lowQualScore : 111 11 33333333
lowQualScore : 1 33333 444444 1 3 1 1 22 000 7777 1 1 1 3333 555555 8888888 3 7777 222 22 222 1 1 1 666 00 444 22 222 1 1 444 1 3 33 1 3333 1 88888888 1 66 4 1 3 1 1 3 1 1 33 3333 22 1 1 1 1 3 1 3
lowQualScore : . ..... ...... . . . . .. ... .... . . . .... ...... ....... . .... ... .. ... . . . ... .. ... .. ... . . ... . . .. . .... . ........ . .. . . . . . . . . .. .... .. . . . . . . .
lowQualScore : 5 77777 333333 5 0 5 5 00 222 2222 6 7 5 0000 555555 1111111 2 8888 888 22 888 6 6 6 666 88 000 33 888 7 6 444 6 2 88 6 4444 6 66666666 6 00 8 3 1 5 5 1 5 5 77 3333 11 6 7 7 7 3 7 3
consensus : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TCTGGA--C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAAAA-A-T-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-TCCCC---TA---AAA-A--CCATATG-AATCTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
Reference ( gi|80647 ) : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TCTGGG--C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAAAG-A-T-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-TCCCC---AT---AAA-A--CCATATG-AATCTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
gi|80646 : AACAAGCGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TCCGGA--C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAAAA-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-TCCCC---TA---AAA-A--CCATATG-AATCTCTG-AA-A-TAAACTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTT
gi|80648 : AACAAGCAA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TCTGGA--C----CTGCG-TC-GTTCGC-AAC----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAAAA-----T--TCTGT---C-AC-TTCAGC---AT-GAT-A--TT-A----AA-TCCCC---TA---AAA-A--CAATATG-AATCTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-AAG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAAtcaa
gi|80649 : AACAA-TGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TCTGGA--C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-CTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAAAT---T-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-TCCCC---TA---AAA-A--TCATATGAAAACTCTG-AA-A-TAAGCAG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATC-TG-G-T-G-A-TTTTT
gi|80656 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TTTGGA--CGAC-CTGCA-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------T-A-TTTATTAAA----A---T--T---TG-T-A-AT---AAAAAA-A-T-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A---T-A----GA-TCTCC---CTCTAAAA-A--CCATATG-AATCTCTG-AA----AATCTG-AA-ATGAA--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAAttaaa
gi|80654 : AAAAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TCTGG---C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTATAAA-----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAAAA-A-T-G---CTGT---C-AA-TTCA-----AT-GGT-A--AT-A----AA-TCCCC---TA---AAA-A--CCATATG-AATCTCTG-AA-A-TAAGCTG--A-ATG-A--TA----AGC--TAAT-AAA-TG-A-T-G-A-TTTT
gi|80652 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TCTGGA--C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGCAAAATA------TA-------TC----TAT-AAA----T---T--T---TG-T-A-ATAAAAAAAAA-A-A-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GTT-A--T-------AA-TCCCC---TA---AAA-A--CCATATG-AATCTTTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--T-AT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTTAA
gi|80651 : AACAAGTGA-AACC-----TA------A-T-G-A-TG--TCTGGA--C----CTGCG-TT-GCACGC-AGC----TACTAGTATA-------TCA-TTTATAACA----T---T--T---TG-T-A-ATT--AAAAAA-A-T-T-----GT---C-AG-TTCAGC---AT-AAT-A--TC-A----AA-TCCCC---TA---AAA-A--CCATACG-AATTTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AAC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTTAAA
gi|80655 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TCTGGA--C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-ATTGTAAAA--------T--T---TG-T-A-ATAA-AAAAAA-A-A-T--GCTGT---C-AA-TTCA-C---AT-GGTAA--GT-A----AA-TCCCC---TA---AAA-A--CCATATGAAATCTGTG-AA-A-TAAGCTG--A-ATG-A--TA----AGC--TAAT-AAA-TG-A-TGG-A-TTTTTGAAA
gi|80653 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-TTG-A-TG--TCTGGAT-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----AA------AAA------TCA-TTTATAACA----T---T--TGTACA-T-A-AA---AAAAAA-A-A-T--TCTGT---C-AG---CAGC---AT-GGT-A--TTTA----AA-TCCGC---CT---AAA-AACCCAT-TG-AATCTTTG-AA-A-TAAGCTG-AG-ATG-A--TA----ACT--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTT
gi|80657 : AACAAGTGA-GACC-----TACATGTAA-T-G-A-TG--TCTGGA--CAGGTCTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------C--------------TGTAGAA----G---CACT---TG-T-A-AT---AAAAAA-A-A-T--TCTGT---C-AG-TTCAGCCCCAT-GGT-A--TT-A----AAATCCCCTA-GT---AAA-AA-CCATATG-AAT-TCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-T-T-G-ATTTTTTGAAt
gi|80658 : AGCAAGTGA-GACTACATGTA------AAT-G-A-TG--TCTGGA--C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TAT-----TA-------TCA-TTTATAAAAAC--T---T--T---TG-T-A-AT---AAAAAGAA-A-T--TCTCT---C-AGTTTCAGC---AT-GG-----TT-ATGGTAA-TCCCCTA-AA---AAA-A--CCATATGAAATCTCTT-AG-A-T-AGCTG-AAGATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-ATT-G-ATTTTTTGAA
