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Reference ( gi|94468 ) : AATA-T-GCTA--G-A---CAA---AGA-AG--AAA-AT---T----TGTTAAA----A--G--A-C-AGG---C-C-TG-CA--------C---T---TC-TT-T--ATA-A--AT-G---A-C------A-T--A--G--G---GG-TTTTT--G--A--G--A---G-G-T--A---TAA--A---C-T-CT-G-T--ATA--G-AA-------TG-AT-T-G-G-C---GAC-C-TA-GGAG-AGA--G-CGA--ATTG-T-CC-AG-G-----GAAT-TATC--AG-T-A--AA---AA---TCG--CG-TCG--A-AAA----G--AC-T---T---CA-TA-----ACG---TC-AT-G----G----T-TT-C--C-T-ATTG-TAA-T----T--T--AA-GC-A-G--A---GT--AAT-A-AA-G--T----AG--A---AAAA--TT-GA---AA--A---GT-C--C-G----AC-G-A--ACTTT--ATA--TTATATA
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Reference ( family-535 ) : AATA-T-GCT------A--G-A---CAAA------GA-AG--AAA-A-T----A-T---GTTAA-A----A--G--A-C-AGG---C-C-TG-CA--------T---T---T--C-TT-T--ATA-A--AT-G---A-C------A-T--A--G--G---GG-TTTTT--G--A---G--A--G-G--T--AA---AAA---C-T-CT-G-T--ATAG--AA-------TG-AT-T-G-GC---GAC-C-TA-GGAG-AGA-----------G-CGA--ATT---------GAA-T-TAT-C--AG--T-----A--AAA--A---TC-A-C-G--TCG--A-A--------------------AA-G-----A--C-T---T---C-ATA-----AC-G---T-CAT-G----G---T-T----T-C--C-TA-TTG-T----AA-T-T--T--AA-GC-AG--A---GT--AA-C--A-A-G-G--T--AG--A---AAAA--TT-GA---AA--A---GT-C--C-G----AC-G-A--AC-TTTAACTTATATA
gi|94440 : AATA-T-GCT------A--G-A---CAAA------AA-AT--AAA-A-T----A-T---GTTTA-A----T--G--A-T-AGG---C-C-TG-TA--------T---T---T--C-TT-T--ATA-A--AT-G---A-C------T-T--A--G--G---GG-TTTTT--G--A---G--A--G-G--T--AA---AAA---C-T-CT-G-T--ATAG--AA-------TG-AT-T-G-GC---GAC-C-TA-GGAG-AGA-----------G-C----------------GAA-T-TAT-C--GG--T-----A--AAA--A---TT-A-C-G--TCG----A--------------------AA-G-----A--C-T---T---C-ATA-----AC-G---T-CAT-G----GT--T-T----T-C--C-TA-TTG-T----AA-T-T--T--AA-GC-AG--A---GT--AA-C--A-A-G-G--T--AG--A---AAAA--TT-GA---AA--A---GT-C--C-G----AC-A-A--AC-GTTAACTTATA
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gi|94458 : tttaaAATA-TTGCT------A--G-GGC-CAAA------GA-AATAAAA-A-T----A-T---GTTAA-A----A-----A-C-CGG---C-C-TG-CA--------T---G---T--C-TT-T--ATA-G--CT-G---A-C------A-TT-A--G--G---GG-TTTT---G--A---A--ACAG-G--TT-AA---AAA---C-T-CT-G-T--ATAG--AA-------T--AT-T-G-GT---GAC-T-TA-GG----------------------------------------T-AAT-C--AG--T-----A--AAAA-A---TC-A-C-G--TTG--A-A--------------------A--------G--C-T---T---C-ATA-----ACGG---T-CAT-G----GA--T-T----T-A--T-TA-ATG-T----AA-T-T--A--AG-GC-AG--A---GT--AA-C--A-A-A-G--T--AA--G---AAAA--TT-GA---AA--A---GT-C--C-GCGACAC-G-A--AC-TTCAACTTATA
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gi|94462 : tttAATA-T-GCT------AATG-A---CAAA------GA-AA--ATATA-T----A-G---ATTAA-A----A--G--A-C-AGA---C---TG-CA--------T---TATTT--C-TT-C--ATA-A--AT-G---A-C------AAT--A--G--G---GT-TTTTT--GGAA---G--A--G-G--T--AATACAAAT--C-TGCT-G-T--ATAG--AA-------TG-TA-T-G-GC---GATAC-TA-GGAG-AGACAAGTGTACCAG-TAA--AAT---------GAA-TATAT-C--AG--T-----A--AAA--A---TCTA-CCG--TCG--A-A--------------------AG-C-----A--T-TCATT---C-ACT-----CC-C---T-TAT-GT---G---T-T----T-TT-C-TA-TTG-T----AA-T-T--T--AA-GC-AG--A---GT--AA-C--A-G-G-T--T--GG--A---AAAT--TC-GA---AATCA---GTCC--C-G----AC-GAA--AC-TTT
