lowQualScore                  :                                                                                                444444444444444444444444444               1111111111111111111            1111                                             2                        22222222222222222                                22222222            11111111111                                       
lowQualScore                  :       1   33333  44 33  8888   11   55  222   111 11  33    11 11  33    1 22 1  555  33333333 666666666666666666666666666 1   11   6 2  8888888888888888888 22   1 11  8888  222   3    8888888888888888 2 1 9 33 2  1  3  222   11      0 22 0  00000000000000000  88888 1 111 1   11    11 1 1  00000000 3333   1 1 22222222222 11 444444  1  77  1 6 1  4            
lowQualScore                  :       .   .....  .. ..  ....   ..   ..  ...   ... ..  ..    .. ..  ..    . .. .  ...  ........ ........................... .   ..   . .  ................... ..   . ..  ....  ...   .    ................ . . . .. .  .  .  ...   ..      . .. .  .................  ..... . ... .   ..    .. . .  ........ ....   . . ........... .. ......  .  ..  . . .  .            
lowQualScore                  :       0   66666  33 11  7777   44   00  888   888 44  44    44 44  44    0 44 0  222  66666666 333333333333333333333333333 1   11   3 1  6666666666666666666 55   1 44  7777  999   2    0000000000000000 1 1 5 99 1  1  4  666   33      9 22 9  77777777777777777  99999 0 888 0   44    44 0 0  88888888 8888   2 3 77777777777 99 000000  4  66  4 5 5  8            
consensus                     :  GATTTGTGG---A-AA--A--AT----TGC--TCAA-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A--T-TT--NGC--------A----N---A----T-A-T--CTT-CT-T-TAGG-TCA-T-AC-------CA--A-----T-A--AAT-A--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-CT-CG-AA-AA---TTC--AAAATG-G--C-GG-----C---T-T-T---TG----GC-G---G-CCA--TTTT--G-A-AAN------NA----ATG-C-G-----G-----C--A------AA-AT--TA-ANA-AT-AAATCAGAAAAA
Reference ( gi|64817 )        :  GATTTGTGA---A-AA--A--AT----TGC--TCAG-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A--T-TT--TGC--------A----G---A----T-C-T--CTT-CT-T-TAGG-TCA-T-AC-------CA--A-----T-A--AAT-A--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-CT-CG-AATAA---TTC--AAAATG-G--C-GG-----C---T-T-T---TG----AC-G---G-CCA--TTTT--G-A-AAA------TA----ATG-C-G-----A-----C--A------AA-AT--TA-AGA-AT-AAATCAGAAAAA
gi|64823                      :  GATTTGTGA---A-AAA-A--AT----TGC--TCAG-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A--T-TT--TGC--------A----A---A----T-A-T--CTT-CT-T-TAGG-TTA-T-AC-------CA--A-----T-A--AAT-A--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-CT-CG-AATAA---TTC--AAAATG-G--C-GG-----C---T-T-T---TG----GT-G---G-CCA--TTTT--G-A-AAA------TA----ATG-C-G-----A-----C--A------AA-AT--TA-AGA-AT-AAATCAGGAAAA
gi|64813                      :  GATTTGTGA---A-AA--A--AAAAAATGC--TCAT-CA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A--T-TT--TGC--------A----C---A----T-G-T--CCT-CT-T-TAAG-CCA-T-AC-------CA--A-----T-A--AAT-A--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-AT-CG-AAAAA---CTC--AAAATG-G--C-GG-----C---T-T-T---TG----GC-G---A-CCA--TTTT--T-A-AAT------GA----ATG-C-G-----G-----C--A------AA-AT--TA-ATA-AT-AAATCAGAAAAAaaaaa
gi|64824                      :  GATTTGTGA---A-AAAAA--AT----TGC--TCAG-AT---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-C--T-TT--TGC--------A----C---A----T-G-T--CTT-CT-T-TAGG-CTA-T-AC-------CA--A-----T-A--AAT-T--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-AT-CG----AA---CTC--AAAATG-G--C-GG-----A---T-T-T---TG----GC-G---G-CCA--TTTT--G-A-AAT------AA----ATG-C-G-----G-----C--A------AA-AT--TA-ATA-AT-AAATCAGAA
gi|64828                      :  GATTTGTGA---A-AA--A--AAA---GGC--TCAG-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-AGAT-TG--TAC--------A----T---ACATGT-A-T--CTT-CT-T-TAGG-TCA-T-AC-------CA--A-----T-A--AAT-A--TA----AG---AAG-TGGA----------------T-C-C-A-AT-CG-AATAA---CTC--AAAATG-G--T-GG-----C---T-T-T---TG----GC-G---G-CCA--TTTT--G-A-CAA------TA----ATG-C-G-----A-----C--A------AA-AT--T----A-AT-AAATCAGAAA
gi|64814                      :  GATTGGTGA---A-GG--A--AA----TGC--CCAA-AG---GGT---G--GT--AAAA--G--CA--TGAA-A--T-TT--TGC--------A----C---A----T-A-T--CTT-CT-T-TAGG-TCA-T-AC-------CA--A-----T-A--AAT-A--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-AT-CG-AAAAA---CTC--AAAATG-G--C-GG-----C---T-T-T---TG----GC-G---G-TCA--TTTT--G-A-AGT------GA----ATG-C-G-----G-----C--A------AA-AT--TC-ATA-AT-AAATCAGTAAAAtaa
gi|64816                      :  GATTTGTGA---A-AA--A--AAAA--TGC--T----GA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A--T-TT--TGC--------A----C---A----A-G-T--TTT-CT-T-TAGG-CCA-T-AC-------CA--A-----T-A--AAT-A--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-AT-CG-AAAAA---CTC--AAAATG-G--C-GG-----C---T-T-T---TG----AC-G---G-CCA--TTTT--G-A-AAT------GA----ATG-T-G-----G-----C--A------AA-AT--GA-ATA-AT-AAA
gi|64820                      :  GATTTGTGA---A-AA--A--AA----TGT--TCAT-CA---GGT---C--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A--T-TT--TGC--------A----C---A----T-G-T--CTT-CC-T-TAGG-CCA-T-ACATGTAC-CA--A-----T-A--AAT-A--TT----AG---AAA-TGAG----------------C-C-C-A-AT-CA-AA-AA---CCC--AAAATG-G--C-GG-----C---T-T-T---TG----GT-G---G-CCA--TTTT--G-A-AAT------GA----ATG-A-G-----G-----C--A------AA-AT--TA-ATA-AT-AAATCAGAGAAA
gi|64819                      :  GATTTGTGA---A-AA--ACAAA----TGC--TCAG-AA---GGT---A--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A--T-TT--TGC--------A----C---A----A-A-T--CTT-CT-T-TAGA-TCA-T-AC-------CA--A-----T-A--AAT-A--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-AT-CG-AAAAA---CTC--AAAATG-G--C-GG---------T-T-T---TG----GA-G---G-CCC--TTTT--G-A-AAT------GA----ATA-C-G-----G-----C--A------AA-AC--CA-ATT-AT-AA
gi|64821                      :  GATTTGTGA---A-TA--A--AT-----GC--TCAG-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A--T-TT---GC--------A----C---A----TGC-T--CTT-CT-T--AGG-CCA-T-ACATGTAC-CA--A-----T-A--AAT-A--TT----AG---AAA-TGAG----------------C-C-C-A-AT-CA-AA--A---CCC--AAAATG-G--C-GG-----C---T-T-T---TG----GT-G---G-CCA--TTTT--G-A-AAT------GA----ATG-A-G-----G-----C--A------AA-AT--TA-ATA-AT-AAATCAGAGAAtaaa
gi|64826                      :  GATTTGTGA---A-AA--AGAAA----TGC--TCAT-CA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A--T-TT--GGC--------A----T---A----T-A-T--CTT-CT-T-TTGG-TCA-T-AT-------AA--A-----T-A--AAA-A--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-CT-TC-AAAAA---ATC--AAAATG-G--C-GG-----C---C-T-T---TG----GC-G---G-CCA--TTTT--G-A-ATT------TA----ATG-C-G-----G-----C--A------AA-AT--GT-ATA-GT-AAATCAGACAAAcaa
