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Reference ( gi|32761 ) : ATTTTA---TTT-T--AT------CACAA--A--CTTG----C-G-ATGA---CATTGAT-------GAATT--ACG--CATATAT----TT---TGTGTA--AT-T-A-AAC-TG-----G-----G---AGA--CG-----------A-TA-----------AC--ATGGATATC----AACATGA----TCACG--G-G---A---A-----A-------AT--A-G-------T-T---CG---T-GA-AT-TTT---GACTGGGAC-C----TTGCAT-A----TTTAAATG-A---AATTT---TT--ATT-TCA---GGA---TGAT-----CACGA-----TAAT-TC--GAT--------T--AT-----------G-ATGA-A-A---TT-GACAAAT--CG-C----A----CA----T--TT--T--GTG-A--ATT-T-----------------AAACTGGTCCAGGA--GACGATA-ACTTG-----------G-AT----ACT----AAC-ATGAC----T----A-----C-GGGCC------------C--A--------T-G---C-A-A----TTCA-T-G-AA---T-TTTGACCAAGATC--TTTTGAAATTGT-CACGCCGT--ATTCAATGATGTAT-TCACACAACATAGTTT-A-AAAATAATAT-GCAAAT--CGGCT--TTCC-G-CCCACTGGT-GTAT-TTCCAGTTATTGTACACTTTTGACAAAGGGAA-AACACC-ACAGTCATG-AT-ACAA
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Reference ( family-555 ) : ATTTTA---TTTT--ATCACA-A-G-CGTGC-G-ATGAA-A---TTGACGAATTACGTATATAT----TT---TGTGTA--ATT-A-AAC-TGGG---AGA--CG-----------A-TA-----------ACG--TGGATATC----AACATGACCACGGGGA---A---------A------TA------G--TT---CGT-GA-AT-TTT---GACTGGGAC-C----TTGCAT-A----TTTAAATG---C-AA--T--TT---T-T-ATT-TCATGA------TG-----AT-CACGA--GG-ATTCGATT--NT-------------G-ATGA-A-A--TT-GACGAAT--CG-C-ACA-T--TTT--GTG-A--ATTT-----------------AAACTGGTCCAGGA--GACGATAACTTGG-AT----ACT----AAC-A-TGAC----C----A-----C-GGGCC------T--A--------T-G----C-A-ATTCA-T-G-AA---TTTTGACCGAGA--CCTTTTGAAATTGTCACGCGGT--ATTCAATGATTTAT-TTACACAGCACAG-T----TT-A-AAAATAATA-TGCAAATGGG--CGTTCC-G-CCCACTGG-T-GTATCTCCAGTTATTGTACACTTTTGACAAAGGGAA-AACACC-ACAGCCATG-AT-ACAA
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gi|32766 : ATTTTA---TTTT--ATCACT-A-G-TGTGC-G-ATGAA-A---TTAATGGATAATGTATATGT----TT---TGTGTACTATTTA-AAC-TGGG---AGA--CG-----------A-TA-----------GCG--TGGACATC----AACATGACCGCGGTGA---A---------A------CA------G--TT---CGT-AA-AT-TTT---GACTGGGAC-C----TTGCGT-A----TTTAAATG---T-AA--T--TT---T-T-ATT-TCATGA------TG-----AT-CACAA--AG-ATTCGATT--CT-------------G-ATGA-A----------------------CA-T--TAT--GTG-A--ATCT-----------------TAACTGGTCCAGTA--GACGATAACTTGG-AT----ACT----TAC-A-TGTC----C----A-----C-TGGCT------T--A--------T-G----C-A-ATTCA-T-G-AA---T---------------TTTTGAAATTGTCACGCGGT--ATTCAATGATTTAT-TTACACGGCACAG-T----GT-A-AAAATAATA-TGCAAATGGG--TGTTCC-G-CCCACTCG-T-GTATCTCCACTTATTGTACACTTTTAACAAAGGGAA-AACCTC-ACAGCCATG-AT-ACAA
