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lowQualScore                  :     .  . .    ..   .. .... ...  . . . ..  .  ..  .  . ...... . . . . .   ..... . .........    . . .... ..  ..  . .. .  ...    . ... . ..  .. ..    .. .. ..  ...   .  ... .. .. ...   .  . ..  .  .  ..  ..  ..   .   ..  .   .... .....   . . . . .   . .  ..................  ... ..   . . ...    . .. .   ..  . ....  . ....  .  ...... ..  .. . .  . .  .  .  .  ... .     . . . .     .    
lowQualScore                  :     7  7 5    00   44 0000 777  5 5 5 55  7  22  7  3 999999 5 8 2 2 5   77777 3 111111111    3 3 0000 88  22  3 88 3  777    3 555 8 33  99 33    99 33 99  888   4  444 99 77 888   4  8 99  8  4  99  99  33   7   88  3   4444 44444   4 5 4 4 4   4 4  666666666666666666  222 99   4 4 555    4 99 4   88  4 7777  1 2222  4  888888 99  88 3 3  4 4  4  4  4  444 4     4 0 5 0     7    
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Reference ( gi|113229 )       : CTTC-TT-A-CATGT-CAA--A-T--T---TT-C-A-C--AA-TA--TG-CG-T--C---T-T-A-C-C-AGCG----G-AG----TA--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A--AAAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-CAT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
gi|113231                     : CTTC-TT-A-CATGC-CAA--A-T--T---TT-C-A-C--AA-TA--TG-CG-T--G---T-T-A-C-C-AGCG------AT----AA--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A--AAAA--A--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AA--GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-CAT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AC------------------AA------CCA-A-T---ACAA-C--A-CAT--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
gi|113232                     : CTTC-TT-A-CATGC-CAA--A-T--T---TT-C-A-A--AA-CA--TG-CG-T--G---T-T-A-C-C-AGCG----G-AT----AA--TTTA-T-T----A--AT--AA----C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A--AAAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GG--GC--AA--GTG-CAT---C-TTT-C--------CTG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAC--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-A-T-CTTTT-AGATac
gi|113230                     : CTTC-TT-A-CATGT-CAA--A-T--T---T--C-A-C--AA-TA--TG-CG-T--C---T-TTA-C-CCAGCG----G-AG----TT--TTTA-T-T----A--ATT-AA-G--C-TC---AAAA-A-G-AAT--AT--A--AAAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-CAT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-ATG-T-AA------------------AA---A--TC--A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G----CC-TC---C--G--CGGAA-A-TT-A-CC-GGAAG-TT---G-CCC-C-A-G-T-CTTTT-AGATgc
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gi|113239                     : CTTCGTT-AGCATGC-CAA--A-T--T---TTTC-A-C--AAATA--TG-CG-T--G---T-T-AGC-C-AGCG----G-AA----AAA-TTTA-T-TT---A--AT--AA-AGCC-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A--AAAG--G-----CT---TAA-CA---A--G--A---AA--GT-TTAAG-GA-GA--GC--AG--ATG-C-T--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---AAATCA-A-T---ACA--C--A-TAT--TG-AA---CAAG--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TTAA-CC-GG-AG-TT---G--CCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
gi|113240                     : CTTC-TT-A-CATG--CAA--A-T--T---T--C-A----AA-TA--TG-CGGT--G---T-T-A-C-C-AGCG----G-AG----AA--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--T-TT---CAAA-A-G-A-T--AT--AT-AAAA--TC-T--TT---TAA-AC---T--G------AAA-GT-T--GA-GA-GAACGC--AA--GTG-CAT--AC-CTTAT--T-----CTG-A-A-A-T-CGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---A-AA-C--A-TAT--TG-AG---CA-GGCC-CC-TC---C--G--C-----A-TT-ACCC-GG-AG-TT---G--CCAC-A-G-T-CTTTT-AGATac
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gi|113243                     : CCTC-TT-AACATG--CAA--A-T--T---TT-C-A-C--A--TA--TG-CG-G------T-T-A-C-C--GCG----G-AA-----A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AGAA-A---A-T--AT--A--AAAT--T--T--CT---GAA-C----T--G--A---AAA-GT-T---G-GA-GA--GC--AA--GTG-CAT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGT-C---------------------CC---A--TCG-A-T---ACAA-C--A-TA---TG-A----CA-G----CC-TC---C--G---G--A-A-TT-T-CC-GG--G-TT-----CCCAC---G-T-CTTTT-AGATac
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gi|113242                     : CTTC-TA-A-T-TGC-CAG--A-T--T---TT-T-A-CCCAA-TAC-TG-CG-T--G---T-T-A-C-CCAGCG----G-AG----AT--TTTA-TCT----A--ATCAAA-G--C-TC---AAAA-C---A-T--ATTAA--AAAA--T--T--CT---TAAACA---C--GC-A---AAA-GG-T--GG-GA-GA--GC--AAA-GTG-CAT--AC-TTT-C--T-----CTG---A-A-A-TGG-T-AAG-----------------AA---A--TCA-ATT---ACAAGC--A-TAC--TGTG----AA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC--G-AG-TT---G--CCAC-A-G-T-CTTTT-AGATac
gi|113246                     : CTTC-TT-A-CATG--CAA--A-T--T---TT-CCA-C--GA-TA--TG-CG-T--G---T-T-A-C-C-AGCT----G-AG----AA--TTTA-T-C----A--AT----------T---------------T--AT--T--AAAA--T--T--CT---TAA-CA---T--GGAA---AAA-GT-T--AGCGAGGA--GCCAAA--GTG-C----GC-TCT-T--T-----GTG---A-A-A-TGG-TAAA------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--ATTAT--TG-A----CA-G--CATC-TC---C--G--CG--ACATTT-A-CCGGG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-ATTTac
gi|113245                     : CTTA-TT-A-CATGC-AAA--A-G--T---TT-C-A-G--AA-TA--TG-CG-T--G---T-T-A-C-G-AGTT----G-AA----AA--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--CGCC---AAAA-A-G-G-TAAAA--A--AAAA--T--T--CT---CAA-TA---T--G--A---AAA-GTAT--AA-G--GA--GC--AA--GTG-CAT--A---TT-CAGT-----CTG-A-A-C-A-TGC-T-AT------------------AG---T--TTA-------ACAG-A--A-TAT--TG-A----CA-G--C-CA-TC---A--T--CA--A-A-TT-A-CC-GC-CG-TT---G-TCCAC-A-G-T-CCTTT-AGAT
gi|113247                     : CTTC-TT-A-CATGCATAA--A-T--G---TT-C-A-C--AA-TA--TG-CG-C--G---TGT-A-C-C-AGCT----G-AG----AA--TTTA-T-T----A--A---AA-G--C-T----AAAA-A-G-A-T--AT--A--AAAA--G--T--CT---TAA-CA---T--GA-A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTGAAAT--AC--TC-C--T-----CTG-A-A-A-ATTGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-ac
gi|113248                     : CTTC-TT-A-CATGC-CG-----C--TGAGTT-C-A-C--A--TA---G-CG-TATC---G-T-A-C-C-AGCGCTTAG-AGA---TA--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--T-TC---AAAA-A-C-A-TG-AT--AATAAAA--T--TTCCT---TCA-CA---T--G--A---AAA--T-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTGCCAT--AC-TTT-T--T-----CTG-A-A-A-A-TGGTT-AA------------------AAC--A--TCAGA-TTTAAAGA-C--C-CAT--T--A----CATG--T-CC-TCCAAC--A--CA--A-A-TT-A-TC-GG-AGTTT---GCCCCAC-A-G-T-CTCT
gi|113250                     : CTTC-TT-C-C-TG--CAA--A-G--T---TT-C-AAC--AT-CA--TGGCG-T--G---T-T-A-A-C-AGCT----G-AG----AAATTTCAGT-T----A--AT--AA-G--C--C---AAAA-A-GCA-T--AT--A--AAAA--T--T--CT---TAA-CA---TTTG--AG--AAA-GT-T--GG-AA-GA--GC--AA--GTG-CAT--AC-TCT-C--T------TGCA-A-A-A-TGA-T-AA------------------AG------TCA-A-T---ACAT-C--A-TAT--TG-A----CAAG--C-GC-TC---A--G--CG--A-A-AA-T-CC-TG-TC-TTTTAG-CTTAC-T-G-TACTTTT-AGAT
