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lowQualScore                  :   .       . .    .  .  .    ..  .  ..    ..   ..   ...   . .  .   .  .     ..........    ..      .    ...     ..   . ..  .... . ..  ..   .  ..   ..........     .  ...   ... ..      ..   ....  .        .        ....     .  .  .    . ... . .  .........     ..  . .    . . . ..  .   ...    .   .. . .  ... .. ..   .   .  .    .    .    .... .. ..  ... .    .    .   ... . .      ..    ..     .......... .    .  .     .        .   .    ....    ..   .  .        .  .       ...  .        .  .       . .   .   . . .      ...  .   .......         ... .   . . . ................      ..   .        .    .....  .......    ..       ..  .  . ...     .  .     .     .  .      .  ......... .   .....       ..    . ...  . .   .    .  . ..  ..    .   . .  .. .      . .    .   .   .   ...... ..   ...  ....  .        ..  .  .   . ....   .  ...       
lowQualScore                  :   2       7 4    4  2  1    99  2  55    99   11   777   2 1  1   0  2     6666666666    88      0    222     44   0 88  2222 0 55  99   1  99   5555555555     1  777   777 00      99   6666  1        2        1111     2  2  2    2 888 2 2  999999999     55  1 2    2 2 2 11  2   999    4   44 4 4  111 66 22   2   2  2    7    4    8888 11 99  777 2    1    1   777 1 2      11    66     3333333333 4    4  6     1        4   4    0000    22   4  4        4  4       555  7        2  1       1 1   2   2 2 2      111  4   7777777         111 4   4 4 5 7777777777777777      22   4        2    55555  3333333    99       99  1  1 777     1  0     0     0  0      0  000000000 0   00000       99    1 777  1 1   1    1  1 00  99    2   2 2  88 2      4 2    1   1   1   111111 00   777  5555  1        99  1  1   2 9999   5  444       
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Reference ( gi|92567 )        : AATTAAAATT-T-GTGT-TA-AC-GCCG--AC-GC-AGGGA--GTC-AAAC---TCA-C-GA-CGT-CGTGGTTG-----GTG--GTCC--GGAGCG-TTACCA-ACTGAA-CTA-C--GC----A-GTTCC--ATG-AG--CAT--C-------GAGTC-GT---TAA---T--TTTTAT--TAT----AA-AGTTAACA-TTGGCCTCT-T-GTTCT-AA-AT-ACCC-G---T-T-TT---------AAGAA--TTCA-AAAT-C-A-A--CT-TTT---TATT-GTAC-T-G-CT---G--G--TAA-ATT-GT-AAAG-CATT-CTAT----A--G--AT---G-ATTA-CTCT-GAA---A-A-GCAATA--GATA--GGCCT----------A-TATC-GCTGTAAAAGTTCTCAA-TAT-TGAT----TAGT--AAG-CA-ACCAACGT-CA-TTGGAAA---CG-TTTGTGAC-GT-CAATGTG-A-TGT-CAT-T-C-GTCTGA---AT-CAG-------AAACAAAAT---A-TGA-G-TTG-T-CTA----TAATT-GTTTCG--GGA-CTGACGAA-CCAG--C--TT-------ATTT--AGGGACC--AA-CA-T---CTAAT-GTCCCAAG-AAAAC-TA-AACATG-CG---------A-TGA-----ATTTCAG--TATA-A---AA-C-TGC-GCGG-CG-A-TTT--TATG-AGA-G-AC-AG-AGGCAA-G-CCTG-TCG-ATG-TTT------T--AAA---AT----AC-TCAAAAAT--GG-AC-TTCAC----CTC-AT---CAAAGTG
gi|92568                      : AAATAAAATT-T-GTGT-CA-AC-GCCG--AC-GC-GGGGA--GTC-GAAC---TCT-T-GG-CGT-CGCGGTTG-----GCG--GTCC--GGAGCG-TTACCG-ACTGAG-CTA-C--GC----A-GGCTC--ATG-AG--AAA--T-------GAGTC-GT---TAA---T--TTTTAT--TAT----AA-AGTTAACA-TTGGCCTCC-A-GTTCT-AA-AT-ACCC-GT--T-T-TT---------AAGAA--TTTA-AAAT-C-A-A--CT-TTT---TATT-GTAA-T-G-CT---G--G--TAA-ATT-GT-AATG-CATT-CTAT----A--A--AT---G-ATTA-CTCT-TAA---A-A-GCAATA--GATA--GGCCT----------A-TATC-GCCGTAAAAGTTCTCAATTAT-TGAT----TAGT--AAG-CA-ACCAACGT-CA-TTGGAAA---CGTTTTGTGAC-GT-CAATGTG-A-TGT-CAT-T-C-GTCTGA---AT-CAG-------AAACAAAAT---A-TGA-G-TTG-C-C------TAATC-GTTTCG--GGA-CTGAC-AA-CCAG--CT-TT-------ATTT--AGGGACC--AA-CA-T---CTAAT-GT-CCAAG-AAAAC-TA-AACATGCCG---------A-TGA-----ATTTCAG--TATA-A---AA-C-TGC-GCGG-CG-A-TTT--TATG-AGA-GAAC-AT-A-GCGA-G-CCTG-TCG-AT--TTT------T--AAA---AT----AC-TCAAAAAT--GG-AC-TTCGC----CTC-AT---CAAAGTG
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gi|92572                      : AATTAAAATT-T-GCATATA-A--GCCG--AC-GC--GGGA--ATA-GGAC---TCA-C-GA-TGT-CGCGTTTG-----AAG--GTCC--GGAGCG-TTACCG-AATGAG-CTA-C--GC----A-GGTCC--TCG-AG--CAT--T-------TAGTC-GT---TAA---T--TTTTAT--TAT----AT-AGTTAACA-ATGACTTCC-A-GTTCT-AA-AT-ACCC-T---TGT-TT---------AAGAA--TTTA-AAAT-C-A-A--CT-TTT---TATT-GTAA-T-G-CT---G--G--TAA-ATT-TT-AAAG-CATT-ATTT----A--G--AT---G-ATTA-CTCT-GAA---A-A-ACAATA--GAGA--GGCCT----------A-TTTC-GCCGTAAAAGTTCTCAA-TAT-TGAT----TAGT--AAG-CA-AACAACGT-CA-TTGGAAA---CG-TTTGTGAA-GT-CAATGTG-A-TGT-CAT-T-C-GTCAGC---AT-CAGCTGTAA-AAACAAAAC---A-CGA-G-TAG-C-C--------------TTCG--GGA-CTGACAAA-TTAG--CT-TT-------ATTT--AGGAACC--AC-AA-T---CTAAT-GT-CCAAG-AAAAC-TA-AACATG-CG---------A-TGA-----ATCCCAG--TATA-A---CA-C-TGC-ACGG-CG-A-TTTTATATG-AGA-G-AC-TG-AGGCAA-G-CCTG-TCG-ATG-------------------------------AAACT--GG-AC-TCCGCCAAACTA-TT---CAAAGTG
