lowQualScore : 11 7777 11 11 4 1 33 22 11 0 33333 11 0 999 2 0 111 333 22 1111 0 1 111 33 22222 0 1 222 11 1 1 2 11 2 1 33 1 1 1 1 2 1
lowQualScore : .. .... .. .. . . .. .. .. . ..... .. . ... . . ... ... .. .... . . ... .. ..... . . ... .. . . . .. . . .. . . . . . .
lowQualScore : 66 0000 33 33 8 0 55 22 33 9 22222 22 9 111 7 9 999 222 11 8888 9 9 666 11 33333 9 0 888 44 0 0 1 44 1 0 88 0 1 1 1 1 1
consensus : GATATTC--T-AN-TTT--GA--AA-A-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-G-TAC---A--TT----T-G-AA---AA--T-----A-TC-G---CAAT--A-TATC-G-C--G-A-TA--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
Reference ( gi|42467 ) : GATATTC--T-AC-TTT--GA--AA-A-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-G-TAT-C-GCA-G-TAC---A--TT----T-G-AA---AA--T-----A-TC-G---CAAT--A-TATC-G-C--G-A-TA--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42471 : GATATTC--T-AC-TTT--GA--AA-A-TAT--T--G--C-AT----A--TA-C-G-TGT-C-GCA-G-TAC---A--TC----T-G-AA---AA--T-----A-TC-G---CAAT--A-TATC-G-C--G-A-TA--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42472 : GATATTC--T-TA-TTT--GA--AA-A-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-G-TATGC-GCA-G-TAC---A--TT----T-G-AA---AA--T-----A-TC-G---CAAT--A-TATC-G-C--G-A-TA--C-G-AAA-A-T-TCC-ACCCGAT
gi|42468 : GATATTC--T-TA-TTT--GA--AA-A-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-G-TAT-C-GCA-G-TAC---A--TT----T-G-AA---AA--T-----A-TC-G---CAAT--A-TATCGG-C--G-A-TA--C-G-AAA-A-T-TCC-ACCCGAT
gi|42469 : GGTATTC--T-AT-TTT--GA--AA-T-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-G-TAC---A--TT----T-G-AA---AA--T-----A-TC-G---CAAT--A-TATC-G-T--G-A-TA--C-G-GAA-A-T-GTC-ACCCGATc
gi|42473 : GATATTC--T-AT-TTT--GA--AA-A-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-T-GCA-G-TAC---A--TT----T-G-AA---AA--T-----A-TC-A---CAAT--A-TATC-A-A--G-A-TG--C-T-AAA-A-T-TTC-ATCCAAT
gi|42478 : GATATTT--T-AT-TTT--GA--AG-A-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-A-GTA-G-TAC---A--TA----C-G-AA---AA--T-----A-TC-G---CAAT--A-TGTC-G-C--G-A-TA--C-G-AAA-A-T-TTC-TCCCGAT
gi|42477 : GATATTC--T-TA-TTT--GA--AA-A-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-G-TAT---A--TT----T-G-AA---AA--T-----A-TG-G---CAAT--A-TATC-G-T--G-A-TA--C-C-AAA-A-T-TTC-TCCAGAT
gi|42476 : GATATTC--T-TG-TTG--GA--AA-A-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-A-TAC---A--TT----T-G-AA---AA--T-----A-TC-G---CAAT--A-TATC-G-C--G-A-TG--C-G-AAA-A-T-TT
gi|42474 : GATATTC--T-TA-TTT--GA--AA-T-AAT--T--G--C-A-----A--CA-C-A-TAT-C-GCA-G-TAC---A--TT----T-G-AA---AA--T-----A-TC-G---CAAT--A-TATC-G-T--G-A-TA--T-G-AAA-A-T-TTC-ACCt
gi|42479 : GATATTC--TTAC-TTG--AA--AA-A-TAT--T--G--C-A-----A--TG-C-A-TAT-C-TCA-A-T-C------TT----T-G-AA---AA--T-----A-TC-G---CAAT--A-TATT-GCC--G-A-TA--C-A-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42480 : GATATT---T-AT-TTT--GA--AA-A-TAT-----G--C-A-----A--TC-A-A-TAT-C-GCA-G-CAC---A--TT----T-T-AA---AAAGT-----A-TC-G---CAAT--A-TATC-G-C--G-A-TA--C-G-AAA-T-T-TTC-ACCTGAT
