lowQualScore : 55 11 2 111 1111111111 2222 111111111 222222222222222222222222 222222222222222222222222 111111 111 1111 1111 22222222 1 111 1111
lowQualScore : 55 55 6 55 0 55 2 5555 2 3 0 555 000 2 2 22 1 3 6666 1 22 44444 1 555555 333 3 1 22 44 3333333333 1 22 44 1 22 22 1 666 88888 4 2 22 2 2 22 2 22 1 22 5555 1 555555555 0 1 1 33333 1 3 77 8888888888888 22 222222222222222222222222 33 33 4 666 22 111111111111111111111111 1 4 1 33333 1 2 55555555555 66666666666 222 1 1 1 22 1 44 33 3333 22 1 22 33 1 3333 3333 222 1 1 3 55 444 1 1 33 1 1 1 6666 1 1 55555 1 222222 22 2 66 2 6 222 111 3333 44 1 7 1 3333 3 1 4444 5 88888888888 6666 222 888888888888 1 22 44 22 3 777777 1 22 5555555 3333 1 6666 666 333 22 1 333 1 66666666 0 7777 1 1 44 1 66666666666666 44444444 2 1 888 22 22 1 888 666 3 3333 1 2 2 2 66 22 2 4444 777 33 0 2
lowQualScore : .. .. . .. . .. . .... . . . ... ... . . .. . . .... . .. ..... . ...... ... . . .. .. .......... . .. .. . .. .. . ... ..... . . .. . . .. . .. . .. .... . ......... . . . ..... . . .. ............. .. ........................ .. .. . ... .. ........................ . . . ..... . . ........... ........... ... . . . .. . .. .. .... .. . .. .. . .... .... ... . . . .. ... . . .. . . . .... . . ..... . ...... .. . .. . . ... ... .... .. . . . .... . . .... . ........... .... ... ............ . .. .. .. . ...... . .. ....... .... . .... ... ... .. . ... . ........ . .... . . .. . .............. ........ . . ... .. .. . ... ... . .... . . . . .. .. . .... ... .. . .
lowQualScore : 00 33 7 33 6 00 1 8888 1 8 7 888 555 0 0 88 9 8 0000 9 66 88888 9 555555 333 8 9 66 55 9999999999 8 55 33 8 55 66 9 000 88888 0 0 88 0 0 88 0 66 9 66 8888 8 666666666 5 5 5 77777 5 0 00 1111111111111 00 333333333333333333333333 55 55 4 111 00 777777777777777777777777 5 3 4 66666 4 9 88888888888 88888888888 555 5 4 4 00 5 11 77 2222 22 6 22 88 6 4444 4444 888 6 6 2 66 444 6 6 55 5 4 4 5555 4 4 00000 4 999999 00 9 66 9 6 555 444 0000 88 5 0 5 8888 0 5 6666 7 99999999999 3333 888 222222222222 6 22 00 33 5 000000 8 55 9999999 9999 8 0000 000 222 55 8 222 8 55555555 1 9999 8 7 00 7 66666666666666 99999999 4 8 444 55 55 7 666 444 6 1111 8 0 0 0 11 88 0 5555 000 33 8 5
consensus : TTTG--TGGGG--T-GA--TGCCCC--TA-G---GT-CGGGTTTGCAC---A-C-TAA-C-CC-CT-CTCAGA-G----TT-TAG--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--CCA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-ATG--C-A--TTT-GAT--TC-C-T-CGA----C-G--CCCACTC-AG-G-----GA-T-A--TG-------------GT--GG----------A---------C---C--A--TTC-ATG---TC--TACA------------------------GCA-G-T-T-----TCT-AC-C--C--------AG-----------TG---C-TG-TG-GCG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCA-CC--G--G-CAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG--A---T--A-GG-GA-GGG---GG--A----C-GCA-GGG-A-T--TTC-T-TT----AGGCCGAG-G---------G---AGCAGCAGCAC---C------------T-G--AGC--A--GTTTCCTCG-G-----TCAGC-AG--CTGC-------C----C-CC---TAACC--GT---AT--GCCCC-AG---C-TTACCC-----CA-CACA--G-GC-AG-C--GC-CACC----G-G-T-A---A-----G--CGC-CT--AT--GTTC--CTCTG-ACGCG---TA---A-G-N--C-TA-G-A-TAN-AAG--G-A----TCTG--NAT-GAAGAT-GACA
Reference ( gi|127862 ) : TTTGCATGGGG--T-GA--TGATCC--TA-G---GT-CGGGTTTGCAC---A-T-TAA-C-CC-TT-CTCAGA-G----TT-TAG--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--CCA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-ATG--C-A--TTT-GAT--TT-A-T-CGA----T-G--CCCACTC-AG-G-----GA-T-A--TG-------------GT--GG----------G---------T---C--A--TTC-ATG---TC--TACA------------------------GCA-G-T-T-----TCT-AC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-GCG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCA-CT--G--G-TAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG--G---T--A-GG-AA-GAG---GA--A----C-ACA-GAG-A-C--TTC-T-TT----AGGCCGAG-A---------G---AGCAACAGCAC---C------------T-G--AAC--A--GTTTCCTCG-G-----TCAGC-AG--CTGC-------C----C-CT---TAACC--GT---AT--GCCCC-AG---C-TTACCC-----TT-CATA--G-GC-AG-C--GC-CACC----G-G-T-A---A-----G--CAC-CT--CT--GTTT--CTCTG-ACGCG---TA---A-G-T--C-TA-G-A-TAG-AAG--G-A----TCTG--AAT-GAAGAT-GACA
gi|127863 : TTTG---GGGG--T-GA--TGCTCC--TA-G---GC-CGGGTTTGCAC---A-C-TAA-C-CC-CT-CTCAGA-G----TT-TAG--G-----A-AA------TA---G-A-A--T--T----A-T---C-G--GTT--CCA-T--G--C------A---A-G-A-A--T-C-ATG--C-A--TTT-GAT--TT-T-T-CGA----C-A--TCCATTC-AG-G-----GA-T-A--TA-------------GT--GG----------A---------T---C--A--TTC-ATG---TC--TACA------------------------GTA-G-T-T-----TCT-AC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-GCG--G-ACC--CC--T-A--ATA--TCA-CT--G--G-TAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAT---T-TCGCT-CA--G-CTT-GCCC-A--T-C-C-CGAAA-----G-AG--A---G--A-GG-AA-TGG---GG--A----C-GCA-TGG-A-T--TTC-T-TT----AGGCCGAG-A---------G---AGTAACAGCAC---C------------T-G--AAC--A--GTTTCCTCG-G-----TCAGC-AG--CTGC-------C----A-CC---TAACC--GT---GT--GCCCC-AG---C-TTACCC-----CA-CACA--G-GC-AG-C--GC-CACC----G-G-T-A---A-----G--CAC-CT--AT--GTTT--CTCTG-ACGCG---TA---A-G-T--C-TA-G-A-TAG-AAG--G-A----TTTG--AAT-GAAGAT-GACA
gi|127864 : TTTG---GGGG--T-GA--TGCTCC--TA-G---GT-CGGGTTTG-AC---A-C-TAA-C-CC-CT-CTTAGA-G----TT-TAG--G-----A-AA------TA---T-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--CCA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-ATG--C-A--TTT-GAT--TC-C-T-CGA----T-G--TCCTCTC-AG-G-----GA-T-A--TG-------------GT--GG----------A---------T---C--A--TTC-ATG---TT--TACA------------------------GCA-G-T-T-----TCT-AC-T--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-CCG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCA-CT--G--G-TAACTGC----CCTAGGT---A-GT-A-TA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG--A---T--ACGG-AA-G-G---GG--A----C-ACA-GGG-A-T--TCA-T-TT----AGGCCGAG-A---------G---AGCAACATCAC---C------------T-G--AAC--A--GTTTCCTTG-G-----TCGGC-AG--TTGC-------C----C-CC---TAA----G----------CTC-AG---C-TTACCC-----CA-CACA--G-GC-AG-C--GC-CACC----T-A-T-G---A-----A--CAC-CA--TT--GTTT--CTCTA-ATGCGT--TA---A-G-T--C-TA-G-A-TAG-AAG--G-A----TCTG--AAT-GAAGAT-GACA
gi|127868 : TTTG---GGGG--T-GA--TGCTCC--TA-G---GT-CGGGTTTGTAC---A-C-TAA-C-CC-CT-CTCACA-G----TT-TAG--G-----A-AA------TA---G-A-C--TTAT----A-T---C-G--GTT--CCA-T--
gi|127872 : TTTG---GGGA--TAGA--TG--CA--TA-G---GT-CTGGTTTGCAC---A-C-TGA-C-CC-TT-CTCAGA-G----TT-TAG--G-----G-AA------TA---G-G-A--T--C----G-----C-G--TTT--TCA-T--G--C-C---AG---C-A-A-A--T-C-ATA--C-A--TTC-GAT--T----C-TGA----C-A--CCCA
gi|127874 : TGGAG--T-GAA-TGCTCC--TA-G---GT-CGGGTT-GCAC---ACT-TAA-C-CC-CT-CTCAGA-G----TT-TAG--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--CCA-A--G--C-CTAAAA---A-A-A-A--A-C-ATG--C-A--TTT-GAT--TC-C-T-CGA----C-G--CCCTCTC-AG-G------A-T-A--TG-------------GT--GG----------A---------C---C--A--T-C-A-G---TC--TAGA------------------------GTA-G-T-T-----TCT-AC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-GCG--A-ACC--CC--A-C--ATA--TCA-TT--G--G-T--CTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ATACT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG--T---T--A-GGCGA-GGG---GAT-G----C--CA-GAG-G-CATTTC-T-TT----AGGCCGAG-A---------G---AGCAACAGCAC---C------------T-G--AAC--A--GTTT-CTCGCG-----TCAGC-AG--CTGC-------C----C-CC---TAACC--GT---AT--GCCCC-AG---T-TTACCC-----CA-CACA--A-GC-AG-C--GC-CACC------G-T-A---A-----G--CAC-CT--TT--GTTT--CTCTG-AAGCG---TA---A-G-T--C-TA-G-A-TAG-AAG--G-A----TCTG--AAT-GAAGAT-GACA
gi|127875 : ttTGGAG--T-GA--TG-TCC--TA-G----T-CGGCGTTGCAC---ACT-TAA-C-CC-C--CTCAGA-G----TT-TAG--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--CCA-T--G--C-CTA-AA---A-A-A-A--A-C-ATGCCC-A--TTT-GAT--TC-C-T-C-A----C-G--CCC-CTC-AG-G-----GA-TCA--T--------------GT--GG----------A---------C---C--A--TTC-ATG---TC--TAGA------------------------G-A-GTT-T-----TCT-AC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-GC---A-ACC--CC--A----ATA--T-A-TT--GC-G-TCAATGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACTAC-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG--T---T--A-GG-GA-GGG---GATGC----C-GCA-G-G-A-T--TTC-T-TT----AGGCCGAG-A---------G---AGCAACAGCAC---C------------T-G--AAC--A--GT---CTCGCG-----TCAGC-AG--CTGC-------C----C-CC---TAACC--GT---AT--GCCCC-AG---T-TTACCC------C-CACA----GC-AG-C--GC-CACC----G-G-T-A---A-----GCCCAC-CT--TT--GTTT--CTCTG-AAGCGC--TA---A-G-T--C-TA-G-A-TAG-AAG--G-A----TCTGA-AAT-GAAGAT-
gi|127866 : ttTGGGGGTT-GA--TGCCCC--TA-G---GT-CGGGTTTGTAC---A-C-TAA-C-CC-CT-CTCAGA-G----TT-TAG--G-----A-AA------TA---G-A-G--C--T----C-C---T-G--GTT--CCA-T--G--C-T---AA---T-G-A-A--C-A-ATG--C-A--TTT-GAT--TC-C-T-CGA----C-A--CCCACTC-GG-G-----GA-T-A--TG-------------GT--GGACCATTCAATG---------A---C--A--TTC-ATG---TC--TACA------------------------GCA-G-T-T-----TCT-AC-A--C--------AT-----------TG---T-TG-TG-GCG--A-ACC--CC--A-G--ATA--TCA-CC--G--G-CAACTGC----CC----T---T-GT-A-CA-TCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--A-C-C-CGGAC-----A-AA--T---T--A-GC-GA-GAG---G---A----T-GCA-GGG-T-T--TTC-C-TT----AGGCCCAG-G---------A---AGCAGCAACAC---C------------T-G--AGC--A--GTGTCTTCG-G-----TCAGC-AG--CTAC-------C----C-CC---TACAC--GT---AT--GCCCC-AG---C-TTACCC-----CA-CACA--G-GC-AG-C--GC-CACT----G-GTT-A---ATACATG--TAC-CT--AT--GTTC--ATCTG-GCGCG---CA---A-GAT--C-T
gi|127867 : ttTGGGGGTT-GA--TGCCCC--TA-A---GT-CCGGGTTGTAC---A-C-TGA-A-CC-CT-CTCAGA-G----TT-TAG--G-----A-AA------TA---G-A-G--C--T----C-C---T-G--GTT--CCA-T--G--C-T---AA---T-G-A-A--C-C-ATG--T-A--TTT-GAT--TC-C-T-CGA----C-A--CCCAGTC-AG-T-----GA-T-A--TG-------------GT--GG----------A---------C---C--A--TTC-ATA---TC--TACA------------------------GCA-G-T-C-----TCT-AC-C--A--------AA-----------TG---C-TA-TG-GCG--G-ACG--CC--A-G--ATG--TCA-CC--G--G-CAACTGC----CC----T---A-AT-A-CA-CTTC---T-ACACT-CA--G-TCT-GCCC-A--A-T-C-CGGAA-----G-GA--A---T--A-GG-GATGAG---G---A----C-GCA-GGG-A-T--TTC-T-TT----AGCTCCAG-G---------G---CACAGCAGTGC---C------------T-G--GGC--A--GTTTTCTCG-G-----GCAAC-AG--CTAC-------C----C-CC---TACCA--GT---AT--ACCCC-AG---C-TTAACA--------CA-A--A-AC-GG-C--G--CACC----G-C-C-A---A-----------------T--GTTC--TTCTG-ACGCG---TA---A-G-G--C-TA-G-A-TAC-AAG--A-A----TCTG--CAT-TATGAT-
gi|127870 : ttTGGGGGTT-GA--TGCCCC--TA-G---GT-CGGGTTTGTAC---A-C-TGA-G-CC-CT-CTCAGA-G----TT-TAG--A-----A-AA------CA---G-A-G--C--T----C-G---C-G--GTT--CCA-T--G--C-T---A------GTA-A--C-C-ATG--C-A--TTT-GAT--TC-C-T-TAA----C-A--CCCAGTC-AG-G-----GA-T-A--TG-------------GT--GG----------A---------C---C--A--TTC-TTG---TC--TACATCAGA-------------------GCA-G-T-T-----TCT-AC-C--A--------AA-----------TG---C-TA-CA-GCG-----------------------TCA-CC--A--G-CATTTGC----CC----T---A-GT-A-AA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-TCT-GCCC-A--A-C-C-CGAAA-----G-GA--A---T--A-GG-GA-GGA---GA--A----C-GCA-GGG-A-T--TTC-T-TT----AAGCCAAG-G---------G---CACAGGAGCGC---C------------T-G--
gi|127877 : ttTGGGGGTT-GA--TGCCCC--GA-G---GT-CGGGTTTGTAC---A-C-TGAGC-CC-TT-CTCAGA-G----TT-TAG--A-----A-AA------CA---GGA-G--C--T----C-G---C-G--GTTT-CCA-T--G--C-T---A------GTA-A--C-C-ATG--C-A--TTT-GATCCTT-A-----A----C-A--CCCAT---AG-G-----GA-T-A---G-------------GT--GG----------A---------C---C--T--TACTATGGG-TC--TACATCAGA-------------------GCA-G-T-T------CT-AC-C--C--------A-------------A---A-TG-CT-ACA--G-------C--A-A--ACG--TCA-CA--G--C---ATTGC----CC----T---A-GT-A-AA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-TCT-GCCC-A--A---C-CGGAA-----A-GGTAA---T--AGGG-AG-GAG---AA--A----C-GCA-GGG-ATT--TTC-T-TT----AAGCCCAA-G---------G---CACAGGAGC-C---C------------T-GTAAACT-G--GTCTCC
gi|127869 : tTGGGGGTT-GA--TGCCCT--TA-G---GT-CGAGTTTGTAC---A-C-TGA-C-AT-CT-CTCAAT-G----TA-TAG--G-----A-AA------TA---G-G-A--C--T----------C-GTAGTC--CCA-T--G--C-T---AA---G-T-A-A--C-C-ATG--C-A--TTT-GAT--TC-C-T-CGA----C-A--CCAACTC-AG-G-----GA-G-A--TG-------------GT--AG----------A---------C---C--A--TTC-ATG---TA--TACT------------------------GCA-G-T-T-----TTT-AC-C--C--------AG-----------TA---
gi|127873 : ttTGGGG--TTGA--TGCCCC--TA-T---GTTCGGGTT-GTAC---A-C-TGA-A-CC-CT-CTCAGA-G----TT-TAG--G-----A-AA------TA---G-A-G--C--T----C-C---T-G--GTT--CCA-T--G--C-T---Atcatcacgccatgcctgtccaaccctgaagggatagggagggaggggacgcaggaatttctttgggcccagcaacatctgagcagtttccacaggtagtttccccgtatgcctaagcttacccacacaggcagcaccaccagttagcccctagctatgtttctctgaagcgtaatgctaaatacaaggacctgcattatgatgaca
gi|127865 : ttGGGG--T-GAAATGCTCCCTTA-G----T-TGGGTTTTCAC---A-C-TAA-CACCATC-CTCAGAAG----TT-CAG--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--TTAATA-T---C-G---TT--CCA-T--GTGC-T---AA---A-G-A-A--C-C-ATG--C-A--TTT-GAT--TT-C-TTCGA----T-A--CCCACTC-AG-G-----GA-T-A--TG-------------GT--GG----------A---------T---C--A--TTC-ATG---TCCTTACA------------------------GTA-G-T-T-----TCT-AC-C--C--------AG-----------TAAATC-TGGTG-GCG--G-ACC--CCC-A-G--ATA--TCA-CT--G--G-TAACTGC----CC----T---ATGT-A-CAACCAC---T-TCGCT-CA--G-CCT-GCCCCA--T-A-C-CCGAA-----A-GA--A---T--A-GG-AA-GGG---GG--A----CCGCAAGGG-A-T--TTC-T-TT----AG-CCGAG-AA--------G---AGCAACAGCAC---C------------T-G--AAC--A--GTTTCCTCG-G-----TCAGC-AG--CTGC-------C----C-C----TAACC--GT---AT--G-CTC-AG---C-TTACCC------T-CACAACG-GTAAG-C--GC-CACC----G-G-TAA---A-----G--CAC-CTA-AT--GTTT--CTCTG-ACGCG---TA---A-G-TCCC-TA-G-A-TAG-AAG--G-A----TTTG--AAT-GAAGAT-GA
gi|127880 : ttagGGGG--T-GA--TGCTCC--TA-GCGTGT-CGG------AC---A-C-TAA-C-CT-TT-C--AGA-G----TT-TAG--------A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G---TT--CC----------T---AA---A-G-A-A--C-C-ATG--C----TTT-GAT--TC---T-TGA------G--CCCTCTC-AG-G-----GA-T-AA-TG-------------GT--GG----------A---------T------A--TTC-ATG---TT--TA-A------------------------GCA-G-T-T-----T-T-AC-CATC--------A------------TC---G-TG-TG-G-G--G-ACC--CCCAA-G--ATA--TTA-CT--G--G-TAACT------CC----T---A-GT-A-C--CTAC---T-ACGCT--A--GTCCT-GCCC-A--G-C----GGAA-----T-GG--A---T--A-GG----GGG---GG--A----C-GCA-GGG-A-T--TTC-T-TT----AGGCCGAG-----------G---AGCAACAGCAC---C------------T-G--AA---A--GTTTCCTCG-------TCAGC-AG--CTGC-------C----C------TAAAT--GT---AT--GCCC--AT---C-TTACCC-----TT--ACA--GCGC-AG-A--GC--ATC----GCG-T-A---A-----G--C-C-CT--AT--GTTT--CTCTG-ACGCG---TA---A-G-TA-C-TA-G-A--AG-AAG--G-A----TCTG--AAT-GAAAAT-GACA