gi|113249                     : CTTC-TT-A-CATGC-AAA--A-A--A---TT-C-A-G--GA-CA--TG-CT-A--T---T-T-A-C-C-AGCT----G-CG----AA--TTTA-T-TTTAAA--AT--AA-G--C-TT---AAAT-T-G-A-T--AT--A--ACAA--G--T--CT---TAG-CA---T--G--A---AAA-CT-T--GG-GG-GA--GC--AA--GTG-CAT--AC-TAT-A--TGCATATTG-ACACA-A-TGT-T-AACTTCGCCTTTTTGTATCTAA---A---CA-T-G---ATAA-CACA-TAT--TG-A----CA-----------------G--CG--A-A-TT-A-CC-AA-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGATa
gi|113251                     : CTTC-TT-A-CATAC-AAA--A-G--T---TT-C-A-C--AA-TA--TG-CG-T--G---T-T-A-C-C-AGCgc
gi|113252                     :  TTC-TT-G-CAGGC-CAA--A-T--T---TT-C-A-C--AA-TA--TG-CG-T--C---A-T-A-C-C-AGCA----G-Aataaagatttta
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Reference ( family-559 )      : CTTC-TT-A-CATGC-CA---A--AT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G----GAG-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
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gi|113243                     : CCTC-TT-AACATGC--A---A--AT--TTT-C-AC--A---TA-------TG-CG---GT--T----A-C-C--GC--G----GA--A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AGAA-A---A-T--AT--A-A--AAT--T--T--CT---GAA-C----T--G--A---AAA-GT-T---G-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGT-C---------------------CC---A--TCG-A-T---ACAA-C--A-TA---TG-A----CA-G----CC-TC---C--G---G--A-A-TT-T-CC-GG--G-TT-----CCCAC---G-T-CTTTT-AGATac
gi|113244                     : CTTT-TT-A-CATGC-AA---A--CT--TTT-C-AC--A-A-TAGTTGTGTTG-CA-T-GT-------A-C-C-GGC--T----GAG-A-A--TTTA-T-TTATCA--AT--AA-C--C-TC---AAAA-A---A-T--AT--T-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---A--G--A---AAA-GG-T--TG-GG-TA--GT--AA--GTG-C-AT--AC-TCT-A--T-----CTG-A-A-C-A-CGA-T-AC------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G--T-GA-TC---A--G--TG--A-A-CT-A-CC-GG-AA-TT---G-CCCAC-A-G-T-C-TTT-AGATac
gi|113245                     : CTTA-TT-A-CATGC-AA---A--AG--TTT-C-AG--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-G-AGT--T----GAA-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--CGCC---AAAA-A-G-G-TAAAA--A-A--AAA--T--T--CT---CAA-TA---T--G--A---AAA-GTAT--AA-G--GA--GC--AA--GTG-C-AT--A---TT-CAGT-----CTG-A-A-C-A-TGC-T-AT------------------AG---T--TTA-------ACAG-A--A-TAT--TG-A----CA-G--C-CA-TC---A--T--CA--A-A-TT-A-CC-GC-CG-TT---G-TCCAC-A-G-T-CCTTT-AGATac
gi|113246                     : CTTC-TT-A-CATGC--A---A--AT--TTT-CCAC--G-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--T----GAG-A-A--TTTA-T-C----A--AT----------T---------------T--AT--T-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--GGAA---AAA-GT-T--AGCGAGGA--GCCAAA--GTG-C-----GC-TCT-T--T-----GTG---A-A-A-TGG-TAAA------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--ATTAT--TG-A----CA-G--CATC-TC---C--G--CG--ACATTT-A-CCGGG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-ATTTac
gi|113247                     : CTTC-TT-A-CATGCATA---A--AT--GTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-C-GTG-T----A-C-C-AGC--T----GAG-A-A--TTTA-T-T----A--A---AA-G--C-T----AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--G--T--CT---TAA-CA---T--GA-A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTGAA-AT--AC--TC-C--T-----CTG-A-A-A-ATTGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-
gi|113248                     : CTTC-TT-A-CATGC-CGCTGA--GT--T---C-AC--A---TA--------G-CG-T-ATCGT----A-C-C-AGC--GCTTAGAG-ATA--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--T-TC---AAAA-A-C-A-TG-AT--A-ATAAAA--T--TTCCT---TCA-CA---T--G--A---AAA--T-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-CCAT--AC-TTT-T--T-----CTG-A-A-A-A-TGGTT-AA------------------AAC--A--TCAGA-TTTAAAGA-C--C-CAT--T--A----CATG--T-CC-TCCAAC--A--CA--A-A-TT-A-TC-GG-AGTTT---GCCCCAC-A-G-T-CTCT
gi|113249                     : CTTC-TT-A-CATGC-AA---A--AA--ATT-C-AG--G-A-CA-------TG-CT-A-TT--T----A-C-C-AGC--T----GCG-A-A--TTTA-T-TTTAAA--AT--AA-G--C-TT---AAAT-T-G-A-T--AT--A-A--CAA--G--T--CT---TAG-CA---T--G--A---AAA-CT-T--GG-GG-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TAT-A--TGCATATTG-ACACA-A-TGT-T-AACTTCGCCTTTTTGTATCTAA---A---CA-T-G---ATAA-CACA-TAT--TG-A----CA-----------------G--CG--A-A-TT-A-CC-AA-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
gi|113250                     : CTTC-TT-C-C-TGC-AA---A--GT--TTC-A-AC--A-T-CA-------TGGCG-T-GT--T----A-A-C-AGC--T----GAG-A-AATTTCAGT-T----A--AT--AA-G--C--C---AAAA-A-GCA-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---TTTG--AG--AAA-GT-T--GG-AA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TCT-C--T------TGCA-A-A-A-TGA-T-AA------------------AG------TCA-A-T---ACAT-C--A-TAT--TG-A----CAAG--C-GC-TC---A--G--CG--A-A-AA-T-CC-TG-TC-TTTTAG-CTTAC-T-G-TACTTTT-AGATgc
gi|113251                     : CTTC-TT-A-CATAC-AA---A--AG--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGCATA----AAG-A-T--TTTA-a
gi|113252                     :  TTC-TT-G-CAGGC-CA---A--AT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-CA--T----A-C-C-AGC--A----GA
gi|113253                     :   TC-CT-A-CTTAA-CA---A--AA--GTT-C-AA--GTG-TA-------TG-CT-T-GT--T----A-C-C-AGC--T----GAA-C-A--TTTT-T-T----G--AT--AT-A--C-TTTTAAAAACA-G-A-A--AT--A-A--AAA--T--C--CT---TTA-CA---T--G--A---AAA-AT-G--GA-GG-GA--AC--AA--TTG-T-AT--A--TTT-A--T-----ACA-ACA-C-A-TGC-T-AT------------------AA---T--TCA-A-T-----AA-C--A-TAT--TG-AGATTCA-T--T-GA-TC---A--G--CG--A-T-TT-A-CC-AG-GG-TT---T-TCTAC-A-T-T-CCTAT-TGATa
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Reference ( family-559 )      : CTTC-TT-A-CATGC-CA---A--AT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G----GAG-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
gi|113229                     : CTTC-TT-A-CATGT-CA---A--AT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-CT--T----A-C-C-AGC--G----GAG-T-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
gi|113230                     : CTTC-TT-A-CATGT-CA---A--AT--TT--C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-CT--TT---A-C-CCAGC--G----GAG-T-T--TTTA-T-T----A--ATT-AA-G--C-TC---AAAA-A-G-AAT--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-ATG-T-AA------------------AA---A--TC--A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G----CC-TC---C--G--CGGAA-A-TT-A-CC-GGAAG-TT---G-CCC-C-A-G-T-CTTTT-AGAT
gi|113231                     : CTTC-TT-A-CATGC-CA---A--AT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G-----AT-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--A--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AA--GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AC------------------AA------CCA-A-T---ACAA-C--A-CAT--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
gi|113232                     : CTTC-TT-A-CATGC-CA---A--AT--TTT-C-AA--A-A-CA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G----GAT-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA----C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GG--GC--AA--GTG-C-AT---C-TTT-C--------CTG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAC--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-A-T-CTTTT-AGATac
