lowQualScore                  :                                                                   11111                       2            1111111                     2222222                          2222                              
lowQualScore                  :                                                               666 55555  3 55 3 3 77       11 1   1      3 0000000  2 2 8888888888 1   8888888 1     444 77 2  1 1 111  1111 3 2 44 1   3 55 4  3         
lowQualScore                  :                                                               ... .....  . .. . . ..       .. .   .      . .......  . . .......... .   ....... .     ... .. .  . . ...  .... . . .. .   . .. .  .         
lowQualScore                  :                                                               000 44444  2 77 2 2 88       77 4   1      2 5555555  2 2 8888888888 1   4444444 1     555 77 2  1 1 999  2222 2 2 77 1   2 88 3  2         
consensus                     :                                                        ACCGACA---T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAA-GA-TTT-ATAAAA-C---AG--GT-A-A--C--CT-G-T-AGA----C--A-GAGAT-C-A--T-AG-A-A---CCG---A-C-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
Reference ( gi|129791 )       :                                                        ACCAACA---T-TT--GA-C--A-C-A--GAGGTAA-GAGTTT-ATAAAA-C---AG--GT-A-A--C--CT-G-T-AGA----C--A-GAGAT-C-A--T-AG-A-A---CC----A-C-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129790                     :                                                        ACCAACA---T-CC--GA-C--A-C-A--AGGGTAA-GA-TTT-ATAGAA-C---AGTGAT-A-A--C--TT-A-T-AGA----CCAG-GAGAT-C-A--T-AG-A-A---CC----AAC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129789                     :                                                        ACCAACA---T-CC--GA-C--A-C-A--AGGGTAA-GA-TTT-ATAGAA-C---AGTGAT-A-A--C--TT-A-T-AGA----CCAG-GAGAT-C-A--T-AG-A-A---CC----AAC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129788                     :                                                        ACCAACA---T-CC--GA-C--A-C-A--AGGGTAA-GA-TTT-ATAGAA-C---AGTGAT-A-A--C--TT-A-T-AGA----CCAG-GAGAT-C-A--T-AG-A-A---CC----AAC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129822                     :                                                        ACCAACA---T-TT--GA-C--A-C-A--GAGGTAA-G
gi|129794                     : atccgacacagaggtaaaattttaaaacaggtaacctatagaccgagacaatagaACCAACA---T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAA-GATTTT-ATAAAA-C---A---GT-A-A--C--CT-T-A-AGAC---C--A-GAGAT-C-G--T-AG-A-G---CC----A-A-AT-T-CCG-A--C-CC-AGAGAT
gi|129793                     :                                                        ACCAACA---T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAA-GATTTT-ATAAAA-C---A---GT-A-A--C--CT-T-A-AGAC---C--A-GAGAT-C-G--T-AG-A-G---CC----A-A-AT-T-CCG-A--C-CC-AGAGAT
gi|129792                     :                                                        ACCAACA---T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAA-GATTTT-ATAAAA-C---A---GT-A-A--C--CT-T-A-AGAC---C--A-GAGAT-C-G--T-AG-A-G---CC----A-A-AT-T-CCG-A--C-CC-AGAGAT
gi|129795                     :                                                        ACCGACA---T-CC---A-C--A-C-A--GAGGTAA-GA-TTT-ATAAAC-A---AG--GTCA-A--C--CT-G-T-AGAGCCGC--A-GAGAT---A--T-AG-A-A---CC----G-CAA--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAA
gi|129799                     :                                                        ACCGACAGGTC-CT--GA-C--A-C-AT-GAGGTAA-GATGTA-ATAAAAACG--AG--GT-A-A--C--CT-G-T-AGA----CC-A-GAGAT-C-A--T-AG-A-A---CCG---A-C-A--T-CCG-A--CAACGAGAGGTGAG
gi|129798                     :                                                        ACCGACAGGTC-CT--GA-C--A-C-AT-GAGGTAA-GATGTA-ATAAAAACG--AG--GT-A-A--C--CT-G-T-AGA----CC-A-GAGAT-C-A--T-AG-A-A---CCG---A-C-A--T-CCG-A--CAACGAGAGGTGAG
gi|129797                     :                                                        ACCGACAGGTC-CT--GA-C--A-C-AT-GAGGTAA-GATGTA-ATAAAAACG--AG--GT-A-A--C--CT-G-T-AGA----CC-A-GAGAT-C-A--T-AG-A-A---CCG---A-C-A--T-CCG-A--CAACGAGAGGTGAG
gi|129801                     :                                                        ACCAACA---T-TT--GA-CC-A-C-A--GAG-TAA-AA-TTC-ATAGAA-C---AG--GT-A-A--C--CT-GTT-AGAC---C--A-GAGAT-C-A--T-AG-A-A------------------CCG-AG-C-AC--GAGGTAAG
gi|129796                     :                                                        ACCAACA---T-TT--GA-CC-A-C-A--GAG-TAA-AA-TTC-ATAGAA-C---AG--GT-A-A--G--CT-G-T-AGAGC--C--A-GAGAT-T-A--T-AG-A-A------------------CCG-A--C-A--AGAGGTAAG
gi|129806                     :                                                        ACCGACA---T-CC--GA-CT-A-C-A--GAGGTGA-AATTGT-ATAAAA-A---GG--GT-A-A--C---T-A-T-AGA----C--CCGAGAT-C-A--T-AG-A-A---CA----A-C-A--TGTTG-A--C-AC-AGA-GTAAG
gi|129805                     :                                                        ACCAACA---T-CC--GAAC--C-C-C--GAGGTGA----TTT-ATAGAA-C----G--GT-A-A--T--TA-A-T-CGA----C--A-GAGAT-C-AA-T-AG-A-A---CC----A-C------TCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129804                     :                                                        ACCAACA---T-CC--GAAC--C-C-C--GAGGTGA----TTT-ATAGAA-C----G--GT-A-A--T--TA-A-T-CGA----C--A-GAGAT-C-AA-T-AG-A-A---CC----A-C------TCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129803                     :                                                        ACCAACA---T-CC--GAAC--C-C-C--GAGGTGA----TTT-ATAGAA-C----G--GT-A-A--T--TA-A-T-CGA----C--A-GAGAT-C-AA-T-AG-A-A---CC----A-C------TCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129800                     :                                                        ACCTACA---T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAAGGAACCT-GTAGAC-C---AC--G-----------------AGAC---C--A-GAGAT-C-A--T-AG-A-G---CCA---A-C-A--T-CCG-A--C-AC-ACAGGTAAG
