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Reference ( gi|113229 ) : CTTC-TT-A-CATGT-CAA--A-T--T---TT-C-A-C--AA-TA--TG-CG-T--C---T-T-A-C-C-AGCG----G-AG----TA--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A--AAAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-CAT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
gi|113231 : CTTC-TT-A-CATGC-CAA--A-T--T---TT-C-A-C--AA-TA--TG-CG-T--G---T-T-A-C-C-AGCG------AT----AA--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A--AAAA--A--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AA--GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-CAT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AC------------------AA------CCA-A-T---ACAA-C--A-CAT--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
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gi|113241 : CTTC-TT-A-CCTGC-CAA--A-G--T---TT-C-A-CC-AA-TA--TG-CG-T--G---T-TGA-C-C-AGCG----G-AG----AAG-TTTA-T-T----A--AT--AA-G----TC---AAAA-A-G-A-A--AT--A--AT----T--T--CT---TA--CT---T--G--A---AG--GT-T--TG-GA-GA--GC--AA--GTG-CATTTAC-TTT-A--T-----TCG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---AAAA-C--A-TA---TG-A----CA-G--T-CCGTC---C--GTTTA--A-A-TT---CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-GAT-CTTTTAAGATac
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gi|113244 : CTTT-TT-A-CATG--CAA--ACT--T---TT-C-A-C--AA-TAGTTG-TG-T--TGCATGT-A-C-C-GGCT----G-AGAATTTA--TTTA-T-C----A--AT--AA-C--C-TC---AAAA-A---A-T--AT--T--AAAA--T--T--CT---TAA-CA---A--G--A---AAA-GG-T--TG-GG-TA--GT--AA--GTG-CAT--AC-TCT-A--T-----CTG-A-A-C-A-CGA-T-AC------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G--T-GA-TC---A--G--TG--A-A-CT-A-CC-GG-AA-TT---G-CCCAC-A-G-T-C-TTT-AGATac
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gi|113250 : CTTC-TT-C-C-TG--CAA--A-G--T---TT-C-AAC--AT-CA--TGGCG-T--G---T-T-A-A-C-AGCT----G-AG----AAATTTCAGT-T----A--AT--AA-G--C--C---AAAA-A-GCA-T--AT--A--AAAA--T--T--CT---TAA-CA---TTTG--AG--AAA-GT-T--GG-AA-GA--GC--AA--GTG-CAT--AC-TCT-C--T------TGCA-A-A-A-TGA-T-AA------------------AG------TCA-A-T---ACAT-C--A-TAT--TG-A----CAAG--C-GC-TC---A--G--CG--A-A-AA-T-CC-TG-TC-TTTTAG-CTTAC-T-G-TACTTTT-AGAT
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gi|113262 : g-CAT--AC-TCT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGA-T-AA------------------AA---G--TCA-A-T---ACAT-C--A-TAT--TG-A----CA-G--C-GC-TC---A--G--CG--A-A-
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Reference ( family-559 ) : CTTC-TT-A-CATGC-CA---A--AT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G----GAG-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
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gi|113231 : CTTC-TT-A-CATGC-CA---A--AT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G-----AT-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--A--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AA--GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AC------------------AA------CCA-A-T---ACAA-C--A-CAT--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
gi|113232 : CTTC-TT-A-CATGC-CA---A--AT--TTT-C-AA--A-A-CA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G----GAT-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA----C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GG--GC--AA--GTG-C-AT---C-TTT-C--------CTG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAC--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-A-T-CTTTT-AGATac
gi|113233 : CTTC-TT-A--ATGC-AA---A--AT--TT--A-AC--T-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--T----GAG-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T---T----A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-G--T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TCT-T--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T---------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G----CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CT-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGATgc
gi|113234 : CTTC-TT-A-CATAC-TA---A--AG--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--T----GAA-A-A--TTTA-T-TTTAAA--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAT--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---ACA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TAT-C--T-----CTA-A-A-A-A-TCG-A-AA------------------AA---A--TCA-A-T---GCAA-C--A-TTT--TG-A----CA-A--T-GC-TC---A--G--CA--A-A-TC-A-CC-GG-AG-TT---G-CC--C-A-G-T-CTTTT-AGATgc
gi|113235 : CTTC-TT-A-CATGC-AA---A--AG--TTT-C-AC--G-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--T----GAA-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-G-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CAACAT--G--A---AAA-GT-T--TG-GA-GA--GC--AA--GCG-C-AT--AC-TCT-C--T-----TTG-A-A-A-A-TGA-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---GAAA-T--A-TAA--TG-A----CA-G--C-GC-TC---A--G--CG--A-A-TT-A-CC-TG-AG-TT---G-CCCAac
gi|113236 : CTTC-TTTA-CATGC-CA---A--AT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G----GAT-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AAGG--G-TCA--AAAA-A-G-A-T--AT----A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--A--GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--ACTTTT-C--T-----CTG-A-A-A-G-TGG-T--A------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TC-A----CA-G--C-CC-TA---C--G--CG--A-A-TT-A--C-GG-AG--T---G-GCCAC-AGG-T-CTTTT-AGAT
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gi|113242 : CTTC-TA-A-T-TGC-CA---G--AT--TTT-T-ACCCA-A-TAC------TG-CG-T-GT--T----A-C-CCAGC--G----GAG-A-T--TTTA-TCT----A--ATCAAA-G--C-TC---AAAA-C---A-T--ATTAA-A--AAA--T--T--CT---TAAACA---C--GC-A---AAA-GG-T--GG-GA-GA--GC--AAA-GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG---A-A-A-TGG-T-AAG-----------------AA---A--TCA-ATT---ACAAGC--A-TAC--TGTG----AA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC--G-AG-TT---G--CCAC-A-G-T-CTTTT-AGATac
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gi|113245 : CTTA-TT-A-CATGC-AA---A--AG--TTT-C-AG--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-G-AGT--T----GAA-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--CGCC---AAAA-A-G-G-TAAAA--A-A--AAA--T--T--CT---CAA-TA---T--G--A---AAA-GTAT--AA-G--GA--GC--AA--GTG-C-AT--A---TT-CAGT-----CTG-A-A-C-A-TGC-T-AT------------------AG---T--TTA-------ACAG-A--A-TAT--TG-A----CA-G--C-CA-TC---A--T--CA--A-A-TT-A-CC-GC-CG-TT---G-TCCAC-A-G-T-CCTTT-AGATac
gi|113246 : CTTC-TT-A-CATGC--A---A--AT--TTT-CCAC--G-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--T----GAG-A-A--TTTA-T-C----A--AT----------T---------------T--AT--T-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--GGAA---AAA-GT-T--AGCGAGGA--GCCAAA--GTG-C-----GC-TCT-T--T-----GTG---A-A-A-TGG-TAAA------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--ATTAT--TG-A----CA-G--CATC-TC---C--G--CG--ACATTT-A-CCGGG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-ATTTac
gi|113247 : CTTC-TT-A-CATGCATA---A--AT--GTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-C-GTG-T----A-C-C-AGC--T----GAG-A-A--TTTA-T-T----A--A---AA-G--C-T----AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--G--T--CT---TAA-CA---T--GA-A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTGAA-AT--AC--TC-C--T-----CTG-A-A-A-ATTGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-
gi|113248 : CTTC-TT-A-CATGC-CGCTGA--GT--T---C-AC--A---TA--------G-CG-T-ATCGT----A-C-C-AGC--GCTTAGAG-ATA--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--T-TC---AAAA-A-C-A-TG-AT--A-ATAAAA--T--TTCCT---TCA-CA---T--G--A---AAA--T-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-CCAT--AC-TTT-T--T-----CTG-A-A-A-A-TGGTT-AA------------------AAC--A--TCAGA-TTTAAAGA-C--C-CAT--T--A----CATG--T-CC-TCCAAC--A--CA--A-A-TT-A-TC-GG-AGTTT---GCCCCAC-A-G-T-CTCT