gi|42483 : gatGATATTC--T-TA-TTC--GA--AA-A-TAT--T--G--T-ACCGTAA--TA-C-A-TAT-C-ACA-G-TAA---A--TT----T-G-AA---AA--T-----A-TC-T---CAAT--A-TATC-G-T--G-A-TA--A-A-AAA-A-T-TTG-ACCTGAT
gi|42482 : GATATTC--T-TA-TTG--GA--AA-A-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TGT-C-GCA-A-TAC---A--TT----T-G-AA---AA--T-----A-TC-G---C----------C--------A-TA--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCAATaccc
gi|42486 : GATATTC--T-TA-TTT--GA--AA-A-TAT--T--G--C-A-----A--TA-------------------C---A--TT----T-A-AA---AA--T-----A-TC-G---AAAT--A-TATC-G-C--G-A-TA--C-G-AAA-A-T-GTC-ACCCGAT
gi|42475 : GATATTC--TTAT-TTT--GA--AA-A-TATAAT--G--C-A-----AACCA-C-A-TAT-C-GCG-A-TAC---A--TT----T-A-AA---AA--T-----A-TC-G---CAATTAA-TATC-G-T--G-AGTAATT-G-AAA-ATT-TTC-ACCCAAT
gi|42484 : GAT-TTC--T-AC-TTT--GA--AT-A--AT--T--G--C-A--------TA-C-AATAT-C-CCA-A-TAC---A--TT----T-G-AA---AAC-T-----A-TC-G---CAAT--A-TATC-G-TGGG-A--A--C-G-AAA-A-TCTTT-ATCCGA
gi|42470 : gatGGTATTC--T-ATATTT--AA--AA-T-TATG-T--G--CTA-----A--TA-C-AATAT-C-GCA-G-TAG---AA-TT----T-G-AA---AAA-T-----A-TC-GTAGCAAT--A-TATC-G-T--GAA-TA--C-G-GAA-A-T-GTC-ACACGAT
gi|42487 : GATATTC--T-TA-TTT--TA--AA-A-TAT--T--G--T-A-----A--TA-C-A-T----------------------------G-AA---AA--T-----A-TC-G---TAAT--T-TATC-A-G--G-A-TA--C-A-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42500 : ATATTCCAT-AT-TTT--CA--AATG-TAC--T--G--C-G-----A--TA-C-G-TAT-T-GCA-
gi|42489 : ttgaaaattATATCT--T-A---TT--GG--AA-A-TAT--T--G--------------------------GCA---TAC---A--TT----T-G-AA---AA--T-----A-TC-G---CAAT--A-TATC-G-C--A-A-TA--C-G-AAT-A-T-TTC-ACCCGATatcgtgataacaaatttttacc
gi|42491 : ATCT--T-AT-TTT---A--AA-A-TAT--TT-G--C-G-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-A-TAC---A--TT----T-G-AA---AA--T-----A-TC-G---CAAT--A-T-TC-GCC--G-A-TA--C-G-AAA-T-T-TTT-ACCCGAT
gi|42485 : TTC--T-AC-TTT--TG--AA-A-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-T-----GCA-G-TAC---A--TT----T-GAAA---AA--T-----A-TC-----CAAA--A-TATC-G-C--G-A-TA--C-GAAAA-A-T-TTC-ACCCGA
gi|42481 : gatttTTC--T-TA-TTT--GA--AA-A-TAT--T--G--C-A-----A--TA-A-T-TAT-C-GCA-A-AAC---A--TT----TTG-AA---AA--T-----A-TC-G---CAAT--A-TATC-G-C--G-A-TA--C-G-TTT-A-T-TTA-ACCCGAT
gi|42493 : gacatTT--T-AC-TTT--GA--CA-A-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-T-GCA-G-TAC---A--TT----C-G-AA---AA--A-----A-TC-G---CAAT--A-TATC-G-C--G-A-TA--C-G-GAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42494 : TT--T-AC-TTT--GA--CA-A-TAT--T--G--C-A-----T--TA-CCA-TAT-T-GCA-G-TAC---A--TT----C-G-AA---AA--A-----A-TC-G---C-AT--A-TATC-G-C--G-A-TAATC-A-GAA-A-T-TTC-ACCCGATaccca
gi|42488 : TT--T-AC-T----GG--AA-A-TAT--T--GGCC-A-----A--TA-C-A-TATTC-GCA-C-TAC---A--TT----T-G-AA---AA--T-----A-TC-G---CAAT--ATTATC-G-C--GAA-TAG-C-G-AAA-A-T-Taccca
gi|42490 : tgtatgtgTC--T-AC-TTTTGGACAAA-G-TAT--T--G--C-A--------CA-C-A-TAT-C-GCA-G-TAC---A--TT----T-G-AA---AA-----------C-G---CAA---A-TATC---C--G-A-TA--C-G-AAA-A-T-TAC-AC
gi|42495 : taC--T-AC-TTT--GA--AA-A-TAT--T--G--C-A-----A--TAAC-A-TAT-C-GCA-G-TAC---A--TT----T-G-AATTTAA--T-----A-TC-GG--CAAT--A-TATC-G-C--G-A-TA--T-A-GAA-T-T-TCC-ACCCAATaatc
