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Reference ( gi|122556 )       : AAAATAAA----CA-AA--AA-A--C----CGAA-C--AG---TA--TCC----A---A--GA-AGA------AACC------T---CC-A---CAAT----A-AA---AAAAT-A----G-TTT-T----T----CT--GAT---A--T-T--C-AA-T--A--A-T----T---CA-G-T-G---A-A--T---C---AAT--A-T----A--AT-T-T----T-T------C---AT--TTTG-A-----G---A-GCT---AA--A--A--T--A----------AA-A-C--A-AA-CAAC------AA---CATT-TTA-A--AT---A-GG---------T-TCC--G---A-T-T-ACT-T-A-C--GC-------A-T---AG-ATC-TAATC-A--CA-A---G-----A--TTG------A--G---G----TTT--T---TT--T-T--------------------------G--------CA-C---AC--G---TG-C---T----A-TG--CGC-ATGAA--TA-TC------GTT-----G-A-A--CT--------TA---CT------------------G-----AA-----G-AC--AA-A-AA----TCA--AA--G------TA-C---A---------G-----------AA-A--G-T-A---T-C-G---AA-AA-GC--GCT--A--A----AACT-TCG---T---T----TT--T----G-T--CT-ATT-G---------T---GT--A--A-AT---G-T-C---A-A--GG---------AACA---A-C------A-C----GAT---AA---A---A---A-----AG---T---A-CA--T-G--C-----AA-TT-C----TA----T---T-T-CT-------GT-A---A-G--A------AT-G--T-AA--C-A-G----A-----T-A----T-G-GA--A--G-G------GGA----------A-A-A-T-G--T---CCTG--A--A---CA----TC-TTCA------C----C-A--CG---------T-T--GA--A-A-----TAT--------AAA-CT-----T-----T-----TG------T--A-TG-CTG-T---T-G-A-T----A--A-AAG--GAC-CACT--TGGAG---C-TG--GGC--T-TTTT-TT--GT-TGTT-GAT--ATC-TATATA
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gi|122559                     : AAAGTAAA----CA-AA--AA-A--C----CGAG-C--AG---TA--TCC----A---A--GA-AGA------AACC------T---CC-A---CAAT----A-CA---AAA-T-A----G-TTT-T----T----CT--GAT---A--C-T--C-AA-T--A--A-T----T---CA-G-T-G---A-A--T---C---AAT--A-T----A--AT-T-T----T-T------C---AT--TTTG-A-----G---A-CCT---AA--A--A--T--A----------AA-A-C--A-AA-CAAC------AG---CATT-TTA-A--AT---A-GG---------T-TCC--G---A-T-T-ACT-T-A-C--GC-------A-T----G-ATC-TAATC----------------------------------------------T---TT--T-T--------------------------G--------CA-C---AC--A---TG-CATAT----A-TG--CGC-ATAAA--TA-TC------GTT-----G-A-A--CT---------A---CTTTTCATA-----------G-----AA-----G-AC--AA-A-AA----TCA--AA--G------TA-C---T---------A-----------AA-A--G-T-A---T-C-G---AA-AA-GC--GCT--A--A----A-CT-TCG---T---T----TT--T----G-T--CT-ATT-A---------T---GT--A--A-AT---G-T-C---A-A--GG---------AACA---A-C------A-C----GAT---AA---A---A---A-----AG---T---A-CA--T-G--C-----AA-CT-C----TA----T---T-T-CT-------GT-A---A-G--A------AT-G--T-AA--C-A-G----A-----T-A----T-G-GA--A--G-G------GGA----------A-A-A-T-G--T---CCTG--A--A---AC----TC-TTCA------C----C-A--CG---------T-T--GA--A-A-----TAT--------AAA--T-----T-----T-----TG------T--A-TG-CTG-T---T-G-A-T----A--A-AAG--GA--CACT--TGGAGT--T-TG--AGC--T-TTTT-TT--G--GGTT-AAT--ATC-TA
gi|122560                     : AAAATAAA----TA-AA--AA-A--C----TGAA-C--AG---TA--TCC----A---A--GA-AGA------AACC------T---CC-A---CAAT----A-CA---AAA-T-A----G-TTT-T----T----CT--GAT---A--T-T--C-AA-T--A--A-T----T---CA-G-T-G---G-A--T---C---GAT--A-T----A--CT-T-T----T-T----------AT--TTTA-A-----G---A-GCT---AA--A--A--T--A----------AA-A-C--A-AA-CAAC------AA---CATT-TTA-G--AT---A-GG---------T-TCC--G---A-T-T-ACT-T-A-C--GC-------A-T---AG-ATC-TAATC-A--CA-A---GATATAA--TTG------A--G---G------T--T---TT--T-T--------------------------G--------CA-C---AC--G---TG-C---T----A-TG--CGC-ATAAA--TA-TC------GTT-----G-A-A--C---------TA---CT------------------G-----AA-------ACA-AA-A-AA----TCA--AA--G