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Reference ( family-555 ) : ATTTTA---TTTT--ATCACA-A-G-CGTGC-G-ATGAA-A---TTGACGAATTACGTATATAT----TT---TGTGTA--ATT-A-AAC-TGGG---AGA--CG-----------A-TA-----------ACG--TGGATATC----AACATGACCACGGGGA---A---------A------TA------G--TT---CGT-GA-AT-TTT---GACTGGGAC-C----TTGCAT-A----TTTAAATG---C-AA--T--TT---T-T-ATT-TCATGA------TG-----AT-CACGA--GG-ATTCGATT--NT-------------G-ATGA-A-A--TT-GACGAAT--CG-C-ACA-T--TTT--GTG-A--ATTT-----------------AAACTGGTCCAGGA--GACGATAACTTGG-AT----ACT----AAC-A-TGAC----C----A-----C-GGGCC------T--A--------T-G----C-A-ATTCA-T-G-AA---TTTTGACCGAGA--CCTTTTGAAATTGTCACGCGGT--ATTCAATGATTTAT-TTACACAGCACAG-T----TT-A-AAAATAATA-TGCAAATGGG--CGTTCC-G-CCCACTGG-T-GTATCTCCAGTTATTGTACACTTTTGACAAAGGGAA-AACACC-ACAGCCATG-AT-ACAA
gi|32760 : ATTTTA---TTTT--ATCACA-A-G-CGTGC-G-ATGAA-A---TTGACAAATTACGTATATAT----TT---TGTGTA--ATT-A-AAC-TGAT---GGA--CG-----------A-TA-----------ACA--TGGATATT----ATCATGACCAAGGGGA---A---------A------TA------G--TT---AGT-GA-AT-TTT---GACTGTGAC-C----CTGCAT-A----TTTAAATG---C-AA--T--TT---T-T-ATT-TCATGA------TG-----AT-CACGA--GG-AGTCGATT--AT-------------G-ATGA-A-A--TT-GACGAAT--TG-C-ACA-T--TTT--GTG-A--ATTT-----------------AAACTGGTCCTGGA--GACGATAACTTGG-AT----ACT----AAC-A-TGAC----C----A-----C-GGGCC------T--A--------T-G----C-A-ATTGA-T-G-AA---CTTTGACTAAGA--CCTTTTGAAATTGTCACGCGGT--ATTCAATGATTTAT-TTACACAGCACAG-T----TT-A-AAAATAATA-TGCAAATGGG--CGTTCC-G-CCTACTGG-T-GTATCTCCAGTTATTGTACACTTTTTACAAAGGGAA-AGCACC-ACAGCCATG-AT-ACAA
gi|32761 : ATTTTA---TTTT--ATCACA-A-A-CTTGC-G-ATGAC-A---TTGATGAATTACGCATATAT----TT---TGTGTA--ATT-A-AAC-TGGG---AGA--CG-----------A-TA-----------ACA--TGGATATC----AACATGATCACGGGAA---A---------A------TA------G--TT---CGT-GA-AT-TTT---GACTGGGAC-C----TTGCAT-A----TTTAAATG---A-AA--T--TT---T-T-ATT-TCAGGA------TG-----AT-CACGA--TA-ATTCGATT--AT-------------G-ATGA-A-A--TT-GACAAAT--CG-C-ACA-T--TTT--GTG-A--ATTT-----------------AAACTGGTCCAGGA--GACGATAACTTGG-AT----ACT----AAC-A-TGAC----T----A-----C-GGGCC------C--A--------T-G----C-A-ATTCA-T-G-AA---TTTTGACCAAGA--TCTTTTGAAATTGTCACGCCGT--ATTCAATGATGTAT-TCACACAACATAG-T----TT-A-AAAATAATA-TGCAAATCGG--CTTTCC-G-CCCACTGG-T-GTATTTCCAGTTATTGTACACTTTTGACAAAGGGAA-AACACC-ACAGTCATG-AT-ACAA