gi|80650 : AACAATTGAAGACC-----TA------A-T-G-AATG--TCTGGA--CT---CTGCG-TCCGC-CGCCAGC----TA-------A-------TCAACTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAAAT-T-T-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT------AA-TCTCC---TA---AAA-A--TCATATG-AAACGCTGAAA-A-TAAGCAGAAA-ATG-A--TA----A-C--TAAT-ATC-TG-G-TCG-A-TTTTTTAAA
gi|80661 : AACAAGTGA-GAC------TA------A-T-G-A-TG--TCTGGA--C----CTGCG-TC-GCTCG--AGC----TA------CATGTGTATTCATTTTATAAAATT--T---T--T---TG-T-A-AT---AAAAAA-A-T-T--T-TGT---CAAG-TTCAGC---AT-GGT-AATTT-A----AA-TCCCT---A----AAA-A--GCATAAG------CTG--A-T-TA----G-AA-ATG----TA----AGC--TAATAATATTG-A-C-G---TTTTTGAA
gi|80667 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TCTGGA--C----CTGCG-TC-GCACGT-AGC----TA------TA-------TC--------AAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAAAC-A-T-T--TCTGT---
gi|80666 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TCTGGA--C----CTGCG-TT-GCTAGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTTTAAAA----T---C--C---TGTT-A-AC---ATAAAA-A-T-t
gi|80664 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TCTGGA--C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------CA-------gaagcttgtcatcacaacgcttttgaaactactcaatac
gi|80659 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TCTGGA--C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------
gi|80660 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TCTGGA--C----CTGCG-TT-GCTCGC-AGC----TA------CA-------
gi|80662 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TCTGGA--C----CTACG-TC-GCTCGC-AGC----TA------
gi|80665 : AACAAGTG--GACC-----TA------A-TTG-A-TG--TCTGGA--C----CTGCG-TC-GCTCAC-AG
gi|80663 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-GAA-TG--TCTGGA--C----CTGCGATC-GCT-GC-A
gi|80668 : AACAAGTGA-GACT-----AA------A-T-G-A-TGACTCTTGGACC----CTGC--TC-GCTCGC-AGC----TA------
gi|80669 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-A-G-A-TG--TCTGGA--C----CTGC
gi|80670 : AACAAGTGA-AACC-----TA------A-T-G-A-TG--TCTGGA--C----C
gi|80671 : ACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A--G--TCTGGA--C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----AA------AAA------TCA-TTTATAAC-----T---T--T---TG-T-ACAT---AAAAAA-A-A-AAATCTGT---C-AG---CAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-TCC------T---AAA-AACCCATA-G-AATCTTTG-AA-A-TAAGCTG-AG-ATG-A--TA----A-CTATAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTT
gi|80672 : CAAGTGA-GACC-----TT------A-T-A-A-TG--TCTGGA--C----TTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAAAA-A-T-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GTC-A--TT-A----AA-TCCCC----T---AAACA--TCATATA-ATTCTCTG-AA-A-T----TA-A----------A----AGC--TAAT-AT--TG-A-T-G-A-TTTTTAAAAt
gi|80673 : AAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TCTGGA--C----CTGCG-
gi|80674 : C-AG-----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAAAA-A-T-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGC-A--TT-A----AA-TCTCC---TA---AAA-A--CCATATG-AAT-TCTGAAA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatctctgaaatgagctgaaatgataagctaat
gi|80675 : C-AGT----AA------TA-------TCA-TTTATAAAA----AAAAT--T---TG-A-A-AT---AAAAA--A-T-T--TCTGT---C-AG-TTT-GC---AT-GGT-A--TG-T----AA-TCCGC---CTA--AAA-A--CCATATA-AATTTCTG-AA-A-TA--CTGAAA-ATG-A--TA----AGG--TA
gi|80676 : ----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAAAA-A-T-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-TCCCC---TA---AAA-A--CCATAT--AATTTCTG-AA-ATTAAGCTA-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-A-A-
gi|80677 : ----TA------TA-------TCA-TTTATAAAAAACAG---T--T---TG---A-AT---AAAAA--A-T-T--TCTGT---C-AG-TACAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-TCCCC---TA---AAA-A--CCATATA-AATTTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGG--T-AT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
gi|80678 : ----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T---AT---AAAAAA-A-T-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-AT-TT-A----AA-TCCCC---TA---AAA-A--CCATATG-AATTTCTG-AA-A-ATAGCTG-AA-A-G-AT-TA----AGG--TAAT-ATA-TG-A-T-ATA-TTTTTGAAA
gi|80679 : ----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-TTA-AT---AAAAAA-A-T-T--TCTGTTTTC-AG-TTCAGCC--ATTGGT-A--TT-A----AA-TCCCC---TTA--AAA-A--CCATA-G-AATTTCTG-AA-A-TAAGCTG-A---------------------AAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
gi|80680 : A-------TCA-TTTTTAAAA----T---T--T---TT-T-A-AT---AAAAAA-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCATG---AT-GGTAA--TC-A----AA-TCCCCTCTA----AAA-A--TCATATA-ATTTCCTG-AAGA-TACACTG--A-ATG-AACTAAGCTAGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTT
gi|80681 : -TCTACAGTA----T---T--T---TG-A-A-AT---AAAAAA-A-AAT--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-TCCCC---TA---AAA-A--CCATATG-AATTTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
gi|80682 : TGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-TCCGC----T---AAA----------------TCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TGAA-T-A-A-TTTT
gi|80683 : aataatgaacaca-TTCAGC---AG-GGT-A--TT-A----AA-TCCCC---TG---AAA-A--CCATATG-AATTTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-C-T-A-TTTTTGAAA
gi|80673 : ATCTCTG-AA-A-TGAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-
Alignments