gi|92573                      : AATAAAAATTAT-GTGT-GA-ACCGCCG--AC-GC-GGGGA--GTC-GAAC---TCA-C-GA-CGT-CGCGG-TG-----GC---GTCG--GGAGC--TTACCG-ACTGAG-CTA-C--GC----A-GGCCC--ACA-AG--CAT-----------AGTC-GT---TAA---T--TTTTAT--TAT----AA-A-TTAACA-TT-GCCTCC-CAGTTCT-AA-AT-ACCC-GTTTT-T-TT---------AAGAA--TGTA-AAA--C-A-A--C--TTT---TA-T-GTAA-T-G-CT---GC-G--TAAGATT-GT-GAAGCCATT-CTAT----T--G--AT---G-ATTAGCTCT-GAA---A-A-GCAATATTGATA---GCCT----------A-TATC-GCC-TAAAAGTT-TCAG-TAT-TGA-----TAGA--AAG-CA-ACCAACGT-CA-TTGGAAAG--CG-TTTGTGAC-GTCCAATATG-A-TGT-CAT-T-C-G
gi|92576                      : AATCAAAATT-C-GTAT-TT-TC-GCTG---T-GC--GGGA--GTC-GAAC---TCA-C-GA-CGT-TGCGGTTG-----GCG--GTCC--G------TTACTG-ACTGAG-CTA-C--GCC---A-GGCCC--TCG-AG--CAT--A-------CAGTCCGT---TAT---T--TTTAAT--TAT----AA-AGTTAACA-TTGGCCTCC-A-GTTCT-AATAT-AGCC-AC--T-T-TT---------AAGAG--CTTA-AAAT-C-A-AACTT-TTT---TATT-GTA--T-G-CT---G--G--TAA-ATT-GT-AAAG-CATT-TTGT----A--AGCAT---G-A--A-CTCT-GAA---A-A-ACAATG--GGTAG-GGCCT------------TATT-GCCGTAAAAGTTCTC-A-TAT-TGAT----TAGT--AAG-CA-ACCAACAT-CA-TTGGATA---CC-TTTGTGAC-GT-CAAT-CG-A-TG
gi|92577                      : AAATAACATT-T-TTTT-TCTAC-GCCG--TT-GC-GAGGA--GTC-GAAC---TGA-A-GA-CGT-TGCTGTTG-----GAT--GTCC--GGAACG-TTACTG-AATGAG-CTA-C--GC----A-GACCC--TCG-AG--CAT--T-------ACGTT-GT---TAA---T--CTTTAC--TAT----AA-AGTTAACA-TTAGCCCTC-A-GTTCT-AA-AT-ACCC-G---T-T-TTTGCG-----AGGTG--TTC--AAGT-C-A-G--CT-TCC---TATggatccattacactcaacaa
gi|92575                      : AAATAAAATT-T-GTGT-TA-AC-GCCG--AC-GC-GGGGA--GTT-TAAC---TCA-C-GA-CGT-CGCGGTTG-------------------GCG-TTACCG-ATTGAG-CTA-C--GC----A-GGCCC--ATG-AATCCATGCT-------GAGTC-GT---TAA--------TTAA--TAT----AA-GTTCAACA-GTGGCgttagcgtccagtaaa
gi|92578                      : AAATAAAATT-T-GTGT-TA-AC-GGCG--AT-GC-GTGGA--GTC-GAAC---TCAAC-GA-CGT-TGCGGTT--------------------------ACCG-ACTGAG-CTA-A--GC----A-GGCCC--ACA-AG--CAT--T-------GAGTC-GT---TAA---T--CTTTAT--TAT----AA-AGTtcgatttctaga
gi|92579                      : AATTAAAATT-T-GTAT-TT-TC-ACCGTTTC-GC---CAA--GTC-CAAC---TCA-C-GA-CGT-CGCGATTA-----GAA--GTCC--GGAGCG-TTACCG-ATTGAG-CTA-C--GC----A-G
gi|92580                      :    TAAAAGT-T-GT---TA-AC-GCCG--ACAGC-GGAGA--GTCCAAAC---TCA-C-AAACGT-CGCGGTTG-----GCG---TCC--AGAGCG-TTAC---GCTGA--CTA----GC----A-GGCCC--ATG-AG--CAT--C-------G------T---TAA---T--TTT-AT--TAT----AA-A-TTAACACTTGGCCTCA---GTTCT-AA-AT-ACCCCG---T-T-TT---------AAGAAATTTAA-AAAT-C-A-A--CT-TTT---TAT--GTAA-T-G-CT---G--G--TAA--TT-GT-AAAA-CATT-CTAT----A--A--AT---G-ATTA-CTCT-GAATGAA-A-GCAATA--GGTA--GGCCT----------AATATCAGCCGTAAAAGTTCTCAA-ATT-TGAT----TAGT--AAG-CA-AC-AACGT-CA-TTGGAAA---CG-TTTGTGACCGT-CAATGTG-AATGT-CAT-T-C-GCCTGA---AT--AG-------AAACAAAAT---A-TGAAG-TTG---CTA-----AATCCGTTTCG--GGA-CTGACGAA-TCAG--C--TTCA-----ATTT--AGGGACC--AAACA-T---CTAAT-GTCCCAAG-AAAAC-TA-AACATG-CG---------A-TAA-----ATTTCAG--TAT--A---AA-C-TGC-ACGG-CG-ATTTT--TATA-AGA-G-AC-AG-AGGTAAGG-CCTG-TCG-ATG-TTT------A--AAA---AT----AC-TCAAAAAT--GG-AC-TTTGC----CTC-ATATGCAAAGTGg
gi|92581                      :    TAAAATT-T-GTGT-TA-AC-ACCG--AC-GC-AGGGA--GTC-GAAC---TCA-C-GA-CGT-CGCTGTTG-----GCG--GCCC--GGAGCG-TTACCG-ACTGAG-CTA-T--GC----A-GGCCC--ATG-AG--CAT--T-------GAGTC-AT---TAA---T--TTTTAT--TAT----AA-CGTTAACA-TTGGCCTCA-A-GTTCT-AA-AT-ACCC-GT--T-T-TT---------AAGAA--ATCG-AAAT-C-A-A--C--TTT---TATT-GTAA-T-G-TC---GTCG--AAA-GTT-GT-AA
gi|92582                      :     AAAATT-T-GTGT-CA-AC-GCCG--AC-GC-GGGGA--GTC-GAAC---TCA-C-GA-CGT-CGCGGTTG-----GCG--GTCC--CGAGCG-TTACCA-ACTGAG-CTA-C--GC----A-GGTCC--ATG-AG--CAT--T-------GAGTC-GT---TAA---T--TTGTAT--TAT----AA-AGTTAACA-TTGGCCTCC-A-GTTCT-AA-AT-ACCC-GT--T-T-TT---------AAGAA--TTTA-AAAT-T-G-A--AT-TTT---TATT-GTAA-T-G-CT---G--G--TAA-ATT-GT-AAAG-CATT-CTAT----A--G--AT---G-CTTA-CTCT-GAA---A-A-GCAATA--GATA--GGCTT----------A-TATC-GCCGT-AAAGTTCTCAA-TAT-TGAT----TAGT--AAG-CA-ACCAACGT-CA-TTGGAAA---CG-TTTGTGAC-GT-CAGTGTG-A-TGT-CAT-T-C-GTCTGA---AT-CAGCTGTAA-AAACAAAAT---A-TTA-G---G-C-CTA-------------------GA-CTGACGAA-CCAG--CT-TT-------ATTT--AGGG-----AA-CG-TTCACTAAT-GT--CAAA-GAAAC-TATAACATT-CG---------A-AGA-----A-TTCAG--TATA-A---AA-C-TGC-GCGG-CG-A-TTC--TATG-AGA-G-AC-AG-AGGCAA-G-CCTG-TCG-A-G-TTT------T--AAA---AT----A--TCAAAACT--GGAAC-TTCGC----gtgcctctgagggagcgccaggggtcgggtcgcatcatggtagattgcgattatttcgacaagaatagataggggcctgagtgcgccgatccgccgtaaagttctcaagattgatatgctagtaagccaatcgacgtccattggaaacgtttgtgacgtcaa
gi|92583                      :     AAAATTCT-GTGT-TA-AC-GCCG--AC-GC--GAAA--GTC-CGACACGTCAACAGA-CGTGCGCGGTTG-----GCG--TCTC--GGAGCG-TTACCG-ACTGAG-CTA-C--GC----A-GTTCCCAATGCAG--CAT--T-------GAGTC-GT---TAA---T--TTT-AT--TAT----AA-AGTTA-CA-TTGACCTCC-CAGTTCT-AA-GTTACCC-G---T-T-TTT--------AAGAA--TTTA-AAAT-C-A-A--CT-TTT---TATTTGTACAT-GACT---G--G--TAA-ATTTGT-AAAG-CAAT-TCAT----A--G--AT---GCATTA-CTCT-AAA---GCA-ACAATT--GATA--AGCCT----------A-TATC-GCCGTAAAAGTTGTCAA-TAT-TTAT----TAGT--AGG-CA-ACCAACGT-CA-TTGGAAA---CG-TTTGTGAC-GT-CAATGTG-A-TGT-CAT-T-C-GTCTGA---AT-CAG-------AAACAAAATTATA-TCA-G-TTG-C-CTAGGCCTAATC-GTTTTG--GGA-CTGACGAA-CCAG--C--TTT------ATTT--AGGGACC--AA-CA-T---CTAAT-GTCCCAAG-AAAAC-TA-AACATG-CG---------A-TGA-----ATTTCAG--TATA-A---AA-C-TGC-GCGG-CG-A-TTT--TATG-AGA-G-AC-AG-AGGTAA-G-CCTG-TCG-ATG-TT------------------------------AAT--GG-AC-TTCGC----CTC-AT---CAAAGTG
