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lowQualScore                  :     4        5 5    9999 3 3 8888 2222222 3  6 3    2  2 6 2  88 2   4 99 2 2 4  2  2 8 8  7777 5 5 0   2 333333333333333 77  555555555 5  3 6 3 55555 777777 3 000000   3333   11 2 77 8   000 444  00 444  222 55555555555555555555555555555555 88 333  11  77 444 5 2 9999    77  88 2  77 77 222  5  5  2 1111 11111 00 77 9999 44444  2 7777777777  111 2  66666666  444444  444 4   2 111 4 2   6666666 2 2     6666 1 4444 1 1  77  1 6  77 333 1 1 1 1 6  999999999  2   4 222 44 2 2 333 11 666666 11 2   2 777 4    000  88 2  11 111  33  2  222    5 2  5 2 5555   77  0000 77  3 7 3  5555 3 5555 2222 888888 7 888888  22   3 00  4     4   9999   44  333 5  5 3333 1 5 1 7 7 7      
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Reference ( gi|92360 )        :  AAACTTTCACGT-G-AAAT----T-A-T----T-------A-TA-C-AATT-CA-C-T-TT--C-CTT-A--G-T-A-TT-GC-A-T-CA----C-T-C-TCA-A-----------A--CT--CT---------C-GA-T-A-T-----T------C-A----C-CAT----GCG--C-A--A-ATG-T-A---AT--A---TC---T-A--------A----C----------A-T---A--T---AT--CG-CG---A-C-C----TTGA--AA--T-CG--C--C---CC-TT-TT-C----T-----G--C--A----T-----CT-A----------TA---C-AA--------TG------GA---C-TCA-T---T-T-GCATT-----A-A-AGAGGG--TT-A----T-C-GCC-TG-T-AA--A---C-A-A-T-G-CGC-----C--AG-TTT-C---A--C-G-A---T--A-C----C--T-GCT-A-C-A-GTCAG-GTT--A-CA--C---AA--TT-TT---TTGG-A-AT-A-TA-AGATTT-TG--T-A--TT-T-A-TTCA--T-A-T--T----T------T-T------GA--AAA-G--TG-TTGGG-AGC----AAC--TT--CT-TA-C----T-T-A-T-A-T-ATTTAA
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gi|92378                      :   AAATTTCACGT-G-AAAT----T-A-TAAATT-------A-TA-C-AATT-CA-C-T-TTT-C-CTC-A--G-T---TT--C-A-T-CA----C-T-C-TCA-A-----------A--TT--CT---------C-GA-T-A-T-----T------C-A----T-TAT----GCG--C-A--ATATG-T-A---A---A---TC---TCG--------A----C----------ATT---A--T---AT--TG-AGA--A-C-C----TTGA--AA--T-CGGCC--T---CC-TT-TT-C----T-----G--C--C----T-----CT-A----------TA---C-AAT-------TG------GA---C-TCA-T---T-T-GCA-T-----A-A-AGATGG--GT-A----T-C-GCC-TGAT-AA--A---C-A-A-T-G-CGC-----C--AG-TTT-C---A----G-A---T--A-TA---C--T-GCT-A-CTACGTCA--GTT--A-CA--C----A--TG-TT---TTTG-A-AT-A-AT-AGATCT-GG--C-A--TT-T-ATTTTA--T-A-T--T----T------T-T------AA--AAA-G--TG-TGGGT-GGC----AAC--TT--TT-TA-C----T-T-A-T-A-TCCTTTAA
gi|92383                      :   AATTTTC-CGT-G-AAATGTTAT-A-T----C-------A-TATC-TATT------T-TT--C-TTT-A--G-T-A-TT-G--A---CA----C-TGC-TCA-AG----------A--TT--CT---------CTGA-T-A-T-----T--------A----T-CCT----GCG--C-A--AGACG-T-A---AT--A---TC--------------A---------------A-T---T--T---AT--CG-TGTG-A-CGC----TTGA--AG--A-TG--C--C---CC-TT-TT-C----T-----G--C--A----T-----CT-A----------TA---C-AAG-------TG------GAG--C-CCA-T---T-T-GCAAT-----A-ATAGAGGG--TT-A----T-C-GCA-TG-C-AA--A---C-A-A-T-GGCGA-----A--AG-TTT-C---A--C-G-AATAT--A-T----C--T-GCT---C-G-CTCAG-TTC--A-CA------AA--TT-TT---TTTG-G-AT-G-TG-ATATTC-TG--G-A--TT-T-A-TTTAG-T-A-T--T----T------T-T------GA--AAA-GGCTG-TTGGG-AGC----AAC--TT--CT-TA-C------T-A-TGA-T-ATT
gi|92380                      :   AAATTTCACG--G-AA----------T----T-------A-TA-C-AATC-AA-C-T-TT--TGCCT-A--G-T-A-TT-TCCA-T--A----C-T-T-TCA-A--------------CT--CT---------C-GA-T-A-T---------------------CATA---GCGG-C-A--A-AT--T-A---AT--A---TC---T-A-------------C----------T-T---AAAT---AT--CG-CG---A-C-CG---TTGA--AA--T-CG-----C---CC-TT-TT-C----T-----G--C--A----T-----CT-A----------TA---C-AA--------T-------GA---C-TCATT---T-T-GCATCAAAGAA-A-AGAGGG--AG-G----T---GCC--G-T-AA--AC--C-A-A-TAG-C-C-----C--AG-TTT-C---C--A-G-A---T--A-C----C--T-GCT---C-A-GTC----TTA-A-CA--C---AA---T-TT---TTGG-A-AT-A-T--AGATTC-TG--CAA--TT-TAA-TTTA--T-A-T--T----T------T-T------GA--AAA-G--TG-TTGGG--GC----AAC--TTA-TT-TA-C----T-T-A---A-T-CTTTAA
gi|92382                      :   AAATTTCACGT-G-AAAT----T-AAT----T-------A-TA-C-CATT-CA-C-T-TT--C-CTT-A--G-TAA-TT-TC-A-T-CA----C-T-C-TCA-A-----------A---T--CT---------C-GA-T-A-T-----T------C-A----T-TA-----GC---C-AATA-ATG-T-AT--AT--A----C---T----------A----C----------A-T---A--T---AT--
gi|92387                      :      TTTCACGT-G-AAGT----T-A-T----C-------A-TA-C-ACTT-CA-C-T-TTT-C-CTT-A--G-T-A-TT-GC-A-TTCA----C-T-G-TTA-A-----------A--TT--C------------GA-T-A-T-----T------C--------CAT----GCG--C-A--A--TG-TGA---AT--A---T----T-A--------A----C----------A-TT--A--T---AT--CGGCG---AAC-C----TTGA--AA--A-TG--C--C---C--TT-TT-C----T-----G--CGAA----T-----CT-A----------TA---C-AA--------TG------GA---C-GTA-T---T-T-GCA-T-----A-A-AGAGGG--TT-A----T-C-G-C-TG-TAAA--A---C-A-A-T-GACGC-----C--AG-TTT-C---A--C-G-A---T--A-C----C--T-GCG-A-C-A-GTTCA-GTT--G--A--C---AG--AT-TT---TTGG-A-ATGA-TA-GGATTCGTG--C-ATTTT-T-A-TTTAGGT-A-T--TGGA-T------TGT------GA--AAA-G--TG-TTGGG-A-C----AAC--TT--TT-TATT----T-T-A-T-A-T-ATTggacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggcatcgcctgtaaacaatgcgccagtttcacg
gi|92385                      :      TTTCACGT-G-AATT----A-A-T----T-------AGTAGCGAATT-CA-C-T-TTTAC-CCG-A--GGT-A-TTTAC-A-T-CA----C-T-C--CA-A-----------ATGCT--AT---------C-GAGT-A-TGTGTATAGGCAGC-A----G-TAT----ATA--T-G--A-CTG-A-A---ATCTA---TC---T-AGAGTTTAGA----C----------C-T---A--C---ATT-CG-CGGAAA-T-CGGCGTTGG--AAATT-CG--C--TGCGCC-TTGCT-C----T-----G----------T-----CG-A----------TG---C-AAGTCTGACATA------GG---A-TCA-TATGT-T-GCATA-----G-A-GGAGGGGGTT-A----TGC-GCT-TA-A-AA--G---C-A-A-T-G-CGC--------AG-TTT-CGTCA--C-G-A---TTAA-T----CCGT-GCT-A-C-A-GTCAGTGAT--A-C---C---AC--TT-TTGCTTTGG-A-ATGA-T--AGATTC-TG--C-A--TT-T-A-TT-A--T-A-TGATGTTGT------T-T------AAG-AAA-G--TG-TTGGT-GCT----AAC--TTTGTT-TA-C----TGT-A---G-T-ATTTA
gi|92384                      :    aaTTTCTC-T-G-AAAT----TGA-T----T-------A-TT-C-ACAT-CA-T-T-TT-----TT-ATTG-C-ACTT-GC-A-A-GA----CCT-CATCA-A-----------A--TT--AT---------C-GA-TTA-T-----T------T-AAACCC-CA------------A--A-ATG-T-A---AT--AGTATC---T-AT-------A----G----------A-T---A--T----T--CG-TG---A-C-C----TTGA--AA--T-CG--C--C---CT-TC-GC-C----T-----G--C--A----T-----CT-T----------TA---
gi|92363                      :     aaTTCACGT-G-AAAT----T-A-T----A-------A-TA-C-AATT-CA-C-T-TT--T-CCT--------------------CA----C-T-C-T-A-A-----------A---T--CT---------C-GA-T-A-T------------C-A----T-CAT----GCA--C-A--A-ATG-T-A---AT--A---TC---T----------A----C----------ATT---A--T---AT--CG-CG---A-C-C----TTGA--AC--T-CG--C--C---CC-TT-TT-C----T-----G--C--A----T-----CT-A----------TA---C-AA--------TG------AA---C-TCA-T---T-T-GCA-T-----A-A-AGA-GG--TT-A----T-C-GCC-TG-T-AA--A---C-A-A-T-G-CGC-----C--AG-TTT-C---A--C-G-A---T--A-C----C--T-GCT-A-C-A-GTCA--GTT--A-CA--C---AA--TT-TT---TTGG-A-AT-A--A-AGATTC-TG--C-A--TT-C-A-TTTA--T-A-T--T----T------T-T------GA--AAAGG--TG-TTGGG-AGC----AAC--TT--CT-TA-C----T-T-A-T-A-T-ATTTAA
