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Reference ( gi|15208 ) : ACCATCGTTTTCAAATA-GGCAT---G-A--TAGA---CT-TTT---CTTG-AAAACTCCAGAT-G-AA-A-GCAAA-----TA----TAGA-G---CCA-C--A--GC-GTG-A--T---ATAA-ATTA-AAGATGACA-GG-T-A-T-TTACAAT----AA-A-TG---T------TC-T---T----C--A-T--TT---A--TT-C--A--GTC-T---TT--C-A-AG-TCGT-T--T--T---A-A---AAAAAT-TG---A--TTT-TGC-T-A-C-GAA-G-CGA-GT-ATA-GG-GGTG----GAA---TTC---T--AT--C-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
gi|15209 : ATCATCGTTTTCAAATA-GGCAT---G-A--TAGA---CT-TTT---CTTG-AAAACTCCAGAC-G-AA-G-GCAAA-----TA----TAGA-G---CCA-C--A--GC-GTG-A--T---ATCA-ATTA-AAGATGACA-GG-T-A-T-TTACAAT----AA-C-TG---T------TC-T---T----C--A-T--TT---A--TT-C--A--GTA-T---TT--C-A-AG-CCGT-TTAT--C---A-A---AAAAAA-TC---A--TTT-TGC-T-A-C-GAA-G-CGG-GT-ATA-GG-GGAG----GAA---TTC---T--AT--C-GT--T--AG--ACC-GG--GTCC
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Reference ( family-517 ) : ATCATCGTTTTCAAATA-GGCAT---G-A--TAGA---CT-TTT---CTTG-AAAACTC--CAGAT-G-AA-GGCAAA-----TATAG-A-G---CCA--C--G--GC-GTG--AT---ATAA-ATTA-AAGATGACA-GG-T--------A-T-T-TACA-A-T----AA---A--T-T-T-CT---T---CA-T--TT---A--TT-C--A--G--CCC---TG-C-AG--G-CCG--TNT-T----A-A--NA---AANTT---CGTTT-T-GC-T-A-C-G-AA-G-CG-AGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA---TTCT--A---T--C-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
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gi|15207 : ATCATCGTTTTCAAATA-GGCAT---G-A--TAGT---CT-TGT---CTTA-AAAACTC--CAGAT-G-AA-GGCAAA-----TATAG-A-G---CCA--C--G--GC-GTG--AT---AT-A-ATTA-AAGATGACA-GG-T--------A-T-T-TACA-A-T----AA---A--T-G-T-TC---T---CA-T--TT---A--TT-C--A--G--TCT---TT-C-AA--G-CCG--TTTAT----A-A--AA---AAAACAAACATTT-T-GC-T-A-C-G-AA-G-CG-AGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA---TTCT--A---T--C-TA--A--AA--ACC-GG--GTCC
gi|15208 : ACCATCGTTTTCAAATA-GGCAT---G-A--TAGA---CT-TTT---CTTG-AAAACTC--CAGAT-G-AA-AGCAAA-----TATAG-A-G---CCA--C--A--GC-GTG--AT---ATAA-ATTA-AAGATGACA-GG-T--------A-T-T-TACA-A-T----AA---A--TGT-T-CT---T---CA-T--TT---A--TT-C--A--G--TCT---TT-C-AA--G-TCG--TTT-T----A-A--AA---AAATT---GATTT-T-GC-T-A-C-G-AA-G-CG-AGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA---TTCT--A---T--C-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
gi|15209 : ATCATCGTTTTCAAATA-GGCAT---G-A--TAGA---CT-TTT---CTTG-AAAACTC--CAGAC-G-AA-GGCAAA-----TATAG-A-G---CCA--C--A--GC-GTG--AT---ATCA-ATTA-AAGATGACA-GG-T--------A-T-T-TACA-A-T----AA---C--TGT-T-CT---T---CA-T--TT---A--TT-C--A--G--TAT---TT-C-AA--G-CCGTTTAT-C----A-A--AA---AAAAT---CATTT-T-GC-T-A-C-G-AA-G-CG-GGT-AT-A-GG-GGAG----G--AA---TTCT--A---T--C-GT--T--AG--ACC-GG--GTCC
gi|15210 : ATCATCGTTTTCAAATA-GGCAT---G-A--TAGA---CT-TTT---CTTG-AAAACCC--CAGAT-G-AA-GACAAA-----TATAG-A-G---CCA--C--G--GA-GTG--AT---ATAA-ATTA-AAGATGACA-GG-T--------A-T-T-T-CA-G------------------T-CT---T-----------------------------------TG---AA--G-CAGTTTAT-T----A-A--AA---AA--T---CATTT-T-GC-T-A-C-G-AA-G-CA-GGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA---TTCT--A---T--C-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