gi|64827                      :  GATTTGTGA---A-AA--A--AAA---TGC--TCAA-------GT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAT-A--T-TT--TGC--------A----C---A----T-G-T--CT-------------------C-------CA--A-----T-A--AAT-A--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-AT-CG-AAAAA---CTC--AAAACG-G--C-AG-----C---T-T-T---TG----GA-G---G-CCA--TTTT--G-A-AAT------GA----ATG-C-G-----G-----C--A------AA-AT--TG-ATA-AT-AAATCAGAAAaa
gi|64838                      :  GATTTGTGA---A-AA------T----TGC--TCAG-AAC--GGT---G---T--AAAA--GAGCAA-TGAA-A--T-TT--TGC--------A----C---A----T-A-T--CCT-CTCT-TAGGGTCA-T-TC-------CA--AATAATT-A--ATT-A--TT----AAGACAAG-TGGAGGGTTTTCGTTGGCGAC-C-C-A-AT-CG-AATAAAACCTC--AAAA-G-G--C-GG-----C---T-T-T---TG----GC-G---GGCCA--TTTT--G-A-AAAA-----TA----ATG-C-G-----A-----C--A------AA-AT--TA-AGA-CTAAAATCAGAAAAA
gi|64831                      :  GATTTGTGA---A-AA--A--AAA---TGC--TCAT-CA---GGT---G--GT--AAAA--G--CA--TGAA-G--A-TT--TGC--------A----C---A----T-A-T--TTT-CT-T-TAGA-TCA-T-AC-------CA--A-----T-G--AAT-A--T--------------------------------------C-A-AT-CG-AAAAA---CTC--AAAATG-G--C-GG-----G---T-G-T---TG----GC-G---G-CCA--TTTT--G-A-ATT------GA----ATG-C-G-----G-----C--A------AA-AT--CA-A
gi|64836                      :  GATTTGTGA---A-AC--A--AT----TGG--TCAG-AA---GGT---G--CT--AAAA--G--CA--TGGA-A--T-TT--TGT--------T----T---A----T-A-T--ATT-CT-T-AAGG-TTA-T-AA-------CA--A-----T-A--AAT-G--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-T-A-AT-CG-AAAAA---CTC--AAAANA-G--C-GA-----C---ttacaaa
gi|64835                      :  GATTTTTGG---C-AG--A--AT----TGC--TCAA-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A--T-TT--GGC--------AT---G---A----T-G-G--TAG-C--T-TAGA-TCATT-AC-------------------A--AAC-G--TTTTC-AG---AAG-TGGA----------------C-CAA-A-CT-CG-AA-AA---TCC--AAAATG-A--C-GG---------G-A-A---TG----GC-G---G-CCA--TTTT--G-A-AA--------A----ACG-C-G-----
gi|64829                      :  GATTTTTGG---C-AA--A--AT-----GC--TCAA-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A--T-TT--GGC--------G----T---A----G-T-T--GTT-C--T-TAGA-TCA-T-TA-------CA--A-------A--CAT-T--TT----CA---ATG-TGGA----------------C-C-CAA-CT-CA-AA-AA---TCC--AAAATG-G--C-GG-----G---G-A-A---TG----GC-G---G-CCA--TTTT--G-A-AAAAAGCGGTG----ATA-TAG-----G-----C--C------AA-ATGATA-AAA-AT-AAAtttaaaatgatacatgtaaaaa
gi|64840                      :  GATTTGTGA---A-AA--A--AAA---TGC--TCAG-AA---G---------C--AAAA--G--CA--TGGA-G--CGTT--TGC--------A----C--------T-A-T--CTT-CT-T-TTGG-TCA-T-GT-------CA--A-----T-G--AATTA--TT----AG---AAG-TGGA----------------CAT-C-A-TT-CA-AA-AA---CTC--AAA-----------------------------G----AC-G---G---A--ATTT--G-A-AAT------GA----ATG-C-A-----G-----C--G------AA-AT--GA-ATG-AT-AAATCAGAGAAAaaa
gi|64833                      :  GATTTTTGG---C-GG--A--AT----TGC--TCAA-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A--T-TT--GGT--------ATGGTG---G----T-A-G--C------T-TAGA-TCATT-AC-------------------A--AAC-A--TTTTC-AG---AAG-TGGA----------------C-C-CAA-CT-CA-AA-AA---TCC--AAAATG-G--C-GG---------G-A-A---TG----GC-G---G-CCA--TTTT--G-A-AAA-------A----ACG-T-GT----ATATACC--A------AA-ATGATA-AAA-AA-AAATaa
gi|64834                      :  GATTTTTGG---C-CG--A--AT----TGC--TCAA-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A--T-TT--GGC--------A----T---G----G-C-G--GTA-GC-T-TAGA-TCATT-AC-------------------A--AAC-A--TTTTC-AG---AAG-TGGA----------------C-C-CAA-CT-CG-AA-AA---TCC--AAAATG-GC-C-GG-----A-------A---TG----GC-G---G-CCA--TTTT--A-A-AAAAAGGG-TAT---ATA-C-------------C--A------AA-ATGATA-AAA-Aaa
gi|64818                      :  GATTTTTGG---C-AG--A--AT----TGC--TCAA-AA---GGT---A--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A--T-TT--GGA--------ATGGTG---G----T-A-G--CTT-------AGA-TCA-TTAC-------------------A--AAC-A--TTTTC-AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-AACT-CG-AA-AA---TCC--AAAATG-G--C-GG-----G---A-A-T----G----GC-G---G-CAA--TTTT--G---AAA------TA----A
gi|64830                      :  GATTTTTGG---C-AA--A--AT-----GC--TCAA-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A--T-TTGCCGT--------A----GTGTA----T-C-----------T-TAGA-TCA-T-TA-------CA--A-------A--CAT-T--TT----CA---ATG-TGGA----------------C-C-CAA-CC-CA-AA-AA---TCC--AAAATG-G--C-GGGGGAA------------TG----GC-G---G-CCA--TTTT--G-A-AAA------AAGCGTATA-T-A-----G-----C--A------AA-ATGATA-AAA-AT-AAAacgtatataccaaaatgataaaaa
gi|64837                      :  GATTTTTGG---C-GG--A--AT----TGC--TCAA-AA---GGT---G--AT--ACAA--G--CA--TGAA-A--T-TT--GGC--------ACGGTG---G----T-A-G--C------T-TAGA-TCATT-AC-------AA--A-----C-ATTCAT-T--TC----AG---AAG-TGGA----------------C-C-CAA-CT-CG-AA-AA---TCC--AGAATG-G--C-G--------------TGAATG----GC-G---G-CCA--TTTT--aaa
gi|64815                      :  GATTTTTGG---C-AG--A--AT----TGC--TCA--AA---GGT---G--GT--AAAA--G--CA--GGAC-A--T-TT--GGC--------ATGGTG---A----T-A-G--CTT-AG-T-TAAT-T------------------A-----C-A--AAC-A--TTTTC-AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-AACC-CG-AA-AA---TTA--AAAATG-G--C-GG-----G---A-A-T----G----GC-G---G-CCA--TTTT--G-A-AAA------
gi|64839                      :  GATTTTTGG---C-AG--A--AT----TGC--TCAA-AA---GGT---G--GT--AAAT--G--CA--TGAA-A--T-TT--GGC--------AT---G---A----T-G-G--TAG-CT-T--AGT-TCA-T----------CA--------C-A--AAC-A--TTTGC-AG---AAG-TGGA----------------C-C-CAA-CC-CG-AA-AA---ACC--AAAATG-G--CAGG-----A-------A---TG----GC-G---G-CCA--TTTA--A-A-AAA------AA----AAG-C-aaggcatatatactaaaatgataaag
gi|64843                      :  GATTTTTGG---GCGG--A--AT----TGC--TCA--AA---GGT---G--ATG-AAAA--G--CA--TGAA-AA-T-TT--GGC--------AT---G---G----T-G-G--TAG-CT-A-GAAA-TCA-TTAC-------------------A--AAC-A--TTTTCCAG---AAG-TGGA----------------C-C-CAA-CTCCG-AA-AA---TCTAAAAAATG-G--C-GG-----A-------A---TG----GCTG---G-CCAATTTTT--G-A-AA--------A----ACG-C-GTATATA-----C--C------AA-AG--TA-AAA-Aatataaataccataaaa
gi|64842                      :  GAGTTTTGG---A-AG--A--AT----TTC--TCAA-AA---GGT---G--GT--AAAC--A--CA--TGAA-A--T-TT--GGCATGGTAGTA----G---A------------------T-TAGT-TCATT-AC-------------------A--AGC-A--TTTC--AG---AAA-TGGA----------------C-T-CAA-CC-CA-AAAAA---TCC--AAATTG-G--G-GG------------------GAAAAAC-G---G-CGA--TTTT--G-G-AAag
gi|64825                      :  GATTTTTGG---T-AG--A--AT----TGT--TCAA-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--AGAA-A--T-TT--TGC--------A----t
gi|64822                      :  GATTTTTGG---T-AG--A--TT----TGC--TTAA-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A--T-TT--TGC--------A----t
gi|64846                      :   ATTTTTGG---C-AG--A--AT----TGCTTTCAA-AA---GGT---G--GTTAAAAG--G--CA--TCAA-A----TT--GGC--------AT---G---G----T-G-TAGCTTACT-T-T----TC------------------------------------C----AG---AAG-CGGA------------------C-C-A-T-----AA-AA---TTC--AAAATG-G--C-GG-----CGCTT-T-T---TG----t
gi|64848                      :    TTTGTGA---A-AAAAA--AT----TGC--TCAG-AA---GGT---G--AT--AACA--G--CA--TGAA-A--T-TT--C-C--------A----C---A----T-A-T--C---CC-T-TAGG-TCA-A-TT-------CA--A-----T-T--AAT-A--TT----AG---AAG-TGGA------------------C-C-A-AT-CG-AATAAC--TCC--AAAAT--G--C-GG-----C---T-TAT---TG-----C-G---G--CA--TTTT--G-A-AAA------TA----ATG-C-G-----A-----CAGA------AA-AT--TACAGA-CT-AAATCAGAAA
