lowQualScore                  :                         2222222222              111                       111                                                                                               111111111          3333333333333333333333333333                                                                     11111        1111111                                                   
lowQualScore                  :     1     1 1 555555555 5555555555 2222 33 333  666   4444 11  1  4 77 11 777  1   1 1 44 33333  2 1   333 1   1 44444444  1 11  2 333 2222 44   11   44 1 222 2  4444 1 3  000000000 1 1 2 33 9999999999999999999999999999 1     11 4444444444 1 1   1   1   2 1  777  4444 2 4 1 22  4444444  33333   4444 8888888  3 33 1 444 22 1   33     1   55 22 1 1 3  1 1    
lowQualScore                  :     .     . . ......... .......... .... .. ...  ...   .... ..  .  . .. .. ...  .   . . .. .....  . .   ... .   . ........  . ..  . ... .... ..   ..   .. . ... .  .... . .  ......... . . . .. ............................ .     .. .......... . .   .   .   . .  ...  .... . . . ..  .......  .....   .... .......  . .. . ... .. .   ..     .   .. .. . . .  . .    
lowQualScore                  :     5     4 4 777777777 5555555555 7777 11 555  888   0000 88  3  0 22 88 000  3   3 3 55 22222  5 2   444 2   2 44444444  2 77  4 333 6666 11   77   22 2 222 5  0000 3 9  222222222 3 3 6 11 2222222222222222222222222222 3     88 9999999999 3 3   3   3   7 3  666  8888 9 3 4 00  2222222  88888   8888 5555555  1 77 5 888 11 5   77     6   99 33 7 7 3  7 7    
consensus                     : TAGC-CTTCT-A-A---------T----------C----T--G---CA-G-CTG----A--TG-AA-G--C--T---GA-TAA-A-T--C-----TT-A-CAC---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC--G-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-GC---GT----T-G-A-T--AG--A----AA-GG--AAC----T-----T-TA-T--G-A---C--T-ACT--TTGTC-CAT-CC--C-T-G-TA-T-TGTT
Reference ( gi|4771 )         : TAGC-CTTCT-A-A---------T----------C----T--G---CA-C-CTG----A--TG-AA-G--C--T---GA-TAA-A-T--C-----TT-A-CAC---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC--G-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-GC---GT----T-G-A-T--AG--A----AA-GA--AAC----T-----G-TA-T--G-A---C--T-ACT--TTGTC-CAT-TC--C-T-G-TA-T-TGTT
gi|4772                       : TAGC-CCTCT-A-A---------T----------C----T--G---CA-G-CTG----A--GG-AA-G--C--T---GA-TAA-A-T--C-----TT-A-CAC---A-ATC-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC--A-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-AAT-G-GC---GT----T-G-A-T--AG--A----AA-GG--AAC----T-----G-TA-T--G-A---C--T-CCT--TAGTC-CAT-CC--C-T-G-TA-T-TGTT
gi|4773                       : TAGC-CTTCT-A-A---------T----------C----T--G---CA-G-CTG----A--TG-AA-G--C--T---GA-TAA-A-T--C-----TT-G-CAC---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC--G-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-CTGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-GC---GT----T-G-A-T--AG--AAATTAA-GG--AAC----G-----T-TA-T--G-A---C--T-ACT--TTGTC-CAT-CC--C-T-G-Tta
gi|4774                       : TAGC-CTTCT-A-A---------T---------------T--G---CA-G-CTG----A--TG-AA-G--C--T---GA-TAA-A-T--A-----TT-A-CAC---A-AGT-A--------A--C--AT-A---G----T--TAA--TCC--G-T---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-GTGAC--A----------A-C-CCA-GTT-GAT-G-GC---GT----T-G-A-T--AG--A----AA-GG--AAA----T-----T-TA-C--G-A---C--C-ATT--TTGTC-CA--TC--C-T-G-TA-T-TGTTttatcag
gi|4778                       : TATC-CTTCT-T-A---------T----------C----T--G---CA-G-CTG----A--TG-AA-G--T--T---GA-TAA-A-TA-T-----TT-A-CAC---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCCGGG-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--TTA------A-------------T-----T-ATGAC--A----------A-C-CCA-GTT-GAT-G-ACTCTAT----T-G-A-T--AG--A----AA-GG--AAC----T-----T-TACT--G-G---C--T-AC---TTGTC-CAT-CC--C-T-G-TA-T-TGTTtatcag
gi|4776                       : TAGC-CCTCTTA-A---------TT---------C----T--G---CA-G-CTG----A--TG-A--G--C--T---GA-TAA-A-T--C-----TTTA-CAC---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC--G-G---TATT----T-A-AA---------T-A-G-A--T--------AT------------T-----T-ATGAC--A--A-------A-C-CCA-GTT-GGT-G-GC---GT----T-G-ATT--AGA-A----AA-GA--AAC----T-----T-TC-T--G-A---CAGT-AC---TTGTC-CAT-CC--T-T-G-TA-T-TGTTtatca
gi|4777                       : TAGC-CTTCT-A-G--------------------C----T--G---CA-G-CTG----A--TG-AA-A--C--TCTGAA-CAA-A-T--C-----TT-A-CAC---A-AGT-A--------AA-C--AT-AA--G----T--TAA--TCC--G-----T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-------ATGGT--A--G-------A-C-CCA-GTT-GGT-G-GC---AT----T-G-A-T--AG--A----AA-GG--GAC----T-----T-TA-T--G-A---C--C-ACTAAATGTC-CAT-CC--C-T-G-TA-T-TGTTt
gi|4775                       : TAGC-CTTCT-A-T---------T----------C----TT-G---CA-G-TTG----A--TG-AA-G--C--T---GA-TAA-A-T--C-----TT-A-CACG--A-AGTTA--------AA-C--AT-A---G----TA-TAA--TCC--G-G---T-TT------A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGCA--A--C-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-GC---GT----T-G-A-T--AG--A----AT-GCTTAAC----T-----T-TA-T--G-A---C--T-CCT--TTGTC-CAC-CC--C-T-GATA-T-TGTTtatcag
gi|4782                       : TAGC-CCTCT-A-A---------T----------T----T--GATCCA-C-TTGCAGCAGTTG-AA-G--C--TCT-GA-TAA-A-T--C-----TT-A-CAC---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCT--G-A---T-TT----T-A-AT---------A-A-G-G--T--------AACACAAAATGAATT-----T-ATGGC--A--G-------A-T-CCA-CTC-GGT-G-GC---GT----T-G-A-T--AA--A----AA-GG--AAC----T-----T-TA-T--G-A---C--C-ACC--TTGTC-CAT-CC--C-T-G-TA-T-CGTTtatcag
gi|4783                       : TATC-CTTCT-TTA---------T----------C----T--G---CA-G-CTG----A--TG-AA-G--T--T---GA-TAA-A-T--A-----TT-A--AC---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAAGTCCC--G-G---T-TT----TAA-AT---------T-A-GAA--TTA------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-ACTCTAT----T-GCA-T--AA--A----AA-GG--AACT---T-----T-TA-T--G-G---C--T-ACT--TTGTC-CA--TC--C-T-G-T--T-TGTTtatcag
gi|4784                       : TAGCACTTCT-A-A---------T----------C----T--GT--CA-G-CTG----A--TG-AACGT-C--T---GA-TCA-A-T--C-----TT-A-CAC---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCCA-G-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-AG-TTA------A-------------T-----T-ATGGC--AATG-------A-C-TCA-GTT-GAT-G-GCG--GT----T-GAA-T--AGTAG----AA-GG--AAC----T-----T-TA-T--G-A---C--T-AC------TC-CA--TC--A-T-G-TA-T-TGTtatca
gi|4786                       : TAGC-CTTCT-C-A---------T----------C----TCTG---CA-CACTG----A--TGCAA-G--C--T---GA-TAA-A-T--C-----TT-A-CAC---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC--G-GTTTT-TT----T-A-AT---------T-A-GCA--T--------A-------------TC----T-ATGAC--A--G-------A-C-T----TT-CA---------GT----T-G-A-T--AG--G----AA-G----AC----T-----T-TA-T--G-GGACC--T-ACTC-TTGTC-CAT-CC--C-T-G-TA---TGTTattatta
gi|4779                       : TATC-CTTCT-A-A---------T----------C----T--A---CA-G-ATG----A--TG-AA-G--C--T---AA-TAA-A-T--C-----TT-A-----------------------------------G----T--CAA--TCC--A-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAG--A--T-------A-C-CCT-GTT-GAT-G-GC---GT----T-G-A-T--AG--A----AATG----AC----T-----T-AA-T--C-A---C--T-ACT--TTGTC-CAT-CC--C-T-G-TA-T-TGTTtat
gi|4785                       : TAGC-CTTCT-A-AACTTTGCATT----------CCAGCT--G---CA-G-CTG----A--TG-AA-A--CCCT---GA-AAA-T-T--C-----TT-A-CAC---A-AGT-A--------AC-C--ATTA---G----T--TAA--TCC--T-T---T-TT----A-A-AC---------T-ATA-A--T--------A-------------------T-ATGGC--A--G-------A-C-CCA-ATT-GGTGG-GCA--GT----T-G-A-T--AG--A----AAGGA--AAC----T-----GTTA-T--A-A---C--T-ACT--ATGCT-CAT-CC--C-T-G-TA-T-TGTTtatcag