gi|129802                     :                                                        ACCAACA---T-TT--GA-CC-A-C-A--GAG-TAA-AA-TTC-ATAGAA-C---AG--GT-A-A-----CT-GTT-AGAGC--C--A-GAGAT-CTA--TAAG-A-A---CC----G-----------------AC-AGAGGTAAG
gi|129809                     :                                                        ACCGACA---T-CC--GA-C--AACGA--GAGGTGA-GAATT--ATAAAA-TCGAGG--GT-G-AGGC--CT-G-T-AGAC---C--A-GAGAT---A--T-AG-A-A---CCA---A-C-A--T-CCGAA--C-CC-CGAGGTGA
gi|129808                     :                                                        ACCGACA---T-CC--GA-C--AACGA--GAGGTGA-GAATT--ATAAAA-TCGAGG--GT-G-AGGC--CT-G-T-AGAC---C--A-GAGAT---A--T-AG-A-A---CCA---A-C-A--T-CCGAA--C-CC-CGAGGTGA
gi|129807                     :                                                        ACCGACA---T-CC--GA-C--AACGA--GAGGTGA-GAATT--ATAAAA-TCGAGG--GT-G-AGGC--CT-G-T-AGAC---C--A-GAGAT---A--T-AG-A-A---CCA---A-C-A--T-CCGAA--C-CC-CGAGGTGA
gi|129813                     :                                                        ACCAACA---T-CCCCGA-C--A-C-A--G--GTAG-----TT-ATGACA-C---AG--GT-A-A--C---T-A-T-AGA----CC-A-GAGAT-C-ATGT-AG-A-A---CCA---A-C-A--T-TTG-AC-C-AC-AGA-GTAA
gi|129812                     :                                                        ACCAACA---T-CCCCGA-C--A-C-A--G--GTAG-----TT-ATGACA-C---AG--GT-A-A--C---T-A-T-AGA----CC-A-GAGAT-C-ATGT-AG-A-A---CCA---A-C-A--T-TTG-AC-C-AC-AGA-GTAA
gi|129811                     :                                                        ACCAACA---T-CCCCGA-C--A-C-A--G--GTAG-----TT-ATGACA-C---AG--GT-A-A--C---T-A-T-AGA----CC-A-GAGAT-C-ATGT-AG-A-A---CCA---A-C-A--T-TTG-AC-C-AC-AGA-GTAA
gi|129810                     :                                                        ACCGA-A---T-CC--GA-CTCA-C-A--GAGGTAA-GA-TTT-ATAAAA-----AGT-GT-A-A-----CT-A-T-AGAC---C--C-GAGAC-A-A--T-AG-A-A---CA----A-C-ATGT-TAG-A--C-AC-AGA-GTAAG
gi|129814                     :                                                         CCAACA---T-CC--GA-C--A-C-A--CAGGTAA-GA-TTT-ATAAAA-C---AG--G--A-A------------AGACAT-C--A-GAGAC-T-A--T-AG-A-C---CC----A-
gi|129815                     :                                                         CCAACA---T-CC--GA-C----C-A--GAGAT--------C-ATAGAA-C---CG---T-ACA--T--CC-G-----A----CC-A-GAGATTC-A--T-AG-A-A---CCG---A-C-A--T-CC--A--C-AC-AGAGGTAAGacgt
gi|129817                     :                                                          CAACA---TGTTA-GA-C--A-C-A--GAG-TAA-GAGTTT-ATAAAA-C---AG--GT-A-A--CA-CT-G-T-AGA----C--A-GAGAT-C-A--T-AG-ATA---CCTTTGA-C-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129816                     :                                                          CAACA---TGTT--GA-C--A-C-A--GAG-TAA-GA-TTT-ATAAAA-C---AG--GT-A-A--C--CT-G-TGAGC----C--A-GAGAT-C-A--T-AG-G-ATACCT----A-C-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129818                     :                                                          CGACA---A-TC--CA-C--A-C-ATCGAGGTAA-GAGTTTGATAAAA-----AG--GT-A-A--G--CTGG-T-AGAGCCGC--A-GAGAT---A--T-AG-A-A---CCG---A-C-A--T-CCG-A--CTAC-AGAGGTGA
gi|129821                     :                                                           AACA---T-TCC-GA-C--A-C-AA-GAGGTAA-GAATTT-ATAAAA-C---A----T-T-A--C-----------------------------------G-A-A---CCA---A-C-A--T-CCG-A--C-AC-AAGGGTAAG
gi|129820                     :                                                           AACA---T-TCC-GA-C--A-C-AA-GAGGTAA-GAATTT-ATAAAA-C---A----T-T-A--C-----------------------------------G-A-A---CCA---A-C-A--T-CCG-A--C-AC-AAGGGTAAG
gi|129819                     :                                                           AACA---T-TCC-GA-C--A-C-AA-GAGGTAA-GAATTT-ATAAAA-C---A----T-T-A--C-----------------------------------G-A-A---CCA---A-C-A--T-CCG-A--C-AC-AAGGGTAAG
gi|129822                     :                                                              A---T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAA-AA-TTT--TAAAA-C---AG--GT-A-A--C--CT-A-T-AGA----C--C-GAGAC-A-A--T-AG-A-A---CCA---A-C-A--T-TTG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129824                     :                                                                         A-C--A-C-A--GAGGTAA-GA-TTT-ATAAAC-A---AG--GTCA-A--CAGCT-G-T-AGAG---CCGA-GAGAT---A--T-AGAA-A---CC----G-A-A--T-CCG-ACTC-AC-AGAGGTAAG
gi|129823                     :                                                                          -C--A-C----GAGGTAA-GA-TTT-ATAAAA-C---AG--GT-A-A--C--CT-G-T-AGAC---C--A-GAGAT-C-G--T-AG-A-G---CCA---A-C-A--T-CCG-A--C--C-AGAGAT
gi|129825                     :                                                                        cgag--A-C-A--GAGGTAA-GA-TTT-ATAAAA-C---AG--GT-ACG--C--CT-G-T-AGA----CCAG-GAGAT-C-G--TGAG-A-G---CCA---A-CAA--T-CCG-A--T-CC-AGAGATCAG
gi|129814                     :                                                                                                                                                                         ----A-C-A--T-CCG-A--C-AC-ACAGGTAAG





Alignments
lowQualScore                  :                                                             1111111                    333333333333                                                         
lowQualScore                  :            1   66 4  77  4 55 3 3 77         9  1 1 3     3 0000000  2 2 666666  3 1   000000000000 1     444 77 2  1 22   7777  1 11 1   3 44 4  3         
lowQualScore                  :            .   .. .  ..  . .. . . ..         .  . . .     . .......  . . ......  . .   ............ .     ... .. .  . ..   ....  . .. .   . .. .  .         
