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Reference ( gi|106891 )       :    CTA-T-G-ACG-T-----CGTTTAA-AG-TCT-AT--T----G--C--A-T-TA-CG-TT---GC--G---TTAC-GA-----A-CG-T-C-ATA------G--T-TA-GC--A---A--T--G-CA--T-CAG-A--T-T-CC---C--TC-A-AT-A--T--T-GC----CGGT--C------AA-T-AG--A---T-C-G--CC-G------G-TC-CAA--AAT-T---C--AA---AAAC-T--A-T---T------G-A--C-C-G-G-C-GG------TC-C--AAT----A-G---------ACA-C-A-C--AA-AAT-AGC-TAGA-A--A-TATT--T-AA-TA--TCTA---A-TAAAA--CA-ACAAAAACCCT--T----C--A---A---TTA-GG-T-AA-TAAAA
gi|106874                     :    CTA-T-G-ACG-T-----CATTTGA-AG-TAT-AT--T----G--C--A-T-TA-TG-TT---GC--G---TTAC-GA-----A-CA-T-C-ATA------G--T-TA-GC--A---A--T--G-CA--T-CAG-A--T-T-CC---C--TC-A-AT-A--T--T-AC----CGGT--C------AA-T-AG--A---T-C-G--CC-G------G-TC-CAA--AAT-T---C--AA---AAAC-T--A-T---T------G-A--C-C-G-G-C-GG------TC-C--AAT----A-G---------ACA-C-A-C--AA-AAT-AGC-TAGA-A--A-TATT--T-AA-TA--TCTA---A-TAAAA--CA-ATAAAAACCCT--T----C--A---A---TAA-GG-C-AA-TAAAA
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gi|106880                     :  taCTACT-G-ACG-T-----CATTTGA-AG-CTA-AT--T----AGCC--A-TGTAACG-TT---GC--G---T-ACTGG-----A-CT-C-CTATA------GG-T-TA-GC--A---AAAT--G-CAA-T-CAG-A--T-T-CC---C--TC-A-ATGA--TG-T-GCGA--TGGT--C------AAGT-AG--A---T-C-G--CC-G------G-TC-C-A--AAT-T---A--AA---AAAC-T--ACT---T------G-AC-C-C-G-G-C-AG------TC-C--AAT----A-G---------TCA-C-
gi|106884                     :  tgCTA-T-G-ACG-T-----C-------AG-TCT-AT--T----G--C--A-T-TA-CA-TT---AC--G---TTAC-GT-----A-CG-T-C-ATA------G--T-TA-GC--A---A--T--G-CA--T-CA
gi|106887                     :   aCTT-T-G-ACG-T-----C----AG-AG-TCT-AT--T----G--C--A-T-AA-CG-TT---AC--G---TTAC-GT-----A-CG-T-C-ACA------G--T-TA-GC--A---A--T--G-CA--T-CA--A--T-T-
gi|106881                     :   aCTA-T-G-ACG-T-----CATTTGA-TG-TAT-AT--T----G--C--A-T-TA-CG-TTC--GC--G---TTAC-GA-----A-CG-T-CAATA------G--T-TA-GC--AT--A--T--A-CA--
gi|106885                     :  taCTA-T-G-ACA-T-----CA---GA-GG-TCT-AT--T----G--C--A-T-TA-CG-TT---AC--G---T-AT-GT-----A-CG-T-C-ATA------G--T-TA-GC--A---A--T--G-CA--T-CAA-ACTT-T-TT---C--TC-
gi|106886                     :   aCTA-T-G-ACA-T-----C----AG-AG-TCT-AT--T----G--C--A-T-TA-CG-TT---AC--G---TATT-GT-----G-CG-T-C-ATA------G--T-TA-GCAAA---A--T--G-CA--T-CA
gi|106889                     :   aCTA-T-G-ACG-T-----CG------AG-TCT-AT--T----G--C--C-T-TA---------AC--GC--TTAC-GT-----A-CG-T-C-ACA------G--T-TA-GC--A---AT-T--G-CA--T-CA--------------------A-CT-G--T--T-TT----TGGT--C------AA-T-AA--A---
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gi|106877                     :      A-T-G-ACA-T-----CATTTGAGAG-TCT-AT--T----G--C--A-T-TA-------------------AC-GA-----AGCG-T-C-ATA------GGTT-TAAGC--A---A--T--G-CA--TGCAG-A--T-T-CC---C--TC-A--T-A--T--TTGCGTGGCGG----------AA-T-AG--A---T-C-GT-CC-G------G-TC-AGA--AATGT---C--AA---AA-C-T--A-T---T------G-A--C-C-G-GCC-GG------TC-C--AAT----A-G---------ACA-C-A-A--AA-AAT-AGC-TAG--A--A-TATT--T-AA-TA--TCTA---A-TAAAA--CA-ACAAAAACTCC--T----T--A---A---TTAGGG-TAAA-TGAAA
