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Reference ( gi|99540 )        : AAG-TGAT-TG-CGTGGGT-C-TTG-AA-AAA-TTAAT-GG-C----CCATT--GA--ATT----------TT----TTTTA---A-TTTT----------------------TACA-TAT-TTTGT---T-G--TTG-A-A---AG-T-GT---CT-G-T--AA-C-A-T--AT-T-----AT------G-A-AAG-T---A-T-GA----GG-------T--G---TG--------G-T--T-T--TC----A----AG---------GT-CAT--T-G--T--GA-CGCT-AT-G-----T--TT--GCCA--T-A-GC-A--A---CCCC-CCATTT-CATCTT-TTT--G-A-A-A-TA-A--AT-C-A--A----ATGG-G--T--ACTT-TAT-A--AGGG-GA--T--A----AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-C------T-AGAGT-G-T-TTC---A-T-A--T-GT-TA-TA---T-A--GG-A--TTAAA-GA-CAAAGGTAT---A-GA-T-AATG-CA-T--A-C-TTTTTAT-C--A--AACC-TCA-A-T-TTATTTTCAA
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gi|99557                      :  AG-TGAT-TG-CGAGAGT-A-TTG-AA-AAAATTAAT-G--C----CCATT--TA--ATT----------TT----TTT-----A-TTTT----------------------TACA-TAT-TTTGT---A-G--TGG-A-A---AGGT-GT---CT-G-T--AA-C-G-T--AT-T-----AT------G-A-AAA---------GA----GGGTTTTTGT--A---TG--------A-T--G-T--TC----A----GG---------GG-TAT--G-C--T--GA-CGCT-AC-G-----G--TTCGGCCA--TGA-GC-A--A---ACCC-C-GTTT-CATCTT-TTT----A-A-A-TA-A--AT-C-A--T----ATGG-T--T----TTATAT-A--ACAGTGT--T--T----AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AAG-C------T-AGAGT-G-T-TTC---A-TCA--T-CT-TG-TAT--T-A--GG-A--TTAA---A-CAAA-GTCT---A-GA-T-TATG-CA-TAAA-T-TTTTTAT-C--A--AAAC-CCA-A-T-TCATTT
gi|99559                      :  AA-TGAA-TG-CTTG--T-A-TTG-AA-AA--TTAAA-TG-C----CCATT---A--ATT----------AT----TTTTA-----TTTT----------------------TACA-TAT-TTTGT---A-G--TTG-A-A---AG-T-GT---CT-G-T--AA-C---T--A--T-----AT------G-ACAAG-T---A-T-GA----CG-------T--G---TAT-------G-A--T-T--TC---------AG---------TT-CAT--T-G--G--GA-CGCT-AC-GA----G--TT--GCCA--T-ATAC-A--A---CCCC-TCATGT-TATCTT-TTT--G-A-A----A-A--AT-CTAT-A----ATGG-A--TTAGTTT-TAT-A----GT-GT--T--T----AGA-AT-TTGA--A-T--T-AA-AGG--------T-AGAGT-G-T-TTC---A-T-A--T-CT-TA-TA---T-G--AG-A--TTAAACGA-CAAAGGTTTCTAG-GA-TAAATG-CACT--A-A-TTTTTATCC--A--AACCGTCA-A-T-TTATTTTCAA
gi|99560                      :  AG-TGAT-TG-AGAGGGT-A-TTG-AA-AAA-TTAAA-GG-C----TG--T--GA--ATT----------TTTTTTTTTTA---A-TTTT----------------------CACA-TAT-TTT-T---A-GA-TTT-A-A---AG-T-G----CT-G----AA-C-C-T--AT-
gi|99561                      :    -TGAT-TG-CGTGGGT-A-TTG-AA-AAA-TTAA--AG-T----TCATT--GA--ATT----------TT----CTTGA---A-GTTG----------------------TACA-TAT-TTTGT---A-G--TTG-A-A---AG-T-GT---CT-G-T--AA-CCG-T--AT-T-----AT------G-A-A-G-T---A-T-GA----GG-------T--A---TG--------A-T--T-T--C----------AG---------GT-CAT--T-G--T--GT-CGAT-AC-GG----T--TT--GCCA--T-A-GC-A--A---CCCC-C-ATTT-CAT--T-TTT--A-A-A-A------------A--A----ATA----------TT-TAT-A--AGGT-GT--T--T----AAA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-C------T-AGAGT-A-T-TTC---A-T-A--T-CT-TA-TA---T-T--GG-A--TTAAA-GA-CAAGGGTCT---A-GA-T-AATG-CA-T--A-C-TTTTTATAA--A--AACC-TTC-A-T-TTTTTTT