gi|15211 : ATCATCGTTT-CAAATA-G--AT---GGA--TAGA---CTCTTT---CTTG-AAAACTC--CAAATTG-AA-GGCAAAA----TATAG-A-G---C-A--C--G--GC-GTG--AT---ATAG-ATTA-AAGATGACA-GG-T--------A-T-T-T-CA-C-T----AA---CT-T-T-T-CT---T---CA-T--TT---A--TT-C--A--G--TCT---TT-G-AA--G-TAG--T-T-T----ATA--TA---AAGAT---CATTT-T-GC-T-A-C-G-AA-G-CG-GGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA---TTCT--A---TTCC-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
gi|15212 : CATTTTCAAATAAGGCAT---G-GATTAGA---CT-TTTTT-CTTG-AGAACTC--CAGAT-G-AA-GGCAAA-----TATAG-A-G---TCA--C--A--GC-GTG--AT---ATAA-ATTA-AAGATGACA-GG-T--------A-T-T-TACA-A-T----AA---A----T-T-CT---T---CA-T--TT---A--TT-C--A--G--TCT---TT-C-AA--G-CCGTTTAT-T----A-A--AA---AAAAT---AAGTT-T-GC-T-A-C-G-AA-G-CG-AGT-AT-A-GG-GTTG----G--AA---TTCT--A---T--C-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
gi|15213 : CATTTTCAAATA-GGCAT---G-A--TGGA---CT-TTT---CTTG-AAAACTC--CGTAT-G-AA-GGCAAATGT--TATAG-A-G---CCA--C--GC-AC-GTG--AT---ATAA-ATTA-AAGATGACATGG-T--------A-T-T-AACA-A-T----AAAATA--T-T-C-TT---T---CA-T--TT---A---T-C--A--G--TCT---TT-C-AA--G-CCG--TTT-TATAAA-A--GA---AAA-T---CATTTGT-GC-T-A-C-G-AATGCCG-AGT-AT-A--G-GGTG----G--AA---TTCT--A---T--C-GT--TTAAA--ACC-GT--GTC
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gi|15216 : AATA-G-CAT---G-AC-TAGAACTCT-TTT---CTTTTAAAACTC--CAAAT-G-AA---CAAAGAATGTGTAG-AAG---TCA--C--GCGGC-GTGG-AT---ATAA-ATTAGAAGATGACA-GG-TTATTTACTA-T-C-TACACA-T----CA---C--T-TCT-CT---T---CA-T--TT---AA-TT-C--A--AGTCCT---TG-A-AGTAG-TTG--TAT------A-A--CA---AAAT----CATTT-T-GC-T-A-C-G-AA-G-C--AGG-GT-A-GG-GGTG----G--AA---TTCT--A---
gi|15217 : AATA-G-CAT---G-AC-TAGAACTCT-TTT---CTTT-AAAACTCCACATAT-G-AA--GCAAAAAAG-TTCAGAA-G---TCACGC--G--GC-GTGGAGT---ATAACATTAGAAGATGACA-GG-T--------A-TAT-TACT-A-TCCTCAC---A--TAC-T-CTTC-T---CA-T--TT---A--TT-C--A--GT-CCT---TG-A-AGTAG-TTG--TA--T----A-A--CA---AAA-T---CATTT-T-GC-T-A-CGG-AA-G-CA-GGT-GT-AGGG-GGTG----G--AA---TTCT--A---A--C-G
gi|15218 : AATA-G-CAT---G-AC-TAGAACTCT-TTT---CTTTTAAAACTC--CACAA-G-TA-CAAAAA-----TTTAG-A-AGTACCG--C--G--GC-GTGG-AT---ATAA-ATAA-AGAATGACA-GG-TTATTTACTA-T-C-TACA-C-T----AC---C--T-T-C-CTC--T---CA-T--TA---A--TT-C--A--G--TCT---TG---AA--G-TAG--TTTAT----A-A--CA---AAAT----CATTT-T-GC-T-A-C-G-AA-G-GC-AGG-GT-A-GG-GGTG----G--AA---TTCT--A---
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Alignments
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lowQualScore : . . ... . .. ... . ... . . .. . .. ..... .... . ... . .. .. . . .. ... . . . . . ........ . . . . . . ............... . ... .. .......... . . ... . . .... .. .. ......... .. .... .. . . . . . . . . . . . . . .... .. ... ... .. .. . .. .. .. . ..