lowQualScore                  :            0   00 7  99  3 77 2 2 88         5  1 1 2     2 3333333  1 1 222222  2 1   555555555555 1     111 55 1  1 55   0000  1 44 1   2 77 3  2         
consensus                     :         ACCGACA--T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAAGA-TT-T-A-TAAAA-C---AG--GT-A-A--C--CTG-T-AGA---------C--A-GAGAT-C-A--T-AG-A--ACC---GAC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
Reference ( family-528 )      :         ACCGACA--T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAAGA-TT-T-A-TAAAA-C---AG--GT-A-A--C--CTG-T-AGA---------C--A-GAGAT-C-A--T-AG-A--ACC---GAC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129788                     :         ACCAACA--T-CC--GA-C--A-C-A--AGGGTAAGA-TT-T-A-TAGAA-C---AGTGAT-A-A--C--TTA-T-AGA---------CCAG-GAGAT-C-A--T-AG-A--ACC---AAC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129789                     :         ACCAACA--T-CC--GA-C--A-C-A--AGGGTAAGA-TT-T-A-TAGAA-C---AGTGAT-A-A--C--TTA-T-AGA---------CCAG-GAGAT-C-A--T-AG-A--ACC---AAC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129790                     :         ACCAACA--T-CC--GA-C--A-C-A--AGGGTAAGA-TT-T-A-TAGAA-C---AGTGAT-A-A--C--TTA-T-AGA---------CCAG-GAGAT-C-A--T-AG-A--ACC---AAC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129791                     :         ACCAACA--T-TT--GA-C--A-C-A--GAGGTAAGAGTT-T-A-TAAAA-C---AG--GT-A-A--C--CTG-T-AGA---------C--A-GAGAT-C-A--T-AG-A--ACC----AC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129792                     :         ACCAACA--T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAAGATTT-T-A-TAAAA-C---A---GT-A-A--C--CTT-A-AGAC--------C--A-GAGAT-C-G--T-AG-A--GCC---AAA-T--T-CCG-A--C-CC-AGAGAT
gi|129793                     :         ACCAACA--T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAAGATTT-T-A-TAAAA-C---A---GT-A-A--C--CTT-A-AGAC--------C--A-GAGAT-C-G--T-AG-A--GCC---AAA-T--T-CCG-A--C-CC-AGAGAT
gi|129794                     :         ACCAACA--T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAAGATTT-T-A-TAAAA-C---A---GT-A-A--C--CTT-A-AGAC--------C--A-GAGAT-C-G--T-AG-A--GCC---AAA-T--T-CCG-A--C-CC-AGAGAT
gi|129795                     :         ACCGACA--T-CC---A-C--A-C-A--GAGGTAAGA-TT-T-A-TAAAC-A---AG--GTCA-A--C--CTG-T-AGAGCCG-----C--A-GAGAT---A--T-AG-A--ACC---GCA-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAA
gi|129796                     :         ACCAACA--T-TT--GA-CC-A-C-A--GAG-TAAAA-TT-C-A-TAGAA-C---AG--GT-A-A--G--CTG-T-AGAGC-------C--A-GAGAT-T-A--T-AG-A--ACC---GAC-A----------------AGAGGTAAG
gi|129797                     :         ACCGACAGGT-CCT-GA-C--A-C-AT-GAGGTAAGA-TG-T-AATAAAAACG--AG--GT-A-A--C--CTG-T-AGA---------CC-A-GAGAT-C-A--T-AG-A--ACC---GAC-A--T-CCG-A--CAACGAGAGGTGAG
gi|129798                     :         ACCGACAGGT-CCT-GA-C--A-C-AT-GAGGTAAGA-TG-T-AATAAAAACG--AG--GT-A-A--C--CTG-T-AGA---------CC-A-GAGAT-C-A--T-AG-A--ACC---GAC-A--T-CCG-A--CAACGAGAGGTGAG
gi|129799                     :         ACCGACAGGT-CCT-GA-C--A-C-AT-GAGGTAAGA-TG-T-AATAAAAACG--AG--GT-A-A--C--CTG-T-AGA---------CC-A-GAGAT-C-A--T-AG-A--ACC---GAC-A--T-CCG-A--CAACGAGAGGTGAG
gi|129800                     :         ACCTACA--T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAAGG-------------------------A-A--C--CTG-T-AGACCACGAGACC--A-GAGAT-C-A--T-AG-A--GCC---AAC-A--T-CCG-A--C-AC-ACAGGTAAG
gi|129801                     :         ACCAACA--T-TT--GA-CC-A-C-A--GAG-TAAAA-TT-C-A-TAGAA-C---AG--GT-A-A--C--CTGTT-AGAC--------C--A-GAGAT-C-A--T-AG-A--ACC---GA-----------G--C-AC--GAGGTAAG
gi|129802                     :         ACCAACA--T-TT--GA-CC-A-C-A--GAG-TAAAA-TT-C-A-TAGAA-C---AG--GT-A-A-----CTGTT-AGAGC-------C--A-GAGAT-CTA--TAAG-A--ACC---G-----------------AC-AGAGGTAAG
gi|129803                     :         ACCAACA--T-CC--GAAC--C-C-C--GAGGT--GA-TT-T-A-TAGAA-C----G--GT-A-A--T--TAA-T-CGA---------C--A-GAGAT-C-AA-T-AG-A--ACC-------A--C-TCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129804                     :         ACCAACA--T-CC--GAAC--C-C-C--GAGGT--GA-TT-T-A-TAGAA-C----G--GT-A-A--T--TAA-T-CGA---------C--A-GAGAT-C-AA-T-AG-A--ACC-------A--C-TCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129805                     :         ACCAACA--T-CC--GAAC--C-C-C--GAGGT--GA-TT-T-A-TAGAA-C----G--GT-A-A--T--TAA-T-CGA---------C--A-GAGAT-C-AA-T-AG-A--ACC-------A--C-TCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129806                     :         ACCGACA--T-CC--GA-CT-A-C-A--GAGGTGAAA-TTGT-A-TAAAA-A---GG--GT-A-A--C---TA-T-AGA---------C--CCGAGAT-C-A--T-AG-A--A-C---AAC-A--TGTTG-A--C-AC-AGA-GTAAG