gi|32762 : ATTTTA---TTTC--ATCACA-A-G-CATGC-A-ATGAA-A---TTGATGAATTACGTATATAT----GG---TGTGTA--ATT-A-AAC-TGGG---ATA--CG-----------A-TA-----------ACA--TGGATATT----AACATGATCACGGGGA---A---------A------TA------G--TT---TCT-GA-AT-TTT---AACTGGGAC-T----TTGCAT-A----TTTAAATG---A-AA--T--TT---T-T-ATT-TCAGGA------TG-----AT-CACGA--TA-ATTCGATT--AC-------------G-ATGA-A-A--TT-GACAAAT--CG-C-ACA-T--TTT--GTG-A--ATTT-----------------AAACTGGTTCAGGA--GACGATAATTTGG-AT----ACT----AAC-A-TAAC----C----A-----C-GGGCC------C--A--------T-
gi|32762 : GATATAT-TTACACAGCACAG-T----TT-A-AAAATAATA-TGCAAATGGG--CGATCC-G-CCCACTAG-T-GGATCTCCAATTATTGTACATTTTTGACAAAGGGAA-AACACG-ACAGCCATG-AT-ACAAatatttacacagatatatttacacagcacagtttaaaaataatatgcaaatgggcgatccgcccactagtggatctccaattattgtacatttttgacaaagggaaaacacgacagccatgatacaa
gi|32763 : attttatttcatcacaagcatgcaatgaaattgatgaattacgtatatatggtgtgtaattaaactgggatacgataacatggatattaacatgatcacggggaaatagtttctgaattttaactgggactttgcatatttaaatgaaatttttatttcaggatgatcacgataattcgattacgatgaaattgacaaatcgcacattttgtgaatttaaactggttcaggagacgataatttggatactaacataaccacgggcccatatatttacacaATTTTA---TTT---ATCAAA-A-G-CATGC-G-ATGAA-A---TTCATGAATTACATACATAT----TT---TGTGAA--ATT-A-AAC-TTGG---AGA--CG-----------A-TA-----------ACT--TGGATATC----AACATGACCACGGGGA---A---------A------CA------G--TT---CGT-GA-AC-TTT---TACTGGGAC-C----TTGCAT-A----TTTAAATG---C-AA--T--TT---T-T-ATT-TCATGA------TG-----AT-CACGA--GG-ATTCGATT--CT-------------G-ATGA-A-A--TT-GACAAAT--TG-C-ACA-T--TTT--GTG-A--ATTT-----------------AAACTGGTCCAGGA--GACGATGATTTGG-AT----ACT----AAC-A-TGAC----C----A-----C-GGGCC------T--A--------T-A----C-A-ATTCA-T-G-AA---TTTTGATTGAGA--CCTTTTGAAACTGTCACACGGT--ATTCA---ATTTAT-TTACACAACACAG-T----TT-A-AAAATAATA-TGCAAATGGT--AGTTCC-G-CCCACTGG-T-GTATCTCCAGTTA-TGTACACTTTTGACAAATGAAA-AACACC-ACAGCCATG-AT-ACAA
gi|32764 : ATTTTAA--TTTT--ATCACA---G-CGTGC-GGATGAA-A---TTGATGAATTACGTATAATT----TT---TGTGTA--ATT-A-AAC-TGGG---AGA--CG-----------A-TACATTGAATATAACA--TTGATATC----AACATGACC--GGGGA---A---------A------TACGAGTAG--TT---CGT-GA-AT-TTT---GACTGGGAC-C----TTGCAT-AATCATTTAAATG---C-AA--T--TT---T-T-ATT-TCATGA------TG-----AT-CATGA--GG-ATTTGATT--CT-------------G-ATGA-A-A--TT-GACGAAT--CA-C-ACA-T--TTT--GTG-A--ATTT-----------------AAACTGGTCCAGGA--GACGATAACTTGG-AT----GCT----AAC-A-TGAC----C----ACGCCGC-GAGCCTAATAGT--A--------T-G----C-A-ATCCA-T-G-AA---TTTTGACCTAGA--CCTTTTGAAATTGTCACGCGG----------------T-TTACGCAGCACAG-T----TT-A-AAAATAATA-TGCAAATGGG--CGTTCC-G-CCCACTGG-T-GTATCTCCAGTTATTGTACACTTTTAACAAAGGGAA-AACACC-ACAGCCATG-AT-ACAA
