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lowQualScore                  :      .     . .... . . . .. ... . .................    . .. ...... .   ...  . .. . . ....................  .. . ..     .   ..  .. ..  . .. . .......   ......     . . .   . . .......  .. . ...  . . . .... .  . ...  .  . ......... .. . . . .   .. ....  .  ... . . . .....   . . .......  .. . ..  .  ....... . .. .  ..  . .  .... . .. ... . .  .....  .   .  ...  ... ... . ... .. . .. . .. ......   .     
lowQualScore                  :      7     5 4444 4 8 4 22 222 4 33333333333333333    4 77 333333 8   888  4 33 4 4 00000000000000000000  55 4 99     9   44  88 99  8 88 4 4444444   777777     3 3 6   3 3 9999999  88 5 666  2 2 2 0000 2  6 111  6  2 000000000 77 8 2 2 8   22 9999  5  222 2 3 3 22222   3 3 5555555  88 3 55  2  0000000 6 88 6  88  3 3  7777 3 00 333 3 3  55555  3   3  333  222 555 3 333 88 3 22 8 77 333333   4     
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Reference ( gi|107626 )       : TCATA-TTGTA-AA---C-A-T-C--C---T-A------------T----GTGC-A--C---A--T-GGT---TT-C--G-G-T--------C----G------AT-TG-G--TAATT-AAA--CA-TG--TG-C-AG-G--A----AAA------AGGAG-A-A-TGA-A-C------AGC--A-T-C-CA-C-A-T----A-CA-T---AT-CA-T---------T--C-T-C-A-CAAG-C----AA-AA---C-T-T-T-----TGT-A-T--C-A--AA--A-A--AT-AA-------A-T--G-TG--AA-T-TT----A-A-TT---T-A-ATT----AC-CCT-TA---AC---T---T-T---T--T-G--T-G--G------AGT-ATATA
gi|107627                     : TCATA-TTGTA-AA---C-A-C-C--C---T-A------------T----GTGC-A--C---G--T-GGT---TT-C--G-G-T--------C----A------AT-TG-G--TAATT-AAA--CA-CG--TG-C-AG-G--T----AAA------AGGAG-A-A-TGA-A-C------AGC--A-T-C-CA-G-A-T----A-CA-T---AT-CA-T---------T--C-T-C-A------C----AA-AA---C-T-T-T-----TGT-A-T--C-A--AA--A-A--AT-AA-------A-T--G-TG--AA-T-TT----A-A-TT---T-A-ATG----TC-CCT-TA---AC---T---TAT---T--T-G--T-G--G------AGT-ATAT
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gi|107637                     : TCATA-TTGTA-AA---C-A-T-C--CA--T-A------------T----GTGC-A--T---GG-T-GTT---TT-C--G-GAT--------A----A------AT-CG-G--TAATT-AAAA-CA-CG--TG-C-CG-G--A----AAA------AGGAA-A-AATGAGA-T------GGC--T-T-GACA-T-A-T----A-CAAT---AT-CA-T---------T--C-T-C-A-CAAA-C----AA-AT---G-C-T-T-----TGT-A-TCAC-A--AG--A-A--AT-AA-------ACT--G-TG--AA----T----A-A--T---T-A-ATG----AC-CC--TA---ACTT-T---T-T---T--T-G--T-T--G------AGT-ATt
gi|107638                     : TCACA-TTATT-AC---C-A-T-C--C---T-A------------T----GTGC-A--C---G--T-GTT---GT-C--G-G-T--------C----A------AT-CG-G--CAATC-AAA--CA-CT--TG-C-AG-G--T----AAA------AGGAG-A-A-TG-----------------------------------------------A-T---------T--C-T-A-A-CATA-C----AA-AA---C-TGT-TGTACATGT-A-T--C-A--AA--A-A--AT-AA-------A-A--G-TG---------------------------------AC-CTC-TA---AC---T---T-TTTCT--T-G--T-T--G------AGT-ATATA
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gi|107639                     : TCATA-T-GTA-AA---CCA-TTC--C---T-A-----------------GTGC-A--C---G--T-GGT---TT-C--G-G-T--------TTAA-A------AT-CA-GGTTAATT-ATA---A-TGACTC-C-GG-T--T----ATA------AAGA--A-A-TGA-A-C------GGT--A-T-A-CA-CAA-A----A-CA-TTAAAT-CA-T---------T--C-T-C-A-AAAGAC----CA-AA---C-T-T-C-----TAT-A-T--T-C--AA--A-A--ATCAA-------A-TAAG-TG--AA---GT----A-A-TT---TCATATG----ACACCT-TA---AC---T---T-T---T--T-ATCT-GATG------AGT-ATATAtctctggagattattat
gi|107641                     : TCATA-TTGTA-AG---C-A-T-T--C---T-A------------T----GTGC-A--C---A--T-GGT---TT-C--G-G-T--------C----A------AT-CG-G--TAA
gi|107642                     : TCATA-TTGTC-AA---C-A-T-C--C---T-A------------T----GTGC-A--C---G--A-GGT---TT-C--G-G-T--------
gi|107643                     :  CATA-TTGTA-AA---A-C-T-C--C---T-A------------T----GTGC-AG-C---G--T-GGT---TTTC--GCG-T--------A----A------AT-CG-G--TAATA-AAG--CA-CG--TG-C-GG-G--T----AAA------AGGAG-A-A-TGA-A-C------GGT--A-T-A-CA-T-G-TACCAA-CA-T---AT-CA-T---------T--T-T-C-A-CAAA-C-----A-AA---C-T-T-C-----TGT-A-T--C----AA--A-A--AT-AA-------A-T--G-TG--AA-T-TT----ATA-AT---T-A-ATG----AC-CCT-TA---AC---T---T-T---T--T-T--T-GGTG------AGT-ATATaaat