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Reference ( family-517 ) : ATCATCGTTTTCAAATA-GGCAT---G-A--TAGA---CT-TTT---CTTG-AAAACTCCAGAT--G-AA-GGCAAA-----TA----TAGA-G---CCA-C--G--GC-GTG-A--T---ATAA-ATTA-AAGATGACA-GG-T--------A-T-T-T-ACA-A-T----A-A---T--T-TCT--ATCTCAT--TT-A--T--T-CA-GCCCA-T-GC-AG--G-CCG--TAT--TN--------ACAAA-TT----T--CG-TTT-TGC-T-AC-G-AA-G-CG-AGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
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gi|15216 : AATA-G-CAT---G-AC-TAGAACTCT-TTT---CTTTTAAAACTCCAAAT--G-AA---CAAAGAATGTG----TAGAAG---TCA-C--GCGGC-GTGGA--T---ATAA-ATTAGAAGATGACA-GG-TTATTTACTA-T-C-T-ACACA-T----C-A---C--T-TCT--CT-TCAT--TT-AA-T--T-CAAGTCCT-T-GA-AGTAG-TTG--TAT---A--------ACAAA-AT-------CA-TTT-TGC-T-AC-G-AA-G-C--AGG-GT-A-GG-GGTG----G--AA---TTC---T--A
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Reference ( family-517 ) : ATCATCGTTTTCAAATA-GGCAT---G-A--TAGA---CT-TTT---CTTG-AAAACTCCAGAT--G-AA-GGCAAA-----TA----TAGA-G---CCA-C--G--GC-GTG-A--T---ATAA-ATTA-AAGATGACA-GG-T--------A-T-T-T-ACA-A-T----A-A---T--T-TCT--ATCTCAT--TT-A--T--T-CA-GCCCA-T-GC-AG--G-CCG--TAT--TN--------ACAAA-TT----T--CG-TTT-TGC-T-AC-G-AA-G-CG-AGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
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gi|15220 : ACA-GG-T--------A-T-T-T-ATA-A-C----A-----T--T-CCT--ATCTCAT--TT-C--T-----A-GCCCA-TGGCGAA--C-CCG--TAT--TT--------ACAAA-TT----T--CG-TTT-TGC-TAAC-G-AA-G-CG-AGT-AA-A-GG-GGT-----G--AA---TTC---CTAAT--C-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
gi|15221 : taaaaaatgtcagtttACA-GG-T--------A-T-T-T-ATA-A-C----A-----T--T-TCT--ACCTCAT--TT-AATT--TATA-GCCCA-T-GC-AG--A-CTG--TAT--TT--------ATAAA-TT----T--CG-TTT-TGC-T-AC-G-AA-G-CG-AGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
gi|15222 : ACA-GG-T--------A-T-T-T-ATA-A-C----A-----T--T-TCT--TTCTCAT--TT----T--A-AA-GCCCA-T-GC-AG--A-CCG--TAT--TT--------ATAAG-TT----T--CG-TTT-TGC-T-AC-G-AA-G-CG-AGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
gi|15223 : ACA-GG-T--------A-T-T-T-ATA-A-C----A-----C--T-TGT--ATCTCAT--TTTA--T-----A-CCCCA-T-GC-AG--A-CCG--TAT--TT--------ATAAA-TT----T--CG-TTT-TGC-T-AT-G-AA-G-CG-AGT-AT-A-GG-GGTG----G--GA---TTC---T--AT--C-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
gi|15224 : ACA-AG-T--------A-T-T-T-A-----T----A-A---T--T-TCTCCATCTCAT--TTCA--T-----G-GCCTA-T-TC-AC--A-CCG--TAT--TC--------ACAAA-TT----G--CG-TTT-TGC-T-AC-G-AA-G-CG-AGT-AT-A-GC-GGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-GTTAT--AA--ACC-GA--GTCC
gi|15225 : ACA-GG-T--------A-T-T-T-AAA-A-C----------T--T-TCT--ATCTCAT--TTTA--T-------GCC-G-T-GC-AG--A-CCG--TAT--TT--------ACAAA-TT----T--CG-TTT--GC-A-AC-G-AA-G-CG-AGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-GT--T--TA--ACC-AG--GTCC
gi|15226 : ACA-GG-T--------A-T-T-T-ATA-A--------A---T--TCTCT--ATCTCAT--TTTA--T-----G-ACCCA-T-GC-AG--A-CCG--TAT--TT--------ACAAA-TT----T--CG-TTT-TGCTT-AC-G-AA-G-TG-AGT-AT-A--G-GGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
gi|15227 : ACA-GG-T--------A-T-T-T-ATA-G-C----A-----T--T-TCT--ATCTCAT--TTTA--T-----A-GCCAA-T-GC-AG--A-TCG--TAT--TT--------ATAAA-TT----T--CG-TTT-TGC-T-AC-G-AA-G-CA-AGT-AT-A-TG-GGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