gi|42468 : --T-AT-TTT--CA--AATG-TAC--T--G--C-G-----A--TA-C-G-TAT-T-GCA-A-TAT---T--TTCAAAT-A-AG---AA--T-----A-TC-
gi|42473 : --T-AT-TTT--CA--AATG-TAC--T--G--C-A-----A--TA-T-G-TAT-T-GCA-A-TAT------TT----T-C-AA---AA--T-----A-tcgcaatatatcggcgatacgaaaattccacccgatc
gi|42498 : gatattc--T-AT-TTT--CA--AATG-TAC--T--G--C-A-----A--TA-T-G-TAT-T-GCA-A-TAT---A--TT----T-tcacaatatatcaagatgctaaaatttcatccaat
gi|42491 : tttga--T-AT-TTT--CA--AATG-TAT--T--G--C-G-----A--TA-T-G-TAT-C-GCA-A--AT---A--TT----T-T-AA---AA--T-----A-tcgcaatatatcgtgatacaaaaatttcacccgat
gi|42496 : atct--T-AT-TTT--AA--AA-A--AT--T--G--C-A-----A--TA-C---CATAC-GCA-AATAC---A--TT----T-G-AA---AA--T-----A-TC-G---CAAT--A-TATC-G-C--G-A-TA--C-G-AAA-T-T-GTC-ACCCGATtcgcaatattcgccgatacgaaatttttacccgat
gi|42497 : --T-AT-TTT---A--AA-A-TAT--TTGG--C-A-----A--TA-CCA-TAT-C-GCA-A-TAC------TT----T-G-AA---AA--T-----AATC-G---CAAT--A-TATC-G-C--G-A-TA--C-G-AAA-T-TATTC-ACCCGAT
gi|42504 : C-TTT--GA--AA-A-TAT--C--A--C-A-----A--TA-C----AT-T-GCA-A-TAC--------------G-AA---AA--T-----T-TC-A---C
gi|42498 : tacatattgcaatac-TTT--GA--AA-A-TATATT--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-T-GCA-G-TAC---A--TT----T-G-AA---AA--T-----A-TC-G---CAAT--A-TATC-G-T--G-A-TA--C-A-AAA-A-T-TTC-ACCCGATtcgat
gi|42492 : -TTT--GA--AA-A-TAT-----G--T-A-----A--TA-C---TAT-T-GCATA-TAC---A--TT----T-G-AA---AA--T-----A-TT-G---CAAT--A-TATC-G-C--G-A-TA--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42502 : atctta-TTT--GA--AA-A-TAT--C--G--C-A-----A--T----G-CAT-C-GCG-A-TACTAAA--TT----T-
gi|42505 : aattgtataatattgcagtata-TTT--GA--AA-A-TAT--T--G--C-A-----A--TA-----TAT-C-GTG-A-TACGAAA--TT----T-tttacccaat
gi|42499 : tTT--GA--AA-AATAT--T--G--C-A-----A--AA-C-A-TAT-CCGCA-G-TAC---AATTT----T-G-AA---A---T-----A-TC-G---CAAT--A-TATC-G-C--G-A-TA--CAA-AAA-A-T-TTCAACCCAATtcacccgat
gi|42500 : TT--GA--AA-A-T-T--T--G--C-A-----A--TA-C-G-TAT-C-GCA-G-TAC---A--TT----T-G-AA---AA--T-----A-T--G---GAAT--A-TATC-G-T--G-A-TA--A-C-AAA-T-T-TTT-ACCc
gi|42501 : --GA--AA-A-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-A-TAC---A--TT----T-G-AA---AA--T-----A-TC-G---CA------------------A-TA--C-A-AAA-A-T-TTA-ACCCGAT
gi|42502 : AT--T--G--T-A--------TA---A-TAT-T-GCA-G-TAT---A--TT----T-G-AA---AA--T-----A-TC-G---CAAT--G-CATC-G-C--G-A-TA--C-T-AAATT-T-TTT-ACCCAAT
gi|42503 : a-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-A-TAC---A--TT----T-GAAA---AA--T-----A-TCGG---CAAT------------------TA--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42504 : --TA-C-A-TAT-T-GCA-A-TAC---C--TT----T-G-AA---AA--T-----A-TC-A---CAAT--A-CATT-G-C--A-A-TA--C-G-AAA-A-T-TTC-ACTCGAT
gi|42505 : --TT----T-G-AA---AA--T-----A-TT-G---CAAT--A-TATC-G-T--G-A-TA--C-G-AAA-T-T-TTC-ACCCGAT
gi|42480 : t----T-G-AA---AA--TTTCGTA-TC-G---CGAT--A-TATT-G-C--G-A-TA--C-
Alignments
lowQualScore : 6666 11 11 1 44 22 11 1 33333 11 1 3 2 2 1 1 1 22 1 2 111 33 1 1 222 11 1 1 2 2 1 1 33 1 1 1 1 2 1
lowQualScore : .... .. .. . .. .. .. . ..... .. . . . . . . . .. . . ... .. . . ... .. . . . . . . .. . . . . . .
