lowQualScore : 111 333333 1111111 11 22222222222222222222222222222222 111111111 1111111111111 111111 11 22222 111 2222222222
lowQualScore : 1 11 111 2 8888 11 666 33 22 1 777777 1111111 55555 333 1111 33 0 0 222222 11 00 22 3333 22 11111111111111111111111111111111 0 1 11 111 444444444 0 11 0 000000000 555 99999 6666 222 55 0 111 33 22 0 0 8888888888888 2 11 11 555555 1 11 22222 1 33 33333 1 444 2 1 44 33333 33333 8888 33 7777777777 2
lowQualScore : . .. ... . .... .. ... .. .. . ...... ....... ..... ... .... .. . . ...... .. .. .. .... .. ................................ . . .. ... ......... . .. . ......... ... ..... .... ... .. . ... .. .. . . ............. . .. .. ...... . .. ..... . .. ..... . ... . . .. ..... ..... .... .. .......... .
lowQualScore : 1 55 222 9 7777 33 000 11 66 9 777777 5555555 99999 999 8888 33 9 9 555555 22 11 11 7777 11 55555555555555555555555555555555 9 8 22 666 888888888 9 22 9 111111111 333 11111 1111 999 99 9 666 88 66 9 9 5555555555555 2 55 55 222222 1 77 77777 1 99 66666 2 888 6 3 88 22222 33333 7777 88 7777777777 4
consensus : GGTAAT-C--GTAATCGAGTAA-T-C-GT--AA---TCGAT-TGTA--A-T-C--GATTAC--T----T-----TT---T----TT--CAA-G-TAA------TT--GAN-A--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--T---T------C--A-A--TT-AC--------NTG---TAA-----TC---GTAAT---T--T-A---AT-CG--A-TT-AC-A---GCT-----AA-AT--T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-TA--ATT-AC-TTTTNNA--AT-TAC--NTTC-A-A--T-----TA-----CT---TC--TAT-T--TCTA-AA-ATATTGT
Reference ( gi|82543 ) : GGTAAT-C--GTAATCGAGTAA-T-C-AT--AA---TCGAT-TGTA--A-T-C--C-TTAC--T----T-----TT---T----TT--CAA-G-TAA------TT--GAC-A--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--T---T------C--A-A--TT-AC--------TTG---TAA-----TC---GTAAT---T--T-A---AT-CG--A-TT-AC-A---GCT-----AA-AT--T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-TA--ATT-AC-TTTTAAA--AT-TAC--ATTC-A-A--T-----TA-----CT---TC--TAT-T--TCTG-AA-ATATTGT
gi|82544 : GGTAAT-C--GTAATCGATTAA-T-C-AT--AA---TCGAT-TGTA--A-T-C--C-TTACT-T----T-----TT---T----TT--CAA-G-TAA------TT--GAC-A--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTATT-T--T---T------C--A-A--TT-AC--------TTG---T-A-----TC---GT-AT---T--T-A---AT-CG--A-TT-AC-A---GCT-----AA-AT--T--TTG--T--GTGT-AAT--TA-TA--ATT-AC-TTTTAAA--AT-TAC--ATTC-A-A--T-----TA-----C----TC--TA--T--TCTGAAA-ATATTGT
gi|82542 : GATAAT-C--GTAATCGAGTAA-T-C-GT--AA---TCGAT-TGTA--A-T-C--A-TTAC--T----T-----TT---T----TT--CAA-G-TAA------TT--GAC-A--GTAATC----TGTAA--T----T-A------AAG---------------CTA-T-T--T---T------C--A-A--TT-AC--------TTG---TAA-----TC---GTAAT---T--T-A---AT-TG--A-TT-AC-A---GCT-----AA-AT--T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-TA--ATT-AC-TTTTTGA--AT-TAT--TTTC-A-AT-T-----TA-----AT---AC--TACAC--TCTA-AA-ATATTGT
gi|82545 : GGTAAT-C--GTAATCGAGTAA-T-C-GT--AA---TCGAT-TGTA--A-T-C------------------------------------AA-G-TAA------TT--GAC-A--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--T---T------C--A-A--TT-AC--------TTA---TAA-----TC---TTAAT---C--T-A---AT-CG--A-TT-AC-A---GCC-----AA-AT--T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-TA--ATT-AC-TTTTTCA--AT-TAC--TTTC-A-A--T-----TA-----C----TC--TA--C--TCTA-AA-ATATTGTcatct
gi|82548 : GGTAAT-C--GTATTCGAGTAA-T-C-GT--AA---TCGAT-TGTA--A-T-C--A-TTAC--T----T-----TT---T----TTTTCAA-G-TAA------TT--GAT-A--GTAACC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--T---T------C--A-A--TT-AC--------TTG---TAA-----TT---GTAAT---T--T-C---AT-GG--A-TT-AC-A---GCT-----AA-AT--T--TTG--TG-GTAT-AAT--TA-TA--ATT-AC-TTTTcattt
gi|82546 : GGTATA-C--GTAATCGAGAAAAT-C-GT--AA---TCGAT-TGTA--A-T-C--A-TTAC--T----T-----TT---T----TT--CAA-G-TAA------TT--GAC-A--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AGG---------------CTA-T-T--T---T------C--A-G--TT-AC--------TTGTAATAA-----TC---GTAAT---T--T-A---AT-CG--A-TT-AC-A---GCT-----AA-AT--T--TTG--TG-GT-T-AAT--TA-T---ATT-AC-TTTTTCA--AT-TAC--ATTC-A-A--T-----TA-----C----TC--TAT-caatacctttcgaatatact
gi|82547 : GGTAAT-C--GTAATCGGGTAA-T-C-GT--AA---TGAAT-TGTA--A-T-C--A-TTAC--T----TA----TT---T----TT--CAA-G-TAA------TT--GAC-A--GTAATC----T-----------T-G------AAG---------------CTA-T-T--T---T------T--A-A--TT-AC--------TAA---TAA-----TC---GTAAT---T--T-A---AT-CG--A-TT-AC-T---GCT-----AC-AT--T--TTG--TA-GTGT-AAT--TA-CA--ATT-ACTTTTTTCC--AT-TAC--TTTC-A-A--T-----TA------T---TC--TA--C--TGTA-AA-ATATTATatatcataatgtcat
gi|82549 : GGTAAT-C--GTATTCGAGTAA-T---GT--AA---TCGA--TGTA--ACT-C--A-TTAC--T----T-----TT---TTTTCTT--C-A-G-TAA------TTGAGAT-A--GTAATC-----GTAA--A----T-T------AAG----------------TA-T-T--T---T------C--A-A--TT-AC--------TTG---TAA-----TCT--GTAAT---T--T-----AT-GG--A-TT-ACAA---GCT-----AA-AT--T--TTG--T--GTCT-AATA-TA-AA--ATT-AC-TTTT-CA--AT-TAC--TTTC-ATA--T-----TA-----C----TC--TAcattt
gi|82550 : GGTAAT-T--GAAA-AAAGTAA-T-T-GT--AA---CTGAG-TGTA--A-T-T--AATTAC--A----T-----AT---T----TT--CAA-G-TAA------TT--GGA-A--GTAATG----TGTAA--T----T-G------AAG---------------TT--T-T--T---T------C--A-A--TT-AC--------AAG---TAA-----TT---GTAAT---T--T-A---AT-TA--A-TT-AC-ATT-GCA-----AA-AA--TAAT-------ATGT-AAT--TC-CA--ATT-AC-TTTT-CA--AT-TACT-CTCC-A-A--T-----TA-----CA---TC--cactaaa
gi|82551 : GGTAAT-T--GAAA--AATTAA-T-T-GT--AA---TTGAG-TGTATAA-T-T--A-ATAC--A----TA----TT---C----TT--CAA-G-TAA------TT--GGA-A--GTAATTAAGGTGTAA--T----T-G------AAG---------------TTA-AAT--T---T------C--A-A--TT-AC--------AAG---TAA-----TC---GTAAT---T--T-A---AT-TA--A-TTTAC-A---atactaagaca
gi|82551 : GGTAAT-T--GAAA--AATTAA-T-T-GT--AA---TTGAG-TGTATAA-T-T--A-ATAC--A----TA----TT---C----TT--CAA-G-TAA------TT--GGA-A--GTAATTAAGGTGTAA--T----T-G------AAG---------------TTA-AAT--T---T------C--A-A--TT-AC--------AAG---TAA-----TC---GTAAT---T--T-A---AT-TA--ATTT-AC-AATTGCA-----AA-AA--T--AGG--CATGTATAAAT--TC-CA--ATT-AC-TTTT-TA--AT-TACTTCTCC-A-A--T-----TA-----CA---TC--attgcaaaaataggcatgtataaattccaattactttttaattacttctccaattacatcacactaaa
gi|82552 : GGTAAT-C--GTAATCT-GTAA-T-C-GT--AA---TCAGC-TGTA--A-T-TGAT-TTAC--A----T-----TT---T----TT--CAA-G-TAA------TC--GAA-T--GTAATC----TGTAA--T----C-G------TG-----------------TA-T-T--T---T------T--AGA--TT-AC--------ATG---CA-------------AAT---A--T-A---AT-CG--A-TT-AC-A-----T-----TA-AT--A--CTA--CC-CAGT-AAT--CA-TG--ATT-AC-ATTT-AG--AT-TACTTTTTT-G-A--T-----TA-----CT---TG--CAT-TCATTTA-AT-ATATTacactaaa
gi|82554 : GGTAAT-G--GTAAT-GTGTAA-T---GT--AA---TGCAT-TGCA--A-T-G--CATTAC--T----T-----TT---T----AT--CAA-G-TAA-------T--GCCTA--GTAATG----TGTAA--TGCACT-G------AA------------------A-A-C--T---G------C--G-A--TT-ACA-------TTG---TAA-----TG---ATAAT---G--T-A---AT-GC--A-TT-AC-T---TTC-----AA-AT--T--TTG---G-G-GT-AATGCTA-GC--ATT-AC---TTGGC--AT-TAC--ATTG-A-A--T-----TA-----CT---TT--TA-------TA-AG-ATATT
gi|82553 : GGTAAT-C--GTAATCT-GTAA-T-C-GT--AA---TCAGC-TGTA--A-T-T--GATTACAAT----T-----TT---A----TT---AA-G-TAA------TC--GAA-T--GTATTC----TGTAA--T----T-G------TGT---------------ATG-T-T--T---TA-----G--A-A--TT-AC--------ATG---TAA-----TT---TAAAT---TGGT-A---ATGCG--A-TT-AC-A----TT-----A------T--TTA--CACTTGT-AAT--CA-TG--ATT-AC--ATTAGA--GT-TAC--TTTT-G-A--T-----TA-----CT---agtattt
gi|82555 : GGTAAT-G--GTAAT-GTGTAA-T-G-GT--AA---TGCAT-TGCA--A-T-G--CATTAC--T----T-----TT---T----AT--CAA-G-TAA-------T--GCCTA--GTAATG----TGTAA--TGCACT-GA-----AAA---------------CTG-C--------------------A--TT-AC--------ATG---TAA-----TG---GTAAT---G--T-A---AT-GC--A-TT-AC-T---TTC-----AA-AA--T--TT---TG-GTGT-AATGCTA-GC--ATT-A---TTTGGC--AT-TAC--ATTTGA-A--T-----TA-----CT---T
gi|82564 : GGTAAT-TTGGTAAT-GTGTAA-T-G-GT--AA---TGCAT-TGCA--A-T-G--CATTAC--T----T-----TT---T----AT--CAA-G-TAA-------T--GCCTA--GTAATG----TGTAA--TGCACTAA------AAA---------------CTG-T--------------------A--TT-AC--------ATG---TAA-----TG---GTAAT---G--T-A---AT-GC--A-TT-AC------CTTCA--AA-AT--G--T----TG-GTGT-AATGCTA-GC--ATT-A---TTTGGC--AT-TAC--ATTG-A-A--T-----TA-----CT---TT--TAT-T-------AG-ATATTtaataagatattagtattt
gi|82565 : GGTAAT-T--GTAATAG-GTAA-T-G-GT--AA---TGTAT-TGCA--A-TGC--T-TTAC--T----T-----TT---A----T---CAA-G-TAA------TC--GCT-A--GTAATG----TGTAA--TACACTAA------AAA---------------CTG-T--------------------A--TT-AC--------ATG---TAA-----CG---GTAAT---G--T-A---AT-GC--A-TT-GC------CTTCA--AA-AT--T--T----TG-GTGT-AATGCTA-GC--ATT-AT-TTagtattt
gi|82559 : GGTAAT-G--GTAAT-GTGTAA-T-G-GT--AA---TGCAT-TGCA--A-T-G--CATTAC--T----T-----TT---T----AT--CAA-G-TAA-------T--GCCAA--GTAATG----TGTAA--T---------------G---------------C------------------------------AC---------TG---TAA-----TG---GTAAT---G--T-A---AT-GC--A-TT-AC-T---TTC-----AA-AA--T--TT---TT-GTGT-AAT--GG-TAGCATT-A---TTTGGC--AT-TAC--ATTTGA-A--T-----TA-----CT---TT--TA-------TA-AA-GTATTggcaataattccaatatcctttatt
gi|82563 : GGTAAT-C--GTAATCT-GTAA-TAC-GT--AA---TCAGC-TATA--A-T-T--GATTACAAT----T-----TT---T----CG--CAA-G-TA--------T---AC-AATGTAATC----TGTAA--T----C-G------TG-----------------TA-T-T--T---T------TTAG-A--TT-AC--------ATGTA-TAA-----TT----TAAT---TG-T-A---AT-CG--A-TT-AC-A-----T-----TA-AT--T--TTACCCC-ATGT-AAT--CA-TG--ATT-AA-TTT--AG--AT-TAC--TTT
gi|82558 : GGTAAT-C--GTAATCG-GTAAAT-C-GT--AAAA-TCAGCATGTA--A-T-------TAGA-T----TAGAGATT---T----TT--CAA-G-TAA------TC--AAA-T--GTAATC----TGTAA--TCG--T-G------TA----------------TTA-T-T--T---T------A--G-A--TT-AC--------ATG---TAA-----TT---TTAGA---T--T-A---AT-CGATA-TT-AC-A-----T-----TA-AT--T--TTA--CC-CTGT-AAT--CATTG--ATT-AC-ATTT-AG--AT-TAC---TT-------T-----T-------T---TC--TAT-T--tttgattatcttgctcatctatatatattatattt
gi|82560 : GGTAAT-T--GAAAAAAGGTAA-T-T-TT--AA---TTCAG-TGCA--A-T-T--AATTAC--A----T-----AT---T----TT--CAA-A-TAA------TT--GCA-A--GTAATT----TGTAA--T----T-G------GAG---------------TTT-T-T--T---T------C--A-A--TT-AC--------