gi|64841                      :    TTTGTGA---A-AA--C--AT----TGC--TCAG-AA---GG----G--AT--AATA--G--CA--TGAA-A--T-TT--GGC--------A--------A----T-A-T--CTT-C--T-TAGG-TCA-T-AC-----------A-----TCG--AAT-A---T----AGC--AAGCTGGA----------------C-C-A-C-CT-CGAAATAA----TC--AAATGG-G--C-GC-----C---T-T-T---TG----GC-G---G--CA--TTTT--A-A-AA--------A----ATG-C-GA----A-----C--A------TA-A---TA-AGAGATAAAATCAGAAAAA
gi|64832                      : gacTTTGTGACAAA-AA--A--ATC---TGC--TTAA-AATCAGGTTTGG--AA--AGAT--G--CAATTGAAGA--T-CT--TGC--------A----C---A----T-A-T--TTT-CT-TGTAGA-TCA-T-AC-------CA--A-----T-G--AAT-A--TC----A----------------------------------A-CT-CG-AAAAA---CTC--AAAATGAG--C-GG-----G---TGG-T---TG----GC-G---G-CCA--TTT-----G-AAT------TG----ATG-C-G-----G-----C--A------AATAT--CA-ATT-ATCAAATCA
gi|64847                      : gatTTTTTGG---C-AG--A--AT----TGC--TCAA-AA---GGT---G--GT--AAAA--G--CA--TCAA-A--T-TT--GGC-----------------A----T-----------------GG-TGG-T-AG-------C---------T-T--ACT-T--CC----AG---AAG-CGGA------------------C-C-A-T-----AA-AA---TTC--AAAATG-G--C-GG-----C---C-T-T---Taga
gi|64849                      :     TTGTGA---A-AA--A--TT----GGC--TTCA-AA---GGT---G--ATT-AAAACGA--CA--TGAA----T-TT--TGC--------A----A---A----T---T--CTT-CT-T-TAGG-TCA-T-AC-------CA--A-----T-A--AAT-A--TA----AG---AAGTTGGAC---------------C-C-C-A-CT-CG-AATAA---TTC--TCAATG-A--C-GA-----CTTTT-T-T---TG----GC-G---G-CCA--TTTTTCG-AGAAA------TA----AGG-C-GA----A-----C--GTATTTTAA-AC--TA-AGA-GT-AAATCAGAAAA
gi|64850                      :       tcGA---A-AA--A--AT-----GC--TCAG-AA---GGT------AT--AAAA--G--CA--TGAA-A--T-TT---GC--------A----C---A----TGC-T--CT--CA-T-TAGG-CCA-T-ACACTGTACCA--A-----T-A--AAT----TT----AG---AAAATGAG----------------C-C-C-A-AT-CA-AA--A---CCC--AAAATG-G--C-GG-----C---T-T-T---TG-----T-G---G-CCA--TTT---G-A-AAT------GA----ATG-A-G-----G-----C--A------AA-AT--TA-ATA-AT--AATCAGAGAA
gi|64845                      :                        T----TAC--TCAA-AA---GAT---G--GA--ATAA--G--CC--TGGA-C--T-TT--TAC--------A-----------------T--GTT-GG-C-AGGG-TAA-T--T-------CATTA-----C-A--AGC-A--TTTGC-AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-ATACA-AA-----------AAAATG-G--C-GG-----G---T-G-T---GG----AT-----G-CCA--TTTT--GAA-AAA------AA----AAA-T-A-----G-----C--A------AA-AT--TA-caa
gi|64851                      :           gacttttagtatat----TGC--TCAGGAA---GGT---G--AT--AAA---G--CAA-TGAC-A--T-TT--TCC--------A----A---A----A-T-A--CTT-CTGT-TAGG-TCA-T-AC-------CA----------A--AAT-A--TT----AG---AAG-TGGA----------------CGC-C-A-CT-CG-AATAA---TTC---AAATG-GTCT-GG-----A---T-T-T---TG----GC-G---G-CCA--TTTT--G-A-AAA------TA----ATGCC-G-----A-----C---------AA-AT--TG-AGA-AT-AAATCAGAAAAAtaaaa
gi|64844                      :                         ----TGC--TCAA-AA---GGT------AT--AAAA--G--CC--TGAA-A--G-CT--TGT--------AT---G---G----T-G-TAGC------T-TAGA-TCATT-AC----------------------AAC-A--TTC---AG---AAG-T-GA----------------C-C-A-A-CT-CG-AA-AA---TCC--AAAATG-G--C-GG---------G-A-A---TG----AC-G---G-CCA---TTT--G-A-AA--------A----ACG-C-GT----A-----T---------AA-CC--TA-AAA----AAAT--GAAAA
gi|64852                      :         gatctttggctgggaa----TGT--TTAA-AA---GGT---T--GT--AAAC--G--CA--TGAA-A--T-TT--GGC--------ATGGTG---G----T-A-G--C------T-TAGA-TCA-T-TA-------CA--A-------A--CAT-A--TTC---AG---AAG-TGGA----------------C-C-TAA-CT-CG-AA-AA---TCC--AAA----------------------------TG----GC-G---G-CCA--TTCT--G-A-AAA------AA----ACG-
gi|64853                      :                                      -AA---GGT---TTCAT--AAAA-----CA---GAA-T--T-AT--GGC--------A----C---A----T-AGT--CTT-CCAT-TAG--CCA-T-AC-------TA--A-----C-CT-AAT-AGTTC----AG---AAA-TGAG----------------C-C-C-A-A---A-AACAC---ACC--AAAATG----C-GG-----T---T-T-G---GG----TG-G---G-CCA--TTT---G-G-AAA------TG----AAG-A-G-----G-----C--A------AA-AT--TA-ATA-AT-AAGTCAGAGAAAt
gi|64826                      :                                                                                                                                                                                                                           AA---TTC--AAAATG-G--C-CG-----C---C-A-A---AG----GC-C---G-CCA--TTTT--G-A-
gi|64831                      :                                                                                                                 gatttgtgaaaaagaaatgctcatcaggtgataaaagcatgaaatttggcatatatcttcttttggtcatataaataaaaattagaagtggacccacttcaaaaaaAA---TTC--AAAATG-G--C-CG-----C-----------CA----AC-ACCCG-CCA--TTTT--G-A-taatgcggcaaaatgtatagtaaatcagacaaaaa
gi|64829                      :                                                                                                                                gatttgtgaaaaaaaatgctcatcaggtggtaaaagcatgaagatttgcacatattttctttagatcataccaatgaatatcaatcgaaaaac---TTC--AAAATG-G--C-CG-----C---C-A-T---TC----CC-C---G-CCA--TTTT--G-G-Agaatgcggcaaaatcaattacaaa
gi|64834                      :                                                                                                                         gatttttggcaaaatgctcaaaaggtgataaaagcatgaaatttggcgtagttgttcttagatcattacaaacattttcaatgtggacccaactcaaaaa---TTT--AAAATG-G--C-CG-----C---C-A-T---TC-----C-G---G-CCA--TTTT--G-G-Aaaaagcggtgatataggccaaatgataaaaataaaaaa
gi|64854                      :                                                                                                                                  gatttttggccgaattgctcaaaaggtgataaaagcatgaaatttggcatggcggtagcttagatcattacaaacattttcagaagtggacccaactcgaaaaTG-G--C-GG-----C---T-T-T---TG----GC-G---G-CCA--TTTC--A-A-AAA------TA----ATG-C-G-----A-----C--A------AA-AT--TA-AGA-AT-AAATCAGAAAAAaaaagggtatataccaaaatgataaaaa

lowQualScore                  :                                                                                                    3333333333333333333333333                1111111111111111111            1111                                  1                                        2222222222222                              1111111111                                                    
lowQualScore                  :                   111  444444   77  8888  1  11   1  222   111 11  33    11 11  33  1  1 11 1  2   4444444444444444444444444 1   2222   8   7777777777777777777 22  1  11  8888  222   3    7777777777777777 2 1 0 444 1  8  777 1 44444  11      1 1 22  1111111111111   22222 1  2   11    11 1 1  1111111111   2222 1 333  11 5555  1  88  2 1 11  4            
lowQualScore                  :                   ...  ......   ..  ....  .  ..   .  ...   ... ..  ..    .. ..  ..  .  . .. .  .   ......................... .   ....   .   ................... ..  .  ..  ....  ...   .    ................ . . . ... .  .  ... . .....  ..      . . ..  .............   ..... .  .   ..    .. . .  ..........   .... . ...  .. ....  .  ..  . . ..  .            