lowQualScore : 8888 66 66 1 22 66 55 1 88888 44 1 2 1 1 1 1 1 44 0 1 888 55 0 0 888 44 0 0 1 1 0 0 88 0 0 0 0 1 1
consensus : GATATTCT-AN-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
Reference ( family-524 ) : GATATTCT-AN-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42467 : GATATTCT-AC-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-G-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42468 : GATATTCT-TA-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-G-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATCGG-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TCC-ACCCGAT
gi|42469 : GGTATTCT-AT-TTT--GA--AAT-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-TG-A-T-A--C-G-GAA-A-T-GTC-ACCCGATc
gi|42470 : GGTATTCT-ATATTT--AA--AAT-TATG-T--G--CTA-----A--TA-C-AATAT-C-GCA-G-TAGAA-TTT-G-AA---AAA-TA-TC-GTAGCAAT--A-TATC-G-TGAA-T-A--C-G-GAA-A-T-GTC-ACACGAT
gi|42471 : GATATTCT-AC-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-AT----A--TA-C-G-TGT-C-GCA-G-TACA--TCT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42472 : GATATTCT-TA-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-G-TATGC-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TCC-ACCCGAT
gi|42473 : GATATTCT-AT-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-T-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-A---CAAT--A-TATC-A-AG-A-T-G--C-T-AAA-A-T-TTC-ATCCAAT
gi|42474 : GATATTCT-TA-TTT--GA--AAT-AAT--T--G--C-A-----A--CA-C-A-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-TG-A-T-A--T-G-AAA-A-T-TTC-ACC
gi|42475 : GATATTCTTAT-TTT--GA--AAA-TATAAT--G--C-A-----AACCA-C-A-TAT-C-GCG-A-TACA--TTT-A-AA---AA--TA-TC-G---CAATTAA-TATC-G-TG-AGT-AATT-G-AAA-ATT-TTC-ACCCAAT
gi|42476 : GATATTCT-TG-TTG--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-A-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-G--C-G-AAA-A-T-TT
gi|42477 : GATATTCT-TA-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-G-TATA--TTT-G-AA---AA--TA-TG-G---CAAT--A-TATC-G-TG-A-T-A--C-C-AAA-A-T-TTC-TCCAGATt
gi|42478 : GATATTTT-AT-TTT--GA--AGA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-A-GTA-G-TACA--TAC-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TGTC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-TCCCGAT
gi|42479 : GATATTCTTAC-TTG--AA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TG-C-A-TAT-C-TCA-A-T-C---TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATT-GCCG-A-T-A--C-A-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42480 : GATATT-T-AT-TTT--GA--AAA-TAT-----G--C-A-----A--TC-A-A-TAT-C-GCA-G-CACA--TTT-T-AA---AAAGTA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-T-T-TTC-ACCTGAT
gi|42481 : gatTTCT-TA-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-A-T-TAT-C-GCA-A-AACA--TTTTG-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-TTT-A-T-TTA-ACCCGAT
gi|42482 : gacatGATATTCT-TA-TTG--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TGT-C-GCA-A-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---C----------C------A-T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCAAT
gi|42483 : GATATTCT-TA-TTC--GA--AAA-TAT--T--G--T-ACCGTAA--TA-C-A-TAT-C-ACA-G-TAAA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-T---CAAT--A-TATC-G-TG-A-T-A--A-A-AAA-A-T-TTG-ACCTGAT
gi|42484 : GAT-TTCT-AC-TTT--GA--ATA--AT--T--G--C-A--------TA-C-AATAT-C-CCA-A-TACA--TTT-G-AA---AAC-TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-TG-G-GAA--C-G-AAA-A-TCTTT-ATCCGAaccc
gi|42485 : gatTTCT-AC-TTT--TG--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-T-----GCA-G-TACA--TTT-GAAA---AA--TA-TC-----CAAA--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-GAAAA-A-T-TTC-ACCCGA
gi|42486 : gatttGATATTCT-TA-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-T------------------TT-A-AA---AA--TA-TC-G---AAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-GTC-ACCCGAT
gi|42487 : GATATTCT-TA-TTT--TA--AAA-TAT--T--G--T-A-----A--TA-C-A-T---------------------G-AA---AA--TA-TC-G---TAAT--T-TATC-A-GG-A-T-A--C-A-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42488 : T--GG--AAA-TAT--T--GGCC-A-----A--TA-C-A-TATTC-GCA-C-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--ATTATC-G-CGAA-T-AG-C-G-AAA-A-T-T
gi|42489 : tgtatgtgtttacATATCTT-A---TT--GG--AAA-TAT--T--G--------------------------GCA---TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CA-A-T-A--C-G-AAT-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42490 : TCT-AC-TTTTGGACAAAG-TAT--T--G--C-A--------CA-C-A-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA------C-G---CAA---A-TATC---CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TAC-AC
gi|42491 : taATCTT-AT-TTT---A--AAA-TAT--TT-G--C-G-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-A-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-T-TC-GCCG-A-T-A--C-G-AAA-T-T-TTT-ACCCGATaatc