gi|82556 : GGTAAT-C--GAAA-AAAGTAA-T-T-GT--AA---TTGAG-TGTA--A-T-T--AATTAC--A----T-----AT---T----TT--TAA-G-TAA------TT--GGA-A--GTAA---------GA--T----C-A------------------------CTT-T-T--T---T------C--A-A--TT-AC--------AAG---TAA-----TT---GTAAT---T--C-A---AT-TA--T-TT-AC-ATT-GCA-----AA-A-------TA--AC-ATGT-AAT--TC-CA--ATT-AT-TCC---A--AT-TAC--
gi|82557 : GGTAAT-T--GAAA-AAAGTAA-T-T-GT--AA---TTGAG-TGTA--A-T-T--AATTAC--A----T-----AT---T----TT--CAA-G-TAA------TT--GGA-A--GTAATT----TGTAA--T----A-G------AAGTTTTTTGTTTTTGTTTTT-T-T--T---T------T--A-A--TT-AC--------AAG---TAA-----TT---GTAA
gi|82569 : GGTAAT-G--GTAAT--GGTA----T-ATGGAA---TGCAT-TGCA--A-T-G--A-TTAC--T----T-----TT---T----AT--CAA-G-TAA------T---GCC-AA-GTAATG----TGTAA--T------GCACCAAAAA---------------CTG-C--------------------A--TT-AC--------ATG---TAA-----TG---GTAAT---G--T-A---AT-TGCCA-TT-AC-T---TTTC----AA-AT--T--TTG-----GTGT-AATGCTA-GC--ATT-A---TTTGGC--AT-TAC--ATTT-G-AATT-----TA-----CT---TT--TA-------TA-AG-ATATT
gi|82567 : GGTAAT-T--GAAA-AAAGTAA-----AT--TG---TAGAG-TGTA--A-T-T--AATTAC--A----TA----TT---T----TT--CAA-GATAA------TG--GA--A--GTAATT----TGTAA--TC---T-G------AAG---------------TTT-T-TTAT---T------C--A-A--TT-AC--------AAGA--TAA-----TT---GTATT---T--T-A---AT-TA--A-TA-AC-ATT-GCA-----AA-AT--taattattt
gi|82566 : GGTAAT-G--GTAAT-GTGTAA-T-G-GT--AA---TGCAT-TGCA--A-T-A--CATTAC--T----T-----TT---T----AT--CAA-G-TA-------TT--GCA-A--GTATAA----TGTAA--TGCACT-A------AAAA--------------CTG-C--------------------A--TT-AC--------TTG---TAA-----TG---GTAATGTAT--T-A---AT-GC--A-TT-AC------TTTCA--AA-AT--T--TTG--T---TGT-AATGCTA-GC--ATT-A---TTTGGC--AT-TAC--AATG-A-A--T-----TA------T---TT--TAT-A--TC-A-AG-ATATTaacattgattccaatacttttta
gi|82561 : GGTAAT-C--GTAATCT-GTAATT-C-GT--AA---TCAGC-TGTA--A-T-TG-A-TTAC--A----A-----TT---T----TT--CAA-G-TAA------TC--AA--A--TTAATT----TAATA--T----C-G-------------------------TA-T-T--T---T------TTAG-A--TT-AC--------ATG-----------TC---TTTAT---TG-T-A---AT-CG--A-TT-AC-A-----T-----TA-AT--T--TTC--C---TGT-AAT--CA-TG--ATT-ACATTTTAGAT-AC-TTT--TTTT-G-A--T-----TACCTTGCT---TCATTAT-T--TATA-AT-ATATTagtattt
gi|82568 : GGTAAT-C--GAAATCGA-TAA-T-C-GA--AA---TCGAT-TGCA--A-T------TAAT--TAAAGT-----TT---T----CT--C-T-G-TAA------TT--GAA-G--GTAATC----ttcat
gi|82570 : GCAAT-C--GTAATCGAGTAA-T-C-GT--AA---TCGAT-TGAA--A-T-C--A-TTAC--T----T-----TT---T----TT--CAA-G-TAA------TT--GAC-A--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--T---T------C--A-A--TT-AC--------TTG---CAA-----TC---GTAAT---T--T-A---AT-CA--A-TT-AC-A---GCT-----GA-AT--T--TTG--TG-GTTT-AAT--TA-TA--ATT-AC-TTTATTA--AT-TAC--TTTC-A-A--T-----TA-----C----AC--TA--C--TCTA-AA-AT-TTGT
gi|82570 : GTAAT-T--ATAATTAA---A-C-C-AC--AAAATTCAGC-TGTA--A-T-T--GATTAA--A----T-----TACGAT----TG--CAA-G-TAA------TT--GAA-A--ATAG-C----TTCAA--T----T-A------CAGA--------------TTA-C-T--G---T------C--A-A--TT-AC--------TTG---AAAAAAAGTA---ATGAT---T--TCA---AT-CG--A-TT-AC-cattt
gi|82571 : gcaatcgtaatcgagtaatcGCAAT-C--GTAATCGAGTAA-T-C-GT--AA---TCGAT-TG-A--A-T-C--A-TTAC--T----T-----TT---T----TT--CAA-G-TAA------TT--GAC-A--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AA----------------CTA-T-T--T---T------C--A-A--TT-AC--------TTG---CAA-----TC---GTAAT---T--T-A---AT-CA--A-TT-AC-A---GCT-----GA-AT--T--TTG--TG-GTTT-AAT--TA-TA--ATT-AC-TTTATTA--AT-TAC--TTTC-A-A--T-----TA-----C----AC--TA--C--TCT--AA-ATATTGTtttattaattactttcaattacactactctaaaatttgtcattt
gi|82571 : GTAAT-T--ATAATTAA---A-C-C-AC--AAAATTCAGC-TGTA--A-T-T--GATTAA--A----T-----TACGAT----TG--CAA-G-TAA------TT--GAA-A--ATAGTT----C--AA--T----T-A------CAGA--------------TTA-C-T--G---T------C--A-A--TT-AC--------TTG---AAAAAAAGTA---ATGAT---T--C-A---AT-CG--A-TT-AC-cattt
gi|82572 : gcaatcgtaatcgagtaatcGTAATGC--GTATTCGAGTAA-T-C-GT--AA---TCGATGTGTA--A-T-C--A-TTAC--T----T-----TTT--T----TT--CAA-G-TAA------TT--GAT-A--GTAACC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--T---T------C--A-A--TT-AC--------TTG---TAA-----TT---GTA-----T--T-C---AT-GG--A-TT-AC-A---GCT-----AA-AT--T--TTG--T--GTAT-AATA-TA--A--ATT-AC-TTTTTCA--A--TAC--TTTC-A-A--T-----TA-----CTTACTC--TAT-tttattaattactttcaattacactactctaaatattgtcattt
gi|82573 : GTAAT-C--GTA-TCTGTCAA-T---GT--AA---TCAGC-TGTA--A-T-T--GATTAC--AGA--T-----TT---C----TT--CA--G-TAA------TC--GAA-T--GTAATC----TGTAA--TGT--T-GT-----AA-----------------TA-T-T--T---T------A--G-A--TT-AC--------ATG---TAA-----TT----TAAT---G--T-A---AT--G--A-TT-AC-A----TT-----AACAT--T--TTaataattgtcattt
gi|82573 : GTAAT-C--GTA-TCTGTCAA-T---GT--AA---TCAGC-TGTA--A-T-T--GATTAC--AGA--T-----TT---C----TT--CA--G-TAA------TC--GAA-T--GTAATC----TGTAATGT----T-GT-----AA-----------------TA-T-T--T---T------A--G-A--TT-AC--------ATG---TAA-----TT----TAAT---G--T-A---AT--G--A-TT-AC-A----TT-----AACAT--T--TTA--C--CTGT-AAT--C--TG--ATT-AC-TTTT-AG--AT-TACTTTTTT-G-A--T-----TA-----Cacctgtaatctgattacttttagattacttttttgattac
gi|82562 : GTAAT-C--GTAATC-----A-T-CTGT--AA---TTGAT-TACA--A-T------TTCC--T----T-----------------------G-TAA------TT--AAA-T--GTCATC----CATAA--T----C-G------TAT---------------TTT-T-T--T---T------TTAG-A--TT-AC--------ATG---TAA-----TT---GTAAT---T------------G--A-TT-AC-A-----T-----TA-AT--T--TTA--CC-CTGT-AAT--CA-TG--ATT-AC-ATGTAGATTAT-TAT---TTT-G-A--T-----TA-----CT---
gi|82574 : ggtaattgtaatctAT-C--ATAATCG--TAA-T-C-GT--GAGA-TCAGC-TGTA--A-T-T--GATTACATT----T-----TT---T----TT--CAAAG-TAA------TT--GAA-A--TTAATA----T-TAA--T----T-G------TAGTGAA-----------TTA-T-G--T---T------C--A-GATTT-ACATA-----TT----TAA-----T-----TAAT---TG-T-A---AT-CG--A-TT-AC-A---TTT--------AT--T--TTA--CATATCT-AAT--CA-TG--ATT-AC-ATAGTAG--AT-TAC--TTTT-A-GATT-----TA-----CT---GCA-TAA-T--T-TG-AATATATTAT
gi|82575 : ATGGGGTAA-T-C-GT--AA---TCGAT-TGTA--A-T-C--A-TTAC--T----T-----TT---T----TT---AA-G-TAA------TT--GAC-A--GTAATC----TGTAA--T----C-G------AAT---------------CTA-T-T--T---T------C--A-A--TT-AC--------TTG---TAA-----TC---GTAAT---T--T-A---AT-CG--A-TT-AC-A---GCT-----TA-AT--T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-TA--ATT-AC-TTTTTCA--AT-TAC--ATTC-A-A--T-----TA-----C----TC--TA--T--TCTG-AA-ATATTGT
gi|82576 : ATGGGGTAA-T-A-GT--AA---TCGA---GTA--A-T-C--A-TTAC--T----T-----TT---T----TT--CAA-G-GAA------TT--GAC-T--GTAATC----AGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--T---T------C--A-A--TA-AC--------TTG---TAA-----TC---GTAAT---T--T-A---AT-CG--A-TT-AC-A---GCT-----AA-AT--T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-TA--ATTCAC-TTTTTCA--AT-TAC--TTTC-A-T--T-----TA-----CT---TC---AC-T--T-TA-AA-ACATTGTcattt
gi|82578 : ATTGAGTAA-T-C-GT--AA---T-GAT-TGTA----T-C--A-TTAT--T----T-----TT---T----TTATCTG-G-TA-------TT--GA-------ATTC----TGTAAA-T----T-G------AAG---------------CTT-A-T--T---T------C--A-T--TTTATGGGGGTTTTTT---TTA-----TCAGGGT--T---T--T-A---AT--G--A-TT-A------GCT-----AA-AT--T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-TA--ATT-AT-TTTTCA-----------ATTC-A-A--TAGATATA-----TT---GC--CAT-T--Tcattt
gi|82577 : ATGGGGTAA-T-C-GA--AA---TCGAT-TGCA--A-T-TAAT-TAAA--T----T-----TT---T----TT--C-T-G-TAA------TT--GAC-A--GTAATC----GATTA--T----C-A------AAA---------------AAA-A-T--T---T------C--A-A--TT-AC--------TTT---TAA-----TC---G-AAG---A--A-A---AT-CG--A-TT-AC-A---GCTGAAAAAA-AT--------------CAT-AA----G-TA--ATT-AC-GATTAAA----------ATTC-A-A--T-----TA-----TT---T
gi|82579 : GCAA-T-T-GT--AA---TTGAG-TGTA--A-T-T--AATTAC--A----T-----AT---A----TT--CAA-G-TAA------TT--GGA-A--GTAATG----TGTAA--T----T-G------AAG---------------TTT-T-T--TTTGT------C--A-A--TT-AC--------AAG---TAA-----TT---GTAAT---T--T-A---AT-TA--A-TT-AC-ATT-GCA-----AG-ATAAC--ATG--TACACGT-AAT--TC-CA--GTT-AC-TTTT-CA--AT-TAC--TCTC-C-A--T-----Tt
gi|82546 : T--AA---TCGAT-TA-A--A-T-------TAC--G----A-----TT---A----TTA-CAA-G-TAA------CT--GAA-A--ATAGCC----T-CAA--T----T-A------CAGA--------------TTA-C-T--G---T------C--A-A--TT-AC--------TTG---AAAAAAAGTA---ATGAT---TA-C-A---AT-CG--A-TT-AC-
gi|82580 : ggtatacgtaatcgagaaaatcAT-TGTA--AAT-A--A-TTAC--A----T-----AT---T----TT--CAA-G-TAAATTGCATT--GGA-A--GTAATT----TTTAA--T----T-G------AAG---------------TTT-T-T--T---TTTTTTTC--A-A--TT-AC---------------AA-----TT---GTAAT---T--T-A---A--------------------T-----AA-AT--T--ACA--T---TGC-AA-------A--AT---------AAA--ATGTAC--TTCC-A-A--T-----TA-----CT---TT--Tcagctaaattttgtggttaattatattactttttcaattacattcaattactctatatatcataatgtcat
gi|82581 : -TTAT--A----T-----TT---T----TT--CAA-G-TAA------TT--GAC-A--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-A-T--T---T------C--A-A--TT-AC--------TTG---TAA-----TC---GTAAT---T--T-A---AT-CG--A-TT-AC-A---GCT-----AA-AT--T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-TA--ATT-AC-TTTTTCA--AT-TAC--ATTA-A-A--T-----TG-----C----TC--TA--T--TCTG-AA-ATATTGTcaattactttccaattacaccatactaagaca
gi|82542 : ---T----TA--CAA-G-TAA------TT--GAA-A--ATAG-C----TTTAA--T----T-A------CAGA--------------TTA-C-T--G---T------C--A-A--TT-AC--------TTG---AAAAAAAGTA---ATGAT---TA-C-A---AT-CG--A-TT-AC-cagtt
gi|82572 : gataatcgtaatcgagtaatc---T----TA--CAA-G-TAA------TT--GAA-A--ATAG-C----TTCAA--T----T-AC-----AGG---------------TTA-C-T--A---T------C--A-A--TT-AC--------TTGAAAAAA-----AA---GTAATGA-T--T-ACACAT-CG--A-TT-AC-tcgtaatttaattgattacagctaaattttgtggtgtaattataattactttttgaattattttcaatttaatactacactctaaaatattgtcatct
Alignments
lowQualScore : 111 111 1111111111111111111111111111111 1111111111 11111111111 111111 11 11111 2222222
lowQualScore : 1 11 000 1 4 22 22 2 11 888 1 111 88888 4 11 4444 1 1 222222 2 11 2222 22 9999999999999999999999999999999 11 1 11 111 1 44 1 11 44 0000000000 4444 111 44 44444 1 66666666666 1 11 11 333333 1 00 1 2222 1 666 11111 1 666 4444 1 44 1 33333 6 55 5555555 1
lowQualScore : . .. ... . . .. .. . .. ... . ... ..... . .. .... . . ...... . .. .... .. ............................... .. . .. ... . .. . .. .. .......... .... ... .. ..... . ........... . .. .. ...... . .. . .... . ... ..... . ... .... . .. . ..... . .. ....... .
