lowQualScore : 1111 33
lowQualScore : 77 1 11 1 333 22 1 2 222222 3333333 1 1 2 7777 2 9999 2 1111 2 2 2 2 33 33 5 66 55 2 2 2 2 2 2 44 6666 3 00
lowQualScore : .. . .. . ... .. . . ...... ....... . . . .... . .... . .... . . . . .. .. . .. .. . . . . . . .. .... . ..
lowQualScore : 44 0 33 0 000 33 0 0 888888 2222222 0 0 2 6666 5 7777 5 6666 5 5 5 5 44 44 0 55 99 5 5 5 5 5 7 22 5555 1 33
consensus : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-CTAACAA--TAAAAA
Reference ( gi|128794 ) : GTCAAAGACAA-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--T-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-GTTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-CTAACAAT-TAAAAA
gi|128793 : GTCAAAAACAG-AA-ATGGCTGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-ATAACAA--TAAAAA
gi|128795 : GTCAAAGACAG-AA-ATAGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAG----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCAAGCT--TTC-T-ATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TTTTAAAAATA-CTAACAA--TAAAA
gi|128796 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGA--AA-A-TGCCGGTA-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCCCACT--TTC-T-ATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-CTAGCAAT-
gi|128797 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTG--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--C------AT-AA-AA----TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGG--CC-ATT-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-CTAACAA--TAAAaacaa
gi|128798 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--GA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-GAT-AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGG--CC-TTC-AAGG-AT-GC-T
gi|128799 : GTCAAAGACAG-AA-ATGACCGGT--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTCAAT----GAA-ATT--C-ATA-AAT-CA-AA-T--ATCACCAATTT--TTT-TCATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----ATATA-CTATCAA--CAAAAA
gi|128800 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGACGGA--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--C---------------------------ATG-AAT-AA-AA-T--TTCATCAAACT--TTC-T-GTTGT--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ACA--TT----AAATA-CTAACAA--TAAAAA
gi|128802 : GTCAAAGACAATAA-ATG--CGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------AAATATAAT-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GT---C-ATGTAAT-AATAA-T--TT-ACCAAACT--TCC-T-GTTGG--CC-TTATTAGGCAT-GC-TT-ATACTTT----AAATA-CTATCAA--TAAAAA
gi|128801 : GTCCAAGACAG-AA-ATGACCGGG--T-T---GCTGC--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA----TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-AAA-AA-AA-A--TTCACCACACT--TTC-T-ATTGG--CC-TCA-TTGG----CC-TT-AT
gi|128807 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128806 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128805 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128804 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128810 : GTCAAAGACAT-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128809 : GTCAAAGACGG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128803 : GTCAAAAACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128813 : GTAAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128812 : GTCAAAGACAG-AA-ATGTCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128815 : GTCTAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128814 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AT-A-T------A-------T-GT-Tctaggtcgagtaaacaggaataagtttc
gi|128808 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGC--AG--T-T---GCTGT--AATT-T------A-------T-CG-TGATTTCCTA----TT-TGTTGTATTGA-GGA-GTA--C-ATG-AATGAA-AA-TACTTCTTCAAATCAGGTC-T-ATTGGACTC-TTT-CAGG-ATCGCATT-TTA--TC----CATTA-C-AAAAATGTAAA
gi|128816 : GTCAAAGACAG-AA-A-GGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-Ttacaaa
gi|128817 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-TCA-GCTGT--AA-A-T------A-------T-CT-TA--TT-CTA--
gi|128811 : GTCAAAGACAT-AA-ATGGCCGGG----T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128818 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--TGT---GCTGT--AA-A-A------A-------T-GT-T
gi|128819 : GTCAAAGACAG-AATATGGCCGGG--T-T---GCTGTAAAA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128821 : GTCAAAGACAG-AA-ATGACAGGG--T-T---ACTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128820 : GTCAAAGACAG-AA--TGTCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128822 : GTCAATGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A--------A-------T-GT-T