lowQualScore : 1 33333 444444 1 2 1 1 22 1 2 7777 1 1 1 2222 555555 7777777 3 7777 222 22 222 1 1 1 666 3 1 1 22 222 1 1 444 1 3 33 1 3333 1 222 3 22 1 22 222 3 4 0 3 1 1 3 1 1 33 3333 22 1 1 1 1 3 1 3
lowQualScore : . ..... ...... . . . . .. . . .... . . . .... ...... ....... . .... ... .. ... . . . ... . . . .. ... . . ... . . .. . .... . ... . .. . .. ... . . . . . . . . . .. .... .. . . . . . . .
lowQualScore : 4 66666 111111 4 9 4 4 00 4 9 0000 5 6 5 9999 333333 8888888 1 5555 777 11 777 5 5 5 333 1 5 5 22 777 6 5 222 5 1 77 5 3333 5 777 1 11 5 11 777 1 6 9 0 5 5 0 5 5 55 1111 00 5 6 6 6 2 6 2
consensus : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATG-AATCTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
Reference ( family-531 ) : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATG-AATCTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
gi|80646 : AACAAGCGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-CGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAAAA-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATG-AATCTCTG-AA-A-TAAACTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTT
gi|80647 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGG-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-GAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-A--T---AAAACC-ATATG-AATCTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAAtcaa
gi|80648 : AACAAGCAA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GTTCGC-AAC----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-A---T--TCTGT---C-AC-TTCAGC---AT-GAT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACA-ATATG-AATCTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-AAG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
gi|80649 : AACAA-TGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-CTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT----AAA-A-ATT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAATC-ATATGAAAACTCTG-AA-A-TAAGCAG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATC-TG-G-T-G-A-TTTTT
gi|80650 : AACAATTGAAGACC-----TA------A-T-G-AATG--TC-TGGA-CT---CTGCG-TCCGC-CGCCAGC----TA-------A-------TCAACTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-TTT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT------AA-T---CT-C--C-T--A---AAAATC-ATATG-AAACGCTGAAA-A-TAAGCAGAAA-ATG-A--TA----A-C--TAAT-ATC-TG-G-TCG-A-TTTTTTAAAttaaa
gi|80651 : AACAAGTGA-AACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TT-GCACGC-AGC----TACTAGTATA-------TCA-TTTATAACA----T---T--T---TG-T-A-ATT--AAAA-A-AAT-T-----GT---C-AG-TTCAGC---AT-AAT-A--TC-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATACG-AATTTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AAC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTTAAA
gi|80652 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGCAAAATA------TA-------TC----TAT-AAA----T---T--T---TG-T-A-ATAAAAAAA-A-AAA-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GTT-A--T-------AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATG-AATCTTTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--T-AT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTTAA
gi|80653 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-TTG-A-TG--TC-TGGATC----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----AA------AAA------TCA-TTTATAACA----T---T--TGTACA-T-A-AA---AAAA-A-AAA-T--TCTGT---C-AG---CAGC---AT-GGT-A--TTTA----AA-T---CCGC--C-T--A---AAAACCCAT-TG-AATCTTTG-AA-A-TAAGCTG-AG-ATG-A--TA----ACT--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTT
gi|80654 : AAAAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGG--C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTATAAA-----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAT-G---CTGT---C-AA-TTCA-----AT-GGT-A--AT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATG-AATCTCTG-AA-A-TAAGCTG--A-ATG-A--TA----AGC--TAAT-AAA-TG-A-T-G-A-TTTTt
gi|80655 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-ATTGTAAAA--------T--T---TG-T-A-ATAA-AAAA-A-AAA-T--GCTGT---C-AA-TTCA-C---AT-GGTAA--GT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATGAAATCTGTG-AA-A-TAAGCTG--A-ATG-A--TA----AGC--TAAT-AAA-TG-A-TGG-A-TTTTTGAAA
gi|80656 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TT-TGGA-CGAC-CTGCA-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------T-A-TTTATTAAA----A---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A---T-A----GA-TCTCCC-T--C-T--A---AAAACC-ATATG-AATCTCTG-AA----AATCTG-AA-ATGAA--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
gi|80657 : AACAAGTGA-GACC-----TACATGTAA-T-G-A-TG--TC-TGGA-CAGGTCTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------C--------------TGTAGAA----G---CACT---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAA-T--TCTGT---C-AG-TTCAGCCCCAT-GGT-A--TT-A----AAAT---CC-C--C-T--AGTAAAAACC-ATATG-AAT-TCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-T-T-G-ATTTTTTGAA
gi|80658 : AGCAAGTGA-GACTACATGTA------AAT-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TAT-----TA-------TCA-TTTATAAAAAC--T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-AGAAA-T--TCTCT---C-AGTTTCAGC---AT-GG-----TT-ATGGTAA-T---CC-C--C-TAAA---AAAACC-ATATGAAATCTCTT-AG-A-T-AGCTG-AAGATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-ATT-G-ATTTTTTGAA
