lowQualScore                  :                                           111111111                        11111     222222222             11                                                                                                  11111111                                                                            11                                                               11111                                11                         44444444444444444444                                                                                                                                   111                                                   1                                    
lowQualScore                  :             1 1  222 22   1   44 3 1 1 22 222222222  44 1 7777777777  1    77777  1  666666666     66666 1 88   1  666666  33  3  3 1   555   55     1 22   3 3 1  3333  1 88888 1 444444   5   1  1 1   22  1 11111111 333  444 1  1 55 5555  1 5555 1  1  22  444 1 22  1   1  1  333   3333  1  22 22  333   66666666 1 55  1  1 1  8 1 333      44 22  1 1 1 1  11111    3    5555 8888888  22  1  1 99 1    333 1 777 4 1  1 1 66666666666666666666  1  22  333   1  444  3      33  6666    1     555 55  44444  22 444      888888   3    22 1 1  4 6666  1   22   1    444444 77   000 33 5555 666 55  5555 1 1  1   1 22 3333  5   22 3 6  1 1   44   4   3    22  22   2    
lowQualScore                  :             . .  ... ..   .   .. . . . .. .........  .. . ..........  .    .....  .  .........     ..... . ..   .  ......  ..  .  . .   ...   ..     . ..   . . .  ....  . ..... . ......   .   .  . .   ..  . ........ ...  ... .  . .. ....  . .... .  .  ..  ... . ..  .   .  .  ...   ....  .  .. ..  ...   ........ . ..  .  . .  . . ...      .. ..  . . . .  .....    .    .... .......  ..  .  . .. .    ... . ... . .  . . ....................  .  ..  ...   .  ...  .      ..  ....    .     ... ..  .....  .. ...      ......   .    .. . .  . ....  .   ..   .    ...... ..   ... .. .... ... ..  .... . .  .   . .. ....  .   .. . .  . .   ..   .   .    ..  ..   .    
lowQualScore                  :             7 7  999 33   7   00 3 7 7 33 999999999  00 7 3333333333  7    33333  7  000000000     11111 7 11   7  555555  22  3  3 7   222   66     7 33   3 3 7  5555  7 88888 7 777777   0   7  7 7   33  7 44444444 222  444 7  7 66 4444  7 2222 7  7  33  444 6 22  7   7  7  000   7777  7  77 44  000   33333333 7 99  7  7 7  9 8 222      33 55  8 8 8 8  00000    6    0000 5555555  55  8  8 44 7    000 7 000 9 7  7 7 99999999999999999999  7  44  000   7  888  5      88  6666    6     000 44  00000  22 111      666666   2    22 6 7  1 9999  6   22   6    666666 88   666 88 6666 000 44  6666 6 6  6   7 33 5555  0   33 3 0  7 7   88   6   8    88  77   0    
consensus                     : AATTATAGTGGT-C-AA---G--GAA-AAA--C-A-A-T--T-------C-TG--T-G----------TA-AAAG-AN-TTT-AA---TTTT-CAAACA-----T-TT-CTA-CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACCA-T--TGC-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TGA-TGA-CA-A-AAT--GT-T--AN----A-G-AG-A-C-GA-C-AT----AT-G----G-AT-GT--AC---A-G-CAG-GGC-GG-TC---GTG----CC-AT-NA--AG---ATG--------C-T--TC-AA-A-TGGA-T---ATGCTC--C--AA-C-G-T-CANG---TGGC-GTGA-T--G-G-----TT--TA-AC-GTTA-GTGA---A-A-C-CGT-AA-T-T---A-A---NAGGT------TA-TG--GG---AAA-GG---TT-CCAGAA--CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--GAAGACC-T-CG-TAG-TGGC--A-A-GCTC----AG-AAG--AAT-GACA------G-CTCA-T-G--G----G---G--TC---NT-A-AA-ATA-G--T----GC-TTT--T-GGCA-A-AAC--GCANTCG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
Reference ( gi|110123 )       : AATTATAGTGGT-C-AA---G--GAA-AAA--C-A-A-T--T-------T-TG--T-G----------TA-AAAG-AC-GTT-AA---CTCT-AAAACA-----T-TG-CTA-CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACCA-T--TGC-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TGA-TGA-CA-A-AAT--GT-T--AC----A-A-AG-A-C-GA-C-AT----AT-G----G-AT-GT--AC---A-G-CAG-GGC-GG-TC---GTG----CC-AT-CA--AG---ATG--------C-T--TC-AA-A-TGCA-T---ATGCTC--C--AA-C-G-T-CACG---TGGC-GTGA-T--G-G-----TT--TA-AC-GCAA-GTGA---A-A-C-CAT-AA-T-T---A-A---TTGGC------TA-TG--GG---AAA-GG---TT-CCAGAA--CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--AAAGACC-C-CC-TAG-TGGC--A-A-GCTC----AG-AAG--AAT-GACA------G-TTCA-T-G--G----G---G--TC---AT-A-AA-ATA-G--T----GC-TTT--T-GCCA-A-AAC--GCATTTG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110124                     : AATTATAGTTGT-G-AA---G--GAA-AAA--C-A-A-T--T-------C-TG--T-G----------TA-AAGG-AC-TTT-AA---TTTT-CAAACA-----T-TG-CTA-CA------GAG-TT-CT-G-AAA---TTT--GACCA-T--TGC-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TGA-TGA-TA-A-AAT--GT-T--TC----A-G-AG-A-C-AA-C-AT----AT-G----G-GT-GT--AC---A-G-GAG-GGC-GG-TC---GTG----CC-AT-CA--AG---ATG--------C-T--TC-AA-A-TGCA-T---TAGCTC--C--TA-A-G-T-CACG---TAGC-GTGG-T--G-G-----TT--TA-AC-GCCA-GTGA---A-A-T-CAT-AA-T-C---A-A---AAGGT------TA-TG--GG---AAA-GG---TT-CCAGAA--CA----CAGG-AAGGG---T--GC-----AA--C--AAAGACC-T-CC-TAG-TGGC--A-A-GCTC----AG-TAG--AAT-GACA------G-CTCA-T-G--G----G---GA-TC---AT-A-AA-AAA-G--T----GC-TTT--T-GACA-A-AAC--GAAATTG-GTTA--AT-CTCT-GCTG
gi|110128                     : AATTATAGTGGT-C-AA---G--GAA-AAA--C-A-A-T--T-------C-TA--T-G----------TA-AAA----------A---C-------ACA-----T-TT-CTA-CA------GAA-TT-TT-G-AAA---TTT--GACCA-T--TGC-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TGA-TGA-CA-A-AAT--GT-T--AC----A-G-AG-A-C-GG-C-AT----AT-G----G-AT-AT--AC---A-G-AAG-GAG-AG-TC---GTG----CC-AT-CA--AG---ATG--------C-T--TC-AA-A-TTCA-T---ATGCTC--C--AA-C-G-T-CACA---TGGC-GTGA-T--G-G-----AT--TA-AC-GTCA-GTGA---A-A-T-CGT-AA-T-G---A-A---AAGGT------TA-TG--GG---AAA-AA---TT-CCAGAA--CA----AAGG-GAAGG---T--GC-----AG--C--AAAGACC-T-CC-TAG-TGGC--A-A-GCTC----AG-AAG--AAT-GACA------A-CCCA-TGG--G----G---G--TA---AT-A-AA-ATA-G--T----GC-TTT--T-GGCA-G-AAC--GCATTTG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110125                     : AATTATTGTGGT-C-AA---G--GAA-AAG--A-A-A-T--C-------T-GT--T-G----------TA-AAAT-AT-TTT-AA---TTGT-CAAACA-----A-TT-CTA-CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACCA-T--TGC-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TAA-TGC-CA-A-AAT--GT-T--AA----T-G-AG-A-C-GA-C-AG----AT-A----G-AT-GT--AC---A-G-GAA-GGC-GG-TC---GTG----CC-AT-CA--AG---ATG--------C-T--TC-AA-A-TGCA-T---ATGCTC--T--AA-C-G-T-CACG---TGGC-GTGA-T--G-G-----CT--TA-AT-GTCA-ATGA---A-A-T-CAT-AA-T-T---A-A---AAGGTTACATGTA-TG--GG---AAA-GG---TT-CCAGAA---A----CAGG-AAGGG---T--GC-----AA--C--AAAGACC-T-CC-TAG-TGAC--A-A-GCTC----AG-AAG--AAT-GACA------G-CTCA-T-GA-G----G---G--TC---AT-A-AA-ATA-G--T----GC-TTT--T-GGCA-A-AAC--GCATTTG-GTTC--AT-TTCT-GCTG
gi|110126                     : AATTATAGTGGT-C-CA---G--GAA-AGA--T-A-A-T--T-------C-TG--T-G----------TA-AAAG-AT-TTT-AA---TTTT-CAAACA-----C-TT-TTA-CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACCT-T--TGC-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TGA-TGA-CA-A-AAT--GT-T--AC----A-G-AG-G-C-GA-C-AT----AT-G----G-AT-GT--AC---A-G-CAG-AGC-GG-TA---GTA----CC-AT-CA--AG---ATT--------C-T--TC-AA-A-TGCA-T---ATGCTC--C--AA-C-G-T-CACG---CGGC-GTGG-T--G-G-----TT--TA-AC-CTCA-GCGA---A-A-T-CGT-AA-T-T---A-A---AAGGT------TA-TG--GG---AAA-GG---TT-CCTCAA--CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--AAAGACC-T-CC-TAG-TTGC--ACA-GCTC----AT-AAC--AAT-GACA------G-CTCA-TCG--G----G---G--TA---AT-A-AA-ATA-G--T----GC-TTT--T-GGCA-A-AAC--AAAATCC-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110127                     : AATTTTAGTGGT-C-AA---G--AAA-AAA--C-A-A-T--T-------T-TG--T-G----------TA-ATAG-AC-ATT-CA---TTTT-CAAGCA-----T-TG-CTA-CA------GAG-TT-TT-T-AAA---TTT--GATCA-T--TGC-T-G-AC----AT-T-----G-A--C---TGA-TGA-CA-A-AAT--GT-T--AC----A-C-AT-A-C-GA-C-AT----AT-G----T-AT-GT--AC---A-A-CAG-GGC-GG-TC---GTC----CC-AT-CA--AG---ATG--------C-T--TC-AA-A-TGGA-T---ATGTTC--C--AA-C-G-T-CACG---TGGC-GTTA-T--G-G-----TT--TA-AC-GTCA-TTGA---A-A-T-CGT-AAGTAT---A-A-----GGT------TA-TG--GG---AAA-GG---TTCCCAGAT--CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--AAGGACC-T-CC-TAG-TGGC--A-A-ACTC----AG-AAG--AAT-GACA------G-CTCATT-G--G----G---G--TC---AT-A-AA-ATA-G--T----GC-TTT--T-AGCT-A-AAC--AAAATCG-ATTA--AT-CTCT-GCTG
gi|110129                     :   TTATGGTAGT-C-GA---G--GAA-AAT--T-A-A-T--T-------C-TG--T-G----------TA-AAAG-AG-TTT-AA---TTTT-CAAACA-----T-TT-CTA-CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GAACA-T--TAC-T-G-AC----CT-T-----G-A--T---TGA-TAA-CA-A-AAT--GT-T--GA----A-A-AT-A-C-GA-C-TT----AT-T----G-AT-GT--AC---A-G-TAG-AGC-GG-TC---ATG----CC-AT-AA--AG---ATG--------C-T--TC-AA-A-TGGA-T---ATGCGC--C--AA-C-G-T-CAGG---TAGC-GTGA-T--G-A-----TT--TA-AC-ATTA-GTAA---A-A-C-CGT-AA-T-TTA-G-A---T--GT------TA-TG--GG---AAA-GG---TT-C-------------CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--GATGACC-T-CG-TAG-TGGC--A-A-TCGC----AG-AAG--AAT-GACA------G-CTCATT-G--G----G---G--TC---CT-A-AA-
gi|110130                     :   TTATAGTGGT-C-AA---G--GAA-AAA--C-A-A-CAAT-------T-CG--C-G----------TA-AAAT-AC-TTT-AA---TTTT-CAAATA-----T-TT-CTA-CA------TAG-TT-TT-GAAAA---TTT--GACTA-T--TGC-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TGA-TAA-CA-A-AAA--AT-T--AC----A-G-AG-A-T-GA-C-ATG---AT-G----GAAT-GT--AC---A-G-C-T-GGC-GG-TC---GTG----TC-AT-TA--AT---A-A--------C-T--TC-AA-A-TGTA-T---ATGCTCTGC--AA-C-A-T-CACA---GGGT-GTGA-T--G-C-----CT--TA-AC-GTTA-GTGG---A-A-A-TGTAAA-T-G---A-A---AAGTT------TATTG--GG---AAA-GG---TT-CCGGAA--CAC---CAGG-GAGGG---T--CC-----AT--CA-AAAGACC-T-CC-TAT-TGGC--A-A-GCTTA---AG-AAG--AAT-GACA------G-CTCA-TCG--G----A---C--TC---AT-A-AG-ATA-G--T----GTGTTT--T-G-CA-A-AACGAGCAATCGTTTTT--AT-CTCT-
gi|110131                     :   TTATGGTGGT-C-AA---G--GAC-AAT--C-A-A-T--T-------C-TG--T-G----------TA-AAAG-AC-ATT-CA---TTTT-CAAACA-----T-TC-CTA-TA------GAA-TT-TT-G-AAA---CTT--GATCA-T--TGT-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TGG-TGA-CA-A-AAT--GT-T--AT----A-G-AG---C-GA-C-AT----AA-T----G-ATAGT--AC---A-A-CAG-AGC-GGTTT---GTG----CC-AT--A--AG---ATG--------C-T--TC-AA-A-TGGA-T---ATGCTC--C--AA-T-GTT-CAGT---TGGC-GT-A-G--G-G-----CT-----AC-GTTA-GTGA---A-A---CGT-AA-T-T---G-A---AAAGT------TC-TT--GG---AAA-GGT--TT-CCAGAA--CAG---CAGG-GAGGG---T--G------GA--C----GGACC-T-CG-AAG-TG----A-A-GCTC----AG-A----AAT-GGAA------G-CTCA-T-G--G----G---GGACC---A--A-AC-A-A-G--T----GCTTTT--T-GACC-A-AAC--ACATTT--GTTCATAT-CTCT-
gi|110132                     :   TTATGGTGGA-C-AA-----------AT--C-A-A-T--T-------T-TG--T-T----------TA-AAAG-AC-TTT-AAAATTTTC-AAAACA-----T-TT-CTA-CA------GAA-TT-TT-G-AAA---TTT--GGC-A-T--TGC-TTG-AC----CT-------G-A------TGA-TGA----A-CAT--GT-T--AC----A-G-AG-AAC-GA-CCAT----AT-G----G-AT-GC--AC---AAG-CAG-G-C-G--TC---GTA----CC-AT-AG--AG---ATG--------C-T--TC-AA-A-TGGA-C----TGCTC--C--AAAT-G-T-CA-GAGCTGGC-ATGA-A--G-G-----CT--TA-GC-TTTA-GTGA---A-A-A-CGT-AA-T-T---T-A---GAGGT------TA-TG--GG---AAA-GG---TTTCCAAGA--CA----CAAG-AAGGG---T--GG-----AA--C--AAAGACC-C-TCGTAGTTGGC--A-G-G--C----AGAAAG--GTT-GGCA------G-CTCA-G-G--G----G---T--TC---CTAA-AA-ATA-G--T----GC-TTT--T-GGCA-A-ACC--G--TTTG-GTTC--ATACTCT-
gi|110133                     :   TTATGGTGGT-C-AA---A--GGA-AAA--C-A-AAT--T-------C-TG--T-G----------TA-AAAG-AG-GTT----------------------T-T------CA------GA---T-TT-C-AAA-----------CA-T--GGAGT-G-AC----CT-T-----G-A------TGA-TGA-CA-A-AAT--GT-TT-AC----A-G-AG-A-C-GATC-AT----AT-G------AT-GT--AC---A-G-CAG-ATC-G--TC---GTG----CT-AT--ATTAG---ATG--------C-T--TC-AA-A-TGGA-T---ATG-------------G-C-C---------T-GTGA-G--G-A-----TT--AA-AC-GTTA-GTAA---A-A-C-CGT-AA-T-TT--A-G---GAGGT------TA-TG--GG---AA--GG---TT-CCAGAA--CA----CAGG-GAGGGGC-T--GC-----AG--C--GAATA-C-T-TT-GAG-TGG---A-A-TCGC----AG-AAG--AAT-GGCA------G-CTTACT-G--G----GC--G--TC---CT-GTAA-ATG-G--T----GC-TTT--TGGGCA-A-AAC--GCAATCG-GTTG--AT--TCT-ACCG
gi|110134                     :   TTATGGCGGT-C-AA---G--GAA-AAA------A-T--T-------C-GA--TCG----------TA-AAAA----GTT-AAGGTTTCC-AAA-CA-----T-TT-CTA-CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACCA-T--TACGT-G-A-----CT-T-----G-A--T---TGA-TAA-CA-A-AAT--GT-TTGAA----A-A-GG-A-C-
gi|110135                     :   TTATGGTGGT-C-AA---G--GAA-AAA--C-A-A-T--T-------C-TG--T-G----------TA-AAAG-AG-TTT-AA---TTTT-CAA
gi|110136                     :    TATAGTGGT-C-AG---G--AAA-AAA--CCA-A-T--T-------C-CGCTT-A----------TA-AAAATACTGTT-AA---TTTT-CAAATAG----T-TT-CTA-CA------TAG-TT-TTTG-AAA---TTT--GACAA-T--TG--T-G-AC----CT-TA----G-A--C---TGACTGA-CA-A-ATT--TT-TTCAC----A-A-AG-ATC-GA-C-AT----AT-GC---G-AT-GT--GC---A-G-CAT-GGT-GG-TC---GT------C-AT-CA--AT---ATG--------C-TCTTC-AATA-TGCACT---ATGCTC--C--AA-G-G-T-CACG---TTGC-GTGATT--G-G-----CC--TA-AC-ATTC-GTGA---A-A-T-CGT-TA-T-T---A-AAAGTT--T------TA-TGGCGG---AAAGGG---TT-CCGGAA--CA----CA-G-GAGGG---T--CC-----AT--CCAAAAGACCTC-TC-TAT-TGGC--A-T-GAAT----AG-AAG--AAT-GACA--------TTCATT-GACG----G---G--TC---AT-A-AA-A-A-G--T----GG-TTT--TGGCAA-A-AACGAGAATACGTGTTC--AT-ATCT-GCTG
gi|110137                     :      TAGTGGT-CAAA---G--GAA-AAA--C-A-G----T-------T-AG--T-A----------TA-AAAG-A--G-T-AA----TTT-CAAACA-----T-TT-CTA-CAGAAAGTGAA-TTATT-G-AAA---TTT--
gi|110138                     :       AGTGGT-C-A----G--GAA-AAA--C-A-A-T--TG------C-TG--T-G----------TA-AAAG-A--GTT-AA---TTTT-CAAACA-----T-TTTCTA-CAA-----GAA-TT-TT-G-AAAAT-TTT--GACCA-T--TAC-T-G-AC----CT-T-----GTA--T---TGA-TAA-CA-A-AAT--GT-T--GG----A-A-AG-A-T-GA-C-TT----AT-G----G-AT-GT--AC---A-G-TAG-AGC-GG-TC---GTG----CC-AT-AA--AG---ATG--------C-T--TC-AA-A-TGAA-T---ATGCGC--T--AA-C-G-T-CAGG---AGGC-GTGA-T--G-A-----TT--TA-AC-GTTA-GTAA---A-AAC-CGT-AA-T-T---T-A---GAGGT------TA-TG--GG---AAA-GG---TT-CCAGAA--CA----CAGG-GAAGG---T--GC-----AA--C--GAAGATA-T-CG-TAG-TGGC--T-A-TCGC----AG-AAG--AAT-GACA------G-CTCA-T-G--G----G---G--TC---TT-A-AA-ATG-G--T----GA-TTT--T-GGCA-A-AAT--GCAATCG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110139                     :       AGTGGT-C-AA---G--GAA-AAA--C-A-A-T--TAAACAATTATG--T-G----------TA-AAAA----GTT-AA---TTTTTCAAACA-----T-TT-CTA-CA------TAA-TT-TT-G-AAA---TTT--GACCA-T--TGT-T-G-AC----CT-T-----A-A--C---TGA-TGA-CA-A-AAT--GT-T--AC----A-G-AG---C-GA-C-TT----AT-G----G-AC-GT--AC---A-G-CAG-AGC-GG-TT---GT-----CC-AT-AA--AG---A-G--------C-T---C-AA-A-TG-A-T----TGCTC--C--AT-C-G-T-CAAG---TG-C-GTGA-T--G-G-----TT--TA-AC-GTTA-GTGA---A-A-C-CGT-AA-T-TG--A-A-----AGT------TA-TG--G----AAA-GG---TT-CCAGAA--CA----TAAG-GAGGG---T--GC-----AA--C--AAAGACC-T-CG-TAG-T-GC--A-A-GCTA----AG-AAG--AATCAACA------G-CTCA-A-T--G----G---G--TC---CT-A-AA-ATA-G--T----GC-TAT--T-GGCA-A-AAC--GCATTT--GTTC--AC-CTTT-GCTG
gi|110140                     :       AGTGGT-C-AA---G--GAA-AAA--C-C-A-T--TA------T-GG--T-G----------TA-AA-G-AG-TTT-AT---TTTT-CAAACA-----T-TT-CTA-CA------GAA-TT-TT-G-AAA---TTTT-GACCA-T--TAC-T-G-A------T-T-----G-A--T---TGA-TAA-CA-A-A-T--GT-T--GA----A-A-AG---C--A-C-TT----AT-A----G-AT-GT--AC---A-G-TAG-AGC-GG-TA---GTG----TC-AT-AA--AG---ATG--------C-TG-TC-AA-A-TGGA-T---ATGGCG--C--AA-CAG-T-CAGG---TGGC-GTGA-T--G-A-----TT--TA-AC-GTAA-GT-A---A-A-C-CGT-AA-T-T---AGA-----GGT------TA-TA--GG---AAA-GG---TT-GCAGAA--CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--GAAGA-C-T-CG-TAG-TGGC--A-A-TCGC----AG-AAG--AAT-GACA------G-CTCA-TCG--G----G---G--T-----T-A-AA-ATG-G--T----GC-TTT--T-GGC--A-AAT--GAAATC--GTTC--AT--TCT-GCTG
gi|110141                     :        GTGGT-C-AA---A--GAA-AAA--TTA-A-T-------------G--T-G----------TACAAAG-AG-TTT-AT---TTTT-CAAACA-----T-T--CTA-CA------GA--TT-TT-G-AAA---TTTT-GACCA-T--TAC-T-G-AC----CT-T-----G-A--T---TGA-TAA--A-C-AAT--GT-T--GA----A-A-AG-A-C-GA-C-TT----AT-G----G-AT-GC--AC---A-G-TAG-AGC-GG-TA---GTG----TC-AT--A--AG---ATG--------C-T--TC-AA-A-TGAT-T---ATGC----C--AA-C-G-T-GAGG---TG-C-GTGA-T--A-------TT--TA-AC-GTTA-GTAA---ATA-A-CGT-AA-T-T---T-A---GAGGT------TA-TG--GG---ATA-TG---TT-GCAGAA--CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--A--GAAGACC-C-CG-TAG-TGGC--A-A-TCGC----AA-TAG--AAT-GACA------G-CTCA-TGG--G----G---G--TC---CT-A-AA-ATG-G--T----GC-TTT--T-GGCA-A-AAT--GCAATCG-GTTC--AT-TTCT-GCTG
gi|110142                     :        GTGGT-C-AA---G--GAA-AAAA-T-A-A-T--T-------C-TG--T-G----------TA-AAAGGAC-TTT-AA---TTTT-CAAACA-----T-TT-CTA----------AG-GC-AT-G-AAG---TTT--GACC--T--TGC-T-G--C----CT-T-----G-A--C---TGAATGA-CA-ACAAT--GT-T--AG----A-G-AG-G-C-GA-C-AT----AT-G------AT-GT--AC---A-G---A-GAC-GG-TT---GTG----CA-A---A--GG---ATA--------C-T--TG-AA-AATGGA-T---ATGCTCA-C--AA-C-G-G-CA-G---TGGCCGTGA-T--G-G-----TT--TA-AC-GTTATGTGA---A-A-A-CCG-AA-T-T---A-A---C--GT------TA-TG--GG---AAA--G---TT-CCAGAAATCA----CAGA-GAGGG---T--GC-----AAACC--AAAGACC-T-GT---G-TGGC--A-A-GC-C----AG-AAG--AAT-AACA------G-CTCA-TGG--G----G---G--TC---CC-T-AA-ATA-G--T----GT-TTC--T-G-CA-A-AAC---CATTTA-GTTA--AC-ATTT-GCTG
gi|110143                     :        GTGGT-C-AA---G--GAA-AA---C-A-A-T--T-------C-TG--T-G----------TA-AAAG-A--GTT-TA---TTTTCAAAACA-----T-TT-CTA-CA------GAATTT-TT-G-AAC---TTT--GACCA-T--TAC-TAG-AC----CT-TAAA--G-A--T---TG--TAAGCA-A-AAT--GTGT--GA----A-ACAG-A-T-GA-T--T----ATGG----G-AT-G---ACGTGA-G--AG-GGT--A-TC---GTA-----C-AT--A--AG---ATG--------CTT--TC-AA-A-TGAA-T---ATGCGC------A-C-G-T-CAGG---TGG--GTGA-T--GAA-----TT--TA-AC-GTTA-GTAA---A-A---CGT-AT-T-T---AGA-----GGT------TA-TG--GG---AAA-GG---TT-C--GAA--CA----CAGGTGAGGG---TG-GC-----AA--C--GATAA-T-C-TG-TAG-TGGC--T-A-TCGC----AG-AAGAAAAT-GACA------GCTTCA-T-A--G----G---G--TC---TT----A-ATA-G--T----GT-ATT--T-GGCA-A-AAT--GCTTCTG-GTAC--AT-TACTAGCTG