gi|107644                     :  CATA-TGG-A-AA---C-AGT-C--CA--T-A------------T----GTG--A--C---AGGT-GGTGTTTT-C--G-G-T--------C----A------AT--G-G--TAATT-AAA--CC-TG--CATC-AG-G--AT---AAG------ACGAGGA-A-TGA-A-C------AGC--A-T-C--A-C-A-T----AGCAAT---AT-CACT---------T--C-T-C-AACAAT-C----AA-AA---CAT-C-T-----TGA-A-T--T-A--AACAA-A--AT-AA-------A-T--G-TG--AA-T-CT----A-A-TT---C-A-ATG----AC-CC--TA---TC---T---T-T---T--T-
gi|107645                     :  CATAATTGTA-GAGAGC-A-T-CGGC---TCA------------T----GTGC-CGTC---G--T-AGC---TT------G-T--------C----G------------G--TAATT-AAA--CA-CG--TG-C-CG-G--T----AAA------TGAGA-A-A-TGA-A-T------GGT--G-T-A-CA-C-A------A-CA-T---ATGCA-T---------T--CGTGC-A-CAAA-C----AACAA---C-T-T-C-----TGT-A-T--C-ATAAA--A-A--AT-AA-------A-T--G-TG--AA-T-TA----A-A-TT---T-A-ACG----AC-CTC-TA---ACT--T---T-T---T--T-GGCT-G--G------AGT-ATATAt
gi|107646                     :   ATA-TTGTA-A----C-AGT-C--C---T-G------------T-----TGC-A--T---G--T-GGT---TT-C--G-G-T--------C----A------ATATG-G--TAATTTAAA--CA-CG--TG-C-AG-G--T----AAA-------GGAG-ATA-TGA-A-C------AGC--A-T-C-CA-C-A-T----A-CA-T---AT-AA-T---------T--C-T-C-A-CAAA-T----CA-AA---C-A-T-T-----TGA-A-T-------AA--A-A--AT-AAAT-----A-T--G-TG--AA-T-TT------A-TT---T-A-ATG----AC-CCT-TA---AC---T---T-T---TTCT-G--T-G--G------AGT-ATATAt
gi|107647                     :    TA-TTGTA-AA---C-A-T-CGGCGTAC-A------------T----GTGC-A--C---T--T-GGT---TT-CCGG-G-TA-------T----A------AT-CG-G--TA-TT-AAA--CA-CG--TG-C-CG-G--T----AAA------AGGAG-A-A-TGA-A-C------GGT--A-T-CACA-C-A-T------CA-T---AT-CA-----------T--C-T-C-A-CAAA-C----AA-AA---C-T-TGT-----TGTAA-T--C-A--AA--A-A--AT--A-------A-T--G-TG--AA-T-TC----A-A------T-A-ATTATCGAC-CCT-TA---ACTT-T---T-T---T--T-G--T-G--G------AGT-ATATAt
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gi|107636                     : TCATA-TTGTA-AG---C-A---C--C---T------------AG----GTG-C-A--C--G--T-GGT---TT-C--G---T-C------A-A--T--CG----T-C--AT-C-A-TG--C-AC-TTG-C-AG------T-A-AA------TGGAA-G-A-AGA-A-C------GG-C--AAT-C-CA-C-A-T----A-CA-T---AT-C--A-T-------T--C-T-CAA-CAA-ACA---AA--AA---C-C-T-T-----TGT-A-T--A-A--AA--A-G--AT--A-------A-T--G-TG--AA-T-TT----A-A----T---T-A-ATGAC-CCT-TA---ACTTT-T--TT--T--T--G--C-G--GA--AGTATATt
gi|107637                     : TCATA-TTGTA-AA---C-A-T-C--CA--T------------AT----GTG-C-A--T--GG-T-GTT---TT-C--G-GAT-A------A-A--T--CG-G--T-A--AT-T-A-AAA-C-AC-GTG-C-CG-G----A-A-AA------AGGAA-A-AATGAGA-T------GG-C--T-T-GACA-T-A-T----A-CAAT---AT-C--A-T-------T--C-T-C-A-CAA-AC----AA--AT---G-C-T-T-----TGT-A-TCAC-A--AG--A-A--AT-AA-------ACT--G-TG--AA----T----A-A----T---T-A-ATGAC-CC--TA---ACT-T-T--TT--T--T--G--T-T--G---AGTAT
gi|107638                     : TCACA-TTATT-AC---C-A-T-C--C---T------------AT----GTG-C-A--C--G--T-GTT---GT-C--G-G-T-C------A-A--T--CG-G--C-A--AT-C-A-AA--C-AC-TTG-C-AG-G----T-A-AA------AGGAG-A-A-TG--------------------------------------------------A-T-------T--C-T-A-A-CAT-AC----AA--AA---C-TGT-TGTACATGT-A-T--C-A--AA--A-A--AT-AA-------A----------------------------------A-GTGAC-CTC-TA---AC--T-T--TTTCT--T--G--T-T--G---AGTATATA
gi|107639                     : TCATA-T-GTA-AA---CCA-TTC--C---T------------A-----GTG-C-A--C--G--T-GGT---TT-C--G-G-T-TTAA---A-A--T--CA-GGTT-A--AT-T-ATAA--TGAC--TC-C-GG-T----T-A-TA------AAGA--A-A-TGA-A-C------GG-T--A-T-A-CA-CAA-A----A-CA-TTAAAT-C--A-T-------T--C-T-C-A-AAAGAC----CA--AA---C-T-T-C-----TAT-A-T--T-C--AA--A-A--ATCAA-------A-TAAG-TG--AA---GT----A-A-T--T---TCATATGACACCT-TA---AC--T-T--TT--TA-T--C--T-GATG---AGTATATAt
gi|107640                     : TCATA-TTGTA-AA---C---T-C--C---T------------ATT---GTG-CCA--C--T--TCGGTC--TT-C--G-G-T-T------A-AAGTAGCG-GGGT-A--CT-T-A-AAAAC-AC-GTG-CCAGTG----T-A-AATACTGCAGAAG-A-A-TGA-A-CCACGGGAG-C--A-T-TTCA-T-A-T----A-CA-A---ATAC--A-T-------TAAC-T-C-A-CAA-AC----AAT-AAGGCT-T-T-T-----TGT-ACT--C-A--AA--A-A--AT-AAGTTACAAA-T--G-TG--GA-T-AT----A-AAT--T---T-A-ATGAC-CTT-TA---AC--T-T--TT--TTCT--C--T-G--G---AG
gi|107641                     : TCATA-TTGTA-AG---C-A-T-T--C---T------------AT----GTG-C-A--C--A--T-GGT---TT-C--G-G-T-C------A-A--T--CG-G--T-A--Aattattat
gi|107642                     : TCATA-TTGTC-AA---C-A-T-C--C---T------------AT----GTG-C-A--C--G--A-GGT---TT-C--G-G-T-A------A-A--T--