gi|92365                      :   aaaaTTCACGT-G-AA-T----T-A-T----T-------A-TA-T-AATT-CA-C-T-TT--C-CTT-A--G-T-A-TT-GC-A-T-CA----C-T-C-TCA-A-----------A---T--TT---------C-GA-T-A-T-----T------C-A----T-CAT----GCA--C-A--A-AT--T-A---AT--A---TC---T----------A----C----------ATT---A--T---AT--CG-CG---A-C-C----TTGA--AA--T-CG--CCGC---CT-TT-TT-C----T-----G--C--A----T-----CT-A----------TA---C-AA--------TG------AA---C-TCA-T---T-T-GCA-C-----A-A-AGAGGT--TT-T----A-C-GCC-TG-T-AA--A---C-A-A-T-G-CGC-----T--AG-TTT-CA--A--C-G-A---T--A------C--T-GCT-A-C-A-GTCA--TTT--A-CA--C---AA--TT-TT---TGGG-A-AT-A-TA-GAATTC-T---T-A--TT-T-A-TTCG--T-A-T--T----T------T-T------GA--AAA-G--TG-TTGGG-AGC----AAC--TT---T-TA-C----T-T-A-T-A-T-ATTTA
gi|92372                      :   aaaaTTCACGT-GAAAAT----T-A-T----T-------A-TA-C-AA-T-CA-CTT-TT--C-CTT-A--G-T-A--T-GC-A-T-AA----C-T-A-TCA-A-----------A--CT--CT---------C-GA-T-A-T-----T------C-A----T-CAT----GCGGCC-A--A-ATG-T-A---AT--A---TC---T----------A----C----------ATT---A--T---AT--CG--G---A-C-C----TTGA--AA--T-CG--C--C---CC-TT-TT-C----T-----GGCC--A----T-----CT-A----------TA---CGAA--------TG------GA---C--CA-T---T-T-GC--T-----A-A-AGA-GG--TT-A----G-C-GCC-TG-TAAA--A---C-A-ACT-G-CGC-----C--AG--TT-C---A--CGG-A---T--A-C----C--T-GCT-A-C-A-GTCAG-CTT--A-GAT-C---AA--TT-
gi|92379                      :   aaaaaTTACGT-G-AAAT----T-A-T----T-------A-TA-C-AATT-CG-CTT-TT--C-CTT-A--G-T-A-TG-GC-ACT-CA----C-T-CTTCA-A-----------A------TT---------C-GA-T-A-------T------C-A----T-CAT----GC---C-A--A-CTG-A-T---AT--A---TC---T----------A----C----------A-T---A--T---AT-----CG---A---C----TTGAAGAA--T-CG--C--C---C---T-TT-C----T-----G--G--C----T-----CT-A----------TA---C-AA--------TG------GA---C-TCA-T---T-TAGCGAT-----A-A-AGAGGG--TC------T-C-GCCTTG-T-AC--A---C---A-T-G--GC-----C--AG-TTT-C---A--C-G-A---T--A------C--T-GCT-A-T---GTCA--GTT--A--A--C---AA-----TT---TTAG-A-GC-A-TATAGAATT-TG--C-A--TTCT-A-TTTA--T-A-T--A----T------T-T------GAAGAAA-G--TG-TTGGG-AGC-----AC--TT--CT-TA-C----T-C-A-T-AGT-ATT
gi|92386                      :        aaaCGT-G-AAAT----G-A-T----T-------A-TG-T-TATT-TA-T-T-TT------T-A--A-T-A-TA-GC-A-T--G----C-T-T-T---A-----------A--TT--T------------GA-T-A-T-----C------C-A------------------------------------T--A---T---------------------------------T---A--T---AT--CG-TG---G-C-G----TTGA--TA--T-AA--T--C---TA-TT-AT-CCG--T-----G--T--G----T-----CT-GATGTGGTT--TA---T-GA--------TT------GA---C-TCA-T---T-T-GCAT------A-A-ATATTC--TT-A----T-A-AAC-AA-T-AA--A---C-A-A-T-A-CAA-----A--AG-TT--C---A--C----------A-CTCTGC--T-GCT-A-T-A-TTCGG--------CA--CTTCAA--TT-CT---TTAA-G-AT-A-CA----TAT-TG--T-AGATA-T-A-CTTAG-T-A-T--T----T------C-TTAACCTGA--AAA-T--TT-TTGGG-AGC----AAC--CT---T-TG-C----T-TGA-T-A-C-
gi|92388                      :     aattgctGT-G-AAAT----G-A-T----T-------A-TA-T-A--T-CA-C-A-TC--T-CTT----G-T---TT----A-T-GA----C-T-----A-A-----------A--GT--CTT--------C-AA-T-A-T-----T------T------T-CAT-----------A--A-ATG-G-T---AT--G---CC---C-A--------A----CGAAAGTTTTGA-T---A--TTGTAT--TA-TG---A-C-T----CTGA--AA--T-TG--C--C---CT-TA-AT-C----T-----G--C--AGAAGT-----GT-T----------TA---A-AA--------TG------TA---A-T-G-T---T-T-GTAT------G-A-ATAGTT--AT-A----T-C-GTA-TG-T-AA--A---C-G-A-T-G-CG
gi|92373                      :                -AAAT----T-A-T----TTATGTTCA-TA-T-CATT-C----T-TT--C-TTT-A--G-T-T-TT-GG-C-T-CA----C-T-C-TCA-AGATGTTTGGTTA--AT--CTAACGAGTGCCAGA-T-A-T-----T------CCA----C-TAT----AC--------A-AT--------AT--A---TT---T-A--------C----T----------A-T---G--T---ATGACG-TA---A-A-C----CTGACAGA--TACT--C--T---TC-TT-TT-TATGGT-----G--C--G----C-----GT-A----------TA------A--------TG------GATCTC-TCA-T---T---GC--T-----AGA-AGAGG---TT-A----A-T-GTA-CG-T-AA------C-A-A-T-G-TGA-----A--AG-TTT-C---A--C-G-A---T--ATT----C--T-GCC-A-T-A-GCCA--GTT--A-C--------A--TC-TT---TT-G-A-AT-A-T----ATTTCTG--G-A--TT-T-A-T---------------------------------------A-G--TGTTTGGG-AGT----AAC--TTG-CT-TA-C----T-T-A-
gi|92389                      :        aagatttttcAAT----T-A-T----T-------A-TT-C-ATAT-CA-T-T-TT--T-CTTTA--G-T-T-TT-GC-A-T-CA----C-T-C-TCA-A-----------A--TTGTTT---------T-TA-T-A-T-----C------T-A----A-CAT----GCG--C-A--A-ATG-T-A---AT--A---TC---T-ATATT----A----C----------A-T---G--T---ATACTG-TA---A-C-C----TTGA--AA--T-CA--C--C---TC-TT-TT-T----TATGGTG--C--G----T-----C--G----------TA---T-AA--------TG------GA---C-TCA-T---T-T-GCAT------A-A-AGAGGG--TT-A----T-C-GTA-CG-T-AA--A---C-A-A-T-G-TGA-----A--AG-TTT-C---A--C-G-A---T--A-T----C--T-GCC-A-T-A-GCCA--GTT-----A--C---AA--TC-TT---TTTG-A-AT-A-T--ATATTC-TG--G-A--TT-T-A-T---------------------------------------A-G--TG-TTGGG-AGT----AAC--TT--CT-TA-C----T-T-A-
gi|92390                      :                   AT----G-A-T----T-------A-TA-C-AATT-CA-C-T-TT--C-CCT-A--G-T-A-TT-GC-A-T-CA----C-T-C-TCA-A-----------A--TT--CT---------C-GA-T-A-T-----T------C-A----T-CAT----GCG--C-A--A-ATG-T-A---AT--A----C---T-A------------------------A-T---A--T---AT--CG-CA---A-C-C----TTGA--AA--T-CG--C--C---CC-TT-TT-C----G-----G--T--A----T-----CT-A----------TA---C-AA--------TG------GA---C-TCA-T---T-T-GCA-T-----A-A-AGA-GG--CT-A----T-C-GCA-TG-T-AA--A---CAA-A-T-G-CGA-----C--AT-TTT-C---ACGC-G-A---T--A-C----C--T-GCA-T-C-A-GTCA--GTT--A-CA--C---AA--TT-TT---T--G-G-AT-A-T--AGATTC-TG--C-A--TT-T-A-TTTA--T-A----T----T------T-T------GA--AAA-G--TG-CTGGG-AGC----AAC--TT--CT-TA-C----T-T-A-T-A-T-ATTTAA
gi|92381                      :                          -A-T----T-------A-AA-C-AAT--CA-C-T-TT--T-CTT-A--A---A-T---C-A-T-CA----C---C-TCA-A-----------G--AT--CT---------C-GA-T-A-T-----T------C-T--------T----GCG--C-A--ATAGG-T-A---G---A---TC---T-A-------------C------------T---A--T---AT--CG-CG---A-C-C----TTGA------T-CG--C--A---CC-TT-TT-C----T-----G--C--------------T-A----------TAGGAC-AA--------TG-------A---C-CCA-T---GAT-GCA-----------AGAGG----T-A----T---GCC-TG-T-AAACA---C-A-A-T-G-CG------C--AG--TT-C---A--G-G-A---T--G-C----C--T-GCT-A-A-A-GTCA--GTT--AGTA--A---AA--TA-TT---TGGA-G-AT-A-TA-GGA-TG-CG--C-A--TT-T-A-T--A--T-T-A--T----T------T-T------GA--AAA-G--GG-TTGGT--GC-------------CT-TA-C----T-T-A-T-A-G-GCTTAA
gi|92391                      :                     aaatatcgaagtga-------A-TA-C-GATT-AG-T-T-TT-----TT-A------A-TT-GA-G-G-CA----C-T-C-TCA-A-----------A--TG--TT---------T-GA-T-A-T-----T------T-A----A-CAT----GCG--C-A--A-AGG-C-A---AT--A---TC---T-A-------------C----------A-TC--A--T---AC--TG-TG---A-C-C----TTGA--AA--T-CA--C--C---CC-TT-CT-C----T-----G--C--A-----------C-A----------TA---C-AA--------TA------GA---C-TCA-T---T-T-GCA-T-----A-A-ACAGGG--GT-A----T-C-GTA-TG-T-AA--A---C-A-G-T-G-CAA-----A--AT-TTT-C---A--C-G-A---T--A-T----C--T-GCT-A-T-A-ACTA--GTT--A-TA--T---AA--TA-TT---TTGG---AT-A-TG-TG-TTC-TA--G-A--TT-C-A-TTTA--C-A-T--G----TATGCAAT-A------GA--AAA-A--TG-TTGGA-AGC----AAC--TT--CC-TA-A----T-T-A-T-A-T-ATTCAA