lowQualScore : 2 77 666 1 2 66 99 1 44 666 0 888 99999 0 44 5555 0 0 999999 9 44 1111 44 8888888888888888888888888888888 55 0 44 888 0 22 0 44 11 4444444444 9999 999 77 77777 1 77777777777 1 55 55 777777 1 33 1 3333 1 777 44444 1 999 7777 2 55 2 11111 3 22 9999999 9
consensus : GGTAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGTA--ATC-GA-TTA---C--T--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGANA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--T---T-C--A-A--TTAC-NTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT---AA-AT--T--TTG--CG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTNNA--ATT-AC--TTT-C--A-A--T-TA-----CTTC--TAT-T--TCTAAAAT-ATTGT
Reference ( family-518 ) : GGTAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGTA--ATC-GA-TTA---C--T--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGANA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--T---T-C--A-A--TTAC-NTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT---AA-AT--T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTNNA--ATT-AC--NTT-C--A-A--T-TA-----CTTC--TAT-T--TCTAAAAT-ATTGT
gi|82542 : GATAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGTA--ATC--A-TTA---C--T--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----TGTAA--T----T-A------AAG---------------CTA-T-T--T---T-C--A-A--TTAC-TTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-TG--A-TTAC-A---GCT---AA-AT--T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTTGA--ATT-AT--TTT-C--A-AT-T-TA-----ATAC--TACAC--TCTAAAAT-ATTGT
gi|82543 : GGTAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CATAA--TCGAT-TGTA--ATC-C--TTA---C--T--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--T---T-C--A-A--TTAC-TTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT---AA-AT--T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTAAA--ATT-AC--ATT-C--A-A--T-TA-----CTTC--TAT-T--TCTGAAAT-ATTGTcatct
gi|82544 : GGTAAT-C--GTAATCGATTA-A-T-CATAA--TCGAT-TGTA--ATC--C-TTA---CT-T--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTATT-T--T---T-C--A-A--TTAC-TTG----------T-ATC---GT-AT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT---AA-AT--T--TTG--T--GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTAAA--ATT-AC--ATT-C--A-A--T-TA-----C-TC--TAT-T--CTGAAAAT-ATTGT
gi|82545 : GGTAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGTA--A--------------------------T----CAA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--T---T-C--A-A--TTAC-TTA----------TAATC---TTAAT---C--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCC---AA-AT--T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTTCA--ATT-AC--TTT-C--A-A--T-TA-----C-TC--TA--C--TCTAAAAT-ATTGT
gi|82546 : GGTATA-C--GTAATCGAGAA-AAT-CGTAA--TCGAT-TGTA--ATC--A-TTA---C--T--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AGG---------------CTA-T-T--T---T-C--A-G--TTAC-TTGTAA-------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT---AA-AT--T--TTG--TG-GT-T-AAT--TA-T----ATT-AC-TTTTTCA--ATT-AC--ATT-C--A-A--T-TA-----C-TC--TAT-cattt
gi|82547 : GGTAAT-C--GTAATCGGGTA-A-T-CGTAA--TGAAT-TGTA--ATC--A-TTA---C--T--TATT--TTT----CAA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----T-----------T-G------AAG---------------CTA-T-T--T---T-T--A-A--TTAC-TAA----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-T---GCT---AC-AT--T--TTG--TA-GTGT-AAT--TA-C-A--ATT-ACTTTTTTCC--ATT-AC--TTT-C--A-A--T-TA------TTC--TA--C--TGTAAAAT-ATTATatatcataatgtcat
gi|82548 : GGTAAT-C--GTATTCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGTA--ATC--A-TTA---C--T--T-TTTTTTT----CAA-G-TAA------TTGATA--GTAACC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--T---T-C--A-A--TTAC-TTG----------TAATT---GTAAT---T--TCAT-GG--A-TTAC-A---GCT---AA-AT--T--TTG--TG-GTAT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTCAA----T-AC--CTT-TCGA-A--TATA-----CTcattt
gi|82549 : GGTAAT-C--GTATTCGAGTA-A-T--GTAA--TCGAT--GTA--ACT-CA-TTA---C--T--T-TT--TTTTCTTCA--G-TAA------TTGAGATAGTAATC-----GTAA--A----T-T------AAG----------------TA-T-T--T---T-C--A-A--TTAC-TTG----------TAATCT--GTAAT---T--T-AT-GG--A-TTACAA---GCT---AA-AT--T--TTG--T--GTCT-AATA-TA-A-A--ATT-AC-TTTT-CA--ATT-AC--TTT-C--ATA--T-TA-----C-TC--TA
gi|82550 : GGTAAT-T--GAAA-AAAGTA-A-T-TGTAA--CTGAG-TGTA--ATT-AA-TTA---C--A--T-AT--TTT----CAA-G-TAA------TTGGAA--GTAATG----TGTAA--T----T-G------AAG---------------TT--T-T--T---T-C--A-A--TTAC-AAG----------TAATT---GTAAT---T--TAAT-TA--A-TTAC-ATT-GCA---AA-AA--TAAT-------ATGT-AAT--TC-C-A--ATT-AC-TTTT-CA--ATT-ACT-CTC-C--A-A--T-TA-----CATCA-TA------CTAAGAC-cactaaa
gi|82551 : GGTAAT-T--GAAA--AATTA-A-T-TGTAA--TTGAG-TGTATAATT-AA-T-A---C--A--TATT--CTT----CAA-G-TAA------TTGGAA--GTAATTAAGGTGTAA--T----T-G------AAG---------------TTA-AAT--T---T-C--A-A--TTAC-AAG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-TA--ATTTAC-AATTGCA---AA-AA--T--AGG--CATGTATAAAT--TC-C-A--ATT-AC-TTTT-TA--ATT-ACTTCTC-C--A-A--T-TA-----CATC--
gi|82552 : GGTAAT-C--GTAATCT-GTA-A-T-CGTAA--TCAGC-TGTA--ATT-GATTTA---C--A--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TCGAAT--GTAATC----TGTAA--T----C-G------TG-----------------TA-T-T--T---T-T--AGA--TTAC-ATG----------CA--------AAT---A--TAAT-CG--A-TTAC-A-----T---TA-AT--A--CTA--CC-CAGT-AAT--CA-T-G--ATT-AC-ATTTAG---ATT-ACTTTTT-T--G-A--T-TA-----CTTG--CAT-TCATTTAATAT-ATTacactaaa
gi|82553 : GGTAAT-C--GTAATCT-GTA-A-T-CGTAA--TCAGC-TGTA--ATT-GA-TTA---CAAT--T-TT--ATT-----AA-G-TAA------TCGAAT--GTATTC----TGTAA--T----T-G------TGT---------------ATG-T-T--T---TAG--A-A--TTAC-ATG----------TAATT---TAAAT---TGGTAATGCG--A-TTAC-A----TT---A------T--TTA--CACTTGT-AAT--CA-T-G--ATT-AC--ATTAGA--GTT-AC--TTT-T--G-A--T-TA-----CT
gi|82554 : GGTAAT-G--GTAAT-GTGTA-A-T--GTAA--TGCAT-TGCA--ATG-CA-TTA---C--T--T-TT--TAT----CAA-G-TAA------TGCCTA--GTAATG----TGTAA--TGCACT-G------AA------------------A-A-C--T---G-C--G-A--TTACATTG----------TAATG---ATAAT---G--TAAT-GC--A-TTAC-T---TTC---AA-AT--T--TTG---G-G-GT-AATGCTA-G-C--ATT-AC---TTGGC--ATT-AC--ATT-G--A-A--T-TA-----CTTT--TA-------TAAGAT-ATT
gi|82555 : GGTAAT-G--GTAAT-GTGTA-A-T-GGTAA--TGCAT-TGCA--ATG-CA-TTA---C--T--T-TT--TAT----CAA-G-TAA------TGCCTA--GTAATG----TGTAA--TGCACT-GA-----AAA---------------CTG-C---------------A--TTAC-ATG----------TAATG---GTAAT---G--TAAT-GC--A-TTAC-T---TTC---AA-AA--T--TT---TG-GTGT-AATGCTA-G-C--ATT-A---TTTGGC--ATT-AC--ATT-TG-A-A--T-TA-----CTTT--AA-------TAAGAT-ATTagtattt
gi|82556 : GGTAAT-C--GAAA-AAAGTA-A-T-TGTAA--TTGAG-TGTA--ATT-AA-TTA---C--A--T-AT--TTT----TAA-G-TAA------TTGGAA--GTAA---------GA--T----C-A------------------------CTT-T-T--T---T-C--A-A--TTAC-AAG----------TAATT---GTAAT---T--CAAT-TA--T-TTAC-ATT-GCA---AA-A-------TA--AC-ATGT-AAT--TC-C-A--ATT-A----TTCCA--ATT-AC--agtattt
gi|82557 : GGTAAT-T--GAAA-AAAGTA-A-T-TGTAA--TTGAG-TGTA--ATT-AA-TTA---C--A--T-AT--TTT----CAA-G-TAA------TTGGAA--GTAATT----TGTAA--T----A-G------AAGTTTTTTGTTTTTGTTTTT-T-T--T---T-T--A-A--TTAC-AAG----------TAATT---GTAA
gi|82558 : GGTAAT-C--GTAATCG-GTA-AAT-CGTAAAATCAGCATGTA--ATTAGA-TTA---G--A--GATT--TTT----CAA-G-TAA------TCAAAT--GTAATC----TGTAA--TCG--T-G------TA----------------TTA-T-T--T---T-A--G-A--TTAC-ATG----------TAATT---TTAGA---T--TAAT-CGATA-TTAC-A-----T---TA-AT--T--TTA--CC-CTGT-AAT--CATT-G--ATT-AC-ATTTAG---ATT-AC--TTT------------------TTTC--TAT-T--
gi|82559 : GGTAAT-G--GTAAT-GTGTA-A-T-GGTAA--TGCAT-TGCA--ATG-CA-TTA---C--T--T-TT--TAT----CAA-G-TAA------TGCCAA--GTAATG----TGTAA--T---------------G---------------C------------------------AC--TG----------TAATG---GTAAT---G--TAAT-GC--A-TTAC-T---TTC---AA-AA--T--TT---TT-GTGT-AAT--GG-T-AGCATT-A---TTTGGC--ATT-AC--ATT-TG-A-A--T-TA-----CTTT--TA-------TAAAGT-ATT
gi|82560 : GGTAAT-T--GAAAAAAGGTA-A-T-TTTAA--TTCAG-TGCA--ATT-AA-TTA---C--A--T-AT--TTT----CAA-A-TAA------TTGCAA--GTAATT----TGTAA--T----T-G------GAG---------------TTT-T-T--T---T-C--A-A--TTAC-
gi|82561 : GGTAAT-C--GTAATCT-GTA-ATT-CGTAA--TCAGC-TGTA--ATT-GA-TTA---C--A--A-TT--TTT----CAA-G-TAA------TC-AAA--TTAATT----TAATA--T----C-G-------------------------TA-T-T--T---T-TTAG-A--TTAC-ATG-------------TC---TTTAT---TG-TAAT-CG--A-TTAC-A-----T---TA-AT--T--TTC--C---TGT-AAT--CA-T-G--ATT-ACATTTTAGAT-ACT-TT--TTT-T--G-A--T-TACCTTGCTTCATTAT-T--TATAATAT-ATT
gi|82562 : GGTAAT-T--GTAATCT-GTA-A-T-CGTAA--TCATC-TGTA--ATT-GA-TTA---CAAT--T-TC--CTT--------G-TAA------TTAAAT--GTCATC----CATAA--T----C-G------TAT---------------TTT-T-T--T---T-TTAG-A--TTAC-ATG----------TAATT---GTAAT---T--------G--A-TTAC-A-----T---TA-AT--T--TTA--CC-CTGT-AAT--CA-T-G--ATT-AC-ATGTAGATTATT-A---TTT-T--G-A--T-TA-----CTttcat
gi|82563 : GGTAAT-C--GTAATCT-GTA-A-TACGTAA--TCAGC-TATA--ATT-GA-TTA---CAAT--T-TT--TCG----CAA-G-T-A------TACAAT--GTAATC----TGTAA--T----C-G------TG-----------------TA-T-T--T---T-TTAG-A--TTAC-ATGTA--------TAATT----TAAT---TG-TAAT-CG--A-TTAC-A-----T---TA-AT--T--TTACCCC-ATGT-AAT--CA-T-G--ATT-AA-TTT--AG--ATT-AC--TTT-
gi|82564 : GGTAAT-TTGGTAAT-GTGTA-A-T-GGTAA--TGCAT-TGCA--ATG-CA-TTA---C--T--T-TT--TAT----CAA-G-TAA------TGCCTA--GTAATG----TGTAA--TGCACTAA------AAA---------------CTG-T---------------A--TTAC-ATG----------TAATG---GTAAT---G--TAAT-GC--A-TTAC------CTTCAAA-AT--G--T----TG-GTGT-AATGCTA-G-C--ATT-A---TTTGGC--ATT-AC--ATT-G--A-A--T-TA-----CTTT--TAT-T------AGAT-ATTtttgattatcttgctcatctatatatattatattt
gi|82565 : GGTAAT-T--GTAATAG-GTA-A-T-GGTAA--TGTAT-TGCA--ATG-CT-TTA---C--T--T-TT--AT-----CAA-G-TAA------TCGCTA--GTAATG----TGTAA--TACACTAA------AAA---------------CTG-T---------------A--TTAC-ATG----------TAACG---GTAAT---G--TAAT-GC--A-TTGC------CTTCAAA-AT--T--T----TG-GTGT-AATGCTA-G-C--ATT-A--TTTGGCA--A-T-AA--TTC-C--A-A--T-AT-----CCTT--TAT-T--agtattt
gi|82566 : GGTAAT-G--GTAAT-GTGTA-A-T-GGTAA--TGCAT-TGCA--ATA-CA-TTA---C--T--T-TT--TAT----CAA-G-TA-------TTGCAA--GTATAA----TGTAA--TGCACT-A------AAAA--------------CTG-C---------------A--TTAC-TTG----------TAATG---GTAATGTAT--TAAT-GC--A-TTAC------TTTCAAA-AT--T--TTG--T---TGT-AATGCTA-G-C--ATT-A---TTTGGC--ATT-AC--AAT-G--A-A--T-TA------TTT--TAT-A--TC-AAGAT-ATT
gi|82567 : GGTAAT-T--GAAA-AAAGTA-AAT-TGTA-----GAG-TGTA--ATT-AA-TTA---C--A--TATT--TTT----CAA-GATAA------TGGA-A--GTAATT----TGTAA--TC---T-G------AAG---------------TTT-T-TTAT---T-C--A-A--TTAC-AAGA---------TAATT---GTATT---T--TAAT-TA--A-TAAC-ATT-GCA---AA-AT--agtattt
gi|82568 : GGTAAT-C--GAAATCGA-TA-A-T-CGAAA--TCGAT-TGCA--ATT-AA-TTAAAGT--T--T-TC--TCT--------G-TAA------TTGAAG--GTAATC----aacattgattccaatacttttta
gi|82569 : GGTAAT-G--GTAAT--GGTATA-T-GG-AA--TGCAT-TGCA--AT--GA-TTA---C--T--T-TT--TAT----CAA-G-TAA------TGCCAA--GTAATG----TGTAA--T------GCACCAAAAA---------------CTG-C---------------A--TTAC-ATG----------TAATG---GTAAT---G--TAAT-TGCCA-TTAC-T---TTTC--AA-AT--T--TTG-----GTGT-AATGCTA-G-C--ATT-A---TTTGGC--ATT-AC--ATT-T--G-AATT-TA-----CTTT--TA-------TAAGAT-ATT
gi|82570 : GCAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGAA--ATC--A-TTA---C--T--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--T---T-C--A-A--TTAC-TTG----------CAATC---GTAAT---T--TAAT-CA--A-TTAC-A---GCT---GA-AT--T--TTG--TG-GTTT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTATTA--ATT-AC--TTT-C--A-A--T-TA-----C-AC--TA--C--TCTAAAAT--TTGTtaattattt
gi|82571 : GCAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TG-A--ATC--A-TTA---C--T--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AA----------------CTA-T-T--T---T-C--A-A--TTAC-TTG----------CAATC---GTAAT---T--TAAT-CA--A-TTAC-A---GCT---GA-AT--T--TTG--TG-GTTT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTATTA--ATT-AC--TTT-C--A-A--T-TA-----C-AC--TA--C--TCT-AAAT-ATTGTcattt
gi|82572 : GTAATGC--GTATTCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGATGTGTA--ATC--A-TTA---C--T--T-TT--TTTT---CAA-G-TAA------TTGATA--GTAACC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--T---T-C--A-A--TTAC-TTG----------TAATT---GTA-----T--TCAT-GG--A-TTAC-A---GCT---AA-AT--T--TTG--T--GTAT-AA---TA-TAA--ATT-AC-TTTTTCA--A-T-AC--TTT-C--A-A--T-TA-----CT----TA--C--TCTATAATAATTGTcattt
gi|82573 : GTAAT-C--GTA-TCTGTCA-A-T--GTAA--TCAGC-TGTA--ATT-GA-TTA---C--AGAT-TT--CTT----CA--G-TAA------TCGAAT--GTAATC----TGTAATGT----T-GT-----AA-----------------TA-T-T--T---T-A--G-A--TTAC-ATG----------TAATT----TAAT---G--TAAT--G--A-TTAC-A----TT---AACAT--T--TTA--C--CTGT-AAT--C--T-G--ATT-AC-TTTTAG---ATT-ACTTTTT-T--G-A--T-TA-----Ccattt
gi|82574 : AT-C--ATAATCG--TA-A-T-CGTGAGATCAGC-TGTA--ATT-GA-TTA---CATT--T-TT--TTT----CAAAG-TAA------TTGAAA--TTAATA----T-TAA--T----T-G------TAGTGAA-----------TTA-T-G--T---T-C--A-GATTTAC-ATATT--------TAAT-----TAAT---TG-TAAT-CG--A-TTAC-A---TTT------AT--T--TTA--CATATCT-AAT--CA-T-G--ATT-AC-ATAGTAG--ATT-AC--TTT-T--A-GATT-TA-----CTGCA-TAA-T--TTGAATAT-ATTAT
gi|82575 : ATGGGGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGTA--ATC--A-TTA---C--T--T-TT--TTT-----AA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----TGTAA--T----C-G------AAT---------------CTA-T-T--T---T-C--A-A--TTAC-TTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT---TA-AT--T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTTCA--ATT-AC--ATT-C--A-A--T-TA-----C-TC--TA--T--TCTGAAAT-ATTGT
gi|82576 : ATGGGGTA-A-T-AGTAA--TCGA---GTA--ATC--A-TTA---C--T--T-TT--TTT----CAA-G-GAA------TTGACT--GTAATC----AGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--T---T-C--A-A--TAAC-TTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT---AA-AT--T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATTCAC-TTTTTCA--ATT-AC--TTT-C--A-T--T-TA-----CTTC---AC-T--T-TAAAAC-ATTGTcattt
gi|82577 : ATGGGGTA-A-T-CGAAA--TCGAT-TGCA--ATT-AA-TTA---AA-T--T-TT--TTT----C-T-G-TAA------TTGACA--GTAATC----GATTA--T----C-A------AAA---------------AAA-A-T--T---T-C--A-A--TTAC-TTT----------TAATC---G-AAG---A--AAAT-CG--A-TTAC-A---GCTGAAAA-A-------------------AAT--CA-T-A--AGT-AA---TTACG--ATTAAA--ATT-C--A-A--T-TA-----TTTcattt
gi|82578 : ATTGAGTA-A-T-CGTAA--T-GAT-TGTA---TC--A-TTA---T--T--T-TT--TTTAT--CTG-G-TA-------TTGA------ATTC----TGTAAA-T----T-G------AAG---------------CTT-A-T--T---T-C--A-T--TT-T-ATGGGGGTTTTTTTTATCAGGGT--T---T--TAAT--G--A-TTA------GCT---AA-AT--T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-A--TTTTTCA--ATT-t
gi|82579 : GCA-A-T-TGTAA--TTGAG-TGTA--ATT-AA-TTA---C--A--T-AT--ATT----CAA-G-TAA------TTGGAA--GTAATG----TGTAA--T----T-G------AAG---------------TTT-T-T--TTTGT-C--A-A--TTAC-AAG----------TAATT---GTAAT---T--TAAT-TA--A-TTAC-ATT-GCA---AG-ATAAC--ATG--TACACGT-AAT--TC-C-A--GTT-AC-TTTT-CA--ATT-AC--TCT-C--C-A--T-Tcaatagatatattgccattt
gi|82580 : AT-TGTA--AAT-AA-TTA---C--A--T-AT--TTT----CAA-G-TAAATTGCATTGGAA--GTAATT----TTTAA--T----T-G------AAGTTTTTT---------TTT-T-T--T---T-C--A-A--TTAC---------------AATT---GTAAT---T--TAAT-AA--A-TTAC-ATT-GCA---AA-A-------TA--AA-ATGT-ACT--TC-C-A--ATT-AC-TTTT-CA--ATT-AC--TTTCC--A-A--T-TA-----C
gi|82581 : -TTA---T--A--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-A-T--T---T-C--A-A--TTAC-TTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT---AA-AT--T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTTCA--ATT-AC--ATT-A--A-A--T-TG-----C-TC--TA--T--TCTGAAAT-ATTGTaccatactaagaca
Alignments
lowQualScore : 111 111 1111111111111111111111111111111 1111111111 2222222222222 111111 11 11111 2222222
lowQualScore : 1 11 000 1 4 22 22 2 11 888 1 111 88888 4 11 4444 1 1 222222 2 11 2222 22 5555555555555555555555555555555 11 1 11 888888888 1 11 44 0000000000 4444 111 44 44444 1 1111111111111 1 2222 11 999999 1 00 1 2222 1 555 11111 1 77777 222 1 44 1 33333 6 55 5555555 1
lowQualScore : . .. ... . . .. .. . .. ... . ... ..... . .. .... . . ...... . .. .... .. ............................... .. . .. ......... . .. .. .......... .... ... .. ..... . ............. . .... .. ...... . .. . .... . ... ..... . ..... ... . .. . ..... . .. ....... .