gi|15228 : ACA-CG-T--------A-T-T-T-ATA-T-T----A----------TCT--ACCTCAT--TT----T--G-TG-GTCCA-T-GC-AG--A-CCA--TAT--TT--------ACAAA-TT----T--CGTTTT-TGC-T-AC-G-AA-G-TG-AGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA---TTCTAGT--AT--C-GT--T--AA--ACC-GA--GTCC
gi|15229 : ACA-TG-T--------A-T-TGT-ATA-A-C----A-----T--T-TCT--ATCTCTT--TT-A--------A-GCCCA-T-GC-AG--A-CCG--TAT--AT--------A-AAA-TT----T--CG--TT-TGCTT-AC-G-AA-G-CG-AGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-GT--T--TA--ACCGGG--GTCC
gi|15230 : ACA-GG-T--------A-T-T-TTATA-A-C----A-----T--T-TCT--ATCTCAT--TTTA--T-----A-GCCCA-T-GC-AG--A-CCA--TAT--TT--------ACAA--TT----T--CG-TTT--GC-T-AC-G-AA-G-TGAAGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA----TC---T--AT--C-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
gi|15231 : ACA-GGAT--------A-T-T-T-ATA-ACT----------T--T-TCT--ATCTCATATTT-A--TAGT-C---CCCA-T-GC-AA--GACCG--TAT--TT--------ATAAA-TT----T--CG-TTT-TGC-T-AC-GAAA-G-CG-AGTCAT-A-TG-GGTG----GAAAA---TTC---T--AT--C-GT--T--AA--ACC--G--GTCC
gi|15232 : ACA-GG-T--------A-T-C-T-ATA-A-C----A-----T--T-TCT--ATTTC---------------------CA-T-GC-AG--GACCG--TAT--TAGT------ACAAAATT----T--TG-CTT-TGC-T-AC-G-AA-G-CG-AGT-AC-T-AG-GGTG----G--AAACGTTC---T--AT--T--T--T--AAAGACC-GG--GTCC
gi|15233 : ACA-GG-T--------A-T-T-T-ATA-A-C----A-----T--T-TCT--GTCTCAT--TTTA--T-----A-GCC-A-T-GC-AG--A-CCG--TATAATT--------A-AAA-TT----T--CG-TTT--GC-T-AC-G-AG-A-CG-AGT-AT-A--G-GGT-----G--AA---TCC---T--AT--C--T--T--AA--ACC-G
gi|15234 : CA-GG-T--------A-T-T-T-A-A-A-T----A-ACA-T--T-TCT--ATCACAT--T--A--T-----A-GCCCA-T-GC-AGA-G-CCG--TAT--TT--------ACAAA-TT----TGACG-TTT-TGC-T-AC-A-GA-G-CG-AGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA---TTC---G--AT--C-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
gi|15235 : CA-GG-T--------A-T-T-T-------T----A-AACTT--T-TCT--GTCTCGT--TT-A--T--T-TG---CTA-T-AC-AG--A-CCA--TAT--TA--------ACAAA-TT----T--CG-TTT-TGC-T-AC-G-AA-G-TG-AGT-AT-A-TG-GGTA----G--AA---TTC---T--AT--C-AT--T--AA--ACC-GG--GTC
gi|15236 : CA-GG-T--------A-T-T-T-ATA-A-C----A-----T--T-TCT--ATCTCAT--TTTA--T-----A-GCCCA-T-GC-CG--A-CCG--TAT--TT--------ACAAA-TT----T--CG-TTT-TGC-T-AC-A-AA-G-CG-AGT-AT-A-GA-GGTG----G--AA---TTC---
gi|15237 : --TA--------ACAAA-AT-------CA-TTT-TGC-T-AC-G-AA-G-CA-GGT-GT-A-GG-GGTG----G--AA---TTC---T--AA--C-GT--T--AA--ACT-GG--GTCC
gi|15238 : gttta--------ATAAA-TT----T--CG-TTT-TGC-T-AC-G-AA-G-CA-CGT-AT-A--G-GGTG----G--AA---GTC---T--AG--CGGT--T--AA--ACC-GG--GTCC
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gi|15244 : --------ACAAA-TT----T--CG-TTT-TGC-C-AC-G-AA-G-CG-AGT-ATCC-GA-GGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-GT--T--AA--A-C-GGACGTCC
gi|15245 : AAA-TT----T--CG-TTT-TGC-T-AC-G-AA-G-CA-AGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-TT--T--AA--ACC-GG--GTCC
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blockSeqs : . G . . C ACT A TT T G T C G TGT . A . . . CG A G . . . G . . TATTTACT . . . . C . TAAAATA . C . ATAGTC A TT . . TAG TT A AGT A . . . . T . . . C . . . C . . . . . . . . . . TA . . AC