lowQualScore                  :                   999  555555   00  5555  0  44   0  777   777 33  33    33 33  33  0  0 33 0  9   6666666666666666666666666 0   3333   2   2222222222222222222 44  0  44  2222  888   1    8888888888888888 1 0 3 222 0  2  999 0 33333  44      0 0 44  8888888888888   77777 1  2   55    55 1 1  6666666666   4444 2 333  88 0000  3  99  6 5 88  3            
consensus                     :              GATTTG--TGG---A-AAA--AT----TG-CT--CAA-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TG-AA-A--T-TTTGCA----C----G----TA-TCTT-CT-T-TAG--G-TCA-TAC-------CA--A-----T-A--AA-TA--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-C-T-CG-AA---A-A-C---CC--AAAATG-G-C--GGC---T-TT-----TGG-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-AANN-A------ATG----C-G---GC--A----AA-AT--TA-ANA--AT-AAATCAGAAAAA
Reference ( family-495 )      :              GATTTG--TGG---A-AAA--AT----TG-CT--CAA-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TG-AA-A--T-TTNGCA----N----A----TA-TCTT-CT-T-TAG--G-TCA-TAC-------CA--A-----T-A--AA-TA--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-C-T-CG-AA---A-A-T---TC--AAAATG-G-C--GGC---T-TT-----TGG-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-AANN-A------ATG----C-G---GC--A----AA-AT--TA-ANA--AT-AAATCAGAAAAA
gi|64813                      :              GATTTG--TGA---A-AAA--AAAAAATG-CT--CAT-CA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TG-AA-A--T-TTTGCA----C----A----TG-TCCT-CT-T-TAA--G-CCA-TAC-------CA--A-----T-A--AA-TA--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-A-T-CGAAA---A-A-C---TC--AAAATG-G-C--GGC---T-TT-----TGG-----C-GA-CCA--TTTT--T-A-AATG-A------ATG----C-G---GC--A----AA-AT--TA-ATA--AT-AAATCAGAAAAA
gi|64814                      :              GATTGG--TGA---A-GGA--AA----TG-CC--CAA-AG---GGT---G--GT--AAAA--G--CA--TG-AA-A--T-TTTGCA----C----A----TA-TCTT-CT-T-TAG--G-TCA-TAC-------CA--A-----T-A--AA-TA--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-A-T-CGAAA---A-A-C---TC--AAAATG-G-C--GGC---T-TT-----TGG-----C-GG-TCA--TTTT--G-A-AGTG-A------ATG----C-G---GC--A----AA-AT--TC-ATA--AT-AAATCAGTAAAA
gi|64815                      :              GATTTT--TGG---C-AGA--AT----TG-CT--CAA-A----GGT---G--GT--AAAA--G--CA--GG-AC-A--T-TTGGCA----TGGTGA----TA-GCTT-AG-T-TAA--T-T-----------------A-----C-A--AA-CA--TTTTC-AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-AAC-C-CG-AA---A-A-T---TA--AAAATG-G-C--GGG---A-AT------GG-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-AAAA-A---------------G---GC--ATAT-AT-AC--TA-AAATGAT-AAA
gi|64816                      :              GATTTG--TGA---A-AAA--AAAA--TG-CT------GA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TG-AA-A--T-TTTGCA----C----A----AG-TTTT-CT-T-TAG--G-CCA-TAC-------CA--A-----T-A--AA-TA--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-A-T-CGAAA---A-A-C---TC--AAAATG-G-C--GGC---T-TT-----TGA-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-AATG-A------ATG----T-G---GC--A----AA-AT--GA-ATA--AT-AAAg
gi|64817                      :              GATTTG--TGA---A-AAA--AT----TG-CT--CAG-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TG-AA-A--T-TTTGCA----G----A----TC-TCTT-CT-T-TAG--G-TCA-TAC-------CA--A-----T-A--AA-TA--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-C-T-CG-AAT--A-A-T---TC--AAAATG-G-C--GGC---T-TT-----TGA-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-AAAT-A------ATG----C-G---AC--A----AA-AT--TA-AGA--AT-AAATCAGAAAAA
gi|64818                      :              GATTTT--TGG---C-AGA--AT----TG-CT--CAA-AA---GGT---A--AT--AAAA--G--CA--TG-AA-A--T-TTGGAATGGTG----G----TA-GC------T-TAG--A-TCATTAC-------------------A--AA-CA--TTTTC-AG---AAG-TGGA----------------C-C-CAA-C-T-CG-AA---A-A-T---CC--AAAATG-G-C--GG----G-AA-----TGG-----C-GG-CAA--TTTT--G-A-AATA-A------ACGTATAT-A---CC--A----AA-ATGATA-AAA--A
gi|64819                      :              GATTTG--TGA---A-AAACAAA----TG-CT--CAG-AA---GGT---A--AT--AAAA--G--CA--TG-AA-A--T-TTTGCA----C----A----AA-TCTT-CT-T-TAG--A-TCA-TAC-------CA--A-----T-A--AA-TA--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-A-T-CGAAA---A-A-C---TC--AAAATG-G-C--GG----T-TT-----TGG-----A-GG-CCC--TTTT--G-A-AATG-A------ATA----C-G---GC--A----AA-AC--CA-ATT--AT-AA
gi|64820                      :              GATTTG--TGA---A-AAA--AA----TG-TT--CAT-CA---GGT---C--AT--AAAA--G--CA--TG-AA-A--T-TTTGCA----C----A----TG-TCTT-CC-T-TAG--G-CCA-TACATGTAC-CA--A-----T-A--AA-TA--TT----AG---AAA-TGAG----------------C-C-C-A-A-T-CA-AA---A-A-C---CC--AAAATG-G-C--GGC---T-TT-----TGG-----T-GG-CCA--TTTT--G-A-AATG-A------ATG----A-G---GC--A----AA-AT--TA-ATA--AT-AAATCAGAGAAAtaaa
gi|64821                      :              GATTTG--TGA---A-TAA--AT-----G-CT--CAG-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TG-AA-A--T-TT-GCA----C----A----TGCTCTT-CT-T--AG--G-CCA-TACATGTAC-CA--A-----T-A--AA-TA--TT----AG---AAA-TGAG----------------C-C-C-A-A-T-C--AA---A-A-C---CC--AAAATG-G-C--GGC---T-TT-----TGG-----T-GG-CCA--TTTT--G-A-AATG-A------ATG----A-G---GC--A----AA-AT--TA-ATA--AT-AAATCAGAGAA
gi|64822                      :              GATTTT--TGG---T-AGA--TT----TG-CT--TAA-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TG-AA-A--T-TTTGCA----caa
gi|64823                      :              GATTTG--TGA---A-AAAA-AT----TG-CT--CAG-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TG-AA-A--T-TTTGCA----A----A----TA-TCTT-CT-T-TAG--G-TTA-TAC-------CA--A-----T-A--AA-TA--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-C-T-CG-AAT--A-A-T---TC--AAAATG-G-C--GGC---T-TT-----TGG-----T-GG-CCA--TTTT--G-A-AAAT-A------ATG----C-G---AC--A----AA-AT--TA-AGA--AT-AAATCAGGAAAAt
gi|64824                      :              GATTTG--TGA---A-AAAAAAT----TG-CT--CAG-AT---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TG-AA-C--T-TTTGCA----C----A----TG-TCTT-CT-T-TAG--G-CTA-TAC-------CA--A-----T-A--AA-TT--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-A-T-CG------A-A-C---TC--AAAATG-G-C--GGA---T-TT-----TGG-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-AATA-A------ATG----C-G---GC--A----AA-AT--TA-ATA--AT-AAATCAGAAaaaaa
gi|64825                      :              GATTTT--TGG---T-AGA--AT----TG-TT--CAA-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--AG-AA-A--T-TTTGCA----
gi|64826                      :              GATTTG--TGA---A-AAAGAAA----TG-CT--CAT-CA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TG-AA-A--T-TTGGCA----T----A----TA-TCTT-CT-T-TTG--G-TCA-TAT-------AA--A-----T-A--AA-AA--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-CTT-CA-AA---A-A-A---TC--AAAATG-G-C--GGC---C-TT-----TGG-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-ATTT-A------ATG----C-G---GC--A----AA-AT--GT-ATA--GT-AAATCAGACAAAt
gi|64827                      :              GATTTG--TGA---A-AAA--AAA---TG-CT--CAA-------GT---G--AT--AAAA--G--CA--TG-AT-A--T-TTTGCA----C----A----TG-TCT--------------------C-------CA--A-----T-A--AA-TA--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-A-T-CGAAA---A-A-C---TC--AAAACG-G-C--AGC---T-TT-----TGG-----A-GG-CCA--TTTT--G-A-AATG-A------ATG----C-G---GC--A----AA-AT--TG-ATA--AT-AAATCAGAAAaa
