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lowQualScore                  :       .. . .. . .   . ....................  .. ... ..   .. . .. ..  ..   . .. ...... .   . ........  ...........  . ... . ...... .  . . ... .  .... ......   . .  .. .  . . ...  .. ...... .. ....   ....... . .. ........ .. . . . .. . . .. ..  ..  . .  . . .  .  .  . . . .  .   ... .     ..... ..   .     ..   .... .. ............... . .      ....................  .. . .......... ..    . ..........   . ..... .  ...... ..  .  .   .  . ..  . .   .... . .. . . .  . .  ... .... .. .  ..   ..    . ....  . ...  .   .  . .  ..... .   .....  . . .  .  .   . . .. . ...  ...... . ....  . .   . . .  . . ..  . . .   ....   ...   ..  .  . .  .  .      ..   ..... . . ... .......  ..................         .  
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Reference ( gi|112725 )       : CTCTGT--C-T--G-T-AAA-A---CA--A-A--------A-GCG-T---T--AAA--T-T--G--AA--TTA-A--A-A----T-TCA-T--------AC-----------AT-T---G-T------T-GC-A-T---G-AA----G------TAA-G-AT--G-AG-T-A---AC--A---A--G--T----CAG-------T-C--G------T-T--T-A-C-T--G-C-A--A--AA--GA-C-AC-G-T-GG-AA-AT-C-A-A-GA-CTC---G-TTCTC----GG-GGAA-GTGCG--CAA-T--T--G------------G--A-G-TACCAG--------------------TT--T-G----------G--TGAA-A----------TAT-G-----G-TG--T---T--TT-CA-GCA-AG-A--GG-T-AAA----A-T--C-C-A-AA-A-TA-T-T----T--T-CA--ACA--TCGG-A----CA-A---TT-TTT-TC-A-TG-----C-TTT-----TC-T-G-TT-AA-TTG-A-T--A-A---CA------T-A----AGGGTTAG-A-ATTA-T-T--TT-G-G-GTG----TAA---TTTG-AT-AT-G-AA-CA-TGCAGT--CAC-----A-A-A---A-------TA-----------G------TTTTTTTTTATT
gi|112726                     : CTCTGT--C-T--G-T-AAA-AA--CA--A-A--------T-GCA-T---T--AAA--T-T--G--AA--TTA-A--A-A----T-CCA-T--------AC-----------AT-T---G-T------T-GCAA-T---G-AA----G------TAA-G-AT--G-AG-T-----AC--A---A--G--T----CAG-------T-C--G------T-T--T-A-C-T--G-C-A--A--AA--GA-C-AC-G-T-GG-AA-AT-C-A-A-GA-CTC---G-TTCTC----AG-GGAATGTG-A--CAA-T--T--G------------G--A-G-TACCAG--------------------TT--T-G----------G--TGAA-A----------TAT-G-----G-TG------T--TT-CA-GCA-AG-A--GG-T-AAA----A-T--C-C-A-AA-A-T--T-T----T--T-CA--ACA--TCGG-A----CA-ATT-TT-TTT-TC-A-TG-----C-TTT-----TC-T-G-TT-AA-TTG-A-T--A-A---CA------T------AGAGTTAG-A-ATTA-T-T--TT-G-G-GTG----TAA---TTTG-AT-AT-G-AA-CA-TGCAGT--CAC-----A-A-A---A-------TA-----------GGTTGGTTTTTTTTTTATT
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gi|112736                     : CTCTGT--C-TCTG-T-AAA-AAACCA--ATA--------A-GCG-T---T--AAA--T-T--G--A---TTA-A--A-A----T-CCA-T--------AC------------T-T---G-T------T-GC-A-TT--G-AA----G------TAA-G-ATT-G-AC-T-AGT-AC--A---A--G--T----CAG-------T-C--G------G-T--T-A-T-C--T-C-AC-A--AA--GA-C-CC-G-TCGG-AA-AT-C-A-A--A-CTG---T-TTCTC----AG-GGA--GTGCGACCAA-T--T--G------------G--AAG-TACCAG--------------------TT--T-G-------------TGAA-G----------TATTG-----G-TGG-T---T--TT-CA-GCA--G-A--G--T-AAA----A-T--C-A-A-CATA-TA-C-T----T--T-CC--ACA--T--G-A----CA-ATT-TT-TTT-TC-A-TG-----C-TTT--------T-G-TT-AA-TTG-A-T--ACA---CA------T-A----AGAGTTAG-A-A-TA-T-T--T----G-GTG----TAA----TTG-AT-AT-G-AA-CA-TGCA-T----C-----A-A-A---A-------TAAGGTTGTTGT-G------TTTTTTTTT
