lowQualScore                  :               111111111111          111                          22                                        333333333333333333333333333333333333333                                     1          111                                           11                                                                                                                                                               1111                                            22222222                                                   1111  222                         111111                                                                                          222                                       111111111111111111                               1111111111                                 2222222222222222      1                                          1111               
lowQualScore                  :       2   2   444444444444 2     2  555      33 7  2  2 5555   2 99 2  0  55  33  444 2 33     2 88888888  999999999999999999999999999999999999999 666    33 8888  444    2 55  2      2 55  2 33 222  4  22 2  2   2 4    44 2   2         2   00 55    2  22 333   333 2 2 8888 22  2 55      99   2    333     1 55  1     1  22    3333 1 2222  1 222   1 1  1 22   44 3 1  22 22  3 1 3 1   3 1  1 1 5555   0000  555   2  44 2 2     4 2      888888   2   44444444 7777777 2 4  77   33 33 2  44   2  2  2 444 66 2  3333  000 2  33  2 4444 33        111111     33 2 3333   999       2      2 4           666  4       2 2   2  999   2  2 66666    000 7777777  2 333 2 4   2  22 4444  2    888888888888888888    88      333   5   55 333   2222222222 2   2   88888 1    77777777 2   7777777777777777      0  333 2  333 1 1  1   1    3 1        22  9999      22  2    
lowQualScore                  :       .   .   ............ .     .  ...      .. .  .  . ....   . .. .  .  ..  ..  ... . ..     . ........  ....................................... ...    .. ....  ...    . ..  .      . ..  . .. ...  .  .. .  .   . .    .. .   .         .   .. ..    .  .. ...   ... . . .... ..  . ..      ..   .    ...     . ..  .     .  ..    .... . ....  . ...   . .  . ..   .. . .  .. ..  . . . .   . .  . . ....   ....  ...   .  .. . .     . .      ......   .   ........ ....... . .  ..   .. .. .  ..   .  .  . ... .. .  ....  ... .  ..  . .... ..        ......     .. . ....   ...       .      . .           ...  .       . .   .  ...   .  . .....    ... .......  . ... . .   .  .. ....  .    ..................    ..      ...   .   .. ...   .......... .   .   ..... .    ........ .   ................      .  ... .  ... . .  .   .    . .        ..  ....      ..  .    
lowQualScore                  :       9   9   666666666666 9     9  111      44 2  4  4 0000   4 11 4  4  66  66  444 4 22     4 55555555  111111111111111111111111111111111111111 555    22 2222  111    4 66  4      0 66  2 11 777  9  88 0  0   0 0    88 0   0         1   11 00    1  99 777   777 1 1 1111 99  1 88      33   1    555     7 66  7     7  44    5555 7 3333  7 999   7 7  7 33   00 3 7  33 33  3 7 3 7   5 7  7 7 4444   4444  222   0  88 0 0     2 1      222222   1   22222222 2222222 2 4  55   11 11 2  66   5  5  5 444 99 4  4444  555 4  22  4 2222 22        555555     22 4 3333   444       2      2 4           666  2       1 1   1  888   1  1 99999    222 2222222  2 999 1 6   2  66 7777  2    444444444444444444    66      777   2   55 555   3333333333 0   0   88888 9    22222222 0   9999999999999999      5  555 0  555 9 8  8   8    6 8        88  2222      99  2    
consensus                     : GGCAGT-AGT-CGT------------G-TGTTG-GA--GTGGCTT--GCCA-CT-C----AGA-GG-C-TAACC--AG-CGAT--A-G--AGGTT-A--------GC----------CACC------------------------AA---GCAG--A----GT---AATC-C--GT-CTTCCTGA--CC-T--G-TCTGGCG--A-CC-AAG-C-TGTT--G-TGT-GCAGTGTGT-CTGC-C--TGAA-TA--A---GGC---T-T-GC---A--GT-G--TACACAG-CAG-TGGA---AGGGC-T--AT-CACTT-AT--ACTG----T-G--T-GT-C---CTG-A-AT-A--AGG--C-T-GC--A--GT-A-T-A-AGC-G-GT-A-G----TCCG---AG---GTT-GA--C-C-AGTGT-A-AGGCTA------ACC-ATT-----A--G-------T-C-TA--CCC--A--C-TGC-CAA-TC-AC-C---C--A-AT-CATTA-G-A-TT--TT-AT---G--TGATTCCC------TAATT--C-A-A--ATT-A-TAGTGAT-TATCAA-C-CTAGATAAGGT---TA-GGCCATA-C-TTT-TT--GGTA-TA-T-A---TTTG-C-A-------GG-C---CTTCGTT-TT-AA----AT-CATTT----GGC-------TA-ATCA-TTTTTAG---AGGAAAA--T---TGT--------T-A-TAT-ATA-----T-TAAA--------G-TCA--TC-----------CCCCAAACCC---T-TG---A-A-TT-GAC-AAGG-T-ACGAGCCC--TG-GT-AGGCGC--TT-ACGT
Reference ( gi|110529 )       : GGCAGT-AGT-CGT------------G-TGTTG-GA--TTGGCTT--GTCA-CT-C----AGA-G--C-TAGCC--AG-CGAT--A-G--AGGTT-A--------GC----------CACC------------------------TA---GCAG--A----GT---AATC-C--GT-CTTCCTTA--CC-T--G-CTTGACG--A-CC-AAG-C-TGTT--G-TGT-GCAGTGTGT-CTGT-C--TGAA-TA--A---GGC---T-T-GT---A--GT-G--TACACAT-CAG-TGGA---AGGGC-T--AT-CACTT-AT--ACTG----T-G--T-GT-C---CTG-A-AT-A--AGG--C-T-GC--A--GT-A-T-A-AGC-G-GT-A-G----TCCA---AG---GTT-GA--C-C-AGTGT-A-AGGCTA------ACC-ATT-----G--G-------T-C-TA--CCC--A--C-TGC-CAA-TC-AC-C---C--A-AT-CACTA-T-A-TT--TT-AT---G--TGATTCCC------TAATT--C-A-A--ATT-A-TAGTGAT-TATCAA-C-CTAGATAAGGT---TA-GGCCATA-C-TTT-TT--GGTA-TA-T-A---TTTG-G-A-------GG-C---CTTTGTT-TT-AA----AT-CATTT----GGC-------TA-ATCA-TTTTTAG---AGGAAAA--T---TGT--------T-A-TAT-ATA-----T-TAAA--------G-TCA--AC-----------TCCCAAAACC---T-TG---A-A-TT-GAC-AAGG-T-ACGAGCCC--TG-AC-AGGCGC--TT-ACGT
gi|110530                     : GGCAGT-AGT-CGT------------G-TGTTG-GA--GTGGTTT--GCCA-CT-C----AGG-GG-C-TAGTT--AG-TGAT--A-G--AGGTT-A--------GC----------CACC------------------------AA---GCAG--A----GT---AATC-C--GT-CTTCCTGA--CG-T--T-CCTGGCG--A-CC-AAG-C-TGTT--G-TGT-GCAGTGTGT-CTGC-C--TGAA-TA--A---GGC---T-T-GC---A--GTGG--TACACAT-CAG-TGGA---AGGGC-T--AT-CGCTT-AT---CTG----T-G--T-GT-C---CTG-A-AT-A--AGG--C-T-GC--A--GT-A-T-A-AGC-G-GT-A-G----TCCG---AG---GTT-GA--C-C-AGTGT-A-AGGCTA------ACC-ATT-----A--G-------T-C-TA---CC--A--C-TGT-CAA-TC-AC-C---C--A-AT-AATTA-G-A-TT--TT-AT---G--TGATTCCC------TAATT--CAA-A--ATT-A-TAGTGAT-TATCAA---CTAGATAAGGT---TA-GGCCACA-C-TTT-GT--GGTA-TA-T-A---CTTG-C-A-------GG-C---CTTCG-T-TT-AA----AT-CATTT----GGC-------T--ATCA--TTTTAG---AGGAAAA--T---TGT--------T-A-TAT-ATA-----T-TAAA--------G-TCA---------------TCCCAAACCC---T-TG---ATA-TT-GAC-AAGG-TAACGAGCCC--TG-GTAAGGCGC--TT-ACGT
gi|110534                     : GGCAGT-AGT-CGT------------G-TGTTG-GA--GTGGTTTTGGCCA-TC-C----AGA-G--C-TAGCC--AG-CGAT--A-G--AGGTTTA--------GCA---------CA---------------------------A---GCA---A----GT---AATC-C--GT-CTTC-TGAT-CC-T--G-TATGGCG--A-C--AAG-C-TGTTTGG-TGT-GCAGTGTGT-CTGC-C--TGAA-TA--A---GGC---T-T-GC---C--GT-G--TACACA--CAG-TGGA---AGGG--T--AT-CA-TT-AT--ACTG----T-G--T-GT-C---CTG-A-AT-A--AGG--C-T-GC--A--GT-G-T-A--GC-G-GT-A-G----TCCG---AG----TT-GT--A-C-AGTGT-A-AGGCTA------ACC-ATT-----A--G-------T-C-TA--CC---A--C-TGC-CAA-TC-AC-C---A--A-AT-CATTA-G-C-TT--TT-AT---G--TGATTCCT--------ATT--C-A-A--ATT-A-TAGTGAT-TATCAA-C-CTAGATAAGGT---TA-GGCAATAGCGTTTATG--GGTA-TA-T-A---TTT--G-A-------GG-C---CTTCGTT-TT-GA----AT-CATTT----GGC-------TA-ATCA--TTTTAG---AGG-AAA--T---TGT--------T-A-TAT-ATC-----T-T-AA--------G-TCA---------------TCCCCAAACC---T-TG---A-A-TT-GAC-AAGG-T-A-GAGCCC--TG-GT-AGGCGC--TT-ACGT