gi|107643                     :  CATA-TTGTA-AA---A-C-T-C--C---T------------AT----GTG-C-AG-C--G--T-GGT---TTTC--GCG-T-A------A-A--T--CG-G--T-A--AT-A-A-AG--C-AC-GTG-C-GG-G----T-A-AA------AGGAG-A-A-TGA-A-C------GG-T--A-T-A-CA-T-G-TACCAA-CA-T---AT-C--A-T-------T--T-T-C-A-CAA-AC-----A--AA---C-T-T-C-----TGT-A-T--C----AA--A-A--AT-AA-------A-T--G-TG--AA-T-TT----ATA-A--T---T-A-ATGAC-CCT-TA---AC--T-T--TT--T--T-----T-GGTG---AGTATAT
gi|107644                     :  CATA-TGG-A-AA---C-AGT-C--CA--T------------AT----GTGAC-A--G--G--T-GGTGTTTT-C--G-G-T-C------A-A--T---G-G--T-A--AT-T-A-AA--C-CT-GCATC-AG-GA---T-A-AG------ACGAGGA-A-TGA-A-C------AG-C--A-T-C--A-C-A-T----AGCAAT---AT-C--ACT-------T--C-T-C-AACAA-TC----AA--AA---CAT-C-T-----TGA-A-T--T-A--AACAA-A--AT-AA-------A-T--G-TG--AA-T-CT----A-A-T--T---C-A-ATGAC-CC--TA---TC--T-T--TT--T--T--
gi|107645                     :  CATAATTGTA-GAGAGC-A-T-CGGC---TC-----------AT----GTG-C-CGTC--G--T-AGC---TT-------------------G--T--CG-G--T-A--AT-T-A-AA--C-AC-GTG-C-CG-G----T-A-AA------TGAGA-A-A-TGA-A-T------GG-T--G-T-A-CA-C-A------A-CA-T---ATGC--A-T-------T--CGTGC-A-CAA-AC----AAC-AA---C-T-T-C-----TGT-A-T--C-ATAAA--A-A--AT-AA-------A-T--G-TG--AA-T-TA----A-A-T--T---T-A-ACGAC-CTC-TA---AC--T-T--TT--T--T--GGCT-G--G---AGTATATA
gi|107646                     :   ATA-TTGTA-A----C-AGT-C--C---T------------GT-----TG-C-A--T--G--T-GGT---TT-C--G-G-T-C------A-A--TA-TG-G--T-A--AT-TTA-AA--C-AC-GTG-C-AG-G----T---AA------AGGAG-ATA-TGA-A-C------AG-C--A-T-C-CA-C-A-T----A-CA-T---AT-A--A-T-------T--C-T-C-A-CAA-AT----CA--AA---C-A-T-T-----TGA-A-T-------AA--A-A--AT-AAAT-----A-T--G-TG--AA-T-TT------A-T--T---T-A-ATGAC-CCT-TA---AC--T-T--TT--TC-T--G--T-G--G---AGTATATAt
gi|107647                     :    TA-TTGTA-AA---C-A-T-CGGCGTAC------------AT----GTG-C-A--C--T--T-GGT---TT-CCGG-G-TAT------A-A--T--CG-G--T-A---T-T-A-AA--C-AC-GTG-C-CG-G----T-A-AA------AGGAG-A-A-TGA-A-C------GG-T--A-T-CACA-C-A-T------CA-T---AT-C--A---------T--C-T-C-A-CAA-AC----AA--AA---C-T-TGT-----TGTAA-T--C-A--AA--A-A--AT--A-------A-T--G-TG--AA-T-TC----A-A-TAAT---T-A-TCGAC-CCT-TA---ACT-T-T--TT--T--T--G--T-G--G---AGTATATAt
gi|107648                     :      -TTGTATAG---C-A-T-C--T---T------------ATTGTCATG-C-A--CTAGATC-GGT---TT-CC-G-G-T-C------ACA--T--CG----T-A--AT-T-A-AA--C-AC-GTG-C-AG-G----TCATAG------AGGAG-A-A-TGA-A-C------GG-CTAA-T-C-CA-C-A-TC---A-CA-T---ATTC--A-T-------T--C-T-C-A-CAA-AC----AA--AA---C-G-T-T-----GTT-A-T--T-G--AA--A-A--AT--A-------A-T--G-TG--AA-TATT----A-C-T--T---T-A-ATAAC-TCT-TAAACAC--T-T--TT-----------T-G--G---AGTATATt
gi|107649                     :        TGCA-AG---C-A-T-C--T---T------------AG----GTG-C-A--C--A--T-AGT---TT-C--G-G-T-C------A-T--C--TG-G--TTAGTAT-C-A-AG--C-AC-TTG-C-AG-A----T-A-AA------AGGAG-A-A-TGA-A-C------GG-C--A-T-C-CA-C-A-T----A-CA-T---AT-C--A-T-------G--CTT-C-A-CAA-TC----AA--AG-----G-T-T-----TGT-A-T--C-A--AA--A-AAGATAAA-------A-T--GTTG--AA-T-TT----T-A----T---T-G-ATGAC-CCT-TA---ACTGT-T--TT--T--T--G--CAG--G---AG-ATAT
gi|107650                     :        TGTA-AA---C-A-T-CT-C---T------------AT----GTG-C-AA-T--G--T-GGG---TT-C--T-G-C-CGGGTAAA-A--T--CG-G--T-A--AT---A-AA--C-AC-GTG-C-AG-G----T-A-AA------AGGAG-T-A-TGA-A-C------GG----G-T-A-CA-T-A-T----A-CATT---AT-C--A-TGTGGCTAC--C-C-C-T-CCA-AC----AA--AA---C-T-T-T-----TGT-A-T--A-A--AA--AGA--ATGAG-------A-T----TG--AA-T-TT----A-C-T--T---T-A-ATGAA-CTT-AA---AC--T-T--TT--T--T--G--T-T--G---AGTA-ATA
gi|107651                     :        TGTA-AG---C-A-T-C--C---TAGGCTTGTTTGAAT----GTG-C----------T-GGT---TT-C--G-G-T-C------A-A--T--C--T--T-A--AT-TCA-AA--C-ACTTTG-C-AG-GATTAT-A-AT------AGGAG---A-TG--A-C------GGAA--A-T-C-CC-C-A-T----A-C------AT-T--A-T-------T--C-T-C-A-CAA-AC----AA--AA---C---T-T-----TGT-A-TG-C-A--AA--A-A--AT-AA-------A-T--A-TG---A-T-TT----A-A-T--T---TGA-ATGA--CCT-TA---AC--T-T--TT--T--T--G--T-G--G---AGTATATtgtat
gi|107652                     :           A-AG---C-A-T-C--T---T------------AG----GTG-C-A--C--A--T-AGT---TT-C--G-G-T-C------A-A--T--CG-G--T-A--AT-C-A-AG--C-AC-TTG-C-AG-A----T-A-AA------AGGAG-A-A-TGA-A-C------GG-C--A-T-C-CA-C-A-T----A-CA-T---AT-C--A-T-------G--CTT-C-A-CAA-TC----AA--AG-----G-T-T-----TGT-A-T--C-A--AA--A-AAGATAAA-------A-T--GTTG--AA-T-TT----T-A----T---T-G-ATGAC-CCT-TA---ACTGT-T--TT--T--T--G--CAG--G---AG-ATAT