gi|127881 : gGGGC--T-G---TG-TCC--TA-GT--GT-CGGCTTTGCAC---A-C-TAA-C-CC-CT-CTCAGT-G----TT-TAG--A-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---T-C--GTTTCCCA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-ATG--C-A---TT-GAT--TTCC-T-CAA----T-G--CCCTTTC-AG-G-----GA-T-A--T--------------GT--GG----------A---------T---C--A--TTC-ATG---TT--TACAGTATAAAAACTTGTACGGTCTTACGCA-GTT-T-----TCTAAC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-
gi|127871 : GGG--T-GA--T--CCC--TA-G---CT-CGGATT-GCAC---A-CGTAA-C-CC-TTTCTCAGA---------TAG--G-----A-AA-------A---G-A----T--T----A-TAATC-G--GTT--C-A-T--G--C-T---AGC--A-G-A-A--G-C-A-G--C-----TT-GAT--CT---T-CGA----C-C--ACCACTC-AG-G-----GA-T-A--TG-------------GT--GG----------A---------A---T--A--TT----A---TC--TACA------------------------GTA-G-T-T-----T-T-AC-C-----------AG-----------TA---C-TG-TGCGCG--G-ACC--CC--AAG--ATA--TCA-CT--G--G-TAA--GC----CC----A---C-GT-AACA-CCAC---T---GCT-CA--G-CCC-TCCC-A----C-C-CGAAA-----T-GA------T--A-GA-AA-GGG---GA--G----C-ACG-G-G-A----TTC-T-TT----AGGCCGAG-C---------G---AGCAACAGCA----C------------T-G--AAC--A--GTT---CCG-G-----T-AGCAAG--CTGC-------C----C-CG---TAACC--GT----T--CCCCC-AG---C-TTACCCAGGGATT-CAAC--G-GC--G-C--GC-AAC
gi|127879 : tttggtttGGT--T-GA--TG-CCC--TAAG---GT-CCGGTTGTCAC-----T-GAA-C-GC-TC-CTCAGATG----TTATAG--------A-AA------TT---G-ATG--C--T----GCT---C-T--GGT--CCA-T--G----T---AA---T-G-AGA--T-C-A-G--T-A--TTT-GAT--TC---C-CGA----TCA--CCCAGTC-AG----------T-G--TA-------------AT--GG----------G---------TGGAC--AATTTCGATA---T---TACA-------------------------CA-G-T-C------CT-AC-G--A--------AA-----------TG---C--A-TG-G-G--G-ACC--AG--A-A--A-A--TCA-CG--T--G-CAACTGC----CC----T---A-AT-A-CATCTA------ACACT-CA--G-TC--GCCC-A----T-T-CGGAA-----GAGA--A---T--A-GG-GA-TAG---GA--G----C-aaaaacccacagaggcatcagtaaaaattcgaacatagtaacccggttagcctacaaaaacctgacgcgtaaagtccagaatagaaggcatttgtgaatcaagatgaca
gi|127878 : gaGG--TCGA--TGCTCCA-TA-G----T-CGAGCT--CACCGAA-C-TAA-C-CC-TA-CTCAG--G----TT-TAT--G-----A-AG------AATCCG-A-G--TA-T----A-T---CCG--GTT--CCAAT--G--C-T---AATATA-G-A-A--C-CGATG--C-AAGTAT-GAC--TT-CCT-CGA----TCGTCCCCTCTC-AGTGCACCTGA-T-GACTG-------------GT--GG----------A---------T---CG-A--TTCTATGG--TT--TACA------------------------TCGTA-T-TACTGGTCT-AC-C--CGGGCCTAAAG-----------TG---C-TG-TG-GTG--GTACC--CC--A-T--ATAATCCT-CT--G--G-TTACTGC----CC----TCCTA-GT-A-CAACCACC--T-ACGCT-CA--G-GCT-GCCC-A--G-C-CGCGGAA-----T-GG--A---TTAG-GG-GA-GAG---GGC-ACGGCC-GCA-GGGAA-A--TTC-T-TTTTAGAGACCGCG-ACGAGCTAATA---AGCAACAGCACAGTC------------TAG--AAC--A--GTTTCACCG-GGGAGCTCAAC-AATCTTGC-------C----C-CT---AAACG--ATTTAATGCGCCCT-AGAGTC-TTA--------TT-CACA-----C-AG-CTAGCACGCCTTCGG-G-T-AAATA-----A--CAC-CTA-TT--GTTTACTTCCATAAACA---CA---A-G-TA-CATA-G-A-AAGCAAG--G-AATGCTC-G--AATGGAAGATAGACAtaggattcatatcatagtttagcagtgagaaacacagca
gi|127876 : ttgagtC--TA-G---AT-CATGGTTGTACT--A-A-GAA-C-TC-CT-CCCAAA-T----GT-TAGACG-----ATAA------TA---G-A-GGCT--C----A-TAGCT-G--GT----CA-TTTG--C-T---AT---GTG-A-AGTC-C-ATG--CCA--TTTTGAT--TC-C-T-CGAACCAC-A--CCTAGTCTAG-G-----GAAT-A--TG-------------ATTAGG----------A---------C---CTAA--TTC-ATG---TC--TACA------------------------GCA-G-T-T-----TCT-GC-C--A--------AA-----------TG---C-TA-TT-ACG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCA-CC--G--A-CAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACGAT-CA--G-TCT-ACCC-A--A-C-C-TAGAT-----G-TG--A---T--A-GG-GA-GGA---GG--A----C-ACA-GGG-A-T--TTA-T-TT----AGGTCCAG-G---------GC--AGCAGCAGCGC---C------------T-G--GGG--A--GTTTTCTCA-A-----ACAGA-AG--ATAC-------C----C-C----TATCT--GT---AT--A-CCC-AG---C-TTACCC-----AA-CGCA--G-GC-AG-T--GC-AACC----A-G-C-T---A-----A--CGC-CT--AT--ATTC--CTCTG-ACGCG---TA---A-G-G--C-TA-G-A-TAA-AAG--G-A----TTTG--CAT-
gi|127882 : ttgggcggttaatgtcccatA-C-CC-CT-CTCAGA-AGAATTT-TAG--G-----A-AAAATAAATA---GGA-A--T--T----ACT---C-G--GTT--CCA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--AAC-ATG--C-A--TT--GAT--TC---T-CGA----C-A--CCCACTC-AG-G-----CA-TCA--TG-------------GT--GG----------A---------T---C--A--TG--ATG---TT--TACA------------------------GTA-G-T-T-----TCT-AT-C--C--------AG-----------TA---C-TG-T--GCG--G-ACC--CC--A-GGAGTA--TCATCTTAG--G-AAATTGCTTAATC----C---A-GTAA-CA-CCAC---T-TCGC--CA--G-CCT-GCCC-ATCG-CAC-CGAAAT----G-GC--GTCTT--A-TG-AA-G-G---GA--A----C-GCA--AT-A-T--TTC-TATT----AGGCCAAG-A---------GA--AGCAACAGTAC---TTGTCACAGACAAT-G--AAC--AATGTTTCCTCG-G-----T
gi|127883 : ttgcccacgtaagT-CACAGG-GC---TT-TAG--GGCCTAA-AG------TA---A-A-G--T-------A-T---T-G--GTG--GCG----G--CAT---AG---T-G-A-A--C-A-ATG--C-A--TTT-GAT--TC-C-T-CGA----CCG--CCTTCTC-AG-G------A-T----TT-------------GT--GG----------A---------T---C--AC-TTC-ATG---TT--TACA------------------------GCA-G-T-T-----TC-----------------------------------------------------------------TA--TCA-CC--G--GGTAACTGC----CC----T---A-GT-A-C--CCAC---T-GC----CA--G-C-T-GCCC-A--G-C-C-AGGGGAGGGGG-GG--G---C--A-GG-GA-AAG---GGG-A----C-GCA-GAT-A-T--TTC-T-TT----A-GCC-AG-A---------G---GGC----GCAT---C------------------GC--A--GTTTCCTC--G-----TCAGC-AG--CTGC-------C----CGCC---T-ACC--GT----T--GCTCC-AT---C-TTACCC-----CA-CACA--G-GC-AG----AC-CACCG---G-G-T-A---A-----G--CA---T--AT--AGTT--TTCTG-A---G---TA---T-A-C--T-TA-GAA-TGA-GAG--G-A----T-TA--GAT-G-AGAT-GACgtctctcaatgacagtttggccctttccctaaccaagttaaatcatgcccgtctatctaaacaatcccaaacatcaatgaatttcagcggccacgtaggtaagctacctaatgtttcattcttgactggacgtaattct
gi|127885 : c-G--GTT--CCA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-ATG--C-A--TTT-GAT--CC-C-T-CGA----C-G--CCCTCTC-AG-G-----GA-T-A--TG-------------GT--GG----------A---------C---C--A--TTC-ATG---TC--TACA------------------------GTA-G-T-T-----TCT-AC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-AGG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCA-CT--A--G-TAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ATGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-ATGAA-----G-GG--A---T--A-GG-GC-GGG---GG--A----C-GCA-GGG-A----TTC-T-TT----AGGCCGAG-A---------G---AGCAACAGCAG---C------------T-G--AAC--A--CTTTTCTCG-G-----TCAGC-AG--CTGC-------C----C-CC---TAAC--------AT------C-AG---C-TTACCC-----CA-CACA--G-TC-AG-C--GC-CACC----G-G-T-A---T-----G--CAC-CT--AT--GTTT--CTCTG-ACGTG---TA---A------------------------A-A----CCTG--AAT-GAAGAT-GACA
gi|127886 : --TTT-GAT--TC-C-T-CGA----C-G--CCCTCTC-AG-G-----GA-T-A--TGCGCCCTCTCAGGGAT--GA----------GACACTAGTCT---C--A--TTC-ATG---TT--TACA------------------------GCA-G-T-T-----TC-----------------------------------------------------------------TA--TCA-CC--G--G-TAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGGA-----G-GG--A---C--A-GG-GA-GGG---GG--A----C-GCA-GAG-A-T--TTC-T-TT----AGACCGAG-A---------G---A
gi|127887 : -T-CGA----C-A--TCCACTC-AG-G-----GA-T-A--TG-------------GT--GG----------A---------T---C--A--ATT-ATA---TC--TACA------------------------TAA-T-T-T-----TCT-AC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-GCG--G-ACC--CC--A-G--
gi|127888 : --CCAACCC-AG-G-----GC-T-A--TG-------------GT--TG----------A---------C---C--A--ACT-ATG---TC--AACA------------------------ACA-G-C-C-----CCT-AT-C--C--------AG-----------TG---C-TA-TG-GTG--G-ACC--C---A-G--ATG--TCA-CC--G--G-CGACTGC----CA----C---A-GT-A-T-----C---T--CACT-TA--G-CTT-GTCA-A--T-C-C-CGGAA-----G-GG--A---T--T-GG-GA-G----------------ACA-GGA-A-T--TTA-T-TC----AGGCCTAG-G---------G---GGAATCAGCAC---C------------C-T--AGCCAA--G--TCCTCG-G------AAGC-AA--CTAC-------CCATAC-CTGTGCAACCA-GT---A---ATTCC-AA---T-TTACCC-----TA-TGCA--G-GC-AG-T--GC-AATT----A-G-C-A---A-----G--CGC-CT--AT--GCCC--CTCAG-A
gi|127889 : --CCTACTC-AG-G-----GC-T-A--TG-------------GT--GG----------A---------C---C--A--TTA-ATG---TC--GACA------------------------G-A-GCT-C-----CCT-GA-T--C--------AG-----------AA---G-TA-TG-GTG--A-ACT--C
gi|127890 : CCACTC-CG-G-----GA-T-A--TA-------------GT--AA--------------------T---C--A--TTC-ATG---TC--GACA------------------------GCA-G-T-T-----TCT-AC-A--C--------AG-----------TG---C-CA-TG-GCG--G-ACT--CC--A-G--GTG--TCA-CT--G--G-CAAATGC----TC----T---A-GC-A-TA-TCAC---T-AGGCT-CA--G-CCT-GCCA-A--A-C-C-TGGAA-----G-GG--A---T--G-GG-GA-GGG---GG--G----C-ACA-GGG-A-T--TTC-T-TT----AGACCCAG-G---------G---TGCAGCAGCAT---C------------T-A--AGC--A--GTTTCCTCG-G-----GTAGC-AG--CTAC-------C----C-CC---TACCA--GT---AG--GCCCC-AG---C-TTACCC-----CA-CACA--G-GC-AG-C--GC-CACC----G-C-T-T---A-----G--CGC-TT--AT--GCTG--CTCTG-ACGCA---TA---A-G-A--C-TA-G-A-TAC-AAG--A-A----TCTG--
gi|127891 : CCACTC-CG-G------A-T-AC-TA-------------GT--AA--------------------T---C--T--TCC-ATG---TC--GACA------------------------GCA-G-T-T-----TCT-ACAC--T--------AG-----------TG---C-CA--G-GC---G-ATC--CA--A-G--GTG--T-A-CC--T--G-CAAATGC----TC----T---A-GC-A-AT-CCACTGGT-AGGCT-C---G-CCT-GCCA-A--ATC-C-TGGAA-----G-GGT-A---T--G-GG-GA-G-G---GG--G----C-ACA-GGG-A-TTATTCAT-TTA---AGACCAGG-G---------G---CGCAGCA--AT---C------------T-A--AGC--A--G-TTCCTCG-G-----GTAGC-AG--CT-C-------C----C-CT-----ACCCAGT---CA--GCCCCAAG---C-TTACCC------C-CACAACA-GC-AGCC--GC-CACC----G-C-T--------------TACGCT--AT--GCTG--CTCTG-ACGCAT--TA---A-G-A--C-TACG-A-TAC-AAGAAA-A----TCTG--
gi|127892 : ATTC-AG-G-----AA-T-A--TG-------------GT--GA----------A---------T---C--A--TTC-ATG---TC--AGCA------------------------GGA-G-C-A-----TCT-AT-A--C--------AG-----------TG---C-TA-TG-ATG--G-ACC--CC--A-G--ATG--TCA-TT--G--T-TGGCTGT----CC----C---A-GT-A-TC-TCAC---T-AAGGT-CA--G-CCT-GTCA-A--A-A-C-CTGAA-----G-GA--A---T--G-GA-GA-GAG---AG--A----C-ACA-GGG-A-T--TTC-T-TA----AGGACAGGCA---------GGCAGGCAGCAGCAC---C------------T-G--GGC--A--GTTTCCTCA-G-----GCAGC-TG--CTAC-------A----C-CC---TACCC--AT---AT--ACCTC-AT---C-CTAGCT-----CA-CACA--G-GC-A----------------------A---A-----G----C-CT--AT--GCCC--CTCTG-ATGCGTAATA---A-G-G--C-TA-A-A-GAC-AAG--G-
gi|127884 : -AA-G-----GA-T-AAGTG-------------GT--GG----------AA--------C---C--A--TTC-ATGGGATA--TACT------------------------GTA-G-TAT-----TCT-AAAC--C--------AGGAAAAAACAAATG---CATG-TA-GCGCGG-ACCAACT--A-G--ATA--TCA-CC--G--G-CAAC-GC----CC----A---G-AC-ATCA-TCAC---TTATGCTTCA--G-CCTTGTCC-A--A-C-C-CAGAA-----G-GG--A---T--A-GG-GA-GGG---GG--A----C-G-A-GGG-T-T--TTCCT-TT----CGGTCCAG-G---------G---CGCAGCAGCAC---C------------T-G--AGC--A--GTTTCCTAA-C-----TCAGC-AG--CTAC-------C----C-C----TAACC--TT---AT--GCTCC-AG---CTTTACCC-----AC-CA-A--C-GC-AG-C--GC-CACC----G-G-T-A---A-----G--CGC-CT--AT--GTTC--CTCT--ACCCG---TA---AGG-T--C-T
gi|127893 : ctcagagatatttaaggagaataaggagctcgtaggttcacaggaaagaacaatgctaagaaaccaagtgcaatttatgatcccagaacaccaaacaaatagaaaacacgatg-T-C-----TCT-AC-C--A--------AA-----------TG---C-TA-TG-GCG--G-AGC--CC--A-G--ATG--TCA-CC--A--G-CAACTGC----CA----T---A-AT-A-CA-CCTC---T-ACGCT-CACAG-TCT-ACCC-A--A-C-C-CGGAA-----G-GG--A---T--A-GG-GA-GGA---GG--A----C-GCA-GGG-A-T--TTC-T-TT----AGGTCCAG-G---------G---CGCAGCAGTGC---C------------T-G--GGC--A--GTTTTCTCA-G-----GCAAC-AG--CTACAAAGTACC----C-CC---TACCA--GT---AT--GCCCC-AG---C-TTAA-------TA-CAAAAAG-GC-AG-C--CC-CACC----G-C-C-A---A-----------------T--GTTC--CTCTG-ACGCG---TA---A-G-G--C-TA-G-A-TAC-AAG--G-A----TCTG--CAT-TATGAT-GGCA
gi|127869 : -TG-GTA--G-ACCATTC--A-T--GTA--T-A-CT--GCAG-TTTTTAC----CC--------A-GT-A-T---CAT---C-ACGC--CAT-G-CCT-GTCC-A--A-C-C-CTGAA-----G-GG--A---T--A-GG-GA-GGGAGGGG--A----C-GCA-GGA-A-T--TTC-T-TT----GGGCC--------------------CAGCAACAT---C------------T-G--AGC--A--GTTTCCACA-G--------GT-AG--TTTC-------C----C-C-----------GT---AT--GCCTA-AG---C-TTACCC-----A--CACA--G-GC-AG-C--AC-CACC----A-G-T-T---A-----G--CCC-CTAGCTATGTTT--CTCTG-AAGCG---TA---A-T-G--C-TA-A-A-TAC-AAG--G-A----CCTG--CAT-TATGAT-GACA
gi|127894 : tttgggggttgatgcccttaggtcgagtttgtacactgacatctctcaatgtataggaaataggactcgtagtcccatgctaagtaaccatgcatttgattcctcgacaccaactcagggaga--G-CCT-GTCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG--A---T--G-GG-GGCGGG---AA--A----C-GCA-GCG-A-T--GTC-T-TC----AGGCCCAG-A---------
gi|127895 : --G-CCT-GTCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG--A---T--G-GG-GC-GGG---AA--A----C-GCA-GCG-A-T--GTC-T-TC----A-GCCCAG-A---------
gi|127896 : CT-GCCC-A--A-C-C-CGGAA-----G-GG--A---T--A-GG----GAG---G---A----C-GCA-GGG-A-T--TGC-T-TT----AGGTCCAG-G---------G---
gi|127897 : GACCGAA-A---------G---A---ACAGCAC---C------------T-G--TAC--A--GTTTCTTAG-G-----TCAGC-AG--CTGC-------C----C-CC---TGAAC--GT---AT--GCCTC-AG---C-TTACCC-----CA-CACA--G-GC-AG-C--
gi|127898 : C---C------------T-G--GGC--T--GTTTTCTCG-G-----GGAAC-A----TAC-------C----C-CTCC-TACCA--GT---AT--GTCC--AG---C-TT---------TTACACA--A-AC-AG-CA-GC-CTCC----------A---C-----G--CGC---------ATTT--CTCTG-ACGCG---TA---G-G------CA-G-A-T----AA--G-A----T-TG--CAT-TATGAT-GGCA
gi|127900 : G-T--GC-CACC----G-G-T-T---A-----G--CGC-TT--AT--GTCC--CTCTC-ATACG---TAATGA-G-A--C-TA-G-A-TAC-AAG--G-A----TCTG--TGT-TATGAT-GACA
gi|127899 : cagaagG-T--GC-CACC----G-G-T-T---A-----G--CGC-TT--AT--GTCC--CTCTC-ATACG---TAATGA-G-A--C-TA-G-A-TAC-AAG--G-A----TCTG--TGT-TATGAT-GACA
gi|127871 : cagaagCTG-ACGCG---TA---AAG-T--C-CA-G-AATAG-AAG--GCA----TTTGTGAAT-CAAGAT-GACA
Alignments
lowQualScore : 222 1111111111 111111111111111111111111111111 1111111
lowQualScore : 444 1 4 55 2 555 2 555 1 0 555 3 5 44 22 1 3 8888 1 1 22 44444 3 555555 555 3 1 22 44 3333333333 1 22 44 77777777777 3 22 22 1 555 77777 3 1 22 1 1 22 22 1 44 1 1 3 1 6666 3333 222222222222222222222222222222 22 1 1 33333 1 555 66 1 22 1 7777777777 33 1 44 555 22 77777 1 2 1 33333 2 55555555555 88888888888 222 1 1 1 22 1 22 33 1 33 22 2222 1 3333 3333 222 1 1 3 33 444 3 1 33 1 1 1 5555 1 1 33333 1 777777 1 222 111 1 444 11 1 222 1 333 11 1 1 1 1 33333 11 5555 5555 333 222 777777777777 1 22 22 3 1111111 222 1 1 5555555 222 3333 444 22 3333 0 55 444444 444444 222 1 222 3333 1 1 1 66666 444 3333 1 3 22 555 1 44444 44444444 22 3 5555 222 22 1 1 222 777 555 1 666 1 1 1 1 33 22 1 4444 6666 22 0 2
lowQualScore : ... . . .. . ... . ... . . ... . . .. .. . . .... . . .. ..... . ...... ... . . .. .. .......... . .. .. ........... . .. .. . ... ..... . . .. . . .. .. . .. . . . . .... .... .............................. .. . . ..... . ... .. . .. . .......... .. . .. ... .. ..... . . . ..... . ........... ........... ... . . . .. . .. .. . .. .. .... . .... .... ... . . . .. ... . . .. . . . .... . . ..... . ...... . ... ... . ... .. . ... . ... .. . . . . ..... .. .... .... ... ... ............ . .. .. . ....... ... . . ....... ... .... ... .. .... . .. ...... ...... ... . ... .... . . . ..... ... .... . . .. ... . ..... ........ .. . .... ... .. . . ... ... ... . ... . . . . .. .. . .... .... .. . .
