lowQualScore : 000 0 0 0 0
lowQualScore : ... . . . .
lowQualScore : 777 4 8 4 8
consensus : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
Reference ( gi|64858 ) : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64856 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64855 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64879 : GCACCTGATCCCACCTCTGATGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64876 : GCACCTGATCCTACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64859 : GCACCTAATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64907 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64905 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64904 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64903 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64902 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64901 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64900 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64899 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64897 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64896 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64895 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64890 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64928 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGATTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64926 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTATGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64923 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGATTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64922 : GCACCTGATCCCACCTCAGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64921 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGATTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64954 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACC---CTT-G-TT-T-T
gi|64953 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCGACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64951 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTC-G-TT-T-T
gi|64943 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGAAGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64942 : GCACCTGATCCCACTTCTGGTGTGTCCAAGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64941 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGAGTCCGTGTTTACCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64983 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTACCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64980 : GCACCTGATCCCATCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64978 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGATCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64977 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTATGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64975 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGAGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64974 : GCACCTAATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64971 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGTCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64970 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTATGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64969 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTATGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64968 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTATTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64965 : GCACCTGATCCCACCTCTGATGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64964 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTATGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64960 : GCACCTGATCCCACCTCTGATGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64958 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTATGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64957 : GCACCTGATCCCACCTCTGATGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64955 : GCACCTGATCCCACTTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64944 : GCACCTGATCCCACATCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TG
gi|64867 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-A-TT-T-T
gi|64865 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64864 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|65004 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAATT---CTT-G-TT-T-
gi|64992 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-CTAT-TGT
gi|65008 : GCACCTGATTCCACCTCTGGTTTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|65006 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTTCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-GCTT-T-TGT
gi|65000 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTATGCCCAGCT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64993 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCAAGGGGTCCGTGTTTACCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64874 : GCACCTGATCCCAACTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64872 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCTTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64871 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGTGTTTGCCCAACT---CTT-GCTT-T-TGT
gi|65003 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCAAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64956 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCAAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64935 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTTTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64875 : GCACCAGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64889 : GCACCTGATCTCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCATGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64883 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGAGTCTGTGTTTGCCCAATT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64880 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGAGTCCGTGTTTACCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64914 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTATTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64988 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCTGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-C-TT-T-TGT
gi|64918 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTC-G-GT-T-TGT
gi|64927 : GCACCTGATCCCACCTCTAGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-
gi|64920 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGCGTTTGCCCAACT---CTTCA-TT-T-TGT
gi|64931 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGGTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64925 : GCACCTAATCCAACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64940 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGTGATTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64939 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGATTGCCCAACT---CTT-A-TT-T-T
gi|64934 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGATTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64932 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGTGATTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64946 : GCATCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGCGTTTGCCCAATT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64863 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGTCCAGCT---CTT-A-TT-T-TGT
gi|64989 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATC-AGGGGTCCGTGTTTGCCTAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64987 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGG-CTGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64986 : GCACCTAATCCCACCTCTGGTATATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64985 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTTCAGAGGTCTGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64984 : GCACCTGATCCCATCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCTAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|65002 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTTCAGTGGTCTGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-CT-T-TGT
gi|64995 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTATACCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-TATGT
gi|65009 : GCATCTGATCCCACCTCTGGTGTATCAAGGGGTCCGTGTTTGTCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|65017 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTTCAGGGGTCTGTGATTGCCCAATT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|65014 : GTACCAGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGATCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-A-TT-T-TGT
gi|65013 : GCACCTGATCCCACCTCTGTTG-ATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64998 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCTAGGGGTCCGTGTTGGCCCAACT---TTC-A-TT-T-TGT
gi|64916 : GCACCTGATCTCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCTGTGTTTGCCCAGCTTGACTT-A-TT-T-TGT
gi|65304 : CACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTATTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|65305 : CACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|65307 : CACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-CG
gi|65313 : CACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-TATGT
gi|65316 : CACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTTCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-CT-T-TGT
gi|65314 : CACCTGATCCCACCTCTAGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT---TT-T-TGT
gi|65359 : ACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|65358 : ACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-
gi|65360 : ACCTGATCCCACTTTTGGTGTATCCAGGGGTCCGTATTTGCCCAACT---CTT-A-TT-T-TGT
Alignments
lowQualScore : 000 0 0 0 0
lowQualScore : ... . . . .