gi|129807                     :         ACCGACA--T-CC--GA-C--AACGA--GAGGTGAGA-AT-T-A-TAAAA-TCGAGG--GT-G-AGGC--CTG-T-AGAC--------C--A-GAGAT---A--T-AG-A--ACC---AAC-A--T-CCGAA--C-CC-CGAGGTGA
gi|129808                     :         ACCGACA--T-CC--GA-C--AACGA--GAGGTGAGA-AT-T-A-TAAAA-TCGAGG--GT-G-AGGC--CTG-T-AGAC--------C--A-GAGAT---A--T-AG-A--ACC---AAC-A--T-CCGAA--C-CC-CGAGGTGA
gi|129809                     :         ACCGACA--T-CC--GA-C--AACGA--GAGGTGAGA-AT-T-A-TAAAA-TCGAGG--GT-G-AGGC--CTG-T-AGAC--------C--A-GAGAT---A--T-AG-A--ACC---AAC-A--T-CCGAA--C-CC-CGAGGTGA
gi|129810                     :         ACCGA-A--T-CC--GA-CTCA-C-A--GAGGTAAGA-TT-T-A-TAAAA-----AGT-GT-A-A-----CTA-T-AGAC--------C--C-GAGAC-A-A--T-AG-A--A-C---AAC-ATGT-TAG-A--C-AC-AGA-GTAAG
gi|129811                     :         ACCAACA--T-CCCCGA-C--A-C-A--G--GTAG----T-T-A-TGACA-C---AG--GT-A-A--C---TA-T-AGA---------CC-A-GAGAT-C-ATGT-AG-A--ACC---AAC-A--T-TTG-AC-C-AC-AGA-GTAA
gi|129812                     :         ACCAACA--T-CCCCGA-C--A-C-A--G--GTAG----T-T-A-TGACA-C---AG--GT-A-A--C---TA-T-AGA---------CC-A-GAGAT-C-ATGT-AG-A--ACC---AAC-A--T-TTG-AC-C-AC-AGA-GTAA
gi|129813                     :         ACCAACA--T-CCCCGA-C--A-C-A--G--GTAG----T-T-A-TGACA-C---AG--GT-A-A--C---TA-T-AGA---------CC-A-GAGAT-C-ATGT-AG-A--ACC---AAC-A--T-TTG-AC-C-AC-AGA-GTAA
gi|129814                     :          CCAACA--T-CC--GA-C--A-C-A--CAGGTAAGA-TT-T-A-TAAAA-C---AG--G--A-A-----------AGACAT------C--A-GAGAC-T-A--T-AG-A--CCC---AAC-G--T-
gi|129815                     :          CCAACA--T-CC--GA-C----C-A--GAGAT--------C-A-TAGAA-C---CG---T-ACA--T--CCG-----A---------CC-A-GAGATTC-A--T-AG-A--ACC---GAC-A--T-CC--A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129816                     :           CAACA--TGTT--GA-C--A-C-A--GAG-TAAGA-TT-T-A-TAAAA-C---AG--GT-A-A--C--CTG-TGAGC---------C--A-GAGAT-C-A--T-AG-GATACC---TAC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129817                     :                      --GA-C--A-C-A--GAG-TAAGAGTT-T-A-TAAAA-C---AG--GT-A-A--CA-CTG-T-AGA---------C--A-GAGAT-C-A--T-AG-AT-ACCTTTGAC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129818                     : caacatgttaCGACAA-T-CC---A-C--A-C-ATCGAGGTAAGAGTT-TGA-TAAAA-----AG--GT-A-A--G--CTGGT-AGAGCCG-----C--A-GAGAT---A--T-AG-A--ACC---GAC-A--T-CCG-A--CTAC-AGAGGTGA
gi|129819                     :             ACA--TTCC--GA-C--A-C-AA-GAGGTAAGAATT-T-A-TAAAA-C---A----T-T-A--C---------------------------------------G-A--ACC---AAC-A--T-CCG-A--C-AC-AAGGGTAAG
gi|129820                     :            aACA--TTCC--GA-C--A-C-AA-GAGGTAAGAATT-T-A-TAAAA-C---A----T-T-A--C---------------------------------------G-A--ACC---AAC-A--T-CCG-A--C-AC-AAGGGTAAG
gi|129821                     :            aACA--TTCC--GA-C--A-C-AA-GAGGTAAGAATT-T-A-TAAAA-C---A----T-T-A--C---------------------------------------G-A--ACC---AAC-A--T-CCG-A--C-AC-AAGGGTAAG
gi|129822                     :              aA--T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAAAA-TT-T---TAAAA-C---AG--GT-A-A--C--CTA-T-AGA---------C--C-GAGAC-A-A--T-AG-A--ACC---AAC-A--T-TTG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129823                     :                     C--GAGC--A-C----GAGGTAAGA-TT-T-A-TAAAA-C---AG--GT-A-A--C--CTG-T-AGAC--------C--A-GAGAT-C-G--T-AG-A--GCC---AAC-A--T-CCG-A--C--C-AGAGAT
gi|129824                     :                         A-C--A-C-A--GAGGTAAGA-TT-T-A-TAAAC-A---AG--GTCA-A--CAGCTG-T-AGAG--------CCGA-GAGAT---A--T-AGAA--ACC---GA--A--T-CCG-ACTC-AC-AGAGGTAAG
gi|129825                     :                            --A-C-A--GAGGTAAGA-TT-T-A-TAAAA-C---AG--GT-ACG--C--CTG-T-AGA---------CCAG-GAGAT-C-G--TGAG-A--GCC---AACAA--T-CCG-A--T-CC-AGAGATCAG





Alignments
lowQualScore                  :                                                             1111111                    333333333333                                                         
lowQualScore                  :            1   66 4  77  4 55 3 3 77         9  1 1 3     3 0000000  2 2 666666  3 1   000000000000 1     444 77 2  1 22   7777  1 11 1   3 44 4  3         
lowQualScore                  :            .   .. .  ..  . .. . . ..         .  . . .     . .......  . . ......  . .   ............ .     ... .. .  . ..   ....  . .. .   . .. .  .         