lowQualScore : 444 4 2 00 1 555 0 555 5 4 222 8 7 55 55 7 5 5555 7 7 44 33333 5 000000 444 5 7 44 11 5555555555 7 33 00 99999999999 3 33 44 7 444 99999 6 8 55 8 8 55 55 8 88 7 7 5 7 9999 5555 000000000000000000000000000000 00 4 4 66666 4 444 88 4 00 4 7777777777 44 4 88 999 00 11111 4 9 4 66666 9 88888888888 22222222222 666 5 5 5 00 5 00 77 5 77 22 8888 6 3333 3333 777 5 5 1 55 222 1 5 44 4 4 4 9999 4 4 44444 4 222222 4 444 999 4 888 99 4 444 4 888 99 4 4 4 4 44444 99 5555 9999 000 777 999999999999 5 33 33 3 1111111 999 7 7 4444444 555 5555 666 33 5555 1 66 888888 888888 999 7 999 5555 7 7 6 22222 444 4444 6 2 33 333 7 77777 77777777 11 3 2222 444 33 6 6 999 999 888 7 666 8 9 9 9 66 66 9 2222 1111 55 2 4
consensus : TTTG--GGGGGT-GA--TGC-CCC---TA-G---GTCGGGTTTGCAC---AC-T-AA--CCCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-G--CC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-TTC--ATG---TC--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TG---C-TG-TG-GCG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCACC---GG-CAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TAGG---GA-G-G-G---G--GAC-GC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----GG-A-GCAGCAGCAC---C------------T-GAGC--A--GTTTCCTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--CT----AACC--G------T------ATGCC---CC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---A-----G--C-GCCT-A----TGTT--CC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--NC-TA-G-A-TA-NAAG--G-A----TCTG-N--AT-GAAGAT-GACA
Reference ( family-523 ) : TTTG--TGGGGT-GA--TGC-CCC---TA-G---GTCGGGTTTGCAC---AC-T-AA--CCCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-G--CC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-TTC--ATG---TC--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TG---C-TG-TG-GCG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCACC---GG-CAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TAGG---GA-G-G-G---G--GAC-GC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----GG-A-GCAGCAGCAC---C------------T-GAGC--A--GTTTCCTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--CT----AACC--G------T------ATGCC---CC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---A-----G--C-GCCT-A----TGTT--CC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--NC-TA-G-A-TA-NAAG--G-A----TCTG-N--AT-GAAGAT-GACA
gi|127862 : TTTGCATGGGGT-GA--TGA-TCC---TA-G---GTCGGGTTTGCAC---AT-T-AA--CCCT--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTTAT-CGA----T-G--CC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGG-T----------C--A-TTC--ATG---TC--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-GCG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCACT---GG-TAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------G-TAGG---AA-G-A-G---G--AAC-AC---A-GAGA---C--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----AG-A-GCAACAGCAC---C------------T-GAAC--A--GTTTCCTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--TT----AACC--G------T------ATGCC---CC-AG---CT----TACCC-TTC-AT-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---A-----G--C-ACCT-C----TGTT--TC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--TC-TA-G-A-TA-GAAG--G-A----TCTG-A--AT-GAAGAT-GACA
gi|127863 : TTTG---GGGGT-GA--TGC-TCC---TA-G---GCCGGGTTTGCAC---AC-T-AA--CCCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-A--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C------A---A-G-A-A--T-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTTTT-CGA----C-A--TC--------------CA--------------T--TC-AG-G-----GA-T---A--TAG-T--GGA-T----------C--A-TTC--ATG---TC--TACA-----GTA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-GCG--G-ACC--CC--T-A--ATA--TCACT---GG-TAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAT---T-TCGCT-CA--G-CTT-GCCC-A--T-C-C-CGAAA-----G-AG------A-GAGG---AA-T-G-G---G--GAC-GC---A-TGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----AG-A-GTAACAGCAC---C------------T-GAAC--A--GTTTCCTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----A---C--CT----AACC--G------T------GTGCC---CC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---A-----G--C-ACCT-A----TGTT--TC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--TC-TA-G-A-TA-GAAG--G-A----TTTG-A--AT-GAAGAT-GACA
gi|127864 : TTTG---GGGGT-GA--TGC-TCC---TA-G---GTCGGGTTTG-AC---AC-T-AA--CCCC--T-CTTAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---T-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----T-G--TC--------------CT--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-T----------C--A-TTC--ATG---TT--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTAC-T--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-CCG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCACT---GG-TAACTGC----CCTAGGT---A-GT-A-TA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TACG---GA-A-G-G---G--GAC-AC---A-GGGA---T--TC-A-T-TT-AG-----GC--CG---AG----AG-A-GCAACATCAC---C------------T-GAAC--A--GTTTCCTTG-G------TCG---GC-AG-T-------T--GCC----C---C--CT----AA----G-----------------C---TC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--C-T-A-T-G---A-----A--C-ACCA-T----TGTT--TC--TC-TA-AT---GCGT--TA---A-G--TC-TA-G-A-TA-GAAG--G-A----TCTG-A--AT-GAAGAT-GACA
gi|127865 : GGGGT-GAAATGCTCCC---TT-A---GTTGGGTTTTCAC---AC-T-AA--CACCATC-CTCAGAAG----TT-CA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--TTAATA-T---C-G---TT--C-----------CA-T--GTGC-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTTCTTCGA----T-A--CC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-T----------C--A-TTC--ATG---TCCTTACA-----GTA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TAAATC-TGGTG-GCG--G-ACC--CCC-A-G--ATA--TCACT---GG-TAACTGC----CC----T---ATGT-A-CAACCAC---T-TCGCT-CA--G-CCT-GCCCCA--T-A-C-CCGAA-----A-GA------A-TAGG---AA-G-G-G---G--GACCGC---AAGGGA---T--TT-C-T-TT-A------GC--CG---AGA---AG-A-GCAACAGCAC---C------------T-GAAC--A--GTTTCCTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--G-C----C---C--CT----AACC--G------T------ATG-C---TC-AG---CT----TACCCTCACAAC-G-----G---T----AAG-C-GCCAC--C-G-G-TAA---A-----G--C-ACCTAA----TGTT--TC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-GTCCC-TA-G-A-TA-GAAG--G-A----TTTG-A--AT-GAAGAT-GA
gi|127866 : ttagTTTG--GGGGTT-GA--TGC-CCC---TA-G---GTCGGGTTTGTAC---AC-T-AA--CCCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--C--T----C-C---T-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---T-G-A-A--C-A-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-A--CC--------------CA--------------C--TC-GG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-CCATTCAATGAC--A-TTC--ATG---TC--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTAC-A--C--------AT-----------TG---T-TG-TG-GCG--A-ACC--CC--A-G--ATA--TCACC---GG-CAACTGC----CC----T---T-GT-A-CA-TCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--A-C-C-CGGAC-----A-AA------T-TAGC---GA---G-A---G--GAT-GC---A-GGGT---T--TT-C-C-TT-AG-----GC--CC---AG----GA-A-GCAGCAACAC---C------------T-GAGC--A--GTGTCTTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--ACC----C---C--CT----ACAC--G------T------ATGCC---CC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--T-G-GTT-A---ATACATG--T-ACCT-A----TGTT--CA--TC-TG-GC---GCG---CA---A-G--
gi|127867 : TTTG--GGGGTT-GA--TGC-CCC---TA-A---GTCCGGGTTGTAC---AC-T-GA--ACCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--C--T----C-C---T-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---T-G-A-A--C-C-A--TG--T-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-A--CC--------------CA--------------G--TC-AG-T-----GA-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-TTC--ATA---TC--TACA-----GCA-G-T-C-----TCTAC-C--A--------AA-----------TG---C-TA-TG-GCG--G-ACG--CC--A-G--ATG--TCACC---GG-CAACTGC----CC----T---A-AT-A-CA-CTTC---T-ACACT-CA--G-TCT-GCCC-A--A-T-C-CGGAA-----G-GA------A-TAGG---GA-T-G-A---G--GAC-GC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----CT--CC---AG----GG-C-ACAGCAGTGC---C------------T-GGGC--A--GTTTTCTCG-G------GCA---AC-AG-C-------T--ACC----C---C--CT----ACCA--G------T------ATACC---CC-AG---CT----TA-----AC-ACAA-----A---A----CGG-C-G-CAC-----------------------C-GCCA-A----TGTT--CT--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--GC-TA-G-A-TA-CAAG--A-A----TCTG-C--AT-TATGAT-atct
gi|127868 : TTTG---GGGGT-GA--TGC-TCC---TA-G---GTCGGGTTTGTAC---AC-T-AA--CCCC--T-CTCACA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-C--TTAT----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--
gi|127869 : TTTG--GGGGTT-GA--TGC-CCT---TA-G---GTCGAGTTTGTAC---AC-T-GA--CATC--T-CTCAAT-G----TA-TA-G--G-----A-AA------TA---G-G-A--C--T----------C-GTAGTC--C-----------CA-T--G--C-T---AA---G-T-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-A--CC--------------AA--------------C--TC-AG-G-----GA-G---A--TGG-T--AGA-C----------C--A-TTC--ATG---TA--TACT-----GCA-G-T-T-----TTTAC-C--C--------AG-----------T
gi|127869 : ----CC----C---A-GT-A-T---CAT---C-ACGC--CAT-G-CCT-GTCC-A--A-C-C-CTGAA-----G-GG------A-TAGG---GA-G-G-GAGGG--GAC-GC---A-GGAA---T--TT-C-T-TT-GG-----GC--C----------------CAGCAACAT---C------------T-GAGC--A--GTTTCCACA-G------------GT-AG-T-------T--TCC----C---C--------------G------T------ATGCC---TA-AG---CT----TACCC--AC-AC-A-----G---G----CAG-C-ACCAC--C-A-G-T-T---A-----G--C-CCCT-AGCTATGTT--TC--TC-TG-AA---GCG---TA---A-T--GC-TA-A-A-TA-CAAG--G-A----CCTG-C--AT-TATGAT-GACAatcatcacgccatgcctgtccaaccctgaagggatagggagggaggggacgcaggaatttctttgggcccagcaacatctgagcagtttccacaggtagtttccccgtatgcctaagcttacccacacaggcagcaccaccagttagcccctagctatgtttctctgaagcgtaatgctaaatacaaggacctgcattatgatgaca
gi|127870 : tttgggggttgatgcccttaggtcgagtttgtacactgacatctctcaatgtataggaaataggactcgtagtcccatgctaagtaaccatgcatttgattcctcgacaccaactcagggagatggtagaccattcatgtatactgcagtttttaTTTG--GGGGTT-GA--TGC-CCC---TA-G---GTCGGGTTTGTAC---AC-T-GA--GCCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--A-----A-AA------CA---G-A-G--C--T----C-G---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---A------GTA-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-TAA----C-A--CC--------------CA--------------G--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-TTC--TTG---TC--TACATCAGAGCA-G-T-T-----TCTAC-C--A--------AA-----------TG---C-TA-CA-GCG-----------------------TCACC---AG-CATTTGC----CC----T---A-GT-A-AA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-TCT-GCCC-A--A-C-C-CGAAA-----G-GA------A-TAGG---GA-G-G-A---G--AAC-GC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AA-----GC--CA---AG----GG-C-ACAGGAGCGC---C------------T-G
gi|127871 : TTTGGTTTGGGT-GA--T---CCC---TA-G---CTCGGATT-GCAC---ACGT-AA--CCCT--TTCTCAGA---------TA-G--G-----A-AA-------A---G-A----T--T----A-TAATC-G--GTT--C------------A-T--G--C-T---AGC--A-G-A-A--G-C-A---G--C-----T-T-GA-T-CTT-CGA----C-C--AC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-A----------T--A-TT-----A---TC--TACA-----GTA-G-T-T-----T-TAC-C-----------AG-----------TA---C-TG-TGCGCG--G-ACC--CC--AAG--ATA--TCACT---GG-TAA--GC----CC----A---C-GT-AACA-CCAC---T---GCT-CA--G-CCC-TCCC-A----C-C-CGAAA-----T-G-------A-TAGA---AA-G-G-G---G--AGC-AC-----GGGA---T--T--C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----CG-A-GCAACAGCA----C------------T-GAAC--A--GTT---CCG-G------T-A---GCAAG-C-------T--GCC----C---C--GT----AACC--G------T-------TCCC---CC-AG---CT----TACCC-
gi|127871 : C-TG-AC---GCG---TA---AAG--TC-CA-G-AATA-GAAG--GCA----TTTG-TGAAT-CAAGAT-GACAagggattcaacggcgcgcaacaaaaacccacagaggcatcagtaaaaattcgaacatagtaacccggttagcctacaaaaacctgacgcgtaaagtccagaatagaaggcatttgtgaatcaagatgaca
gi|127872 : tttggtttgggtgatccctagctcggattgcacacgtaaccctttctcagataggaaaagattataatcggttcatgctagcagaagcagcttgatcttcgaccaccactcagggatatggtggaatattatctacagtagttttaccagtactgtgcgcggaccccaagatatcactggtaagcccacgtaacaccactgctcagccctcccacccgaaatgatagaaaggggagcacgggattctttaggccgagcgagcaacagcactgaacagttccggtagcaagctgccccgtaaccgttcccccagcttacccagggattcaacggcgcgcaacaaaaacccacagaggcatcagtaaaaattcgaacatagtaacccggttagcctacaaaaacTTTG---GGGATAGA--TGC-A-----TA-G---GTCTGGTTTGCAC---AC-T-GA--CCCT--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----G-AA------TA---G-G-A--T--C----G-----C-G--TTT--T-----------CA-T--G--C-C---AG---C-A-A-A--T-C-A--TA--C-A--TT-C-GA-TTC---TGA----C-A--CC--------------CA--------------
gi|127873 : TTTG---GGGTT-GA--TGC-CCC---TATG---TTCGGG-TTGTAC---AC-T-GA--ACCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--C--T----C-C---T-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---A
gi|127874 : --TGGAGT-GAA-TGC-TCC---TA-G---GTCGGGTT-GCAC---AC-TTAA--CCCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-A--G--C-CTAAAA---A-A-A-A--A-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-G--CC--------------CT--------------C--TC-AG-G------A-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-T-C--A-G---TC--TAGA-----GTA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-GCG--A-ACC--CC--A-C--ATA--TCATT---GG-T--CTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ATACT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------T-TAGG---CG-A-G-G---G--GAT-GCCAGA-GGCA---T--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----AG-A-GCAACAGCAC---C------------T-GAAC--A--GTTT-CTCGCG------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--CT----AACC--G------T------ATGCC---CC-AG---TT----TACCC-CAC-AC-A-----A---G----CAG-C-GCCAC--C---G-T-A---A-----G--C-ACCT-T----TGTT--TC--TC-TG-AA---GCG---TA---A-G--TC-TA-G-A-TA-GAAG--G-A----TCTG-A--AT-GAAGAT-GACA
gi|127875 : tt--TGGAGT-GA--TGT-CC----TA-G----TCGGCGTTGCAC---AC-TTAA--CCCC----CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-CTA-AA---A-A-A-A--A-C-A--TGCCC-A--TT-T-GA-TTCCT-C-A----C-G--CC--------------C---------------C--TC-AG-G-----GA-TC--A--T-G-T--GGA-C----------C--A-TTC--ATG---TC--TAGA-----G-A-GTT-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-GC---A-ACC--CC--A-AT-ATA--TTG-C---GT-CAA-TGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACTAC-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------T-TAGG---GA-G-G-G---GATGCC-GC---A--GGA---T--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----AG-A-GCAACAGCAC---C------------T-GAAC--A--GT---CTCGCG------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--CT----AACC--G------T------ATGCC---CC-AG---TT----TACCC-C-C-AC-A---------G----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---A-----GCCC-ACCT-T----TGTT--TC--TC-TG-AA---GCGC--TA---A-G--TC-TA-G-A-TA-GAAG--G-A----TCTGAA--AT-GAAGAT-
gi|127876 : ttGGTT-AA--TGT-CCCATCTA-G---ATCATGGTTGTACT--AA-G-AA--CTCC--T-CCCAAA-T----GT-TA-GACG-----ATAA------TA---G-A-GGCT--C----A-TAGCT-G--GT---------------CA-TTTG--C-T---AT---GTG-A-AGTC-C-A--TG--CCA--TT-TTGA-TTCCT-CGAACCAC-A--CC--------------TA--------------G--TCTAG-G-----GAAT---A--TGA-TTAGGA-C----------CTAA-TTC--ATG---TC--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTGC-C--A--------AA-----------TG---C-TA-TT-ACG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCACC---GA-CAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACGAT-CA--G-TCT-ACCC-A--A-C-C-TAGAT-----G-TG------A-TAGG---GA-G-G-A---G--GAC-AC---A-GGGA---T--TT-A-T-TT-AG-----GT--CC---AG----GGCA-GCAGCAGCGC---C------------T-GGGG--A--GTTTTCTCA-A------ACA---GA-AG-A-------T--A-C----C---C--CT----ATCT--G------T------ATA-C---CC-AG---CT----TACCC-AAC-GC-A-----G---G----CAG-T-GCAAC--C-A-G-C-T---A-----A--C-GCCT-A----TATT--CC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--GC-TA-G-A-TA-AAAG--G-A----TTTG-C--AT-
gi|127877 : ttgggcTTG--GGGGTT-GA--TGC-CCC---GA-G---GTCGGGTTTGTAC---AC-T-GAG-CCCT--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--A-----A-AA------CA---GGA-G--C--T----C-G---C-G--GTTT-C-----------CA-T--G--C-T---A------GTA-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-T-CCT-TAA----C-A--CC--------------CA--------------T-----AG-G-----GA-T---A---GG-T--GGA-C----------C--T-TACT-ATGGG-TC--TACATCAGAGCA-G-T-T------CTAC-C--C--------AAA----------TG---C-TA-CA-GCA--A-AC--------------G--TCAC----AG-CA-TTGC----CC----T---A-GT-A-AA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-TCT-GCCC-A--A---C-CGGAA-----A-GGTA----A-TAGG---GA-G-GAG---A--AAC-GC---A-GGGAT--T--TT-C-T-TT-AA-----GC--CC---AA----GG-C-ACAGGAGC-C---C------------T-G
gi|127878 : TTG--AGTGGTCGA--TGC-TCCA--TA-G----TCGAGCT--CACCGAAC-T-AA--CCCT--A-CTCAG--G----TT-TA-T--G-----A-AG------AATCCG-A-G--TA-T----A-T---CCG--GTT--C-----------CAAT--G--C-T---AATATA-G-A-A--C-CGA--TG--C-AAGTA-T-GACTTCCT-CGAT---C-GTCCC--------------CT--------------C--TC-AGTGCACCTGA-T---GACTGG-T--GGA-T----------CG-A-TTCT-ATGG--TT--TACA-----TCGTA-T-TACTGGTCTAC-C--CGGGCCTAAAG-----------TG---C-TG-TG-GTG--GTACC--CC--A-T--ATAATCCTCT---GG-TTACTGC----CC----TCCTA-GT-A-CAACCACC--T-ACGCT-CA--G-GCT-GCCC-A--G-C-CGCGGAA-----T-GG------ATTAGGGGAGA-G-G-GCACG--GCC-GC---A-GGGAAATT--CT-T-T-TT-AGAGACCGCGACG---AGCTAATA-A-GCAACAGCACAGTC------------TAGAAC--A--GTTTCACCG-GGGAGC-TCA---AC-AATC-------T--TGC----C---C--CT----AAAC--GATTTAAT------GCGCC---CT-AGAGTCT----TA-TT-CAC-AC-A-----GCTAG----CA--C-GCCTT--CGG-G-T-AAATA-----A--C-ACCT-AT---TGTTTACT--TC-CATAA---ACA---CA---A-GT-ACATA-G-A-AAGCAAG--G-AATGCTC-G-A--ATGGAAGATAGACAtaaactggtctcc
gi|127879 : GGTT-GA--TGC-CCT---AA-G---GTCCGGTT-GT-C---AC-TGAA--CGCT--C-CTCAGATG----TTATA-G--------A-AA------TT---G-ATG--C--T----GCT---C-T--GGT--C-----------CA-T--G----T---AA---T-G-AGA--T-C-A---G--T-A--TT-T-GA-TTCC--CGAT---C-A--CC--------------CA--------------G--TC-AG-T-----GT-A---A--TGGGT--GGA-C----------A--A-TTTCGATA---T---TACA------CA-G-T-C------CTAC-G--A--------AA-----------TG---C--A-TG-G-G--G-ACC--AG--A-A--A-A--TCACG---TG-CAACTGC----CC----T---A-AT-A-CA-T--C---TAACACT-CA--G-TC--GCCC-A----T-T-CGGAA-----GAGA------A-TAGG---GA-T-A-G---G--A---GC---T-AGGA---T--T
gi|127880 : gaGGGGT-GA--TGC-TCC---TA-GCGTGTCGG------AC---AC-T-AA--CC----T-TTCAGA-G----TT-TA-G--------A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G---TT--C-----------C----------T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C----TT-T-GA-TTCTT--GA------G--CC--------------CT--------------C--TC-AG-G-----GA-T---AA-TGG-T--GGA-T-------------A-TTC--ATG---TT--TA-A-----GCA-G-T-T-----T-TAC-CATC--------AT-----------CG-----TG-TG-G-G--G-ACC--CCCAA-G--ATA--TTACT---GG-TAACT------CC----T---A-GT-A-C--CTAC---T-ACGCT--A--GTCCT-GCCC-A--G-C----GGAA-----T-GG------A-TAGG---G----G-G---G--GAC-GC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----G--A-GCAACAGCAC---C------------T-GAA---A--GTTTCCTCG--------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C-------T----AAAT--G------T------ATGCC---C--AT---CT----TACCC-T-T-AC-A-----GC--G----CAG-A-GC-AT--C-GCG-T-A---A-----G--C--CCT-A----TGTT--TC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-GT-AC-TA-G-A--A-GAAG--G-A----TCTG-A--AT-GAAAAT-GACAcatatcatagtttagcagtgagaaacacagca
gi|127881 : gCC---TA-GT--GTCGGCTTTGCAC---AC-T-AA--CCCC--T-CTCAGT-G----TT-TA-G--A-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---T-C--GTTTCC-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A---T-T-GATTTCCT-CAA----T-G--CC--------------CT--------------T--TC-AG-G-----GA-T---A--T-G-T--GGA-T----------C--A-TTC--ATG---TT--TACA-----GTA-
gi|127882 : gggctgtgtTTGCCC---ACGT-AAGACCCC--T-CTCAGA-AGAATTT-TA-G--G-----A-AAAATAAATA---GGA-A--T--T----ACT---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--AAC-A--TG--C-A--TT---GA-TTC-T-CGA----C-A--CC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----CA-TC--A--TGG-T--GGA-T----------C--A--TG--ATG---TT--TACA-----GTA-G-T-T-----TCTAT-C--C--------AG-----------TA---C-TG-T--GCG--G-ACC--CC--A-GGAGTA--TCATCTTAGG-AAATTGCTTAATC----C---A-GTAA-CA-CCAC---T-TCGC--CA--G-CCT-GCCC-ATCG-CAC-CGAAA-----T-GGCGTCTTA-T------GA-A-G-G---G--AAC-GC---A--ATA---T--TT-C-TATT-AG-----GC--CA---AGA---GA-A-GCAACAGTAC---TTGTCACAGACAAT-GAAC--AATGTTTCCTCG-GTGTCTCTCAATGAC-AG-T-------TTGGCCCTTTC---C--CT----AACCAAG------TTAAATCATGCCCGTCT-AT---CTAAACAATCC-CAA-AC-ATCAATG---AATTTCAG-CGGCCACGTA-G-G-T-A---A-----G--CTACCTAA----TGTT--TCATTCTTG-ACTGGACG---TA---A-T--TC-Ttaaaaacttgtacggtcttacgcagttttctaacccagtactgtg
gi|127883 : C--T-CACAGG-GC---TT-TA-G--GGCCTAA-AG------TA---A-A-G--T-------A-T---T-G--GTG--G-----------CG----G--CAT---AG---T-G-A-A--C-A-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----CCG--CC--------------TT--------------C--TC-AG-G------A-T------TTG-T--GGA-T----------C--ACTTC--ATG---TT--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTA------------------------------------------------------------------TCACC---GGGTAACTGC----CC----T---A-GT-A-C--CCAC---T-GC----CA--G-C-T-GCCC-A--G-C-C-AGGGGAGGGGG-GG------G-CAGG---GA-AAG-G---G--GAC-GC---A-GATA---T--TT-C-T-TT-AG-----CC--AG---AG----GG-C-GCATC-------------------------GC--A--GTTTCCTC--G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----CG--C--CT-----ACC--G------T-------TGCT---CC-AT---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG---ACCAC--CGG-G-T-A---A-----G--C-A--T-A----TAGT--TT--TC-TG-A------G---TA---T-A--CT-TA-GAA-TG-AGAG--G-A----T-TA-G--AT-G-AGAT-GAC
gi|127884 : -CTCAGA-GATA-TT-TAAG--G-----AGAA------TAAG-G-A-G--C--TC---G-T---A-G--GTT--CACAGGAAAGAACAAT--G--C-T---AA---G-A-A-A--C-C-AAGTG--C-AATTTAT-GA-TCCCA-GAA----C-A--CCAAACAAATAGAAAACA--------------CGATG-AA-G-----GA-T---AAGTGG-T--GGAAC----------C--A-TTC--ATGGGATA--TACT-----GTA-G-TAT-----TCTAAAC--C--------AGGAAAAAACAAATG---CATG-TA-GCGCGG-ACCAACT--A-G--ATA--TCACC---GG-CAAC-GC----CC----A---G-AC-ATCA-TCAC---TTATGCTTCA--G-CCTTGTCC-A--A-C-C-CAGAA-----G-GG------A-TAGG---GA-G-G-G---G--GAC-G----A-GGGT---T--TTCC-T-TT-CG-----GT--CC---AG----GG-C-GCAGCAGCAC---C------------T-GAGC--A--GTTTCCTAA-C------TCA---GC-AG-C-------T--A-C----C---C--CT----AACC--T------T------ATGCT---CC-AG---CT----TTACC-CAC-CA-A-----C---G----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---A-----G--C-GCCT-A----TGTT--CC--TC-T--AC---CCG---TA---A-G--
gi|127885 : -G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TCCCT-CGA----C-G--CC--------------CT--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-TTC--ATG---TC--TACA-----GTA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-AGG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCACT---AG-TAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ATGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-ATGAA-----G-GG------A-TAGG---GC-G-G-G---G--GAC-GC---A-GGGA------TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----AG-A-GCAACAGCAG---C------------T-GAAC--A--CTTTTCTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--CT----AAC-----------------AT-------C-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---T----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---T-----G--C-ACCT-A----TGTT--TC--TC-TG-AC---GTG---TA---A-A--AC-------------------------CTG-A--AT-GAAGAT-GACAgtct
gi|127886 : --TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-G--CCCTCT----------CAGGGATATGCGCCCTC--TC-AG-G-----GA-TGAGA--CAC-T--AGT-CT---------C--A-TTC--ATG---TT--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTA------------------------------------------------------------------TCACC---GG-TAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGGA-----G-GG------A-CAGG---GA-G-G-G---G--GAC-GC---A-GAGA---T--TT-C-T-TT-AG-----AC--CG---AG----AG-A-
gi|127887 : T-CGA----C-A--TC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-T----------C--A-ATT--ATA---TC--TACA-----TAA-T-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-GCG--G-ACC--CC--A-G--
gi|127888 : --CC--------------AA--------------C--CC-AG-G-----GC-T---A--TGG-T--TGA-C----------C--A-ACT--ATG---TC--AACA-----ACA-G-C-C-----CCTAT-C--C--------AG-----------TG---C-TA-TG-GTG--G-A-C--CC--A-G--ATG--TCACC---GG-CGACTGC----CA----C---A-GT-A-T-----C---T--CACT-TA--G-CTT-GTCA-A--T-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TTGG---GA-G--------------AC---A-GGAA---T--TT-A-T-TC-AG-----GC--CT---AG----GG-G-GAATCAGCAC---C------------C-TAGCCAA--G--TCCTCG-G-------AA---GC-AA-C-------T--ACC----CATAC--CTGTGCAACCA-G------T------A-ATT---CC-AA---TT----TACCC-TAT-GC-A-----G---G----CAG-T-GCAAT--T-A-G-C-A---A-----G--C-GCCT-A----TGCC--CC--TC-AG-A
gi|127889 : --CC--------------TA--------------C--TC-AG-G-----GC-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-TTA--ATG---TC--GACA-----G-A-GCT-C-----CCTGA-T--C--------AG-----------AA---G-TA-TG-GTG--A-ACT--C
gi|127890 : C--------------CA--------------C--TC-CG-G-----GA-T---A--TAG-T--A-A-T----------C--A-TTC--ATG---TC--GACA-----GCA-G-T-T-----TCTAC-A--C--------AG-----------TG---C-CA-TG-GCG--G-ACT--CC--A-G--GTG--TCACT---GG-CAAATGC----TC----T---A-GC-A-TA-TCAC---T-AGGCT-CA--G-CCT-GCCA-A--A-C-C-TGGAA-----G-GG------A-TGGG---GA-G-G-G---G--GGC-AC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----AC--CC---AG----GG-T-GCAGCAGCAT---C------------T-AAGC--A--GTTTCCTCG-G------GTA---GC-AG-C-------T--ACC----C---C--CT----ACCA--G------T------AGGCC---CC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--C-G-C-T-T---A-----G--C-GCTT-A----TGCT--GC--TC-TG-AC---GCA---TA---A-G--AC-TA-G-A-TA-CAAG--A-A----TCTG-
gi|127891 : C--------------CA--------------C--TC-CG-G------A-T---AC-TAG-T--A-A-T----------C--T-TCC--ATG---TC--GACA-----GCA-G-T-T-----TCTACAC--T--------AG-----------TG---C-CA--G-GC---G-ATC--CA--A-G--GTG--T-ACC---TG-CAAATGC----TC----T---A-GC-A-AT-CCACTGGT-AGGCT-C---G-CCT-GCCA-A--ATC-C-TGGAA-----G-GGT-----A-TGGG---GA-G-G-G---G--G-C-AC---A-GGGA---TTATT-CAT-TTAAG-----AC--CA---GG----GG-C-GCAGCA--AT---C------------T-AAGC--A--G-TTCCTCG-G------GTA---GC-AG-C-------T----C----C---C--CT----ACCCA-G------T------CAGCC---CCAAG---CT----TACCC-C-C-AC-AAC---A---G----CAGCC-GCCAC--C-G-C-T-T---A--------C-G-CT-A----TGCT--GC--TC-TG-AC---GCAT--TA---A-G--AC-TACG-A-TA-CAAGAAA-A----TCTG-
gi|127892 : A--------------T--TC-AG-G-----AA-T---A--TGG-T--GAA-T----------C--A-TTC--ATG---TC--AGCA-----GGA-G-C-A-----TCTAT-A--C--------AG-----------TG---C-TA-TG-ATG--G-ACC--CC--A-G--ATG--TCATT---GT-TGGCTGT----CC----C---A-GT-A-TC-TCAC---T-AAGGT-CA--G-CCT-GTCA-A--A-A-C-CTGAA-----G-GA------A-TGGA---GA-G-A-G---A--GAC-AC---A-GGGA---T--TT-C-T-TA-AG-----GA--CAGGCAG----GC-AGGCAGCAGCAC---C------------T-GGGC--A--GTTTCCTCA-G------GCA---GC-TG-C-------T--ACA----C---C--CT----ACCC--A------T------ATACC---TC-AT---CC----TAGCT-CAC-AC-A-----G---G----CA-------------------A---A----------GCCT-A----TGCC--CC--TC-TG-AT---GCGTAATA---A-G--GC-TA-A-A-GA-CAAG--G-
gi|127893 : -T-C-----TCTAC-C--A--------AA-----------TG---C-TA-TG-GCG--G-AGC--CC--A-G--ATG--TCACC---AG-CAACTGC----CA----T---A-AT-A-CA-CCTC---T-ACGCT-CACAG-TCT-ACCC-A--A-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TAGG---GA-G-G-A---G--GAC-GC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----GT--CC---AG----GG-C-GCAGCAGTGC---C------------T-GGGC--A--GTTTTCTCA-G------GCA---AC-AG-CTACAAAGT--ACC----C---C--CT----ACCA--G------T------ATGCC---CC-AG---CT----TAATA-CAA-AA-A-----G---G----CAG-C-CCCAC-----------------------C-GCCA-A----TGTT--CC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--GC-TA-G-A-TA-CAAG--G-A----TCTG-C--AT-TATGAT-GGCA
gi|127894 : --G-CCT-GTCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TGGG---GGCG-G-G---A--AAC-GC---A-GCGA---T--GT-C-T-TC-AG-----GC--CC---AG----
gi|127895 : --G-CCT-GTCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TGGG---GC-G-G-G---A--AAC-GC---A-GCGA---T--GT-C-T-TC-AG-----CC--Ca
gi|127896 : CT-GCCC-A--A-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TAGG---GA---------G--GAC-GC---A-GGGA---T--TG-C-T-TT-AG-----GT--CC---AG----GG-aga
gi|127897 : G-----AC--CG---AA----AG-A-ACAGCA---C---C------------T-GTAC--A--GTTTCTTAG-G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--CT----GAAC--G------T------ATGCC---TC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-
gi|127898 : C---C------------T-GGGC--T--GTTTTCTCG-G------GGA---AC-A----------T--ACC----C---CTCCT----ACCA--G------T------ATGTC---C--AG---CT----T---T-TAC-AC-A-----A---A----CAG-CAGCCTC--C-------A---C-----G--C-GC---------ATT--TC--TC-TG-AC---GCG---TA---G-G--C---A-G-A-TA-A-----G-A----T-TG-C--AT-TATGAT-GGCA
gi|127899 : C-A-----G---A----AGG-T-GCCAC--C-G-G-T-T---A-----G--C-GCTT-A----TGTC--CC--TC-TC-AT---ACG---TAATGA-G--AC-TA-G-A-TA-CAAG--G-A----TCTG-T--GT-TATGAT-GACA
gi|127900 : C-A-----G---A----AGG-T-GCCAC--C-G-G-T-T---A-----G--C-GCTT-A----TGTC--CC--TC-TC-AT---ACG---TAATGA-G--AC-TA-G-A-TA-CAAG--G-A----TCTG-T--GT-TATGAT-GACA
Alignments
lowQualScore : 1111111111 111111111111111111111111111111 1111111
lowQualScore : 22 0 4 55 2 555 2 555 1 0 555 3 5 44 22 1 3 8888 1 1 22 44444 3 555555 555 3 1 22 44 3333333333 1 22 44 77777777777 3 22 22 1 555 77777 3 1 22 1 1 22 22 1 44 1 1 3 1 6666 3333 222222222222222222222222222222 22 1 1 33333 1 555 66 1 22 1 7777777777 33 1 44 555 22 77777 1 2 1 33333 2 55555555555 88888888888 222 1 1 1 22 1 22 33 1 33 22 2222 1 3333 3333 222 1 1 3 33 444 3 1 33 1 1 1 5555 1 1 33333 1 777777 1 222 111 1 444 11 1 222 1 333 11 1 1 1 1 33333 11 5555 5555 333 222 777777777777 1 22 22 3 1111111 222 1 1 5555555 222 3333 444 22 3333 0 55 444444 444444 222 1 222 3333 1 1 1 66666 444 3333 1 3 22 555 1 44444 44444444 22 3 5555 222 22 1 1 222 777 555 1 666 1 1 1 1 33 22 1 4444 6666 22 0 2
lowQualScore : .. . . .. . ... . ... . . ... . . .. .. . . .... . . .. ..... . ...... ... . . .. .. .......... . .. .. ........... . .. .. . ... ..... . . .. . . .. .. . .. . . . . .... .... .............................. .. . . ..... . ... .. . .. . .......... .. . .. ... .. ..... . . . ..... . ........... ........... ... . . . .. . .. .. . .. .. .... . .... .... ... . . . .. ... . . .. . . . .... . . ..... . ...... . ... ... . ... .. . ... . ... .. . . . . ..... .. .... .... ... ... ............ . .. .. . ....... ... . . ....... ... .... ... .. .... . .. ...... ...... ... . ... .... . . . ..... ... .... . . .. ... . ..... ........ .. . .... ... .. . . ... ... ... . ... . . . . .. .. . .... .... .. . .