gi|42492 : TCT-TA-TTT--GA--AAA-TAT-----G--T-A-----A--TA-C---TAT-T-GCATA-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TT-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42493 : aTTT-AC-TTT--GA--CAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-T-GCA-G-TACA--TTC-G-AA---AA--AA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-GAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42494 : TTT-AC-TTT--GA--CAA-TAT--T--G--C-A-----T--TA-CCA-TAT-T-GCA-G-TACA--TTC-G-AA---AA--AA-TC-G---C-AT--A-TATC-G-CG-A-T-AATC-A-GAA-A-T-TTC-ACCCGATaccca
gi|42495 : CT-AC-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TAAC-A-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AATTTAA--TA-TC-GG--CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--T-A-GAA-T-T-TCC-ACCCAATaccca
gi|42496 : T-AT-TTT--AA--AAA--AT--T--G--C-A-----A--TA-CCA-TA--C-GCA-AATACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-T-T-GTC-ACCCGAT
gi|42497 : T-AT-TTT---A--AAA-TAT--TTGG--C-A-----A--TA-CCA-TAT-C-GCA-A-TAC---TTT-G-AA---AA--TAATC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-T-TATTC-ACCCGAT
gi|42498 : -TTT--GA--AAA-TATATT--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-T-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-TG-A-T-A--C-A-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42499 : TT--GA--AAAATAT--T--G--C-A-----A--AA-C-A-TAT-CCGCA-G-TACAATTTT-G-AA---A---TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--CAA-AAA-A-T-TTCAACCCAAT
gi|42500 : TT--GA--AAA-T-T--T--G--C-A-----A--TA-C-G-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-T--G---GAAT--A-TATC-G-TG-A-T-A--A-C-AAA-T-T-TTT-ACCc
gi|42501 : --GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-A-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CA----------------A-T-A--C-A-AAA-A-T-TTA-ACCCGAT
gi|42502 : AT--T--G--T-A--------TA---A-TAT-T-GCA-G-TATA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--G-CATC-G-CG-A-T-A--C-T-AAATT-T-TTT-ACCCAAT
gi|42503 : a-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-A-TACA--TTT-GAAA---AA--TA-TCGG---CAAT----------------T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42504 : --TA-C-A-TAT-T-GCA-A-TACC--TTT-G-AA---AA--TA-TC-A---CAAT--A-CATT-G-CA-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-ACTCGAT
gi|42505 : --TTT-G-AA---AA--TA-TT-G---CAAT--A-TATC-G-TG-A-T-A--C-G-AAA-T-T-TTC-ACCCGAT
Alignments
lowQualScore : 6666 11 11 1 44 22 11 1 33333 11 1 3 2 2 1 1 1 22 1 2 111 33 1 1 222 11 1 1 2 2 1 1 33 1 1 1 1 2 1
lowQualScore : .... .. .. . .. .. .. . ..... .. . . . . . . . .. . . ... .. . . ... .. . . . . . . .. . . . . . .
lowQualScore : 8888 66 66 1 22 66 55 1 88888 44 1 2 1 1 1 1 1 44 0 1 888 55 0 0 888 44 0 0 1 1 0 0 88 0 0 0 0 1 1
consensus : GATATTCT-AN-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
Reference ( family-524 ) : GATATTCT-AN-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42467 : GATATTCT-AC-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-G-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42468 : GATATTCT-TA-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-G-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATCGG-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TCC-ACCCGAT
gi|42469 : GGTATTCT-AT-TTT--GA--AAT-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-TG-A-T-A--C-G-GAA-A-T-GTC-ACCCGATc
gi|42470 : GGTATTCT-ATATTT--AA--AAT-TATG-T--G--CTA-----A--TA-C-AATAT-C-GCA-G-TAGAA-TTT-G-AA---AAA-TA-TC-GTAGCAAT--A-TATC-G-TGAA-T-A--C-G-GAA-A-T-GTC-ACACGAT
gi|42471 : GATATTCT-AC-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-AT----A--TA-C-G-TGT-C-GCA-G-TACA--TCT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42472 : GATATTCT-TA-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-G-TATGC-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TCC-ACCCGAT
gi|42473 : GATATTCT-AT-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-T-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-A---CAAT--A-TATC-A-AG-A-T-G--C-T-AAA-A-T-TTC-ATCCAAT
gi|42474 : GATATTCT-TA-TTT--GA--AAT-AAT--T--G--C-A-----A--CA-C-A-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-TG-A-T-A--T-G-AAA-A-T-TTC-ACC
gi|42475 : GATATTCTTAT-TTT--GA--AAA-TATAAT--G--C-A-----AACCA-C-A-TAT-C-GCG-A-TACA--TTT-A-AA---AA--TA-TC-G---CAATTAA-TATC-G-TG-AGT-AATT-G-AAA-ATT-TTC-ACCCAAT
gi|42476 : GATATTCT-TG-TTG--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-A-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-G--C-G-AAA-A-T-TT
gi|42477 : GATATTCT-TA-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-G-TATA--TTT-G-AA---AA--TA-TG-G---CAAT--A-TATC-G-TG-A-T-A--C-C-AAA-A-T-TTC-TCCAGATt
gi|42478 : GATATTTT-AT-TTT--GA--AGA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-A-GTA-G-TACA--TAC-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TGTC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-TCCCGAT