lowQualScore                  :            0   00 7  99  3 77 2 2 88         5  1 1 2     2 3333333  1 1 222222  2 1   555555555555 1     111 55 1  1 55   0000  1 44 1   2 77 3  2         
consensus                     :         ACCGACA--T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAAGA-TT-T-A-TAAAA-C---AG--GT-A-A--C--CTG-T-AGA---------C--A-GAGAT-C-A--T-AG-A--ACC---GAC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
Reference ( family-528 )      :         ACCGACA--T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAAGA-TT-T-A-TAAAA-C---AG--GT-A-A--C--CTG-T-AGA---------C--A-GAGAT-C-A--T-AG-A--ACC---GAC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129788                     :         ACCAACA--T-CC--GA-C--A-C-A--AGGGTAAGA-TT-T-A-TAGAA-C---AGTGAT-A-A--C--TTA-T-AGA---------CCAG-GAGAT-C-A--T-AG-A--ACC---AAC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129789                     :         ACCAACA--T-CC--GA-C--A-C-A--AGGGTAAGA-TT-T-A-TAGAA-C---AGTGAT-A-A--C--TTA-T-AGA---------CCAG-GAGAT-C-A--T-AG-A--ACC---AAC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129790                     :         ACCAACA--T-CC--GA-C--A-C-A--AGGGTAAGA-TT-T-A-TAGAA-C---AGTGAT-A-A--C--TTA-T-AGA---------CCAG-GAGAT-C-A--T-AG-A--ACC---AAC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129791                     :         ACCAACA--T-TT--GA-C--A-C-A--GAGGTAAGAGTT-T-A-TAAAA-C---AG--GT-A-A--C--CTG-T-AGA---------C--A-GAGAT-C-A--T-AG-A--ACC----AC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129792                     :         ACCAACA--T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAAGATTT-T-A-TAAAA-C---A---GT-A-A--C--CTT-A-AGAC--------C--A-GAGAT-C-G--T-AG-A--GCC---AAA-T--T-CCG-A--C-CC-AGAGAT
gi|129793                     :         ACCAACA--T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAAGATTT-T-A-TAAAA-C---A---GT-A-A--C--CTT-A-AGAC--------C--A-GAGAT-C-G--T-AG-A--GCC---AAA-T--T-CCG-A--C-CC-AGAGAT
gi|129794                     :         ACCAACA--T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAAGATTT-T-A-TAAAA-C---A---GT-A-A--C--CTT-A-AGAC--------C--A-GAGAT-C-G--T-AG-A--GCC---AAA-T--T-CCG-A--C-CC-AGAGAT
gi|129795                     :         ACCGACA--T-CC---A-C--A-C-A--GAGGTAAGA-TT-T-A-TAAAC-A---AG--GTCA-A--C--CTG-T-AGAGCCG-----C--A-GAGAT---A--T-AG-A--ACC---GCA-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAA
gi|129796                     :         ACCAACA--T-TT--GA-CC-A-C-A--GAG-TAAAA-TT-C-A-TAGAA-C---AG--GT-A-A--G--CTG-T-AGAGC-------C--A-GAGAT-T-A--T-AG-A--ACC---GAC-A----------------AGAGGTAAG
gi|129797                     :         ACCGACAGGT-CCT-GA-C--A-C-AT-GAGGTAAGA-TG-T-AATAAAAACG--AG--GT-A-A--C--CTG-T-AGA---------CC-A-GAGAT-C-A--T-AG-A--ACC---GAC-A--T-CCG-A--CAACGAGAGGTGAG
gi|129798                     :         ACCGACAGGT-CCT-GA-C--A-C-AT-GAGGTAAGA-TG-T-AATAAAAACG--AG--GT-A-A--C--CTG-T-AGA---------CC-A-GAGAT-C-A--T-AG-A--ACC---GAC-A--T-CCG-A--CAACGAGAGGTGAG
gi|129799                     :         ACCGACAGGT-CCT-GA-C--A-C-AT-GAGGTAAGA-TG-T-AATAAAAACG--AG--GT-A-A--C--CTG-T-AGA---------CC-A-GAGAT-C-A--T-AG-A--ACC---GAC-A--T-CCG-A--CAACGAGAGGTGAG
gi|129800                     :         ACCTACA--T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAAGG-------------------------A-A--C--CTG-T-AGACCACGAGACC--A-GAGAT-C-A--T-AG-A--GCC---AAC-A--T-CCG-A--C-AC-ACAGGTAAG
gi|129801                     :         ACCAACA--T-TT--GA-CC-A-C-A--GAG-TAAAA-TT-C-A-TAGAA-C---AG--GT-A-A--C--CTGTT-AGAC--------C--A-GAGAT-C-A--T-AG-A--ACC---GA-----------G--C-AC--GAGGTAAG
gi|129802                     :         ACCAACA--T-TT--GA-CC-A-C-A--GAG-TAAAA-TT-C-A-TAGAA-C---AG--GT-A-A-----CTGTT-AGAGC-------C--A-GAGAT-CTA--TAAG-A--ACC---G-----------------AC-AGAGGTAAG
gi|129803                     :         ACCAACA--T-CC--GAAC--C-C-C--GAGGT--GA-TT-T-A-TAGAA-C----G--GT-A-A--T--TAA-T-CGA---------C--A-GAGAT-C-AA-T-AG-A--ACC-------A--C-TCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129804                     :         ACCAACA--T-CC--GAAC--C-C-C--GAGGT--GA-TT-T-A-TAGAA-C----G--GT-A-A--T--TAA-T-CGA---------C--A-GAGAT-C-AA-T-AG-A--ACC-------A--C-TCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129805                     :         ACCAACA--T-CC--GAAC--C-C-C--GAGGT--GA-TT-T-A-TAGAA-C----G--GT-A-A--T--TAA-T-CGA---------C--A-GAGAT-C-AA-T-AG-A--ACC-------A--C-TCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129806                     :         ACCGACA--T-CC--GA-CT-A-C-A--GAGGTGAAA-TTGT-A-TAAAA-A---GG--GT-A-A--C---TA-T-AGA---------C--CCGAGAT-C-A--T-AG-A--A-C---AAC-A--TGTTG-A--C-AC-AGA-GTAAG
gi|129807                     :         ACCGACA--T-CC--GA-C--AACGA--GAGGTGAGA-AT-T-A-TAAAA-TCGAGG--GT-G-AGGC--CTG-T-AGAC--------C--A-GAGAT---A--T-AG-A--ACC---AAC-A--T-CCGAA--C-CC-CGAGGTGA
gi|129808                     :         ACCGACA--T-CC--GA-C--AACGA--GAGGTGAGA-AT-T-A-TAAAA-TCGAGG--GT-G-AGGC--CTG-T-AGAC--------C--A-GAGAT---A--T-AG-A--ACC---AAC-A--T-CCGAA--C-CC-CGAGGTGA
gi|129809                     :         ACCGACA--T-CC--GA-C--AACGA--GAGGTGAGA-AT-T-A-TAAAA-TCGAGG--GT-G-AGGC--CTG-T-AGAC--------C--A-GAGAT---A--T-AG-A--ACC---AAC-A--T-CCGAA--C-CC-CGAGGTGA
gi|129810                     :         ACCGA-A--T-CC--GA-CTCA-C-A--GAGGTAAGA-TT-T-A-TAAAA-----AGT-GT-A-A-----CTA-T-AGAC--------C--C-GAGAC-A-A--T-AG-A--A-C---AAC-ATGT-TAG-A--C-AC-AGA-GTAAG
gi|129811                     :         ACCAACA--T-CCCCGA-C--A-C-A--G--GTAG----T-T-A-TGACA-C---AG--GT-A-A--C---TA-T-AGA---------CC-A-GAGAT-C-ATGT-AG-A--ACC---AAC-A--T-TTG-AC-C-AC-AGA-GTAA
gi|129812                     :         ACCAACA--T-CCCCGA-C--A-C-A--G--GTAG----T-T-A-TGACA-C---AG--GT-A-A--C---TA-T-AGA---------CC-A-GAGAT-C-ATGT-AG-A--ACC---AAC-A--T-TTG-AC-C-AC-AGA-GTAA
gi|129813                     :         ACCAACA--T-CCCCGA-C--A-C-A--G--GTAG----T-T-A-TGACA-C---AG--GT-A-A--C---TA-T-AGA---------CC-A-GAGAT-C-ATGT-AG-A--ACC---AAC-A--T-TTG-AC-C-AC-AGA-GTAA
gi|129814                     :          CCAACA--T-CC--GA-C--A-C-A--CAGGTAAGA-TT-T-A-TAAAA-C---AG--G--A-A-----------AGACAT------C--A-GAGAC-T-A--T-AG-A--CCC---AAC-G--T-
gi|129815                     :          CCAACA--T-CC--GA-C----C-A--GAGAT--------C-A-TAGAA-C---CG---T-ACA--T--CCG-----A---------CC-A-GAGATTC-A--T-AG-A--ACC---GAC-A--T-CC--A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129816                     :           CAACA--TGTT--GA-C--A-C-A--GAG-TAAGA-TT-T-A-TAAAA-C---AG--GT-A-A--C--CTG-TGAGC---------C--A-GAGAT-C-A--T-AG-GATACC---TAC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129817                     :                      --GA-C--A-C-A--GAG-TAAGAGTT-T-A-TAAAA-C---AG--GT-A-A--CA-CTG-T-AGA---------C--A-GAGAT-C-A--T-AG-AT-ACCTTTGAC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129818                     : caacatgttaCGACAA-T-CC---A-C--A-C-ATCGAGGTAAGAGTT-TGA-TAAAA-----AG--GT-A-A--G--CTGGT-AGAGCCG-----C--A-GAGAT---A--T-AG-A--ACC---GAC-A--T-CCG-A--CTAC-AGAGGTGA
gi|129819                     :             ACA--TTCC--GA-C--A-C-AA-GAGGTAAGAATT-T-A-TAAAA-C---A----T-T-A--C---------------------------------------G-A--ACC---AAC-A--T-CCG-A--C-AC-AAGGGTAAG
gi|129820                     :            aACA--TTCC--GA-C--A-C-AA-GAGGTAAGAATT-T-A-TAAAA-C---A----T-T-A--C---------------------------------------G-A--ACC---AAC-A--T-CCG-A--C-AC-AAGGGTAAG