gi|112737                     : CTCTGT--C-T--G-TAAAA-A---CA--A-A--------T-GCG-T---T--AAA--T-T--G--AA--TT--A--A-A----T-CCA-T--------AC-----------AT-T---G-T------T-G--A-T---G-AA----G------TAA-GAAT--G-AG-T-A---AC--A---A--G--T----CAG-------T-C--G------T-T--T-A-C-T--G-C-A--A--AA--GA-C-ACTG-T-GG-AA-AT-CAA-A-GA-CTC---G-TTCTC-----A-GGAA-GTGCGA-CAA-T--T--G------------G--A-G-TACCt
gi|112739                     : CTCTGT--C-T--G-T-AAA-AA--CA--A-A--------A-----------------------------TCA-------------CCA-T--------AC-----------AT-T---G-T------T-GC---T---G-AGCCTCA------TAA-G-AT--G-AGCT-A---AC--A---A--G--T----CAG-------T-C--GCAACCAT-T--T-A-C----G-C-A--A--AAAGGA-C-AC-G-T-GG-AA-AT-C-A-T-GA-CTC---G-TTCTC----AG-GGAA-GTGCGA-CAACT--T--GCCAATACCCGACG--A-G-AACCAGCGACGGATAGACCTCACCAGTT--A-G----------G--TGAA-A----------TAT-G-----GCCG--T---T--TT-CA-GCA-AGCA--GG-T-AAA----A-T--C-C-A-AA-A-TAGT-C----T--T-CA--ACA--TCGG-A----CA-A---TT-TTTGT----TGC----C-TTT-----TC-TGG-TT-AATTTG-A-T--
gi|112738                     : CTCTGT--C-T--G-T-AAA-AA--CA--A-------------C----------------------AA--TC--------------CCA-T--------AC-----------AT-T---G-T------T-GC---T---G-AA----GCTACCATAA-G-AT--G-AG-TTA---AC--A---A--G--T----CAG-------T-C--GCAACCCT-T--T-A-C-T--G-C-A--A--AA--GA-C-AC-G-T-GG-AA-AT-C-ATG-GA-CTC---G-TTCTC----AG-GGAA-GTGCGA-CAA----T--G------------C--A-C-TACC
gi|112740                     : CTCTAT--C-T--G-T-AAA-AA--CA--A-A--------T-GT--T---T--AAA--T-C--T--AA--TTA-A--A-A----T-TCA-C--------AC-----------AT-T---G-T------T-GC-A-T---A-AA----A------TAA-G-AT--G--G-T-A---G---A---A----------CAG-------T-C--G------T-T--T-A-C-T--G-C-A--A--AA--GA-C-AC-G-T-GG-AA-AT-C-A-A-ccaagcagaacacaaaaaggcaagaacatacccagttaggtgaaatatgcgcgttttcagcaagacggtaaaaatccaaaaatagtttcaacatcggacaattttttcatgccttttctggttaatttgat
gi|112741                     : CTCTGT--C-T--GAC-AAAGA---CA--A-ATTACATTTA-AT--T---T--AAA--T-T--GGGAA--TTTTA--A-A----T-TCA-TT-------AC-----------AT-CTGGG-T------G-GC-A-TTTGG-AA----A------TAA-G-AT--G-GT-T-A---AC--C---A--G--TC---CA----------C--G------T-TCAC-A-C-T--G-C-A--A--AA--GATC-AC-G-T-GG-AA-AT-C-
gi|112742                     : CTCTAT--C-C--G-T-AAA-AA--CA--A-A--------T-GT--T---T--AAA--TCT--AT-AA--TTA-A--A-A----T-TCA-C--------AC-----------AT-T---G-T------T-GC-A-T---A-AA----G------
gi|112743                     :  TCTGT--C-T--G-T-AAA-AA--CA--A-A--------T-GCT-T---C--AAA--T-T--G--AA--TTA-A--A-A----T-TCA-C--------AC-----------AT-T---T-T------T-GC-A-T---A-AA----A------TAA-G-AT--G-GG-T-A---AC--AAC-A--G--T----CAG-------T-C--G------T-T--T-A-C-T--G-C-A--A--AA--GA-C-AC-G-T-GG-AA-AT-C-A-A-GG-GTC---G-
