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gi|22533 : TTCCGCAAAATTT--AAACCA-TCGCG-AA---AT---G--CT---TAAAG-TT----A--AAA-A-T--------C-GC--GA-AA-TTTT--AGCCCCGCA-AAATT--AAAGCC-------CTTTACAGTA
gi|22534 : TTACGCGAAATTT--AAACCA-TCGCG-AA---AT---A--CC---AAAGG-AT----A--AAA-A-T--------C-GC--GA-AA-ATTT--AACCCCGCG-AAATT--AAAGCC-------CTTTACAGTA
gi|22535 : TTCCGCGAAATTT--AAACCA-CCGCG-AA---CT---A--CT---GAAAG-AT----A--AAA-A-T--------T-GT--GA-AA-TTTT--AGCCCCACG-AAATT--AAAGCC-------CTCTACAG
gi|22536 : TTCCGCGAAATTT--AAATCA-TCGCG-AA---AT---G--CT---TAAAG-TT----A--AAA-A-T--------C-GC--GA-AA-TTTT--AGCCCCGCG-AAATT--ATAGCC-------CTTTACAGTA
gi|22537 : TTCCGCGAAATT---AAACCAATCGCG-AA---AT---GGTTT---AAAAGTAT----A--TAA-A-T--------C-GC--GA-AAATTTT--AG-CCCGCGAAAATT--AAAGCC-------CTTTACAGTA
gi|22538 : TTCCGCGAAATTT--AAACCA-TCGAG-AA---AT---G--CT---TAAAG-TT----A--AAA-A-T--------C-GC--G--AA-TTTT--AGCCCCGCA-AAATT--AAAGCC-------CTTTACAGTA
gi|22539 : TCTGCGAAATTT--AAACCA-TCGCG-AA---AT---G--CT---GAAAG-AT----A--AAAAA-T--------C-GC--GA-AA-TTTT--AGCCCCGCG-AAATT--AAAACC-------CTTTACAGTA
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gi|22541 : TCTGCGAA-TTA--AAACCA-TCGCA-AA---AT---A--AC----AAAG-AGG---A--AAA-A-T--------C-GCTGAA-AA-TTTT--AGCCCCGCG-AAAGT--AAAGCC-------CCTTACAGTA
gi|22542 : TCCGCGAAATTT--AAACCA-TCGCG-AA---AT---G--CT---AAAAG-AT----A--AAA-A-T--------C-AC--GA-AA-TTTT--AGCCCCACG-AAATT--AAAGCC-------CTTTACAGTA
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gi|22545 : TCCGCGAAATTT--AAACCA-TCGTG-AA---AT---A--CC---GAAAA-AT----A--AAG-A-T--------T-GC--GA-AA-TTTT--AGCGCCGCG-AAATT--AAAGCC-------CTTTACAGTA
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gi|22547 : TCCGCGAAATTT--AAACCA-TAGCA-AA---ATG--A--TT---AAAAG-AT----TTTAAA-A-T--------C-GC--GA-AA-TTTT--AGCCCCGCG-AAATT--AAAGCC-------CATTACAGTA
gi|22548 : CCGTGAAAATT--AAACCA-TCGCG-AA---AT---A--CC---GAAAG-AT----G--GAA-A-T--------C-GC--GA-AA-TTTT--AGCCCCGCG-AATTT--AAAGCC-------CTTT-CAGTA
gi|22549 : CCGCGAAAATT--AAACCA-TTGCG-AA---AT---A--CC---GAAAG-AT----A--GAA-A-T--------C-GC--AA-AA-TTTT--AGCCCCGCG-AAATC--AAAGCC-------CTTTACTGTA
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blockSeqs : . . G . ACCG . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . ACCA . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . G . GCTT . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . A . GCTA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . GCTA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . ACCG . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . ACCA . . . . . . . . . . . . . .
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originalCons : TTCCGCGAAATTT--AAACCA-TCGCG-AA---AT---A--CC---GAAAG-AT----A--AAA-A-T--------C-GC--GA-AA-TTTT--AGCCCCGCG-AAATT--AAAGCC-------CTTTACAGTA
finalCons : TTCCGCGAAATTT--AAACCA-TCGCG-AA---ATGCCG--------AAAG-AT----A--AAA-A-T--------C-GC--GA-AA-TTTT--AGCCCCGCG-AAATT--AAAGCC-------CTTTACAGTA
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22516 ): TTAAAGTCCGCTAAAATAAAACCACGTACCGCAATTAGACCCAATATGAAAAACAGCGAACATCAAGAACTGCAAAATTAAACCCACCTTCAGTA
Unaligned ( gi|22521 ): TGAATTCTGTGAAAATAAAACCACCACAATTAGACTAATATGAAAATCTGTGAACTTTTAGCA
Alignments
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consensus : TTCCGCGAAATTT--AAACCA-TCGCG-A--A---AT---G--CC---GAAA--G-AT----A--AAA-A-T--------C-GC--GA-AA-TTTT--AGCCCCGCG-AAATT--AAAGCC-------CTTTACAGTA
Reference ( family-497 ) : TTCCGCGAAATTT--AAACCA-TCGCG-A--A---AT---G--CC---GAAA--G-AT----A--AAA-A-T--------C-GC--GA-AA-TTTT--AGCCCCGCG-AAATT--AAAGCC-------CTTTACAGTA
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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