gi|110531                     : GACAGT-AGT-CGT------------G-TGTTG-AA--GTGGCAT--GCCA-CT-C----AGA-GG-C-TAACC--AG-TGAC----G--AGGTT-A--------AC-----------ATC------------------------AA---GCAG--A----GT---AATC-C--AT-CTTCCTGA--CC-T--G-TCTGGCG--A-CC-AAG-C-TGTT--G-TGT-ACAGTGTGT-CTGC-C--TGAA-TA--A---GGC---T-T-GC---A--GT-G--TACACAG-CAG-TGGA---AGGGC-T--GT-CACTTAAC--ACTG----T-G--T-GT-C---CTG-A-AT-A--AGG--C-T-GC--A--GT-G-T-A-AGC-GTAT-A-G----TCCG---A----GTT-GA--C-C-AATAT-A-AGGCT-------ACC-ATT-----A--G-------T-C-TA--CCC--A--C-TG--CAA-TC-AC-C---C--A-AT-AATTA-G-ATTT--TT-AT---G--TGATTCCCAGACCTTAATT--C-A-T--ATT-G-TAGTGAT-TATCAA-C-CTAGATAAGGT---TA-GGCCATA-C-TTT-TT---GTA-TA-C-A---TTTG-C-A-------G------CTTTGTT-TT-CA----AT-CATTT----TGG-------TA-ATCA-TTTTTAG---AGG-AAA--T---TGT--------T-A-TAT--T------T-CCAA--------G-TCA--TC-----------CCCCAAACCC---T-TG-----A-TT-GAC-AA-G-T-ACGAGCCC--TG-GT-CGGCGC--TT-ACGT
gi|110532                     : GGCAGT-AGT-CGT------------T-TGTTG-GA--GTGGCTT--GCCA-CT-C----AGA-GG-C-TAGCC--AG-CGAT--A-T--AGGTT-G--------GC----------AACC------------------------AA---GCAG--A----GT---AATC-C--GT-CTTCCTGA--CC-T--G-TCTGGCG--A--C-AAG-C-TGTT--G-TGT-GCAGTGTGT-CTGC-C--TG-A-TA--A---GGC---T-T-GC---A--GT-G--CACACAT-CAG-TGGA---CGGGC-TA-AT-CACTT-AT--ACTG----T-A--T-GT-C---CTG-A-AT-A--AGG--C-T-GC--A--GTAA-TGA-AGCGG-GTAA-G----TCC----GG---GTT-GA--CTC-AGTGT-A-AGG-TA------ACCAATT-----GA-G-------T-C-TA--CCC--A--G-CGA-CAA-TC-ACTC---C--A-AT--ATTA---A-TTTATT-AT---GGTTGATTCCC------T-ATT--C-A-A--ATT-A-AAGTTAT-TATCAA-CGCTAGATAAGGT---TATGCCCATA-C-AGT-TT--GGTA-TA-T-A---TTTG-C-A-------AG-C---CTTCGTT-TT-AA-----------------------------ATCA-TTTTTAG---AGGAAAA--T---TGT--------T-A-TAT-ATA-----T-TAAA--------G-TCA--TC-----------CCCCAAACCC---T-TG---A-A-TG-GAC-AAGG-T-ACGAGCCC--TG-GT-AGGCGC--TT-ACGT
gi|110533                     : GGCAGT-AGT-CGT------------T-TGTTG-GAG-TCGGCTT--GCCAACT-C----AGA-GGGC-TAGCCT-AG-CGAT--ATG--AGGTT-G--------GC----------AACC------------------------GAA--GCAG--A----GT---AATC-C--GT-CTTCCCGA--CC-T--G--TCGGCG--A-GC-AAG-CCTGTT--G-TGT-GC-GTGTGT-C-GC-C--TGGA-TA--A---GGC---T-T-GC---A--GT-G--CACACAT-CAG-TGG----AGGGC-TA-AT-CAC-T-AT--ACTG----T-A--T-GT-C---CTG-A-ATGA--AGG--C-TGGC--A--GTAA-TGA-AGCGG-GT-A-G----TC------G---GGT-GA--C-C-AGTGT-A-AGGCTA------ACC-ATT-----GA-G-------T-C-TA--CCC--A--G-CGA-CAA-TCAAC-T---C--A-AT--ATTA---A--T--TT-ATTTGG--TGATTCCCG-----TATGT--C-A-A--ATTAA-TAGTTAT-TATCAA-CGCTAGATAAGGT---TATGCCCATA-C-AGT-TT--GGTA-TA-T-A---ATTGCA-A-------AG-C---CTTCGTTGTT-AAAAATAT-CATTT----------------------TTTGTAG---AGG-AAA--T---TGT--------T-A-TATAATA-----T-TAAA--------G-TCA--TC-----------CCCC-AACCC---T-TG---A-A-TG-GAC-AA-G-T-AC-AGCCC--TG-GT-A-GCGC--TT-ACGT
gi|110536                     : GGCAGT-AGT-CGT------------G-TGTTG-GA--TTGGCTT--GCCA-CT-CCTGAAGACG--C-TAGCA--AG-CGAT--A-G--AGGTT-A--------GC----------CACC------------------------AA---GTAG--A----AT---AATC-C--GT-CTTCCTGA--CC-T--G-TCTGGCG--A-CC-AAG-C-TGTT--G-TGT-GCAGTGTGT-CTGC-C--TAAA-TA--A---GGT---T-T-GC---A--GT-G--TACACAT-CAG-TGGA---AGGAT-T--AT-CACTT-AT--ACAG----T-G--T-GT-C---CTG-G-AT-A--AGG--C-T-GC--A--GT-A-T-A-AGC-G-TT-A-G----TCCG---AG---GTT-GA--C-C-AGTGT-A-AGGCTA------ACC-ATT-----A--G-------T-C-TA--CCC--A--T-TGC-CAA-TC-AC-T---C------------------T--TT-AT---G--TGATTCCC------TAATT--C-A-A--ATT-A-TAGT
gi|110535                     : GGCAGT-AGTTCGTTATCGAATAAAGG-TGTTG-GGAGTCGCCAT--GCCA-CT-C----AAG-G--C-TAACC--AG-TGA---A-G--AGGGT-A--------GC----------CACC------------------------AA---GCAG--A----GT---AATC-G--GT-CTTCCTGA--CC-T--G-TCTGGTG--AGCC-AAG-C-TGTT--G-TGTTGCAGTGTGT-CTGC-C--T-AA-TA--A---GGC---G-G-GC---A--AT-G--TACACAG-CAG-TGGA---AGGGG-TGTAT-CATTT-AT--ACTG----T-G--TTGT-C---CTG-A-AT-A--AGG--C-T-GC--A--GT-A-T-A-AGC-G-GT-A-G----TCCG---AG---GTT-GA--C-C-ATTAT-A-CGGCTACATGTAACC-ATT-----A--G-------T-C-TA--CCC--A--C-TGA-CAA-TC-AC-C---C--A-AT-AATTA-A-A-GT--TT-AC---G--TGATTCAC------TAATT--C-A-T--ATT-G-TAGTGAT-TATCAA-C-CTAGATAAGGT---AG-GGCCATA-C--AT-TT--AGTA-TG-T-A---TTTG-C-A-------GG-C---CTT
gi|110537                     : GGCAGTTAGT-CGT------------G-TGTTG-GA--GTGGCTA--GCCA-CT-C----AGA-GA-C-TAACT--GG-TGAC--A-G--AGGTT-A--------GC----------CACCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---GAAG--A----GT---AATC-T--GT-CTTC--TG--CAGT--G-TCTGGCG--A-CCCAAG-C-TGTT--G-TGT-GCAGTGTGT---GC-C--TGAA-TA--A---GGC---T-T-GC---A--GT-G--TACA-AG-CAG-TGAA---AGGGA-T--AT-CACTT-AT--ACTA------G--T-AT-C----TG-A--T-A--AG---C-T-GC--A--GT-A-T-A-AGC-G-GT-A-T----TCCG---A----GTT-GA--C-CAAGTGT-A-ACGCTA------ACC-ATT-----A--G-------T-C-TA--CCC--A--CTTGC-CTA-TC-AC-C---CTGA-AT---CTATT-A-AT--TT-AT---A--TGATTCCC------TAATT--C-ATA--GTT---TA-TGAT-TCTCAA-C-CTTGATAAGGT---TA-CGCCATA-G-TTT-T-----TA-TAGC-A---TGTG-ACA-------GG-C---CTTC-TT-TT-AA-----------------------------ATCA-TTTTTAG---TGGAAAATGT---TGT--------T-A-TAC-ATATATATT-TAAG--------A-TCA--A--------------CCAAATCC---T-TG---C-A-TT-G---AAAG-T-AC--GCCT--T---T-AGGCGC--TC-ACGT
gi|110538                     : GGCAGT-AGT-CGT------------GGTGTTGTGA--GTGGCTT--GCCA-CTTC----AGA-G--G-TAACC--AGGTGATCTA-G--AGGTT-ACGCTGATAGC----------CATC------------------------AA---GCA---A----GT---AATT-CCGGT-CTTCCTGA--CC-T--G-CT-GGCG--A-CC-AAG---------------------------G--C--TTAA-TA--A---GGC---T-T-GC---A--GT-G--CGCACAG-AAG-TGGA---AGGAC-T--AT-CACTT-AT--ACCG----T-G--T-GT-C---CTG-A-AT-A--AGG--C-T-GC--A--GT-A-T-A-AGC-G-GT-A-G----TCCG---A-------------------------GGCTA------ACC-ATT-----A--G-------T-C-TA--CCC--A--C-TGC-CAA-TC-AC-C---C--A-AT-AATCA-A-A-TT--TT-AT---G--TGTTTCCC------TAATT--C-A-T--ATT-G-TAGTGAT-TATCAT-C-CTAGATAAGGT---TA-GGCCATA-C-TTT-TT---GTA-TA-C-A---TTGA-C-A-------GG-T---CTTC-TT-TT-GA----
gi|110539                     : GGCAGT-AGC-CGT------------A-TGTTG-GA--GTGGCTT--GCCA-CT-C----AGA-GG-C-TAACC--AG-TGAC--A-G--AGGTT-A--------GC----------CACC------------------------AA---GCAG--A----GT---AATC-C--GT-CTTCCTGA--CC-T--G-TCTGGCG--A-CC-AAG-C-TGTT--G-TGT-GCAGTGT
gi|110540                     :  GCAGT-AGT-CGT------------G-TGTTG-GA--TGGGTGT--G-CA-CT-C----AGA-GG-C-TAACC--AG-TGAT--A-G--AGGTT-A--------GC----------AACA-------------------------A---GCAG--A----GT---AATC-C--GT-CTTCCTGA--CC-T-----CTGGCG--A-CC-AAG-C-TGTT--G-TGT-GCAGTGTGT-CTGC-C--TGAA--A--A---GGC---T-T-GC---A--GT-G--TACACAT-C-G-TGGA---AGG-C-T--AT-CACTT--T--AGTG----T-G--T--T-C---CTG-A-AT-A--AGG--C-T-GC--A--GT-A-T-A-AGA-G-GT-A-G----TCCG---AG---GTT-GA--A-C-AGTAT-A-AGGCTA------ACC-A----------G-------TAC-TA--ACC--A--C-TGC-CAA-TC-AC-C---C--A-AT-CA-TA-G-A-TT--TT-AT---G--TGATTCCC------TAATT--C-A-A--ATT-A-TGGTGAT-TATCAA-C-CTAGAGA--GT---TA-GGCCATA-C-TTT-TT--GGTA-TA-T-A---TTTG-C-A-------GG-C---CTTCGTT-TT-AA----AT-CATTT----GGC-------TA-ATCA-TTTTTAG---AGGAAAA--T---TTTATATATTAT-A-TAT-ATA-----T-CAAA--------G-TCA--TC-----------CCCC-AAACC---C-TG---A-A-TT-GAC-AA-G-T-AC-AGCC
gi|110541                     :   CAGT-AGT-CGT------------G-TGTTG-GA--GTGGCTT--GCAA-CT-C----AGA-GG-C-TAGCC--AG-TGAT--A-G--AGGTT-A--------GCAGGATTTAGCCAAC------------------------CAAAGGCAG--A----GTTAAAATC-CT-GT-ATTCCTGAATCC-T--GTCTCGGCG--A-CA-AAGGC-TGTT--G-TGT-GCAGTGTGT-CT-C-C--TGAACTA--AAGAGGC---T---GC---A--G--GAATACACAT-CAGCTGGA---GGAGCCT--ATTCACTA-AAGAACTG----GAG--T-GT-C---CTGCATAT-A--AGG--C-T-GC--G--GT-A-G-AGAGC-G-GT-A-GG---TCCG---AG---GTT-GAA-C-C-AGTGTCA-AAGCTA------ACC-AGT-----AA-G-------T-A-TAT-CCC--A--C-TGTGCAA-TC-AC-CTCAC--A-AT-CATTAATGA-TT--TT-AA---G--TGATTCCCC-----TAATT--C-A-ACAATT-AATAGTGAA-TATTAAAC-CTAGATAAGGT---AA-GGCCATA-C-TTT-TTCAGGTA-TA-T-AGATTTTGCA-A-------GG-CCAACATCGTT-GTAAA----AT-CATTT-----GC-------TACATCATTTTTTAGTACGAGAGAA--T---TGT--------TAA-TAT-ATA-----T-TAAA--------G-T
