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consensus : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA----C----C---CCC--CC--------CCCC---CT-----TT---TT-----TTT----TT---TTTT------A--A-A--TTCTG-N-TC------T--G-G-G-AT--A-G--A-T-A-C-------AC------T--------T---T-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--C---G-TT-A--TT---T-A--T--G-------T------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----A-T-G---AT-C-AT--------C-C---AN--AA---------T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-C-G-T--A-TTACT-A-AAT--A-T-C--AC----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAA
Reference ( gi|81439 ) : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA----C----C---CCC--CC--------CCCC---TT-----TT---TT-----TTT----TT---TTTT------A--A-A--TTCTG-T-TC------T--G-G-G-AT--A-G--A-T-A-C-------AC------T--------T---T-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--C---G-TT-A--TT---T-A--T--G-------T------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----A-T-G---AT-C-AT--------C-C---AC--AA---------T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-C-G-T--A-TTACT-A-AAT--A-T-C--AT----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAA
gi|81440 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA----C----C---CCC--CC--------CCCT---TT-----TT---TT-----TTT----TT---TTTTT-----A--A-A--TTCTG-T-TC------T--G-G-G-AT--A-G--A-T-A-C-------AC------T--------TATTT-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--C---G-T--A--TT---T-A--T--G-------T------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----A-T-G---AT-C-AT--------C-C---AC--AA---------T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-C-G-T--A-TTACT-A-AAA--T-T-C--AT----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAA
gi|81442 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---ATA------GA----C----C---CCC--CC--------CCCC---CA-----CT---TT-----TTT----TT---CT--------A--A-A--TTCTG-T-TC------T--G-G-G-AT--A-G--A-T-A-C-------AC------T--------TATTT-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--C---G-TTTA--TT---T-A--T--G-------T------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----A-T-G---AT-C-AT--------C-C---AC--AA---------T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-C-G----A-TTACT-A-AAT--A-G-C--AT----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAA
gi|81441 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA----C----C---CCC--CC--------CCC-----------TT---TT-----TTT----TT---TTTT------A--A-AT-TTCTG-T-TC------T--G-G-G-AT--A-G--A-T-G-C-------ACTTA---T--------T---T-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--C---G-TT-A--TT---T-A--T--G-------T------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A--T-C----A-T-G---AT-C-AT--------C-C---AC--AA---------T-G-T---TA-------T-T--T-T-C-----GT-CTCCC-T-GT-C--A-C-G-T--A-TTACT-A-AAT--ATT-C--AT----GC-TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAAaga
gi|81447 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------G-----C----C---CCC--CC--------CCCC---TT-----TT---TT------------------------------A-A--TTCTG-A-TC------T--G-G-G-GT--A-G--A-T-A-C-------ACTTA---T--------T---T-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--C---G-TT-A--TT---T-A--T--G--------------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----G-T-G---AT-C-AT--------C-C---A---AA---------T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--G-C-G-T--ATTTACTAA-AAT--A-T-C--AC----G--TT--CA-ATG--A-C-AT-T-aga
gi|81443 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA----C----C---CCC--CC--------CCCC---CT-----TT---TT-----TTC----AA---TTA-------A--A-A--TTCTG-A-AC------T--G-G-G-AA--A-A--A-T-A-C-------AC------T--------TATTT-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--C---G-TT-A--AT---T-A--T--G-------T------TT--------TA-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-A----A-A-G---AT-C-AT--------C-G---AA--AA---------T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-T-G-T--A-TTACT-A-AAT--A-T-C--AT----G--TT--TA-GTG--A-C-AT-T-A-CAAcactaaaga
gi|81445 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-GTA----T-C---AT-------GA----C----C---CCC--CC--------CT-----TTA----TT---TT-----TTT----TT---TTTT------A--A-A--T-CTG-T-TC------T--G-G-G-AT--A-G--A-T-A-C-------AC------TGTA-----T---T-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--C---G-TT----TT---T-A--T--G-------T------TC--------TG-T--A-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----AGT-G---AT-C-AT--------C-C---AC---A---------T-G-T---TA-------T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT----A-C-G-T--A-TTACT---AAT--A-T----AT----GT-TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAAaga
gi|81448 : CACAG-G---CAC-TT--GG---CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA----C----C---CCC--CC--------CCCC---CC-----CC---TC-----TTT----TT---TT--------A--A-T--TTCTG-A-TT------T--A-G-G-AT--A-G--A-C-A-C-------AC------T--------TACTT-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--C---A-TT-A--AT---T-A--C--G-------T------TT--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-A----A-A-G---AT-C-AT--------C-C---GA--AA---------T-G-C---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-C-A-T--A-TTACT-A-AAA--A-T-C--AC----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAAaga
gi|81450 : CACAG-G---CAT-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GG----C----C---CCCCGCC--------CCCC---CT-----TG---TT-----TTT----TT---TTTA------A--A-A--TTCTG-T-TC------T--G-G-ATAT--C-G--A-T-A-C-------AC------T--------TA--T-----T-----T-CTTT----T-T-------CTATGC---G-TT-A--TT---T-AT-T--G-------T------TC--------TG-T-AA-A-TGA--------T-G---CAA-TT-C----A-T-----AT-C-AT--------C-C---CC--AA---------T-G-T---TA----T--T-TTAT-T-T-----GT-CT--C-T-GT-C--A-C-G-TGAA-TTACTAA-AAT--A-T-CA-AT----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-AGTAAgga
gi|81452 : CACAG-G---CAC-TT--GATG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA----CATCGC---CCA--CA--------CCCC---AT-----TT---TT-----GTT----TT-------------G--A-A--TTCTG-A-TC------T--G-G-G-AT--A-G--A-C-G-C-------AG------T--------TATTT-----T-----T-C-TT----T-TAAAATTACTA--C---A-TT-A--TT---C-A--T--G-------T------TT--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----A-A-G---AT-C-AT--------C-C---AA--AA---------T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-C-G-T--A-TTACT-A-AAT--A-T-C--AT----G--TT--CA-GTG--A-C-AC-T-a
gi|81449 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T---G-A----T-CA--AT-------GA----C----C---CCG--CC--------CCCT---TT-----TT---TT-----TTT----TT----------------A-A--TTGTGAT-TC------T--G-G-G-AT--ATT--A-T-A---------ACAGCTTAT--------T---T-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--C---G-TT-A--TT---T-A--T--G-------T------TC--------TG-T-AATA-TAA--------T-G---C-A-TT-C----A-T-G---AT-C-AT--------CTC---AA--AA---------TCG-T---TAT---T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-C-G-T--A-TTAC--A-AAT--A-T-C--AT----GT-TT--CAGGTG--A-C-AT-T---TAA
gi|81451 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-TTG-G-A----T-C---AT-------GA----C----C---CCC--CC--------C-------------------T-----TTT----TT---TTTT------A--A-C--TTCTG-A-TC------T--G-G-G-AT--A-G--A-T-A-CAA-----ACTTA---T--------T---T-----T-----T-C-TTTTTCT-T-------CTA--C---GTTT-A--TT---T-A--T--GGTTTTTTT------TC--------TG-T-AA-C-TAA--------T-G---C-A-TT-C----A-A-G---AT-C-AT--------C-CAA-AA--AA---------T-GTT---TAT---T--T-T--T-T-C-----GTCCT--C-T-GT-C--A-C-GTT--A-TTACT-A-AAT--A-T-C--CA----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-TAA-TAAaaga
gi|81446 : CACAG-----CAC-TT--GG---CA-T-G-G------T-C---AT-------GAACCCC----C---CCC--CC--------CCCC---TT-----TT---TT-----TTTTTT-TT---TTTT------A--A-A--TCTTG-T-TC------TG-G-G-G-AT--A-T--ATT-ACC-------AC------T--------A---T-----T-----T-T-CT----T-T-------CTA--C---G-TT-A---T---T-A--T--G-------T------TC-----------T-AA-A-T-T--------T-G---C-A-TT-C----A-T-GA--AT-CAAT--------C-CA--AC--AA---------T-G-T---TAT---T--T-T--T-T-C-----GT-CTC-C-T-GT-C--AGCGG-T--ATTTACT-A-AAT--A-T-C--AT----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAAaga
gi|81454 : CACAG-T---CAT-T----GGG-CA-T-G---A----T-C---A--------GA----C----C---CCC--CC----------------------TT---TT-----TTT----TT---TTTT------GGTA-A--TTCTG-T--C------T--G-----AT--A----A-T-A-C-------AC------T--------------------------A-TC----T-T-------CTA--C---G-AT-A--TT-----A-----G-------T------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------T-GG--C-A-TT-C----A-T-G---ATTC-AT--------C-C---AC--AA---------T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--CCT-GT-C--A-C-G-T--A-TTATT-A-AAT--A-T-C--AT----G--TT--CA-GTG--A---A--T-A-TAAa
