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Reference ( gi|118692 )       : CCCTA-T-AC-T-C-GC-TT-CGT-A-GCAAAA-CG---------AAAC-TT----A-------TA--A----A-T-AC--G---G--T-C-T-G---C--A----T--G-GG--C-T--------T-TA----AA--ATG-A-G-A-----A-AGA-A--AT--G----TT---A--T------A--AA--TA-C----CT-G----------T--A--AA-C-T-G---A-A---T-T---T------AAAC-C----A----C---T-G---T--T--TT-T---AGT-GATACAGTATT-T--GC-A-TT--G-TA-A-------T-T---AA-A--GA--TTCC-AAT-A---T------AT---A--T-TGT-----CA-T--GCTGACT
gi|118698                     : CCATA-T-AC-T-T-GC-TT-CGT-A-GCAAAA-CG---------AAAT-TT----A-------TA--A----A-T-AC--G---A--T-C-T-G---C--A----T--T-GG--C-T--------A-TA----AA--ATG-A-G-A-----T-AGA-A--AT--G----CT---A--T------A--AA--TA-C----CT-GTAAACAGTACT--A--AA-C-T-G---A-A---T-T---T------AAAC-C----A----C---T-GTT-T--T--TT-T---AGT-GA-----TATT-T--GC-A-TT--G-TA-A-------T-T---AA-A--GA--TTTCAAAT-A---T------AT---A--T-TGT-----CA-T--GTTGACT
gi|118695                     : CCCTA-T-AC-T-C-GT-CT-CGT-A-GCAAA--CG---------AAAT-TT------------TA--ATT--A-T-AC--G---G--T-C-T-G---C--A----T--G-G---C-T--------A-TA----AA--ATG-A-G-A-----C-AGA-A--AT--G----TT---A--T------A--AA--TA-C----CT-G----------T--A--AA-C-T-G---A-A---T-T---T------AAAC-C----A----C---T-G------T--TT-T---AGT-GA-----TATT-T--GC-A-TT--G-TA-A-------T-T---AA-A--AA--TTTC-A---A---T------AT---A--T-TGT-----CA-T--GCTGACT
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gi|118721                     :  CCCA-T-AC-T-CCGA-TT-CGT-A-GCAAA--CG---------AAAT-TC----G-------TA--A----A-T-AC--G---G--T-C-TTG---CTCA----T--G-GG--C-C--------A-TC----AA--ATG-A-G-T-----A--GA-A------G----TT---A--T------A--AAAATA-C----AT-G----------T--A--AA-C-T-G---A-A---T-T---T------AAA--C----A----C---T-G------T--TT-A---AGT-GATAT----TC-T--GC-A-TTTGG-TA-A-------T-G---AA-
gi|118722                     :   CTA-T-AC-T-C-GC-TT-CGT-A-GCAAAA-CG---------CAAT-TT----G-------TG--A----A-T-AC--G---G--T-G-T-G---A--A----T--A-GG--C-C--------A-TG----AA--ATG-A-G-ATG---G-AGA-A--A--------TT---A--T------A--AA--TA-C----TT-G----------T--A--AA-C-T-G---A-A---T-T---T------AAAC-C----A----C---T-G---T--TACTTAT---AGT-G---C--TATT-T--CC-A-TT--G-
gi|118723                     :    TA-T--C-T-C-GC-TT-CGTTA-GCAAA---G---------AAATGTT----A-------TA--A----A-T-AC--GT--G--T-C-T-G---C--AA---T--G-GG--C-TAA------TATA----AA--ATG-A-G-A-----T-AGA-C--AT--GCT--TT---A--T------A--TA--AA-C----CT-G----------TTAA--AA-C-T-G---A-A---A-T---T------AAAC-C----A----C---T-G---T--T--TT-T---AGT-GATAT--TA---T--GC-A-TT--ACCA-A-------T-T---AA-A--GAATTTCC-TAT-A---TA-----AT---A--T-TGT-----CA-T--GCTGA
gi|118724                     :    TA-T-ACAT-C-GC-TT-CGT-A-GCCAAA-CA---------AAAT-TT----G-------TA--A----A-T-AC--G---GT-T-T-T-G---C--A----T--G-GA--C-C--------A-T-----AA--ATG-A-G-A-----A-TGA-AG-AA--G----TT---A--T------A--AA--TA------CT-G----------T--A--AA-C-T-G---A-A---T-T---T------AAAC-C----A----CA--T-C---T--T--TT-TGAAGGC-GAT----TATTCT--GC-A--T--G-CA-A-------T-T---AG-AATAA--TGTC-AATGA---T------AT---G--T-T
gi|118725                     :    TA-T-AC---C-AC-TT-CGTGA-GCAAAA-CACGA------AAAT-TT----A-------CA--A----A-C------------T-C-T-G---C--A----TCTG-GG--C-A--------AATA----AACTATG-AAG-A-----T-AGG-A--GA--G----TT---AC-T------A--AG-----C----CT-G----------T--A--TA-T-C-G---A-A---TAT---T------AAAC-C----A----C---T-G------T--TT-T---AGT-GAT----TATT-TTACC-A-TT--G-TACA-------T-G---AC-A--GAG-TTTC-AAC-A---T------AA---A--T-T-T-----CATT--GCTGtttgaagctgcatt