gi|64828                      :              GATTTG--TGA---A-AAA--AAA---GG-CT--CAG-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TG-AA-AGAT-TGTACA----T----ACATGTA-TCTT-CT-T-TAG--G-TCA-TAC-------CA--A-----T-A--AA-TA--TA----AG---AAG-TGGA----------------T-C-C-A-A-T-CG-AAT--A-A-C---TC--AAAATG-G-T--GGC---T-TT-----TGG-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-CAAT-A------ATG----C-G---AC--A----AA-AT--T----A--AT-AAATCAGAAA
gi|64829                      :              GATTTT--TGG---C-AAA--AT-----G-CT--CAA-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TG-AA-A--T-TTGGCG----T----A----GT-TGTT-C--T-TAG--A-TCA-TTA-------CA--A-------A--CA-TT--TT----CA---ATG-TGGA----------------C-C-CAA-C-T-CA-AA---A-A-T---CC--AAAATG-G-C--GGG---G-AA-----TGG-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-AAAA-AGCGGTGATA----TAG---GC--C----AA-ATGATA-AAA--AT-AAAtaa
gi|64830                      :              GATTTT--TGG---C-AAA--AT-----G-CT--CAA-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TG-AA-A--T-TTGCCG----T----AGTG-TA-TC------T-TAG--A-TCA-TTA-------CA--A-------A--CA-TT--TT----CA---ATG-TGGA----------------C-C-CAA-C-C-CA-AA---A-A-T---CC--AAAATG-G-C--GG--------GGGAATGG-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-AAAA-AGCGT--ATA----T-A---GC--A----AA-ATGATA-AAA--AT-AAAaaa
gi|64831                      :              GATTTG--TGA---A-AAA--AAA---TG-CT--CAT-CA---GGT---G--GT--AAAA--G--CA--TG-AA-G--A-TTTGCA----C----A----TA-TTTT-CT-T-TAG--A-TCA-TAC-------CA--A-----T-G--AA-TA--T--------------------------------------C-A-A-T-CGAAA---A-A-C---TC--AAAATG-G-C--GGG---T-GT-----TGG-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-ATTG-A------ATG----C-G---GC--A----AA-AT--CA-ATT--AC-AAAaaa
gi|64832                      :                TTTG--TGACAAA-AAA--ATC---TG-CT--TAA-AATCAGGTTTGG--AA--AGAT--G--CAATTG-AAGA--T-CTTGCA----C----A----TA-TTTT-CT-TGTAG--A-TCA-TAC-------CA--A-----T-G--AA-TA--TC----A----------------------------------A-C-T-CGAAA---A-A-C---TC--AAAATGAG-C--GGG---TGGT-----TGG-----C-GG-CCA--TTT-----G-AATT-G------ATG----C-G---GC--A----AATAT--CA-ATT--ATCAAATCA
gi|64833                      :           gatGATTTT--TGG---C-GGA--AT----TG-CT--CAA-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TG-AA-A--T-TTGGTATGGTG----G----TA-GC------T-TAG--A-TCATTAC-------------------A--AA-CA--TTTTC-AG---AAG-TGGA----------------C-C-CAA-C-T-CA-AA---A-A-T---CC--AAAATG-G-C--GG----G-AA-----TGG-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-AAAA-ACGTGT-ATA----T-A---CC--A----AA-ATGATA-AAA--AA-AAATaga
gi|64834                      :              GATTTT--TGG---C-CGA--AT----TG-CT--CAA-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TG-AA-A--T-TTGGCATGGCG----G----TA-GC------T-TAG--A-TCATTAC-------------------A--AA-CA--TTTTC-AG---AAG-TGGA----------------C-C-CAA-C-T-CG-AA---A-A-T---CC--AAAATG-GCC--GGA------A-----TGG-----C-GG-CCA--TTTT--A-A-AAAA-AGGGT--ATA----T-A---CC--A----AA-ATGATA-AAA--Aaa
gi|64835                      :              GATTTT--TGG---C-AGA--AT----TG-CT--CAA-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TG-AA-A--T-TTGGCATGATG----G----TA-GC------T-TAG--A-TCATTAC-------------------A--AA-CG--TTTTC-AG---AAG-TGGA----------------C-CAA-A-C-T-CG-AA---A-A-T---CC--AAAATG-A-C--GG----G-AA-----TGG-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-AA---A------ACG----C-G---
gi|64836                      :              GATTTG--TGA---A-ACA--AT----TG-GT--CAG-AA---GGT---G--CT--AAAA--G--CA--TG-GA-A--T-TTTGTT----T----A----TA-TATT-CT-T-AAG--G-TTA-TAA-------CA--A-----T-A--AA-TG--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-T-A-A-T-CGAAA---A-A-C---TC--AAAANA-G-C--GAC---tttaaaatgatacatgtaaaaa
gi|64837                      :              GATTTT--TGG---C-GGA--AT----TG-CT--CAA-AA---GGT---G--AT--ACAA--G--CA--TG-AA-A--T-TTGGCACGGTG----G----TA-GC------T-TAG--A-TCATTAC-------AA--A-----C-ATTCA-TT--TC----AG---AAG-TGGA----------------C-C-CAA-C-T-CG-AA---A-A-T---CC--AGAATG-G-C--G--------TGAA--TGG-----C-GG-CCA--TTTT--
gi|64838                      :              GATTTG--TG------AAA--AT----TG-CT--CAG-AAC--GGT---G---T--AAAA--GAGCAA-TG-AA-A--T-TTTGCA----C----A----TA-TCCT-CTCT-TAG--GGTCA-TTC-------CA--AATAATT-A--AT-TA--TT----AAGACAAG-TGGAGGGTTTTCGTTGGCGAC-C-C-A-A-T-CG-AATAAA-A-CC--TC--AAAA-G-G-C--GGC---T-TT-----TGG-----C-GGGCCA--TTTT--G-A-AAAATA------ATG----C-G---AC--A----AA-AT--TA-AGA--CTAAAATCAGAAAAA
gi|64839                      :              GATTTT--TGG---C-AGA--AT----TG-CT--CAA-AA---GGT---G--GT--AAAT--G--CA--TG-AA-A--T-TTGGCATGATG----G----TA-GC------T-TAG--T-TCA-T-C-----------A-----C-A--AA-CA--TTTGC-AG---AAG-TGGA----------------C-C-CAA-C-C-CG-AA---A-A-A---CC--AAAATG-G-CA-GGA------A-----TGG-----C-GG-CCA--TTTA--A-A-AAAA-A------AAG----C-
gi|64840                      :              GATTTG--TGA---A-AAA--AAA---TG-CT--CAG-AA---G---------C--AAAA--G--CA--TG-GA-G--CGTTTGCA----C---------TA-TCTT-CT-T-TTG--G-TCA-TGT-------CA--A-----T-G--AATTA--TT----AG---AAG-TGGA----------------CAT-C-A-T-T-CA-AA---A-A-C---TC--AAA--G-A-C--GG----------------------------A--ATTT--G-A-AATG-A------ATG----C-A---GC--G----AA-AT--GA-ATG--AT-AAATCAGAGAAAatataaataccataaaa
gi|64841                      :                TTTG--TGA---A-AAC--AT----TG-CT--CAG-AA---GG----G--AT--AATA--G--CA--TG-AA-A--T-TTGGCA---------A----TA-TCTT-C--T-TAG--G-TCA-TAC-----------A-----TCG--AA-TA---T----AGC--AAGCTGGA----------------C-C-A-C-C-T-CG-AA---ATA-A---TC--AAATGG-G-C--GCC---T-TT-----TGG-----C-GG--CA--TTTT--A-A-AA---A------ATG----C-GA--AC--A----TA-AT--AA-GAG--ATAAAATCAGAAAAAaa
gi|64842                      :           gacGAGTTT--TGG---A-AGA--AT----TT-CT--CAA-AA---GGT---G--GT--AAAC--A--CA--TG-AA-A--T-TTGGCAT---G----G----TA--GTA-GA-T-TAG--T-TCATTAC-------------------A--AG-CA--TTTC--AG---AAA-TGGA----------------C-T-CAA-C-C-CA-AA---A-A-A---TC--CAAATT-G-G--GG--------------GGAAAAAC-GG-CGA--TTTT--G-G-AA
gi|64843                      :              GATTTT--TGG---GCGGA--AT----TG-CT--C-A-AA---GGT---G--ATG-AAAA--G--CA--TGAAA-A--T-TTGGCATGGTG----G----TA-GC--------TAGAAA-TCATTAC-------------------A--AA-CA--TTTTCCAG---AAG-TGGA----------------C-C-CAA-C-TCCG-AA---A-A-T---CTAAAAAATG-G-C--GGA------A-----TGG-----CTGG-CCAATTTTT--G-A-AA---A------ACG----C-G---t
gi|64844                      :                TTTGGCTGG---G-AA---------TG-CT--CAA-AA---GGT------AT--AAAA--G--CC--TG-AA-A--G-CTTGTATGG-T----G----TA-GC------T-TAG--A-TCATTAC----------------------AA-CA--TTC---AG---AAG-T-GA----------------C-C-A-A-C-T-CG-AA---A-A-T---CC--AAAATG-G-C--GG----G-AA-----TGA-----C-GG-CCA---TTT--G-A-AA---A------ACG----C-G---TA--T----AA-CC--TA-AAA-----AAAT--GAAAAtatataccaaagtaaaaaag
gi|64845                      :                                gatcT----TA-CT--CAA-AA---GAT---G--GA--ATAA--G--CC--TG-GA-C--T-TTTACA-----------------TGTT-GG-C-AGG--G-TAA-T-T-------CATTA-----C-A--AG-CA--TTTGC-AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-A-T-AC-AA---A-----------AAAATG-G-C--GG----G-TG-----TGG-----A-TG-CCA--TTTT--GAA-AAAA-A------AAA----T-A---GC--A----AA-AT--TATAAA--A
gi|64846                      : gacttttagtatatATTTT--TGG---C-AGA--AT----TG-CTTTCAA-AA---GGT---G--GTTAAAAG--G--CA--TC-AA-A----TTGGCATGG-T----G----TA-GCTTACT-T-T------TC-----------------------------------C----AG---AAG-CGGA------------------C-C-A-T------AA---A-A-T---TC--AAAATG-G-C--GGCGCTT-TT-----TG