gi|92584                      :     AAAGTT-T-GTGT-TA-AC-GCTG--AC-GC-GGGGA--GTC-GAAC---TCA-C-GA-CGT-CGCCATTG-----ACG--GTC---GGAGCGATTAC-G-ATTGAG-CTA-C--GC----A-GGCCC--ATG-AG--CAT--T-------GAGTC-GT---TAA---TA-TTTTAT--TTTT---AA-AGTTAATA-TTGGCCTCC-A-GTTCT-AA-TT-ACCC-G---T-T-TTT--------AAGAA--TTTA-AAAT-CGA-A--TTCTTT---TATT-GTAA-T-G-CT---G--G--TAA-ATT-GT-AAAG-CATT-CTAT----A--G--AT---G-ATTA-CTCT-GAA---A-A-GCAATA--GATA--GGT-T----------A-TATC-GCAGTAAA-GTTCTCAA-TAT-AGAT----TAGT--AAG-CA-ACCAACGT-CA-TTGGAAA---CG-TTTGTGAC-GT-CAGTGTG-A-TGT-CAT-T-C-GTCTGA---AT-CAGCTGTAA-AAACAAAAT---A-TTA-G--------------------GCTT----AGA-CTGACGAA-CCAGA-T--TT-------ATTT--AGGGACA--AA-CA-T---CTAAT-GT--CAAA-GAAAC-TA-TACATT-CG---------A-AGA-----ATTTCAG--TATA-A---AA-C-TGC-GCGG-CG-A-TTC--TATG-AGA-G-AC-AG-AGGCAA-G-CCTG-TTG-ATG-TTT------T--AAA---AT----AC-TCACACCT--GG-AC-TTCAC----
gi|92585                      :       AATT-T-ATTT-TA-AC-GCCG--AC-GTTGGGGA--GTC-GAAC---TCA-C-GA-CGT-CGCAGTTG-----GCG--GTCA--GGAGCG-TTACCG-ACTGAG-CTACC--GC----A-G-GCC--ATA-AG--CAA--T-------GAGAC-GT---TAA---T--TTTTAT--TTT----AA-AGTTAAC--TTGGCCTCT-A-GTTCTAAA-AT-ACCC-G---T-TCTT---------AAGAAT-TTTA-AAAG-C-A-A--CT-TTT---TATT-GTAA-T-G-CT---G--G--TAA-ATT-GTAAAAG-CATT-TTCT----AGTG--AC---G-ATTA-CTCT-GAA---A-AGGCAATA--GATA--GGCCT----------A-TAC---CCGTAAAAGTTTTC-G-TAT-TATT----TAGTTAAGG-CA-ACAAACGT-CATTTGGAAAAACTT-TTTGTGAC-GT-CAAGTTG-A-TGTGCAT-T-C--TCTGA---AT-CAGCTGTAAAAAACAAAAT---ATTGA-G-TAG-C-C------TAATC-GTTTTGTTGGA-CTGACT-A-CCAG--CTTTT-------ATTT--TGGGACG--GA-CA-T---CTAAT--TCCTAAG-AAAACTTA-AACAAG-CGATTTTCGGCA-TGA-----ATTTCAGTTTATA-A---AA-CTTGC-GCGG-CG-A-TTT--TATG-GGA-G-AC-AG-A-GCAA-G-CCTT-TCGCATG-ATT------T---AA---AT----GC-TCAAAAAT--GG-AC-TTCGC----CTCAAT---TAAAGCG
gi|92586                      :                     -AC-GGCA--ACCGC-GGGGGCCGTT-GAAC---CTA-C-GA-CGT--GCGGTTG-----GTG--GTCCTCGGAGTG-TTACCAGACTGAGGCTA-C--GCCACAA-GGCCC--ACA-AG--CAT--CCTAAGTTGAGTC-GTCTGTAAGTTT--TTTTATCATAT----AA-AGTTAACA-TTG-CCTCT-A-GTTCT-AA-AT-ACC--G---T-T-GT---------AAGAAC-TTTACAAAT-C-ATA--CT-TTT---TATT-GTAA-T-G-CT---G--G--TAA-ATT-GT-AAAGCCATT-ATACGTTGA--A--AT---GAATTA-CTCT-GAA---G-ACGCAATA--GATA--GGCCT----------A-TATC-GCCGTGAACGTT-TCAG-TA--TGAT----TAGT--AAG-CAGACCAACGT-CA-ATTGACA---CGTTTTGTGAC-GT-CAATGTGAA-GGT-CATGT-CGGTCTGA---AT-CAGCTGTAA-GAACAAAAC---A-TGA-G-TAGCC-CTG----AACTC-GTTTCA--GGA-CTGACGAA-CCAAGTT--TT-------ATTCTGAGGGACCTGAT-CA-T---CTAAT-GTCCCAAGAAAAAC-TAGAACATG-CG---------ATTGACTGGTGTCTCAT--CATACA---AA-T-TGCTGCAG-CG-A--TT--TATGAAGA-G-AC--G-AGGCAA-GCCCTG-TCG-AAG-TTT------T--AAA---AT----AC-TAGAAAATGCGA-AC-TTCGC----CTC-AT---ACAAGTG
gi|92588                      :                       C-GGCA--AC-GC-GGGGA--GTT-GAAC---TCA-C-GA-CGT-CGCGGT
gi|92574                      :                                                                 GT-GGTGGTCGAACTCGTGTTATCC--GGAGCG-TTACCG-ACTGAG-CTA-CCCGC----A-AGTCC--TCG-AA--TAC--T-------ACGTT-GT---TAA---T--CTTTAT--TAT----AT-AGTTAACA-TTCGCCTAC-A-GTTCT-AA-AT-ACCC-G---T-T-TTTAAGTTTTTAAGAG--TTGA-AAAT-A-A-A--CT-TTTTTTTATT-GTAA-C-A-TT---G--T--TAA-ATT-GT-AAAG-CTAC-CTGT----A--T--AT---G-ATTA-CTCT-GAA---A-A-ACGATA--GTTA--GACCT----------A-TACC-GCCGTGAAAGTTTTCAA-TATATAAT----TAGT--CAG-CG-ATCAACAC-CA-TTGGAAA---CG-TTTGTGAC-GT-CAATGTA-G-TG--CAC-TAC-GTCTGA---TT-CAGTTGTAA-AAACGAAAC---A-TGA-G-TT-----TA----CAATC-GTTTCG--GGA-CTGACAAA-TCAGT-T--TT-------ATTT--AGGTACC--AA-GA-T---CTCAT--------G-AAAAC-TA-AATATC-CG---------A-TGA-----ATTT
gi|92590                      :                                                           aaataaagattatttttgcgtcgct--GTCG--GGAGCG-TTACCA---CGA--CTA-C--GC----AAGGCCC--A-G-AG--CAT--T-------GAGTC-GA---CAA---TACTTTTTT--TATCAACAACAGTTA-CA-TTGATCTCCAT-TTTTT-AA-AT-ACCT-G---T-T-TTT--------AAGAA--TT---AAAT-C-A-A--AT-TG-----ATT-GTAA-TCG-CTCTCG--GAATAA-AA--AC-AAA---AAT-CTATCC--A--G--AT---G-ACTA-CTCT-G-----A-A-GCAATA--GAT