gi|81455 : CACAG-G---CAC-TA--GAGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA----C----C---CCC--CC--------CCCT---TCATCCGTT---AC-----TTTATAATT---TTTT------ATCA-C--TTCTG-A-TC------T--G-G-G-AT--A-G--A-C-A-A-------AC------T--------TAT-T-----T-----TGC-TTCAC-T-T-------CTA--C---G-TT-G--AT---T-A--T--G-------T------TT--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-A----G-A-A---AT-C-AC--------C-C---AA--AA---------T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-T--A-T--------TTAAG-A-AAT--G-A-C--AT----A--TT--aga
gi|81444 : CACAG-G---CAC-TT--TGGG--A-T-G-G-A----T-C---AT-------GA----C----A---CCC--CC--------CCC----------------TT-----TTT----TTAAATAAT------A--A-A--TTCTG-A-TC------T--G-G-A-AC-------A-T-A-C-------AC------CTTA-----T---T-----T-----T-C-TT----T-C-------GT---C---G-TT-A--AT---T-A--T----------T------TT--------TA-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-A----A-A-GA--AT-C-AT--------C-G---A---AA---------T-G-T---TA----T--T-T--T-T-------GT-CT--C-T-TT------T-G-T--ATTTACT-A-AATC-A-T-C--AT----G--TT--TA-GTGTAA-C--T-T-A-CAAt
gi|81453 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA----CTT--C---CCC--CCGCACCCTTCCCCCTTTT-----TT---TT-----TTT----TT---TTTT------A--ACA--TTCTG-CATC------T--G-G-G-AT--A-GGTA-T-A-C-------AC------T--------aaa
gi|81458 : CACAG-A---CAC-TTT-GGGG-GA-T-G-G-ACATTT-C---ATCGATTCCAA----C----C---CCC--CC--------CCCC---CCAATACTT---TT-----TTTAA--TT---ATCT------G--A-A--ATC-G-A-AC------C--G-G-G-AT--A------------------AC------T--------T---C-----T-----T-T-TT----T-T--------TA--C---T-TT-AAATT---T-G--TAGG-------A------TT--------TG-C-AA-A-T-AA-------T-A---C-A-TTTC----G-T----------AT--------C-C---AC--AAACAAAATATT-G-T---TA----T-----------C-----GC-CT--C-T-GT-C--A-C-G-T--A-TTACT-A-AA---A-T----AT----G--TT--
gi|81456 : CACAG-G---CAC-T----GGG-CA-T-G-G-A----TTC---AT-------GAGA--C----C---CCC--CC--------CCCC-----------------------CT----TT---TTTA------A--A-A--TTCTG-T-TC------T--GTA-G-AT--A-A--ATT-A-CA------AC------TATAAATTAT---T-----T-----T-C-CT----T-T-------CTA--t
gi|81457 : CACAG-A---CAC-TT--GGG--CA-----G-A----T-TG--AT-------AA----C----C---CCC--CC--------CCC-----------------T-----TTA----TT---GTAT------A--A-AGTTTCTG-A-TCTTGGAGT--G-G-G-AT--A-A--A-C-A-C-------AC------T--------T---A-----T---------TT----T-T-------CT---------T-----TT---T-G--T--G-------C------TC--------TG-T-
gi|81459 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA----T----C---cacgttttattaaaacctcacgattcagtgacattatagggaaaatacccatgatacatgccacaccttctttctgatctgggagtgggataaacacacttatttttctttttgtctcttgtcacgttttattaaaactcacgttcagtgacattata
gi|81461 : ACAG-G---CAC-TCTGGGGG-CA-T-G-GGA----T-C---AA-------TA----C----C---CCC--CC--------CCCC---CT-----TT---TT-----TTT----TT---TTTA------A--A-A--ATCTGAA-TC------T--GCG-G-AT--A-G--A-T-A-CAACACTTAT------T--------T---T-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--G---G-TT-A--TT---T-A--T--G-------T------TC--------T--T-AA-A-T-A--------T-G---C-ACTT-C----A-T-G---AT-CAAT--------C-C---A---AA---------T-G-T---TA----T--T-T--T-TCC-----GT-CT--C-T-GT-C--A-C-G-T--A-T---T-A-AAT--A-T-TCAAC----G--TT---A-GTG--ATC-ATAT-A-TAA
gi|81460 : ACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-GCG-A----T-C---AG-------GA----C----C---CCC--CC--------CCCC---TT-----TT---TT-----TTT----TT----------------A-ACCTCCTGTT-TC------T--G-G-G-AC--A-G--A-TAA-C-------AC------TCCATATA-T---T-----T-----T-C-TTA---T-T-------CTA--C---G-TT-A--TT---T-A--T--G-------T------TC--------TGATAAA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----A-T-G---AT-C-AT--------A-C----C--CA---------T-G-T---TAATACT--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-C-G-T----TTACT---AAT--G-T-C--Aaga
gi|81462 : CAG-GGCCCAC-TTT-GGGG-CAAT-G-G-A----T-C---ATT------GA----C----C---CCC--CC--------CCCC---TT-----TT---TT-----TTTTT--TT---TTTT------A--A-A--TTCTGAT-TC------T--G-GAG-AT--A-G--A-T-A-C-------ACTTA---T--------T---T-----T-----T-T-CT----T-T-------CTA--C---G-TT-A--TT---T-ATTT--G-------T------TC--------TG-T-AA-ATT-A--------T-G---C-A-TT-TCA--A-A-G---AT-C-AT--------C-C---AA--AA---------T-T-TA--TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-C-GAT--A--TACTAA-AAT--A-TCC--AC----G--TT--CA-GTG--A-C--T-T-A-TAA
gi|81463 : CAGTG---CACCTT--GGGGACA-T-G-ACA----T-C---AT-------GA----C----CGATCCT--CC--------CCCC---CA-----TT---TT-----TTT----TT---TA--------A--A-A--TTCTG-T-TC------TGAG-G-G-ATTCA-G--ATT-A-C-------AC------T--------TA--T-----TTGTTAT-C-TT----T-T-------CTT--CCCGG-TT-A--TT---T-AACT--G-------A------TC--------TG-T-AA-C-T-ATT------T-GCGCC-A-TT-TGCAGA-TAG---AT-C-ATATAATTTAC-CTAAAC--AAG--------T-G-TCCCTA----T--T-T--T-T-TA----GT-CT--C-T-GTCC--A-C-G-T--A-TTACT-A-AAT--A-T-C--AT----GTTTT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-aga
gi|81464 : AG-G---CAA-TA--GAAG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA----CAC--C---CCC--TC--------CCCC---CG-----TTACATT-----TAT----AT---TTAT------C--A-T--TTCTG-A-TC------T--G-G---AT--A-G--A-C-A-A-------AC------T--------TATTT-----T-----T-C-TT----T-T-------CAA--T---G-TT-A--TT-----A--T--G-------T------TT--------TG-C-AA-A-T-A--------C-G---C-A---------A-T-GTAAAT-C-AC--------C-C---AA--AA---------C-G-T---TA----C--G-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT----A-C-A-T--A-CTAGT-A-AATAAA-T-C--ATAATAA--TTACTA-GTG--A-C-AT-T-A-CA
gi|81465 : AG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------G-----C----C---CCC--CC--------CCC----------------TT-----TTT----TT---TTTT------A--A-A--TTCTG-
gi|81466 : -G---CAC-TT--GGG--CA-A-G-G-A----T-C---AT-------GA----C----C---CCC--CC--------CCCT---TT-----TT---TT-----TCT----TT---TTCTTTATTAA--A-A--ATCAG-A-TC------T----A-G-AT--A-G--A-C-A-C-------ATGTA---T--------T---T-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--C---G-TT-A--ATAAAT-A--T---------------------------TG-T--A-A-T-A--------T-T---C-A-TT-TA---A-A-A---AT-C-AT--------C-C---AA--CA---------T-G-T---TA----T--T-T--T-C-C------T-CT--C-T-GT-C--A---G-T-------------AT--G-T-C--AT---------------TG--A-C-AT-T-A-TAAatttcatttg
gi|81467 : --GGGG-CA-G-G-G-A----T-CTGCAT-------GA----C----C---CCC--TC--------CCC-----------------------TTT----TT---TTTT------T--A-A--TTCAG-A-TC------T--G-A-G-AT--T-G--A-T-G-C-------ACTTA---T--------T---T-----T-----T-C-TT----TAT-------CTA--C---G-TT-G--AT---T-A--T--G-------TTCAATGTC--------TG-T-GA-A-T-T--------T-G---C-C-TT-A----A-T-T---TT-C-AG--------C-C---Agg
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gi|81461 : ACAG-G---CAC-TCTGGGGG-CA-T-G-GGA----T-C---AA-------TA---C--C---CCC--CC--------CCC-----CC---T-----T-----T---TT-----TTT----T--TTTTA------A--A-A--ATCTGAATC------T--GCG-G-AT--A-G--A-T-ACAACACTTAT------T--------T---T-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--G---G-TT-A--TT---T-A--T--G-------T------TC--------T--T-AA-A-T-A--------T-G---C-ACTT-C----A-T-G---A-T-CAA-T--------C---C---A--AA-T-G-T---TA----T--T-T--T-TCC-----GT-CT--C-T-GT-C--A-CG-T--A-T-----T-A-AAT--A-T-TCAAC----G--TT---A-GTG--ATC-ATAT-A-TAA
gi|81462 : CAG-GGCCCAC-TTT-GGGG-CAAT-G-G-A----T-C---ATT------GA---C--C---CCC--CC--------CCC-----CT---T-----T-----T---TT-----TTT----TTTTTTTT------A--A-A--TTCTGATTC------T--G-GAG-AT--A-G--A-T-AC-------ACTTA---T--------T---T-----T-----T-T-CT----T-T-------CTA--C---G-TT-A--TT---T-ATTT--G-------T------TC--------TG-T-AA-ATT-A--------T-G---C-A-TT-TCA--A-A-G---A-T-C-A-T--------C---C---AA-AA-T-T-TA--TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-CG----A-TAT-ACTAA-AAT--A-TCC--AC----G--TT--CA-GTG--A-C--T-T-A-TAAaga
gi|81463 : CAGTG---CACCTT--GGGGACA-T-G-ACA----T-C---AT-------GA---C--CGATCCT--CC--------CCC-----CC---A-----T-----T---TT-----TT--------TTTTA------A--A-A--TTCTG-TTC------TGAG-G-G-ATTCA-G--ATT-AC-------AC------T--------TA--T-----TTGTTAT-C-TT----T-T-------CTT--CCCGG-TT-A--TT---T-AACT--G-------A------TC--------TG-T-AA-C-T-ATT------T-GCGCC-A-TT-TGCAGA-TAG---A-T-C-A-TATAATTTAC---CTAAAC-AAGT-G-TCCCTA----T--T-T--T-T-TA----GT-CT--C-T-GTCC--A-CG-T--A-T-T-ACT-A-AAT--A-T-C--AT----GTTTT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-aga
gi|81464 : AG-G---CAA-TA--GAAG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---CACC---CCC--TC--------CCC-----CC---G-----T-----TACATT-----TAT----A--TTTAT------C--A-T--TTCTG-ATC------T--G-G---AT--A-G--A-C-AA-------AC------T--------TATTT-----T-----T-C-TT----T-T-------CAA--T---G-TT-A--TT-----A--T--G-------T------TT--------TG-C-AA-A-T-A--------C-G---C-A---------A-T-GTAAA-T-C-A-C--------C---C---AA-AA-C-G-T---TA----C--G-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT----A-CA-T--A-C-T-AGT-A-AATAAA-T-C--ATAATAA--TTACTA-GTG--A-C-AT-T-A-CA