gi|112744                     :  TCTGTAAT-T--G-T-AAATA---CA--A-A--------T-GCT-T---T--AAA--T-T--G--AA--TTA-A--A-A----T-TCA-C--------AT-----------AT-T---G-T------T-GC-A-T---A-AA----A------TAA-G-AT--G-GG-T-A---AC--AAC-A--G--T----CAG-------T-C--G------T-T--T-A-C-T--G-C-A--A--AA--GA-C-AC-G-T-GG-AA-AT-C-A-A-G
gi|112745                     :   CTGT--C-T--G-T-AAA-AA--CA--A-A--------T-GCG-T---T--AAA--T-T--G--A---TTA-A--A-A----T-CCA-T--------AC-----------AT-T---G-T------T-GC-A-T---G-AA----G------TAA-G-AT--G-AG-T-A---TC--A---A--G--T----CAG-------T-C--G------T-T--T-A-C-T--G-CCA--A--AA--GA-C-AC-G-T-GG-AA-AT-CCA-A-GA-CTC---G-TTCTC----AG---AA-GT-CG--ACA-T--T--G------------GTGA-G-TACCAG--------------------TT--T-G----------G--TGAA-A----------TGT-G-----G-TG--T---T--T--CA-GCA-AG-A--GG-T-AAA------T--C-C-A-AA-A-TA-T-T----T--C-----ACA--TCGG-A----CA-A---TT-TT--TC-A-TG-----C-TTT-----TC-T-G-TT-AA-TTG-A-T--A-A---CA------T-A----AGAGTTAG-A-ATTA-T-T--TT-G-G-GTG----TAA---TTTG-AT-AT-G-AA-CA-TGCAGT--CACAAATTA-A-A---A-------TAGGTT-------G------TTGTTTTTT
gi|112747                     :   CTG---C-T--G-T-AAA-AA--CA--A-T--------ATGCT-T---T--GAA--A-T--A--AA--GAA-A--A-A----T-TCA-T--------AC------------T-C---A-T------C-TC---T---G-AA----A------TT-----T--G-AG-T-A---AC--AT--AC-A--C----CAG-------T-C--G------C-T--T-A-C-T--G-C-G--A--AA--TA-A-AC-G-T-GG-AA-AT-C-A-A-t
gi|112746                     :   CTAT--C-T--G-T-AAA-AA--CA--A-T--------ATGCT-T---T--GAA--A-T--A--AA----A-AC-A-A----A-TCA-T--------ACTCATTCTCTGAAT-TTATG-T------T-GC-A-T---G-AA----G------------AT--G-AG-T-A---AC--ATACAT-G--TACACCAG-------T-C--G------C-T--T-A-C-T--G-C-G--A--AT--TA-A-AC-G-T-GG-AA-AT-C-A-A-GG-CCC---
gi|112749                     :   CTGT--C-T--G-TTAAA-AT--CA--A-A--------ATGCT-T---TTGAAA--T----A--AA--GAA-A--A-A----T-TCA-T--------ACTC---------AT-C---C-T---------C-T-T---G-AA----T------T------T--T-AG-T-G---AC--AT--A--G--C----CAG-------T-C--C------C-T--T-A-C-T--G-C-G--A--AAT-AA-A-AC-A-T-AG-AA-AT-C-A-A-GT-CTC---G-ctca
gi|112748                     :   CTGT--C-T--G-T-AAA-AA--CA--T-A--------T-GC--T---T--AGCCTT-T--G--AA--ATA-A--A-G-------AA-A--------AC-----------CT-C-------------------T---G-AA----A------TT-----T--G-AG-T-A---AC--AT--AC-G--C----CAG-------T-C--G------C-T--T-A-C-T--G-T-G--A--AAT-GA---AC-G-T-GG-AA-AT-C-A-A-GT-CCC---G-
gi|112750                     :   CTGT--C-T--G-T-AAA-AA--CA--A-T--------ATGCT-T---TTGAAA--T-AAAG--AA----A-A--A-A----T-TCA-T--------ACCC---------AT-C---C-T------C-------------------------TAA-A-ATTTG-AG-T-A---AC--AT--AC-G--T----CAG-------T-C--G------C-T--T-A-C-T--G-C-G--A--AA---A-T-----------AA-AT-C-A-A-G
gi|112751                     :   CTAT--C-TA-G-T-AAA-AA--CA--A-A--------T-GTA-T---T--AAAATT-C--T--AA--TTA-A--A-AAAAAT-TCA-C--------AC-----------ATGT---G-T------T--C-A-C---A-AA------------AA-G-ATAAA-AG-C-ATAGAC--A---G--GA-TTA--CAGAACAGACT-A--C------T-T--T-AGC-T--GCC-AACA--AA--GA-C-AC-G-T-GG-AA-AT-C-A-