gi|118726                     :    TA-A-AC-T-C-GGGTT-CGTTA-GCAAAA-CG---------AAAT-TT----G-------TA--A----A-A-ACCAA---A--T-C-T-GCCCC--A----T--T-GG--CAA--------T-TA----AA--ATG-G-G-ATAAAGA-GGA-A--GT--T----TT---A--CCCCCAAA--AA--TA-C----CT-G----------TTAA--AA-C-TGG---A-A---T-T---TTTAAAAAAAC-CCCA-A----CTTTT-G---T--T--TT-T---AGT-G-T----TATT-T--G--G-TG--G-CA-A-------T-T---
gi|118728                     :     A-T-AC-T-C-GC-TT-CGT-G-GCAAAA-CG---------AAAT-TT----G-------TA--A----A-T-AC--GT--G--T-C-T-G---C--A----T--G-GA--C-CA-------T-TA----AA--ATGAA-G-A-----T-AGA-A--AG--T----TT---A--T------A--AA--TA-CAAAATA-G----------T--A--AA-C---G---A-A---T-T---T------AAAT-C----A----CT--T-G---T--T--TT-A---GGT-G----AGT-TT-T--GC-A-TT--G-CA-AT------T-T---AA-A--GA--TTTC-AAT-A---T------AT---T--T-TGT-----CA-T--TCCGATT
gi|118727                     :     A-T-AC-T-C-GC-TT-CGT-G-GCAAAA-CG---------AAAT-TT----G-------TA--A----A-T-AC--GT--G--T-C-T-G---C--A----T--G-GA--C-CA-------T-TA----AA--ATGAA-G-A-----T-AGA-A--AG--T----TT---A--T------A--AA--TA-CAAAATA-G----------T--A--AA-C---G---A-A---T-T---T------AAAT-C----A----CT--T-G---T--T--TT-A---GGT-G----AGT-TT-T--GC-A-TT--G-CA-AT------T-T---AA-A--GA--TTTC-AAT-A---T------AT---T--T-TGT-----CA-T--TCCGATT
gi|118729                     :      -T-GC-T-C-GC-CC-TGT-AAGCAAAA-CG---------AAAT-TTT---A-------TA--A----AAT-AC--G---G--T-C-T-G---C--A----T--G-G---C-T--------A-TA----AA--ATG-A-G-A-----TTAGA-A--AT--GG---TT---A--T------A--AA--TA-C----CTTG----------T--A--AA-C-T-G---A-A---T-T---T------AAAC-C----A----C---T-G---T--T--TT-T---AGT-GATA------T-T--GC-A-TT--A-CA-A-------T-T----A-A--GA--TTTC-AAT-A---TA-----AT---A--T-TGT-----CA----GCTGACT
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Reference ( family-488 )      : CCCTA-T-AC-T-C-GC-TT-CGT-A-GCAAAA-CG---AAAT-TT-G-------T-A--A----A-T--AC--G---G--T-C-T-G---C--A----T--G-GG--CC--A---TA-------AA--A--TG-A-G----AT-A-----GA-A----A--T--G--TT---A---T------A--AA--TA-C----CT-G----------T--AA--A-C-T-G---A-A---T-T---T------AAAC-C----A----C---TG---T--T--TT-T---AGTG-AT----TATT-T--GC-A-TT--G-CA-A-------T-T---AA-A--GA--TTTC-A-A--T-A---T------ATA--T-TGT-----CA-T--GCTGACT
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gi|118699                     : CCCTA-T-A--T-C-GC-TT-CGT-T-GCAAAA-C-----AAT-TT-G-------T-A--A----A-T--AC--G--------T-T-G---C--A----C--G-G---CC--A---TA-------AAT-A--TG-A-G----AT-A-----GAGA----A--A--G--TT-------T------A--AA--TA-C----CT-G----------T--AA--A-C-T-G---A-A---T-T---T------AGAC-C----A----C---TG---------TT-T---AGTG-A-----TATT-T--GC-A-TT--A-CA-A-------T-T---AA-A--GA--TTTC-A-A--T-A---T------ATT--T-TGT-----CA-T--TCCGATT
gi|118700                     : CCCTA-T-AC-TTC-AC-TT-CGT-A-GCAAA--CG---AAAT-T--G-------T-A--A----A-T--AT--G---G--T-C-T-G---C--A----T--G-GG--CT--A---TA-------AA--A--TG-A-G----AT-A-----GA-A----A--T--G--TT---A---TA-----A--AA--TA-C----CT-G----------T--AA--A-C-T-G---A-A---T-T---T------AAA--C----A----C---TG---T--T--TT-T---AGTG-A-----TATT-T--CC-A-TA--G-TA-A-------T-T---AA-A--GA--TTTC-A-A----A---T------AAA--T-TGT-----CA-TTGGCTG