gi|110542                     :   CAGT-AAT-CGT------------G-TGTTG-GA--ATGGCTT--GTCA-CT-T----AGA-GG-C-TAACC--AG-TGAT--A-G--AGGTT-A--------GC----------CGCC------------------------AA---GCAG--A----GT---AATC-C--GT-CTT
gi|110543                     :    AGT-A-T-CGT------------G-TGTTG-GA--GTGGCAT--GCCA-CT-C----AGA-GG-C-TAACC--AG-TGAC--A-G--AGGTT-A--------------------CATC------------------------AA---GCAG--A----GT---AATC-C--GT-CTTCCTGA--CC-T--GTCCTGGCG--A-CC-A-G-C-TGTT--G-TGT-ACAGTGTGT-CTG--------------------C---T-T-GC---A--GT-G--CACACAG-CAG-TGGA---AGGGT-T--AT-CACTT-AT--GCTG----T-G--T-GT-C---CTG-A-AT-A--AGG--C-T-GC--A--GT-G-T-A-AGT-G-GT-A-G----TCCG---AG---GTT-GA--C-C-AATAT-A-AGGCTA------GCC-ATT-----A--G-------T-C-TA---CC--A--C-TGT-CAA-TC-AC-C---C--A-AT-AATTA-G-A-TT--TT-AT---G--TGATTCCC------TAATT--C-A-T--ATT-G-TAGTGAT-TATCAA-C-CTAGATAAGGT---TA-GGCCATA-C-TTT-TT---GTA-TA-C-A---TTTG-C-A-------GG-C---CTTCGTT-TT-AA----AT-CATTT----TGC-------TA-ATCA-TTTTTAG---AGGAAAA--T---TGT------------TAT-ATA-----T-CAAA--------G-TCA--TC-----------CCCCAAACCC---T-TG---A-A-TT-AAC-AAGG-T-ACGAGCCC--TG-GT-AGACAC--TT-ACGT
gi|110546                     :                                         GGCCT--GCCA-CG-G----AGA-GG-C-TGACC---T-CAGT--A-GGGAGGCT-A--------GC----------CA--------------------------TA---TTAGTTA----G---------C--GT-CTGCATTG--------G-CT----G--A-AC-AGA-C-TGCT--G-TAC-TCACTGT---CCGT-CC-TTAA-TA--A---GGCAATC-T-AC---A--GT-GAGTGTGAGTGCAG-TGGGTTTAAGGC-T--AT-CACAT-AC--ACTG----T-C--C-GT-C---CTG-A-AC-AGGAGC--C-C-AC--A--GT---T-A---T-G-GT-A-A----TCCG---AG---GGC-GA--C-----------AGGCTC------GGT-ATTTATA-GTTG-------T-T-TAGGCTCGTA--T-TG----A-CT-GT-C---C--AGAT-AAATA-T-A-T------A----G--TGATT-----------ATT----A-A--ATT-------GAT-TA-CAA-C-CTAGGTAAGGT---TA-GGCGATA-C-CGT------GTA-TA-T-----TTTG-C-A-------GGCC---CTTTG------------AT-TATTA----GTC-------CA-ATAA-T---------AGG-AAA--T---CGT--------T-A-TAT-ATA-----T-
gi|110545                     :                                              --GCCA-CT-C----GGA-GG-C-TAACC--AG-TAA---A-G--AGGTT-A--------GC----------CTTC------------------------AA---G-AG--ATAATGT---AATT----GTGCTTGCGGA--G-----G-TCTGGCA--A-TC-A-G-CGTGTT--G-TGT-GCAGTGTGT-CTGCAC--TGAA-TACAA---GGC---T-T-GTCCAA--GT-G--TACACAG-CAG-TGGA---AGGGC-T--AT-CACTT-AT--ACTG----T-G--T-GT-C---CTG-A-AT-A--AG---C-T-GC-----GT-A-T-A-AGC-G-GT-A-G----TCCG---AG---GTTTGA--C-C-AGTGT-A--GGCTAC-----ACC-ATT-----A--G-------T-CCTA--CCC--AACT-TGC-CAA-TC-AC-C---C--A-AT-CATTA-G-A-TT--TT-AT---G--TGATTCC-------TAATTTTC-A-A--ATT-A-TAGTGAT-TAT-AA-C-CTAGATAAAGT---TA-GGCCATA-C-TTT-TTATGGTA-TT-T-AGT-TTTG-CCA-------GG-C---CTTCGTT-TT-AA----AT-CATTT----GGC-------TA-ATCA-TTTTTAG---AGGAAAA--T---TGT--------T-A-TAT-ATA-----T-TAAA----------TCA--TC------------CCCAAAACCCATT-TG---A-G-AT-GAC-AAGG-T--CGAGCGCTGTG-TT-AGGCGCCTTT-ACG
gi|110544                     :                                            gagtgcgc-CT-C----GGA-G--CCTAACCCAAG-TAAC--A-G--GAGTT-A--------GC----------CTTC------------------------AA---GGAT--AAT--GT---AATTTC--GT-TCTGCGGA--CT-TCAG-TCTGGCG--A-CC-AAG-C-TGTTT-G-TGT-GC-GTGTGTTCTGT-CGCTGAA-TA--A---GGC---T-T-GC------GC-T--TACACAG-CAG-TGGA---AGGGC-A--A--CACTT-AT--ACTG----T-G--T-GT-C---CTG---AT-A--AGG--C-T--C--A--GT-A-T-A-AGC-G-GT-AGG----TCCAG--AG---GTT-GAACC-C-AGTGTAA-AGGCTA------ACC-ATTTACTAG--GTATTAGTT-C-TAT-CCC--A--C-TGC-CAATTC-AC-C---C--A-ATCCATTAGT-A-TT--TTAAT---G--TGATTCCC------TAATT--A-A-A--TTT-ATTAGTGATGTATCAA---CTAGATAAGTC---TA-GG-CA-A-C-GTT-TT--GTT--TA---A---TTTG-C-A-------GG-C---C-TCGTT-TT-AA----AT-CATAT----TGC-------TA-ATCA--TTTTAG---AAGAAAA--T---T-T--------T-AGTAT-ATA-----T-TAAA--------G-T-A--TC-----------CCCCACAACC---C-TT---A-A-TT-GACAAAGG-T-ACGAG-AC--TG-GT-AGGCGC--TT-ACGT
gi|110547                     :                                                                                                                                                                   gtagtgtacttgagtgcacgccA--CT-T--G-ACTGGCG--A-CC-AAG-C-TATT--G-C-T--CAGTGT---CTAC-C--TGAA-TA--A---GGA---T-CCAC---A--AT-G--TGTTCAA-CGG-TTGA---AGGGA-T--GT-CACTT-GC--ACTG----T-G--T-GT-C---CTG-A-AT-A--ATG--C-T-GC--A--GT-A-T-A-CGC-G-TT-A-G----TCCG---AGATCGTT-GG--C-------T-G-AGACTA------GAC-AT
gi|110548                     :                                                                                                                                                                                            gC-T--G-GCTGACG--A-GC-AGG-C-TGTT--G-CTC-ATAGTGT---CTAC-C--TGAA-TA--A---GGC---TCT-AC---A--GT-G--TGAGTAG-CGG-TTGA---AGGGC-T--GT-CA
gi|110549                     :                                                                                                                                                                                                      TGACGTAA-CC-AGG-C-CGTT--GATTC-ACAGTGTGT-CTGC-C--TGAA-TA--A---TGC---T-C-AT---ACAGT-G--TGTCTAG-CGG-TTTG---AAGGC-T--GT-CACTT-GT--ACTGAGGTT-GATC-GT-C---CTG-A-AT-A--AGG--C-T-GC--A--GT-ACC-A-AGC-G-TC-A-G----CCTG---AGT--GTT-TG--T-C-AG
gi|110550                     :                                                                                                                                                                                                        cCG--G-CT-AAG-C-TGCT--G-AGT-GCAGTGTGT-CTAC-C--TGAA-TA--A---GGC---T-T-GC---A--GT-G--TGCACatctgttggtagagtggtggtcacattgccgatgtatgattagacagtttataatcatacattaaaaatcatttggttaacctctgatttttgtgtagttagatcattatatctccgtgatttgataaataattattaacctaggtagggttatagactacttttgtactatgatttgcaggcccattcttaattattgttgcattacagaaaagtagctgttctatttaccaccgtcgaaccctgtgaatttgacaaggcac
gi|110551                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                               tag-CAG-TGAA---AGGGA-T--AT-CACTT-AT--ACTA----T-G--T-AT-C---CTG-A-AT-A--AGG--C-T-GC--A--GT-A-T-A-AGC-G-GT-A-G----TCCG---AG---GTT-GA--C-C-AGTGT-A-ACGCTA------ACC-ATT-----A--G-------T-C-TA--CCC--A--C-TGC-CTA-TC-AC-C---CTGA-AT-CATTA-G-A-TT--TT-A-------TANNNNNN------NNNNN--N-N-N--NNN-N-NNNNNNN-TATTAG-T-TTA-ATATGATTCCTA-ATTCATA-G-TTA-GT--GAT--TA-TCA---CCTT-G-ATAAGGTTAG-C---CATAGTT-TT-TG----ATACATTGACCAGGCCTTCTTTTAAATCA--TTTTAG---TGGAAAATGT---TGT--------T-A-TAC-ATATATT-T-TAGA--------GATC---AC-----------CACCAAATCC---T-TG---C-A-TT-GAC-AAGG-T-ACAGACCC--TT--T-AGGCGC--TC-ACGTcgc
gi|110552                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       agGA---AGGGC-T--GT-CGCTT-GA--ACTG----T-G--T-GT-C---CTG-G-AT-A--AGG--C-T-AC--A--AC-A-C-A-AGC-G-TT-A-G----TTTA---AG---GTC-AA--C-G-AGT-T-ATGGGCTG------A-G-AGT-----G--G-------T-CATA--CGC--A--T-TGC-TA
gi|110530                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GGAC-T--AC-CGCTT-AT--ACTG----C-A----G--C---CTT-A-TT-C--AGGA-CAC-AC--A--G--A-T-A-AGC-G-AT-A-GCCCTTCCACTGAT---GTG-TA--C-C-ACTGC-A-AGCCT---------T-ATTCA---G--G-------C-A-GA--CAC--A--C-TGC-
gi|110538                     :                                                                                                                                                                                            ggcagtagtcgtgtgttggagtggtttgccactcaggggctagttagtgatagaggttagccaccaagcagagtaatccgtcttcctgacgttcctggcgaccaagctgttgtgtGGAC-T--AC-CGCTT-AT--ACTG----C-A----G--C---CTT-A-TT-C--AGG--A-C-AC--ACGGT-A-T-A-AGT-G-AT-A-G----TCCgaggttgaccagtgtaaggctaaccattagtctaccactgtcaatcacccaataattagattttatgtgattccctaattcaaaattatagtgattatcaactagataaggttaggccacactttgtggtatatacttgcaggccttcgtttaaatcatttggctatcattttagaggaaaattgttatatatattaaagtcatcccaaacccttgatattgacaaggtaacgagccctggtaaggcgcttacgt