gi|92591                      :                                                                                                                                                                                                                            -AA-AT--CCC-G---T-T-TT---------TCAGA--TTTA-AAATTC-A-G--CT-TTT---TAT--GTAA-T-G--T---G--G--TAA--TT-GT-AAAG-CATTTCTAT----A--G--AT---G-AT-A-CTCT-GAA---G-A-G-AATA--GGTA--GGCCT----------A-TAT--GC-GTAAA-GTTCTCAA-TAT-TGAT----TAGT--AAG-CA-ACCA-CGT-CA-TTGAAAG---T--TTTGTGAC-GT-CA-TGTG-A-TGT-CAT-T-C-GCCTGA---AT-AAG-------AAACAAAAA---A-TGA-GTTTG-C-C------TAATC-GTTTC---GGA-CT---GAA-CCAC--T--TT-------A-TT--AGGGACC--AA-CA-T---CTAAT-GT-CCAAG--AAAT-TA-AACATG-CG---------A-TG------ATTTCAG--TATA-T---AA-A-TGC-GTGG-CG-A-ATA--TAT---GA-G-AC--G-AGGCAA-G-CCAGATCG-ATA--TT------T--AAA---AT----ACGTCAAAA-----G-AC-TT--T----CT--AT---CAAAGTG
gi|92592                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       A-ATT-GT-AAAG-CATT-CTAT----T--G--AT---G-ATTA-CTCTAGAA---A-A-
gi|92581                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T----A--G--ATTGCG-ATTA-TTTC-GAC---A-A-G-AATA--GATAGGGGCCTGAGTGCGCCGA-T-CC-GCCGT-AAAGTTCTCAA-GAT-TGATATGCTAGT--AAGCCA-ATCGACGTCCA-TTGGAAA---CG-TTTGTGAC-GT-CAA
gi|92593                      :                                                                                                  taaaatttgtgttaacaccgacgcagggagtcgaactcacgacgtcgctgttggcggcccggagcgttaccgactgagctatgcaggcccatgagcattgagtcattaatttttattataacgttaacattggcctcaagttctaaatacccgtttttaagaaatcgaaatcaacttttattgtaatgtcgtcgaaagttgtaagtgcctctgagggagcgccaggggtcgggtcgcatcatgg--AT---G-ATTA-TTCT-GAA---A-A-GCAATA--AATA--AGCCT----------A-TATC-GCCGTAAA-GTTCTCAA-TAT-TGAT----TAGT--AAG-CA-ACCAACGT-CA-TTGGAAA---CG-TTTGTGAC-GT-CAATGTG-A-TGC-TAA-T-C-GTCTGA---AT-CAG-------AAACAAAAT---A-TGA-G-TTG-C-CTA------ATC-GTTTCG--GGA-CTGACGAA-CCAG--C--TTTAGGCCTATTT--AGGGACC--AA-CA-T---CTAAT-GTCCCAAG-AAAAC-TA-AACATG-CG---------A-TGA-----ATTTCTG--TATA-A---AT-C-TGC-GCGG-CG-A-TTT--TATG-CGA-A-AC-AG-AGGCGA-T-CCTG-TCG-ATGTTTT------T--ATA---AT----AC-TCAAAAAT--GG-ACATACAC----CTC-TG---CAAAGTG
gi|92594                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTGGAAC-GT---ATGCG-A-TG--CAT-T-C-GTCTAATAGAT-CTGTA-----AAACAAACA---A-TGA-G-TAG-T-C-A----TA-TC-GTTTTG--GGAACTGA-GAA-CAAG--C--TTT------ATTT--AGGGACG--AA----T---CTAA--GT----AG-AAA-C-TA-AA---------------------------TTTCAC--TACA-A---A--C-TGC-GCGG-CG-A-TTT--T-----GA-G-AC--G-AGGCA---------------G-TTT------T--AAA---AT----A--TCAAAACT--GG-AT-T
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|92589 ): CCGAGCACGGGGTTCGAACTCATGACCTCCCGATCACGAGGCGAGAGCAACGTGACCGCTGGAAACATGCAGGCACATGAAGTGATGTCACATTGTGTAGTTATTTTAATTATATAGTGTTAACGTT
Unaligned ( gi|92587 ): ACGCCCACGTTGGGACTCGAACTCAAGACCCTCATATTAAAAGTCTGATGCTCTACCGACTGAGCTACGCGGGC






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Reference ( family-581 )      :                                                                                                                                                                                                                                                 AANTAAAATT-T-GTGT-TA-AC-GCCGA-C-GC-GGGGA--GTC-GAAC---TCA-C-GA-CGT-CGCG-GTT----GGCGGTCC--GGAG---CG-TTACC-GACTG--AG-CTA-C--GC----A-GGCCC--ACG-A---------G--CAT-------TGAGTC-GT---TAA---T--TTTTAT--TAT----AA-A--GTTAACA-TTGGCCTCC-AGTTCT-AA-AT-ACCCG--TTTTTAAG--------A-A-T-TTA-AAA-T-C-A-A--CT-TTT---TATT-GTA-AT-G-CT---G--G--TAA-ATT-GT-AAAG-C-ATT-CTAT----A--G--AT---G-A-TTA-CTCT-GAA---A-A-GCAATA--GATA--GGCCT----------A-TATC-GCCGTAAAAGTTCTCAA-TAT-TGAT----TAGT--AAG-CA-ACCAACGT-CA-TTGGAAA---CG-TTTGTGAC-GT-CAATGTG-A-TGT-CAT-T-C-GTCTGA---AT-CAG-------AAACAAAAT---A-TGA-G-TTG-C-CTA----TAATC-GTTTCG--GGA-CTGACGAA-CCAG--C--T-------T--ATTT--AGGGACC--AA-CA-T---CTAAT-GTCCCAAG-AAAAC-TA-AACATG-CG---------A-TGA-----ATTTCAG--TATA-A---AA-C-TGC-GCGG-CG-A-TTT--TATG-AGA-G-AC-AG-AGGCAA-G-CCTG-TCG-ATG-TTT------T--AAA---AT----AC-TCAAAAAT--GG-AC-TTCGC----CTC-AT---CAAAGTG
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gi|92574                      :                                                                                                                                                                                                                                             aataAAATAAAGAT-T-ATTT-TT-GC-GTCGC-T-GT-GGTG---GTC-GAAC---TC--------GT------GTT----A----TCC--GGAG---CG-TTACC-GACTG--AG-CTA-CCCGC----A-AGTCC--TCG-A---------A--TAC-------TACGTT-GT---TAA---T--CTTTAT--TAT----AT-A--GTTAACA-TTCGCCTAC-AGTTCT-AA-AT-ACCCG--TTTTTAAGTTTTTAAGA-G-T-TGA-AAA-T-A-A-A--CT-TTTTTTTATT-GTA-AC-A-TT---G--T--TAA-ATT-GT-AAAG-C-TAC-CTGT----A--T--AT---G-A-TTA-CTCT-GAA---A-A-ACGATA--GTTA--GACCT----------A-TACC-GCCGTGAAAGTTTTCAA-TATATAAT----TAGT--CAG-CG-ATCAACAC-CA-TTGGAAA---CG-TTTGTGAC-GT-CAATGTA-G-TG--CAC-TAC-GTCTGA---TT-CAGTTGTAA-AAACGAAAC---A-TGA-G-TT-----TA----CAATC-GTTTCG--GGA-CTGACAAA-TCAGT-T--T-------T--ATTT--AGGTACC--AA-GA-T---CTCAT--------G-AAAAC-TA-AATATC-CG---------A-TGA-----ATTT