gi|113233                     : CTTC-TT-A--ATGC-AA---A--AT--TT--A-AC--T-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--T----GAG-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T---T----A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-G--T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TCT-T--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T---------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G----CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CT-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGATgc
gi|113234                     : CTTC-TT-A-CATAC-TA---A--AG--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--T----GAA-A-A--TTTA-T-TTTAAA--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAT--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---ACA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TAT-C--T-----CTA-A-A-A-A-TCG-A-AA------------------AA---A--TCA-A-T---GCAA-C--A-TTT--TG-A----CA-A--T-GC-TC---A--G--CA--A-A-TC-A-CC-GG-AG-TT---G-CC--C-A-G-T-CTTTT-AGATgc
gi|113235                     : CTTC-TT-A-CATGC-AA---A--AG--TTT-C-AC--G-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--T----GAA-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-G-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CAACAT--G--A---AAA-GT-T--TG-GA-GA--GC--AA--GCG-C-AT--AC-TCT-C--T-----TTG-A-A-A-A-TGA-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---GAAA-T--A-TAA--TG-A----CA-G--C-GC-TC---A--G--CG--A-A-TT-A-CC-TG-AG-TT---G-CCCAac
gi|113236                     : CTTC-TTTA-CATGC-CA---A--AT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G----GAT-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AAGG--G-TCA--AAAA-A-G-A-T--AT----A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--A--GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--ACTTTT-C--T-----CTG-A-A-A-G-TGG-T--A------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TC-A----CA-G--C-CC-TA---C--G--CG--A-A-TT-A--C-GG-AG--T---G-GCCAC-AGG-T-CTTTT-AGAT
gi|113237                     : CTCT-TT-A-CATGC-CA---ATCAT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--TT---A-C-C-AGC--G----GATTA-A--TTTA-T-C----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--G--T--CTCTTTAA--A---T--G--A---AAAAGTCT--AG-AG-GA--GC--AAAAGAG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AAA--A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--G-A-AT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCACAA-G-T-CTTTT-AGATac
gi|113238                     : CCTC-TT-A-CA-GC-CA---A--ATCATTT-C-A---A-A-TA-------TGACG-TCGT--T----A-C-C-AGC--G----CAATA-A--TTTA-T-TC---A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-A-AAT--AT--A-A--AAAGTT--T--CTA--TAA-CA---T--G--ATAGAAA-GT-T--AG-GA-GG--GC--AA--GAG-C-AT--AC-TTT----T-----CTG-A-A-A---TGG-T-AA------------------AAGCAA--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G--C-CC-T----C--G--CG--A-ATTT-A-CC-GG--G-TT---G-CCCAC-A---T-CTTTT-AGATac
gi|113239                     : CTTCGTT-AGCATGC-CA---A--AT--TTTTC-AC--A-AATA-------TG-CG-T-GT--T----AGC-C-AGC--G----GAA-A-AA-TTTA-T-TT---A--AT--AA-AGCC-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAG--G-----CT---TAA-CA---A--G--A---AA--GT-TTAAG-GA-GA--GC--AG--ATG-C--T--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---AAATCA-A-T---ACA--C--A-TAT--TG-AA---CAAG--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TTAA-CC-GG-AG-TT---G--CCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
gi|113240                     : CTTC-TT-A-CATGC--A---A--AT--TT--C-A---A-A-TA-------TG-CGGT-GT--T----A-C-C-AGC--G----GAG-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--T-TT---CAAA-A-G-A-T--AT--ATA--AAA--TC-T--TT---TAA-AC---T--G------AAA-GT-T--GA-GA-GAACGC--AA--GTG-C-AT--AC-CTTAT--T-----CTG-A-A-A-T-CGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---A-AA-C--A-TAT--TG-AG---CA-GGCC-CC-TC---C--G--C-----A-TT-ACCC-GG-AG-TT---G--CCAC-A-G-T-CTTTT-AGATac
gi|113241                     : CTTC-TT-A-CCTGC-CA---A--AG--TTT-C-ACC-A-A-TA-------TG-CG-T-GT--TG---A-C-C-AGC--G----GAG-A-AG-TTTA-T-T----A--AT--AA-G----TC---AAAA-A-G-A-A--AT--A-A--T----T--T--CT---TA--CT---T--G--A---AG--GT-T--TG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-ATTTAC-TTT-A--T-----TCG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---AAAA-C--A-TA---TG-A----CA-G--T-CCGTC---C--GTTTA--A-A-TT---CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-GAT-CTTTTAAGATac
gi|113242                     : CTTC-TA-A-T-TGC-CA---G--AT--TTT-T-ACCCA-A-TAC------TG-CG-T-GT--T----A-C-CCAGC--G----GAG-A-T--TTTA-TCT----A--ATCAAA-G--C-TC---AAAA-C---A-T--ATTAA-A--AAA--T--T--CT---TAAACA---C--GC-A---AAA-GG-T--GG-GA-GA--GC--AAA-GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG---A-A-A-TGG-T-AAG-----------------AA---A--TCA-ATT---ACAAGC--A-TAC--TGTG----AA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC--G-AG-TT---G--CCAC-A-G-T-CTTTT-AGATac
gi|113243                     : CCTC-TT-AACATGC--A---A--AT--TTT-C-AC--A---TA-------TG-CG---GT--T----A-C-C--GC--G----GA--A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AGAA-A---A-T--AT--A-A--AAT--T--T--CT---GAA-C----T--G--A---AAA-GT-T---G-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGT-C---------------------CC---A--TCG-A-T---ACAA-C--A-TA---TG-A----CA-G----CC-TC---C--G---G--A-A-TT-T-CC-GG--G-TT-----CCCAC---G-T-CTTTT-AGATac
gi|113244                     : CTTT-TT-A-CATGC-AA---A--CT--TTT-C-AC--A-A-TAGTTGTGTTG-CA-T-GT-------A-C-C-GGC--T----GAG-A-A--TTTA-T-TTATCA--AT--AA-C--C-TC---AAAA-A---A-T--AT--T-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---A--G--A---AAA-GG-T--TG-GG-TA--GT--AA--GTG-C-AT--AC-TCT-A--T-----CTG-A-A-C-A-CGA-T-AC------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G--T-GA-TC---A--G--TG--A-A-CT-A-CC-GG-AA-TT---G-CCCAC-A-G-T-C-TTT-AGATac
gi|113245                     : CTTA-TT-A-CATGC-AA---A--AG--TTT-C-AG--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-G-AGT--T----GAA-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--CGCC---AAAA-A-G-G-TAAAA--A-A--AAA--T--T--CT---CAA-TA---T--G--A---AAA-GTAT--AA-G--GA--GC--AA--GTG-C-AT--A---TT-CAGT-----CTG-A-A-C-A-TGC-T-AT------------------AG---T--TTA-------ACAG-A--A-TAT--TG-A----CA-G--C-CA-TC---A--T--CA--A-A-TT-A-CC-GC-CG-TT---G-TCCAC-A-G-T-CCTTT-AGATac
gi|113246                     : CTTC-TT-A-CATGC--A---A--AT--TTT-CCAC--G-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--T----GAG-A-A--TTTA-T-C----A--AT----------T---------------T--AT--T-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--GGAA---AAA-GT-T--AGCGAGGA--GCCAAA--GTG-C-----GC-TCT-T--T-----GTG---A-A-A-TGG-TAAA------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--ATTAT--TG-A----CA-G--CATC-TC---C--G--CG--ACATTT-A-CCGGG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-ATTTac
gi|113247                     : CTTC-TT-A-CATGCATA---A--AT--GTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-C-GTG-T----A-C-C-AGC--T----GAG-A-A--TTTA-T-T----A--A---AA-G--C-T----AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--G--T--CT---TAA-CA---T--GA-A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTGAA-AT--AC--TC-C--T-----CTG-A-A-A-ATTGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-