gi|118701                     : CCCTA-T-AC-T-C-GC-TT-CGTAA-GC-AAA-CG---AAAT-TT---------T-A--T----A-T--AC--G---G--T-C-T-G---C--A----T--G-GG--CT------TA-------AA--A---G-A-G----AT-A-----GA-A----A--T--G--TT---A---T------AC-AA--TA-C----AT-G----------T--AA--A-C-T-G---ATA---T-T---T------AAAC-C----A----C---TG---T--T--TT-T---AGTG-A-----TA-T-T--GC-AGTT--A-CA-A-------TGT---AA-A--GA--TTTC-A-A--T-ATATT------ATA--T-TGT-----CA-T--GCTGACT
gi|118702                     : CCATA-TGAC-T-C-GC-TTTCGT-A-GCAAAA-CG---AAAT-TT-A-------T-A--A----A-T--AC--G---G--T-CTT-G---C--A----T--G-GGGACT--A---TA-------AAT-A--TG-A-G----AT-A-----GA-A----A--A--G--TT---A---T------A--AA--TATC----CT-G----------T--AA--A-C-T-G---A-A---T-T---T------AAACAC----AGTGCT---TG---T--T--TT-T---TGTG-A-----TATT-T--GCGA-TT--G-T--A-------T-T---TA-A--GA--TTTC-A-A--A-T---T------ATA--T-TGTTTTTCCA-T--GCTGA
gi|118703                     : CCCTA-T-AC-T-T-GC-TT-CGT-A-GCAAAA-CG---AAAT-TT-A-------C-A--A----A-T--AC--G---A--T-C-T-G---C-------------------------------------A--TG-A-G----AT-A-----TA-A----A--C--A--TT---A---T------A--AA--TA-C----CT-A-------------AA--A-C-T-G---A-A---T-T---T------AAAC-C----A----C---CG------T--TT-T---AGTG-AT----AATT-T--GC-A-TT--A-CA-A-------T-T---AA-A--TA--TTTC-A-A--T-A---TAATATGATA--T-TGT-----CA-T--GCTG
gi|118704                     : CCCTT-T-AC-T-C-GC-TT-CGTTA-GCAAAA-CG---AAAT-TT-G-------T-A--A----A-T--AC--G---GGTT-C-G-C---C--A----T--G-GG--CT--A----G-------AA--A--TG-A-G----AT-A-----GG-A----A--T--G--TT---A---T------A--AA--TA-C----CT-G----------T--AA--A-C-T-G---ACATTTT-T---T------AAAC-C----A----C---TG---T--T--TT-T---AGTGCAT----CATT-T--GC-A-TT--G-TA-A-------T-T---AATA--GA--TTTC-A-A----A---T------A
gi|118705                     : CCCTA-T-AC-T-C-GC-TC-TGT-A-GCAAAA-CGTC-AAAT-TT-G-------T-A--A----A-T--AC--G---GC-T-C-T-G---C--A----T--G-GG--CT--A---T---------A--A--TG-T-G----AT-A-----GA-A----A--T--G--TT---ATT-T------A--AA--TA-C----CT-G----------C--AA--A-C-T-G---A-A---T-T---T-------AAC-C----A----C---TG---T--T--TT-T---AGTG-------TATT-T--G--A-TT--G-TA-A-------T-T---AA-----A--TGTC-A-AATT-AT--T------AAA--T-TGT-----CA-T--GCTTAC
gi|118706                     : CCCTA-T-AC-T-T-GC-TT-CAT-A-GCAAA--CG---AAAT-TT-G-------T-A--T----A-T--AC--GTTGG--T-C-T-G---C--A----T--G-GG--CT--A---TA-------AA--A--AG-A-G----AT-A-----GA-G----A--A--G--TT---A---T------A--AAC-TA-C----CT-G----------T--AA--ATC-T-G---A-A---T-T---GA-----AAAC-C----A----C---TGTT-T--T--TT-T---AATG-TA----TATT-T--GC-A-TT--G-TACA-------T-TTTAAA-A--GA--TTTC-A-T--T-A---T-------TA----TGT-----Cgatt
gi|118707                     : CTCTA-T-AC-T-C-GC-TT-TGT-A-GCAAAA-CG---AAAT-TT-G-------T-A--A----A-T--AC--G---G--T-C-G-G---C--A----T--G-GG--CT--A---TA-------AA--A--TG-A-G----AT-A-----GA-A----A--T--G--TT---A---T------A--AA--TA-C----CT-G----------C--AA--A-C-T-G---A-A---T-C---T------AAAC-C----A----C---T
gi|118708                     : CCCTAGT-AC-T-C-GC-TT-CGT-A-GCAAAG-CA---AAAT-TTTG-------T-ACTA----A-T--AC--G---G--T-CCT-G---C--A----T--G-G------------------------------A-A----AT-A-----GA-A----A--T--G--TT---A---T------A--GA--TA-C----CT-G----------T--AA--A-C-T-G---A-A---T-T---TA-----AAAC-C----A----C---TA---T--T--TT-C---AGTG-AT----TTTT-T--GC-A-TT--G-TA-GGCCTAATT-T---AA-C--AA--TTTC-A-A--A-A---T------A-A--T-TGT-----CA-T--GCTGACT