gi|81465 : AG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------G----C--C---CCC--CC--------CCC--------------------------TT-----TTT----T--TTTTT------A--A-A--TTCTG-ATT------T--
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gi|81467 : --GGGG-CA-G-G-G-A----T-CTGCAT-------GA---C--C---CCC--TC--------CCC---------------------------------TTT----T--TTTTT------T--A-A--TTCAG-ATC------T--G-A-G-AT--T-G--A-T-GC-------ACTTA---T--------T---T-----T-----T-C-TT----TAT-------CTA--C---G-TT-G--AT---T-A--T--G-------TTCAATGTC--------TG-T-GA-A-T-T--------T-G---C-C-TT-A----A-T-T---T-T-C-A-G--------C---C---Agg
gi|81468 : --C---CCC--CC--------CCC-----CC---T-----TACTACT---TTACTAATTA----T--TTTTT------A--T----TTCTG-ACC------T--G-G-G-AT--A-G--A-C-GC-------AC------T--------T---TAATTTT-----C-C-TT----T-T-------ATA--C---G-TT-A--AT---T-A--T--G-------T------TT--------AG-T-AA-A-T-A--------T-----C-A-TA-C----A-T-------T-C-A-T--------T---A---AA-AA-TCA-T---CAT---T--T-T--T-T-C-----GT-CT----T-GT-T--A-AG-A--A-T-C-AGT-A-AAA--A-T-C--AC----G--TT--
gi|81469 : --A-T-AC-------AT------C--------T---T-----T-----T-T-TC----T-T-------CTA--C---G-TT-A--TT---TTA--T--G-------T------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------TTG---C-A-TT-C----A-A-G---A-T-C-A----------C---C---GA-AA-TCG-T---TA----TGTT-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-CG-T--AGT-T-ACT-A-AAT--A-T-C--AC----GATTT--CA-G-G--ACC-ATGT-A-TAAgaatttacatgtgactatagaga
gi|81470 : a---T-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--C---G-TT-A--TT---T-A--T--G-------T------CCACTGACTTCG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TTCC----A-T-G---A-T-C-A-TTTA-----C---C---A--AA-T-G-T---TA----T--TCT--T-T-C-----GTCCT--C-T-GT-TCAA-CG-T--ATT-T-ACT---AAT----T-CA-AC----G--TT--CA-GTG--A-CAAT-T-A-TAAaga
gi|81471 : TA--C-----TT-A--AT---T-A--T--G-------T------TT--------TG-T-AA-A-T-AATTGAATAT-A---C-A-TT-A----A-A-G---A-T-C-A-T--------T---T---AA-AA-T-G-T---TA----T--T-T--T---C-----GT-CT--CCT-G--C--A-AG-T--A-T-T-ACT-A-AAA--C-T-C--AC----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T---TAAaga
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gi|81473 : T-C----A-TAG---A-C-C-A-T--------C---C---AA-AA-T-G-T---GG----C--T-T--T-T-T-----GT-CT--C-T-GT-C--A-CG-T--A-T-T-AGT-ACAAT----T-C--AA----G--TTG-CA-GTG--
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Reference ( family-560 ) : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---C--C---CCC--CC--------CCC-----CC---T-----T-----T---TT-----TTT----T--TTTTT------A--A-A--TTCTG-NTC------T--G-G-G-AT--A-G--A-T-AC-------AC------T--------T---T-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--C---G-TT-A--TT---T-A--T--G-------T------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----A-T-G---A-T-C-A-T--------C---C--A--A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-CG-T--A-T-T-ACT-A-AAT--A-T-C--AC----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAA
gi|81439 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---C--C---CCC--CC--------CCC-----CT---T-----T-----T---TT-----TTT----T--TTTTT------A--A-A--TTCTG-TTC------T--G-G-G-AT--A-G--A-T-AC-------AC------T--------T---T-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--C---G-TT-A--TT---T-A--T--G-------T------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----A-T-G---A-T-C-A-T--------C---C--A--C-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-CG-T--A-T-T-ACT-A-AAT--A-T-C--AT----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAA
gi|81440 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---C--C---CCC--CC--------CCC-----TT---T-----T-----T---TT-----TTT----T--TTTTTT-----A--A-A--TTCTG-TTC------T--G-G-G-AT--A-G--A-T-AC-------AC------T--------TATTT-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--C---G-T--A--TT---T-A--T--G-------T------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----A-T-G---A-T-C-A-T--------C---C--A--C-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-CG-T--A-T-T-ACT-A-AAA--T-T-C--AT----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAA
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gi|81443 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---C--C---CCC--CC--------CCC-----CC---T-----T-----T---TT-----TTC----A--ATTA-------A--A-A--TTCTG-AAC------T--G-G-G-AA--A-A--A-T-AC-------AC------T--------TATTT-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--C---G-TT-A--AT---T-A--T--G-------T------TT--------TA-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-A----A-A-G---A-T-C-A-T--------C---G--A--A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-TG-T--A-T-T-ACT-A-AAT--A-T-C--AT----G--TT--TA-GTG--A-C-AT-T-A-CAAaga
gi|81444 : CACAG-G---CAC-TT--TGGG--A-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---C--A---CCC--C----------CC-----CC---T-----T-----T---TT-----TTA----A--ATAAT------A--A-A--TTCTG-ATC------T--G-G-A-AC-------A-T-AC-------AC------CTTA-----T---T-----T-----T-C-TT----T-C-------GT---C---G-TT-A--AT---T-A--T----------T------TT--------TA-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-A----A-A-GA--A-T-C-A-T------------C--G--A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-------GT-CT--C-T-TT------TG-T--ATT-T-ACT-A-AATC-A-T-C--AT----G--TT--TA-GTGTAA-C--T-T-A-CAAaga
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gi|81453 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---CTTC---CCC--CCGCACCCTTCCC-----CCTTTT-----T-----T---TT-----TTT----T--TTTTT------A--ACA--TTCTGCATC------T--G-G-G-AT--A-GGTA-T-AC-------AC------T--------
gi|81454 : CACAG-T---CAT-T----GGG-CA-T-G---A----T-C---A--------GA---C--C---CCC--CC---------------------------T-----T---TT-----TTT----T--TTTTT------GGTA-A--TTCTG--TC------T--G-----AT--A----A-T-AC-------AC------T--------------------------A-TC----T-T-------CTA--C---G-AT-A--TT-----A-----G-------T------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------T-GG--C-A-TT-C----A-T-G---A-TTC-A-T--------C---C--A--C-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--CCT-GT-C--A-CG-T--A-T-T-ATT-A-AAT--A-T-C--AT----G--TT--CA-GTG--A---A--T-A-TAA
gi|81455 : CACAG-G---CAC-TA--GAGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---C--C---CCC--CC--------CCCTTCATCC---G-----T-----T---AC-----TTTATAAT--TTTTT------ATCA-C--TTCTG-ATC------T--G-G-G-AT--A-G--A-C-AA-------AC------T--------TAT-T-----T-----TGC-TTCAC-T-T-------CTA--C---G-TT-G--AT---T-A--T--G-------T------TT--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-A----G-A-A---A-T-C-A-C--------C---C--A--A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-T--A-aga
gi|81456 : CACAG-G---CAC-T----GGG-CA-T-G-G-A----TTC---AT-------GAGA-C--C---CCC--CC--------CCC-----CC----------------------------T----T--TTTTA------A--A-A--TTCTG-TTC------T--GTA-G-AT--A-A--ATT-ACA------AC------TATAAATTAT---T-----T-----T-C-CT----T-T-------CTA--tttaagaaatgacatattt
gi|81457 : CACAG-A---CAC-TT--GGG--CA-----G-A----T-TG--AT-------AA---C--C---CCC--------------C-----CC---------------C---CT-----TTA----T--TGTAT------A--A-AGTTTCTG-ATCTTGGAGT--G-G-G-AT--A-A--A-C-AC-------AC------T--------T---A-----T---------TT----T-T-------CT---------T-----TT---T-G--T--G-------C------TC--------TG-T-
gi|81457 : -T---TA----T--T-T--T-T-CTTTTTGTGCT--C-T-GT-C--A-CG-T--T-T-T-ATTAA-AAC--C-T-C--AC----GA-TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAcacgttttattaaaacctcacgattcagtgacattatagggaaaatacccatgatacatgccacaccttctttctgatctgggagtgggataaacacacttatttttctttttgtctcttgtcacgttttattaaaactcacgttcagtgacattata
gi|81457 : cacagacacttgggcagattgataacccccccccctttattgtataaagtttctgatcttggagtgggataaacacac-T---TA----T--T-T--T-T-CTTTTTGT-CT--C-TTGT-C--A-CG-T--T-T-T-ATT-A-AAA--C-T-C--AC----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAgggaaaatacccatgatacatgccacaccttctttctgatctgggagtgggataaacacacttatttttctttttgtctcttgtcacgttttattaaaactcacgttcagtgacattata
gi|81458 : cacagacacttgggcagattgataacccccccccctttattgtataaagtttctgatcttggagtgggataaacacacttatttttctttttgtgctctgtcacgttttattaaaacctcacgattcagtgacattatagggaaaatacccatgatacatgccacaccttctttctgatctgggagtgggataaacacacCACAG-A---CAC-TTT-GGGG-GA-T-G-G-ACATTT-C---ATCGATTCCAA---C--C---CCC--CC--------CCC-----CC---CAATACT-----T---TT-----TTTAA--T--TATCT------G--A-A--ATC-G-AAC------C--G-G-G-AT--A-----------------AC------T--------T---C-----T-----T-T-TT----T-T--------TA--C---T-TT-AAATT---T-G--TAGG-------A------TT--------TG-C-AA-A-T-AA-------T-A---C-A-TTTC----G-T-----A-T-C-C-A--------CAAAC--A--A-AA----T-A-T---TG----T--T-A--T---C-----GC-CT--C-T-GT-C--A-CG-T--A-T-T-ACTAA-AAT--A-T-