lowQualScore : 2 77 666 1 2 66 99 1 44 666 0 888 99999 0 44 5555 0 0 999999 9 44 1111 44 6666666666666666666666666666666 55 0 44 222222222 0 44 11 4444444444 9999 999 77 77777 1 8888888888888 1 3333 55 666666 1 33 1 3333 1 333 00000 1 22222 111 2 11 2 11111 3 22 9999999 9
consensus : GGTAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGTA--ATC-GA-TTA---C--T--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGANA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT------C--A-A--TTAC-NTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--CG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTNNA--ATTA-C--T--TT-C-A-A--T-TA-----CTTC--TAT-T--TCTAAAAT-ATTGT
Reference ( family-518 ) : GGTAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGTA--ATC-GA-TTA---C--T--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGANA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT------C--A-A--TTAC-NTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--CG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTNNA--ATTA-C--T--TT-C-A-A--T-TA-----CTTC--TAT-T--TCTAAAAT-ATTGT
gi|82542 : GATAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGTA--ATC--A-TTA---C--T--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----TGTAA--T----T-A------AAG---------------CTA-T-T--TT------C--A-A--TTAC-TTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-TG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTTGA--ATTA-T--T--TT-C-A-AT-T-TA-----ATAC--TACAC--TCTAAAAT-ATTGT
gi|82543 : GGTAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CATAA--TCGAT-TGTA--ATC-C--TTA---C--T--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT------C--A-A--TTAC-TTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTAAA--ATTA-C--A--TT-C-A-A--T-TA-----CTTC--TAT-T--TCTGAAAT-ATTGTcatct
gi|82544 : GGTAAT-C--GTAATCGATTA-A-T-CATAA--TCGAT-TGTA--ATC--C-TTA---CT-T--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTATT-T--TT------C--A-A--TTAC-TTG----------T-ATC---GT-AT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--T--GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTAAA--ATTA-C--A--TT-C-A-A--T-TA-----C-TC--TAT-T--CTGAAAAT-ATTGT
gi|82545 : GGTAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGTA--A--------------------------T----CAA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT------C--A-A--TTAC-TTA----------TAATC---TTAAT---C--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCC-----AA-AT----T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTTCA--ATTA-C--T--TT-C-A-A--T-TA-----C-TC--TA--C--TCTAAAAT-ATTGT
gi|82546 : GGTATA-C--GTAATCGAGAA-AAT-CGTAA--TCGAT-TGTA--ATC--A-TTA---C--T--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AGG---------------CTA-T-T--TT------C--A-G--TTAC-TTGTAA-------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--TG-GT-T-AAT--TA-T----ATT-AC-TTTTTCA--ATTA-C--A--TT-C-A-A--T-TA-----C-TC--TAT-cattt
gi|82547 : GGTAAT-C--GTAATCGGGTA-A-T-CGTAA--TGAAT-TGTA--ATC--A-TTA---C--T--TATT--TTT----CAA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----T-----------T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT------T--A-A--TTAC-TAA----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-T---GCT-----AC-AT----T--TTG--TA-GTGT-AAT--TA-C-A--ATT-ACTTTTTTCC--ATTA-C--T--TT-C-A-A--T-TA------TTC--TA--C--TGTAAAAT-ATTATatatcataatgtcat
gi|82548 : GGTAAT-C--GTATTCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGTA--ATC--A-TTA---C--T--T-TTTTTTT----CAA-G-TAA------TTGATA--GTAACC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT------C--A-A--TTAC-TTG----------TAATT---GTAAT---T--TCAT-GG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--TG-GTAT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTCAA----TACC--T--TT-CGA-A--TATA-----CTcattt
gi|82549 : GGTAAT-C--GTATTCGAGTA-A-T--GTAA--TCGAT--GTA--ACT-CA-TTA---C--T--T-TT--TTTTCTTCA--G-TAA------TTGAGATAGTAATC-----GTAA--A----T-T------AAG----------------TA-T-T--TT------C--A-A--TTAC-TTG----------TAATCT--GTAAT---T--T-AT-GG--A-TTACAA---GCT-----AA-AT----T--TTG--T--GTCT-AATA-TA-A-A--ATT-AC-TTTT-CA--ATTA-C--T--TT-C-ATA--T-TA-----C-TC--TA
gi|82550 : GGTAAT-T--GAAA-AAAGTA-A-T-TGTAA--CTGAG-TGTA--ATT-AA-TTA---C--A--T-AT--TTT----CAA-G-TAA------TTGGAA--GTAATG----TGTAA--T----T-G------AAG---------------TT--T-T--TT------C--A-A--TTAC-AAG----------TAATT---GTAAT---T--TAAT-TA--A-TTAC-ATT-GCA-----AA-AA----TAAT-------ATGT-AAT--TC-C-A--ATT-AC-TTTT-CA--ATTA-C--TC-TC-C-A-A--T-TA-----CATCA-TA------CTAAGAC-cactaaa
gi|82551 : GGTAAT-T--GAAA--AATTA-A-T-TGTAA--TTGAG-TGTATAATT-AA-T-A---C--A--TATT--CTT----CAA-G-TAA------TTGGAA--GTAATTAAGGTGTAA--T----T-G------AAG---------------TTA-AAT--TT------C--A-A--TTAC-AAG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-TA--ATTTAC-AATTGCA-----AA-AA----T--AGG--CATGTATAAAT--TC-C-A--ATT-AC-TTTT-TA--ATTA-C--TTCTC-C-A-A--T-TA-----CATC--
gi|82552 : GGTAAT-C--GTAATCT-GTA-A-T-CGTAA--TCAGC-TGTA--ATT-GATTTA---C--A--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TCGAAT--GTAATC----TGTAA--T----C-G------TG-----------------TA-T-T--TT------T--AGA--TTAC-ATG----------CA--------AAT---A--TAAT-CG--A-TTAC-A-----T-----TA-AT----A--CTA--CC-CAGT-AAT--CA-T-G--ATT-AC-ATTTAG---ATTA-CTTT--TT-T-G-A--T-TA-----CTTG--CAT-TCATTTAATAT-ATTacactaaa
gi|82553 : GGTAAT-C--GTAATCT-GTA-A-T-CGTAA--TCAGC-TGTA--ATT-GA-TTA---CAAT--T-TT--ATT-----AA-G-TAA------TCGAAT--GTATTC----TGTAA--T----T-G------TGT---------------ATG-T-T--TTA-----G--A-A--TTAC-ATG----------TAATT---TAAAT---TGGTAATGCG--A-TTAC-A----TT-----A--------T--TTA--CACTTGT-AAT--CA-T-G--ATT-AC--ATTAGA--GTTA-C--T--TT-T-G-A--T-TA-----CT
gi|82554 : GGTAAT-G--GTAAT-GTGTA-A-T--GTAA--TGCAT-TGCA--ATG-CA-TTA---C--T--T-TT--TAT----CAA-G-TAA------TGCCTA--GTAATG----TGTAA--TGCACT-G------AA------------------A-A-C--TG------C--G-A--TTACATTG----------TAATG---ATAAT---G--TAAT-GC--A-TTAC-T---TTC-----AA-AT----T--TTG---G-G-GT-AATGCTA-G-C--ATT-AC---TTGGC--ATTA-C--A--TT-G-A-A--T-TA-----CTTT--TA-------TAAGAT-ATT
gi|82555 : GGTAAT-G--GTAAT-GTGTA-A-T-GGTAA--TGCAT-TGCA--ATG-CA-TTA---C--T--T-TT--TAT----CAA-G-TAA------TGCCTA--GTAATG----TGTAA--TGCACT-GA-----AAA---------------CTG-C-----------------A--TTAC-ATG----------TAATG---GTAAT---G--TAAT-GC--A-TTAC------TTTCA--AA-AT----T--TT----G-GTGT-AATGCTA-G-C--ATT-A---TTTGGC--ATTA-CA-T--TT-G-A-A--T-TA-----CTTT--AA-------TAAGAT-ATTagtattt
gi|82556 : GGTAAT-C--GAAA-AAAGTA-A-T-TGTAA--TTGAG-TGTA--ATT-AA-TTA---C--A--T-AT--TTT----TAA-G-TAA------TTGGAA--GTAA---------GA--T----C-A------------------------CTT-T-T--TT------C--A-A--TTAC-AAG----------TAATT---GTAAT---T--CAAT-TA--T-TTAC-ATT-GCA-----AA-A--------TAA--C--ATGT-AAT--TC-C-A--ATT-A----TTCCA--ATTA-C--agtattt
gi|82557 : GGTAAT-T--GAAA-AAAGTA-A-T-TGTAA--TTGAG-TGTA--ATT-AA-TTA---C--A--T-AT--TTT----CAA-G-TAA------TTGGAA--GTAATT----TGTAA--T----A-G------AAGTTTTTTGTTTTTGTTTTT-T-T--TT------T--A-A--TTAC-AAG----------TAATT---GTAA
gi|82558 : GGTAAT-C--GTAATCG-GTA-AAT-CGTAAAATCAGCATGTA--ATTAGA-TTA---G--A--GATT--TTT----CAA-G-TAA------TCAAAT--GTAATC----TGTAA--TCG--T-G------TA----------------TTA-T-T--TT------A--G-A--TTAC-ATG----------TAATT---TTAGA---T--TAAT-CGATA-TTAC-A-----T-----TA-AT----T--TTA--CC-CTGT-AAT--CATT-G--ATT-AC-ATTTAG---ATTA-C--T--TT-----------------TTTC--TAT-T--
gi|82559 : GGTAAT-G--GTAAT-GTGTA-A-T-GGTAA--TGCAT-TGCA--ATG-CA-TTA---C--T--T-TT--TAT----CAA-G-TAA------TGCCAA--GTAATG----TGTAA--T---------------G---------------C--------------------------AC--TG----------TAATG---GTAAT---G--TAAT-GC--A-TTAC------TTTCA--AA-AT----T--TT----T-GTGT-AAT--GG-T-AGCATT-A---TTTGGC--ATTA-CA-T--TT-G-A-A--T-TA-----CTTT--TA-------TAAAGT-ATT
gi|82560 : GGTAAT-T--GAAAAAAGGTA-A-T-TTTAA--TTCAG-TGCA--ATT-AA-TTA---C--A--T-AT--TTT----CAA-A-TAA------TTGCAA--GTAATT----TGTAA--T----T-G------GAG---------------TTT-T-T--TT------C--A-A--TTAC-
gi|82561 : GGTAAT-C--GTAATCT-GTA-ATT-CGTAA--TCAGC-TGTA--ATT-GA-TTA---C--A--A-TT--TTT----CAA-G-TAA------TC-AAA--TTAATT----TAATA--T----C-G-------------------------TA-T-T--TT------TTAG-A--TTAC-ATG-------------TC---TTTAT---TG-TAAT-CG--A-TTAC-A-----T-----TA-AT----T--TTC--C---TGT-AAT--CA-T-G--ATT-ACATTTTAGAT-ACTT-T--T--TT-T-G-A--T-TACCTTGCTTCATTAT-T--TATAATAT-ATT
gi|82562 : GGTAAT-T--GTAATCT-GTA-A-T-CGTAA--TCATC-TGTA--ATT-GA-TTA---CAAT--T-TC--CTT--------G-TAA------TTAAAT--GTCATC----CATAA--T----C-G------TAT---------------TTT-T-T--TT------TTAG-A--TTAC-ATG----------TAATT---GTAAT---T--------G--A-TTAC-A-----T-----TA-AT----T--TTA--CC-CTGT-AAT--CA-T-G--ATT-AC-ATGTAGATTATTA----T--TT-T-G-A--T-TA-----CTttcat
gi|82563 : GGTAAT-C--GTAATCT-GTA-A-TACGTAA--TCAGC-TATA--ATT-GA-TTA---CAAT--T-TT--TCG----CAA-G-T-A------TACAAT--GTAATC----TGTAA--T----C-G------TG-----------------TA-T-T--TT------TTAG-A--TTAC-ATGTA--------TAATT----TAAT---TG-TAAT-CG--A-TTAC-A-----T-----TA-AT----T--TTACCCC-ATGT-AAT--CA-T-G--ATT-AA-TTT--AG--ATTA-C--T--TT-
gi|82564 : GGTAAT-TTGGTAAT-GTGTA-A-T-GGTAA--TGCAT-TGCA--ATG-CA-TTA---C--T--T-TT--TAT----CAA-G-TAA------TGCCTA--GTAATG----TGTAA--TGCACTAA------AAA---------------CTG-T-----------------A--TTAC-ATG----------TAATG---GTAAT---G--TAAT-GC--A-TTAC------CTTCA--AA-AT----G--TT----G-GTGT-AATGCTA-G-C--ATT-A---TTTGGC--ATTA-C--A--TT-G-A-A--T-TA-----CTTT--TAT-T------AGAT-ATTtttgattatcttgctcatctatatatattatattt
gi|82565 : GGTAAT-T--GTAATAG-GTA-A-T-GGTAA--TGTAT-TGCA--ATG-CT-TTA---C--T--T-TT--AT-----CAA-G-TAA------TCGCTA--GTAATG----TGTAA--TACACTAA------AAA---------------CTG-T-----------------A--TTAC-ATG----------TAACG---GTAAT---G--TAAT-GC--A-TTGC------CTTCA--AA-AT----T--TT----G-GTGT-AATGCTA-G-C--ATT-A--TTTGGCA--A-TA-A--T--TC-C-A-A--T-AT-----CCTT--TAT-T--agtattt
gi|82566 : GGTAAT-G--GTAAT-GTGTA-A-T-GGTAA--TGCAT-TGCA--ATA-CA-TTA---C--T--T-TT--TAT----CAA-G-T-A------TTGCAA--GTATAA----TGTAA--TGCACTAA------AAA---------------CTG-C-----------------A--TTAC-TTG----------TAATG---GTAATGTAT--TAAT-GC--A-TTAC------TTTCA--AA-AT----T--TTG--T---TGT-AATGCTA-G-C--ATT-A---TTTGGC--ATTA-C--A--AT-G-A-A--T-TA------TTT--TAT-A--TC-AAGAT-ATT
gi|82567 : GGTAAT-T--GAAA-AAAGTA-AAT-TGTA-----GAG-TGTA--ATT-AA-TTA---C--A--TATT--TTT----CAA-GATAA------TGGA-A--GTAATT----TGTAA--TC---T-G------AAG---------------TTT-T-TTATT------C--A-A--TTAC-AAGA---------TAATT---GTATT---T--TAAT-TA--A-TAAC-ATT-GCA-----AA-AT----agtattt
gi|82568 : GGTAAT-C--GAAATCGA-TA-A-T-CGAAA--TCGAT-TGCA--ATT-AA-TTAAAGT--T--T-TC--TCT--------G-TAA------TTGAAG--GTAATC----aacattgattccaatacttttta