gi|113249 : CTTC-TT-A-CATGC-AA---A--AA--ATT-C-AG--G-A-CA-------TG-CT-A-TT--T----A-C-C-AGC--T----GCG-A-A--TTTA-T-TTTAAA--AT--AA-G--C-TT---AAAT-T-G-A-T--AT--A-A--CAA--G--T--CT---TAG-CA---T--G--A---AAA-CT-T--GG-GG-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TAT-A--TGCATATTG-ACACA-A-TGT-T-AACTTCGCCTTTTTGTATCTAA---A---CA-T-G---ATAA-CACA-TAT--TG-A----CA-----------------G--CG--A-A-TT-A-CC-AA-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
gi|113250 : CTTC-TT-C-C-TGC-AA---A--GT--TTC-A-AC--A-T-CA-------TGGCG-T-GT--T----A-A-C-AGC--T----GAG-A-AATTTCAGT-T----A--AT--AA-G--C--C---AAAA-A-GCA-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---TTTG--AG--AAA-GT-T--GG-AA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TCT-C--T------TGCA-A-A-A-TGA-T-AA------------------AG------TCA-A-T---ACAT-C--A-TAT--TG-A----CAAG--C-GC-TC---A--G--CG--A-A-AA-T-CC-TG-TC-TTTTAG-CTTAC-T-G-TACTTTT-AGATgc
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gi|113253 : TC-CT-A-CTTAA-CA---A--AA--GTT-C-AA--GTG-TA-------TG-CT-T-GT--T----A-C-C-AGC--T----GAA-C-A--TTTT-T-T----G--AT--AT-A--C-TTTTAAAAACA-G-A-A--AT--A-A--AAA--T--C--CT---TTA-CA---T--G--A---AAA-AT-G--GA-GG-GA--AC--AA--TTG-T-AT--A--TTT-A--T-----ACA-ACA-C-A-TGC-T-AT------------------AA---T--TCA-A-T-----AA-C--A-TAT--TG-AGATTCA-T--T-GA-TC---A--G--CG--A-T-TT-A-CC-AG-GG-TT---T-TCTAC-A-T-T-CCTAT-TGATa
gi|113254 : --TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G-----AG-A-A--TTTA-T-TT---A--AT--AA-G--C-TC---AAA----G-A-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-AGA-A-A-T-G-T-AA------------------AA---A--TTA-A-T---ACAA-C--A-TATTATG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-ACTT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AAATac
gi|113255 : --TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G-----AG-A-A--TTTA-T-TT---A--AT--AA-G--C-TC---AAA----G-A-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-AGA-A-A-T-G-T-AA------------------AA---A--TTA-A-T---ACAA-C--A-TATTATG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-ACTT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AAATa
gi|113256 : --TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--C----A-C-C-AGC--G----GAA-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---ATAA-a
gi|113257 : -C-AC--A-AATA-------TG-CG-T-GT--T----A-CAC-AGC--G----GAT-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--G-TC---AAAA-G-A-A-T---T--A-A--AAA--T--T--CT---TA--CA---T--G--A---AA---T-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T--A------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TC-A----C--G--C-CC-TA---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TG---G-CCCAC-AGG-T-CTTTT-AGAT
gi|113258 : C--A-A--A-------TG-CA-T-GT--TCTTCA-C-C-AGC--T----GAA-C-A--TTT--T-T----G--TT--CA----C-TT---AAAA-A-G-A-A--AT--A-G--AAA--T--C--CT---TTA-CA---T--G--A---AAT-AT-T--TT-GT-GA--CC--AA--TTA-C-A---AA-TTT-A--T-----ATT-A-A-ACA-TGA-T-AA------------------AA---T--GTA-A-T-----AA-G--A-TAT--TG-G----CA-G--C-CA-CC---A--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-CT-TT---G-TATAT-A-T-T-CTTac
gi|113259 : -TA-------TG-CG-T-TT--T----A-C-A-AGC--T----GAA-T-T--TTTG-T-C----C--AA--AC-A--C-TC---AAAA-A-G-A-A--AT--A-G--AAA--TCGT--CT-----A-CA---T--G--A---AAA-AT-G--GT-GG-GA--GC--AA--ATG-C-AT--AT-TTA-C--T-----TC------A-A-T-T-T-AA------------------GC---A--T------------A-C--A-TAT--TA-A----AA-G--T-CA-TA---A--G--CA--A-A-TT-A-CC-GG-GT-TT---G-TCTAC-A-T-TACTTTT--GAT
gi|113260 : A-------TG-TG-C-GT--T----A-C-C-AGC--T----GAA-T-A--TTTT-T-T----TTTAT--AT-A--T-TC---AAAA-A-----------------AAA--T--C--CT---TTA-TA---T--G--A---AAA--T-T--AGTGA-GA--GC--AA--TTG-C-AT--AT-Tac
gi|113261 : -GT--T----A-C-C-A-C--G----TCA-ACA--TTTA-T-T----G--AT--AT-G--T-TC---AAAA-AAG-A-A--GT--A-A--AAA--T--C--TT---TTA-CA---T--G--A---AAA-AT-G--AT-GG-GA--AC--AA--ATG-C-AT--AC-TCA-A--A-----CT----A-A-A-CAA-T-AA------------------TA---A--TTT-A-T----TAA-C--A-TAT--CG-A----CC-G--T-CC-TC---A--G--CA--A-A-TT-A-CC-GA-GG-TT---A-TCCGC-