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gi|99563                      :                      -TTG-AA-AAAATTAAT-GA-CTCACCCATT--GA---------------------TTTTA-----TTTT----------------------TA----AT-TT-GT---A-G--T-G-ACA---AG-G-CT---CA-G-T--AG-C-G-TCAAT-T-----AT------A-A-AAG-T---AAT-AA----GG----------GCATTG--------A-T--TATG-TC----ATAGCAG---------GT-CTA--T-G--T--GA-CGCT-AC-G-----G--TT--GCC---T-A-GCCA--A---CCCC----TTTACAT-TT-TTT--G-A-A-A-TA-AG-AT-C-T--A-----TAG-G--T----TT-TAG-A--AGGT-GT--T--A-----GA-AT-TTG---A-T--A-AA-AAGCC------T-ATAGT-G-T-ATC---A-T-A--A-TC-TA-TA---T-A--GGAA--TTAAA-GA-CAA
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gi|99566                      :                         G-GA-GAA-CTAAT-TG-A----CCATT--GA--ATT----------TC----TTTT----A-TTTT----------------------TACA-TAT-AACGT---A-G--CTT-A--------T-GTTAGCG-G-T--AT-C-A----AT-TG----AT--------A-AAG-T---A-T--C----GG-------T--T---TG--------G-A--T-TAGTC----A----GG---------TT-CAT--A-G--T--GT-TGCT-AT-GGGCACT--TT--ATCA--T-------------CCCC-CCc
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gi|99568                      :                                A-TTAAT-GG-C----CCATT--GA--TTT----------TT----TTTTTTT-A-TTTT----------------------TACA-TGT-TTTGT---A-G--TTG-A-A---AG-T-GT---CT-G-T--AA-C-G-T--AT-C-----AT------G-A-AAG-T---A-T-GA----GG-------T--A---TG--------A-T--T-T--TC----A----GG---------GT-CAT--T-G--T--GA-CGCT-AC-G-----G--TT--GCCA--T-A-GC-A--A----CCC-CCATTT-CATCTT-TTT--T-A-A-A-TA-A--AT-C-AT-AATTTATGG-G--T--ATTT-TAT-A--AGGT-GT--T--T----AGA-AT-TTGA--A-T--A-AA-AGG-CTAGCTAT-AGAGT-G-T-TTC---A-T-A--C-CT-TA-TA---T-A--GG-A--TTAAA-GA-CAAAGGTCT---A-GA-T-AATG-CA-T--A-A-TTTTTAT-CT-A--AACC-TCA-A-T-TTATTTTCAAggcactttatccccccc
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gi|99558                      :  AG-TGAT-TG-CGTGG-T-ATT--G-AC-AAA-T---AAT-GGC----CC-ATT--GA------------------TTTTTTTT---A-TTTT----------------------TAC-A-T-ATTT-GT-AG-TT-T-A-AGTAA---G-T-GTCT-G-T--AA-C-G-T--AT-T-----A--T------GG-A-AAT-T---A-T-CA----G-G-------T--A--TG--------G--TTT---TC----------G---------GTCA-T--T-A--T-G--A-C-GC-TAC--G-G----T-T--ACCA-T-A--G-C-AA--CCC---CCA-TTT-CATCTT-TT--TGAA-A-ATA-A-ATTT--AT----T--ATGGG--T--G-TTTGT-A--A-G----G-T-G-TTT--ATA-ATCTTGA--A-T--A-A-AAGG-C------T-AA-----TGT-G-----T-TTC---A-TCA--TC-T-TAATA---T-A--GA-A--T-T-AAA-GA-CAA---AGG--TCT-A-GA-T-AA--T-GCA-TATA--TTTTTA-TC-AA-A--C-TCA-A-A-TTA
gi|99559                      :  AA-TGAA-TG-CTTG--T-ATT--G-AA-AA--T--TAAA-TGC----CC-ATT---A--A----T----------TATTTTT----A-TTTT----------------------TAC-A-T-ATTTTGT-AG-TT-G-A-A---A---G-T-GTCT-G-T--AA-C---T--A--T-----A--T------G--ACAAG-T---A-T-GAC---GTG-------T--A--TG--------A---TT---TC----A-----G---------TTCA-T--T-G--G-G--A-C-GC-TAC--GAG----T-T--GCCA-T-AT-A-C-AA-CCCC---TCA-TGT-TATCTT-TT--TG-A-A---A-A-A-TCT-AT----A--ATGGA--TTAGTTTTAT-A---------G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--T-A-AAGG--------T-AG-----AGT-G-----T-TTC---A-T-A--TC-T-T-ATA---T-G--AG-A--T-T-AAACGA-CAA---AGGTTTCT-AGGA-TAAA--T-GCACTA-A--TTTTTA-TC-CA-AACCGTCA-A-T-TTATTTTCAA