gi|64847                      :                TTTT--TGG---C-AGA--AT----TG-CT--CAA-AA---GGT---G--GT--AAAA--G--CA--TC-AA-A--T-TTGGCA----T------------------------G--G-TGG-TAG-------C---------T-T--AC-TT--CC----AG---AAG-CGGA------------------C-C-A-T------AA---A-A-T---TC--AAAATG-G-C--GGC---C-TT-----T
gi|64848                      :                TTTG--TGA---A-AAAAAAT----TG-CT--CAG-AA---GGT---G--AT--AACA--G--CA--TG-AA-A--T-TTC-CA----C----A----TA-TC---CC-T-TAG--G-TCA-ATT-------CA--A-----T-T--AA-TA--TT----AG---AAG-TGGA------------------C-C-A-A-T-CG-AAT--A-ACT---CC--AAAAT--G-C--GGC---T-TA-----TTG-----C-GG--CA--TTTT--G-A-AAAT-A------ATG----C-G---ACAGA----AA-AT--TACAGA--CT-AAATCAGAAA
gi|64849                      :                 TTG--TG----A-AAA--AT----TGGCT--TCA-AA---GGT---G--ATT-AAAACGA--CA--TG-AA----T-TTTGCA----A----A----T--TCTT-CT-T-TAG--G-TCA-TAC-------CA--A-----T-A--AA-TA--TA----AG---AAGTTGGAC---------------C-C-C-A-C-T-CG-AAT--A-A-T---TC--TCAATG-A-C--GACTTTT-TT-----TGG-----C-GG-CCA--TTTTTCG-AGAAAT-A------AGG----C-GAACGT--ATTTTAA-AC--TA-AGA--GT-AAATCAGAAAA
gi|64850                      :                      tcG---A-AAA--AA----TG-CT--CAG-AA---GGT------AT--AAAA--G--CA--TG-AA-A--T-TT-GCA----C----A----TG-CTCT-CA-T-TAG--G-CCA-TACACTGTACCA--A-----T-A--AA-T---TT----AG---AAAATGAG----------------C-C-C-A-A-T-C--AA---A-A-C---CC--AAAATG-G-C--GGC---T-TT-----TG------T-GG-CCA--TTT---G-A-AATG-A------ATG----A-G---GC--A----AA-AT--TA-ATA--AT--AATCAGAGAA
gi|64851                      :                                     ----TG-CT--CAGGAA---GGT---G--AT--AAA---G--CAA-TG-AC-A--T-TTTCCA----A----AA---TA--CTT-CTGT-TAG--G-TCA-TAC-------CA--A----------AA-TA--TT----AG---AAG-TGGA----------------CGC-C-A-C-T-CG-AAT--A-A-T---TC--AAA-TG-G-TCTGGA---T-TT-----TGG-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-AAAT-A------ATG----C-C---GA--C----AA-AT--TG-AGA--AT-AAATCAGAAAAAcaa
gi|64852                      :                                     ----TG-TT--TAA-AA---GGT---T--GT--AAAC--G--CA--TG-AA-A--T-TTGGCATGGTG----G----TA-GC------T-TAG--A-TCA-TTA-------CA--A-------A--CA-TA--TTC---AG---AAG-TGGA----------------C-C-TAA-C-T-CG-AA---A-A-T---CC--AAA------------------------TGG-----C-GG-CCA--TTCT--G-A-AAAA-A------ACG----
gi|64853                      :                                                   -AA---GGT---TTCAT--AAAA-----CA---G-AA-T--T-ATGGCA----C----A----TAGTCTT-CCAT-TAG----CCA-TAC-------TA--A-----C-CT-AA-TAGTTC----AG---AAA-TGAG----------------C-C-C-A--------AA---A-A-CACACC--AAAATG---C--GG----T-TT-----GGG-----T-GGGCCA--TTTG--G-A-AATG-A------A-G----A-G---GC--A----AA-AT--TA-ATA--AT-AAGTCAGAGAAAt
gi|64854                      :                                                                                                                                                                                                                                                 TG-G-C--GGC---T-TT-----TGG-----C-GG-CCA--TTTC--A-A-AAAT-A------ATG----C-G---AC--A----AA-AT--TA-AGA--AT-AAATCAGAAAAA

lowQualScore                  :                                                                                                  333333333333333333333333333                1111111111111111111            1111                                  1                                         2222222222222                                 111111                                                    
lowQualScore                  :                   111  444444   77  8888  1  11   1  222   111 11  33    11 11  33    1 1 1  3   111111111111111111111111111 1   222   6 2  7777777777777777777 22  1  11  8888  222   3    7777777777777777 2 1 0 444 1 1 8  777 1 3333 1 11      1 1 22  1111111111111   22222 2  1   11    11 2 1  88 111111   2222 1 333  11 5555  1  88  2 1 11  4            
lowQualScore                  :                   ...  ......   ..  ....  .  ..   .  ...   ... ..  ..    .. ..  ..    . . .  .   ........................... .   ...   . .  ................... ..  .  ..  ....  ...   .    ................ . . . ... . . .  ... . .... . ..      . . ..  .............   ..... .  .   ..    .. . .  .. ......   .... . ...  .. ....  .  ..  . . ..  .            
lowQualScore                  :                   999  555555   00  5555  0  44   0  777   777 33  33    33 33  33    0 0 0  1   555555555555555555555555555 0   999   2 1  8888888888888888888 44  0  44  2222  888   1    8888888888888888 1 0 3 222 0 0 2  999 0 4444 0 44      0 0 44  8888888888888   77777 2  1   55    55 2 1  11 000000   4444 2 333  88 0000  3  99  6 5 88  3            
consensus                     :              GATTTG--TGG---A-AAA--AT----TG-CT--CAA-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A-T-TTTGCA---C------G----TA--TCTT-CT-T-TAGG--TCA-T-AC-------CA--A-----T-A--AA-TA--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-C-T-C-G-AA---A-AC---C-C--AAAATG-G-C--GGC---T-TT-----TGG-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-AANNA------ATG----C-G---GC--A----AA-AT--TA-ANA--AT-AAATCAGAAAAA
Reference ( family-495 )      :              GATTTG--TGG---A-AAA--AT----TG-CT--CAA-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A-T-TTTGCA---C------G----TA--TCTT-CT-T-TAGG--TCA-T-AC-------CA--A-----T-A--AA-TA--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-C-T-C-G-AA---A-AC---C-C--AAAATG-G-C--GGC---T-TT-----TGG-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-AANNA------ATG----C-G---GC--A----AA-AT--TA-ANA--AT-AAATCAGAAAAA
gi|64813                      :              GATTTG--TGA---A-AAA--AAAAAATG-CT--CAT-CA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A-T-TTTGCA---C------A----TG--TCCT-CT-T-TAAG--CCA-T-AC-------CA--A-----T-A--AA-TA--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-A-T-C-GAAA---A-AC---T-C--AAAATG-G-C--GGC---T-TT-----TGG-----C-GA-CCA--TTTT--T-A-AATGA------ATG----C-G---GC--A----AA-AT--TA-ATA--AT-AAATCAGAAAAA
gi|64814                      :              GATTGG--TGA---A-GGA--AA----TG-CC--CAA-AG---GGT---G--GT--AAAA--G--CA--TGAA-A-T-TTTGCA---C------A----TA--TCTT-CT-T-TAGG--TCA-T-AC-------CA--A-----T-A--AA-TA--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-A-T-C-GAAA---A-AC---T-C--AAAATG-G-C--GGC---T-TT-----TGG-----C-GG-TCA--TTTT--G-A-AGTGA------ATG----C-G---GC--A----AA-AT--TC-ATA--AT-AAATCAGTAAAA
gi|64815                      :              GATTTT--TGG---C-AGA--AT----TG-CT--CAA-A----GGT---G--GT--AAAA--G--CA--GGAC-A-T-TTGGCA---T------GGTGATA--GCTT-AG-T-TAAT--T------------------A-----C-A--AA-CA--TTTTC-AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-AAC-C-C-G-AA---A-AT---T-A--AAAATG-G-C--GGG---A-AT------GG-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-AAAAA---------------G---GC--ATAT-AT-AC--TA-AAATGAT-AAA
gi|64816                      :              GATTTG--TGA---A-AAA--AAAA--TG-CT------GA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A-T-TTTGCA---C------A----AG--TTTT-CT-T-TAGG--CCA-T-AC-------CA--A-----T-A--AA-TA--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-A-T-C-GAAA---A-AC---T-C--AAAATG-G-C--GGC---T-TT-----TGA-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-AATGA------ATG----T-G---GC--A----AA-AT--GA-ATA--AT-AAAg