gi|4780                       : TATC-CTTCT-A-A---------T----------C----T--A---CA-G-ATG----A--TG-AA-G--C--T---GA-TAA-A-TG-C-----TT-------------------------------T-----G----T--TAA--TCC--A-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------T-------------T-----A-ATGAG--A--T-------A-C-CCCTGTT-GAT---GC---GT----T-G-A-T--AG--A----AATG----AC----T-----T-AA-T--C-A---C--T-ACT--TTGTC-CAT-CC--C-T-G-TA-T-TGTTtatcag
gi|4787                       : TAAC-CTTCT-A-A---------TTTGATCCAG-C----T--G---CA-G-CTG----A--TT-AACGT-C--T---GA-AAA-A-T--C-----TC-G-CAC---A-AGT-A--------AA-C--AT-G---A----TATTAA--GCC--T-G---T-TT----A-A-AT---------T-A-G-A--T--------AACACGATATAAATT-----C-ATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-GC---GT----T-G-A-T--AG--A----AA-GG--AACTTTAT-----T-TA-T--A-A---C--C-ACT--TTGatcag
gi|4788                       : TAGC-CTTCT-A-A---------TGTTTGATCAGC----T--G---CA-G-CTG----A--TG-AA-CT-C--T---GA-AAA-AAT--C-----TTTA-CAC---ATAGA-A--------AG-C--AT-A---G----T--TAA--TTC--GCG---T-TTTTTCT-A-AT---------TAA-G-A--T--------A-------------T-----A-GTGGC--A--G-------A-CGCCA-GTT-GGTGG-GC---ATAA--T-G-A-G--TG--A----AA-GG--AAT----T-----T-TA-T--G-A------T-ACT--TTGTC-CATATC--C-CAG-TA-T-TGT
gi|4781                       : TATC-CTTCT-A-A---------T----------C----T--A---CA-G--TG----A--T--AA-G--C--T---G--TAA-A-TATC-----TT-------------------------------T-G-----------TAA--TCC--A-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAG--AT-G-------A-C-CCT-GTTTGAT-G-GC---GT----T-G-A-T--AG--A----AATG----AC----T-----T-AA-TC-A-A---C--T-ACT--TTGTC-CAT-CC--C-T-G-TA-TGTGTTcgttattcag
gi|4790                       : TAGT-CTTCT-A-A---------T----------C----T--G---------------------AA-G--C--T---GA-TAT-A-T--C-----TT-A-CAC---A-AGT-------------------------------------------------------T-A-ATA--------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-GC---GT----atcag
gi|4789                       : TAGC-CTTCT-A-A---------T----------C----T--G---CA-----------------A-G--C--T---GA-------------------------------------------A-T--AT-A----------------TTC--G-G---T-TT----T-G-AT---------C-A-T-A--T--------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------A-T-CCA-GTT-GAT---GC---GT----T-G-A-T--AG----------------------------------------------ACT--TTGT--CAT-----C-C-G-TA-T-TGTT
gi|4791                       : TAGC-CTTCT-A-A---------TTTGATCCAG-C----T--G---CA-G-CTG----A--TG-AA-G--C--TCT-GA-TAA-A-T--A-----TT-A-AAT---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAC--TCT--A-G---T-tatcag
gi|4792                       : TAGC-CTTCT-A-A---------TCTGCTCCAG-C----T--G---CA-G-CTA----A--TG-AA-GCTC--T---AA-TAA-A-T--C-----TT-A-CAC---A-AGT-A--------AA-
gi|4793                       : TAAC-CTTCT-A-A---------TTTA-------C----T--G---TA-G-CTG----A--TG-AA-G--C--TCT-GA-TAA-A-T--C-----TT----AC---A-AGT-A--------AAGC--ATCA---G----T--T
gi|4794                       :  AGT-CTTCT-A-A---------T----------C----T--G---CA-G-CTG----A--T
gi|4795                       :   GC-CTTCT-A-A---------G----------C----T--G---CAGC-CTGG---A--TG-AATA--C--T---GA-TAA-A-T--C-----TT-AACACCCAA-AGT-ATAAAATACAA-G--AT-A---GGTTATA-TAA--TCC--G-G---T-TT----T-ATAT---------T-A-G-T--T----------------------T-----T-ATGACTAA--GTACCCGAA-C-CCA-GTT-GAT-G-GC---GT----TGG-A-T--AG--A----AAGGA--AAC----TTTTAAG-CA-T--GAA---C--TGACT--TTGTCGCAT-CC--CAT-G-TA-T-TGaaattcttacaagcagtaattcttttcgggaataaacaatacaatacacaagtaaaatagttaatcattttacattagatattatgacagatcccagttgatggcgtttgcatagaaaagaactttatgactactttgtccatccttgtattgttttatcag
gi|4796                       :    C-CTTCT-A-A---------T----------C----T--G---CA-G-CTG----A--TG-AA-G--C--TCT-GA-TGC-A-T--C-----TT-G-CAC---A-AGT-A--------AA-C--AT-ACTAG----T--TAA--ACT--G-G---T-TT----T-A-AT---------G-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGGC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GGA-G-GC---GT----T-G-A-T--AG--A----AA-GG--AAC----T-----T-TA-T--G-A---C--C-ACC--TTGTC-CAT-CC--C-T-C-TA-T-TGTTggtatca
gi|4797                       :    C-CTTTT-T-A---------T----------C----T--G---CA-G-CTG----A--TG-AA-G--T--T---GAATAATA-T--CAGTTATT-A-CAC---A-AGT-C--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCCG-G-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--TTA------A-------------T-----TCATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT---GC---GCTATAT-G-A-T--AG--A----AG-GG--ACT----T-----T-TAGTTAG-A---C--T-ACT--TTGTC-CAT-CC--C-T-GTTA-T-CGTTtatcgg
gi|4798                       :     -CTCCT-A-A---------T----------C----T--G---CA-G-TTG----G--TG-AA-AA-C--TCG-GA-TAA-A-T--C-----TT-G-CAC---A-AAT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC--G-G---T-TT----T-A-AA---------T-C-G-A--TTA------A-------------T-----T-AAGGC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-GC---AT----T-G-A-T--AG--A----AA-Gtatca
gi|4799                       :       TTCT-A-A---------T----------C----T--G---CA-G-CTG----A------A-G----------A-TAA-A-T--C-----TT-A-CAC---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC--G-G---TAAA----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAA-G-G
gi|4801                       :                         ----------C----T--G---CA-G-CCG----A--GG-TA-G--C--TAT-GA-TAA-A-C--C-----TT-A-CAC---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TTA--TCC--G-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------GATACAACATT---T-----T-ATGGC--A--A-------A-C-CCA-GTT-GGT-G-CC---GT----T-A-A-
gi|4800                       :                         ----------C----T--G---CA-----G----T--TG-AA-G--C--TCT-GA-TGA-A-T--C-----TT-G-CAC---A-ATT-G--------AA-C--A------G----T--TAA--TTC--G-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--TAACGCAAAA-------------TAAATGT-ATGGC--A--A-------A-C-CCA-GAT-GGT-G-GC----T----T---------------------------------------TA-T--G-A---C--C-ACT--TTGTC-CAT-CC--C-T-T-TA-T-TGTT
gi|4802                       :                                    ----T--A---CA-G-CTG----A--TA-AA-G--C--TCT-GA-TAA-A-T--C-----TT-A-AGC---A-AAT-A--------AA-C-----A---G----T--TTA--TTC--G-G---T-TT----T-A-GT---------T-A-A-A--T--------A-------------A-----C-ATGAatca
gi|4803                       :                                                                                           -----TT-A-CTC---A-ATT-A--------TA-TGAAT-A---G----T--TAA--TCC--G-G---T-CT----T-AGATAACACAAAAT-A-A-A--TTCCA----A-------------G-----T-ATGGC--A--G-------A-C-CCA-GTT-AGT-G-GC---GT----T-------------------------AC----T-----T-TA-T--G-A---C--C-ATC--TTGTC-CAT-CC--C-T-G-TA-T-TGattttatgacaaatttggtcaatccctgtaatgtttatcag
gi|4794                       :                                                                    cagcatgaaatatatgatcaagtcagtgtT-A-CAC---A-AGT-A--------AA----AT-A---G----T--TAA--TC-----A---T-TT----T-ACAT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------ATC-CCA-GTT-GAT-G-GC---GT----TTGCA-T--AG--A----AA-AG--AAC----T-----T-TA-T--G-A---C--T-ACT--TTGTC-CAT-CC--T-T-G-TA-T-TGTTattatcag
gi|4804                       :                                                agtcttctaatctgcagctgataaattcttacaagcagtaattcttttcgggaataaacaatacaa--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC--G-G---T-TT----T-A-AT---------A-A-G-A--T--------AATACAAAATAAA-TG----T-ATGGC--A--G-------A-C-C-A-GTT-GGT-GTGT---GT----T-A-A-T--AG-------AA-GG--GAC----T-----T-TA-T--G-ATC-C--T-GCA--TTGTT-TAT-ttatcag
gi|4805                       :                                                                                                                           A-C--AT-A---G----T--TTA--ACC--G-G---T-TGA---T-A-ACACAAAA---T-A-A-AATT--------A-------------TG----C-ATGGC--A--G-------A-C-CAG-GTG-GA--G-GC---GT----T-G-A-TTAAA--A----AA-GG--AAC----T-------TA-T--G-A---C--C-ACC--TTGTC-CAT-TCCAC-T-G-TATT-TGTTcag