gi|42479 : GATATTCTTAC-TTG--AA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TG-C-A-TAT-C-TCA-A-T-C---TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATT-GCCG-A-T-A--C-A-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42480 : GATATT-T-AT-TTT--GA--AAA-TAT-----G--C-A-----A--TC-A-A-TAT-C-GCA-G-CACA--TTT-T-AA---AAAGTA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-T-T-TTC-ACCTGAT
gi|42481 : gatTTCT-TA-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-A-T-TAT-C-GCA-A-AACA--TTTTG-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-TTT-A-T-TTA-ACCCGAT
gi|42482 : gacatGATATTCT-TA-TTG--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TGT-C-GCA-A-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---C----------C------A-T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCAAT
gi|42483 : GATATTCT-TA-TTC--GA--AAA-TAT--T--G--T-ACCGTAA--TA-C-A-TAT-C-ACA-G-TAAA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-T---CAAT--A-TATC-G-TG-A-T-A--A-A-AAA-A-T-TTG-ACCTGAT
gi|42484 : GAT-TTCT-AC-TTT--GA--ATA--AT--T--G--C-A--------TA-C-AATAT-C-CCA-A-TACA--TTT-G-AA---AAC-TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-TG-G-GAA--C-G-AAA-A-TCTTT-ATCCGAaccc
gi|42485 : gatTTCT-AC-TTT--TG--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-T-----GCA-G-TACA--TTT-GAAA---AA--TA-TC-----CAAA--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-GAAAA-A-T-TTC-ACCCGA
gi|42486 : gatttGATATTCT-TA-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-T------------------TT-A-AA---AA--TA-TC-G---AAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-GTC-ACCCGAT
gi|42487 : GATATTCT-TA-TTT--TA--AAA-TAT--T--G--T-A-----A--TA-C-A-T---------------------G-AA---AA--TA-TC-G---TAAT--T-TATC-A-GG-A-T-A--C-A-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42488 : T--GG--AAA-TAT--T--GGCC-A-----A--TA-C-A-TATTC-GCA-C-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--ATTATC-G-CGAA-T-AG-C-G-AAA-A-T-T
gi|42489 : tgtatgtgtttacATATCTT-A---TT--GG--AAA-TAT--T--G--------------------------GCA---TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CA-A-T-A--C-G-AAT-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42490 : TCT-AC-TTTTGGACAAAG-TAT--T--G--C-A--------CA-C-A-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA------C-G---CAA---A-TATC---CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TAC-AC
gi|42491 : taATCTT-AT-TTT---A--AAA-TAT--TT-G--C-G-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-A-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-T-TC-GCCG-A-T-A--C-G-AAA-T-T-TTT-ACCCGATaatc
gi|42492 : TCT-TA-TTT--GA--AAA-TAT-----G--T-A-----A--TA-C---TAT-T-GCATA-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TT-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42493 : aTTT-AC-TTT--GA--CAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-T-GCA-G-TACA--TTC-G-AA---AA--AA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-GAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42494 : TTT-AC-TTT--GA--CAA-TAT--T--G--C-A-----T--TA-CCA-TAT-T-GCA-G-TACA--TTC-G-AA---AA--AA-TC-G---C-AT--A-TATC-G-CG-A-T-AATC-A-GAA-A-T-TTC-ACCCGATaccca
gi|42495 : CT-AC-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TAAC-A-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AATTTAA--TA-TC-GG--CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--T-A-GAA-T-T-TCC-ACCCAATaccca
gi|42496 : T-AT-TTT--AA--AAA--AT--T--G--C-A-----A--TA-CCA-TA--C-GCA-AATACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-T-T-GTC-ACCCGAT
gi|42497 : T-AT-TTT---A--AAA-TAT--TTGG--C-A-----A--TA-CCA-TAT-C-GCA-A-TAC---TTT-G-AA---AA--TAATC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-T-TATTC-ACCCGAT
gi|42498 : -TTT--GA--AAA-TATATT--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-T-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-TG-A-T-A--C-A-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42499 : TT--GA--AAAATAT--T--G--C-A-----A--AA-C-A-TAT-CCGCA-G-TACAATTTT-G-AA---A---TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--CAA-AAA-A-T-TTCAACCCAAT
gi|42500 : TT--GA--AAA-T-T--T--G--C-A-----A--TA-C-G-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-T--G---GAAT--A-TATC-G-TG-A-T-A--A-C-AAA-T-T-TTT-ACCc
gi|42501 : --GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-A-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CA----------------A-T-A--C-A-AAA-A-T-TTA-ACCCGAT
gi|42502 : AT--T--G--T-A--------TA---A-TAT-T-GCA-G-TATA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--G-CATC-G-CG-A-T-A--C-T-AAATT-T-TTT-ACCCAAT
gi|42503 : a-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-A-TACA--TTT-GAAA---AA--TA-TCGG---CAAT----------------T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42504 : --TA-C-A-TAT-T-GCA-A-TACC--TTT-G-AA---AA--TA-TC-A---CAAT--A-CATT-G-CA-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-ACTCGAT
gi|42505 : --TTT-G-AA---AA--TA-TT-G---CAAT--A-TATC-G-TG-A-T-A--C-G-AAA-T-T-TTC-ACCCGAT
blockSeqs : ATA TG CA A AA TG GC T CCGTA AC A C A G C T A AT T A TTT AG A G TAG TA T G C A G A AT A A T T C A
blockSeqs : TAT . . . AT T . . T . . C A T . . . A . A . A . . G . . . C A . . AT . . . . A .