gi|94463 : tttAATA-T--CT------AA-G-A---CCAA------AG-AG--AAA-A-T----T-T---GTTAA-A----A--G--A-C-AGG---C-C-GG-CA--------C---T---T--C-TT-T--ATACA--AT-G---G---------------------------TTTT--G--A---G--A--G-G--T--AT---AAA---C-T-CT-G-T--ATAG--AA-------GG-AT-C-T-GCCCGAAC-C-TA-GGAG-AGA-----------G-CGA--ATTACTCCCGG-GAA-T-TAT-CAAAG--TA----A--AAA--A---TC-G-C-G--TCGAAA-A--------------------AA-G-----A--C-T---T---C-ATA-----AC-GGTAC-AAT-G----GT--T-T----T-C--C-TA-TTGAT----AA-T-CAAT--GA-GC-AT--GTATGT--AATC--A-A-A-GTCT--GA--A---AAAA--TT-GATAGAG--A---GT-CAAC-G----AC-A-ACTAC-TCTAATTTA
gi|94464 : tttAGTA-T-GCT------A--GGA---CAAA------GGGAG--AAA-A-T----A-T---GCTGA-A----AAGG--G-C-AGGGACC-C-TG-TA--------T---T---T--C-TTAT--ATA-A--AT-G---A-C------A-T--AT-G--G---GG-TTTTT--G--A---G--A--G-G--T--AA---AAA---C-T-CT-A-TC-ATAT--AT-------TG-AT-T-G-GC---GAC-C-TA-GAAA-AA---------------GA--------------GAA-A-TAT-G--AG--T-----AAGAGA--A---TC-G-A-G---CG--ACA--------------------GA-G-----A--------G---C-AGAGAGCGAC-G---C-C---G----G----------T-C--C-TA-TTGTT----AA-T-T--A--TA-GC----------T--AA-C--A-A-A-A--T--AG--A---AAAAT-TT-GA---AA--AAG-GT-CA-G-G----ACGG-A--AC-TTTAACTTAT
gi|94465 : ttttAATAAT-GCT------A--G-AAAACAAA------GA-AG--AAA-AAT----A-T---GTTTA-A------------C-AAA---G-T-T---A--------T---TAA-TA-C-TT-T--CTA-A--AT-G---A-CTGGTTAA-TTGA--C--A---GG-TTTCA--A--AGATG--A--G-G--T--AA---CAAGGCC-T-CT-G-T--ATAGA-AA-------TGAAA-T-G-AC---GAT-C-TA-GGAG-AGA-----------G-TG-----------------A-T-TAT-C--AGGCTGTACAA--GAA--A---TC-A-C-
gi|94466 : ttttATA-T-GTT------AA-G-A---AAAA------GT-AA--GCC-A-T----A-----GTGAATA----A--G--A-A-AGCATTC-T-TG--A--------T---T---TATT-TT-T--GTA-A--AT-AGAAA-C------A-T--AATG--G---GA-TTATC--G------------G-T--T--AT---AAA---C-T-CT-G-T--ATGG--AA-------TGTAT-C-A-AC---GAC-T-TG-TGAG-ATAAC---------G-CGA--ATCACCTGAGAGGAA-T-TAT-C--AGT-T-----A--AGA--A---TCGA-C-GGATTGCCA-ACTTGGGCTTTGGGATATGCGAA-G-----ACAC-T---TGATC-ATAC----AC-G---T-CA--G----A---A-T----T-C--C-TA--TG-T----AA-TGT--T--AA-G--AGTAA---GT--AA-TAGA-A-G-A--T--AT--A---AAAA--TT-GT---AA--A---GT-C--C-G----AC-G-A--Aaaaggttt
gi|94467 : tttaagtAATA-T-GCT------A--G-A---CAAT------TA-AG--GAA-A-T----A-T---GTTAA-A----A--G--A-C-AGG---C-C-TA-CA--------C---T---C--C-TT-T--ATA-A--AT-