gi|32765 : ATTTTA---TTTG--ATCACA-A-G-TGTGC-G-ACGAA-A---TTGACGAATTACGTACATA------------------------AAC-TGGG---AGA--CG-----------A-TA-----------ACG--TGGATATC----AACATGACCACGGGGC---A---------A------CA------G--TT---CGT-GA-AT-TTT---GACTGGGAC-C----TT------------------------------TT---T-T-ATT-TCATGA------TG-----AT-CACGA--GG-ATTCGATC--CT-------------G-ATGA-A-A--TT-GACGAAT--CG-C-ACA-T--TTT--GTG-A--ATGT-----------------AAACTGGTCCAGGA--AACGATAACTTGG-AT----ACT----AAC-A-TGAC----C----A-----C-GGACC------T--A--------T-A----C-A-ATTCA-T-G-AC---TTTTGACTGAGA--CCTTTGGAAATTGTCACGCGGT--ATTCAATAATTTAT-TTACACGGCACAG-T----TTAA-AAAATAATA-TGCAAATGTG--CATTCC-G-ACCACTGG-T-GTATTTCCAGTTATTGTACACTTTCGACAAAGGGAA-AACACC-ACAGCCATT-AT-ACAA
gi|32766 : ATTTTA---TTTT--ATCACT-A-G-TGTGC-G-ATGAA-A---TTAATGGATAATGTATATGT----TT---TGTGTACTATTTA-AAC-TGGG---AGA--CG-----------A-TA-----------GCG--TGGACATC----AACATGACCGCGGTGA---A---------A------CA------G--TT---CGT-AA-AT-TTT---GACTGGGAC-C----TTGCGT-A----TTTAAATG---T-AA--T--TT---T-T-ATT-TCATGA------TG-----AT-CACAA--AG-ATTCGATT--CT-------------G-ATGA-A----------------------CA-T--TAT--GTG-A--ATCT-----------------TAACTGGTCCAGTA--GACGATAACTTGG-AT----ACT----TAC-A-TGTC----C----A-----C-TGGCT------T--A--------T-G----C-A-ATTCA-T-G-AA---T---------------TTTTGAAATTGTCACGCGGT--ATTCAATGATTTAT-TTACACGGCACAG-T----GT-A-AAAATAATA-TGCAAATGGG--TGTTCC-G-CCCACTCG-T-GTATCTCCACTTATTGTACACTTTTAACAAAGGGAA-AACCTC-ACAGCCATG-AT-ACAA
gi|32767 : ATTTTAAATTTTT--ATCACA-A---------------------TTGACGAATTACGTA-ATATCATATT---TGTGTA---TT-ACAACCTGGG---AGAAACG-----------A-TAT----------ACA--ATGATATC----AACATGACAACGGGAA---A---------A------TAT-----T--TT---CGTGGA-AT-TTT---GACT-GGAC-C-----TGCAT-A----TTTAAATG---C-AA--T--TT---T-T-ATT-TCATGA------TG-----AT-C-CGA--GGAATTCGATTTAAT-------------G-ATGA-A-AATTT-GACG-AT--CG-CAACATT--TTT--GTG-A--A-TA-----------------AAACTGGTCT-GGA--GACGATAA-TTGGTAT----AC-----AAC-A-TGAC----C----A--------GGCC------T--A--------T-G----CAA-ATTCA-T-G-CA---TTTTA---GAGAACCTTTTTGAAAGTGT-ACGCGGTAAATTCAAT-ATTTATCTTACAC-GCAAAT-T----TA-A-AAAATAATA-TGC-AATGGA---GTTCC-G--CCACTGG-TAGTATCTCCAGTTCTTGTACAC-TTTAAC-AAGGGAA-AACACCAACAGCCATT-ATGACA
gi|32768 : ATTTTA---TTTT--ATCACA-A-G-CGTGC-G-ATGAA-A---TTGACGAATTACGTATATAT----TT---TGTGTA--ATT-A-AAC-TGGG---AGA--CT-----------A-TA-----------ACA--TGGATATC----AACATGACC--GGGGA---A---------A------TA------G--TT---CGT-GA-AT-TTT---GACTGGGAC-T----TTGCAT-A----TTTAAATG---C-AA--T--TT---T-T-ATT-TCATGA------TG-----AT-CACGA--GG-ATTTGATT--AT-------------G-ATGA-A-A--TT-GACGAAT--CA-C-ACA-T--TTT--GTG-A--ATTT-----------------AAACTGGTCCAGGA--GACTATAAC