gi|80659 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------
gi|80660 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TT-GCTCGC-AGC----TA------CA-------
gi|80661 : AACAAGTGA-GAC------TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCG--AGC----TA------CATGTGTATTCATTTTATAAAATT--T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAT-T--T-TGT---CAAG-TTCAGC---AT-GGT-AATTT-A----AA-T----C-C--C-T--A---AAAAGC-ATAAG------CTG--A-T-TA----G-AA-ATG----TA----AGC--TAATAATATTG-A-C-G---TTTTTGAA
gi|80662 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTACG-TC-GCTCGC-AGC----TA------
gi|80663 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-GAA-TG--TC-TGGA-C----CTGCGATC-GCT-GC-A
gi|80664 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------CA-------
gi|80665 : AACAAGTG--GACC-----TA------A-TTG-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCAC-AG
gi|80666 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TT-GCTAGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTTTAAAA----T---C--C---TGTT-A-AC---ATAA-A-AAT-
gi|80667 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCACGT-AGC----TA------TA-------TC--------AAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-CAT-T--TCTGT---gaagcttgtcatcacaacgcttttgaaactactcaatac
gi|80668 : AACAAGTGA-GACT-----AA------A-T-G-A-TGACTCTTGGACC----CTGC--TC-GCTCGC-AGC----TA------t
gi|80669 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-A-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGC
gi|80670 : AACAAGTGA-AACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----C
gi|80671 : ACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A--G--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----AA------AAA------TCA-TTTATAAC-----T---T--T---TG-T-ACAT---AAAA-A-AAA-AAATCTGT---C-AG---CAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC------T--A---AAAACCCATA-G-AATCTTTG-AA-A-TAAGCTG-AG-ATG-A--TA----A-CTATAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTT
gi|80672 : CAAGTGA-GACC-----TT------A-T-A-A-TG--TC-TGGA-C----TTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GTC-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AACATC-ATATA-ATTCTCTG-AA-A-T-----------TA-A---A----AGC--TAAT-AT--TG-A-T-G-A-TTTTTAAAAt
gi|80673 : AAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-
gi|80673 : ATCTCTG-AA-A-TGAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatctctgaaatgagctgaaatgataagctaat
gi|80674 : aagtgagacctaatgatgtctggacctgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC-AG-----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGC-A--TT-A----AA-T---CT-C--C-T--A---AAAACC-ATATG-AAT-TCTGAAA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTT
gi|80675 : C-AGT----AA------TA-------TCA-TTTATAAAA----AAAAT--T---TG-A-A-AT---AAAA---AAT-T--TCTGT---C-AG-TTT-GC---AT-GGT-A--TG-T----AA-T---CCGC--C-T--A---AAAACC-ATATA-AATTTCTG-AA-A-TA--CTGAAA-ATG-A--TA----AGG--TA
gi|80676 : ----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATAT--AATTTCTG-AA-ATTAAGCTA-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-A-A-
gi|80677 : ----TA------TA-------TCA-TTTATAAAAAACAG---T--T---TG---A-AT---AAAA---AAT-T--TCTGT---C-AG-TACAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATA-AATTTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGG--T-AT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
gi|80678 : ----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T---AT---AAAA-A-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-AT-TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATG-AATTTCTG-AA-A-ATAGCTG-AA-A-G-AT-TA----AGG--TAAT-ATA-TG-A-T-ATA-TTTTTGAAA
gi|80679 : ----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-TTA-AT---AAAA-A-AAT-T--TCTGTTTTC-AG-TTCAGCC--ATTGGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--CTT--A---AAAACC-ATA-G-AATTTCTG-AA-A-TAAGCTG-A---------------------AAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
gi|80680 : A-------TCA-TTTTTAAAA----T---T--T---TT-T-A-AT---AAAAAA-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCATG---AT-GGTAA--TC-A----AA-T---CC-CCTC-T--A---AAAATC-ATATA-ATTTCCTG-AAGA-TACACTG--A-ATG-AACTAAGCTAGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTT
gi|80681 : -TCTACAGTA----T---T--T---TG-A-A-AT---AAAA-A-AAAAT--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATG-AATTTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
gi|80682 : TGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-G--C-T--A---AA---------------TCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TGAA-T-A-A-TTTT
gi|80683 : aataatgaacaca-TTCAGC---AG-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--G---AAAACC-ATATG-AATTTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-C-T-A-TTTTTGAAA
Alignments
lowQualScore : 1 33333 444444 1 2 1 1 22 1 2 7777 1 1 1 2222 555555 7777777 3 7777 222 22 222 1 1 1 666 3 1 1 22 222 1 1 444 1 3 33 1 3333 1 222 3 22 1 22 222 3 4 0 3 1 1 3 1 1 33 3333 22 1 1 1 1 3 1 3
lowQualScore : . ..... ...... . . . . .. . . .... . . . .... ...... ....... . .... ... .. ... . . . ... . . . .. ... . . ... . . .. . .... . ... . .. . .. ... . . . . . . . . . .. .... .. . . . . . . .