gi|113248                     : CTTC-TT-A-CATGC-CGCTGA--GT--T---C-AC--A---TA--------G-CG-T-ATCGT----A-C-C-AGC--GCTTAGAG-ATA--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--T-TC---AAAA-A-C-A-TG-AT--A-ATAAAA--T--TTCCT---TCA-CA---T--G--A---AAA--T-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-CCAT--AC-TTT-T--T-----CTG-A-A-A-A-TGGTT-AA------------------AAC--A--TCAGA-TTTAAAGA-C--C-CAT--T--A----CATG--T-CC-TCCAAC--A--CA--A-A-TT-A-TC-GG-AGTTT---GCCCCAC-A-G-T-CTCT
gi|113249                     : CTTC-TT-A-CATGC-AA---A--AA--ATT-C-AG--G-A-CA-------TG-CT-A-TT--T----A-C-C-AGC--T----GCG-A-A--TTTA-T-TTTAAA--AT--AA-G--C-TT---AAAT-T-G-A-T--AT--A-A--CAA--G--T--CT---TAG-CA---T--G--A---AAA-CT-T--GG-GG-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TAT-A--TGCATATTG-ACACA-A-TGT-T-AACTTCGCCTTTTTGTATCTAA---A---CA-T-G---ATAA-CACA-TAT--TG-A----CA-----------------G--CG--A-A-TT-A-CC-AA-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
gi|113250                     : CTTC-TT-C-C-TGC-AA---A--GT--TTC-A-AC--A-T-CA-------TGGCG-T-GT--T----A-A-C-AGC--T----GAG-A-AATTTCAGT-T----A--AT--AA-G--C--C---AAAA-A-GCA-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---TTTG--AG--AAA-GT-T--GG-AA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TCT-C--T------TGCA-A-A-A-TGA-T-AA------------------AG------TCA-A-T---ACAT-C--A-TAT--TG-A----CAAG--C-GC-TC---A--G--CG--A-A-AA-T-CC-TG-TC-TTTTAG-CTTAC-T-G-TACTTTT-AGATgc
gi|113251                     : CTTC-TT-A-CATAC-AA---A--AG--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGCATA----AAG-A-T--TTTA-a
gi|113252                     :  TTC-TT-G-CAGGC-CA---A--AT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-CA--T----A-C-C-AGC--A----GA
gi|113253                     :   TC-CT-A-CTTAA-CA---A--AA--GTT-C-AA--GTG-TA-------TG-CT-T-GT--T----A-C-C-AGC--T----GAA-C-A--TTTT-T-T----G--AT--AT-A--C-TTTTAAAAACA-G-A-A--AT--A-A--AAA--T--C--CT---TTA-CA---T--G--A---AAA-AT-G--GA-GG-GA--AC--AA--TTG-T-AT--A--TTT-A--T-----ACA-ACA-C-A-TGC-T-AT------------------AA---T--TCA-A-T-----AA-C--A-TAT--TG-AGATTCA-T--T-GA-TC---A--G--CG--A-T-TT-A-CC-AG-GG-TT---T-TCTAC-A-T-T-CCTAT-TGATa
gi|113254                     :                           --TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G-----AG-A-A--TTTA-T-TT---A--AT--AA-G--C-TC---AAA----G-A-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-AGA-A-A-T-G-T-AA------------------AA---A--TTA-A-T---ACAA-C--A-TATTATG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-ACTT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AAATac
gi|113255                     :                           --TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G-----AG-A-A--TTTA-T-TT---A--AT--AA-G--C-TC---AAA----G-A-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-AGA-A-A-T-G-T-AA------------------AA---A--TTA-A-T---ACAA-C--A-TATTATG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-ACTT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AAATa
gi|113256                     :                           --TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--C----A-C-C-AGC--G----GAA-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---ATAA-a
gi|113257                     :                                -C-AC--A-AATA-------TG-CG-T-GT--T----A-CAC-AGC--G----GAT-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--G-TC---AAAA-G-A-A-T---T--A-A--AAA--T--T--CT---TA--CA---T--G--A---AA---T-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T--A------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TC-A----C--G--C-CC-TA---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TG---G-CCCAC-AGG-T-CTTTT-AGAT
gi|113258                     :                                    C--A-A--A-------TG-CA-T-GT--TCTTCA-C-C-AGC--T----GAA-C-A--TTT--T-T----G--TT--CA----C-TT---AAAA-A-G-A-A--AT--A-G--AAA--T--C--CT---TTA-CA---T--G--A---AAT-AT-T--TT-GT-GA--CC--AA--TTA-C-A---AA-TTT-A--T-----ATT-A-A-ACA-TGA-T-AA------------------AA---T--GTA-A-T-----AA-G--A-TAT--TG-G----CA-G--C-CA-CC---A--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-CT-TT---G-TATAT-A-T-T-CTTac
gi|113259                     :                                          -TA-------TG-CG-T-TT--T----A-C-A-AGC--T----GAA-T-T--TTTG-T-C----C--AA--AC-A--C-TC---AAAA-A-G-A-A--AT--A-G--AAA--TCGT--CT-----A-CA---T--G--A---AAA-AT-G--GT-GG-GA--GC--AA--ATG-C-AT--AT-TTA-C--T-----TC------A-A-T-T-T-AA------------------GC---A--T------------A-C--A-TAT--TA-A----AA-G--T-CA-TA---A--G--CA--A-A-TT-A-CC-GG-GT-TT---G-TCTAC-A-T-TACTTTT--GAT
gi|113260                     :                                            A-------TG-TG-C-GT--T----A-C-C-AGC--T----GAA-T-A--TTTT-T-T----TTTAT--AT-A--T-TC---AAAA-A-----------------AAA--T--C--CT---TTA-TA---T--G--A---AAA--T-T--AGTGA-GA--GC--AA--TTG-C-AT--AT-Tac
gi|113261                     :                                                           -GT--T----A-C-C-A-C--G----TCA-ACA--TTTA-T-T----G--AT--AT-G--T-TC---AAAA-AAG-A-A--GT--A-A--AAA--T--C--TT---TTA-CA---T--G--A---AAA-AT-G--AT-GG-GA--AC--AA--ATG-C-AT--AC-TCA-A--A-----CT----A-A-A-CAA-T-AA------------------TA---A--TTT-A-T----TAA-C--A-TAT--CG-A----CC-G--T-CC-TC---A--G--CA--A-A-TT-A-CC-GA-GG-TT---A-TCCGC-
gi|113262                     :                                                                                                                                                                                                                       -C-AT--AC-TCT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGA-T-AA------------------AA---G--TCA-A-T---ACAT-C--A-TAT--TG-A----CA-G--C-GC-TC---A--G--CG--A-A-
gi|113263                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AAAT
gi|113264                     :                                                                                                                                                                                                                                                                         aaaatataaaaaaaaaaattaaattgaaattAA-C--A-TAT---G-A----CA-G--C-CC-TC---CCCG--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAT---G-T-CTTTT-AGATa


blockSeqs                     :     G  T G     AT CTG TC  CA   T C  CC T A  GTTGTGT  A  G C  CG CTTC G A C   GCTTA    TT T AT    G C TTAA TT  CA  G GC G  TTA    C GC  A AA  TA T TA   GT CG TC  CTT   A  ACA TT GA TAG   A  C TA  C  G  AC  CA  AA   A C  TT  T   CAG  GCATA   C C C C T   T A  CTTCGCCTTTTTGTATCT  GCA AA   G T TTA    G AC T   TA  T GATT  A GCC   G  CAAC   TT  GA C T  A C  G  A  T  TTA C     A G A A     A
blockSeqs                     :     .  . A     C  .   .   .    . .  C  . A  C        G  . .  G  T    . . C   ATA      AT C A     . . TATC .   T   . .  .  A      . AG  A G   .  . .    .  C  .   A     .  .   .  C  G     .  A .   T  .  .   .   A    . .  .   .   AT   .       . C . . .   . .  G                   A   .    . . .      . .  .   TA  . A     T CA    .  CCC    .   .  . T  . .  .  .  .  .   .     . G . A     .