blockSeqs : TAC . . . G . . . . . . C . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . G . . . . . .
blockSeqs : TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : GATATTCT-AN-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
finalCons : GATATTCT-AN-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
Alignments
lowQualScore : 6666 11 11 1 44 22 11 1 33333 11 1 3 2 2 1 1 1 22 1 2 111 33 1 1 222 11 1 1 2 2 1 1 33 1 1 1 1 2 1
lowQualScore : .... .. .. . .. .. .. . ..... .. . . . . . . . .. . . ... .. . . ... .. . . . . . . .. . . . . . .
lowQualScore : 8888 66 66 1 22 66 55 1 88888 44 1 2 1 1 1 1 1 44 0 1 888 55 0 0 888 44 0 0 1 1 0 0 88 0 0 0 0 1 1
consensus : GATATTCT-AN-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
Reference ( family-524 ) : GATATTCT-AN-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42467 : GATATTCT-AC-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-G-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42468 : GATATTCT-TA-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-G-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATCGG-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TCC-ACCCGAT
gi|42469 : GGTATTCT-AT-TTT--GA--AAT-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-TG-A-T-A--C-G-GAA-A-T-GTC-ACCCGATc
gi|42470 : GGTATTCT-ATATTT--AA--AAT-TATG-T--G--CTA-----A--TA-C-AATAT-C-GCA-G-TAGAA-TTT-G-AA---AAA-TA-TC-GTAGCAAT--A-TATC-G-TGAA-T-A--C-G-GAA-A-T-GTC-ACACGAT
gi|42471 : GATATTCT-AC-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-AT----A--TA-C-G-TGT-C-GCA-G-TACA--TCT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42472 : GATATTCT-TA-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-G-TATGC-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TCC-ACCCGAT
gi|42473 : GATATTCT-AT-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-T-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-A---CAAT--A-TATC-A-AG-A-T-G--C-T-AAA-A-T-TTC-ATCCAAT
gi|42474 : GATATTCT-TA-TTT--GA--AAT-AAT--T--G--C-A-----A--CA-C-A-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-TG-A-T-A--T-G-AAA-A-T-TTC-ACC
gi|42475 : GATATTCTTAT-TTT--GA--AAA-TATAAT--G--C-A-----AACCA-C-A-TAT-C-GCG-A-TACA--TTT-A-AA---AA--TA-TC-G---CAATTAA-TATC-G-TG-AGT-AATT-G-AAA-ATT-TTC-ACCCAAT
gi|42476 : GATATTCT-TG-TTG--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-A-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-G--C-G-AAA-A-T-TT
gi|42477 : GATATTCT-TA-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-G-TATA--TTT-G-AA---AA--TA-TG-G---CAAT--A-TATC-G-TG-A-T-A--C-C-AAA-A-T-TTC-TCCAGATt
gi|42478 : GATATTTT-AT-TTT--GA--AGA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-A-GTA-G-TACA--TAC-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TGTC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-TCCCGAT
gi|42479 : GATATTCTTAC-TTG--AA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TG-C-A-TAT-C-TCA-A-T-C---TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATT-GCCG-A-T-A--C-A-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42480 : GATATT-T-AT-TTT--GA--AAA-TAT-----G--C-A-----A--TC-A-A-TAT-C-GCA-G-CACA--TTT-T-AA---AAAGTA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-T-T-TTC-ACCTGAT
gi|42481 : gatTTCT-TA-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-A-T-TAT-C-GCA-A-AACA--TTTTG-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-TTT-A-T-TTA-ACCCGAT
gi|42482 : gacatGATATTCT-TA-TTG--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TGT-C-GCA-A-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---C----------C------A-T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCAAT
gi|42483 : GATATTCT-TA-TTC--GA--AAA-TAT--T--G--T-ACCGTAA--TA-C-A-TAT-C-ACA-G-TAAA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-T---CAAT--A-TATC-G-TG-A-T-A--A-A-AAA-A-T-TTG-ACCTGAT