gi|112752                     :    TGT--C-T--G-T-ATA-A---TA--T-A--------ATGCG-TATAT--AAT--T-T--G--AT--TTT-A--A-T----TATCA-TCACTA---ACT----------AT-T---G-T------T-GC-AAT---G-AA----G------TAA-ACATT-G-GG-T-A---AC--A---A--G--TTCT-CA----------C--G------T-T--TTA-C-TCTG-C-C--A--A---GA-C-AC-G-T-GG--A-TT-CGA-A-GA-CTCA--A-TTCTC----AG-AGAA-G-GTG--CAG-A--TAAG------------G--G-G-TACTAG--------------------TT--T-G----------T--GGAA-AC---------TAT-T-----A-TA--TACGTAGCT-CA-GCA-GT-A--GT-A-AAA----A-T--C-
gi|112753                     :    TGT--C-T--G-T-AAA-A---AC--A-A--------T-GCT-T---T--GAA--A-T--G--AA--TGA-ATCATA----C-CCA-TCCTTTGAAAC-----------TT-T---G-T------T-GC-A-T---G-AA----G------ATG-G-AT-----A-T-A---ACGTA---T--G--T----CAG-------G-C--G------C-T--T-A-C-T--A-C-G--A--TA--GA-C-AC-G-T-GG-GA-AT-C-A-A-GG-Catttctgtgatggtgtgttcagcaagaggtttaccttactaccattatattatttttcaacatcaggttaccgattcttttcatgcgttttcacgattgattgataatactattcgaggtagattaatttcttgcggtgtaattcttttgtttgttgaagcgattgttgctgggtcacaaaatctgttggttttttgtttttttt
gi|112732                     :               -T-AAA-A---CA--A-T----------GCG-T---T--AAA--T-T--G--AA--TTA-A--A--------TCACT--------AC-----------AT-T---G-TG-----T-GC-A-T---A-AA----G------TAA-G-AT--G-AG-T-A---AC--A---A--G--T----CAG-------T-C--G--------T--T-A-C-T--G-C-A--A--A----G-C-AC-G-T-GG-AA-AT-C-A-AGGA-CC------TTCTCA---GA-GGAA-GTGCGA-CAA----T--G------------G--A-G-TACCAG--------------------TT--T------------G--TGAA-A----------TG--A-----G-TT--T---T--CT-CA-G---AG-A--GG-T-AAA----A-T--C-C-A-AA-A-TA---T----T--T-CA--ACA--TCGG-A----AC-A---TT-TTT-TC-A--G-----C-TTT-----TC-T-G--T-AA--TG-A-T--A-A---CAACATTGT-A----AGAGTTAG-A-A-TA---T--TT-G-G-GTG----TAA---TTTG-AT-AT-G-AA-CA-TGCA-T--CACAAATTA-A-A---A-------TAGG---------G------TTTTTTTTTTTT
gi|112757                     :       ctgtgtcact-AAA-A---CG--A-A--------T-GC--------------T-G--G--AA--TTA-A--A------T-TCA-T--------AC-----------AT-T---G-T------T-GC-A-T---G-AA----G------TAA-A-AT--G-GG-T-A---AC--AAC-A--G--T----CAG-------T-C--G------T-T--T-A-C-T--G-C-A--A--AA--GA-C-AC-G-T-GG-AA-AT-C-tt
gi|112758                     :                 -AAA-A---CG--A-A--------T-GC----------------T--G--AA--TTA-A--A--------TCC-T--------AC-----------AT-T---G-T------T-GC-A-TT--G-AA----G------TAA---AT--G-GG-T-A---AC--A---ACAG--T----CAG-------T-C--G------T-T--TTA-T-T--G-C-A--A--AA--GA-C-AC-G-T-GG-AA-ATAC-A-A-GA-GTC---
gi|112754                     :                 -AAA-A---CA--A-A--------T-GCT-T---T--AA---T-T--G--AA--TTA-A--A-T----T-TCA-T--------AC-----------AT-T---G-T------T-GC-A-T---G-AA----G------T
gi|112755                     :              gca-AAA-A---CA--A-ATCATA---A-GTG--------AAA--TGT--G--AA--CCA-A--G------T-TCA-TGT------ACT----------AT-G---A-T------C-GC-AAT---A-GATGC-G------TAC-GTCT--G-A--T-A---AC--A---A--G--T----CAG-------T-C--G--------T--T-A-C-T----C-A--A--AA---A-CAAC-G-T-GG-AACAT-C-A-A-AA-CTA---A--TCTC----AGCCGAA-GTGCGGATAA-T--T--G------------G--