gi|129821                     :            aACA--TTCC--GA-C--A-C-AA-GAGGTAAGAATT-T-A-TAAAA-C---A----T-T-A--C---------------------------------------G-A--ACC---AAC-A--T-CCG-A--C-AC-AAGGGTAAG
gi|129822                     :              aA--T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAAAA-TT-T---TAAAA-C---AG--GT-A-A--C--CTA-T-AGA---------C--C-GAGAC-A-A--T-AG-A--ACC---AAC-A--T-TTG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129823                     :                     C--GAGC--A-C----GAGGTAAGA-TT-T-A-TAAAA-C---AG--GT-A-A--C--CTG-T-AGAC--------C--A-GAGAT-C-G--T-AG-A--GCC---AAC-A--T-CCG-A--C--C-AGAGAT
gi|129824                     :                         A-C--A-C-A--GAGGTAAGA-TT-T-A-TAAAC-A---AG--GTCA-A--CAGCTG-T-AGAG--------CCGA-GAGAT---A--T-AGAA--ACC---GA--A--T-CCG-ACTC-AC-AGAGGTAAG
gi|129825                     :                            --A-C-A--GAGGTAAGA-TT-T-A-TAAAA-C---AG--GT-ACG--C--CTG-T-AGA---------CCAG-GAGAT-C-G--TGAG-A--GCC---AACAA--T-CCG-A--T-CC-AGAGATCAG


blockSeqs                     :                GG G  CC  A TC A G TC         G  G G A     A CGAGG    C C GGCC    T G   CCACGAGACC   C     CT  TG A  A AT   TTTG  A TG G   A CT A  G
blockSeqs                     :                GG T  CC  A C  A G T          T  . . A     A CGAGG    C C GGCC    T .   GCCGC        .     TC  TG G  . T    A     . .  .   A C  A  G
blockSeqs                     :                GG T  CC  A C  A G T          T  . . A     A CGAGG    . . GGCC    G .   GCCGC        .     C   TG .  . .    A     . .  .   A C  A  G
blockSeqs                     :                A  T  T   G C  . . T          T  . . .     . AGTG     . . CAGC    . .   CATC         .     C   A  .  . .    A     . .  .   . C  T  .
blockSeqs                     :                .  .  T   . T  . . A          G  . . .     . AGTG     . . CAC     . .   GCCG         .     C   A  .  . .    A     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  T   . .  . . A          G  . . .     . GAG      . . CT      . .   CCA          .     C   A  .  . .    A     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  .   . .  . . A          A  . . .     . GAG      . . CT      . .   CCA          .     C   .  .  . .    G     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  .   . .  . . .          A  . . .     . GAG      . . CC      . .   GCC          .     C   .  .  . .    G     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  .   . .  . . .          A  . . .     . AGT      . . CC      . .   GCC          .     T   .  .  . .    G     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  .   . .  . . .          .  . . .     . AG       . . CC      . .   CCA          .     C   .  .  . .    G     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  .   . .  . . .          .  . . .     . AG       . . CC      . .   CC           .     C   .  .  . .    G     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  .   . .  . . .          .  . . .     . AG       . . CC      . .   CC           .     C   .  .  . .    A     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  .   . .  . . .          .  . . .     . AG       . . GC      . .   CC           .     C   .  .  . .    G     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  .   . .  . . .          .  . . .     . AG       . . CC      . .   CC           .     C   .  .  . .    G     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  .   . .  . . .          .  . . .     . GG       . . CC      . .   CC           .     C   .  .  . .    A     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  .   . .  . . .          .  . . .     . AG       . . CC      . .   CC           .     C   .  .  . .    A     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  .   . .  . . .          .  . . .     . AG       . . CC      . .   CC           .     C   .  .  . .    A     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  .   . .  . . .          .  . . .     . AG       . . CC      . .   CC           .     C   .  .  . .    A     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  .   . .  . . .          .  . . .     . AG       . . TT      . .   CC           .     A   .  .  . .    A     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  .   . .  . . .          .  . . .     . CG       . . TT      . .   CC           .     C   .  .  . .    A     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  .   . .  . . .          .  . . .     . AG       . . TT      . .   CC           .     C   .  .  . .    A     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  .   . .  . . .          .  . . .     . AG       . . TC      . .   CC           .     C   .  .  . .    A     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  .   . .  . . .          .  . . .     . AG       . . CC      . .   CC           .     T   .  .  . .    A     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  .   . .  . . .          .  . . .     . AG       . . GC      . .   CC           .     C   .  .  . .    G     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  .   . .  . . .          .  . . .     . AG       . . CC      . .   CC           .     C   .  .  . .    T     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  .   . .  . . .          .  . . .     . AG       . . CC      . .   CC           .     A   .  .  . .    G     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  .   . .  . . .          .  . . .     . AG       . . CC      . .   C            .     C   .  .  . .    A     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  .   . .  . . .          .  . . .     . A        . . C       . .   C            .     C   .  .  . .    A     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  .   . .  . . .          .  . . .     . A        . . C       . .   C            .     .   .  .  . .    A     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  .   . .  . . .          .  . . .     . A        . . C       . .   C            .     .   .  .  . .    A     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  .   . .  . . .          .  . . .     . G        . . C       . .   C            .     .   .  .  . .    A     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  .   . .  . . .          .  . . .     . G        . . C       . .   C            .     .   .  .  . .    G     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                .  .  .   . .  . . .          .  . . .     . G        . . C       . .   C            .     .   .  .  . .    A     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                      .   . .  . . .          .  . . .     . A        . . C       . .   C            .     .   .  .  . .    .     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                      .   . .  . . .          .  . . .     . A        . . C       . .   .            .     .   .  .  . .    .     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                          . .  . . .          .  . . .     . A        . . C       . .   .            .     .   .  .  . .    .     . .  .   . .  .  .
blockSeqs                     :                            .  . . .          .  . . .     . .        . . .       . .   .            .     .   .  .  . .    .     . .  .            