gi|106899                     : tactgA-T-G-ACG-A-----CATT-GA-AG-TC--AT--T----G--C--A-T-TA-CG-TT---A-------TTAT--A-----A-CG-T-T--CA------G--T-TAAGC--A---A--T--G-CA--T-CAG-A--T-TATC---C--TC-A-AT-A--T--T-GC----CGGA--T------AA-T-AG--A---T-C-G--CC-G------G-TC-CAA--AA--T---C--AA---AAAC-T--A-T---T------G-AC-C-C-G-G-C-GG------TC-C--AAT----A-G---------AC--C-A-C--AA-AA--AGC-TTAA-A--A-TAT---------------------TAAAA--C--AC-AAAACCCT----------A---A---TTA-GG-T-AA-TAAA
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gi|106902                     :                             -AG-GCT-AC--T----G--T--A-T-TA-C---------------TTAC-TA-----G-TG-TAC-GTA-----------TA-----A---A--T--G-CGGTT-CAA-A--G-T-CC---C--TC-A--T-A-------GCTT--CGGTTCC------AA-T-AG--A---AAC-G--CT----------TT-CAA--GAT-T---T--GG--------T--A-TGCCTCA----G-A--C-T-G-A-T-GA------TT-C--A-------------------CA-T-A-A--AA-AAT-AAC-T-GA-A--A-CACT--A-AA-TA--TTTA---A-TAAAA--CT-ACAAAATCCCT----------A---G---TTA-AG-T-AA-
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Reference ( family-525 )      :      CTA-T-G-ACG-T-C-AT---T--T-GA-A--GTCT-AT--T----G--C--A-T-TA-CG-TT---GC--G---TTAC-GA-----A-CG-T-C-ATA------G--T-TA-GC---A-A--T--G-CA--T-CAG-A--T-T-CC---C--TC-A-AT-A--T--TGC----CGGT--C------AA-T-AG--A---T-C-G--CC-G------G-TC-CAA--AAT-T---C--AA---AAAC-T--A-T---T------G-A--C-C-G-G-C-GG------TC-C--AAT----A-G---------ACA-C-A-C--AA-AAT-AGC-TAGA-A--A-TATTT-A--A-TA--TCTA---A-TAAAA--CA-ACAAAAACCCT--T----C--A---A---TTA-GG-T-AA-TAAAA
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Reference ( family-525 )      :      CTA-T-G-ACG-T-C-AT---T--T-GA-A--GTCT-AT--T----G--C--A-T-TA-CG-TT---GC--G---TTAC-GA-----A-CG-T-C-ATA------G--T-TA-GC---A-A--T--G-CA--T-CAG-A--T-T-CC---C--TC-A-AT-A--T--TGC----CGGT--C------AA-T-AG--A---T-C-G--CC-G------G-TC-CAA--AAT-T---C--AA---AAAC-T--A-T---T------G-A--C-C-G-G-C-GG------TC-C--AAT----A-G---------ACA-C-A-C--AA-AAT-AGC-TAGA-A--A-TATTT-A--A-TA--TCTA---A-TAAAA--CA-ACAAAAACCCT--T----C--A---A---TTA-GG-T-AA-TAAAA
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gi|106899                     :        A-T-G-ACG-A-C-AT---T----GA-A--GTC--AT--T----G--C--A-T-TA-CG-TT---A-------TTAT--A-----A-CG-T-T--CA------G--T-TAAGC---A-A--T--G-CA--T-CAG-A--T-TATC---C--TC-A-AT-A--T--TGC----CGGA--T------AA-T-AG--A---T-C-G--CC-G------G-TC-CAA--AA--T---C--AA---AAAC-T--A-T---T------G-AC-C-C-G-G-C-GG------TC-C--AAT----A-G---------AC--C-A-C--AA-AA--AGC-TTAA-A--A-TAT---------------------TAAAA--C--AC-AAAACCCT----------A---A---TTA-GG-T-AA-TAAA
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gi|106903                     :                                         T-GT--T----G--C--ACT-TA-CGGTT---GC--GATTTTAC--A-----A-CG-T-C-ATA------G--T-TA-GC---A-A--T--GGCA--T-CAG-A--T-T-CC---G---C-A-AT-A--T--TGC----CGGTT-C------AA-T-AG--A---T-CTG--CC-G------G-TC-CAA--AAT-T---C--AA---AAA-------T---T------T-A--C-C-G-G-T-G-------TC-C--AAT----A-G----------CA-A-G-C--AA-ATT-AGC-TAGA-A--A-TATTT-A----TA--TCTA---A-TAAAA--CA--CAAA--CCCT--T----C--A---A---TTA-GG-T-AATTAAAA