lowQualScore : 4 66666 111111 4 9 4 4 00 4 9 0000 5 6 5 9999 333333 8888888 1 5555 777 11 777 5 5 5 333 1 5 5 22 777 6 5 222 5 1 77 5 3333 5 777 1 11 5 11 777 1 6 9 0 5 5 0 5 5 55 1111 00 5 6 6 6 2 6 2
consensus : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATG-AATCTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
Reference ( family-531 ) : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATG-AATCTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
gi|80646 : AACAAGCGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-CGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAAAA-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATG-AATCTCTG-AA-A-TAAACTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTT
gi|80647 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGG-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-GAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-A--T---AAAACC-ATATG-AATCTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAAtcaa
gi|80648 : AACAAGCAA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GTTCGC-AAC----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-A---T--TCTGT---C-AC-TTCAGC---AT-GAT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACA-ATATG-AATCTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-AAG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
gi|80649 : AACAA-TGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-CTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT----AAA-A-ATT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAATC-ATATGAAAACTCTG-AA-A-TAAGCAG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATC-TG-G-T-G-A-TTTTT
gi|80650 : AACAATTGAAGACC-----TA------A-T-G-AATG--TC-TGGA-CT---CTGCG-TCCGC-CGCCAGC----TA-------A-------TCAACTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-TTT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT------AA-T---CT-C--C-T--A---AAAATC-ATATG-AAACGCTGAAA-A-TAAGCAGAAA-ATG-A--TA----A-C--TAAT-ATC-TG-G-TCG-A-TTTTTTAAAttaaa
gi|80651 : AACAAGTGA-AACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TT-GCACGC-AGC----TACTAGTATA-------TCA-TTTATAACA----T---T--T---TG-T-A-ATT--AAAA-A-AAT-T-----GT---C-AG-TTCAGC---AT-AAT-A--TC-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATACG-AATTTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AAC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTTAAA
gi|80652 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGCAAAATA------TA-------TC----TAT-AAA----T---T--T---TG-T-A-ATAAAAAAA-A-AAA-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GTT-A--T-------AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATG-AATCTTTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--T-AT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTTAA
gi|80653 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-TTG-A-TG--TC-TGGATC----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----AA------AAA------TCA-TTTATAACA----T---T--TGTACA-T-A-AA---AAAA-A-AAA-T--TCTGT---C-AG---CAGC---AT-GGT-A--TTTA----AA-T---CCGC--C-T--A---AAAACCCAT-TG-AATCTTTG-AA-A-TAAGCTG-AG-ATG-A--TA----ACT--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTT
gi|80654 : AAAAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGG--C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTATAAA-----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAT-G---CTGT---C-AA-TTCA-----AT-GGT-A--AT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATG-AATCTCTG-AA-A-TAAGCTG--A-ATG-A--TA----AGC--TAAT-AAA-TG-A-T-G-A-TTTTt
gi|80655 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-ATTGTAAAA--------T--T---TG-T-A-ATAA-AAAA-A-AAA-T--GCTGT---C-AA-TTCA-C---AT-GGTAA--GT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATGAAATCTGTG-AA-A-TAAGCTG--A-ATG-A--TA----AGC--TAAT-AAA-TG-A-TGG-A-TTTTTGAAA
gi|80656 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TT-TGGA-CGAC-CTGCA-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------T-A-TTTATTAAA----A---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A---T-A----GA-TCTCCC-T--C-T--A---AAAACC-ATATG-AATCTCTG-AA----AATCTG-AA-ATGAA--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
gi|80657 : AACAAGTGA-GACC-----TACATGTAA-T-G-A-TG--TC-TGGA-CAGGTCTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------C--------------TGTAGAA----G---CACT---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAA-T--TCTGT---C-AG-TTCAGCCCCAT-GGT-A--TT-A----AAAT---CC-C--C-T--AGTAAAAACC-ATATG-AAT-TCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-T-T-G-ATTTTTTGAA
gi|80658 : AGCAAGTGA-GACTACATGTA------AAT-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TAT-----TA-------TCA-TTTATAAAAAC--T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-AGAAA-T--TCTCT---C-AGTTTCAGC---AT-GG-----TT-ATGGTAA-T---CC-C--C-TAAA---AAAACC-ATATGAAATCTCTT-AG-A-T-AGCTG-AAGATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-ATT-G-ATTTTTTGAA
gi|80659 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------
gi|80660 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TT-GCTCGC-AGC----TA------CA-------
gi|80661 : AACAAGTGA-GAC------TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCG--AGC----TA------CATGTGTATTCATTTTATAAAATT--T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAT-T--T-TGT---CAAG-TTCAGC---AT-GGT-AATTT-A----AA-T----C-C--C-T--A---AAAAGC-ATAAG------CTG--A-T-TA----G-AA-ATG----TA----AGC--TAATAATATTG-A-C-G---TTTTTGAA