gi|107653                     :              A---C-A-T-C--C---T------------AT----GTG-C-A--G--G--T-GGT---TT-C--G-G-C-C------A-A--T--CG-G--T-G--AT-T-A-AA--C-AC-GTG-C-AG-A----T-A-AA------AGGAG-A-A-TGA-A-A------GG-C--A-T-G-CA-C-ATT----A-CA-----AT-CAAA-C-------C--C-T-T-A-TAT-AT----AACTAA---C-T-T-T-----
gi|107654                     :                   -A-T-C--C---T------------AT----GTG-C-A--C--G--A-GGT---TT-C--G-G-T-C------A-A--T--TG-G--T-A--AT-T-A-AA--C-AC-GTG-C-AG-G----T-A-AA------AGGAG-A-T-TGA-A-C------AG-C--A-T-C-CA-C-A-T----G-CA-T---AC-C--A-G-------T--G-T-C-A-CAA-AC----AA--AA---C-T-T-T-----TGA-A-T--T-A--AA--A-A--AT-AA-------A-C--G-TG--AA-T-TC----A-A-T--T---T-A-ATGCC-CAT-TA---AC--T-T--TT--T--T--G--T-G--G---AGTATAT
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gi|107656                     :                                                                                                     G-G--T-A--AT-C-A-AA--C-AC-CTG-C-AG-C----T-A-AA------CGGAG-A-A-TGA-A-C------GG-C--A-T-C-CG-C-A-T----A-CA-T---AT-C--A-T-------T--C-T-C-A-CAA-AC----AA--AA---C-T-T-T-----TGT-A-T--A-A--AA--A-A--AT-AA-------A-T--G-TG--AA-T-TT----A-A-T--T---T-G-ATGAC-CCT-TA---AC--T-T--TT--T--T--G--T-G--G---AGTATATgt
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Reference ( family-549 )      : TCATA-TTGTA-AA---C-A-T-C--C---T------------AT----GTG-C-A--C--G--T-GGT---TT-C--G-G-T-C------A-A--T--CG-G--T-A--AT-T-A-AA--C-AC-GTG-C-AG-G----T-A-AA------AGGAG-A-A-TGA-A-C------GG-C--A-T-C-CA-C-A-T----A-CA-T---AT-C--A-T-------T--C-T-C-A-CAA-AC----AA--AA---C-T-T-T-----TGT-A-T--C-A--AA--A-A--AT-AA-------A-T--G-TG--AA-T-TT----A-A-T--T---T-A-ATGAC-CCT-TA---AC--T-T--TT--T--T--G--T-G--G---AGTATATA
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gi|107643                     :  CATA-TTGTA-AA---A-C-T-C--C---T------------AT----GTG-C-AG-C--G--T-GGT---TTTC--GCG-T-A------A-A--T--CG-G--T-A--AT-A-A-AG--C-AC-GTG-C-GG-G----T-A-AA------AGGAG-A-A-TGA-A-C------GG-T--A-T-A-CA-T-G-TACCAA-CA-T---AT-C--A-T-------T--T-T-C-A-CAA-AC-----A--AA---C-T-T-C-----TGT-A-T--C----AA--A-A--AT-AA-------A-T--G-TG--AA-T-TT----ATA-A--T---T-A-ATGAC-CCT-TA---AC--T-T--TT--T--T-----T-GGTG---AGTATAT
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gi|107646                     :   ATA-TTGTA-A----C-AGT-C--C---T------------GT-----TG-C-A--T--G--T-GGT---TT-C--G-G-T-C------A-A--TA-TG-G--T-A--AT-TTA-AA--C-AC-GTG-C-AG-G----T---AA------AGGAG-ATA-TGA-A-C------AG-C--A-T-C-CA-C-A-T----A-CA-T---AT-A--A-T-------T--C-T-C-A-CAA-AT----CA--AA---C-A-T-T-----TGA-A-T-------AA--A-A--AT-AAAT-----A-T--G-TG--AA-T-TT------A-T--T---T-A-ATGAC-CCT-TA---AC--T-T--TT--TC-T--G--T-G--G---AGTATATAt
gi|107647                     :    TA-TTGTA-AA---C-A-T-CGGCGTAC------------AT----GTG-C-A--C--T--T-GGT---TT-CCGG-G-TAT------A-A--T--CG-G--T-A---T-T-A-AA--C-AC-GTG-C-CG-G----T-A-AA------AGGAG-A-A-TGA-A-C------GG-T--A-T-CACA-C-A-T------CA-T---AT-C--A---------T--C-T-C-A-CAA-AC----AA--AA---C-T-TGT-----TGTAA-T--C-A--AA--A-A--AT--A-------A-T--G-TG--AA-T-TC----A-A-TAAT---T-A-TCGAC-CCT-TA---ACT-T-T--TT--T--T--G--T-G--G---AGTATATAt
gi|107648                     :      -TTGTATAG---C-A-T-C--T---T------------ATTGTCATG-C-A--CTAGATC-GGT---TT-CC-G-G-T-C------ACA--T--CG----T-A--AT-T-A-AA--C-AC-GTG-C-AG-G----TCATAG------AGGAG-A-A-TGA-A-C------GG-CTAA-T-C-CA-C-A-TC---A-CA-T---ATTC--A-T-------T--C-T-C-A-CAA-AC----AA--AA---C-G-T-T-----GTT-A-T--T-G--AA--A-A--AT--A-------A-T--G-TG--AA-TATT----A-C-T--T---T-A-ATAAC-TCT-TAAACAC--T-T--TT-----------T-G--G---AGTATATt
gi|107649                     :        TGCA-AG---C-A-T-C--T---T------------AG----GTG-C-A--C--A--T-AGT---TT-C--G-G-T-C------A-T--C--TG-G--TTAGTAT-C-A-AG--C-AC-TTG-C-AG-A----T-A-AA------AGGAG-A-A-TGA-A-C------GG-C--A-T-C-CA-C-A-T----A-CA-T---AT-C--A-T-------G--CTT-C-A-CAA-TC----AA--AG-----G-T-T-----TGT-A-T--C-A--AA--A-AAGATAAA-------A-T--GTTG--AA-T-TT----T-A----T---T-G-ATGAC-CCT-TA---ACTGT-T--TT--T--T--G--CAG--G---AG-ATAT
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gi|107651                     :        TGTA-AG---C-A-T-C--C---TAGGCTTGTTTGAAT----GTG-C----------T-GGT---TT-C--G-G-T-C------A-A--T--C--T--T-A--AT-TCA-AA--C-ACTTTG-C-AG-GATTAT-A-AT------AGGAG---A-TG--A-C------GGAA--A-T-C-CC-C-A-T----A-C------AT-T--A-T-------T--C-T-C-A-CAA-AC----AA--AA---C---T-T-----TGT-A-TG-C-A--AA--A-A--AT-AA-------A-T--A-TG---A-T-TT----A-A-T--T---TGA-ATGA--CCT-TA---AC--T-T--TT--T--T--G--T-G--G---AGTATATtgtat