gi|118709                     : CCCTA-T-AC-T-C-GC-TT-CAT-A-GCAAAA-CG---AAAT-TT-A-------T-A--A----A-T--AC--G---G--T-C-T-G---C--A----T--G-GG--GT--A---TA-------AA--A--TG-A-G----AT-A-----CA-A----G--T--G--TT---A---T------A--AA--TA-C----CT-G----------T--AA--A-C-T-G---A-T---T-T---T------AAAC-TTTAAA----T---TGAC-T--T--TT-T---AGTG-
gi|118710                     : CCCTA-T-AC-T-C-AC-TT-CGT-A-GCAAAA-CG---AAAT-TT-G-------T-A--A----A-T--AC--G---G--A-C-T-G---C--A----T--G-GG--CC--A---TA-------AA--A--TG-A-G----AT-A-----CA-G----A--A--G--TT-----------------------------------------------A--A-C-T-G---A-A---T-T---T------AAA-------G----T---GG---T--T--TA-T---AGTG-A-----TATT-T--GC-A-TT--
gi|118711                     : CCCTA-T-AC-T-C-GC-TT-CGT-A-GCAAAA-CG---AAAT-TT-A-------T-A--A----A-T--AC--A---G--T-C-T-G---C--A----T--G-GG--CT--A---TAAATT---AA--A--TG-A-G----GT-A-----GA-A----A--T--G--TT---A---T------A--AA--TA-C----CT-G----------T--A
gi|118712                     : CCCTA-T-AC-G-T-GC-TT-CGT-A-GCAAAA-CG---AAAT-TT-A-------T-A--A----A-TA-AC--A---G--TCC-T-G---CA-A----T--G-GG--CC--A---TATAGAATTAA--ATTTG-A-G----GT-A-----GA-AT---A--T--G--TTTAAA---T------A--AA--TA-C----CT-T----------A--AA--A-C-G-GAGAA-A---T-T---T------AAAA-C----AAC--T---TGGTTT--T--TT-T---AGTG-GA----TATT-
gi|118713                     : CCCTA-T-AC-T-C-GT-TT-CGT-A-GCAAAA-TG---CAAT-TT-G-------T-A--ATATTA-T--AC--G---G--T-C-T-G---C--A----C--G-GG--CC--A---TA-------AA--A--TG-A-GTAGAGT-A-----GG-ATAGGA--T-----CT---A---TG-----A--AA--TA-T----CT-G----------T--AAGAA-C-TTG---A-A---T-T---T------AAAG-C----A----A---TGGT-TG-T--TC-T---AGTT-ATAT--TGTG-T--GC-A-TTT-G-TA-A-------T-T---AA-A--GAT-TTTC-A-A--T-A---T------A
gi|118714                     : CCCTA-T-AC-T-C-GC-TT-CGT-A-GCAAAA-TC---AATT-TT-T-------T-T--A----A-A--AC--G---A--C-T-T-G---A--A-------A-GA--CTGAA---T--------AA--A--TG-A---------A-----GA-AC---ATTT--A--TT---G---T------A--AA--TA-C----CT-G----------T--CA--T-CTT-T---A-A---T-T---T------ATAT-C----ACG--C---TG---TGGC--TC-T---A----------TATT-T--GC---TT--T-CA-T-------C-T---GG-A--GT--TTTC-A-A--G-A---A------AAG--TCTAT-----CA-T--GCct
gi|118715                     : CCCTA-T-AC-C-C-GC-TT-CGT-A-GCAAAA-TG---ATCT-TT-A-------T-A--T----A-A--AC---------TAC-T-T---C--A----A--A-GA--CTGAA---T--------AA--A--TG-A---------A-----GA-A----A--A--G--TT---AG--TG-----A--AA--TA-C----CT-G----------T--ctatt
gi|118716                     : CCCTA-T-AC-T-C-GC-TT-CGT-A-GCAAAA-TG------T-TT-GTTTTTTTT-A--T----A-A--AC--G---G--C-T-T-G---A--A-------A-GA--CTGAA---T--------AA--A--TG-A---------A-----GA-AC---ATTT--A--TT---G---T------A--AA--TA-C----CT-G----------T--
gi|118717                     : CCCTA-T-AC-T-C-GC-TT-CGT-A-GCAAAA-TG------T-TT-GTTTTTTTT-A--T----A-A--AC--G---G--C-T-T-G---A--A-------A-GA--CTGAA---T--------AA--A--TG-A-G----A--A-----CA-T----T--T--A--TT---G---T------A--AA--TA-C----CT-G----------T--catctttaatta
gi|118718                     : CCCTA-T-AC-T-C-GC-TT-CGT-A-GCAAAC-TT---ATTT-TT-T-------T-T--A----A-TAAAC--G---G--C-T-T-G---A--A-------A-GA--CTGAA---T--------AA--A--TG-A---------A-----GA-AT---T--T--A--TT---G---T------A--AA--TA-C----CT-G----------T--catctttaatta
gi|118719                     : CCCTA-T-AC-C-C-GC-TT-CGT-A-GCAAAA-TG---ATTT-TT-T-------T-T--G----A-TAAAC--G---G--C-T-T-G---A--AATACT--G-A-------A---T--------AA--A--TG-A---------A-----GA-A----C--A--G--TT---ATTGT------A--AA--TA-C----CT-G----------T--CA--T-CTT-T---A-A---T-T---G------ATAT-C----ACG--C---TG---TGGC--TC-T---A----------TATT-T--GC-C-TT----CG-T-------C-T---GG-A--GT--TTTC-A-A--G-A---A------AAG--TCTAT-----CA-T--GC