blockSeqs : . G . . C ACT . . . G . . A A . . . . . C . . . . . . . . . . . . . C . TAAACTT . A . AATTC . TT . . TAG TT . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . C . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . TAAATG . C . ATTC . TT . . GA . . A G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . A . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . TAACTG . A . ATTC . CG . . GA . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . TAACTT . A . ATTC . CT . . AG . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . T . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . TAACAT . A . ATTC . CT . . G . . A C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . A . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . TAAAT . T . ATTC . CA . . G . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . A . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . TAAC . A . ATTT . CA . . G . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . TAAA . A . ATTC . CA . . G . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . C . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . CTTT . A . ATTC . CA . . G . . A T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . C . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . TCAC . A . ATTT . CA . . G . . A T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . TACC . A . TTC . TA . . G . . A T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . TAAT . A . ATC . CA . . G . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . CTT . A . TAT . AA . . A . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . CAT . A . TAA . CA . . C . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . CAT . A . TAT . CA . . A . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . CAT . G . CAT . CA . . A . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . CAC . A . TAT . CA . . A . . C T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . CAT . G . TAT . CA . . A . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . CAT . A . TAT . CA . . A . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . CAT . . . TGT . TA . . A . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . CTT . . . TAT . CA . . A . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . CAT . . . TAT . T . . A . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . CAT . . . TAT . T . . A . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . CAT . . . AT . T . . A . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . CT . . . CT . T . . A . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . AT . . . AT . T . . A . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TA . . . A . G . . A . . A T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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Reference ( family-517 ) : ATCATCGTTTTCAAATA-GGCAT---G-A--TAGA---CT-TTT---CTTG-AAAACTC--CAGAT-G-AA-GGCAAA-----TATAG-A-G---CCA--C--G--GC-GTG--AT---ATAA-ATTA-AAGATGACA-GG-T-AT-T----T-A--C-----A-----AC---A--T---T----TCTATCTCAT--TT-A---TNCA-G--CCCA-T-GC-AG--G-CCG--TA--T--T--TA-------C----AAA-TT----T--CG-TTT-TGC-T-AC-G-AA-G-CG-AGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