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gi|113259 : -TA-------TG-CG-T-TT--T----A-C-A-AGC--T----GAA-T-T--TTTG-T-C----C--AA--AC-A--C-TC---AAAA-A-G-A-A--AT--A-G--AAA--TCGT--CT-----A-CA---T--G--A---AAA-AT-G--GT-GG-GA--GC--AA--ATG-C-AT--AT-TTA-C--T-----TC------A-A-T-T-T-AA------------------GC---A--T------------A-C--A-TAT--TA-A----AA-G--T-CA-TA---A--G--CA--A-A-TT-A-CC-GG-GT-TT---G-TCTAC-A-T-TACTTTT--GAT
gi|113260 : A-------TG-TG-C-GT--T----A-C-C-AGC--T----GAA-T-A--TTTT-T-T----TTTAT--AT-A--T-TC---AAAA-A-----------------AAA--T--C--CT---TTA-TA---T--G--A---AAA--T-T--AGTGA-GA--GC--AA--TTG-C-AT--AT-Tac
gi|113261 : -GT--T----A-C-C-A-C--G----TCA-ACA--TTTA-T-T----G--AT--AT-G--T-TC---AAAA-AAG-A-A--GT--A-A--AAA--T--C--TT---TTA-CA---T--G--A---AAA-AT-G--AT-GG-GA--AC--AA--ATG-C-AT--AC-TCA-A--A-----CT----A-A-A-CAA-T-AA------------------TA---A--TTT-A-T----TAA-C--A-TAT--CG-A----CC-G--T-CC-TC---A--G--CA--A-A-TT-A-CC-GA-GG-TT---A-TCCGC-
gi|113262 : -C-AT--AC-TCT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGA-T-AA------------------AA---G--TCA-A-T---ACAT-C--A-TAT--TG-A----CA-G--C-GC-TC---A--G--CG--A-A-
gi|113263 : --A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AAAT
gi|113264 : aaaatataaaaaaaaaaattaaattgaaattAA-C--A-TAT---G-A----CA-G--C-CC-TC---CCCG--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAT---G-T-CTTTT-AGATa
blockSeqs : G T G AT CTG TC CA T C CC T A GTTGTGT A G C CG CTTC G A C GCTTA TT T AT G C TTAA TT CA G GC G TTA C GC A AA TA T TA GT CG TC CTT A ACA TT GA TAG A C TA C G AC CA AA A C TT T CAG GCATA C C C C T T A CTTCGCCTTTTTGTATCT GCA AA G T TTA G AC T TA T GATT A GCC G CAAC TT GA C T A C G A T TTA C A G A A A
blockSeqs : . . A C . . . . . C . A C G . . G T . . C ATA AT C A . . TATC . T . . . A . AG A G . . . . C . A . . . C G . A . T . . . A . . . . AT . . C . . . . . G A . . . . . . . TA . A T CA . CCC . . . T . . . . . . . . G . A .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . . . . . T . . . G G . G . . TTAA . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . C . . . . . . . . . G A C . C . . . C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . . . . . G . . . G T . . . . C . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . C . . . C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . G T . . . . T . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T G . . . . T . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T A . . . . T . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . G A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . G A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T G . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T G . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T G . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . T G . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . T G . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T G . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . G
blockSeqCons :
originalCons : CTTC-TT-A-CATGC-CA---A--AT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G----GAG-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
finalCons : CTTC-TT-A-CATGC-CA---A--AT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G----GAG-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
Alignments
lowQualScore : 1111 111111111111111111
lowQualScore : 1 1 3 55 222 22 22 1 1 33 1 2 5555555 2 1 1 22 6666 1 1 2 5555555 33 2 44 1 1 3333 11 33 1 11 1 333 1 222 2 33 11 1 11 11 33 11 333 1 222 11 44 333 1 2 11 2 1 11 11 33 1 1 11 1 2222 33333 1 5 1 1 1 1 1 111111111111111111 555 11 1 1 222 1 11 1 33 1 5555 4 2222 1 333333 11 11 1 5 1 1 1 1 1 222 1 1 2 1 2 1
lowQualScore : . . . .. ... .. .. . . .. . . ....... . . . .. .... . . . ....... .. . .. . . .... .. .. . .. . ... . ... . .. .. . .. .. .. .. ... . ... .. .. ... . . .. . . .. .. .. . . .. . .... ..... . . . . . . . .................. ... .. . . ... . .. . .. . .... . .... . ...... .. .. . . . . . . . ... . . . . . .