lowQualScore : 99 5 2 00 1 555 0 555 5 4 222 8 7 55 55 7 5 5555 7 7 44 33333 5 000000 444 5 7 44 11 5555555555 7 33 00 99999999999 3 33 44 7 444 99999 6 8 55 8 8 55 55 8 88 7 7 5 7 9999 5555 000000000000000000000000000000 00 4 4 66666 4 444 88 4 00 4 7777777777 44 4 88 999 00 11111 4 9 4 66666 9 88888888888 22222222222 666 5 5 5 00 5 00 77 5 77 22 8888 6 3333 3333 777 5 5 1 55 222 1 5 44 4 4 4 9999 4 4 44444 4 222222 4 444 999 4 888 99 4 444 4 888 99 4 4 4 4 44444 99 5555 9999 000 777 999999999999 5 33 33 3 1111111 999 7 7 4444444 555 5555 666 33 5555 1 66 888888 888888 999 7 999 5555 7 7 6 22222 444 4444 6 2 33 333 7 77777 77777777 11 3 2222 444 33 6 6 999 999 888 7 666 8 9 9 9 66 66 9 2222 1111 55 2 4
consensus : TTTGGG--GGGT-GA--TGC-CCC---TA-G---GTCGGGTTTGCAC---AC-T-AA--CCCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-G--CC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-TTC--ATG---TC--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TG---C-TG-TG-GCG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCACC---GG-CAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TAGG---GA-G-G-G---G--GAC-GC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----GG-A-GCAGCAGCAC---C------------T-GAGC--A--GTTTCCTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--CT----AACC--G------T------ATGCC---CC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---A-----G--C-GCCT-A----TGTT--CC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--NC-TA-G-A-TA-NAAG--G-A----TCTG-N--AT-GAAGAT-GACA
Reference ( family-523 ) : TTTGGG--GGGT-GA--TGC-CCC---TA-G---GTCGGGTTTGCAC---AC-T-AA--CCCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-G--CC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-TTC--ATG---TC--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TG---C-TG-TG-GCG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCACC---GG-CAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TAGG---GA-G-G-G---G--GAC-GC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----GG-A-GCAGCAGCAC---C------------T-GAGC--A--GTTTCCTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--CT----AACC--G------T------ATGCC---CC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---A-----G--C-GCCT-A----TGTT--CC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--NC-TA-G-A-TA-NAAG--G-A----TCTG-N--AT-GAAGAT-GACA
gi|127862 : G--GGGT-GA--TGA-TCC---TA-G---GTCGGGTTTGCAC---AT-T-AA--CCCT--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTTAT-CGA----T-G--CC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGG-T----------C--A-TTC--ATG---TC--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-GCG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCACT---GG-TAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------G-TAGG---AA-G-A-G---G--AAC-AC---A-GAGA---C--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----AG-A-GCAACAGCAC---C------------T-GAAC--A--GTTTCCTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--TT----AACC--G------T------ATGCC---CC-AG---CT----TACCC-TTC-AT-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---A-----G--C-ACCT-C----TGTT--TC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--TC-TA-G-A-TA-GAAG--G-A----TCTG-A--AT-GAAGAT-GACA
gi|127863 : tttgcatTTTGG--GGGT-GA--TGC-TCC---TA-G---GCCGGGTTTGCAC---AC-T-AA--CCCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-A--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C------A---A-G-A-A--T-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTTTT-CGA----C-A--TC--------------CA--------------T--TC-AG-G-----GA-T---A--TAG-T--GGA-T----------C--A-TTC--ATG---TC--TACA-----GTA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-GCG--G-ACC--CC--T-A--ATA--TCACT---GG-TAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAT---T-TCGCT-CA--G-CTT-GCCC-A--T-C-C-CGAAA-----G-AG------A-GAGG---AA-T-G-G---G--GAC-GC---A-TGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----AG-A-GTAACAGCAC---C------------T-GAAC--A--GTTTCCTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----A---C--CT----AACC--G------T------GTGCC---CC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---A-----G--C-ACCT-A----TGTT--TC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--TC-TA-G-A-TA-GAAG--G-A----TTTG-A--AT-GAAGAT-GACA
gi|127864 : TTTGG--GGGT-GA--TGC-TCC---TA-G---GTCGGGTTTG-AC---AC-T-AA--CCCC--T-CTTAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---T-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----T-G--TC--------------CT--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-T----------C--A-TTC--ATG---TT--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTAC-T--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-CCG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCACT---GG-TAACTGC----CCTAGGT---A-GT-A-TA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TACG---GA-A-G-G---G--GAC-AC---A-GGGA---T--TC-A-T-TT-AG-----GC--CG---AG----AG-A-GCAACATCAC---C------------T-GAAC--A--GTTTCCTTG-G------TCG---GC-AG-T-------T--GCC----C---C--CT----AA----G-----------------C---TC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--C-T-A-T-G---A-----A--C-ACCA-T----TGTT--TC--TC-TA-AT---GCGT--TA---A-G--TC-TA-G-A-TA-GAAG--G-A----TCTG-A--AT-GAAGAT-GACA
gi|127865 : TTAGG--GGGT-GAAATGCTCCC---TT-A---GTTGGGTTTTCAC---AC-T-AA--CACCATC-CTCAGAAG----TT-CA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--TTAATA-T---C-G---TT--C-----------CA-T--GTGC-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTTCTTCGA----T-A--CC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-T----------C--A-TTC--ATG---TCCTTACA-----GTA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TAAATC-TGGTG-GCG--G-ACC--CCC-A-G--ATA--TCACT---GG-TAACTGC----CC----T---ATGT-A-CAACCAC---T-TCGCT-CA--G-CCT-GCCCCA--T-A-C-CCGAA-----A-GA------A-TAGG---AA-G-G-G---G--GACCGC---AAGGGA---T--TT-C-T-TT-A------GC--CG---AGA---AG-A-GCAACAGCAC---C------------T-GAAC--A--GTTTCCTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--G-C----C---C--CT----AACC--G------T------ATG-C---TC-AG---CT----TACCCTCACAAC-G-----G---T----AAG-C-GCCAC--C-G-G-TAA---A-----G--C-ACCTAA----TGTT--TC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-GTCCC-TA-G-A-TA-GAAG--G-A----TTTG-A--AT-GAAGAT-GA
gi|127866 : TTTGGG--GGTT-GA--TGC-CCC---TA-G---GTCGGGTTTGTAC---AC-T-AA--CCCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--C--T----C-C---T-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---T-G-A-A--C-A-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-A--CC--------------CA--------------C--TC-GG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-CCATTCAATGAC--A-TTC--ATG---TC--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTAC-A--C--------AT-----------TG---T-TG-TG-GCG--A-ACC--CC--A-G--ATA--TCACC---GG-CAACTGC----CC----T---T-GT-A-CA-TCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--A-C-C-CGGAC-----A-AA------T-TAGC---GA---G-A---G--GAT-GC---A-GGGT---T--TT-C-C-TT-AG-----GC--CC---AG----GA-A-GCAGCAACAC---C------------T-GAGC--A--GTGTCTTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--ACC----C---C--CT----ACAC--G------T------ATGCC---CC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--T-G-GTT-A---ATACATG--T-ACCT-A----TGTT--CA--TC-TG-GC---GCG---CA---A-G--
gi|127867 : TTTGGG--GGTT-GA--TGC-CCC---TA-A---GTCCGGGTTGTAC---AC-T-GA--ACCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--C--T----C-C---T-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---T-G-A-A--C-C-A--TG--T-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-A--CC--------------CA--------------G--TC-AG-T-----GA-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-TTC--ATA---TC--TACA-----GCA-G-T-C-----TCTAC-C--A--------AA-----------TG---C-TA-TG-GCG--G-ACG--CC--A-G--ATG--TCACC---GG-CAACTGC----CC----T---A-AT-A-CA-CTTC---T-ACACT-CA--G-TCT-GCCC-A--A-T-C-CGGAA-----G-GA------A-TAGG---GA-T-G-A---G--GAC-GC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----CT--CC---AG----GG-C-ACAGCAGTGC---C------------T-GGGC--A--GTTTTCTCG-G------GCA---AC-AG-C-------T--ACC----C---C--CT----ACCA--G------T------ATACC---CC-AG---CT----TA-----AC-ACAA-----A---A----CGG-C-G-CAC-----------------------C-GCCA-A----TGTT--CT--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--GC-TA-G-A-TA-CAAG--A-A----TCTG-C--AT-TATGAT-atct
gi|127868 : TTTGG--GGGT-GA--TGC-TCC---TA-G---GTCGGGTTTGTAC---AC-T-AA--CCCC--T-CTCACA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-C--TTAT----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--
gi|127869 : TTTGGG--GGTT-GA--TGC-CCT---TA-G---GTCGAGTTTGTAC---AC-T-GA--CATC--T-CTCAAT-G----TA-TA-G--G-----A-AA------TA---G-G-A--C--T----------C-GTAGTC--C-----------CA-T--G--C-T---AA---G-T-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-A--CC--------------AA--------------C--TC-AG-G-----GA-G---A--TGG-T--AGA-C----------C--A-TTC--ATG---TA--TACT-----GCA-G-T-T-----TTTAC-C--C--------AG-----------T
gi|127869 : ----CC----C---A-GT-A-T---CAT---C-ACGC--CAT-G-CCT-GTCC-A--A-C-C-CTGAA-----G-GG------A-TAGG---GA-G-G-GAGGG--GAC-GC---A-GGAA---T--TT-C-T-TT-GG-----GC--C----------------CAGCAACAT---C------------T-GAGC--A--GTTTCCACA-G------------GT-AG-T-------T--TCC----C---C--------------G------T------ATGCC---TA-AG---CT----TACCC--AC-AC-A-----G---G----CAG-C-ACCAC--C-A-G-T-T---A-----G--C-CCCT-AGCTATGTT--TC--TC-TG-AA---GCG---TA---A-T--GC-TA-A-A-TA-CAAG--G-A----CCTG-C--AT-TATGAT-GACAatcatcacgccatgcctgtccaaccctgaagggatagggagggaggggacgcaggaatttctttgggcccagcaacatctgagcagtttccacaggtagtttccccgtatgcctaagcttacccacacaggcagcaccaccagttagcccctagctatgtttctctgaagcgtaatgctaaatacaaggacctgcattatgatgaca
gi|127870 : tttgggggttgatgcccttaggtcgagtttgtacactgacatctctcaatgtataggaaataggactcgtagtcccatgctaagtaaccatgcatttgattcctcgacaccaactcagggagatggtagaccattcatgtatactgcagtttttaTTTGGG--GGTT-GA--TGC-CCC---TA-G---GTCGGGTTTGTAC---AC-T-GA--GCCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--A-----A-AA------CA---G-A-G--C--T----C-G---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---A------GTA-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-TAA----C-A--CC--------------CA--------------G--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-TTC--TTG---TC--TACATCAGAGCA-G-T-T-----TCTAC-C--A--------AA-----------TG---C-TA-CA-GCG-----------------------TCACC---AG-CATTTGC----CC----T---A-GT-A-AA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-TCT-GCCC-A--A-C-C-CGAAA-----G-GA------A-TAGG---GA-G-G-A---G--AAC-GC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AA-----GC--CA---AG----GG-C-ACAGGAGCGC---C------------T-G
gi|127871 : TTTGGTTTGGGT-GA--T---CCC---TA-G---CTCGGATT-GCAC---ACGT-AA--CCCT--TTCTCAGA---------TA-G--G-----A-AA-------A---G-A----T--T----A-TAATC-G--GTT--C------------A-T--G--C-T---AGC--A-G-A-A--G-C-A---G--C-----T-T-GA-T-CTT-CGA----C-C--AC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-A----------T--A-TT-----A---TC--TACA-----GTA-G-T-T-----T-TAC-C-----------AG-----------TA---C-TG-TGCGCG--G-ACC--CC--AAG--ATA--TCACT---GG-TAA--GC----CC----A---C-GT-AACA-CCAC---T---GCT-CA--G-CCC-TCCC-A----C-C-CGAAA-----T-G-------A-TAGA---AA-G-G-G---G--AGC-AC-----GGGA---T--T--C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----CG-A-GCAACAGCA----C------------T-GAAC--A--GTT---CCG-G------T-A---GCAAG-C-------T--GCC----C---C--GT----AACC--G------T-------TCCC---CC-AG---CT----TACCC-
gi|127871 : C-TG-AC---GCG---TA---AAG--TC-CA-G-AATA-GAAG--GCA----TTTG-TGAAT-CAAGAT-GACAagggattcaacggcgcgcaacaaaaacccacagaggcatcagtaaaaattcgaacatagtaacccggttagcctacaaaaacctgacgcgtaaagtccagaatagaaggcatttgtgaatcaagatgaca
gi|127872 : tttggtttgggtgatccctagctcggattgcacacgtaaccctttctcagataggaaaagattataatcggttcatgctagcagaagcagcttgatcttcgaccaccactcagggatatggtggaatattatctacagtagttttaccagtactgtgcgcggaccccaagatatcactggtaagcccacgtaacaccactgctcagccctcccacccgaaatgatagaaaggggagcacgggattctttaggccgagcgagcaacagcactgaacagttccggtagcaagctgccccgtaaccgttcccccagcttacccagggattcaacggcgcgcaacaaaaacccacagaggcatcagtaaaaattcgaacatagtaacccggttagcctacaaaaacTTTGGG--GATA-GA--TGC-A-----TA-G---GTCTGGTTTGCAC---AC-T-GA--CCCT--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----G-AA------TA---G-G-A--T--C----G-----C-G--TTT--T-----------CA-T--G--C-C---AG---C-A-A-A--T-C-A--TA--C-A--TT-C-GA-TTC---TGA----C-A--CC--------------CA--------------
gi|127873 : TTTGG--GGTT-GA--TGC-CCC---TATG---TTCGGG-TTGTAC---AC-T-GA--ACCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--C--T----C-C---T-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---A
gi|127874 : G--GAGT-GAA-TGC-TCC---TA-G---GTCGGGTT-GCAC---AC-TTAA--CCCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-A--G--C-CTAAAA---A-A-A-A--A-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-G--CC--------------CT--------------C--TC-AG-G------A-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-T-C--A-G---TC--TAGA-----GTA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-GCG--A-ACC--CC--A-C--ATA--TCATT---GG-T--CTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ATACT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------T-TAGG---CG-A-G-G---G--GAT-GCCAGA-GGCA---T--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----AG-A-GCAACAGCAC---C------------T-GAAC--A--GTTT-CTCGCG------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--CT----AACC--G------T------ATGCC---CC-AG---TT----TACCC-CAC-AC-A-----A---G----CAG-C-GCCAC--C---G-T-A---A-----G--C-ACCT-T----TGTT--TC--TC-TG-AA---GCG---TA---A-G--TC-TA-G-A-TA-GAAG--G-A----TCTG-A--AT-GAAGAT-GACA
gi|127875 : tttG--GAGT-GA--TGT-CC----TA-G----TCGGCGTTGCAC---AC-TTAA--CCCC----CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-CTA-AA---A-A-A-A--A-C-A--TGCCC-A--TT-T-GA-TTCCT-C-A----C-G--CC--------------C---------------C--TC-AG-G-----GA-TC--A--T-G-T--GGA-C----------C--A-TTC--ATG---TC--TAGA-----G-A-GTT-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-GC---A-ACC--CC--A-AT-ATA--TTG-C---GT-CAA-TGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACTAC-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------T-TAGG---GA-G-G-G---GATGCC-GC---A--GGA---T--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----AG-A-GCAACAGCAC---C------------T-GAAC--A--GT---CTCGCG------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--CT----AACC--G------T------ATGCC---CC-AG---TT----TACCC-C-C-AC-A---------G----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---A-----GCCC-ACCT-T----TGTT--TC--TC-TG-AA---GCGC--TA---A-G--TC-TA-G-A-TA-GAAG--G-A----TCTGAA--AT-GAAGAT-