lowQualScore                  :                                                  1111111111                                                           111                                                                                                                                      3333333333333333333333                                                                                                                                                      
lowQualScore                  :                              1     1 1 555555555 9999999999 2222 33 666666666 444444444 1   11    666666666  4 55 333 555 1 1 1  1  44 88888  55555555555 1  5555555555 333 1   1 44444444  1 11  2 333 2222 44   11   2 1 333 2  3333 1 3  999999999 1 1 2 33 6666666666666666666666 66666 1     11 4444444444 1 1   1   1   1 1 1 777 1 4444 1 4 1 22  33 3333   11 11 1 4444 1  33333 2 33 1 444 22 1   33   1  1 22    22 1  3  1 1    
lowQualScore                  :                              .     . . ......... .......... .... .. ......... ......... .   ..    .........  . .. ... ... . . .  .  .. .....  ........... .  .......... ... .   . ........  . ..  . ... .... ..   ..   . . ... .  .... . .  ......... . . . .. ...................... ..... .     .. .......... . .   .   .   . . . ... . .... . . . ..  .. ....   .. .. . .... .  ..... . .. . ... .. .   ..   .  . ..    .. .  .  . .    
lowQualScore                  :                              4     4 4 555555555 5555555555 7777 00 111111111 888888888 2   77    111111111  8 33 888 555 2 2 2  2  11 55555  88888888888 2  3333333333 333 2   2 33333333  1 66  4 222 5555 00   77   4 2 888 4  9999 2 8  888888888 2 2 5 00 5555555555555555555555 99999 2     88 5555555555 3 3   3   3   3 3 3 333 3 7777 4 1 4 00  44 0000   99 66 4 5555 4  66666 9 44 4 555 00 4   44   4  5 00    11 5  1  6 6    
consensus                     :                          TAGC-CTTCT-A-A---------T----------C----T--G---------C---------A-GCT--GATG---------AA-G--C---T---G-A-T-AA-AT--C-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC-G-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-G-C---G-T----T-G-A-T--AG--A----AAG--G-AA-C----T-TT-----A-T--G-A---C--T-ACT--TTG-TC-C--ATCC--C-TG-TA-T-TGTT
Reference ( family-570 )      :                          TAGC-CTTCT-A-A---------T----------C----T--G---------C---------A-GCT--GATG---------AA-G--C---T---G-A-T-AA-AT--C-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC-G-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-G-C---G-T----T-G-A-T--AG--A----AAG--G-AA-C----T-TT-----A-T--G-A---C--T-ACT--TTG-TC-C--ATCC--C-TG-TA-T-TGTT
gi|4771                       :                          TAGC-CTTCT-A-A---------T----------C----T--G---------C---------A-CCT--GATG---------AA-G--C---T---G-A-T-AA-AT--C-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC-G-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-G-C---G-T----T-G-A-T--AG--A----AAG--A-AA-C----T-GT-----A-T--G-A---C--T-ACT--TTG-TC-C--ATTC--C-TG-TA-T-TGTT
gi|4772                       :                          TAGC-CCTCT-A-A---------T----------C----T--G---------C---------A-GCT--GAGG---------AA-G--C---T---G-A-T-AA-AT--C-----TT-----------A-CA----------C---A-ATC-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC-A-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-AAT-G-G-C---G-T----T-G-A-T--AG--A----AAG--G-AA-C----T-GT-----A-T--G-A---C--T-CCT--TAG-TC-C--ATCC--C-TG-TA-T-TGTT
gi|4773                       :                          TAGC-CTTCT-A-A---------T----------C----T--G---------C---------A-GCT--GATG---------AA-G--C---T---G-A-T-AA-AT--C-----TT-----------G-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC-G-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-CTGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-G-C---G-T----T-G-A-T--AG--AAATTAAG--G-AA-C----G-TT-----A-T--G-A---C--T-ACT--TTG-TC-C--ATCC--C-TG-Tta
gi|4774                       :                          TAGC-CTTCT-A-A---------T---------------T--G---------C---------A-GCT--GATG---------AA-G--C---T---G-A-T-AA-AT--A-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------A--C--AT-A---G----T--TAA--TCC-G-T---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-GTGAC--A----------A-C-CCA-GTT-GAT-G-G-C---G-T----T-G-A-T--AG--A----AAG--G-AA-A----T-TT-----A-C--G-A---C--C-ATT--TTG-TC-C--AT-C--C-TG-TA-T-TGTTttatcag
gi|4775                       :                          TAGC-CTTCT-A-T---------T----------C----TT-G---------C---------A-GTT--GATG---------AA-G--C---T---G-A-T-AA-AT--C-----TT-----------A-CA----------CG--A-AGTTA--------AA-C--AT-A---G----TA-TAA--TCC-G-G---T-TT------A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGCA--A--C-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-G-C---G-T----T-G-A-T--AG--A----ATGCTT-AA-C----T-TT-----A-T--G-A---C--T-CCT--TTG-TC-C--ACCC--C-TGATA-T-TGTTtatcag
gi|4776                       :                          TAGC-CCTCTTA-A---------TT---------C----T--G---------C---------A-GCT--GATG----------A-G--C---T---G-A-T-AA-AT--CT----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC-G-G---TATT----T-A-AA---------T-A-G-A--T--------AT------------T-----T-ATGAC--A--A-------A-C-CCA-GTT-GGT-G-G-C---G-T----T-G-ATT--AGA-A----AAG--A-AA-C----T-TT-----C-T--G-A---CAGT-AC---TTG-TC-C--ATCC--T-TG-TA-T-TGTTtatcag
gi|4777                       :                          TAGC-CTTCT-A-G--------------------C----T--G---------C---------A-GCT--GATG---------AA-A--C---TCTGA-A-C-AA-AT--C-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-AA--G----T--TAA--TCC-G-----T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-------ATGGT--A--G-------A-C-CCA-GTT-GGT-G-G-C---A-T----T-G-A-T--AG--A----AAG--G-GA-C----T-TT-----A-T--G-A---C--C-ACTAAATG-TC-C--ATCC--C-TG-TA-T-TGTTt
gi|4778                       :                          TATC-CTTCT-T-A---------T----------C----T--G---------C---------A-GCT--GATG---------AA-G--T---T---G-A-T-AA-ATA-T-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC-G-GGG-T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--TTA------A-------------T-----T-ATGAC--A----------A-C-CCA-GTT-GAT-G-A-CTCTA-T----T-G-A-T--AG--A----AAG--G-AA-C----T-TT-----ACT--G-G---C--T-AC---TTG-TC-C--ATCC--C-TG-TA-T-TGTTtatcag
gi|4779                       :                          TATC-CTTCT-A-A---------T----------C----T--A---------C---------A-GAT--GATG---------AA-G--C---T---A-A-T-AA-AT--C-----TT-----------A---------------------------------------------G----T--CAA--TCC-A-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAG--A--T-------A-C-CCT-GTT-GAT-G-G-C---G-T----T-G-A-T--AG--A----AAT--G--A-C----T-TA-----A-T--C-A---C--T-ACT--TTG-TC-C--ATCC--C-TG-TA-T-TGTTtatca
gi|4780                       :                          TATC-CTTCT-A-A---------T----------C----T--A---------C---------A-GAT--GATG---------AA-G--C---T---G-A-T-AA-ATG-C-----TT---------------------------------T-----------------------G----T--TAA--TCC-A-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------T-------------T-----A-ATGAG--A--T-------A-C-CCCTGTT-GAT---G-C---G-T----T-G-A-T--AG--A----AAT--G--A-C----T-TA-----A-T--C-A---C--T-ACT--TTG-TC-C--ATCC--C-TG-TA-T-TGTTtatcag
gi|4781                       :                          TATC-CTTCT-A-A---------T----------C----T--A---------C---------A-G-T--GAT----------AA-G--C---T---G---T-AA-ATATC-----TT---------------------------------------------------T-G-----------TAA--TCC-A-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAG--AT-G-------A-C-CCT-GTTTGAT-G-G-C---G-T----T-G-A-T--AG--A----AAT--G--A-C----T-TA-----A-TC-A-A---C--T-ACT--TTG-TC-C--ATCC--C-TG-TA-TGTGTTatcag