gi|82569 : GGTAAT-G--GTAAT--GGTATA-T-GG-AA--TGCAT-TGCA--AT--GA-TTA---C--T--T-TT--TAT----CAA-G-TAA------TGCCAA--GTAATG----TGTAA-------T-GCACCAAAAA---------------CTG-C-----------------A--TTAC-ATG----------TAATG---GTAAT---G--TAAT-TGCCA-TTAC-T---TTTC----AA-AT----T--TT----G-GTGT-AATGCTA-G-C--ATT-A---TTTGGC--ATTA-CA-T--TT-G-A-AT-T-TA-----CTTT--TA-------TAAGAT-ATT
gi|82570 : GCAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGAA--ATC--A-TTA---C--T--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT------C--A-A--TTAC-TTG----------CAATC---GTAAT---T--TAAT-CA--A-TTAC-A---GCT-----GA-AT----T--TTG--TG-GTTT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTATTA--ATTA-C--T--TT-C-A-A--T-TA-----C-AC--TA--C--TCTAAAAT--TTGTtaattattt
gi|82571 : GCAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TG-A--ATC--A-TTA---C--T--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AA----------------CTA-T-T--TT------C--A-A--TTAC-TTG----------CAATC---GTAAT---T--TAAT-CA--A-TTAC-A---GCT-----GA-AT----T--TTG--TG-GTTT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTATTA--ATTA-C--T--TT-C-A-A--T-TA-----C-AC--TA--C--TCT-AAAT-ATTGTcattt
gi|82572 : GTAATGC--GTATTCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGATGTGTA--ATC--A-TTA---C--T--T-TT--TTTT---CAA-G-TAA------TTGATA--GTAACC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT------C--A-A--TTAC-TTG----------TAATT---GTA-----T--TCAT-GG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--T--GTAT-AA---TA-TAA--ATT-AC-TTTTTCA--A-TA-C--T--TT-C-A-A--T-TA-----CT----TA--C--TCTATAATAATTGTcattt
gi|82573 : GTAAT-C--GTA-TCTGTCA-A-T--GTAA--TCAGC-TGTA--ATT-GA-TTA---C--AGAT-TT--CTT----CA--G-TAA------TCGAAT--GTAATC----TGTAATGT----T-GT-----AA-----------------TA-T-T--TT------A--G-A--TTAC-ATG----------TAATT----TAAT---G--TAAT--G--A-TTAC-A----TT-----AACAT----T--TTA--C--CTGT-AAT--C--T-G--ATT-AC-TTTTAG---ATTA-CTTT--TT-T-G-A--T-TA-----Ccattt
gi|82574 : AT-C--ATAATCG--TA-A-T-CGTGAGATCAGC-TGTA--ATT-GA-TTA---CATT--T-TT--TTT----CAAAG-TAA------TTGAAA--TTAATA----T-TAA--T----T-G------TAGTGAA-----------TTA-T-G--TT------C--A-GATTTAC-ATATT--------TAAT-----TAAT---TG-TAAT-CG--A-TTAC-A---TTT--------AT----T--TTA--CATATCT-AAT--CA-T-G--ATT-AC-ATAGTAG--ATTA-C--T--TT-T-A-GATT-TA-----CTGCA-TAA-T--TTGAATAT-ATTAT
gi|82575 : ATGGGGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGTA--ATC--A-TTA---C--T--T-TT--TTT-----AA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----TGTAA--T----C-G------AAT---------------CTA-T-T--TT------C--A-A--TTAC-TTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT-----TA-AT----T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTTCA--ATTA-C--A--TT-C-A-A--T-TA-----C-TC--TA--T--TCTGAAAT-ATTGT
gi|82576 : ATGGGGTA-A-T-AGTAA--TCGA---GTA--ATC--A-TTA---C--T--T-TT--TTT----CAA-G-GAA------TTGACT--GTAATC----AGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT------C--A-A--TAAC-TTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATTCAC-TTTTTCA--ATTA-C--T--TT-C-A-T--T-TA-----CTTC---AC-T--T-TAAAAC-ATTGTcattt
gi|82577 : ATGGGGTA-A-T-CGAAA--TCGAT-TGCA--ATT-AA-TTA---AA-T--T-TT--TTT----CT--G-TAA------TTGACA--GTAATC----GATTA--T----C-A------AAA---------------AAA-A-T--TT------C--A-A--TTAC-TTT----------TAATC---G-AAG---A--AAAT-CG--A-TTAC-A---GCTGAAAAAA-AT----------------CAT-AA----G-T-A--ATT-AC-GATTAAA--A----------TT-C-A-A--T-TA-----TTTcattt
gi|82578 : ATTGAGTA-A-T-CGTAA--T-GAT-TGTA---TC--A-TTA---T--T--T-TT--TTTAT--CTG-G-TA-------TTGA------ATTC----TGTAAA-T----T-G------AAG---------------CTT-A-T--TT------C--A-T--TT-T-ATGGGGGTTTTTTTTATCAGGGT--T---T--TAAT--G--A-TTA------GCT-----AA-AT----T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-A--TTTTTCA--ATTt
gi|82579 : GCA-A-T-TGTAA--TTGAG-TGTA--ATT-AA-TTA---C--A--T-AT--ATT----CAA-G-TAA------TTGGAA--GTAATG----TGTAA--T----T-G------AAG---------------TTT-T-T--TTTGT---C--A-A--TTAC-AAG----------TAATT---GTAAT---T--TAAT-TA--A-TTAC-ATT-GCA-----AG-ATAACAT--GTA--CA--CGT-AAT--TC-C-A--GTT-AC-TTTT-CA--ATTA-C--T--CT-C-C-A--T-Tcaatagatatattgccattt
gi|82580 : AT-TGTA--AAT-AA-TTA---C--A--T-AT--TTT----CAA-G-TAAATTGCATTGGAA--GTAATT----TTTAA--T----T-G------AAG---------------TTT-T-T--TTTTTTTTC--A-A--TTAC---------------AATT---GTAAT---T--TAAT-AA--A-TTAC-ATT-GCA-----AA-AT---------A--AA-ATGT-ACT--TC-C-A--ATT-AC-TTTTC-A--ATTA-C--T--TTCC-A-A--T-TA-----C
gi|82581 : -TTA---T--A--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-A-T--TT------C--A-A--TTAC-TTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTTCA--ATTA-C--A--TT-A-A-A--T-TG-----C-TC--TA--T--TCTGAAAT-ATTGTaccatactaagaca
Alignments
lowQualScore : 111 111 1111111111111111111111111111111 1111111111 2222222222222 111111 11 11111 2222222
lowQualScore : 1 11 000 1 4 22 22 2 11 888 1 111 88888 4 11 4444 1 1 222222 2 11 2222 22 5555555555555555555555555555555 11 1 11 888888888 1 11 44 0000000000 4444 111 44 44444 1 1111111111111 1 2222 11 999999 1 00 1 2222 1 555 11111 1 77777 222 1 44 1 33333 6 55 5555555 1
lowQualScore : . .. ... . . .. .. . .. ... . ... ..... . .. .... . . ...... . .. .... .. ............................... .. . .. ......... . .. .. .......... .... ... .. ..... . ............. . .... .. ...... . .. . .... . ... ..... . ..... ... . .. . ..... . .. ....... .
lowQualScore : 2 77 666 1 2 66 99 1 44 666 0 888 99999 0 44 5555 0 0 999999 9 44 1111 44 6666666666666666666666666666666 55 0 44 222222222 0 44 11 4444444444 9999 999 77 77777 1 8888888888888 1 3333 55 666666 1 33 1 3333 1 333 00000 1 22222 111 2 11 2 11111 3 22 9999999 9
consensus : GGTAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGTA--ATC-GA-TTA---C--T--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGANA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT------C--A-A--TTAC-NTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--CG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTNNA--ATTA-C--T--TT-C-A-A--T-TA-----CTTC--TAT-T--TCTAAAAT-ATTGT
Reference ( family-518 ) : GGTAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGTA--ATC-GA-TTA---C--T--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGANA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT------C--A-A--TTAC-NTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--CG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTNNA--ATTA-C--T--TT-C-A-A--T-TA-----CTTC--TAT-T--TCTAAAAT-ATTGT
gi|82542 : GATAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGTA--ATC--A-TTA---C--T--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----TGTAA--T----T-A------AAG---------------CTA-T-T--TT------C--A-A--TTAC-TTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-TG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTTGA--ATTA-T--T--TT-C-A-AT-T-TA-----ATAC--TACAC--TCTAAAAT-ATTGT
gi|82543 : GGTAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CATAA--TCGAT-TGTA--ATC-C--TTA---C--T--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT------C--A-A--TTAC-TTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTAAA--ATTA-C--A--TT-C-A-A--T-TA-----CTTC--TAT-T--TCTGAAAT-ATTGTcatct
gi|82544 : GGTAAT-C--GTAATCGATTA-A-T-CATAA--TCGAT-TGTA--ATC--C-TTA---CT-T--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTATT-T--TT------C--A-A--TTAC-TTG----------T-ATC---GT-AT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--T--GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTAAA--ATTA-C--A--TT-C-A-A--T-TA-----C-TC--TAT-T--CTGAAAAT-ATTGT
gi|82545 : GGTAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGTA--A--------------------------T----CAA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT------C--A-A--TTAC-TTA----------TAATC---TTAAT---C--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCC-----AA-AT----T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTTCA--ATTA-C--T--TT-C-A-A--T-TA-----C-TC--TA--C--TCTAAAAT-ATTGT
gi|82546 : GGTATA-C--GTAATCGAGAA-AAT-CGTAA--TCGAT-TGTA--ATC--A-TTA---C--T--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AGG---------------CTA-T-T--TT------C--A-G--TTAC-TTGTAA-------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--TG-GT-T-AAT--TA-T----ATT-AC-TTTTTCA--ATTA-C--A--TT-C-A-A--T-TA-----C-TC--TAT-cattt
gi|82547 : GGTAAT-C--GTAATCGGGTA-A-T-CGTAA--TGAAT-TGTA--ATC--A-TTA---C--T--TATT--TTT----CAA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----T-----------T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT------T--A-A--TTAC-TAA----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-T---GCT-----AC-AT----T--TTG--TA-GTGT-AAT--TA-C-A--ATT-ACTTTTTTCC--ATTA-C--T--TT-C-A-A--T-TA------TTC--TA--C--TGTAAAAT-ATTATatatcataatgtcat
gi|82548 : GGTAAT-C--GTATTCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGTA--ATC--A-TTA---C--T--T-TTTTTTT----CAA-G-TAA------TTGATA--GTAACC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT------C--A-A--TTAC-TTG----------TAATT---GTAAT---T--TCAT-GG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--TG-GTAT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTCAA----TACC--T--TT-CGA-A--TATA-----CTcattt
gi|82549 : GGTAAT-C--GTATTCGAGTA-A-T--GTAA--TCGAT--GTA--ACT-CA-TTA---C--T--T-TT--TTTTCTTCA--G-TAA------TTGAGATAGTAATC-----GTAA--A----T-T------AAG----------------TA-T-T--TT------C--A-A--TTAC-TTG----------TAATCT--GTAAT---T--T-AT-GG--A-TTACAA---GCT-----AA-AT----T--TTG--T--GTCT-AATA-TA-A-A--ATT-AC-TTTT-CA--ATTA-C--T--TT-C-ATA--T-TA-----C-TC--TA
gi|82550 : GGTAAT-T--GAAA-AAAGTA-A-T-TGTAA--CTGAG-TGTA--ATT-AA-TTA---C--A--T-AT--TTT----CAA-G-TAA------TTGGAA--GTAATG----TGTAA--T----T-G------AAG---------------TT--T-T--TT------C--A-A--TTAC-AAG----------TAATT---GTAAT---T--TAAT-TA--A-TTAC-ATT-GCA-----AA-AA----TAAT-------ATGT-AAT--TC-C-A--ATT-AC-TTTT-CA--ATTA-C--TC-TC-C-A-A--T-TA-----CATCA-TA------CTAAGAC-cactaaa
gi|82551 : GGTAAT-T--GAAA--AATTA-A-T-TGTAA--TTGAG-TGTATAATT-AA-T-A---C--A--TATT--CTT----CAA-G-TAA------TTGGAA--GTAATTAAGGTGTAA--T----T-G------AAG---------------TTA-AAT--TT------C--A-A--TTAC-AAG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-TA--ATTTAC-AATTGCA-----AA-AA----T--AGG--CATGTATAAAT--TC-C-A--ATT-AC-TTTT-TA--ATTA-C--TTCTC-C-A-A--T-TA-----CATC--
gi|82552 : GGTAAT-C--GTAATCT-GTA-A-T-CGTAA--TCAGC-TGTA--ATT-GATTTA---C--A--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TCGAAT--GTAATC----TGTAA--T----C-G------TG-----------------TA-T-T--TT------T--AGA--TTAC-ATG----------CA--------AAT---A--TAAT-CG--A-TTAC-A-----T-----TA-AT----A--CTA--CC-CAGT-AAT--CA-T-G--ATT-AC-ATTTAG---ATTA-CTTT--TT-T-G-A--T-TA-----CTTG--CAT-TCATTTAATAT-ATTacactaaa