gi|81459 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---T--C---gttt
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gi|81461 : ACAG-G---CAC-TCTGGGGG-CA-T-G-GGA----T-C---AA-------TA---C--C---CCC--CC--------CCC-----CC---T-----T-----T---TT-----TTT----T--TTTTA------A--A-A--ATCTGAATC------T--GCG-G-AT--A-G--A-T-ACAACACTTAT------T--------T---T-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--G---G-TT-A--TT---T-A--T--G-------T------TC--------T--T-AA-A-T-A--------T-G---C-ACTT-C----A-T-G---A-T-CAA-T--------C---C-----A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-TCC-----GT-CT--C-T-GT-C--A-CG-T--A-T-----T-A-AAT--A-T-TCAAC----G--TT---A-GTG--ATC-ATAT-A-TAA
gi|81462 : CAG-GGCCCAC-TTT-GGGG-CAAT-G-G-A----T-C---ATT------GA---C--C---CCC--CC--------CCC-----CT---T-----T-----T---TT-----TTT----TTTTTTTT------A--A-A--TTCTGATTC------T--G-GAG-AT--A-G--A-T-AC-------ACTTA---T--------T---T-----T-----T-T-CT----T-T-------CTA--C---G-TT-A--TT---T-ATTT--G-------T------TC--------TG-T-AA-ATT-A--------T-G---C-A-TT-TCA--A-A-G---A-T-C-A-T--------C---C--A--A-AA----T-T-TA--TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-CG----A-TAT-ACTAA-AAT--A-TCC--AC----G--TT--CA-GTG--A-C--T-T-A-TAAaga
gi|81463 : CAGTG---CACCTT--GGGGACA-T-G-ACA----T-C---AT-------GA---C--CGATCCT--CC--------CCC-----CC---A-----T-----T---TT-----TT--------TTTTA------A--A-A--TTCTG-TTC------TGAG-G-G-ATTCA-G--ATT-AC-------AC------T--------TA--T-----TTGTTAT-C-TT----T-T-------CTT--CCCGG-TT-A--TT---T-AACT--G-------A------TC--------TG-T-AA-C-T-ATT------T-GCGCC-A-TT-TGCAGA-TAG---A-T-C-A-TATAATTTAC---C--T--A-AACAAGT-G-TCCCTA----T--T-T--T-T-TA----GT-CT--C-T-GTCC--A-CG-T--A-T-T-ACT-A-AAT--A-T-C--AT----GTTTT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-aga
gi|81464 : AG-G---CAA-TA--GAAG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---CACC---CCC--TC--------CCC-----CC---G-----T-----TACATT-----TAT----A--TTTAT------C--A-T--TTCTG-ATC------T--G-G---AT--A-G--A-C-AA-------AC------T--------TATTT-----T-----T-C-TT----T-T-------CAA--T---G-TT-A--TT-----A--T--G-------T------TT--------TG-C-AA-A-T-A--------C-G---C-A---------A-T-GTAAA-T-C-A-C--------C---C--A--A-AA----C-G-T---TA----C--G-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT----A-CA-T--A-C-T-AGT-A-AATAAA-T-C--ATAATAA--TTACTA-GTG--A-C-AT-T-A-CA
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gi|81467 : --GGGG-CA-G-G-G-A----T-CTGCAT-------GA---C--C---CCC--TC--------CCC---------------------------------TTT----T--TTTTT------T--A-A--TTCAG-ATC------T--G-A-G-AT--T-G--A-T-GC-------ACTTA---T--------T---T-----T-----T-C-TT----TAT-------CTA--C---G-TT-G--AT---T-A--T--G-------TTCAATGTC--------TG-T-GA-A-T-T--------T-G---C-C-TT-A----A-T-T---T-T-C-A-G--------C---C--A--gg
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Reference ( family-560 ) : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---C--C---CCC--CC--------CCC-----CC---T-----T-----T---TT-----TTT----T--TTTTT------A--A-A--TTCTG-NTC------T--G-G-G-AT--A-G--A-T-AC-------AC------T--------T---T-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--C---G-TT-A--TT---T-A--T--G-------T------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----A-T-G---A-T-C-A-T--------C---C--A--A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-CG-T--A-T-T-ACT-A-AAT--A-T-C--AC----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAA
gi|81439 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---C--C---CCC--CC--------CCC-----CT---T-----T-----T---TT-----TTT----T--TTTTT------A--A-A--TTCTG-TTC------T--G-G-G-AT--A-G--A-T-AC-------AC------T--------T---T-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--C---G-TT-A--TT---T-A--T--G-------T------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----A-T-G---A-T-C-A-T--------C---C--A--C-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-CG-T--A-T-T-ACT-A-AAT--A-T-C--AT----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAA
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gi|81443 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---C--C---CCC--CC--------CCC-----CC---T-----T-----T---TT-----TTC----A--ATTA-------A--A-A--TTCTG-AAC------T--G-G-G-AA--A-A--A-T-AC-------AC------T--------TATTT-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--C---G-TT-A--AT---T-A--T--G-------T------TT--------TA-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-A----A-A-G---A-T-C-A-T--------C---G--A--A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-TG-T--A-T-T-ACT-A-AAT--A-T-C--AT----G--TT--TA-GTG--A-C-AT-T-A-CAAaga
gi|81444 : CACAG-G---CAC-TT--TGGG--A-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---C--A---CCC--C----------CC-----CC---T-----T-----T---TT-----TTA----A--ATAAT------A--A-A--TTCTG-ATC------T--G-G-A-AC-------A-T-AC-------AC------CTTA-----T---T-----T-----T-C-TT----T-C-------GT---C---G-TT-A--AT---T-A--T----------T------TT--------TA-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-A----A-A-GA--A-T-C-A-T------------C--G--A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-------GT-CT--C-T-TT------TG-T--ATT-T-ACT-A-AATC-A-T-C--AT----G--TT--TA-GTGTAA-C--T-T-A-CAAaga
gi|81445 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-GTA----T-C---AT-------GA---C--C---CCC--CC--------CTT-----TA---T-----T-----T---TT-----TTT----T--TTTT-------A--A-A--T-CTG-TTC------T--G-G-G-AT--A-G--A-T-AC-------AC------TGTA-----T---T-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--C---G-TT----TT---T-A--T--G-------T------TC--------TG-T--A-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----AGT-G---A-T-C-A-T--------C---C-----A-CA----T-G-T---TA-------T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT----A-CG-T--A-T-T-ACT---AAT--A-T----AT----GT-TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAAaaa
gi|81446 : CACAG-----CAC-TT--GG---CA-T-G-G------T-C---AT-------GAACCC--C---CCC--CC--------CCC-----CC---T-----T-----T---TT-----TTT----T--TTTTTTTTT--A--A-A--TCTTG-TTC------T--G-G-GGAT--A-T--A-TTACC------AC------T--------A---T-----T-----T-T-CT----T-T-------CTA--C---G-TT-A--TT-----A--T--G-------T------TC--------T----AA-A-T-T--------T-G---C-A-TT-C----A-T-G---AAT-C-AAT--------C---C--A--ACAA----T-G-T---TA----T--T-T--T-TTC-----GT-CT--CCT-GT-C--AGCGGT--A-T-TTACT-A-AAT--A-T-C--AT----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAAaga
gi|81447 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------G-------C---CCC--CC--------CCC-----CC---T-----T-----T---TT-----T-----------------------A-A--TTCTG-ATC------T--G-G-G-GT--A-G--A-T-AC-------ACTTA---T--------T---T-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--C---G-TT-A--TT---T-A--T--G--------------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----G-T-G---A-T-C-A-T--------C---C-----A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--G-CG-T--ATT-T-ACTAA-AAT--A-T-C--AC----G--TT--CA-ATG--A-C-AT-T-a
gi|81448 : CACAG-G---CAC-TT--GG---CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---C--C---CCC--CC--------CCC-----CC---C-----C-----C---TC-----TTT----T--TTT--------A--A-T--TTCTG-ATT------T--A-G-G-AT--A-G--A-C-AC-------AC------T--------TACTT-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--C---A-TT-A--AT---T-A--C--G-------T------TT--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-A----A-A-G---A-T-C-A-T--------C---C--G--A-AA----T-G-C---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-CA-T--A-T-T-ACT-A-AAA--A-T-C--AC----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAAcactaaaga
gi|81449 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T---G-A----T-CA--AT-------GA----------CCC--CG--------CCC-----CC---T-----T-----T---TT-----TTT----T--TTT-----------A-A--TTGTGATTC------T--G-G-G-AT--ATT--A-T-A--------ACAGCTTAT--------T---T-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--C---G-TT-A--TT---T-A--T--G-------T------TC--------TG-T-AATA-TAA--------T-G---C-A-TT-C----A-T-G---A-T-C-A-T--------CT--C--A--A-AA----TCG-T---TAT---T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-CG-T--A-T-T-AC--A-AAT--A-T-C--AT----GT-TT--CAGGTG--A-C-AT-T---TAAgga
gi|81450 : CACAG-G---CAT-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GG---C--C---CCCCGCC--------CCC-----CC---T-----T-----G---TT-----TTT----T--TTTTA------A--A-A--TTCTG-TTC------T--G-G-ATAT--C-G--A-T-AC-------AC------T--------TA--T-----T-----T-CTTT----T-T-------CTATGC---G-TT-A--TT---T-AT-T--G-------T------TC--------TG-T-AA-A-TGA--------T-G---CAA-TT-C----A-T-----A-T-C-A-T--------C---C--C--C-AA----T-G-T---TA----T--T-TTAT-T-T-----GT-CT--C-T-GT-C--A-CG-TGAA-T-T-ACTAA-AAT--A-T-CA-AT----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-AGTAAaaga