gi|99560                      :  AG-TGAT-TG-AGAGGGT-ATT--G-AA-AAA-T--TAAA-GGC----T---GT--GA--ATTTTT----------TTTTTTTA---A-TTTT----------------------CAC-A-T-ATTTT-T-AGATT-T-A-A---A---G-T-G-CT-G----AA-C-C-T--AT-
gi|99561                      :    -TGAT-TG-CGTGGGT-ATT--G-AA-AAA-T--TAA--AGT----TC-ATT--GA--A----T----------TTTCTTGA---A-GTTG----------------------TAC-A-T-ATTTTGT-AG-TT-G-A-A---A---G-T-GTCT-G-T--AA-CCG-T--AT-T-----A--T------G--A-A-G-T---A-T-GA----G-G-------T--A--TG--------A--TTT----C----A----GG----------TCA-T--T-G--T-G--T-C-GA-TAC--G-G----T-TT-GCCA-T-A--G-C-AA-CCCC---C-A-TTT-CAT--T-TT--TA-A-A-A-A-A-A-T----------------------ATTT-AT-A--A-G----G-T-G-TTT--AAA-AT-TTGA--A-T--A-A-AAGG-C------T-AG-----AGT-A-----T-TTC---A-T-A--TC-T-T-ATA---T-T--GG-A--T-T-AAA-GA-CAA---GGG--TCT-A-GA-T-AA--T-GCA-TA-C--TTTTTA-TA-AA-AACC-TTC-A-T-TTTTTTT
gi|99562                      :    -TGAT-TG-CATGGGTCATT--G-GA-AG--T--TAAT-G---------------A--A----T----------CTATTT-G---A-TTTT----------------------TAC-A-C-ATTTTGA-AG-CT-G-A-C---G---A-C-ATCA-A-T--AA-C-T-C--AT-C-----A--T------G--A-AAG-T---A-T-CATAATT-A-------T--A--TG--------G--TTT---TC----A----GG---------GTAC-C--T-G--T-G--A-T-GT-TA----------T-T--GTCA-T-A--G-
gi|99563                      :            -CGTGCAT-ATTTGA-AA-AAA-T--TAAT-GACTCACCC-ATT--GA----------------------TTTT---A-TTTT----------------------TA------ATTT-GT-AG-T--G-ACA---A---G-G-CTCA-G-T--AG-C-G-TCAAT-T-----A--T------A--A-AAG-T---AAT-AA----G-GG------C--A--TT--------G--ATTATGTC----ATAGCAG---------GTCT-A--T-G--T-G--A-C-GC-TAC--G-G----T-T--GCC--T-A--G-CCAA-CCCC-------TTTACAT-TT-TT--TG-A-A-ATA-AGA-TC--------T--ATAGG--T----TTTAG-A--A-G----G-T-G-TT---AGA-AT-TTG---A-T--A-A-AAAGCC------T-AT-----AGT-G-----T-ATC---A-T-A--AT-C-T-ATA---T-A--GGAA--T-T-AAA-GA-CAATCCTGT--TCT------T-AACTT-CTA-TA-A--TTTTAG-CC-AA-AA
gi|99564                      :                    -ATT--G-AA-AAA-AAATAAA-GGC----TC-TTT--GA-------T----------TTGTATTG---A-TTTT----------------------TGC----------------TT---------A---G-T-GTCT-G-C--AA-C-T-T--AT-T-----A--T------G--A-AAG-T---A-T-GA----C-G-------T--A----------------TC---TT----A----GG---------A-CA--------------A-T-AC-TGC--G-G----T-T--GATA-T-A--
gi|99565                      :                       T--G-GA-GAA-G--TAAT-TGA----CC-ATT--GA--A----T----------TTTCTTTT---A-TTTT----------------------TAC-A-T-ATAATAT-AG-CT-T-A-----------T-GT-----T--AG-C-G-T--AT-TAATTGA--T------A--A-AAG-T---A-T--C----G-G-------T--T--TGC-------A--TAT---TC----A----GG---------TTCA-T--A-A--T-G--A-T-AC-TAT--G-GACACT-T--ATCA-T------T-AC-CCCC---CC
gi|99566                      :                        --G-GA-GAA-C--TAAT-TGA----CC-ATT--GA--A----T----------TTCTTTT----A-TTTT----------------------TAC-A-T-ATAACGT-AG-CT-T-A-----------T-GT-----T--AG-CGG-T--AT-C-----AATT------GATA-AAG-T---A-T--C----G-G-------T--T--TG--------G--ATTAG-TC----A----GG---------TTCA-T--A-G--T-G--T-T-GC-TAT--G-G----G-C--ACTT-T-A--T-C-AT-CCCC---CC