gi|82553 : GGTAAT-C--GTAATCT-GTA-A-T-CGTAA--TCAGC-TGTA--ATT-GA-TTA---CAAT--T-TT--ATT-----AA-G-TAA------TCGAAT--GTATTC----TGTAA--T----T-G------TGT---------------ATG-T-T--TTA-----G--A-A--TTAC-ATG----------TAATT---TAAAT---TGGTAATGCG--A-TTAC-A----TT-----A--------T--TTA--CACTTGT-AAT--CA-T-G--ATT-AC--ATTAGA--GTTA-C--T--TT-T-G-A--T-TA-----CT
gi|82554 : GGTAAT-G--GTAAT-GTGTA-A-T--GTAA--TGCAT-TGCA--ATG-CA-TTA---C--T--T-TT--TAT----CAA-G-TAA------TGCCTA--GTAATG----TGTAA--TGCACT-G------AA------------------A-A-C--TG------C--G-A--TTACATTG----------TAATG---ATAAT---G--TAAT-GC--A-TTAC-T---TTC-----AA-AT----T--TTG---G-G-GT-AATGCTA-G-C--ATT-AC---TTGGC--ATTA-C--A--TT-G-A-A--T-TA-----CTTT--TA-------TAAGAT-ATT
gi|82555 : GGTAAT-G--GTAAT-GTGTA-A-T-GGTAA--TGCAT-TGCA--ATG-CA-TTA---C--T--T-TT--TAT----CAA-G-TAA------TGCCTA--GTAATG----TGTAA--TGCACT-GA-----AAA---------------CTG-C-----------------A--TTAC-ATG----------TAATG---GTAAT---G--TAAT-GC--A-TTAC------TTTCA--AA-AT----T--TT----G-GTGT-AATGCTA-G-C--ATT-A---TTTGGC--ATTA-CA-T--TT-G-A-A--T-TA-----CTTT--AA-------TAAGAT-ATTagtattt
gi|82556 : GGTAAT-C--GAAA-AAAGTA-A-T-TGTAA--TTGAG-TGTA--ATT-AA-TTA---C--A--T-AT--TTT----TAA-G-TAA------TTGGAA--GTAA---------GA--T----C-A------------------------CTT-T-T--TT------C--A-A--TTAC-AAG----------TAATT---GTAAT---T--CAAT-TA--T-TTAC-ATT-GCA-----AA-A--------TAA--C--ATGT-AAT--TC-C-A--ATT-A----TTCCA--ATTA-C--agtattt
gi|82557 : GGTAAT-T--GAAA-AAAGTA-A-T-TGTAA--TTGAG-TGTA--ATT-AA-TTA---C--A--T-AT--TTT----CAA-G-TAA------TTGGAA--GTAATT----TGTAA--T----A-G------AAGTTTTTTGTTTTTGTTTTT-T-T--TT------T--A-A--TTAC-AAG----------TAATT---GTAA
gi|82558 : GGTAAT-C--GTAATCG-GTA-AAT-CGTAAAATCAGCATGTA--ATTAGA-TTA---G--A--GATT--TTT----CAA-G-TAA------TCAAAT--GTAATC----TGTAA--TCG--T-G------TA----------------TTA-T-T--TT------A--G-A--TTAC-ATG----------TAATT---TTAGA---T--TAAT-CGATA-TTAC-A-----T-----TA-AT----T--TTA--CC-CTGT-AAT--CATT-G--ATT-AC-ATTTAG---ATTA-C--T--TT-----------------TTTC--TAT-T--
gi|82559 : GGTAAT-G--GTAAT-GTGTA-A-T-GGTAA--TGCAT-TGCA--ATG-CA-TTA---C--T--T-TT--TAT----CAA-G-TAA------TGCCAA--GTAATG----TGTAA--T---------------G---------------C--------------------------AC--TG----------TAATG---GTAAT---G--TAAT-GC--A-TTAC------TTTCA--AA-AT----T--TT----T-GTGT-AAT--GG-T-AGCATT-A---TTTGGC--ATTA-CA-T--TT-G-A-A--T-TA-----CTTT--TA-------TAAAGT-ATT
gi|82560 : GGTAAT-T--GAAAAAAGGTA-A-T-TTTAA--TTCAG-TGCA--ATT-AA-TTA---C--A--T-AT--TTT----CAA-A-TAA------TTGCAA--GTAATT----TGTAA--T----T-G------GAG---------------TTT-T-T--TT------C--A-A--TTAC-
gi|82561 : GGTAAT-C--GTAATCT-GTA-ATT-CGTAA--TCAGC-TGTA--ATT-GA-TTA---C--A--A-TT--TTT----CAA-G-TAA------TC-AAA--TTAATT----TAATA--T----C-G-------------------------TA-T-T--TT------TTAG-A--TTAC-ATG-------------TC---TTTAT---TG-TAAT-CG--A-TTAC-A-----T-----TA-AT----T--TTC--C---TGT-AAT--CA-T-G--ATT-ACATTTTAGAT-ACTT-T--T--TT-T-G-A--T-TACCTTGCTTCATTAT-T--TATAATAT-ATT
gi|82562 : GGTAAT-T--GTAATCT-GTA-A-T-CGTAA--TCATC-TGTA--ATT-GA-TTA---CAAT--T-TC--CTT--------G-TAA------TTAAAT--GTCATC----CATAA--T----C-G------TAT---------------TTT-T-T--TT------TTAG-A--TTAC-ATG----------TAATT---GTAAT---T--------G--A-TTAC-A-----T-----TA-AT----T--TTA--CC-CTGT-AAT--CA-T-G--ATT-AC-ATGTAGATTATTA----T--TT-T-G-A--T-TA-----CTttcat
gi|82563 : GGTAAT-C--GTAATCT-GTA-A-TACGTAA--TCAGC-TATA--ATT-GA-TTA---CAAT--T-TT--TCG----CAA-G-T-A------TACAAT--GTAATC----TGTAA--T----C-G------TG-----------------TA-T-T--TT------TTAG-A--TTAC-ATGTA--------TAATT----TAAT---TG-TAAT-CG--A-TTAC-A-----T-----TA-AT----T--TTACCCC-ATGT-AAT--CA-T-G--ATT-AA-TTT--AG--ATTA-C--T--TT-
gi|82564 : GGTAAT-TTGGTAAT-GTGTA-A-T-GGTAA--TGCAT-TGCA--ATG-CA-TTA---C--T--T-TT--TAT----CAA-G-TAA------TGCCTA--GTAATG----TGTAA--TGCACTAA------AAA---------------CTG-T-----------------A--TTAC-ATG----------TAATG---GTAAT---G--TAAT-GC--A-TTAC------CTTCA--AA-AT----G--TT----G-GTGT-AATGCTA-G-C--ATT-A---TTTGGC--ATTA-C--A--TT-G-A-A--T-TA-----CTTT--TAT-T------AGAT-ATTtttgattatcttgctcatctatatatattatattt
gi|82565 : GGTAAT-T--GTAATAG-GTA-A-T-GGTAA--TGTAT-TGCA--ATG-CT-TTA---C--T--T-TT--AT-----CAA-G-TAA------TCGCTA--GTAATG----TGTAA--TACACTAA------AAA---------------CTG-T-----------------A--TTAC-ATG----------TAACG---GTAAT---G--TAAT-GC--A-TTGC------CTTCA--AA-AT----T--TT----G-GTGT-AATGCTA-G-C--ATT-A--TTTGGCA--A-TA-A--T--TC-C-A-A--T-AT-----CCTT--TAT-T--agtattt
gi|82566 : GGTAAT-G--GTAAT-GTGTA-A-T-GGTAA--TGCAT-TGCA--ATA-CA-TTA---C--T--T-TT--TAT----CAA-G-T-A------TTGCAA--GTATAA----TGTAA--TGCACTAA------AAA---------------CTG-C-----------------A--TTAC-TTG----------TAATG---GTAATGTAT--TAAT-GC--A-TTAC------TTTCA--AA-AT----T--TTG--T---TGT-AATGCTA-G-C--ATT-A---TTTGGC--ATTA-C--A--AT-G-A-A--T-TA------TTT--TAT-A--TC-AAGAT-ATT
gi|82567 : GGTAAT-T--GAAA-AAAGTA-AAT-TGTA-----GAG-TGTA--ATT-AA-TTA---C--A--TATT--TTT----CAA-GATAA------TGGA-A--GTAATT----TGTAA--TC---T-G------AAG---------------TTT-T-TTATT------C--A-A--TTAC-AAGA---------TAATT---GTATT---T--TAAT-TA--A-TAAC-ATT-GCA-----AA-AT----agtattt
gi|82568 : GGTAAT-C--GAAATCGA-TA-A-T-CGAAA--TCGAT-TGCA--ATT-AA-TTAAAGT--T--T-TC--TCT--------G-TAA------TTGAAG--GTAATC----aacattgattccaatacttttta
gi|82569 : GGTAAT-G--GTAAT--GGTATA-T-GG-AA--TGCAT-TGCA--AT--GA-TTA---C--T--T-TT--TAT----CAA-G-TAA------TGCCAA--GTAATG----TGTAA-------T-GCACCAAAAA---------------CTG-C-----------------A--TTAC-ATG----------TAATG---GTAAT---G--TAAT-TGCCA-TTAC-T---TTTC----AA-AT----T--TT----G-GTGT-AATGCTA-G-C--ATT-A---TTTGGC--ATTA-CA-T--TT-G-A-AT-T-TA-----CTTT--TA-------TAAGAT-ATT
gi|82570 : GCAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGAA--ATC--A-TTA---C--T--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT------C--A-A--TTAC-TTG----------CAATC---GTAAT---T--TAAT-CA--A-TTAC-A---GCT-----GA-AT----T--TTG--TG-GTTT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTATTA--ATTA-C--T--TT-C-A-A--T-TA-----C-AC--TA--C--TCTAAAAT--TTGTtaattattt
gi|82571 : GCAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TG-A--ATC--A-TTA---C--T--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AA----------------CTA-T-T--TT------C--A-A--TTAC-TTG----------CAATC---GTAAT---T--TAAT-CA--A-TTAC-A---GCT-----GA-AT----T--TTG--TG-GTTT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTATTA--ATTA-C--T--TT-C-A-A--T-TA-----C-AC--TA--C--TCT-AAAT-ATTGTcattt
gi|82572 : GTAATGC--GTATTCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGATGTGTA--ATC--A-TTA---C--T--T-TT--TTTT---CAA-G-TAA------TTGATA--GTAACC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT------C--A-A--TTAC-TTG----------TAATT---GTA-----T--TCAT-GG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--T--GTAT-AA---TA-TAA--ATT-AC-TTTTTCA--A-TA-C--T--TT-C-A-A--T-TA-----CT----TA--C--TCTATAATAATTGTcattt
gi|82573 : GTAAT-C--GTA-TCTGTCA-A-T--GTAA--TCAGC-TGTA--ATT-GA-TTA---C--AGAT-TT--CTT----CA--G-TAA------TCGAAT--GTAATC----TGTAATGT----T-GT-----AA-----------------TA-T-T--TT------A--G-A--TTAC-ATG----------TAATT----TAAT---G--TAAT--G--A-TTAC-A----TT-----AACAT----T--TTA--C--CTGT-AAT--C--T-G--ATT-AC-TTTTAG---ATTA-CTTT--TT-T-G-A--T-TA-----Ccattt
gi|82574 : AT-C--ATAATCG--TA-A-T-CGTGAGATCAGC-TGTA--ATT-GA-TTA---CATT--T-TT--TTT----CAAAG-TAA------TTGAAA--TTAATA----T-TAA--T----T-G------TAGTGAA-----------TTA-T-G--TT------C--A-GATTTAC-ATATT--------TAAT-----TAAT---TG-TAAT-CG--A-TTAC-A---TTT--------AT----T--TTA--CATATCT-AAT--CA-T-G--ATT-AC-ATAGTAG--ATTA-C--T--TT-T-A-GATT-TA-----CTGCA-TAA-T--TTGAATAT-ATTAT
gi|82575 : ATGGGGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGTA--ATC--A-TTA---C--T--T-TT--TTT-----AA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----TGTAA--T----C-G------AAT---------------CTA-T-T--TT------C--A-A--TTAC-TTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT-----TA-AT----T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTTCA--ATTA-C--A--TT-C-A-A--T-TA-----C-TC--TA--T--TCTGAAAT-ATTGT
gi|82576 : ATGGGGTA-A-T-AGTAA--TCGA---GTA--ATC--A-TTA---C--T--T-TT--TTT----CAA-G-GAA------TTGACT--GTAATC----AGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT------C--A-A--TAAC-TTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATTCAC-TTTTTCA--ATTA-C--T--TT-C-A-T--T-TA-----CTTC---AC-T--T-TAAAAC-ATTGTcattt
gi|82577 : ATGGGGTA-A-T-CGAAA--TCGAT-TGCA--ATT-AA-TTA---AA-T--T-TT--TTT----CT--G-TAA------TTGACA--GTAATC----GATTA--T----C-A------AAA---------------AAA-A-T--TT------C--A-A--TTAC-TTT----------TAATC---G-AAG---A--AAAT-CG--A-TTAC-A---GCTGAAAAAA-AT----------------CAT-AA----G-T-A--ATT-AC-GATTAAA--A----------TT-C-A-A--T-TA-----TTTcattt
gi|82578 : ATTGAGTA-A-T-CGTAA--T-GAT-TGTA---TC--A-TTA---T--T--T-TT--TTTAT--CTG-G-TA-------TTGA------ATTC----TGTAAA-T----T-G------AAG---------------CTT-A-T--TT------C--A-T--TT-T-ATGGGGGTTTTTTTTATCAGGGT--T---T--TAAT--G--A-TTA------GCT-----AA-AT----T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-A--TTTTTCA--ATTt
gi|82579 : GCA-A-T-TGTAA--TTGAG-TGTA--ATT-AA-TTA---C--A--T-AT--ATT----CAA-G-TAA------TTGGAA--GTAATG----TGTAA--T----T-G------AAG---------------TTT-T-T--TTTGT---C--A-A--TTAC-AAG----------TAATT---GTAAT---T--TAAT-TA--A-TTAC-ATT-GCA-----AG-ATAACAT--GTA--CA--CGT-AAT--TC-C-A--GTT-AC-TTTT-CA--ATTA-C--T--CT-C-C-A--T-Tcaatagatatattgccattt
gi|82580 : AT-TGTA--AAT-AA-TTA---C--A--T-AT--TTT----CAA-G-TAAATTGCATTGGAA--GTAATT----TTTAA--T----T-G------AAG---------------TTT-T-T--TTTTTTTTC--A-A--TTAC---------------AATT---GTAAT---T--TAAT-AA--A-TTAC-ATT-GCA-----AA-AT---------A--AA-ATGT-ACT--TC-C-A--ATT-AC-TTTTC-A--ATTA-C--T--TTCC-A-A--T-TA-----C
gi|82581 : -TTA---T--A--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGACA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-A-T--TT------C--A-A--TTAC-TTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTTCA--ATTA-C--A--TT-A-A-A--T-TG-----C-TC--TA--T--TCTGAAAT-ATTGTaccatactaagaca
blockSeqs : G TG CGA T A AC AA A TA TAG T AAG AAT A TT TCTT A A ATTGCA C TA AAGG TG AGAAGTTTTTTGTTTTTGTT AT A TA TTTTTTC G AT AT GGGGTTTTTT CAGG GTA GG CGAT T AGCTGAAAA C AACA AA ACCCC A GC T AGC C CTT AGATT C TTC CG T AT A CCTTG T AT TTCATT A
blockSeqs : . . CGA . A C GA G . CC . . AAT A . AT . . . C . . A TGCACCAAAAA A . . TGTC . . T TAA CT . G TGCC . AATTGCA . . . GCAT . GC . AA . CAT AGAT . TTT CC . T . . T A TTTC .