blockSeqs                     :     .  . .     C  .   .   .    . .  .  . .  .        .  . .  .  T    . . .   G        G  . G     . . TTAA .   .   . .  .  .      . G   . .   .  . .    .  .  .   .     .  .   .  A  .     .  . .   .  .  .   .   .    . .  .   .   C    .       . G . . .   . .  .                   C   .    . . .      . .  .   .   . G     A C     .  C      .   .  . C  . .  .  .  .  .   .     . . . .     .
blockSeqs                     :     .  . .     C  .   .   .    . .  .  . .  .        .  . .  .  G    . . .   G        T  . .     . . C    .   .   . .  .  .      . G   . .   .  . .    .  .  .   .     .  .   .  .  .     .  . .   .  .  .   .   .    . .  .   .   C    .       . G . . .   . .  .                   .   .    . . .      . .  .   .   . .     . C     .  C      .   .  . C  . .  .  .  .  .   .     . . . .     .
blockSeqs                     :     .  . .     A  .   .   .    . .  .  . .  .        .  . .  .  .    . . .   G        T  . .     . . T    .   .   . .  .  .      . G   . .   .  . .    .  .  .   .     .  .   .  .  .     .  . .   .  .  .   .   .    . .  .   .   C    .       . . . . .   . .  .                   .   .    . . .      . .  .   .   . .     . T     .  C      .   .  . .  . .  .  .  .  .   .     . . . .     .
blockSeqs                     :     .  . .     T  .   .   .    . .  .  . .  .        .  . .  .  .    . . .   T        G  . .     . . T    .   .   . .  .  .      . G   . .   .  . .    .  .  .   .     .  .   .  .  .     .  . .   .  .  .   .   .    . .  .   .   T    .       . . . . .   . .  .                   .   .    . . .      . .  .   .   . .     . C     .  C      .   .  . .  . .  .  .  .  .   .     . . . .     .
blockSeqs                     :     .  . .     A  .   .   .    . .  .  . .  .        .  . .  .  .    . . .   T        A  . .     . . T    .   .   . .  .  .      . G   . .   .  . .    .  .  .   .     .  .   .  .  .     .  . .   .  .  .   .   .    . .  .   .   C    .       . . . . .   . .  .                   .   .    . . .      . .  .   .   . .     . C     .  A      .   .  . .  . .  .  .  .  .   .     . . . .     .
blockSeqs                     :     .  . .     C  .   .   .    . .  .  . .  .        .  . .  .  .    . . .   T        A  . .     . . .    .   .   . .  .  .      . G   . .   .  . .    .  .  .   .     .  .   .  .  .     .  . .   .  .  .   .   .    . .  .   .   C    .       . . . . .   . .  .                   .   .    . . .      . .  .   .   . .     . C     .  A      .   .  . .  . .  .  .  .  .   .     . . . .     .
blockSeqs                     :     .  . .     C  .   .   .    . .  .  . .  .        .  . .  .  .    . . .   G        T  . .     . . .    .   .   . .  .  .      . G   . .   .  . .    .  .  .   .     .  .   .  .  .     .  . .   .  .  .   .   .    . .  .   .   C    .       . . . . .   . .  .                   .   .    . . .      . .  .   .   . .     . C     .  C      .   .  . .  . .  .  .  .  .   .     . . . .     .
blockSeqs                     :     .  . .     C  .   .   .    . .  .  . .  .        .  . .  .  .    . . .   G        A  . .     . . .    .   .   . .  .  .      . G   . .   .  . .    .  .  .   .     .  .   .  .  .     .  . .   .  .  .   .   .    . .  .   .   C    .       . . . . .   . .  .                   .   .    . . .      . .  .   .   . .     . C     .  C      .   .  . .  . .  .  .  .  .   .     . . . .     .
blockSeqs                     :     .  . .     C  .   .   .    . .  .  . .  .        .  . .  .  .    . . .   G        G  . .     . . .    .   .   . .  .  .      . A   . .   .  . .    .  .  .   .     .  .   .  .  .     .  . .   .  .  .   .   .    . .  .   .   C    .       . . . . .   . .  .                   .   .    . . .      . .  .   .   . .     . T     .  C      .   .  . .  . .  .  .  .  .   .     . . . .     .
blockSeqs                     :     .  . .     C  .   .   .    . .  .  . .  .        .  . .  .  .    . . .   G        G  . .     . . .    .   .   . .  .  .      . G   . .   .  . .    .  .  .   .     .  .   .  .  .     .  . .   .  .  .   .   .    . .  .   .   A    .       . . . . .   . .  .                   .   .    . . .      . .  .   .   . .     . C     .  C      .   .  . .  . .  .  .  .  .   .     . . . .     .
blockSeqs                     :     .  . .     C  .   .   .    . .  .  . .  .        .  . .  .  .    . . .   G        G  . .     . . .    .   .   . .  .  .      . G   . .   .  . .    .  .  .   .     .  .   .  .  .     .  . .   .  .  .   .   .    . .  .   .   C    .       . . . . .   . .  .                   .   .    . . .      . .  .   .   . .     . T     .  C      .   .  . .  . .  .  .  .  .   .     . . . .     .
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blockSeqs                     :     .  . .     C  .   .   .    . .  .  . .  .        .  . .  .  .    . . .   G        G  . .     . . .    .   .   . .  .  .      . G   . .   .  . .    .  .  .   .     .  .   .  .  .     .  . .   .  .  .   .   .    . .  .   .   T    .       . . . . .   . .  .                   .   .    . . .      . .  .   .   . .     . C     .  C      .   .  . .  . .  .  .  .  .   .     . . . .     .
blockSeqs                     :     .  . .     A  .   .   .    . .  .  . .  .        .  . .  .  .    . . .   T        G  . .     . . .    .   .   . .  .  .      . C   . .   .  . .    .  .  .   .     .  .   .  .  .     .  . .   .  .  .   .   .    . .  .   .   C    .       . . . . .   . .  .                   .   .    . . .      . .  .   .   . .     . T     .  A      .   .  . .  . .  .  .  .  .   .     . . . .     .
blockSeqs                     :     .  . .     A  .   .   .    . .  .  . .  .        .  . .  .  .    . . .   T        G  . .     . . .    .   .   . .  .  .      . G   . .   .  . .    .  .  .   .     .  .   .  .  .     .  . .   .  .  .   .   .    . .  .   .   T    .       . . . . .   . .  .                   .   .    . . .      . .  .   .   . .     . C     .  A      .   .  . .  . .  .  .  .  .   .     . . . .     .