gi|81451 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-TTG-G-A----T-C---AT-------GA---C--C---CCC--CC--------C-----------------------------T-----TTT----T--TTTTT------A--A-C--TTCTG-ATC------T--G-G-G-AT--A-G--A-T-ACAA-----ACTTA---T--------T---T-----T-----T-C-TTTTTCT-T-------CTA--C---GTTT-A--TT---T-A--T--GGTTTTTTT------TC--------TG-T-AA-C-TAA--------T-G---C-A-TT-C----A-A-G---A-T-C-A-T--------C---CAAA--A-AA----T-GTT---TAT---T--T-T--T-T-C-----GTCCT--C-T-GT-C--A-CGTT--A-T-T-ACT-A-AAT--A-T-C--CA----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-TAA-TAAa
gi|81452 : CACAG-G---CAC-TT--GATG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---C--A---TCG--CC--------CAC-----AC---C-----C-----C---AT-----TTT----T--GTTTT------G--A-A--TTCTG-ATC------T--G-G-G-AT--A-G--A-C-GC-------AG------T--------TATTT-----T-----T-C-TT----T-TAAAATTACTA--C---A-TT-A--TT---C-A--T--G-------T------TT--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----A-A-G---A-T-C-A-T--------C---C--A--A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-CG-T--A-T-T-ACT-A-AAT--A-T-C--AT----G--TT--CA-GTG--A-C-AC-T-aga
gi|81453 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---CTTC---CCC--CCGCACCCTTCCC-----CCTTTT-----T-----T---TT-----TTT----T--TTTTT------A--ACA--TTCTGCATC------T--G-G-G-AT--A-GGTA-T-AC-------AC------T--------
gi|81454 : CACAG-T---CAT-T----GGG-CA-T-G---A----T-C---A--------GA---C--C---CCC--CC---------------------------T-----T---TT-----TTT----T--TTTTT------GGTA-A--TTCTG--TC------T--G-----AT--A----A-T-AC-------AC------T--------------------------A-TC----T-T-------CTA--C---G-AT-A--TT-----A-----G-------T------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------T-GG--C-A-TT-C----A-T-G---A-TTC-A-T--------C---C--A--C-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--CCT-GT-C--A-CG-T--A-T-T-ATT-A-AAT--A-T-C--AT----G--TT--CA-GTG--A---A--T-A-TAA
gi|81455 : CACAG-G---CAC-TA--GAGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---C--C---CCC--CC--------CCCTTCATCC---G-----T-----T---AC-----TTTATAAT--TTTTT------ATCA-C--TTCTG-ATC------T--G-G-G-AT--A-G--A-C-AA-------AC------T--------TAT-T-----T-----TGC-TTCAC-T-T-------CTA--C---G-TT-G--AT---T-A--T--G-------T------TT--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-A----G-A-A---A-T-C-A-C--------C---C--A--A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-T--A-aga
gi|81456 : CACAG-G---CAC-T----GGG-CA-T-G-G-A----TTC---AT-------GAGA-C--C---CCC--CC--------CCC-----CC----------------------------T----T--TTTTA------A--A-A--TTCTG-TTC------T--GTA-G-AT--A-A--ATT-ACA------AC------TATAAATTAT---T-----T-----T-C-CT----T-T-------CTA--tttaagaaatgacatattt
gi|81457 : CACAG-A---CAC-TT--GGG--CA-----G-A----T-TG--AT-------AA---C--C---CCC--------------C-----CC---------------C---CT-----TTA----T--TGTAT------A--A-AGTTTCTG-ATCTTGGAGT--G-G-G-AT--A-A--A-C-AC-------AC------T--------T---A-----T---------TT----T-T-------CT---------T-----TT---T-G--T--G-------C------TC--------TG-T-
gi|81457 : -T---TA----T--T-T--T-T-CTTTTTGTGCT--C-T-GT-C--A-CG-T--T-T-T-ATTAA-AAC--C-T-C--AC----GA-TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAcacgttttattaaaacctcacgattcagtgacattatagggaaaatacccatgatacatgccacaccttctttctgatctgggagtgggataaacacacttatttttctttttgtctcttgtcacgttttattaaaactcacgttcagtgacattata
gi|81457 : cacagacacttgggcagattgataacccccccccctttattgtataaagtttctgatcttggagtgggataaacacac-T---TA----T--T-T--T-T-CTTTTTGT-CT--C-TTGT-C--A-CG-T--T-T-T-ATT-A-AAA--C-T-C--AC----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAgggaaaatacccatgatacatgccacaccttctttctgatctgggagtgggataaacacacttatttttctttttgtctcttgtcacgttttattaaaactcacgttcagtgacattata
gi|81458 : cacagacacttgggcagattgataacccccccccctttattgtataaagtttctgatcttggagtgggataaacacacttatttttctttttgtgctctgtcacgttttattaaaacctcacgattcagtgacattatagggaaaatacccatgatacatgccacaccttctttctgatctgggagtgggataaacacacCACAG-A---CAC-TTT-GGGG-GA-T-G-G-ACATTT-C---ATCGATTCCAA---C--C---CCC--CC--------CCC-----CC---CAATACT-----T---TT-----TTTAA--T--TATCT------G--A-A--ATC-G-AAC------C--G-G-G-AT--A-----------------AC------T--------T---C-----T-----T-T-TT----T-T--------TA--C---T-TT-AAATT---T-G--TAGG-------A------TT--------TG-C-AA-A-T-AA-------T-A---C-A-TTTC----G-T-----A-T-C-C-A--------CAAAC--A--A-AA----T-A-T---TG----T--T-A--T---C-----GC-CT--C-T-GT-C--A-CG-T--A-T-T-ACTAA-AAT--A-T-
gi|81459 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---T--C---gttt
gi|81460 : ACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-GCG-A----T-C---AG-------GA---C--C---CCC--CC--------CCC-----C--------------------TT-----TTT----T--TTTTT------A--ACC--TCCTGTTTC------T--G-G-G-AC--A-G--A-TAAC-------AC------TCCATATA-T---T-----T-----T-C-TTA---T-T-------CTA--C---G-TT-A--TT---T-A--T--G-------T------TC--------TGATAAA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----A-T-G---A-T-C-A-TAC------C---C--------A----T-G-T---TAATACT--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-CG-T----T-T-ACT---AAT--G-T-C--A
gi|81461 : ACAG-G---CAC-TCTGGGGG-CA-T-G-GGA----T-C---AA-------TA---C--C---CCC--CC--------CCC-----CC---T-----T-----T---TT-----TTT----T--TTTTA------A--A-A--ATCTGAATC------T--GCG-G-AT--A-G--A-T-ACAACACTTAT------T--------T---T-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--G---G-TT-A--TT---T-A--T--G-------T------TC--------T--T-AA-A-T-A--------T-G---C-ACTT-C----A-T-G---A-T-CAA-T--------C---C-----A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-TCC-----GT-CT--C-T-GT-C--A-CG-T--A-T-----T-A-AAT--A-T-TCAAC----G--TT---A-GTG--ATC-ATAT-A-TAA
gi|81462 : CAG-GGCCCAC-TTT-GGGG-CAAT-G-G-A----T-C---ATT------GA---C--C---CCC--CC--------CCC-----CT---T-----T-----T---TT-----TTT----TTTTTTTT------A--A-A--TTCTGATTC------T--G-GAG-AT--A-G--A-T-AC-------ACTTA---T--------T---T-----T-----T-T-CT----T-T-------CTA--C---G-TT-A--TT---T-ATTT--G-------T------TC--------TG-T-AA-ATT-A--------T-G---C-A-TT-TCA--A-A-G---A-T-C-A-T--------C---C--A--A-AA----T-T-TA--TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-CG----A-TAT-ACTAA-AAT--A-TCC--AC----G--TT--CA-GTG--A-C--T-T-A-TAAaga
gi|81463 : CAGTG---CACCTT--GGGGACA-T-G-ACA----T-C---AT-------GA---C--CGATCCT--CC--------CCC-----CC---A-----T-----T---TT-----TT--------TTTTA------A--A-A--TTCTG-TTC------TGAG-G-G-ATTCA-G--ATT-AC-------AC------T--------TA--T-----TTGTTAT-C-TT----T-T-------CTT--CCCGG-TT-A--TT---T-AACT--G-------A------TC--------TG-T-AA-C-T-ATT------T-GCGCC-A-TT-TGCAGA-TAG---A-T-C-A-TATAATTTAC---C--T--A-AACAAGT-G-TCCCTA----T--T-T--T-T-TA----GT-CT--C-T-GTCC--A-CG-T--A-T-T-ACT-A-AAT--A-T-C--AT----GTTTT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-aga
gi|81464 : AG-G---CAA-TA--GAAG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---CACC---CCC--TC--------CCC-----CC---G-----T-----TACATT-----TAT----A--TTTAT------C--A-T--TTCTG-ATC------T--G-G---AT--A-G--A-C-AA-------AC------T--------TATTT-----T-----T-C-TT----T-T-------CAA--T---G-TT-A--TT-----A--T--G-------T------TT--------TG-C-AA-A-T-A--------C-G---C-A---------A-T-GTAAA-T-C-A-C--------C---C--A--A-AA----C-G-T---TA----C--G-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT----A-CA-T--A-C-T-AGT-A-AATAAA-T-C--ATAATAA--TTACTA-GTG--A-C-AT-T-A-CA
gi|81465 : AG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------G----C--C---CCC--CC--------CCC--------------------------TT-----TTT----T--TTTTT------A--A-A--TTCTG-ATT------T--
gi|81466 : -G---CAC-TT--GGG--CA-A-G-G-A----T-C---AT-------GA---C--C---CCC--CC--------CCC-----TT---T-----T-----T---TT-----TCT----T--TTTCTTTATTAA--A-A--ATCAG-ATC------T----A-G-AT--A-G--A-C-AC-------ATGTA---T--------T---T-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--C---G-TT-A--ATAAAT-A--T---------------------------TG-T--A-A-T-A--------T-T---C-A-TT-TA---A-A-A---A-T-C-A-T--------C---C--A--A-CA----T-G-T---TA----T--T-T--T-C-C------T-CT--C-T-GT-C--A--G-T--A-T---------------------------G---T--CA-TTG--A-C-AT-T-A-TAAcatttg
gi|81467 : --GGGG-CA-G-G-G-A----T-CTGCAT-------GA---C--C---CCC--TC--------CCC---------------------------------TTT----T--TTTTT------T--A-A--TTCAG-ATC------T--G-A-G-AT--T-G--A-T-GC-------ACTTA---T--------T---T-----T-----T-C-TT----TAT-------CTA--C---G-TT-G--AT---T-A--T--G-------TTCAATGTC--------TG-T-GA-A-T-T--------T-G---C-C-TT-A----A-T-T---T-T-C-A-G--------C---C--A--gg
gi|81468 : --C---CCC--CC--------CCC-----CC---T-----TACTACT---TTACTAATTA----T--TTTTT------A--T----TTCTG-ACC------T--G-G-G-AT--A-G--A-C-GC-------AC------T--------T---TAATTTT-----C-C-TT----T-T-------ATA--C---G-TT-A--AT---T-A--T--G-------T------TT--------AG-T-AA-A-T-A--------T-----C-A-TA-C----A-T-------T-C-A-T--------T---A--A--A-AA----TCA-T---CAT---T--T-T--T-T-C-----GT-CT----T-GT-T--A-AG-A--A-T-C-AGT-A-AAA--A-T-C--AC----G--TT--