gi|110144                     :         TGGTTC-AA---G--GAA-AAA--C-A-A-C--T-------A-TG--T-G----------TA-AAAG-AG-TTT-AA---TTTT-CAAACA-----TGTT-CTA-TG------GAG-TT-TTCG-AAA---TTTTTGACCA-T--TAC-T-G-AC----CT-T-----T-G--TATTTGA-TAA-CATA-AAT--GT-T--GA----A-A-AG-A-C-GA-C--------T-GAAAAG-AT-GT--AC---A-G-CAG-AGC-AG-GT---ATGAAGCCT-AT-GA--AAGAAATG--------C-T--TCCAA-A-TGGA-----ATGCTC--TCAAA-C-G-TTCAGG---TGGC-GTGA-TTTG-ACC---TTAATA-AC-GTTA-GTAA---A-A-C-CGG-AA-T-T---T-A---GAAGT------TA-TG--AGGAAAAA-GG---TT-CCAGAA--AA----CAAG-GGGGA---T--GC-----AA--C--GAAGACC-T-CA-TAG-TGGC--A-ATG--C----AG-AAG--AAT-AATGAATAGCG-CTCA-T-G--GTCACG---G--TCCTTAC-A-AA-TTGCG--T----GCTTTT--T-GACA-ACAAT--GC
gi|110145                     :           GT-C-AATTGG--GAA-AAA--C-A-A-T--T-------C-TG--T-GTTTTATTTTATA-AAAG-AT-TTT-AA---TTTC---AACA-----T-TT-CTA-CA------TAA----TT-G-AAA---TTT--GACCATT--TGC-C-G-AC----CTCT-----G-A--C---T-A-TTA-CT-A-ACT---T-T--AC----AGA-AGAA-C-GA-C-ATGTCAAT-G----G-A--AT--AC---A-G-CAG-AGCGGG-TCTTAGTG----CC-ACATA--GG---A---------------TC-CA-A-TGGA-----AAACTC--T--AA-C-G-T-CA-G---TTGCAGTGACT--GAG-----CA--TA-AA-TTAT-GTGA---A-A-C-CGT-AA-T-TGA-A-A---T--GT------TA-----GG---AAA--G---TT-CC--AA--CA----T-TA-GAGGGTAAT--GC-----AA--C---AAGA-C-T-TC-TAGTTTTC--A-A-GCTC----AG-AAG----T-TA-A------G---CA-T-A--T----G---G--TC---AT-A-AATAT--G--T----TC-TTTCAT-G-CA-A-AAC--G
gi|110146                     :           GT-C-AA---GCGGAA-AGATGC-A-A-T--T-------C-TG--T-G----------TA-AACG-AG-TTT-AA---TTTTTCAAACA-----T-TTTCTAGCA------GAA-TTGTT-G-AAA---TTT--GACCA-T--TAC-T-G-AC----CT-A-----G-AGTT---TGACTAA-CA-A-AGT--GT-T--G-----A-A-AG-C-CTGA-C-TT----AA-T----G-AT-GT--AC---A-G-
gi|110147                     :                 A---G--GAATAAA--C-AGA-T--T-------C-TGG-C-G----------TA-AAAA-GA-GTTCAA---TTTC-AAAGCAATTTCT-TA-TTT-CA------GAA-TT-TT-G-AGAAATTTT--GACCA-TACTGC-T-GTACACGGTT-TGTAGCG-A--C---TGA-T-A-CA-A-AATTGGT-T--ATTATGA-A-TG-A-C-GA-C-AT----AT-G----G-AT-GT--ACT--A-GACAGAGAC-GT-TT---ATG----TCAAT-AG--AG---ATAACATCAATC-TC-TC-AA-A-TGGA-TAAAACATTC--T--AG-A-G-T-CA-GTT-TGGG-ATGA----G-GAGCATCT--TATACTGTTA-GTGAAGGA-A-CGTGT-GA-T-TTTGA-A---GTGTT------TA-AA--GA---TAA-GGAGCTT-TCAGAAT-CAATAGGAGG-GAGGG---CGAGCTGGCAAA--C--AGAGTCC-TATG-TAG-TGACTAA-A-GCTCA---AG-AAG--AAT-GGCA------G-CGTA-T-G--G----GTGTG--TC---AT-A-AA-ATA-GATT----GC-TTT--G-GCAA-A-A
gi|110148                     :                                                                                                               TG-CG------GAG-TT-TT-C-TAA---TTT--GATCG-T--TAC-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TGA-TAA-CA-A-AAT--GT-T--AA----A-C-AG-A-C-GA-C-TT----AT-G----G-AT-GT--AC---A-A-TAG-AGC-
gi|110150                     :                                                                                                              ttttgatacaaaagttttgtttgtgagaataatatgtaCA-T--TGC-T-G-AC----TT-T-----G-A--C---TGA-TGA-CA-A-AAT--GT-T--GT----A-G-AG-A-C-GA-T-GT----AT-G----G-AT-GTAGAC---A-A-CA---GC-GG-GT---ATA----CC-AT-AG--GG---ATG--------C-T--TC-AA-A-TGGA-T---ATGCTC--C--AA-C-G-T-CAGC---TGGC-ATGA-G--G-G-----CA--TA-GC-GTTA-CTGA---A-A-C-TTT-AA-T-T---G-A---AAGGT------TA-TA--GG---AAA-GG---TT-CCAGTA--CA----CAAG-GAGGG---T--AG-----AA--C--AAAGACC-T-CG-TAG-TGGC--A-A-GCGC----AG-AAA--AAT-GGCA------G-CTCA-T-G--G----G---G--TC---CT-A-AA-ATA-G--T----GT-TTT--T-GGCA-A-AAC--GCATTTG-GTTC--AT-TTCT-GCCG
gi|110151                     :                                                                                                                                                                                                                                                  ----G-AT-GT--AC---A-G-CAG-AGC-GG-TA---GTG----CT-AT-AA--AG---ATG--------C-T--TC-AA-A-T
gi|110152                     :                                                                                                                                                                                                                                                                 ---A-G-CAG-GGC-GG-TC---TTG----TC-AT-CA--AG---ATG--------C-T--TC-AA-A-TGCA-T---ATGCTC--C--AA-C-G-T-CACG---TGGC-GTGA-A--G-G-----TT--TA-AC-GTCA-GTGA---A-A-T-CAT-AA-T-T---G-A---AAGGT------TA-TG--GG---AAA-GG---TT-CCAGAA--CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--AAAGACC-T-CC-TAG-TGGC--A-A-GCTC----AG-AAG--AAT-GACA------G-CTCA-T-A--G----G---G--GA---AT-A-AA-ATA-G--T----GC-TGT--T-GACA-A-AAC--GAAATCG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110153                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A-GTAA---A-A-C-CGT-AA-T-T---------TTG----------------------A-GG---T--CCAGAA--CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--T--GAAGACA-T-TG-TAG-TGGT--A-A-TCGC----AG-AAG--AAT-GACA------G-CTCC-T-G--G----GC--G--TC---CT-A-AA-ATG-G--T----GC-TTT--T-GGCA-A-AAC--GCAATCG-GTTG--AT-CTCT-GCTG
gi|110154                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cattAGAA--CA----CAGG-GAAGG---T--GC-----AA--C--AAAGACC-T-CC-TAG-TGCC--A-
gi|110149                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       --CA----CGGG-ACGAG---TT-GC-----AA--C--GAAGATA-T-CGATAG-TGGC--T-T-GATCCGCAAG-AAG--AAT-GACA------G-CTCATT-G--GGC--G---G--TC---TT-A-AA-ATG-G--TTGACGT-CTT--T-GGAATA-AAT--GCAATCG-GTT
gi|110155                     :                                                                                                                                                                                                                                                     tttacattattcaatcacttaatcacatgaattttgaaattttgaccgcattagactagagcttgtattgatatcatcaacaatcactgatttcggacagactgacttttgcgcttttgtgtacacgtagcgggaggccgagcgtgcgttcgccgatgaagatgcttgcctcacatgaatctgctcgctaatacgtcagcgaggacgttagtgtatttggattatcaacgttgagtataagtaactccgtatattttatgagaggtttactgcggatatagagttcacgcagatatatctG-AAG--AAT-TACA------G-CTCA-T-G--G----G---GG-TC---AT-A-AA-ATA-G--T----GC-TTT--T-GGCA-A-AAC--GCATTTG-GTTC--AT-CACT-GCTG





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             11111                                                                                                                                                                                                                                                        
lowQualScore                  :             1   444 22   1   33 3 1 444  444 44444 1 55 1  7777777777 1   1 3 5555 1   1 44  1  1 1   1  3 1  55  1 444  777777   1  3  3 1   666   55    22  22 1 22 1 4 222  22  1 444 66666 444444  1 3  444444 1  1 55555   22  1 77777 1  22 3333 3  1 55 5555  1 6666 55555  1  22  444 4444 1    5555555 1   3  222  22 3333  1 1 77 1  222   55555555 1 55 5555 1  1   1 1  222     66 22  44 1 1 1  66 22 1  3 1    9999999999 6666666  22  444  1   1 3   1  444 99999999   1 1   22222 1  1  444444 1 3  33  222 222  1  666  1 222    222 666  3 3333   1     444 3 444444   33 444    1   1 555   3    22 1 1  3 5555 1 1   22   1    444444  1   999 33 5555 555 3  1 444 1     3 22 3333  3    1 1  1 1 1   22 1  1 1  3    22  22   1    
lowQualScore                  :             .   ... ..   .   .. . . ...  ... ..... . .. .  .......... .   . . .... .   . ..  .  . .   .  . .  ..  . ...  ......   .  .  . .   ...   ..    ..  .. . .. . . ...  ..  . ... ..... ......  . .  ...... .  . .....   ..  . ..... .  .. .... .  . .. ....  . .... .....  .  ..  ... .... .    ....... .   .  ...  .. ....  . . .. .  ...   ........ . .. .... .  .   . .  ...     .. ..  .. . . .  .. .. .  . .    .......... .......  ..  ...  .   . .   .  ... ........   . .   ..... .  .  ...... . .  ..  ... ...  .  ...  . ...    ... ...  . ....   .     ... . ......   .. ...    .   . ...   .    .. . .  . .... . .   ..   .    ......  .   ... .. .... ... .  . ... .     . .. ....  .    . .  . . .   .. .  . .  .    ..  ..   .    
lowQualScore                  :             7   444 22   6   88 2 6 444  444 00000 6 44 6  0000000000 6   6 2 8888 5   5 22  5  5 5   5  1 5  22  5 222  555555   5  1  1 5   333   22    11  11 5 11 5 6 777  11  5 222 99999 222222  5 1  444444 5  5 44444   11  5 88888 5  11 9999 1  6 44 0000  6 3333 44444  5  11  111 6666 5    0000000 5   2  888  22 4444  6 6 88 6  888   88888888 6 44 0000 6  6   0 7  999     22 33  00 7 7 7  55 33 7  3 7    3333333333 9999999  33  666  6   6 2   6  444 33333333   6 6   66666 6  6  666666 6 2  88  888 888  6  000  6 888    777 333  1 3333   5     888 1 444444   77 888    5   5 222   1    11 5 6  6 0000 5 5   11   5    444444  5   888 77 4444 888 1  5 222 5     2 22 4444  2    6 6  6 6 6   33 7  0 8  6    66  11   9    
consensus                     : AATTATAGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TT---C-----T-G--T-GT----------A-AAA-G-AG---T-TTA-A--TT-TT-C-AAA-CA-T-TT--CT-A---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--AT--T-G--C-T-G---AC--CT-T---G-----A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--AN-A-GA--G--A-C-GA-C-AT----AT-G----G-----AT-GT--AC---A----G-CAGG-------G-CGG-TC---GT--G----CC-A-TN-A-AG---ATG--------C-T--T----C-AA-ATGGA-TA---TGCTC--C--AA--C-G-T-CAG-G--T-GG-C-GTGA-------T--G-G-----TT--TA---AC-GTT-A-GTG-AA---A------C-CGT-A-ATT----NAGAG-GT------T-A-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA---A---CA-C----AGG-GAGGG---T-G------CAA--C--GAAGA-CCT-C-G-TAG-TGGC--A-A-GCTC----A-G-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-T-G--G----G---G-TCNT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAC--G-CANT-CG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
Reference ( family-593 )      : AATTATAGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TT---C-----T-G--T-GT----------A-AAA-G-AN---T-TTA-A--TT-TT-C-AAA-CA-T-TT--CT-A---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--AT--T-G--C-T-G---AC--CT-T---G-----A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--AN-A-GA--G--A-C-GA-C-AT----AT-G----G-----AT-GT--AC---A----G-CAGG-------G-CGG-TC---GT--G----CC-A-TN-A-AG---ATG--------C-T--T----C-AA-ATGGA-TA---TGCTC--C--AA--C-G-T-CAN-G--T-GG-C-GTGA-------T--G-G-----TT--TA---AC-GTT-A-GTG-AA---A------C-CGT-A-ATT----AANAG-GT------T-A-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA---A---CA-C----AGG-GAGGG---T-G------CAA--C--GAAGA-CCT-C-G-TAG-TGGC--A-A-GCTC----A-G-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-T-G--G----G---G-TCNT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAC--G-CANT-CG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110123                     : AATTATAGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TT---T-----T-G--T-GT----------A-AAA-G-AC---G-TTA-A--CT-CT-A-AAA-CA-T-TG--CT-A---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--AT--T-G--C-T-G---AC--CT-T---G-----A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--AC-A-AA--G--A-C-GA-C-AT----AT-G----G-----AT-GT--AC---A----G-CAGG-------G-CGG-TC---GT--G----CC-A-TC-A-AG---ATG--------C-T--T----C-AA-ATGCA-TA---TGCTC--C--AA--C-G-T-CAC-G--T-GG-C-GTGA-------T--G-G-----TT--TA---AC-GCA-A-GTG-AA---A------C-CAT-A-ATT----AATTG-GC------T-A-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA---A---CA-C----AGG-GAGGG---T-G------CAA--C--AAAGA-CCC-C-C-TAG-TGGC--A-A-GCTC----A-G-AAG--AAT-GACA------GT-TCA-T-G--G----G---G-TCAT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-CC-A-A-AAC--G-CATT-TG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110124                     : AATTATAGTTGT-GAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TT---C-----T-G--T-GT----------A-AAG-G-AC---T-TTA-A--TT-TT-C-AAA-CA-T-TG--CT-A---CA------GAG-TT-CT-G-AAA---TTT--GACC--AT--T-G--C-T-G---AC--CT-T---G-----A--C---TG-A-TG------A-TA-A-----AAT--GT-T--TC-A-GA--G--A-C-AA-C-AT----AT-G----G-----GT-GT--AC---A----G-GAGG-------G-CGG-TC---GT--G----CC-A-TC-A-AG---ATG--------C-T--T----C-AA-ATGCA-TT---AGCTC--C--TA--A-G-T-CAC-G--T-AG-C-GTGG-------T--G-G-----TT--TA---AC-GCC-A-GTG-AA---A------T-CAT-A-ATC----AAAAG-GT------T-A-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA---A---CA-C----AGG-AAGGG---T-G------CAA--C--AAAGA-CCT-C-C-TAG-TGGC--A-A-GCTC----A-G-TAG--AAT-GACA------GC-TCA-T-G--G----G---GATCAT---A-AAAAA-G--T----GC-TTTT-G-AC-A-A-AAC--G-AAAT-TG-GTTA--AT-CTCT-GCTG
gi|110125                     : AATTATTGTGGT-CAA---G--GAA-AAG--A-A-A----T---C-----T-GT-T-GT----------A-AAA-T-AT---T-TTA-A--TT-GT-C-AAA-CA-A-TT--CT-A---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--AT--T-G--C-T-G---AC--CT-T---G-----A--C---TA-A-TG------C-CA-A-----AAT--GT-T--AA-T-GA--G--A-C-GA-C-AG----AT-A----G-----AT-GT--AC---A----G-GAAG-------G-CGG-TC---GT--G----CC-A-TC-A-AG---ATG--------C-T--T----C-AA-ATGCA-TA---TGCTC--T--AA--C-G-T-CAC-G--T-GG-C-GTGA-------T--G-G-----CT--TA---AT-GTC-A-ATG-AA---A------T-CAT-A-ATT----AAAAG-GTTACATGT-A-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA---A----A-C----AGG-AAGGG---T-G------CAA--C--AAAGA-CCT-C-C-TAG-TGAC--A-A-GCTC----A-G-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-T-GA-G----G---G-TCAT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAC--G-CATT-TG-GTTC--AT-TTCT-GCTG
gi|110126                     : AATTATAGTGGT-CCA---G--GAA-AGA--T-A-A---TT---C-----T-G--T-GT----------A-AAA-G-AT---T-TTA-A--TT-TT-C-AAA-CA-C-TT--TT-A---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--TT--T-G--C-T-G---AC--CT-T---G-----A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--AC-A-GA--G--G-C-GA-C-AT----AT-G----G-----AT-GT--AC---A----G-CAGA-------G-CGG-TA---GT--A----CC-A-TC-A-AG---ATT--------C-T--T----C-AA-ATGCA-TA---TGCTC--C--AA--C-G-T-CAC-G--C-GG-C-GTGG-------T--G-G-----TT--TA---AC-CTC-A-GCG-AA---A------T-CGT-A-ATT----AAAAG-GT------T-A-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CTCA---A---CA-C----AGG-GAGGG---T-G------CAA--C--AAAGA-CCT-C-C-TAG-TTGC--ACA-GCTC----A-T-AAC--AAT-GACA------GC-TCA-TCG--G----G---G-TAAT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAC--A-AAAT-CC-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110127                     : AATTTTAGTGGT-CAA---G--AAA-AAA--C-A-A---TT---T-----T-G--T-GT----------A-ATA-G-AC---A-TTC-A--TT-TT-C-AAG-CA-T-TG--CT-A---CA------GAG-TT-TT-T-AAA---TTT--GATC--AT--T-G--C-T-G---AC--AT-T---G-----A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--AC-A-CA--T--A-C-GA-C-AT----AT-G----T-----AT-GT--AC---A----A-CAGG-------G-CGG-TC---GT--C----CC-A-TC-A-AG---ATG--------C-T--T----C-AA-ATGGA-TA---TGTTC--C--AA--C-G-T-CAC-G--T-GG-C-GTTA-------T--G-G-----TT--TA---AC-GTC-A-TTG-AA---A------T-CGT-A-AGT----ATAAG-GT------T-A-TG--GG---A---AA-GG---TTCC---CAGA---T---CA-C----AGG-GAGGG---T-G------CAA--C--AAGGA-CCT-C-C-TAG-TGGC--A-A-ACTC----A-G-AAG--AAT-GACA------GC-TCATT-G--G----G---G-TCAT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-A-GC-T-A-AAC--A-AAAT-CG-ATTA--AT-CTCT-GCTG
gi|110128                     : AATTATAGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TT---C-----T-A--T-GT----------A-AAA-------------------------ACA-CA-T-TT--CT-A---CA------GAA-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--AT--T-G--C-T-G---AC--CT-T---G-----A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--AC-A-GA--G--A-C-GG-C-AT----AT-G----G-----AT-AT--AC---A----G-AAGG-------A-GAG-TC---GT--G----CC-A-TC-A-AG---ATG--------C-T--T----C-AA-ATTCA-TA---TGCTC--C--AA--C-G-T-CAC-A--T-GG-C-GTGA-------T--G-G-----AT--TA---AC-GTC-A-GTG-AA---A------T-CGT-A-ATG----AAAAG-GT------T-A-TG--GG---A---AA-AA---TT-C---CAGA---A---CA-A----AGG-GAAGG---T-G------CAG--C--AAAGA-CCT-C-C-TAG-TGGC--A-A-GCTC----A-G-AAG--AAT-GACA------AC-CCA-TGG--G----G---G-TAAT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-G-AAC--G-CATT-TG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110129                     :   TTATGGTAGT-CGA---G--GAA-AAT--T-A-A---TT---C-----T-G--T-GT----------A-AAA-G-AG---T-TTA-A--TT-TT-C-AAA-CA-T-TT--CT-A---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GAAC--AT--T-A--C-T-G---AC--CT-T---G-----A--T---TG-A-TA------A-CA-A-----AAT--GT-T--GA-A-AA--T--A-C-GA-C-TT----AT-T----G-----AT-GT--AC---A----G-TAGA-------G-CGG-TC---AT--G----CC-A-TA-A-AG---ATG--------C-T--T----C-AA-ATGGA-TA---TGCGC--C--AA--C-G-T-CAG-G--T-AG-C-GTGA-------T--G-A-----TT--TA---AC-ATT-A-GTA-AA---A------C-CGT-A-ATT----TAGAT-GT------T-A-TG--GG---A---AA-GG---TT-C-----------------C----AGG-GAGGG---T-G------CAA--C--GATGA-CCT-C-G-TAG-TGGC--A-A-TCGC----A-G-AAG--AAT-GACA------GC-TCATT-G--G----G---G-TCCT---A-AA