------TA-C---T---------G-----------AA-A--G-T-A---T-C-G---AA-AA-GT--GCT----------AACT-TCG---T---T----TT--T----G-T--C--ATT-A---------T---GT--A--A-AT---G-T-C---A-A--GG---------AACA---A-C------A-C----GAT---AA---A---G---A-----AG---T---A-CA--T-G--C-----AA-TT-C----TA----TTCCT-C-CT-------AT-A---A-G--A------AT-G--T-AA--C-A-T----A-----T-A----T-G-GA--A--G-G------GGG----------A-A-A-T-G--T---GTTG--A--A---AC----TC-TTCA------C----C-A--CG---------T-T--GA--A-A-----TA--------------T-----T-----T-----TG------T--A-TG-CTG-T---T-G-T-T----A--A-AAG--GA--CACT--TGGAGT--C-TG--CGC----TTTT-TT--GT-TGTT-GAT--ATC-TATATA
gi|122561                     : AAAATAAA----TA-AA--AA-A--C----C-AA-C--AG---TA--TCA----A---G--AA-AGA------AACCC-----T---CC-A---CAAT----A-CA---AAAAT-A----G-TTT-T----T----CTT-GAT---A--T-T--C-AA-T--A--A-T----T---CA-G-T-G---A-AATT---C---AAT--A-T----A--AT-T-T----T-T------C---AT--TTTG-A-----G---A-GCTT--AA--A--A--T--A----------AA-A------AA-CAAC------AA---CATT-TTT-A--AT---A-----------------------------ACT-T-A-C--GC-------A-T---AG-AT--TAATC-A--CA-----G-----A--TTG------A--G---G----TTT--T---TT--T----------------------------G--------CA-C---AT--G---TG-C---T----A-TG--CGC-ATATA--AA-TC------GTT-----G-A-A--CT---------A---CT------------------G-----AA-----G-AC--AA-A-AA----TCA--AA--G------TA-C---T---------G-----------AATA--G-T-A---T-C-G---AA-AA-GC--GCT-----A----AACT-TTG---T---T----TT--T----G-T--CT-ATT-A---------T---GT--A--A-AT---GTT-C---A-A--GG---------ACAA---A-C------A-C----AGT---AA---A---A---A-----AG-------A-CA--T-G--C-----AA-TT-C----TA----T---T-T-CT-------GT-A---A-G--A------AT-G--T-AA--CAA-G----A-----T-A----T-G-GA--A--G-GA-----GGG----------A-A-A-T-G--T---CGCG--A--A---C-----TC-TTCA------C----C-A--CG---------T-T--GA--A-A-----TAT--------ATA-CT-----T-----T-----T-------T--A-TG--TG-T---T-G-ATT----A--A-AAG--GA--CACT--TGGAGT--C-TG--CGC--TGTTTTGTT--G--TGTT-GAT--ATC-TATAT
gi|122562                     : AAAGTAAT----CA-CA--AA-A--C----CGAA-G--AG---TA--TCC----A---A--GA-ACA------AACC------T---CT-A---CAAT----A-CA---AAA-T-A----G-TTT-T----TT---CT--GAT---A--T-T--C-AA-T--A--A-T----T---CA-G-T-G---A-A--T---C---ATT--A-T----A--AT-T-T----T-T------C---AT--TTTG-A-----G---A-GCT---AA--A--A--T--A----------AA-A-C--A-----AAC------AA---CATT-TTA-A--AT---A-GG---------T-TCC--G---A-T-T-ACT-T-A-C--GC-------A-T----G-ATC-TAATC-A--CA-A---G-----A--TTG------A--G---G----TTT--TGGGTT--T-TTTGGTTTGTTTGTTTTGGGTTTTTTTG--------CA-C---AC--G---TG-C---T----A-TG--CGC-ATAAA--TA-TC------GTT-----G-A-A--C---------TA---CTTTTTA-------------T-----AA-----GCAC--GG-G-GA----AGA--A-----------A-T---A---------G-----------AA-A--G-T-A---T-CGG---AA-AA-GC--GT------A----AACT-------T---T----TT--G----G-T--TT-TTT-A---------T---GT--A--A-AT---G-T-C---A-A--GG---------AACA---A-C------A-C----GAT---AA---A---A---A-----AG---A---A-C---T-G--C-----AA-CT-C----TA----T---T-T--T-------GT-A---A-G--A------AT-G--T-AAC-C-A-G----A-----T-A----T-G-GA--A--G-G------GG-----------A-A-A-T-G--T----TTG--A--A----A----TC--TCA------C----C-A--AG---------T-T--GA--A-A-----TAT--------AAA-C------T-----T-----TG------T--A--G-CTG-T---T-G-A-T----A--A-AAG-------ACC--TGGAGT--C-TG--CGC--T-TTTTGTT--G---GTT-GAT--ATC-TATATA