gi|110551                     :                                                                                                                                                     ggcagtagtcgtggtgttgtgagtggcttgccacttcagaggtaaccaggtgatctagaggttacgctgatagccatcaagcaagtaattccggtcttcctgacctgctggcgaccaaggcttaataaggcttgcagtgcgcacagaagtggaaGGAC-T--AC-CGCTT-AT--ACTG----C-A----G--C---CTT-A-TT-C--AGG--A-T-ACATA--GT-A-T-A-AGT-G-AT-A------TCCgaggctaaccattagtctacccactgccaatcacccaataatcaaattttatgtgtttccctaattcatattgtagtgattatcatcctagataaggttaggccatactttttgtatacattgacaggtcttcttttga
gi|110548                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     agcagtgaaagGGC-T--GT-TGCTC-AT--A--G----T-G--T-CTAC---CTG-A-AT-A--AGGCTC-T-AC--A--GT-G-T-G-AGT-A-GC-G-G----TTGA---AG---Ggaggttgaccagtgtaacgctaaccattagtctacccactgcctatcaccctgaatcattagattttatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattagtttaatatgattcctaattcatagttagtgattatcaccttgataaggttagccatagtttttgatacattgaccaggccttcttttaaatcattttagtggaaaatgttgttatacatatattttagagatcaccaccaaatccttgcattgacaaggtacagaccctttaggcgctcacgt
gi|110550                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ctggctgacgagcaG----T-G--T-GT-CTACCTG-A-AT-A--AGG--CTT-GC--A--GT-G-T-gctgtca
gi|110549                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tagcggctaagctgctgagtgca-AT-CATTA-T-A-TC--TC--C---G--TGATT---------TGAT-----A-A--AT--------AAT-TATTAA-C-CTAGGTAGGGTTA-TA-GAC--TA-C-TTT-T----GTACTA-TGA---TTTG-C-A-------GG-C---C--CATT-CT-TA----AT-TATT------GT-------TG---CA----TTAC---AGAAAAG--TAGCTGT--------T-C-TAT---------T-TA-------------CC--AC-----------CGTCGAACCC---TGTG---A-ATTT-GAC-AAGG-C-ACgcaccgc
gi|110553                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ctgacgtaaccaggccgttgattcacagtgtgtctgcctgaataatgctcatacagtgtgtctagcggtttgaaggctgtcacttgtactgaggttgatcgtcctgaataaggctgcagtaccaagcgtcagcctgagtgtttgtcagatctgttggtagagtggtggtcacattgccgatgtatgattagacagtttataatcatacattaaaaatcatttggttaacctctgatttttgtgtagttagGTGAT-TAT-AA-C-CTAGGTAAGGT---TA-GGCGATA-C-CT-------GTA-CA-T-----TTTG-GCA-------GG-C---C----CT-TT-GA----AT-TATTA----GTC-------CA-ATCA------AT---AGG-AAA--T---CAT--------T-A-TAT-ATA-----TATAAACCGAGTTTG-TTAGTACATTTTAGTTCATCCCAAACCC---T-GG---A-A-TT-GAC-CAGG-T-ACGATCCT--CG-GT-AG
gi|110554                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AT-TATCAA-C-CTAGATAAGGT---TA-CGCCATA-C-TAT-TT--GGTA-TA-T-A---ATTG-C-A-------GG-C---CTTCGTT-TT-AA----AT-CATTT----GGC-------TA-ATGA-TTTTTAG---AGGAAAA--T---TGTTA------T-A-TAT-ATA-----T-TAAA--------G-TCA--TC-----------CCCCAAACCC---T-TG---A-A-CT-GAC-AAGGTT-ACGAGCCC--TG-GT-AGAAGC--TT-ACGT
gi|110555                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TAGATGAGGT---TA-GGCCATA-C-TTT-TT--GGTA-TA-T-A---TTTG-
gi|110556                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTGTT-TT-CA----AT-CATTT------------------TTT-TTTTTGG---AGAAAAA--C---TGT----------------------------------------------C-----------CCCCAAACTC---T-T----A-A-TT-GAT-AGGG-T-ACGAGCCC--TG-GT-AGACGC--TT-ACGT
gi|110557                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tatatcatattgtagtgT-CATTT----TGC-------TA-ATCA-TTTTTAG---A---------------------------------A-----T-TAAA--------G-TCA--TC-----------CCCCAAACCC---T-TG---A-A-AT-GAC-AAGG-T-ACGAGCCC--TG-GT-AGGCGC--TT-ACGT
gi|110558                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         A-ATCA-TTTTGCG---AGGAAAA--T---TGT------------TAT-ATA-----T-TAAA--------G-TCA--TC-----------CCCCAAACCC---T-TGGAAA-A-TTCGAC-AAGGTT-ACGAGCCC--TGCGT-AGGCGC--TTGACGT
gi|110559                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 --T---TGT--------C-A-TAA-AGT-----T-GAGA--------G-TCA--TC-----------CCCCAAATCA---T-TG---A-A-TT-GAC-AAGG-T-ACGAGCCC--TG-TT-AGGCGC--TC-ACGT
gi|110560                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -----T-TAAA--------G-TCA--TC-----------CCCCAACCCC---T-TG---A-A-TT-GAC-AAGG-T-ACGAGCCC--TG-GT-AGGCGC--TT-ACGT
gi|110561                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AACCC---T-TG---A-A-TT-GAC-AAGG-T-ACGAGCCC--TG-GT-AGGCGC--TT-ACAT
gi|110562                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -A-TT-GAC-AAGG-T-ACGAGCCC--TG-GT-AGGCGC--T
gi|110563                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -TT-GAC-AAGG-T-ACGAGCCC--TG-GT-AGGCGC--TT-ACGT

lowQualScore                  :                                                                                111111111111                                                                               111111111111          222222222222222222222222                                                                                                                                                                                                                                                                                          11111111111                                         11                                                                       11111111111                                                                                                    111111111111111                                   1111111111111                                                                                                                   
lowQualScore                  :                                                                        2   2   222222222222 2     2 2   2 2   4 33    2  2 4444     2      88  33  555 2      2 88888888  111111111111   2  33  111111111111111111111111   7777  333    55555  2        55   22 0 1 1   1 22 1  1  1 1 1    44 1   1         2   2 2 22    2  666    333 44 2  333   2 55   2   1   2    333    1  66 1      2 22     4444 2 22 2      2 2  2 22     2     4 2 4 2   4 2  2 2 2   2   555   2 2 22 2 2     2 2 2     888888   2   88888888888   2 4  4    33 2  22    2 2  2 444 66   00    777777  55   2 444 33     2   999999     33 2 55   2 4  2      2   00000000000 2   4           333  66       2 2   2  888   1  1 88888 1   6666  6666  333 0     2  2  4444  2    333333333333333  2 2   55      333   4   55 333   3333333333333 1   1   3333 1   4444  1 777777777    77777777     1     22 1  333 1 1  1   1    3 1          3 1 1      22  2    
lowQualScore                  :                                                                        .   .   ............ .     . .   . .   . ..    .  . ....     .      ..  ..  ... .      . ........  ............   .  ..  ........................   ....  ...    .....  .        ..   .. . . .   . .. .  .  . . .    .. .   .         .   . . ..    .  ...    ... .. .  ...   . ..   .   .   .    ...    .  .. .      . ..     .... . .. .      . .  . ..     .     . . . .   . .  . . .   .   ...   . . .. . .     . . .     ......   .   ...........   . .  .    .. .  ..    . .  . ... ..   ..    ......  ..   . ... ..     .   ......     .. . ..   . .  .      .   ........... .   .           ...  ..       . .   .  ...   .  . ..... .   ....  ....  ... .     .  .  ....  .    ...............  . .   ..      ...   .   .. ...   ............. .   .   .... .   ....  . .........    ........     .     .. .  ... . .  .   .    . .          . . .      ..  .    