gi|92392                      :                                                    T-CA-C-T-TT--T-CTTTA--G-T-A-TT-GC-A-T-TA----C-T-C-TCA-A-----------A--TT--CT---------C-GA-T-A-T-----T------T-A----T-CAT----GCG-------A-ATG-T-A---AT--A---TA---T-AT-------A----T----------A-TTTTA--T---AT--CG-TG---A-C-C----TTGA--TA--T-CG--C--C---CC-TT-TT-C----T-----G--C--A----T-----CC-A----------TG---C-AG--------TG------GA---C-TCA-T---T-T-GCA-T-----A-A-AAAGGG--TT-A----T-C-GCA-TG-T-AA--A---C-A-A-T-G-CGA-----A--AG-TTT-C---A--C-G-A---T--A-T----C--T-GCT-A-T-T-ATCA--GTT--A-CA--C---AA--TT-TT---TTGG-A-AT-A-T--ATATTC-TG--C-A--TT-T-G-TTTA--T-A-T--T----T------T-T------TA--AAG-G--TG-TTGGG-AGC----GAC--TT--CT-TG-C----T-T-A-T-A-T-ATTTAA
gi|92393                      :                                                     -CA-C-T-TTT-C-CTC-A--G-T-A-TT-GC-A-T-CA----C-T-C-TCA-A-----------A--CT--CG---------A-GA-T-A-T-----T------C-A----T-CAT----GCG--C-A--A-ATG-T-A---AT--A---TC---T-A--------
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Reference ( family-492 )      :                                                                                                                                                                                                   AAAATTTC-A-CGT-G-AAAT----T-A-T----T-------A-TA-C-AATT-CA-C-T-TT--C-CTT-A--G-T-A-TT-GC-A-T-CA----C-T-C-TCA-A-AT----------T--CT---------C-GA-T-A-T-TC-A----T-C-----AT-GC-G--C-A--A---ATG-T-A---A--------T-A---T-C---T-A--------A----C----------A-T---A--T---AT--CG-CG---A-C-C----TTGA--AA--T-CG--C--C---CC-TT-TT-C----T-----G--C--A----T-----CT-A----------TA---C-AA--------TG------GA---C-TCA-T---T-T-GCATT-----A-A-AGAGGG--TT-A----T-C-GCC-TG-T-AA--A---C-A-A-T-G-CGC-----C--AG-TTT-C---A--C-G-A---T--A-C----C--T-GCT-A-C-A-GTCAG-GTT--A-CA--C---AA--TT-TT---TTGG-AAT-A-TA-AG-ATTC-TG--C-A--TT-T-A-T-T-T---A--T-A-TT---T------T-T------GA--AAA-G--TG-TTGGG-AGC----AAC--TT--CT-TA-C----T-T-A-T-A-T-ATTTAA
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gi|92382                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -A----T-C-GCC-TG-T-AA--A---C-A-A-T-G-CGC-----C--AG-TTT-C---A--C-G-ggacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggcatcgcctgtaaacaatgcgccagtttcacg
gi|92383                      : aaatttcacgtgaaattaattataccattcactttccttagtaatttcatcactctcaaatctcgatattcattagccaataatgtatatactacatatatggacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggcAATTTT-C-CGT-G-AAATGTTAT-A-T----C-------A-TATC-TATT------T-TT--C-TTT-A--G-T-A-TT-G--A---CA----C-TGC-TCA-AGAT----------T--CT---------CTGA-T-A-T-T--A----T-C-----CT-GC-G--C-A--AG--ACG-T-A---A--------T-A---T-C--------------A---------------A-T---T--T---AT--CG-TGTG-A-CGC----TTGA--AG--A-TG--C--C---CC-TT-TT-C----T-----G--C--A----T-----CT-A----------TA---C-AAG-------TG------GAG--C-CCA-T---T-T-GCAAT-----A-ATAGAGGG--TT-A----T-C-GCA-TG-C-AA--A---C-A-A-T-GGCGA-----A--AG-TTT-C---A--C-G-AATAT--A-T----C--T-GCT---C-G-CTCAG-TTC--A-CA------AA--TT-TT---TTTG-GAT-G-TG-AT-ATTC-TG--G-A--TT-T-A-T-T-T---AG-T-A-TT---T------T-T------GA--AAA-GGCTG-TTGGG-AGC----AAC--TT--CT-TA-C------T-A-TGA-T-ATT
gi|92384                      :                                                                                                                                                                                                     AATTTC-T-C-T-G-AAAT----TGA-T----T-------A-TT-C-ACAT-CA-T-T-TT-----TT-ATTG-C-ACTT-GC-A-A-GA----CCT-CATCA-A-AT----------T--AT---------C-GA-TTA-T-TT-AAACCC-C-----A----------A--A---ATG-T-A---A--------T-AGTAT-C---T-AT-------A----G----------A-T---A--T----T--CG-TG---A-C-C----TTGA--AA--T-CG--C--C---CT-TC-GC-C----T-----G--C--A----T-----CT-T----------TA---
gi|92385                      :                                                                                                                                                                                                     AATTTC-A-CGT-G-AATT----A-A-T----T-------AGTAGCGAATT-CA-C-T-TTTAC-CCG-A--GGT-A-TTTAC-A-T-CA----C-T-C--CA-A-AT----------G--CTAT-------C-GAGT-A-T-GT-G----TAT-----AG-GCAG--C-A--GTATATA-T-G---ACTGAAATCT-A---T-C---T-AGAGTTTAGA----C----------C-T---A--C---ATT-CG-CGGAAA-T-CGGCGTTGG--AAATT-CG--C--TGCGCC-TTGCT-C----T-----G----------T-----CG-A----------TG---C-AAGTCTGACATA------GG---A-TCA-TATGT-T-GCATA-----G-A-GGAGGGGGTT-A----TGC-GCT-TA-A-AA--G---C-A-A-T-G-CGC--------AG-TTT-CGTCA--C-G-A---TTAA-T----CCGT-GCT-A-C-A-GTCAGTGAT--A-C---C---AC--TT-TTGCTTTGG-AATGA-TA--G-ATTC-TG--C-A--TT-T-A-T-TATATGA--T-G-TTG--T------T-T------AAG-AAA-G--TG-TTGGT-GCT----AAC--TTTGTT-TA-C----TGT-A---G-T-ATTTA
gi|92386                      :                                                                                                                                                                                                     AATTGC-T-CGT-G-AAAT----G-A-T----T-------A-TG-T-TATT-TA-T-T-TT------T-A--A-T-A-TA-GC-A-T--G----C-T-T-T---A-AT----------T--T------------GA-T-A-T-CC-A----T----------------------------------------------A---T----------------------------------T---A--T---AT--CG-TG---G-C-G----TTGA--TA--T-AA--T--C---TA-TT-AT-CCG--T-----G--T--G----T-----CT-GATGTGGTT--TA---T-GA--------TT------GA---C-TCA-T---T-T-GCAT------A-A-ATATTC--TT-A----T-A-AAC-AA-T-AA--A---C-A-A-T-A-CAA-----A--AG-TT--C---A--C----------A-CTCTGC--T-GCT-A-T-A-TTCGG--------CA--CTTCAA--TT-CT---TTAA-GAT-A-CA--T-ATTG-TA--G-A--TA-T-A-C-T-T---AG-T-A-TT---T------C-TTAACCTGA--AAA-T--TT-TTGGG-AGC----AAC--CT---T-TG-C----T-TGA-T-A-C-
gi|92387                      :                                                                                                                                                                                                       TTTC-A-CGT-G-AAGT----T-A-T----C-------A-TA-C-ACTT-CA-C-T-TTT-C-CTT-A--G-T-A-TT-GC-A-TTCA----C-T-G-TTA-A-AT----------T--C------------GA-T-A-T-TC--------C-----AT-GC-G--C-A--A----TG-TGA---A--------T-A---T-----T-A--------A----C----------A-TT--A--T---AT--CGGCG---AAC-C----TTGA--AA--A-TG--C--C---C--TT-TT-C----T-----G--CGAA----T-----CT-A----------TA---C-AA--------TG------GA---C-GTA-T---T-T-GCA-T-----A-A-AGAGGG--TT-A----T-C-G-C-TG-TAAA--A---C-A-A-T-GACGC-----C--AG-TTT-C---A--C-G-A---T--A-C----C--T-GCG-A-C-A-GTTCA-GTT--G--A--C---AG--AT-TT---TTGG-AATGA-TA-GG-ATTCGTG--C-ATTTT-T-A-T-T-T---AGGT-A-TTGGAT------TGT------GA--AAA-G--TG-TTGGG-A-C----AAC--TT--TT-TATT----T-T-A-T-A-T-ATT