blockSeqCons                  :                                                             AG*****                    CC**********
originalCons                  :         ACCGACA--T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAAGA-TT-T-A-TAAAA-C---AG--GT-A-A--C--CTG-T-AGA---------C--A-GAGAT-C-A--T-AG-A--ACC---GAC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
finalCons                     :         ACCGACA--T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAAGA-TT-T-A-TAAAA-CAG-----GT-A-A--C--CTG-T-AGACC----------A-GAGAT-C-A--T-AG-A--ACC---GAC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG





Alignments
lowQualScore                  :            1   66 4  77  4 55 3 3 77        11 9  1 1 3     3 9999999  2 2 777777777    66 33 1 1 3    444 77 2  1 22   7777  1 11 1   3 44 4  3         
lowQualScore                  :            .   .. .  ..  . .. . . ..        .. .  . . .     . .......  . . .........    .. .. . . .    ... .. .  . ..   ....  . .. .   . .. .  .         
lowQualScore                  :            0   00 7  99  3 77 2 2 88        44 5  1 1 2     2 7777777  1 1 666666666    11 66 1 1 2    111 55 1  1 55   0000  1 44 1   2 77 3  2         
consensus                     :         ACCGACA--T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAAG--A-TT-T-A-TAAAA-C---AG--GT-A-A--C--CTG-TAGA--C--C-A-G-AGAT-C-A--T-AG-A--ACC---GAC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
Reference ( family-528 )      :         ACCGACA--T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAAG--A-TT-T-A-TAAAA-C---AG--GT-A-A--C--CTG-TAGA--C--C-A-G-AGAT-C-A--T-AG-A--ACC---GAC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129788                     :         ACCAACA--T-CC--GA-C--A-C-A--AGGGTAAG--A-TT-T-A-TAGAA-C---AGTGAT-A-A--C--TTA-TAGA--C--C-A-GGAGAT-C-A--T-AG-A--ACC---AAC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129789                     :         ACCAACA--T-CC--GA-C--A-C-A--AGGGTAAG--A-TT-T-A-TAGAA-C---AGTGAT-A-A--C--TTA-TAGA--C--C-A-GGAGAT-C-A--T-AG-A--ACC---AAC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129790                     :         ACCAACA--T-CC--GA-C--A-C-A--AGGGTAAG--A-TT-T-A-TAGAA-C---AGTGAT-A-A--C--TTA-TAGA--C--C-A-GGAGAT-C-A--T-AG-A--ACC---AAC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129791                     :         ACCAACA--T-TT--GA-C--A-C-A--GAGGTAAG--AGTT-T-A-TAAAA-C---AG--GT-A-A--C--CTG-TAGA-----C-A-G-AGAT-C-A--T-AG-A--ACC----AC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129792                     :         ACCAACA--T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAAG--ATTT-T-A-TAAAA-C---A---GT-A-A--C--CTT-AAGA--C--C-A-G-AGAT-C-G--T-AG-A--GCC---AAA-T--T-CCG-A--C-CC-AGAGAT
gi|129793                     :         ACCAACA--T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAAG--ATTT-T-A-TAAAA-C---A---GT-A-A--C--CTT-AAGA--C--C-A-G-AGAT-C-G--T-AG-A--GCC---AAA-T--T-CCG-A--C-CC-AGAGAT
gi|129794                     :         ACCAACA--T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAAG--ATTT-T-A-TAAAA-C---A---GT-A-A--C--CTT-AAGA--C--C-A-G-AGAT-C-G--T-AG-A--GCC---AAA-T--T-CCG-A--C-CC-AGAGAT
gi|129795                     :         ACCGACA--T-CC---A-C--A-C-A--GAGGTAAG--A-TT-T-A-TAAAC-A---AG--GTCA-A--C--CTG-TAGAGCCG-C-A-G-AGAT---A--T-AG-A--ACC---GCA-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAA
gi|129796                     :         ACCAACA--T-TT--GA-CC-A-C-A--GAG-TAAA--A-TT-C-A-TAGAA-C---AG--GT-A-A--G--CTG-TAGAG-C--C-A-G-AGAT-T-A--T-AG-A--ACC---GAC-A----------------AGAGGTAAG
gi|129797                     :         ACCGACAGGT-CCT-GA-C--A-C-AT-GAGGTAAG--A-TG-T-AATAAAAACG--AG--GT-A-A--C--CTG-TAGA--C--C-A-G-AGAT-C-A--T-AG-A--ACC---GAC-A--T-CCG-A--CAACGAGAGGTGAG
gi|129798                     :         ACCGACAGGT-CCT-GA-C--A-C-AT-GAGGTAAG--A-TG-T-AATAAAAACG--AG--GT-A-A--C--CTG-TAGA--C--C-A-G-AGAT-C-A--T-AG-A--ACC---GAC-A--T-CCG-A--CAACGAGAGGTGAG
gi|129799                     :         ACCGACAGGT-CCT-GA-C--A-C-AT-GAGGTAAG--A-TG-T-AATAAAAACG--AG--GT-A-A--C--CTG-TAGA--C--C-A-G-AGAT-C-A--T-AG-A--ACC---GAC-A--T-CCG-A--CAACGAGAGGTGAG
gi|129800                     :         ACCTACA--T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAAGGAA-CC-T-G-TAGAC-C---AC--G---------------AGA--C--C-A-G-AGAT-C-A--T-AG-A--GCC---AAC-A--T-CCG-A--C-AC-ACAGGTAAG
gi|129801                     :         ACCAACA--T-TT--GA-CC-A-C-A--GAG-TAAA--A-TT-C-A-TAGAA-C---AG--GT-A-A--C--CTGTTAGA--C--C-A-G-AGAT-C-A--T-AG-A--ACC---GA-----------G--C-AC--GAGGTAAG