lowQualScore                  :                                                                        7   5   888888888888 5     4 4   2 2   4 11    2  2 7777     2      33  88  000 2      2 11111111  777777777777   2  11  444444444444444444444444   8888  999    66666  2        33   99 3 9 9   9 66 9  9  9 9 9    55 9   9         0   0 0 88    0  222    555 88 0  555   0 55   0   5   0    333    9  44 9      0 88     2222 0 88 0      0 0  0 88     0     0 0 0 0   0 0  0 0 0   0   555   0 0 88 0 1     2 2 2     666666   2   22222222222   4 7  7    22 4  55    5 5  5 444 99   66    222222  66   4 111 22     4   111111     22 2 33   2 4  2      1   00000000000 1   2           555  88       0 0   0  888   9  9 11111 9   3333  2222  555 5     1  1  5555  1    888888888888888  0 0   22      555   5   22 333   0000000000000 9   9   9999 8   0000  9 666666666    22222222     9     66 9  333 8 7  7   7    5 7          8 9 9      88  1    
consensus                     :                                                                  GGCAGT-AGT-CGT------------G-TGTTG-G-AGT-G-GCT-T--GCCA-CT-C----AGAGG-CTAACC--AG-TGAT--A-GAGGTT-A--------GC---------C--ACC-AA--GC------------------------AGA----GT---AATC--C--GT-CTTCCTGA--CCT--GTC-T-GGC-G--A-CC-AA-G-C-TGTT--G-TGT-GCAGTGTGT-CTG-C-C--TGAA-TA---AGGC---T--T-GC---AGT-G--TAC-ACAGCAG-TGGA---AGGG-CT--A-TCACTT-A--TACTG----T-G--T-GTCCTG-A-AT-A--AGGCT-GCAGT-A-T-A-AGC-G-GT-A-G-TCC-GAG---GTT-G-A--C-C-AGTGT-A-A-GGCTA------ACC-ATT-----------AGT-C-TA-CCCA--C-TGC-CAAT-C-AC-C---C--AATC-ATTA--G-A-TT--TTA-T---G--TGATT-CCC------TAATT--C-A--AAT-T-AT-AGTGAT-TAT-----------C-AAC-CTAGATAAGGT---TA--GGCCATA-C-TTT-TT--GGTA-TA-T-A---T-TTG--C-AG----GC---CTTCGTT-TT-AA----AT-CATTT----GGC-------TA-A-TCA-TTTTTAG---AGGAAAA--T---TGT--------T----A-TAT-ATA----T-TAA----AG-T---------CATC--------CCCCA-AACCC--T-TG---A-A-TT-GAC-AAGG-T-ACGAGCCCTG-G-T-AGGCGC--TT-ACGT
Reference ( family-568 )      :                                                                  GGCAGT-AGT-CGT------------G-TGTTG-G-AGT-G-GCT-T--GCCA-CT-C----AGAGG-CTAACC--AG-CGAT--A-GAGGTT-A--------GC---------C--ACC-AA--GC------------------------AGA----GT---AATC--C--GT-CTTCCTGA--CCT--GTC-T-GGC-G--A-CC-AA-G-C-TGTT--G-TGT-GCAGTGTGT-CTG-C-C--TGAA-TA---AGGC---T--T-GC---AGT-G--TAC-ACAGCAG-TGGA---AGGG-CT--A-TCACTT-A--TACTG----T-G--T-GTCCTG-A-AT-A--AGGCT-GCAGT-A-T-A-AGC-G-GT-A-G-TCC-GAG---GTT-G-A--C-C-AGTGT-A-A-GGCTA------ACC-ATT-----------AGT-C-TA-CCCA--C-TGC-CAAT-C-AC-C---C--AATC-ATTA--G-A-TT--TTA-T---G--TGATT-CCC------TAATT--C-A--AAT-T-AT-AGTGAT-TAT-----------C-AAC-CTAGATAAGGT---TA--GGCCATA-C-TTT-TT--GGTA-TA-T-A---T-TTG--C-AG----GC---CTTCGTT-TT-AA----AT-CATTT----GGC-------TA-A-TCA-TTTTTAG---AGGAAAA--T---TGT--------T----A-TAT-ATA----T-TAA----AG-T---------CATC--------CCCCA-AACCC--T-TG---A-A-TT-GAC-AAGG-T-ACGAGCCCTG-G-T-AGGCGC--TT-ACGT
gi|110529                     :                                                                  GGCAGT-AGT-CGT------------G-TGTTG-G-ATT-G-GCT-T--GTCA-CT-C----AGAG--CTAGCC--AG-CGAT--A-GAGGTT-A--------GC---------C--ACC-TA--GC------------------------AGA----GT---AATC--C--GT-CTTCCTTA--CCT--GCT-T-GAC-G--A-CC-AA-G-C-TGTT--G-TGT-GCAGTGTGT-CTG-T-C--TGAA-TA---AGGC---T--T-GT---AGT-G--TAC-ACATCAG-TGGA---AGGG-CT--A-TCACTT-A--TACTG----T-G--T-GTCCTG-A-AT-A--AGGCT-GCAGT-A-T-A-AGC-G-GT-A-G-TCC-AAG---GTT-G-A--C-C-AGTGT-A-A-GGCTA------ACC-ATT-----------GGT-C-TA-CCCA--C-TGC-CAAT-C-AC-C---C--AATC-ACTA--T-A-TT--TTA-T---G--TGATT-CCC------TAATT--C-A--AAT-T-AT-AGTGAT-TAT-----------C-AAC-CTAGATAAGGT---TA--GGCCATA-C-TTT-TT--GGTA-TA-T-A---T-TTG--G-AG----GC---CTTTGTT-TT-AA----AT-CATTT----GGC-------TA-A-TCA-TTTTTAG---AGGAAAA--T---TGT--------T----A-TAT-ATA----T-TAA----AG-T---------CAAC--------TCCCA-AAACC--T-TG---A-A-TT-GAC-AAGG-T-ACGAGCCCTG-A-C-AGGCGC--TT-ACGT
gi|110530                     :                                                                  GGCAGT-AGT-CGT------------G-TGTTG-G-AGT-G-GTT-T--GCCA-CT-C----AGGGG-CTAGTT--AG-TGAT--A-GAGGTT-A--------GC---------C--ACC-AA--GC------------------------AGA----GT---AATC--C--GT-CTTCCTGA--CGT--TCC-T-GGC-G--A-CC-AA-G-C-TGTT--G-TGT-GCAGTGTGT-CTG-C-C--TGAA-TA---AGGC---T--T-GC---AGTGG--TAC-ACATCAG-TGGA---AGGG-CT--A-TCGCTT-A--T-CTG----T-G--T-GTCCTG-A-AT-A--AGGCT-GCAGT-A-T-A-AGC-G-GT-A-G-TCC-GAG---GTT-G-A--C-C-AGTGT-A-A-GGCTA------ACC-ATT-----------AGT-C-TA--CCA--C-TGT-CAAT-C-AC-C---C--AATA-ATTA--G-A-TT--TTA-T---G--TGATT-CCC------TAATT--CAA--AAT-T-AT-AGTGAT-TAT-----------C-AA--CTAGATAAGGT---TA--GGCCACA-C-TTT-GT--GGTA-TA-T-A---C-TTG--C-AG----GC---CTTCG-T-TT-AA----AT-CATTT----GGC-------T--A-TCA--TTTTAG---AGGAAAA--T---TGT--------T----A-TAT-ATA----T-TAA----AG-T---------CAT----------CCCA-AACCC--T-TG---ATA-TT-GAC-AAGG-TAACGAGCCCTG-G-TAAGGCGC--TT-ACGT
gi|110531                     :                                                                  GACAGT-AGT-CGT------------G-TGTTG-A-AGT-G-GCA-T--GCCA-CT-C----AGAGG-CTAACC--AG-TGAC----GAGGTT-A--------AC------------ATC-AA--GC------------------------AGA----GT---AATC--C--AT-CTTCCTGA--CCT--GTC-T-GGC-G--A-CC-AA-G-C-TGTT--G-TGT-ACAGTGTGT-CTG-C-C--TGAA-TA---AGGC---T--T-GC---AGT-G--TAC-ACAGCAG-TGGA---AGGG-CT--G-TCACTTAA--CACTG----T-G--T-GTCCTG-A-AT-A--AGGCT-GCAGT-G-T-A-AGC-GTAT-A-G-TCC-GA----GTT-G-A--C-C-AATAT-A-A-GGCT-------ACC-ATT-----------AGT-C-TA-CCCA--C-TG--CAAT-C-AC-C---C--AATA-ATTA--G-ATTT--TTA-T---G--TGATT-CCCAGACCTTAATT--C-A--TAT-T-GT-AGTGAT-TAT-----------C-AAC-CTAGATAAGGT---TA--GGCCATA-C-TTT-TT---GTA-TA-C-A---T-TTG--C-AG---------CTTTGTT-TT-CA----AT-CATTT----TGG-------TA-A-TCA-TTTTTAG---AGG-AAA--T---TGT--------T----A-TAT--T-----T-CCA----AG-T---------CATC--------CCCCA-AACCC--T-TG-----A-TT-GAC-AA-G-T-ACGAGCCCTG-G-T-CGGCGC--TT-ACGT