lowQualScore : 777 4 8 4 8
consensus : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
Reference ( family-50 ) : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64855 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64856 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64858 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64859 : GCACCTAATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64863 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGTCCAGCT---CTT-A-TT-T-TGT
gi|64864 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64865 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64867 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-A-TT-T-T
gi|64871 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGTGTTTGCCCAACT---CTT-GCTT-T-TGT
gi|64872 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCTTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64874 : GCACCTGATCCCAACTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64875 : GCACCAGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64876 : GCACCTGATCCTACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64879 : GCACCTGATCCCACCTCTGATGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64880 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGAGTCCGTGTTTACCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64883 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGAGTCTGTGTTTGCCCAATT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64889 : GCACCTGATCTCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCATGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64890 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64895 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64896 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64897 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64899 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64900 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64901 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64902 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64903 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64904 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64905 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64907 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64914 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTATTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64916 : GCACCTGATCTCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCTGTGTTTGCCCAGCTTGACTT-A-TT-T-TGT
gi|64918 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTC-G-GT-T-TGT
gi|64920 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGCGTTTGCCCAACT---CTTCA-TT-T-TGT
gi|64921 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGATTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64922 : GCACCTGATCCCACCTCAGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64923 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGATTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64925 : GCACCTAATCCAACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64926 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTATGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64927 : GCACCTGATCCCACCTCTAGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-
gi|64928 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGATTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64931 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGGTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64932 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGTGATTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64934 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGATTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64935 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTTTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64939 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGATTGCCCAACT---CTT-A-TT-T-T
gi|64940 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGTGATTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64941 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGAGTCCGTGTTTACCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64942 : GCACCTGATCCCACTTCTGGTGTGTCCAAGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64943 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGAAGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64944 : GCACCTGATCCCACATCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TG
gi|64946 : GCATCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGCGTTTGCCCAATT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64951 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTC-G-TT-T-T
gi|64953 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCGACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64954 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACC---CTT-G-TT-T-T
gi|64955 : GCACCTGATCCCACTTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64956 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCAAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64957 : GCACCTGATCCCACCTCTGATGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64958 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTATGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64960 : GCACCTGATCCCACCTCTGATGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64964 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTATGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64965 : GCACCTGATCCCACCTCTGATGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64968 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTATTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64969 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTATGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64970 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTATGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64971 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGTCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64974 : GCACCTAATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64975 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGAGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64977 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTATGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64978 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGATCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64980 : GCACCTGATCCCATCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64983 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTACCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64984 : GCACCTGATCCCATCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCTAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64985 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTTCAGAGGTCTGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64986 : GCACCTAATCCCACCTCTGGTATATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64987 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGG-CTGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64988 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCTGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-C-TT-T-TGT
gi|64989 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATC-AGGGGTCCGTGTTTGCCTAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64992 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-CTAT-TGT
gi|64993 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCAAGGGGTCCGTGTTTACCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64995 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTATACCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-TATGT
gi|64998 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCTAGGGGTCCGTGTTGGCCCAACT---TTC-A-TT-T-TGT
gi|65000 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTATGCCCAGCT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|65002 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTTCAGTGGTCTGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-CT-T-TGT
gi|65003 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCAAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|65004 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAATT---CTT-G-TT-T-
gi|65006 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTTCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-GCTT-T-TGT
gi|65008 : GCACCTGATTCCACCTCTGGTTTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|65009 : GCATCTGATCCCACCTCTGGTGTATCAAGGGGTCCGTGTTTGTCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|65013 : GCACCTGATCCCACCTCTGTTG-ATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|65014 : GTACCAGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGATCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-A-TT-T-TGT
gi|65017 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTTCAGGGGTCTGTGATTGCCCAATT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|65304 : CACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTATTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|65305 : CACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|65307 : CACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-CG
gi|65313 : CACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-TATGT
gi|65314 : CACCTGATCCCACCTCTAGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT---TT-T-TGT
gi|65316 : CACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTTCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-CT-T-TGT
gi|65358 : ACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-
gi|65359 : ACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|65360 : ACCTGATCCCACTTTTGGTGTATCCAGGGGTCCGTATTTGCCCAACT---CTT-A-TT-T-TGT
Alignments
lowQualScore : 000 0 0 0 0
lowQualScore : ... . . . .