gi|106904                     :                                          -AT--T----G-------T-TG-CG-TT---AC--G---TTAC-GT-----A-CG-T-C-ATA------G--T-TA-GC---A-G--T--G-CA--T-CA
gi|106905                     :                                                     --C--A-T-TA-CG-TT---GC--G---TTAC-GA-----A-CA-T-C-ATA------G--T-TA-GT---A-A--T--G-CA--T-CAG-A--T-T-CC---C--TC-C-AT-A--T--TGC----TGGT--C------AA-T-AG--A---T-C-G--CC-G------G-TC-CAG--AAT-T---C--AA---AAAC-T--A-T---T------G-A--C-C-G-G-C-GG------TC-C--AAT----A-G---------ACA-C-A-C--AA-AAT-AGC-TAGA-A--A-TATTT-A--A-TA--TCTA---A-TAAAA--CT-GCAAAAACCCT--T----C--G---A---TTA-GG-T-AA-TAA
gi|106906                     :                                                        --A-T-TAACG-TT---GT--G---TTAC-GA-----A-CG-T-C-ATA------G--T-TA-GC---A-T--T--G-CA--T-CAG-A--T-T-CCT--C--TC-A-AT-A--T--TGC----CAGT--CA-----AA-T-AG--A---TCC-G--CC-G------G-TC-C-A--AAT-T---CAAAA---AAAC-T--A-T---T------G-A--C-C-G-G-C-GGT-----TC-C--AAT----A-G---------ACA-C-A-C--AA-AAT-AGC-TAGA-ATGT-TATTT-A--A-TA--TCTA---A-TAATA--CA-ACAAAAA-CCT--T----C--A---A---TTA-GG-T-AA-TAA
gi|106907                     :                                                                                                                                     -CA--T-CAG-A--T-T-CC---C--TC-A-AT-A--T--TTC----CGGT--C------AA-T-AG--A---T-C-G--CC-G------G-T
gi|106908                     :                                                                                                                                                                   -AT-A--T---GC----CAGT--C------AA-T-AG------T-C-G--TC-G------G-TC---A--AAT-T---C--AA------C-TT-A-T---T------G-A--C-CTG-G-C-G-------TC-C--AAT----A-G---------ACA-C-ATC--AA-AAT-AGT---------A-TA-TT-A--A-TA--TC-A---A-T-AAA--CA-ACAAAACCTCTA-TTTGGT--A---A---TTA-GG-T-AA-TAAA
gi|106909                     :                                                                                                                                                                              GC----CGGT--C------AA-C-TA--A---G-C-AACCC-G------G-TC-CAA--AAT-----C--AA---AAAC-T--A-T---T------G-A--C-C-G-G-C-GG------TC-C--CAC----T-A---------AGA-T-C-C--AA-AAT-AGC-TAGA-A--A-TATTT-A--A-TC--TCTA---A-TAAAA--CA-ACAAAAACCCT--T----C--A---A---TTA-GGTT-AA-TA
gi|106910                     :                                                                                                                                                                                                                                                             -T--A-T---T------G-A--C-C-G-G-C-GG------TC-C--AATC---ACG---------ACA---A-C--AACAAT-AGC-TA-A-A--A-T-TTT-A--ATTAT-TCTA---A-TAAAA--CA-ACAA-----------------A---A---TTAGGG-T-AA-TA