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Reference ( family-492 )      :                                                                                                                                                                                                   AAAATTTC-A-CGT-G-AAAT----T-A-T----T-------A-TA-C-AATT-CA-C-T-TT--C-CTT-A--G-T-A-TT-GC-A-T-CA----C-T-C-TCA-A-AT----------T--CT---------C-GA-T-A-T-TC-A----T-C-----AT-GC-G--C-A--A---ATG-T-A---A--------T-A---T-C---T-A--------A----C----------A-T---A--T---AT--CG-CG---A-C-C----TTGA--AA--T-CG--C--C---CC-TT-TT-C----T-----G--C--A----T-----CT-A----------TA---C-AA--------TG------GA---C-TCA-T---T-T-GCATT-----A-A-AGAGGG--TT-A----T-C-GCC-TG-T-AA--A---C-A-A-T-G-CGC-----C--AG-TTT-C---A--C-G-A---T--A-C----C--T-GCT-A-C-A-GTCAG-GTT--A-CA--C---AA--TT-TT---TTGG-AAT-A-TA-AG-ATTC-TG--C-A--TT-T-A-T-T-T---A--T-A-TT---T------T-T------GA--AAA-G--TG-TTGGG-AGC----AAC--TT--CT-TA-C----T-T-A-T-A-T-ATTTAA
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gi|92379                      :                                                                                                                                                                                                    AAATT---A-CGT-G-AAAT----T-A-T----T-------A-TA-C-AATT-CG-CTT-TT--C-CTT-A--G-T-A-TG-GC-ACT-CA----C-T-CTTCA-A-AT--------------T---------C-GA-T-A---TC-A----T-C-----AT-GC----C-A--A---CTG-A-T---A--------T-A---T-C---T----------A----C----------A-T---A--T---AT-----CG---A---C----TTGAAGAA--T-CG--C--C---C---T-TT-C----T-----G--G--C----T-----CT-A----------TA---C-AA--------TG------GA---C-TCA-T---T-TAGCGAT-----A-A-AGAGGG--TC------T-C-GCCTTG-T-AC--A---C---A-T-G--GC-----C--AG-TTT-C---A--C-G-A---T--A------C--T-GCT-A-T---GTCA--GTT--A--A--C---AA--TT-TT---AGAG-CAT-A-TA-GA-ATT--TG--C-A--TTCT-A-T-T-T---A--T-A-TA---T------T-T------GAAGAAA-G--TG-TTGGG-AGC-----AC--TT--CT-TA-C----T-C-A-T-AGT-ATT
gi|92380                      :                                                                                                                                                                                                    AAATTTC-A-CG--G-AA----------T----T-------A-TA-C-AATC-AA-C-T-TT--TGCCT-A--G-T-A-TT-TCCA-T--A----C-T-T-TCA-A--C----------T--CT---------C-GA-T-A-T--C-A----T-A-----GC-G--G--C-A--A---AT--T-A---A--------T-A---T-C---T-A-------------C----------T-T---AAAT---AT--CG-CG---A-C-CG---TTGA--AA--T-CG-----C---CC-TT-TT-C----T-----G--C--A----T-----CT-A----------TA---C-AA--------T-------GA---C-TCATT---T-T-GCATCAAAGAA-A-AGAGGG--AG-G----T---GCC--G-T-AA--AC--C-A-A-TAG-C-C-----C--AG-TTT-C---C--A-G-A---T--A-C----C--T-GCT---C-A-GTC----TTA-A-CA--C---AA---T-TT---TTGG-AAT-A-T--AG-ATTC-TG--CAA--TT-TAA-T-T-T---A--T-A-TT---T------T-T------GA--AAA-G--TG-TTGGG--GC----AAC--TTA-TT-TA-C----T-T-A---A-T-CTTTAA
gi|92381                      :                                                                                                                                                                                                    AAATATCGA-AGT-G-AA----------T----T-------A-AA-C-AAT--CA-C-T-TT--T-CTT-A--A---A-T---C-A-T-CA----C---C-TCA-A-GA----------T--CT---------C-GA-T-A-T-TC------T--------T-GC-G--C-A--AT--AGG-T-A---G----------A---T-C---T-A-------------C------------T---A--T---AT--CG-CG---A-C-C----TTGA------T-CG--C--A---CC-TT-TT-C----T-----G--C--------------T-A----------TAGGAC-AA--------TG-------A---C-CCA-T---GAT-GCA-----------AGAGG----T-A----T---GCC-TG-T-AAACA---C-A-A-T-G-CG------C--AG--TT-C---A--G-G-A---T--G-C----C--T-GCT-A-A-A-GTCA--GTT--AGTA--A---AA--TA-TT---TGGA-GAT-A-TA-GG-ATGC--G--C-A--TT-T-A-TAT-T---A-------T---T------T-T------GA--AAA-G--GG-TTGGT--GC-------------CT-TA-C----T-T-A-T-A-G-GCTTAA
gi|92382                      :                                                                                                                                                                                                    AAATTTC-A-CGT-G-AAAT----T-AAT----T-------A-TA-C-CATT-CA-C-T-TT--C-CTT-A--G-TAA-TT-TC-A-T-CA----C-T-C-TCA-A-A-----------T--CT---------C-GA-T-A-T-TC-A----T-T-----A--GC----C-AATA---ATG-T-----A--------T-A---TAC---T----------A----C----------A-T---A--T---AT--
gi|92382                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -A----T-C-GCC-TG-T-AA--A---C-A-A-T-G-CGC-----C--AG-TTT-C---A--C-G-ggacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggcatcgcctgtaaacaatgcgccagtttcacg
gi|92383                      : aaatttcacgtgaaattaattataccattcactttccttagtaatttcatcactctcaaatctcgatattcattagccaataatgtatatactacatatatggacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggcAATTTT-C-CGT-G-AAATGTTAT-A-T----C-------A-TATC-TATT------T-TT--C-TTT-A--G-T-A-TT-G--A---CA----C-TGC-TCA-AGAT----------T--CT---------CTGA-T-A-T-T--A----T-C-----CT-GC-G--C-A--AG--ACG-T-A---A--------T-A---T-C--------------A---------------A-T---T--T---AT--CG-TGTG-A-CGC----TTGA--AG--A-TG--C--C---CC-TT-TT-C----T-----G--C--A----T-----CT-A----------TA---C-AAG-------TG------GAG--C-CCA-T---T-T-GCAAT-----A-ATAGAGGG--TT-A----T-C-GCA-TG-C-AA--A---C-A-A-T-GGCGA-----A--AG-TTT-C---A--C-G-AATAT--A-T----C--T-GCT---C-G-CTCAG-TTC--A-CA------AA--TT-TT---TTTG-GAT-G-TG-AT-ATTC-TG--G-A--TT-T-A-T-T-T---AG-T-A-TT---T------T-T------GA--AAA-GGCTG-TTGGG-AGC----AAC--TT--CT-TA-C------T-A-TGA-T-ATT
gi|92384                      :                                                                                                                                                                                                     AATTTC-T-C-T-G-AAAT----TGA-T----T-------A-TT-C-ACAT-CA-T-T-TT-----TT-ATTG-C-ACTT-GC-A-A-GA----CCT-CATCA-A-AT----------T--AT---------C-GA-TTA-T-TT-AAACCC-C-----A----------A--A---ATG-T-A---A--------T-AGTAT-C---T-AT-------A----G----------A-T---A--T----T--CG-TG---A-C-C----TTGA--AA--T-CG--C--C---CT-TC-GC-C----T-----G--C--A----T-----CT-T----------TA---
gi|92385                      :                                                                                                                                                                                                     AATTTC-A-CGT-G-AATT----A-A-T----T-------AGTAGCGAATT-CA-C-T-TTTAC-CCG-A--GGT-A-TTTAC-A-T-CA----C-T-C--CA-A-AT----------G--CTAT-------C-GAGT-A-T-GT-G----TAT-----AG-GCAG--C-A--GTATATA-T-G---ACTGAAATCT-A---T-C---T-AGAGTTTAGA----C----------C-T---A--C---ATT-CG-CGGAAA-T-CGGCGTTGG--AAATT-CG--C--TGCGCC-TTGCT-C----T-----G----------T-----CG-A----------TG---C-AAGTCTGACATA------GG---A-TCA-TATGT-T-GCATA-----G-A-GGAGGGGGTT-A----TGC-GCT-TA-A-AA--G---C-A-A-T-G-CGC--------AG-TTT-CGTCA--C-G-A---TTAA-T----CCGT-GCT-A-C-A-GTCAGTGAT--A-C---C---AC--TT-TTGCTTTGG-AATGA-TA--G-ATTC-TG--C-A--TT-T-A-T-TATATGA--T-G-TTG--T------T-T------AAG-AAA-G--TG-TTGGT-GCT----AAC--TTTGTT-TA-C----TGT-A---G-T-ATTTA