gi|81469 : --A-T-AC-------AT------C--------T---T-----T-----T-T-TC----T-T-------CTA--C---G-TT-A--TT---TTA--T--G-------T------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------TTG---C-A-TT-C----A-A-G---A-T-C-A----------C---C--G--A-AA----TCG-T---TA----TGTT-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-CG-T--AGT-T-ACT-A-AAT--A-T-C--AC----GATTT--CA-G-G--ACC-ATGT-A-TAAgaatttacatgtgactatagaga
gi|81470 : a---T-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--C---G-TT-A--TT---T-A--T--G-------T------CCACTGACTTCG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TTCC----A-T-G---A-T-C-A-T--------T---T--ACCA-AA----T-G-T---TA----T--TCT--T-T-C-----GTCCT--C-T-GT-TCAA-CG-T--ATT-T-ACT---AAT----T-CA-AC----G--TT--CA-GTG--A-CAAT-T-A-TAAaga
gi|81471 : TA--C-----TT-A--AT---T-A--T--G-------T------TT--------TG-T-AA-A-T-AATTGAATAT-A---C-A-TT-A----A-A-G---A-T-C-A-T--------T---T--A--A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T---C-----GT-CT--CCT-G--C--A-AG-T--A-T-T-ACT-A-AAA--C-T-C--AC----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T---TAAaga
gi|81472 : --------T-G---C-A-TT-A----A-A-G---A-T-C-A-T--------C---C--A--A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----AT-TT--C-G-GT-C--A-CA-T--A---T-AAT-A-AAC----T-C--AC----G--TT--TA-GTG--A-C-AT-
gi|81473 : T-C----A-TAG---A-C-C-A-T--------C---C--A--A-AA----T-G-T---GG----C--T-T--T-T-T-----GT-CT--C-T-GT-C--A-CG-T--A-T-T-AGT-ACAAT----T-C--AA----G--TTG-CA-GTG--
gi|81474 : -T-G---A-T-C-A-T--------C---C--AC-A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--TTT-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-CG-T--A---T-ACT-A-AAT--A-T-C--AT----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAA
blockSeqs : T GCC C TG A A T C T CATT T TGC CGATTCC ACC TT GAT CG GCACCCTT TTCATCCGT ACA ACTAA ATAA TT CTTTATTA GT C GT AT TTGGAG GA T A G TC T GT T T AACACTT TATAAATTAT AATTT TGTTA G T TTTC A AAAATTA TG CCG T T AA AAA T TT AG GTTTTTT TCAATG ACTGACTT A A T T A ATTGAATA T CGC A C TGCAG TGTAA A T A A ATAATTTA AAA AAA C CAAG C T CCC ATAC GT C TA T T TTTTT C CC C T C CA G G GA T A T A C AAA C CA TAATA TT AC G TA T A A A G
blockSeqs : . . . T . . . . G . . A A GA AC . . . CCCAATACT . . AA . TTTTTT TC C T CA . . C . T . . . T A AA TCCATATAT . . . . CAC . . . . . . . . . AC . . . . . . . . G TT . G . . TCA AGA . . . . AC T ACC . . C . A T . . . . C TTTTT G . C . . . . T . T . . A . AT . A T AT G . . C . G . .
blockSeqs : . . . T . . . . C . . G T . . . . . CCTTACTAC . . . . TTT . . . TT . . . . . . . . . . C AGCTTATT . . . . A . . . . . . . . . T . . . . . . . . A A . . . . TC GTG . . . . . . AC . . C . . T . . . . . A C . C . . . . . . G . . A . CA . A T C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCTTTTT . . . . TT . . . AA . . . . . . . . . . A TTATT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA TAG . . . . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T . . A . T . . T T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTT . . . . AT . . . AT . . . . . . . . . . . TTATT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CC TAG . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . A . . T T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCAC . . . . TA . . . T . . . . . . . . . . . TTATT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C TG . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCTT . . . . TT . . . T . . . . . . . . . . . TTATT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C TG . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCTT . . . . TT . . . T . . . . . . . . . . . CTTAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C TG . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . TATT . . . . TT . . . A . . . . . . . . . . . TGTAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A AG . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCTT . . . . TT . . . A . . . . . . . . . . . TTATT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A TG . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCTT . . . . TT . . . T . . . . . . . . . . . TTACT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C TG . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCCC . . . . TA . . . T . . . . . . . . . . . TTATT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C AG . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCTT . . . . AT . . . A . . . . . . . . . . . TTATT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C TG . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCTT . . . . CT . . . A . . . . . . . . . . . TTATT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A AG . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACCC . . . . TT . . . T . . . . . . . . . . . TTATT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C AG . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCTT . . . . TA . . . A . . . . . . . . . . . GTATT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C TG . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . CTTT . . . . TT . . . A . . . . . . . . . . . TTATT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C AA . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCAT . . . . TA . . . A . . . . . . . . . . . TTAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C TG . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCGT . . . . AT . . . T . . . . . . . . . . . TTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C TG . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTT . . . . TT . . . A . . . . . . . . . . . TTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A AG . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . CC . . . . TT . . . A . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C AA . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . CC . . . . TT . . . T . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C TT . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . A . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A AG . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T . . . A . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C TG . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C AG . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A AG . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : TTATT**************
originalCons : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---C--C---CCC--CC--------CCC-----CC---T-----T-----T---TT-----TTT----T--TTTTT------A--A-A--TTCTG-NTC------T--G-G-G-AT--A-G--A-T-AC-------AC------T--------T---T-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--C---G-TT-A--TT---T-A--T--G-------T------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----A-T-G---A-T-C-A-T--------C---C--A--A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-CG-T--A-T-T-ACT-A-AAT--A-T-C--AC----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAA
finalCons : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---C--C---CCC--CC--------CCC-----CC---T-----T-----T---TT-----TTT----T--TTTTT------A--A-A--TTCTG-NTC------T--G-G-G-AT--A-G--A-T-AC-------ACTTATT--------------T-----T-----T-C-TT----T-T-------CTA--C---G-TT-A--TT---T-A--T--G-------T------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----A-T-G---A-T-C-A-T--------C---C--A--A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-CG-T--A-T-T-ACT-A-AAT--A-T-C--AC----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAA
Alignments
lowQualScore : 22222222222222222222222222
lowQualScore : 1 222 1 44 1 1 1 1 4 2222 1 555 7777777 444 33 222 11 55555555 00000000000000000000000000 33333 4444 2222 222 6666666 33 4444 77 1 777777 2 1 1 444444 11 1 11 4 555 1 11 2 333 11 1 555555 1 11 6666 1 4444444 11 222 2 222 222 1 55 22 4444444 444444 55555555 1 1 1 1 4 88888888 1 333 1 1 666666 5555555 1 2 66666666 333 55555 1 2222 4 1 333 7777 11 1 11 1 1 77777 3 33 2 1 1 11 1 1 1 11 6 1 6 1 4444 1 44 33333 99 33 1 22 3 1 3 1 1
lowQualScore : . ... . .. . . . . . .... . ... ....... ... .. ... .. ........ .......................... ..... .... .... ... ....... .. .... .. . ...... . . . ...... .. . .. . ... . .. . ... .. . ...... . .. .... . ....... .. ... . ... ... . .. .. ....... ...... ........ . . . . . ........ . ... . . ...... ....... . . ........ ... ..... . .... . . ... .... .. . .. . . ..... . .. . . . .. . . . .. . . . . .... . .. ..... .. .. . .. . . . . .