gi|112756                     :                gtaAA-A---CACGA-A--------T-GCT-T---T--AAA--A-T--G--GACATTA-A--A------T-TCA-T---------C-----------AT-T---G-T------T-G--A-T---G-AA----G------TAAAG-AT--GCGG-T-A---AC--A---G----------CAG-------T-C--G------T-T--T-A-C-T--G-C----A--AA--GA-C-AC-G-TGGG-AA-AT-C-A-A-G----C---G-TTCccacatcacccgtgctcaagctctaccagtgtgtgcgtaaaataatttataatctatagaaaacaatatgttaacatgttccaggcaagacaggctaacatccatacatatttcatcaccacatcgtcttttctatctttcattaacttgtataagcttataatgacgagtatattatttgggatagttttaattattgaacatgcagtccacacaaatatcttttttattct
gi|112759                     :                                             G-T---T--AAA----------AA--C-A-A--A-A----T-CCA-T--------AC-----------AT-T---G-T------T-GC-A-T---G-A-----G------TAA-G-AT--G-AG-T-A---AC--A---A--G--T----CAG-------T-C--G------T-T--T-A-C-T--G-C-A--A--AA--GA-C-AC-G-T-GGAAA-AT-C-A-T-GA-CTC---G-TTCTC----AG-GGAA-GTGCGA-CAAGT--T--G------------G--A-G-TACCAG------------------------T-G----------G--TGAA-A----------TAT-G-----G-CG------T--TT-CA--CA-AG-A--GG-T-AAA----A-T--C-C-A-AA-A-TA-T-T----T--T-CA--ACA--TCGG-A----CA-A---TT-TTT-TC-AGTG-----C-TTT-----TC-TAG-TT--A-TTG-A-T--
gi|112760                     :                                              -T---T--AAA--T-T--G--AA--T---A--A-A----T-TCA-T--------AC-----------AT-T---G-T------T----A-T---G-AA----G------TAA-G-AT--G-GG-T-A---AC--A---AAAG--T----CAG-------T-C--GC-----T-T--T-A-C-T--G-C-A--A------GA-C-AC-G-T-GG-AA-AT-C-A-A-GA---------TCTTC----AG-GGAA-GTGCGA-CA-----T--G------------G--A-G-TACCAT--------------------TG--T-GAATATTTATAG--CAAA-AAAAGTATTTTTGT-G-----G-TG--T---T--TTTCA-GCA--G-A--GG-T-TAA----A-T--C-C-A-AA-A-TA---T----T--T-CA--AC---TCGG-A----TG-AAT-TT-TTT-TCAA-TG-----C-TTT-----TC-T-G-TT-AA-TTG-A-T--A-A---CA------T-AC---AGG--TAG---ATTA-T-T--TT-G-G-GTG----T-----TTT--AT-AT-G-A---A-TGCAGT--CAC-----A-A-A---AGT-----TG-----------G------TTTTTTT
gi|112761                     :                                                                                                      -----------AT-T---GAC------T-GC-A-T---G-AA----G------------AT--G-AG-T-A---AC---------G--T----ACG-------T-C--G------C-T--T-A-C-T--G-C-G--A--CA--GA-A-AC-G-T-GG-AA-AT-C-A-A-G
gi|112762                     :                                                                                                                  T-T---G-T------T-GC-A-T---G-AA----G------------AT--G-AG-T-A---AC--A---T--GCAT----CAA-------T-C--G------CCT--T-A-C-T--G-C-G--A--AA--TA-A-AC-G-T-GG-AA-AT-C-A-A-G
gi|112763                     :                                                                                                                                                                                                     G-------T-C--G------T-T--T-A-C-T--G-C-A--A--AA--GA-C-AT-G-T-GG-AA-AT-C-A-