gi|80662 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTACG-TC-GCTCGC-AGC----TA------
gi|80663 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-GAA-TG--TC-TGGA-C----CTGCGATC-GCT-GC-A
gi|80664 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------CA-------
gi|80665 : AACAAGTG--GACC-----TA------A-TTG-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCAC-AG
gi|80666 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TT-GCTAGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTTTAAAA----T---C--C---TGTT-A-AC---ATAA-A-AAT-
gi|80667 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCACGT-AGC----TA------TA-------TC--------AAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-CAT-T--TCTGT---gaagcttgtcatcacaacgcttttgaaactactcaatac
gi|80668 : AACAAGTGA-GACT-----AA------A-T-G-A-TGACTCTTGGACC----CTGC--TC-GCTCGC-AGC----TA------t
gi|80669 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-A-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGC
gi|80670 : AACAAGTGA-AACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----C
gi|80671 : ACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A--G--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----AA------AAA------TCA-TTTATAAC-----T---T--T---TG-T-ACAT---AAAA-A-AAA-AAATCTGT---C-AG---CAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC------T--A---AAAACCCATA-G-AATCTTTG-AA-A-TAAGCTG-AG-ATG-A--TA----A-CTATAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTT
gi|80672 : CAAGTGA-GACC-----TT------A-T-A-A-TG--TC-TGGA-C----TTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GTC-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AACATC-ATATA-ATTCTCTG-AA-A-T-----------TA-A---A----AGC--TAAT-AT--TG-A-T-G-A-TTTTTAAAAt
gi|80673 : AAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-
gi|80673 : ATCTCTG-AA-A-TGAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatctctgaaatgagctgaaatgataagctaat
gi|80674 : aagtgagacctaatgatgtctggacctgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC-AG-----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGC-A--TT-A----AA-T---CT-C--C-T--A---AAAACC-ATATG-AAT-TCTGAAA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTT
gi|80675 : C-AGT----AA------TA-------TCA-TTTATAAAA----AAAAT--T---TG-A-A-AT---AAAA---AAT-T--TCTGT---C-AG-TTT-GC---AT-GGT-A--TG-T----AA-T---CCGC--C-T--A---AAAACC-ATATA-AATTTCTG-AA-A-TA--CTGAAA-ATG-A--TA----AGG--TA
gi|80676 : ----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATAT--AATTTCTG-AA-ATTAAGCTA-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-A-A-
gi|80677 : ----TA------TA-------TCA-TTTATAAAAAACAG---T--T---TG---A-AT---AAAA---AAT-T--TCTGT---C-AG-TACAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATA-AATTTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGG--T-AT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
gi|80678 : ----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T---AT---AAAA-A-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-AT-TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATG-AATTTCTG-AA-A-ATAGCTG-AA-A-G-AT-TA----AGG--TAAT-ATA-TG-A-T-ATA-TTTTTGAAA
gi|80679 : ----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-TTA-AT---AAAA-A-AAT-T--TCTGTTTTC-AG-TTCAGCC--ATTGGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--CTT--A---AAAACC-ATA-G-AATTTCTG-AA-A-TAAGCTG-A---------------------AAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
gi|80680 : A-------TCA-TTTTTAAAA----T---T--T---TT-T-A-AT---AAAAAA-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCATG---AT-GGTAA--TC-A----AA-T---CC-CCTC-T--A---AAAATC-ATATA-ATTTCCTG-AAGA-TACACTG--A-ATG-AACTAAGCTAGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTT
gi|80681 : -TCTACAGTA----T---T--T---TG-A-A-AT---AAAA-A-AAAAT--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATG-AATTTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
gi|80682 : TGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-G--C-T--A---AA---------------TCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TGAA-T-A-A-TTTT
gi|80683 : aataatgaacaca-TTCAGC---AG-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--G---AAAACC-ATATG-AATTTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-C-T-A-TTTTTGAAA
blockSeqs : A ACATG CATGTA A T A A AC T T AGGT A C C AAAA CTAGTA TGTGTAT A AACA AAA AC GTA T T C AAA A G A AA TTT A T CCC T A AT T TGGT A CTC G CT T AA GTA C A A G T A G A AC AGCT TA A T A T C T T
blockSeqs : . . . . T . . . . C GAC . . . . T A T AC . . . . . . AA . . . . . . . C . A T . . . . G . . . . C A A . . A . . T . . . . . . G . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . . . A . TT . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons :
originalCons : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATG-AATCTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
finalCons : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATG-AATCTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
Alignments
lowQualScore : 1 33333 444444 1 2 1 1 22 1 2 7777 1 1 1 2222 555555 7777777 3 7777 222 22 222 1 1 1 666 3 1 1 22 222 1 1 444 1 3 33 1 3333 1 222 3 22 1 22 222 3 4 0 3 1 1 3 1 1 33 3333 22 1 1 1 1 3 1 3
lowQualScore : . ..... ...... . . . . .. . . .... . . . .... ...... ....... . .... ... .. ... . . . ... . . . .. ... . . ... . . .. . .... . ... . .. . .. ... . . . . . . . . . .. .... .. . . . . . . .