lowQualScore : 4 555 4 77 4 4 4 4 1 9999 4 222 2222222 333 77 333 99 00000000 77777777777777777777777777 44444 8888 9999 444 4444444 88 1111 66 3 000000 8 4 4 000000 99 4 88 0 000 3 88 7 777 99 4 333333 3 88 5555 3 3333333 99 555 9 111 555 4 44 00 6666666 111111 22222222 4 4 4 4 3 33333333 4 888 4 4 999999 6666666 3 6 55555555 555 22222 3 8888 0 2 444 7777 77 2 77 2 2 55555 8 00 5 2 2 77 2 3 3 88 5 3 5 3 5555 3 55 88888 33 33 4 00 0 5 0 5 7
consensus : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---C--C---CCC--CC--------CCC-----CC---T-----T-----T---TT-----TTT----T----T---TTTT------A--A-A--TTCTG-AT-CT------G-G-G-A------T--A-G--A-T---A-C--A-CT---T--A-T------TT-T--TCTT----T-T-------CTA--C---G-TTA--TT---T-A--T--G-------T------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----A-T-G---AT-C-AT--------C---C--A--A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-C-G-T--A-T-TACT-A-AAT--A-T-C--AC----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAA
Reference ( family-560 ) : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---C--C---CCC--CC--------CCC-----CC---T-----T-----T---TT-----TTT----T----T---TTTT------A--A-A--TTCTG-NT-CT------G-G-G-A------T--A-G--A-T---A-C--A-CT---T--A-T------TT-T--TCTT----T-T-------CTA--C---G-TTA--TT---T-A--T--G-------T------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----A-T-G---AT-C-AT--------C---C--A--A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-C-G-T--A-T-TACT-A-AAT--A-T-C--AC----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAA
gi|81439 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---C--C---CCC--CC--------CCC-----CT---T-----T-----T---TT-----TTT----T----T---TTTT------A--A-A--TTCTG-TT-CT------G-G-G-A------T--A-G--A-T---A-C--A-CT---T------------T-T--TCTT----T-T-------CTA--C---G-TTA--TT---T-A--T--G-------T------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----A-T-G---AT-C-AT--------C---C--A--C-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-C-G-T--A-T-TACT-A-AAT--A-T-C--AT----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAA
gi|81440 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---C--C---CCC--CC--------CCCT----TT---T-----T-----T---TT-----TTT----T----T---TTTT------A--A-A--TTCTG-TT-CT------G-G-G-A------T--A-G--A-T---A-C--A-CT---T--A-T------TT-T--TCTT----T-T-------CTA--C---G--TA--TT---T-A--T--G-------T------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----A-T-G---AT-C-AT--------C---C--A--C-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-C-G-T--A-T-TACT-A-AAA--T-T-C--AT----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAA
gi|81441 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---C--C---CC----C--------CCC-----CC---T-----T-----T---TT-----TTT----T----T---TTTA------A--A-T--TTCTG-TT-CT------G-G-G-A------T--A-G--A-T---G-C--A-CT---T--A-T------TT-T--TCTT----T-T-------CTA--C---G-TTA--TT---T-A--T--G-------T------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A--T-C----A-T-G---AT-C-AT--------C---C--A--C-AA----T-G-T---TA-------T-T--T-T-C-----GT-CTCCC-T-GT-C--A-C-G-T--A-T-TACT-A-AAT--ATT-C--AT----GC-TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAA
gi|81442 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---ATA------GA---C--C---CCC--CC--------CCC-----CC---------------A---CT-----TTT----T----T---TTCT------A--A-A--TTCTG-TT-CT------G-G-G-A------T--A-G--A-T---A-C--A-CT---T--A-T------TT-T--TCTT----T-T-------CTA--C---GTTTA--TT---T-A--T--G-------T------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----A-T-G---AT-C-AT--------C---C--A--C-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-C-G----A-T-TACT-A-AAT--A-G-C--AT----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAAaga
gi|81443 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---C--C---CC---CC--------CCC-----CC---C-----T-----T---TT-----TTT----C----A---ATTA------A--A-A--TTCTG-AA-CT------G-G-G-A------A--A-A--A-T---A-C--A-CT---T--A-T------TT-T--TCTT----T-T-------CTA--C---G-TTA--AT---T-A--T--G-------T------TT--------TA-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-A----A-A-G---AT-C-AT--------C---G--A--A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-T-G-T--A-T-TACT-A-AAT--A-T-C--AT----G--TT--TA-GTG--A-C-AT-T-A-CAAaga
gi|81444 : CACAG-G---CAC-TT--TGGG--A-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---C--A---CCC--CC--------CCC--------------------------TT-----TTT----T----TAAATAAT------A--A-A--TTCTG-AT-CT------G-G-A-A------C-------A-T---A-C--ACCT---T--A--------TT-T--TCTT----T-C-------GT---C---G-TTA--AT---T-A--T----------T------TT--------TA-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-A----A-A-GA--AT-C-AT------------C--G--A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-------GT-CT--C-T-TT------T-G-T--ATT-TACT-A-AATC-A-T-C--AT----G--TT--TA-GTGTAA-C--T-T-A-CAAaga
gi|81445 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-GTA----T-C---AT-------GA---C--C---CCC--CC--------CTT-----TA---T-----T-----T---TT-----TTT----T----T---TTT-------A--A-A--T-CTG-TT-CT------G-G-G-A------T--A-G--A-T---A-C--A-CTG--T--A--------TT-T--TCTT----T-T-------CTA--C---G-TT---TT---T-A--T--G-------T------TC--------TG-T--A-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----AGT-G---AT-C-AT--------C---C-----A-CA----T-G-T---TA-------T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT----A-C-G-T--A-T-TACT---AAT--A-T----AT----GT-TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAAaaa
gi|81446 : CACAG-----CAC-TT--GG---CA-T-G-G------T-C---AT-------GAACCC--C---CCC--CC--------CCC-----CC---T-----T-----T---TT-----TTT----TTTTTT---TTTT------A--A-A--TCTTG-TT-CTG-----G-G-G-A------T--A-T--ATT---ACC--A-C----T--A-T------TT-T----CT----T-T-------CTA--C---G-TTA---T---T-A--T--G-------T------TC-----------T-AA-A-T-T--------T-G---C-A-TT-C----A-T-GA--AT-CAAT--------C---C--A--ACAA----T-G-T---TAT---T--T-T--T-T-C-----GT-CTC-C-T-GT-C--AGCGG-T--ATT-TACT-A-AAT--A-T-C--AT----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAAaga
gi|81447 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------G-------C---CCC--CC--------CCC-----CC---T-----T-----T---TT-----T----------------------------A-A--TTCTG-AT-CT------G-G-G-G------T--A-G--A-T---A-C--A-CT---T--A-T------TT-T--TCTT----T-T-------CTA--C---G-TTA--TT---T-A--T--G--------------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----G-T-G---AT-C-AT--------C---C-----A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--G-C-G-T--ATT-TACTAA-AAT--A-T-C--AC----G--TT--CA-ATG--A-C-AT-T-a
gi|81448 : CACAG-G---CAC-TT--GG---CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---C--C---CCC--CC--------CCC-----CC---C-----C-----C---TC-----TTT----T----T---TT--------A--A-T--TTCTG-AT-TT------A-G-G-A------T--A-G--A-C---A-C--A-CT---T--A-C------TT-T--TCTT----T-T-------CTA--C---A-TTA--AT---T-A--C--G-------T------TT--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-A----A-A-G---AT-C-AT--------C---C--G--A-AA----T-G-C---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-C-A-T--A-T-TACT-A-AAA--A-T-C--AC----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAAcactaaaga
gi|81449 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T---G-A----T-CA--AT-------GA----------CCC--CG--------CCC-----CC---T-----T-----T---TT-----TTT----T----T---TT-----------A-A--TTGTGATT-CT------G-G-G-A------T--ATT--A-TA--A-C--AGCT---T--A-T------TT-T--TCTT----T-T-------CTA--C---G-TTA--TT---T-A--T--G-------T------TC--------TG-T-AATA-TAA--------T-G---C-A-TT-C----A-T-G---AT-C-AT--------CT--C--A--A-AA----TCG-T---TAT---T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-C-G-T--A-T-TAC--A-AAT--A-T-C--AT----GT-TT--CAGGTG--A-C-AT-T---TAAgga
gi|81450 : CACAG-G---CAT-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GG---C--C---CCCCGCC--------CCC-----CC---T-----T-----G---TT-----TTT----T----T---TTTA------A--A-A--TTCTG-TT-CT------G-G-ATA------T--C-G--A-T---A-C--A-CT---T--A-T------TT-C--T-TT----T-T-------CTATGC---G-TTA--TT---T-AT-T--G-------T------TC--------TG-T-AA-A-TGA--------T-G---CAA-TT-C----A-T-----AT-C-AT--------C---C--C--C-AA----T-G-T---TA----T--T-TTAT-T-T-----GT-CT--C-T-GT-C--A-C-G-TGAA-T-TACTAA-AAT--A-T-CA-AT----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-AGTAAaaga
gi|81451 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-TTG-G-A----T-C---AT-------GA---C--C---CCC--CC--------C-----------------------------T-----TTT----T----T---TTTT------A--A-C--TTCTG-AT-CT------G-G-G-A------T--A-G--A-T---A-CAAA-CT---T--A-T------TT-T--TCTTTTTCT-T-------CTA--C---GTTTA--TT---T-A--T--GGTTTTTTT------TC--------TG-T-AA-C-TAA--------T-G---C-A-TT-C----A-A-G---AT-C-AT--------C---CAAA--A-AA----T-GTT---TAT---T--T-T--T-T-C-----GTCCT--C-T-GT-C--A-C-GTT--A-T-TACT-A-AAT--A-T-C--CA----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-TAA-TAAa
gi|81452 : CACAG-G---CAC-TT--GATG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---C--A---TCG--CC--------CAC-----AC---C-----C-----C---AT-----TTT----T----G---TTTT------G--A-A--TTCTG-AT-CT------G-G-G-A------T--A-G--A-C---G-C--A-GT---T--A-T------TT-T--TCTT----T-TAAAATTACTA--C---A-TTA--TT---C-A--T--G-------T------TT--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----A-A-G---AT-C-AT--------C---C--A--A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-C-G-T--A-T-TACT-A-AAT--A-T-C--AT----G--TT--CA-GTG--A-C-AC-T-aga