gi|112764                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --G------------G--A-G-TACCAG--------------------TT--T-G----------G--TGAA-A----------TAT-G-----G-TG--T---T--TT-CA-GCA-AG-A--GG-T-A
gi|112738                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CCAG--------------------TT--A-G----------G--TGAA-A----------TAT-GC----G-CG--T---T--TT-CA-GCA-AG-AC-GG-T-AAA----AAT--C-C-A-AA-AATA-G-T----T--T-CA--ACA--TCGG-A----CA-A---TT-TTT-TC-A-TGC----C-TTT-----TC-TGG-TT-AATTTG-A-T--
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gi|112752                     :                                                                                                                                                                                                                         TGT--C-T--G-TATAATA--T--AA--T--G-C----G-TATAT------AAT--T--TG--AT--TT----T-A--ATTA--TCATCACTA------A--CT----------AT-T---G-T------T-GC-AAT---G-AA----G------TAA-ACA--TT-G-GG-T-A---AC--A---A--G--TTCT-CA----------C--G------T-T--TTA-C-TCTG-C-C--A--A---GA-C-AC-G-T-GG--A-TT-CGA-A-GA-CTCA--A-TTCTCA----G-AGAAGGTGCAG-AT-AA------G------------G--G-G-TACTAG--------------------TT--T-G----------T--GGAA-AC---------TAT-T-----A-TA--TACGTAGCT-CA-GCA-GT-A--GT-A-AAA----A-T--C-
gi|112752                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AT-G-----G-TG--T---G--TT-CA-GCA-AG-A--GG-T-TTACCTTA-CTAC-C-A-TT-A-TA-T-TATTTT--T-CA--AC-A--TCAG-GTTACC-G-A---TTCTTT-TC-A-TG-----CGTTT-----TCAC-GATT-GA-TTG-A-T--A-A---TA------C-TATTC-GAGG-TAG-ATTAA-T-TTCTT-GCG-GTG----TAATTCTTTTG-TTTGTT-G-AAGCGATTGTTGCTGGGT--C-AC-----A-A-A---A-T-CTGTTG-GTT------T---TTTGTTTTTatttctgtgatggtgtgttcagcaagaggtttaccttactaccattatattatttttcaacatcaggttaccgattcttttcatgcgttttcacgattgattgataatactattcgaggtagattaatttcttgcggtgtaattcttttgtttgttgaagcgattgttgctgggtcacaaaatctgttggttttttgtttttttt
gi|112753                     : tgtctgtataatataatgcgtatataatttgattttaattatcatcactaactattgttgcaatgaagtaaacattgggtaacaagttctcacgttttactctgccaagacacgtggattcgaagactcaattctcagagaaggtgcagataaggggtactagtttgtggaaactattatatacgtagctcagcagtagtaaaaatcatttctgtgTGT--C-T--G-TAAAA-A--C--AA--T--G-C----T-T---T------GAA--A--TG--AA--TG----A-ATCAT-A--CC--CATCCTTTGAAA--C-----------TT-T---G-T------T-GC-A-T---G-AA----G------ATG-G-A--T-----A-T-A---ACGTA---T--G--T----CAG-------G-C--G------C-T--T-A-C-T--A-C-G--A--TA--GA-C-AC-G-T-GG-GA-AT-C-A-A-GG-Cttt
gi|112754                     :                                                                                                                                                                                                                                 --G-CAAAA-A--C--AA-AT--G-C----T-T---T------AA---T--TG--AA--TT----A-A--A--T--TT--CAT--------A--C-----------AT-T---G-T------T-GC-A-T---G-AA----G------T