lowQualScore : 6 6 2 99 888 22 00 4 4 22 3 6 3333333 5 2 2 99 2222 2 2 4 1111111 55 5 22 2 3 4444 88 11 3 88 3 555 3 111 7 22 88 3 88 88 22 88 777 3 333 88 55 777 3 7 88 7 3 88 88 22 3 3 88 3 0000 33333 3 3 3 3 3 3 3 222222222222222222 000 88 3 3 444 3 88 3 77 3 5555 0 7777 3 333333 88 88 3 2 3 3 3 3 3 333 3 4 9 4 9 6
consensus : CTTC-TT-A-CATGC-CA---A--AT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G----GAG-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
Reference ( family-559 ) : CTTC-TT-A-CATGC-CA---A--AT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G----GAG-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
gi|113229 : CTTC-TT-A-CATGT-CA---A--AT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-CT--T----A-C-C-AGC--G----GAG-T-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
gi|113230 : CTTC-TT-A-CATGT-CA---A--AT--TT--C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-CT--TT---A-C-CCAGC--G----GAG-T-T--TTTA-T-T----A--ATT-AA-G--C-TC---AAAA-A-G-AAT--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-ATG-T-AA------------------AA---A--TC--A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G----CC-TC---C--G--CGGAA-A-TT-A-CC-GGAAG-TT---G-CCC-C-A-G-T-CTTTT-AGAT
gi|113231 : CTTC-TT-A-CATGC-CA---A--AT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G-----AT-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--A--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AA--GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AC------------------AA------CCA-A-T---ACAA-C--A-CAT--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
gi|113232 : CTTC-TT-A-CATGC-CA---A--AT--TTT-C-AA--A-A-CA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G----GAT-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA----C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GG--GC--AA--GTG-C-AT---C-TTT-C--------CTG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAC--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-A-T-CTTTT-AGATac
gi|113233 : CTTC-TT-A--ATGC-AA---A--AT--TT--A-AC--T-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--T----GAG-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T---T----A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-G--T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TCT-T--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T---------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G----CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CT-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGATgc
gi|113234 : CTTC-TT-A-CATAC-TA---A--AG--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--T----GAA-A-A--TTTA-T-TTTAAA--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAT--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---ACA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TAT-C--T-----CTA-A-A-A-A-TCG-A-AA------------------AA---A--TCA-A-T---GCAA-C--A-TTT--TG-A----CA-A--T-GC-TC---A--G--CA--A-A-TC-A-CC-GG-AG-TT---G-CC--C-A-G-T-CTTTT-AGATgc
gi|113235 : CTTC-TT-A-CATGC-AA---A--AG--TTT-C-AC--G-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--T----GAA-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-G-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CAACAT--G--A---AAA-GT-T--TG-GA-GA--GC--AA--GCG-C-AT--AC-TCT-C--T-----TTG-A-A-A-A-TGA-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---GAAA-T--A-TAA--TG-A----CA-G--C-GC-TC---A--G--CG--A-A-TT-A-CC-TG-AG-TT---G-CCCAac