gi|118720                     :  CCCA-T-AT-T-C-GCGTT-CGT-A-GCAAAA-CG---AAAT-TT-A-------T-A--A----A-T--AC--G---G--T---T-G---CATA----T--G-GA--CCT-A---TA-------AA--A--TG-A-G----AT-------GA-A----A--TAGG--TT---A---T------AGCAA--TA-C----CT------------T--AA--A-C-T-G---A-A---T-TTTAT------AACT-C----A----C---TG---T--T--TT-T---GCTG-A-----TA-T-T--GCAA-TT--G-TA-A-------T-T---AA-A--GA---TTC-ATA--T-A---T------ATAGTT-TGT-----CA-T--GCTGACTctatt
gi|118721                     :  CCCA-T-AC-T-CCGA-TT-CGT-A-GCAAA--CG---AAAT-TC-G-------T-A--A----A-T--AC--G---G--T-C-TTG---CTCA----T--G-GG--CC--A---TC-------AA--A--TG-A-G-----T-A-----GA-A----------G--TT---A---T------A--AAAATA-C----AT-G----------T--AA--A-C-T-G---A-A---T-T---T------AAA--C----A----C---TG------T--TT-A---AGTG-A-----TATTCT--GC-A-TTTGG-TA-A-------T-G---AA-
gi|118722                     :   CTA-T-AC-T-C-GC-TT-CGT-A-GCAAAA-CG---CAAT-TT-G-------T-G--A----A-T--AC--G---G--T-G-T-G---A--A----T--A-GG--CC--A---TG-------AA--A--TG-A-G----AT-G-----GA-G----A--A--A--TT---A---T------A--AA--TA-C----TT-G----------T--AA--A-C-T-G---A-A---T-T---T------AAAC-C----A----C---TG---T--TACTTAT---AGTG--C----TATT-T--CC-A-TT--G-
gi|118723                     :    TA-T--C-T-C-GC-TT-CGTTA-GCAAA---G---AAATGTT-A-------T-A--A----A-T--AC--GT--G--T-C-T-G---C--AA---T--G-GG--CT--AATATA-------AA--A--TG-A-G----AT-A-----GA-C----A--T--GCTTT---A---T------A--TA--AA-C----CT-G----------TTAAA--A-C-T-G---A-A---A-T---T------AAAC-C----A----C---TG---T--T--TT-T---AGTG-A-----TATTAT--GC-A-TT--ACCA-A-------T-T---AA-A--GAATTTCC-T-A--T-A---TA-----ATA--T-TGT-----CA-T--GCTGA
gi|118724                     :    TA-T-ACAT-C-GC-TT-CGT-A-GCCAAA-CA---AAAT-TT-G-------T-A--A----A-T--AC--G---GT-T-T-T-G---C--A----T--G-GA--CC--A---T--------AA--A--TG-A-GA---AT-G-----AA-G----A--A--G--TT---A---T------A--AA--TA------CT-G----------T--AA--A-C-T-G---A-A---T-T---T------AAAC-C----A----CA--TC---T--T--TT-TGAAGGCG-AT----TATTCT--GC-A--T--G-CA-A-------T-T---AG-AATAA--TGTC-A-A--TGA---T------ATG--T-T
gi|118725                     :    TA-T-AC---C-AC-TT-CGTGA-GCAAAA-CACGAAAAT-TT-A-------C-A--A----A-C-------------T-C-T-G---C--A----TCTG-GG--CA--AA--TA-------AACTA--TG-AAG----AT-A-----GG-A----G--A--G--TT---AC--T------A--AG-----C----CT-G----------T--AT--A-T-C-G---A-A---TAT---T------AAAC-C----A----C---TG------T--TT-T---AGTG-AT----TATT-TTACC-A-TT--G-TACA-------T-G---AC-A--GAG-TTTC-A-A--C-A---T------AAA--T-T-T-----CATT--GCTGtttgaagctgcatt
gi|118726                     :    TA-A-AC-T-C-GGGTT-CGTTA-GCAAAA-CG---AAAT-TT-G-------T-A--A----A-A--ACCAA---A--T-C-T-GCCCC--A----T--T-GG--CA--AT--TA-------AA--A--TG-G-G----AT-AAAGAGGA-A----G--T--T--TT---A---CCCCCAAA--AA--TA-C----CT-G----------TTAAA--A-C-TGG---A-A---T-T---TTTAAAAAAAC-CCCA-A----CTTTTG---T--T--TT-T---AGTG--T----TATT-T--G--G-TG--G-CA-A-------T-T---
gi|118727                     :     A-T-AC-T-C-GC-TT-CGT-G-GCAAAA-CG---AAAT-TT-G-------T-A--A----A-T--AC--GT--G--T-C-T-G---C--A----T--G-GA--CC--AT--TA-------AA--A--TGAA-G----AT-A-----GA-A----A--G--T--TT---A---T------A--AA--TA-CAAAATA-G----------T--AA--A-C---G---A-A---T-T---T------AAAT-C----A----CT--TG---T--T--TT-A---GGTG-AG----T-TT-T--GC-A-TT--G-CA-AT------T-T---AA-A--GA--TTTC-A-A--T-A---T------ATT--T-TGT-----CA-T--TCCGATT