gi|64817                      :              GATTTG--TGA---A-AAA--AT----TG-CT--CAG-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A-T-TTTGCA---G------A----TC--TCTT-CT-T-TAGG--TCA-T-AC-------CA--A-----T-A--AA-TA--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-C-T-C-G-AAT--A-AT---T-C--AAAATG-G-C--GGC---T-TT-----TGA-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-AAATA------ATG----C-G---AC--A----AA-AT--TA-AGA--AT-AAATCAGAAAAA
gi|64818                      :              GATTTT--TGG---C-AGA--AT----TG-CT--CAA-AA---GGT---A--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A-T-TTGGAA---TGGTG--G----TA--GC------T-TAGA--TCATT-AC-------------------A--AA-CA--TTTTC-AG---AAG-TGGA----------------C-C-CAA-C-T-C-G-AA---A-AT---C-C--AAAATG-G-C--GG----G-AA-----TGG-----C-GG-CAA--TTTT--G-A-AATAA------ACGTATAT-A---CC--A----AA-ATGATA-AAA--A
gi|64819                      :              GATTTG--TGA---A-AAACAAA----TG-CT--CAG-AA---GGT---A--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A-T-TTTGCA---C------A----AA--TCTT-CT-T-TAGA--TCA-T-AC-------CA--A-----T-A--AA-TA--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-A-T-C-GAAA---A-AC---T-C--AAAATG-G-C--GG----T-TT-----TGG-----A-GG-CCC--TTTT--G-A-AATGA------ATA----C-G---GC--A----AA-AC--CA-ATT--AT-AA
gi|64820                      :              GATTTG--TGA---A-AAA--AA----TG-TT--CAT-CA---GGT---C--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A-T-TTTGCA---C------A----TG--TCTT-CC-T-TAGG--CCA-T-ACATGTAC-CA--A-----T-A--AA-TA--TT----AG---AAA-TGAG----------------C-C-C-A-A-T-C-A-AA---A-AC---C-C--AAAATG-G-C--GGC---T-TT-----TGG-----T-GG-CCA--TTTT--G-A-AATGA------ATG----A-G---GC--A----AA-AT--TA-ATA--AT-AAATCAGAGAAAtaaa
gi|64821                      :              GATTTG--TGA---A-TAA--AT-----G-CT--CAG-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A-T-TT-GCA---C------A----TGC-TCTT-CT-T--AGG--CCA-T-ACATGTAC-CA--A-----T-A--AA-TA--TT----AG---AAA-TGAG----------------C-C-C-A-A-T-C---AA---A-AC---C-C--AAAATG-G-C--GGC---T-TT-----TGG-----T-GG-CCA--TTTT--G-A-AATGA------ATG----A-G---GC--A----AA-AT--TA-ATA--AT-AAATCAGAGAA
gi|64822                      :              GATTTT--TGG---T-AGA--TT----TG-CT--TAA-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A-T-TTTGCA---caa
gi|64823                      :              GATTTG--TGA---A-AAAA-AT----TG-CT--CAG-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A-T-TTTGCA---A------A----TA--TCTT-CT-T-TAGG--TTA-T-AC-------CA--A-----T-A--AA-TA--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-C-T-C-G-AAT--A-AT---T-C--AAAATG-G-C--GGC---T-TT-----TGG-----T-GG-CCA--TTTT--G-A-AAATA------ATG----C-G---AC--A----AA-AT--TA-AGA--AT-AAATCAGGAAAAt
gi|64824                      :              GATTTG--TGA---A-AAAAAAT----TG-CT--CAG-AT---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-C-T-TTTGCA---C------A----TG--TCTT-CT-T-TAGG--CTA-T-AC-------CA--A-----T-A--AA-TT--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-A-T-C-G------A-AC---T-C--AAAATG-G-C--GGA---T-TT-----TGG-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-AATAA------ATG----C-G---GC--A----AA-AT--TA-ATA--AT-AAATCAGAAaaaaa
gi|64825                      :              GATTTT--TGG---T-AGA--AT----TG-TT--CAA-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--AGAA-A-T-TTTGCA---
gi|64826                      :              GATTTG--TGA---A-AAAGAAA----TG-CT--CAT-CA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A-T-TTGGCA---T------A----TA--TCTT-CT-T-TTGG--TCA-T-AT-------AA--A-----T-A--AA-AA--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-CTT-C-A-AA---A-AA---T-C--AAAATG-G-C--GGC---C-TT-----TGG-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-ATTTA------ATG----C-G---GC--A----AA-AT--GT-ATA--GT-AAATCAGACAAAt
gi|64827                      :              GATTTG--TGA---A-AAA--AAA---TG-CT--CAA-------GT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAT-A-T-TTTGCA---C------A----TG--TCT--------------------C-------CA--A-----T-A--AA-TA--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-A-T-C-GAAA---A-AC---T-C--AAAACG-G-C--AGC---T-TT-----TGG-----A-GG-CCA--TTTT--G-A-AATGA------ATG----C-G---GC--A----AA-AT--TG-ATA--AT-AAATCAGAAAaa
gi|64828                      :              GATTTG--TGA---A-AAA--AAA---GG-CT--CAG-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A-G-ATTGTA---CATACATG----TA--TCTT-CT-T-TAGG--TCA-T-AC-------CA--A-----T-A--AA-TA--TA----AG---AAG-TGGA----------------T-C-C-A-A-T-C-G-AAT--A-AC---T-C--AAAATG-G-T--GGC---T-TT-----TGG-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-CAATA------ATG----C-G---AC--A----AA-AT--T----A--AT-AAATCAGAAA
gi|64829                      :              GATTTT--TGG---C-AAA--AT-----G-CT--CAA-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A-T-TTGG-----C------G----TAGTTGTT-C--T-TAGA--TCA-T-TA-------CA--A-------A--CA-TT--TT----CA---ATG-TGGA----------------C-C-CAA-C-T-C-A-AA---A-AT---C-C--AAAATG-G-C--GGG---G-AA-----TGG-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-AAAAAGCGGTGATA----TAG---GC--C----AA-ATGATA-AAA--AT-AAAtaa
gi|64830                      :              GATTTT--TGG---C-AAA--AT-----G-CT--CAA-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A---TTTGC----C------G----TAG-TGTA-TC-T-TAGA--TCA-T-TA-------CA--A-------A--CA-TT--TT----CA---ATG-TGGA----------------C-C-CAA-C-C-C-A-AA---A-AT---C-C--AAAATG-G-C--GG--------GGGAATGG-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-AAAAAGCGT--ATA----T-A---GC--A----AA-ATGATA-AAA--AT-AAAaaa
gi|64831                      :              GATTTG--TGA---A-AAA--AAA---TG-CT--CAT-CA---GGT---G--GT--AAAA--G--CA--TGAA-G-A-TTTGCA---C------A----TA--TTTT-CT-T-TAGA--TCA-T-AC-------CA--A-----T-G--AA-TA--T--------------------------------------C-A-A-T-C-GAAA---A-AC---T-C--AAAATG-G-C--GGG---T-GT-----TGG-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-ATTGA------ATG----C-G---GC--A----AA-AT--CA-ATT--AC-AAAaaa
gi|64832                      :                TTTG--TGACAAA-AAA--ATC---TG-CT--TAA-AATCAGGTTTGG--AA--AGAT--G--CAATTGAAGA-T-CTTGCA---C------A----TA--TTTT-CT-TGTAGA--TCA-T-AC-------CA--A-----T-G--AA-TA--TC----A----------------------------------A-C-T-C-GAAA---A-AC---T-C--AAAATGAG-C--GGG---TGGT-----TGG-----C-GG-CCA--TTT-----G-AATTG------ATG----C-G---GC--A----AATAT--CA-ATT--ATCAAATCA
gi|64833                      :           gatGATTTT--TGG---C-GGA--AT----TG-CT--CAA-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A-T-TTGGTA---TGGTG--G----TA--GC------T-TAGA--TCATT-AC-------------------A--AA-CA--TTTTC-AG---AAG-TGGA----------------C-C-CAA-C-T-C-A-AA---A-AT---C-C--AAAATG-G-C--GG----G-AA-----TGG-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-AAAAACGTGT-ATA----T-A---CC--A----AA-ATGATA-AAA--AA-AAATaga
gi|64834                      :              GATTTT--TGG---C-CGA--AT----TG-CT--CAA-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A-T-TTGGCA---TGGCG--G----TA--GC------T-TAGA--TCATT-AC-------------------A--AA-CA--TTTTC-AG---AAG-TGGA----------------C-C-CAA-C-T-C-G-AA---A-AT---C-C--AAAATG-GCC--GGA------A-----TGG-----C-GG-CCA--TTTT--A-A-AAAAAGGGT--ATA----T-A---CC--A----AA-ATGATA-AAA--Aaa