gi|94468 : ttttAATA-T-GCT------A--G-A---CAAA------GA-AG--AAA-A-T----T-T---GTTAA-A----A--G--A-C-AGG---C-C-TG-CA--------C---T---T--C-TT-T--ATA-A--AT-G---A-C------A-T--A--G--G---GG-TTTTT--G--A---G--A--G-G--T--AT---AAA---C-T-CT-G-T--ATAG--AA-------TG-AT-T-G-GC---GAC-C-TA-GGAG-AGA-----------G-CGA--ATTGTCCAGG--GAA-T-TAT-C--AG--T-----A--AAA--A---TC-G-C-G--TCG--A-A--------------------AA-G-----A--C-T---T---C-ATA-----AC-G---T-CAT-G----G---T-T----T-C--C-TA-TTG-T----AA-T-T--T--AA-GC-AG--A---GT--AA-T--A-A-A-G--T--AG--A---AAAA--TT-GA---AA--A---GT-C--C-G----AC-G-A--AC-TTTATATTATATA
gi|94469 : TA-T-GCT------A--G-A---CAAA------GA-AG--AAA-A-T----A-C---GTTAA-A----A--G--A-C-AGG---C-C-TG-CG--------T---T---C--T-TT-TA-ATA-A--AT-G---A-C------A-T--A--G--A---GGTTTTTT--G--A---G--A--G-G--T--AA---AAA---C-T-CT-G-T--ATAGC-AA-------TT-AT-T-G-GC---AAC-C-TA-GGAG-AGA-----------G-CGA--ATT-----------A-T---T-C--AG--T-----A--AAA--A---TA-A-C-G--TTG----A--------------------AA-G-----A--C-T---T---C-ATA-----AC-G---T-CAT-G----GT--T-T----T-T--C-TA-TTT-C----AA-T-T--A--AA-GC-AG--A---GT--AA-CA-A-A-G-G--T--AG--A---AAGA--TT-GA---AA--AAGGAT-C--C-G----AC-G-A--AC--TTAACTTA
gi|94470 : TA-T-GGT------A--A-A---AAAAAGAGGGGG-AG--AAA-A-A----A-A---ATCAA-AGAGTA--A--A-C-AGC---C-C-TG-CA--------T---T---T--C-TT-TC-AT--A--AT-G---A-C------A-T--A--G--G---GG-TTTTTG-G--A---G--G--G-GTAT--AA---AGA---C-G-TC-G-TG-ATAG--AAAGATTTCTG-AC-T-GAGA---GAC-C-TA-GG-G-AGG-----------G-CGA--------------------TATCC--CG--T-----A--AAT--A---TC-C-C-G--TCG--A-A--------------------AA-------A--C-----T---C-ATA-----AC-G---C-CAT-G----C---T-T----TAC--C-TG-ATG-------A-T-TC-T--AG-GC-AG--A---GT---A-C--A-A-A-G--T--AG--A---AAAA--TT-GG---AA--A---GT-C--C-G----A
gi|94471 : CT------A--G-AAT-CAAA------GA--G--AAA-A-TTCAAA-T---TTTAA-A----ATAG--A-C-AGG---CTC-TG-TAACATTAATT---T---T--A-TT-T--CTATA--TT-T---A-C------A-T--A--C--GCAAGG-TTTTT--G--A------A--A-G--T--AG---AAA---C-T-CT-G-T--A-AG--AA-------TG-ATGTAG-AC---GAC-C-TA-GGCG-AGA-----------G-TGA--A-----------------TAT-C--AG--T-----A--AAAGCG---TT-A-C-G--TTG--A-A--------------------GATGGGGTTA--C-A---T---G-ATA-----AC-G---T-CAT-GCGATG---C-T----T-C--C-TA-TTG-TAGTAAG-T-T--T--AA-GCAAG--A---GTCAAA-T--C-A-G-G--T--AGA-A---AAAA--TTAGA---AA--G---GT-C--C-G----AC-G-A--CT-CTTAACTTAT
gi|94472 : ---CAAA------GA-AGC-AAA-A-T----A-C---GTTAG-A----A--GCAG-C-AGGG--C-C-TG-CA--------T---T---T--CCTT-T--ATA-ACCAT-G---AAC------A-T--A--G--A---GG-TTTTTCCG--A---G--A--G-G--T--AACA-AAG---C-T-CT-G-T--ACAG--AA-------TG-AT-TTG-GC---GACGC-TA-GGAG-AGA-----------G-CGAGCATT---------ACA-T-TAT-C--AG--T-----A--CAA--AGT-TC-A-C-G--TTG--A-A--------------------AG-G-----A--C-T---T---C-ATA-----AC-GCT-C-CAT-GGTT-G---T-T----T-C--C-TA-TTG-T----AA-T-T--TTAGA-GC-AGT-T---GT--AA-CG-A-A-GCG--TAGAG--A---AAAA--TT-GA---AA--A---GT-C--CGG----AT-G-A--AC-TTTAACTTAT
gi|94473 : TA-A--AT-G---A-T------A-T--A--G--G---GG-TTTTT--G--A---G--A--G-G--T--AA---CAA---C-T-CT-G-T--ATAC--AA-------TG-AT-T-G-GC---GAC-A-TA-GGAG-AGA-----------G-CGA--ATT---------