gi|122563                     : AAAATAA-----CA-AA--AA-A--C----CGAA-C--AG---TA--TCC----A---A---A-AGA------AACC-----------C-A---CAAT----A-CA---AAACT-A----G-TTT-T----T----CT--GAT---A--T-T--C-AA-T--GCGA-T----T---CA-G-TTG---ATA--T---C---AAT--A-T----A--AT-T-T----T-T------C---AT--TTTGCA-----G---A-GCT---AA--A--A--T--A----------AA-A-CTGA-AA-CAAC------AA---CATT-TTA-A--GT---A-GGGGGGGGGGGT-TCT--A-------T-ACT---A-C--GC-------A-T---AT-ATC-TAATC-A--CA-GT--G-----A--T-G------A--G---G----TTT--T---TT--T-G--------------------------GGC------CA-C---AC--CAACTG-C---T----A-T---CGC-A-GAAAGTA-TC------GTT-----G-ATA--CT---------A---CT------------------G-----CA-----A-AC--AA-ATAA----TCA--GA--G------AG-T---A---------ATT---------GA-A--G-T-A---T-C-G---AA-A--GC--GCT--A--A------CT-TCG---TGT-T----TT--T----G-T--CT-ATT-A---------T---GT--A--A-A----G-T-C---A-A--G----------AACA---AAC------A-C----GAT---AA---A---AGAAA-----AG---T---A-CAA-T-G--C-----AA-TT-C----CT----T---T-T-CT-------GT-A---ACG--A------AT-G--T-AA--C-A-G----A-----T-A----T-G-GA--A----G------GGA----------A-A-A-TGG--T---CCTA--G--A---AA----TC-TTCA------C----C-A---G---------T-T--GA--A-A-----TAT--------AA---------------T-----TG------T--A-TG-CTG-TGA-T-G-A-C-------A-AAG--GACACATT--TGGA
gi|122564                     : AAAGTAAA----CA-AA--AA-A--C-------G-C--AG---CA--TTC----C---A--GA-AGA------A-CC------T---CC-A---CA-T----A-CA---AA--T-A----G-TTT-T----T----CT--GAT---A--T-T--C-AA-TTAA--A-T----T---C--G-T-G---A-A--T---C---AAT----T----A--AT-T-T----T-T------C---AT--TTTG-A-----G---A-GTA---AA--A--A--T--A----------A-------T-AA-CAAC------A-----ATT-TTA-A--AT---A-GA---------T-TCC--G---A---T-A-T-T-A-C--GCT------A-T----G-ATC-TA--C-A--TATA---G-----A--TTG------G--G---------TT--C---TG--T-T--------------------------G--------CAGC---AC--G---TG-C---TAGTAA-TG---GC-AT-----CA-TC------GTT-----G-ACA--C---------TA---CTTTTTA-------------G-----CA-----G-AC--AACA-AA----TCA--AA--G------AT-C---T---------G-----------AA------T-A---T-C-G---AA-AA-GC--GCT-----A----AACT-TC--------T----TT--T----G-T--CT-ATT-A---------T---GTA-A--A-AT---G-T-C-----A--GG---------AACA---A-C------A------GAT---AA---A---A---AG----AA---T---A-CA--T-G--G-----AA-CT------------T---T-T-CT-------GT-A---A-G--A---------G--T-AA----A-G----A-----T-A----T-G-GA--A--G-G------GG-----------A-A-A-T-G--T----CTG--A--A---AC----TC-TTCA-----------C-A--CG---------T-T--GA--A-A-----T-T--------AA---C-----T-----T-----TG------T--A-TGCCTG-T---T-G-A-T----A--A------GAC---CT--TGGGT---C-T----GC--C-TTTT-TT--G--TGTT---T--TTC-TATATA
gi|122566                     : AAAATATA----CA-ACTTAA-A--C----CGAA-C--AG---TA--TTCCCCAA---A--AA-AGA------AACC------T---CC-A---CAAA----ATAC---AAAAT-A----G-TTT-T----TAT--CT--GATTATA--T-T--CCAA-TC-A--A-T----T---CA-G-T-GTAGA-A--TTGTC---AAT--A-C----A--AC-T-TATA-TGT------C---AT--TTTG-ATAC--G---A--CT---AA--A--AAAT--A----------AA-A-C--ACAA-CAAA------AAACACATT-TTA-ATGAT---A-GGAC-------T-TCC--GCGGA-T-T-ACT-T-A-C--GCCCTATGCA-C---AG-ATC-TATTC-A--CA-A---G-----A--TTGATTTGAA--A---A----TTTGAT---TT--TAT--------------------------GTCGTAACCTA-C---AC--G---TG-A---T----A-CAATCTCTATAAA--TA-TCCAGCGTATTGA---G-A-A--C---------TA---CT------------------T-----AAGC---G-AC---A-A-AA----TAAACAA--G------TA-C---A---------G-----------AA-A--G-T-ATC-T-C-G---AA-AATACA-GCTC-A--A----ACCT-TCG---T---T----TT--TTCCGA-T--CTAATT-GA--------TG--GT--AAGA-AT---G-T-CTATA-G--AGTTTCAC---AACA---A-CTAACTGA-C-----AT---AA---A---A---AACGATAG---G---A-CA--A-T--C-----AATTT-C----TA----T---T-C-CT-------GT-A---A-GTAG------ATAA--T-AA--C-A-AT---A-----TAA----T-G-GA--A--G-GATTCTAGGA----------A-ACA-T-G--C---CCTG--A--AAAGCACTACTA-TCCA------C----T----CGATACTGTCTT-T--GA--G-AATTCCTAT--------AA---C-----T-----T-----TG------TAGA-TG-GTGTT---T-G-ACT----AAGA-AAG--GACACA-T--CGGAGT--C-TG--CGC----TTTT-TT--GT-TGTT-GAT--ATC-TATATA