gi|106911                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -AAT-AGC-TAGA-C--A-TATTT-A--A-TA--TATA---A-TAAAA--CA-ACAAAAACCCT--T----C--A---A---TTA-GG-T-AA-TAA


blockSeqs                     :         C T G   A A C TACCTT     G AG    T  GT AATT GC CA A G  A  G  TTG  CA ATT    T  TAAAG G  C A T   CATGTA GT G  A  ATT T AA AA G  CT G   C CT A A  ACG CC  G T  ATT  GA   GTGG    TC CCGCAA  G G  CC GTT A T AC  T CTGCCT T  G   CA   G GTG AA  TAC    A GA C GCC CTCAAA C AT G T C C A  GTTATT  A CA   GCTG C ACAGAATGCA  G T T CA  C   G   C    G TG T     A GT T  CT    CCT T     AC AG           ATTTGGT    GGT ACT   G  T A  G
blockSeqs                     :         . . .   . T . TGAGT      . C     .  GT T    .  CA C .  A  G  T    .  A      C  TAAAG .  . . A   .      G  .  A  AA  C A  AA .  GT .   . .  . .  T   .   . G  GA   G    GA      T  A       . .  .  T   C . T   . .      .  .   .    . .   AA  .      . GA . .   CA     . C  . . . . A  C       . CA   C    . A           . . C .   C   G   .    . .  T     . .  .  T     CCT .     .  AC           TCGG       .   .     C  . A  G
blockSeqs                     :         . . .   . . . TTTT       . .     .  GT .    .  CA . .  A  .  C    .  A      .  TAAAG .  . . .   .      .  .  T  C   . T  AA .  A  .   . .  . .  .   .   . .  A    .    TT      .  .       . .  .  .   . . .   . .      .  .   .    . .   A   .      . GA . .   C      . C  . . . . A  T       . .    .    . A           . . T .   C   G   .    . .  T     . .  .  .     CCT .     .  A            TCGG       .   .     G  . .  G
blockSeqs                     :         . . .   . . . TTT        . .     .  .  .    .  CC . .  A  .  .    .  A      .  G     .  . . .   .      .  .  A  .   . T  GG .  .  .   . .  . .  .   .   . .  A    .    .       .  .       . .  .  .   . . .   . .      .  .   .    . .   .   .      . T  . .   .      . .  . . . . .  .       . .    .    . A           . . . .   .   .   .    . .  .     . .  .  .     .   .     .  A            TCGG       .   .     .  . .  T
blockSeqs                     :         . . .   . . . TTT        . .     .  .  .    .  G  . .  A  .  .    .  .      .  .     .  . . .   .      .  .  .  .   . .  A  .  .  .   . .  . .  .   .   . .  A    .    .       .  .       . .  .  .   . . .   . .      .  .   .    . .   .   .      . .  . .   .      . .  . . . . .  .       . .    .    . T           . . . .   .   .   .    . .  .     . .  .  .     .   .     .  A            AATT       .   .     .  . .  .
blockSeqs                     :         . . .   . . . TTT        . .     .  .  .    .  .  . .  .  .  .    .  .      .  .     .  . . .   .      .  .  .  .   . .  .  .  .  .   . .  . .  .   .   . .  A    .    .       .  .       . .  .  .   . . .   . .      .  .   .    . .   .   .      . .  . .   .      . .  . . . . .  .       . .    .    . A           . . . .   .   .   .    . .  .     . .  .  .     .   .     .  A            CGC        .   .     .  . .  .