gi|94474 : --G--A---G--A--G-G--T--AA---AAA---G-T-AT-G-T--ACAG--AA-------TG-AT-T-G-GT---GAA-C-TA-GGAG-AGA-----------G-CGA--ATT----------------AT-G--AA--T-----A--AAA--A---TA-A-C-G--TTG--A-A--------------------A--G-----A--C-T---T---C-ATA-----AC-G---T-CAT-G----G---T-T----C-C--CCTA-TTG-T----AA-T-T--T--AA-GC-AG--A---GT--AA-T--A-T-G-G--T--AG--A---AAAA--TT-GA---AA--A---GT-C--C-G----AC-G-A--AC-a
gi|94475 : G--AA-------TG-AT-T-G-GC---GAT-C-TA-GGGG-AGA-----------G-CGA--ATT-------------T---T-C--AG--T-----A--AAA--A---TC-A-C-GT-TC-----A--------------------AA-G-----A--C-T---A---C-ATA-----TC-G---T-CAT-G----GT--T-T----T-C--C-TA-CTG-T----AA-T-T--T--CA-GC-AG--A---GA--AA-C--A-A-G-G--C--AG------AATA--TT-GA---AA--A---GT-C--C-G----AC-G-A--AC-TTTAACTTGTA
gi|94476 : -A--------------------AA-G-----A--A-T---T---C-GTA-----AT-G---T-CAT-G----G---T-T----TTC--C-TA-TTG-C----AA-T-T--T--AT-GC-AG--A---GT--AA-C--A-A-G-G--T--AGAAA---AAAA--TT-GA---AA--A---GT-C--C-G----AC-A-A--AC-TTTAGCTTTTA
blockSeqs : A T GGAGCA AT G AAA AGAGGG G TA T A TCAA C ATC T GAGTA CA A G GAC T A T ACATTAAT CAA ATT AT C A GC C CC T GAA G TGGTTA C TG AT AA CAA T CC GA GAT GG CG C TA TA TAC GGC A G A T TT TG AGATTTC G G A A CCG A C C C CAAGTGTACCAGTAAAATGA C A C AA GC GTACA AG GC AAC T A C GA CCAACTTGGGCTTTGGGATATGCG AT GGGTT CA G CAT GAT A GAGCG G GTA C C CGAT GTT G GTTT A TG A A A AGTA T G AA TA C G AC TAT CA T AG T T C TC AG AA GAC AT A TAG TC AGG C AA G CGAC G C CT T
blockSeqs : . . . A . GC . . C . . . . . . AAG T . . ATT . . . C . AA T . A A T . T T A . T T T . . . T . . CA CG . C T CA T . . . . C T . A . T . . G . . . ACGCGAATCACCTGAGAGGA . . . . T A . A GT G . . C AAAA A . . . G . C C . CT . . GTT T . . T GG C . T . . . C . . A TA . . . A . . . . . AA . T . . . AG . A . C . C . T
blockSeqs : . . . A . AT . . . . . . . . . ATA . . . A . . . . . . A . . C . . . . . . A . . . . . G . . . CA . C . . . . . . . G A . T . . . . . . . . GCGAATTATCCCGGGGA . . . . . . . . . . . . T ACA A . . . . . C . . . . . T T . . . A . . . . . . . . . . T . . . A . . . . . A . T . . . . . . . A . A . T
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . AA . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . GCGAATTACTCCCGGGA . . . . . . . . . . . . . AA A . . . . . . . . . . . . T . . . G . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GCGAATTATCCTGGGA . . . . . . . . . . . . . AA A . . . . . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GCGAATTGTCCAGGGA . . . . . . . . . . . . . AA A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GCGAATCATTCCAGA . . . . . . . . . . . . . AA A . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GCGAATCATTCCAGA . . . . . . . . . . . . . AA G . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GCGAGCATTAC . . . . . . . . . . . . . AA G . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAAAGCGA . . . . . . . . . . . . . AA A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTGAATTA . . . . . . . . . . . . . AA A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GACGAATT . . . . . . . . . . . . . AA A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACGAATT . . . . . . . . . . . . . GA G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GCGAATT . . . . . . . . . . . . . AA A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACGAATT . . . . . . . . . . . . . AA T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGAACGA . . . . . . . . . . . . . AA G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GCGAATT . . . . . . . . . . . . . AA A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GCGAATT . . . . . . . . . . . . . AA A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GCGAATT . . . . . . . . . . . . . AA A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GCGAAT . . . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACTGA . . . . . . . . . . . . . G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GCCGA . . . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTGAA . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GCGA . . . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GCAA . . . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTGA . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTGA . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GCGA . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAGA . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GCGA . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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Reference ( family-535 ) : AATA-T-GCT------A--G-A---CAAA------GA-AG--AAA-A-T----A-T---GTTAA-A----A--G--A-C-AGG---C-C-TG-CA--------T---T---T--C-TT-T--ATA-A--AT-G---A-C------A-T--A--G--G---GG-TTTTT--G--A---G--A--G-G--T--AA---AAA---C-T-CT-G-T--ATAG--AA-------TG-AT-T-G-GC---GAC-C-TA-G---GAG-A-G---A--G-CG---------A--AT---T-----------A--T---------T--------ATC--AG--T-----A--AAA--A---TC-A-CG--TCG--A-A--------------------AA-G-----A--C---T-T---C-ATA-----AC-G---T-CAT-G----G----T-TT-C--C-TA-TTG-T----AA-T-T--T--AA-GC-AG--A---GT--AA-C--A-A-G-G--T--AG--A---AAAA--TT-GA---AA--A---GT-C--C-G----AC-G-A--AC-TTTAACTTATATA
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gi|94458 : tttaaAATA-TTGCT------A--G-GGC-CAAA------GA-AATAAAA-A-T----A-T---GTTAA-A----A-----A-C-CGG---C-C-TG-CA--------T---G---T--C-TT-T--ATA-G--CT-G---A-C------A-TT-A--G--G---GG-TTTT---G--A---A--ACAG-G--TT-AA---AAA---C-T-CT-G-T--ATAG--AA-------T--AT-T-G-GT---GAC-T-TA-G---G---------------------------------T-----------A---------------------ATC--AG--T-----A--AAAA-A---TC-A-CG--TTG--A-A--------------------A--------G--C---T-T---C-ATA-----ACGG---T-CAT-G----GA---T-TT-A--T-TA-ATG-T----AA-T-T--A--AG-GC-AG--A---GT--AA-C--A-A-A-G--T--AA--G---AAAA--TT-GA---AA--A---GT-C--C-GCGACAC-G-A--AC-TTCAACTTATA