gi|122565                     : AAAATAAA----CA-AA--AA-A--AAAAACGAA-C--AG---TA--TCC----A---A--GA-CGA------AACC------T---CC-A---CAAT----A-CA---AAATT------G-TTT-T----T----CT--GAT---A--T-T--C-AA-T--A--A-T----T---CA-G-T-G---A-A--T---C---AAT--A-T----G--AT-T-T----T-T------C---AT--TTTG-A-----G---A-GCT---AA--A--A--G--A----------AA-A-C--A-AA-CGAC------A-------T-TTA-A--AT---A-GG---------T-TCC--G---A-T-T-ACT-T-A-C--GC-------A-T---AG-
gi|122567                     : AAAGTAAA----CA-AA--AA-A--C----CGAA-C--AT---TA--TCG----A---A--GA-AGA------AACC------T---CC-A---CAAT------AC---AAAAT-A----G-TTT-T----TAGAGCT--GAT---A--T-T--C-AA-T-----A-T----T---TA-G-T-G--------T---C---AATGAA-T-------AT-T-T----T-TCA----C---AT--TTTG-A-----G---A-GCT---AA--A--A--T--A----------AA-A-C----AA-CAAC------AA---CATT-TTA-A--AT---C-GG---------T-TCC--G---A-T-T-ACT-T-A-----C-------A-T---AG-
gi|122569                     : AAAAAAAC----CA-AA--AA-A--A----AAAC-C--AG---TA--TCC----A---A--GA-AGA------AACC------T---TC-A---CAAT----A-GA-------T-A----G-TCT-T----T----CT--G----------------------------------------T-G---A-A--T---C---AAT--A-T----AT-AT-T-T----T-T------TTTAAT--TTTG-A-----G---A-GCT---AA--A--A--T--A----------AA-A-C--A-AA-CAAT------AC---C--------A--GT---A-GG---------T-TTC--G---A-T-T-ACT-T-A-C--GC-------A-T----G-ATC-TAATC-A--CA-A---G-----A--TTG------A--G---G----GTT--T---TT--T-
gi|122568                     : AAAGTAAA----CA-AA--AA-A--C-----AAA-C--AG---CA--TTC----A---A--GA-AGA------AACT------T---AC-C---CAAC----A-CA---AAA-T-A----G-TTT-T----T----CT--GAT---A--T-T--C-AA-T--A--A-T----T---GG-G-T-G---A-A--T---C---AAT--A-T----A--AT-T-T----T-T------T----T--TTTT-A-----GCTAA-AAT---AA--A--A--T--A----------AA-A-C--A-AA-CAAC------AA---CATT-TTT-A--AT---A-GG---------T-TTC--A---A-T-T-CAT-T-A-C--GC-------A-T----T-CTC-TAATC-A--
gi|122570                     : AAAGTAAA----CA-AA--AA-A--C----CGAG-C--AG---TA--TC-----A---A--GA-AGA------ACCCCGAAGTT---CC-A--------------------AAT-A----G-TTT-T----T----CT--GAT---A--CAT--C-AA-T--T--A-C----TTTACA-G-T-G---A-A--T---C---AAT--A-T----A--AT-T-TGTATT-T------C---AT--TTTG-A-----G---AAGCT---ATTTATTA--TCAA----------AG-A-C--A-AA-CAAC------AT-----TT-TTA-A--AT---A-GG---------T-TCC--G---A-T-TTACG-T-A-CA-GC-------A-T----G-ATC--AATC-A--CA-A---G-----A--TTG------G--GTTGG----GTT--T---TT--T-T--------------------------G--------
gi|122572                     : AAAA-AAA----CA-AA--A--A--C----CGAA-C--AG---TA--TCC----A---A--GA-AGA------AACC------TC--CC-A---CAAT------AC---AAAAT-A----GTTTT-T----T----CT--GAT---A--T-T--C-AA-CTAA--A-T----T---CATGCT-G---A-A--T---CA--AAT--A-T----A--
gi|122573                     : AAAGTAAA----CA-AA--AA----C----CGAAGC--AGC--TT--TCC----A---A----------------CT------TT--CC-G---AAAT----A-AC---AAAAT-A----G-TTC-T----T----CT--GAT---A--T-T--C-CA-G--A--A-TA---T---TA-G-T-G---A-A--T---A---AAG--AGC----A--AT-T-T----T-G------A---AT--TTTT-A-----G---A-GCT---CA--A--A--T--A----------AACA-C--A-A
gi|122571                     : AAAGTAAA----GA-AG--AA-A--C----CAAA-C--AG---TA--ATC----A---T--GA-AAA------AACT------T---CC-G----AAC----G-CA---CAA-T-A----G-TTT-T----TTT--CT--GGA---A--A-T--C-AA-T--A--A-T----T---TA-G-T-C---A-A--T---C---AAG--A-T----