gi|4782                       :                          TAGC-CCTCT-A-A---------T----------T----T--GATCCACTTGC---------A-GCA--GTTG---------AA-G--C---TCT-G-A-T-AA-AT--C-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCT-G-A---T-TT----T-A-AT---------A-A-G-G--T--------AACACAAAATGAATT-----T-ATGGC--A--G-------A-T-CCA-CTC-GGT-G-G-C---G-T----T-G-A-T--AA--A----AAG--G-AA-C----T-TT-----A-T--G-A---C--C-ACC--TTG-TC-C--ATCC--C-TG-TA-T-CGTTatcag
gi|4783                       :                          TATC-CTTCT-TTA---------T----------C----T--G---------C---------A-GCT--GATG---------AA-G--T---T---G-A-T-AA-AT--A-----TT-----------A--A----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAAGTCCC-G-G---T-TT----TAA-AT---------T-A-GAA--TTA------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-A-CTCTA-T----T-GCA-T--AA--A----AAG--G-AA-CT---T-TT-----A-T--G-G---C--T-ACT--TTG-TC-C--AT-C--C-TG-T--T-TGTTtatcag
gi|4784                       :                          TAGCACTTCT-A-A---------T----------C----T--GT--------C---------A-GCT--GATG---------AACGT-C---T---G-A-T-CA-AT--C-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCCAG-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-AG-TTA------A-------------T-----T-ATGGC--AATG-------A-C-TCA-GTT-GAT-G-G-CG--G-T----T-GAA-T--AGTAG----AAG--G-AA-C----T-TT-----A-T--G-A---C--T-AC-------TC-C--AT-C--A-TG-TA-T-TGTtatca
gi|4785                       :                          TAGC-CTTCT-A-AACTTTGCATT----------CCAGCT--G---------C---------A-GCT--GATG---------AA-A--CCC-T---G-A-A-AA-TT--C-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AC-C--ATTA---G----T--TAA--TCC-T-T---T-TT----A-A-AC---------T-ATA-A--T--------A-------------T-------ATGGC--A--G-------A-C-CCA-ATT-GGT-G-GGCA--G-T----T-G-A-T--AG--A----AAG--G-AAAC----TGTT-----A-T--A-A---C--T-ACT--ATG-CT-C--ATCC--C-TG-TA-T-TGTTattatta
gi|4786                       :                          TAGC-CTTCT-C-A---------T----------C----TCTG---------C---------ACACT--GATGC--------AA-G--C---T---G-A-T-AA-AT--C-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC-G-GTTTT-TT----T-A-AT---------T-A-GCA--T--------A-------------TC----T-ATGAC--A--G-------A-C-T----TT-CA----------G-T----T-G-A-T--AG--G----AAG-----A-C----T-TT-----A-T--G-GGACC--T-ACTC-TTG-TC-C--ATCC--C-TG-TA---TGTTtatcag
gi|4787                       :                          TAAC-CTTCT-A-A---------TTTGATCCAG-C----T--G---------C---------A-GCT--GATT---------AACGT-C---T---G-A-A-AA-AT--C-----TC-----------G-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-G---A----TATTAA--GCC-T-G---T-TT----A-A-AT---------T-A-G-A--T--------AACACGATATAAATT-----C-ATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-G-C---G-T----T-G-A-T--AG--A----AAG--G-AA-CTTTAT-TT-----A-T--A-A---C--C-ACT--TTG-tat
gi|4788                       :                          TAGC-CTTCT-A-A---------TGTTTGATCAGC----T--G---------C---------A-GCT--GATG---------AACT--C---T---GAA-A-AA-AT--CT----TT-----------A-CA----------C---ATAGA-A--------AG-C--AT-A---G----T--TAA--TTC-GCG---T-TTTTTCT-A-AT---------TAA-G-A--T--------A-------------T-----A-GTGGC--A--G-------A-CGCCA-GTT-GGTGG-G-C---A-TAA--T-G-A-G--TG--A----AAG--G-AA-T----T-TT-----A-T--G-A------T-ACT--TTG-TC-CATATCC--C-AG-TA-T-TGT
gi|4789                       :                          TAGC-CTTCT-A-A---------T----------C----T--G---------C---------A--------------------A-G--C---T---G-A---------------------------------------------------------------A-T--AT-A----------------TTC-G-G---T-TT----T-G-AT---------C-A-T-A--T--------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------A-T-CCA-GTT-GAT---G-C---G-T----T-G-A-T--AG-----------------------------------------------ACT--TTG-T--C--ATCC-----G-TA-T-TGTTcgttattcag
gi|4790                       :                          TAGT-CTTCT-A-A---------T----------C----T--G---------------------------------------AA-G--C---T---G-A-T-AT-AT--C-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT------------------------------------------------------T-A-ATA--------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-G-C---G-T----tatcag
gi|4791                       :                          TAGC-CTTCT-A-A---------TTTGATCCAG-C----T--G---------C---------A-GCT--GATG---------AA-G--C---TCT-G-A-T-AA-AT--A-----TT-----------A-AA----------T---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAC--TCT-A-G---T-
gi|4792                       :                          TAGC-CTTCT-A-A---------T----------C----T--G---------CTCCAGCTGCA-GCT--AATG---------AA-G--C---TCT-A-A-T-AA-AT--C-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AA-
gi|4793                       :                          TAAC-CTTCT-A-A---------TTTA-------C----T--G---------T---------A-GCT--GATG---------AA-GCTC---T---G-A-T-AA-AT--C-----TT--------------A----------C---A-AGT-A--------AAGC--ATCA---G----T--T
gi|4794                       :                           AGT-CTTCT-A-A---------T----------C----T--G---------C---------A-GCT--GATAAATTCTTACAA-G--C---A---G---T-AA-TT--C-----TTTTCGGGAATAAA-CAATACAATACAC---A-AGT-A--------AA----AT-A---G----T--TAA--TC----A---T-TT----T-ACAT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------ATC-CCA-GTT-GAT-G-G-C---GTT----T-GCA-T--AG--A----AAA--G-AA-C----T-TT-----A-T--G-A---C--T-ACT--TTG-TC-C--ATCC--T-TG-TA-T-TGTT
gi|4795                       :                            GC-CTTCT-A-A---------G----------C----T--G---------C---------A-GCCTGGATG---------AATA--C---T---G-A-T-AA-AT--C-----TT-----------AACA----------CCCAA-AGT-ATAAAATACAA-G--AT-A---GGTTATA-TAA--TCC-G-G---T-TT----T-ATAT---------T-A-G-T--T----------------------T-----T-ATGACTAA--GTACCCGAA-C-CCA-GTT-GAT-G-G-C---G-T----TGG-A-T--AG--A----AAG--GAAA-C----T-TTTAAGCA-T--GAA---C--TGACT--TTG-TCGC--ATCC--CATG-TA-T-TGttatcag
gi|4796                       :                             C-CTTCT-A-A---------T----------C----T--G---------C---------A-GCT--GATG---------AA-G--C---TCT-G-A-T-GC-AT--C-----TT-----------G-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-ACTAG----T--TAA--ACT-G-G---T-TT----T-A-AT---------G-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGGC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GGA-G-G-C---G-T----T-G-A-T--AG--A----AAG--G-AA-C----T-TT-----A-T--G-A---C--C-ACC--TTG-TC-C--ATCC--C-TC-TA-T-TGTTggtatca
gi|4797                       :                             C-CTTTT-T-A---------T----------C----T--G---------C---------A-GCT--GATG---------AA-G--T---T---G-AAT-AATAT--CAGTTATT-----------A-CA----------C---A-AGT-C--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCCGG-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--TTA------A-------------T-----TCATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT---G-C---G-CTATAT-G-A-T--AG--A----AGG--G-AC-T----T-TT-----AGTTAG-A---C--T-ACT--TTG-TC-C--ATCC--C-TGTTA-T-CGTTtatcgg
gi|4798                       :                              -CTCCT-A-A---------T----------C----T--G---------C---------A-GTT--GGTG---------AA-AA-C---TCG-G-A-T-AA-AT--C-----TT-----------G-CA----------C---A-AAT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC-G-G---T-TT----T-A-AA---------T-C-G-A--TTA------A-------------T-----T-AAGGC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-G-C---A-T----T-G-A-T--AG--A----AAG--tatca