blockSeqs : . . CGA . T C . . . TC . . AAT A . T . . . C . . . GCACTGAAAA A . . TTA . . T TA C . G GCG . ATTGCA . . . ACAC . GC . A . CT AAA . TTT C . . . . T A TTCT .
blockSeqs : . . CGA . A C . . . TA . . AGA A . . . . . C . . . GCACTAAAAA A . . TTA . . T TT C . G CG . ATTGCA . . . ACAT . GC . A . CT AAA . TC C . . . . A . TTTA .
blockSeqs : . . CGG . . C . . . TA . . ATT . . . . . . C . . . ACACTAAAAA A . . TTA . . T A C . . CG . ATTGCA . . . GTG . GC . A . CT TCA . AT C . . . . A . TATC .
blockSeqs : . . CGA . . C . . . TG . . TT . . . . . . T . . . GCACTAAAAA A . . AG . . T . C . . CG . ATTGCA . . . GTG . GC . A . CT TCA . AT C . . . . T . ATTT .
blockSeqs : . . CGA . . C . . . TG . . AT . . . . . . G . . . TGTAGTGAA A . . C . . T . C . . CG . ATTGCA . . . GTG . A . A . CT TCC . AT C . . . . T . CTC .
blockSeqs : . . AAA . . T . . . GC . . T . . . . . . A . . . GCACTGAA A . . C . . T . T . . CG . AAGCT . . . GTA . . . A . CT CAA . A C . . . . T . CTG .
blockSeqs : . . AAA . . T . . . GC . . T . . . . . . A . . . CGTGTA A . . C . . A . T . . GG . TTTCA . . . GTG . . . A . CT AGA . A C . . . . T . CTC .
blockSeqs : . . AAA . . C . . . TA . . T . . . . . . A . . . CTGAAG G . . C . . A . C . . GG . TTTCA . . . ACC . . . A . CT GGC . T C . . . . T . CTC .
blockSeqs : . . AAG . . C . . . TA . . T . . . . . . A . . . TGAAG A . . T . . A . T . . TA . CTTCA . . . ACC . . . G . CA GGC . A T . . . . T . CTC .
blockSeqs : . . AAA . . G . . . GC . . T . . . . . . T . . . TGAAG G . . C . . A . G . . TA . CTTCA . . . ACC . . . G . CA CCA . T T . . . . T . TTC .
blockSeqs : . . CGA . . T . . . TA . . A . . . . . . T . . . TGAAG T . . C . . A . G . . CG . TTTCA . . . GTG . . . C . CA GGC . T G . . . . T . CTT .
blockSeqs : . . CGA . . T . . . TG . . A . . . . . . A . . . TGAGG T . . C . . A . T . . GC . TTTTC . . . GTG . . . C . AT GGC . T G . . . . T . TTC .
blockSeqs : . . CGA . . C . . . TG . . A . . . . . . A . . . TGAAG A . . C . . A . T . . GC . AGCT . . . GTG . . . A . CT GCA . T G . . . . C . TT .
blockSeqs : . . CGA . . G . . . TG . . T . . . . . . A . . . TGAAG T . . T . . A . T . . TA . AGCT . . . GTG . . . G . CT GGC . A T . . . . T . C .
blockSeqs : . . CTG . . T . . . GC . . T . . . . . . A . . . TTAAG A . . C . . A . G . . GC . AGCC . . . GTG . . . G . CT GGC . T T . . . . T . . .
blockSeqs : . . GGG . . C . . . GC . . A . . . . . . A . . . TGAAG T . . C . . A . C . . CG . AGCT . . . ACA . . . G . CT TTA . T G . . . . T . . .
blockSeqs : . . GGG . . C . . . AC . . A . . . . . . A . . . TGAAG A . . T . . A . T . . CG . TGCT . . . AAA . . . G . CA TTA . T C . . . . T . . .
blockSeqs : . . GGG . . G . . . TA . . A . . . . . . A . . . TGTGT G . . A . . A . T . . GC . AGCT . . . GTG . . . C . CT TCA . T G . . . . T . . .
blockSeqs : . . TGA . . G . . . TA . . T . . . . . . A . . . TGGAG G . . C . . A . G . . GC . TTTC . . . GT . . . C . CT TAG . A G . . . . T .
blockSeqs : . . AA . . G . . . TG . . A . . . . . . T . . . CGTAT G . . C . . T . G . . GC . AGCT . . . GT . . . C . CG TCA . T C . . . . . .
blockSeqs : . . CT . . T . . . TG . . A . . . . . . T . . . TGAAG T . . C . . A . G . . TA . AGCT . . . GG . . . C . CT TCA . A C . . . . . .
blockSeqs : . . CT . . C . . . TA . . T . . . . . . A . . . TGAAG G . . C . . A . T . . CA . AGCT . . . AC . . . A . CT AAA . T C . . . . . .
blockSeqs : . . GT . . G . . . TA . . T . . . . . . A . . . TGTAA A . . C . . T . G . . CA . ATTT . . . CC . . . A . CT TCA . T T . . . . . .
blockSeqs : . . GT . . C . . . TA . . T . . . . . . A . . . CGAAT A . . A . . T . C . . GG . AGCT . . . GT . . . G . C TCA . T T . . . . .
blockSeqs : . . CG . . C . . . C . . A . . . . . . C . . . TGAAG A . . C . . T . C . . CG . AGCT . . . GT . . . G . C CA . T C . . . . .
blockSeqs : . . GT . . C . . . C . . T . . . . . . C . . . CAAAA A . . C . . A . T . . CG . AGCT . . . AC . . . A . T CA . A C . . . . .
blockSeqs : . . CT . . C . . . C . . T . . . . . . T . . . TGAAG A . . C . . A . T . . CG . ATT . . . G . . . A . T TA . T C . . . . .
blockSeqs : . . CT . . C . . . C . . T . . . . . . A . . . TGAAG A . . C . . T . C . . CG . ATT . . . T . . . A . . AG . T C . . . .
blockSeqs : . . CT . . A . . . G . . T . . . . . . A . . . TGAAG A . . C . . T . C . . TA . GCT . . . G . . . A . . AG . T A . . . .
blockSeqs : . . GT . . C . . . C . . T . . . . . . C . . . TGAAG A . . C . . T . C . . AA . AT . . . G . . . A . . AG . A . . . .
blockSeqs : AG . . C . . . C . . T . . . . . . C . . . CGTG T . . . . . A . T . . CG . AT . . . G . . . A . . AG . .
blockSeqs : GT . . T . . . C . . T . . . . . . C . . . CGTG T . . . . . A . T . . G . AT . . . . . . . A . . CA .
blockSeqs : CG . . . . . . C . . T . . . . . . A . . . TGAA T . . . . . T . C . . G . AT . . . . . . . . . . CA
blockSeqs : G . . . . . . C . . A . . . . . . A . . . CA A . . . . . . . . . . G . AT . .
blockSeqs : . . . . . . C . . A . . . . . . C . . . CG . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : TN* ** CTC****
originalCons : GGTAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGTA--ATC-GA-TTA---C--T--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGANA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT------C--A-A--TTAC-NTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--CG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTNNA--ATTA-C--T--TT-C-A-A--T-TA-----CTTC--TAT-T--TCTAAAAT-ATTGT
finalCons : GGTAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGTA--ATTN-A-TTA---C--T--T-TT--TTT----CAA-G-TAA------TTGANA--GTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT------C--A-A--TTAC-NTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--CG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTNNA--ATTA-C--T--TT-C-A-A--T-TA-----CTTC--TACTC----TAAAAT-ATTGT
Alignments
lowQualScore : 111 111 1111111111111111111111111111111 1111111111 2222222222222 111111 11 11111
lowQualScore : 1 11 000 1 4 22 22 22 11 111 1 111 88888 4 22 2222 11 1 1 222222 11 2 2222 22 8888888888888888888888888888888 11 1 11 555555 1 11 44 0000000000 4444 111 44 44444 1 1111111111111 1 2222 11 999999 1 00 1 2222 1 555 11111 1 88888 1 1 1 22 3333 1 6 1 3 9999999 1 1 1 2
lowQualScore : . .. ... . . .. .. .. .. ... . ... ..... . .. .... .. . . ...... .. . .... .. ............................... .. . .. ...... . .. .. .......... .... ... .. ..... . ............. . .... .. ...... . .. . .... . ... ..... . ..... . . . .. .... . . . . ....... . . . .
lowQualScore : 2 77 666 1 2 66 99 99 44 111 0 888 99999 0 44 1111 44 0 0 999999 44 9 1111 44 6666666666666666666666666666666 55 0 44 333333 0 44 11 4444444444 9999 999 77 77777 1 8888888888888 1 3333 55 666666 1 33 1 3333 1 333 00000 1 88888 2 2 2 99 8888 3 8 5 3 3333333 8 8 8 0
consensus : GGTAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGTA--ATTN-A-TTA---C--T--T-TT--T----TT--C-AAG-TA------ATT--GANAGTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT---C--A-A--TTAC-NTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--CG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTNNA--ATTA-C--T--TT-C-A-A--T----TA-CTT-C-TA-CTC---T-A-AA-AT-ATTGT
Reference ( family-518 ) : GGTAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGTA--ATTN-A-TTA---C--T--T-TT--T----TT--C-AAG-TA------ATT--GANAGTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT---C--A-A--TTAC-NTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--CG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTNNA--ATTA-C--T--TT-C-A-A--T----TA-CTT-C-TA-CTC---T-A-AA-AT-ATTGT
gi|82542 : GATAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGTA--AT-C-A-TTA---C--T--T-TT--T----TT--C-AAG-TA------ATT--GACAGTAATC----TGTAA--T----T-A------AAG---------------CTA-T-T--TT---C--A-A--TTAC-TTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-TG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTTGA--ATTA-T--T--TT-C-A-A--TTTAATA-CTA-C--A-CTC---T-A-AA-AT-ATTGT
gi|82543 : GGTAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CATAA--TCGAT-TGTA--ATCC---TTA---C--T--T-TT--T----TT--C-AAG-TA------ATT--GACAGTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT---C--A-A--TTAC-TTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTAAA--ATTA-C--A--TT-C-A-A--T----TA-CTT-C-TATTTC---T-G-AA-AT-ATTGTcatct
gi|82544 : GGTAAT-C--GTAATCGATTA-A-T-CATAA--TCGAT-TGTA--ATCC---TTA---CT-T--T-TT--T----TT--C-AAG-TA------ATT--GACAGTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTATT-T--TT---C--A-A--TTAC-TTG----------T-ATC---GT-AT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--T--GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTAAA--ATTA-C--A--TT-C-A-A--T----TA-C-T-C-TA-TTC---TGA-AA-AT-ATTGT
gi|82545 : GGTAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGTA--A------------------------------T--C-AAG-TA------ATT--GACAGTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT---C--A-A--TTAC-TTA----------TAATC---TTAAT---C--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCC-----AA-AT----T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTTCA--ATTA-C--T--TT-C-A-A--T----TA-C-T-C-TA-CTC---T-A-AA-AT-ATTGT
gi|82546 : GGTATA-C--GTAATCGAGAA-AAT-CGTAA--TCGAT-TGTA--AT-C-A-TTA---C--T--T-TT--T----TT--C-AAG-TA------ATT--GACAGTAATC----TGTAA--T----T-G------AGG---------------CTA-T-T--TT---C--A-G--TTAC-TTGTAA-------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--TG-GT-T-AAT--TA-T----ATT-AC-TTTTTCA--ATTA-C--A--TT-C-A-A--T----TA-C-T-C-TA-cattt
gi|82547 : GGTAAT-C--GTAATCGGGTA-A-T-CGTAA--TGAAT-TGTA--AT-C-A-TTA---C--T--TATT--T----TT--C-AAG-TA------ATT--GACAGTAATC----T-----------T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT---T--A-A--TTAC-TAA----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-T---GCT-----AC-AT----T--TTG--TA-GTGT-AAT--TA-C-A--ATT-ACTTTTTTCC--ATTA-C--T--TT-C-A-A--T----TA--TT-C-TA-CTG---T-A-AA-AT-ATTATtatatcataatgtcat
gi|82548 : GGTAAT-C--GTATTCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGTA--AT-C-A-TTA---C--T--T-TTTTT----TT--C-AAG-TA------ATT--GATAGTAACC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT---C--A-A--TTAC-TTG----------TAATT---GTAAT---T--TCAT-GG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--TG-GTAT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTCAA----TACC--T--TT-CGA-A--TA---TA-CTcattt
gi|82549 : GGTAAT-C--GTATTCGAGTA-A-T--GTAA--TCGA--TGTA--ACTC-A-TTA---C--T--T-TT--TTTTCTT--C--AG-TA------ATTGAGATAGTAATC-----GTAA--A----T-T------AAG----------------TA-T-T--TT---C--A-A--TTAC-TTG----------TAATCT--GTAAT---T--T-AT-GG--A-TTACAA---GCT-----AA-AT----T--TTG--T--GTCT-AATA-TA-A-A--ATT-AC-TTTT-CA--ATTA-C--T--TT-C-ATA--T----TA-C-T-C-TA-CAC---T-A-AA-