gi|127876 : tttTTGGG--CGGTTAA--TGT-CCCATCTA-G---ATCATGGTTGTACT--AA-G-AA--CTCC--T-CCCAAA-T----GT-TA-GACG-----ATAA------TA---G-A-GGCT--C----A-TAGCT-G--GT---------------CA-TTTG--C-T---AT---GTG-A-AGTC-C-A--TG--CCA--TT-TTGA-TTCCT-CGAACCAC-A--CC--------------TA--------------G--TCTAG-G-----GAAT---A--TGA-TTAGGA-C----------CTAA-TTC--ATG---TC--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTGC-C--A--------AA-----------TG---C-TA-TT-ACG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCACC---GA-CAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACGAT-CA--G-TCT-ACCC-A--A-C-C-TAGAT-----G-TG------A-TAGG---GA-G-G-A---G--GAC-AC---A-GGGA---T--TT-A-T-TT-AG-----GT--CC---AG----GGCA-GCAGCAGCGC---C------------T-GGGG--A--GTTTTCTCA-A------ACA---GA-AG-A-------T--A-C----C---C--CT----ATCT--G------T------ATA-C---CC-AG---CT----TACCC-AAC-GC-A-----G---G----CAG-T-GCAAC--C-A-G-C-T---A-----A--C-GCCT-A----TATT--CC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--GC-TA-G-A-TA-AAAG--G-A----TTTG-C--AT-
gi|127877 : TTGGG--GGTT-GA--TGC-CCC---GA-G---GTCGGGTTTGTAC---AC-T-GAG-CCCT--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--A-----A-AA------CA---GGA-G--C--T----C-G---C-G--GTTT-C-----------CA-T--G--C-T---A------GTA-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-T-CCT-TAA----C-A--CC--------------CA--------------T-----AG-G-----GA-T---A---GG-T--GGA-C----------C--T-TACT-ATGGG-TC--TACATCAGAGCA-G-T-T------CTAC-C--C--------AAA----------TG---C-TA-CA-GCA--A-AC--------------G--TCAC----AG-CA-TTGC----CC----T---A-GT-A-AA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-TCT-GCCC-A--A---C-CGGAA-----A-GGTA----A-TAGG---GA-G-GAG---A--AAC-GC---A-GGGAT--T--TT-C-T-TT-AA-----GC--CC---AA----GG-C-ACAGGAGC-C---C------------T-G
gi|127878 : TTGAG--TGGTCGA--TGC-TCCA--TA-G----TCGAGCT--CACCGAAC-T-AA--CCCT--A-CTCAG--G----TT-TA-T--G-----A-AG------AATCCG-A-G--TA-T----A-T---CCG--GTT--C-----------CAAT--G--C-T---AATATA-G-A-A--C-CGA--TG--C-AAGTA-T-GACTTCCT-CGAT---C-GTCCC--------------CT--------------C--TC-AGTGCACCTGA-T---GACTGG-T--GGA-T----------CG-A-TTCT-ATGG--TT--TACA-----TCGTA-T-TACTGGTCTAC-C--CGGGCCTAAAG-----------TG---C-TG-TG-GTG--GTACC--CC--A-T--ATAATCCTCT---GG-TTACTGC----CC----TCCTA-GT-A-CAACCACC--T-ACGCT-CA--G-GCT-GCCC-A--G-C-CGCGGAA-----T-GG------ATTAGGGGAGA-G-G-GCACG--GCC-GC---A-GGGAAATT--CT-T-T-TT-AGAGACCGCGACG---AGCTAATA-A-GCAACAGCACAGTC------------TAGAAC--A--GTTTCACCG-GGGAGC-TCA---AC-AATC-------T--TGC----C---C--CT----AAAC--GATTTAAT------GCGCC---CT-AGAGTCT----TA-TT-CAC-AC-A-----GCTAG----CA--C-GCCTT--CGG-G-T-AAATA-----A--C-ACCT-AT---TGTTTACT--TC-CATAA---ACA---CA---A-GT-ACATA-G-A-AAGCAAG--G-AATGCTC-G-A--ATGGAAGATAGACAtaaactggtctcc
gi|127879 : GA--GGTT-GA--TGC-CCT---AA-G---GTCCGGTT-GT-C---AC-TGAA--CGCT--C-CTCAGATG----TTATA-G--------A-AA------TT---G-ATG--C--T----GCT---C-T--GGT--C-----------CA-T--G----T---AA---T-G-AGA--T-C-A---G--T-A--TT-T-GA-TTCC--CGAT---C-A--CC--------------CA--------------G--TC-AG-T-----GT-A---A--TGGGT--GGA-C----------A--A-TTTCGATA---T---TACA------CA-G-T-C------CTAC-G--A--------AA-----------TG---C--A-TG-G-G--G-ACC--AG--A-A--A-A--TCACG---TG-CAACTGC----CC----T---A-AT-A-CA-T--C---TAACACT-CA--G-TC--GCCC-A----T-T-CGGAA-----GAGA------A-TAGG---GA-T-A-G---G--A---GC---T-AGGA---T--T
gi|127880 : GG--GGGT-GA--TGC-TCC---TA-GCGTGTCGG------AC---AC-T-AA--CC----T-TTCAGA-G----TT-TA-G--------A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G---TT--C-----------C----------T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C----TT-T-GA-TTCTT--GA------G--CC--------------CT--------------C--TC-AG-G-----GA-T---AA-TGG-T--GGA-T-------------A-TTC--ATG---TT--TA-A-----GCA-G-T-T-----T-TAC-CATC--------AT-----------CG-----TG-TG-G-G--G-ACC--CCCAA-G--ATA--TTACT---GG-TAACT------CC----T---A-GT-A-C--CTAC---T-ACGCT--A--GTCCT-GCCC-A--G-C----GGAA-----T-GG------A-TAGG---G----G-G---G--GAC-GC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----G--A-GCAACAGCAC---C------------T-GAA---A--GTTTCCTCG--------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C-------T----AAAT--G------T------ATGCC---C--AT---CT----TACCC-T-T-AC-A-----GC--G----CAG-A-GC-AT--C-GCG-T-A---A-----G--C--CCT-A----TGTT--TC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-GT-AC-TA-G-A--A-GAAG--G-A----TCTG-A--AT-GAAAAT-GACAcatatcatagtttagcagtgagaaacacagca
gi|127881 : CC---TA-GT--GTCGGCTTTGCAC---AC-T-AA--CCCC--T-CTCAGT-G----TT-TA-G--A-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---T-C--GTTTCC-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A---T-T-GATTTCCT-CAA----T-G--CC--------------CT--------------T--TC-AG-G-----GA-T---A--T-G-T--GGA-T----------C--A-TTC--ATG---TT--TACA-----GTA-
gi|127882 : gggctgtgtTTGCCC---ACGT-AAGACCCC--T-CTCAGA-AGAATTT-TA-G--G-----A-AAAATAAATA---GGA-A--T--T----ACT---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--AAC-A--TG--C-A--TT---GA-TTC-T-CGA----C-A--CC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----CA-TC--A--TGG-T--GGA-T----------C--A--TG--ATG---TT--TACA-----GTA-G-T-T-----TCTAT-C--C--------AG-----------TA---C-TG-T--GCG--G-ACC--CC--A-GGAGTA--TCATCTTAGG-AAATTGCTTAATC----C---A-GTAA-CA-CCAC---T-TCGC--CA--G-CCT-GCCC-ATCG-CAC-CGAAA-----T-GGCGTCTTA-T------GA-A-G-G---G--AAC-GC---A--ATA---T--TT-C-TATT-AG-----GC--CA---AGA---GA-A-GCAACAGTAC---TTGTCACAGACAAT-GAAC--AATGTTTCCTCG-GTGTCTCTCAATGAC-AG-T-------TTGGCCCTTTC---C--CT----AACCAAG------TTAAATCATGCCCGTCT-AT---CTAAACAATCC-CAA-AC-ATCAATG---AATTTCAG-CGGCCACGTA-G-G-T-A---A-----G--CTACCTAA----TGTT--TCATTCTTG-ACTGGACG---TA---A-T--TC-Ttaaaaacttgtacggtcttacgcagttttctaacccagtactgtg
gi|127883 : C--T-CACAGG-GC---TT-TA-G--GGCCTAA-AG------TA---A-A-G--T-------A-T---T-G--GTG--G-----------CG----G--CAT---AG---T-G-A-A--C-A-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----CCG--CC--------------TT--------------C--TC-AG-G------A-T------TTG-T--GGA-T----------C--ACTTC--ATG---TT--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTA------------------------------------------------------------------TCACC---GGGTAACTGC----CC----T---A-GT-A-C--CCAC---T-GC----CA--G-C-T-GCCC-A--G-C-C-AGGGGAGGGGG-GG------G-CAGG---GA-AAG-G---G--GAC-GC---A-GATA---T--TT-C-T-TT-AG-----CC--AG---AG----GG-C-GCATC-------------------------GC--A--GTTTCCTC--G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----CG--C--CT-----ACC--G------T-------TGCT---CC-AT---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG---ACCAC--CGG-G-T-A---A-----G--C-A--T-A----TAGT--TT--TC-TG-A------G---TA---T-A--CT-TA-GAA-TG-AGAG--G-A----T-TA-G--AT-G-AGAT-GAC
gi|127884 : -CTCAGA-GATA-TT-TAAG--G-----AGAA------TAAG-G-A-G--C--TC---G-T---A-G--GTT--CACAGGAAAGAACAAT--G--C-T---AA---G-A-A-A--C-C-AAGTG--C-AATTTAT-GA-TCCCA-GAA----C-A--CCAAACAAATAGAAAACA--------------CGATG-AA-G-----GA-T---AAGTGG-T--GGAAC----------C--A-TTC--ATGGGATA--TACT-----GTA-G-TAT-----TCTAAAC--C--------AGGAAAAAACAAATG---CATG-TA-GCGCGG-ACCAACT--A-G--ATA--TCACC---GG-CAAC-GC----CC----A---G-AC-ATCA-TCAC---TTATGCTTCA--G-CCTTGTCC-A--A-C-C-CAGAA-----G-GG------A-TAGG---GA-G-G-G---G--GAC-G----A-GGGT---T--TTCC-T-TT-CG-----GT--CC---AG----GG-C-GCAGCAGCAC---C------------T-GAGC--A--GTTTCCTAA-C------TCA---GC-AG-C-------T--A-C----C---C--CT----AACC--T------T------ATGCT---CC-AG---CT----TTACC-CAC-CA-A-----C---G----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---A-----G--C-GCCT-A----TGTT--CC--TC-T--AC---CCG---TA---A-G--
gi|127885 : -G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TCCCT-CGA----C-G--CC--------------CT--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-TTC--ATG---TC--TACA-----GTA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-AGG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCACT---AG-TAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ATGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-ATGAA-----G-GG------A-TAGG---GC-G-G-G---G--GAC-GC---A-GGGA------TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----AG-A-GCAACAGCAG---C------------T-GAAC--A--CTTTTCTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--CT----AAC-----------------AT-------C-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---T----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---T-----G--C-ACCT-A----TGTT--TC--TC-TG-AC---GTG---TA---A-A--AC-------------------------CTG-A--AT-GAAGAT-GACAgtct
gi|127886 : --TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-G--CCCTCT----------CAGGGATATGCGCCCTC--TC-AG-G-----GA-TGAGA--CAC-T--AGT-CT---------C--A-TTC--ATG---TT--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTA------------------------------------------------------------------TCACC---GG-TAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGGA-----G-GG------A-CAGG---GA-G-G-G---G--GAC-GC---A-GAGA---T--TT-C-T-TT-AG-----AC--CG---AG----AG-A-
gi|127887 : T-CGA----C-A--TC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-T----------C--A-ATT--ATA---TC--TACA-----TAA-T-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-GCG--G-ACC--CC--A-G--
gi|127888 : --CC--------------AA--------------C--CC-AG-G-----GC-T---A--TGG-T--TGA-C----------C--A-ACT--ATG---TC--AACA-----ACA-G-C-C-----CCTAT-C--C--------AG-----------TG---C-TA-TG-GTG--G-A-C--CC--A-G--ATG--TCACC---GG-CGACTGC----CA----C---A-GT-A-T-----C---T--CACT-TA--G-CTT-GTCA-A--T-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TTGG---GA-G--------------AC---A-GGAA---T--TT-A-T-TC-AG-----GC--CT---AG----GG-G-GAATCAGCAC---C------------C-TAGCCAA--G--TCCTCG-G-------AA---GC-AA-C-------T--ACC----CATAC--CTGTGCAACCA-G------T------A-ATT---CC-AA---TT----TACCC-TAT-GC-A-----G---G----CAG-T-GCAAT--T-A-G-C-A---A-----G--C-GCCT-A----TGCC--CC--TC-AG-A
gi|127889 : --CC--------------TA--------------C--TC-AG-G-----GC-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-TTA--ATG---TC--GACA-----G-A-GCT-C-----CCTGA-T--C--------AG-----------AA---G-TA-TG-GTG--A-ACT--C
gi|127890 : C--------------CA--------------C--TC-CG-G-----GA-T---A--TAG-T--A-A-T----------C--A-TTC--ATG---TC--GACA-----GCA-G-T-T-----TCTAC-A--C--------AG-----------TG---C-CA-TG-GCG--G-ACT--CC--A-G--GTG--TCACT---GG-CAAATGC----TC----T---A-GC-A-TA-TCAC---T-AGGCT-CA--G-CCT-GCCA-A--A-C-C-TGGAA-----G-GG------A-TGGG---GA-G-G-G---G--GGC-AC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----AC--CC---AG----GG-T-GCAGCAGCAT---C------------T-AAGC--A--GTTTCCTCG-G------GTA---GC-AG-C-------T--ACC----C---C--CT----ACCA--G------T------AGGCC---CC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--C-G-C-T-T---A-----G--C-GCTT-A----TGCT--GC--TC-TG-AC---GCA---TA---A-G--AC-TA-G-A-TA-CAAG--A-A----TCTG-
gi|127891 : C--------------CA--------------C--TC-CG-G------A-T---AC-TAG-T--A-A-T----------C--T-TCC--ATG---TC--GACA-----GCA-G-T-T-----TCTACAC--T--------AG-----------TG---C-CA--G-GC---G-ATC--CA--A-G--GTG--T-ACC---TG-CAAATGC----TC----T---A-GC-A-AT-CCACTGGT-AGGCT-C---G-CCT-GCCA-A--ATC-C-TGGAA-----G-GGT-----A-TGGG---GA-G-G-G---G--G-C-AC---A-GGGA---TTATT-CAT-TTAAG-----AC--CA---GG----GG-C-GCAGCA--AT---C------------T-AAGC--A--G-TTCCTCG-G------GTA---GC-AG-C-------T----C----C---C--CT----ACCCA-G------T------CAGCC---CCAAG---CT----TACCC-C-C-AC-AAC---A---G----CAGCC-GCCAC--C-G-C-T-T---A--------C-G-CT-A----TGCT--GC--TC-TG-AC---GCAT--TA---A-G--AC-TACG-A-TA-CAAGAAA-A----TCTG-
gi|127892 : A--------------T--TC-AG-G-----AA-T---A--TGG-T--GAA-T----------C--A-TTC--ATG---TC--AGCA-----GGA-G-C-A-----TCTAT-A--C--------AG-----------TG---C-TA-TG-ATG--G-ACC--CC--A-G--ATG--TCATT---GT-TGGCTGT----CC----C---A-GT-A-TC-TCAC---T-AAGGT-CA--G-CCT-GTCA-A--A-A-C-CTGAA-----G-GA------A-TGGA---GA-G-A-G---A--GAC-AC---A-GGGA---T--TT-C-T-TA-AG-----GA--CAGGCAG----GC-AGGCAGCAGCAC---C------------T-GGGC--A--GTTTCCTCA-G------GCA---GC-TG-C-------T--ACA----C---C--CT----ACCC--A------T------ATACC---TC-AT---CC----TAGCT-CAC-AC-A-----G---G----CA-------------------A---A----------GCCT-A----TGCC--CC--TC-TG-AT---GCGTAATA---A-G--GC-TA-A-A-GA-CAAG--G-
gi|127893 : -T-C-----TCTAC-C--A--------AA-----------TG---C-TA-TG-GCG--G-AGC--CC--A-G--ATG--TCACC---AG-CAACTGC----CA----T---A-AT-A-CA-CCTC---T-ACGCT-CACAG-TCT-ACCC-A--A-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TAGG---GA-G-G-A---G--GAC-GC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----GT--CC---AG----GG-C-GCAGCAGTGC---C------------T-GGGC--A--GTTTTCTCA-G------GCA---AC-AG-CTACAAAGT--ACC----C---C--CT----ACCA--G------T------ATGCC---CC-AG---CT----TAATA-CAA-AA-A-----G---G----CAG-C-CCCAC-----------------------C-GCCA-A----TGTT--CC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--GC-TA-G-A-TA-CAAG--G-A----TCTG-C--AT-TATGAT-GGCA
gi|127894 : --G-CCT-GTCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TGGG---GGCG-G-G---A--AAC-GC---A-GCGA---T--GT-C-T-TC-AG-----GC--CC---AG----
gi|127895 : --G-CCT-GTCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TGGG---GC-G-G-G---A--AAC-GC---A-GCGA---T--GT-C-T-TC-AG-----CC--Ca
gi|127896 : CT-GCCC-A--A-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TAGG---GA---------G--GAC-GC---A-GGGA---T--TG-C-T-TT-AG-----GT--CC---AG----GG-aga
gi|127897 : G-----AC--CG---AA----AG-A-ACAGCA---C---C------------T-GTAC--A--GTTTCTTAG-G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--CT----GAAC--G------T------ATGCC---TC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-
gi|127898 : C---C------------T-GGGC--T--GTTTTCTCG-G------GGA---AC-A----------T--ACC----C---CTCCT----ACCA--G------T------ATGTC---C--AG---CT----T---T-TAC-AC-A-----A---A----CAG-CAGCCTC--C-------A---C-----G--C-GC---------ATT--TC--TC-TG-AC---GCG---TA---G-G--C---A-G-A-TA-A-----G-A----T-TG-C--AT-TATGAT-GGCA
gi|127899 : C-A-----G---A----AGG-T-GCCAC--C-G-G-T-T---A-----G--C-GCTT-A----TGTC--CC--TC-TC-AT---ACG---TAATGA-G--AC-TA-G-A-TA-CAAG--G-A----TCTG-T--GT-TATGAT-GACA
gi|127900 : C-A-----G---A----AGG-T-GCCAC--C-G-G-T-T---A-----G--C-GCTT-A----TGTC--CC--TC-TC-AT---ACG---TAATGA-G--AC-TA-G-A-TA-CAAG--G-A----TCTG-T--GT-TATGAT-GACA
Alignments
lowQualScore : 1111111111 111111111111111111111111111111 1111111
lowQualScore : 22 0 4 55 2 555 2 555 1 0 555 3 5 44 22 1 3 8888 1 1 22 44444 3 555555 555 3 1 22 44 3333333333 1 22 44 77777777777 3 22 22 1 555 77777 3 1 22 1 1 22 22 1 44 1 1 3 1 6666 3333 222222222222222222222222222222 22 1 1 33333 1 555 66 1 22 1 7777777777 33 1 44 555 22 77777 1 2 1 33333 2 55555555555 88888888888 222 1 1 1 22 1 22 33 1 33 22 2222 1 3333 3333 222 1 1 3 33 444 3 1 33 1 1 1 5555 1 1 33333 1 777777 1 222 111 1 444 11 1 222 1 333 11 1 1 1 1 33333 11 5555 5555 333 222 777777777777 1 22 22 3 1111111 222 1 1 5555555 222 3333 444 22 3333 0 55 444444 444444 222 1 222 3333 1 1 1 66666 444 3333 1 3 22 555 1 44444 44444444 22 3 5555 222 22 1 1 222 777 555 1 666 1 1 1 1 33 22 1 4444 6666 22 0 2
lowQualScore : .. . . .. . ... . ... . . ... . . .. .. . . .... . . .. ..... . ...... ... . . .. .. .......... . .. .. ........... . .. .. . ... ..... . . .. . . .. .. . .. . . . . .... .... .............................. .. . . ..... . ... .. . .. . .......... .. . .. ... .. ..... . . . ..... . ........... ........... ... . . . .. . .. .. . .. .. .... . .... .... ... . . . .. ... . . .. . . . .... . . ..... . ...... . ... ... . ... .. . ... . ... .. . . . . ..... .. .... .... ... ... ............ . .. .. . ....... ... . . ....... ... .... ... .. .... . .. ...... ...... ... . ... .... . . . ..... ... .... . . .. ... . ..... ........ .. . .... ... .. . . ... ... ... . ... . . . . .. .. . .... .... .. . .