gi|4799                       :                                TTCT-A-A---------T----------C----T--G---------C---------A-GCT--GA------------A-G------------A-T-AA-AT--C-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC-G-G---TAAA----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAA-G-G-
gi|4800                       :                                                  ----------C----T--G---------C---------A-GTT--GA------------A-G--C---TCT-G-A-T-GA-AT--C-----TT-----------G-CA----------C---A-ATT-G--------AA-C--A------G----T--TAA--TTC-G-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--TAACGCAAAA-------------TAAATGT-ATGGC--A--A-------A-C-CCA-GAT-GGT-G-G----------------------------------------C----T-TT-----A-T--G-A---C--C-ACT--TTG-TC-C--ATCC--C-TT-TA-T-TGTT
gi|4801                       :                                                  ----------C----T--G---------C---------A-GCC--GAGG---------TA-G--C---TAT-G-A-T-AA-AC--C-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TTA--TCC-G-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------GATACAACATT---T-----T-ATGGC--A--A-------A-C-CCA-GTT-GGT-G-C-C---G-T----T-A-A-atca
gi|4802                       :                                                             ----T--A---------C---------A-GCT--GATA---------AA-G--C---TCT-G-A-T-AA-AT--C-----TT-----------A-AG----------C---A-AAT-A--------AA-C-----A---G----T--TTA--TTC-G-G---T-TT----T-A-GT---------T-A-A-A--T--------A-------------A-----C-ATGA
gi|4802                       :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --G-AA-T----T-TT-----A-T--G-A---C--A-AAT--TTGGTC-A--ATCC--C-TG-TA-A-TGTTattttatgacaaatttggtcaatccctgtaatgtttatcag
gi|4803                       : tacagctgataaagctctgataaatcttaagcaaataaacagtttattcggttttagttaaataacat---------C---------A-GC----ATG---------AA-A--TATAT---G-A-TCAA-GT--CAGTGTTT-----------A-CT----------C---A-ATT-A--------TA-TGAAT-A---G----T--TAA--TCC-G-G---T-CT----T-AGATAACACAAAAT-A-A-A--TTCCA----A-------------G-----T-ATGGC--A--G-------A-C-CCA-GTT-AGT-G-G-C---G-T----T-------------------------A-C----T-TT-----A-T--G-A---C--C-ATC--TTG-TC-C--ATCC--C-TG-TA-T-TGtatcag
gi|4804                       :                                                                                                                                                                                   --------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC-G-G---T-TT----T-A-AT---------A-A-G-A--T--------AATACAAAATAAA-TG----T-ATGGC--A--G-------A-C-C-A-GTT-GGT-GTG-T---G-T----T-A-A-T--AG--A----AGG--G-A--C----T-TT-----A-T--G-ATC-C--T-GCA--TTG-TT-T--ATCattatcag
gi|4805                       :                                                                                                                                                                                            A-C--AT-A---G----T--TTA--ACC-G-G---T-TGA---T-A-ACACAAAA---T-A-A-AATT--------A-------------TG----C-ATGGC--A--G-------A-C-CAG-GTG-GA--G-G-C---G-T----T-G-A-TTAAA--A----AAG--G-AA-C------TT-----A-T--G-A---C--C-ACC--TTG-TC-C--ATTCCAC-TG-TATT-TGTTag

lowQualScore                  :                                                  1111111111                                                           111                                                                                                                                      3333333333333333333333                                                                                                                                                      
lowQualScore                  :                              1     1 1 555555555 9999999999 2222 33 666666666 444444444 1   11    666666666  4 55 333 555 1 1 1  1  44 88888  55555555555 1  5555555555 333 1   1 44444444  1 11  2 333 2222 44   11   2 1 333 2  3333 1 3  999999999 1 1 2 33 6666666666666666666666 66666 1     11 4444444444 1 1   1   1   1 1 1 777 1 4444 1 4 1 22  33 3333   11 11 1 4444 1  33333 2 33 1 444 22 1   33   1  1 22    22 1  3  1 1    
lowQualScore                  :                              .     . . ......... .......... .... .. ......... ......... .   ..    .........  . .. ... ... . . .  .  .. .....  ........... .  .......... ... .   . ........  . ..  . ... .... ..   ..   . . ... .  .... . .  ......... . . . .. ...................... ..... .     .. .......... . .   .   .   . . . ... . .... . . . ..  .. ....   .. .. . .... .  ..... . .. . ... .. .   ..   .  . ..    .. .  .  . .    
lowQualScore                  :                              4     4 4 555555555 5555555555 7777 00 111111111 888888888 2   77    111111111  8 33 888 555 2 2 2  2  11 55555  88888888888 2  3333333333 333 2   2 33333333  1 66  4 222 5555 00   77   4 2 888 4  9999 2 8  888888888 2 2 5 00 5555555555555555555555 99999 2     88 5555555555 3 3   3   3   3 3 3 333 3 7777 4 1 4 00  44 0000   99 66 4 5555 4  66666 9 44 4 555 00 4   44   4  5 00    11 5  1  6 6    
consensus                     :                          TAGC-CTTCT-A-A---------T----------C----T--G---------C---------A-GCT--GATG---------AA-G--C---T---G-A-T-AA-AT--C-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC-G-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-G-C---G-T----T-G-A-T--AG--A----AAG--G-AA-C----T-TT-----A-T--G-A---C--T-ACT--TTG-TC-C--ATCC--C-TG-TA-T-TGTT
Reference ( family-570 )      :                          TAGC-CTTCT-A-A---------T----------C----T--G---------C---------A-GCT--GATG---------AA-G--C---T---G-A-T-AA-AT--C-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC-G-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-G-C---G-T----T-G-A-T--AG--A----AAG--G-AA-C----T-TT-----A-T--G-A---C--T-ACT--TTG-TC-C--ATCC--C-TG-TA-T-TGTT
gi|4771                       :                          TAGC-CTTCT-A-A---------T----------C----T--G---------C---------A-CCT--GATG---------AA-G--C---T---G-A-T-AA-AT--C-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC-G-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-G-C---G-T----T-G-A-T--AG--A----AAG--A-AA-C----T-GT-----A-T--G-A---C--T-ACT--TTG-TC-C--ATTC--C-TG-TA-T-TGTT
gi|4772                       :                          TAGC-CCTCT-A-A---------T----------C----T--G---------C---------A-GCT--GAGG---------AA-G--C---T---G-A-T-AA-AT--C-----TT-----------A-CA----------C---A-ATC-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC-A-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-AAT-G-G-C---G-T----T-G-A-T--AG--A----AAG--G-AA-C----T-GT-----A-T--G-A---C--T-CCT--TAG-TC-C--ATCC--C-TG-TA-T-TGTT
gi|4773                       :                          TAGC-CTTCT-A-A---------T----------C----T--G---------C---------A-GCT--GATG---------AA-G--C---T---G-A-T-AA-AT--C-----TT-----------G-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC-G-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-CTGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-G-C---G-T----T-G-A-T--AG--AAATTAAG--G-AA-C----G-TT-----A-T--G-A---C--T-ACT--TTG-TC-C--ATCC--C-TG-Tta
gi|4774                       :                          TAGC-CTTCT-A-A---------T---------------T--G---------C---------A-GCT--GATG---------AA-G--C---T---G-A-T-AA-AT--A-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------A--C--AT-A---G----T--TAA--TCC-G-T---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-GTGAC--A----------A-C-CCA-GTT-GAT-G-G-C---G-T----T-G-A-T--AG--A----AAG--G-AA-A----T-TT-----A-C--G-A---C--C-ATT--TTG-TC-C--AT-C--C-TG-TA-T-TGTTttatcag