gi|110532                     :                                                                  GGCAGT-AGT-CGT------------T-TGTTG-G-AGT-G-GCT-T--GCCA-CT-C----AGAGG-CTAGCC--AG-CGAT--A-TAGGTT-G--------GC---------A--ACC-AA--GC------------------------AGA----GT---AATC--C--GT-CTTCCTGA--CCT--GTC-T-GGC-G--A--C-AA-G-C-TGTT--G-TGT-GCAGTGTGT-CTG-C-C--TG-A-TA---AGGC---T--T-GC---AGT-G--CAC-ACATCAG-TGGA---CGGG-CTA-A-TCACTT-A--TACTG----T-A--T-GTCCTG-A-AT-A--AGGCT-GCAGTAA-TGA-AGCGG-GTAA-G-TCC-G-G---GTT-G-A--CTC-AGTGT-A-A-GG-TA------ACCAATTG----------AGT-C-TA-CCCA--G-CGA-CAAT-C-ACTC---C--AAT--ATTA----A-TTTATTA-T---GGTTGATT-CCC------T-ATT--C-A--AAT-T-AA-AGTTAT-TAT-----------C-AACGCTAGATAAGGT---TAT-GCCCATA-C-AGT-TT--GGTA-TA-T-A---T-TTG--C-AA----GC---CTTCGTT-TT-A----------------------------A-A-TCA-TTTTTAG---AGGAAAA--T---TGT--------T----A-TAT-ATA----T-TAA----AG-T---------CATC--------CCCCA-AACCC--T-TG---A-A-TG-GAC-AAGG-T-ACGAGCCCTG-G-T-AGGCGC--TT-ACGT
gi|110533                     :                                                                  GGCAGT-AGT-CGT------------T-TGTTG-G-AGTCG-GCT-T--GCCAACT-C----AGAGGGCTAGCCT-AG-CGAT--ATGAGGTT-G--------GC---------A--ACCGAA--GC------------------------AGA----GT---AATC--C--GT-CTTCCCGA--CCT--GTC---GGC-G--A-GC-AA-GCC-TGTT--G-TGT-GC-GTGTGT-C-G-C-C--TGGA-TA---AGGC---T--T-GC---AGT-G--CAC-ACATCAG-TGG----AGGG-CTA-A-TCAC-T-A--TACTG----T-A--T-GTCCTG-A-ATGA--AGGCTGGCAGTAA-TGA-AGCGG-GT-A-G-TC----G---GGT-G-A--C-C-AGTGT-A-A-GGCTA------ACC-ATTG----------AGT-C-TA-CCCA--G-CGA-CAAT-CAAC-T---C--AAT--ATTA--A----T--TTA-TTTGG--TGATT-CCCG-----TATGT--C-A--AAT-TAAT-AGTTAT-TAT-----------C-AACGCTAGATAAGGT---TAT-GCCCATA-C-AGT-TT--GGTA-TA-T-A---A-TTG--CAAA----GC---CTTCGTTGTT-AAAAATAT-CATTT-----------------------TTTGTAG---AGG-AAA--T---TGT--------T----A-TATAATA----T-TAA----AG-T---------CATC--------CCCC--AACCC--T-TG---A-A-TG-GAC-AA-G-T-AC-AGCCCTG-G-T-A-GCGC--TT-ACGT
gi|110534                     :                                                                  GGCAGT-AGT-CGT------------G-TGTTG-G-AGT-G-GTT-TTGGCCA-TC-C----AGAG--CTAGCC--AG-CGAT--A-GAGGTTTA--------GC------------AC--AA--GC------------------------A-A----GT---AATC--C--GT-CTTC-TGAT-CCT--GTA-T-GGC-G--A-C--AA-G-C-TGTTTGG-TGT-GCAGTGTGT-CTG-C-C--TGAA-TA---AGGC---T--T-GC---CGT-G--TAC-ACA-CAG-TGGA---AGGG--T--A-TCA-TT-A--TACTG----T-G--T-GTCCTG-A-AT-A--AGGCT-GCAGT-G-T-A--GC-G-GT-A-G-TCC-GAG----TT-G-T--A-C-AGTGT-A-A-GGCTA------ACC-ATT-----------AGT-C-TA-CC-A--C-TGC-CAAT-C-AC-C---A--AATC-ATTA--G-C-TT--TTA-T---G--TGATT-CCT--------ATT--C-A--AAT-T-AT-AGTGAT-TAT-----------C-AAC-CTAGATAAGGT---TA--GGCAATAGCGTTTATG--GGTA-TA-T-A---T-TTG----AG----GC---CTTCGTT-TT-GA----AT-CATTT----GGC-------TA-A-TCA--TTTTAG---AGG-AAA--T---TGT--------T----A-TAT-ATC----T-T-A----AG-T---------CAT---------CCCCA-AA-CC--T-TG---A-A-TT-GAC-AAGG-T-A-GAGCCCTG-G-T-AGGCGC--TT-ACGT
gi|110535                     :                                                                  GGCAGT-AGTTCGTTATCGAATAAAGG-TGTTG-GGAGT-C-GCCAT--GCCA-CT-C----A-AGG-CTAACC--AG-TGA---A-GAGGGT-A--------GC---------C--ACC-AA--GC------------------------AGA----GT---AATC--G--GT-CTTCCTGA--CCT--GTC-T-GGT-G--AGCC-AA-G-C-TGTT--G-TGTTGCAGTGTGT-CTG-C-C--T-AA-TA---AGGC---G--G-GC---AAT-G--TAC-ACAGCAG-TGGA---AGGG-GTGTA-TCATTT-A--TACTG----T-G--TTGTCCTG-A-AT-A--AGGCT-GCAGT-A-T-A-AGC-G-GT-A-G-TCC-GAG---GTT-G-A--C-C-ATTAT-A-C-GGCTACATGTAACC-ATT-----------AGT-C-TA-CCCA--C-TGA-CAAT-C-AC-C---C--AATA-ATTA--A-A-GT--TTA-C---G--TGATT-CAC------TAATT--C-A--TAT-T-GT-AGTGAT-TAT-----------C-AAC-CTAGATAAGGT---AG--GGCCATA-C--AT-TT--AGTA-TG-T-A---T-TTG--C-AG----GC---CTT
gi|110536                     :                                                                  GGCAGT-AGT-CGT------------G-TGTTG-G-ATT-G-GCT-T--GCCA-CT-CCTGAAGACG-CTAGCA--AG-CGAT--A-GAGGTT-A--------GC---------C--ACC-AA--GT------------------------AGA----AT---AATC--C--GT-CTTCCTGA--CCT--GTC-T-GGC-G--A-CC-AA-G-C-TGTT--G-TGT-GCAGTGTGT-CTG-C-C--TAAA-TA---AGGT---T--T-GC---AGT-G--TAC-ACATCAG-TGGA---AGGA-TT--A-TCACTT-A--TACAG----T-G--T-GTCCTG-G-AT-A--AGGCT-GCAGT-A-T-A-AGC-G-TT-A-G-TCC-GAG---GTT-G-A--C-C-AGTGT-A-A-GGCTA------ACC-ATT-----------AGT-C-TA-CCCA--T-TGC-CAAT-C-AC-T---C------------------T--TTA-T---G--TGATT-CCC------TAATT--C-A--AAT-T-AT-AGT
gi|110537                     :                                                                  GGCAGTTAGT-CGT------------G-TGTTG-G-AGT-G-GCT-A--GCCA-CT-C----AGAGA-CTAACT--GG-TGAC--A-GAGGTT-A--------GC---------C--ACC-AN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAGA----GT---AATC--T--GT-CTTC-TGC--AGT--GTC-T-GGC-G--A-CCCAA-G-C-TGTT--G-TGT-GCAGTGTGT---G-C-C--TGAA-TA---AGGC---T--T-GC---AGT-G--TAC-A-AGCAG-TGAA---AGGG-AT--A-TCACTT-A--TACTA------G--T-ATC-TG-A--T-A--AG-CT-GCAGT-A-T-A-AGC-G-GT-A-T-TCC-GA----GTT-G-A--C-CAAGTGT-A-A-CGCTA------ACC-ATT-----------AGT-C-TA-CCCA--CTTGC-CTAT-C-AC-C---CTGAATCTATTA--A----T--TTA-T---A--TGATT-CCC------TAATT--C-AT-AGT-T--T-A-TGAT-TCT-----------C-AAC-CTTGATAAGGT---TA--CGCCATA-G-TTT-T-----TA-TAGC-A---T-GTGA-C-AG----GC---CTTC-TT-TT-A----------------------------A-A-TCA-TTTTTAG---TGGAAAATGT---TGT--------TATACA-TAT-ATA----T-TTA----AG------------ATC--------AACCA-AATCC--T-TG---C-A-TT-G---AAAG-T-AC--GCCTT----T-AGGCGC--TC-ACGT
gi|110538                     :                                                                  GGCAGT-AGT-CGT------------GGTGTTGTG-AGT-G-GCT-T--GCCA-CTTC----AGAGG--TAACC--AGGTGATCTA-GAGGTT-ACGCTGATAGC---------C--ATC-AA--GC------------------------A-A----GT---AATT--CCGGT-CTTCCTGA--CCT--G-C-T-GGC-G--A-CC-AA-G---------------------------G-C-T--T-AA-TA---AGGC---T--T-GC---AGT-G--CGC-ACAGAAG-TGGA---AGGA-CT--A-TCACTT-A--TACCG----T-G--T-GTCCTG-A-AT-A--AGGCT-GCAGT-A-T-A-AGC-G-GT-A-G-TCC-G--------------------------A-GGCTA------ACC-ATT-----------AGT-C-TA-CCCA--C-TGC-CAAT-C-AC-C---C--AATA-ATCA--A-A-TT--TTA-T---G--TGTTT-CCC------TAATT--C-A--TAT-T-GT-AGTGAT-TAT-----------C-ATC-CTAGATAAGGT---TA--GGCCATA-C-TTT-TT---GTA-TA-C-A---T-TGA--C-AG----GT---CTTC-TT-TT-GA----
gi|110539                     :                                                                  GGCAGT-AGC-CGT------------A-TGTTG-G-AGT-G-GCT-T--GCCA-CT-C----AGAGG-CTAACC--AG-TGAC--A-GAGGTT-A--------GC---------C--ACC-AA--GC------------------------AGA----GT---AATC--C--GT-CTTCCTGA--CCT--GTC-T-GGC-G--A-CC-AA-G-C-TGTT--G-TGT-GCAGTGT