gi|110130                     :   TTATAGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-ACAATT---C-------G--C-GT----------A-AAA-T-AC---T-TTA-A--TT-TT-C-AAA-TA-T-TT--CT-A---CA------TAG-TT-TT-GAAAA---TTT--GACT--AT--T-G--C-T-G---AC--CT-T---G-----A--C---TG-A-TA------A-CA-A-----AAA--AT-T--AC-A-GA--G--A-T-GA-C-ATG---AT-G----GA----AT-GT--AC---A----G-C-TG-------G-CGG-TC---GT--G----TC-A-TT-A-AT---A-A--------C-T--T----C-AA-ATGTA-TA---TGCTCTGC--AA--C-A-T-CAC-A--G-GG-T-GTGA-------T--G-C-----CT--TA---AC-GTT-A-GTG-GA---A------A-TGTAA-ATG----AAAAG-TT------T-ATTG--GG---A---AA-GG---TT-C---CGGA---A---CACC----AGG-GAGGG---T-C------CAT--CA-AAAGA-CCT-C-C-TAT-TGGC--A-A-GCTTA---A-G-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-TCG--G----A---C-TCAT---A-AGATA-G--T----GT-GTTT-T-GC-A-A-AACGAG-CAAT-CGTTTTT--AT-CTCT-
gi|110131                     :   TTATGGTGGT-CAA---G--GAC-AAT--C-A-A---TT---C-----T-G--T-GT----------A-AAA-G-AC---A-TTC-A--TT-TT-C-AAA-CA-T-TC--CT-A---TA------GAA-TT-TT-G-AAA---CTT--GATC--AT--T-G--T-T-G---AC--CT-T---G-----A--C---TG-G-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--AT-A-GA--G----C-GA-C-AT----AA-T----G-----ATAGT--AC---A----A-CAGA-------G-CGGTTT---GT--G----CC-A-T--A-AG---ATG--------C-T--T----C-AA-ATGGA-TA---TGCTC--C--AA--T-GTT-CAG-T--T-GG-C-GT-A-------G--G-G-----CT-------AC-GTT-A-GTG-AA---A--------CGT-A-ATT----GAAAA-GT------T-C-TT--GG---A---AA-GGT--TT-C---CAGA---A---CAGC----AGG-GAGGG---T-G-------GA--C--G--GA-CCT-C-G-AAG-TG----A-A-GCTC----A-G-A----AAT-GGAA------GC-TCA-T-G--G----G---G-GACC---A-AACAA-G--T----GCTTTTT-G-AC-C-A-AAC--A-CATT-T--GTTCATAT-CTCT-
gi|110132                     :   TTATGGTGGA-CAA-----------AT--C-A-A---TT---T-----T-G--T-TT----------A-AAA-G-AC---T-TTA-AAATT-TT-C-AAAACA-T-TT--CT-A---CA------GAA-TT-TT-G-AAA---TTT--GGC---AT--T-G--C-TTG---AC--CT-----G-----A------TG-A-TG------A----A-----CAT--GT-T--AC-A-GA--G--AAC-GA-CCAT----AT-G----G-----AT-GC--AC---AA---G-CAGG---------CG--TC---GT--A----CC-A-TA-G-AG---ATG--------C-T--T----C-AA-ATGGA-C----TGCTC--C--AAA-T-G-T-CAG-AGCT-GG-C-ATGA-------A--G-G-----CT--TA---GC-TTT-A-GTG-AA---A------A-CGT-A-ATT----TAGAG-GT------T-A-TG--GG---A---AA-GGT--TT-C---CAAG---A---CA-C----AAG-AAGGG---T-G------GAA--C--AAAGACCCT-C-G-TAGTTGGC--A-G-G--C----A-GAAAG--GTT-GGCA------GC-TCA-G-G--G----G---T-TCCTA--A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-ACC--G---TT-TG-GTTC--ATACTCT-
gi|110133                     :   TTATGGTGGT-CAA---A--GGA-AAA--C-A-AA--TT---C-----T-G--T-GT----------A-AAA-G-AGGTTT-TCA-G--AT-TT-C-AAA-CA-T-------------G------GAG-T-------------------------------------G---AC--CT-T---G-----A------TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-TT-AC-A-GA--G--A-C-GATC-AT----AT-G----------AT-GT--AC---A----G-CAGA-------T-CG--TC---GT--G----CT-A-TA-TTAG---ATG--------C-T--T----C-AA-ATGGA-TA---TG--------------G-C-C-----------T-GTGA-------G--G-A-----TT--AA---AC-GTT-A-GTA-AA---A------C-CGT-A-ATTT---AGGAG-GT------T-A-TG--GG---A---A--GG---TT-C---CAGA---A---CA-C----AGG-GAGGGGC-T-G------CAG--C--GAATA-CTT-T-G--AG-TGG---A-A-TCGC----A-G-AAG--AAT-GGCA------GC-TTACT-G--G----GC--G-TCCT---GTAAATG-G--T----GC-TTTTGG-GC-A-A-AAC--G-CAAT-CG-GTTG--AT--TCT-ACCG
gi|110134                     :   TTATGGCGGT-CAA---G--GAA-AAA------A---TT---C-----G-A--TCGT----------A-AAA-A-G------TTA-AGGTT-TC-C-AAA-CA-T-TT--CT-A---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--AT--T-A--CGT-G---A---CT-T---G-----A--T---TG-A-TA------A-CA-A-----AAT--GT-TTGAA-A-AG--G--A-C-
gi|110135                     :   TTATGGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TT---C-----T-G--T-GT----------A-AAA-G-AG---T-TTA-A--TT-TT-C-AA
gi|110136                     :    TATAGTGGT-CAG---G--AAA-AAA--CCA-A---TT---C-----C-GCTT-AT----------A-AAA-ATAC---TGTTA-A--TT-TT-C-AAA-TAGT-TT--CT-A---CA------TAG-TT-TTTG-AAA---TTT--GACA--AT--T-G----T-G---AC--CT-TA--G-----A--C---TG-ACTG------A-CA-A-----ATT--TT-TTCAC-A-AA--G--ATC-GA-C-AT----AT-GC---G-----AT-GT--GC---A----G-CATG-------G-TGG-TC---GT--------C-A-TC-A-AT---ATG--------C-TCTT----C-AATATGCACTA---TGCTC--C--AA--G-G-T-CAC-G--T-TG-C-GTGA-------TT-G-G-----CC--TA---AC-ATT-C-GTG-AA---A------T-CGT-T-ATT----AAAAGTTT------T-A-TGGCGG---A---AAGGG---TT-C---CGGA---A---CA-C----A-G-GAGGG---T-C------CAT--CCAAAAGA-CCT-CTC-TAT-TGGC--A-T-GAAT----A-G-AAG--AAT-GACA-------T-TCATT-GACG----G---G-TCAT---A-AAA-A-G--T----GG-TTTT-G-GCAA-A-AAC--GAGAATACGTGTTC--AT-ATCT-GCTG
gi|110137                     :      TAGTGGT-CAAA--G--GAA-AAA--C-A-G---TT---A-------G--T-AT----------A-AAA-G-AG---T---A-A--TT-T--C-AAA-CA-T-TT--CT-A---CAGAAAGTGAA-TTATT-G-AAA---TTT--
gi|110138                     :       AGTGGT-CA----G--GAA-AAA--C-A-A---TTG--C-----T-G--T-GT----------A-AAA-G-AG---T-T-A-A--TT-TT-C-AAA-CA-T-TTT-CT-A---CAA-----GAA-TT-TT-G-AAAAT-TTT--GACC--AT--T-A--C-T-G---AC--CT-T---GT----A--T---TG-A-TA------A-CA-A-----AAT--GT-T--GG-A-AA--G--A-T-GA-C-TT----AT-G----G-----AT-GT--AC---A----G-TAGA-------G-CGG-TC---GT--G----CC-A-TA-A-AG---ATG--------C-T--T----C-AA-ATGAA-TA---TGCGC--T--AA--C-G-T-CAG-G--A-GG-C-GTGA-------T--G-A-----TT--TA---AC-GTT-A-GTA-AA---AA-----C-CGT-A-ATT----TAGAG-GT------T-A-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA---A---CA-C----AGG-GAAGG---T-G------CAA--C--GAAGA-TAT-C-G-TAG-TGGC--T-A-TCGC----A-G-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-T-G--G----G---G-TCTT---A-AAATG-G--T----GA-TTTT-G-GC-A-A-AAT--G-CAAT-CG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110139                     :       AGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TTAAACAATTAT-G--T-GT----------A-AAA---AG---T-TAA-T--TT-TT-C-AAA-CA-T-TT--CT-A---CA------TAA-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--AT--T-G--T-T-G---AC--CT-T---A-----A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--AC-A-GA--G----C-GA-C-TT----AT-G----G-----AC-GT--AC---A----G-CAGA-------G-CGG-TT---GT-------CC-A-TA-A-AG---A-G--------C----T----C-AA-AT-GA-T----TGCTC--C--AT--C-G-T-CAA-G--T--G-C-GTGA-------T--G-G-----TT--TA---AC-GTT-A-GTG-AA---A------C-CGT-A-ATT----GAAA--GT------T-A-T---GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA---A---CA-T----AAG-GAGGG---T-G------CAA--C--AAAGA-CCT-C-G-TAG-T-GC--A-A-GCTA----A-G-AAG--AATCAACA------GC-TCA-A-T--G----G---G-TCCT---A-AAATA-G--T----GC-TATT-G-GC-A-A-AAC--G-CATT-T--GTTC--AC-CTTT-GCTG
gi|110140                     :       AGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-C-A---TT---A-----TGG--T-GT------------AAA-G-AG---T-TTA-T--TT-TT-C-AAA-CA-T-TT--CT-A---CA------GAA-TT-TT-G-AAAT--TTT--GACC--AT--T-A--C-T-G---A----T-T---G-----A--T---TG-A-TA------A-C--A-----AAT--GT-T--GA-A-AA--G----C--A-C-TT----AT-A----G-----AT-GT--AC---A----G-TAGA-------G-CGG-TA---GT--G----TC-A-TA-A-AG---ATG--------C-TG-T----C-AA-ATGGA-TA---TGGCG--C--AA--CAG-T-CAG-G--T-GG-C-GTGA-------T--G-A-----TT--TA---AC-GTA-A-GT--AA---A------C-CGT-A-ATT-----AGAG-GT------T-A-TA--GG---A---AA-GG---TT-G---CAGA---A---CA-C----AGG-GAGGG---T-G------CAA--C--GAAGA--CT-C-G-TAG-TGGC--A-A-TCGC----A-G-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-TCG--G----G---G-T--T---A-AAATG-G--T----GC-TTTT-G-GC---A-AAT--G-AAAT-C--GTTC--AT--TCT-GCTG
gi|110141                     :        GTGGT-CAA---A--GAA-AAA--TTA-A---T------------G--T-GT----------ACAAA-G-AG---T-TTA-T--TT-TT-C-AAA-CA-T-T---CT-A---CA------GA--TT-TT-G-AAA---TTTT-GACC--AT--T-A--C-T-G---AC--CT-T---G-----A--T---TG-A-TA------A--A-C-----AAT--GT-T--GA-A-AA--G--A-C-GA-C-TT----AT-G----G-----AT-GC--AC---A----G-TAGA-------G-CGG-TA---GT--G----TC-A-T--A-AG---ATG--------C-T--T----C-AA-ATGAT-TA---TGC----C--AA--C-G-T-GAG-G--T-G--C-GTGA-------T--A-------TT--TA---AC-GTT-A-GTA-AAT--A------A-CGT-A-ATT----TAGAG-GT------T-A-TG--GG---A---TA-TG---TT-G---CAGA---A---CA-C----AGG-GAGGG---T-G------CAA--A--GAAGA-CCC-C-G-TAG-TGGC--A-A-TCGC----A-A-TAG--AAT-GACA------GC-TCA-TGG--G----G---G-TCCT---A-AAATG-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAT--G-CAAT-CG-GTTC--AT-TTCT-GCTG
gi|110142                     :        GTGGT-CAA---G--GAA-AAAA-T-A-A---TT---C-----T-G--T-GT----------A-AAA-GGAC---T-TTA-A--TT-TT-C-AAA-CA-T-TT--CT-A------------AG-GC-AT-G-AAG---TTT--GACC---T--T-G--C-T-G----C--CT-T---G-----A--C---TGAA-TG------A-CA-AC----AAT--GT-T--AG-A-GA--G--G-C-GA-C-AT----AT------G-----AT-GT--AC---A----G---AG-------A-CGG-TT---GT--G----CA-A----A-GG---ATA--------C-T--TG---A-AA-ATGGA-TA---TGCTCA-C--AA--C-G-G-CA--G--T-GGCC-GTGA-------T--G-G-----TT--TA---AC-GTT-ATGTGAAA---A------C-CG--A-ATT----AAC---GT------T-A-TG--GG---A---AA--G---TT-C---CAGA---AAT-CA-C----AGA-GAGGG---T-G------CAAACC--AAAGA-CCT---G-T-G-TGGC--A-A-GC-C----A-G-AAG--AAT-AACA------GC-TCA-TGG--G----G---G-TCCC---T-AAATA-G--T----GT-TTCT---GC-A-A-AAC----CATT-TA-GTTA--AC-ATTT-GCTG
gi|110143                     :        GTGGT-CAA---G--GAA-AA---C-A-A---TT---C-----T-G--T-GT----------A-AAA-G-AG---T-TT--A--TT-TT-CAAAA-CA-T-TT--CT-A---CA------GAATTT-TT-G-AAC---TTT--GACC--AT--T-A--C-TAG---AC--CT-TAAAG-----A--T---TG---TA------AGCA-A-----AAT--GTGTG-AA-A-CA--G--A-T-GA-T--T----ATGG----G-----AT-G---ACGTGA----G--AGG-------G-T-A-TC---GT--A-----C-A-T--A-AG---ATG--------CTT--T----C-AA-ATGAA-TA---TGCGC------A--C-G-T-CAG-G--T-GG---GTGA-------T--GAA-----TT--TA---AC-GTT-A-GTA-AA---A--------CGT---ATT----TAGAG-GT------T-A-TG--GG---A---AA-GG---TT-C-----GA---A---CA-C----AGGTGAGGG---TGG------CAA--C--GATAA-TCT---G-TAG-TGGC--T-A-TCGC----A-G-AAGAAAAT-GACA------GCTTCA-T-A--G----G---G-TCTT------AATA-G--T----GT-ATTT-G-GC-A-A-AAT--G-CTTC-TG-GTAC--AT-TACTAGCTG
gi|110144                     :         TGGTTCAA---G--GAA-AAA--C-A-A---CT---A-----T-G--T-GT----------A-AAA-G-AG---T-TTA-A--TT-TT-C-AAA-CA-TGTT--CT-A---TG------GAG-TT-TTCG-AAA---TTTTTGACC--AT--T-A--C-T-G---AC--CT-T---T-----G--TATTTG-A-TA------A-CATA-----AAT--GT-T--GA-A-AA--G--A-C-GA-C--------T-GAAAAG-----AT-GT--AC---A----G-CAGA-------G-CAG-GT---AT--GAAGCCT-A-TG-A-AAGAAATG--------C-T--T----CCAA-ATGGA--A---TGCTC--TCAAA--C-G-TTCAG-G--T-GG-C-GTGA-------TTTG-ACC---TTAATA---AC-GTT-A-GTA-AA---A------C-CGG-A-ATT----TAGAA-GT------T-A-TG--AGGAAA---AA-GG---TT-C---CAGA---A---AA-C----AAG-GGGGA---T-G------CAA--C--GAAGA-CCT-C-A-TAG-TGGC--A-ATG--C----A-G-AAG--AAT-AATGAATAGCGC-TCA-T-G--GTCACG---G-TCCTTACA-AATTGCG--T----GCTTTTT-G-AC-A-ACAAT--G-C
gi|110145                     :           GT-CAATTGG--GAA-AAA--C-A-A---TT---C-----T-G--T-GTTTTATTTTATA-AAA-G-AT---T-TTA-A--TT-TC----AA-CA-T-TT--CT-A---CA------TAA-TT----G-AAA---TTT--GACC--AT--TTG--C-C-G---AC--CTCT---G-----A--C---T--A-TT------A-CT-A-----ACT---T-T--AC-A-GA--AGAA-C-GA-C-ATGTCAAT-G----G-----A--AT--AC---A----G-CAGA-------G-CGGGTCTTAGT--G----CC-A-CATA-GG---ATC--------C------------A-ATGGA-AA----ACTC--T--AA--C-G-T-CA--G--T-TG-CAGTGAC------T--GAG-----CA--TA---A--ATT-ATGTG-AA---A------C-CGT-A-ATT----GAAAT-GT------T-A-----GG---A---AA--G---TT-C---C--A---A---CA-T-----TA-GAGGGTAAT-G------CAA--C---AAGA-CTT-C---TAGTTTTC--A-A-GCTC----A-G-AAG----T-TA-A------G---CA-T-A--T----G---G-TCAT-----AAATATG--T----TC-TTTC-ATGC-A-A-AAC--G-
gi|110146                     :           GT-CAA---GCGGAA-AGATGC-A-A---TT---C-----T-G--T-GT----------A-AAC-G-AG---T-TTA-A--TT-TTTC-AAA-CA-T-TTT-CT-AG--CA------GAA-TTGTT-G-AAA---TTT--GACC--AT--T-A--C-T-G---AC--CT-A---G-----AGTT---TG-ACTA------A-CA-A-----AGT--GT-T---G-A-AA--G--C-CTGA-C-TT----AA-T----G-----AT-GT--AC---A----G-
gi|110147                     :                A---G--GAATAAA--C-AGA---TT---C-----T-GG-C-GT----------A-AAAAG-AG---T-TCA-A--TT-TC-A-AAG-CAAT-TT--CTTATTTCA------GAA-TT-TT-G-AGAAATTTT--GACC--ATACT-G--C-T-GTACACGGTT-T---GTAGCGA--C---TG-A-T-------A-CA-A-----AATTGGT-T--ATTATGAATG--A-C-GA-C-AT----AT-G----G-----AT-GT--ACT--A----GACAGA-------GACGT-TT---AT--G----TC-AATA-G-AG---ATAACATCAATC-TC-T----C-AA-ATGGA-TAAAACATTC--T--AG--A-G-T-CAG-T--TTGG-G-ATGA----------G-GAGCATCT--TAT--ACTGTT-A-GTG-AAGGAA------CGTGT-G-ATTTTG-AAGTG-TT------T-A-AA--GA---T---AA-GGAGCTT-T---CAGA---AT--CA-ATAGGAGG-GAGGG---C-GAGCTGGCAAA-C--AGAGT-CCTAT-G-TAG-TGACTAA-A-GCTC----AAG-AAG--AAT-GGCA------GC-GTA-T-G--G----GTGTG-TCAT---A-AAATA-GATT----GC--TTT-G-GC-A-A-AA
gi|110148                     :                                                                                                     AA-TA-T-GT--AT-G---CG------GAG-TT-TT-C-TAA---TTT--GATC--GT--T-A--C-T-G---AC--CT-T---G-----A--C---TG-A-TA------A-CA-A-----AAT--GT-T--AA-A-CA--G--A-C-GA-C-TT----AT-G----G-----AT-GT--AC---A----A-TAGA-------G-C
gi|110149                     :                                                  ttttgatacaaaagttttgtttgtgagaat---T-TTACA--TTATT-C-AAT-CA-C-TTAATC-A---CAT-----GAA-TT-TT-G-AAA---TTTT-GACCGCAT--T-AGAC-TAG---AG--CT-T---GT----A--T---TG-A-TATCATCAA-CA-ATCACTGAT--TT-C--GG-A-CA--G--A-CTGA-C-TT----TT-GC---GCTTTTGT-GT--AC---ACGTAG-CGGGAGGCCGAG-CGT-GC---GTTCG----CCGA-TG-A-AG---ATG--------C-T--TGCCTC-AC-ATGAA-TC---TGCTCGCT--AATAC-G-T-CAGCG--A-GGAC-GTTAGTGTATTT--G-G-----AT--TATCAAC-GTTGA-GTA-TA---AGTAACTC-CGT-ATATTTTATGAGAG-GT------TTACTGC-GG---ATATAG-AG---TT-CACGCAGATATATCTCA-C----GGG-ACGAG---TTG------CAA--C--GAAGA-TAT-C-GATAG-TGGC--T-T-GATCCGCAA-G-AAG--AAT-GACA------GC-TCATT-G--GGC--G---G-TCTT---A-AAATG-G--TTGACGT-CTTT-G-GA-ATA-AAT--G-CAAT-CG-GTT
gi|110150                     :                                                                                                                                                          C--AT--T-G--C-T-G---AC--TT-T---G-----A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--GT-A-GA--G--A-C-GA-T-GT----AT-G----G-----AT-GTAGAC---A----A-CA---------G-CGG-GT---AT--A----CC-A-TA-G-GG---ATG--------C-T--T----C-AA-ATGGA-TA---TGCTC--C--AA--C-G-T-CAG-C--T-GG-C-ATGA-------G--G-G-----CA--TA---GC-GTT-A-CTG-AA---A------C-TTT-A-ATT----GAAAG-GT------T-A-TA--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGT---A---CA-C----AAG-GAGGG---T-A------GAA--C--AAAGA-CCT-C-G-TAG-TGGC--A-A-GCGC----A-G-AAA--AAT-GGCA------GC-TCA-T-G--G----G---G-TCCT---A-AAATA-G--T----GT-TTTT-G-GC-A-A-AAC--G-CATT-TG-GTTC--AT-TTCT-GCCG
gi|110151                     :                                                                                                                                                                                                                                                                        ----G-----AT-GT--AC---A----G-CAGA-------G-CGG-TA---GT--G----CT-A-TA-A-AG---ATG--------C-T--T----C-AA-AT
gi|110152                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                           ---A----G-CAGG-------G-CGG-TC---TT--G----TC-A-TC-A-AG---ATG--------C-T--T----C-AA-ATGCA-TA---TGCTC--C--AA--C-G-T-CAC-G--T-GG-C-GTGA-------A--G-G-----TT--TA---AC-GTC-A-GTG-AA---A------T-CAT-A-ATT----GAAAG-GT------T-A-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA---A---CA-C----AGG-GAGGG---T-G------CAA--C--AAAGA-CCT-C-C-TAG-TGGC--A-A-GCTC----A-G-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-T-A--G----G---G-GAAT---A-AAATA-G--T----GC-TGTT-G-AC-A-A-AAC--G-AAAT-CG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110153                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          C-ATT-A-GTA-AA---A------C-CGT-A-ATT-----------T------T-G---------------A-GG---T--C---CAGA---A---CA-C----AGG-GAGGG---T-G------CAA--T--GAAGA-CAT-T-G-TAG-TGGT--A-A-TCGC----A-G-AAG--AAT-GACA------GC-TCC-T-G--G----GC--G-TCCT---A-AAATG-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAC--G-CAAT-CG-GTTG--AT-CTCT-GCTG
gi|110154                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGA---A---CA-C----AGG-GAAGG---T-G------CAA--C--AAAGA-CCT-C-C-TAG-TGCC--A-
gi|110155                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -G-AAG--AAT-TACA------GC-TCA-T-G--G----G---GGTCAT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAC--G-CATT-TG-GTTC--AT-CACT-GCTG





Alignments
lowQualScore                  :             1   444 22   1   33 3 1 444  444 44444 1 55 1 6666666666  1   333 4444 1   1 55  1 1  1 3333  1 1 3 1  33 1  444  777777   1  3  3 1   666   55    22 1 22  22 1 4 1  3333  1 88888 3 444444  1 3  444444 1  1 55555   22  1 77777 1  44  3 3  1 55 5555  1 6666 55555  1  22  444 4444 1   1 5555555  1  1  222  22 3333  3  77 1  222   55555555 1 8888 1 1  1   1 1 222     22 44 22 22 1 1 1 1  66 22   3     9999999999 6666666  22 222 1  1   1 3   1 222 1 99999999    1  3333 2 22  1 666 444444  3  33  222 222  1  666  1 222    1 77777  6666    1     666 33  33333  22 444    1   1 555   3    22 1 1  3 6666  1   22   1    444444  1   999 33 5555 555 3  1 444 1     3 22 3333  3    1 1  1 1 1   22 1  1 1  3    22  22   1    
lowQualScore                  :             .   ... ..   .   .. . . ...  ... ..... . .. . ..........  .   ... .... .   . ..  . .  . ....  . . . .  .. .  ...  ......   .  .  . .   ...   ..    .. . ..  .. . . .  ....  . ..... . ......  . .  ...... .  . .....   ..  . ..... .  ..  . .  . .. ....  . .... .....  .  ..  ... .... .   . .......  .  .  ...  .. ....  .  .. .  ...   ........ . .... . .  .   . . ...     .. .. .. .. . . . .  .. ..   .     .......... .......  .. ... .  .   . .   . ... . ........    .  .... . ..  . ... ......  .  ..  ... ...  .  ...  . ...    . .....  ....    .     ... ..  .....  .. ...    .   . ...   .    .. . .  . ....  .   ..   .    ......  .   ... .. .... ... .  . ... .     . .. ....  .    . .  . . .   .. .  . .  .    ..  ..   .    