gi|92386                      :                                                                                                                                                                                                     AATTGC-T-CGT-G-AAAT----G-A-T----T-------A-TG-T-TATT-TA-T-T-TT------T-A--A-T-A-TA-GC-A-T--G----C-T-T-T---A-AT----------T--T------------GA-T-A-T-CC-A----T----------------------------------------------A---T----------------------------------T---A--T---AT--CG-TG---G-C-G----TTGA--TA--T-AA--T--C---TA-TT-AT-CCG--T-----G--T--G----T-----CT-GATGTGGTT--TA---T-GA--------TT------GA---C-TCA-T---T-T-GCAT------A-A-ATATTC--TT-A----T-A-AAC-AA-T-AA--A---C-A-A-T-A-CAA-----A--AG-TT--C---A--C----------A-CTCTGC--T-GCT-A-T-A-TTCGG--------CA--CTTCAA--TT-CT---TTAA-GAT-A-CA--T-ATTG-TA--G-A--TA-T-A-C-T-T---AG-T-A-TT---T------C-TTAACCTGA--AAA-T--TT-TTGGG-AGC----AAC--CT---T-TG-C----T-TGA-T-A-C-
gi|92387                      :                                                                                                                                                                                                       TTTC-A-CGT-G-AAGT----T-A-T----C-------A-TA-C-ACTT-CA-C-T-TTT-C-CTT-A--G-T-A-TT-GC-A-TTCA----C-T-G-TTA-A-AT----------T--C------------GA-T-A-T-TC--------C-----AT-GC-G--C-A--A----TG-TGA---A--------T-A---T-----T-A--------A----C----------A-TT--A--T---AT--CGGCG---AAC-C----TTGA--AA--A-TG--C--C---C--TT-TT-C----T-----G--CGAA----T-----CT-A----------TA---C-AA--------TG------GA---C-GTA-T---T-T-GCA-T-----A-A-AGAGGG--TT-A----T-C-G-C-TG-TAAA--A---C-A-A-T-GACGC-----C--AG-TTT-C---A--C-G-A---T--A-C----C--T-GCG-A-C-A-GTTCA-GTT--G--A--C---AG--AT-TT---TTGG-AATGA-TA-GG-ATTCGTG--C-ATTTT-T-A-T-T-T---AGGT-A-TTGGAT------TGT------GA--AAA-G--TG-TTGGG-A-C----AAC--TT--TT-TATT----T-T-A-T-A-T-ATT
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gi|92400                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    A--------TG------GA---CACCA-T---T-T-GCAT------A-A-AGAGG----T-A----G-C-GCC-TG-T-AA--AA--C-A-A-T-G-CGCG----C--AG-TTTTC---A--C-G-A---T--A-C----C--T-GCT-A-C-A-GTCA--GTTAGA-GA--C---AA--TT-AA---TTGG-AAT-C-TA-At
gi|92401                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -GCT-A-C-A-GTCAG--TT--A-CA--C---CA--TT-TT---TTGG-AAT-A--A-AG-ATTa


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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                           . .   . .    .    . . .    .       .  . .    .  . . .  T  .   . .  . . .  .  . . .  .    . . .   . .  .          .   .         .  . . . .  . .    . .      .  . .  . .  .     . . .   .        . .   . .   ACATAT                           .  .    .   .  .   . . .       .   .  .  .  .  .    .  .  . .    .     .  .  .    .      . .           .   .  .         .       .   .   . .   . .   TA      . .      T   . .    . .  C   . .  .  .   . . . . .  CT         .   . .   .  . . .   .  C      .  .   . C   .    GG   .  .  .  .    .   .  .      .   . . ATA      .  T    .   . . . . . .   .  . .  .   .      . .       .    . .   .     .   .      .   T   .  . .    . . . . . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                           . .   . .    .    . . .    .       .  . .    .  . . .  T  .   . .  . . .  .  . . .  .    . . .   . .  .          .   .         .  . . . .  . .    . .      .  . .  . .  .     . . .   .        . .   . .   ACATTA                           .  .    .   .  .   . . .       .   .  .  .  .  .    .  .  . .    .     .  .  .    .      . .           .   .  .         .       .   .   . .   . .   AT      . .      T   . .    . .  C   . .  .  .   . . . . .  CC         .   . .   .  . . .   .  C      .  .   . C   .    GA   .  .  .  .    .   .  .      .   . . TAG      .  C    .   . . . . . .   .  . .  .   .      . .       .    . .   .     .   .      .   T   .  . .    . . . . . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                           . .   . .    .    . . .    .       .  . .    .  . . .  T  .   . .  . . .  .  . . .  .    . . .   . .  .          .   .         .  . . . .  . .    . .      .  . .  . .  .     . . .   .        . .   . .   ATAGAT                           .  .    .   .  .   . . .       .   .  .  .  .  .    .  .  . .    .     .  .  .    .      . .           .   .  .         .       .   .   . .   . .   T       . .      T   . .    . .  C   . .  .  .   . . . . .  CC         .   . .   .  . . .   .  C      .  .   . C   .    G    .  .  .  .    .   .  .      .   . . AGA      .  C    .   . . . . . .   .  . .  .   .      . .       .    . .   .     .   .      .   T   .  . .    . . . . . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                           . .   . .    .    . . .    .       .  . .    .  . . .  .  .   . .  . . .  .  . . .  .    . . .   . .  .          .   .         .  . . . .  . .    . .      .  . .  . .  .     . . .   .        . .   . .   AACATT                           .  .    .   .  .   . . .       .   .  .  .  .  .    .  .  . .    .     .  .  .    .      . .           .   .  .         .       .   .   . .   . .   T       . .      T   . .    . .  C   . .  .  .   . . . . .  CC         .   . .   .  . . .   .  C      .  .   . C   .    G    .  .  .  .    .   .  .      .   . . AGG      .  C    .   . . . . . .   .  . .  .   .      . .       .    . .   .     .   .      .   C   .  . .    . . . . . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                           . .   . .    .    . . .    .       .  . .    .  . . .  .  .   . .  . . .  .  . . .  .    . . .   . .  .          .   .         .  . . . .  . .    . .      .  . .  . .  .     . . .   .        . .   . .   ACATT                            .  .    .   .  .   . . .       .   .  .  .  .  .    .  .  . .    .     .  .  .    .      . .           .   .  .         .       .   .   . .   . .   C       . .      T   . .    . .  C   . .  .  .   . . . . .  AC         .   . .   .  . . .   .  C      .  .   . C   .    T    .  .  .  .    .   .  .      .   . . GAT      .  C    .   . . . . . .   .  . .  .   .      . .       .    . .   .     .   .      .   C   .  . .    . . . . . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                           . .   . .    .    . . .    .       .  . .    .  . . .  .  .   . .  . . .  .  . . .  .    . . .   . .  .          .   .         .  . . . .  . .    . .      .  . .  . .  .     . . .   .        . .   . .   ACATT                            .  .    .   .  .   . . .       .   .  .  .  .  .    .  .  . .    .     .  .  .    .      . .           .   .  .         .       .   .   . .   . .   C       . .      