gi|113236 : CTTC-TTTA-CATGC-CA---A--AT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G----GAT-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AAGG--G-TCA--AAAA-A-G-A-T--AT----A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--A--GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--ACTTTT-C--T-----CTG-A-A-A-G-TGG-T--A------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TC-A----CA-G--C-CC-TA---C--G--CG--A-A-TT-A--C-GG-AG--T---G-GCCAC-AGG-T-CTTTT-AGAT
gi|113237 : CTCT-TT-A-CATGC-CA---ATCAT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--TT---A-C-C-AGC--G----GATTA-A--TTTA-T-C----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--G--T--CTCTTTAA--A---T--G--A---AAAAGTCT--AG-AG-GA--GC--AAAAGAG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AAA--A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--G-A-AT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCACAA-G-T-CTTTT-AGATac
gi|113238 : CCTC-TT-A-CA-GC-CA---A--ATCATTT-C-A---A-A-TA-------TGACG-TCGT--T----A-C-C-AGC--G----CAATA-A--TTTA-T-TC---A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-A-AAT--AT--A-A--AAAGTT--T--CTA--TAA-CA---T--G--ATAGAAA-GT-T--AG-GA-GG--GC--AA--GAG-C-AT--AC-TTT----T-----CTG-A-A-A---TGG-T-AA------------------AAGCAA--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G--C-CC-T----C--G--CG--A-ATTT-A-CC-GG--G-TT---G-CCCAC-A---T-CTTTT-AGATac
gi|113239 : CTTCGTT-AGCATGC-CA---A--AT--TTTTC-AC--A-AATA-------TG-CG-T-GT--T----AGC-C-AGC--G----GAA-A-AA-TTTA-T-TT---A--AT--AA-AGCC-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAG--G-----CT---TAA-CA---A--G--A---AA--GT-TTAAG-GA-GA--GC--AG--ATG-C--T--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---AAATCA-A-T---ACA--C--A-TAT--TG-AA---CAAG--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TTAA-CC-GG-AG-TT---G--CCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
gi|113240 : CTTC-TT-A-CATGC--A---A--AT--TT--C-A---A-A-TA-------TG-CGGT-GT--T----A-C-C-AGC--G----GAG-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--T-TT---CAAA-A-G-A-T--AT--ATA--AAA--TC-T--TT---TAA-AC---T--G------AAA-GT-T--GA-GA-GAACGC--AA--GTG-C-AT--AC-CTTAT--T-----CTG-A-A-A-T-CGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---A-AA-C--A-TAT--TG-AG---CA-GGCC-CC-TC---C--G--C-----A-TT-ACCC-GG-AG-TT---G--CCAC-A-G-T-CTTTT-AGATac
gi|113241 : CTTC-TT-A-CCTGC-CA---A--AG--TTT-C-ACC-A-A-TA-------TG-CG-T-GT--TG---A-C-C-AGC--G----GAG-A-AG-TTTA-T-T----A--AT--AA-G----TC---AAAA-A-G-A-A--AT--A-A--T----T--T--CT---TA--CT---T--G--A---AG--GT-T--TG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-ATTTAC-TTT-A--T-----TCG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---AAAA-C--A-TA---TG-A----CA-G--T-CCGTC---C--GTTTA--A-A-TT---CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-GAT-CTTTTAAGATac
gi|113242 : CTTC-TA-A-T-TGC-CA---G--AT--TTT-T-ACCCA-A-TAC------TG-CG-T-GT--T----A-C-CCAGC--G----GAG-A-T--TTTA-TCT----A--ATCAAA-G--C-TC---AAAA-C---A-T--ATTAA-A--AAA--T--T--CT---TAAACA---C--GC-A---AAA-GG-T--GG-GA-GA--GC--AAA-GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG---A-A-A-TGG-T-AAG-----------------AA---A--TCA-ATT---ACAAGC--A-TAC--TGTG----AA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC--G-AG-TT---G--CCAC-A-G-T-CTTTT-AGATac
gi|113243 : CCTC-TT-AACATGC--A---A--AT--TTT-C-AC--A---TA-------TG-CG---GT--T----A-C-C--GC--G----GA--A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AGAA-A---A-T--AT--A-A--AAT--T--T--CT---GAA-C----T--G--A---AAA-GT-T---G-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGT-C---------------------CC---A--TCG-A-T---ACAA-C--A-TA---TG-A----CA-G----CC-TC---C--G---G--A-A-TT-T-CC-GG--G-TT-----CCCAC---G-T-CTTTT-AGATac