gi|122574                     :  AAATAAA----CA-AA--AA-AACC----CGA--C--AG---TA--TCA----A---ACGGA-AGA--------CC------T---CC-AA--CAAT----A-CA---AA--T-A----G-TTT-T----T----AT--T-T---A--T-T--C-AAGT--A--A-T----TT--CA-GCT-G---A-A--T---C---AAT--A-T----A--AT-T-T----T-T------C---AT--TT-G-A-----A---A-GCT---AC--A--A--T--A----------AA-AAC--A-AAACAACCA----AA---CATT-TTG-A--AT---A-GG---------C-TCC--G---A-T-T-ACT-TTA-C--GC-------A-T---AGGATC-TAATC-A--CA-A---G-----A--TTT------A--G---G----TTT--T---TT--T----------------------------G--------CA-C---AC--G---TG-C---T----A-TG--CGA-ATAAA--TA-TG------GTT-----G-A-A--CT---------A---CT------------------G-----AA-----G-CA--AA-A-AA----TCA--AA--G------TAGC---T---------G-----------AA-A--G-T-A---TTC-G---AA-AT-GCCGGCT--A--C----AACT-TCG---T---T----TT--T----G-T--CT-ATT-A---------T---GT--A--A-AT---G-T-C---A-A--GG---------AACA---A-C------A-C----GAT---AA---A---A---A-----CGAT-T---A-CA--A-G--C-----AA-TT-C----TA----T---T-T-CT-------GT-A---A-G--A------AT-G--T-AA--C-A-G----AT----T-G----T-G-GA--AAGG-G------GAA----------A-A-A-T-G--T---CCTG--A--A---AC----TC-TTCA-----------C-A--TG---------T-T--GA--A-A-----TAT--------TAA-AA-----T-----T-----TG------T--A-TG-CTG-T---T-G-A-T----T--A-AAG--GA--CACC--TGGAGTC-C-TG--CGCTAT-TTTT-TT--TT-TGTT-GAT--ATT-TATATA
gi|122575                     :  AAATAAAAACTCA-AA--AA-AA-C----CGAA-C--AG---TAGTTCC----A---A--GG-AGACAAATAAATT------TTTGCC-AAACCAAT----A-AC---GAGAT-AATAGG-TTTAT----T----CT--GAT---A--T-TTTC-AA----A--A-TATCGT---CA-G-T-G---A----T---C---AAT--A-T----ATAAT-TGT----T-T------C---AT--TTTG-A-----G---AAGCT---AA--A--A--T--AC---------AA-A-C--A-AA-CAAC------AA---CATTGTTATA--AT---A-GG---------CGTTC--G---A-TAT-CCTAT-AAC--AC-------AAT---AG-ATC-TAATC-AACCA-A---G-----AGTTTG------AATG---G----TTT--TTT-TT--T-T--------------------------G--------CA-C---AC--G---TG-C---T----A-TG--CGC-ATAAA--TATTC------GTT-----GTT-A--CC--------TAAC-CT------------------G-----AA-----G-ACAAAA-A-AA----TCA--AA--G------TA-CTTTG---------A-----------AA-G--G-T-A---T-C-GATTAG-AA-GC--GCTTAA--A----AACT-TCGTTTT---T----TT--T----G-T--CC-A-T-A---------T---GT--A--A-AT---G-TCC---A-A--GG---------AACAT--A-C------AGCA---GATCCCAC---A---A---A----------T---ATCAAGT-G--C-----AA-TT-C----TA----T---T-T-CT-------G------A-G--A------AT-G--TAAA--C-A-T----ATT---T-A----T-G-GC--A--A-A------GAC----------A-A-A-T-G--T---CCTG--A--G---AA-----C-TCCA------CTTCGC-AACCG---------T-A--GAC-A-A-----TAT--------AAA-C------T-----T-----TG------T--ATTG-CTG-T---T-G-A-TAA--A--A-AAG--GA--CACT--TGGAGT--C-TG--CGC--T-ATTT-T
gi|122576                     :      AAA----GA-AA--AA-A--C-----GAA-CGAAG---TA--TCCCGC-A---A--GA-GAG------AATC------T---CCGA---CAAG----T-AC---AAAAT-A----G-GTT-T----T----CTGAGAT---AAGT-T--C-AAGT--A--A-T----T---GC-G-T-G---A-A--T---CGAGAGTG-A-T----A--AG-G-T----G-T------CAG-ATTATTTG-GGGAATG---A-GCCTAAAA--A--A--T--A----------AA-A-C--A-AA-CA--------AA---TATT-TGA-AC-AT---AGGG---------T-TTC--G---G-A-C-ACT-T-A-CAGAC-------A-TTGAGG-ATCATAATCAA--CA-ATAGA-----A--TTG------A--A---G----TGT--T---TG--T-T--------------------------G--------C