T   . .    . .  A   . .  .  .   . . . . .  CC         .   . .   .  . . .   .  C      .  .   . T   .    T    .  .  .  .    .   .  .      .   . . AGG      .  G    .   . . . . . .   .  . .  .   .      . .       .    . .   .     .   .      .   A   .  . .    . . . . . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                           . .   . .    .    . . .    .       .  . .    .  . . .  .  .   . .  . . .  .  . . .  .    . . .   . .  .          .   .         .  . . . .  . .    . .      .  . .  . .  .     . . .   .        . .   . .   ACATT                            .  .    .   .  .   . . .       .   .  .  .  .  .    .  .  . .    .     .  .  .    .      . .           .   .  .         .       .   .   . .   . .   T       . .      T   . .    . .  A   . .  .  .   . . . . .  AA         .   . .   .  . . .   .  T      .  .   . T   .    G    .  .  .  .    .   .  .      .   . . GTG      .  G    .   . . . . . .   .  . .  .   .      . .       .    . .   .     .   .      .   T   .  . .    . . . . . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                           . .   . .    .    . . .    .       .  . .    .  . . .  .  .   . .  . . .  .  . . .  .    . . .   . .  .          .   .         .  . . . .  . .    . .      .  . .  . .  .     . . .   .        . .   . .   ACATT                            .  .    .   .  .   . . .       .   .  .  .  .  .    .  .  . .    .     .  .  .    .      . .           .   .  .         .       .   .   . .   . .   T       . .      G   . .    . .  C   . .  .  .   . . . . .  AA         .   . .   .  . . .   .  C      .  .   . T   .    G    .  .  .  .    .   .  .      .   . . AAG      .  C    .   . . . . . .   .  . .  .   .      . .       .    . .   .     .   .      .   C   .  . .    . . . . . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                           . .   . .    .    . . .    .       .  . .    .  . . .  .  .   . .  . . .  .  . . .  .    . . .   . .  .          .   .         .  . . . .  . .    . .      .  . .  . .  .     . . .   .        . .   . .   ACATT                            .  .    .   .  .   . . .       .   .  .  .  .  .    .  .  . .    .     .  .  .    .      . .           .   .  .         .       .   .   . .   . .   T       . .      T   . .    . .  C   . .  .  .   . . . . .  CC         .   . .   .  . . .   .  C      .  .   . T   .    G    .  .  .  .    .   .  .      .   . . AG       .  G    .   . . . . . .   .  . .  .   .      . .       .    . .   .     .   .      .   C   .  . .    . . . . . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                           . .   . .    .    . . .    .       .  . .    .  . . .  .  .   . .  . . .  .  . . .  .    . . .   . .  .          .   .         .  . . . .  . .    . .      .  . .  . .  .     . . .   .        . .   . .   ACATT                            .  .    .   .  .   . . .       .   .  .  .  .  .    .  .  . .    .     .  .  .    .      . .           .   .  .         .       .   .   . .   . .   T       . .      A   . .    . .  C   . .  .  .   . . . . .  CC         .   . .   .  . . .   .  C      .  .   . C   .    G    .  .  .  .    .   .  .      .   . . AG       .  C    .   . . . . . .   .  . .  .   .      . .       .    . .   .     .   .      .   C   .  . .    . . . . . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                           . .   . .    .    . . .    .       .  . .    .  . . .  .  .   . .  . . .  .  . . .  .    . . .   . .  .          .   .         .  . . . .  . .    . .      .  . .  . .  .     . . .   .        . .   . .   GATGT                            .  .    .   .  .   . . .       .   .  .  .  .  .    .  .  . .    .     .  .  .    .      . .           .   .  .         .       .   .   . .   . .   T       . .      T   . .    . .  C   . .  .  .   . . . . .  CC         .   . .   .  . . .   .  T      .  .   . A   .    G    .  .  .  .    .   .  .      .   . . AG       .  C    .   . . . . . .   .  . .  .   .      . .       .    . .   .     .   .      .   T   .  . .    . . . . . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                           . .   . .    .    . . .    .       .  . .    .  . . .  .  .   . .  . . .  .  . . .  .    . . .   . .  .          .   .         .  . . . .  . .    . .      .  . .  . .  .     . . .   .        . .   . .   ACATT                            .  .    .   .  .   . . .       .   .  .  .  .  .    .  .  . .    .     .  .  .    .      . .           .   .  .         .       .   .   . .   . .   T       . .      T   . .    . .  C   . .  .  .   . . . . .  CC         .   . .   .  . . .   .  T      .  .   . C   .    G    .  .  .  .    .   .  .      .   . . AG       .  C    .   . . . . . .   .  . .  .   .      . .       .    . .   .     .   .      .   C   .  . .    . . . . . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                           . .   . .    .    . . .    .       .  . .    .  . . .  .  .   . .  . . .  .  . . .  .    . . .   . .  .          .   .         .  . . . .  . .    . .      .  . .  . .  .     . . .   .        . .   . .   ACTAT                            .  .    .   .  .   . . .       .   .  .  .  .  .    .  .  . .    .     .  .  .    .      . .           .   .  .         .       .   .   . .   . .   T       . .      T   . .    . .  A   . .  .  .   . . . . .  AA         .   . .   .  . . .   .  C      .  .   . C   .    G    .  .  .  .    .   .  .      .   . . AA       .  G    .   . . . . . .   .  . .  .   .      . .       .    . .   .     .   .      .   C   .  . .    . . . . . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                           . .   . .    .    . . .    .       .  . .    .  . . .  .  .   . .  . . .  .  . . .  .    . . .   . .  .          .   .         .  . . . .  . .    . .      .  . .  . .  .     . . .   .        . .   . .   ATATT                            .  .    .   .  .   . . .       .   .  .  .  .  .    .  .  . .    .     .  .  .    .      . .           .   .  .         .       .   .   . .   . .   T       . .      A   . .    . .  T   . .  .  .   . . . . .  AA         .   . .   .  . . .   .  T      .  .   . T   .    G    .  .  .  .    .   .  .      .   . . AG       .  C    .   . . . . . .   .  . .  .   .      . .       .    . .   .     .   .      .   C   .  . .    . . . . . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                           . .   . .    .    . . .    .       .  . .    .  . . .  .  .   . .  . . .  .  . . .  .    . . .   . .  .          .   .         .  . . . .  . .    . .      .  . .  . .  .     . . .   .        . .   . .   AATTT                            .  .    .   .  .   . . .       .   .  .  .  .  .    .  .  . .    .     .  .  .    .      . .           .   .  .         .       .   .   . .   . .   T       . .      T   . .    . .  C   . .  .  .   . . . . .  CC         .   . .   .  . . .   .  C      .  .   . C   .    G    .  .  .  .    .   .  .      .   . . AA       .  G    .   . . . . . .   .  . .  .   .      . .       .    . .   .     .   .      .   C   .  . .    . . . . . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                           . .   . .    .    . . .    .       .  . .    .  . . .  .  .   . .  . . .  .  . . .  .    . . .   . .  .          .   .         .  . . . .  . .    . .      .  . .  . .  .     . . .   .        . .   . .   ATATT                            .  .    .   .  .   . . .       .   .  .  .  .  .    .  .  . .    .     .  .  .    .      . .           .   .  .         .       .   .   . .   . .   T       . .      C   . .    . .  C   . .  .  .   . . . . .  AA         .   . .   .  . . .   .  T      .  .   . T   .    G    .  .  .  .    .   .  .      .   . . AG       .  C    .   . . . . . .   .  . .  .   .      . .       .    . .   .     .   .      .   C   .  . .    . . . . . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                           . .   . .    .    . . .    .       .  . .    .  . . .  .  .   . .  . . .  .  . . .  .    . . .   . .  .          .   .         .  . . . .  . .    . .      .  . .  . .  .     . . .   .        . .   . .   ACATC                            .  .    .   .  .   . . .       .   .  .  .  .  .    .  .  . .    .     .  .  .    .      . .           .   .  .         .       .   .   . .   . .   T       . .      G   . .    . .  A   . .  .  .   . . . . .  AC         .   . .   .  . . .   .  T      .  .   . C   .    G    .  .  .  .    .   .  .      .   . . AG       .  G    .   . . . . . .   .  . .  .   .      . .       .    . .   .     .   .      .   C   .  . .    . . . . . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                           . .   . .    .    . . .    .       .  . .    .  . . .  .  .   . .  . . .  .  . . .  .    . . .   . .  .          .   .         .  . . . .  . .    . .      .  . .  . .  .     . . .   .        . .   . .   ATATC                            .  .    .   .  .   . . .       .   .  .  .  .  .    .  .  . .    .     .  .  .    .      . .           .   .  .         .       .   .   . .   . .   T       . .      T   . .    . .  A   . .  .  .   . . . . .  AA         .   . .   .  . . .   .  C      .  .   . T   .    G    .  .  .  .    .   .  .      .   . . AT       .  C    .   . . . . . .   .  . .  .   .      . .       .    . .   .     .   .      .   .   .  . .    . . . . . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                           . .   . .    .    . . .    .       .  . .    .  . . .  .  .   . .  . . .  .  . . .  .    . . .   . .  .          .   .         .  . . . .  . .    . .      .  . .  . .  .     . . .   .        . .   . .   ACAT                             .  .    .   .  .   . . .       .   .  .  .  .  .    .  .  . .    .     .  .  .    .      . .           .   .  .         .       .   .   . .   . .   T       . .      A   . .    . .  A   . .  .  .   . . . . .  AA         .   . .   .  . . .   .  T      .  .   . T   .    G    .  .  .  .    .   .  .      .   . . AT       .  G    .   . . . . . .   .  . .  .   .      . .       .    . .   .     .   .      .   .   .  . .    . . .      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                           . .   . .    .    . . .    .       .  . .    .  . . .  .  .   . .  . . .  .  . . .  .    . . .   . .  .          .   .         .  . . . .  . .    . .      .  . .  . .  .     . . .   .        . .   . .   ACTT                             .  .    .   .  .   . . .       .   .  .  .  .  .    .  .  . .    .     .  .  .    .      . .           .   .  .         .       .   .   . .   . .   T       . .      A   . .    . .  A   . .  .  .   . . . . .  AA         .   . .   .  . . .   .  T      .  .   . T   .    G    .  .  .  .    .   .  .      .   . . AG       .  C    .   . . . . . .   .  . .  .   .      . .       .    . .   .     .   .      .   .   .  . .    . . .      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                           . .   . .    .    . . .    .       .  . .    .  . . .  .  .   . .  . . .  .  . . .  .    . . .   . .  .          .   .         .  . . . .  . .    . .      .  . .  . .  .     . . .   .        . .   . .   ACAT                             .  .    .   .  .   . . .       .   .  .  .  .  .    .  .  . .    .     .  .  .    .      . .           .   .  .         .       .   .   . .   . .   T       . .      C   . .    . .  A   . .  .  .   . . . . .  AC         .   . .   .  . . .   .  C      .  .   . T   .    G    .  .  .  .    .   .  .      .   . . AT       .  G    .   . . . . . .   .  . .  .   .      . .       .    . .   .     .   .      .   .   .                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                 . .    .    . . .    .       .  . .    .  . . .  .  .   . .  . . .  .  . . .  .    . . .   . .  .          .   .         .  . . . .  . .    . .      .  . .  . .  .     . . .   .        . .   . .   ACT                              .  .    .   .  .   . . .       .   .  .  .  .  .    .  .  . .    .     .  .  .    .      . .           .   .  .         .       .   .   . .   . .   T       . .      T   . .    . .  A   . .  .  .   . . . . .  AA         .   . .   .  . . .   .  T      .  .   . C   .    G    .  .  .  .    .   .  .      .   . . AT       .  G    .   . . . . . .   .  . .  .   .      . .       .    . .   .     .   .      .                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                        .    . . .    .       .  . .    .  . . .  .  .   . .  . . .  .  . . .  .    . . .   . .  .          .   .         .  . . . .  . .    . .      .  . .  . .  .     . . .   .        . .   . .   AAT                              .  .    .   .  .   . . .       .   .  .  .  .  .    .  .  . .    .     .  .  .    .      . .           .   .  .         .       .   .   . .   . .   T       . .      T   . .    . .  C   . .  .  .   . . . . .  C          .   . .   .  . . .   .  T      .  .   . T   .    G    .  .  .  .    .   .  .      .   . . GC       .  G    .   . . . . . .   .  . .  .   .      . .       .    .                                                   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                        .    . . .    .       .  . .    .  . . .  .  .   . .  . . .  .  . . .  .    . . .   . .  .          .   .         .  . . . .  . .    . .      .  . .  . .  .     . . .   .        . .   . .   AAT                              .  .    .   .  .   . . .       .   .  .  .  .  .    .  .  . .    .     .  .  .    .      . .           .   .  .         .       .   .   . .   . .   T       . .      .   . .    . .  A   . .  .  .   . . . . .  C          .   . .   .  . . .   .  C      .  .   . T   .    G    .  .  .  .    .   .  .      .   . . GC       .  G    .   . . . . . .   .  . .  .   .      . .       .    .                                                   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                      .       .  . .    .  . . .  .  .   . .  . . .  .  . . .  .    . . .   . .  .          .   .         .  . . . .  . .    . .      .  . .  . .  .     . . .   .        . .   . .   T                                .  .    .      .   . . .       .   .  .  .  .  .    .  .  . .    .     .  .  .    .      . .           .   .  .         .       .   .   . .   . .   T       . .      .   . .    . .  A   . .  .  .   . . . . .  C          .   . .   .  . . .   .  .      .  .   . C   .    G    .  .  .  .    .   .  .      .   . . A                                                                                                                        
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Reference ( family-492 )      :                                                                                                                                                                                                   AAAATTTC-A-CGT-G-AAAT----T-A-T----T-------A-TA-C-AATT-CA-C-T-TT--C-CTT-A--G-T-A-TT-GC-A-T-CA----C-T-C-TCA-A-AT----------T--CT---------C-GA-T-A-T-TC-A----T-C-----AT-GC-G--C-A--A---ATG-T-A---A--------T-A---T-C---T-A--------A----C----------A-T---A--T---AT--CG-CG---A-C-C----TTGA--AA--T-CG--CC---CC-TT-TT-C----T-----G--C--A----T-----CT-A----------TA---C-AA--------TG------GA---C-TCA-T---T-T-GC-A-T------A-A-A-GA---GGG-TT-A----T-CG-CC-TG-T-AA--A---C-A-A-T-G-C-GC-----C--AGTTT-C---A--C-G-A---T--A-C----C--T-GCT-A-C-A-G-TCA-G-TT--A-CA---CAA--T--T-TTT----TGG-A--AT-AT-A-G-A--TTC-TG--C-A--TT-T-A-T-T-T---A--T-A-TT---T------T-TGA--AAA-G--TG-TTGGG-AGC----AAC--TT--CT-TA-C----T-T-A-T-A-T-ATTTAA
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gi|92382                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -A----T-CG-CC-TG-T-AA--A---C-A-A-T-G-C-GC-----C--AGTTT-C---A--C-G-ggacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggcatcgcctgtaaacaatgcgccagtttcacg
gi|92383                      : aaatttcacgtgaaattaattataccattcactttccttagtaatttcatcactctcaaatctcgatattcattagccaataatgtatatactacatatatggacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggcAATTTT-C-CGT-G-AAATGTTAT-A-T----C-------A-TATC-TATT------T-TT--C-TTT-A--G-T-A-TT-G--A---CA----C-TGC-TCA-AGAT----------T--CT---------CTGA-T-A-T-T--A----T-C-----CT-GC-G--C-A--AG--ACG-T-A---A--------T-A---T-C--------------A---------------A-T---T--T---AT--CG-TGTG-A-CGC----TTGA--AG--A-TG--CC---CC-TT-TT-C----T-----G--C--A----T-----CT-A----------TA---C-AAG-------TG------GAG--C-CCA-T---T-T-GC-AAT------A-ATA-GA---GGG-TT-A----T-CG-CA-TG-C-AA--A---C-A-A-T-GGC-GA-----A--AGTTT-C---A--C-G-AATAT--A-T----C--T-GCT---C-G-C-TCA-G-TT----CA---CAAATT--T-TTT----TGG-A---T-GTGA-T-A--TTC-TG--G-A--TT-T-A-T-T-T---AG-T-A-TT---T------T-TGA--AAA-GGCTG-TTGGG-AGC----AAC--TT--CT-TA-C------T-A-TGA-T-ATT
gi|92384                      :                                                                                                                                                                                                     AATTTC-T-C-T-G-AAAT----TGA-T----T-------A-TT-C-ACAT-CA-T-T-TT-----TT-ATTG-C-ACTT-GC-A-A-GA----CCT-CATCA-A-AT----------T--AT---------C-GA-TTA-T-TT-AAACCC-C-----A----------A--A---ATG-T-A---A--------T-AGTAT-C---T-AT-------A----G----------A-T---A--T----T--CG-TG---A-C-C----TTGA--AA--T-CG--CC---CT-TC-GC-C----T-----G--C--A----T-----CT-T----------TA---
gi|92385                      :                                                                                                                                                                                                     AATTTC-A-CGT-G-AATT----A-A-T----T-------AGTAGCGAATT-CA-C-T-TTTAC-CCG-A--GGT-A-TTTAC-A-T-CA----C-T-C--CA-A-AT----------G--CTAT-------C-GAGT-A-T-GT-G----TAT-----AG-GCAG--C-A--GTATATA-T-G---ACTGAAATCT-A---T-C---T-AGAGTTTAGA----C----------C-T---A--C---ATT-CG-CGGAAA-T-CGGCGTTGG--AAATT-CG--CTGCGCC-TTGCT-C----T-----G----------T-----CG-A----------TG---C-AAGTCTGACATA------GG---A-TCA-TATGT-T-GC-A-T------A-G-A-GGAGGGGG-TT-A----TGCG-CT-TA-A-AA--G---C-A-A-T-G-C-GC--------AGTTT-CGTCA--C-G-A---TTAA-T----CCGT-GCT-A-C-A-G-TCA-G-TG--A-TA---CCA--C--T-TTTGCTTTGG-A--ATGAT-A-G-A--TTC-TG--C-A--TT-T-A-T-TATATGA--T-G-TTG--T------T-TAAG-AAA-G--TG-TTGGT-GCT----AAC--TTTGTT-TA-C----TGT-A---G-T-ATTTA
gi|92386                      :                                                                                                                                                                                                     AATTGC-T-CGT-G-AAAT----G-A-T----T-------A-TG-T-TATT-TA-T-T-TT------T-A--A-T-A-TA-GC-A-T--G----C-T-T-T---A-AT----------T--T------------GA-T-A-T-CC-A----T----------------------------------------------A---T----------------------------------T---A--T---AT--CG-TG---G-C-G----TTGA--TA--T-AA--TC---TA-TT-AT-CCG--T-----G--T--G----T-----CT-GATGTGGTT--TA---T-GA--------TT------GA---C-TCA-T---T-T-GC-A-T------A-A-A-TA---TTC-TT-A----T-AA-AC-AA-T-AA--A---C-A-A-T-A-C-AA-----A--AG-TT-C---A--C----------A-CTCTGC--T-GCT-A-T-A-T-TCG-G-------CACTTCAA--T--T-CTT----TAA-G--AT-AC-A-T-A--TTG-TA--G-A--TA-T-A-C-T-T---AG-T-A-TT---TCTTAACC-TGA--AAA-T--TT-TTGGG-AGC----AAC--CT---T-TG-C----T-TGA-T-A-C-
gi|92387                      :                                                                                                                                                                                                       TTTC-A-CGT-G-AAGT----T-A-T----C-------A-TA-C-ACTT-CA-C-T-TTT-C-CTT-A--G-T-A-TT-GC-A-TTCA----C-T-G-TTA-A-AT----------T--C------------GA-T-A-T-TC--------C-----AT-GC-G--C-A--A----TG-TGA---A--------T-A---T-----T-A--------A----C----------A-TT--A--T---AT--CGGCG---AAC-C----TTGA--AA--A-TG--CC---C--TT-TT-C----T-----G--CGAA----T-----CT-A----------TA---C-AA--------TG------GA---C-GTA-T---T-T-GC-A-T------A-A-A-GA---GGG-TT-A----T-CG--C-TG-TAAA--A---C-A-A-T-GAC-GC-----C--AGTTT-C---A--C-G-A---T--A-C----C--T-GCG-A-C-A-GTTCA-G-TT--G--A---CAG--A--T-TTT----TGG-A--ATGAT-AGG-A--TTCGTG--C-ATTTT-T-A-T-T-T---AGGT-A-TTGGAT------TGTGA--AAA-G--TG-TTGGG-A-C----AAC--TT--TT-TATT----T-T-A-T-A-T-ATT
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