blockSeqs                     :         . . .   . . . TTT        . .     .  .  .    .  .  . .  .  .  .    .  .      .  .     .  . . .   .      .  .  .  .   . .  .  .  .  .   . .  . .  .   .   . .  A    .    .       .  .       . .  .  .   . . .   . .      .  .   .    . .   .   .      . .  . .   .      . .  . . . . .  .       . .    .    . A           . . . .   .   .   .    . .  .     . .  .  .     .   .     .  A            TC         .   .     .  . .  .
blockSeqs                     :         . . .   . . . TTT        . .     .  .  .    .  .  . .  .  .  .    .  .      .  .     .  . . .   .      .  .  .  .   . .  .  .  .  .   . .  . .  .   .   . .  G    .    .       .  .       . .  .  .   . . .   . .      .  .   .    . .   .   .      . .  . .   .      . .  . . . . .  .       . .    .    . C           . . . .   .   .   .    . .  .     . .  .  .     .   .     .  A            TC         .   .     .  . .  .
blockSeqs                     :         . . .   . . . TTT        . .     .  .  .    .  .  . .  .  .  .    .  .      .  .     .  . . .   .      .  .  .  .   . .  .  .  .  .   . .  . .  .   .   . .  G    .    .       .  .       . .  .  .   . . .   . .      .  .   .    . .   .   .      . .  . .   .      . .  . . . . .  .       . .    .    . C           . . . .   .   .   .    . .  .     . .  .  .     .   .     .  T            TT         .   .     .  . .  .
blockSeqs                     :         . . .   . . . TTT        . .     .  .  .    .  .  . .  .  .  .    .  .      .  .     .  . . .   .      .  .  .  .   . .  .  .  .  .   . .  . .  .   .   . .  A    .    .       .  .       . .  .  .   . . .   . .      .  .   .    . .   .   .      . .  . .   .      . .  . . . . .  .       . .    .    . C           . . . .   .   .   .    . .  .     . .  .  .     .   .     .  T            TC         .   .     .  . .  .
blockSeqs                     :         . . .   . . . TTT        . .     .  .  .    .  .  . .  .  .  .    .  .      .  .     .  . . .   .      .  .  .  .   . .  .  .  .  .   . .  . .  .   .   . .  A    .    .       .  .       . .  .  .   . . .   . .      .  .   .    . .   .   .      . .  . .   .      . .  . . . . .  .       . .    .    . T           . . . .   .   .   .    . .  .     . .  .  .     .   .     .  T            TC         .   .     .  . .  .
blockSeqs                     :         . . .   . . . TTT        . .     .  .  .    .  .  . .  .  .  .    .  .      .  .     .  . . .   .      .  .  .  .   . .  .  .  .  .   . .  . .  .   .   . .  A    .    .       .  .       . .  .  .   . . .   . .      .  .   .    . .   .   .      . .  . .   .      . .  . . . . .  .       . .    .    . T           . . . .   .   .   .    . .  .     . .  .  .     .   .     .  A            TC         .   .     .  . .  .
blockSeqs                     :         . . .   . . . TTT        . .     .  .  .    .  .  . .  .  .  .    .  .      .  .     .  . . .   .      .  .  .  .   . .  .  .  .  .   . .  . .  .   .   . .  A    .    .       .  .       . .  .  .   . . .   . .      .  .   .    . .   .   .      . .  . .   .      . .  . . . . .  .       . .    .    . A           . . . .   .   .   .    . .  .     . .  .  .     .   .     .  A            TC         .   .     .  . .  .
blockSeqs                     :         . . .   . . . TTT        . .     .  .  .    .  .  . .  .  .  .    .  .      .  .     .  . . .   .      .  .  .  .   . .  .  .  .  .   . .  . .  .   .   . .  A    .    .       .  .       . .  .  .   . . .   . .      .  .   .    . .   .   .      . .  . .   .      . .  . . . . .  .       . .    .    . A           . . . .   .   .   .    . .  .     . .  .  .     .   .     .  A            TC         .   .     .  . .  .