gi|118728                     :     A-T-AC-T-C-GC-TT-CGT-G-GCAAAA-CG---AAAT-TT-G-------T-A--A----A-T--AC--GT--G--T-C-T-G---C--A----T--G-GA--CC--AT--TA-------AA--A--TGAA-G----AT-A-----GA-A----A--G--T--TT---A---T------A--AA--TA-CAAAATA-G----------T--AA--A-C---G---A-A---T-T---T------AAAT-C----A----CT--TG---T--T--TT-A---GGTG-AG----T-TT-T--GC-A-TT--G-CA-AT------T-T---AA-A--GA--TTTC-A-A--T-A---T------ATT--T-TGT-----CA-T--TCCGATT
gi|118729                     :      -T-GC-T-C-GC-CC-TGT-AAGCAAAA-CG---AAAT-TTTA-------T-A--A----AAT--AC--G---G--T-C-T-G---C--A----T--G-G---CT--A---TA-------AA--A--TG-A-G----ATTA-----GA-A----A--T--GG-TT---A---T------A--AA--TA-C----CTTG----------T--AA--A-C-T-G---A-A---T-T---T------AAAC-C----A----C---TG---T--T--TT-T---AGTG-A-----TA-T-T--GC-A-TT--A-CA-A-------T-T----A-A--GA--TTTC-A-A--T-A---TA-----ATA--T-TGT-----CA----GCTGACT
gi|118730                     :                     -CGT-A-GCAAAG-CG---AAAT-TT-G-------T-A--A----A-T--AC--G---G--T-C-T-A---T--A----T--ATGG--CA--A---CA-------AA--A--TG-A-G----AT-G-----GG-G----A--A--A--TT---A---T------A--AT--TA-C----AT-G----------T--AA--A-C-T-G---A-A---T-T---T------AAAC-C----A----C---TC---T--T--TT-G---TGTG-A-----TACT-T--GG-A-TT--T-CA-A-------T-T---AA-G--GA--TTTT-A-A--T-A---C------ATA--T-TGT-----CA-T--GCTGATT
gi|118731                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ----TATC-T--GC-A-TT--G-TA-A-------T-T---AA-A--GA--TTTC-A-A--T-A---A------ATA--T-TGT-----CA-T--GCTGACT
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Reference ( family-488 )      : CCCTA-T-AC-T-C-GC-TT-CGT-A-GCAAAA-CG---AAAT-TT-G-------TA--A----A-T--AC--G---G--T-C-T-G---C--A----T--G-GG--CC--A---TA-------AA--A--TG-A-G----AT-A-----GA-A----A--T--G--TT---A---T------A--AA--TA-C----CT-G----------T--AA--A-C-T-G---A-A---T-T---T------AAAC-C----A----C---TG---T--T--TT-T---AGT-G-A-----T-ATT---T--GC-A-TT--G-CA-A-------T-T---AA-A--GA--TTTC-A-A--T-A---T------ATA--T-TGT-----CA-T--GCTGACT
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gi|118703                     : CCCTA-T-AC-T-T-GC-TT-CGT-A-GCAAAA-CG---AAAT-TT-A-------CA--A----A-T--AC--G---A--T-C-T-G---C-------------------------------------A--TG-A-G----AT-A-----TA-A----A--C--A--TT---A---T------A--AA--TA-C----CT-A-------------AA--A-C-T-G---A-A---T-T---T------AAAC-C----A----C---CG------T--TT-T---AGT-G-A-----TAATT---T--GC-A-TT--A-CA-A-------T-T---AA-A--TA--TTTC-A-A--T-A---TAATATGATA--T-TGT-----CA-T--GCTG
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gi|118705                     : CCCTA-T-AC-T-C-GC-TC-TGT-A-GCAAAA-CGTC-AAAT-TT-G-------TA--A----A-T--AC--G---GC-T-C-T-G---C--A----T--G-GG--CT--A---T---------A--A--TG-T-G----AT-A-----GA-A----A--T--G--TT---ATT-T------A--AA--TA-C----CT-G----------C--AA--A-C-T-G---A-A---T-T---T-------AAC-C----A----C---TG---T--T--TT-T---AGT-G-------T-ATT---T--G--A-TT--G-TA-A-------T-T---AA-----A--TGTC-A-AATT-AT--T------AAA--T-TGT-----CA-T--GCTTAC
gi|118706                     : CCCTA-T-AC-T-T-GC-TT-CAT-A-GCAAA--CG---AAAT-TT-G-------TA--T----A-T--AC--GTTGG--T-C-T-G---C--A----T--G-GG--CT--A---TA-------AA--A--AG-A-G----AT-A-----GA-G----A--A--G--TT---A---T------A--AAC-TA-C----CT-G----------T--AA--ATC-T-G---A-A---T-T---GA-----AAAC-C----A----C---TGTT-T--T--TT-T---AAT-GTA-----T-ATT---T--GC-A-TT--G-TACA-------T-TTTAAA-A--GA--TTTC-A-T--T-A---T-------TA----TGT-----Cgatt