gi|94459 : ttttAATA-T-GCT------A--G-A---CAAA------GA-AT--AAG-A-T----ACT---GTTTA-A----A--T--A-C-AGG---C-C-TG-CA--------T---T---T--C-TT-T--ATA-A--AT-G---A-C------ATT--A--G--A---GG--TTTT--G--A---GCAG--G-G--T--AA---CAT---T-T-CT-GTT--ATAG--AA-------TG--T-T-G-GC---GA--C-TA-----GAG-ATG---A--A-CG---------A-------------------A--T---------T--------ATC--AG--C-----A--AAC--A---TA-A-TG--TCC--G-A--------------------AA-G-----A--CG--T-T---C--T------AC-G---T-CAC-G----GGTT-C-TT-C--A-TA-TTG-T----AATT-T--T--AA-GC-AGACA---AT--AA-C--A-ATG-T--T--AG--A---AAAAATTC-GA---AA--A---GT-C--C-G----AC-G-A--AC-TTTA
gi|94460 : ttttTA-T-GCTGGAGCAA--G-A---CAAA------AA-A---AAA-T-T----A-C---TTTAA-AT---A--G--A-C-TGG---C-C-TTTCA--------T---T---T--C-TTAT--ATA-A--AT-G---AGC------A-T--A--G--A---GG-TTTT---G--A---G--A--GCG--CTAAA---AAA---C-G-CT-G-TTTATAG--AA-------TGGAT-T-G-GC---GAC-C-AA-G---GAG-A-G---A--GCCG---------A--AC------------------T---------T--------ATC--AG--T-----A--AAA--T---TC---C----------------------------------------A--C---T---------------AC-G---T-CAT-A----GT---T-TT-T--C-TA-TTA-T----AA-T-T--A--AA-GC-AG--A---GT--AA-C--A-A-G-G--T--AG--A---AAGA--TT-GA---AA--G---GT-C--C-G----AC-G-A--AC-TT--ACTTAT
gi|94461 : ttttatAATA-T-GCT------A--G-T---AAAA------GA-AG--AAA-A-T------T---GTTAA-A----A--G--A-T-AGG---C-C-TG-CA--------T---A---T--C-TT-T--TAA-A--AT-G---A-C------A-T--A--G--G---GT-ATTTT--G--A---G--A--G-G--T--AA---AAA---C-T-CT-G-T--ATAG--AA-------TG-AT-T-G-GC---GAC-C-TA-G---GAG-A-G---C--G-CG---------A-------------------A--T---------T--------ATG--AG--T-----A--AAA--A---TC-A-CG--TCG----A--------------------AT-G-----A--C---T-T---C-ATA-----AC-G---
gi|94462 : tttAATA-T-GCT------AATG-A---CAAA------GA-AA--ATATA-T----A-G---ATTAA-A----A--G--A-C-AGA---C---TG-CA--------T---TATTT--C-TT-C--ATA-A--AT-G---A-CA-----A-T--A--G--G---GT-TTTTT--GGAA---G--A--G-G--T--AATACAAAT--C-TGCT-G-T--ATAG--AA-------TG-TA-T-G-GC---GATAC-TA-G---GAG-A-GACAA--G-TGTACCAGTAAA--ATGAAT-----------A------------T--------ATC--AG--T-----A--AAA--A---TCTACCG--TCG--A-A--------------------AG-C-----A--TTCAT-T---C-ACT-----CC-C---T-TAT-GT---GT---T-TT-T--C-TA-TTG-T----AA-T-T--T--AA-GC-AG--A---GT--AA-C--A-G-G-T--T--GG--A---AAAT--TC-GA---AATCA---GTCC--C-G----AC-GAA--AC-TTT
gi|94463 : tttAATA-T--CT------AA-G-A---CCAA------AG-AG--AAA-A-T----T-T---GTTAA-A----A--G--A-C-AGG---C-C-GG-CA--------C---T---T--C-TT-T--ATACA--AT-G---G---------------------------TTTT--G--A---G--A--G-G--T--AT---AAA---C-T-CT-G-T--ATAG--AA-------GG-AT-C-T-GCCCGAAC-C-TA-G---GAG-A-G---A--G-CG---------A--AT---TACTCCCGGGA-A--T---------T--------ATCAAAG--TA----A--AAA--A---TC-G-CG--TCGAAA-A--------------------AA-G-----A--C---T-T---C-ATA-----AC-GGTAC-AAT-G----GT---T-TT-C--C-TA-TTGAT----AA-T-CAAT--GA-GC-AT--GTATGT--AATC--A-A-A-GTCT--GA--A---AAAA--TT-GATAGAG--A---GT-CAAC-G----AC-A-ACTAC-TCTAATTTA