gi|128825 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGA--G-T---GCTGT--AA-ATT------A-------T-GT-CGGT
gi|128824 : GTTAAAGACAG-AA-ATGGCCGGGTTT-T---GCTGTC-AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128823 : GTCACAGACAG-AA--TGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-ATATG--TT-CTA--
gi|128826 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCC-GG--T-T---GCTGG--AA-A-T------A-------T-GA-TGGT
gi|128828 : TCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T--T-AGA-TT-CTA----TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--T-ATG-A---AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGG--CCTTTA-CAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-CTAATAAT-CAAAA
gi|128827 : TCAAAAACAG-AA-ATGGT-GGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTT-AAT----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGGC-CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-ATCATAA---AAAAA
gi|128829 : TCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-Ta
gi|128830 : CAAAGAAAG-AA-ATGGCCTGG--T-T---GCTAT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TA-TGTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AT-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTAG--CA-TTA-TAGG-GT-GC-TT-ATG--TT----ATACAGTTAAC
gi|128831 : CAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-----GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT--TA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-ATA--CGATG-AAT-AA-CA-T--TTCACCAAACG--TTT-T-ATT-G--CC-TTT-TAGG-AT-GC-TT-TTA--AT----AAATC-CTAAAAA
gi|128832 : CAAAGACAG-AA-ATGGCCAGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-Taa
gi|128833 : AAGAAAAGAA-ATGGCCTGG--T-T---GCTAT--AA-A-A------A-------T-GT-TGATTT-CTA--TATTATGTTGAAT----GAAGGTA--C-ATG--AT-AA-AT-T--TTCACCAAACT--TTCTT-ATTAG--CA-TTA-TAGG--T-GC-TT-
gi|128834 : A-AG-ATGGCCGCG--T-TTATGCTGT--AA-AAT------A-------TTGT-TGATTT-CTGACC-TT-TGTTGAATTTTTAAT-GTAAGC-AAG-AAT-AA-AAAT--TTCCACAAACT--TTCCT-ATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TTAATA--TT----GAATA-CT-ACAA--CAAAAA
Alignments
lowQualScore : 1 1 11 1 333 22 1 1 222222 3333333 1 1 2 7777 2 8888 2 33 2 2 2 2 2 33 33 4 2 55 2 2 2 2 2 2 33 6666 2 3
lowQualScore : . . .. . ... .. . . ...... ....... . . . .... . .... . .. . . . . . .. .. . . .. . . . . . . .. .... . .
lowQualScore : 0 9 33 0 000 33 0 9 777777 1111111 0 0 0 7777 2 6666 2 11 2 2 2 2 2 11 22 7 4 66 4 4 4 4 4 5 99 1111 9 1
consensus : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-CTAACAA-TAAAAA
Reference ( family-498 ) : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-CTAACAA-TAAAAA
gi|128793 : GTCAAAAACAG-AA-ATGGCTGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-ATAACAA-TAAAAA
gi|128794 : GTCAAAGACAA-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--T-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-GTTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-CTAACAATTAAAAA
gi|128795 : GTCAAAGACAG-AA-ATAGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAG----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCAAGCT--TTC-T-ATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TTTTAAAAATA-CTAACAA-TAAAA
gi|128796 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGA--AA-A-TGCCGGTA-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCCCACT--TTC-T-ATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-CTAGCAA-TAACAA
gi|128797 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTG--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--C------AT-AA-AA----TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGG--CC-ATT-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-CTAACAA-TAAA
gi|128798 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--GA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-GAT-AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGG--CC-TTC-AAGG-AT-GC-T
gi|128799 : GTCAAAGACAG-AA-ATGACCGGT--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTCAAT----GAA-ATT--C-ATA-AAT-CA-AA-T--ATCACCAATTT--TTT-TCATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----ATATA-CTATCAA-CAAAAA
gi|128800 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGACGGA--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA----------------------------C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCATCAAACT--TTC-T-GTTGT--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ACA--TT----AAATA-CTAACAA-TAAAAA
gi|128801 : GTCCAAGACAG-AA-ATGACCGGG--T-T---GCTGC--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT--GTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-AAA-AA-AA-A--TTCACCACACT--TTC-T-ATTGG--CC-TCA-TTGG----CC-TT-AT
