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Reference ( family-577 ) : CCCCCT-CACGCCAAA-A-TCTGT--GCA----AGT-C-G-GT-A-----AA-A------T-AG-C---T---A-G--TTT-A-T--A-G-C------TAATG----------TTA---A-TT-G-TT----GA--T-T-------T-ATAT--GTCCGA-C--TTT--AAAAATAAA
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . T . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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originalCons : CCCCCT-CACGCCAAA-A-TCTGT--GCA----AGT-C-G-GT-A-----AA-A------T-AG-C---T---A-G--TTT-A-T--A-G-C------TAATG----------TTA---A-TT-G-TT----GA--T-T-------T-ATAT--GTCCGA-C--TTT--AAAAATAAA
finalCons : CCCCCT-CACGCCAAA-A-TCTGT--GCA----AGT-C-G-GT-A-----AA-A------T-AG-C---T---A-G--TTT-A-T--A-G-C------TAATG----------TTA---A-TT-G-TT----GA--T-T-------T-ATAT--GTCCGA-C--TTT--AAAAATAAA
Alignments
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consensus : CCCCCT-CACGCCAAA-A-TCTGT--GCA----AGT-C-G-GT-A-----AA-A------T-AG-C---T---A-G--TTT-A-T--A-G-C------TAATG----------TTA---A-TT-G-TT----GA--T-T-------T-ATAT--GTCCGA-C--TTT--AAAAATAAA
Reference ( family-577 ) : CCCCCT-CACGCCAAA-A-TCTGT--GCA----AGT-C-G-GT-A-----AA-A------T-AG-C---T---A-G--TTT-A-T--A-G-C------TAATG----------TTA---A-TT-G-TT----GA--T-T-------T-ATAT--GTCCGA-C--TTT--AAAAATAAA
gi|18425 : CCCCCT-CACGCCCAA-A-TCTGT--TCA----AGT-C-G-GT-T-----AA-A------T-AG-C---T---A-G--TTT-A-T--A-G-C------TAATG----------TTA---A-TT-A-TT----GA--T-A-------T-ATAA--GTCCAA-C--TTT--GAAAATAAA
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gi|18428 : CCCCCT-CACGCTAAA-A-TCTGT--GCA----AGT-C-G-GT-T-----AA-A------T-AG-C---T---A-G--TTT-A-T--A-G-C------TCATG----------TTA---A-TT-G-TT----GA--T-A-------T-ATAA--GTCCGA-C--TTT--CAACATAA
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gi|18439 : CCCCCT-CATGCCAAA-T-TATGT--GCA----AGT-C-A-GT-ACAGTAAA-G------T-AG-G---T---A-G--TTT-A-T--A-G-C------TAATG----------TTC---A-TT-A-TT----GA--T-
gi|18440 : CCCCCT-CACGCCAAA-A-TCTGT--GC-----AGT-C-GTAT-AG----AA-A------T-AG-C---TCACA-G--TTT---T--A----------TTACGTCCCTCCGGTTTA---A-TT-G--T----GA--T-A-------T-A-AA--GTCCGA-C--TTT--AAAAATAAA
gi|18441 : CCCCCT-TACGCCAAA-A-TCTGT--GCA----AGT-C-T-GT-A-----AAGA------A-AG-C---T---A-G--TAT-ACT--ATG-CT-----TATTG----------TTA---T-TTGG-TT----GA--T-T-------T-AGGT--GTCCAAGC--TTTA-AAAAATAAA
gi|18442 : CCCCCT-TGCATCAAT-A-CCTGT--GCA----AGT-C-A-GT-A-----AG-A------T-AG-A---T---A-G--TGT-A-T--A-G-G------TAATG----------TTC---A-TT-GTTT----GA--TAA-------T-ATAT--
gi|18443 : CCCCCT-TGCGCCAAAGA-TCT-T--GCA----AGT-C-G-GT-A-----AA-A--------AG-C---T---A-----TT-A-T--ATG-C------TTATG----------TTA---T-TT-G-TT----AA--T-T-------A-GAAT--TTCCGA-CATTTT--AGAAATAAAagtaca
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gi|18449 : CCCCT-CACGCCAAA-A-TCTAT--GCA----GGT-T-G-GT-A-----AA-A------T-TG-C---T---A-G--TTT-A-T--A-G-G------T-GCA----------TTT---A-TT-T-TT----GA--T-T-------C-GTAT--GTCCGA-C--TCA--AAAAAAAAA
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gi|18453 : CCCT-CACGCCAAA---TCTGT--GCA----AGT-T-G-GT-T-----AA-A------T-AG-C---T---A-G--TTT-A-T--A-G-C------TAATG----------TTG---A-TT-G-TT----G---------------ATAA--GTCCGA-C---TC--AAAAATAAA
gi|18454 : CCCC-AACGCCAAC-A-CCCGT--GTA----AGT-C-G-A--A-----AC-A------T-AG-C---T---A-G--TAT-A-C--A-A-A------TAATA----------TTC---C-TT-G-T-----------------------AT--GTCCGA-C--TTT--GAAAAT
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