gi|4775                       :                          TAGC-CTTCT-A-T---------T----------C----TT-G---------C---------A-GTT--GATG---------AA-G--C---T---G-A-T-AA-AT--C-----TT-----------A-CA----------CG--A-AGTTA--------AA-C--AT-A---G----TA-TAA--TCC-G-G---T-TT------A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGCA--A--C-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-G-C---G-T----T-G-A-T--AG--A----ATGCTT-AA-C----T-TT-----A-T--G-A---C--T-CCT--TTG-TC-C--ACCC--C-TGATA-T-TGTTtatcag
gi|4776                       :                          TAGC-CCTCTTA-A---------TT---------C----T--G---------C---------A-GCT--GATG----------A-G--C---T---G-A-T-AA-AT--CT----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC-G-G---TATT----T-A-AA---------T-A-G-A--T--------AT------------T-----T-ATGAC--A--A-------A-C-CCA-GTT-GGT-G-G-C---G-T----T-G-ATT--AGA-A----AAG--A-AA-C----T-TT-----C-T--G-A---CAGT-AC---TTG-TC-C--ATCC--T-TG-TA-T-TGTTtatcag
gi|4777                       :                          TAGC-CTTCT-A-G--------------------C----T--G---------C---------A-GCT--GATG---------AA-A--C---TCTGA-A-C-AA-AT--C-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-AA--G----T--TAA--TCC-G-----T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-------ATGGT--A--G-------A-C-CCA-GTT-GGT-G-G-C---A-T----T-G-A-T--AG--A----AAG--G-GA-C----T-TT-----A-T--G-A---C--C-ACTAAATG-TC-C--ATCC--C-TG-TA-T-TGTTt
gi|4778                       :                          TATC-CTTCT-T-A---------T----------C----T--G---------C---------A-GCT--GATG---------AA-G--T---T---G-A-T-AA-ATA-T-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC-G-GGG-T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--TTA------A-------------T-----T-ATGAC--A----------A-C-CCA-GTT-GAT-G-A-CTCTA-T----T-G-A-T--AG--A----AAG--G-AA-C----T-TT-----ACT--G-G---C--T-AC---TTG-TC-C--ATCC--C-TG-TA-T-TGTTtatcag
gi|4779                       :                          TATC-CTTCT-A-A---------T----------C----T--A---------C---------A-GAT--GATG---------AA-G--C---T---A-A-T-AA-AT--C-----TT-----------A---------------------------------------------G----T--CAA--TCC-A-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAG--A--T-------A-C-CCT-GTT-GAT-G-G-C---G-T----T-G-A-T--AG--A----AAT--G--A-C----T-TA-----A-T--C-A---C--T-ACT--TTG-TC-C--ATCC--C-TG-TA-T-TGTTtatca
gi|4780                       :                          TATC-CTTCT-A-A---------T----------C----T--A---------C---------A-GAT--GATG---------AA-G--C---T---G-A-T-AA-ATG-C-----TT---------------------------------T-----------------------G----T--TAA--TCC-A-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------T-------------T-----A-ATGAG--A--T-------A-C-CCCTGTT-GAT---G-C---G-T----T-G-A-T--AG--A----AAT--G--A-C----T-TA-----A-T--C-A---C--T-ACT--TTG-TC-C--ATCC--C-TG-TA-T-TGTTtatcag
gi|4781                       :                          TATC-CTTCT-A-A---------T----------C----T--A---------C---------A-G-T--GAT----------AA-G--C---T---G---T-AA-ATATC-----TT---------------------------------------------------T-G-----------TAA--TCC-A-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAG--AT-G-------A-C-CCT-GTTTGAT-G-G-C---G-T----T-G-A-T--AG--A----AAT--G--A-C----T-TA-----A-TC-A-A---C--T-ACT--TTG-TC-C--ATCC--C-TG-TA-TGTGTTatcag
gi|4782                       :                          TAGC-CCTCT-A-A---------T----------T----T--GATCCACTTGC---------A-GCA--GTTG---------AA-G--C---TCT-G-A-T-AA-AT--C-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCT-G-A---T-TT----T-A-AT---------A-A-G-G--T--------AACACAAAATGAATT-----T-ATGGC--A--G-------A-T-CCA-CTC-GGT-G-G-C---G-T----T-G-A-T--AA--A----AAG--G-AA-C----T-TT-----A-T--G-A---C--C-ACC--TTG-TC-C--ATCC--C-TG-TA-T-CGTTatcag
gi|4783                       :                          TATC-CTTCT-TTA---------T----------C----T--G---------C---------A-GCT--GATG---------AA-G--T---T---G-A-T-AA-AT--A-----TT-----------A--A----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAAGTCCC-G-G---T-TT----TAA-AT---------T-A-GAA--TTA------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-A-CTCTA-T----T-GCA-T--AA--A----AAG--G-AA-CT---T-TT-----A-T--G-G---C--T-ACT--TTG-TC-C--AT-C--C-TG-T--T-TGTTtatcag
gi|4784                       :                          TAGCACTTCT-A-A---------T----------C----T--GT--------C---------A-GCT--GATG---------AACGT-C---T---G-A-T-CA-AT--C-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCCAG-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-AG-TTA------A-------------T-----T-ATGGC--AATG-------A-C-TCA-GTT-GAT-G-G-CG--G-T----T-GAA-T--AGTAG----AAG--G-AA-C----T-TT-----A-T--G-A---C--T-AC-------TC-C--AT-C--A-TG-TA-T-TGTtatca
gi|4785                       :                          TAGC-CTTCT-A-AACTTTGCATT----------CCAGCT--G---------C---------A-GCT--GATG---------AA-A--CCC-T---G-A-A-AA-TT--C-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AC-C--ATTA---G----T--TAA--TCC-T-T---T-TT----A-A-AC---------T-ATA-A--T--------A-------------T-------ATGGC--A--G-------A-C-CCA-ATT-GGT-G-GGCA--G-T----T-G-A-T--AG--A----AAG--G-AAAC----TGTT-----A-T--A-A---C--T-ACT--ATG-CT-C--ATCC--C-TG-TA-T-TGTTattatta
gi|4786                       :                          TAGC-CTTCT-C-A---------T----------C----TCTG---------C---------ACACT--GATGC--------AA-G--C---T---G-A-T-AA-AT--C-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC-G-GTTTT-TT----T-A-AT---------T-A-GCA--T--------A-------------TC----T-ATGAC--A--G-------A-C-T----TT-CA----------G-T----T-G-A-T--AG--G----AAG-----A-C----T-TT-----A-T--G-GGACC--T-ACTC-TTG-TC-C--ATCC--C-TG-TA---TGTTtatcag
gi|4787                       :                          TAAC-CTTCT-A-A---------TTTGATCCAG-C----T--G---------C---------A-GCT--GATT---------AACGT-C---T---G-A-A-AA-AT--C-----TC-----------G-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-G---A----TATTAA--GCC-T-G---T-TT----A-A-AT---------T-A-G-A--T--------AACACGATATAAATT-----C-ATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-G-C---G-T----T-G-A-T--AG--A----AAG--G-AA-CTTTAT-TT-----A-T--A-A---C--C-ACT--TTG-tat
gi|4788                       :                          TAGC-CTTCT-A-A---------TGTTTGATCAGC----T--G---------C---------A-GCT--GATG---------AACT--C---T---GAA-A-AA-AT--CT----TT-----------A-CA----------C---ATAGA-A--------AG-C--AT-A---G----T--TAA--TTC-GCG---T-TTTTTCT-A-AT---------TAA-G-A--T--------A-------------T-----A-GTGGC--A--G-------A-CGCCA-GTT-GGTGG-G-C---A-TAA--T-G-A-G--TG--A----AAG--G-AA-T----T-TT-----A-T--G-A------T-ACT--TTG-TC-CATATCC--C-AG-TA-T-TGT
gi|4789                       :                          TAGC-CTTCT-A-A---------T----------C----T--G---------C---------A--------------------A-G--C---T---G-A---------------------------------------------------------------A-T--AT-A----------------TTC-G-G---T-TT----T-G-AT---------C-A-T-A--T--------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------A-T-CCA-GTT-GAT---G-C---G-T----T-G-A-T--AG-----------------------------------------------ACT--TTG-T--C--ATCC-----G-TA-T-TGTTcgttattcag
gi|4790                       :                          TAGT-CTTCT-A-A---------T----------C----T--G---------------------------------------AA-G--C---T---G-A-T-AT-AT--C-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT------------------------------------------------------T-A-ATA--------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-G-C---G-T----tatcag
gi|4791                       :                          TAGC-CTTCT-A-A---------TTTGATCCAG-C----T--G---------C---------A-GCT--GATG---------AA-G--C---TCT-G-A-T-AA-AT--A-----TT-----------A-AA----------T---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAC--TCT-A-G---T-
gi|4792                       :                          TAGC-CTTCT-A-A---------T----------C----T--G---------CTCCAGCTGCA-GCT--AATG---------AA-G--C---TCT-A-A-T-AA-AT--C-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AA-