gi|32769 : ATTTGA---TTTT--ATCACA-G-G--------------------TAACGAATCCC----ACAT----TT---TGAGAA--ATT-A-AAT-TGGG---AGA--CA-----------A-TA-----------AAG--TGGGTATTTTAAAACATGACCAAGCGCC---T---------A------CA------G--TT---CGT-GA-AT-TTT---GACTTGGAC-G----ATGGAC-A----TATAACTA---C-AG--T--TT---T-T-ATT-CCATGAGGAATTTGATTTTAT-CACAA--GA-ATGC---------------------A-ATGA-A-A--TT-GACGAGT--CA-C-ACA-T--TTT--GTG-A--AATT-----------------AAACTG-----GAA--GATGATAAAGT-G-AT----ATT----AAC-A-TGAC----C----A-----A-GGACC------T--ACACTTCTGT-A----C-A-ATTCA-C-G-AA---AATTTACTGGGA--CCTTTCAAAATTTTCACGCGGT--ATTCAATAAT---------GCAACACAG-TTAAATT-A-AAAA-AAT
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gi|32783 : tttaattagggcacttatactatatgatgatttcattccacgatggccatggggTGAATGACAC-GA--T--TTGGAT-A-ATT-CCATGA------TG-----AC-CATAA--GA-ATTTGATT--TT---------------ATCACA-G--GT-AACGAAT--CC-C-ACA-T--TTT--GAG-A--AATT-----------------AAATTG-----GGA--GACAATAAAGTGG-GT----ATTTTAAAAC-A-TGAC----C----A-----A-GCGCC------T--A---------------C-A-GTTCG-T-G-AA---TTTTGACTTGGA--C
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gi|32789 : tttcttccacgattaccatggggT---T-T-ATA-TCACAG------CG------T-TGCGATGAG-ATT-GATT--AT-------------G-ATGA-A-A--TTTGAC-AAT--CA-C-ACA-T--TTT--GTG-A--ATTT-----------------AAACTGGTCCAGGA--GACGATAA--TGG-AT----AC-----AAA-A-TGAC----CCGTCG-----C-GGGCC------TTAA--------TAG----T-ATATGCA-TTG-AT---TTTTGACCTGGG--CCTTTT-AAATT-----------------------------ACACAGCACAG-T----TT-T-AAAATAATA-TGCAAATGGG--CTTTTCAG-GCCACTGG-T-GTATCT-CAGTTA-TGTACATTTTTAACAAAGGGAA-AACACC-ACA-CCATGAAT-ACAA
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gi|32793 : atgatgaccatggggATTTTAAATTTTT--ATCACA-A---------------------TTGACGAATTACGTA-ATATCATATT---TGTGTA---TT-ACAACCTGGG---AGAAACG-----------A-TAT----------ACA--ATGATATC----AACATGACAACGGGAA---A---------A------TAT-----T--TT---CGTGGA-AT-TTT---GACT-GGAC-C----T
gi|32794 : tgatgaccatggggT----TC---TGTGAA--ATT-A-AGC-TGGG---AGA--TG-----------A-TA-----------AAA--TGGATATC----AACATGACCGCGAG-----C---------C------TA------GGTTT---TGT-GA-AT-TTT---GATTGG
gi|32794 : acgtTTTGAAATTGTCTCGTGGT--GTTAAATAATTTAT-TTACACAGCACAG-A----TT-A-AAAATATGA-TGCAAATGAT--GGTTCC-G-CCCACTGG-T-GTATATTTCGTTATTGTATACTTTTGATAAAGGCAAGAACTTC-ACACCCATG-AT-ACAAtgtttcacgcattgaacagaagaatgttttgaagagccgcgattcggtttagaagtatttgaaattgtctcgtggtgttaaataatttatttacacagcacagattaaaaatatgatgcaaatgatggttccgcccactggtgtatatttcgttattgtatacttttgataaaggcaagaacttcacacccatgatacaa