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gi|92581                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T----A--G--ATTGCG-A-TTA-TTTC-GAC---A-A-G-AATA--GATAGGGGCCTGAGTGCGCCGA-T-CC-GCCGT-AAAGTTCTCAA-GAT-TGATATGCTAGT--AAGCCA-ATCGACGTCCA-TTGGAAA---CG-TTTGTGAC-GT-CAAgtgcctctgagggagcgccaggggtcgggtcgcatcatggtagattgcgattatttcgacaagaatagataggggcctgagtgcgccgatccgccgtaaagttctcaagattgatatgctagtaagccaatcgacgtccattggaaacgtttgtgacgtcaa
gi|92582                      : taaaatttgtgttaacaccgacgcagggagtcgaactcacgacgtcgctgttggcggcccggagcgttaccgactgagctatgcaggcccatgagcattgagtcattaatttttattataacgttaacattggcctcaagttctaaatacccgtttttaagaaatcgaaatcaacttttattgtaatgtcgtcgaaagttgtaagtgcctctgagggagcgccaggggtcgggtcgcatcatggAAAATT-T-GTGT-CA-AC-GCCGA-C-GC-GGGGA--GTC-GAAC---TCA-C-GA-CGT-CGCG-GTT----GGCGGTCC--CGAG---CG-TTACC-AACTG--AG-CTA-C--GC----A-GGTCC--ATG-A---------G--CAT-------TGAGTC-GT---TAA---T--TTGTAT--TAT----AA-A--GTTAACA-TTGGCCTCC-AGTTCT-AA-AT-ACCCG--TTTTTAAG--------A-A-T-TTA-AAA-T-T-G-A--AT-TTT---TATT-GTA-AT-G-CT---G--G--TAA-ATT-GT-AAAG-C-ATT-CTAT----A--G--AT---G-C-TTA-CTCT-GAA---A-A-GCAATA--GATA--GGCTT----------A-TATC-GCCGT-AAAGTTCTCAA-TAT-TGAT----TAGT--AAG-CA-ACCAACGT-CA-TTGGAAA---CG-TTTGTGAC-GT-CAGTGTG-A-TGT-CAT-T-C-GTCTGA---AT-CAGCTGTAA-AAACAAAAT---A-TTA-G---G-C-CTA-------------------GA-CTGACGAA-CCAG--CT-T-------T--ATTT--AGGG-----AA-CG-TTCACTAAT-GT--CAAA-GAAAC-TATAACATT-CG---------A-AGA-----A-TTCAG--TATA-A---AA-C-TGC-GCGG-CG-A-TTC--TATG-AGA-G-AC-AG-AGGCAA-G-CCTG-TCG-A-G-TTT------T--AAA---AT----A--TCAAAACT--GGAAC-TTCGC----
gi|92583                      :                                                                                                                                                                                                                                                     AAAATTCT-GTGT-TA-AC-GCCGA-C-GC-GAA-A--GTC-CGACACGTCAACAGA-CGTGCGCG-GTT----GGCGTCTC--GGAG---CG-TTACC-GACTG--AG-CTA-C--GC----A-GTTCCCAATGCA---------G--CAT-------TGAGTC-GT---TAA---T--TTT-AT--TAT----AA-A--GTTA-CA-TTGACCTCCCAGTTCT-AA-GTTACCCG--TTTTTAAG--------A-A-T-TTA-AAA-T-C-A-A--CT-TTT---TATTTGTACAT-GACT---G--G--TAA-ATTTGT-AAAG-C-AAT-TCAT----A--G--AT---GCA-TTA-CTCT-AAA---GCA-ACAATT--GATA--AGCCT----------A-TATC-GCCGTAAAAGTTGTCAA-TAT-TTAT----TAGT--AGG-CA-ACCAACGT-CA-TTGGAAA---CG-TTTGTGAC-GT-CAATGTG-A-TGT-CAT-T-C-GTCTGA---AT-CAG-------AAACAAAATTATA-TCA-G-TTG-C-CTAGGCCTAATC-GTTTTG--GGA-CTGACGAA-CCAG--C--T-------TT-ATTT--AGGGACC--AA-CA-T---CTAAT-GTCCCAAG-AAAAC-TA-AACATG-CG---------A-TGA-----ATTTCAG--TATA-A---AA-C-TGC-GCGG-CG-A-TTT--TATG-AGA-G-AC-AG-AGGTAA-G-CCTG-TCG-ATG-TT------------------------------AAT--GG-AC-TTCGC----CTC-AT---CAAAGTG
gi|92584                      :                                                                                                                                                                                                                                                     AAAGTT-T-GTGT-TA-AC-GCTGA-C-GC-GGGGA--GTC-GAAC---TCA-C-GA-CGT-CGCC-ATT----GACGGTC---GGAG---CGATTAC--GATTG--AG-CTA-C--GC----A-GGCCC--ATG-A---------G--CAT-------TGAGTC-GT---TAA---TA-TTTTAT--TTTT---AA-A--GTTAATA-TTGGCCTCC-AGTTCT-AA-TT-ACCCG--TTTTTAAG--------A-A-T-TTA-AAA-T-CGA-A--TTCTTT---TATT-GTA-AT-G-CT---G--G--TAA-ATT-GT-AAAG-C-ATT-CTAT----A--G--AT---G-A-TTA-CTCT-GAA---A-A-GCAATA--GATA--GGT-T----------A-TATC-GCAGTAAA-GTTCTCAA-TAT-AGAT----TAGT--AAG-CA-ACCAACGT-CA-TTGGAAA---CG-TTTGTGAC-GT-CAGTGTG-A-TGT-CAT-T-C-GTCTGA---AT-CAGCTGTAA-AAACAAAAT---A-TTA-G---G-C-TTA-------------------GA-CTGACGAA-CCAGA-T--T-------T--ATTT--AGGGACA--AA-CA-T---CTAAT-GT--CAAA-GAAAC-TA-TACATT-CG---------A-AGA-----ATTTCAG--TATA-A---AA-C-TGC-GCGG-CG-A-TTC--TATG-AGA-G-AC-AG-AGGCAA-G-CCTG-TTG-ATG-TTT------T--AAA---AT----AC-TCACACCT--GG-AC-TTCAC----
gi|92585                      :                                                                                                                                                                                                                                                       AATT-T-ATTT-TA-AC-GCCGA-C-GTTGGGGA--GTC-GAAC---TCA-C-GA-CGT-CGCA-GTT----GGCGGTCA--GGAG---CG-TTACC-GACTG--AG-CTACC--GC----A-GG-CC--ATA-A---------G--CAA-------TGAGAC-GT---TAA---T--TTTTAT--TTT----AA-A--GTTAAC--TTGGCCTCT-AGTTCTAAA-AT-ACCCG--TTCTTAAG--------A-ATT-TTA-AAA-G-C-A-A--CT-TTT---TATT-GTA-AT-G-CT---G--G--TAA-ATT-GTAAAAG-C-ATT-TTCT----AGTG--AC---G-A-TTA-CTCT-GAA---A-AGGCAATA--GATA--GGCCT----------A-TAC---CCGTAAAAGTTTTC-G-TAT-TATT----TAGTTAAGG-CA-ACAAACGT-CATTTGGAAAAACTT-TTTGTGAC-GT-CAAGTTG-A-TGTGCAT-T-C--TCTGA---AT-CAGCTGTAAAAAACAAAAT---ATTGA-G-TAG-C-C------TAATC-GTTTTGTTGGA-CTGACT-A-CCAG--CTTT-------T--ATTT--TGGGACG--GA-CA-T---CTAAT--TCCTAAG-AAAACTTA-AACAAG-CGATTTTCGGCA-TGA-----ATTTCAGTTTATA-A---AA-CTTGC-GCGG-CG-A-TTT--TATG-GGA-G-AC-AG-A-GCAA-G-CCTT-TCGCATG-ATT------T---AA---AT----GC-TCAAAAAT--GG-AC-TTCGC----CTCAAT---TAAAGCG