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gi|118715                     : CCCTA-T-AC-C-C-GC-TT-CGT-A-GCAAAA-TG---ATCT-TT-A-------TA--T----A-A--AC---------TAC-T-T---C--A----A--A-GA--CTGAA---T--------AA--A--TG-A---------A-----GA-A----A--A--G--TT---AG--TG-----A--AA--TA-C----CT-G----------T--ctatt
gi|118716                     : CCCTA-T-AC-T-C-GC-TT-CGT-A-GCAAAA-TG------T-TT-GTTTTTTTTA--T----A-A--AC--G---G--C-T-T-G---A--A-------A-GA--CTGAA---T--------AA--A--TG-A---------A-----GA-AC---ATTT--A--TT---G---T------A--AA--TA-C----CT-G----------T--
gi|118717                     : CCCTA-T-AC-T-C-GC-TT-CGT-A-GCAAAA-TG------T-TT-GTTTTTTTTA--T----A-A--AC--G---G--C-T-T-G---A--A-------A-GA--CTGAA---T--------AA--A--TG-A-G----A--A-----CA-T----T--T--A--TT---G---T------A--AA--TA-C----CT-G----------T--catctttaatta
gi|118718                     : CCCTA-T-AC-T-C-GC-TT-CGT-A-GCAAAC-TT---ATTT-TT-T-------TT--A----A-TAAAC--G---G--C-T-T-G---A--A-------A-GA--CTGAA---T--------AA--A--TG-A---------A-----GA-AT---T--T--A--TT---G---T------A--AA--TA-C----CT-G----------T--catctttaatta
gi|118719                     : CCCTA-T-AC-C-C-GC-TT-CGT-A-GCAAAA-TG---ATTT-TT-T-------TT--G----A-TAAAC--G---G--C-T-T-G---A--AATACT--G-A-------A---T--------AA--A--TG-A---------A-----GA-A----C--A--G--TT---ATTGT------A--AA--TA-C----CT-G----------T--CA--T-CTT-T---A-A---T-T---G------ATAT-C----ACG--C---TG---TGGC--TC-T---------A-----T-ATT---T--GC-C-TT----CG-T-------C-T---GG-A--GT--TTTC-A-A--G-A---A------AAG--TCTAT-----CA-T--GC
gi|118720                     :  CCCA-T-AT-T-C-GCGTT-CGT-A-GCAAAA-CG---AAAT-TT-A-------TA--A----A-T--AC--G---G--T---T-G---CATA----T--G-GA--CCT-A---TA-------AA--A--TG-A-G----AT-------GA-A----A--TAGG--TT---A---T------AGCAA--TA-C----CT------------T--AA--A-C-T-G---A-A---T-TTTAT------AACT-C----A----C---TG---T--T--TT-T---GCT-G-A-----T-A-T---T--GCAA-TT--G-TA-A-------T-T---AA-A--GA---TTC-ATA--T-A---T------ATAGTT-TGT-----CA-T--GCTGACTctatt
gi|118721                     :  CCCA-T-AC-T-CCGA-TT-CGT-A-GCAAA--CG---AAAT-TC-G-------TA--A----A-T--AC--G---G--T-C-TTG---CTCA----T--G-GG--CC--A---TC-------AA--A--TG-A-G-----T-A-----GA-A----------G--TT---A---T------A--AAAATA-C----AT-G----------T--AA--A-C-T-G---A-A---T-T---T------AAA--C----A----C---TG------T--TT-A---AGT-G-A-----T-ATTC--T--GC-A-TTTGG-TA-A-------T-G---AA-
gi|118722                     :   CTA-T-AC-T-C-GC-TT-CGT-A-GCAAAA-CG---CAAT-TT-G-------TG--A----A-T--AC--G---G--T-G-T-G---A--A----T--A-GG--CC--A---TG-------AA--A--TG-A-G----AT-G-----GA-G----A--A--A--TT---A---T------A--AA--TA-C----TT-G----------T--AA--A-C-T-G---A-A---T-T---T------AAAC-C----A----C---TG---T--TACTTAT---AGT-G-C-----T-ATT---T--CC-A-TT--G-
gi|118723                     :    TA-T--C-T-C-GC-TT-CGTTA-GCAAA---G---AAATGTT-A-------TA--A----A-T--AC--GT--G--T-C-T-G---C--AA---T--G-GG--CT--AATATA-------AA--A--TG-A-G----AT-A-----GA-C----A--T--GCTTT---A---T------A--TA--AA-C----CT-G----------TTAAA--A-C-T-G---A-A---A-T---T------AAAC-C----A----C---TG---T--T--TT-T---AGT-G-A-----T-ATTA--T--GC-A-TT--ACCA-A-------T-T---AA-A--GAATTTCC-T-A--T-A---TA-----ATA--T-TGT-----CA-T--GCTGA