gi|42484 : GAT-TTCT-AC-TTT--GA--ATA--AT--T--G--C-A--------TA-C-AATAT-C-CCA-A-TACA--TTT-G-AA---AAC-TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-TG-G-GAA--C-G-AAA-A-TCTTT-ATCCGAaccc
gi|42485 : gatTTCT-AC-TTT--TG--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-T-----GCA-G-TACA--TTT-GAAA---AA--TA-TC-----CAAA--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-GAAAA-A-T-TTC-ACCCGA
gi|42486 : gatttGATATTCT-TA-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-T------------------TT-A-AA---AA--TA-TC-G---AAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-GTC-ACCCGAT
gi|42487 : GATATTCT-TA-TTT--TA--AAA-TAT--T--G--T-A-----A--TA-C-A-T---------------------G-AA---AA--TA-TC-G---TAAT--T-TATC-A-GG-A-T-A--C-A-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42488 : T--GG--AAA-TAT--T--GGCC-A-----A--TA-C-A-TATTC-GCA-C-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--ATTATC-G-CGAA-T-AG-C-G-AAA-A-T-T
gi|42489 : tgtatgtgtttacATATCTT-A---TT--GG--AAA-TAT--T--G--------------------------GCA---TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CA-A-T-A--C-G-AAT-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42490 : TCT-AC-TTTTGGACAAAG-TAT--T--G--C-A--------CA-C-A-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA------C-G---CAA---A-TATC---CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TAC-AC
gi|42491 : taATCTT-AT-TTT---A--AAA-TAT--TT-G--C-G-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-A-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-T-TC-GCCG-A-T-A--C-G-AAA-T-T-TTT-ACCCGATaatc
gi|42492 : TCT-TA-TTT--GA--AAA-TAT-----G--T-A-----A--TA-C---TAT-T-GCATA-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TT-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42493 : aTTT-AC-TTT--GA--CAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-T-GCA-G-TACA--TTC-G-AA---AA--AA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-GAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42494 : TTT-AC-TTT--GA--CAA-TAT--T--G--C-A-----T--TA-CCA-TAT-T-GCA-G-TACA--TTC-G-AA---AA--AA-TC-G---C-AT--A-TATC-G-CG-A-T-AATC-A-GAA-A-T-TTC-ACCCGATaccca
gi|42495 : CT-AC-TTT--GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TAAC-A-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AATTTAA--TA-TC-GG--CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--T-A-GAA-T-T-TCC-ACCCAATaccca
gi|42496 : T-AT-TTT--AA--AAA--AT--T--G--C-A-----A--TA-CCA-TA--C-GCA-AATACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-T-T-GTC-ACCCGAT
gi|42497 : T-AT-TTT---A--AAA-TAT--TTGG--C-A-----A--TA-CCA-TAT-C-GCA-A-TAC---TTT-G-AA---AA--TAATC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--C-G-AAA-T-TATTC-ACCCGAT
gi|42498 : -TTT--GA--AAA-TATATT--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-T-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-TG-A-T-A--C-A-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42499 : TT--GA--AAAATAT--T--G--C-A-----A--AA-C-A-TAT-CCGCA-G-TACAATTTT-G-AA---A---TA-TC-G---CAAT--A-TATC-G-CG-A-T-A--CAA-AAA-A-T-TTCAACCCAAT
gi|42500 : TT--GA--AAA-T-T--T--G--C-A-----A--TA-C-G-TAT-C-GCA-G-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-T--G---GAAT--A-TATC-G-TG-A-T-A--A-C-AAA-T-T-TTT-ACCc
gi|42501 : --GA--AAA-TAT--T--G--C-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-A-TACA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CA----------------A-T-A--C-A-AAA-A-T-TTA-ACCCGAT
gi|42502 : AT--T--G--T-A--------TA---A-TAT-T-GCA-G-TATA--TTT-G-AA---AA--TA-TC-G---CAAT--G-CATC-G-CG-A-T-A--C-T-AAATT-T-TTT-ACCCAAT
gi|42503 : a-A-----A--TA-C-A-TAT-C-GCA-A-TACA--TTT-GAAA---AA--TA-TCGG---CAAT----------------T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-ACCCGAT
gi|42504 : --TA-C-A-TAT-T-GCA-A-TACC--TTT-G-AA---AA--TA-TC-A---CAAT--A-CATT-G-CA-A-T-A--C-G-AAA-A-T-TTC-ACTCGAT
gi|42505 : --TTT-G-AA---AA--TA-TT-G---CAAT--A-TATC-G-TG-A-T-A--C-G-AAA-T-T-TTC-ACCCGAT