gi|92586                      :                                                                                                                                                                                                                                                                     -AC-GGCAA-CCGC-GGGGGCCGTT-GAAC---CTA-C-GA-CGT--GCG-GTT----GGTGGTCCTCGGAG---TG-TTACCAGACTG--AGGCTA-C--GCCACAA-GGCCC--ACA-A---------G--CATCCTAAGTTGAGTC-GTCTGTAAGTTT--TTTTATCATAT----AA-A--GTTAACA-TTG-CCTCT-AGTTCT-AA-AT-ACC-G--TTGT-AAG--------A-ACT-TTACAAA-T-C-ATA--CT-TTT---TATT-GTA-AT-G-CT---G--G--TAA-ATT-GT-AAAG-CCATT-ATACGTTGA--A--AT---G-AATTA-CTCT-GAA---G-ACGCAATA--GATA--GGCCT----------A-TATC-GCCGTGAACGTT-TCAG-TA--TGAT----TAGT--AAG-CAGACCAACGT-CA-ATTGACA---CGTTTTGTGAC-GT-CAATGTGAA-GGT-CATGT-CGGTCTGA---AT-CAGCTGTAA-GAACAAAAC---A-TGA-G-TAGCC-CTG----AACTC-GTTTCA--GGA-CTGACGAA-CCAAGTT--T-------T--ATTCTGAGGGACCTGAT-CA-T---CTAAT-GTCCCAAGAAAAAC-TAGAACATG-CG---------ATTGACTGGTGTCTCAT--CATACA---AA-T-TGCTGCAG-CG-A--TT--TATGAAGA-G-AC--G-AGGCAA-GCCCTG-TCG-AAG-TTT------T--AAA---AT----AC-TAGAAAATGCGA-AC-TTCGC----CTC-AT---ACAAGTG
gi|92587                      :                                                                                                                                                                                                                                                                     -AC-GCCCA-C-GT-TGGGA--CTC-GAAC---TCA-A-GA-C-C-CTCATATT----AAAAGTCT--GATG---CT-CTACC-GACTG--AG-CTA-C--GC----G-GGC
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gi|92589                      :                                                                                                                                                                                                                                                                          CCGAGC-AC-GGGG---TTC-GAAC---TCA-T-GA-CCT-CCCG-ATCACGAGGCG------AGAGCAACG-TGACC-G-CTGGAAA-C-A-T--GC----A-GGCAC--ATG-AAGTGATGTCA--CAT-------TGTGTA-GT---T-A---T--TTTAAT--TAT----AT-AGTGTTAACG-TT
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gi|92591                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -AA-AT--CCCG--TTTTTCAG--------A---T-TTA-AAA-TTC-A-G--CT-TTT---TAT--GTA-AT-G--T---G--G--TAA--TT-GT-AAAG-C-ATTTCTAT----A--G--AT---G-A-T-A-CTCT-GAA---G-A-G-AATA--GGTA--GGCCT----------A-TAT--GC-GTAAA-GTTCTCAA-TAT-TGAT----TAGT--AAG-CA-ACCA-CGT-CA-TTGAAAG---T--TTTGTGAC-GT-CA-TGTG-A-TGT-CAT-T-C-GCCTGA---AT-AAG-------AAACAAAAA---A-TGA-GTTTG-C-C------TAATC-GTTTC---GGA-CT---GAA-CCAC--T--T-------T--A-TT--AGGGACC--AA-CA-T---CTAAT-GT-CCAAG--AAAT-TA-AACATG-CG---------A-TG------ATTTCAG--TATA-T---AA-A-TGC-GTGG-CG-A-ATA--TAT---GA-G-AC--G-AGGCAA-G-CCAGATCG-ATA--TT------T--AAA---AT----ACGTCAAAA-----G-AC-TT--T----CT--AT---CAAAGTG
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gi|92593                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               --AT---G-A-TTA-TTCT-GAA---A-A-GCAATA--AATA--AGCCT----------A-TATC-GCCGTAAA-GTTCTCAA-TAT-TGAT----TAGT--AAG-CA-ACCAACGT-CA-TTGGAAA---CG-TTTGTGAC-GT-CAATGTG-A-TGC-TAA-T-C-GTCTGA---AT-CAG-------AAACAAAAT---A-TGA-G-TTG-C-C------TAATC-GTTTCG--GGA-CTGACGAA-CCAG--C--TTTAGGCCT--ATTT--AGGGACC--AA-CA-T---CTAAT-GTCCCAAG-AAAAC-TA-AACATG-CG---------A-TGA-----ATTTCTG--TATA-A---AT-C-TGC-GCGG-CG-A-TTT--TATG-CGA-A-AC-AG-AGGCGA-T-CCTG-TCG-ATGTTTT------T--ATA---AT----AC-TCAAAAAT--GG-ACATACAC----CTC-TG---CAAAGTG
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gi|92577                      :                                                                                                                                                                                                                                                 AAAT-AACA-TT-T-TTTT-TCTAC-GCCGT-T-GC-GAGGA--GTC-GAAC---TGA-A-GA-CGT-TGCT-GTT----GGATGTCC--GGAA---CG-TTACT-GAATG--AG-CTA-C--GC----A-GACCC--TCG-A---------G--CAT-------TACGTT-GT---TAA---T--CTTTAC--TAT----AA-A--GTTAACA-TTAGCCCTC-AGTTCT-AA-AT-ACCCG--TTTTTGCG--------AGG-TGTTC-AAG-T-C-A-G--CT-TCC---TATG-TTA-GC-GTCC---A--G--TAA-Aggatccattacactcaacaa
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gi|92579                      :                                                                                                                                                                                                                                                 AATT-AAAA-TT-T-GTAT-TT-TC-ACCGT-T-TC-GCCAA--GTC-CAAC---TCA-C-GA-CGT-CGCG-ATT----AGAAGTCC--GGAG---CG-TTACC-GATTG--AG-CTA-C--GC----A-GG