lowQualScore : 99 5 2 00 1 555 0 555 5 4 222 8 7 55 55 7 5 5555 7 7 44 33333 5 000000 444 5 7 44 11 5555555555 7 33 00 99999999999 3 33 44 7 444 99999 6 8 55 8 8 55 55 8 88 7 7 5 7 9999 5555 000000000000000000000000000000 00 4 4 66666 4 444 88 4 00 4 7777777777 44 4 88 999 00 11111 4 9 4 66666 9 88888888888 22222222222 666 5 5 5 00 5 00 77 5 77 22 8888 6 3333 3333 777 5 5 1 55 222 1 5 44 4 4 4 9999 4 4 44444 4 222222 4 444 999 4 888 99 4 444 4 888 99 4 4 4 4 44444 99 5555 9999 000 777 999999999999 5 33 33 3 1111111 999 7 7 4444444 555 5555 666 33 5555 1 66 888888 888888 999 7 999 5555 7 7 6 22222 444 4444 6 2 33 333 7 77777 77777777 11 3 2222 444 33 6 6 999 999 888 7 666 8 9 9 9 66 66 9 2222 1111 55 2 4
consensus : TTTGGG--GGGT-GA--TGC-CCC---TA-G---GTCGGGTTTGCAC---AC-T-AA--CCCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-G--CC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-TTC--ATG---TC--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TG---C-TG-TG-GCG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCACC---GG-CAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TAGG---GA-G-G-G---G--GAC-GC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----GG-A-GCAGCAGCAC---C------------T-GAGC--A--GTTTCCTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--CT----AACC--G------T------ATGCC---CC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---A-----G--C-GCCT-A----TGTT--CC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--NC-TA-G-A-TA-NAAG--G-A----TCTG-N--AT-GAAGAT-GACA
Reference ( family-523 ) : TTTGGG--GGGT-GA--TGC-CCC---TA-G---GTCGGGTTTGCAC---AC-T-AA--CCCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-G--CC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-TTC--ATG---TC--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TG---C-TG-TG-GCG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCACC---GG-CAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TAGG---GA-G-G-G---G--GAC-GC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----GG-A-GCAGCAGCAC---C------------T-GAGC--A--GTTTCCTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--CT----AACC--G------T------ATGCC---CC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---A-----G--C-GCCT-A----TGTT--CC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--NC-TA-G-A-TA-NAAG--G-A----TCTG-N--AT-GAAGAT-GACA
gi|127862 : G--GGGT-GA--TGA-TCC---TA-G---GTCGGGTTTGCAC---AT-T-AA--CCCT--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTTAT-CGA----T-G--CC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGG-T----------C--A-TTC--ATG---TC--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-GCG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCACT---GG-TAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------G-TAGG---AA-G-A-G---G--AAC-AC---A-GAGA---C--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----AG-A-GCAACAGCAC---C------------T-GAAC--A--GTTTCCTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--TT----AACC--G------T------ATGCC---CC-AG---CT----TACCC-TTC-AT-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---A-----G--C-ACCT-C----TGTT--TC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--TC-TA-G-A-TA-GAAG--G-A----TCTG-A--AT-GAAGAT-GACA
gi|127863 : tttgcatTTTGG--GGGT-GA--TGC-TCC---TA-G---GCCGGGTTTGCAC---AC-T-AA--CCCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-A--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C------A---A-G-A-A--T-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTTTT-CGA----C-A--TC--------------CA--------------T--TC-AG-G-----GA-T---A--TAG-T--GGA-T----------C--A-TTC--ATG---TC--TACA-----GTA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-GCG--G-ACC--CC--T-A--ATA--TCACT---GG-TAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAT---T-TCGCT-CA--G-CTT-GCCC-A--T-C-C-CGAAA-----G-AG------A-GAGG---AA-T-G-G---G--GAC-GC---A-TGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----AG-A-GTAACAGCAC---C------------T-GAAC--A--GTTTCCTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----A---C--CT----AACC--G------T------GTGCC---CC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---A-----G--C-ACCT-A----TGTT--TC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--TC-TA-G-A-TA-GAAG--G-A----TTTG-A--AT-GAAGAT-GACA
gi|127864 : TTTGG--GGGT-GA--TGC-TCC---TA-G---GTCGGGTTTG-AC---AC-T-AA--CCCC--T-CTTAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---T-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----T-G--TC--------------CT--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-T----------C--A-TTC--ATG---TT--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTAC-T--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-CCG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCACT---GG-TAACTGC----CCTAGGT---A-GT-A-TA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TACG---GA-A-G-G---G--GAC-AC---A-GGGA---T--TC-A-T-TT-AG-----GC--CG---AG----AG-A-GCAACATCAC---C------------T-GAAC--A--GTTTCCTTG-G------TCG---GC-AG-T-------T--GCC----C---C--CT----AA----G-----------------C---TC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--C-T-A-T-G---A-----A--C-ACCA-T----TGTT--TC--TC-TA-AT---GCGT--TA---A-G--TC-TA-G-A-TA-GAAG--G-A----TCTG-A--AT-GAAGAT-GACA
gi|127865 : TTAGG--GGGT-GAAATGCTCCC---TT-A---GTTGGGTTTTCAC---AC-T-AA--CACCATC-CTCAGAAG----TT-CA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--TTAATA-T---C-G---TT--C-----------CA-T--GTGC-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTTCTTCGA----T-A--CC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-T----------C--A-TTC--ATG---TCCTTACA-----GTA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TAAATC-TGGTG-GCG--G-ACC--CCC-A-G--ATA--TCACT---GG-TAACTGC----CC----T---ATGT-A-CAACCAC---T-TCGCT-CA--G-CCT-GCCCCA--T-A-C-CCGAA-----A-GA------A-TAGG---AA-G-G-G---G--GACCGC---AAGGGA---T--TT-C-T-TT-A------GC--CG---AGA---AG-A-GCAACAGCAC---C------------T-GAAC--A--GTTTCCTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--G-C----C---C--CT----AACC--G------T------ATG-C---TC-AG---CT----TACCCTCACAAC-G-----G---T----AAG-C-GCCAC--C-G-G-TAA---A-----G--C-ACCTAA----TGTT--TC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-GTCCC-TA-G-A-TA-GAAG--G-A----TTTG-A--AT-GAAGAT-GA
gi|127866 : TTTGGG--GGTT-GA--TGC-CCC---TA-G---GTCGGGTTTGTAC---AC-T-AA--CCCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--C--T----C-C---T-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---T-G-A-A--C-A-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-A--CC--------------CA--------------C--TC-GG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-CCATTCAATGAC--A-TTC--ATG---TC--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTAC-A--C--------AT-----------TG---T-TG-TG-GCG--A-ACC--CC--A-G--ATA--TCACC---GG-CAACTGC----CC----T---T-GT-A-CA-TCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--A-C-C-CGGAC-----A-AA------T-TAGC---GA---G-A---G--GAT-GC---A-GGGT---T--TT-C-C-TT-AG-----GC--CC---AG----GA-A-GCAGCAACAC---C------------T-GAGC--A--GTGTCTTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--ACC----C---C--CT----ACAC--G------T------ATGCC---CC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--T-G-GTT-A---ATACATG--T-ACCT-A----TGTT--CA--TC-TG-GC---GCG---CA---A-G--
gi|127867 : TTTGGG--GGTT-GA--TGC-CCC---TA-A---GTCCGGGTTGTAC---AC-T-GA--ACCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--C--T----C-C---T-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---T-G-A-A--C-C-A--TG--T-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-A--CC--------------CA--------------G--TC-AG-T-----GA-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-TTC--ATA---TC--TACA-----GCA-G-T-C-----TCTAC-C--A--------AA-----------TG---C-TA-TG-GCG--G-ACG--CC--A-G--ATG--TCACC---GG-CAACTGC----CC----T---A-AT-A-CA-CTTC---T-ACACT-CA--G-TCT-GCCC-A--A-T-C-CGGAA-----G-GA------A-TAGG---GA-T-G-A---G--GAC-GC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----CT--CC---AG----GG-C-ACAGCAGTGC---C------------T-GGGC--A--GTTTTCTCG-G------GCA---AC-AG-C-------T--ACC----C---C--CT----ACCA--G------T------ATACC---CC-AG---CT----TA-----AC-ACAA-----A---A----CGG-C-G-CAC-----------------------C-GCCA-A----TGTT--CT--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--GC-TA-G-A-TA-CAAG--A-A----TCTG-C--AT-TATGAT-atct
gi|127868 : TTTGG--GGGT-GA--TGC-TCC---TA-G---GTCGGGTTTGTAC---AC-T-AA--CCCC--T-CTCACA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-C--TTAT----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--
gi|127869 : TTTGGG--GGTT-GA--TGC-CCT---TA-G---GTCGAGTTTGTAC---AC-T-GA--CATC--T-CTCAAT-G----TA-TA-G--G-----A-AA------TA---G-G-A--C--T----------C-GTAGTC--C-----------CA-T--G--C-T---AA---G-T-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-A--CC--------------AA--------------C--TC-AG-G-----GA-G---A--TGG-T--AGA-C----------C--A-TTC--ATG---TA--TACT-----GCA-G-T-T-----TTTAC-C--C--------AG-----------T
gi|127869 : ----CC----C---A-GT-A-T---CAT---C-ACGC--CAT-G-CCT-GTCC-A--A-C-C-CTGAA-----G-GG------A-TAGG---GA-G-G-GAGGG--GAC-GC---A-GGAA---T--TT-C-T-TT-GG-----GC--C----------------CAGCAACAT---C------------T-GAGC--A--GTTTCCACA-G------------GT-AG-T-------T--TCC----C---C--------------G------T------ATGCC---TA-AG---CT----TACCC--AC-AC-A-----G---G----CAG-C-ACCAC--C-A-G-T-T---A-----G--C-CCCT-AGCTATGTT--TC--TC-TG-AA---GCG---TA---A-T--GC-TA-A-A-TA-CAAG--G-A----CCTG-C--AT-TATGAT-GACAatcatcacgccatgcctgtccaaccctgaagggatagggagggaggggacgcaggaatttctttgggcccagcaacatctgagcagtttccacaggtagtttccccgtatgcctaagcttacccacacaggcagcaccaccagttagcccctagctatgtttctctgaagcgtaatgctaaatacaaggacctgcattatgatgaca
gi|127870 : tttgggggttgatgcccttaggtcgagtttgtacactgacatctctcaatgtataggaaataggactcgtagtcccatgctaagtaaccatgcatttgattcctcgacaccaactcagggagatggtagaccattcatgtatactgcagtttttaTTTGGG--GGTT-GA--TGC-CCC---TA-G---GTCGGGTTTGTAC---AC-T-GA--GCCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--A-----A-AA------CA---G-A-G--C--T----C-G---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---A------GTA-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-TAA----C-A--CC--------------CA--------------G--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-TTC--TTG---TC--TACATCAGAGCA-G-T-T-----TCTAC-C--A--------AA-----------TG---C-TA-CA-GCG-----------------------TCACC---AG-CATTTGC----CC----T---A-GT-A-AA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-TCT-GCCC-A--A-C-C-CGAAA-----G-GA------A-TAGG---GA-G-G-A---G--AAC-GC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AA-----GC--CA---AG----GG-C-ACAGGAGCGC---C------------T-G
gi|127871 : TTTGGTTTGGGT-GA--T---CCC---TA-G---CTCGGATT-GCAC---ACGT-AA--CCCT--TTCTCAGA---------TA-G--G-----A-AA-------A---G-A----T--T----A-TAATC-G--GTT--C------------A-T--G--C-T---AGC--A-G-A-A--G-C-A---G--C-----T-T-GA-T-CTT-CGA----C-C--AC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-A----------T--A-TT-----A---TC--TACA-----GTA-G-T-T-----T-TAC-C-----------AG-----------TA---C-TG-TGCGCG--G-ACC--CC--AAG--ATA--TCACT---GG-TAA--GC----CC----A---C-GT-AACA-CCAC---T---GCT-CA--G-CCC-TCCC-A----C-C-CGAAA-----T-G-------A-TAGA---AA-G-G-G---G--AGC-AC-----GGGA---T--T--C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----CG-A-GCAACAGCA----C------------T-GAAC--A--GTT---CCG-G------T-A---GCAAG-C-------T--GCC----C---C--GT----AACC--G------T-------TCCC---CC-AG---CT----TACCC-
gi|127871 : C-TG-AC---GCG---TA---AAG--TC-CA-G-AATA-GAAG--GCA----TTTG-TGAAT-CAAGAT-GACAagggattcaacggcgcgcaacaaaaacccacagaggcatcagtaaaaattcgaacatagtaacccggttagcctacaaaaacctgacgcgtaaagtccagaatagaaggcatttgtgaatcaagatgaca
gi|127872 : tttggtttgggtgatccctagctcggattgcacacgtaaccctttctcagataggaaaagattataatcggttcatgctagcagaagcagcttgatcttcgaccaccactcagggatatggtggaatattatctacagtagttttaccagtactgtgcgcggaccccaagatatcactggtaagcccacgtaacaccactgctcagccctcccacccgaaatgatagaaaggggagcacgggattctttaggccgagcgagcaacagcactgaacagttccggtagcaagctgccccgtaaccgttcccccagcttacccagggattcaacggcgcgcaacaaaaacccacagaggcatcagtaaaaattcgaacatagtaacccggttagcctacaaaaacTTTGGG--GATA-GA--TGC-A-----TA-G---GTCTGGTTTGCAC---AC-T-GA--CCCT--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----G-AA------TA---G-G-A--T--C----G-----C-G--TTT--T-----------CA-T--G--C-C---AG---C-A-A-A--T-C-A--TA--C-A--TT-C-GA-TTC---TGA----C-A--CC--------------CA--------------
gi|127873 : TTTGG--GGTT-GA--TGC-CCC---TATG---TTCGGG-TTGTAC---AC-T-GA--ACCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--C--T----C-C---T-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---A
gi|127874 : G--GAGT-GAA-TGC-TCC---TA-G---GTCGGGTT-GCAC---AC-TTAA--CCCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-A--G--C-CTAAAA---A-A-A-A--A-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-G--CC--------------CT--------------C--TC-AG-G------A-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-T-C--A-G---TC--TAGA-----GTA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-GCG--A-ACC--CC--A-C--ATA--TCATT---GG-T--CTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ATACT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------T-TAGG---CG-A-G-G---G--GAT-GCCAGA-GGCA---T--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----AG-A-GCAACAGCAC---C------------T-GAAC--A--GTTT-CTCGCG------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--CT----AACC--G------T------ATGCC---CC-AG---TT----TACCC-CAC-AC-A-----A---G----CAG-C-GCCAC--C---G-T-A---A-----G--C-ACCT-T----TGTT--TC--TC-TG-AA---GCG---TA---A-G--TC-TA-G-A-TA-GAAG--G-A----TCTG-A--AT-GAAGAT-GACA
gi|127875 : tttG--GAGT-GA--TGT-CC----TA-G----TCGGCGTTGCAC---AC-TTAA--CCCC----CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-CTA-AA---A-A-A-A--A-C-A--TGCCC-A--TT-T-GA-TTCCT-C-A----C-G--CC--------------C---------------C--TC-AG-G-----GA-TC--A--T-G-T--GGA-C----------C--A-TTC--ATG---TC--TAGA-----G-A-GTT-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-GC---A-ACC--CC--A-AT-ATA--TTG-C---GT-CAA-TGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACTAC-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------T-TAGG---GA-G-G-G---GATGCC-GC---A--GGA---T--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----AG-A-GCAACAGCAC---C------------T-GAAC--A--GT---CTCGCG------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--CT----AACC--G------T------ATGCC---CC-AG---TT----TACCC-C-C-AC-A---------G----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---A-----GCCC-ACCT-T----TGTT--TC--TC-TG-AA---GCGC--TA---A-G--TC-TA-G-A-TA-GAAG--G-A----TCTGAA--AT-GAAGAT-
gi|127876 : tttTTGGG--CGGTTAA--TGT-CCCATCTA-G---ATCATGGTTGTACT--AA-G-AA--CTCC--T-CCCAAA-T----GT-TA-GACG-----ATAA------TA---G-A-GGCT--C----A-TAGCT-G--GT---------------CA-TTTG--C-T---AT---GTG-A-AGTC-C-A--TG--CCA--TT-TTGA-TTCCT-CGAACCAC-A--CC--------------TA--------------G--TCTAG-G-----GAAT---A--TGA-TTAGGA-C----------CTAA-TTC--ATG---TC--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTGC-C--A--------AA-----------TG---C-TA-TT-ACG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCACC---GA-CAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACGAT-CA--G-TCT-ACCC-A--A-C-C-TAGAT-----G-TG------A-TAGG---GA-G-G-A---G--GAC-AC---A-GGGA---T--TT-A-T-TT-AG-----GT--CC---AG----GGCA-GCAGCAGCGC---C------------T-GGGG--A--GTTTTCTCA-A------ACA---GA-AG-A-------T--A-C----C---C--CT----ATCT--G------T------ATA-C---CC-AG---CT----TACCC-AAC-GC-A-----G---G----CAG-T-GCAAC--C-A-G-C-T---A-----A--C-GCCT-A----TATT--CC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--GC-TA-G-A-TA-AAAG--G-A----TTTG-C--AT-
gi|127877 : TTGGG--GGTT-GA--TGC-CCC---GA-G---GTCGGGTTTGTAC---AC-T-GAG-CCCT--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--A-----A-AA------CA---GGA-G--C--T----C-G---C-G--GTTT-C-----------CA-T--G--C-T---A------GTA-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-T-CCT-TAA----C-A--CC--------------CA--------------T-----AG-G-----GA-T---A---GG-T--GGA-C----------C--T-TACT-ATGGG-TC--TACATCAGAGCA-G-T-T------CTAC-C--C--------AAA----------TG---C-TA-CA-GCA--A-AC--------------G--TCAC----AG-CA-TTGC----CC----T---A-GT-A-AA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-TCT-GCCC-A--A---C-CGGAA-----A-GGTA----A-TAGG---GA-G-GAG---A--AAC-GC---A-GGGAT--T--TT-C-T-TT-AA-----GC--CC---AA----GG-C-ACAGGAGC-C---C------------T-G
gi|127878 : TTGAG--TGGTCGA--TGC-TCCA--TA-G----TCGAGCT--CACCGAAC-T-AA--CCCT--A-CTCAG--G----TT-TA-T--G-----A-AG------AATCCG-A-G--TA-T----A-T---CCG--GTT--C-----------CAAT--G--C-T---AATATA-G-A-A--C-CGA--TG--C-AAGTA-T-GACTTCCT-CGAT---C-GTCCC--------------CT--------------C--TC-AGTGCACCTGA-T---GACTGG-T--GGA-T----------CG-A-TTCT-ATGG--TT--TACA-----TCGTA-T-TACTGGTCTAC-C--CGGGCCTAAAG-----------TG---C-TG-TG-GTG--GTACC--CC--A-T--ATAATCCTCT---GG-TTACTGC----CC----TCCTA-GT-A-CAACCACC--T-ACGCT-CA--G-GCT-GCCC-A--G-C-CGCGGAA-----T-GG------ATTAGGGGAGA-G-G-GCACG--GCC-GC---A-GGGAAATT--CT-T-T-TT-AGAGACCGCGACG---AGCTAATA-A-GCAACAGCACAGTC------------TAGAAC--A--GTTTCACCG-GGGAGC-TCA---AC-AATC-------T--TGC----C---C--CT----AAAC--GATTTAAT------GCGCC---CT-AGAGTCT----TA-TT-CAC-AC-A-----GCTAG----CA--C-GCCTT--CGG-G-T-AAATA-----A--C-ACCT-AT---TGTTTACT--TC-CATAA---ACA---CA---A-GT-ACATA-G-A-AAGCAAG--G-AATGCTC-G-A--ATGGAAGATAGACAtaaactggtctcc
gi|127879 : GA--GGTT-GA--TGC-CCT---AA-G---GTCCGGTT-GT-C---AC-TGAA--CGCT--C-CTCAGATG----TTATA-G--------A-AA------TT---G-ATG--C--T----GCT---C-T--GGT--C-----------CA-T--G----T---AA---T-G-AGA--T-C-A---G--T-A--TT-T-GA-TTCC--CGAT---C-A--CC--------------CA--------------G--TC-AG-T-----GT-A---A--TGGGT--GGA-C----------A--A-TTTCGATA---T---TACA------CA-G-T-C------CTAC-G--A--------AA-----------TG---C--A-TG-G-G--G-ACC--AG--A-A--A-A--TCACG---TG-CAACTGC----CC----T---A-AT-A-CA-T--C---TAACACT-CA--G-TC--GCCC-A----T-T-CGGAA-----GAGA------A-TAGG---GA-T-A-G---G--A---GC---T-AGGA---T--T
gi|127880 : GG--GGGT-GA--TGC-TCC---TA-GCGTGTCGG------AC---AC-T-AA--CC----T-TTCAGA-G----TT-TA-G--------A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G---TT--C-----------C----------T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C----TT-T-GA-TTCTT--GA------G--CC--------------CT--------------C--TC-AG-G-----GA-T---AA-TGG-T--GGA-T-------------A-TTC--ATG---TT--TA-A-----GCA-G-T-T-----T-TAC-CATC--------AT-----------CG-----TG-TG-G-G--G-ACC--CCCAA-G--ATA--TTACT---GG-TAACT------CC----T---A-GT-A-C--CTAC---T-ACGCT--A--GTCCT-GCCC-A--G-C----GGAA-----T-GG------A-TAGG---G----G-G---G--GAC-GC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----G--A-GCAACAGCAC---C------------T-GAA---A--GTTTCCTCG--------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C-------T----AAAT--G------T------ATGCC---C--AT---CT----TACCC-T-T-AC-A-----GC--G----CAG-A-GC-AT--C-GCG-T-A---A-----G--C--CCT-A----TGTT--TC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-GT-AC-TA-G-A--A-GAAG--G-A----TCTG-A--AT-GAAAAT-GACAcatatcatagtttagcagtgagaaacacagca
gi|127881 : CC---TA-GT--GTCGGCTTTGCAC---AC-T-AA--CCCC--T-CTCAGT-G----TT-TA-G--A-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---T-C--GTTTCC-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A---T-T-GATTTCCT-CAA----T-G--CC--------------CT--------------T--TC-AG-G-----GA-T---A--T-G-T--GGA-T----------C--A-TTC--ATG---TT--TACA-----GTA-
gi|127882 : gggctgtgtTTGCCC---ACGT-AAGACCCC--T-CTCAGA-AGAATTT-TA-G--G-----A-AAAATAAATA---GGA-A--T--T----ACT---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--AAC-A--TG--C-A--TT---GA-TTC-T-CGA----C-A--CC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----CA-TC--A--TGG-T--GGA-T----------C--A--TG--ATG---TT--TACA-----GTA-G-T-T-----TCTAT-C--C--------AG-----------TA---C-TG-T--GCG--G-ACC--CC--A-GGAGTA--TCATCTTAGG-AAATTGCTTAATC----C---A-GTAA-CA-CCAC---T-TCGC--CA--G-CCT-GCCC-ATCG-CAC-CGAAA-----T-GGCGTCTTA-T------GA-A-G-G---G--AAC-GC---A--ATA---T--TT-C-TATT-AG-----GC--CA---AGA---GA-A-GCAACAGTAC---TTGTCACAGACAAT-GAAC--AATGTTTCCTCG-GTGTCTCTCAATGAC-AG-T-------TTGGCCCTTTC---C--CT----AACCAAG------TTAAATCATGCCCGTCT-AT---CTAAACAATCC-CAA-AC-ATCAATG---AATTTCAG-CGGCCACGTA-G-G-T-A---A-----G--CTACCTAA----TGTT--TCATTCTTG-ACTGGACG---TA---A-T--TC-Ttaaaaacttgtacggtcttacgcagttttctaacccagtactgtg
gi|127883 : C--T-CACAGG-GC---TT-TA-G--GGCCTAA-AG------TA---A-A-G--T-------A-T---T-G--GTG--G-----------CG----G--CAT---AG---T-G-A-A--C-A-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----CCG--CC--------------TT--------------C--TC-AG-G------A-T------TTG-T--GGA-T----------C--ACTTC--ATG---TT--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTA------------------------------------------------------------------TCACC---GGGTAACTGC----CC----T---A-GT-A-C--CCAC---T-GC----CA--G-C-T-GCCC-A--G-C-C-AGGGGAGGGGG-GG------G-CAGG---GA-AAG-G---G--GAC-GC---A-GATA---T--TT-C-T-TT-AG-----CC--AG---AG----GG-C-GCATC-------------------------GC--A--GTTTCCTC--G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----CG--C--CT-----ACC--G------T-------TGCT---CC-AT---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG---ACCAC--CGG-G-T-A---A-----G--C-A--T-A----TAGT--TT--TC-TG-A------G---TA---T-A--CT-TA-GAA-TG-AGAG--G-A----T-TA-G--AT-G-AGAT-GAC
gi|127884 : -CTCAGA-GATA-TT-TAAG--G-----AGAA------TAAG-G-A-G--C--TC---G-T---A-G--GTT--CACAGGAAAGAACAAT--G--C-T---AA---G-A-A-A--C-C-AAGTG--C-AATTTAT-GA-TCCCA-GAA----C-A--CCAAACAAATAGAAAACA--------------CGATG-AA-G-----GA-T---AAGTGG-T--GGAAC----------C--A-TTC--ATGGGATA--TACT-----GTA-G-TAT-----TCTAAAC--C--------AGGAAAAAACAAATG---CATG-TA-GCGCGG-ACCAACT--A-G--ATA--TCACC---GG-CAAC-GC----CC----A---G-AC-ATCA-TCAC---TTATGCTTCA--G-CCTTGTCC-A--A-C-C-CAGAA-----G-GG------A-TAGG---GA-G-G-G---G--GAC-G----A-GGGT---T--TTCC-T-TT-CG-----GT--CC---AG----GG-C-GCAGCAGCAC---C------------T-GAGC--A--GTTTCCTAA-C------TCA---GC-AG-C-------T--A-C----C---C--CT----AACC--T------T------ATGCT---CC-AG---CT----TTACC-CAC-CA-A-----C---G----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---A-----G--C-GCCT-A----TGTT--CC--TC-T--AC---CCG---TA---A-G--