blockSeqs                     :         . . .   . . . TTT        . .     .  .  .    .  .  . .  .  .  .    .  .      .  .     .  . . .   .      .  .  .  .   . .  .  .  .  .   . .  . .  .   .   . .  A    .    .       .  .       . .  .  .   . . .   . .      .  .   .    . .   .   .      . .  . .   .      . .  . . . . .  .       . .    .    . A           . . . .   .   .   .    . .  .     . .  .  .     .   .     .  T            AC         .   .     .  . .  .
blockSeqs                     :         . . .   . . . TTT        . .     .  .  .    .  .  . .  .  .  .    .  .      .  .     .  . . .   .      .  .  .  .   . .  .  .  .  .   . .  . .  .   .   . .  A    .    .       .  .       . .  .  .   . . .   . .      .  .   .    . .   .   .      . .  . .   .      . .  . . . . .  .       . .    .    . A           . . . .   .   .   .    . .  .     . .  .  .     .   .     .  A            TC         .   .     .  . .  .
blockSeqs                     :         . . .   . . . TTT        . .     .  .  .    .  .  . .  .  .  .    .  .      .  .     .  . . .   .      .  .  .  .   . .  .  .  .  .   . .  . .  .   .   . .  A    .    .       .  .       . .  .  .   . . .   . .      .  .   .    . .   .   .      . .  . .   .      . .  . . . . .  .       . .    .    . A           . . . .   .   .   .    . .  .     . .  .  .     .   .     .  T            TC         .   .     .  . .  .
blockSeqs                     :         . . .   . . . TTT        . .     .  .  .    .  .  . .  .  .  .    .  .      .  .     .  . . .   .      .  .  .  .   . .  .  .  .  .   . .  . .  .   .   . .  A    .    .       .  .       . .  .  .   . . .   . .      .  .   .    . .   .   .      . .  . .   .      . .  . . . . .  .       . .    .    . A           . . . .   .   .   .    . .  .     . .  .  .     .   .     .  A            TC         .   .     .  . .  .
blockSeqs                     :         . . .   . . . TTT        . .     .  .  .    .  .  . .  .  .  .    .  .      .  .     .  . . .   .      .  .  .  .   . .  .  .  .  .   . .  . .  .   .   . .  A    .    .       .  .       . .  .  .   . . .   . .      .  .   .    . .   .   .      . .  . .   .      . .  . . . . .  .       . .    .    . A           . . . .   .   .   .    . .  .     . .  .  .     .   .     .  A            TC         .   .     .  . .  .
blockSeqs                     :         . . .   . . . TT         . .     .  .  .    .  .  . .  .  .  .    .  .      .  .     .  . . .   .      .  .  .  .   . .  .  .  .  .   . .  . .  .   .   . .  A    .    .       .  .       . .  .  .   . . .   . .      .  .   .    . .   .   .      . .  . .   .      . .  . . . . .  .       . .    .    . A           . . . .   .   .   .    . .  .     . .  .  .     .   .     .  A            TC         .   .     .  . .  .
blockSeqs                     :         . . .   . . . TT         . .     .  .  .    .  .  . .  .  .  .    .  .      .  .     .  . . .   .      .  .  .  .   . .  .  .  .  .   . .  . .  .   .   . .  A    .    .       .  .       . .  .  .   . . .   . .      .  .   .    . .   .   .      . .  . .   .      . .  . . . . .  .       . .    .    . A           . . . .   .   .   .    . .  .     . .  .  .     .   .     .  A            TC         .   .     .  . .  .
blockSeqs                     :         . . .   . . . .          . .     .  .  .    .  .  . .  .  .  .    .  .      .  .     .  . . .   .      .  .  .  .   . .  .  .  .  .   . .  . .  .   .   . .  A    .    .       .  .       . .  .  .   . . .   . .      .  .   .    . .   .   .      . .  . .   .      . .  . . . . .  .       . .    .    . .           . . . .   .   .   .    . .  .     . .  .  .     .   .     .  A            .          .   .     .  . .  .
blockSeqs                     :         . . .   . . . .          . .     .  .  .    .  .  . .  .  .  .    .  .      .  .     .  . . .   .      .  .  .  .   . .  .  .  .  .   . .  . .  .   .   . .  .    .    .       .  .       . .  .  .   . . .   . .      .  .   .    . .   .   .      . .  . .   .      . .  . . . . .  .       . .    .    . .           . . . .   .   .   .    . .  .     . .  .  .     .   .     .  .            .          .   .     .  . .  .