gi|128802 : GTCAAAGACAATAA-ATG--CGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------AAATATAAT-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GT---C-ATGTAAT-AATAA-T--TT-ACCAAACT--TCC-T-GTTGG--CC-TTATTAGGCAT-GC-TT-ATACTTT----AAATA-CTATCAA-TAAAAA
gi|128803 : GTCAAAAACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128804 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128805 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128806 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128807 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128808 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGC--AG--T-T---GCTGT--AATT-T------A-------T-CG-TGATTTCCTA----TT-TGTTGTATTGA-GGA-GTA--C-ATG-AATGAA-AA-TACTTCTTCAAATCAGGTC-T-ATTGGACTC-TTT-CAGG-ATCGCATT-TTA--TC----CATTA-C-AAAAA-TGTAAA
gi|128809 : GTCAAAGACGG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-Ttacaaa
gi|128810 : GTCAAAGACAT-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128811 : GTCAAAGACAT-AA-ATGGCCGGG----T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128812 : GTCAAAGACAG-AA-ATGTCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128813 : GTAAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128814 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AT-A-T------A-------T-GT-T
gi|128815 : GTCTAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-G------TT-CTA-------GGTCGAGT----AA----A--C-AGG-AAT--A-AG-T--TTC
gi|128816 : GTCAAAGACAG-AA-A-GGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128817 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-TCA-GCTGT--AA-A-T------A-------T-CT-TA--TT-CTA--
gi|128818 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--TGT---GCTGT--AA-A-A------A-------T-GT-T
gi|128819 : GTCAAAGACAG-AATATGGCCGGG--T-T---GCTGTAAAA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128820 : GTCAAAGACAG-AA--TGTCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128821 : GTCAAAGACAG-AA-ATGACAGGG--T-T---ACTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128822 : GTCAATGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A--------A-------T-GT-T
gi|128823 : GTCACAGACAG-AA--TGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-ATATG--TT-CTA--
gi|128824 : GTTAAAGACAG-AA-ATGGCCGGGTTT-T---GCTGTC-AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128825 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGA--G-T---GCTGT--AA-ATT------A-------T-GT-CGGT
gi|128826 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCC-GG--T-T---GCTGG--AA-A-T------A-------T-GA-TGGT
gi|128827 : TCAAAAACAG-AA-ATGGT-GGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTT-AAT----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGGC-CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-ATCATAA-AAAAAA
gi|128828 : TCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T--T-AGA-TT-CTA----TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--T-ATG-A---AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGG--CCTTTA-CAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-CTAATAA-TCAAAA
gi|128829 : TCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128830 : CAAAGAAAG-AA-ATGGCCTGG--T-T---GCTAT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TA-TGTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AT-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTAG--CA-TTA-TAGG-GT-GC-TT-ATG--TT----ATACAGTTAAC
gi|128831 : CAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-----GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT--TA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-ATA--CGATG-AAT-AA-CA-T--TTCACCAAACG--TTT-T-ATT-G--CC-TTT-TAGG-AT-GC-TT-TTA--AT----AAATC-CTAA-----AAAAA
gi|128832 : CAAAGACAG-AA-ATGGCCAGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128833 : AG-AA-ATGGCCTGG--T-T---GCTAT--AA-A-A------A-------T-GT-TGATTT-CTA--TATTATGTTGAAT----GAAGGTA--C-ATG--AT-AA-AT-T--TTCACCAAACT--TTCTT-ATTAG--CA-TTA-TAGG--T-GC-TT-
gi|128834 : aagaaaAG-AAGATGGCCGCG--T-TTATGCTGT--AA-AAT------A-------TTGT-TGATTT-CTGACC-TT-TGTTGAATTTTTAAT-GTAAGC-AAG-AAT-AA-AAAT--TTCCACAAACT--TTCCT-ATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TTAATA--TT----GAATA-CT-ACAA-CAAAAA
Alignments
lowQualScore : 1 1 11 1 333 22 1 1 222222 3333333 1 1 2 7777 2 8888 2 33 2 2 2 2 2 33 33 4 2 55 2 2 2 2 2 2 33 6666 2 3
lowQualScore : . . .. . ... .. . . ...... ....... . . . .... . .... . .. . . . . . .. .. . . .. . . . . . . .. .... . .