gi|129802                     :         ACCAACA--T-TT--GA-CC-A-C-A--GAG-TAAA--A-TT-C-A-TAGAA-C---AG--GT-A-A-----CTGTTAGAG-C--C-A-G-AGAT-CTA--TAAG-A--ACC---G-----------------AC-AGAGGTAAG
gi|129803                     :         ACCAACA--T-CC--GAAC--C-C-C--GAGGT--G--A-TT-T-A-TAGAA-C----G--GT-A-A--T--TAA-TCGA--C----A-G-AGAT-C-AA-T-AG-A--ACC-------A--C-TCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129804                     :         ACCAACA--T-CC--GAAC--C-C-C--GAGGT--G--A-TT-T-A-TAGAA-C----G--GT-A-A--T--TAA-TCGA--C----A-G-AGAT-C-AA-T-AG-A--ACC-------A--C-TCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129805                     :         ACCAACA--T-CC--GAAC--C-C-C--GAGGT--G--A-TT-T-A-TAGAA-C----G--GT-A-A--T--TAA-TCGA--C----A-G-AGAT-C-AA-T-AG-A--ACC-------A--C-TCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129806                     :         ACCGACA--T-CC--GA-CT-A-C-A--GAGGTGAA--A-TTGT-A-TAAAA-A---GG--GT-A-A--C---TA-TAGA--C--C-C-G-AGAT-C-A--T-AG-A--A-C---AAC-A--TGTTG-A--C-AC-AGA-GTAAG
gi|129807                     :         ACCGACA--T-CC--GA-C--AACGA--GAGGTGAG--A-AT-T-A-TAAAA-TCGAGG--GT-G-AGGC--CTG-TAGA--C--C-A-G-AGAT---A--T-AG-A--ACC---AAC-A--T-CCGAA--C-CC-CGAGGTGA
gi|129808                     :         ACCGACA--T-CC--GA-C--AACGA--GAGGTGAG--A-AT-T-A-TAAAA-TCGAGG--GT-G-AGGC--CTG-TAGA--C--C-A-G-AGAT---A--T-AG-A--ACC---AAC-A--T-CCGAA--C-CC-CGAGGTGA
gi|129809                     :         ACCGACA--T-CC--GA-C--AACGA--GAGGTGAG--A-AT-T-A-TAAAA-TCGAGG--GT-G-AGGC--CTG-TAGA--C--C-A-G-AGAT---A--T-AG-A--ACC---AAC-A--T-CCGAA--C-CC-CGAGGTGA
gi|129810                     :         ACCGA-A--T-CC--GA-CTCA-C-A--GAGGTAAG--A-TT-T-A-TAAAA-----AGT-GT-A-A-----CTA-TAGA--C--C-C-G-AGAC-A-A--T-AG-A--A-C---AAC-ATGT-TAG-A--C-AC-AGA-GTAAG
gi|129811                     :         ACCAACA--T-CCCCGA-C--A-C-A--G--GTAG------T-T-A-TGACA-C---AG--GT-A-A--C---TA-TAGA--C--C-A-G-AGAT-C-ATGT-AG-A--ACC---AAC-A--T-TTG-AC-C-AC-AGA-GTAA
gi|129812                     :         ACCAACA--T-CCCCGA-C--A-C-A--G--GTAG------T-T-A-TGACA-C---AG--GT-A-A--C---TA-TAGA--C--C-A-G-AGAT-C-ATGT-AG-A--ACC---AAC-A--T-TTG-AC-C-AC-AGA-GTAA
gi|129813                     :         ACCAACA--T-CCCCGA-C--A-C-A--G--GTAG------T-T-A-TGACA-C---AG--GT-A-A--C---TA-TAGA--C--C-A-G-AGAT-C-ATGT-AG-A--ACC---AAC-A--T-TTG-AC-C-AC-AGA-GTAA
gi|129814                     :          CCAACA--T-CC--GA-C--A-C-A--CAGGTAAG--A-TT-T-A-TAAAA-C---AG--G--A-A----------AGA--CATC-A-G-AGAC-T-A--T-AG-A--CCC---AAC-G--T-
gi|129815                     :          CCAACA--T-CC--GA-C----C-A--GAGAT----------C-A-TAGAA-C---CG---T-ACA--T--CCG----A--C--C-A-G-AGATTC-A--T-AG-A--ACC---GAC-A--T-CC--A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129816                     :           CAACA--TGTT--GA-C--A-C-A--GAG-TAAG--A-TT-T-A-TAAAA-C---AG--GT-A-A--C--CTG-TGAG--C--C-A-G-AGAT-C-A--T-AG-GATACC---TAC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129817                     :                      --GA-C--A-C-A--GAG-TAAG--AGTT-T-A-TAAAA-C---AG--GT-A-A--CA-CTG-TAGA-----C-A-G-AGAT-C-A--T-AG-AT-ACCTTTGAC-A--T-CCG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129818                     : caacatgttaCGACAA-T-CC---A-C--A-C-ATCGAGGTAAG--AGTT-TGA-TAAAA-----AG--GT-A-A--G--CTGGTAGAGCCG-C-A-G-AGAT---A--T-AG-A--ACC---GAC-A--T-CCG-A--CTAC-AGAGGTGA
gi|129819                     :             ACA--TTCC--GA-C--A-C-AA-GAGGTAAG--AATT-T-A-TAAAA-C---A----T-T-A--C----------------------------------G-A--ACC---AAC-A--T-CCG-A--C-AC-AAGGGTAAG
gi|129820                     :            aACA--TTCC--GA-C--A-C-AA-GAGGTAAG--AATT-T-A-TAAAA-C---A----T-T-A--C----------------------------------G-A--ACC---AAC-A--T-CCG-A--C-AC-AAGGGTAAG
gi|129821                     :            aACA--TTCC--GA-C--A-C-AA-GAGGTAAG--AATT-T-A-TAAAA-C---A----T-T-A--C----------------------------------G-A--ACC---AAC-A--T-CCG-A--C-AC-AAGGGTAAG
gi|129822                     :              aA--T-CC--GA-C--A-C-A--GAGGTAAA--A-TT-T---TAAAA-C---AG--GT-A-A--C--CTA-TAGA--C--C---G-AGAC-A-A--T-AG-A--ACC---AAC-A--T-TTG-A--C-AC-AGAGGTAAG
gi|129823                     :                     C--GAGC--A-C----GAGGTAAG--A-TT-T-A-TAAAA-C---AG--GT-A-A--C--CTG-TAGA--C--C-A-G-AGAT-C-G--T-AG-A--GCC---AAC-A--T-CCG-A--C--C-AGAGAT
gi|129824                     :                         A-C--A-C-A--GAGGTAAG--A-TT-T-A-TAAAC-A---AG--GTCA-A--CAGCTG-TAGAG-C--CGA-G-AGAT---A--T-AGAA--ACC---GA--A--T-CCG-ACTC-AC-AGAGGTAAG
gi|129825                     :                            --A-C-A--GAGGTAAG--A-TT-T-A-TAAAA-C---AG--GT-ACG--C--CTG-TAGA--C--C-AGG-AGAT-C-G--TGAG-A--GCC---AACAA--T-CCG-A--T-CC-AGAGATCAG