gi|127885 : -G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TCCCT-CGA----C-G--CC--------------CT--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-TTC--ATG---TC--TACA-----GTA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-AGG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCACT---AG-TAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ATGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-ATGAA-----G-GG------A-TAGG---GC-G-G-G---G--GAC-GC---A-GGGA------TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----AG-A-GCAACAGCAG---C------------T-GAAC--A--CTTTTCTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--CT----AAC-----------------AT-------C-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---T----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---T-----G--C-ACCT-A----TGTT--TC--TC-TG-AC---GTG---TA---A-A--AC-------------------------CTG-A--AT-GAAGAT-GACAgtct
gi|127886 : --TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-G--CCCTCT----------CAGGGATATGCGCCCTC--TC-AG-G-----GA-TGAGA--CAC-T--AGT-CT---------C--A-TTC--ATG---TT--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTA------------------------------------------------------------------TCACC---GG-TAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGGA-----G-GG------A-CAGG---GA-G-G-G---G--GAC-GC---A-GAGA---T--TT-C-T-TT-AG-----AC--CG---AG----AG-A-
gi|127887 : T-CGA----C-A--TC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-T----------C--A-ATT--ATA---TC--TACA-----TAA-T-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-GCG--G-ACC--CC--A-G--
gi|127888 : --CC--------------AA--------------C--CC-AG-G-----GC-T---A--TGG-T--TGA-C----------C--A-ACT--ATG---TC--AACA-----ACA-G-C-C-----CCTAT-C--C--------AG-----------TG---C-TA-TG-GTG--G-A-C--CC--A-G--ATG--TCACC---GG-CGACTGC----CA----C---A-GT-A-T-----C---T--CACT-TA--G-CTT-GTCA-A--T-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TTGG---GA-G--------------AC---A-GGAA---T--TT-A-T-TC-AG-----GC--CT---AG----GG-G-GAATCAGCAC---C------------C-TAGCCAA--G--TCCTCG-G-------AA---GC-AA-C-------T--ACC----CATAC--CTGTGCAACCA-G------T------A-ATT---CC-AA---TT----TACCC-TAT-GC-A-----G---G----CAG-T-GCAAT--T-A-G-C-A---A-----G--C-GCCT-A----TGCC--CC--TC-AG-A
gi|127889 : --CC--------------TA--------------C--TC-AG-G-----GC-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-TTA--ATG---TC--GACA-----G-A-GCT-C-----CCTGA-T--C--------AG-----------AA---G-TA-TG-GTG--A-ACT--C
gi|127890 : C--------------CA--------------C--TC-CG-G-----GA-T---A--TAG-T--A-A-T----------C--A-TTC--ATG---TC--GACA-----GCA-G-T-T-----TCTAC-A--C--------AG-----------TG---C-CA-TG-GCG--G-ACT--CC--A-G--GTG--TCACT---GG-CAAATGC----TC----T---A-GC-A-TA-TCAC---T-AGGCT-CA--G-CCT-GCCA-A--A-C-C-TGGAA-----G-GG------A-TGGG---GA-G-G-G---G--GGC-AC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----AC--CC---AG----GG-T-GCAGCAGCAT---C------------T-AAGC--A--GTTTCCTCG-G------GTA---GC-AG-C-------T--ACC----C---C--CT----ACCA--G------T------AGGCC---CC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--C-G-C-T-T---A-----G--C-GCTT-A----TGCT--GC--TC-TG-AC---GCA---TA---A-G--AC-TA-G-A-TA-CAAG--A-A----TCTG-
gi|127891 : C--------------CA--------------C--TC-CG-G------A-T---AC-TAG-T--A-A-T----------C--T-TCC--ATG---TC--GACA-----GCA-G-T-T-----TCTACAC--T--------AG-----------TG---C-CA--G-GC---G-ATC--CA--A-G--GTG--T-ACC---TG-CAAATGC----TC----T---A-GC-A-AT-CCACTGGT-AGGCT-C---G-CCT-GCCA-A--ATC-C-TGGAA-----G-GGT-----A-TGGG---GA-G-G-G---G--G-C-AC---A-GGGA---TTATT-CAT-TTAAG-----AC--CA---GG----GG-C-GCAGCA--AT---C------------T-AAGC--A--G-TTCCTCG-G------GTA---GC-AG-C-------T----C----C---C--CT----ACCCA-G------T------CAGCC---CCAAG---CT----TACCC-C-C-AC-AAC---A---G----CAGCC-GCCAC--C-G-C-T-T---A--------C-G-CT-A----TGCT--GC--TC-TG-AC---GCAT--TA---A-G--AC-TACG-A-TA-CAAGAAA-A----TCTG-
gi|127892 : A--------------T--TC-AG-G-----AA-T---A--TGG-T--GAA-T----------C--A-TTC--ATG---TC--AGCA-----GGA-G-C-A-----TCTAT-A--C--------AG-----------TG---C-TA-TG-ATG--G-ACC--CC--A-G--ATG--TCATT---GT-TGGCTGT----CC----C---A-GT-A-TC-TCAC---T-AAGGT-CA--G-CCT-GTCA-A--A-A-C-CTGAA-----G-GA------A-TGGA---GA-G-A-G---A--GAC-AC---A-GGGA---T--TT-C-T-TA-AG-----GA--CAGGCAG----GC-AGGCAGCAGCAC---C------------T-GGGC--A--GTTTCCTCA-G------GCA---GC-TG-C-------T--ACA----C---C--CT----ACCC--A------T------ATACC---TC-AT---CC----TAGCT-CAC-AC-A-----G---G----CA-------------------A---A----------GCCT-A----TGCC--CC--TC-TG-AT---GCGTAATA---A-G--GC-TA-A-A-GA-CAAG--G-
gi|127893 : -T-C-----TCTAC-C--A--------AA-----------TG---C-TA-TG-GCG--G-AGC--CC--A-G--ATG--TCACC---AG-CAACTGC----CA----T---A-AT-A-CA-CCTC---T-ACGCT-CACAG-TCT-ACCC-A--A-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TAGG---GA-G-G-A---G--GAC-GC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----GT--CC---AG----GG-C-GCAGCAGTGC---C------------T-GGGC--A--GTTTTCTCA-G------GCA---AC-AG-CTACAAAGT--ACC----C---C--CT----ACCA--G------T------ATGCC---CC-AG---CT----TAATA-CAA-AA-A-----G---G----CAG-C-CCCAC-----------------------C-GCCA-A----TGTT--CC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--GC-TA-G-A-TA-CAAG--G-A----TCTG-C--AT-TATGAT-GGCA
gi|127894 : --G-CCT-GTCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TGGG---GGCG-G-G---A--AAC-GC---A-GCGA---T--GT-C-T-TC-AG-----GC--CC---AG----
gi|127895 : --G-CCT-GTCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TGGG---GC-G-G-G---A--AAC-GC---A-GCGA---T--GT-C-T-TC-AG-----CC--Ca
gi|127896 : CT-GCCC-A--A-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TAGG---GA---------G--GAC-GC---A-GGGA---T--TG-C-T-TT-AG-----GT--CC---AG----GG-aga
gi|127897 : G-----AC--CG---AA----AG-A-ACAGCA---C---C------------T-GTAC--A--GTTTCTTAG-G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--CT----GAAC--G------T------ATGCC---TC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-
gi|127898 : C---C------------T-GGGC--T--GTTTTCTCG-G------GGA---AC-A----------T--ACC----C---CTCCT----ACCA--G------T------ATGTC---C--AG---CT----T---T-TAC-AC-A-----A---A----CAG-CAGCCTC--C-------A---C-----G--C-GC---------ATT--TC--TC-TG-AC---GCG---TA---G-G--C---A-G-A-TA-A-----G-A----T-TG-C--AT-TATGAT-GGCA
gi|127899 : C-A-----G---A----AGG-T-GCCAC--C-G-G-T-T---A-----G--C-GCTT-A----TGTC--CC--TC-TC-AT---ACG---TAATGA-G--AC-TA-G-A-TA-CAAG--G-A----TCTG-T--GT-TATGAT-GACA
gi|127900 : C-A-----G---A----AGG-T-GCCAC--C-G-G-T-T---A-----G--C-GCTT-A----TGTC--CC--TC-TC-AT---ACG---TAATGA-G--AC-TA-G-A-TA-CAAG--G-A----TCTG-T--GT-TATGAT-GACA
blockSeqs : TT T AA T ATC T CGT T CGA G T GA AT T A GAAT A A AC GCCTA T AATAAA TCC G T GC TA TAATAT C TA TC ACAGGAAAGAA A TT TG A TAA TATA T G GT A G AG CC C AG A T C T ACCA GTC CTCTCAGGGATATGCGCCCT GA T T CACCT A GAG AC G TA A CATTCAATGA TA C CG GGA CT TCAGA T T A ACTGG A CGGGCCTAA GAAAAAACAAA AAT A G C CG T AA CA A GA AT CTTA G TTAA TAGG CCT T A A AA TGG A T CA T T C TCG A G AGGGG A CGTCTT T GGA AA A AGG AT C CAG A AAT TA C A A A AGACC GA AGGC CTAA CA AGT TGTCACAGACAA A CA AT C TGTCTCT ATG A T TACAAAG TGG CTTT ATA TC GTGC AA ATTTAA TAAATC CGT A AGT AAAC T A A TCAAT CTA ATTT C G GT GG T AAAT TACATG TA A GCTA TAC AT T T TGG TAA ATG A TCC A C A A GC AA C ATGC TGA GG A
blockSeqs : . C A . A . T T T G T G . . T ATA . . . . G . AG G . . A ATAAT . . T . A . . . TA CA T . . . . . . . AT . . T . T CG AAACAAATAGAAAACA . . . . . C AG . . . T G . T GG . TCAGA . C . . A ATC A . . . . . . . C . T . T . . . . . . T AA C T . T . . . AT . . . . TA . . CG . CAC . . . . T . . . . . . . G A AG . . . . . C GGAGCT . . . . G . G . . A . . . . . . . . . AC C . . A . GC . AA GCC A A T T . . . . T ATG . TA . . . . G . . . AA G .
blockSeqs : . . . . . . . T . . G . . . . C . . . . . . . . . . . ATAGC . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . T A CA . . . . . C A . . . . . . T G . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . T . . T . . . . . . . . . . . . . . G A A . . . . . . T . . . . G . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . GG . A G A . . T . . . . C . . TA . . . . G . . . A G .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GCT . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . G CT . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . T . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . G A A . . T . . . . T . . T . . . . G . . . A G .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACT . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . A CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . C . A . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . A G A . . C . . . . . . . T . . . . C . . . A T .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CGT . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . A CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . C . A . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . T G G . . C . . . . . . . G . . . . C . . . C T .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . A . C . . . . . . G . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . A G C . . T . . . . . . . G . . . . G . . . C C .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . G . C . . . . . . T . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . A A A . . T . . . . . . . T . . . . G . . . A G .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CC . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . A CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . T . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . T A A . . T . . . . . . . T . . . . G . . . C G .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CC . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . C CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . T . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . A G G . . C . . . . . . . T . . . . A . . . A G .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . A CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . C . A . . . . . . A . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . A G A . . T . . . . . . . G . . . . G . . . A G .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . G CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . C . C . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . A G A . . T . . . . . . . T . . . . A . . . G G .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CC . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . G TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . T . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . A G G . . T . . . . . . . C . . . . C . . . A T .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . A CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . T . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . A G A . . C . . . . . . . A . . . . C . . . C T .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . A CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A . A . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . A G G . . T . . . . . . . A . . . . C . . . C T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . A CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . G . C . . . . . . G . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . T G G . . C . . . . . . . A . . . . C . . . T T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . G CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . C . C . . . . . . G . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . T G G . . G . . . . . . . G . . . . A . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . G CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . G . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . A G G . . G . . . . . . . G . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . A CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . T . . . . . . . G . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . G . A . . . . . . G . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A G G . . C . . . . . . . C . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . C . . . . . . . T . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T . G . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . G . . C . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . C . T . . . . . . G . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . G . . T . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . A . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . C . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . C . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TTTGGG--GGGT-GA--TGC-CCC---TA-G---GTCGGGTTTGCAC---AC-T-AA--CCCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-G--CC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-TTC--ATG---TC--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TG---C-TG-TG-GCG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCACC---GG-CAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TAGG---GA-G-G-G---G--GAC-GC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----GG-A-GCAGCAGCAC---C------------T-GAGC--A--GTTTCCTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--CT----AACC--G------T------ATGCC---CC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---A-----G--C-GCCT-A----TGTT--CC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--NC-TA-G-A-TA-NAAG--G-A----TCTG-N--AT-GAAGAT-GACA
finalCons : TTTGGG--GGGT-GA--TGC-CCC---TA-G---GTCGGGTTTGCAC---AC-T-AA--CCCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-G--CC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-TTC--ATG---TC--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TG---C-TG-TG-GCG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCACC---GG-CAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TAGG---GA-G-G-G---G--GAC-GC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----GG-A-GCAGCAGCAC---C------------T-GAGC--A--GTTTCCTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--CT----AACC--G------T------ATGCC---CC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---A-----G--C-GCCT-A----TGTT--CC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--NC-TA-G-A-TA-NAAG--G-A----TCTG-N--AT-GAAGAT-GACA
Alignments
lowQualScore : 1111111111 111111111111111111111111111111 1111111
lowQualScore : 22 0 4 55 2 555 2 555 1 0 555 3 5 44 22 1 3 8888 1 1 22 44444 3 555555 555 3 1 22 44 3333333333 1 22 44 77777777777 3 22 22 1 555 77777 3 1 22 1 1 22 22 1 44 1 1 3 1 6666 3333 222222222222222222222222222222 22 1 1 33333 1 555 66 1 22 1 7777777777 33 1 44 555 22 77777 1 2 1 33333 2 55555555555 88888888888 222 1 1 1 22 1 22 33 1 33 22 2222 1 3333 3333 222 1 1 3 33 444 3 1 33 1 1 1 5555 1 1 33333 1 777777 1 222 111 1 444 11 1 222 1 333 11 1 1 1 1 33333 11 5555 5555 333 222 777777777777 1 22 22 3 1111111 222 1 1 5555555 222 3333 444 22 3333 0 55 444444 444444 222 1 222 3333 1 1 1 66666 444 3333 1 3 22 555 1 44444 44444444 22 3 5555 222 22 1 1 222 777 555 1 666 1 1 1 1 33 22 1 4444 6666 22 0 2
lowQualScore : .. . . .. . ... . ... . . ... . . .. .. . . .... . . .. ..... . ...... ... . . .. .. .......... . .. .. ........... . .. .. . ... ..... . . .. . . .. .. . .. . . . . .... .... .............................. .. . . ..... . ... .. . .. . .......... .. . .. ... .. ..... . . . ..... . ........... ........... ... . . . .. . .. .. . .. .. .... . .... .... ... . . . .. ... . . .. . . . .... . . ..... . ...... . ... ... . ... .. . ... . ... .. . . . . ..... .. .... .... ... ... ............ . .. .. . ....... ... . . ....... ... .... ... .. .... . .. ...... ...... ... . ... .... . . . ..... ... .... . . .. ... . ..... ........ .. . .... ... .. . . ... ... ... . ... . . . . .. .. . .... .... .. . .
lowQualScore : 99 5 2 00 1 555 0 555 5 4 222 8 7 55 55 7 5 5555 7 7 44 33333 5 000000 444 5 7 44 11 5555555555 7 33 00 99999999999 3 33 44 7 444 99999 6 8 55 8 8 55 55 8 88 7 7 5 7 9999 5555 000000000000000000000000000000 00 4 4 66666 4 444 88 4 00 4 7777777777 44 4 88 999 00 11111 4 9 4 66666 9 88888888888 22222222222 666 5 5 5 00 5 00 77 5 77 22 8888 6 3333 3333 777 5 5 1 55 222 1 5 44 4 4 4 9999 4 4 44444 4 222222 4 444 999 4 888 99 4 444 4 888 99 4 4 4 4 44444 99 5555 9999 000 777 999999999999 5 33 33 3 1111111 999 7 7 4444444 555 5555 666 33 5555 1 66 888888 888888 999 7 999 5555 7 7 6 22222 444 4444 6 2 33 333 7 77777 77777777 11 3 2222 444 33 6 6 999 999 888 7 666 8 9 9 9 66 66 9 2222 1111 55 2 4
consensus : TTTGGG--GGGT-GA--TGC-CCC---TA-G---GTCGGGTTTGCAC---AC-T-AA--CCCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-G--CC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-TTC--ATG---TC--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TG---C-TG-TG-GCG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCACC---GG-CAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TAGG---GA-G-G-G---G--GAC-GC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----GG-A-GCAGCAGCAC---C------------T-GAGC--A--GTTTCCTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--CT----AACC--G------T------ATGCC---CC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---A-----G--C-GCCT-A----TGTT--CC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--NC-TA-G-A-TA-NAAG--G-A----TCTG-N--AT-GAAGAT-GACA
Reference ( family-523 ) : TTTGGG--GGGT-GA--TGC-CCC---TA-G---GTCGGGTTTGCAC---AC-T-AA--CCCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-G--CC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-TTC--ATG---TC--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TG---C-TG-TG-GCG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCACC---GG-CAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TAGG---GA-G-G-G---G--GAC-GC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----GG-A-GCAGCAGCAC---C------------T-GAGC--A--GTTTCCTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--CT----AACC--G------T------ATGCC---CC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---A-----G--C-GCCT-A----TGTT--CC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--NC-TA-G-A-TA-NAAG--G-A----TCTG-N--AT-GAAGAT-GACA
gi|127862 : G--GGGT-GA--TGA-TCC---TA-G---GTCGGGTTTGCAC---AT-T-AA--CCCT--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTTAT-CGA----T-G--CC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGG-T----------C--A-TTC--ATG---TC--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-GCG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCACT---GG-TAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------G-TAGG---AA-G-A-G---G--AAC-AC---A-GAGA---C--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----AG-A-GCAACAGCAC---C------------T-GAAC--A--GTTTCCTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--TT----AACC--G------T------ATGCC---CC-AG---CT----TACCC-TTC-AT-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---A-----G--C-ACCT-C----TGTT--TC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--TC-TA-G-A-TA-GAAG--G-A----TCTG-A--AT-GAAGAT-GACA
gi|127863 : tttgcatTTTGG--GGGT-GA--TGC-TCC---TA-G---GCCGGGTTTGCAC---AC-T-AA--CCCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-A--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C------A---A-G-A-A--T-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTTTT-CGA----C-A--TC--------------CA--------------T--TC-AG-G-----GA-T---A--TAG-T--GGA-T----------C--A-TTC--ATG---TC--TACA-----GTA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-GCG--G-ACC--CC--T-A--ATA--TCACT---GG-TAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAT---T-TCGCT-CA--G-CTT-GCCC-A--T-C-C-CGAAA-----G-AG------A-GAGG---AA-T-G-G---G--GAC-GC---A-TGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----AG-A-GTAACAGCAC---C------------T-GAAC--A--GTTTCCTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----A---C--CT----AACC--G------T------GTGCC---CC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---A-----G--C-ACCT-A----TGTT--TC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--TC-TA-G-A-TA-GAAG--G-A----TTTG-A--AT-GAAGAT-GACA
gi|127864 : TTTGG--GGGT-GA--TGC-TCC---TA-G---GTCGGGTTTG-AC---AC-T-AA--CCCC--T-CTTAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---T-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----T-G--TC--------------CT--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-T----------C--A-TTC--ATG---TT--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTAC-T--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-CCG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCACT---GG-TAACTGC----CCTAGGT---A-GT-A-TA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TACG---GA-A-G-G---G--GAC-AC---A-GGGA---T--TC-A-T-TT-AG-----GC--CG---AG----AG-A-GCAACATCAC---C------------T-GAAC--A--GTTTCCTTG-G------TCG---GC-AG-T-------T--GCC----C---C--CT----AA----G-----------------C---TC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--C-T-A-T-G---A-----A--C-ACCA-T----TGTT--TC--TC-TA-AT---GCGT--TA---A-G--TC-TA-G-A-TA-GAAG--G-A----TCTG-A--AT-GAAGAT-GACA
gi|127865 : TTAGG--GGGT-GAAATGCTCCC---TT-A---GTTGGGTTTTCAC---AC-T-AA--CACCATC-CTCAGAAG----TT-CA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--TTAATA-T---C-G---TT--C-----------CA-T--GTGC-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTTCTTCGA----T-A--CC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-T----------C--A-TTC--ATG---TCCTTACA-----GTA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TAAATC-TGGTG-GCG--G-ACC--CCC-A-G--ATA--TCACT---GG-TAACTGC----CC----T---ATGT-A-CAACCAC---T-TCGCT-CA--G-CCT-GCCCCA--T-A-C-CCGAA-----A-GA------A-TAGG---AA-G-G-G---G--GACCGC---AAGGGA---T--TT-C-T-TT-A------GC--CG---AGA---AG-A-GCAACAGCAC---C------------T-GAAC--A--GTTTCCTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--G-C----C---C--CT----AACC--G------T------ATG-C---TC-AG---CT----TACCCTCACAAC-G-----G---T----AAG-C-GCCAC--C-G-G-TAA---A-----G--C-ACCTAA----TGTT--TC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-GTCCC-TA-G-A-TA-GAAG--G-A----TTTG-A--AT-GAAGAT-GA