lowQualScore                  :             7   444 22   6   88 2 6 444  444 00000 6 44 6 7777777777  5   555 1111 5   5 66  5 5  5 1111  5 5 1 5  77 5  222  555555   5  1  1 5   333   22    11 5 11  11 5 6 5  3333  5 11111 1 222222  5 1  444444 5  5 44444   11  5 88888 5  22  1 1  6 44 0000  6 3333 44444  5  11  111 6666 5   5 0000000  5  6  888  22 4444  2  88 6  888   88888888 6 8888 6 6  6   0 7 999     33 00 33 33 7 7 7 7  55 33   3     2222222222 9999999  33 999 7  6   6 2   6 888 6 33333333    6  4444 6 66  6 000 666666  2  88  888 888  6  000  6 888    5 55555  3333    5     333 77  88888  11 888    5   5 222   1    11 5 6  6 6666  5   11   5    444444  5   888 77 4444 888 1  5 222 5     2 22 4444  2    6 6  6 6 6   33 7  0 8  6    66  11   9    
consensus                     : AATTATAGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AG---T-TTA-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TT--C-TA---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TG--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-NA-GA--GA-C-GA-C-AT----AT-G----G-----AT-GT--AC---A----G-CAG-G-------GC-GG-TC---GT--G----CC-AT-NA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGGA-T---ATGCT--C--C--A--A-C-G-T-CAG-G--TGG-CGTGA-------T--G-G-----TT--T---A-AC-GTT-A-GTG-A---A-A------C-CGTA-AT----TNAG-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA-A-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--GAAGA-CCT-C-G-TAG-TGGC--A-A-GCTC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-T-G--G----G---G-TCNT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAC--G-CANT-CG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
Reference ( family-593 )      : AATTATAGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AG---T-TTA-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TT--C-TA---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TG--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-NA-GA--GA-C-GA-C-AT----AT-G----G-----AT-GT--AC---A----G-CAG-G-------GC-GG-TC---GT--G----CC-AT-NA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGGA-T---ATGCT--C--C--A--A-C-G-T-CAG-G--TGG-CGTGA-------T--G-G-----TT--T---A-AC-GTT-A-GTG-A---A-A------C-CGTA-AT----TNAG-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA-A-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--GAAGA-CCT-C-G-TAG-TGGC--A-A-GCTC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-T-G--G----G---G-TCNT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAC--G-CANT-CG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110123                     : AATTATAGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TT---T-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AC---G-TTA-A--CT-C-TA-A----AA-C-A-T-TG--C-TA---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TG--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-CA-AA--GA-C-GA-C-AT----AT-G----G-----AT-GT--AC---A----G-CAG-G-------GC-GG-TC---GT--G----CC-AT-CA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGCA-T---ATGCT--C--C--A--A-C-G-T-CAC-G--TGG-CGTGA-------T--G-G-----TT--T---A-AC-GCA-A-GTG-A---A-A------C-CATA-AT----TAAT-TG-G---C------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA-A-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--AAAGA-CCC-C-C-TAG-TGGC--A-A-GCTC----AG-AAG--AAT-GACA------GT-TCA-T-G--G----G---G-TCAT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-CC-A-A-AAC--G-CATT-TG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110124                     : AATTATAGTTGT-GAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAG-G-AC---T-TTA-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TG--C-TA---CA------GAG-TT-CT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TG--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-A-TG------A-TA-A-----AAT--GT-T--T-CA-GA--GA-C-AA-C-AT----AT-G----G-----GT-GT--AC---A----G-GAG-G-------GC-GG-TC---GT--G----CC-AT-CA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGCA-T---TAGCT--C--C--T--A-A-G-T-CAC-G--TAG-CGTGG-------T--G-G-----TT--T---A-AC-GCC-A-GTG-A---A-A------T-CATA-AT----CAAA-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA-A-----CA----CAGG-AAGGG---T--GC-----AA--C--AAAGA-CCT-C-C-TAG-TGGC--A-A-GCTC----AG-TAG--AAT-GACA------GC-TCA-T-G--G----G---GATCAT---A-AAAAA-G--T----GC-TTTT-G-AC-A-A-AAC--G-AAAT-TG-GTTA--AT-CTCT-GCTG
gi|110125                     : AATTATTGTGGT-CAA---G--GAA-AAG--A-A-A----T---C-----T-GT-T-G----------TA-AAA-T-AT---T-TTA-A--TT-G-TC-A----AA-C-A-A-TT--C-TA---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TG--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TA-A-TG------C-CA-A-----AAT--GT-T--A-AT-GA--GA-C-GA-C-AG----AT-A----G-----AT-GT--AC---A----G-GAA-G-------GC-GG-TC---GT--G----CC-AT-CA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGCA-T---ATGCT--C--T--A--A-C-G-T-CAC-G--TGG-CGTGA-------T--G-G-----CT--T---A-AT-GTC-A-ATG-A---A-A------T-CATA-AT----TAAA-AG-G---TTACATGTA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA-A------A----CAGG-AAGGG---T--GC-----AA--C--AAAGA-CCT-C-C-TAG-TGAC--A-A-GCTC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-T-GA-G----G---G-TCAT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAC--G-CATT-TG-GTTC--AT-TTCT-GCTG
gi|110126                     : AATTATAGTGGT-CCA---G--GAA-AGA--T-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AT---T-TTA-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-C-TT--T-TA---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--T-T--TG--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-CA-GA--GG-C-GA-C-AT----AT-G----G-----AT-GT--AC---A----G-CAG-A-------GC-GG-TA---GT--A----CC-AT-CA-AG---ATT--------C-T----T-C-AA-ATGCA-T---ATGCT--C--C--A--A-C-G-T-CAC-G--CGG-CGTGG-------T--G-G-----TT--T---A-AC-CTC-A-GCG-A---A-A------T-CGTA-AT----TAAA-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CTCA-A-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--AAAGA-CCT-C-C-TAG-TTGC--ACA-GCTC----AT-AAC--AAT-GACA------GC-TCA-TCG--G----G---G-TAAT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAC--A-AAAT-CC-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110127                     : AATTTTAGTGGT-CAA---G--AAA-AAA--C-A-A---TT---T-----T-G--T-G----------TA-ATA-G-AC---A-TTC-A--TT-T-TC-A----AG-C-A-T-TG--C-TA---CA------GAG-TT-TT-T-AAA---TTT--GATC--A-T--TG--C-T-G-AC----AT-T-----G-A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-CA-CA--TA-C-GA-C-AT----AT-G----T-----AT-GT--AC---A----A-CAG-G-------GC-GG-TC---GT--C----CC-AT-CA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGGA-T---ATGTT--C--C--A--A-C-G-T-CAC-G--TGG-CGTTA-------T--G-G-----TT--T---A-AC-GTC-A-TTG-A---A-A------T-CGTA-AG----TATA-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TTCC---CAGA-T-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--AAGGA-CCT-C-C-TAG-TGGC--A-A-ACTC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCATT-G--G----G---G-TCAT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-A-GC-T-A-AAC--A-AAAT-CG-ATTA--AT-CTCT-GCTG
gi|110128                     : AATTATAGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TT---C-----T-A--T-G----------TA-AAA-------------------------A----CA-C-A-T-TT--C-TA---CA------GAA-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TG--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-CA-GA--GA-C-GG-C-AT----AT-G----G-----AT-AT--AC---A----G-AAG-G-------AG-AG-TC---GT--G----CC-AT-CA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATTCA-T---ATGCT--C--C--A--A-C-G-T-CAC-A--TGG-CGTGA-------T--G-G-----AT--T---A-AC-GTC-A-GTG-A---A-A------T-CGTA-AT----GAAA-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-AA---TT-C---CAGA-A-----CA----AAGG-GAAGG---T--GC-----AG--C--AAAGA-CCT-C-C-TAG-TGGC--A-A-GCTC----AG-AAG--AAT-GACA------AC-CCA-TGG--G----G---G-TAAT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-G-AAC--G-CATT-TG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110129                     :   TTATGGTAGT-CGA---G--GAA-AAT--T-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AG---T-TTA-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TT--C-TA---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GAAC--A-T--TA--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--T---TG-A-TA------A-CA-A-----AAT--GT-T--G-AA-AA--TA-C-GA-C-TT----AT-T----G-----AT-GT--AC---A----G-TAG-A-------GC-GG-TC---AT--G----CC-AT-AA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGGA-T---ATGCG--C--C--A--A-C-G-T-CAG-G--TAG-CGTGA-------T--G-A-----TT--T---A-AC-ATT-A-GTA-A---A-A------C-CGTA-AT----TTAG-AT-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C--------------------CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--GATGA-CCT-C-G-TAG-TGGC--A-A-TCGC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCATT-G--G----G---G-TCCT---A-AA
gi|110130                     :   TTATAGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-ACAATT---C-------G--C-G----------TA-AAA-T-AC---T-TTA-A--TT-T-TC-A----AA-T-A-T-TT--C-TA---CA------TAG-TT-TT-GAAAA---TTT--GACT--A-T--TG--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-A-TA------A-CA-A-----AAA--AT-T--A-CA-GA--GA-T-GA-C-ATG---AT-G----GA----AT-GT--AC---A----G-C-T-G-------GC-GG-TC---GT--G----TC-AT-TA-AT---A-A--------C-T----T-C-AA-ATGTA-T---ATGCT--CTGC--A--A-C-A-T-CAC-A--GGG-TGTGA-------T--G-C-----CT--T---A-AC-GTT-A-GTG-G---A-A------A-TGTA-AA----TGAA-AA-GT--T------TATTG--GG---A---AA-GG---TT-C---CGGA-A-----CAC---CAGG-GAGGG---T--CC-----AT--CA-AAAGA-CCT-C-C-TAT-TGGC--A-A-GCTTA---AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-TCG--G----A---C-TCAT---A-AGATA-G--T----GT-GTTT-T-GC-A-A-AACGAG-CAAT-CGTTTTT--AT-CTCT-
gi|110131                     :   TTATGGTGGT-CAA---G--GAC-AAT--C-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AC---A-TTC-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TC--C-TA---TA------GAA-TT-TT-G-AAA---CTT--GATC--A-T--TG--T-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-G-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-TA-GA--G--C-GA-C-AT----AA-T----G-----ATAGT--AC---A----A-CAG-A-------GC-GGTTT---GT--G----CC-AT--A-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGGA-T---ATGCT--C--C--A--A-T-GTT-CAG-T--TGG-CGT-A-------G--G-G-----CT--------AC-GTT-A-GTG-A---A-A--------CGTA-AT----TGAA-AA-G---T------TC-TT--GG---A---AA-GGT--TT-C---CAGA-A-----CAG---CAGG-GAGGG---T--G------GA--C--G--GA-CCT-C-G-AAG-TG----A-A-GCTC----AG-A----AAT-GGAA------GC-TCA-T-G--G----G---G-GACC---A-AACAA-G--T----GCTTTTT-G-AC-C-A-AAC--A-CATT-T--GTTCATAT-CTCT-
gi|110132                     :   TTATGGTGGA-CAA-----------AT--C-A-A---TT---T-----T-G--T-T----------TA-AAA-G-AC---T-TTA-AAATT-T-TC-A----AAAC-A-T-TT--C-TA---CA------GAA-TT-TT-G-AAA---TTT--GGC---A-T--TG--C-TTG-AC----CT-------G-A------TG-A-TG------A----A-----CAT--GT-T--A-CA-GA--GAAC-GA-CCAT----AT-G----G-----AT-GC--AC---AA---G-CAG-G--------C-G--TC---GT--A----CC-AT-AG-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGGA-C----TGCT--C--C--A--AAT-G-T-CAG-AGCTGG-CATGA-------A--G-G-----CT--T---A-GC-TTT-A-GTG-A---A-A------A-CGTA-AT----TTAG-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GGT--TT-C---CAAG-A-----CA----CAAG-AAGGG---T--GG-----AA--C--AAAGACCCT-C-G-TAGTTGGC--A-G-G--C----AGAAAG--GTT-GGCA------GC-TCA-G-G--G----G---T-TCCTA--A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-ACC--G---TT-TG-GTTC--ATACTCT-
gi|110133                     :   TTATGGTGGT-CAA---A--GGA-AAA--C-A-AA--TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AGGTTT-TCA-G--AT-T-TC-A----AA-C-A-T-------------G------GAG-T-------------------------------------G-AC----CT-T-----G-A------TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-TT-A-CA-GA--GA-C-GATC-AT----AT-G----------AT-GT--AC---A----G-CAG-A-------TC-G--TC---GT--G----CT-AT-ATTAG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGGA-T---ATG-----------------G-C-C----------TGTGA-------G--G-A-----TT--A---A-AC-GTT-A-GTA-A---A-A------C-CGTA-AT----TTAGGAG-G---T------TA-TG--GG---A---A--GG---TT-C---CAGA-A-----CA----CAGG-GAGGGGC-T--GC-----AG--C--GAATA-CTT-T-G--AG-TGG---A-A-TCGC----AG-AAG--AAT-GGCA------GC-TTACT-G--G----GC--G-TCCT---GTAAATG-G--T----GC-TTTTGG-GC-A-A-AAC--G-CAAT-CG-GTTG--AT--TCT-ACCG
gi|110134                     :   TTATGGCGGT-CAA---G--GAA-AAA------A---TT---C-----G-A--TCG----------TA-AAA---AG---T-T-A-AGGTT-T-CC-A----AA-C-A-T-TT--C-TA---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TA--CGT-G-A-----CT-T-----G-A--T---TG-A-TA------A-CA-A-----AAT--GT-TTGA-AA-AG--GA-C-
gi|110135                     :   TTATGGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AG---T-TTA-A--TT-T-TC-A----A
gi|110136                     :    TATAGTGGT-CAG---G--AAA-AAA--CCA-A---TT---C-----C-GCTT-A----------TA-AAA-ATAC---TGTTA-A--TT-T-TC-A----AA-T-AGT-TT--C-TA---CA------TAG-TT-TTTG-AAA---TTT--GACA--A-T--TG----T-G-AC----CT-TA----G-A--C---TG-ACTG------A-CA-A-----ATT--TT-TTCA-CA-AA--GATC-GA-C-AT----AT-GC---G-----AT-GT--GC---A----G-CAT-G-------GT-GG-TC---GT--------C-AT-CA-AT---ATG--------C-TCT--T-C-AATATGCACT---ATGCT--C--C--A--A-G-G-T-CAC-G--TTG-CGTGAT------T--G-G-----CC--T---A-AC-ATT-C-GTG-A---A-A------T-CGTT-AT----TAAA-AGTT---T------TA-TGGCGG---A---AAGGG---TT-C---CGGA-A-----CA----CA-G-GAGGG---T--CC-----AT--CCAAAAGA-CCT-CTC-TAT-TGGC--A-T-GAAT----AG-AAG--AAT-GACA-------T-TCATT-GACG----G---G-TCAT---A-AAA-A-G--T----GG-TTTT-G-GCAA-A-AAC--GAGAATACGTGTTC--AT-ATCT-GCTG
gi|110137                     :      TAGTGGT-CAAA--G--GAA-AAA--C-A-G---TT---A-------G--T-A----------TA-AAA-G-AG---T---A-A--TT-T--C-A----AA-C-A-T-TT--C-TA---CAGAAAGTGAA-TTATT-G-AAA---TTT--
gi|110138                     :       AGTGGT-CA----G--GAA-AAA--C-A-A---TTG--C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AG---T-T-A-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TTT-C-TA---CAA-----GAA-TT-TT-G-AAAAT-TTT--GACC--A-T--TA--C-T-G-AC----CT-T-----GTA--T---TG-A-TA------A-CA-A-----AAT--GT-T--G-GA-AA--GA-T-GA-C-TT----AT-G----G-----AT-GT--AC---A----G-TAG-A-------GC-GG-TC---GT--G----CC-AT-AA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGAA-T---ATGCG--C--T--A--A-C-G-T-CAG-G--AGG-CGTGA-------T--G-A-----TT--T---A-AC-GTT-A-GTA-A---A-AA-----C-CGTA-AT----TTAG-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA-A-----CA----CAGG-GAAGG---T--GC-----AA--C--GAAGA-TAT-C-G-TAG-TGGC--T-A-TCGC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-T-G--G----G---G-TCTT---A-AAATG-G--T----GA-TTTT-G-GC-A-A-AAT--G-CAAT-CG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110139                     :       AGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TTAAACAATTAT-G--T-G----------TA-AAA---AG---T-TAA-T--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TT--C-TA---CA------TAA-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TG--T-T-G-AC----CT-T-----A-A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-CA-GA--G--C-GA-C-TT----AT-G----G-----AC-GT--AC---A----G-CAG-A-------GC-GG-TT---GT-------CC-AT-AA-AG---A-G--------C------T-C-AA-AT-GA-T----TGCT--C--C--A--T-C-G-T-CAA-G--T-G-CGTGA-------T--G-G-----TT--T---A-AC-GTT-A-GTG-A---A-A------C-CGTA-AT----TGA--AA-G---T------TA-T---GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA-A-----CA----TAAG-GAGGG---T--GC-----AA--C--AAAGA-CCT-C-G-TAG-T-GC--A-A-GCTA----AG-AAG--AATCAACA------GC-TCA-A-T--G----G---G-TCCT---A-AAATA-G--T----GC-TATT-G-GC-A-A-AAC--G-CATT-T--GTTC--AC-CTTT-GCTG
gi|110140                     :       AGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-C-A---TT---A-----TGG--T-G----------T--AAA-G-AG---T-TTA-T--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TT--C-TA---CA------GAA-TT-TT-G-AAAT--TTT--GACC--A-T--TA--C-T-G-A------T-T-----G-A--T---TG-A-TA------A-C--A-----AAT--GT-T--G-AA-AA--G--C--A-C-TT----AT-A----G-----AT-GT--AC---A----G-TAG-A-------GC-GG-TA---GT--G----TC-AT-AA-AG---ATG--------C-TG---T-C-AA-ATGGA-T---ATGGC--G--C--A--A-CAG-T-CAG-G--TGG-CGTGA-------T--G-A-----TT--T---A-AC-GTA-A-GT--A---A-A------C-CGTA-AT----T-AG-AG-G---T------TA-TA--GG---A---AA-GG---TT-G---CAGA-A-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--GAAGA--CT-C-G-TAG-TGGC--A-A-TCGC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-TCG--G----G---G-T--T---A-AAATG-G--T----GC-TTTT-G-GC---A-AAT--G-AAAT-C--GTTC--AT--TCT-GCTG
gi|110141                     :        GTGGT-CAA---A--GAA-AAA--TTA-A---T------------G--T-G----------TACAAA-G-AG---T-TTA-T--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-T---C-TA---CA------GA--TT-TT-G-AAA---TTTT-GACC--A-T--TA--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--T---TG-A-TA------A--A-C-----AAT--GT-T--G-AA-AA--GA-C-GA-C-TT----AT-G----G-----AT-GC--AC---A----G-TAG-A-------GC-GG-TA---GT--G----TC-AT--A-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGAT-T---ATGC------C--A--A-C-G-T-GAG-G--TG--CGTGA-------T--A-------TT--T---A-AC-GTT-A-GTA-A---ATA------A-CGTA-AT----TTAG-AG-G---T------TA-TG--GG---A---TA-TG---TT-G---CAGA-A-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--A--GAAGA-CCC-C-G-TAG-TGGC--A-A-TCGC----AA-TAG--AAT-GACA------GC-TCA-TGG--G----G---G-TCCT---A-AAATG-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAT--G-CAAT-CG-GTTC--AT-TTCT-GCTG
gi|110142                     :        GTGGT-CAA---G--GAA-AAAA-T-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-GGAC---T-TTA-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TT--C-TA------------AG-GC-AT-G-AAG---TTT--GACC----T--TG--C-T-G--C----CT-T-----G-A--C---TGAA-TG------A-CA-AC----AAT--GT-T--A-GA-GA--GG-C-GA-C-AT----AT------G-----AT-GT--AC---A----G---A-G-------AC-GG-TT---GT--G----CA-A---A-GG---ATA--------C-T----TGA-AA-ATGGA-T---ATGCT--CA-C--A--A-C-G-G-CA--G--TGGCCGTGA-------T--G-G-----TT--T---A-AC-GTT-ATGTGAA---A-A------C-CG-A-AT----TA---AC-G---T------TA-TG--GG---A---AA--G---TT-C---CAGA-AAT---CA----CAGA-GAGGG---T--GC-----AAACC--AAAGA-CCT---G-T-G-TGGC--A-A-GC-C----AG-AAG--AAT-AACA------GC-TCA-TGG--G----G---G-TCCC---T-AAATA-G--T----GT-TTCT---GC-A-A-AAC----CATT-TA-GTTA--AC-ATTT-GCTG
gi|110143                     :        GTGGT-CAA---G--GAA-AA---C-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AG---T-TT--A--TT-T-TCAA----AA-C-A-T-TT--C-TA---CA------GAATTT-TT-G-AAC---TTT--GACC--A-T--TA--C-TAG-AC----CT-TAAA--G-A--T---TG---TA------AGCA-A-----AAT--GTGTG-A-AA-CA--GA-T-GA-T--T----ATGG----G-----AT-G---ACGTGA----G--AG-G-------GT--A-TC---GT--A-----C-AT--A-AG---ATG--------CTT----T-C-AA-ATGAA-T---ATGCG--C--------A-C-G-T-CAG-G--TGG--GTGA-------T--GAA-----TT--T---A-AC-GTT-A-GTA-A---A-A--------CGT--AT----TTAG-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C-----GA-A-----CA----CAGGTGAGGG---TG-GC-----AA--C--GATAA-TCT---G-TAG-TGGC--T-A-TCGC----AG-AAGAAAAT-GACA------GCTTCA-T-A--G----G---G-TCTT------AATA-G--T----GT-ATTT-G-GC-A-A-AAT--G-CTTC-TG-GTAC--AT-TACTAGCTG
gi|110144                     :         TGGTTCAA---G--GAA-AAA--C-A-A---CT---A-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AG---T-TTA-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-TGTT--C-TA---TG------GAG-TT-TTCG-AAA---TTTTTGACC--A-T--TA--C-T-G-AC----CT-T-----T-G--TATTTG-A-TA------A-CATA-----AAT--GT-T--G-AA-AA--GA-C-GA-C--------T-GAAAAG-----AT-GT--AC---A----G-CAG-A-------GC-AG-GT---AT--GAAGCCT-AT-GA-AAGAAATG--------C-T----T-CCAA-ATGGA-----ATGCT--C--TCAA--A-C-G-TTCAG-G--TGG-CGTGA-------TTTG-ACC---TTAAT---A-AC-GTT-A-GTA-A---A-A------C-CGGA-AT----TTAG-AA-G---T------TA-TG--AGGAAA---AA-GG---TT-C---CAGA-A-----AA----CAAG-GGGGA---T--GC-----AA--C--GAAGA-CCT-C-A-TAG-TGGC--A-ATG--C----AG-AAG--AAT-AATGAATAGCGC-TCA-T-G--GTCACG---G-TCCTTACA-AATTGCG--T----GCTTTTT-G-AC-A-ACAAT--G-C