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gi|15210 : ATCATCGTTTTCAAATA-GGCAT---G-A--TAGA---CT-TTT---CTTG-AAAACCC--CAGAT-G-AA-GACAAA-----TATAG-A-G---CCA--C--G--GA-GTG--AT---ATAA-ATTA-AAGATGACA-GG-T-AT-T----T----C-----A-----G----------------TCT------T--TG-A---AGCA-G--TT-------------------TA--T--T--AA-------A----AAA-------T--CA-TTT-TGC-T-AC-G-AA-G-CA-GGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
gi|15211 : ATCATCGTTT-CAAATA-G--AT---GGA--TAGA---CTCTTT---CTTG-AAAACTC--CAAATTG-AA-GGCAAAA----TATAG-A-G---C-A--C--G--GC-GTG--AT---ATAG-ATTA-AAGATGACA-GG-T-AT-T----TCA--CT----A-----AC---T--T---T----TCT---TCAT--TT-A---TTCA-G--TCTT-T-G--AA--G-TAG--TT--T--A--TA-------T----AAA-GA----T--CA-TTT-TGC-T-AC-G-AA-G-CG-GGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA---TTC---T--ATTCC-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
gi|15212 : CATTTTCAAATAAGGCAT---G-GATTAGA---CT-TTTTT-CTTG-AGAACTC--CAGAT-G-AA-GGCAAA-----TATAG-A-G---TCA--C--A--GC-GTG--AT---ATAA-ATTA-AAGATGACA-GG-T-AT-T----T-A--C-----A-----ATA--A--A---T----TCT---TCAT--TT-A---TTCA-G--TCT--T-TC-AA--G-CCGTTTA--T--T--AA-------A----AAA-AA----T--AA-GTT-TGC-T-AC-G-AA-G-CG-AGT-AT-A-GG-GTTG----G--AA---TTC---T--AT--C-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
gi|15213 : CATTTTCAAATA-GGCAT---G-A--TGGA---CT-TTT---CTTG-AAAACTC--CGTAT-G-AA-GGCAAATGT--TATAG-A-G---CCA--C--GC-AC-GTG--AT---ATAA-ATTA-AAGATGACATGG-T-AT-T----A-A--C-----A-----ATAAAA--TA--T----TC--TTTCAT--TT-A---T-CA-G--TCT--T-TC-AA--G-CCG--T---T--T--TA-------T----AAA-AGAAAAT--CA-TTTGTGC-T-AC-G-AATGCCG-AGT-AT-A--G-GGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-GT--TTAAA--ACC-GT--GTC
gi|15214 : TTTCAAATA-GGCATCGAA-A--TAGA---CTATTTGTCCTTG-AAAACTC--CAAA--G-AATGGCAAA-----TATAG-A-G---CCAC-C--G--GC-GTG--ATATAATAA-ATTA-AGCATGATA-GG-T-AT-TTTACT-A--T-----A-----AC---T--T---T----TCT-TCTTAT--TC-A---T--A-G--TCTT-T-GA-A-------G--TAATT--T--TA-------TAAAAAAA-CA----T--CA-TTT-GAG-T-AC-G-AACG-CG--GT-AT-A-AGTAGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-GT--
gi|15215 : CAAATC-GGAAT---G-A--CAAA---AT-AT----ATTG-AAATCTT--TAATT-GTAA-TGCAAA-----TAT----------CA--CTAA--ACAGTG--GT---CTAA-ATTC-A-GTTTACA-GG-T-AT-T----T-A--------A-----AC---T--T---TC---TCTATCTCATATTT-A---T----G--GCCG-T-GC-AA-----CG--TA--T--T--TA-------C----AAA-TT--------G-TTT-TGC-A-AC-G-AA-G-CG-A-T-AT-A-GG-GGTG----G--A----TTC---T--AT--C-GT--T--AA--ACC-AG--GCCa
gi|15216 : AATA-G-CAT---G-AC-TAGAACTCT-TTT---CTTTTAAAACTC--CAAAT-G-AA---CAAAGAATGTGTAG-AAG---TCA--C--GCGGC-GTGG-AT---ATAA-ATTAGAAGATGACA-GG-TTAT-T----T-A--CTATCTAC----AC---A--TCACT----TCTCT-TCAT--TT-AA--TTCAAG--TCCT-T-GA-AGTAG-TTG--TA--T--A---A-------C----AAA-AT-------CA-TTT-TGC-T-AC-G-AA-G-C--AGG-GT-A-GG-GGTG----G--AA---TTC---T--A
gi|15217 : AATA-G-CAT---G-AC-TAGAACTCT-TTT---CTTT-AAAACTCCACATAT-G-AA--GCAAAAAAG-TTCAGAA-G---TCACGC--G--GC-GTGGAGT---ATAACATTAGAAGATGACA-GG-T-ATAT----T-A--CT----ATCCTCAC---A--TA--C----TCT-TCTCAT--TT-A---TTCA-G--TCCT-T-GA-AGTAG-TTG--TA-----T--AA-------C----AAA--A----T--CA-TTT-TGC-T-ACGG-AA-G-CA-GGT-GT-AGGG-GGTG----G--AA---TTC---T--AA--C-G