gi|82550 : GGTAAT-T--GAAA-AAAGTA-A-T-TGTAA--CTGAG-TGTA--ATTA-A-TTA---C--A--T-AT--T----TT--C-AAG-TA------ATT--GGAAGTAATG----TGTAA--T----T-G------AAG---------------TT--T-T--TT---C--A-A--TTAC-AAG----------TAATT---GTAAT---T--TAAT-TA--A-TTAC-ATT-GCA-----AA-AA----TAAT-------ATGT-AAT--TC-C-A--ATT-AC-TTTT-CA--ATTA-C--TC-TC-C-A-A--T----TA-CAT-CATA-CT
gi|82551 : GGTAAT-T--GAAA--AATTA-A-T-TGTAA--TTGAG-TGTATAATTA-A-T-A---C--A--TATT--C----TT--C-AAG-TA------ATT--GGAAGTAATTAAGGTGTAA--T----T-G------AAG---------------TTA-AAT--TT---C--A-A--TTAC-AAG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-TA--ATTTAC-AATTGCA-----AA-AA----T--AGG--CATGTATAAAT--TC-C-A--ATT-AC-TTTT-TA--ATTA-C--TTCTC-C-A-A--T----TA-CAT-C--A-CAC---T-A-AA-aagaca
gi|82552 : GGTAAT-C--GTAATCT-GTA-A-T-CGTAA--TCAGC-TGTA--ATTG-ATTTA---C--A--T-TT--T----TT--C-AAG-TA------ATC--GAATGTAATC----TGTAA--T----C-G------TG-----------------TA-T-T--TT---T--AGA--TTAC-ATG----------CA--------AAT---A--TAAT-CG--A-TTAC-A-----T-----TA-AT----A--CTA--CC-CAGT-AAT--CA-T-G--ATT-AC-ATTTAG---ATTA-CTTT--TT-T-G-A--T----TA-CTT-G-CA-TTCATTT-A-AT-AT-ATT
gi|82553 : GGTAAT-C--GTAATCT-GTA-A-T-CGTAA--TCAGC-TGTA--ATTG-A-TTA---CAAT--T-TT--A----TT----AAG-TA------ATC--GAATGTATTC----TGTAA--T----T-G------TGT---------------ATG-T-T--TTA--G--A-A--TTAC-ATG----------TAATT---TAAAT---TGGTAATGCG--A-TTAC-A----TT-----A--------T--TTA--CACTTGT-AAT--CA-T-G--ATT-AC--ATTAGA--GTTA-C--T--TT-T-G-A--T----TA-CT
gi|82554 : GGTAAT-G--GTAAT-GTGTA-A-T--GTAA--TGCAT-TGCA--ATGC-A-TTA---C--T--T-TT--T----AT--C-AAG-TA------ATG--CCTAGTAATG----TGTAA--TGCACT-G------AA------------------A-A-C--TG---C--G-A--TTACATTG----------TAATG---ATAAT---G--TAAT-GC--A-TTAC-T---TTC-----AA-AT----T--TTG---G-G-GT-AATGCTA-G-C--ATT-AC---TTGGC--ATTA-C--A--TT-G-A-A--T----TA-CTT-T-TA-------T-A-AG-AT-ATT
gi|82555 : GGTAAT-G--GTAAT-GTGTA-A-T-GGTAA--TGCAT-TGCA--ATGC-A-TTA---C--T--T-TT--T----AT--C-AAG-TA------ATG--CCTAGTAATG----TGTAA--TGCACT-GA-----AAA---------------CTG-C--------------A--TTAC-ATG----------TAATG---GTAAT---G--TAAT-GC--A-TTAC------TTTCA--AA-AT----T--TT----G-GTGT-AATGCTA-G-C--ATT-A---TTTGGC--ATTA-CA-T--TT-G-A-A--T----TA-CTT-T-AA-------T-A-AG-AT-ATTagtattt
gi|82556 : GGTAAT-C--GAAA-AAAGTA-A-T-TGTAA--TTGAG-TGTA--ATTA-A-TTA---C--A--T-AT--T----TT--T-AAG-TA------ATT--GGAAGTAA---------GA--T----C-A------------------------CTT-T-T--TT---C--A-A--TTAC-AAG----------TAATT---GTAAT---T--CAAT-TA--T-TTAC-ATT-GCA-----AA-A--------TAA--C--ATGT-AAT--TC-C-A--ATT-A----TTCCA--ATTA-C--agtattt
gi|82557 : GGTAAT-T--GAAA-AAAGTA-A-T-TGTAA--TTGAG-TGTA--ATTA-A-TTA---C--A--T-AT--T----TT--C-AAG-TA------ATT--GGAAGTAATT----TGTAA--T----A-G------AAGTTTTTTGTTTTTGTTTTT-T-T--TT---T--A-A--TTAC-AAG----------TAATT---GTAA
gi|82558 : GGTAAT-C--GTAATCG-GTA-AAT-CGTAAAATCAGCATGTA--ATTAGA-TTA---G--A--GATT--T----TT--C-AAG-TA------ATC--AAATGTAATC----TGTAA--TCG--T-G------TA----------------TTA-T-T--TT---A--G-A--TTAC-ATG----------TAATT---TTAGA---T--TAAT-CGATA-TTAC-A-----T-----TA-AT----T--TTA--CC-CTGT-AAT--CATT-G--ATT-AC-ATTTAG---ATTA-C--T--TT-
gi|82559 : GGTAAT-G--GTAAT-GTGTA-A-T-GGTAA--TGCAT-TGCA--ATGC-A-TTA---C--T--T-TT--T----AT--C-AAG-TA------ATG--CCAAGTAATG----TGTAA--T---------------G---------------C-----------------------AC--TG----------TAATG---GTAAT---G--TAAT-GC--A-TTAC------TTTCA--AA-AT----T--TT----T-GTGT-AAT--GG-T-AGCATT-A---TTTGGC--ATTA-CA-T--TT-G-A-A--T----TA-CTT-T-TA-------T-A-AA-GT-ATTtttctatt
gi|82560 : GGTAAT-T--GAAAAAAGGTA-A-T-TTTAA--TTCAG-TGCA--ATTA-A-TTA---C--A--T-AT--T----TT--C-AAA-TA------ATT--GCAAGTAATT----TGTAA--T----T-G------GAG---------------TTT-T-T--TT---C--A-A--TTAC-
gi|82561 : GGTAAT-C--GTAATCT-GTA-ATT-CGTAA--TCAGC-TGTA--ATTG-A-TTA---C--A--A-TT--T----TT--C-AAG-TA------ATC---AAATTAATT----TAATA--T----C-G-------------------------TA-T-T--TT---TTAG-A--TTAC-ATG-------------TC---TTTAT---TG-TAAT-CG--A-TTAC-A-----T-----TA-AT----T--TTC--C---TGT-AAT--CA-T-G--ATT-ACATTTTAGAT-ACTT-T--T--TT-T-G-A--T----TA-CCT-
gi|82562 : GGTAAT-T--GTAATCT-GTA-A-T-CGTAA--TCATC-TGTA--ATTG-A-TTA---CAAT--T-TC--C----TT------G-TA------ATT--AAATGTCATC----CATAA--T----C-G------TAT---------------TTT-T-T--TT---TTAG-A--TTAC-ATG----------TAATT---GTAAT---T--------G--A-TTAC-A-----T-----TA-AT----T--TTA--CC-CTGT-AAT--CA-T-G--ATT-AC-ATGTAGATTATTA----T--TT-T-G-A--T----TA-CTtgcttcattatttataatatattttcat
gi|82563 : GGTAAT-C--GTAATCT-GTA-A-TACGTAA--TCAGC-TATA--ATTG-A-TTA---CAAT--T-TT--T----CG--C-AAG-T-------ATA--CAATGTAATC----TGTAA--T----C-G------TG-----------------TA-T-T--TT---TTAG-A--TTAC-ATGTA--------TAATT----TAAT---TG-TAAT-CG--A-TTAC-A-----T-----TA-AT----T--TTACCCC-ATGT-AAT--CA-T-G--ATT-AA-TTT--AG--ATTA-CTTT--TT-T-G-A--T----TATCTTGC-TC-ATC---T-ATAT-AT-ATTAT
gi|82564 : GGTAAT-TTGGTAAT-GTGTA-A-T-GGTAA--TGCAT-TGCA--ATGC-A-TTA---C--T--T-TT--T----AT--C-AAG-TA------ATG--CCTAGTAATG----TGTAA--TGCACTAA------AAA---------------CTG-T--------------A--TTAC-ATG----------TAATG---GTAAT---G--TAAT-GC--A-TTAC------CTTCA--AA-AT----G--TT----G-GTGT-AATGCTA-G-C--ATT-A---TTTGGC--ATTA-C--A--TT-G-A-A--T----TA-CTT-T-TA-TT--------AG-AT-ATTattt
gi|82565 : GGTAAT-T--GTAATAG-GTA-A-T-GGTAA--TGTAT-TGCA--ATGC-T-TTA---C--T--T-TT--A----T---C-AAG-TA------ATC--GCTAGTAATG----TGTAA--TACACTAA------AAA---------------CTG-T--------------A--TTAC-ATG----------TAACG---GTAAT---G--TAAT-GC--A-TTGC------CTTCA--AA-AT----T--TT----G-GTGT-AATGCTA-G-C--ATT-A--TTTGGCA--A-TA-A--T--TC-C-A-A--T----agtattt
gi|82566 : GGTAAT-G--GTAAT-GTGTA-A-T-GGTAA--TGCAT-TGCA--ATAC-A-TTA---C--T--T-TT--T----AT--C-AAG-T-------ATT--GCAAGTATAA----TGTAA--TGCACTAA------AAA---------------CTG-C--------------A--TTAC-TTG----------TAATG---GTAATGTAT--TAAT-GC--A-TTAC------TTTCA--AA-AT----T--TTG--T---TGT-AATGCTA-G-C--ATT-A---TTTGGC--ATTA-C--A--AT-G-A-A--T----TA--TT-T-TA-TAT---C-A-AG-AT-ATTatcctttatt
gi|82567 : GGTAAT-T--GAAA-AAAGTA-AAT-TGTA-----GAG-TGTA--ATTA-A-TTA---C--A--TATT--T----TT--C-AAGATA------ATG--GA-AGTAATT----TGTAA--TC---T-G------AAG---------------TTT-T-TTATT---C--A-A--TTAC-AAGA---------TAATT---GTATT---T--TAAT-TA--A-TAAC-ATT-GCA-----AA-AT----agtattt
gi|82568 : GGTAAT-C--GAAATCGA-TA-A-T-CGAAA--TCGAT-TGCA--ATTA-A-TTAAAGT--T--T-TC--T----CT------G-TA------ATT--GAAGGTAATC----aacattgattccaatacttttta
gi|82569 : GGTAAT-G--GTAAT--GGTATA-T-GG-AA--TGCAT-TGCA--AT-G-A-TTA---C--T--T-TT--T----AT--C-AAG-TA------ATG--CCAAGTAATG----TGTAA-------T-GCACCAAAAA---------------CTG-C--------------A--TTAC-ATG----------TAATG---GTAAT---G--TAAT-TGCCA-TTAC-T---TTTC----AA-AT----T--TT----G-GTGT-AATGCTA-G-C--ATT-A---TTTGGC--ATTA-CA-T--TT-G-A-AT-T----TA-CTT-T-TA-------T-A-AG-AT-ATT
gi|82570 : GCAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGAA--AT-C-A-TTA---C--T--T-TT--T----TT--C-AAG-TA------ATT--GACAGTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT---C--A-A--TTAC-TTG----------CAATC---GTAAT---T--TAAT-CA--A-TTAC-A---GCT-----GA-AT----T--TTG--TG-GTTT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTATTA--ATTA-C--T--TT-C-A-A--T----TA-C-A-C-TA-CTC---T-A-AA-AT--TTGTtaattattt
gi|82571 : GCAAT-C--GTAATCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TG-A--AT-C-A-TTA---C--T--T-TT--T----TT--C-AAG-TA------ATT--GACAGTAATC----TGTAA--T----T-G------AA----------------CTA-T-T--TT---C--A-A--TTAC-TTG----------CAATC---GTAAT---T--TAAT-CA--A-TTAC-A---GCT-----GA-AT----T--TTG--TG-GTTT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTATTA--ATTA-C--T--TT-C-A-A--T----TA-C-A-C-TA-CTC---T---AA-AT-ATTGTcattt
gi|82572 : GTAATGC--GTATTCGAGTA-A-T-CGTAA--TCGATGTGTA--AT-C-A-TTA---C--T--T-TTT-T----TT--C-AAG-TA------ATT--GATAGTAACC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT---C--A-A--TTAC-TTG----------TAATT---GTA-----T--TCAT-GG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--T--GTAT-AA---TA-TAA--ATT-AC-TTTTTCA--A-TA-C--T--TT-C-A-A--T----TA-CT----TA-CTC---T-A-TA-ATAATTGTcattt
gi|82573 : GTAAT-C--GTA-TCTGTCA-A-T--GTAA--TCAGC-TGTA--ATTG-A-TTA---C--AGAT-TT--C----TT--C-A-G-TA------ATC--GAATGTAATC----TGTAATGT----T-GT-----AA-----------------TA-T-T--TT---A--G-A--TTAC-ATG----------TAATT----TAAT---G--TAAT--G--A-TTAC-A----TT-----AACAT----T--TTA--C--CTGT-AAT--C--T-G--ATT-AC-TTTTAG---ATTA-CTTT--TT-T-G-A--T----TA-Ccattt
gi|82574 : AT-C--ATAATCG--TA-A-T-CGTGAGATCAGC-TGTA--ATTG-A-TTA---CATT--T-TT--T----TT--CAAAG-TA------ATT--GAAATTAATA----T-TAA--T----T-G------TAGTGAA-----------TTA-T-G--TT---C--A-GATTTAC-ATATT--------TAAT-----TAAT---TG-TAAT-CG--A-TTAC-A---TTT--------AT----T--TTA--CATATCT-AAT--CA-T-G--ATT-AC-ATAGTAG--ATTA-C--T--TT-T-A-GATT----TA-CTG-CATA-ATT---T-G-AATAT-ATTAT
gi|82575 : ATGGGGTA-A-T-CGTAA--TCGAT-TGTA--AT-C-A-TTA---C--T--T-TT--T----TT----AAG-TA------ATT--GACAGTAATC----TGTAA--T----C-G------AAT---------------CTA-T-T--TT---C--A-A--TTAC-TTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT-----TA-AT----T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTTCA--ATTA-C--A--TT-C-A-A--T----TA-C-T-C-TA-TTC---T-G-AA-AT-ATTGT
gi|82576 : ATGGGGTA-A-T-AGTAA--TCGA---GTA--AT-C-A-TTA---C--T--T-TT--T----TT--C-AAG-GA------ATT--GACTGTAATC----AGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-T-T--TT---C--A-A--TAAC-TTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATTCAC-TTTTTCA--ATTA-C--T--TT-C-A-T--T----TA-CTT-C--A-CTT---T-A-AA-AC-ATTGTcattt
gi|82577 : ATGGGGTA-A-T-CGAAA--TCGAT-TGCA--ATTA-A-TTA---AA-T--T-TT--T----TT--C-T-G-TA------ATT--GACAGTAATC----GATTA--T----C-A------AAA---------------AAA-A-T--TT---C--A-A--TTAC-TTT----------TAATC---G-AAG---A--AAAT-CG--A-TTAC-A---GCTGAAAAAA-AT----------------CAT-AA----G-T-A--ATT-AC-GATTAAA--A----------TT-C-A-A--T----TA-TTT-cattt
gi|82578 : ATTGAGTA-A-T-CGTAA--T-GAT-TGTA----TC-A-TTA---T--T--T-TT--T----TTATC-TGG-TA-------TT--GA----ATTC----TGTAAA-T----T-G------AAG---------------CTT-A-T--TT---C--A-T--TT-T-ATGGGGGTTTTTTTTATCAGGGT--T---T--TAAT--G--A-TTA------GCT-----AA-AT----T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-A--TTTTTCA--ATTt
gi|82579 : GCA-A-T-TGTAA--TTGAG-TGTA--ATTA-A-TTA---C--A--T-AT--A----TT--C-AAG-TA------ATT--GGAAGTAATG----TGTAA--T----T-G------AAG---------------TTT-T-T--TTTGTC--A-A--TTAC-AAG----------TAATT---GTAAT---T--TAAT-TA--A-TTAC-ATT-GCA-----AG-ATAACAT--GTA--CA--CGT-AAT--TC-C-A--GTT-AC-TTTT-CA--ATTA-C--T--CT-C-C-A--T----Tcaatagatatattgccattt
gi|82580 : AT-TGTA--AATA-A-TTA---C--A--T-AT--T----TT--C-AAG-TAAATTGCATT--GGAAGTAATT----TTTAA--T----T-G------AAGTTTTTT---------TTT-T-T--TT---C--A-A--TTAC---------------AATT---GTAAT---T--TAAT-AA--A-TTAC-ATT-GCA-----AA-A---------TA--AA-ATGT-ACT--TC-C-A--ATT-AC-TTTT-CA--ATTA-C--T--TTCC-A-A--T----TA-C
gi|82581 : -TTA---T--A--T-TT--T----TT--C-AAG-TA------ATT--GACAGTAATC----TGTAA--T----T-G------AAG---------------CTA-A-T--TT---C--A-A--TTAC-TTG----------TAATC---GTAAT---T--TAAT-CG--A-TTAC-A---GCT-----AA-AT----T--TTG--TG-GTGT-AAT--TA-T-A--ATT-AC-TTTTTCA--ATTA-C--A--TT-A-A-A--T----TG-C-T-C-TA-TTC---T-G-AA-AT-ATTGTaccatactaagaca