gi|110145                     :           GT-CAATTGG--GAA-AAA--C-A-A---TT---C-----T-G--T-GTTTTATTTTATA-AAA-G-AT---T-TTA-A--TT-T-C-------AA-C-A-T-TT--C-TA---CA------TAA----TT-G-AAA---TTT--GACC--ATT--TG--C-C-G-AC----CTCT-----G-A--C---T--A-TT------A-CT-A-----ACT---T-T--A-CA-GAAGAA-C-GA-C-ATGTCAAT-G----G-----A--AT--AC---A----G-CAG-A-------GCGGG-TCTTAGT--G----CC-ACATA-GG---A-----------------T-C-CA-ATGGA-----AAACT--C--T--A--A-C-G-T-CAG-T--TGC-AGTGAC------T--GAG-----CA--T---A-A--ATT-ATGTG-A---A-A------C-CGTA-AT----TGAA-AT-G---T------TA-----GG---A---AA--G---TT-C---C--A-A-----CA----T-TA-GAGGGTAAT--GC-----AA--C---AAGA-CTT-C---TAGTTTTC--A-A-GCTC----AG-AAG----T-TA-A------G---CA-T-A--T----G---G-TCAT-----AAATATG--T----TC-TTTC-ATGC-A-A-AAC--G-
gi|110146                     :           GT-CAA---GCGGAA-AGATGC-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAC-G-AG---T-TTA-AT-TT-T-TC-A----AA-C-ATT-TT--C-TAG--CA------GAA-TTGTT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TA--C-T-G-AC----CT-A-----G-AGTT---TG-ACTA------A-CA-A-----AGT--GT-T----GA-AA--GC-CTGA-C-TT----AA-T----G-----AT-GT--AC---A----G-
gi|110147                     :                A---G--GAATAAA--C-AGA---TT---C-----T-GG-C-G----------TA-AAAAG-AG---T-TCA-A--TT-T-CA-A----AG-CAA-T-TT--CTTATTTCA------GAA-TT-TT-G-AGAAATTTT--GACC--A-TACTG--C-T-GTACACGGTT-TGTAGCG-A--C---TG-A-T-------A-CA-A-----AATTGGT-T--ATTATGAATGA-C-GA-C-AT----AT-G----G-----AT-GT--ACT--A----GACAGAG-------AC-GT-TT---AT--G----TCAAT-AG-AG---ATAACATCAATC-TC---T-C-AA-ATGGA-TAAAACATT--C--T--A--G-A-G-T-CAGTT--TGG-GATGA----------G-GAGCATCT--T---ATACTGTT-A-GTG-AAGGA-A------CGTGTG-AT----TTTG-AA-GTGTT------TA-AA--GA---T---AA-GGAGCTT-T---CAGA-AT----CAATAGGAGG-GAGGG---CGAGCTGGCAAA--C--AGAGT-CCTAT-G-TAG-TGACTAA-A-GCTCA---AG-AAG--AAT-GGCA------GC-GTA-T-G--G----GTGTG-TCAT---A-AAATA-GATT----GC--TTT-G-GC-A-A-AA
gi|110148                     :                                                           ----------TA-CAA-A-AG---T-TTT-G--TT-TGTG-AGAATAA-T-A-T-GT--A-TG---CG------GAG-TT-TT-C-TAA---TTT--GATC--G-T--TA--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-A-TA------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-AA-CA--GA-C-GA-C-TT----AT-G----G-----AT-GT--AC---A----A-TAG-A-------GC-
gi|110149                     :                                                                          ttttga---T-TTACA--TTAT-TC-A----AT-C-A-C-TTAAT-CA---CAT-----GAA-TT-TT-G-AAA---TTTT-GACCGCA-T--TAGAC-TAG-AG----CT-T-----GTA--T---TG-A-TATCATCAA-CA-ATCACTGAT--TT-C--G-GA-CA--GA-CTGA-C-TT----TT-GC---GCTTTTGT-GT--AC---ACGTAG-CGG-GAGGCCGAGC-GT-GC---GTTCG----CCGAT-GA-AG---ATG--------C-TTGCCT-C-AC-ATGAA-T---CTGCTCGC--T--AATA-C-G-T-CAGCG--AGGACGTTAGTGTATTT--G-G-----AT--TATCA-AC-GTTGA-GTA-T---A-AGTAACTC-CGTATATTTTATGAG-AG-GT--T------TACTGC-GG---ATATAG-AG---TT-CACGCAGATATATCTCA----CGGG-ACGAGT--T--GC-----AA--C--GAAGA-TAT-C-GATAG-TGGC--T-T-GATCCGCAAG-AAG--AAT-GACA------GC-TCATT-G--GGC--G---G-TCTT---A-AAATG-G--TTGACGT-CTTT-G-GA-ATA-AAT--G-CAAT-CG-GTT
gi|110150                     :                                                                                                                                                               C--A-T--TG--C-T-G-AC----TT-T-----G-A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--G-TA-GA--GA-C-GA-T-GT----AT-G----G-----AT-GTAGAC---A----A-CA----------GC-GG-GT---AT--A----CC-AT-AG-GG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGGA-T---ATGCT--C--C--A--A-C-G-T-CAG-C--TGG-CATGA-------G--G-G-----CA--T---A-GC-GTT-A-CTG-A---A-A------C-TTTA-AT----TGAA-AG-G---T------TA-TA--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGT-A-----CA----CAAG-GAGGG---T--AG-----AA--C--AAAGA-CCT-C-G-TAG-TGGC--A-A-GCGC----AG-AAA--AAT-GGCA------GC-TCA-T-G--G----G---G-TCCT---A-AAATA-G--T----GT-TTTT-G-GC-A-A-AAC--G-CATT-TG-GTTC--AT-TTCT-GCCG
gi|110151                     :                                                                                                                                                                                                                                                                         ----G-----AT-GT--AC---A----G-CAG-A-------GC-GG-TA---GT--G----CT-AT-AA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-AT
gi|110152                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                            ---A----G-CAG-G-------GC-GG-TC---TT--G----TC-AT-CA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGCA-T---ATGCT--C--C--A--A-C-G-T-CAC-G--TGG-CGTGA-------A--G-G-----TT--T---A-AC-GTC-A-GTG-A---A-A------T-CATA-AT----TGAA-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA-A-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--AAAGA-CCT-C-C-TAG-TGGC--A-A-GCTC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-T-A--G----G---G-GAAT---A-AAATA-G--T----GC-TGTT-G-AC-A-A-AAC--G-AAAT-CG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110153                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            C-ATT-A-GTA-A---A-A------C-CGTA-AT----TTTG-AG-G---T---------------------------------C---CAGA-A-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--T--GAAGA-CAT-T-G-TAG-TGGT--A-A-TCGC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCC-T-G--G----GC--G-TCCT---A-AAATG-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAC--G-CAAT-CG-GTTG--AT-CTCT-GCTG
gi|110154                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGA-A-----CA----CAGG-GAAGG---T--GC-----AA--C--AAAGA-CCT-C-C-TAG-TGCC--A-
gi|110155                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        G-AAG--AAT-TACA------GC-TCA-T-G--G----G---GGTCAT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAC--G-CATT-TG-GTTC--AT-CACT-GCTG





Alignments
lowQualScore                  :             1   444 22   1   33 3 1 444  444 44444 1 55 1 6666666666  1   333 4444 1   1 55  1 1  1 3333  1 1 3 1  33 1  444  777777   1  3  3 1   666   55    22 1 22  22 1 4 1  3333  1 88888 3 444444  1 3  444444 1  1 55555   22  1 77777 1  44  3 3  1 55 5555  1 6666 55555  1  22  444 4444 1   1 5555555  1  1  222  22 3333  3  77 1  222   55555555 1 8888 1 1  1   1 1 222     22 44 22 22 1 1 1 1  66 22   3     9999999999 6666666  22 222 1  1   1 3   1 222 1 99999999    1  3333 2 22  1 666 444444  3  33  222 222  1  666  1 222    1 77777  6666    1     666 33  33333  22 444    1   1 555   3    22 1 1  3 6666  1   22   1    444444  1   999 33 5555 555 3  1 444 1     3 22 3333  3    1 1  1 1 1   22 1  1 1  3    22  22   1    
lowQualScore                  :             .   ... ..   .   .. . . ...  ... ..... . .. . ..........  .   ... .... .   . ..  . .  . ....  . . . .  .. .  ...  ......   .  .  . .   ...   ..    .. . ..  .. . . .  ....  . ..... . ......  . .  ...... .  . .....   ..  . ..... .  ..  . .  . .. ....  . .... .....  .  ..  ... .... .   . .......  .  .  ...  .. ....  .  .. .  ...   ........ . .... . .  .   . . ...     .. .. .. .. . . . .  .. ..   .     .......... .......  .. ... .  .   . .   . ... . ........    .  .... . ..  . ... ......  .  ..  ... ...  .  ...  . ...    . .....  ....    .     ... ..  .....  .. ...    .   . ...   .    .. . .  . ....  .   ..   .    ......  .   ... .. .... ... .  . ... .     . .. ....  .    . .  . . .   .. .  . .  .    ..  ..   .    
lowQualScore                  :             7   444 22   6   88 2 6 444  444 00000 6 44 6 7777777777  5   555 1111 5   5 66  5 5  5 1111  5 5 1 5  77 5  222  555555   5  1  1 5   333   22    11 5 11  11 5 6 5  3333  5 11111 1 222222  5 1  444444 5  5 44444   11  5 88888 5  22  1 1  6 44 0000  6 3333 44444  5  11  111 6666 5   5 0000000  5  6  888  22 4444  2  88 6  888   88888888 6 8888 6 6  6   0 7 999     33 00 33 33 7 7 7 7  55 33   3     2222222222 9999999  33 999 7  6   6 2   6 888 6 33333333    6  4444 6 66  6 000 666666  2  88  888 888  6  000  6 888    5 55555  3333    5     333 77  88888  11 888    5   5 222   1    11 5 6  6 6666  5   11   5    444444  5   888 77 4444 888 1  5 222 5     2 22 4444  2    6 6  6 6 6   33 7  0 8  6    66  11   9    
consensus                     : AATTATAGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AG---T-TTA-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TT--C-TA---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TG--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-NA-GA--GA-C-GA-C-AT----AT-G----G-----AT-GT--AC---A----G-CAG-G-------GC-GG-TC---GT--G----CC-AT-NA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGGA-T---ATGCT--C--C--A--A-C-G-T-CAG-G--TGG-CGTGA-------T--G-G-----TT--T---A-AC-GTT-A-GTG-A---A-A------C-CGTA-AT----TNAG-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA-A-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--GAAGA-CCT-C-G-TAG-TGGC--A-A-GCTC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-T-G--G----G---G-TCNT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAC--G-CANT-CG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
Reference ( family-593 )      : AATTATAGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AG---T-TTA-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TT--C-TA---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TG--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-NA-GA--GA-C-GA-C-AT----AT-G----G-----AT-GT--AC---A----G-CAG-G-------GC-GG-TC---GT--G----CC-AT-NA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGGA-T---ATGCT--C--C--A--A-C-G-T-CAG-G--TGG-CGTGA-------T--G-G-----TT--T---A-AC-GTT-A-GTG-A---A-A------C-CGTA-AT----TNAG-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA-A-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--GAAGA-CCT-C-G-TAG-TGGC--A-A-GCTC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-T-G--G----G---G-TCNT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAC--G-CANT-CG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110123                     : AATTATAGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TT---T-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AC---G-TTA-A--CT-C-TA-A----AA-C-A-T-TG--C-TA---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TG--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-CA-AA--GA-C-GA-C-AT----AT-G----G-----AT-GT--AC---A----G-CAG-G-------GC-GG-TC---GT--G----CC-AT-CA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGCA-T---ATGCT--C--C--A--A-C-G-T-CAC-G--TGG-CGTGA-------T--G-G-----TT--T---A-AC-GCA-A-GTG-A---A-A------C-CATA-AT----TAAT-TG-G---C------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA-A-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--AAAGA-CCC-C-C-TAG-TGGC--A-A-GCTC----AG-AAG--AAT-GACA------GT-TCA-T-G--G----G---G-TCAT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-CC-A-A-AAC--G-CATT-TG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110124                     : AATTATAGTTGT-GAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAG-G-AC---T-TTA-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TG--C-TA---CA------GAG-TT-CT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TG--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-A-TG------A-TA-A-----AAT--GT-T--T-CA-GA--GA-C-AA-C-AT----AT-G----G-----GT-GT--AC---A----G-GAG-G-------GC-GG-TC---GT--G----CC-AT-CA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGCA-T---TAGCT--C--C--T--A-A-G-T-CAC-G--TAG-CGTGG-------T--G-G-----TT--T---A-AC-GCC-A-GTG-A---A-A------T-CATA-AT----CAAA-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA-A-----CA----CAGG-AAGGG---T--GC-----AA--C--AAAGA-CCT-C-C-TAG-TGGC--A-A-GCTC----AG-TAG--AAT-GACA------GC-TCA-T-G--G----G---GATCAT---A-AAAAA-G--T----GC-TTTT-G-AC-A-A-AAC--G-AAAT-TG-GTTA--AT-CTCT-GCTG
gi|110125                     : AATTATTGTGGT-CAA---G--GAA-AAG--A-A-A----T---C-----T-GT-T-G----------TA-AAA-T-AT---T-TTA-A--TT-G-TC-A----AA-C-A-A-TT--C-TA---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TG--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TA-A-TG------C-CA-A-----AAT--GT-T--A-AT-GA--GA-C-GA-C-AG----AT-A----G-----AT-GT--AC---A----G-GAA-G-------GC-GG-TC---GT--G----CC-AT-CA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGCA-T---ATGCT--C--T--A--A-C-G-T-CAC-G--TGG-CGTGA-------T--G-G-----CT--T---A-AT-GTC-A-ATG-A---A-A------T-CATA-AT----TAAA-AG-G---TTACATGTA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA-A------A----CAGG-AAGGG---T--GC-----AA--C--AAAGA-CCT-C-C-TAG-TGAC--A-A-GCTC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-T-GA-G----G---G-TCAT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAC--G-CATT-TG-GTTC--AT-TTCT-GCTG
gi|110126                     : AATTATAGTGGT-CCA---G--GAA-AGA--T-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AT---T-TTA-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-C-TT--T-TA---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--T-T--TG--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-CA-GA--GG-C-GA-C-AT----AT-G----G-----AT-GT--AC---A----G-CAG-A-------GC-GG-TA---GT--A----CC-AT-CA-AG---ATT--------C-T----T-C-AA-ATGCA-T---ATGCT--C--C--A--A-C-G-T-CAC-G--CGG-CGTGG-------T--G-G-----TT--T---A-AC-CTC-A-GCG-A---A-A------T-CGTA-AT----TAAA-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CTCA-A-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--AAAGA-CCT-C-C-TAG-TTGC--ACA-GCTC----AT-AAC--AAT-GACA------GC-TCA-TCG--G----G---G-TAAT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAC--A-AAAT-CC-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110127                     : AATTTTAGTGGT-CAA---G--AAA-AAA--C-A-A---TT---T-----T-G--T-G----------TA-ATA-G-AC---A-TTC-A--TT-T-TC-A----AG-C-A-T-TG--C-TA---CA------GAG-TT-TT-T-AAA---TTT--GATC--A-T--TG--C-T-G-AC----AT-T-----G-A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-CA-CA--TA-C-GA-C-AT----AT-G----T-----AT-GT--AC---A----A-CAG-G-------GC-GG-TC---GT--C----CC-AT-CA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGGA-T---ATGTT--C--C--A--A-C-G-T-CAC-G--TGG-CGTTA-------T--G-G-----TT--T---A-AC-GTC-A-TTG-A---A-A------T-CGTA-AG----TATA-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TTCC---CAGA-T-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--AAGGA-CCT-C-C-TAG-TGGC--A-A-ACTC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCATT-G--G----G---G-TCAT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-A-GC-T-A-AAC--A-AAAT-CG-ATTA--AT-CTCT-GCTG
gi|110128                     : AATTATAGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TT---C-----T-A--T-G----------TA-AAA-------------------------A----CA-C-A-T-TT--C-TA---CA------GAA-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TG--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-CA-GA--GA-C-GG-C-AT----AT-G----G-----AT-AT--AC---A----G-AAG-G-------AG-AG-TC---GT--G----CC-AT-CA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATTCA-T---ATGCT--C--C--A--A-C-G-T-CAC-A--TGG-CGTGA-------T--G-G-----AT--T---A-AC-GTC-A-GTG-A---A-A------T-CGTA-AT----GAAA-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-AA---TT-C---CAGA-A-----CA----AAGG-GAAGG---T--GC-----AG--C--AAAGA-CCT-C-C-TAG-TGGC--A-A-GCTC----AG-AAG--AAT-GACA------AC-CCA-TGG--G----G---G-TAAT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-G-AAC--G-CATT-TG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110129                     :   TTATGGTAGT-CGA---G--GAA-AAT--T-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AG---T-TTA-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TT--C-TA---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GAAC--A-T--TA--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--T---TG-A-TA------A-CA-A-----AAT--GT-T--G-AA-AA--TA-C-GA-C-TT----AT-T----G-----AT-GT--AC---A----G-TAG-A-------GC-GG-TC---AT--G----CC-AT-AA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGGA-T---ATGCG--C--C--A--A-C-G-T-CAG-G--TAG-CGTGA-------T--G-A-----TT--T---A-AC-ATT-A-GTA-A---A-A------C-CGTA-AT----TTAG-AT-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C--------------------CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--GATGA-CCT-C-G-TAG-TGGC--A-A-TCGC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCATT-G--G----G---G-TCCT---A-AA
gi|110130                     :   TTATAGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-ACAATT---C-------G--C-G----------TA-AAA-T-AC---T-TTA-A--TT-T-TC-A----AA-T-A-T-TT--C-TA---CA------TAG-TT-TT-GAAAA---TTT--GACT--A-T--TG--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-A-TA------A-CA-A-----AAA--AT-T--A-CA-GA--GA-T-GA-C-ATG---AT-G----GA----AT-GT--AC---A----G-C-T-G-------GC-GG-TC---GT--G----TC-AT-TA-AT---A-A--------C-T----T-C-AA-ATGTA-T---ATGCT--CTGC--A--A-C-A-T-CAC-A--GGG-TGTGA-------T--G-C-----CT--T---A-AC-GTT-A-GTG-G---A-A------A-TGTA-AA----TGAA-AA-GT--T------TATTG--GG---A---AA-GG---TT-C---CGGA-A-----CAC---CAGG-GAGGG---T--CC-----AT--CA-AAAGA-CCT-C-C-TAT-TGGC--A-A-GCTTA---AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-TCG--G----A---C-TCAT---A-AGATA-G--T----GT-GTTT-T-GC-A-A-AACGAG-CAAT-CGTTTTT--AT-CTCT-
gi|110131                     :   TTATGGTGGT-CAA---G--GAC-AAT--C-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AC---A-TTC-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TC--C-TA---TA------GAA-TT-TT-G-AAA---CTT--GATC--A-T--TG--T-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-G-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-TA-GA--G--C-GA-C-AT----AA-T----G-----ATAGT--AC---A----A-CAG-A-------GC-GGTTT---GT--G----CC-AT--A-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGGA-T---ATGCT--C--C--A--A-T-GTT-CAG-T--TGG-CGT-A-------G--G-G-----CT--------AC-GTT-A-GTG-A---A-A--------CGTA-AT----TGAA-AA-G---T------TC-TT--GG---A---AA-GGT--TT-C---CAGA-A-----CAG---CAGG-GAGGG---T--G------GA--C--G--GA-CCT-C-G-AAG-TG----A-A-GCTC----AG-A----AAT-GGAA------GC-TCA-T-G--G----G---G-GACC---A-AACAA-G--T----GCTTTTT-G-AC-C-A-AAC--A-CATT-T--GTTCATAT-CTCT-
gi|110132                     :   TTATGGTGGA-CAA-----------AT--C-A-A---TT---T-----T-G--T-T----------TA-AAA-G-AC---T-TTA-AAATT-T-TC-A----AAAC-A-T-TT--C-TA---CA------GAA-TT-TT-G-AAA---TTT--GGC---A-T--TG--C-TTG-AC----CT-------G-A------TG-A-TG------A----A-----CAT--GT-T--A-CA-GA--GAAC-GA-CCAT----AT-G----G-----AT-GC--AC---AA---G-CAG-G--------C-G--TC---GT--A----CC-AT-AG-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGGA-C----TGCT--C--C--A--AAT-G-T-CAG-AGCTGG-CATGA-------A--G-G-----CT--T---A-GC-TTT-A-GTG-A---A-A------A-CGTA-AT----TTAG-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GGT--TT-C---CAAG-A-----CA----CAAG-AAGGG---T--GG-----AA--C--AAAGACCCT-C-G-TAGTTGGC--A-G-G--C----AGAAAG--GTT-GGCA------GC-TCA-G-G--G----G---T-TCCTA--A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-ACC--G---TT-TG-GTTC--ATACTCT-
gi|110133                     :   TTATGGTGGT-CAA---A--GGA-AAA--C-A-AA--TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AGGTTT-TCA-G--AT-T-TC-A----AA-C-A-T-------------G------GAG-T-------------------------------------G-AC----CT-T-----G-A------TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-TT-A-CA-GA--GA-C-GATC-AT----AT-G----------AT-GT--AC---A----G-CAG-A-------TC-G--TC---GT--G----CT-AT-ATTAG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGGA-T---ATG-----------------G-C-C----------TGTGA-------G--G-A-----TT--A---A-AC-GTT-A-GTA-A---A-A------C-CGTA-AT----TTAGGAG-G---T------TA-TG--GG---A---A--GG---TT-C---CAGA-A-----CA----CAGG-GAGGGGC-T--GC-----AG--C--GAATA-CTT-T-G--AG-TGG---A-A-TCGC----AG-AAG--AAT-GGCA------GC-TTACT-G--G----GC--G-TCCT---GTAAATG-G--T----GC-TTTTGG-GC-A-A-AAC--G-CAAT-CG-GTTG--AT--TCT-ACCG