gi|122577                     :       AA----CATAA--AATA--C----CGAA-G--AAGTATA--TCC----ACAAA--GACAGA------AACC------T---CC-A---CAATTCCTA-AATACAAAATTA----G-TTT-T---------CT--GATG--A--T-T--C-AAAT--A--A-TA---T---CA-GAT-G---A-A--T---T---AAT--A-TTATCA--ATATAT----T-T------C---AT--TTTG-A-----G---A-GCT---AA--A--A--T--AAGTGAATGGGAG-A-C--A-AATCAACAACCCAAA---CATT-TAA-A--ATTAAA-GG---------T-TTCAGG---ATT-T-ACT-C-A-
gi|122578                     :                                  A-C--AG---CG--TTT----A---A--GA-AGA------AACT------T---CC-C---CAGT----A-CA---AAA-T-A----G-TTT-TTTTTT----CT--GAT---A--T-T--C-AA-T--A--A-T----T---CA-G-T-G---A-A--T---C---AAG--A-TC---A--AT-T-T----T-TAATTAAA---AT--TCTT-A-----C---A-GCT---AA--A--A--T--A----------AA-A-C--A-AA-CAAT------AG---CATatacggcaatgtttttagtatgttttgagagatcgtaaaacgttatgaatctcaagattgagggtgtttttttacttgcacctaaccagtggctaatacgaaatacaactgaaaacgaacattaaataaagattaaggagttgatacatgtagataagaaaacgtaatttcgaagaaatgcgaactaacttcgtttttgtctttatgtaatgtcaagtgcggacggcaaacaacgcacaagtagagtttggagtatatatagcgcgaaaataaaaaaaaaagtgtcaagttttaaagcaatttctatttctgtaaaatccaaaatgtaatccagatatgagaagacggagccgtgaacaaagtgttaccctgataactctccaagtgcactaacgttttgaataattaaaaggaaaactttggtatgctataaatgaataaagaaaagacgacctcttatggagtctgacggtttattttgttgttggatatcttatata
gi|122579                     :                                                                                                                                                                       -T----T---CA-G-T-G---A-A--T---C---AAT--A-T----A--AT-T-T----T--------C---AT--TTTT-A-----T---A-GCT---AA--A--A--T--A----------AA-A-C--A-AA-CAAC------AA---CATT-TT--A--CT---A-GG---------T-TCC--T---A-T-T-CCT-T-A-C--GC-------A-T----T-TTC-TAATC-A--CA-A---G-----A--TTA------AG-G---G----TTT--T---TT--T-C--------------------------GA-------CA-C---AC--G---TG-C---T----A-TC--CGC-ATGAA--TA-TC------GTTTCAAGG-A-A-------------------------------------G-----AA-----G-AC---A-A-AA----TCA--AA--G------TA-C---T---------G-----------AA-A--G-T-A---T-C-G---AA-AA-GC--GCT-----A----AACT-TCG---GAAAG----TT--T----G-T--GT-ATT-A---------T---GT--A--A-AA---G-T-C---A-A--GG---------AACA---A-C------A-
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gi|122577                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aacataaaataccgaagaagtatatccacaaagacagaaacctccacaattcctaaatacaaaattagttttctgatgattcaaataatatcagatgaattaatattatcaatatatttcattttgagagctaaaataagtgaatgggagacaaatcaacaacccaaacatttaaaattaaaggtttcaggatttactcaatacggcaatgtttttagtatgttttgagagatcgtaaaacgttatg-G--C-----AA-T-TTC----TA----T---T-T-CT-------GT-A---A-A--ATCCAAAAT-G--T-AATCC-A-G----A-----T-A----T-GAGA--A--G-AC-----GGAGCCGTGAACAA-A-G-T-G--TTACCCTGATA-------ACT---CTCCAAGTGCACT-AACG---------T-TTTGA--A-T-----AATTAAAAGGAAAA-CT-----T-----T-----GG------T--A-TG-CTA-TAAAT-GAA-T--AAAGA-AAA-GA-CGAC--CTCTTATGGA-------GT--CTGACGG--T-TTATT-T-T--GT-T-GTTGGAT--ATCTTATATAtgcggacggcaaacaacgcacaagtagagtttggagtatatatagcgcgaaaataaaaaaaaaagtgtcaagttttaaagcaatttctatttctgtaaaatccaaaatgtaatccagatatgagaagacggagccgtgaacaaagtgttaccctgataactctccaagtgcactaacgttttgaataattaaaaggaaaactttggtatgctataaatgaataaagaaaagacgacctcttatggagtctgacggtttattttgttgttggatatcttatata