gi|15218 : AATA-G-CAT---G-AC-TAGAACTCT-TTT---CTTTTAAAACTC--CACAA-G-TA-CAAAAA-----TTTAG-A-AGTACCG--C--G--GC-GTGG-AT---ATAA-ATAA-AGAATGACA-GG-TTAT-T----T-A--CT----ATCT--AC---A--C---TACCTTCC-TCTCAT--TA-A---TTCA-G--TCT--T-GA-AG---------TAG-T--T--TATAA----C----AAA-AT-------CA-TTT-TGC-T-AC-G-AA-G-GC-AGG-GT-A-GG-GGTG----G--AA---TTC---T--A
gi|15219 : AATC-AGCAT---G-A--CAAA---AT-AT----ATTG-AAATCTG--TAATT-GCAA-TGCAAA-----TATC--A-C---TTA--C--A--ACAGTG--GT---TTAA-ATTC-A-GTTTACA-GG-T-AT-T----T-A--T-----A-----AC---T--T---T----TCTATCTCAT--TT-----TATG-G--TCCA-T-GC-AG--A-TCG--TA--T--T--TA-------A----AAA-TT----T--CG-TTT-TGG-T-AT-G-AA-G-CA-AGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-GT--T--AG--ACC-GG--GTCC
gi|15220 : ACA-GG-T-AT-T----T-A--T-----A-----AC---A--T---T----CCTATCTCAT--TT-C---T--A-G--CCCA-TGGCGAA--C-CCG--TA--T--T--TA-------C----AAA-TT----T--CG-TTT-TGC-TAAC-G-AA-G-CG-AGT-AA-A-GG-GGT-----G--AA---TTC---CTAAT--C-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
gi|15221 : taaaaaatgtcagtttACA-GG-T-AT-T----T-A--T-----A-----AC---A--T---T----TCTACCTCAT--TT-AATTTATA-G--CCCA-T-GC-AG--A-CTG--TA--T--T--TA-------T----AAA-TT----T--CG-TTT-TGC-T-AC-G-AA-G-CG-AGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
gi|15222 : ACA-GG-T-AT-T----T-A--T-----A-----AC---A--T---T----TCTTTCTCAT--TT-----TAAA-G--CCCA-T-GC-AG--A-CCG--TA--T--T--TA-------T----AAG-TT----T--CG-TTT-TGC-T-AC-G-AA-G-CG-AGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
gi|15223 : ACA-GG-T-AT-T----T-A--T-----A-----AC---A--C---T----TGTATCTCAT--TTTA---TAC-----CCCA-T-GC-AG--A-CCG--TA--T--T--TA-------T----AAA-TT----T--CG-TTT-TGC-T-AT-G-AA-G-CG-AGT-AT-A-GG-GGTG----G--GA---TTC---T--AT--C-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
gi|15224 : ACA-AG-T-AT-T----T-A--T-----A-----AT---T--T---C----TCCATCTCAT--TTCA---TG---G--CCTA-T-TC-AC--A-CCG--TA--T--T--CA-------C----AAA-TT----G--CG-TTT-TGC-T-AC-G-AA-G-CG-AGT-AT-A-GC-GGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-GTTAT--AA--ACC-GA--GTCC
gi|15225 : ACA-GG-T-AT-T----T-A--A-----A-----AC------T---T----TCTATCTCAT--TTTA---TGC-------CG-T-GC-AG--A-CCG--TA--T--T--TA-------C----AAA-TT----T--CG-TTT--GC-A-AC-G-AA-G-CG-AGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-GT--T--TA--ACC-AG--GTCC
gi|15226 : ACA-GG-T-AT-T----T-A--T-----A-----A----A--T---TC---TCTATCTCAT--TT-----TATG-A--CCCA-T-GC-AG--A-CCG--TA--T--T--TA-------C----AAA-TT----T--CG-TTT-TGCTT-AC-G-AA-G-TG-AGT-AT-A--G-GGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
gi|15227 : ACA-GG-T-AT-T----T-A--T-----A-----GC---A--T---T----TCTATCTCAT--TT-----TATA-G--CCAA-T-GC-AG--A-TCG--TA--T--T--TA-------T----AAA-TT----T--CG-TTT-TGC-T-AC-G-AA-G-CA-AGT-AT-A-TG-GGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
gi|15228 : ACA-CG-T-AT-T----T-A--T-----A-------------T---TA---TCTACCTCAT--TT-----TGTG-G--TCCA-T-GC-AG--A-CCA--TA--T--T--TA-------C----AAA-TT----T--CGTTTT-TGC-T-AC-G-AA-G-TG-AGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA---TTCTAGT--AT--C-GT--T--AA--ACC-GA--GTCC