gi|110540                     :                                                                   GCAGT-AGT-CGT------------G-TGTTG-G-A-T-G-GGTGT--GC-A-CT-C----AGAGG-CTAACC--AG-TGAT--A-GAGGTT-A--------GC---------A--AC--AA--GC------------------------AGA----GT---AATC--C--GT-CTTCCTGA--CCT----C-T-GGC-G--A-CC-AA-G-C-TGTT--G-TGT-GCAGTGTGT-CTG-C-C--TGAA--A---AGGC---T--T-GC---AGT-G--TAC-ACATC-G-TGGA---AGG--CT--A-TCACTT----TAGTG----T-G--T--TCCTG-A-AT-A--AGGCT-GCAGT-A-T-A-AGA-G-GT-A-G-TCC-GAG---GTT-G-A--A-C-AGTAT-A-A-GGCTA------ACC-AGT-----------A---C-TA-ACCA--C-TGC-CAAT-C-AC-C---C--AATC-AT-A--G-A-TT--TTA-T---G--TGATT-CCC------TAATT--C-A--AAT-T-AT-GGTGAT-TAT-----------C-AAC-CTAGAGA--GT---TA--GGCCATA-C-TTT-TT--GGTA-TA-T-A---T-TTG--C-AG----GC---CTTCGTT-TT-AA----AT-CATTT----GGC-------TA-A-TCA-TTTTTAG---AGGAAAA--T---TTTATATATTAT----A-TAT-ATA----T-CAA----AG-T---------CATC--------CCCCA-AACCC----TG---A-A-TT-GAC-AA-G-T-AC-AGCC
gi|110541                     :                                                                    CAGT-AGT-CGT------------G-TGTTG-G-AGT-G-GCT-T--GCAA-CT-C----AGAGG-CTAGCC--AG-TGAT--A-GAGGTT-A--------GCAGGATTTAGCCAACC-AAAGGC------------------------AGA----GTTAAAATC--CT-GT-ATTCCTGAATCCT--GTC-TCGGC-G--A-CA-AAGG-C-TGTT--G-TGT-GCAGTGTGT-CT--C-C--TGAACTAAAGAGGC------T-GC---AG--GAATAC-ACATCAGCTGGA---GGAGCCT--ATTCACTA-AAGAACTG----GAG--T-GTCCTGCATAT-A--AGGCT-GCGGT-A-G-AGAGC-G-GT-AGG-TCC-GAG---GTT-GAA--C-C-AGTGTCA-A-AGCTA------ACC-AGTA----------AGT-A-TATCCCA--C-TGTGCAAT-C-AC-CTCAC--AATC-ATTAATG-A-TT--TTA-A---G--TGATTCCCC------TAATT--C-AACAAT-TAAT-AGTGAA-TAT-----------TAAAC-CTAGATAAGGT---AA--GGCCATA-C-TTT-TTCAGGTA-TA-T-AGATT-TTG--CAAG----GCCAACATCGTT-GTAAA----AT-CATTT-----GC-------TACA-TCATTTTTTAGTACGAGAGAA--T---TGT--------TA---A-TAT-ATA----T-TAA----AG-T---------
gi|110542                     :                                                                    CAGT-AAT-CGT------------G-TGTTG-G-AAT-G-GCT-T--GTCA-CT-T----AGAGG-CTAACC--AG-TGAT--A-GAGGTT-A--------GC---------C--GCC-AA--GC------------------------AGA----GT---AATC--C--GT-CTT
gi|110543                     :                                                                     AGT-A-T-CGT------------G-TGTTG-G-AGT-G-GCA-T--GCCA-CT-C----AGAGG-CTAACC--AG-TGAC--A-GAGGTT-A-------------------C--ATC-AA--GC------------------------AGA----GT---AATC--C--GT-CTTCCTGA--CCT--GTCCT-GGC-G--A-CC-A--G-C-TGTT--G-TGT-ACAGTGTGT-CTG-C---------------------T--T-GC---AGT-G--CAC-ACAGCAG-TGGA---AGGG-TT--A-TCACTT-A--TGCTG----T-G--T-GTCCTG-A-AT-A--AGGCT-GCAGT-G-T-A-AGT-G-GT-A-G-TCC-GAG---GTT-G-A--C-C-AATAT-A-A-GGCTA------GCC-ATT-----------AGT-C-TA--CCA--C-TGT-CAAT-C-AC-C---C--AATA-ATTA--G-A-TT--TTA-T---G--TGATT-CCC------TAATT--C-A--TAT-T-GT-AGTGAT-TAT-----------C-AAC-CTAGATAAGGT---TA--GGCCATA-C-TTT-TT---GTA-TA-C-A---T-TTG--C-AG----GC---CTTCGTT-TT-AA----AT-CATTT----TGC-------TA-A-TCA-TTTTTAG---AGGAAAA--T---TGT---------------TAT-ATA----T-CAA----AG-T---------CATC--------CCCCA-AACCC--T-TG---A-A-TT-AAC-AAGG-T-ACGAGCCCTG-G-T-AGACAC--TT-ACGT
gi|110544                     :                                                                          GT-AGT------------G-TACTT-G-AGT-G--CA-C--GCC--CT-C----GGAGC-CTAACCCAAG-TAAC--A-GGAGTT-A--------GC---------C--TTC-AA--GG------------------------ATAAT--GT---AATTT-C--GT-TCTGCGGA--CTTCAGTC-T-GGC-G--A-CC-AA-G-C-TGTTT-G-TGT-GC-GTGTGTTCTG-T-CGCTGAA-TA---AGGC---T--T-GC----GC-T--TAC-ACAGCAG-TGGA---AGGG-CA--A--CACTT-A--TACTG----T-G--T-GTCCTG-A--T-A--AGGCT--CAGT-A-T-A-AGC-G-GT-A-GGTCCAGAG---GTT-G-AACC-C-AGTGT-A-AAGGCTA------ACC-ATTTACTAGGTATTAGTTC-TATCCCA--C-TGC-CAATTC-AC-C---C--AATCCATTA--GTA-TT--TTAAT---G--TGATT-CCC------TAATT--A-A--ATT-T-ATTAGTGATGTAT-----------C-AAC--TAGATAAGTC---TA--GGC-A-A-C-GTT-TT--GTT--TA---A---T-TTG--C-AG----GC---CT-CGTT-TT-AA----AT-CATAT----TGC-------TA-A-TCA-TTTT-AG---AAGAAAA--T---T-T--------T----AGTAT-ATA----T-TAA----AG-T----------ATC--------CCCCACAACCC--T-T----A-A-TT-GACAAAGG-T-ACGAG-ACTG-G-T-AGGCGC--TT-ACGT
gi|110545                     :                                                                                                   -G-AGT-GCGC-----GCCA-CT-C----GGAGG-CTAACC--AG-TAA---A-GAGGTT-A--------GC---------C--TTC-AA--G-------------------------AGATAATGT---AATT-----GTGCTTGCGGA--G----GTC-T-GGC-A--A-TC-A--G-CGTGTT--G-TGT-GCAGTGTGT-CTG-CAC--TGAA-TACA-AGGC---T--T-GTCCAAGT-G--TAC-ACAGCAG-TGGA---AGGG-CT--A-TCACTT-A--TACTG----T-G--T-GTCCTG-A-AT-A--AG-CT-GC-GT-A-T-A-AGC-G-GT-A-G-TCC-GAG---GTTTG-A--C-C-AGTGT-A---GGCTAC-----ACC-ATT-----------AGT-CCTA-CCCAACT-TGC-CAAT-C-AC-C---C--AATC-ATTA--G-A-TT--TTA-T---G--TGATT-CC-------TAATTTTC-A--AAT-T-AT-AGTGAT-TAT-------------AAC-CTAGATAAAGT---TA--GGCCATA-C-TTT-TTATGGTA-TT-T-AGT-T-TTG--CCAG----GC---CTTCGTT-TT-AA----AT-CATTT----GGC-------TA-A-TCA-TTTTTAG---AGGAAAA--T---TGT--------T----A-TAT-ATA----T-TAA----A--T---------CATC--------CCCAA-AACCCATT-TG---A-G-AT-GAC-AAGG-T--CGAGCGCTGTGTT-AGGCGCCTTT-ACG
gi|110546                     :                                                                                                         -G-GCC-T--GCCA-CG-G----AGAGG-CTGACCTCAG-T-AG--G-GAGGCT-A--------GC---------C--AT----------------------------------A----TT---AGTTAGC--GT-CTGCAT-------------T-GGCTG--A-AC-AG-A-C-TGCT--G-TAC-TCACTGT---CCGTC-C--TTAA-TA---AGGCAATC--T-AC---AGT-GAGTGTGAGTGCAG-TGGGTTTAAGG-CT--A-TCACAT-A--CACTG----T-C--C-GTCCTG-A-AC-AGGAGCCC-ACAGT---T-A---T-G-GT-A-A-TCC-GAG---GGC-G-A--C-
gi|110546                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -A--AATAT-AT-AGTGAT-TATTAAATTGATTAC-AAC-CTAGGTAAGGT---TA--GGCGATA-C-CGT------GTA-TA-T-----T-TTG--C-AG----GC---CCT--TT-----G----AT-TATTA----GTC-------CA-A-TAA-T---------AGG-AAA--T---CGT--------T----A-TAT-ATA----T-aggctcggtatttatagttgtttaggctcgtattgactgtccagataaatatatagtgattattaaattgattacaacctaggtaaggttaggcgataccgtgtatattttgcaggccctttgattattagtccaataataggaaatcgttatatatat