gi|32795 : acgtttctgtgaaattaagctgggagatgataaaatggatatcaacatgaccgcgagcctaggttttgtgaattttgattggtgtttcacgcattgaacagaagaatgttttgaagagccgcgattcggtttagaagtaTT-C-AAC-TGGG---AGA--CG-----------A-TA-----------ACG--TGGATATC----AACATGACCACGGGGA---A---------A------GA------C--TT---CGT-GA-TC-TTT---GGCTAGGAC-C----TT
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blockSeqs : . G . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . A . TTAATAG . . . . . . TG . . C A AATT . . . . . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . A . TTAATAG . . . . . . TA . . C A ATT . . . . . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . A . TGAAA . . . . . . TG . . A . ATT . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . T . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . CATG . . . . . . CT . . . . AAT . . . . . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . T . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . A . TATA . . . . . . TG . . . . G . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . A . TATA . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . A . TATG . . . . . . CT . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . A . TATG . . . . . . CA .
blockSeqs : . C . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . A . TATG . . . . . . TG .
blockSeqs : . G . . . . . . . C . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . TATA . . . . . . TT .
blockSeqs : . T . . . . . . . T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . A . TATA . . . . . . CT .
blockSeqs : . T . . . . . . . T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . G . TATG . . . . . . G .
blockSeqs : . T . . . . . . . T . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . A . CATG . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . TA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . .
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lowQualScore : ... ... . . . . . . ... . .... ... .. . . . ... .. ........... . ........... ... .... ... ......... ...... ...... .. ... . . . ... . .... . .... ... . .. .. ... . . . ...... ..... . .. . ... ............. . . . .. . .. . . . .. .. . .. ................. .. . . .... .... . . .... .......... . ......................... . . . . . ... .. .. .. . . .... . . .... . . . ... . . . . . . . .