gi|107652                     :           A-AG---C-A-T-C--T---T------------AG----GTG-C-A--C--A--T-AGT---TT-C--G-G-T-C------A-A--T--CG-G--T-A--AT-C-A-AG--C-AC-TTG-C-AG-A----T-A-AA------AGGAG-A-A-TGA-A-C------GG-C--A-T-C-CA-C-A-T----A-CA-T---AT-C--A-T-------G--CTT-C-A-CAA-TC----AA--AG-----G-T-T-----TGT-A-T--C-A--AA--A-AAGATAAA-------A-T--GTTG--AA-T-TT----T-A----T---T-G-ATGAC-CCT-TA---ACTGT-T--TT--T--T--G--CAG--G---AG-ATAT
gi|107653                     :              A---C-A-T-C--C---T------------AT----GTG-C-A--G--G--T-GGT---TT-C--G-G-C-C------A-A--T--CG-G--T-G--AT-T-A-AA--C-AC-GTG-C-AG-A----T-A-AA------AGGAG-A-A-TGA-A-A------GG-C--A-T-G-CA-C-ATT----A-CA-----AT-CAAA-C-------C--C-T-T-A-TAT-AT----AACTAA---C-T-T-T-----
gi|107654                     :                   -A-T-C--C---T------------AT----GTG-C-A--C--G--A-GGT---TT-C--G-G-T-C------A-A--T--TG-G--T-A--AT-T-A-AA--C-AC-GTG-C-AG-G----T-A-AA------AGGAG-A-T-TGA-A-C------AG-C--A-T-C-CA-C-A-T----G-CA-T---AC-C--A-G-------T--G-T-C-A-CAA-AC----AA--AA---C-T-T-T-----TGA-A-T--T-A--AA--A-A--AT-AA-------A-C--G-TG--AA-T-TC----A-A-T--T---T-A-ATGCC-CAT-TA---AC--T-T--TT--T--T--G--T-G--G---AGTATAT
gi|107655                     :                                                                     T---TT-T--G-G-A-C------A-A--T-------------ATGT-N-NN--N-NN-NNN-N-NN-N----N-N-AA------AGGAG-A-A-TGA-A-C------AG-C--A-T-C-AA-C-A-T----A-CA-T---AT-A--A-T-------T--C-T-C-A-CAA-AG----GA--AA---C-T-T-T-----TGT-A-T--T-A--AA--A-T--AT-AA-------A-T--G-TG--AA-T-TT----A-A-T--T---C-A-ATAAC-CCT-TA---AT--T-T--TT--T--------T-G--G---AGCATAT
gi|107656                     :                                                                                                     G-G--T-A--AT-C-A-AA--C-AC-CTG-C-AG-C----T-A-AA------CGGAG-A-A-TGA-A-C------GG-C--A-T-C-CG-C-A-T----A-CA-T---AT-C--A-T-------T--C-T-C-A-CAA-AC----AA--AA---C-T-T-T-----TGT-A-T--A-A--AA--A-A--AT-AA-------A-T--G-TG--AA-T-TT----A-A-T--T---T-G-ATGAC-CCT-TA---AC--T-T--TT--T--T--G--T-G--G---AGTATATgt
gi|107657                     :                                                                                                                                TG-C-AG-A----T-A-AA------AGCAG-A-A-TGA-A-C------GG-C--A-T-C-CA-C-T-T----A-CA-T---AT-C--A-T-------T--C-T-C-A-CGA-AC----AA--TA---A-T-T-T-----TAT-A-T--C-A--AA--A-A--TC-AA-------A-T--G-TG--AA-G-TT----A-A-T--T---T-A-ATGAC-CCT-TA---ACA-T-T--TT--T--T--G--T-G--T---AGTATAT
gi|107658                     :                                                                                                                                              -A-AA------AGGAG-A-A-TGC-A-C------AG-C--A-T-T-CA-C-A-T----A-CA-T---AC-T--A-T-------T--C-T-C-A-CAA-AT----AA--AA---C-gt
gi|107659                     :                                                                                                                                                                                       -T-C-CG-C-A-T----A-CA-T---AT-T--A-T-------T--C-T-C-A-CAA-AC----AA--AA---C-T-T-T-----TGT-A-T--C-A--AA--A-A--AT-AA-------A-T--G-TG--AA-T-TT----A-A-T--T---T-A-ATGAC-CCT-GA---AC--T-T--TT--T--T--G--T-G--G---AGTCTAT
gi|107660                     :                                                                                                                                                                                             A-C-A-T----A--G-T---AT-C--A-T-------T--C-T-C-AACAA-ACGAAAAA--AA---C-T-C-T------GT-A-T--CAA--AA--A-A--AT-AG-------ATT--G-TGAAAA-T-TCTGAGA-G-T--TACAT-A-ATGAC-CCCATA---AC--T-T--TT--TG-TTGG--T-G--GTCAAGTATAT


blockSeqs                     :      A     T AGAG C G T GG GTA AGGCTTGTTTGA  TGTC   A C GT TA AT C   GTT  T CG C A CGGGTAA  C AG AG  A GT T GT  G T T  AA G  T   T CA T ATTA C T  TACTGC     G T A   G A CACGGG  A TA A AC   T A T ACCA G  A TAA  A AA C GTGGCTA AA G G A A   G  GAAA  CT  GGC A G G GTACA   A C CACA     CA G AG  C  GTTACAA C AA T  AA  C A  TGAG T TAA  ACA C T     A   A  AAC  TT C TA  TC TC TG GC A AT TCA