gi|4793                       :                          TAAC-CTTCT-A-A---------TTTA-------C----T--G---------T---------A-GCT--GATG---------AA-GCTC---T---G-A-T-AA-AT--C-----TT--------------A----------C---A-AGT-A--------AAGC--ATCA---G----T--T
gi|4794                       :                           AGT-CTTCT-A-A---------T----------C----T--G---------C---------A-GCT--GATAAATTCTTACAA-G--C---A---G---T-AA-TT--C-----TTTTCGGGAATAAA-CAATACAATACAC---A-AGT-A--------AA----AT-A---G----T--TAA--TC----A---T-TT----T-ACAT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------ATC-CCA-GTT-GAT-G-G-C---GTT----T-GCA-T--AG--A----AAA--G-AA-C----T-TT-----A-T--G-A---C--T-ACT--TTG-TC-C--ATCC--T-TG-TA-T-TGTT
gi|4795                       :                            GC-CTTCT-A-A---------G----------C----T--G---------C---------A-GCCTGGATG---------AATA--C---T---G-A-T-AA-AT--C-----TT-----------AACA----------CCCAA-AGT-ATAAAATACAA-G--AT-A---GGTTATA-TAA--TCC-G-G---T-TT----T-ATAT---------T-A-G-T--T----------------------T-----T-ATGACTAA--GTACCCGAA-C-CCA-GTT-GAT-G-G-C---G-T----TGG-A-T--AG--A----AAG--GAAA-C----T-TTTAAGCA-T--GAA---C--TGACT--TTG-TCGC--ATCC--CATG-TA-T-TGttatcag
gi|4796                       :                             C-CTTCT-A-A---------T----------C----T--G---------C---------A-GCT--GATG---------AA-G--C---TCT-G-A-T-GC-AT--C-----TT-----------G-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-ACTAG----T--TAA--ACT-G-G---T-TT----T-A-AT---------G-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGGC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GGA-G-G-C---G-T----T-G-A-T--AG--A----AAG--G-AA-C----T-TT-----A-T--G-A---C--C-ACC--TTG-TC-C--ATCC--C-TC-TA-T-TGTTggtatca
gi|4797                       :                             C-CTTTT-T-A---------T----------C----T--G---------C---------A-GCT--GATG---------AA-G--T---T---G-AAT-AATAT--CAGTTATT-----------A-CA----------C---A-AGT-C--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCCGG-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--TTA------A-------------T-----TCATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT---G-C---G-CTATAT-G-A-T--AG--A----AGG--G-AC-T----T-TT-----AGTTAG-A---C--T-ACT--TTG-TC-C--ATCC--C-TGTTA-T-CGTTtatcgg
gi|4798                       :                              -CTCCT-A-A---------T----------C----T--G---------C---------A-GTT--GGTG---------AA-AA-C---TCG-G-A-T-AA-AT--C-----TT-----------G-CA----------C---A-AAT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC-G-G---T-TT----T-A-AA---------T-C-G-A--TTA------A-------------T-----T-AAGGC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-G-C---A-T----T-G-A-T--AG--A----AAG--tatca
gi|4799                       :                                TTCT-A-A---------T----------C----T--G---------C---------A-GCT--GA------------A-G------------A-T-AA-AT--C-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC-G-G---TAAA----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAA-G-G-
gi|4800                       :                                                  ----------C----T--G---------C---------A-GTT--GA------------A-G--C---TCT-G-A-T-GA-AT--C-----TT-----------G-CA----------C---A-ATT-G--------AA-C--A------G----T--TAA--TTC-G-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--TAACGCAAAA-------------TAAATGT-ATGGC--A--A-------A-C-CCA-GAT-GGT-G-G----------------------------------------C----T-TT-----A-T--G-A---C--C-ACT--TTG-TC-C--ATCC--C-TT-TA-T-TGTT
gi|4801                       :                                                  ----------C----T--G---------C---------A-GCC--GAGG---------TA-G--C---TAT-G-A-T-AA-AC--C-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TTA--TCC-G-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------GATACAACATT---T-----T-ATGGC--A--A-------A-C-CCA-GTT-GGT-G-C-C---G-T----T-A-A-atca
gi|4802                       :                                                             ----T--A---------C---------A-GCT--GATA---------AA-G--C---TCT-G-A-T-AA-AT--C-----TT-----------A-AG----------C---A-AAT-A--------AA-C-----A---G----T--TTA--TTC-G-G---T-TT----T-A-GT---------T-A-A-A--T--------A-------------A-----C-ATGA
gi|4802                       :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --G-AA-T----T-TT-----A-T--G-A---C--A-AAT--TTGGTC-A--ATCC--C-TG-TA-A-TGTTattttatgacaaatttggtcaatccctgtaatgtttatcag
gi|4803                       : tacagctgataaagctctgataaatcttaagcaaataaacagtttattcggttttagttaaataacat---------C---------A-GC----ATG---------AA-A--TATAT---G-A-TCAA-GT--CAGTGTTT-----------A-CT----------C---A-ATT-A--------TA-TGAAT-A---G----T--TAA--TCC-G-G---T-CT----T-AGATAACACAAAAT-A-A-A--TTCCA----A-------------G-----T-ATGGC--A--G-------A-C-CCA-GTT-AGT-G-G-C---G-T----T-------------------------A-C----T-TT-----A-T--G-A---C--C-ATC--TTG-TC-C--ATCC--C-TG-TA-T-TGtatcag
gi|4804                       :                                                                                                                                                                                   --------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC-G-G---T-TT----T-A-AT---------A-A-G-A--T--------AATACAAAATAAA-TG----T-ATGGC--A--G-------A-C-C-A-GTT-GGT-GTG-T---G-T----T-A-A-T--AG--A----AGG--G-A--C----T-TT-----A-T--G-ATC-C--T-GCA--TTG-TT-T--ATCattatcag
gi|4805                       :                                                                                                                                                                                            A-C--AT-A---G----T--TTA--ACC-G-G---T-TGA---T-A-ACACAAAA---T-A-A-AATT--------A-------------TG----C-ATGGC--A--G-------A-C-CAG-GTG-GA--G-G-C---G-T----T-G-A-TTAAA--A----AAG--G-AA-C------TT-----A-T--G-A---C--C-ACC--TTG-TC-C--ATTCCAC-TG-TATT-TGTTag


blockSeqs                     :                              A     T T ACTTTGCAT GTTTGATCAG CAGC CT ATCCACTTG TCCAGCTGC C   TG    AATTCTTAC  C CT ATA CTG A A C  T  AT AGTTA  TTCGGGAATAA A  ATACAATACA CCA T   T TAAAATAC  G GA  T CTA GTTA AT   GT   A C TTT A  TTTC A C  AACACAAAA A T A AT AACACAAAATGAAT         AAATG C     TA GTACCCGA   T G   T   T   G T G TCT T TATA G C T TA  TA AATT   CT AA A TTTA G  TAAGC C TA A GAC AG G   AA   G  G AT    CA A  A  T G
blockSeqs                     :                              .     . . .         TTGATCCAG  .    T  T         .         .   .     C          C T  CC  CT  . . .  .  A  AGTGT  .           .  .          G   .   . .         . .   C A   .    A    .    G . GG  A  A    . T  ACAAAA    . . C G  AACACGATATAAAT         C     .     .  ATG        . .   .   .   . . . TCT . AA   . A . .   A  .      .  A  . T    .  .     G C  . TC  .  .   C    .  . .     .  .  T  . .
blockSeqs                     :                              .     . . .         TTGATCCAG  .    .  .         .         .   .     .          C T  .   CT  . . .  .  G  T      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    A    .    . . .   .  .    . G  A         . . . .  AATACAAAATAAA          G     .     .  TG         . .   .   .   . . . G   . .    . C . .   .  .      .  A  . .    .  .     . .  . .   .  .   .    .  . .     .  .  .  . .
blockSeqs                     :                              .     . . .         TTA        .    .  .         .         .   .     .          T A  .   CT  . . .  .  .  T      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  GATACAACATT            G     .     .  G          . .   .   .   . . . A   . .    . . . .   .  .      .  A  . .    .  .     . .  . .   .  .   .    .  . .     .  .  .  . .