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Reference ( family-555 ) : ATTTTA---TTTT--ATCACA-A-G-CGTGC-G-ATGAA-A---TTGACGAATTACGTATATAT----TT---TGTGTA--ATT-A-AAC-TGGG---AGA--CG-----------A-TA-----------ACG--TGGATATC----AACATGACCACGGGGA---A---------A------TA------G--TT---CGT-GA-AT-TTT---GACTGGGAC-C----TTGCAT-A----TTTAAATG---C-AA--T--TT---T-T-ATT-TCATGA------TG-----AT-CACGA--GG-ATTCGATT--NT-------------G-ATGA-A-A--TT-GACGAAT--CG-C-ACA-T--TTT--GTG-A--ATTT-----------------AAACTGGTCCAGGA--GACGATAACTTGG-AT----ACT----AAC-A-TGAC----C----A-----C-GGGCC------T--A--------T-G----C-A-ATTCA-T-G-AA---TTTTGACCGAGA--CCTTTTGAAATTGTCACGCGGT--ATTCAATGATTTAT-TTACACAGCACAG-T----TT-A-AAAATAATA-TGCAAATGGG--CGTTCC-G-CCCACTGG-T-GTATCTCCAGTTATTGTACACTTTTGACAAAGGGAA-AACACC-ACAGCCATG-AT-ACAA
gi|32760 : ATTTTA---TTTT--ATCACA-A-G-CGTGC-G-ATGAA-A---TTGACAAATTACGTATATAT----TT---TGTGTA--ATT-A-AAC-TGAT---GGA--CG-----------A-TA-----------ACA--TGGATATT----ATCATGACCAAGGGGA---A---------A------TA------G--TT---AGT-GA-AT-TTT---GACTGTGAC-C----CTGCAT-A----TTTAAATG---C-AA--T--TT---T-T-ATT-TCATGA------TG-----AT-CACGA--GG-AGTCGATT--AT-------------G-ATGA-A-A--TT-GACGAAT--TG-C-ACA-T--TTT--GTG-A--ATTT-----------------AAACTGGTCCTGGA--GACGATAACTTGG-AT----ACT----AAC-A-TGAC----C----A-----C-GGGCC------T--A--------T-G----C-A-ATTGA-T-G-AA---CTTTGACTAAGA--CCTTTTGAAATTGTCACGCGGT--ATTCAATGATTTAT-TTACACAGCACAG-T----TT-A-AAAATAATA-TGCAAATGGG--CGTTCC-G-CCTACTGG-T-GTATCTCCAGTTATTGTACACTTTTTACAAAGGGAA-AGCACC-ACAGCCATG-AT-ACAA
gi|32761 : ATTTTA---TTTT--ATCACA-A-A-CTTGC-G-ATGAC-A---TTGATGAATTACGCATATAT----TT---TGTGTA--ATT-A-AAC-TGGG---AGA--CG-----------A-TA-----------ACA--TGGATATC----AACATGATCACGGGAA---A---------A------TA------G--TT---CGT-GA-AT-TTT---GACTGGGAC-C----TTGCAT-A----TTTAAATG---A-AA--T--TT---T-T-ATT-TCAGGA------TG-----AT-CACGA--TA-ATTCGATT--AT-------------G-ATGA-A-A--TT-GACAAAT--CG-C-ACA-T--TTT--GTG-A--ATTT-----------------AAACTGGTCCAGGA--GACGATAACTTGG-AT----ACT----AAC-A-TGAC----T----A-----C-GGGCC------C--A--------T-G----C-A-ATTCA-T-G-AA---TTTTGACCAAGA--TCTTTTGAAATTGTCACGCCGT--ATTCAATGATGTAT-TCACACAACATAG-T----TT-A-AAAATAATA-TGCAAATCGG--CTTTCC-G-CCCACTGG-T-GTATTTCCAGTTATTGTACACTTTTGACAAAGGGAA-AACACC-ACAGTCATG-AT-ACAA