gi|94464 : tttAGTA-T-GCT------A--GGA---CAAA------GGGAG--AAA-A-T----A-T---GCTGA-A----AAGG--G-C-AGGGACC-C-TG-TA--------T---T---T--C-TTAT--ATA-A--AT-G---A-C------A-T--AT-G--G---GG-TTTTT--G--A---G--A--G-G--T--AA---AAA---C-T-CT-A-TC-ATAT--AT-------TG-AT-T-G-GC---GAC-C-TA-----GAA-A-A---A--G-AG---------A--A----------------A------------T--------ATG--AG--T-----AAGAGA--A---TC-G-AG---CG--ACA--------------------GA-G-----A--------G---C-AGAGAGCGAC-G---C-C---G----G-------T-C--C-TA-TTGTT----AA-T-T--A--TA-GC----------T--AA-C--A-A-A-A--T--AG--A---AAAAT-TT-GA---AA--AAG-GT-CA-G-G----ACGG-A--AC-TTTAACTTAT
gi|94465 : ttttAATAAT-GCT------A--G-AAAACAAA------GA-AG--AAA-AAT----A-T---GTTTA-A------------C-AAA---G-T-T---A--------T---TAA-TA-C-TT-T--CTA-A--AT-G---A-CTGGTTAA-TTGA--C--A---GG-TTTCA--A--AGATG--A--G-G--T--AA---CAAGGCC-T-CT-G-T--ATAGA-AA-------TGAAA-T-G-AC---GAT-C-TA-G---GAG-A-G---A--G-TG-----------------------------A--T---------T--------ATC--AGGCTGTACAA--GAA--A---TC-A-C
gi|94466 : ttttATA-T-GTT------AA-G-A---AAAA------GT-AA--GCC-A-T----A-----GTGAATA----A--G--A-A-AGCATTC-T-TG--A--------T---T---TATT-TT-T--GTA-A--AT-AGAAA-C------A-T--AATG--G---GA-TTATC--G------------G-T--T--AT---AAA---C-T-CT-G-T--ATGG--AA-------TGTAT-C-A-AC---GAC-T-TG-T---GAG-A-T---AACG-CG---------A--AT---CACCTGAGAGGAA--T---------T--------ATC--AGT-T-----A--AGA--A---TCGA-CGGATTGCCA-ACTTGGGCTTTGGGATATGCGAA-G-----ACAC---T-TGATC-ATAC----AC-G---T-CA--G----A----A-TT-C--C-TA--TG-T----AA-TGT--T--AA-G--AGTAA---GT--AA-TAGA-A-G-A--T--AT--A---AAAA--TT-GT---AA--A---GT-C--C-G----AC-G-A--Aaaaggttt
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gi|94468 : ttttAATA-T-GCT------A--G-A---CAAA------GA-AG--AAA-A-T----T-T---GTTAA-A----A--G--A-C-AGG---C-C-TG-CA--------C---T---T--C-TT-T--ATA-A--AT-G---A-C------A-T--A--G--G---GG-TTTTT--G--A---G--A--G-G--T--AT---AAA---C-T-CT-G-T--ATAG--AA-------TG-AT-T-G-GC---GAC-C-TA-G---GAG-A-G---A--G-CG---------A--AT---TGTCCAGGGA--A--T---------T--------ATC--AG--T-----A--AAA--A---TC-G-CG--TCG--A-A--------------------AA-G-----A--C---T-T---C-ATA-----AC-G---T-CAT-G----G----T-TT-C--C-TA-TTG-T----AA-T-T--T--AA-GC-AG--A---GT--AA-T--A-A-A-G--T--AG--A---AAAA--TT-GA---AA--A---GT-C--C-G----AC-G-A--AC-TTTATATTATATA