gi|113244 : CTTT-TT-A-CATGC-AA---A--CT--TTT-C-AC--A-A-TAGTTGTGTTG-CA-T-GT-------A-C-C-GGC--T----GAG-A-A--TTTA-T-TTATCA--AT--AA-C--C-TC---AAAA-A---A-T--AT--T-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---A--G--A---AAA-GG-T--TG-GG-TA--GT--AA--GTG-C-AT--AC-TCT-A--T-----CTG-A-A-C-A-CGA-T-AC------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G--T-GA-TC---A--G--TG--A-A-CT-A-CC-GG-AA-TT---G-CCCAC-A-G-T-C-TTT-AGATac
gi|113245 : CTTA-TT-A-CATGC-AA---A--AG--TTT-C-AG--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-G-AGT--T----GAA-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--CGCC---AAAA-A-G-G-TAAAA--A-A--AAA--T--T--CT---CAA-TA---T--G--A---AAA-GTAT--AA-G--GA--GC--AA--GTG-C-AT--A---TT-CAGT-----CTG-A-A-C-A-TGC-T-AT------------------AG---T--TTA-------ACAG-A--A-TAT--TG-A----CA-G--C-CA-TC---A--T--CA--A-A-TT-A-CC-GC-CG-TT---G-TCCAC-A-G-T-CCTTT-AGATac
gi|113246 : CTTC-TT-A-CATGC--A---A--AT--TTT-CCAC--G-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--T----GAG-A-A--TTTA-T-C----A--AT----------T---------------T--AT--T-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--GGAA---AAA-GT-T--AGCGAGGA--GCCAAA--GTG-C-----GC-TCT-T--T-----GTG---A-A-A-TGG-TAAA------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--ATTAT--TG-A----CA-G--CATC-TC---C--G--CG--ACATTT-A-CCGGG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-ATTTac
gi|113247 : CTTC-TT-A-CATGCATA---A--AT--GTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-C-GTG-T----A-C-C-AGC--T----GAG-A-A--TTTA-T-T----A--A---AA-G--C-T----AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--G--T--CT---TAA-CA---T--GA-A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTGAA-AT--AC--TC-C--T-----CTG-A-A-A-ATTGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-
gi|113248 : CTTC-TT-A-CATGC-CGCTGA--GT--T---C-AC--A---TA--------G-CG-T-ATCGT----A-C-C-AGC--GCTTAGAG-ATA--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--T-TC---AAAA-A-C-A-TG-AT--A-ATAAAA--T--TTCCT---TCA-CA---T--G--A---AAA--T-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-CCAT--AC-TTT-T--T-----CTG-A-A-A-A-TGGTT-AA------------------AAC--A--TCAGA-TTTAAAGA-C--C-CAT--T--A----CATG--T-CC-TCCAAC--A--CA--A-A-TT-A-TC-GG-AGTTT---GCCCCAC-A-G-T-CTCT
gi|113249 : CTTC-TT-A-CATGC-AA---A--AA--ATT-C-AG--G-A-CA-------TG-CT-A-TT--T----A-C-C-AGC--T----GCG-A-A--TTTA-T-TTTAAA--AT--AA-G--C-TT---AAAT-T-G-A-T--AT--A-A--CAA--G--T--CT---TAG-CA---T--G--A---AAA-CT-T--GG-GG-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TAT-A--TGCATATTG-ACACA-A-TGT-T-AACTTCGCCTTTTTGTATCTAA---A---CA-T-G---ATAA-CACA-TAT--TG-A----CA-----------------G--CG--A-A-TT-A-CC-AA-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
gi|113250 : CTTC-TT-C-C-TGC-AA---A--GT--TTC-A-AC--A-T-CA-------TGGCG-T-GT--T----A-A-C-AGC--T----GAG-A-AATTTCAGT-T----A--AT--AA-G--C--C---AAAA-A-GCA-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---TTTG--AG--AAA-GT-T--GG-AA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TCT-C--T------TGCA-A-A-A-TGA-T-AA------------------AG------TCA-A-T---ACAT-C--A-TAT--TG-A----CAAG--C-GC-TC---A--G--CG--A-A-AA-T-CC-TG-TC-TTTTAG-CTTAC-T-G-TACTTTT-AGATgc
gi|113251 : CTTC-TT-A-CATAC-AA---A--AG--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGCATA----AAG-A-T--TTTA-a