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                     .    .  . .    .  .  .     . .  .     .    .    .     . .  .   .    .   .           .     .    .    C      .   .   . .   .    .     .  T . .         .    .            .  .     .   .       .    .     . .        .         .      .  .  .     .         .        . . .   .   . . . . .   .   .      .   .  . .  .   .  .    .   .  .    . .   .    .    .  .   .   . .   .    .   .   . .      .     .      .          .    .                 .   .    .       .    .  .        .  .       .    .        .  .       . .   .   . . .      .    .   .               .   .   . .   . . T          .      .    .        .    CTTT                .        .   .  . .       .  .     .     .  .      .  .         .   .           .     . .    . .   .    .  . C   .     .   . .  .  .      . .    .   .   .   .      .    .    .     .        .   .  .     .      .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                     .    .  . .    .  .  .     . .  .     .    .    .     . .  .   .    .   .           .     .    .    C      .   .   . .   .    .     .  T . .         .    .            .  .     .   .       .    .     . .        .         .      .  .  .     .         .        . . .   .   . . . . .   .   .      .   .  . .  .   .  .    .   .  .    . .   .    .    .  .   .   . .   .    .   .   . .      .     .      .          .    .                 .   .    .       .    .  .        .  .       .    .        .  .       . .   .   . . .      .    .   .               .   .   . .   . . .          .      .    .        .    CTT                 .        .   .  . .       .  .     .     .  .      .  .         .   .           .     . .    . .   .    .  . .   .     .   . .  .  .      . .    .   .   .   .      .    .    .     .        .   .  .     .            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                          .  . .    .  .  .     . .  .     .    .    .     . .  .   .    .   .           .     .    .    C      .   .   . .   .    .     .  C . .         .    .            .  .     .   .       .    .     . .        .         .      .  .  .     .         .        . . .   .   . . . . .   .   .      .   .  . .  .   .  .    .   .  .               .    .  .   .   . .   .    .   .   . .      .                                                                                                         .  .       . .   .   . . .                                                                                 .    TTT                 .        .   .  . .       .  .     .     .  .      .  .         .   .           .     . .    . .   .    .  . .   .     .   . .  .  .      . .    .   .   .   .      .    .    .     .        .   .  .     .            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                       .  .     . .  .     .    .    .     . .  .   .    .   .           .     .    .    .      .   .   . .   .    .     .  T . .         .    .            .  .     .   .       .    .     . .        .                .  .                                                                                      .                              .   .   . .   .    .   .   . .                                                                                                                   .       . .                                                                                                                      .        .   .  . .       .  .     .     .  .      .  .         .   .           .     . .    . .   .    .  . .   .                               .   .   .   .      .    .    .     .        .   .  .     .            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                       .  .     . .  .     .    .    .     . .  .   .    .   .           .     .    .    .      .   .   . .   .    .     .  . . .         .    .            .  .     .   .       .    .     . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .     .  .      .  .         .   .                                                                                                                                                  