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Reference ( family-508 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAAGTAAAC---A-AA--AA-A--C----CGAA-C--AG---TA--TCC----A---A--GA-AGA------AACC-T---CC-A---CAA--T--------A-CAAAA--ATAG-TTT-T----T----CT--GAT---A--T-T--C-AA-T--A--A-T----T---CA-G-T-G---A-A--T---C---AAT--A-T----A--AT-T----T---T-T------C---AT--TTTG-A-----G---A-GCT---A---A-AA--T--A----------AA-A-C--A-AA-CAAC------AA---CATT-TTA-A--AT---A-GG---------T-TCC--G---A-T-TACT-T-A-C--GC-------A-T---A-G-ATC-TAATC-A--CA-A---G-----A--TTG------A--GG----TTT--T---TT--T-T--------------------------G--------CA-C---AC--G---TG-C---T----A-TG--CGC-ATAAA-TA-TC------GTT-----G--A-A--C-T-A------------CT------------------G-----AA-----G-AC--AA-A-AA----TCA--AA--G------TA-C-------T--GA---------A-A--GT-A---T-C-G---AA-AA-GC--GCT--A--A----AACT-TCG---T---T----TT--T----G-TC---T-A------TT-AT-----GT--A--A-AT---G-T-C---A-AGG---------AACA-A-C-----A-C----G--AT---AA---A---A---A-----AG---T---A-CA--T-G--C-----AA-T-T-C----TA----T---T-T-CT-------GT-A---A-G--A------AT-G--T-AA--C-A-G----A-----T-A----T-G-GA--A--G-G------GGA----------A-A-A-T-G--T---CCTGA-A-------ACT---CTTCA------CC-A-CG---------T-T--GA--A-A-----TAT--------AAA-CT-----T-----T-----TG------T--A-TG-CTG-T---T-G-A-T--A---A-AAG-GA-C-AC--T-----TGGA-------GT--CTG-CGC--T-TT-TT-T-T--GT-T-GTT-GAT--ATC-TATATA
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gi|122577                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aacataaaataccgaagaagtatatccacaaagacagaaacctccacaattcctaaatacaaaattagttttctgatgattcaaataatatcagatgaattaatattatcaatatatttcattttgagagctaaaataagtgaatgggagacaaatcaacaacccaaacatttaaaattaaaggtttcaggatttactcaatacggcaatgtttttagtatgttttgagagatcgtaaaacgttatg-G--C-----AA-T-TTC----TA----T---T-T-CT-------GT-A---A-A--ATCCAAAAT-G--T-AATCC-A-G----A-----T-A----T-GAGA--A--G-AC-----GGAGCCGTGAACAA-A-G-T-G--TTACCCTGATA-------ACT---CTCCAAGTGCACT-AACG---------T-TTTGA--A-T-----AATTAAAAGGAAAA-CT-----T-----T-----GG------T--A-TG-CTA-TAAAT-GAA-T--AAAGA-AAA-GA-CGAC--CTCTTATGGA-------GT--CTGACGG--T-TTATT-T-T--GT-T-GTTGGAT--ATCTTATATAtgcggacggcaaacaacgcacaagtagagtttggagtatatatagcgcgaaaataaaaaaaaaagtgtcaagttttaaagcaatttctatttctgtaaaatccaaaatgtaatccagatatgagaagacggagccgtgaacaaagtgttaccctgataactctccaagtgcactaacgttttgaataattaaaaggaaaactttggtatgctataaatgaataaagaaaagacgacctcttatggagtctgacggtttattttgttgttggatatcttatata
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .   .  .   . .  .       . .   .    .    .    .   .   .   .         . .    . .     .  .        . A   C     .   . .    T     .    .   .  . .  .  GT   .  . .    .    . . . .   . .  .   .     .  . .    .   . .    .   . CAG         .     . .     .   .   .   .   .  .  .  .           . . .  .  .    .      G       .   . .   .   .  .         .   .  .   . .    . . . .   .       . A     .   .     . .   . .   .     .    AATGGT            .  .    .  . GA                                   . .    .  .    . .   .    .  .    .     .  .  .        .     .  . .  . . CTTTTTA                          .      .     .  .   . .  .      .   .  .       . .       .   .         . .   . .   . . .    .  .  .    AACT          .   .   AAAT      .  .    .  .   A         .  .      T  .  .  .   . . .   .   TT           . . .     . .    .  T     .   .   .   A      TAA     .  A  . .  .      . . . TTA        .   . .  .        . .   . GG         . .  .  .  . . .    .     . .    . .  .  .  . .       G           . . . . .  .       . .         C       .       . .  T           .   .  . .       .         GCATAAA                .      .  .  .   . .   . . T    .   .   .  . .  T           .        .    .   T     .  . . .   . .   .   .    .