gi|110547                     : ggcctgccacggagaggctgacctcagtagggaggctagccatattagttagcgtctgcattggctgaacagactgctgtactcactgtccgtccttaataaggcaatctacagtgagtgtgagtgcagtgggtttaaggctatcacatacactgtccgtcctgaacaggagcccacagttatggtaatccgagggcgacaggctcggtatttatagttgtttaggctcgtattgactgtccagatGA--CTT--GAC-T-GGC-G--A-CC-AA-G-C-TATT--G-C-T--CAGTGT---CTA-C-C--TGAA-TA---AGGA---T--CCAC---AAT-G--TGT-TCAACGG-TTGA---AGGG-AT--G-TCACTT-G--CACTG----T-G--T-GTCCTG-A-AT-A--ATGCT-GCAGT-A-T-A-CGC-G-TT-A-G-TCC-GAGATCGTT-G-G--C-------T-G-A-GACTA------GAC-AT
gi|110548                     :                                                                                                                                                                                                                                                            CT--GGC-T-GAC-G--A-GC-AG-G-C-TGTT--G-CTC-ATAGTGT---CTA-C-C--TGAA-TA---AGGC---TC-T-AC---AGT-G--TGA-GTAGCGG-TTGA---AGGG-CT--G-TCA
gi|110549                     :                                                                                                                                                                                                                                                                  C-T-GAC-GTAA-CC-AG-G-C-CGTT--GATTC-ACAGTGTGT-CTG-C-C--TGAA-TA---ATGC---TCAT-AC---AGT-G--TGT-CTAGCGG-TTTG---AAGG-CT--G-TCACTT-G--TACTGAGGTT-GATC-GTCCTG-A-AT-A--AGGCT-GCAGT-ACC-A-AGC-G-TC-A-G-CCT-GAGT--GTT-T-G--T-C-AG
gi|110549                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTA--G-A-TCA-TTA-T---A--T--CT-CCG------TGATT--T-G--A---T-A--AATAAT-TAT-----------T-AAC-CTAGGTAGGGT---TATAGAC--TA-C-TTT-T----GTACTA-TGA---T-TTG--C-AG----GC---C--CATT-CT-TA----AT-TATT------GT-------TG----CA----TTAC---AGAAAAG--TAGCTGT--------T----C-TAT--------T-TA--------C---------CA-C--------CGTCG-AACCC--TGTG---A-ATTT-GAC-AAGG-C-ACatctgttggtagagtggtggtcacattgccgatgtatgattagacagtttataatcatacattaaaaatcatttggttaacctctgatttttgtgtagttagatcattatatctccgtgatttgataaataattattaacctaggtagggttatagactacttttgtactatgatttgcaggcccattcttaattattgttgcattacagaaaagtagctgttctatttaccaccgtcgaaccctgtgaatttgacaaggcac
gi|110550                     :             ctgacgtaaccaggccgttgattcacagtgtgtctgcctgaataatgctcatacagtgtgtctagcggtttgaaggctgtcacttgtactgaggttgatcgtcctgaataaggctgcagtaccaagcgtcagcctgagtgtttgtcagatctgttggtagagtggtggtcacattgccgatgtatgattagacagtttataatcatacattaaaaatcatttggttaacctctgatttttgtgtag-T-AGC-G--G-CT-AA-G-C-TGCT--G-AGT-GCAGTGTGT-CTA-C-C--TGAA-TA---AGGC---T--T-GC---AGT-G--TGC-ACCGC
gi|110551                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGCAG-TGAA---AGGG-AT--A-TCACTT-A--TACTA----T-G--T-ATCCTG-A-AT-A--AGGCT-GCAGT-A-T-A-AGC-G-GT-A-G-TCC-GAG---GTT-G-A--C-C-AGTGT-A-A-CGCTA------ACC-ATT-----------AGT-C-TA-CCCA--C-TGC-CTAT-C-AC-C---CTGAATC-ATTA--G-A-TT--TTA--------TANNN-NNN------NNNNN--N-N--NNN-N-NN-NNNNNN-TAT-----------T-AGT-TTA-ATATGATTCCTA--ATTCATA-G-TTA-GT--GAT--TA-TCAC--C-TTGATA-AGGTTAGC---CATAGTT-TT-TG----ATACATTGACCAGGCCTTCTTTTA-AATCA--TTTTAG---TGGAAAATGT---TGT--------T----A-TAC-ATATATTT-TAG----AGAT---------CA-C--------CACCA-AATCC--T-TG---C-A-TT-GAC-AAGG-T-ACAGACCCT--T-T-AGGCGC--TC-ACGT
gi|110552                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GA---AGGG-CT--G-TCGCTT-G--AACTG----T-G--T-GTCCTG-G-AT-A--AGGCT-ACAAC-A-C-A-AGC-G-TT-A-G-TTT-AAG---GTC-A-A--C-G-AGT-T-ATG-GGCTG------A-G-AGT-----------GGT-CATA-CGCA--T-TGC-TA
gi|110553                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GTGAT-TAT-------------AAC-CTAGGTAAGGT---TA--GGCGATA-C-CT-------GTA-CA-T-T---T-TGG--C-AG----GC---C----CT-TT-GA----AT-TATTA----GTC-------CA-A-TCA------AT---AGG-AAA--T---CAT--------T----A-TAT-ATA----TATAAACCGAG-TTTGTTAGTACATTTTAGTTCATCCCA-AACCC--T-GG---A-A-TT-GAC-CAGG-T-ACGATCCTCG-G-T-AG
gi|110554                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AT-TAT-----------C-AAC-CTAGATAAGGT---TA--CGCCATA-C-TAT-TT--GGTA-TA-T-A---A-TTG--C-AG----GC---CTTCGTT-TT-AA----AT-CATTT----GGC-------TA-A-TGA-TTTTTAG---AGGAAAA--T---TGTTA------T----A-TAT-ATA----T-TAA----AG-T---------CATC--------CCCCA-AACCC--T-TG---A-A-CT-GAC-AAGGTT-ACGAGCCCTG-G-T-AGAAGC--TT-ACGT
gi|110555                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAGATGAGGT---TA--GGCCATA-C-TTT-TT--GGTA-TA-T-A---T-TTG--
gi|110556                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TA-TA-TCA---TATTG--T-AGT---G------TTGTT-TT-CA----AT-CATTT-------------------TTT-TTTTTGG---AGAAAAA--C---TGT---------------------------------------------------C--------CCCCA-AACTC--T-T----A-A-TT-GAT-AGGG-T-ACGAGCCCTG-G-T-AGACGC--TT-ACGT
gi|110557                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         T-CATTT----TGC-------TA-A-TCA-TTTTTAG---A------------------------------------A----T-TAA----AG-T---------CATC--------CCCCA-AACCC--T-TG---A-A-AT-GAC-AAGG-T-ACGAGCCCTG-G-T-AGGCGC--TT-ACGT
gi|110558                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A-A-TCA-TTTTGCG---AGGAAAA--T---TGT--------T----A-TA---TA----T-TAA----AG-T---------CATC--------CCCCA-AACCC--T-TGGAAA-A-TTCGAC-AAGGTT-ACGAGCCCTGCG-T-AGGCGC--TTGACGT
gi|110559                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --T---TGT--------C----A-TAA-AGT----T-GAG----AG-T---------CATC--------CCCCA-AATCA--T-TG---A-A-TT-GAC-AAGG-T-ACGAGCCCTG-T-T-AGGCGC--TC-ACGT
gi|110560                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ----T-TAA----AG-T---------CATC--------CCCCA-ACCCC--T-TG---A-A-TT-GAC-AAGG-T-ACGAGCCCTG-G-T-AGGCGC--TT-ACGT
gi|110561                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -AACCC--T-TG---A-A-TT-GAC-AAGG-T-ACGAGCCCTG-G-T-AGGCGC--TT-ACAT
gi|110562                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -A-TT-GAC-AAGG-T-ACGAGCCCTG-G-T-AGGCGC--T
gi|110563                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -TT-GAC-AAGG-T-ACGAGCCCTG-G-T-AGGCGC--TT-ACGT