blockSeqs                     :     .  . .     A  .   .   .    . .  .  . .  .        .  . .  .  .    . . .   T        G  . .     . . .    .   .   . .  .  .      . G   . .   .  . .    .  .  .   .     .  .   .  .  .     .  . .   .  .  .   .   .    . .  .   .   A    .       . . . . .   . .  .                   .   .    . . .      . .  .   .   . .     . C     .  C      .   .  . .  . .  .  .  .  .   .     . . . .     .
blockSeqs                     :     .  . .     C  .   .   .    . .  .  . .  .        .  . .  .  .    . . .   T        G  . .     . . .    .   .   . .  .  .      . G   . .   .  . .    .  .  .   .     .  .   .  .  .     .  . .   .  .  .   .   .    . .  .   .   C    .       . . . . .   . .  .                   .   .    . . .      . .  .   .   . .     . C     .  A      .   .  . .  . .  .  .  .  .   .     . . . .     .
blockSeqs                     :     .  . .     C  .   .   .    . .  .  . .  .        .  . .  .  .    . . .   T        G  . .     . . .    .   .   . .  .  .      . G   . .   .  . .    .  .  .   .     .  .   .  .  .     .  . .   .  .  .   .   .    . .  .   .   A    .       . . . . .   . .  .                   .   .    . . .      . .  .   .   . .     . C     .  A      .   .  . .  . .  .  .  .  .   .     . . . .     .
blockSeqs                     :     .  . .     .  .   .   .    . .  .  . .  .        .  . .  .  .    . . .   T        A  . .     . . .    .   .   . .  .  .      . A   . .   .  . .    .  .  .   .     .  .   .  .  .     .  . .   .  .  .   .   .    . .  .   .   C    .       . . . . .   . .  .                   .   .    . . .      . .  .   .   . .     . T     .  C      .   .  . .  . .  .  .  .  .   .     . . . .     .
blockSeqs                     :     .  . .     .  .   .   .    . .  .  . .  .        .  . .  .  .    . . .   A        G  . .     . . .    .   .   . .  .  .      . G   . .   .  . .    .  .  .   .     .  .   .  .  .     .  . .   .  .  .   .   .    . .  .   .   C    .       . . . . .   . .  .                   .   .    . . .      . .  .   .   . .     . T     .  C      .   .  . .  . .  .  .  .  .   .     . . . .     .
blockSeqs                     :     .  . .     .  .   .   .    . .  .  . .  .        .  . .  .  .    . . .   T        G  . .     . . .    .   .   . .  .  .      . G   . .   .  . .    .  .  .   .     .  .   .  .  .     .  . .   .  .  .   .   .    . .  .   .   C    .       . . . . .   . .  .                   .   .    . . .      . .  .   .   . .     . C     .  C      .   .  . .  . .  .  .  .  .   .     . . . .     .
blockSeqs                     :                           .    . .  .  . .  .        .  . .  .  .    . . .   G        A  . .     . . .    .   .   . .  .  .      . .   . .   .  . .    .  .  .   .     .  .   .  .  .     .  . .   .  .  .   .   .    . .  .   .   A    .       . . . . .   . .  .                   .   .    . . .      . .  .   .   . .     . C     .  A      .   .  . .  . .  .  .  .  .   .     . . . .      
blockSeqs                     :                           .    . .  .  . .  .        .  . .  .  .    . . .   G        T  . .     . . .    .   .   . .  .  .      . .   . .   .  . .    .  .  .   .     .  .   .  .  .     .  . .   .  .  .   .   .    . .  .   .   C    .       . . . . .   . .  .                   .   .    . . .      . .  .   .   . .     . .     .  A      .   .  . .  . .  .  .  .  .   .     . . . .      
blockSeqs                     :                           .    . .  .  . .  .        .  . .  .  .    . . .   G        A  . .     . . .    .   .   . .  .  .      . .   . .   .  . .    .  .  .   .     .  .   .  .  .     .  . .   .  .  .   .   .    . .  .   .   A    .       . . . . .   . .  .                   .   .    . . .      . .  .   .   . .     . .     .  A      .   .  . .  . .  .  .  .  .   .     . . . .      
blockSeqs                     :                                . .  .  . .  .        .  . .  .  .    . . .   G        A  . .     . . .    .   .   . .  .  .      . .   . .   .  . .    .  .  .   .     .  .   .  .  .     .  . .   .  .  .   .   .    . .  .   .   C    .       . . . . .   . .  .                   .   .    . . .      . .  .   .   . .     . .     .  A      .   .  . .  . .  .  .  .  .   .     .            
blockSeqs                     :                                     .  . .  .        .  . .  .  .    . . .   T        A  . .     . . .    .   .   . .  .  .      . .   . .   .  . .    .  .  .   .     .  .   .  .  .     .  . .   .  .  .   .   .    . .  .   .   .    .       . . . . .   . .  .                   .   .    . .        . .  .   .   . .     . .     .  .      .   .  . .  . .  .  .  .  .   .                  
blockSeqs                     :                                          .  .        .  . .  .  .    . . .   T        A  . .     . . .    .   .   . .  .  .      .                                                                                    . .  .   .                                                                                                                    .  . .                                       
blockSeqs                     :                                             .        .  . .  .  .    . . .   T        .  . .     .                                                                                                                                                                                                                                                                                               
blockSeqs                     :                                                           .  .  .    . . .   G                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   


blockSeqCons                  : 
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finalCons                     : CTTC-TT-A-CATGC-CA---A--AT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G----GAG-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT





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lowQualScore                  :     .  . .     .. ... ..  ..   . .  .. . .  .......  .  . .  .. .... . . .   .......  .. . ..    . . .... ..  ..  . .. .  ...    . ... . ..  .. . ..   .. .. ..  ...   .  ... .. .. ...   .  . ..  .  .  ..  ..  ..   . .  ..  .   .... .....   . . . . .   . .  ..................  ... ..   . . ...    . .. .   ..  . ....  . ....  .  ...... ..  .. . .  . .  .  .  .  ... .     . . . .     .    