lowQualScore : 0 9 33 0 000 33 0 9 777777 1111111 0 0 0 7777 2 6666 2 11 2 2 2 2 2 11 22 7 4 66 4 4 4 4 4 5 99 1111 9 1
consensus : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-CTAACAA-TAAAAA
Reference ( family-498 ) : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-CTAACAA-TAAAAA
gi|128793 : GTCAAAAACAG-AA-ATGGCTGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-ATAACAA-TAAAAA
gi|128794 : GTCAAAGACAA-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--T-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-GTTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-CTAACAATTAAAAA
gi|128795 : GTCAAAGACAG-AA-ATAGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAG----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCAAGCT--TTC-T-ATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TTTTAAAAATA-CTAACAA-TAAAA
gi|128796 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGA--AA-A-TGCCGGTA-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCCCACT--TTC-T-ATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-CTAGCAA-TAACAA
gi|128797 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTG--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--C------AT-AA-AA----TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGG--CC-ATT-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-CTAACAA-TAAA
gi|128798 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--GA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-GAT-AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGG--CC-TTC-AAGG-AT-GC-T
gi|128799 : GTCAAAGACAG-AA-ATGACCGGT--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTCAAT----GAA-ATT--C-ATA-AAT-CA-AA-T--ATCACCAATTT--TTT-TCATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----ATATA-CTATCAA-CAAAAA
gi|128800 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGACGGA--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA----------------------------C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCATCAAACT--TTC-T-GTTGT--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ACA--TT----AAATA-CTAACAA-TAAAAA
gi|128801 : GTCCAAGACAG-AA-ATGACCGGG--T-T---GCTGC--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT--GTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-AAA-AA-AA-A--TTCACCACACT--TTC-T-ATTGG--CC-TCA-TTGG----CC-TT-AT
gi|128802 : GTCAAAGACAATAA-ATG--CGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------AAATATAAT-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GT---C-ATGTAAT-AATAA-T--TT-ACCAAACT--TCC-T-GTTGG--CC-TTATTAGGCAT-GC-TT-ATACTTT----AAATA-CTATCAA-TAAAAA
gi|128803 : GTCAAAAACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128804 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128805 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128806 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128807 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128808 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGC--AG--T-T---GCTGT--AATT-T------A-------T-CG-TGATTTCCTA----TT-TGTTGTATTGA-GGA-GTA--C-ATG-AATGAA-AA-TACTTCTTCAAATCAGGTC-T-ATTGGACTC-TTT-CAGG-ATCGCATT-TTA--TC----CATTA-C-AAAAA-TGTAAA
gi|128809 : GTCAAAGACGG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-Ttacaaa
gi|128810 : GTCAAAGACAT-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128811 : GTCAAAGACAT-AA-ATGGCCGGG----T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128812 : GTCAAAGACAG-AA-ATGTCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128813 : GTAAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128814 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AT-A-T------A-------T-GT-T
gi|128815 : GTCTAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-G------TT-CTA-------GGTCGAGT----AA----A--C-AGG-AAT--A-AG-T--TTC
gi|128816 : GTCAAAGACAG-AA-A-GGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128817 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-TCA-GCTGT--AA-A-T------A-------T-CT-TA--TT-CTA--
gi|128818 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--TGT---GCTGT--AA-A-A------A-------T-GT-T
gi|128819 : GTCAAAGACAG-AATATGGCCGGG--T-T---GCTGTAAAA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128820 : GTCAAAGACAG-AA--TGTCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128821 : GTCAAAGACAG-AA-ATGACAGGG--T-T---ACTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128822 : GTCAATGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A--------A-------T-GT-T