gi|110134                     :   TTATGGCGGT-CAA---G--GAA-AAA------A---TT---C-----G-A--TCG----------TA-AAA---AG---T-T-A-AGGTT-T-CC-A----AA-C-A-T-TT--C-TA---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TA--CGT-G-A-----CT-T-----G-A--T---TG-A-TA------A-CA-A-----AAT--GT-TTGA-AA-AG--GA-C-
gi|110135                     :   TTATGGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AG---T-TTA-A--TT-T-TC-A----A
gi|110136                     :    TATAGTGGT-CAG---G--AAA-AAA--CCA-A---TT---C-----C-GCTT-A----------TA-AAA-ATAC---TGTTA-A--TT-T-TC-A----AA-T-AGT-TT--C-TA---CA------TAG-TT-TTTG-AAA---TTT--GACA--A-T--TG----T-G-AC----CT-TA----G-A--C---TG-ACTG------A-CA-A-----ATT--TT-TTCA-CA-AA--GATC-GA-C-AT----AT-GC---G-----AT-GT--GC---A----G-CAT-G-------GT-GG-TC---GT--------C-AT-CA-AT---ATG--------C-TCT--T-C-AATATGCACT---ATGCT--C--C--A--A-G-G-T-CAC-G--TTG-CGTGAT------T--G-G-----CC--T---A-AC-ATT-C-GTG-A---A-A------T-CGTT-AT----TAAA-AGTT---T------TA-TGGCGG---A---AAGGG---TT-C---CGGA-A-----CA----CA-G-GAGGG---T--CC-----AT--CCAAAAGA-CCT-CTC-TAT-TGGC--A-T-GAAT----AG-AAG--AAT-GACA-------T-TCATT-GACG----G---G-TCAT---A-AAA-A-G--T----GG-TTTT-G-GCAA-A-AAC--GAGAATACGTGTTC--AT-ATCT-GCTG
gi|110137                     :      TAGTGGT-CAAA--G--GAA-AAA--C-A-G---TT---A-------G--T-A----------TA-AAA-G-AG---T---A-A--TT-T--C-A----AA-C-A-T-TT--C-TA---CAGAAAGTGAA-TTATT-G-AAA---TTT--
gi|110138                     :       AGTGGT-CA----G--GAA-AAA--C-A-A---TTG--C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AG---T-T-A-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TTT-C-TA---CAA-----GAA-TT-TT-G-AAAAT-TTT--GACC--A-T--TA--C-T-G-AC----CT-T-----GTA--T---TG-A-TA------A-CA-A-----AAT--GT-T--G-GA-AA--GA-T-GA-C-TT----AT-G----G-----AT-GT--AC---A----G-TAG-A-------GC-GG-TC---GT--G----CC-AT-AA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGAA-T---ATGCG--C--T--A--A-C-G-T-CAG-G--AGG-CGTGA-------T--G-A-----TT--T---A-AC-GTT-A-GTA-A---A-AA-----C-CGTA-AT----TTAG-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA-A-----CA----CAGG-GAAGG---T--GC-----AA--C--GAAGA-TAT-C-G-TAG-TGGC--T-A-TCGC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-T-G--G----G---G-TCTT---A-AAATG-G--T----GA-TTTT-G-GC-A-A-AAT--G-CAAT-CG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110139                     :       AGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TTAAACAATTAT-G--T-G----------TA-AAA---AG---T-TAA-T--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TT--C-TA---CA------TAA-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TG--T-T-G-AC----CT-T-----A-A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-CA-GA--G--C-GA-C-TT----AT-G----G-----AC-GT--AC---A----G-CAG-A-------GC-GG-TT---GT-------CC-AT-AA-AG---A-G--------C------T-C-AA-AT-GA-T----TGCT--C--C--A--T-C-G-T-CAA-G--T-G-CGTGA-------T--G-G-----TT--T---A-AC-GTT-A-GTG-A---A-A------C-CGTA-AT----TGA--AA-G---T------TA-T---GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA-A-----CA----TAAG-GAGGG---T--GC-----AA--C--AAAGA-CCT-C-G-TAG-T-GC--A-A-GCTA----AG-AAG--AATCAACA------GC-TCA-A-T--G----G---G-TCCT---A-AAATA-G--T----GC-TATT-G-GC-A-A-AAC--G-CATT-T--GTTC--AC-CTTT-GCTG
gi|110140                     :       AGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-C-A---TT---A-----TGG--T-G----------T--AAA-G-AG---T-TTA-T--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TT--C-TA---CA------GAA-TT-TT-G-AAAT--TTT--GACC--A-T--TA--C-T-G-A------T-T-----G-A--T---TG-A-TA------A-C--A-----AAT--GT-T--G-AA-AA--G--C--A-C-TT----AT-A----G-----AT-GT--AC---A----G-TAG-A-------GC-GG-TA---GT--G----TC-AT-AA-AG---ATG--------C-TG---T-C-AA-ATGGA-T---ATGGC--G--C--A--A-CAG-T-CAG-G--TGG-CGTGA-------T--G-A-----TT--T---A-AC-GTA-A-GT--A---A-A------C-CGTA-AT----T-AG-AG-G---T------TA-TA--GG---A---AA-GG---TT-G---CAGA-A-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--GAAGA--CT-C-G-TAG-TGGC--A-A-TCGC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-TCG--G----G---G-T--T---A-AAATG-G--T----GC-TTTT-G-GC---A-AAT--G-AAAT-C--GTTC--AT--TCT-GCTG
gi|110141                     :        GTGGT-CAA---A--GAA-AAA--TTA-A---T------------G--T-G----------TACAAA-G-AG---T-TTA-T--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-T---C-TA---CA------GA--TT-TT-G-AAA---TTTT-GACC--A-T--TA--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--T---TG-A-TA------A--A-C-----AAT--GT-T--G-AA-AA--GA-C-GA-C-TT----AT-G----G-----AT-GC--AC---A----G-TAG-A-------GC-GG-TA---GT--G----TC-AT--A-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGAT-T---ATGC------C--A--A-C-G-T-GAG-G--TG--CGTGA-------T--A-------TT--T---A-AC-GTT-A-GTA-A---ATA------A-CGTA-AT----TTAG-AG-G---T------TA-TG--GG---A---TA-TG---TT-G---CAGA-A-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--A--GAAGA-CCC-C-G-TAG-TGGC--A-A-TCGC----AA-TAG--AAT-GACA------GC-TCA-TGG--G----G---G-TCCT---A-AAATG-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAT--G-CAAT-CG-GTTC--AT-TTCT-GCTG
gi|110142                     :        GTGGT-CAA---G--GAA-AAAA-T-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-GGAC---T-TTA-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TT--C-TA------------AG-GC-AT-G-AAG---TTT--GACC----T--TG--C-T-G--C----CT-T-----G-A--C---TGAA-TG------A-CA-AC----AAT--GT-T--A-GA-GA--GG-C-GA-C-AT----AT------G-----AT-GT--AC---A----G---A-G-------AC-GG-TT---GT--G----CA-A---A-GG---ATA--------C-T----TGA-AA-ATGGA-T---ATGCT--CA-C--A--A-C-G-G-CA--G--TGGCCGTGA-------T--G-G-----TT--T---A-AC-GTT-ATGTGAA---A-A------C-CG-A-AT----TA---AC-G---T------TA-TG--GG---A---AA--G---TT-C---CAGA-AAT---CA----CAGA-GAGGG---T--GC-----AAACC--AAAGA-CCT---G-T-G-TGGC--A-A-GC-C----AG-AAG--AAT-AACA------GC-TCA-TGG--G----G---G-TCCC---T-AAATA-G--T----GT-TTCT---GC-A-A-AAC----CATT-TA-GTTA--AC-ATTT-GCTG
gi|110143                     :        GTGGT-CAA---G--GAA-AA---C-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AG---T-TT--A--TT-T-TCAA----AA-C-A-T-TT--C-TA---CA------GAATTT-TT-G-AAC---TTT--GACC--A-T--TA--C-TAG-AC----CT-TAAA--G-A--T---TG---TA------AGCA-A-----AAT--GTGTG-A-AA-CA--GA-T-GA-T--T----ATGG----G-----AT-G---ACGTGA----G--AG-G-------GT--A-TC---GT--A-----C-AT--A-AG---ATG--------CTT----T-C-AA-ATGAA-T---ATGCG--C--------A-C-G-T-CAG-G--TGG--GTGA-------T--GAA-----TT--T---A-AC-GTT-A-GTA-A---A-A--------CGT--AT----TTAG-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C-----GA-A-----CA----CAGGTGAGGG---TG-GC-----AA--C--GATAA-TCT---G-TAG-TGGC--T-A-TCGC----AG-AAGAAAAT-GACA------GCTTCA-T-A--G----G---G-TCTT------AATA-G--T----GT-ATTT-G-GC-A-A-AAT--G-CTTC-TG-GTAC--AT-TACTAGCTG
gi|110144                     :         TGGTTCAA---G--GAA-AAA--C-A-A---CT---A-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AG---T-TTA-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-TGTT--C-TA---TG------GAG-TT-TTCG-AAA---TTTTTGACC--A-T--TA--C-T-G-AC----CT-T-----T-G--TATTTG-A-TA------A-CATA-----AAT--GT-T--G-AA-AA--GA-C-GA-C--------T-GAAAAG-----AT-GT--AC---A----G-CAG-A-------GC-AG-GT---AT--GAAGCCT-AT-GA-AAGAAATG--------C-T----T-CCAA-ATGGA-----ATGCT--C--TCAA--A-C-G-TTCAG-G--TGG-CGTGA-------TTTG-ACC---TTAAT---A-AC-GTT-A-GTA-A---A-A------C-CGGA-AT----TTAG-AA-G---T------TA-TG--AGGAAA---AA-GG---TT-C---CAGA-A-----AA----CAAG-GGGGA---T--GC-----AA--C--GAAGA-CCT-C-A-TAG-TGGC--A-ATG--C----AG-AAG--AAT-AATGAATAGCGC-TCA-T-G--GTCACG---G-TCCTTACA-AATTGCG--T----GCTTTTT-G-AC-A-ACAAT--G-C
gi|110145                     :           GT-CAATTGG--GAA-AAA--C-A-A---TT---C-----T-G--T-GTTTTATTTTATA-AAA-G-AT---T-TTA-A--TT-T-C-------AA-C-A-T-TT--C-TA---CA------TAA----TT-G-AAA---TTT--GACC--ATT--TG--C-C-G-AC----CTCT-----G-A--C---T--A-TT------A-CT-A-----ACT---T-T--A-CA-GAAGAA-C-GA-C-ATGTCAAT-G----G-----A--AT--AC---A----G-CAG-A-------GCGGG-TCTTAGT--G----CC-ACATA-GG---A-----------------T-C-CA-ATGGA-----AAACT--C--T--A--A-C-G-T-CAG-T--TGC-AGTGAC------T--GAG-----CA--T---A-A--ATT-ATGTG-A---A-A------C-CGTA-AT----TGAA-AT-G---T------TA-----GG---A---AA--G---TT-C---C--A-A-----CA----T-TA-GAGGGTAAT--GC-----AA--C---AAGA-CTT-C---TAGTTTTC--A-A-GCTC----AG-AAG----T-TA-A------G---CA-T-A--T----G---G-TCAT-----AAATATG--T----TC-TTTC-ATGC-A-A-AAC--G-
gi|110146                     :           GT-CAA---GCGGAA-AGATGC-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAC-G-AG---T-TTA-AT-TT-T-TC-A----AA-C-ATT-TT--C-TAG--CA------GAA-TTGTT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TA--C-T-G-AC----CT-A-----G-AGTT---TG-ACTA------A-CA-A-----AGT--GT-T----GA-AA--GC-CTGA-C-TT----AA-T----G-----AT-GT--AC---A----G-
gi|110147                     :                A---G--GAATAAA--C-AGA---TT---C-----T-GG-C-G----------TA-AAAAG-AG---T-TCA-A--TT-T-CA-A----AG-CAA-T-TT--CTTATTTCA------GAA-TT-TT-G-AGAAATTTT--GACC--A-TACTG--C-T-GTACACGGTT-TGTAGCG-A--C---TG-A-T-------A-CA-A-----AATTGGT-T--ATTATGAATGA-C-GA-C-AT----AT-G----G-----AT-GT--ACT--A----GACAGAG-------AC-GT-TT---AT--G----TCAAT-AG-AG---ATAACATCAATC-TC---T-C-AA-ATGGA-TAAAACATT--C--T--A--G-A-G-T-CAGTT--TGG-GATGA----------G-GAGCATCT--T---ATACTGTT-A-GTG-AAGGA-A------CGTGTG-AT----TTTG-AA-GTGTT------TA-AA--GA---T---AA-GGAGCTT-T---CAGA-AT----CAATAGGAGG-GAGGG---CGAGCTGGCAAA--C--AGAGT-CCTAT-G-TAG-TGACTAA-A-GCTCA---AG-AAG--AAT-GGCA------GC-GTA-T-G--G----GTGTG-TCAT---A-AAATA-GATT----GC--TTT-G-GC-A-A-AA
gi|110148                     :                                                           ----------TA-CAA-A-AG---T-TTT-G--TT-TGTG-AGAATAA-T-A-T-GT--A-TG---CG------GAG-TT-TT-C-TAA---TTT--GATC--G-T--TA--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-A-TA------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-AA-CA--GA-C-GA-C-TT----AT-G----G-----AT-GT--AC---A----A-TAG-A-------GC-
gi|110149                     :                                                                          ttttga---T-TTACA--TTAT-TC-A----AT-C-A-C-TTAAT-CA---CAT-----GAA-TT-TT-G-AAA---TTTT-GACCGCA-T--TAGAC-TAG-AG----CT-T-----GTA--T---TG-A-TATCATCAA-CA-ATCACTGAT--TT-C--G-GA-CA--GA-CTGA-C-TT----TT-GC---GCTTTTGT-GT--AC---ACGTAG-CGG-GAGGCCGAGC-GT-GC---GTTCG----CCGAT-GA-AG---ATG--------C-TTGCCT-C-AC-ATGAA-T---CTGCTCGC--T--AATA-C-G-T-CAGCG--AGGACGTTAGTGTATTT--G-G-----AT--TATCA-AC-GTTGA-GTA-T---A-AGTAACTC-CGTATATTTTATGAG-AG-GT--T------TACTGC-GG---ATATAG-AG---TT-CACGCAGATATATCTCA----CGGG-ACGAGT--T--GC-----AA--C--GAAGA-TAT-C-GATAG-TGGC--T-T-GATCCGCAAG-AAG--AAT-GACA------GC-TCATT-G--GGC--G---G-TCTT---A-AAATG-G--TTGACGT-CTTT-G-GA-ATA-AAT--G-CAAT-CG-GTT
gi|110150                     :                                                                                                                                                               C--A-T--TG--C-T-G-AC----TT-T-----G-A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--G-TA-GA--GA-C-GA-T-GT----AT-G----G-----AT-GTAGAC---A----A-CA----------GC-GG-GT---AT--A----CC-AT-AG-GG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGGA-T---ATGCT--C--C--A--A-C-G-T-CAG-C--TGG-CATGA-------G--G-G-----CA--T---A-GC-GTT-A-CTG-A---A-A------C-TTTA-AT----TGAA-AG-G---T------TA-TA--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGT-A-----CA----CAAG-GAGGG---T--AG-----AA--C--AAAGA-CCT-C-G-TAG-TGGC--A-A-GCGC----AG-AAA--AAT-GGCA------GC-TCA-T-G--G----G---G-TCCT---A-AAATA-G--T----GT-TTTT-G-GC-A-A-AAC--G-CATT-TG-GTTC--AT-TTCT-GCCG
gi|110151                     :                                                                                                                                                                                                                                                                         ----G-----AT-GT--AC---A----G-CAG-A-------GC-GG-TA---GT--G----CT-AT-AA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-AT
gi|110152                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                            ---A----G-CAG-G-------GC-GG-TC---TT--G----TC-AT-CA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGCA-T---ATGCT--C--C--A--A-C-G-T-CAC-G--TGG-CGTGA-------A--G-G-----TT--T---A-AC-GTC-A-GTG-A---A-A------T-CATA-AT----TGAA-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA-A-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--AAAGA-CCT-C-C-TAG-TGGC--A-A-GCTC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-T-A--G----G---G-GAAT---A-AAATA-G--T----GC-TGTT-G-AC-A-A-AAC--G-AAAT-CG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110153                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            C-ATT-A-GTA-A---A-A------C-CGTA-AT----TTTG-AG-G---T---------------------------------C---CAGA-A-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--T--GAAGA-CAT-T-G-TAG-TGGT--A-A-TCGC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCC-T-G--G----GC--G-TCCT---A-AAATG-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAC--G-CAAT-CG-GTTG--AT-CTCT-GCTG
gi|110154                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGA-A-----CA----CAGG-GAAGG---T--GC-----AA--C--AAAGA-CCT-C-C-TAG-TGCC--A-
gi|110155                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        G-AAG--AAT-TACA------GC-TCA-T-G--G----G---GGTCAT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAC--G-CATT-TG-GTTC--AT-CACT-GCTG


blockSeqs                     :             T   TTG CG   T   TG C G CAA  AAA AATTA G CT C TTTTATTTTA  C   AT  GGTT G   C AA  A G  A GAAT  A A G G  AA T  TTT  GAAAGT   T  A  T A   AAT   TT    GC T AC  GA G T T  ACGG  C GTAGC T TATT    A C  TCATCA G  T TCACT   TG  G TGAA  T  AG  A T  T CA GTCA  G AAAA CTTTT  A  AG  GTG CGTA A   A AGGCCGA  G  T  TTA  TC AAGC  A  AT T  GAA   ACATCAAT T TGCC G C  T   C C AAA     CG TG CA AT A A T T  GT GC   C     GTGTATTT   GAGCAT   AA ATC T  T   G T   A AGG T GTAACTC     T  TTTA A GG  T TGT TACATG  T  GC  GAA TAT  G  AGC  C ACG    T TATCT  ATAG    T     TAA GA  TGGCA  AC CAA    C   A TC    T    TA C T  T CGCA  A   AA   C    AATAGC  T   TC  AC TCAC TGT A  A TAC T     C AT TGAC  T    G T  A T C   GA A  A A  T    AT  AC   A
blockSeqs                     :             .   A   .    .   A  T . A    G   .     . T  . .           .   GG  C    .   . GG  . .  . .     . . T .  T  .  G    A        .  G  C .   AT    T     .  . .   .  . A .  .     . AAA   T GTT     . C  .      .  . C       .   . TCAC  .  AT  T T  . A  G     . C    A      .  .   T   A    .   . .        .  .  .    .  .     G  C  .  .     .        . CT   . .  .   C . .       .  A  .  .  . . . .  GC .    A     TTT        ACC      .  .   .  .   . T   . .   . AC          .  .    A A   . T   .       C  C   .   .    .  T    . .      . AT     C       .     GC  G   .      .  AA     .   . GA    T    .  . .  T A     .   .    .    .       .   TT  A  GC   C   G  A A   .     T .  .     T    . .  . . .   .  .  T .  T    .   C    .
blockSeqs                     :             .   .   .    .   .  . . .    .   .     . G  . .           .   AG  T    .   . T   . .  . .     . . . .  .  .  .    T        .  .  . .   T     T     .  . .   .  . A .  .     . A     . C       . .  .      .  . .       .   . TAC   .  .   . .  . A  .     . C    .      .  .   .   .    .   . .        .  .  .    .  .     .  C  .  .     .        . G    . .  .   C . .       .  .  .  .  . . . .  C  .    .     TT         AA       .  .   .  .   . .   . .   . CG          .  .    A A   . T   .       .  .   .   .    .  T    . .      . T      G       .     T   .   .      .  A      .   . C     .    .  . .  T A     .   .    .    .       .   TG  .  .    C   .  A .   .     . .  .     .    . .  . . .   .  .  A .  .    .   T    .
blockSeqs                     :             .   .   .    .   .  . . .    .   .     . .  . .           .   G   T    .   . .   . .  . .     . . . .  .  .  .    .        .  .  . .   .     .     .  . .   .  . . .  .     . .     . C       . .  .      .  . .       .   . GAA   .  .   . .  . A  .     . .    .      .  .   .   .    .   . .        .  .  .    .  .     .  C  .  .     .        . C    . .  .   G . .       .  .  .  .  . . . .  C  .    .     CT         AG       .  .   .  .   . .   . .   . T           .  .    A A   . .   .       .  .   .   .    .  .    . .      . .      .       .     .   .   .      .  A      .   . C     .    .  . .  T .     .   .    .    .       .   TT  .  .    .   .  A .   .     . .  .     .    . .  . . .   .  .  A .  .    .   C    .
blockSeqs                     :             .   .   .    .   .  . . .    .   .     . .  . .           .   T   C    .   . .   . .  . .     . . . .  .  .  .    .        .  .  . .   .     .     .  . .   .  . . .  .     . .     . C       . .  .      .  . .       .   . ATT   .  .   . .  . A  .     . .    .      .  .   .   .    .   . .        .  .  .    .  .     .  C  .  .     .        . .    . .  .   C . .       .  .  .  .  . . . .  C  .    .     T          G        .  .   .  .   . .   . .   . T           .  .    A A   . .   .       .  .   .   .    .  .    . .      . .      .       .     .   .   .      .  A      .   . C     .    .  . .  T .     .   .    .    .       .   TC  .  .    .   .  A .   .     . .  .     .    . .  . . .   .  .  T .  .    .   C    .
blockSeqs                     :             .   .   .    .   .  . . .    .   .     . .  . .           .   G   G    .   . .   . .  . .     . . . .  .  .  .    .        .  .  . .   .     .     .  . .   .  . . .  .     . .     . C       . .  .      .  . .       .   . TC    .  .   . .  . A  .     . .    .      .  .   .   .    .   . .        .  .  .    .  .     .  C  .  .     .        . .    . .  .   G . .       .  .  .  .  . . . .  C  .    .     T          G        .  .   .  .   . .   . .   . T           .  .    T A   . .   .       .  .   .   .    .  .    . .      . .      .       .     .   .   .      .  A      .   . C     .    .  . .  G .     .   .    .    .       .   CT  .  .    .   .  C .   .     . .  .     .    . .  . . .   .  .  A .  .    .   C    .
blockSeqs                     :             .   .   .    .   .  . . .    .   .     . .  . .           .   G   C    .   . .   . .  . .     . . . .  .  .  .    .        .  .  . .   .     .     .  . .   .  . . .  .     . .     . C       . .  .      .  . .       .   . AA    .  .   . .  . T  .     . .    .      .  .   .   .    .   . .        .  .  .    .  .     .  A  .  .     .        . .    . .  .   T . .       .  .  .  .  . . . .  C  .    .     T          G        .  .   .  .   . .   . .   . T           .  .    G G   . .   .       .  .   .   .    .  .    . .      . .      .       .     .   .   .      .  A      .   . C     .    .  . .  T .     .   .    .    .       .   TT  .  .    .   .  A .   .     . .  .     .    . .  . . .   .  .  T .  .    .   C    .
blockSeqs                     :             .   .   .    .   .  . . .    .   .     . .  . .           .   G   C    .   . .   . .  . .     . . . .  .  .  .    .        .  .  . .   .     .     .  . .   .  . . .  .     . .     . T       . .  .      .  . .       .   . AC    .  .   . .  . A  .     . .    .      .  .   .   .    .   . .        .  .  .    .  .     .  T  .  .     .        . .    . .  .   G . .       .  .  .  .  . . . .  G  .    .     T          G        .  .   .  .   . .   . .   . T           .  .    G A   . .   .       .  .   .   .    .  .    . .      . .      .       .     .   .   .      .  G      .   . G     .    .  . .  T .     .   .    .    .       .   TC  .  .    .   .  C .   .     . .  .     .    . .  . . .   .  .  T .  .    .   C    .