gi|81453 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---CTTC---CCC--CCGCACCCTTCCC-----CCTTTT-----T-----T---TT-----TTT----T----T---TTTT------A--ACA--TTCTGCAT-CT------G-G-G-A------T--A-GGTA-T---A-C--A-CT---
gi|81454 : CACAG-T---CAT-T----GGG-CA-T-G---A----T-C---A--------GA---C--C---CCC--CC---------------------------T-----T---TT-----TTT----T----T---TTTT------GGTA-A--TTCTG--T-CT------G-----A------T--A----A-T---A-C--A-CT------A-T------CT-T--------------------CTA--C---G-ATA--TT-----A-----G-------T------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------T-GG--C-A-TT-C----A-T-G---ATTC-AT--------C---C--A--C-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--CCT-GT-C--A-C-G-T--A-T-TATT-A-AAT--A-T-C--AT----G--TT--CA-GTG--A---A--T-A-TAA
gi|81455 : CACAG-G---CAC-TA--GAGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---C--C---CCC--CC--------CCCTTCATCC---G-----T-----T---AC-----TTTATAAT----T---TTTT------ATCA-C--TTCTG-AT-CT------G-G-G-A------T--A-G--A-C---A-A--A-CT---T--A-T------TT-T--GCTTCAC-T-T-------CTA--C---G-TTG--AT---T-A--T--G-------T------TT--------TG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-A----G-A-A---AT-C-AC--------C---C--A--A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-T--A-aga
gi|81456 : CACAG-G---CAC-T----GGG-CA-T-G-G-A----TTC---AT-------GAGA-C--C---CCC--CC--------CCC-----CC----------------------------T----T----T---TTTA------A--A-A--TTCTG-TT-CT------GTA-G-A------T--A-A--ATT---A-C--A-AC---T--A-TAAATTATT-T--TCCT----T-T-------CTA--tttaagaaatgacatattt
gi|81457 : CACAG-A---CAC-TT--GGG--CA-----G-A----T-TG--AT-------AA---C--C---CCC--CC--------CCC---------------------------T-----TTA----T----T---GTAT------A--A-AGTTTCTG-AT-CTTGGAGTG-G-G-A------T--A-A--A-C---A-C--A-CT---T--A-T------TT-T--TCTT----T-T-------
gi|81457 : -T---TA----T--T-T--T-T-CTTTTTGTGCT--C-T-GT-C--A-C-G-T--T-T-TATTAA-AAC--C-T-C--AC----GA-TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAtgtgctctgtcacgttttattaaaacctcacgattcagtgacattatagggaaaatacccatgatacatgccacaccttctttctgatctgggagtgggataaacacacttatttttctttttgtctcttgtcacgttttattaaaactcacgttcagtgacattata
gi|81457 : cacagacacttgggcagattgataacccccccccctttattgtataaagtttctgatcttggagtgggataaacacac--TTCTG-AT-CT------G-G-G-AGTGGGAT--A-A--A-C---A-C--A-CT---T--A-T------TT-T--TCTT----T-T-------gggaaaatacccatgatacatgccacaccttctttctgatctgggagtgggataaacacacttatttttctttttgtctcttgtcacgttttattaaaactcacgttcagtgacattata
gi|81457 : cacagacacttgggcagattgataacccccccccctttattgtataaagtttctgatcttggagtgggataaacacacttatttttctttttgtgctctgtcacgttttattaaaacctcacgattcagtgacattatagggaaaatacccatgatacatgccacaccttct-T---TA----T--T-T--T-T-CTTTTTGT-CT--C-TTGT-C--A-C-G-T--T-T-TATT-A-AAA--C-T-C--AC----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAtgtctcttgtcacgttttattaaaactcacgttcagtgacattata
gi|81458 : cacagacacttgggcagattgataacccccccccctttattgtataaagtttctgatcttggagtgggataaacacacttatttttctttttgtgctctgtcacgttttattaaaacctcacgattcagtgacattatagggaaaatacccatgatacatgccacaccttctttctgatctgggagtgggataaacacacCACAG-A---CAC-TTT-GGGG-GA-T-G-G-ACATTT-C---ATCGATTCCAA---C--C---CCC--CC--------CCC-----CC---CAATACT-----T---TT-----TTTAA--T----T---ATCT------G--A-A--ATC-G-AA-CC------G-G-G-A------T--A---------------A-CT---T--C-T------TT-T--TTTT----------------A--C---T-TTAAATT---T-G--TAGG-------A------TT--------TG-C-AA-A-T-AA-------T-A---C-A-TTTC----G-T-----AT-C-CA--------CAAAC--A--A-AA----T-A-T---TG----T--T-A--T---C-----GC-CT--C-T-GT-C--A-C-G-T--A-T-TACTAA-AAT--A-T-
gi|81459 : CACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---T--C---gttt
gi|81460 : ACAG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-GCG-A----T-C---AG-------GA---C--C---CCC--CC--------CCC-----C--------------------TT-----TTT----T----T---TTTT------A--ACC--TCCTGTTT-CT------G-G-G-A------C--A-G--A-TA--A-C--A-CTCCAT--A-TA-----TT-T--TCTTA---T-T-------CTA--C---G-TTA--TT---T-A--T--G-------T------TC--------TGATAAA-A-T-A--------T-G---C-A-TT-C----A-T-G---AT-C-ATAC------C---C--------A----T-G-T---TAATACT--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-C-G-T----T-TACT---AAT--G-T-C--A
gi|81461 : ACAG-G---CAC-TCTGGGGG-CA-T-G-GGA----T-C---AA-------TA---C--C---CCC--CC--------CCC-----CC---T-----T-----T---TT-----TTT----T----T---TTTA------A--A-A--ATCTGAAT-CT------GCG-G-A------T--A-G--A-TACAA-C--A-CT---T--ATT------TT-T--TCTT----T-T-------CTA--G---G-TTA--TT---T-A--T--G-------T------TC--------T--T-AA-A-T-A--------T-G---C-ACTT-C----A-T-G---AT-CAAT--------C---C-----A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-TCC-----GT-CT--C-T-GT-C--A-C-G-T--A-T----T-A-AAT--A-T-TCAAC----G--TT---A-GTG--ATC-ATAT-A-TAA
gi|81462 : CAG-GGCCCAC-TTT-GGGG-CAAT-G-G-A----T-C---ATT------GA---C--C---CCC--CC--------CCC-----CT---T-----T-----T---TT-----TTT----T----T---TTTTTT----A--A-A--TTCTG-ATTCT------G-GAG-A------T--A-G--A-T---A-C--A-CT---T--A-T------TT-T--TTCT----T-T-------CTA--C---G-TTA--TT---T-ATTT--G-------T------TC--------TG-T-AA-ATT-A--------T-G---C-A-TT-TCA--A-A-G---AT-C-AT--------C---C--A--A-AA----T-T-TA--TA----T--T-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-C-G----A-TATACTAA-AAT--A-TCC--AC----G--TT--CA-GTG--A-C--T-T-A-TAAaga
gi|81463 : CAGTG---CACCTT--GGGGACA-T-G-ACA----T-C---AT-------GA---C--CGATCCT--CC--------CCC-----CC---A-----T-----T---TT-----TT----------T---TTTA------A--A-A--TTCTG-TT-CTGA----G-G-G-A------TTCA-G--ATT---A-C--A-CT---T--A-T------TTGTTATCTT----T-T-------CTT--CCCGG-TTA--TT---T-AACT--G-------A------TC--------TG-T-AA-C-T-ATT------T-GCGCC-A-TT-TGCAGA-TAG---AT-C-ATATAATTTAC---C--T--A-AACAAGT-G-TCCCTA----T--T-T--T-T-TA----GT-CT--C-T-GTCC--A-C-G-T--A-T-TACT-A-AAT--A-T-C--AT----GTTTT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-aga
gi|81464 : AG-G---CAA-TA--GAAG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------GA---CACC---CCC--TC--------CCC-----CC---G-----T-----TACATT-----TAT----A----T---TTAT------C--A-T--TTCTG-AT-CT------G-G---A------T--A-G--A-C---A-A--A-CT---T--A-T------TT-T--TCTT----T-T-------CAA--T---G-TTA--TT-----A--T--G-------T------TT--------TG-C-AA-A-T-A--------C-G---C-A---------A-T-GTAAAT-C-AC--------C---C--A--A-AA----C-G-T---TA----C--G-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT----A-C-A-T--A-C-TAGT-A-AATAAA-T-C--ATAATAA--TTACTA-GTG--A-C-AT-T-A-CA
gi|81465 : AG-G---CAC-TT--GGGG-CA-T-G-G-A----T-C---AT-------G----C--C---CCC--CC--------CCC--------------------------TT-----TTT----T----T---TTTT------A--A-A--TTCTG-AT-TT------
gi|81466 : -G---CAC-TT--GGG--CA-A-G-G-A----T-C---AT-------GA---C--C---CCC--CC--------CCC-----TT---T-----T-----T---TT-----TCT----T----T---TTCTTTATTAA--A-A--ATCAG-AT-CT--------A-G-A------T--A-G--A-C---A-C--A-TG---T--A-T------TT-T--TCTT----T-T-------CTA--C---G-TTA--ATAAAT-A--T---------------------------TG-T--A-A-T-A--------T-T---C-A-TT-TA---A-A-A---AT-C-AT--------C---C--A--A-CA----T-G-T---TA----T--T-T--T-C-C------T-CT--C-T-GT-C--A---G-T--A-T--------------------------G---T--CA-TTG--A-C-AT-T-A-TAAcatttg
gi|81467 : --GGGG-CA-G-G-G-A----T-CTGCAT-------GA---C--C---CCC--TC--------CCC---------------------------T-----TTT----T----T---TTTT------A--A----TTCAG-AT-CT------G-A-G-A------T--T-G--A-T---G-C--A-CT---T--A-T------TT-T--TCTT----TAT-------CTA--C---G-TTG--AT---T-A--T--G-------TTCAATGTC--------TG-T-GA-A-T-T--------T-G---C-C-TT-A----A-T-T---TT-C-AG--------C---C--A--gg
gi|81468 : --C---CCC--CC--------CCC-----CC---T-----TACTACT---TTACTAATTA----T----T---TTTT------A--T----TTCTG-AC-CT------G-G-G-A------T--A-G--A-C---G-C--A-CT---TTAA-T------TT-T--CCTT----T-T-------ATA--C---G-TTA--AT---T-A--T--G-------T------TT--------AG-T-AA-A-T-A--------T-----C-A-TA-C----A-T------T-C-AT--------T---A--A--A-AA----TCA-T---CAT---T--T-T--T-T-C-----GT-CT----T-GT-T--A-A-G-A--A-T-CAGT-A-AAA--A-T-C--AC----G--TT--
gi|81469 : --A-T---A-C--A-TC---T----T------TT-T--TCTT--------------CTA--C---G-TTA--TT---TTA--T--G-------T------TC--------TG-T-AA-A-T-A--------TTG---C-A-TT-C----A-A-G---AT-C-A---------C---C--G--A-AA----TCG-T---TA----TGTT-T--T-T-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-C-G-T--AGT-TACT-A-AAT--A-T-C--AC----GATTT--CA-G-G--ACC-ATGT-A-TAAgaatttacatgtgactatagaga
gi|81470 : aT-T--TCTT----T-T-------CTA--C---G-TTA--TT---T-A--T--G-------T------CCACTGACTTCG-T-AA-A-T-A--------T-G---C-A-TTCC----A-T-G---AT-C-AT--------T---T--ACCA-AA----T-G-T---TA----T--TCT--T-T-C-----GTCCT--C-T-GT-TCAA-C-G-T--ATT-TACT---AAT----T-CA-AC----G--TT--CA-GTG--A-CAAT-T-A-TAAaga
gi|81471 : TA--C-----TTA--AT---T-A--T--G-------T------TT--------TG-T-AA-A-T-AATTGAATAT-A---C-A-TT-A----A-A-G---AT-C-AT--------T---T--A--A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T---C-----GT-CT--CCT-G--C--A-A-G-T--A-T-TACT-A-AAA--C-T-C--AC----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T---TAAaga
gi|81472 : --------T-G---C-A-TT-A----A-A-G---AT-C-AT--------C---C--A--A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--T-T-C-----AT-TT--C-G-GT-C--A-C-A-T--A---TAAT-A-AAC----T-C--AC----G--TT--TA-GTG--A-C-AT-
gi|81473 : T-C----A-TAG---AC-C-AT--------C---C--A--A-AA----T-G-T---GG----C--T-T--T-T-T-----GT-CT--C-T-GT-C--A-C-G-T--A-T-TAGT-ACAAT----T-C--AA----G--TTG-CA-GTG--
gi|81474 : -T-G---AT-C-AT--------C---C--AC-A-AA----T-G-T---TA----T--T-T--TTT-C-----GT-CT--C-T-GT-C--A-C-G-T--A---TACT-A-AAT--A-T-C--AT----G--TT--CA-GTG--A-C-AT-T-A-TAA