gi|64835                      :              GATTTT--TGG---C-AGA--AT----TG-CT--CAA-AA---GGT---G--AT--AAAA--G--CA--TGAA-A-T-TTGGCA---TGATG--G----TA--GC------T-TAGA--TCATT-AC-------------------A--AA-CG--TTTTC-AG---AAG-TGGA----------------C-CAA-A-C-T-C-G-AA---A-AT---C-C--AAAATG-A-C--GG----G-AA-----TGG-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-AA--A------ACG----C-G---
gi|64836                      :              GATTTG--TGA---A-ACA--AT----TG-GT--CAG-AA---GGT---G--CT--AAAA--G--CA--TGGA-A-T-TTTGTT---T------A----TA--TATT-CT-T-AAGG--TTA-T-AA-------CA--A-----T-A--AA-TG--TT----AG---AAG-TGGA----------------C-C-T-A-A-T-C-GAAA---A-AC---T-C--AAAANA-G-C--GAC---tttaaaatgatacatgtaaaaa
gi|64837                      :              GATTTT--TGG---C-GGA--AT----TG-CT--CAA-AA---GGT---G--AT--ACAA--G--CA--TGAA-A-T-TTGGCA---CGGTG--G----TA--GC------T-TAGA--TCATT-AC-------AA--A-----C-ATTCA-TT--TC----AG---AAG-TGGA----------------C-C-CAA-C-T-C-G-AA---A-AT---C-C--AGAATG-G-C--G--------TGAA--TGG-----C-GG-CCA--TTTT--
gi|64838                      :              GATTTG--TG------AAA--AT----TG-CT--CAG-AAC--GGT---G---T--AAAA--GAGCAA-TGAA-A-T-TTTGCA---C------A----TA--TCCT-CTCT-TAGGG-TCA-T-TC-------CA--AATAATT-A--AT-TA--TT----AAGACAAG-TGGAGGGTTTTCGTTGGCGAC-C-C-A-A-T-C-G-AATAAA-AC---CTC--AAAA-G-G-C--GGC---T-TT-----TGG-----CGGG-CCA--TTTT--GAA-AAATA------ATG----C-G---AC--A----AA-AT--TA-AGA--CTAAAATCAGAAAAA
gi|64839                      :              GATTTT--TGG---C-AGA--AT----TG-CT--CAA-AA---GGT---G--GT--AAAT--G--CA--TGAA-A-T-TTGGCA---TGATG--G----TA--GC------T-TAGT--TCA-T--C-----------A-----C-A--AA-CA--TTTGC-AG---AAG-TGGA----------------C-C-CAA-C-C-C-G-AA---A-AA---C-C--AAAATG-G-CA-GGA------A-----TGG-----C-GG-CCA--TTTA--A-A-AAAAA------AAG----C-
gi|64840                      :              GATTTG--TGA---A-AAA--AAA---TG-CT--CAG-AA---G---------C--AAAA--G--CA--TGGA-G-CGTTTGCA---C-----------TA--TCTT-CT-T-TTGG--TCA-T-GT-------CA--A-----T-G--AATTA--TT----AG---AAG-TGGA----------------CAT-C-A-T-T-C-A-AA---A-AC---T-C--AAA--G-A-C--GG----------------------------A--ATTT--G-A-AATGA------ATG----C-A---GC--G----AA-AT--GA-ATG--AT-AAATCAGAGAAAatataaataccataaaa
gi|64841                      :                TTTG--TGA---A-AAC--AT----TG-CT--CAG-AA---GG----G--AT--AATA--G--CA--TGAA-A-T-TTGGCA----------A----TA--TCTT-C--T-TAGG--TCA-T-AC-----------A-----TCG--AA-TA---T----AGC--AAGCTGGA----------------C-C-A-C-C-T-C-G-AA---ATAA---T-C--AAATGG-G-C--GCC---T-TT-----TGG-----C-GG--CA--TTTT--A-A-AA--A------ATG----C-GA--AC--A----TA-AT--AA-GAG--ATAAAATCAGAAAAAaa
gi|64842                      :           gacGAGTTT--TGG---A-AGA--AT----TT-CT--CAA-AA---GGT---G--GT--AAAC--A--CA--TGAA-A-T-TTGGCA---TG-----G----TA---GTA-GA-T-TAGT--TCATT-AC-------------------A--AG-CA--TTTC--AG---AAA-TGGA----------------C-T-CAA-C-C-CAA-AA---A-AT---C-C--AAATTG-G----GG--------------GGAAAAAC-GG-CGA--TTTT--G-G-AA
gi|64843                      :              GATTTT--TGG---GCGGA--AT----TG-CT--CAA-A----GGT---G--ATG-AAAA--G--CA--TGAA-AAT-TTGGCA---T------GGTGGTA--GCT--------AGAAATCA-TTAC-------------------A--AA-CA--TTTTCCAG---AAG-TGGA----------------C-C-CAA-C-TCC-G-AA---A-AT---C-TAAAAAATG-G-C--GGA------A-----TGG-----CTGG-CCAATTTTT--G-A-AA--A------ACG----C-G---t
gi|64844                      :                TTTGGCTGG---G-AA---------TG-CT--CAA-AA---GGT------AT--AAAA--G--CC--TGAA-A-G-CTTGTA---T------GGTG-TA--GCTT-------AGA--TCA-TTAC----------------------AA-CA--TTC---AG---AAG-TG-A----------------C-C-A-A-C-T-C-G-AA---A-AT---C-C--AAAATG-G-C--GG----G-AA-----TGA-----C-GG-CCA---TTT--G-A-AA--A------ACG----C-G---TA--T----AA-CC--TA-AAA-----AAAT--GAAAAtatataccaaagtaaaaaag
gi|64845                      :                                gatcT----TA-CT--CAA-AA---GAT---G--GA--ATAA--G--CC--TGGA-C-T-TTTACA---T------G----T------T-GG-C-AGGG--TAA-T--T-------CATTA-----C-A--AG-CA--TTTGC-AG---AAG-TGGA----------------C-C-C-A-A-T-A-C-AA---A-A----------AAATG-G-C--GG----G-TG-----TGG-----A-TG-CCA--TTTT--GAA-AAAAA------AAA----T-A---GC--A----AA-AT--TATAAA--A
gi|64846                      : gacttttagtatatATTTT--TGG---C-AGA--AT----TG-CTTTCAA-AA---GGT---G--GTTAAAAG--G--CA--TCAA-A---TTGGCATGGT------G----TA--GCTTACT-T-T-----TC------------------------------------C----AG---AAG-CGGA------------------C-C-A-T-------AA---A-AT---T-C--AAAATG-G-C--GGCGCTT-TT-----TG
gi|64847                      :                TTTT--TGG---C-AGA--AT----TG-CT--CAA-AA---GGT---G--GT--AAAA--G--CA--TCAA-A-T-TTGGCA---TGGTG--G----TA--GCTTACT-T--------------C-------C---------------------------AG---AAG-CGGA------------------C-C-A-T-------AA---A-AT---T-C--AAAATG-G-C--GGC---C-TT-----T
gi|64848                      :                TTTG--TGA---A-AAAAAAT----TG-CT--CAG-AA---GGT---G--AT--AACA--G--CA--TGAA-A-T-TTC-CA---C------A----TA--TC---CC-T-TAGG--TCA-A-TT-------CA--A-----T-T--AA-TA--TT----AG---AAG-TGGA------------------C-C-A-A-T-C-G-AAT--A-ACT--C-C--AAAAT--G-C--GGC---T-TA-----TTG-----C-GG--CA--TTTT--G-A-AAATA------ATG----C-G---ACAGA----AA-AT--TACAGA--CT-AAATCAGAAA
gi|64849                      :                 TTG--TG----A-AAA--AT----TGGCT--TCA-AA---GGT---G--ATT-AAAACGA--CA--TGAA---T-TTTGCA---A------A----T---TCTT-CT-T-TAGG--TCA-T-AC-------CA--A-----T-A--AA-TA--TA----AG---AAGTTGGAC---------------C-C-C-A-C-T-C-G-AAT--A-AT---T-C--TCAATG-A-C--GACTTTT-TT-----TGG-----C-GG-CCA--TTTTTCG-AGAAATA------AGG----C-GAACGT--ATTTTAA-AC--TA-AGA--GT-AAATCAGAAAA
gi|64850                      :                      tcG---A-AAA--AA----TG-CT--CAG-AA---GGT------AT--AAAA--G--CA--TGAA-A-T-TT-GCA---C------A----TG--CTCT-CA-T-TAGG--CCA-T-ACACTGTACCA--A-----T-A--AA-T---TT----AG---AAAATGAG----------------C-C-C-A-A-T-C---AA---A-AC---C-C--AAAATG-G-C--GGC---T-TT-----T-G-----T-GG-CCA---TTT--G-A-AATGA------ATG----A-G---GC--A----AA-AT--TA-ATA--AT--AATCAGAGAA
gi|64851                      :                                     ----TG-CT--CAGGAA---GGT---G--AT--AAA---G--CAA-TGAC-A-T-TTTCCA---A------AA---TA---CTT-CTGT-TAGG--TCA-T-AC-------CA--A----------AA-TA--TT----AG---AAG-TGGA----------------CGC-C-A-C-T-C-G-AAT--A-AT---T-C--AAA-TG-G-TCTGGA---T-TT-----TGG-----C-GG-CCA--TTTT--G-A-AAATA------ATG----C-C---GA--C----AA-AT--TG-AGA--AT-AAATCAGAAAAAcaa
gi|64852                      :                                     ----TG-TT--TAA-AA---GGT---T--GT--AAAC--G--CA--TGAA-A-T-TTGGCA---TGGTG--G----TA--GC------T-TAGA--TCA-T-TA-------CA--A-------A--CA-TA--TTC---AG---AAG-TGGA----------------C-C-TAA-C-T-C-G-AA---A-AT---C-C--AAA------------------------TGG-----C-GG-CCA--TTCT--G-A-AAAAA------ACG----
gi|64853                      :                                                   -AA---GGT---TTCAT--AAAA-----CA---GAA-T-T-ATGGCA---C------A----TAG-TCTT-CCAT-TAG---CCA-T-AC-------TA--A-----C-CT-AA-TAGTTC----AG---AAA-TGAG----------------C-C-C-A---------AA---A-ACACAC-C--AAAATG---C--GG----T-TT-----GGG-----T-GGGCCA--TTTG--G-A-AATGA------A-G----A-G---GC--A----AA-AT--TA-ATA--AT-AAGTCAGAGAAAt
gi|64854                      :                                                                                                                                                                                                                                                  TG-G-C--GGC---T-TT-----TGG-----C-GG-CCA--TTTC--A-A-AAATA------ATG----C-G---AC--A----AA-AT--TA-AGA--AT-AAATCAGAAAAA