gi|15229 : ACA-TG-T-AT-TG---T-A--T-----A-----AC---A--T---T----TCTATCTCTT--TT-A------A-G--CCCA-T-GC-AG--A-CCG--TA--T--A--TA------------AAA-TT----T--CG--TT-TGCTT-AC-G-AA-G-CG-AGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-GT--T--TA--ACCGGG--GTCC
gi|15230 : ACA-GG-T-AT-T----TTA--T-----A-----AC---A--T---T----TCTATCTCAT--TT-----TATA-G--CCCA-T-GC-AG--A-CCA--TA--T--T--TA-------C----AA--TT----T--CG-TTT--GC-T-AC-G-AA-G-TGAAGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA----TC---T--AT--C-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
gi|15231 : ACA-GGAT-AT-T----T-A--T-----A-----AC---T--T---T----TCTATCTCAT--AT-T---TATA-GTCCCCA-T-GC-AA--GACCG--TA--T--T--TA-------T----AAA-TT----T--CG-TTT-TGC-T-AC-GAAA-G-CG-AGTCAT-A-TG-GGTG----GAAAA---TTC---T--AT--C-GT--T--AA--ACC--G--GTCC
gi|15232 : ACA-GG-T-AT-C----T-A--T-----A-----AC---A--T---T----TCTATTTC---------------------CA-T-GC-AG--GACCG--TA--T--TAGTA-------C----AAAATT----T--TG-CTT-TGC-T-AC-G-AA-G-CG-AGT-AC-T-AG-GGTG----G--AAACGTTC---T--AT--T--T--T--AAAGACC-GG--GTCC
gi|15233 : ACA-GG-T-AT-T----T-A--T-----A-----AC---A--T---T----TCTGTCTCAT--TT-----TATA-G--CC-A-T-GC-AG--A-CCG--TA--TAAT--TA------------AAA-TT----T--CG-TTT--GC-T-AC-G-AG-A-CG-AGT-AT-A--G-GGT-----G--AA---TCC---T--AT--C--T--T--AA--ACC-G
gi|15234 : CA-GG-T-AT-T----T-AAAT-----A-----AC---A--T---T----TCTATCACA---TT-A---T--A-G--CCCA-T-GC-AGA-G-CCG--TA--T--T--TA-------C----AAA-TT----TGACG-TTT-TGC-T-AC-A-GA-G-CG-AGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA---TTC---G--AT--C-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
gi|15235 : CA-GG-T-AT-T----T-T--A-----A-----AC---T--T---T----TCTGTCTCGT--TT-A---TTTG-----CTA-T-AC-AG--A-CCA--TA--T--T--AA-------C----AAA-TT----T--CG-TTT-TGC-T-AC-G-AA-G-TG-AGT-AT-A-TG-GGTA----G--AA---TTC---T--AT--C-AT--T--AA--ACC-GG--GTC
gi|15236 : CA-GG-T-AT-T----T-A--T-----A-----AC---A--T---T----TCTATCTCAT--TT-----TATA-G--CCCA-T-GC-CG--A-CCG--TA--T--T--TA-------C----AAA-TT----T--CG-TTT-TGC-T-AC-A-AA-G-CG-AGT-AT-A-GA-GGTG----G--AA---TTC---
gi|15237 : A-------C----AAA-AT-------CA-TTT-TGC-T-AC-G-AA-G-CA-GGT-GT-A-GG-GGTG----G--AA---TTC---T--AA--C-GT--T--AA--ACT-GG--GTCC
gi|15238 : gtttataA-------T----AAA-TT----T--CG-TTT-TGC-T-AC-G-AA-G-CA-CGT-AT-A--G-GGTG----G--AA---GTC---T--AG--CGGT--T--AA--ACC-GG--GTCC
gi|15239 : A-------C----AAA-TT----G--CA-TTT-TGC-T-AC-G-AA-A-CG-AGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-GT--T--AA--ACC-GG--GTCC
gi|15240 : A-------C----AAA-TT----T--TG-TTT-TGC-T-AC-G-AA-G-CG-AGT-AT-A--G-GGTGGATTG--AA---TTC---T--AT--C-GT--T--AA--ACT-GG--GTCC
gi|15241 : A-------C----AAA-TT----T--CG-TTT-TGC-T-AC-G-AA-G-TG-AGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-GT--T--AA--ACC-G
gi|15242 : A-------C----AAA-TT----T--CG-TTT--GC-T-AT-G-AA-G-CA-AGT-AT-A-GG-GG-G----G--AA---TTC---T--AT--C-GT--TTAAA--ACT-GG--GTCC
gi|15243 : A-------C----AAA-TT----T--CG-TTT-TGC-C-AC-G-AA-G-CG-AGT-ATCC-GA-GGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-GT--T--AA--A-C-GGACGTCC
gi|15244 : A-------C----AAA-TT----T--CG-TTT-TGC-C-AC-G-AA-G-CG-AGT-ATCC-GA-GGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-GT--T--AA--A-C-GGACGTCC
gi|15245 : ----AAA-TT----T--CG-TTT-TGC-T-AC-G-AA-G-CA-AGT-AT-A-GG-GGTG----G--AA---TTC---T--AT--C-TT--T--AA--ACC-GG--GTCC