blockSeqs                     :             .   .   .    .   .  . . .    .   .     . .  . .           .   T   C    .   . .   . .  . .     . . . .  .  .  .    .        .  .  . .   .     .     .  . .   .  . . .  .     . .     . C       . .  .      .  . .       .   . AC    .  .   . .  . A  .     . .    .      .  .   .   .    .   . .        .  .  .    .  .     .  A  .  .     .        . .    . .  .   G . .       .  .  .  .  . . . .  C  .    .     T          G        .  .   .  .   . .   . .   . C           .  .    T A   . .   .       .  .   .   .    .  .    . .      . .      .       .     .   .   .      .  G      .   . C     .    .  . .  G .     .   .    .    .       .   TG  .  .    .   .  C .   .     . .  .     .    . .  . . .   .  .  A .  .    .   A    .
blockSeqs                     :             .   .   .    .   .  . . .    .   .     . .  . .           .   G   G    .   . .   . .  . .     . . . .  .  .  .    .        .  .  . .   .     .     .  . .   .  . . .  .     . .     . C       . .  .      .  . .       .   . AC    .  .   . .  . A  .     . .    .      .  .   .   .    .   . .        .  .  .    .  .     .  A  .  .     .        . .    . .  .   G . .       .  .  .  .  . . . .  G  .    .     T          A        .  .   .  .   . .   . .   . A           .  .    T G   . .   .       .  .   .   .    .  .    . .      . .      .       .     .   .   .      .  A      .   . G     .    .  . .  A .     .   .    .    .       .   TG  .  .    .   .  C .   .     . .  .     .    . .  . . .   .  .  A .  .    .   C    .
blockSeqs                     :             .   .   .    .   .  . . .    .   .     . .  . .           .   G   G    .   . .   . .  . .     . . . .  .  .  .    .        .  .  . .   .     .     .  . .   .  . . .  .     . .     . T       . .  .      .  . .       .   . GA    .  .   . .  . A  .     . .    .      .  .   .   .    .   . .        .  .  .    .  .     .  C  .  .     .        . .    . .  .   C . .       .  .  .  .  . . . .  G  .    .     T          C        .  .   .  .   . .   . .   . A           .  .    A A   . .   .       .  .   .   .    .  .    . .      . .      .       .     .   .   .      .  G      .   . G     .    .  . .  G .     .   .    .    .       .   TT  .  .    .   .  A .   .     . .  .     .    . .  . . .   .  .  A .  .    .   C    .
blockSeqs                     :             .   .   .    .   .  . . .    .   .     . .  . .           .   G   C    .   . .   . .  . .     . . . .  .  .  .    .        .  .  . .   .     .     .  . .   .  . . .  .     . .     . C       . .  .      .  . .       .   . AC    .  .   . .  . T  .     . .    .      .  .   .   .    .   . .        .  .  .    .  .     .  A  .  .     .        . .    . .  .   A . .       .  .  .  .  . . . .  C  .    .     G          G        .  .   .  .   . .   . .   . C           .  .    T G   . .   .       .  .   .   .    .  .    . .      . .      .       .     .   .   .      .  G      .   . G     .    .  . .  T .     .   .    .    .       .   T   .  .    .   .  T .   .     . .  .     .    . .  . . .   .  .  T .  .    .   T    .
blockSeqs                     :             .   .   .    .   .  . . .    .   .     . .  . .           .   G   G    .   . .   . .  . .     . . . .  .  .  .    .        .  .  . .   .     .     .  . .   .  . . .  .     . .     . T       . .  .      .  . .       .   . AT    .  .   . .  . T  .     . .    .      .  .   .   .    .   . .        .  .  .    .  .     .  A  .  .     .        . .    . .  .   G . .       .  .  .  .  . . . .  G  .    .     A          G        .  .   .  .   . .   . .   . T           .  .    G G   . .   .       .  .   .   .    .  .    . .      . .      .       .     .   .   .      .  A      .   . G     .    .  . .  G .     .   .    .    .       .   T   .  .    .   .  C .   .     . .  .     .    . .  . . .   .  .  A .  .    .   A    .
blockSeqs                     :             .   .   .    .   .  . . .    .   .     . .  . .           .   G   G    .   . .   . .  . .     . . . .  .  .  .    .        .  .  . .   .     .     .  . .   .  . . .  .     . .     . C       . .  .      .  . .       .   . AC    .  .   . .  . T  .     . .    .      .  .   .   .    .   . .        .  .  .    .  .     .  A  .  .     .        . .    . .  .   G . .       .  .  .  .  . . . .  A  .    .     G          A        .  .   .  .   . .   . .   . C           .  .    T G   . .   .       .  .   .   .    .  .    . .      . .      .       .     .   .   .      .  G      .   . G     .    .  . .  G .     .   .    .    .       .   T   .  .    .   .  C .   .     . .  .     .    . .  . . .   .  .  A .  .    .   T    .
blockSeqs                     :             .   .   .    .   .  . . .    .   .     . .  . .           .   G   G    .   . .   . .  . .     . . . .  .  .  .    .        .  .  . .   .     .     .  . .   .  . . .  .     . .     . T       . .  .      .  . .       .   . GG    .  .   . .  . T  .     . .    .      .  .   .   .    .   . .        .  .  .    .  .     .  G  .  .     .        . .    . .  .   A . .       .  .  .  .  . . . .  G  .    .     T          G        .  .   .  .   . .   . .   . C           .  .    A G   . .   .       .  .   .   .    .  .    . .      . .      .       .     .   .   .      .  G      .   . G     .    .  . .  G .     .   .    .    .       .   G   .  .    .   .  C .   .     . .  .     .    . .  . . .   .  .  T .  .    .   T    .
blockSeqs                     :             .   .   .    .   .  . . .    .   .     . .  . .           .   G   G    .   . .   . .  . .     . . . .  .  .  .    .        .  .  . .   .     .     .  . .   .  . . .  .     . .     . T       . .  .      .  . .       .   . AC    .  .   . .  . A  .     . .    .      .  .   .   .    .   . .        .  .  .    .  .     .  A  .  .     .        . .    . .  .   G . .       .  .  .  .  . . . .  G  .    .     T          A        .  .   .  .   . .   . .   . A           .  .    T G   . .   .       .  .   .   .    .  .    . .      . .      .       .     .   .   .      .  A      .   . G     .    .  . .  T .     .   .    .    .       .   T   .  .    .   .  T .   .     . .  .     .    . .  . . .   .  .  T .  .    .   C    .
blockSeqs                     :             .   .   .    .   .  . . .    .   .     . .  . .           .   G   G    .   . .   . .  . .     . . . .  .  .  .    .        .  .  . .   .     .     .  . .   .  . . .  .     . .     . C       . .  .      .  . .       .   . GA    .  .   . .  . A  .     . .    .      .  .   .   .    .   . .        .  .  .    .  .     .  G  .  .     .        . .    . .  .   A . .       .  .  .  .  . . . .  G  .    .     T          G        .  .   .  .   . .   . .   . C           .  .    T A   . .   .       .  .   .   .    .  .    . .      . .      .       .     .   .   .      .  G      .   . G     .    .  . .  T .     .   .    .    .       .   A   .  .    .   .  C .   .     . .  .     .    . .  . . .   .  .  A .  .    .   C    .
blockSeqs                     :             .   .   .    .   .  . . .    .   .     . .  . .           .   G   C    .   . .   . .  . .     . . . .  .  .  .    .        .  .  . .   .     .     .  . .   .  . . .  .     . .     . T       . .  .      .  . .       .   . GA    .  .   . .  . T  .     . .    .      .  .   .   .    .   . .        .  .  .    .  .     .  A  .  .     .        . .    . .  .   G . .       .  .  .  .  . . . .  G  .    .     T          A        .  .   .  .   . .   . .   . C           .  .    G G   . .   .       .  .   .   .    .  .    . .      . .      .       .     .   .   .      .  G      .   . G     .    .  . .  T .     .   .    .    .       .   T   .  .    .   .  A .   .     . .  .     .    . .  . . .   .  .  T .  .    .   C    .
blockSeqs                     :             .   .   .    .   .  . . .    .   .     . .  . .           .   G   G    .   . .   . .  . .     . . . .  .  .  .    .        .  .  . .   .     .     .  . .   .  . . .  .     . .     . C       . .  .      .  . .       .   . AG    .  .   . .  . A  .     . .    .      .  .   .   .    .   . .        .  .  .    .  .     .  A  .  .     .        . .    . .  .   G . .       .  .  .  .  . . . .  G  .    .     T          G        .  .   .  .   . .   . .   . C           .  .    T G   . .   .       .  .   .   .    .  .    . .      . .      .       .     .   .   .      .  A      .   . A     .    .  . .  G .     .   .    .    .       .   T   .  .    .   .  A .   .     . .  .     .    . .  . . .   .  .  A .  .    .   .    .
blockSeqs                     :             .   .   .    .   .  . . .    .   .     . .  . .           .   G   G    .   . .   . .  . .     . . . .  .  .  .    .        .  .  . .   .     .     .  . .   .  . . .  .     . .     . C       . .  .      .  . .       .   . GA    .  .   . .  . T  .     . .    .      .  .   .   .    .   . .        .  .  .    .  .     .  C  .  .     .        . .    . .  .   G . .       .  .  .  .  . . . .  G  .    .     T          G        .  .   .  .   . .   . .   . C           .  .    G A   . .   .       .  .   .   .    .  .    . .      . .      .       .     .   .   .      .  G      .   . G     .    .  . .  T .     .   .    .    .       .   T   .  .    .   .  T .   .     . .  .     .    . .  . . .   .  .  A .  .    .   .    .
blockSeqs                     :             .   .   .    .   .  . . .    .   .     . .  . .           .   G   T    .   . .   . .  . .     . . . .  .  .  .    .        .  .  . .   .     .     .  . .   .  . . .  .     . .     . C       . .  .      .  . .       .   . AC    .  .   . .  . T  .     . .    .      .  .   .   .    .   . .        .  .  .    .  .     .  .  .  .     .        . .    . .  .   A . .       .  .  .  .  . . . .  C  .    .     G          G        .  .   .  .   . .   . .   . T           .  .    G A   . .   .       .  .   .   .    .  .    . .      . .      .       .     .   .   .      .  A      .   . G     .    .  . .  G .     .   .    .    .       .   T   .  .    .   .  C .   .     . .  .     .    . .  . . .   .  .  T .  .              
blockSeqs                     :             .   .   .    .   .  . . .    .   .     . .  . .           .   A   G    .   . .   . .  . .     . . . .  .  .  .    .        .  .  . .   .     .     .  . .   .  . . .  .     . .     . T       . .  .      .  . .       .   . AA    .  .   . .  . G  .     . .    .      .  .   .   .    .   . .        .  .  .    .  .     .  .  .  .     .        . .    . .  .   G . .       .  .  .  .  . . . .  .  .    .     A          G        .  .   .  .   . .   . .   . C           .  .    G G   . .   .       .  .   .   .    .  .    . .      . .      .       .     .   .   .      .  A      .   . C     .    .  . .  . .     .   .    .    .       .   T   .  .    .   .  A .   .     . .  .     .    . .  . . .   .  .                      
blockSeqs                     :             .   .   .    .   .  . . .    .   .     . .  . .           .   .   G    .   . .   . .  . .     . . . .  .  .  .    .        .  .  . .   .     .     .  . .   .  . . .  .     . .     . C       . .  .      .  . .       .   . GG    .  .   . .  . .  .     . .    .      .  .   .   .    .   . .        .  .  .    .  .     .  .  .  .     .        . .    . .  .   C . .       .  .  .  .  . . . .  .  .    .     .          .        .  .   .  .   . .   . .   . .           .  .    T .   . .   .       .  .   .   .    .  .    . .      . .      .       .     .   .   .      .  G      .   . G     .    .  . .  . .     .   .    .    .       .   T   .  .    .   .  C .   .     . .  .     .    . .  . . .   .  .                      
blockSeqs                     :                 .   .    .   .  . . .    .   .     . .  . .           .   .   G    .   . .   . .  . .     . . . .  .  .  .    .        .  .  . .   .     .     .  . .   .  . . .  .     . .     . .       . .  .      .  . .       .   . GT    .  .   . .  . .  .     . .    .      .  .   .   .    .   . .        .  .  .    .  .     .  .  .  .     .        . .    . .  .                                                                                .   . .   . .   . .           .  .    . .   . .   .       .  .   .   .    .  .    . .      . .      .       .     .   .   .      .  A      .   . C     .    .  . .  . .     .   .    .    .       .   T   .  .    .   .  A .   .     . .  .     .    . .  . . .                             
blockSeqs                     :                                                           .           .   .   .    .   . .   . .  . .     . . . .  .  .  .    .        .  .  . .   .     .     .  . .   .  . . .  .     . .     . .       . .  .      .  . .       .   . G     .  .   . .               .    .      .  .   .   .    .   . .        .                                                                                                                                                                                                                                   . .      .       .     .   .   .      .  .      .   . .     .    .  .            .   .    .    .       .   T   .  .    .   .  . .   .                                                            
blockSeqs                     :                                                                                    .   . .   . .  . .                                                                                                                                                                                      .   .    .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : AATTATAGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AG---T-TTA-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TT--C-TA---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TG--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-NA-GA--GA-C-GA-C-AT----AT-G----G-----AT-GT--AC---A----G-CAG-G-------GC-GG-TC---GT--G----CC-AT-NA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGGA-T---ATGCT--C--C--A--A-C-G-T-CAG-G--TGG-CGTGA-------T--G-G-----TT--T---A-AC-GTT-A-GTG-A---A-A------C-CGTA-AT----TNAG-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA-A-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--GAAGA-CCT-C-G-TAG-TGGC--A-A-GCTC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-T-G--G----G---G-TCNT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAC--G-CANT-CG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
finalCons                     : AATTATAGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AG---T-TTA-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TT--C-TA---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TG--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-NA-GA--GA-C-GA-C-AT----AT-G----G-----AT-GT--AC---A----G-CAG-G-------GC-GG-TC---GT--G----CC-AT-NA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGGA-T---ATGCT--C--C--A--A-C-G-T-CAG-G--TGG-CGTGA-------T--G-G-----TT--T---A-AC-GTT-A-GTG-A---A-A------C-CGTA-AT----TNAG-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA-A-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--GAAGA-CCT-C-G-TAG-TGGC--A-A-GCTC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-T-G--G----G---G-TCNT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAC--G-CANT-CG-GTTC--AT-CTCT-GCTG





Alignments
lowQualScore                  :             1   444 22   1   33 3 1 444  444 44444 1 55 1 6666666666  1   333 4444 1   1 55  1 1  1 3333  1 1 3 1  33 1  444  777777   1  3  3 1   666   55    22 1 22  22 1 4 1  3333  1 88888 3 444444  1 3  444444 1  1 55555   22  1 77777 1  44  3 3  1 55 5555  1 6666 55555  1  22  444 4444 1   1 5555555  1  1  222  22 3333  3  77 1  222   55555555 1 8888 1 1  1   1 1 222     22 44 22 22 1 1 1 1  66 22   3     9999999999 6666666  22 222 1  1   1 3   1 222 1 99999999    1  3333 2 22  1 666 444444  3  33  222 222  1  666  1 222    1 77777  6666    1     666 33  33333  22 444    1   1 555   3    22 1 1  3 6666  1   22   1    444444  1   999 33 5555 555 3  1 444 1     3 22 3333  3    1 1  1 1 1   22 1  1 1  3    22  22   1    
lowQualScore                  :             .   ... ..   .   .. . . ...  ... ..... . .. . ..........  .   ... .... .   . ..  . .  . ....  . . . .  .. .  ...  ......   .  .  . .   ...   ..    .. . ..  .. . . .  ....  . ..... . ......  . .  ...... .  . .....   ..  . ..... .  ..  . .  . .. ....  . .... .....  .  ..  ... .... .   . .......  .  .  ...  .. ....  .  .. .  ...   ........ . .... . .  .   . . ...     .. .. .. .. . . . .  .. ..   .     .......... .......  .. ... .  .   . .   . ... . ........    .  .... . ..  . ... ......  .  ..  ... ...  .  ...  . ...    . .....  ....    .     ... ..  .....  .. ...    .   . ...   .    .. . .  . ....  .   ..   .    ......  .   ... .. .... ... .  . ... .     . .. ....  .    . .  . . .   .. .  . .  .    ..  ..   .    
lowQualScore                  :             7   444 22   6   88 2 6 444  444 00000 6 44 6 7777777777  5   555 1111 5   5 66  5 5  5 1111  5 5 1 5  77 5  222  555555   5  1  1 5   333   22    11 5 11  11 5 6 5  3333  5 11111 1 222222  5 1  444444 5  5 44444   11  5 88888 5  22  1 1  6 44 0000  6 3333 44444  5  11  111 6666 5   5 0000000  5  6  888  22 4444  2  88 6  888   88888888 6 8888 6 6  6   0 7 999     33 00 33 33 7 7 7 7  55 33   3     2222222222 9999999  33 999 7  6   6 2   6 888 6 33333333    6  4444 6 66  6 000 666666  2  88  888 888  6  000  6 888    5 55555  3333    5     333 77  88888  11 888    5   5 222   1    11 5 6  6 6666  5   11   5    444444  5   888 77 4444 888 1  5 222 5     2 22 4444  2    6 6  6 6 6   33 7  0 8  6    66  11   9    
consensus                     : AATTATAGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AG---T-TTA-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TT--C-TA---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TG--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-NA-GA--GA-C-GA-C-AT----AT-G----G-----AT-GT--AC---A----G-CAG-G-------GC-GG-TC---GT--G----CC-AT-NA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGGA-T---ATGCT--C--C--A--A-C-G-T-CAG-G--TGG-CGTGA-------T--G-G-----TT--T---A-AC-GTT-A-GTG-A---A-A------C-CGTA-AT----TNAG-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA-A-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--GAAGA-CCT-C-G-TAG-TGGC--A-A-GCTC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-T-G--G----G---G-TCNT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAC--G-CANT-CG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
Reference ( family-593 )      : AATTATAGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AG---T-TTA-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TT--C-TA---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TG--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-NA-GA--GA-C-GA-C-AT----AT-G----G-----AT-GT--AC---A----G-CAG-G-------GC-GG-TC---GT--G----CC-AT-NA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGGA-T---ATGCT--C--C--A--A-C-G-T-CAG-G--TGG-CGTGA-------T--G-G-----TT--T---A-AC-GTT-A-GTG-A---A-A------C-CGTA-AT----TNAG-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA-A-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--GAAGA-CCT-C-G-TAG-TGGC--A-A-GCTC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-T-G--G----G---G-TCNT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAC--G-CANT-CG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110123                     : AATTATAGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TT---T-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AC---G-TTA-A--CT-C-TA-A----AA-C-A-T-TG--C-TA---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TG--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-CA-AA--GA-C-GA-C-AT----AT-G----G-----AT-GT--AC---A----G-CAG-G-------GC-GG-TC---GT--G----CC-AT-CA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGCA-T---ATGCT--C--C--A--A-C-G-T-CAC-G--TGG-CGTGA-------T--G-G-----TT--T---A-AC-GCA-A-GTG-A---A-A------C-CATA-AT----TAAT-TG-G---C------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA-A-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--AAAGA-CCC-C-C-TAG-TGGC--A-A-GCTC----AG-AAG--AAT-GACA------GT-TCA-T-G--G----G---G-TCAT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-CC-A-A-AAC--G-CATT-TG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110124                     : AATTATAGTTGT-GAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAG-G-AC---T-TTA-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TG--C-TA---CA------GAG-TT-CT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TG--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-A-TG------A-TA-A-----AAT--GT-T--T-CA-GA--GA-C-AA-C-AT----AT-G----G-----GT-GT--AC---A----G-GAG-G-------GC-GG-TC---GT--G----CC-AT-CA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGCA-T---TAGCT--C--C--T--A-A-G-T-CAC-G--TAG-CGTGG-------T--G-G-----TT--T---A-AC-GCC-A-GTG-A---A-A------T-CATA-AT----CAAA-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA-A-----CA----CAGG-AAGGG---T--GC-----AA--C--AAAGA-CCT-C-C-TAG-TGGC--A-A-GCTC----AG-TAG--AAT-GACA------GC-TCA-T-G--G----G---GATCAT---A-AAAAA-G--T----GC-TTTT-G-AC-A-A-AAC--G-AAAT-TG-GTTA--AT-CTCT-GCTG