gi|94469 : TA-T-GCT------A--G-A---CAAA------GA-AG--AAA-A-T----A-C---GTTAA-A----A--G--A-C-AGG---C-C-TG-CG--------T---T---C--T-TT-TA-ATA-A--AT-G---A-C------A-T--A--G--A---GGTTTTTT--G--A---G--A--G-G--T--AA---AAA---C-T-CT-G-T--ATAGC-AA-------TT-AT-T-G-GC---AAC-C-TA-G---GAG-A-G---A--G-CG---------A--AT---T-----------A--T-------------------TC--AG--T-----A--AAA--A---TA-A-CG--TTG----A--------------------AA-G-----A--C---T-T---C-ATA-----AC-G---T-CAT-G----GT---T-TT-T--C-TA-TTT-C----AA-T-T--A--AA-GC-AG--A---GT--AA-CA-A-A-G-G--T--AG--A---AAGA--TT-GA---AA--AAGGAT-C--C-G----AC-G-A--AC--TTAACTTA
gi|94470 : TA-T-GGT------A--A-A---AAAAAGAGGGGG-AG--AAA-A-A----A-A---ATCAA-AGAGTA--A--A-C-AGC---C-C-TG-CA--------T---T---T--C-TT-TC-AT--A--AT-G---A-C------A-T--A--G--G---GG-TTTTTG-G--A---G--G--G-GTAT--AA---AGA---C-G-TC-G-TG-ATAG--AAAGATTTCTG-AC-T-GAGA---GAC-C-TA-G---G-G-A-G---G--G-CG---------A-------T-----------A--T-------------------CC--CG--T-----A--AAT--A---TC-C-CG--TCG--A-A--------------------AA-------A--C-----T---C-ATA-----AC-G---C-CAT-G----C----T-TTAC--C-TG-ATG-------A-T-TC-T--AG-GC-AG--A---GT---A-C--A-A-A-G--T--AG--A---AAAA--TT-GG---AA--A---GT-C--C-G----A
gi|94471 : CT------A--G-AAT-CAAA------GA--G--AAA-A-TTCAAA-T---TTTAA-A----ATAG--A-C-AGG---CTC-TG-TAACATTAATT---T---T--A-TT-T--CTATA--TT-T---A-C------A-T--A--C--GCAAGG-TTTTT--G--A------A--A-G--T--AG---AAA---C-T-CT-G-T--A-AG--AA-------TG-ATGTAG-AC---GAC-C-TA-G---GCG-A-G---A--G-TG---------A--A-----------------------------T--------ATC--AG--T-----A--AAAGCG---TT-A-CG--TTG--A-A--------------------GATGGGGTTA--C---A-T---G-ATA-----AC-G---T-CAT-GCGATG----C-TT-C--C-TA-TTG-TAGTAAG-T-T--T--AA-GCAAG--A---GTCAAA-T--C-A-G-G--T--AGA-A---AAAA--TTAGA---AA--G---GT-C--C-G----AC-G-A--CT-CTTAACTTAT
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gi|94473 : TA-A--AT-G---A-T------A-T--A--G--G---GG-TTTTT--G--A---G--A--G-G--T--AA---CAA---C-T-CT-G-T--ATAC--AA-------TG-AT-T-G-GC---GAC-A-TA-G---GAG-A-G---A--G-CG---------A--AT---T-----------A--
gi|94474 : --G--A---G--A--G-G--T--AA---AAA---G-T-AT-G-T--ACAG--AA-------TG-AT-T-G-GT---GAA-C-TA-G---GAG-A-G---A--G-CG---------A--AT---T-----------A--T---------G--------A-----A--T-----A--AAA--A---TA-A-CG--TTG--A-A--------------------A--G-----A--C---T-T---C-ATA-----AC-G---T-CAT-G----G----T-TC-C--CCTA-TTG-T----AA-T-T--T--AA-GC-AG--A---GT--AA-T--A-T-G-G--T--AG--A---AAAA--TT-GA---AA--A---GT-C--C-G----AC-G-A--AC-
gi|94475 : G--AA-------TG-AT-T-G-GC---GAT-C-TA-G---GGG-A-G---A--G-CG---------A--AT---T--------------T-------------------TC--AG--T-----A--AAA--A---TC-A-CGT-TC-----A--------------------AA-G-----A--C---T-A---C-ATA-----TC-G---T-CAT-G----GT---T-TT-C--C-TA-CTG-T----AA-T-T--T--CA-GC-AG--A---GA--AA-C--A-A-G-G--C--AG------AATA--TT-GA---AA--A---GT-C--C-G----AC-G-A--AC-TTTAACTTGTA
gi|94476 : -A--------------------AA-G-----A--A---T-T---C-GTA-----AT-G---T-CAT-G----G----T-TTTC--C-TA-TTG-C----AA-T-T--T--AT-GC-AG--A---GT--AA-C--A-A-G-G--T--AGAAA---AAAA--TT-GA---AA--A---GT-C--C-G----AC-A-A--AC-TTTAGCTTTTA