blockSeqs                     :                              .     . . .         T          .    .  .         .         .   .     .          . .  .   CT  . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  AACGCAAAA              .     .     .  G          . .   .   .   . . . .   . .    . . . .   .  .      .  A  . .    .  .     . .  . .   .  .   .    .  . .     .  .  .  . .
blockSeqs                     :                              .     . . .         .          .    .  .         .         .   .     .          . .  .   CG  . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  TCCAA                  .     .     .  C          . .   .   .   . . . .   . .    . . . .   .  .      .  A  . .    .  .     . .  . .   .  .   .    .  . .     .  .  .  . .
blockSeqs                     :                              .     . . .         .          .    .  .         .         .   .     .          . .  .   CT  . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  TAA                    .     .     .  A          . .   .   .   . . . .   . .    . . . .   .  .      .  G  . .    .  .     . .  . .   .  .   .    .  . .     .  .  .  . .
blockSeqs                     :                              .     . . .         .          .    .  .         .         .   .     .          . .  .   AT  . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  TAA                    .     .     .  G          . .   .   .   . . . .   . .    . . . .   .  .      .  A  . .    .  .     . .  . .   .  .   .    .  . .     .  .  .  . .
blockSeqs                     :                              .     . . .         .          .    .  .         .         .   .     .          . .  .   CT  . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  TAA                    .     .     .  T          . .   .   .   . . . .   . .    . . . .   .  .      .  A  . .    .  .     . .  . .   .  .   .    .  . .     .  .  .  . .
blockSeqs                     :                              .     . . .         .          .    .  .         .         .   .     .          . .  .   .   . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  TAA                    .     .     .  T          . .   .   .   . . . .   . .    . . . .   .  .      .  A  . .    .  .     . .  . .   .  .   .    .  . .     .  .  .  . .
blockSeqs                     :                              .     . . .         .          .    .  .         .         .   .     .          . .  .   .   . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  TAA                    .     .     .  G          . .   .   .   . . . .   . .    . . . .   .  .      .  A  . .    .  .     . .  . .   .  .   .    .  . .     .  .  .  . .
blockSeqs                     :                              .     . . .         .          .    .  .         .         .   .     .          . .  .   .   . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  AT                     .     .     .  G          . .   .   .   . . . .   . .    . . . .   .  .      .  A  . .    .  .     . .  . .   .  .   .    .  . .     .  .  .  . .
blockSeqs                     :                              .     . . .         .          .    .  .         .         .   .     .          . .  .   .   . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  A                      .     .     .  G          . .   .   .   . . . .   . .    . . . .   .  .      .  A  . .    .  .     . .  . .   .  .   .    .  . .     .  .  .  . .
blockSeqs                     :                              .     . . .         .          .    .  .         .         .   .     .          . .  .   .   . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  A                      .     .     .  G          . .   .   .   . . . .   . .    . . . .   .  .      .  A  . .    .  .     . .  . .   .  .   .    .  . .     .  .  .  . .
blockSeqs                     :                              .     . . .         .          .    .  .         .         .   .     .          . .  .   .   . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  A                      .     .     .  G          . .   .   .   . . . .   . .    . . . .   .  .      .  A  . .    .  .     . .  . .   .  .   .    .  . .     .  .  .  . .
blockSeqs                     :                              .     . . .         .          .    .  .         .         .   .     .          . .  .   .   . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  A                      .     .     .  G          . .   .   .   . . . .   . .    . . . .   .  .      .  A  . .    .  .     . .  . .   .  .   .    .  . .     .  .  .  . .
blockSeqs                     :                              .     . . .         .          .    .  .         .         .   .     .          . .  .   .   . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  A                      .     .     .  G          . .   .   .   . . . .   . .    . . . .   .  .      .  A  . .    .  .     . .  . .   .  .   .    .  . .     .  .  .  . .
blockSeqs                     :                              .     . . .         .          .    .  .         .         .   .     .          . .  .   .   . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  A                      .     .     .  G          . .   .   .   . . . .   . .    . . . .   .  .      .  A  . .    .  .     . .  . .   .  .   .    .  . .     .  .  .  . .
blockSeqs                     :                              .     . . .         .          .    .  .         .         .   .     .          . .  .   .   . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  T                      .     .     .  G          . .   .   .   . . . .   . .    . . . .   .  .      .  A  . .    .  .     . .  . .   .  .   .    .  . .     .  .  .  . .
blockSeqs                     :                              .     . . .         .          .    .  .         .         .   .     .          . .  .   .   . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  A                      .     .     .  G          . .   .   .   . . . .   . .    . . . .   .  .      .  A  . .    .  .     . .  . .   .  .   .    .  . .     .  .  .  . .
blockSeqs                     :                              .     . . .         .          .    .  .         .         .   .     .          . .  .   .   . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  A                      .     .     .  G          . .   .   .   . . . .   . .    . . . .   .  .      .  .  . .    .  .     . .  . .   .  .   .    .  . .     .  .  .  . .
blockSeqs                     :                              .     . . .         .          .    .  .         .         .   .     .          . .  .   .   . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  A                      .     .     .  G          . .   .   .   . . . .   . .    . . . .   .  .      .  .  . .    .  .     . .  . .   .  .   .    .  . .     .  .  .  . .
blockSeqs                     :                              .     . . .         .          .    .  .         .         .   .     .          . .  .   .   . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  A                      .     .     .  G          . .   .   .   . . . .   . .    . . . .   .  .      .  .  . .    .  .     . .  . .   .  .   .    .  . .     .  .  .  . .
blockSeqs                     :                              .     . . .         .          .    .  .         .         .   .     .          . .  .   .   . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  A                      .     .     .  A          . .   .   .   . . . .   . .    . . . .   .  .      .  .  . .    .  .     . .  . .   .  .   .    .  . .     .  .  .  . .
blockSeqs                     :                              .     . . .         .          .    .  .         .         .   .     .          . .  .   .   . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  A                      .     .     .  A          . .   .   .   . . . .   . .    . . . .   .  .      .  .  . .    .  .     . .  . .   .  .   .    .  . .     .  .  .     
blockSeqs                     :                              .     . . .         .          .    .  .         .         .   .     .          . .  .   .   . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  A                      .     .     .  G          . .   .   .   . . . .   . .    . . . .   .  .      .  .  . .    .  .     . .  . .   .  .   .    .  . .                 
blockSeqs                     :                              .     . . .         .          .    .  .         .         .   .     .          . .  .   .   . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  A                      .     .     .  G          . .   .   .   . . . .   . .    . . . .   .  .      .  .  . .    .  .     . .  . .   .  .   .    .                      
blockSeqs                     :                                    . . .         .          .    .  .         .         .   .     .          . .  .   .   . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  A                      .     .     .  G          . .   .   .   . . . .   . .    . . .               .                                                                   
blockSeqs                     :                                                  .          .    .  .         .         .   .     .          . .  .   .   . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  A                      .     .     .  .          . .   .   .   . . . .   . .                                                                                            
blockSeqs                     :                                                  .          .    .  .         .         .   .     .          . .  .   .   . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  A                      .     .     .  .          . .   .   .   . . .                                                                                                    
blockSeqs                     :                                                             .    .  .         .         .   .     .          . .  .   .   . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .  .    . .  .         . . . .  .                      .     .                                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                                     .         .         .   .     .          . .  .   .   . . .  .  .  .      .           .  .          .   .   . .         . .   . .   .    .    .    . . .   .                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                   .         . .   . .   .    .                                                                                                                                                                                                                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                             .                                                                                                                                                                                                                                          


blockSeqCons                  :                          
originalCons                  :                          TAGC-CTTCT-A-A---------T----------C----T--G---------C---------A-GCT--GATG---------AA-G--C---T---G-A-T-AA-AT--C-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC-G-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-G-C---G-T----T-G-A-T--AG--A----AAG--G-AA-C----T-TT-----A-T--G-A---C--T-ACT--TTG-TC-C--ATCC--C-TG-TA-T-TGTT
finalCons                     :                          TAGC-CTTCT-A-A---------T----------C----T--G---------C---------A-GCT--GATG---------AA-G--C---T---G-A-T-AA-AT--C-----TT-----------A-CA----------C---A-AGT-A--------AA-C--AT-A---G----T--TAA--TCC-G-G---T-TT----T-A-AT---------T-A-G-A--T--------A-------------T-----T-ATGAC--A--G-------A-C-CCA-GTT-GAT-G-G-C---G-T----T-G-A-T--AG--A----AAG--G-AA-C----T-TT-----A-T--G-A---C--T-ACT--TTG-TC-C--ATCC--C-TG-TA-T-TGTT