--------T-----TT----------------AAAAG-T-T-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGGT
gi|116511 : C-TTGTT---TCTTATTGTTC-----C---T-TTA-T-T--------C-T-AC--T-CA-G-AA--A--TCAAC--------C-----TT----------------AAA-G-T-C-AA-TG--A-A-ATATTATAGAG-AAAAGGT
gi|116512 : C-TTGTT---T-TTATTTTTC-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AG--A--TAAAT--------T-----TTA---------------AAA-G-C-T-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGGT
gi|116513 : C-TTGTT---T---AATTTGT-----A---T-ATA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCTAT--------C-----TT----------------AAA-A-T-C-AA-TG--A-A-GTA----AGA
gi|116514 : -TTTTT---TTTTAATTTTC-----A---T-GTA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAAT--------C-----TT----------------AAA-A-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
gi|116515 : -TCGTT---TTTTATTTA-C-----A---T-TCA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAAT--------C-----TT----------------AAA-A-T-C-AA-TG--A-A-ATAG---AGAG-AAAA
gi|116516 : TGTT---TCTTGATTTTT-----A---T-TTA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAATCTTACTTAC-----TT----------------AAA-G-T-C-AA-TG--A-A-ATG----AGAG-AAAA
gi|116517 : CTTGTTTTTT-----A---T-TCA-T-T--------C-T-GC--A-TA-T-AA--ACATCAAT--------C-----TA----------------TAA-G-T-C-TA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAAAT
gi|116518 : ATGTTTC-----A---T-ATA-T-T--------C-T-G---A-TA-A-AA--A--TCAAT--------CATAAATT----------------AAA-G-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AAAAGAT
gi|116519 : TTTC-----A---T-AAA------------C-T-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TTCA--------------ATA-G-A-C-AA-GA--A-A-ATA----AGAG-AAAGG
gi|116520 : TC-----A---T-ATA-T-T--------C-A-GC--A-TA-G-AA--A--TCAAT--------C-----TC----------------ATA-A-T-C-AA-TG--A-A-ATA----TGAG-AAAAGAT
gi|116521 : TA-T-T--------C-T-GC--A-TG-G-AA--A--TCAAT--------C-----TT----------------AAA-A-T-C-AA-TG--A-A-ATA----AGAG-AATAGAT