gi|127866 : TTTGGG--GGTT-GA--TGC-CCC---TA-G---GTCGGGTTTGTAC---AC-T-AA--CCCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--C--T----C-C---T-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---T-G-A-A--C-A-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-A--CC--------------CA--------------C--TC-GG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-CCATTCAATGAC--A-TTC--ATG---TC--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTAC-A--C--------AT-----------TG---T-TG-TG-GCG--A-ACC--CC--A-G--ATA--TCACC---GG-CAACTGC----CC----T---T-GT-A-CA-TCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--A-C-C-CGGAC-----A-AA------T-TAGC---GA---G-A---G--GAT-GC---A-GGGT---T--TT-C-C-TT-AG-----GC--CC---AG----GA-A-GCAGCAACAC---C------------T-GAGC--A--GTGTCTTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--ACC----C---C--CT----ACAC--G------T------ATGCC---CC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--T-G-GTT-A---ATACATG--T-ACCT-A----TGTT--CA--TC-TG-GC---GCG---CA---A-G--
gi|127867 : TTTGGG--GGTT-GA--TGC-CCC---TA-A---GTCCGGGTTGTAC---AC-T-GA--ACCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--C--T----C-C---T-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---T-G-A-A--C-C-A--TG--T-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-A--CC--------------CA--------------G--TC-AG-T-----GA-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-TTC--ATA---TC--TACA-----GCA-G-T-C-----TCTAC-C--A--------AA-----------TG---C-TA-TG-GCG--G-ACG--CC--A-G--ATG--TCACC---GG-CAACTGC----CC----T---A-AT-A-CA-CTTC---T-ACACT-CA--G-TCT-GCCC-A--A-T-C-CGGAA-----G-GA------A-TAGG---GA-T-G-A---G--GAC-GC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----CT--CC---AG----GG-C-ACAGCAGTGC---C------------T-GGGC--A--GTTTTCTCG-G------GCA---AC-AG-C-------T--ACC----C---C--CT----ACCA--G------T------ATACC---CC-AG---CT----TA-----AC-ACAA-----A---A----CGG-C-G-CAC-----------------------C-GCCA-A----TGTT--CT--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--GC-TA-G-A-TA-CAAG--A-A----TCTG-C--AT-TATGAT-atct
gi|127868 : TTTGG--GGGT-GA--TGC-TCC---TA-G---GTCGGGTTTGTAC---AC-T-AA--CCCC--T-CTCACA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-C--TTAT----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--
gi|127869 : TTTGGG--GGTT-GA--TGC-CCT---TA-G---GTCGAGTTTGTAC---AC-T-GA--CATC--T-CTCAAT-G----TA-TA-G--G-----A-AA------TA---G-G-A--C--T----------C-GTAGTC--C-----------CA-T--G--C-T---AA---G-T-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-A--CC--------------AA--------------C--TC-AG-G-----GA-G---A--TGG-T--AGA-C----------C--A-TTC--ATG---TA--TACT-----GCA-G-T-T-----TTTAC-C--C--------AG-----------T
gi|127869 : ----CC----C---A-GT-A-T---CAT---C-ACGC--CAT-G-CCT-GTCC-A--A-C-C-CTGAA-----G-GG------A-TAGG---GA-G-G-GAGGG--GAC-GC---A-GGAA---T--TT-C-T-TT-GG-----GC--C----------------CAGCAACAT---C------------T-GAGC--A--GTTTCCACA-G------------GT-AG-T-------T--TCC----C---C--------------G------T------ATGCC---TA-AG---CT----TACCC--AC-AC-A-----G---G----CAG-C-ACCAC--C-A-G-T-T---A-----G--C-CCCT-AGCTATGTT--TC--TC-TG-AA---GCG---TA---A-T--GC-TA-A-A-TA-CAAG--G-A----CCTG-C--AT-TATGAT-GACAatcatcacgccatgcctgtccaaccctgaagggatagggagggaggggacgcaggaatttctttgggcccagcaacatctgagcagtttccacaggtagtttccccgtatgcctaagcttacccacacaggcagcaccaccagttagcccctagctatgtttctctgaagcgtaatgctaaatacaaggacctgcattatgatgaca
gi|127870 : tttgggggttgatgcccttaggtcgagtttgtacactgacatctctcaatgtataggaaataggactcgtagtcccatgctaagtaaccatgcatttgattcctcgacaccaactcagggagatggtagaccattcatgtatactgcagtttttaTTTGGG--GGTT-GA--TGC-CCC---TA-G---GTCGGGTTTGTAC---AC-T-GA--GCCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--A-----A-AA------CA---G-A-G--C--T----C-G---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---A------GTA-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-TAA----C-A--CC--------------CA--------------G--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-TTC--TTG---TC--TACATCAGAGCA-G-T-T-----TCTAC-C--A--------AA-----------TG---C-TA-CA-GCG-----------------------TCACC---AG-CATTTGC----CC----T---A-GT-A-AA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-TCT-GCCC-A--A-C-C-CGAAA-----G-GA------A-TAGG---GA-G-G-A---G--AAC-GC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AA-----GC--CA---AG----GG-C-ACAGGAGCGC---C------------T-G
gi|127871 : TTTGGTTTGGGT-GA--T---CCC---TA-G---CTCGGATT-GCAC---ACGT-AA--CCCT--TTCTCAGA---------TA-G--G-----A-AA-------A---G-A----T--T----A-TAATC-G--GTT--C------------A-T--G--C-T---AGC--A-G-A-A--G-C-A---G--C-----T-T-GA-T-CTT-CGA----C-C--AC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-A----------T--A-TT-----A---TC--TACA-----GTA-G-T-T-----T-TAC-C-----------AG-----------TA---C-TG-TGCGCG--G-ACC--CC--AAG--ATA--TCACT---GG-TAA--GC----CC----A---C-GT-AACA-CCAC---T---GCT-CA--G-CCC-TCCC-A----C-C-CGAAA-----T-G-------A-TAGA---AA-G-G-G---G--AGC-AC-----GGGA---T--T--C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----CG-A-GCAACAGCA----C------------T-GAAC--A--GTT---CCG-G------T-A---GCAAG-C-------T--GCC----C---C--GT----AACC--G------T-------TCCC---CC-AG---CT----TACCC-
gi|127871 : C-TG-AC---GCG---TA---AAG--TC-CA-G-AATA-GAAG--GCA----TTTG-TGAAT-CAAGAT-GACAagggattcaacggcgcgcaacaaaaacccacagaggcatcagtaaaaattcgaacatagtaacccggttagcctacaaaaacctgacgcgtaaagtccagaatagaaggcatttgtgaatcaagatgaca
gi|127872 : tttggtttgggtgatccctagctcggattgcacacgtaaccctttctcagataggaaaagattataatcggttcatgctagcagaagcagcttgatcttcgaccaccactcagggatatggtggaatattatctacagtagttttaccagtactgtgcgcggaccccaagatatcactggtaagcccacgtaacaccactgctcagccctcccacccgaaatgatagaaaggggagcacgggattctttaggccgagcgagcaacagcactgaacagttccggtagcaagctgccccgtaaccgttcccccagcttacccagggattcaacggcgcgcaacaaaaacccacagaggcatcagtaaaaattcgaacatagtaacccggttagcctacaaaaacTTTGGG--GATA-GA--TGC-A-----TA-G---GTCTGGTTTGCAC---AC-T-GA--CCCT--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----G-AA------TA---G-G-A--T--C----G-----C-G--TTT--T-----------CA-T--G--C-C---AG---C-A-A-A--T-C-A--TA--C-A--TT-C-GA-TTC---TGA----C-A--CC--------------CA--------------
gi|127873 : TTTGG--GGTT-GA--TGC-CCC---TATG---TTCGGG-TTGTAC---AC-T-GA--ACCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--C--T----C-C---T-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---A
gi|127874 : G--GAGT-GAA-TGC-TCC---TA-G---GTCGGGTT-GCAC---AC-TTAA--CCCC--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-A--G--C-CTAAAA---A-A-A-A--A-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-G--CC--------------CT--------------C--TC-AG-G------A-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-T-C--A-G---TC--TAGA-----GTA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-GCG--A-ACC--CC--A-C--ATA--TCATT---GG-T--CTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ATACT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------T-TAGG---CG-A-G-G---G--GAT-GCCAGA-GGCA---T--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----AG-A-GCAACAGCAC---C------------T-GAAC--A--GTTT-CTCGCG------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--CT----AACC--G------T------ATGCC---CC-AG---TT----TACCC-CAC-AC-A-----A---G----CAG-C-GCCAC--C---G-T-A---A-----G--C-ACCT-T----TGTT--TC--TC-TG-AA---GCG---TA---A-G--TC-TA-G-A-TA-GAAG--G-A----TCTG-A--AT-GAAGAT-GACA
gi|127875 : tttG--GAGT-GA--TGT-CC----TA-G----TCGGCGTTGCAC---AC-TTAA--CCCC----CTCAGA-G----TT-TA-G--G-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-CTA-AA---A-A-A-A--A-C-A--TGCCC-A--TT-T-GA-TTCCT-C-A----C-G--CC--------------C---------------C--TC-AG-G-----GA-TC--A--T-G-T--GGA-C----------C--A-TTC--ATG---TC--TAGA-----G-A-GTT-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-GC---A-ACC--CC--A-AT-ATA--TTG-C---GT-CAA-TGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACTAC-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------T-TAGG---GA-G-G-G---GATGCC-GC---A--GGA---T--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----AG-A-GCAACAGCAC---C------------T-GAAC--A--GT---CTCGCG------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--CT----AACC--G------T------ATGCC---CC-AG---TT----TACCC-C-C-AC-A---------G----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---A-----GCCC-ACCT-T----TGTT--TC--TC-TG-AA---GCGC--TA---A-G--TC-TA-G-A-TA-GAAG--G-A----TCTGAA--AT-GAAGAT-
gi|127876 : tttTTGGG--CGGTTAA--TGT-CCCATCTA-G---ATCATGGTTGTACT--AA-G-AA--CTCC--T-CCCAAA-T----GT-TA-GACG-----ATAA------TA---G-A-GGCT--C----A-TAGCT-G--GT---------------CA-TTTG--C-T---AT---GTG-A-AGTC-C-A--TG--CCA--TT-TTGA-TTCCT-CGAACCAC-A--CC--------------TA--------------G--TCTAG-G-----GAAT---A--TGA-TTAGGA-C----------CTAA-TTC--ATG---TC--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTGC-C--A--------AA-----------TG---C-TA-TT-ACG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCACC---GA-CAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACGAT-CA--G-TCT-ACCC-A--A-C-C-TAGAT-----G-TG------A-TAGG---GA-G-G-A---G--GAC-AC---A-GGGA---T--TT-A-T-TT-AG-----GT--CC---AG----GGCA-GCAGCAGCGC---C------------T-GGGG--A--GTTTTCTCA-A------ACA---GA-AG-A-------T--A-C----C---C--CT----ATCT--G------T------ATA-C---CC-AG---CT----TACCC-AAC-GC-A-----G---G----CAG-T-GCAAC--C-A-G-C-T---A-----A--C-GCCT-A----TATT--CC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--GC-TA-G-A-TA-AAAG--G-A----TTTG-C--AT-
gi|127877 : TTGGG--GGTT-GA--TGC-CCC---GA-G---GTCGGGTTTGTAC---AC-T-GAG-CCCT--T-CTCAGA-G----TT-TA-G--A-----A-AA------CA---GGA-G--C--T----C-G---C-G--GTTT-C-----------CA-T--G--C-T---A------GTA-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-T-CCT-TAA----C-A--CC--------------CA--------------T-----AG-G-----GA-T---A---GG-T--GGA-C----------C--T-TACT-ATGGG-TC--TACATCAGAGCA-G-T-T------CTAC-C--C--------AAA----------TG---C-TA-CA-GCA--A-AC--------------G--TCAC----AG-CA-TTGC----CC----T---A-GT-A-AA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-TCT-GCCC-A--A---C-CGGAA-----A-GGTA----A-TAGG---GA-G-GAG---A--AAC-GC---A-GGGAT--T--TT-C-T-TT-AA-----GC--CC---AA----GG-C-ACAGGAGC-C---C------------T-G
gi|127878 : TTGAG--TGGTCGA--TGC-TCCA--TA-G----TCGAGCT--CACCGAAC-T-AA--CCCT--A-CTCAG--G----TT-TA-T--G-----A-AG------AATCCG-A-G--TA-T----A-T---CCG--GTT--C-----------CAAT--G--C-T---AATATA-G-A-A--C-CGA--TG--C-AAGTA-T-GACTTCCT-CGAT---C-GTCCC--------------CT--------------C--TC-AGTGCACCTGA-T---GACTGG-T--GGA-T----------CG-A-TTCT-ATGG--TT--TACA-----TCGTA-T-TACTGGTCTAC-C--CGGGCCTAAAG-----------TG---C-TG-TG-GTG--GTACC--CC--A-T--ATAATCCTCT---GG-TTACTGC----CC----TCCTA-GT-A-CAACCACC--T-ACGCT-CA--G-GCT-GCCC-A--G-C-CGCGGAA-----T-GG------ATTAGGGGAGA-G-G-GCACG--GCC-GC---A-GGGAAATT--CT-T-T-TT-AGAGACCGCGACG---AGCTAATA-A-GCAACAGCACAGTC------------TAGAAC--A--GTTTCACCG-GGGAGC-TCA---AC-AATC-------T--TGC----C---C--CT----AAAC--GATTTAAT------GCGCC---CT-AGAGTCT----TA-TT-CAC-AC-A-----GCTAG----CA--C-GCCTT--CGG-G-T-AAATA-----A--C-ACCT-AT---TGTTTACT--TC-CATAA---ACA---CA---A-GT-ACATA-G-A-AAGCAAG--G-AATGCTC-G-A--ATGGAAGATAGACAtaaactggtctcc
gi|127879 : GA--GGTT-GA--TGC-CCT---AA-G---GTCCGGTT-GT-C---AC-TGAA--CGCT--C-CTCAGATG----TTATA-G--------A-AA------TT---G-ATG--C--T----GCT---C-T--GGT--C-----------CA-T--G----T---AA---T-G-AGA--T-C-A---G--T-A--TT-T-GA-TTCC--CGAT---C-A--CC--------------CA--------------G--TC-AG-T-----GT-A---A--TGGGT--GGA-C----------A--A-TTTCGATA---T---TACA------CA-G-T-C------CTAC-G--A--------AA-----------TG---C--A-TG-G-G--G-ACC--AG--A-A--A-A--TCACG---TG-CAACTGC----CC----T---A-AT-A-CA-T--C---TAACACT-CA--G-TC--GCCC-A----T-T-CGGAA-----GAGA------A-TAGG---GA-T-A-G---G--A---GC---T-AGGA---T--T
gi|127880 : GG--GGGT-GA--TGC-TCC---TA-GCGTGTCGG------AC---AC-T-AA--CC----T-TTCAGA-G----TT-TA-G--------A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---C-G---TT--C-----------C----------T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C----TT-T-GA-TTCTT--GA------G--CC--------------CT--------------C--TC-AG-G-----GA-T---AA-TGG-T--GGA-T-------------A-TTC--ATG---TT--TA-A-----GCA-G-T-T-----T-TAC-CATC--------AT-----------CG-----TG-TG-G-G--G-ACC--CCCAA-G--ATA--TTACT---GG-TAACT------CC----T---A-GT-A-C--CTAC---T-ACGCT--A--GTCCT-GCCC-A--G-C----GGAA-----T-GG------A-TAGG---G----G-G---G--GAC-GC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----G--A-GCAACAGCAC---C------------T-GAA---A--GTTTCCTCG--------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C-------T----AAAT--G------T------ATGCC---C--AT---CT----TACCC-T-T-AC-A-----GC--G----CAG-A-GC-AT--C-GCG-T-A---A-----G--C--CCT-A----TGTT--TC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-GT-AC-TA-G-A--A-GAAG--G-A----TCTG-A--AT-GAAAAT-GACAcatatcatagtttagcagtgagaaacacagca
gi|127881 : CC---TA-GT--GTCGGCTTTGCAC---AC-T-AA--CCCC--T-CTCAGT-G----TT-TA-G--A-----A-AA------TA---G-A-G--T--T----A-T---T-C--GTTTCC-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A---T-T-GATTTCCT-CAA----T-G--CC--------------CT--------------T--TC-AG-G-----GA-T---A--T-G-T--GGA-T----------C--A-TTC--ATG---TT--TACA-----GTA-
gi|127882 : gggctgtgtTTGCCC---ACGT-AAGACCCC--T-CTCAGA-AGAATTT-TA-G--G-----A-AAAATAAATA---GGA-A--T--T----ACT---C-G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--AAC-A--TG--C-A--TT---GA-TTC-T-CGA----C-A--CC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----CA-TC--A--TGG-T--GGA-T----------C--A--TG--ATG---TT--TACA-----GTA-G-T-T-----TCTAT-C--C--------AG-----------TA---C-TG-T--GCG--G-ACC--CC--A-GGAGTA--TCATCTTAGG-AAATTGCTTAATC----C---A-GTAA-CA-CCAC---T-TCGC--CA--G-CCT-GCCC-ATCG-CAC-CGAAA-----T-GGCGTCTTA-T------GA-A-G-G---G--AAC-GC---A--ATA---T--TT-C-TATT-AG-----GC--CA---AGA---GA-A-GCAACAGTAC---TTGTCACAGACAAT-GAAC--AATGTTTCCTCG-GTGTCTCTCAATGAC-AG-T-------TTGGCCCTTTC---C--CT----AACCAAG------TTAAATCATGCCCGTCT-AT---CTAAACAATCC-CAA-AC-ATCAATG---AATTTCAG-CGGCCACGTA-G-G-T-A---A-----G--CTACCTAA----TGTT--TCATTCTTG-ACTGGACG---TA---A-T--TC-Ttaaaaacttgtacggtcttacgcagttttctaacccagtactgtg
gi|127883 : C--T-CACAGG-GC---TT-TA-G--GGCCTAA-AG------TA---A-A-G--T-------A-T---T-G--GTG--G-----------CG----G--CAT---AG---T-G-A-A--C-A-A--TG--C-A--TT-T-GA-TTCCT-CGA----CCG--CC--------------TT--------------C--TC-AG-G------A-T------TTG-T--GGA-T----------C--ACTTC--ATG---TT--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTA------------------------------------------------------------------TCACC---GGGTAACTGC----CC----T---A-GT-A-C--CCAC---T-GC----CA--G-C-T-GCCC-A--G-C-C-AGGGGAGGGGG-GG------G-CAGG---GA-AAG-G---G--GAC-GC---A-GATA---T--TT-C-T-TT-AG-----CC--AG---AG----GG-C-GCATC-------------------------GC--A--GTTTCCTC--G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----CG--C--CT-----ACC--G------T-------TGCT---CC-AT---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG---ACCAC--CGG-G-T-A---A-----G--C-A--T-A----TAGT--TT--TC-TG-A------G---TA---T-A--CT-TA-GAA-TG-AGAG--G-A----T-TA-G--AT-G-AGAT-GAC
gi|127884 : -CTCAGA-GATA-TT-TAAG--G-----AGAA------TAAG-G-A-G--C--TC---G-T---A-G--GTT--CACAGGAAAGAACAAT--G--C-T---AA---G-A-A-A--C-C-AAGTG--C-AATTTAT-GA-TCCCA-GAA----C-A--CCAAACAAATAGAAAACA--------------CGATG-AA-G-----GA-T---AAGTGG-T--GGAAC----------C--A-TTC--ATGGGATA--TACT-----GTA-G-TAT-----TCTAAAC--C--------AGGAAAAAACAAATG---CATG-TA-GCGCGG-ACCAACT--A-G--ATA--TCACC---GG-CAAC-GC----CC----A---G-AC-ATCA-TCAC---TTATGCTTCA--G-CCTTGTCC-A--A-C-C-CAGAA-----G-GG------A-TAGG---GA-G-G-G---G--GAC-G----A-GGGT---T--TTCC-T-TT-CG-----GT--CC---AG----GG-C-GCAGCAGCAC---C------------T-GAGC--A--GTTTCCTAA-C------TCA---GC-AG-C-------T--A-C----C---C--CT----AACC--T------T------ATGCT---CC-AG---CT----TTACC-CAC-CA-A-----C---G----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---A-----G--C-GCCT-A----TGTT--CC--TC-T--AC---CCG---TA---A-G--
gi|127885 : -G--GTT--C-----------CA-T--G--C-T---AA---A-G-A-A--C-C-A--TG--C-A--TT-T-GA-TCCCT-CGA----C-G--CC--------------CT--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-TTC--ATG---TC--TACA-----GTA-G-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-AGG--G-ACC--CC--A-G--ATA--TCACT---AG-TAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ATGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-ATGAA-----G-GG------A-TAGG---GC-G-G-G---G--GAC-GC---A-GGGA------TT-C-T-TT-AG-----GC--CG---AG----AG-A-GCAACAGCAG---C------------T-GAAC--A--CTTTTCTCG-G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--CT----AAC-----------------AT-------C-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---T----CAG-C-GCCAC--C-G-G-T-A---T-----G--C-ACCT-A----TGTT--TC--TC-TG-AC---GTG---TA---A-A--AC-------------------------CTG-A--AT-GAAGAT-GACAgtct
gi|127886 : --TT-T-GA-TTCCT-CGA----C-G--CCCTCT----------CAGGGATATGCGCCCTC--TC-AG-G-----GA-TGAGA--CAC-T--AGT-CT---------C--A-TTC--ATG---TT--TACA-----GCA-G-T-T-----TCTA------------------------------------------------------------------TCACC---GG-TAACTGC----CC----T---A-GT-A-CA-CCAC---T-ACGCT-CA--G-CCT-GCCC-A--G-C-C-CGGGA-----G-GG------A-CAGG---GA-G-G-G---G--GAC-GC---A-GAGA---T--TT-C-T-TT-AG-----AC--CG---AG----AG-A-
gi|127887 : T-CGA----C-A--TC--------------CA--------------C--TC-AG-G-----GA-T---A--TGG-T--GGA-T----------C--A-ATT--ATA---TC--TACA-----TAA-T-T-T-----TCTAC-C--C--------AG-----------TA---C-TG-TG-GCG--G-ACC--CC--A-G--
gi|127888 : --CC--------------AA--------------C--CC-AG-G-----GC-T---A--TGG-T--TGA-C----------C--A-ACT--ATG---TC--AACA-----ACA-G-C-C-----CCTAT-C--C--------AG-----------TG---C-TA-TG-GTG--G-A-C--CC--A-G--ATG--TCACC---GG-CGACTGC----CA----C---A-GT-A-T-----C---T--CACT-TA--G-CTT-GTCA-A--T-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TTGG---GA-G--------------AC---A-GGAA---T--TT-A-T-TC-AG-----GC--CT---AG----GG-G-GAATCAGCAC---C------------C-TAGCCAA--G--TCCTCG-G-------AA---GC-AA-C-------T--ACC----CATAC--CTGTGCAACCA-G------T------A-ATT---CC-AA---TT----TACCC-TAT-GC-A-----G---G----CAG-T-GCAAT--T-A-G-C-A---A-----G--C-GCCT-A----TGCC--CC--TC-AG-A
gi|127889 : --CC--------------TA--------------C--TC-AG-G-----GC-T---A--TGG-T--GGA-C----------C--A-TTA--ATG---TC--GACA-----G-A-GCT-C-----CCTGA-T--C--------AG-----------AA---G-TA-TG-GTG--A-ACT--C
gi|127890 : C--------------CA--------------C--TC-CG-G-----GA-T---A--TAG-T--A-A-T----------C--A-TTC--ATG---TC--GACA-----GCA-G-T-T-----TCTAC-A--C--------AG-----------TG---C-CA-TG-GCG--G-ACT--CC--A-G--GTG--TCACT---GG-CAAATGC----TC----T---A-GC-A-TA-TCAC---T-AGGCT-CA--G-CCT-GCCA-A--A-C-C-TGGAA-----G-GG------A-TGGG---GA-G-G-G---G--GGC-AC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----AC--CC---AG----GG-T-GCAGCAGCAT---C------------T-AAGC--A--GTTTCCTCG-G------GTA---GC-AG-C-------T--ACC----C---C--CT----ACCA--G------T------AGGCC---CC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-GCCAC--C-G-C-T-T---A-----G--C-GCTT-A----TGCT--GC--TC-TG-AC---GCA---TA---A-G--AC-TA-G-A-TA-CAAG--A-A----TCTG-
gi|127891 : C--------------CA--------------C--TC-CG-G------A-T---AC-TAG-T--A-A-T----------C--T-TCC--ATG---TC--GACA-----GCA-G-T-T-----TCTACAC--T--------AG-----------TG---C-CA--G-GC---G-ATC--CA--A-G--GTG--T-ACC---TG-CAAATGC----TC----T---A-GC-A-AT-CCACTGGT-AGGCT-C---G-CCT-GCCA-A--ATC-C-TGGAA-----G-GGT-----A-TGGG---GA-G-G-G---G--G-C-AC---A-GGGA---TTATT-CAT-TTAAG-----AC--CA---GG----GG-C-GCAGCA--AT---C------------T-AAGC--A--G-TTCCTCG-G------GTA---GC-AG-C-------T----C----C---C--CT----ACCCA-G------T------CAGCC---CCAAG---CT----TACCC-C-C-AC-AAC---A---G----CAGCC-GCCAC--C-G-C-T-T---A--------C-G-CT-A----TGCT--GC--TC-TG-AC---GCAT--TA---A-G--AC-TACG-A-TA-CAAGAAA-A----TCTG-
gi|127892 : A--------------T--TC-AG-G-----AA-T---A--TGG-T--GAA-T----------C--A-TTC--ATG---TC--AGCA-----GGA-G-C-A-----TCTAT-A--C--------AG-----------TG---C-TA-TG-ATG--G-ACC--CC--A-G--ATG--TCATT---GT-TGGCTGT----CC----C---A-GT-A-TC-TCAC---T-AAGGT-CA--G-CCT-GTCA-A--A-A-C-CTGAA-----G-GA------A-TGGA---GA-G-A-G---A--GAC-AC---A-GGGA---T--TT-C-T-TA-AG-----GA--CAGGCAG----GC-AGGCAGCAGCAC---C------------T-GGGC--A--GTTTCCTCA-G------GCA---GC-TG-C-------T--ACA----C---C--CT----ACCC--A------T------ATACC---TC-AT---CC----TAGCT-CAC-AC-A-----G---G----CA-------------------A---A----------GCCT-A----TGCC--CC--TC-TG-AT---GCGTAATA---A-G--GC-TA-A-A-GA-CAAG--G-
gi|127893 : -T-C-----TCTAC-C--A--------AA-----------TG---C-TA-TG-GCG--G-AGC--CC--A-G--ATG--TCACC---AG-CAACTGC----CA----T---A-AT-A-CA-CCTC---T-ACGCT-CACAG-TCT-ACCC-A--A-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TAGG---GA-G-G-A---G--GAC-GC---A-GGGA---T--TT-C-T-TT-AG-----GT--CC---AG----GG-C-GCAGCAGTGC---C------------T-GGGC--A--GTTTTCTCA-G------GCA---AC-AG-CTACAAAGT--ACC----C---C--CT----ACCA--G------T------ATGCC---CC-AG---CT----TAATA-CAA-AA-A-----G---G----CAG-C-CCCAC-----------------------C-GCCA-A----TGTT--CC--TC-TG-AC---GCG---TA---A-G--GC-TA-G-A-TA-CAAG--G-A----TCTG-C--AT-TATGAT-GGCA
gi|127894 : --G-CCT-GTCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TGGG---GGCG-G-G---A--AAC-GC---A-GCGA---T--GT-C-T-TC-AG-----GC--CC---AG----
gi|127895 : --G-CCT-GTCC-A--G-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TGGG---GC-G-G-G---A--AAC-GC---A-GCGA---T--GT-C-T-TC-AG-----CC--Ca
gi|127896 : CT-GCCC-A--A-C-C-CGGAA-----G-GG------A-TAGG---GA---------G--GAC-GC---A-GGGA---T--TG-C-T-TT-AG-----GT--CC---AG----GG-aga
gi|127897 : G-----AC--CG---AA----AG-A-ACAGCA---C---C------------T-GTAC--A--GTTTCTTAG-G------TCA---GC-AG-C-------T--GCC----C---C--CT----GAAC--G------T------ATGCC---TC-AG---CT----TACCC-CAC-AC-A-----G---G----CAG-C-
gi|127898 : C---C------------T-GGGC--T--GTTTTCTCG-G------GGA---AC-A----------T--ACC----C---CTCCT----ACCA--G------T------ATGTC---C--AG---CT----T---T-TAC-AC-A-----A---A----CAG-CAGCCTC--C-------A---C-----G--C-GC---------ATT--TC--TC-TG-AC---GCG---TA---G-G--C---A-G-A-TA-A-----G-A----T-TG-C--AT-TATGAT-GGCA
gi|127899 : C-A-----G---A----AGG-T-GCCAC--C-G-G-T-T---A-----G--C-GCTT-A----TGTC--CC--TC-TC-AT---ACG---TAATGA-G--AC-TA-G-A-TA-CAAG--G-A----TCTG-T--GT-TATGAT-GACA
gi|127900 : C-A-----G---A----AGG-T-GCCAC--C-G-G-T-T---A-----G--C-GCTT-A----TGTC--CC--TC-TC-AT---ACG---TAATGA-G--AC-TA-G-A-TA-CAAG--G-A----TCTG-T--GT-TATGAT-GACA