lowQualScore : 777 4 8 4 8
consensus : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
Reference ( family-50 ) : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64855 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64856 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64858 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64859 : GCACCTAATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64863 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGTCCAGCT---CTT-A-TT-T-TGT
gi|64864 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64865 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64867 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-A-TT-T-T
gi|64871 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGTGTTTGCCCAACT---CTT-GCTT-T-TGT
gi|64872 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCTTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64874 : GCACCTGATCCCAACTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64875 : GCACCAGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64876 : GCACCTGATCCTACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64879 : GCACCTGATCCCACCTCTGATGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64880 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGAGTCCGTGTTTACCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64883 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGAGTCTGTGTTTGCCCAATT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64889 : GCACCTGATCTCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCATGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64890 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64895 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64896 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64897 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64899 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64900 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64901 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64902 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64903 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64904 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64905 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64907 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64914 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTATTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64916 : GCACCTGATCTCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCTGTGTTTGCCCAGCTTGACTT-A-TT-T-TGT
gi|64918 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTC-G-GT-T-TGT
gi|64920 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGCGTTTGCCCAACT---CTTCA-TT-T-TGT
gi|64921 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGATTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64922 : GCACCTGATCCCACCTCAGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64923 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGATTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64925 : GCACCTAATCCAACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64926 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTATGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64927 : GCACCTGATCCCACCTCTAGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-
gi|64928 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGATTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64931 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGGTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64932 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGTGATTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64934 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGATTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64935 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTTTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64939 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGATTGCCCAACT---CTT-A-TT-T-T
gi|64940 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGTGATTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64941 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGAGTCCGTGTTTACCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64942 : GCACCTGATCCCACTTCTGGTGTGTCCAAGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64943 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGAAGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64944 : GCACCTGATCCCACATCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TG
gi|64946 : GCATCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGCGTTTGCCCAATT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64951 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTC-G-TT-T-T
gi|64953 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCGACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64954 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACC---CTT-G-TT-T-T
gi|64955 : GCACCTGATCCCACTTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64956 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCAAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64957 : GCACCTGATCCCACCTCTGATGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64958 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTATGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64960 : GCACCTGATCCCACCTCTGATGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64964 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTATGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64965 : GCACCTGATCCCACCTCTGATGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64968 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTATTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64969 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTATGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64970 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTATGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64971 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGTCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64974 : GCACCTAATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64975 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGAGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64977 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTATGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64978 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGATCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64980 : GCACCTGATCCCATCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64983 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTACCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64984 : GCACCTGATCCCATCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCTAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64985 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTTCAGAGGTCTGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64986 : GCACCTAATCCCACCTCTGGTATATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64987 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGG-CTGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64988 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCTGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-C-TT-T-TGT
gi|64989 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATC-AGGGGTCCGTGTTTGCCTAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64992 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-CTAT-TGT
gi|64993 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCAAGGGGTCCGTGTTTACCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64995 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTATACCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-TATGT
gi|64998 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCTAGGGGTCCGTGTTGGCCCAACT---TTC-A-TT-T-TGT
gi|65000 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTATGCCCAGCT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|65002 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTTCAGTGGTCTGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-CT-T-TGT
gi|65003 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCAAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|65004 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAATT---CTT-G-TT-T-
gi|65006 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTTCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-GCTT-T-TGT
gi|65008 : GCACCTGATTCCACCTCTGGTTTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|65009 : GCATCTGATCCCACCTCTGGTGTATCAAGGGGTCCGTGTTTGTCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|65013 : GCACCTGATCCCACCTCTGTTG-ATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|65014 : GTACCAGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGATCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-A-TT-T-TGT
gi|65017 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTTCAGGGGTCTGTGATTGCCCAATT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|65304 : CACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTATTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|65305 : CACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|65307 : CACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-CG
gi|65313 : CACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-TATGT
gi|65314 : CACCTGATCCCACCTCTAGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT---TT-T-TGT
gi|65316 : CACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTTCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-CT-T-TGT
gi|65358 : ACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-
gi|65359 : ACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|65360 : ACCTGATCCCACTTTTGGTGTATCCAGGGGTCCGTATTTGCCCAACT---CTT-A-TT-T-TGT
blockSeqCons :
originalCons : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
finalCons : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
Alignments
lowQualScore : 000 0 0 0 0
lowQualScore : ... . . . .