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Reference ( family-581 )      :                                                                                                                                                                                                                                                 AAAT-AAAA-TT-T-GTGT-TA-AC-GCCGA-C-GC-GGGGA--GTC-GAAC---TCA-C-GA-CGT-CGCG-GTT----GGCGGTCC--GGAG---CG-TTACC-GACTG--AG-CTA-C--GC----A-GGCCC--ACG-A---------G--CAT-------TGAGTC-GT---TAA---T--TTTTAT--TAT----AA-A--GTTAACA-TTGGCCTCC-AGTTCT-AA-AT-ACCCG--TTTTTAAG--------A-A-T-TTA-AAA-T-C-A-A--CT-TTT---TATT-GTA-AT-G-CT---G--G--TAA-ATT-GT-AAAG-C-ATT-CTAT----A--G--AT---G-A-TTA-CTCT-GAA---A-A-GCAATA--GATA--GGCCT----------A-TATC-GCCGTAAAAGTTCTCAA-TAT-TGAT----TAGT--AAG-CA-ACCAACGT-CA-TTGGAAA---CG-TTTGTGAC-GT-CAATGTG-A-TGT-CAT-T-C-GTCTGA---AT-CAG-------AAACAAAAT---A-TGA-G-TTG-C-CTA-----AA-TC-GTTTCG--GGA-CTGACGAA-CC-AGC-TT------TA-TTT--AGGGACC--AA-C-AT---CTAA-TGTCCCAAG-AAAAC-TA-AACATG-CG---------A-TGA-----ATTTCAG--TATA-A---AA-C-TGC-GCGG-CG-A-TTT--TATG-AGA-G-AC-AG-AGGCAA-G-CCTG-TCG-ATG-TTT------T--AAA---AT----AC-TCAAAAAT--GG-AC-TTCGC----CTC-AT---CAAAGTG
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gi|92573                      :                                                                                                                                                                                                                                                  AAT-AAAAATTAT-GTGT-GA-ACCGCCGA-C-GC-GGGGA--GTC-GAAC---TCA-C-GA-CGT-CGCG-G-T----GGC-GTCG--GGAG---C--TTACC-GACTG--AG-CTA-C--GC----A-GGCCC--ACA-A---------G--CAT---------AGTC-GT---TAA---T--TTTTAT--TAT----AA-A---TTAACA-TTGCCTCCC-AGTTCT-AA-AT-ACCCGTTTTTTTAAG--------A-A-T-GTA-AAA---C-A-A--C--TTT---TA-T-GTA-AT-G-CT---GC-G--TAAGATT-GT-GAAGCC-ATT-CTAT----T--G--AT---G-A-TTAGCTCT-GAA---A-A-GCAATATTGATA---GCCT----------A-TATC-GCC-TAAAAGTT-TCAG-TAT-TGA-----TAGA--AAG-CA-ACCAACGT-CA-TTGGAAAG--CG-TTTGTGAC-GTCCAATATG-A-TGT-CAT-T-C-G
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gi|92582                      : taaaatttgtgttaacaccgacgcagggagtcgaactcacgacgtcgctgttggcggcccggagcgttaccgactgagctatgcaggcccatgagcattgagtcattaatttttattataacgttaacattggcctcaagttctaaatacccgtttttaagaaatcgaaatcaacttttattgtaatgtcgtcgaaagttgtaagtgcctctgagggagcgccaggggtcgggtcgcatcatgg-AAAA-TT-T-GTGT-CA-AC-GCCGA-C-GC-GGGGA--GTC-GAAC---TCA-C-GA-CGT-CGCG-GTT----GGCGGTCC--CGAG---CG-TTACC-AACTG--AG-CTA-C--GC----A-GGTCC--ATG-A---------G--CAT-------TGAGTC-GT---TAA---T--TTGTAT--TAT----AA-A--GTTAACA-TTGGCCTCC-AGTTCT-AA-AT-ACCCG--TTTTTAAG--------A-A-T-TTA-AAA-T-T-G-A--AT-TTT---TATT-GTA-AT-G-CT---G--G--TAA-ATT-GT-AAAG-C-ATT-CTAT----A--G--AT---G-C-TTA-CTCT-GAA---A-A-GCAATA--GATA--GGCTT----------A-TATC-GCCGT-AAAGTTCTCAA-TAT-TGAT----TAGT--AAG-CA-ACCAACGT-CA-TTGGAAA---CG-TTTGTGAC-GT-CAGTGTG-A-TGT-CAT-T-C-GTCTGA---AT-CAGCTGTAA-AAACAAAAT---A-TTA-G---G-C-CTA--------------------GA-CTGACGAA-CC-AGC-TT------TA-TTT--AGGG-----AA-C-GTTCACTAA-TGT--CAAA-GAAAC-TATAACATT-CG---------A-AGA-----A-TTCAG--TATA-A---AA-C-TGC-GCGG-CG-A-TTC--TATG-AGA-G-AC-AG-AGGCAA-G-CCTG-TCG-A-G-TTT------T--AAA---AT----A--TCAAAACT--GGAAC-TTCGC----
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gi|92586                      :                                                                                                                                                                                                                                                                       -AC-GGCAA-CCGC-GGGGGCCGTT-GAAC---CTA-C-GA-CGT--GCG-GTT----GGTGGTCCTCGGAG---TG-TTACCAGACTG--AGGCTA-C--GCCACAA-GGCCC--ACA-A---------G--CATCCTAAGTTGAGTC-GTCTGTAAGTTT--TTTTATCATAT----AA-A--GTTAACA-TTG-CCTCT-AGTTCT-AA-AT-ACC-G--TTGT-AAG--------A-ACT-TTACAAA-T-C-ATA--CT-TTT---TATT-GTA-AT-G-CT---G--G--TAA-ATT-GT-AAAG-CCATT-ATACGTTGA--A--AT---G-AATTA-CTCT-GAA---G-ACGCAATA--GATA--GGCCT----------A-TATC-GCCGTGAACGTT-TCAG-TA--TGAT----TAGT--AAG-CAGACCAACGT-CA-ATTGACA---CGTTTTGTGAC-GT-CAATGTGAA-GGT-CATGT-CGGTCTGA---AT-CAGCTGTAA-GAACAAAAC---A-TGA-G-TAGCC-CTG-----AACTC-GTTTCA--GGA-CTGACGAA-CCAAGT-TT------TA-TTCTGAGGGACCTGAT-C-AT---CTAA-TGTCCCAAGAAAAAC-TAGAACATG-CG---------ATTGACTGGTGTCTCAT--CATACA---AA-T-TGCTGCAG-CG-A--TT--TATGAAGA-G-AC--G-AGGCAA-GCCCTG-TCG-AAG-TTT------T--AAA---AT----AC-TAGAAAATGCGA-AC-TTCGC----CTC-AT---ACAAGTG
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gi|92593                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 --AT---G-A-TTA-TTCT-GAA---A-A-GCAATA--AATA--AGCCT----------A-TATC-GCCGTAAA-GTTCTCAA-TAT-TGAT----TAGT--AAG-CA-ACCAACGT-CA-TTGGAAA---CG-TTTGTGAC-GT-CAATGTG-A-TGC-TAA-T-C-GTCTGA---AT-CAG-------AAACAAAAT---A-TGA-G-TTG-C-CT------AA-TC-GTTTCG--GGA-CTGACGAA-CC-AGC-TTTAGGCCTA-TTT--AGGGACC--AA-C-AT---CTAA-TGTCCCAAG-AAAAC-TA-AACATG-CG---------A-TGA-----ATTTCTG--TATA-A---AT-C-TGC-GCGG-CG-A-TTT--TATG-CGA-A-AC-AG-AGGCGA-T-CCTG-TCG-ATGTTTT------T--ATA---AT----AC-TCAAAAAT--GG-ACATACAC----CTC-TG---CAAAGTG
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