gi|112755                     :                                                                                                                                                                                                                                 --G-TAAAA-A--C--AA-AT----CATAAG-T---G------AAA--TG-TG--AA--CC----A-A--G-----TT--CATGT------A--CT----------AT-G---A-T------C-GC-AAT---A-GATGC-G------TAC-GTC--T--G-A--T-A---AC--A---A--G--T----CAG-------T-C--G--------T--T-A-C-T----C-A--A--AA---A-CAAC-G-T-GG-AACAT-C-A-A-AA-CTA---A--TCTCA----GCCGAA-GTGCGG-AT-AA-T--T-G------------G--
gi|112755                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A-A----------TAT-GTTAACA-TG--T---T--CC-AG-GCA-AG-ACAGGCT-AAC----A-T--C-C-ATAC-A-TA-T-T----TCAT-CACCAC-A--TCG---------------TC-TTT-TC---TA-----T-CTT-----TC---A-TT-AACTTGTA-T--A-AGCTTA------T-AATGACGAGTATA----TTA-T-T--TG-G-G-ATAGTTTTAA----TT---AT---T-G-AA-CA-----TGC--AGTC-C-AC-----ACA-A---A-T-A-------TC------T---TTTTTATTccacatcacccgtgctcaagctctaccagtgtgtgcgtaaaataatttataatctatagaaaacaatatgttaacatgttccaggcaagacaggctaacatccatacatatttcatcaccacatcgtcttttctatctttcattaacttgtataagcttataatgacgagtatattatttgggatagttttaattattgaacatgcagtccacacaaatatcttttttattct
gi|112756                     :                       gtaaaaacaaatcataagtgaaatgtgaaccaagttcatgtactatgatcgcaatagatgcgtacgtctgataacaagtcagtcgttactcaaaaacaacgtggaacatcaaaactaatctcagccgaagtgcggataattggccacatcacccgtgctcaagctctaccagtgtgtgcgtaaaataatttataatctatagaaaacAAAC-A--C--GA-AT--G-C----T-T---T------AAA--A--TG--GACATT----A-A--A-----TT--CAT-----------C-----------AT-T---G-T------T-G--A-T---G-AA----G------TAAAG-A--T--GCGG-T-A---AC--A---G----------CAG-------T-C--G------T-T--T-A-C-T--G-C----A--AA--GA-C-AC-G-TGGG-AA-AT-C-A-A-G----C---G-TTCct
gi|112757                     :                                                                                                                                                                                                                                       AAA-A--C--GA-AT--G-C----------------------T--GG--AA--TT----A-A--A-----TT--CAT--------A--C-----------AT-T---G-T------T-GC-A-T---G-AA----G------TAA-A-A--T--G-GG-T-A---AC--A---ACAG--T----CAG-------T-C--G------T-T--T-A-C-T--G-C-A--A--AA--GA-C-AC-G-T-GG-AA-AT-C-
gi|112758                     :                                                                                                                                                                                                                                       AAA-A--C--GA-AT--G-C-------------------------TG--AA--TT----A-A--A-----TC--C-T--------A--C-----------AT-T---G-T------T-GC-A-TT--G-AA----G------TAA---A--T--G-GG-T-A---AC--A---ACAG--T----CAG-------T-C--G------T-T--TTA-T-T--G-C-A--A--AA--GA-C-AC-G-T-GG-AA-ATAC-A-A-GA-GTC---
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