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blockSeqs                     :         . . .   . . . .          . .     .  .  .    .  .  . .  .  .  .    .  .      .  .     .  . . .   .      .  .  .  .   . .  .  .  .  .   . .  . .  .   .   . .  .    .    .       .  .       . .  .  .                                                                                                                                                                                                                             
blockSeqs                     :         . . .   . . . .          . .     .  .  .    .  .  . .  .  .  .    .  .      .  .     .  . . .   .      .  .  .  .   . .  .  .  .  .   . .  . .  .   .   . .  .    .    .       .  .       . .  .  .                                                                                                                                                                                                                             
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blockSeqs                     :                                          .  .  .    .  .  . .  .  .  .    .  .      .  .     .  . . .   .      .  .  .  .   . .  .  .  .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                             
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finalCons                     :      CTA-T-G-ACG-T-C-AT---T--T-GA-A--GTCT-AT--T----G--C--A-T-TA-CG-TT---GC--G---TTAC-GA-----A-CG-T-C-ATA------G--T-TA-GC---A-A--T--G-CA--T-CAG-A--T-T-CC---C--TC-A-AT-A--T--TGC----CGGT--C------AA-T-AG--A---T-C-G--CC-G------G-TC-CAA--AAT-T---C--AA---AAAC-T--A-T---T------G-A--C-C-G-G-C-GG------TC-C--AAT----A-G---------ACA-C-A-C--AA-AAT-AGC-TAGA-A--A-TATTT-A--A-TA--TCTA---A-TAAAA--CA-ACAAAAACCCT--T----C--A---A---TTA-GG-T-AA-TAAAA





Alignments
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Reference ( family-525 )      :      CTA-T-G-ACG-T-C-AT---T--T-GA-A--GTCT-AT--T----G--C--A-T-TA-CG-TT---GC--G---TTAC-GA-----A-CG-T-C-ATA------G--T-TA-GC---A-A--T--G-CA--T-CAG-A--T-T-CC---C--TC-A-AT-A--T--TGC----CGGT--C------AA-T-AG--A---T-C-G--CC-G------G-TC-CAA--AAT-T---C--AA---AAAC-T--A-T---T------G-A--C-C-G-G-C-GG------TC-C--AAT----A-G---------ACA-C-A-C--AA-AAT-AGC-TAGA-A--A-TATTT-A--A-TA--TCTA---A-TAAAA--CA-ACAAAAACCCT--T----C--A---A---TTA-GG-T-AA-TAAAA
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gi|106896                     :      CTA-TTG-ACG-T-C-AT---T--T-GA-A--GTCT-AT--T----G--C--A-T-TA-CG-TTTTGAC--G---T-AC-GA-----A-CG-T-C-A-A------G--T-TAAGC---A-A--T--G-TA--T-CAG-A--TAT-CCACGC--TCGA-AT-A--T--TGG----CCGT--C------AA-T-AG--C---T-C-G--CC-G------G-TCGCCA--AAT-T---T--CA---AAAC-T--A-A---TCTCAAAGCA--CGC-G-G-C-GG------TC-TCAAAT----A-G---------TTA-C-A-A--AACAAT-AGC-TAAA-A--A-TA-TT-AGTA-TA--TCTA---A-T-AAA--C--ACAAAAA-CCT--T----C--A---A---TTA-G
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gi|106902                     :                                  -A--GGCT-AC--T----G--T--A-T-TA-C---------------TTAC-TA-----G-TG-TAC-GTA-----------TA------A-A--T--G-CGGTT-CAA-A--G-T-CC---C--TC-A--T-A------GCTT--CGGTTCC------AA-T-AG--A---AAC-G--CT----------TT-CAA--GAT-T---T--GG--------T--A-TGCCTCA----G-A--C-T-G-A-T-GA------TT-C--A-------------------CA-T-A-A--AA-AAT-AAC-T-GA-A--A-CACTA-A--A-TA--TTTA---A-TAAAA--CT-ACAAAATCCCT----------A---G---TTA-AG-T-AA-