gi|118724                     :    TA-T-ACAT-C-GC-TT-CGT-A-GCCAAA-CA---AAAT-TT-G-------TA--A----A-T--AC--G---GT-T-T-T-G---C--A----T--G-GA--CC--A---T--------AA--A--TG-A-GA---AT-G-----AA-G----A--A--G--TT---A---T------A--AA--TA------CT-G----------T--AA--A-C-T-G---A-A---T-T---T------AAAC-C----A----CA--TC---T--T--TT-TGAAGGC-G-AT----T-ATTC--T--GC-A--T--G-CA-A-------T-T---AG-AATAA--TGTC-A-A--TGA---T------ATG--T-T
gi|118725                     :    TA-T-AC---C-AC-TT-CGTGA-GCAAAA-CACGAAAAT-TT-A-------CA--A----A-C-------------T-C-T-G---C--A----TCTG-GG--CA--AA--TA-------AACTA--TG-AAG----AT-A-----GG-A----G--A--G--TT---AC--T------A--AG-----C----CT-G----------T--AT--A-T-C-G---A-A---TAT---T------AAAC-C----A----C---TG------T--TT-T---AGT-G-AT----T-ATT---TTACC-A-TT--G-TACA-------T-G---AC-A--GAG-TTTC-A-A--C-A---T------AAA--T-T-T-----CATT--GCTGtttgaagctgcatt
gi|118726                     :    TA-A-AC-T-C-GGGTT-CGTTA-GCAAAA-CG---AAAT-TT-G-------TA--A----A-A--ACCAA---A--T-C-T-GCCCC--A----T--T-GG--CA--AT--TA-------AA--A--TG-G-G----AT-AAAGAGGA-A----G--T--T--TT---A---CCCCCAAA--AA--TA-C----CT-G----------TTAAA--A-C-TGG---A-A---T-T---TTTAAAAAAAC-CCCA-A----CTTTTG---T--T--TT-T---AGT-G-T-----T-ATT---T--G--G-TG--G-CA-A-------T-T---
gi|118727                     :     A-T-AC-T-C-GC-TT-CGT-G-GCAAAA-CG---AAAT-TT-G-------TA--A----A-T--AC--GT--G--T-C-T-G---C--A----T--G-GA--CC--AT--TA-------AA--A--TGAA-G----AT-A-----GA-A----A--G--T--TT---A---T------A--AA--TA-CAAAATA-G----------T--AA--A-C---G---A-A---T-T---T------AAAT-C----A----CT--TG---T--T--TT-A---GGT-G-A-----G-TTT---T--GC-A-TT--G-CA-AT------T-T---AA-A--GA--TTTC-A-A--T-A---T------ATT--T-TGT-----CA-T--TCCGATT
gi|118728                     :     A-T-AC-T-C-GC-TT-CGT-G-GCAAAA-CG---AAAT-TT-G-------TA--A----A-T--AC--GT--G--T-C-T-G---C--A----T--G-GA--CC--AT--TA-------AA--A--TGAA-G----AT-A-----GA-A----A--G--T--TT---A---T------A--AA--TA-CAAAATA-G----------T--AA--A-C---G---A-A---T-T---T------AAAT-C----A----CT--TG---T--T--TT-A---GGT-G-A-----G-TTT---T--GC-A-TT--G-CA-AT------T-T---AA-A--GA--TTTC-A-A--T-A---T------ATT--T-TGT-----CA-T--TCCGATT
gi|118729                     :      -T-GC-T-C-GC-CC-TGT-AAGCAAAA-CG---AAAT-TTTA-------TA--A----AAT--AC--G---G--T-C-T-G---C--A----T--G-G---CT--A---TA-------AA--A--TG-A-G----ATTA-----GA-A----A--T--GG-TT---A---T------A--AA--TA-C----CTTG----------T--AA--A-C-T-G---A-A---T-T---T------AAAC-C----A----C---TG---T--T--TT-T---AGT-G-A-----T-A-T---T--GC-A-TT--A-CA-A-------T-T----A-A--GA--TTTC-A-A--T-A---TA-----ATA--T-TGT-----CA----GCTGACT
gi|118730                     :                     -CGT-A-GCAAAG-CG---AAAT-TT-G-------TA--A----A-T--AC--G---G--T-C-T-A---T--A----T--ATGG--CA--A---CA-------AA--A--TG-A-G----AT-G-----GG-G----A--A--A--TT---A---T------A--AT--TA-C----AT-G----------T--AA--A-C-T-G---A-A---T-T---T------AAAC-C----A----C---TC---T--T--TT-G---TGT-G-A-----T-ACT---T--GG-A-TT--T-CA-A-------T-T---AA-G--GA--TTTT-A-A--T-A---C------ATA--T-TGT-----CA-T--GCTGATT
gi|118731                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -A-----T-ATC---T--GC-A-TT--G-TA-A-------T-T---AA-A--GA--TTTC-A-A--T-A---A------ATA--T-TGT-----CA-T--GCTGACT
gi|118732                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TT---G--GC-A-TT--G-CA-A-------T-T---AA-A--GA--TTTC-A-A--T-A---T------ATT--T-TGT-----CA-T--GTTGATT