gi|110125                     : AATTATTGTGGT-CAA---G--GAA-AAG--A-A-A----T---C-----T-GT-T-G----------TA-AAA-T-AT---T-TTA-A--TT-G-TC-A----AA-C-A-A-TT--C-TA---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TG--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TA-A-TG------C-CA-A-----AAT--GT-T--A-AT-GA--GA-C-GA-C-AG----AT-A----G-----AT-GT--AC---A----G-GAA-G-------GC-GG-TC---GT--G----CC-AT-CA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGCA-T---ATGCT--C--T--A--A-C-G-T-CAC-G--TGG-CGTGA-------T--G-G-----CT--T---A-AT-GTC-A-ATG-A---A-A------T-CATA-AT----TAAA-AG-G---TTACATGTA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA-A------A----CAGG-AAGGG---T--GC-----AA--C--AAAGA-CCT-C-C-TAG-TGAC--A-A-GCTC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-T-GA-G----G---G-TCAT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAC--G-CATT-TG-GTTC--AT-TTCT-GCTG
gi|110126                     : AATTATAGTGGT-CCA---G--GAA-AGA--T-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AT---T-TTA-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-C-TT--T-TA---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--T-T--TG--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-CA-GA--GG-C-GA-C-AT----AT-G----G-----AT-GT--AC---A----G-CAG-A-------GC-GG-TA---GT--A----CC-AT-CA-AG---ATT--------C-T----T-C-AA-ATGCA-T---ATGCT--C--C--A--A-C-G-T-CAC-G--CGG-CGTGG-------T--G-G-----TT--T---A-AC-CTC-A-GCG-A---A-A------T-CGTA-AT----TAAA-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CTCA-A-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--AAAGA-CCT-C-C-TAG-TTGC--ACA-GCTC----AT-AAC--AAT-GACA------GC-TCA-TCG--G----G---G-TAAT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAC--A-AAAT-CC-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110127                     : AATTTTAGTGGT-CAA---G--AAA-AAA--C-A-A---TT---T-----T-G--T-G----------TA-ATA-G-AC---A-TTC-A--TT-T-TC-A----AG-C-A-T-TG--C-TA---CA------GAG-TT-TT-T-AAA---TTT--GATC--A-T--TG--C-T-G-AC----AT-T-----G-A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-CA-CA--TA-C-GA-C-AT----AT-G----T-----AT-GT--AC---A----A-CAG-G-------GC-GG-TC---GT--C----CC-AT-CA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGGA-T---ATGTT--C--C--A--A-C-G-T-CAC-G--TGG-CGTTA-------T--G-G-----TT--T---A-AC-GTC-A-TTG-A---A-A------T-CGTA-AG----TATA-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TTCC---CAGA-T-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--AAGGA-CCT-C-C-TAG-TGGC--A-A-ACTC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCATT-G--G----G---G-TCAT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-A-GC-T-A-AAC--A-AAAT-CG-ATTA--AT-CTCT-GCTG
gi|110128                     : AATTATAGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TT---C-----T-A--T-G----------TA-AAA-------------------------A----CA-C-A-T-TT--C-TA---CA------GAA-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TG--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-CA-GA--GA-C-GG-C-AT----AT-G----G-----AT-AT--AC---A----G-AAG-G-------AG-AG-TC---GT--G----CC-AT-CA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATTCA-T---ATGCT--C--C--A--A-C-G-T-CAC-A--TGG-CGTGA-------T--G-G-----AT--T---A-AC-GTC-A-GTG-A---A-A------T-CGTA-AT----GAAA-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-AA---TT-C---CAGA-A-----CA----AAGG-GAAGG---T--GC-----AG--C--AAAGA-CCT-C-C-TAG-TGGC--A-A-GCTC----AG-AAG--AAT-GACA------AC-CCA-TGG--G----G---G-TAAT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-G-AAC--G-CATT-TG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110129                     :   TTATGGTAGT-CGA---G--GAA-AAT--T-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AG---T-TTA-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TT--C-TA---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GAAC--A-T--TA--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--T---TG-A-TA------A-CA-A-----AAT--GT-T--G-AA-AA--TA-C-GA-C-TT----AT-T----G-----AT-GT--AC---A----G-TAG-A-------GC-GG-TC---AT--G----CC-AT-AA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGGA-T---ATGCG--C--C--A--A-C-G-T-CAG-G--TAG-CGTGA-------T--G-A-----TT--T---A-AC-ATT-A-GTA-A---A-A------C-CGTA-AT----TTAG-AT-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C--------------------CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--GATGA-CCT-C-G-TAG-TGGC--A-A-TCGC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCATT-G--G----G---G-TCCT---A-AA
gi|110130                     :   TTATAGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-ACAATT---C-------G--C-G----------TA-AAA-T-AC---T-TTA-A--TT-T-TC-A----AA-T-A-T-TT--C-TA---CA------TAG-TT-TT-GAAAA---TTT--GACT--A-T--TG--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-A-TA------A-CA-A-----AAA--AT-T--A-CA-GA--GA-T-GA-C-ATG---AT-G----GA----AT-GT--AC---A----G-C-T-G-------GC-GG-TC---GT--G----TC-AT-TA-AT---A-A--------C-T----T-C-AA-ATGTA-T---ATGCT--CTGC--A--A-C-A-T-CAC-A--GGG-TGTGA-------T--G-C-----CT--T---A-AC-GTT-A-GTG-G---A-A------A-TGTA-AA----TGAA-AA-GT--T------TATTG--GG---A---AA-GG---TT-C---CGGA-A-----CAC---CAGG-GAGGG---T--CC-----AT--CA-AAAGA-CCT-C-C-TAT-TGGC--A-A-GCTTA---AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-TCG--G----A---C-TCAT---A-AGATA-G--T----GT-GTTT-T-GC-A-A-AACGAG-CAAT-CGTTTTT--AT-CTCT-
gi|110131                     :   TTATGGTGGT-CAA---G--GAC-AAT--C-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AC---A-TTC-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TC--C-TA---TA------GAA-TT-TT-G-AAA---CTT--GATC--A-T--TG--T-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-G-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-TA-GA--G--C-GA-C-AT----AA-T----G-----ATAGT--AC---A----A-CAG-A-------GC-GGTTT---GT--G----CC-AT--A-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGGA-T---ATGCT--C--C--A--A-T-GTT-CAG-T--TGG-CGT-A-------G--G-G-----CT--------AC-GTT-A-GTG-A---A-A--------CGTA-AT----TGAA-AA-G---T------TC-TT--GG---A---AA-GGT--TT-C---CAGA-A-----CAG---CAGG-GAGGG---T--G------GA--C--G--GA-CCT-C-G-AAG-TG----A-A-GCTC----AG-A----AAT-GGAA------GC-TCA-T-G--G----G---G-GACC---A-AACAA-G--T----GCTTTTT-G-AC-C-A-AAC--A-CATT-T--GTTCATAT-CTCT-
gi|110132                     :   TTATGGTGGA-CAA-----------AT--C-A-A---TT---T-----T-G--T-T----------TA-AAA-G-AC---T-TTA-AAATT-T-TC-A----AAAC-A-T-TT--C-TA---CA------GAA-TT-TT-G-AAA---TTT--GGC---A-T--TG--C-TTG-AC----CT-------G-A------TG-A-TG------A----A-----CAT--GT-T--A-CA-GA--GAAC-GA-CCAT----AT-G----G-----AT-GC--AC---AA---G-CAG-G--------C-G--TC---GT--A----CC-AT-AG-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGGA-C----TGCT--C--C--A--AAT-G-T-CAG-AGCTGG-CATGA-------A--G-G-----CT--T---A-GC-TTT-A-GTG-A---A-A------A-CGTA-AT----TTAG-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GGT--TT-C---CAAG-A-----CA----CAAG-AAGGG---T--GG-----AA--C--AAAGACCCT-C-G-TAGTTGGC--A-G-G--C----AGAAAG--GTT-GGCA------GC-TCA-G-G--G----G---T-TCCTA--A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-ACC--G---TT-TG-GTTC--ATACTCT-
gi|110133                     :   TTATGGTGGT-CAA---A--GGA-AAA--C-A-AA--TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AGGTTT-TCA-G--AT-T-TC-A----AA-C-A-T-------------G------GAG-T-------------------------------------G-AC----CT-T-----G-A------TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-TT-A-CA-GA--GA-C-GATC-AT----AT-G----------AT-GT--AC---A----G-CAG-A-------TC-G--TC---GT--G----CT-AT-ATTAG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGGA-T---ATG-----------------G-C-C----------TGTGA-------G--G-A-----TT--A---A-AC-GTT-A-GTA-A---A-A------C-CGTA-AT----TTAGGAG-G---T------TA-TG--GG---A---A--GG---TT-C---CAGA-A-----CA----CAGG-GAGGGGC-T--GC-----AG--C--GAATA-CTT-T-G--AG-TGG---A-A-TCGC----AG-AAG--AAT-GGCA------GC-TTACT-G--G----GC--G-TCCT---GTAAATG-G--T----GC-TTTTGG-GC-A-A-AAC--G-CAAT-CG-GTTG--AT--TCT-ACCG
gi|110134                     :   TTATGGCGGT-CAA---G--GAA-AAA------A---TT---C-----G-A--TCG----------TA-AAA---AG---T-T-A-AGGTT-T-CC-A----AA-C-A-T-TT--C-TA---CA------GAG-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TA--CGT-G-A-----CT-T-----G-A--T---TG-A-TA------A-CA-A-----AAT--GT-TTGA-AA-AG--GA-C-
gi|110135                     :   TTATGGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AG---T-TTA-A--TT-T-TC-A----A
gi|110136                     :    TATAGTGGT-CAG---G--AAA-AAA--CCA-A---TT---C-----C-GCTT-A----------TA-AAA-ATAC---TGTTA-A--TT-T-TC-A----AA-T-AGT-TT--C-TA---CA------TAG-TT-TTTG-AAA---TTT--GACA--A-T--TG----T-G-AC----CT-TA----G-A--C---TG-ACTG------A-CA-A-----ATT--TT-TTCA-CA-AA--GATC-GA-C-AT----AT-GC---G-----AT-GT--GC---A----G-CAT-G-------GT-GG-TC---GT--------C-AT-CA-AT---ATG--------C-TCT--T-C-AATATGCACT---ATGCT--C--C--A--A-G-G-T-CAC-G--TTG-CGTGAT------T--G-G-----CC--T---A-AC-ATT-C-GTG-A---A-A------T-CGTT-AT----TAAA-AGTT---T------TA-TGGCGG---A---AAGGG---TT-C---CGGA-A-----CA----CA-G-GAGGG---T--CC-----AT--CCAAAAGA-CCT-CTC-TAT-TGGC--A-T-GAAT----AG-AAG--AAT-GACA-------T-TCATT-GACG----G---G-TCAT---A-AAA-A-G--T----GG-TTTT-G-GCAA-A-AAC--GAGAATACGTGTTC--AT-ATCT-GCTG
gi|110137                     :      TAGTGGT-CAAA--G--GAA-AAA--C-A-G---TT---A-------G--T-A----------TA-AAA-G-AG---T---A-A--TT-T--C-A----AA-C-A-T-TT--C-TA---CAGAAAGTGAA-TTATT-G-AAA---TTT--
gi|110138                     :       AGTGGT-CA----G--GAA-AAA--C-A-A---TTG--C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AG---T-T-A-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TTT-C-TA---CAA-----GAA-TT-TT-G-AAAAT-TTT--GACC--A-T--TA--C-T-G-AC----CT-T-----GTA--T---TG-A-TA------A-CA-A-----AAT--GT-T--G-GA-AA--GA-T-GA-C-TT----AT-G----G-----AT-GT--AC---A----G-TAG-A-------GC-GG-TC---GT--G----CC-AT-AA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGAA-T---ATGCG--C--T--A--A-C-G-T-CAG-G--AGG-CGTGA-------T--G-A-----TT--T---A-AC-GTT-A-GTA-A---A-AA-----C-CGTA-AT----TTAG-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA-A-----CA----CAGG-GAAGG---T--GC-----AA--C--GAAGA-TAT-C-G-TAG-TGGC--T-A-TCGC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-T-G--G----G---G-TCTT---A-AAATG-G--T----GA-TTTT-G-GC-A-A-AAT--G-CAAT-CG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110139                     :       AGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-A-A---TTAAACAATTAT-G--T-G----------TA-AAA---AG---T-TAA-T--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TT--C-TA---CA------TAA-TT-TT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TG--T-T-G-AC----CT-T-----A-A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-CA-GA--G--C-GA-C-TT----AT-G----G-----AC-GT--AC---A----G-CAG-A-------GC-GG-TT---GT-------CC-AT-AA-AG---A-G--------C------T-C-AA-AT-GA-T----TGCT--C--C--A--T-C-G-T-CAA-G--T-G-CGTGA-------T--G-G-----TT--T---A-AC-GTT-A-GTG-A---A-A------C-CGTA-AT----TGA--AA-G---T------TA-T---GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA-A-----CA----TAAG-GAGGG---T--GC-----AA--C--AAAGA-CCT-C-G-TAG-T-GC--A-A-GCTA----AG-AAG--AATCAACA------GC-TCA-A-T--G----G---G-TCCT---A-AAATA-G--T----GC-TATT-G-GC-A-A-AAC--G-CATT-T--GTTC--AC-CTTT-GCTG
gi|110140                     :       AGTGGT-CAA---G--GAA-AAA--C-C-A---TT---A-----TGG--T-G----------T--AAA-G-AG---T-TTA-T--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TT--C-TA---CA------GAA-TT-TT-G-AAAT--TTT--GACC--A-T--TA--C-T-G-A------T-T-----G-A--T---TG-A-TA------A-C--A-----AAT--GT-T--G-AA-AA--G--C--A-C-TT----AT-A----G-----AT-GT--AC---A----G-TAG-A-------GC-GG-TA---GT--G----TC-AT-AA-AG---ATG--------C-TG---T-C-AA-ATGGA-T---ATGGC--G--C--A--A-CAG-T-CAG-G--TGG-CGTGA-------T--G-A-----TT--T---A-AC-GTA-A-GT--A---A-A------C-CGTA-AT----T-AG-AG-G---T------TA-TA--GG---A---AA-GG---TT-G---CAGA-A-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--GAAGA--CT-C-G-TAG-TGGC--A-A-TCGC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-TCG--G----G---G-T--T---A-AAATG-G--T----GC-TTTT-G-GC---A-AAT--G-AAAT-C--GTTC--AT--TCT-GCTG
gi|110141                     :        GTGGT-CAA---A--GAA-AAA--TTA-A---T------------G--T-G----------TACAAA-G-AG---T-TTA-T--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-T---C-TA---CA------GA--TT-TT-G-AAA---TTTT-GACC--A-T--TA--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--T---TG-A-TA------A--A-C-----AAT--GT-T--G-AA-AA--GA-C-GA-C-TT----AT-G----G-----AT-GC--AC---A----G-TAG-A-------GC-GG-TA---GT--G----TC-AT--A-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGAT-T---ATGC------C--A--A-C-G-T-GAG-G--TG--CGTGA-------T--A-------TT--T---A-AC-GTT-A-GTA-A---ATA------A-CGTA-AT----TTAG-AG-G---T------TA-TG--GG---A---TA-TG---TT-G---CAGA-A-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--A--GAAGA-CCC-C-G-TAG-TGGC--A-A-TCGC----AA-TAG--AAT-GACA------GC-TCA-TGG--G----G---G-TCCT---A-AAATG-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAT--G-CAAT-CG-GTTC--AT-TTCT-GCTG
gi|110142                     :        GTGGT-CAA---G--GAA-AAAA-T-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-GGAC---T-TTA-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-T-TT--C-TA------------AG-GC-AT-G-AAG---TTT--GACC----T--TG--C-T-G--C----CT-T-----G-A--C---TGAA-TG------A-CA-AC----AAT--GT-T--A-GA-GA--GG-C-GA-C-AT----AT------G-----AT-GT--AC---A----G---A-G-------AC-GG-TT---GT--G----CA-A---A-GG---ATA--------C-T----TGA-AA-ATGGA-T---ATGCT--CA-C--A--A-C-G-G-CA--G--TGGCCGTGA-------T--G-G-----TT--T---A-AC-GTT-ATGTGAA---A-A------C-CG-A-AT----TA---AC-G---T------TA-TG--GG---A---AA--G---TT-C---CAGA-AAT---CA----CAGA-GAGGG---T--GC-----AAACC--AAAGA-CCT---G-T-G-TGGC--A-A-GC-C----AG-AAG--AAT-AACA------GC-TCA-TGG--G----G---G-TCCC---T-AAATA-G--T----GT-TTCT---GC-A-A-AAC----CATT-TA-GTTA--AC-ATTT-GCTG
gi|110143                     :        GTGGT-CAA---G--GAA-AA---C-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AG---T-TT--A--TT-T-TCAA----AA-C-A-T-TT--C-TA---CA------GAATTT-TT-G-AAC---TTT--GACC--A-T--TA--C-TAG-AC----CT-TAAA--G-A--T---TG---TA------AGCA-A-----AAT--GTGTG-A-AA-CA--GA-T-GA-T--T----ATGG----G-----AT-G---ACGTGA----G--AG-G-------GT--A-TC---GT--A-----C-AT--A-AG---ATG--------CTT----T-C-AA-ATGAA-T---ATGCG--C--------A-C-G-T-CAG-G--TGG--GTGA-------T--GAA-----TT--T---A-AC-GTT-A-GTA-A---A-A--------CGT--AT----TTAG-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C-----GA-A-----CA----CAGGTGAGGG---TG-GC-----AA--C--GATAA-TCT---G-TAG-TGGC--T-A-TCGC----AG-AAGAAAAT-GACA------GCTTCA-T-A--G----G---G-TCTT------AATA-G--T----GT-ATTT-G-GC-A-A-AAT--G-CTTC-TG-GTAC--AT-TACTAGCTG
gi|110144                     :         TGGTTCAA---G--GAA-AAA--C-A-A---CT---A-----T-G--T-G----------TA-AAA-G-AG---T-TTA-A--TT-T-TC-A----AA-C-A-TGTT--C-TA---TG------GAG-TT-TTCG-AAA---TTTTTGACC--A-T--TA--C-T-G-AC----CT-T-----T-G--TATTTG-A-TA------A-CATA-----AAT--GT-T--G-AA-AA--GA-C-GA-C--------T-GAAAAG-----AT-GT--AC---A----G-CAG-A-------GC-AG-GT---AT--GAAGCCT-AT-GA-AAGAAATG--------C-T----T-CCAA-ATGGA-----ATGCT--C--TCAA--A-C-G-TTCAG-G--TGG-CGTGA-------TTTG-ACC---TTAAT---A-AC-GTT-A-GTA-A---A-A------C-CGGA-AT----TTAG-AA-G---T------TA-TG--AGGAAA---AA-GG---TT-C---CAGA-A-----AA----CAAG-GGGGA---T--GC-----AA--C--GAAGA-CCT-C-A-TAG-TGGC--A-ATG--C----AG-AAG--AAT-AATGAATAGCGC-TCA-T-G--GTCACG---G-TCCTTACA-AATTGCG--T----GCTTTTT-G-AC-A-ACAAT--G-C
gi|110145                     :           GT-CAATTGG--GAA-AAA--C-A-A---TT---C-----T-G--T-GTTTTATTTTATA-AAA-G-AT---T-TTA-A--TT-T-C-------AA-C-A-T-TT--C-TA---CA------TAA----TT-G-AAA---TTT--GACC--ATT--TG--C-C-G-AC----CTCT-----G-A--C---T--A-TT------A-CT-A-----ACT---T-T--A-CA-GAAGAA-C-GA-C-ATGTCAAT-G----G-----A--AT--AC---A----G-CAG-A-------GCGGG-TCTTAGT--G----CC-ACATA-GG---A-----------------T-C-CA-ATGGA-----AAACT--C--T--A--A-C-G-T-CAG-T--TGC-AGTGAC------T--GAG-----CA--T---A-A--ATT-ATGTG-A---A-A------C-CGTA-AT----TGAA-AT-G---T------TA-----GG---A---AA--G---TT-C---C--A-A-----CA----T-TA-GAGGGTAAT--GC-----AA--C---AAGA-CTT-C---TAGTTTTC--A-A-GCTC----AG-AAG----T-TA-A------G---CA-T-A--T----G---G-TCAT-----AAATATG--T----TC-TTTC-ATGC-A-A-AAC--G-
gi|110146                     :           GT-CAA---GCGGAA-AGATGC-A-A---TT---C-----T-G--T-G----------TA-AAC-G-AG---T-TTA-AT-TT-T-TC-A----AA-C-ATT-TT--C-TAG--CA------GAA-TTGTT-G-AAA---TTT--GACC--A-T--TA--C-T-G-AC----CT-A-----G-AGTT---TG-ACTA------A-CA-A-----AGT--GT-T----GA-AA--GC-CTGA-C-TT----AA-T----G-----AT-GT--AC---A----G-
gi|110147                     :                A---G--GAATAAA--C-AGA---TT---C-----T-GG-C-G----------TA-AAAAG-AG---T-TCA-A--TT-T-CA-A----AG-CAA-T-TT--CTTATTTCA------GAA-TT-TT-G-AGAAATTTT--GACC--A-TACTG--C-T-GTACACGGTT-TGTAGCG-A--C---TG-A-T-------A-CA-A-----AATTGGT-T--ATTATGAATGA-C-GA-C-AT----AT-G----G-----AT-GT--ACT--A----GACAGAG-------AC-GT-TT---AT--G----TCAAT-AG-AG---ATAACATCAATC-TC---T-C-AA-ATGGA-TAAAACATT--C--T--A--G-A-G-T-CAGTT--TGG-GATGA----------G-GAGCATCT--T---ATACTGTT-A-GTG-AAGGA-A------CGTGTG-AT----TTTG-AA-GTGTT------TA-AA--GA---T---AA-GGAGCTT-T---CAGA-AT----CAATAGGAGG-GAGGG---CGAGCTGGCAAA--C--AGAGT-CCTAT-G-TAG-TGACTAA-A-GCTCA---AG-AAG--AAT-GGCA------GC-GTA-T-G--G----GTGTG-TCAT---A-AAATA-GATT----GC--TTT-G-GC-A-A-AA
gi|110148                     :                                                           ----------TA-CAA-A-AG---T-TTT-G--TT-TGTG-AGAATAA-T-A-T-GT--A-TG---CG------GAG-TT-TT-C-TAA---TTT--GATC--G-T--TA--C-T-G-AC----CT-T-----G-A--C---TG-A-TA------A-CA-A-----AAT--GT-T--A-AA-CA--GA-C-GA-C-TT----AT-G----G-----AT-GT--AC---A----A-TAG-A-------GC-
gi|110149                     :                                                                          ttttga---T-TTACA--TTAT-TC-A----AT-C-A-C-TTAAT-CA---CAT-----GAA-TT-TT-G-AAA---TTTT-GACCGCA-T--TAGAC-TAG-AG----CT-T-----GTA--T---TG-A-TATCATCAA-CA-ATCACTGAT--TT-C--G-GA-CA--GA-CTGA-C-TT----TT-GC---GCTTTTGT-GT--AC---ACGTAG-CGG-GAGGCCGAGC-GT-GC---GTTCG----CCGAT-GA-AG---ATG--------C-TTGCCT-C-AC-ATGAA-T---CTGCTCGC--T--AATA-C-G-T-CAGCG--AGGACGTTAGTGTATTT--G-G-----AT--TATCA-AC-GTTGA-GTA-T---A-AGTAACTC-CGTATATTTTATGAG-AG-GT--T------TACTGC-GG---ATATAG-AG---TT-CACGCAGATATATCTCA----CGGG-ACGAGT--T--GC-----AA--C--GAAGA-TAT-C-GATAG-TGGC--T-T-GATCCGCAAG-AAG--AAT-GACA------GC-TCATT-G--GGC--G---G-TCTT---A-AAATG-G--TTGACGT-CTTT-G-GA-ATA-AAT--G-CAAT-CG-GTT
gi|110150                     :                                                                                                                                                               C--A-T--TG--C-T-G-AC----TT-T-----G-A--C---TG-A-TG------A-CA-A-----AAT--GT-T--G-TA-GA--GA-C-GA-T-GT----AT-G----G-----AT-GTAGAC---A----A-CA----------GC-GG-GT---AT--A----CC-AT-AG-GG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGGA-T---ATGCT--C--C--A--A-C-G-T-CAG-C--TGG-CATGA-------G--G-G-----CA--T---A-GC-GTT-A-CTG-A---A-A------C-TTTA-AT----TGAA-AG-G---T------TA-TA--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGT-A-----CA----CAAG-GAGGG---T--AG-----AA--C--AAAGA-CCT-C-G-TAG-TGGC--A-A-GCGC----AG-AAA--AAT-GGCA------GC-TCA-T-G--G----G---G-TCCT---A-AAATA-G--T----GT-TTTT-G-GC-A-A-AAC--G-CATT-TG-GTTC--AT-TTCT-GCCG
gi|110151                     :                                                                                                                                                                                                                                                                         ----G-----AT-GT--AC---A----G-CAG-A-------GC-GG-TA---GT--G----CT-AT-AA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-AT
gi|110152                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                            ---A----G-CAG-G-------GC-GG-TC---TT--G----TC-AT-CA-AG---ATG--------C-T----T-C-AA-ATGCA-T---ATGCT--C--C--A--A-C-G-T-CAC-G--TGG-CGTGA-------A--G-G-----TT--T---A-AC-GTC-A-GTG-A---A-A------T-CATA-AT----TGAA-AG-G---T------TA-TG--GG---A---AA-GG---TT-C---CAGA-A-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--C--AAAGA-CCT-C-C-TAG-TGGC--A-A-GCTC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCA-T-A--G----G---G-GAAT---A-AAATA-G--T----GC-TGTT-G-AC-A-A-AAC--G-AAAT-CG-GTTC--AT-CTCT-GCTG
gi|110153                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            C-ATT-A-GTA-A---A-A------C-CGTA-AT----TTTG-AG-G---T---------------------------------C---CAGA-A-----CA----CAGG-GAGGG---T--GC-----AA--T--GAAGA-CAT-T-G-TAG-TGGT--A-A-TCGC----AG-AAG--AAT-GACA------GC-TCC-T-G--G----GC--G-TCCT---A-AAATG-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAC--G-CAAT-CG-GTTG--AT-CTCT-GCTG
gi|110154                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGA-A-----CA----CAGG-GAAGG---T--GC-----AA--C--AAAGA-CCT-C-C-TAG-TGCC--A-
gi|110155                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        G-AAG--AAT-TACA------GC-TCA-T-G--G----G---GGTCAT---A-AAATA-G--T----GC-TTTT-G-GC-A-A-AAC--G-CATT-TG-GTTC--AT-CACT-GCTG