gi|32762 : ATTTTA---TTTC--ATCACA-A-G-CATGC-A-ATGAA-A---TTGATGAATTACGTATATAT----GG---TGTGTA--ATT-A-AAC-TGGG---ATA--CG-----------A-TA-----------ACA--TGGATATT----AACATGATCACGGGGA---A---------A------TA------G--TT---TCT-GA-AT-TTT---AACTGGGAC-T----TTGCAT-A----TTTAAATG---A-AA--T--TT---T-T-ATT-TCAGGA------TG-----AT-CACGA--TA-ATTCGATT--AC-------------G-ATGA-A-A--TT-GACAAAT--CG-C-ACA-T--TTT--GTG-A--ATTT-----------------AAACTGGTTCAGGA--GACGATAATTTGG-AT----ACT----AAC-A-TAAC----C----A-----C-GGGCC------C--A--------T-
gi|32762 : GATATAT-TTACACAGCACAG-T----TT-A-AAAATAATA-TGCAAATGGG--CGATCC-G-CCCACTAG-T-GGATCTCCAATTATTGTACATTTTTGACAAAGGGAA-AACACG-ACAGCCATG-AT-ACAAatatttacacagatatatttacacagcacagtttaaaaataatatgcaaatgggcgatccgcccactagtggatctccaattattgtacatttttgacaaagggaaaacacgacagccatgatacaa
gi|32763 : attttatttcatcacaagcatgcaatgaaattgatgaattacgtatatatggtgtgtaattaaactgggatacgataacatggatattaacatgatcacggggaaatagtttctgaattttaactgggactttgcatatttaaatgaaatttttatttcaggatgatcacgataattcgattacgatgaaattgacaaatcgcacattttgtgaatttaaactggttcaggagacgataatttggatactaacataaccacgggcccatatatttacacaATTTTA---TTT---ATCAAA-A-G-CATGC-G-ATGAA-A---TTCATGAATTACATACATAT----TT---TGTGAA--ATT-A-AAC-TTGG---AGA--CG-----------A-TA-----------ACT--TGGATATC----AACATGACCACGGGGA---A---------A------CA------G--TT---CGT-GA-AC-TTT---TACTGGGAC-C----TTGCAT-A----TTTAAATG---C-AA--T--TT---T-T-ATT-TCATGA------TG-----AT-CACGA--GG-ATTCGATT--CT-------------G-ATGA-A-A--TT-GACAAAT--TG-C-ACA-T--TTT--GTG-A--ATTT-----------------AAACTGGTCCAGGA--GACGATGATTTGG-AT----ACT----AAC-A-TGAC----C----A-----C-GGGCC------T--A--------T-A----C-A-ATTCA-T-G-AA---TTTTGATTGAGA--CCTTTTGAAACTGTCACACGGT--ATTCA---ATTTAT-TTACACAACACAG-T----TT-A-AAAATAATA-TGCAAATGGT--AGTTCC-G-CCCACTGG-T-GTATCTCCAGTTA-TGTACACTTTTGACAAATGAAA-AACACC-ACAGCCATG-AT-ACAA
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gi|32775 : TTTTA---TTTTGTATCACAGA-GTCGTGC-G-ATAAATA---TTT-TGGATCACTTG-ACAT----TTACACGTATA--ATT-A-A-C-TGGAGTCAAT--CG-----------AATA-----------ACGGATGGATATC----AACATGGACGCGGG-----A---------A------TA------G--TTTTTCGTTGATAT-TTTTGAGACTGGGTT-CATGTTTGCGTTA----TTTAAATG---C-AAGTT--TT---TGT-ATT-GCATGA------TG-----ATTCACGA--GG--TTTGATT--AT-------------G-AGGA-ATA--TG-TACGAAT--CA-C-ACA-T--TTTTGGTG-A--ATTTTATTTTTTTTTATATTTAAACTGGTCCAGGA--GACGATAACTTGG-ATTACTACT----GACCACTGCT----C----A-----C-GGGCC------T--AATAGTTA-T-ATCATC-A-TTTCA-T-G-GAAGTTTCTGACCTAGA--CCTTTTGAAATTGTT-CACGGC--GTT---TG---------ACACAGCACAGTT----TT-ATAAACTAATATTGCATATGGGTTCGTTCC-GTCCCACTGGTT-GTTCTTCCAGTTATTGTACACTTTTAACAAAGGGAA-AACACG-ACAGCCATG-AT-ACAA
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