gi|106903                     :                                         T-GT--T----G--C--ACT-TA-CGGTT---GC--GATTTTAC--A-----A-CG-T-C-ATA------G--T-TA-GC---A-A--T--GGCA--T-CAG-A--T-T-CC---G---C-A-AT-A--T--TGC----CGGTT-C------AA-T-AG--A---T-CTG--CC-G------G-TC-CAA--AAT-T---C--AA---AAA-------T---T------T-A--C-C-G-G-T-G-------TC-C--AAT----A-G----------CA-A-G-C--AA-ATT-AGC-TAGA-A--A-TATTT-A----TA--TCTA---A-TAAAA--CA--CAAA--CCCT--T----C--A---A---TTA-GG-T-AATTAAAA
gi|106904                     :                                          -AT--T----G-------T-TG-CG-TT---AC--G---TTAC-GT-----A-CG-T-C-ATA------G--T-TA-GC---A-G--T--G-CA--T-CA
gi|106905                     :                                                     --C--A-T-TA-CG-TT---GC--G---TTAC-GA-----A-CA-T-C-ATA------G--T-TA-GT---A-A--T--G-CA--T-CAG-A--T-T-CC---C--TC-C-AT-A--T--TGC----TGGT--C------AA-T-AG--A---T-C-G--CC-G------G-TC-CAG--AAT-T---C--AA---AAAC-T--A-T---T------G-A--C-C-G-G-C-GG------TC-C--AAT----A-G---------ACA-C-A-C--AA-AAT-AGC-TAGA-A--A-TATTT-A--A-TA--TCTA---A-TAAAA--CT-GCAAAAACCCT--T----C--G---A---TTA-GG-T-AA-TAA
gi|106906                     :                                                        --A-T-TAACG-TT---GT--G---TTAC-GA-----A-CG-T-C-ATA------G--T-TA-GC---A-T--T--G-CA--T-CAG-A--T-T-CCT--C--TC-A-AT-A--T--TGC----CAGT--CA-----AA-T-AG--A---TCC-G--CC-G------G-TC-C-A--AAT-T---CAAAA---AAAC-T--A-T---T------G-A--C-C-G-G-C-GGT-----TC-C--AAT----A-G---------ACA-C-A-C--AA-AAT-AGC-TAGA-ATGT-TATTT-A--A-TA--TCTA---A-TAATA--CA-ACAAAAA-CCT--T----C--A---A---TTA-GG-T-AA-TAA
gi|106907                     :                                                                                                                                     -CA--T-CAG-A--T-T-CC---C--TC-A-AT-A--T--TTC----CGGT--C------AA-T-AG--A---T-C-G--CC-G------G-T
gi|106908                     :                                                                                                                                                                   -AT-A--T---GC----CAGT--C------AA-T-AG------T-C-G--TC-G------G-TC---A--AAT-T---C--AA------C-TT-A-T---T------G-A--C-CTG-G-C-G-------TC-C--AAT----A-G---------ACA-C-ATC--AA-AAT-AGT---------A-TA-TT-A--A-TA--TC-A---A-T-AAA--CA-ACAAAACCTCTA-TTTGGT--A---A---TTA-GG-T-AA-TAAA
gi|106909                     :                                                                                                                                                                              GC----CGGT--C------AA-C-TA--A---G-C-AACCC-G------G-TC-CAA--AAT-----C--AA---AAAC-T--A-T---T------G-A--C-C-G-G-C-GG------TC-C--CAC----T-A---------AGA-T-C-C--AA-AAT-AGC-TAGA-A--A-TATTT-A--A-TC--TCTA---A-TAAAA--CA-ACAAAAACCCT--T----C--A---A---TTA-GGTT-AA-TA
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gi|106911                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -AAT-AGC-TAGA-C--A-TATTT-A--A-TA--TATA---A-TAAAA--CA-ACAAAAACCCT--T----C--A---A---TTA-GG-T-AA-TAA