gi|113252 : TTC-TT-G-CAGGC-CA---A--AT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-CA--T----A-C-C-AGC--A----GA
gi|113253 : TC-CT-A-CTTAA-CA---A--AA--GTT-C-AA--GTG-TA-------TG-CT-T-GT--T----A-C-C-AGC--T----GAA-C-A--TTTT-T-T----G--AT--AT-A--C-TTTTAAAAACA-G-A-A--AT--A-A--AAA--T--C--CT---TTA-CA---T--G--A---AAA-AT-G--GA-GG-GA--AC--AA--TTG-T-AT--A--TTT-A--T-----ACA-ACA-C-A-TGC-T-AT------------------AA---T--TCA-A-T-----AA-C--A-TAT--TG-AGATTCA-T--T-GA-TC---A--G--CG--A-T-TT-A-CC-AG-GG-TT---T-TCTAC-A-T-T-CCTAT-TGATa
gi|113254 : --TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G-----AG-A-A--TTTA-T-TT---A--AT--AA-G--C-TC---AAA----G-A-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-AGA-A-A-T-G-T-AA------------------AA---A--TTA-A-T---ACAA-C--A-TATTATG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-ACTT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AAATac
gi|113255 : --TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G-----AG-A-A--TTTA-T-TT---A--AT--AA-G--C-TC---AAA----G-A-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-AGA-A-A-T-G-T-AA------------------AA---A--TTA-A-T---ACAA-C--A-TATTATG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-ACTT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AAATa
gi|113256 : --TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--C----A-C-C-AGC--G----GAA-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---ATAA-a
gi|113257 : -C-AC--A-AATA-------TG-CG-T-GT--T----A-CAC-AGC--G----GAT-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--G-TC---AAAA-G-A-A-T---T--A-A--AAA--T--T--CT---TA--CA---T--G--A---AA---T-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T--A------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TC-A----C--G--C-CC-TA---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TG---G-CCCAC-AGG-T-CTTTT-AGAT
gi|113258 : C--A-A--A-------TG-CA-T-GT--TCTTCA-C-C-AGC--T----GAA-C-A--TTT--T-T----G--TT--CA----C-TT---AAAA-A-G-A-A--AT--A-G--AAA--T--C--CT---TTA-CA---T--G--A---AAT-AT-T--TT-GT-GA--CC--AA--TTA-C-A---AA-TTT-A--T-----ATT-A-A-ACA-TGA-T-AA------------------AA---T--GTA-A-T-----AA-G--A-TAT--TG-G----CA-G--C-CA-CC---A--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-CT-TT---G-TATAT-A-T-T-CTTac
gi|113259 : -TA-------TG-CG-T-TT--T----A-C-A-AGC--T----GAA-T-T--TTTG-T-C----C--AA--AC-A--C-TC---AAAA-A-G-A-A--AT--A-G--AAA--TCGT--CT-----A-CA---T--G--A---AAA-AT-G--GT-GG-GA--GC--AA--ATG-C-AT--AT-TTA-C--T-----TC------A-A-T-T-T-AA------------------GC---A--T------------A-C--A-TAT--TA-A----AA-G--T-CA-TA---A--G--CA--A-A-TT-A-CC-GG-GT-TT---G-TCTAC-A-T-TACTTTT--GAT
gi|113260 : A-------TG-TG-C-GT--T----A-C-C-AGC--T----GAA-T-A--TTTT-T-T----TTTAT--AT-A--T-TC---AAAA-A-----------------AAA--T--C--CT---TTA-TA---T--G--A---AAA--T-T--AGTGA-GA--GC--AA--TTG-C-AT--AT-Tac
gi|113261 : -GT--T----A-C-C-A-C--G----TCA-ACA--TTTA-T-T----G--AT--AT-G--T-TC---AAAA-AAG-A-A--GT--A-A--AAA--T--C--TT---TTA-CA---T--G--A---AAA-AT-G--AT-GG-GA--AC--AA--ATG-C-AT--AC-TCA-A--A-----CT----A-A-A-CAA-T-AA------------------TA---A--TTT-A-T----TAA-C--A-TAT--CG-A----CC-G--T-CC-TC---A--G--CA--A-A-TT-A-CC-GA-GG-TT---A-TCCGC-
gi|113262 : -C-AT--AC-TCT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGA-T-AA------------------AA---G--TCA-A-T---ACAT-C--A-TAT--TG-A----CA-G--C-GC-TC---A--G--CG--A-A-
gi|113263 : --A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AAAT
gi|113264 : aaaatataaaaaaaaaaattaaattgaaattAA-C--A-TAT---G-A----CA-G--C-CC-TC---CCCG--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAT---G-T-CTTTT-AGATa