gi|128823 : GTCACAGACAG-AA--TGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-ATATG--TT-CTA--
gi|128824 : GTTAAAGACAG-AA-ATGGCCGGGTTT-T---GCTGTC-AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128825 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGA--G-T---GCTGT--AA-ATT------A-------T-GT-CGGT
gi|128826 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCC-GG--T-T---GCTGG--AA-A-T------A-------T-GA-TGGT
gi|128827 : TCAAAAACAG-AA-ATGGT-GGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTT-AAT----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGGC-CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-ATCATAA-AAAAAA
gi|128828 : TCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T--T-AGA-TT-CTA----TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--T-ATG-A---AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGG--CCTTTA-CAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-CTAATAA-TCAAAA
gi|128829 : TCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128830 : CAAAGAAAG-AA-ATGGCCTGG--T-T---GCTAT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TA-TGTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AT-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTAG--CA-TTA-TAGG-GT-GC-TT-ATG--TT----ATACAGTTAAC
gi|128831 : CAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-----GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT--TA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-ATA--CGATG-AAT-AA-CA-T--TTCACCAAACG--TTT-T-ATT-G--CC-TTT-TAGG-AT-GC-TT-TTA--AT----AAATC-CTAA-----AAAAA
gi|128832 : CAAAGACAG-AA-ATGGCCAGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128833 : AG-AA-ATGGCCTGG--T-T---GCTAT--AA-A-A------A-------T-GT-TGATTT-CTA--TATTATGTTGAAT----GAAGGTA--C-ATG--AT-AA-AT-T--TTCACCAAACT--TTCTT-ATTAG--CA-TTA-TAGG--T-GC-TT-
gi|128834 : aagaaaAG-AAGATGGCCGCG--T-TTATGCTGT--AA-AAT------A-------TTGT-TGATTT-CTGACC-TT-TGTTGAATTTTTAAT-GTAAGC-AAG-AAT-AA-AAAT--TTCCACAAACT--TTCCT-ATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TTAATA--TT----GAATA-CT-ACAA-CAAAAA
blockSeqs : T TT TAT AA T GCCGGT AATATAA C ACC A TTTT G AG G T G T A AC AG T C AC T T C C A A CT TTAA G T
blockSeqs : G . CA C A . . . TA . TGA . . . . . . . . . C . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-CTAACAA-TAAAAA
finalCons : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-CTAACAA-TAAAAA
Alignments
lowQualScore : 1 1 11 1 333 22 1 1 222222 3333333 1 1 2 7777 2 8888 2 33 2 2 2 2 2 33 33 4 2 55 2 2 2 2 2 2 33 6666 2 3
lowQualScore : . . .. . ... .. . . ...... ....... . . . .... . .... . .. . . . . . .. .. . . .. . . . . . . .. .... . .
lowQualScore : 0 9 33 0 000 33 0 9 777777 1111111 0 0 0 7777 2 6666 2 11 2 2 2 2 2 11 22 7 4 66 4 4 4 4 4 5 99 1111 9 1
consensus : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-CTAACAA-TAAAAA
Reference ( family-498 ) : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-CTAACAA-TAAAAA
gi|128793 : GTCAAAAACAG-AA-ATGGCTGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-ATAACAA-TAAAAA
gi|128794 : GTCAAAGACAA-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--T-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-GTTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-CTAACAATTAAAAA
gi|128795 : GTCAAAGACAG-AA-ATAGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAG----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCAAGCT--TTC-T-ATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TTTTAAAAATA-CTAACAA-TAAAA
gi|128796 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGA--AA-A-TGCCGGTA-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCCCACT--TTC-T-ATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-CTAGCAA-TAACAA
gi|128797 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTG--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--C------AT-AA-AA----TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGG--CC-ATT-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-CTAACAA-TAAA
gi|128798 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--GA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-GAT-AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGG--CC-TTC-AAGG-AT-GC-T
gi|128799 : GTCAAAGACAG-AA-ATGACCGGT--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTCAAT----GAA-ATT--C-ATA-AAT-CA-AA-T--ATCACCAATTT--TTT-TCATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----ATATA-CTATCAA-CAAAAA