lowQualScore : 777 4 8 4 8
consensus : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
Reference ( family-50 ) : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64855 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64856 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64858 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64859 : GCACCTAATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64863 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGTCCAGCT---CTT-A-TT-T-TGT
gi|64864 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64865 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64867 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-A-TT-T-T
gi|64871 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGTGTTTGCCCAACT---CTT-GCTT-T-TGT
gi|64872 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCTTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64874 : GCACCTGATCCCAACTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64875 : GCACCAGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64876 : GCACCTGATCCTACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64879 : GCACCTGATCCCACCTCTGATGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64880 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGAGTCCGTGTTTACCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64883 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGAGTCTGTGTTTGCCCAATT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64889 : GCACCTGATCTCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCATGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64890 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64895 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64896 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64897 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64899 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64900 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64901 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64902 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64903 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64904 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64905 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64907 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64914 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTATTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64916 : GCACCTGATCTCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCTGTGTTTGCCCAGCTTGACTT-A-TT-T-TGT
gi|64918 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTC-G-GT-T-TGT
gi|64920 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGCGTTTGCCCAACT---CTTCA-TT-T-TGT
gi|64921 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGATTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64922 : GCACCTGATCCCACCTCAGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64923 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGATTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64925 : GCACCTAATCCAACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64926 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTATGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64927 : GCACCTGATCCCACCTCTAGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-
gi|64928 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGATTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64931 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGGTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64932 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGTGATTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64934 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGATTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64935 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTTTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64939 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGATTGCCCAACT---CTT-A-TT-T-T
gi|64940 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGTGATTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64941 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGAGTCCGTGTTTACCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64942 : GCACCTGATCCCACTTCTGGTGTGTCCAAGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64943 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGAAGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64944 : GCACCTGATCCCACATCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TG
gi|64946 : GCATCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCTGCGTTTGCCCAATT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64951 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTC-G-TT-T-T
gi|64953 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCGACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64954 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACC---CTT-G-TT-T-T
gi|64955 : GCACCTGATCCCACTTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64956 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCAAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64957 : GCACCTGATCCCACCTCTGATGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64958 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTATGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64960 : GCACCTGATCCCACCTCTGATGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64964 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTATGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64965 : GCACCTGATCCCACCTCTGATGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64968 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTATTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64969 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTATGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64970 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTATGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64971 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGTCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64974 : GCACCTAATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64975 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGAGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64977 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTATGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64978 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGATCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64980 : GCACCTGATCCCATCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64983 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTACCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64984 : GCACCTGATCCCATCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCTAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64985 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTTCAGAGGTCTGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64986 : GCACCTAATCCCACCTCTGGTATATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64987 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGG-CTGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|64988 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCTGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-C-TT-T-TGT
gi|64989 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATC-AGGGGTCCGTGTTTGCCTAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64992 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-CTAT-TGT
gi|64993 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCAAGGGGTCCGTGTTTACCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|64995 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTATACCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-TATGT
gi|64998 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCTAGGGGTCCGTGTTGGCCCAACT---TTC-A-TT-T-TGT
gi|65000 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTATGCCCAGCT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|65002 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTTCAGTGGTCTGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-CT-T-TGT
gi|65003 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCAAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|65004 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAATT---CTT-G-TT-T-
gi|65006 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTTCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-GCTT-T-TGT
gi|65008 : GCACCTGATTCCACCTCTGGTTTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|65009 : GCATCTGATCCCACCTCTGGTGTATCAAGGGGTCCGTGTTTGTCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|65013 : GCACCTGATCCCACCTCTGTTG-ATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|65014 : GTACCAGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGATCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-A-TT-T-TGT
gi|65017 : GCACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTTCAGGGGTCTGTGATTGCCCAATT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|65304 : CACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTATTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-TGT
gi|65305 : CACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|65307 : CACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-CG
gi|65313 : CACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-TATGT
gi|65314 : CACCTGATCCCACCTCTAGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT---TT-T-TGT
gi|65316 : CACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTTCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-CT-T-TGT
gi|65358 : ACCTGATCCCACCTCTGGTGTATCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-
gi|65359 : ACCTGATCCCACCTCTGGTGTGTCCAGGGGTCCGTGTTTGCCCAACT---CTT-G-TT-T-T
gi|65360 : ACCTGATCCCACTTTTGGTGTATCCAGGGGTCCGTATTTGCCCAACT---CTT-A-TT-T-TGT