lowQualScore                  :     6  6 2     99 888 22  00   4 4  22 3 6  3333333  5  2 2  99 2222 2 2 4   1111111  55 5 22    2 3 4444 88  11  3 88 3  555    3 111 7 22  88 3 88   88 22 88  777   3  333 88 55 777   3  7 88  7  3  88  88  22   3 3  88  3   0000 33333   3 3 3 3 3   3 3  222222222222222222  000 88   3 3 444    3 88 3   77  3 5555  0 7777  3  333333 88  88 3 2  3 3  3  3  3  333 3     4 9 4 9     6    
consensus                     : CTTC-TT-A-CATGC-CA---A--AT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G----GAG-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
Reference ( family-559 )      : CTTC-TT-A-CATGC-CA---A--AT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G----GAG-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
gi|113229                     : CTTC-TT-A-CATGT-CA---A--AT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-CT--T----A-C-C-AGC--G----GAG-T-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
gi|113230                     : CTTC-TT-A-CATGT-CA---A--AT--TT--C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-CT--TT---A-C-CCAGC--G----GAG-T-T--TTTA-T-T----A--ATT-AA-G--C-TC---AAAA-A-G-AAT--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-ATG-T-AA------------------AA---A--TC--A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G----CC-TC---C--G--CGGAA-A-TT-A-CC-GGAAG-TT---G-CCC-C-A-G-T-CTTTT-AGAT
gi|113231                     : CTTC-TT-A-CATGC-CA---A--AT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G-----AT-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--A--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AA--GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AC------------------AA------CCA-A-T---ACAA-C--A-CAT--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
gi|113232                     : CTTC-TT-A-CATGC-CA---A--AT--TTT-C-AA--A-A-CA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G----GAT-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA----C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GG--GC--AA--GTG-C-AT---C-TTT-C--------CTG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAC--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-A-T-CTTTT-AGATac
gi|113233                     : CTTC-TT-A--ATGC-AA---A--AT--TT--A-AC--T-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--T----GAG-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T---T----A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-G--T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TCT-T--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T---------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G----CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CT-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGATgc
gi|113234                     : CTTC-TT-A-CATAC-TA---A--AG--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--T----GAA-A-A--TTTA-T-TTTAAA--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAT--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---ACA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TAT-C--T-----CTA-A-A-A-A-TCG-A-AA------------------AA---A--TCA-A-T---GCAA-C--A-TTT--TG-A----CA-A--T-GC-TC---A--G--CA--A-A-TC-A-CC-GG-AG-TT---G-CC--C-A-G-T-CTTTT-AGATgc
gi|113235                     : CTTC-TT-A-CATGC-AA---A--AG--TTT-C-AC--G-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--T----GAA-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-G-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CAACAT--G--A---AAA-GT-T--TG-GA-GA--GC--AA--GCG-C-AT--AC-TCT-C--T-----TTG-A-A-A-A-TGA-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---GAAA-T--A-TAA--TG-A----CA-G--C-GC-TC---A--G--CG--A-A-TT-A-CC-TG-AG-TT---G-CCCAac
gi|113236                     : CTTC-TTTA-CATGC-CA---A--AT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G----GAT-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AAGG--G-TCA--AAAA-A-G-A-T--AT----A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--A--GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--ACTTTT-C--T-----CTG-A-A-A-G-TGG-T--A------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TC-A----CA-G--C-CC-TA---C--G--CG--A-A-TT-A--C-GG-AG--T---G-GCCAC-AGG-T-CTTTT-AGAT
gi|113237                     : CTCT-TT-A-CATGC-CA---ATCAT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--TT---A-C-C-AGC--G----GATTA-A--TTTA-T-C----A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--G--T--CTCTTTAA--A---T--G--A---AAAAGTCT--AG-AG-GA--GC--AAAAGAG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AAA--A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--G-A-AT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCACAA-G-T-CTTTT-AGATac
gi|113238                     : CCTC-TT-A-CA-GC-CA---A--ATCATTT-C-A---A-A-TA-------TGACG-TCGT--T----A-C-C-AGC--G----CAATA-A--TTTA-T-TC---A--AT--AA-G--C-TC---AAAA-A-A-AAT--AT--A-A--AAAGTT--T--CTA--TAA-CA---T--G--ATAGAAA-GT-T--AG-GA-GG--GC--AA--GAG-C-AT--AC-TTT----T-----CTG-A-A-A---TGG-T-AA------------------AAGCAA--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G--C-CC-T----C--G--CG--A-ATTT-A-CC-GG--G-TT---G-CCCAC-A---T-CTTTT-AGATac
gi|113239                     : CTTCGTT-AGCATGC-CA---A--AT--TTTTC-AC--A-AATA-------TG-CG-T-GT--T----AGC-C-AGC--G----GAA-A-AA-TTTA-T-TT---A--AT--AA-AGCC-TC---AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAG--G-----CT---TAA-CA---A--G--A---AA--GT-TTAAG-GA-GA--GC--AG--ATG-C--T--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---AAATCA-A-T---ACA--C--A-TAT--TG-AA---CAAG--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TTAA-CC-GG-AG-TT---G--CCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
gi|113240                     : CTTC-TT-A-CATGC--A---A--AT--TT--C-A---A-A-TA-------TG-CGGT-GT--T----A-C-C-AGC--G----GAG-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--T-TT---CAAA-A-G-A-T--AT--ATA--AAA--TC-T--TT---TAA-AC---T--G------AAA-GT-T--GA-GA-GAACGC--AA--GTG-C-AT--AC-CTTAT--T-----CTG-A-A-A-T-CGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---A-AA-C--A-TAT--TG-AG---CA-GGCC-CC-TC---C--G--C-----A-TT-ACCC-GG-AG-TT---G--CCAC-A-G-T-CTTTT-AGATac
gi|113241                     : CTTC-TT-A-CCTGC-CA---A--AG--TTT-C-ACC-A-A-TA-------TG-CG-T-GT--TG---A-C-C-AGC--G----GAG-A-AG-TTTA-T-T----A--AT--AA-G----TC---AAAA-A-G-A-A--AT--A-A--T----T--T--CT---TA--CT---T--G--A---AG--GT-T--TG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-ATTTAC-TTT-A--T-----TCG-A-A-A-A-TGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-T---AAAA-C--A-TA---TG-A----CA-G--T-CCGTC---C--GTTTA--A-A-TT---CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-GAT-CTTTTAAGATac
gi|113242                     : CTTC-TA-A-T-TGC-CA---G--AT--TTT-T-ACCCA-A-TAC------TG-CG-T-GT--T----A-C-CCAGC--G----GAG-A-T--TTTA-TCT----A--ATCAAA-G--C-TC---AAAA-C---A-T--ATTAA-A--AAA--T--T--CT---TAAACA---C--GC-A---AAA-GG-T--GG-GA-GA--GC--AAA-GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG---A-A-A-TGG-T-AAG-----------------AA---A--TCA-ATT---ACAAGC--A-TAC--TGTG----AA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-A-TT-A-CC--G-AG-TT---G--CCAC-A-G-T-CTTTT-AGATac
gi|113243                     : CCTC-TT-AACATGC--A---A--AT--TTT-C-AC--A---TA-------TG-CG---GT--T----A-C-C--GC--G----GA--A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---AGAA-A---A-T--AT--A-A--AAT--T--T--CT---GAA-C----T--G--A---AAA-GT-T---G-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGT-C---------------------CC---A--TCG-A-T---ACAA-C--A-TA---TG-A----CA-G----CC-TC---C--G---G--A-A-TT-T-CC-GG--G-TT-----CCCAC---G-T-CTTTT-AGATac