lowQualScore : 4 66666 111111 4 9 4 4 00 4 9 0000 5 6 5 9999 333333 8888888 1 5555 777 11 777 5 5 5 333 1 5 5 22 777 6 5 222 5 1 77 5 3333 5 777 1 11 5 11 777 1 6 9 0 5 5 0 5 5 55 1111 00 5 6 6 6 2 6 2
consensus : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATG-AATCTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
Reference ( family-531 ) : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATG-AATCTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
gi|80646 : AACAAGCGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-CGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAAAA-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATG-AATCTCTG-AA-A-TAAACTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTT
gi|80647 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGG-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-GAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-A--T---AAAACC-ATATG-AATCTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAAtcaa
gi|80648 : AACAAGCAA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GTTCGC-AAC----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-A---T--TCTGT---C-AC-TTCAGC---AT-GAT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACA-ATATG-AATCTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-AAG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
gi|80649 : AACAA-TGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-CTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT----AAA-A-ATT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAATC-ATATGAAAACTCTG-AA-A-TAAGCAG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATC-TG-G-T-G-A-TTTTT
gi|80650 : AACAATTGAAGACC-----TA------A-T-G-AATG--TC-TGGA-CT---CTGCG-TCCGC-CGCCAGC----TA-------A-------TCAACTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-TTT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT------AA-T---CT-C--C-T--A---AAAATC-ATATG-AAACGCTGAAA-A-TAAGCAGAAA-ATG-A--TA----A-C--TAAT-ATC-TG-G-TCG-A-TTTTTTAAAttaaa
gi|80651 : AACAAGTGA-AACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TT-GCACGC-AGC----TACTAGTATA-------TCA-TTTATAACA----T---T--T---TG-T-A-ATT--AAAA-A-AAT-T-----GT---C-AG-TTCAGC---AT-AAT-A--TC-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATACG-AATTTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AAC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTTAAA
gi|80652 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGCAAAATA------TA-------TC----TAT-AAA----T---T--T---TG-T-A-ATAAAAAAA-A-AAA-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GTT-A--T-------AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATG-AATCTTTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--T-AT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTTAA
gi|80653 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-TTG-A-TG--TC-TGGATC----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----AA------AAA------TCA-TTTATAACA----T---T--TGTACA-T-A-AA---AAAA-A-AAA-T--TCTGT---C-AG---CAGC---AT-GGT-A--TTTA----AA-T---CCGC--C-T--A---AAAACCCAT-TG-AATCTTTG-AA-A-TAAGCTG-AG-ATG-A--TA----ACT--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTT
gi|80654 : AAAAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGG--C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTATAAA-----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAT-G---CTGT---C-AA-TTCA-----AT-GGT-A--AT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATG-AATCTCTG-AA-A-TAAGCTG--A-ATG-A--TA----AGC--TAAT-AAA-TG-A-T-G-A-TTTTt
gi|80655 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-ATTGTAAAA--------T--T---TG-T-A-ATAA-AAAA-A-AAA-T--GCTGT---C-AA-TTCA-C---AT-GGTAA--GT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATGAAATCTGTG-AA-A-TAAGCTG--A-ATG-A--TA----AGC--TAAT-AAA-TG-A-TGG-A-TTTTTGAAA
gi|80656 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TT-TGGA-CGAC-CTGCA-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------T-A-TTTATTAAA----A---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A---T-A----GA-TCTCCC-T--C-T--A---AAAACC-ATATG-AATCTCTG-AA----AATCTG-AA-ATGAA--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
gi|80657 : AACAAGTGA-GACC-----TACATGTAA-T-G-A-TG--TC-TGGA-CAGGTCTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------C--------------TGTAGAA----G---CACT---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAA-T--TCTGT---C-AG-TTCAGCCCCAT-GGT-A--TT-A----AAAT---CC-C--C-T--AGTAAAAACC-ATATG-AAT-TCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-T-T-G-ATTTTTTGAA
gi|80658 : AGCAAGTGA-GACTACATGTA------AAT-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TAT-----TA-------TCA-TTTATAAAAAC--T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-AGAAA-T--TCTCT---C-AGTTTCAGC---AT-GG-----TT-ATGGTAA-T---CC-C--C-TAAA---AAAACC-ATATGAAATCTCTT-AG-A-T-AGCTG-AAGATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-ATT-G-ATTTTTTGAA