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .   .  .   . .  .       . .   .    .    .    .   .   .   .         . .    . .     .  .        . A   A     .   . .    .     .    .   .  . .  .  AT   .  . .    .    . . . .   . .  .   .     .  . .    .   . .    .   . A           .     . .     .   .   .   .   .  .  .  .           . . .  .  .    .      A       .   . .   .   .  .         .   .  .   . .    . . . .   .       . A     .   .     . .   . .   .     .    AGGT              .  .    .  . G                                    . .    .  .    . .   .    .  .    .     .  .  .        .     .  . .  . . ACCT                             .      .     .  .   . .  .      .   .  .       . .       .   .         . .   . .   . . .    .  .  .    AA            .   .   GTT       .  .    .  .   A         .  .      .  .  .  .   . . .   .   .            . . .     . .    .  T     .   .   .   A      T       .  G  . .  .      . . . TA         .   . .  .        . .   . A          . .  .  .  . . .    .     . .    . .  .  .  . .       A           . . . . .  .       . .         C       .       . .  T           .   .  . .       .         ACTTT                  .      .  .  .   . .   . . T    .   .   .  . .  T           .        .    .   T     .  . . .   . .   .   .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .   .  .   . .  .       . .   .    .    .    .   .   .   .         . .    . .     .  .        . A   A     .   . .    .     .    .   .  . .  .  T    .  . .    .    . . . .   . .  .   .     .  . .    .   . .    .   . C           .     . .     .   .   .   .   .  .  .  .           . . .  .  .    .      A       .   . .   .   .  .         .   .  .   . .    . . . .   .       . A     .   .     . .   . .   .     .    AGGT              .  .    .  . G                                    . .    .  .    . .   .    .  .    .     .  .  .        .     .  . .  . . CTA                              .      .     .  .   . .  .      .   .  .       . .       .   .         . .   . .   . . .    .  .  .    AA            .   .   TTG       .  .    .  .   A         .  .      .  .  .  .   . . .   .   .            . . .     . .    .  T     .   .   .   A      T       .  .  . .  .      . . . TA         .   . .  .        . .   . A          . .  .  .  . . .    .     . .    . .  .  .  . .       A           . . . . .  .       . .         C       .       . .  T           .   .  . .       .         AAATT                  .      .  .  .   . .   . . T    .   .   .  . .  T           .        .    .   T     .  . . .   . .   .   .    .
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Reference ( family-508 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAAGTAAAC---A-AA--AA-A--C----CGAA-C--AG---TA--TCC----A---A--GA-AGA------AACC-T---CC-A---CAA--T--------A-CAAAA-T-A----G--TTT-T----T----CT--GAT---A--T-T--C-AA-T--A--A-T----T---CA-G-T-G---A-A--T---C---AAT--A-T----A--AT-T----T---T-T------C---AT--TTTG-A-----G---A-GCT---A---A-AA--T--A----------AA-A-C--A-AA-CAAC------AA---CATT-TTA-A--AT---A-GG---------T-TCC--G---A-T-TACT-T-A-C--GC-------A-T---A-G-ATC-TAATC-A--CA-A---G-----A--TTG------A--GG----TTT--T---TT--T-T--------------------------G--------CA-C---AC--G---TG-C---T----A-TG--CGC-ATAAA-TA-TC------GTT-----G--A-A--C-T-A------------CT------------------G-----AA-----G-AC--AA-A-AA----TCA--AA--G------TA-C-------T--GA---------A-A--GT-A---T-C-G---AA-AA-GC--GCT--A--A----AACT-TCG---T---T----TT--T----G-TC---T-A------TT-AT-----GT--A--A-AT---G-T-C---A-AGG---------AACA-A-C-----A-C----G--AT---AA---A---A---A-----AG---T---A-CA--T-G--C-----AA-T-T-C----TA----T---T-T-CT-------GT-A---A-G--A------AT-G--T-AA--C-A-G----A-----T-A----T-G-GA--A--G-G------GGA----------A-A-A-T-G--T---CCTGA-A-------ACT---CTTCA------CC-A-CG---------T-T--GA--A-A-----TA-T--------AAA-C-T-----T------TG-T--A-T--G-CT---G-T---T---GA-T--A--A-A---AG-GA-CA----C--TT--GGA-------GT--CTG-CGC--T-TT-TT-T-T--GT-T-GTT-GAT--ATC-TATATA
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gi|122577                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aacataaaataccgaagaagtatatccacaaagacagaaacctccacaattcctaaatacaaaattagttttctgatgattcaaataatatcagatgaattaatattatcaatatatttcattttgagagctaaaataagtgaatgggagacaaatcaacaacccaaacatttaaaattaaaggtttcaggatttactcaatacggcaatgtttttagtatgttttgagagatcgtaaaacgttatg-G--C-----AA-T-TTC----TA----T---T-T-CT-------GT-A---A-A--ATCCAAAAT-G--T-AATCC-A-G----A-----T-A----T-GAGA--A--G-AC-----GGAGCCGTGAACAA-A-G-T-G--TTACCCTGATA-------ACT---CTCCAAGTGCACT-AACG---------T-TTTGA--A-T-----AA-TTAAAAGGAAAA-C-T-----T------TGGT--A-T--G-CT---A-TAAAT---GAAT--A--A-AGAAAA-GA-CGACCTC--TTATGGA-------GT--CTGACGG--T-TTATT-T-T--GT-T-GTTGGAT--ATCTTATATAtgcggacggcaaacaacgcacaagtagagtttggagtatatatagcgcgaaaataaaaaaaaaagtgtcaagttttaaagcaatttctatttctgtaaaatccaaaatgtaatccagatatgagaagacggagccgtgaacaaagtgttaccctgataactctccaagtgcactaacgttttgaataattaaaaggaaaactttggtatgctataaatgaataaagaaaagacgacctcttatggagtctgacggtttattttgttgttggatatcttatata
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