gi|113244                     : CTTT-TT-A-CATGC-AA---A--CT--TTT-C-AC--A-A-TAGTTGTGTTG-CA-T-GT-------A-C-C-GGC--T----GAG-A-A--TTTA-T-TTATCA--AT--AA-C--C-TC---AAAA-A---A-T--AT--T-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---A--G--A---AAA-GG-T--TG-GG-TA--GT--AA--GTG-C-AT--AC-TCT-A--T-----CTG-A-A-C-A-CGA-T-AC------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TG-A----CA-G--T-GA-TC---A--G--TG--A-A-CT-A-CC-GG-AA-TT---G-CCCAC-A-G-T-C-TTT-AGATac
gi|113245                     : CTTA-TT-A-CATGC-AA---A--AG--TTT-C-AG--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-G-AGT--T----GAA-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--CGCC---AAAA-A-G-G-TAAAA--A-A--AAA--T--T--CT---CAA-TA---T--G--A---AAA-GTAT--AA-G--GA--GC--AA--GTG-C-AT--A---TT-CAGT-----CTG-A-A-C-A-TGC-T-AT------------------AG---T--TTA-------ACAG-A--A-TAT--TG-A----CA-G--C-CA-TC---A--T--CA--A-A-TT-A-CC-GC-CG-TT---G-TCCAC-A-G-T-CCTTT-AGATac
gi|113246                     : CTTC-TT-A-CATGC--A---A--AT--TTT-CCAC--G-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--T----GAG-A-A--TTTA-T-C----A--AT----------T---------------T--AT--T-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--GGAA---AAA-GT-T--AGCGAGGA--GCCAAA--GTG-C-----GC-TCT-T--T-----GTG---A-A-A-TGG-TAAA------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--ATTAT--TG-A----CA-G--CATC-TC---C--G--CG--ACATTT-A-CCGGG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-ATTTac
gi|113247                     : CTTC-TT-A-CATGCATA---A--AT--GTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-C-GTG-T----A-C-C-AGC--T----GAG-A-A--TTTA-T-T----A--A---AA-G--C-T----AAAA-A-G-A-T--AT--A-A--AAA--G--T--CT---TAA-CA---T--GA-A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTGAA-AT--AC--TC-C--T-----CTG-A-A-A-ATTGG-T-AA------------------AA---A--TCA-A-
gi|113248                     : CTTC-TT-A-CATGC-CGCTGA--GT--T---C-AC--A---TA--------G-CG-T-ATCGT----A-C-C-AGC--GCTTAGAG-ATA--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--T-TC---AAAA-A-C-A-TG-AT--A-ATAAAA--T--TTCCT---TCA-CA---T--G--A---AAA--T-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-CCAT--AC-TTT-T--T-----CTG-A-A-A-A-TGGTT-AA------------------AAC--A--TCAGA-TTTAAAGA-C--C-CAT--T--A----CATG--T-CC-TCCAAC--A--CA--A-A-TT-A-TC-GG-AGTTT---GCCCCAC-A-G-T-CTCT
gi|113249                     : CTTC-TT-A-CATGC-AA---A--AA--ATT-C-AG--G-A-CA-------TG-CT-A-TT--T----A-C-C-AGC--T----GCG-A-A--TTTA-T-TTTAAA--AT--AA-G--C-TT---AAAT-T-G-A-T--AT--A-A--CAA--G--T--CT---TAG-CA---T--G--A---AAA-CT-T--GG-GG-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TAT-A--TGCATATTG-ACACA-A-TGT-T-AACTTCGCCTTTTTGTATCTAA---A---CA-T-G---ATAA-CACA-TAT--TG-A----CA-----------------G--CG--A-A-TT-A-CC-AA-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AGAT
gi|113250                     : CTTC-TT-C-C-TGC-AA---A--GT--TTC-A-AC--A-T-CA-------TGGCG-T-GT--T----A-A-C-AGC--T----GAG-A-AATTTCAGT-T----A--AT--AA-G--C--C---AAAA-A-GCA-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---TTTG--AG--AAA-GT-T--GG-AA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TCT-C--T------TGCA-A-A-A-TGA-T-AA------------------AG------TCA-A-T---ACAT-C--A-TAT--TG-A----CAAG--C-GC-TC---A--G--CG--A-A-AA-T-CC-TG-TC-TTTTAG-CTTAC-T-G-TACTTTT-AGATgc
gi|113251                     : CTTC-TT-A-CATAC-AA---A--AG--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGCATA----AAG-A-T--TTTA-a
gi|113252                     :  TTC-TT-G-CAGGC-CA---A--AT--TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-CA--T----A-C-C-AGC--A----GA
gi|113253                     :   TC-CT-A-CTTAA-CA---A--AA--GTT-C-AA--GTG-TA-------TG-CT-T-GT--T----A-C-C-AGC--T----GAA-C-A--TTTT-T-T----G--AT--AT-A--C-TTTTAAAAACA-G-A-A--AT--A-A--AAA--T--C--CT---TTA-CA---T--G--A---AAA-AT-G--GA-GG-GA--AC--AA--TTG-T-AT--A--TTT-A--T-----ACA-ACA-C-A-TGC-T-AT------------------AA---T--TCA-A-T-----AA-C--A-TAT--TG-AGATTCA-T--T-GA-TC---A--G--CG--A-T-TT-A-CC-AG-GG-TT---T-TCTAC-A-T-T-CCTAT-TGATa
gi|113254                     :                           --TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G-----AG-A-A--TTTA-T-TT---A--AT--AA-G--C-TC---AAA----G-A-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-AGA-A-A-T-G-T-AA------------------AA---A--TTA-A-T---ACAA-C--A-TATTATG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-ACTT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AAATac
gi|113255                     :                           --TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--T----A-C-C-AGC--G-----AG-A-A--TTTA-T-TT---A--AT--AA-G--C-TC---AAA----G-A-T--AT--A-A--AAA--T--T--CT---TAA-CA---T--G--A---AAA-GT-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-AGA-A-A-T-G-T-AA------------------AA---A--TTA-A-T---ACAA-C--A-TATTATG-A----CA-G--C-CC-TC---C--G--CG--A-ACTT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AAATa
gi|113256                     :                           --TTT-C-AC--A-A-TA-------TG-CG-T-GT--C----A-C-C-AGC--G----GAA-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--C-TC---ATAA-a
gi|113257                     :                                -C-AC--A-AATA-------TG-CG-T-GT--T----A-CAC-AGC--G----GAT-A-A--TTTA-T-T----A--AT--AA-G--G-TC---AAAA-G-A-A-T---T--A-A--AAA--T--T--CT---TA--CA---T--G--A---AA---T-T--AG-GA-GA--GC--AA--GTG-C-AT--AC-TTT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGG-T--A------------------AA---A--TCA-A-T---ACAA-C--A-TAT--TC-A----C--G--C-CC-TA---C--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TG---G-CCCAC-AGG-T-CTTTT-AGAT
gi|113258                     :                                    C--A-A--A-------TG-CA-T-GT--TCTTCA-C-C-AGC--T----GAA-C-A--TTT--T-T----G--TT--CA----C-TT---AAAA-A-G-A-A--AT--A-G--AAA--T--C--CT---TTA-CA---T--G--A---AAT-AT-T--TT-GT-GA--CC--AA--TTA-C-A---AA-TTT-A--T-----ATT-A-A-ACA-TGA-T-AA------------------AA---T--GTA-A-T-----AA-G--A-TAT--TG-G----CA-G--C-CA-CC---A--G--CG--A-A-TT-A-CC-GG-CT-TT---G-TATAT-A-T-T-CTTac
gi|113259                     :                                          -TA-------TG-CG-T-TT--T----A-C-A-AGC--T----GAA-T-T--TTTG-T-C----C--AA--AC-A--C-TC---AAAA-A-G-A-A--AT--A-G--AAA--TCGT--CT-----A-CA---T--G--A---AAA-AT-G--GT-GG-GA--GC--AA--ATG-C-AT--AT-TTA-C--T-----TC------A-A-T-T-T-AA------------------GC---A--T------------A-C--A-TAT--TA-A----AA-G--T-CA-TA---A--G--CA--A-A-TT-A-CC-GG-GT-TT---G-TCTAC-A-T-TACTTTT--GAT
gi|113260                     :                                            A-------TG-TG-C-GT--T----A-C-C-AGC--T----GAA-T-A--TTTT-T-T----TTTAT--AT-A--T-TC---AAAA-A-----------------AAA--T--C--CT---TTA-TA---T--G--A---AAA--T-T--AGTGA-GA--GC--AA--TTG-C-AT--AT-Tac
gi|113261                     :                                                           -GT--T----A-C-C-A-C--G----TCA-ACA--TTTA-T-T----G--AT--AT-G--T-TC---AAAA-AAG-A-A--GT--A-A--AAA--T--C--TT---TTA-CA---T--G--A---AAA-AT-G--AT-GG-GA--AC--AA--ATG-C-AT--AC-TCA-A--A-----CT----A-A-A-CAA-T-AA------------------TA---A--TTT-A-T----TAA-C--A-TAT--CG-A----CC-G--T-CC-TC---A--G--CA--A-A-TT-A-CC-GA-GG-TT---A-TCCGC-
gi|113262                     :                                                                                                                                                                                                                       -C-AT--AC-TCT-C--T-----CTG-A-A-A-A-TGA-T-AA------------------AA---G--TCA-A-T---ACAT-C--A-TAT--TG-A----CA-G--C-GC-TC---A--G--CG--A-A-
gi|113263                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAC-A-G-T-CTTTT-AAAT
gi|113264                     :                                                                                                                                                                                                                                                                         aaaatataaaaaaaaaaattaaattgaaattAA-C--A-TAT---G-A----CA-G--C-CC-TC---CCCG--CG--A-A-TT-A-CC-GG-AG-TT---G-CCCAT---G-T-CTTTT-AGATa