gi|128800 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGACGGA--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA----------------------------C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCATCAAACT--TTC-T-GTTGT--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ACA--TT----AAATA-CTAACAA-TAAAAA
gi|128801 : GTCCAAGACAG-AA-ATGACCGGG--T-T---GCTGC--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT--GTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-AAA-AA-AA-A--TTCACCACACT--TTC-T-ATTGG--CC-TCA-TTGG----CC-TT-AT
gi|128802 : GTCAAAGACAATAA-ATG--CGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------AAATATAAT-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-GT---C-ATGTAAT-AATAA-T--TT-ACCAAACT--TCC-T-GTTGG--CC-TTATTAGGCAT-GC-TT-ATACTTT----AAATA-CTATCAA-TAAAAA
gi|128803 : GTCAAAAACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128804 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128805 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128806 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128807 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128808 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGC--AG--T-T---GCTGT--AATT-T------A-------T-CG-TGATTTCCTA----TT-TGTTGTATTGA-GGA-GTA--C-ATG-AATGAA-AA-TACTTCTTCAAATCAGGTC-T-ATTGGACTC-TTT-CAGG-ATCGCATT-TTA--TC----CATTA-C-AAAAA-TGTAAA
gi|128809 : GTCAAAGACGG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-Ttacaaa
gi|128810 : GTCAAAGACAT-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128811 : GTCAAAGACAT-AA-ATGGCCGGG----T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128812 : GTCAAAGACAG-AA-ATGTCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128813 : GTAAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128814 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AT-A-T------A-------T-GT-T
gi|128815 : GTCTAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-G------TT-CTA-------GGTCGAGT----AA----A--C-AGG-AAT--A-AG-T--TTC
gi|128816 : GTCAAAGACAG-AA-A-GGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128817 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-TCA-GCTGT--AA-A-T------A-------T-CT-TA--TT-CTA--
gi|128818 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--TGT---GCTGT--AA-A-A------A-------T-GT-T
gi|128819 : GTCAAAGACAG-AATATGGCCGGG--T-T---GCTGTAAAA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128820 : GTCAAAGACAG-AA--TGTCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128821 : GTCAAAGACAG-AA-ATGACAGGG--T-T---ACTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128822 : GTCAATGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A--------A-------T-GT-T
gi|128823 : GTCACAGACAG-AA--TGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-ATATG--TT-CTA--
gi|128824 : GTTAAAGACAG-AA-ATGGCCGGGTTT-T---GCTGTC-AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128825 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGA--G-T---GCTGT--AA-ATT------A-------T-GT-CGGT
gi|128826 : GTCAAAGACAG-AA-ATGGCC-GG--T-T---GCTGG--AA-A-T------A-------T-GA-TGGT
gi|128827 : TCAAAAACAG-AA-ATGGT-GGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TT-TGTT-AAT----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGGC-CC-TTA-TAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-ATCATAA-AAAAAA
gi|128828 : TCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T--T-AGA-TT-CTA----TT-TGTTGAAT----GAA-GTA--T-ATG-A---AA-AA-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTGG--CCTTTA-CAGG-AT-GC-TT-ATA--TT----AAATA-CTAATAA-TCAAAA
gi|128829 : TCAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128830 : CAAAGAAAG-AA-ATGGCCTGG--T-T---GCTAT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT-CTA--T-TA-TGTTGAAT----GAA-GTA--C-ATG-AAT-AA-AT-T--TTCACCAAACT--TTC-T-ATTAG--CA-TTA-TAGG-GT-GC-TT-ATG--TT----ATACAGTTAAC
gi|128831 : CAAAGACAG-AA-ATGGCCGGG--T-----GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-TGATTT--TA--T-TT-TGTTGAAT----GAA-ATA--CGATG-AAT-AA-CA-T--TTCACCAAACG--TTT-T-ATT-G--CC-TTT-TAGG-AT-GC-TT-TTA--AT----AAATC-CTAA-----AAAAA
gi|128832 : CAAAGACAG-AA-ATGGCCAGG--T-T---GCTGT--AA-A-T------A-------T-GT-T
gi|128833 : AG-AA-ATGGCCTGG--T-T---GCTAT--AA-A-A------A-------T-GT-TGATTT-CTA--TATTATGTTGAAT----GAAGGTA--C-ATG--AT-AA-AT-T--TTCACCAAACT--TTCTT-ATTAG--CA-TTA-TAGG--T-GC-TT-
gi|128834 : aagaaaAG-AAGATGGCCGCG--T-TTATGCTGT--AA-AAT------A-------TTGT-TGATTT-CTGACC-TT-TGTTGAATTTTTAAT-GTAAGC-AAG-AAT-AA-AAAT--TTCCACAAACT--TTCCT-ATTGG--CC-TTA-TAGG-AT-GC-TTAATA--TT----GAATA-CT-ACAA-CAAAAA