gi|99567                      :                                AA-G--TAAT-TGA----CC-ATT--GA--A----T----------TTCTTTTC-----TTTT----------------------TAC-A-T-ATAATGT-AG-CT---------A---A-T-GCTA-G-T--AG-CGG-T--AT-TGATTGA--T------A--A-AAG-T---A-T--C----G-G-------T--T--TG--------GA-TAT---TC----A----GG---------TTCA-T--A-A--T-G--T-T-AC-TAT--G-G----G-C--ACTT-T-A--T-C----CCCC---CC
gi|99568                      :                                 A-T--TAAT-GGC----CC-ATT--GA--T----T----------TTTTTTTTTT-A-TTTT----------------------TAC-A-T-GTTTTGT-AG-TT-G-A-A---A---G-T-GTCT-G-T--AA-C-G-T--AT-C-----A--T------G--A-AAG-T---A-T-GA----G-G-------T--A--TG--------A--TTT---TC----A----GG---------GTCA-T--T-G--T-G--A-C-GC-TAC--G-G----T-T--GCCA-T-A--G-C-AA--CCC---CCA-TTT-CATCTT-TT--TT-A-A-ATA-A-A-TC--ATAATTT--ATGGG--T--ATTTTAT-A--A-G----G-T-G-TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-A-AAGG-CTAGCTAT-AG-----AGT-G-----T-TTC---A-T-A--CC-T-T-ATA---T-A--GG-A--T-T-AAA-GA-CAA---AGG--TCT-A-GA-T-AA--T-GCA-TA-A--TTTTTA-TC-TA-AACC-TCA-A-T-TTATTTTCAA
gi|99569                      :                                            GC----CC-CTT--GA--A----T----------TTTCTTTT---A-TTTT----------------------TAC-A-T-ATTTTAT-TG-TT-G-A-A---A---A-T-GTCT-G-T--AA-C-A-T--AT-T-----A--T------G--A-AAG-T---A-T-GA----G-G-------T--G--TG--------G--TTT---TC----A----GG---------GTCA-T--A-G--T-G--A-C-GC-TAC--G-G----T-T--GCCA-T-A--G-C-AA-CCCC---C-A-TTT-AATCTT-TT--TG-A-A-ATA-A---TT--A-----TT-ATTGG--T--ATGTTAT-A--A-G----G-G-G-TTT--AGC-AT-TTTA--A-T--A-A-AAGG-C------T-AG-----AGT-G-----T-TTC---A-T-A--CT-T-T-ATA---T-A--GG-A--T-T-AAA-GA-CAA---AGG--TCT-A-GA-T-AA--T-GCA-TA-A--TTTTTA-TC-AA-AACC-TCA-A-T-TTATTTTCAA
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gi|99572                      :                                                         aat--A----T----------TATTGTTG---G-TTCT----------------------CGT-A-T-ATC-----AG-TT-A-A-ATT-ACTTG-T-GTCT-G-T--AT-C-G----AT-A-----A--TCGGA--G--A-AGA-TCAGA-T-GA----G-G-------T--GACTC--------GTATTT---TC----A----GGCGTTCAAATATTA-TGGT-G--T-G--AGC-GCTTACGAG-A----T-T--GCCATT-A--G-C-AA-CCCCT--CCATTTT-CATCTT-TTTCTG-A-A-ATA-A-ATTC--A-----T--ATGGG--T--ATTTTAT-A--A-G----G-T-G--TT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-ATTAGG-C------T-AG-----AGT-G-----T-TTC---A-T-A--TCTT-T-GTA---T-A--GGAA--T-T-AAA-GA-CAA---AGG--TCT-A--A-T-AA--T-GCC-TA-A--TTTTTA-TC-AA-AACC-TCA-A-T-TTATTTTCAA
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gi|99574                      :                                                                                TTTTTG---A-TGTT----------------------TGC-A-T-ACTTTGTTAG-TT-G-A-A---A---G-T-GTCT-G-T--AA-A-A-C--AT-T-----A--TTTAATGG--A-AAGGC---A-T-GA----G-G-------T--A--TG--------G--TTT----C----A----GG---------GTCA-T--T-G--T-G--A-T-GA-TAC--G-G----T-T--ACCA-T-A--C-C-AA-CCCC---CAA-TTT-CATCTT-TT--TG-A-A-ATA-A-A-TC--A-----T--ATAGG--C--A--TTAT-T--A-G----A-T---TTT--AGA-AT-TTGA--A-T--A-A-AAGG-CT-----T-AG-----AGT-G-----C-TTC---A-T-A--TC-T-T-ATATTGT-T--GG-A--T-T-AAA-GA-C-A---AGG--TCT-A-GG-T-AA--T-ACA-TA-A--TTTTTATTC-AA-AACC-TCA-A-T-TTA-TTTCAA
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