gi|80659 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------
gi|80660 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TT-GCTCGC-AGC----TA------CA-------
gi|80661 : AACAAGTGA-GAC------TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCG--AGC----TA------CATGTGTATTCATTTTATAAAATT--T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAT-T--T-TGT---CAAG-TTCAGC---AT-GGT-AATTT-A----AA-T----C-C--C-T--A---AAAAGC-ATAAG------CTG--A-T-TA----G-AA-ATG----TA----AGC--TAATAATATTG-A-C-G---TTTTTGAA
gi|80662 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTACG-TC-GCTCGC-AGC----TA------
gi|80663 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-GAA-TG--TC-TGGA-C----CTGCGATC-GCT-GC-A
gi|80664 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------CA-------
gi|80665 : AACAAGTG--GACC-----TA------A-TTG-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCAC-AG
gi|80666 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TT-GCTAGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTTTAAAA----T---C--C---TGTT-A-AC---ATAA-A-AAT-
gi|80667 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCACGT-AGC----TA------TA-------TC--------AAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-CAT-T--TCTGT---gaagcttgtcatcacaacgcttttgaaactactcaatac
gi|80668 : AACAAGTGA-GACT-----AA------A-T-G-A-TGACTCTTGGACC----CTGC--TC-GCTCGC-AGC----TA------t
gi|80669 : AACAAGTGA-GACC-----TA------A-A-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGC
gi|80670 : AACAAGTGA-AACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----C
gi|80671 : ACAAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A--G--TC-TGGA-C----CTGCG-TC-GCTCGC-AGC----AA------AAA------TCA-TTTATAAC-----T---T--T---TG-T-ACAT---AAAA-A-AAA-AAATCTGT---C-AG---CAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC------T--A---AAAACCCATA-G-AATCTTTG-AA-A-TAAGCTG-AG-ATG-A--TA----A-CTATAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTT
gi|80672 : CAAGTGA-GACC-----TT------A-T-A-A-TG--TC-TGGA-C----TTGCG-TC-GCTCGC-AGC----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GTC-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AACATC-ATATA-ATTCTCTG-AA-A-T-----------TA-A---A----AGC--TAAT-AT--TG-A-T-G-A-TTTTTAAAAt
gi|80673 : AAGTGA-GACC-----TA------A-T-G-A-TG--TC-TGGA-C----CTGCG-
gi|80673 : ATCTCTG-AA-A-TGAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatctctgaaatgagctgaaatgataagctaat
gi|80674 : aagtgagacctaatgatgtctggacctgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC-AG-----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGC-A--TT-A----AA-T---CT-C--C-T--A---AAAACC-ATATG-AAT-TCTGAAA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTT
gi|80675 : C-AGT----AA------TA-------TCA-TTTATAAAA----AAAAT--T---TG-A-A-AT---AAAA---AAT-T--TCTGT---C-AG-TTT-GC---AT-GGT-A--TG-T----AA-T---CCGC--C-T--A---AAAACC-ATATA-AATTTCTG-AA-A-TA--CTGAAA-ATG-A--TA----AGG--TA
gi|80676 : ----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T-A-AT---AAAA-A-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATAT--AATTTCTG-AA-ATTAAGCTA-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-A-A-
gi|80677 : ----TA------TA-------TCA-TTTATAAAAAACAG---T--T---TG---A-AT---AAAA---AAT-T--TCTGT---C-AG-TACAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATA-AATTTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGG--T-AT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
gi|80678 : ----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-T---AT---AAAA-A-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-AT-TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATG-AATTTCTG-AA-A-ATAGCTG-AA-A-G-AT-TA----AGG--TAAT-ATA-TG-A-T-ATA-TTTTTGAAA
gi|80679 : ----TA------TA-------TCA-TTTATAAAA----T---T--T---TG-TTA-AT---AAAA-A-AAT-T--TCTGTTTTC-AG-TTCAGCC--ATTGGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--CTT--A---AAAACC-ATA-G-AATTTCTG-AA-A-TAAGCTG-A---------------------AAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
gi|80680 : A-------TCA-TTTTTAAAA----T---T--T---TT-T-A-AT---AAAAAA-AAT-T--TCTGT---C-AG-TTCATG---AT-GGTAA--TC-A----AA-T---CC-CCTC-T--A---AAAATC-ATATA-ATTTCCTG-AAGA-TACACTG--A-ATG-AACTAAGCTAGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTT
gi|80681 : -TCTACAGTA----T---T--T---TG-A-A-AT---AAAA-A-AAAAT--TCTGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--A---AAAACC-ATATG-AATTTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-T-G-A-TTTTTGAAA
gi|80682 : TGT---C-AG-TTCAGC---AT-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-G--C-T--A---AA---------------TCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TGAA-T-A-A-TTTT
gi|80683 : aataatgaacaca-TTCAGC---AG-GGT-A--TT-A----AA-T---CC-C--C-T--G---AAAACC-ATATG-AATTTCTG-AA-A-TAAGCTG-AA-ATG-A--TA----AGC--TAAT-ATA-TG-A-C-T-A-TTTTTGAAA