blockSeqs                     :      .     . A    . G . GG A   C             T      . . G  .  G  .   C    . C  . . TTAA     . .  A   . GG . .   . C .  A  .  .   T A  . A    . .  .          . . A   . . .       . .  . GA   . . . T    .  A .    G .  . .       .  T . . A   .  A     T   .   . . . .       . . CATA     .  . AG  A  AT      T .  T  .   . .  .    . AT   .   G .     .   .  .    TG . .   .  A  .  .  A GT A  
blockSeqs                     :      .     . A    . . . T  A   .             .      . . A  .  .  .   .    . .  . . GTA      . .  .   . .  . .   . . .  .  .  .   . A  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . TT   . . . C    .  T .    T .  . .       .  T . . A   .  .     C   .   . . . .       . . GCA      .  . .   G  .       . .  .  .   . .  .    . T    .   . .     .   .  .    TG . .   .  C  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :      .     . A    . . . .  .   .             .      . . .  .  .  .   .    . .  . . AT       . .  .   . .  . .   . . .  .  .  .   . C  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . CA   . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . CAA      .  . .   A  .       . .  .  .   . .  .    . T    .   . .     .   .  .    T  . .   .  G  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :      .     . A    . . . .  .   .             .      . . .  .  .  .   .    . .  . . C        . .  .   . .  . .   . . .  .  .  .   . A  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . C    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . CA       .  . .   .  .       . .  .  .   . .  .    . T    .   . .     .   .  .    T  . .   .  .  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :      .     . A    . . . .  .   .             .      . . .  .  .  .   .    . .  . . C        . .  .   . .  . .   . . .  .  .  .   . A  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . C    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . CA       .  . .   .  .       . .  .  .   . .  .    . T    .   . .     .   .  .    T  . .   .  .  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :      .     . A    . . . .  .   .             .      . . .  .  .  .   .    . .  . . A        . .  .   . .  . .   . . .  .  .  .   . C  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . A    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . CA       .  . .   .  .       . .  .  .   . .  .    . T    .   . .     .   .  .    T  . .   .  .  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :      .     . A    . . . .  .   .             .      . . .  .  .  .   .    . .  . . C        . .  .   . .  . .   . . .  .  .  .   . C  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . C    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . CA       .  . .   .  .       . .  .  .   . .  .    . T    .   . .     .   .  .    T  . .   .  .  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :      .     . A    . . . .  .   .             .      . . .  .  .  .   .    . .  . . C        . .  .   . .  . .   . . .  .  .  .   . A  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . C    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . TG       .  . .   .  .       . .  .  .   . .  .    . T    .   . .     .   .  .    A  . .   .  .  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :      .     . G    . . . .  .   .             .      . . .  .  .  .   .    . .  . . A        . .  .   . .  . .   . . .  .  .  .   . A  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . A    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . CT       .  . .   .  .       . .  .  .   . .  .    . T    .   . .     .   .  .    .  . .   .  .  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :      .     . A    . . . .  .   .             .      . . .  .  .  .   .    . .  . . C        . .  .   . .  . .   . . .  .  .  .   . C  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . A    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . CA       .  . .   .  .       . .  .  .   . .  .    . T    .   . .     .   .  .    .  . .   .  .  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :      .     . C    . . . .  .   .             .      . . .  .  .  .   .    . .  . . A        . .  .   . .  . .   . . .  .  .  .   . A  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . C    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . TA       .  . .   .  .       . .  .  .   . .  .    . A    .   . .     .   .  .    .  . .   .  .  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :      .     . A    . . . .  .   .             .      . . .  .  .  .   .    . .  . . A        . .  .   . .  . .   . . .  .  .  .   . G  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . A    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . AA       .  . .   .  .       . .  .  .   . .  .    . T    .   . .     .   .  .    .  . .   .  .  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :      .     . A    . . . .  .   .             .      . . .  .  .  .   .    . .  . . C        . .  .   . .  . .   . . .  .  .  .   . G  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . C    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . CA       .  . .   .  .       . .  .  .   . .  .    . T    .   . .     .   .  .    .  . .   .  .  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :      .     . G    . . . .  .   .             .      . . .  .  .  .   .    . .  . . A        . .  .   . .  . .   . . .  .  .  .   . A  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . A    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . TC       .  . .   .  .       . .  .  .   . .  .    . T    .   . .     .   .  .    .  . .   .  .  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :      .     . A    . . . .  .   .             .      . . .  .  .  .   .    . .  . . C        . .  .   . .  . .   . . .  .  .  .   . C  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . A    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . CA       .  . .   .  .       . .  .  .   . .  .    . T    .   . .     .   .  .    .  . .   .  .  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :      .     . A    . . . .  .   .             .      . . .  .  .  .   .    . .  . . T        . .  .   . .  . .   . . .  .  .  .   . A  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . C    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . TA       .  . .   .  .       . .  .  .   . .  .    . T    .   . .     .   .  .    .  . .   .  .  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :      .     . A    . . . .  .   .             .      . . .  .  .  .   .    . .  . . C        . .  .   . .  . .   . . .  .  .  .   . C  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . A    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . CA       .  . .   .  .       . .  .  .   . .  .    . T    .   . .     .   .  .    .  . .   .  .  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :      .     . A    . . . .  .   .             .      . . .  .  .  .   .    . .  . . A        . .  .   . .  . .   . . .  .  .  .   . A  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . C    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . TG       .  . .   .  .       . .  .  .   . .  .    . T    .   . .     .   .  .    .  . .   .  .  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :      .     . G    . . . .  .   .             .      . . .  .  .  .   .    . .  . . A        . .  .   . .  . .   . . .  .  .  .   . A  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . C    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . CA       .  . .   .  .       . .  .  .   . .  .    . T    .   . .     .   .  .    .  . .   .  .  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :      .     . G    . . . .  .   .             .      . . .  .  .  .   .    . .  . . C        . .  .   . .  . .   . . .  .  .  .   . A  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . C    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . AA       .  . .   .  .       . .  .  .   . .  .    . T    .   . .     .   .  .    .  . .   .  .  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :      .     . A    . . . .  .   .             .      . . .  .  .  .   .    . .  . . C        . .  .   . .  . .   . . .  .  .  .   . A  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . A    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . CA       .  . .   .  .       . .  .  .   . .  .    . T    .   . .     .   .  .    .  . .   .  .  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :      .     . G    . . . .  .   .             .      . . .  .  .  .   .    . .  . . C        . .  .   . .  . .   . . .  .  .  .   . A  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . C    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . TA       .  . .   .  .       . .  .  .   . .  .    . T    .   . .     .   .  .    .  . .   .  .  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :            . G    . . . .  .   .             .      . . .  .  .  .   .    . .  . . C        . .  .   . .  . .   . . .  .  .  .   . A  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . C    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . TA       .  . .   .  .       . .  .  .   . .  .    . T    .   . .     .   .  .    .  . .   .  .  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :            . A    . . . .  .   .             .      . . .  .  .  .   .    . .  . . C        . .  .   . .  . .   . . .  .  .  .   . A  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . G    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . AA       .  . .   .  .       . .  .  .   . .  .    . .    .   . .     .   .  .    .  . .   .  .  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :            . .    . . . .  .   .             .      . . .  .  .  .   .    . .  . . C        . .  .   . .  . .   . . .  .  .  .   . N  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . C    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . CA       .  . .   .  .       . .  .  .   . .  .    . .    .   . .     .   .  .    .  . .   .  .  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :            . .    . . . .  .   .             .      . . .  .  .  .   .    . .  . . C        . .  .   . .  . .   . . .  .  .  .   . A  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . C    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . CA       .  . .   .  .       . .  .  .   . .  .    . .    .   . .     .   .  .    .  . .   .  .  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :              .    . . . .  .   .             .      . . .  .  .  .   .    . .  . . C        . .  .   . .  . .   . . .  .  .  .   . A  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . C    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . C        .  . .   .  .       . .  .  .   . .  .    . .    .   . .     .   .  .    .  . .   .  .  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :                   . . . .  .   .             .      . . .  .  .  .   .    . .  . . C        . .  .   . .  . .   . . .  .  .  .   . .  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . C    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . C        .  . .   .  .       . .  .  .   . .  .    . .    .   . .     .   .  .    .  . .   .  .  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :                                                                      .    . .  . . .        . .  .   . .  . .                    . .  . .    . .  .          . . .   . . .       . .  . T    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . C        .  . .   .  .       . .  .  .   . .  .    . .    .   . .     .   .  .    .  . .   .  .  .  .  . .  .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                              . .  .          . . .   . . .       . .  . C    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .       . . .        .  . .   .  .       . .  .  .   . .  .    . .    .   . .     .   .  .    .  . .   .  .  .             
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       . .    . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   . . . .                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                              . . . .    .  . .    . .  . .       .  . . . .   .  .     .   .   .                                                                                                                                


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